1er cycle – PCEM1 – Chimie générale (1re partie) Année Universitaire 2008 - 2009

• Les êtres vivants diffèrent de la matière non

vivante,
cellules = unités fondamentales de la vie : unités
Cours de Chimie entourées d’une membrane remplies d’une solution
2008 - 2009 aqueuse concentrée de produits chimiques.
Chimie générale • Grande diversité des cellules qui ont la même
chimie de base.
Stéréoisomérie des molécules organiques p
• Elles sont composées du même type
yp de molécules
• Ont le même type de réactions chimiques.
Chimie organique
Dr F. Michel

Les êtres vivants obéissent aux lois Chimie générale

I ) Etude des atomes
de la chimie et de la physique
II ) Classification périodique des éléments (Electronégativité)
• Composés à base de carbone :
III ) Liaisons chimiques
• Étude en labo = chimie organique  liaisons simples
• Étude au sein des organismes vivants = biochimie  liaisons multiples
• Réactions chimiques en solution aqueuse  formes de résonance

• Certaines molécules sont polymériques : IV ) Polarisation des liaisons (effets inductif et mésomère)
macromolécules
lé l
• Mécanismes de régulation V ) Composés de coordination (complexes)

VI ) Associations intermoléculaires
 Interactions électrostatiques, liaison hydrogène
 Interactions de Van der Waals

(Mise ligne 15/09/08 – LIPCOM -RM)

F. MICHEL Faculté de Médecine Montpellier-Nîmes
1er cycle – PCEM1 – Chimie générale (1re partie) Année Universitaire 2008 - 2009

I ) Etude des atomes

Etude des atomes
1) Particules élémentaires
échelle gramme
I – Structure
2) Structure de l’atome
Atome : est électriquement neutre
3) Notion d’isotope
• constitué d’un noyau chargé +
où est concentrée la masse de l’atome
4) Les électrons
Contient les nucléons (p + n )
a) niveaux dd’énergie
énergie
b) nombres quantiques
• autour duquel gravitent les électrons
c) répartition des électrons dans les orbitales
d) forme des orbitales (nuage électronique) chargés -

1) Particules élémentaires
Echelle gramme
Particules charge masse
Fixe arbitrairement à 12 la masse atomique
élémentaires gramme de l’isotope
l isotope prépondérant du C.
électron -1,602 10-19 C 9,109 10-31 Kg Masse réelle d’un atome de C (S. de masse)
(coulomb) me m= 1,993 10-23 g
proton 1,602 10-19 C 1,672 10-27 Kg Constante = nb d’Avogadro
= 1836 me M=Nxm
neutron 0 1 672 10-27
1,672 27 Kg

Masse atomique gramme Masse atomique réelle

Masse p = masse neutron
N = M/m = 6,02 1023 représente le nb d’atomes réels
Masse réelle des atomes très petite = 10-23 g (peu commode) contenus dans un atome gramme
On a défini une échelle gramme.

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Masse d’un atome exprimée en u.m.a. 2) Structure de l’atome :

Atome ou nucléide X caractérisé par :
1 u.m.a. = 1/12 masse d’un atome de C pris à 12g A = nombre de masse
A
Z = numéro
é atomique
i
Z
X
1 u.m.a. = 1/12 . 12.10-3/6,02 10 23 = 1,66 10-27 Kg
A = masse du noyau en u.m.a.
Masse p = masse n # 1 u.m.a. Mp = Mn = 1 u.m.a.
A = 1 x nb de protons + 1 x nb de neutrons
Masse e # 0,0005 u.m.a.(on la néglige) A = Z + N = nombre de nucléons
Z = nombre de protons ( = nb d’électrons)
Charge du proton dans l’échelle gramme :
1,6 10-19 C x 6,02 10 23 = 96 500 C 12
16
6C
= 12 nucléons ( 6 p = 6 n )
8 O = 16 nucléons ( 8 p = 8 n )
Eléments légers nb n = nb p quand Z nb n 19
9F

