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CIDOS NUCLEICOS
INTRODUCCIN La funcin primordial de los cidos nucleicos es almacenar y transmitir la informacin gentica, proceso que es la base para poder mantener la identidad de los organismos, sus caractersticas como especie, y las variaciones entre los individuos de la misma especie. Existen dos tipos de cidos nucleicos, los acidos ribonucleicos (ARN) y los desoxirribonucleicos (ADN) que se encuentran en todos los tipos celulares tanto animales como vegetales o bacterias, solamente los virus carecen de los dos, disponiendo bien de ADN o de ARN. La informacin gentica de todas las clulas de un organismo se encuentra almacenada en el genoma o conjunto de genes, que en el caso de las clulas eucariotas se sita en el ncleo celular. El segmento de ADN que contiene la informacin necesaria para la sntesis de un producto biolgico funcional, protena o ARN, se denomina gen. Cualquier clula normal de los organismos pluricelulares tiene miles de genes, dependiendo de la utilizacin parcializada de toda esta informacin, es posible la diferenciacin de clulas y tejidos para conseguir la estructura adecuada y el desarrollo de las funciones correspondientes. Desde el punto de vista qumico, los cidos nucleicos son polmeros lineales de una unidad bsica: el nucletido. Repetida multitud de veces da lugar a unas molculas cuyo estudio, siendo relativamente reciente si lo comparamos con el resto de biomolculas orgnicas, ocupa una buena parte del amplio campo de conocimientos de la biologa molecular.

NUCLETIDOS Los nucletidos son los monmeros bsicos que construyen los cidos nucleicos y qumicamente estn formados por: 1) Bases nitrogenadas 2) Glcidos y 3) Acido fosfrico (que aporta el carcter cido a la molcula y tambin el nombre). Las bases nitrogenadas son molculas cicladas que presentan un alto contenido en nitrgeno. Este tomo puede fijar reversiblemente protones dando el carcter bsico a la molcula, aunque es una base dbil. Hay dos grupos de bases nitrogenadas, segn deriven del anillo de pirimidina, bases pirimidnicas, o del anillo de purina, bases purnicas o pricas. Las bases pirimidnicas son tres: citosina, uracilo y timina, y las bases pricas son dos: adenina y guanina. Mientras que las bases pricas se encuentra en los dos tipos de cidos nucleicos , las bases pirimidnicas no presentan una distribucin uniforme en todos los cidos nucleicos, ya que el uracilo es propio del ARN y la timina del ADN.

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!"#$#%&"'()*%+,'"-%.%&/'0/%!*#,%1*'("2/%3*'2"% Las bases descritas corresponden a las bases principales y mayoritarias presentes en los cidos nucleicos, pero con menor frecuencia tambin aparecen un tipo de bases derivadas de las anteriores o secundarias como son, la metiladenina, metilguanina o hidroximetilcitosina. El glcido que interviene en la formacin de los nucletidos es una aldopentosa, la D-ribosa que se encuentra en los acidos ribonucleicos (ARN), y un derivado reducido de la misma, la 2-desoxiD-ribosa presente en los acidos desoxirribonucleicos (ADN), ambos en su forma ciclada de !-furanosa.

Estructura del nuclesido La molcula formada por el enlace entre la base nitrogenada y la pentosa se denomina nuclesido. El enlace es de tipo N-glicosdico y se establece entre la molcula de pentosa a travs del tomo de carbono 1' (el signo', prima), permite diferenciar los tomos de carbono del anillo de la pentosa de los correspondientes a la base nitrogenada) y por parte de la base, el N 1 N 9 segn sean bases pirimidnicas o pricas respectivamente.

Estructura de un nucletido La molcula de nuclesido se esterifica con cido fosfrico para formar un nucletido, el enlace ster se sita, normalmente, sobre el carbono 5' de la pentosa. La denominacin del nucletido puede hacerse con el nombre del nuclesido del que deriva y la indicacin del fosfato con su posicin. Son molculas cidas, debido a que el cido fosfrico conserva dos grupos funcionales cidos libres. Los grupos fosfato pueden tambin ocupar posiciones diferentes al carbono 5', una de las posiciones en las que puede situarse el fosfato es sobre el carbono 3', incluyendo esta posicin en la denominacin del nucletido. Adems, una caracterstica del cido fosfrico es la capacidad de combinarse consigo mismo, de forma que cuando uno se ha fijado al nuclesido, puede fijarse un segundo y un tercero dando lugar a los nucletidos mono, di y trifosfatados, abreviadamente NMP o dNMP, si es uno el fosfato, NDP o dNDP, si son dos, o NTP o dNTP, si son tres los grupos fosfato incorporados. Cada uno de estos grupos fosfato se denominan ", ! y # segn se sitan de la posicin ms prxima a ms lejana al C 5'.

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!"#$#%&"'()*%+,'"-%.%&/'0/%!*#,%1*'("2/%3*'2"% Funciones de los nucletidos Los nucletidos constituyen las piezas elementales en la construccin de los cidos nucleicos, pero algunas de estas molculas presentan funciones biolgicas por s mismas. Los ribonucletidos deridados de la adenosina (ATP, ADP y AMP), intervienen en todos los intercambios de energa metablica que se desarrollan en el interior de la clula, ya que la rotura de los enlaces de los grupos fosfato (especialmente el del grupo #) proporciona un gran desprendimiento energtico. En algunos ribonucletidos el grupo fosfato establece un enlace no slo con el carbono 5' sino tambin con el 3', formando un anillo, y dando lugar a una serie de ribonucletidos cclicos, que desarrollan importantes funciones de segundo mensajero para la accin de las hormonas, participando en la regulacin del metabolismo celular. Los ms comunes son el AMPc (AMP cclico), y el GMPc (GMPcclico). Existen por ltimo nucletidos que forman parte de la estructura de otras molculas ms complejas, como los coenzimas NAD (nicotinamida adenina dinucletido), FAD (flavina adenina dinucletido) y coenzima A (fig.8-6), con importantes funciones en la catalizacin enzimtica.

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!"#$#%&"'()*%+,'"-%.%&/'0/%!*#,%1*'("2/%3*'2"% POLINUCLETIDOS Para formar un polmero de nucletidos stos deben unirse entre s de forma fuerte, covalentemente, para asegurar la estabilidad de la macromolcula, de igual manera que los aminocidos se enlazaban en la cadena peptdica. Los enlaces se denominan nucleotdicos y son uniones fosfodister, realizados a travs del grupo fosfato, que enlaza el carbono 5' de un nucletido con el carbono 3' de un segundo nucletido. Los grupos fosfato a pH 7 estn cargados negativamente, y el ADN y ARN son por lo tanto compuestos de carcter cido, tal como indica su nombre. Este tipo de enlace permite la creacin de un esqueleto de la cadena construido por las pentosas y los grupos fosfato alternantes, las bases nitrogenadas que no participan en el enlace quedan a manera de radicales y su sucesin forma la secuencia de bases. La unin da lugar a una cadena nucleotdica que por convencin comienza por el extremo 5' a la izquierda y termina por el extremo 3' a la derecha. Una cadena de menos de 50 nucletidos se denomina oligonucletido. Para describir la estructura de los cidos nucleicos se utiliza el mismo sistema que para las protenas. Se divide el anlisis en sucesivos niveles de complejidad que se van superponiendo con el objeto de determinar la conformacion o arquitectura espacial de la macromolecula. Los niveles de estructura reciben el mismo nombre que en el caso de las protenas, y son: - Estructura primaria o secuencia de nucletidos (o bases) que forman la molcula del cido nucleico. Por convenio, se comienza por el carbono 5' libre de la cadena hasta alcanzar el extremo 3' libre. - Estructura secundaria o disposicin espacial de los nucletidos consecutivos. - Estructura terciaria o conformacin global de la molcula.

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!"#$#%&"'()*%+,'"-%.%&/'0/%!*#,%1*'("2/%3*'2"% ADN El ADN es la molcula depositaria de la informacin gentica. Son estructuras filamentosas muy largas pero flexibles. Los cromosomas estn formados por una sola molcula tremendamente larga de ADN que contiene millones de nucletidos, la secuencia de estos nucletidos almacena toda la informacin gentica del individuo. En las clulas eucariotas se localiza bsicamente en el ncleo, aunque hay tambin una cantidad bastante ms inferior a nivel de las mitocondrias (1%).

Estructura del ADN La estructura primaria consiste en la secuencia de nucletidos de la cadena polinucleotdica y se caracteriza por estar formada por desoxirribonucletidos, cuyas bases son A, G, C y T. En los trabajos de Chargaff, se haba mostrado la relacin que exista, prxima a la unidad, entre el nmero de bases pricas y el de pirimidnicas. Las molculas de ADN presentan diferentes tamaos dependiendo de la clula u organismo del que procedan. Normalmente el tamao del ADN se expresa en el nmero de pares de bases, y debido a los valores tan elevados que aparecen, se utiliza una unidad que es la kilobase que corresponde a 1000 pares de bases, as una molcula de ADN de Escherichia coli tiene 4200 kilobases, y una longitud que sera de 1 mm., superior al tamao de la bacteria, lo que implica que la molcula debe encontrarse empaquetada para ocupar el menor espacio posible. Richard Wheeler (Zephyris)) La estructura secundaria del ADN fue establecida por Watson y Crick en 1953, a partir de varios estudios previos en los que se haba cuantificado las proporciones entre las bases nitrogenadas y se haban realizado medidas entre las posiciones de los tomos mediante difraccin de rayos X. Los postulados de este modelo son: 1) La forma ms habitual de la molcula de ADN es una estructura de doble hlice, formada por dos cadenas polinucletidicas enrolladas en forma espiral sobre un eje longitudinal imaginario. 2) Las dos cadenas se sitan en sentido antiparalelo, sus extremos no son coincidentes, la direccin de una cadena se dice que es 5' a 3' y la paralela 3' a 5'. 3) En el exterior quedan los esqueletos de las cadenas (pentosas-grupos fosfato) y hacia el centro, perpendicularmente al eje, se colocan las bases. 4) Las cadenas se mantienen unidas mediante puentes de hidrgeno establecidos entre las bases nitrogenadas. La unin entre las bases sigue el principio de complementariedad, una base prica se enlaza con una base pirimi-