3) Notion d’isotope :
Masse atomique d’un élément = masse de cet élément en tenant
Atomes ayant même n° atomique (Z) compte de ses isotopes.
nb de masse différent (A)
1 H : hydrogène (p=1, n=0)
1 Chlore naturel, M =35,45 u.m.a (75,4% 3517Cl et 24,6% 3717Cl)
2 H : deutérium (p=1, n=1) isotope stable
1
3 H
1 : tritium (p=1, n=2) isotope radioactif (rayt ) Une mole (mol) ensemble de N (6,02 1023) atomes ou molécules
masse molaire = masse d’une mole
12
6C
: carbone (p=6, n=6)
13
6 : carbone (p=6, n=7) isotope stable
C La masse molaire d’un nuclide en g = masse atomique en u.m.a
14 C : carbone (p=6, n=8) isotope radioactif (rayt )
6
16 Masse atomique de 1 atome de O = 16 u.m.a
35
17Cl : chlore
hl (p=17,
( 17 n=18)
18) O M
Masse molaire
l i ded 1 mole
l de
d O = 16 g
37 8
17Cl : chlore (p=17, n=20)
Masse atomique d’une molécule = somme des masses
Les masses atomiques grammes des corps purs naturels très
molaires des atomes qui constituent cette molécule.
souvent ne sont pas des nombres entiers
Ex H2O M= (1 x 2) + (1x16) = 18 g

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a) Niveaux d’énergie
4) Les électrons : E
(retour à l’état fondamental)
émission
Responsables des propriétés chimiques de l’atome O O O
(Le noyau = propriétés physiques) N N N
M M M
Gravitent autour du noyau M
L L L
L L L Lω L
Chaque électron a une énergie caractéristique.
Si on fournit de l’énergie à un atome K K K
K
E absorbée par ll’ee- atome excité K  K K

K
Retour à l’état fondamental en émettant des radiations Raie K : EL – EK = E = hhC
monochromatiques = spectre d’émission discontinu hconstante de Planck fréquence
= spectre de raies longueur d’onde C:vitesse de la lumière
K<  K<  K<…..  K>  L>  M>…..

 et  varient en sens inverse

b) Nombres quantiques : 4 nombres quantiques :

 n = nb quantique principal = nb entier positif
A toute particule en mouvement est associée une onde de Définit la couche n = 1 couche K
matière. n = 2 couche L
n = 3 couche M
L’éq ation de Schrödinger relie l’ E d’
L’équation d’un
n e- à sa fonction d’onde
 l = nb quantique secondaire
Définit la sous-couche, forme de l’orbitale
Un électron est défini par 0 < l < n-1
4 nombres quantiques : l = 0 orbitale s
l = 1 orbitale p
n
l = 2 orbitale d
l l = 3 orbitale f
m  m = nb quantique magnétique
s Définit l’orientation de l’orbitale -l < m < +l
 s = nb quantique de spin // ou anti//
Rotation de l’électron sur lui même +1/2 -1/2

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l=2 m = -2, -1, 0, +1, +2 3d (5orbitales, 10 e-)
n=3 l=1 m = -1, 0, +1 3p (3orbitales, 6 e-)
l=0 m=0 3s (1orbitale, 2 e-) 3d (5 orbitales)
Case M 3p (3 orbitales)
N n=3
quantique orbitale 3s (1 orbitale)
M n=3 m=+1 2pz
l=1 m=0 2py L
L n=2 m=-1 2px
n=2 2px 2py 2pz
2s
l=0 m=0 2s
K
n=1 l=0 m=0 1s K 1s
n=1
Nb d’orbitales par couche = n2
Dès la couche 3d les niveaux énergétiques sont très proches
et il y a interpénétration

Configuration électronique des atomes

c) Répartition des e- sur les orbitales
dans leur état fondamental
Configuration électronique des éléments
Principe d’exclusion de Pauli 2 e-
Ex : Ti = titane (Z = 22)
2 d’un même atome ont des états quantiques différents.
e- 1s2 2s2 2p6 3s2 3p6 4s2 3d2
1 orbitale est définie p
par 3 nbres q
quantiques,
q ,
elle peut contenir au maximum 2 e- Spins anti//
Règle de Hund
Règle de Klechkowski Une orbitale d’une sous-couche donnée n’accepte un
Les e- se placent d’abord sur les niveaux d’énergie les plus 2ème e- que si toutes les orbitales de la même
faibles sous-couche contiennent au moins 1 e-
n 1 2 3 4 5 6 7
s s s s s s s
Ex : N = azote (Z = 7)
p p p p p 1s2 2s2 2p3

d d d
f

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d) Forme des orbitales II – Classification périodique des éléments

Une orbitale est le volume délimité par l’ensemble
des points de l’espace où l’on a 95% de chance Mendeleïev (en 1869)
63 éléments classés en fonction de leur masse
de trouver l’e-,
c’est le domaine de probabilité de présence de l’e-
Classification selon Z
Orbitales s (symétrie sphérique)
Lignes horizontales : périodes
(correspondent aux couches K, L, M …)
py pz
Orbitales p
Colonnes verticales : familles
px

Métaux légers Métalloïdes Gaz Assemblage des atomes

ns1 ns2 np6 rares
EN Éléments de transition liaisons chimiques
H nd10 He 2
Li Be B C N O F Ne 10 Origine de la liaison :
Na Mg d1 d6 Al Si P S Cl Ar 18
K Ca Fe Co Ni Cu Zn Br Kr 36 2 atomes s’unissent pour former une molécule
I si l’énergie de la molécule est inférieure à la somme
des énergies des 2 atomes séparés.

La différence entre ces 2 énergies

g est l’énergie
g de
Famille des alcalins ns1 EN liaison, elle est toujours négative.
Vont perdre 1 e- pour acquérir la structure du gaz rare qui les précède
Famille des halogènes np5
Vont gagner 1 e- (éléments fortement électronégatifs)

Electronégativité augmente de G à D et de bas vers haut

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III) Assemblage des atomes
1) Electrons de valence :
liaisons chimiques
1) Electrons de valence Électrons de valence = électrons en excès par rapport
à la configuration électronique du gaz rare précédent .
2) Liaison covalente – orbitale moléculaire

3) Hybridation des O. atomiques, hybridation du C Seuls les électrons de valence participent à la liaison,
a) sp3 simple liaison en général électrons de la couche externe
b) sp 2 double liaison (parfois l’atome est dans un état excité).
(p )
c) sp triple liaison

4) Molécules conjuguées – Résonance - Aromaticité

Exemples
Exemples (suite)
 colonne 1 Métal alcalin
Na (Z = 11) 1s2 2s2 2p6 3s1 valence 1  Colonne 6 :
Cation monovalent
 colonne 2 Alcalino-terreux O ns2 np4 Valence 2 O2, H2O
Ca (Z = 20) état fondamental 3s2 3p6 4s2 valence 0 S ns2 np4 Valence 2 H2S
état excité 4s1 4p1 valence 2 ns2 np3 (n+1)s1 Valence 4 SO2

 Colonne 4 ns1 np3 (n+1)s1 (n+1)p1 Valence 6 SO3

C (Z = 6) état fondamental ns2 np2 valence 2 (C=O)  Colonne 7 :
état excité ns1 np3 valence 4
Halogènes : F, Cl, Br, I
 Colonne 5 : ns2 np5 Valence 1 HCl
N ns2 np3 valence 3 NH3,
P ns2 np3 valence 3 PH3
ns1 np3 (n+1) s1 valence 5 PCl5

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Métaux légers Métalloïdes Gaz
ns1 ns2 np6 rares •Eléments de transition
EN Éléments de transition
H nd10 He 2
Li Be B C N O F Ne 10
Insaturation des orbitales d
Na Mg d1 d6 Al Si P S Cl Ar 18 Les éléments ont p
plusieurs états d’oxydation
y
K Ca Fe Co Ni Cu Zn Br Kr 36
I Fe (Z=26) 1s2 2s2 2p6 3s2 3p6 4s2 3d6

Famille des alcalins ns1 EN Fe+++ 1s2 2s2 2p6 3s2 3p6 4s0 3d5
Vont perdre 1 e- pour acquérir la structure du gaz rare qui les précède
Famille des halogènes np5
(26-3=23e )
-

Vont gagner 1 e- (éléments fortement électronégatifs)

Electronégativité augmente de G à D et de bas vers haut

2) Liaison covalente – Orbitale moléculaire

Structures de Lewis :
F (Z= 9) 1s2 2s2 2p5
Une liaison covalente entre 2 atomes résulte de la mise en Couche K L
commun d’une paire d’électrons.
2 s2
H2 H. + .H H:H H–H .. ..
. . ...... 2px2 F 2pz1

..
F
..

..
..

.
.
F2 F + F F F F–F
2py2 Mise en commun des 2 e- pz = liaison covalente
O représente
On é t par un trait
t it chaque
h paire
i d’él
d’électrons
t d
de li
liaison
i
Chaque atome de fluor peut être considéré comme ayant 8 e-sur sa
couche externe.

Règle de l’octet

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Chaque atome engagé dans 1 liaison configuration du gaz

Orbitales moléculaires
rare qui le suit dans la classification périodique.
Dans une molécule, l’électron est soumis au
champ exercé par tous les noyaux, il est
Pour la 2ème période remplissage de la couche de valence à 8 e- décrit par 1 fonction d’onde appelée orbitale
structure stable = celle du Ne (2s2 2p6) moléculaire.
Pour la 3ème période, tendance vers la couche de valence à 8e-,
Ce sont des combinaisons linéaires d’orbitales
ex PCl5 10 e- pour P
atomiques de valence des atomes liés entre
eux.
eux

Molécules diatomiques
Molécules diatomiques
1 orbitale s et 1 orbitale p
2 orbitales s
ex : H2 Ex : HF
 1s
_
HA + HB HA HB = HA HB + • x
- +

- OM liante 1s F H

- OM anti-liante 1s - OM liante x

- OM anti-liante x

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HYBRIDATION DES O .A.
Molécules diatomiques
Géométrie de certaines molécules non
2 orbitales p Cl2 expliquée par le recouvrement des 2 O.A de valence.
- Recouvrement axial, liaison sigma OM x Ex H2O py
pz
H
O 2s2 2p4
x H

px
- Recouvrement latéral, liaison  OM 
y y H 1s1

Py Pz angle de 90° or angle = 104°

De même pour NH3

2 angles de 90° or angle = 107°

Dans le méthane : CH4 Dans les molécules carbonées, on retrouve

des angles caractéristiques :
C état excité : 2s1 2p3
109°28’ dérivés saturés
2
2s 2 px 2 py 2 pz

120° dérivés éthyléniques

180° dérivés acétyléniques.

1 liaison 3 liaisons identiques
l différente et perpendiculaires entre elles
Les O.A. sont préalablement orientées, elles sont
hybridées.
Or les 4 liaisons C – H sont équivalentes,
géométrie : tétraèdre régulier

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Hybridation du C 1) Hybridation sp3 ou tétragonale (109°28)

Etat fondamental 1s2 2 s2 2 p2 1 O.A s avec 3 O.A p 4 OA H identiques

(Energies
(E i
identiques)

CH4
Etat excité 1s2 2 s1 2 p3

C tétraédrique : C ayant 4 liaisons simples 2) Hybridation sp2 ou trigonale (angle 120°)

1 O.A s avec 2 O.A p 3 OA H identiques

angles 109°28

3 OA.H pz
H
H H

CH3 – CH3
éthane

Recouvrement axial H
H des orbitales hybrides
H (liaison sigma)

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Hybridation sp2 Exemple : éthylène, C2H4, CH2 = CH2

Recouvrement latéral des orbitales p

(liaison )
H H

120°

H H

3 Orbitales Hybrides coplanaires (angles = 120°)

Recouvrement axial
1 Orbitale p perpendiculaire à ce plan des orbitales hybrides
(liaison sigma)

La liaison  empêche la rotation autour de la simple 3) Hybridation sp ou digonale (angle 180°)

liaison C – C
1 OA s avec 1 OA p 2 OA H identiques
R  R
C=C
R’  R’ 2 OA H py pz

R R

C = C
R’ R’

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Composés acétyléniques : triple liaison
Hybridation sp
H– C C–H 1 liaison 
y y
 2 liaisons 
z z

180°
H H

2 Orbitales Hybrides coplanaires et alignées (angle = 180°) Recouvrement axial d’orbitales hybrides (liaison )

2 Orbitales p perpendiculaires à ce plan et entre elles Recouvrement latéral d’orbitales py (liaison )

py et pz Recouvrement latéral d’orbitales pz (liaison )

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