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!"#$#%&"'()*%+,'"-%.%&/'0/%!*#,%1*'("2/%3*'2"% dnica, en concreto la adenina con la timina a travs de dos puentes de hidrgeno y la guanina con la citosina.a travs de tres puentes, manteniendo constante la anchura de la hlice, unos 20 A. 5) La hlice es dextrgira, gira sobre su eje mayor hacia la derecha, siendo el paso de rosca de la hlice de 34 A, que corresponde a 10 nucletidos o 10 pares de bases, separadas 3,4 A medido a lo largo del eje de la hlice. 6) La hlice presenta dos surcos de distinta anchura, el surco mayor y el menor. La estructura descrita corresponde a la forma denominada B-ADN o de Watson y Crick, la forma mayoritaria en condiciones fisiolgicas. Se han descrito tambin otras estructuras que posiblemente corresponden a cambios de conformacin cuando se desarrollan algunas de las funciones de la molcula. La flexibilidad de la hlice permite estos cambios de forma, proporcionando una idea del dinamismo y la capacidad de modificacin que presenta el ADN.

A-DNA, B-DNA y Z-DNA ( Richard Wheeler).

La forma A-ADN, se encuentra en uno de los pasos de la transmisin de la informacin, cuando se forma un hbrido de ADN-ARN. Es una hlice dextrgira ms corta y ancha que el B-ADN, donde las bases se sitan ms inclinadas con respecto al eje de la hlice. La forma Z-ADN, se denomina as por la disposicin en zig-zag de los grupos fosfato, es una hlice levgira ms larga y estrecha que el B-ADN, y su funcin an est por clarificar. La prdida de los enlaces de hidrgeno que sostienen la estructura secundaria produce la desnaturalizacin del ADN. Puede realizarse experimentalmente por elevacin de la temperatura o del

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!"#$#%&"'()*%+,'"-%.%&/'0/%!*#,%1*'("2/%3*'2"% pH, y consiste en la separacin de las hebras; el proceso es reversible y pueden volver a formarse los enlaces o a renaturalizarse. La estructura terciaria de la molcula de ADN puede en una primera aproximacin, adoptar dos tipos, el ADN circular (ADN bacteriano, vrico o mitocondrial) en el que los extremos de las cadenas estn unidos; o bien, el ADN lineal, mayoritario en clulas eucariotas, con extremos libres. Tanto uno como otro experimentan plegamientos para formar estructuras ms compactas. Las curvaturas o torsiones de la doble hlice aparecen con secuencias ricas en adenina, permitiendo cambios de direccin especficos, en algunos casos el giro es causado por la unin con protenas. Las secuencias de ADN con repeticiones invertidas o palindromos (como en los trminos solos o radar, que pueden ser ledos indistintamente de derecha a izquierda o de izquierda a derecha) pueden formar horquillas y estructuras en cruz en el ADN. En las molculas de ADN circulares existen superenrollamientos, que pueden ser positivos o negativos segn coincidan o no con la direccin de la doble hlice. Uno de los sistemas que utilizan las largusimas molculas de ADN lineal para empaquetarse es utilizar protenas nucleares, siendo las histonas las ms abundantes. Las histonas son protenas de pequeo tamao, que por su composicin aminoacdica, abundantes en arginina y lisina, estn cargadas positivamente. Existen cinco tipos de histonas denominadas H1, H2A, H2B, H3 y H4.

Epigenetic mechanisms ( National Institute of Health).

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!"#$#%&"'()*%+,'"-%.%&/'0/%!*#,%1*'("2/%3*'2"% Dos copias de las histonas H2A, H2B, H3 y H4 se asocian formando un complejo octamrico sobre el que se enrolla en dos vueltas un segmento de ADN de 146 pares de bases, formando una unidad de empaquetado denominada nucleosoma. El ADN que queda entre nucleosoma y nucleosoma, puede tener de 4 a 104 pares de bases, se denomina ADN espaciador y se relaciona con la histona H1; en el hombre el ADN espaciador tiene entre 30 y 40 pares de bases, aunque en algunos tipos celulares como las neuronas casi no hay. Largas cadenas de nucleosomas, a manera de cuentas de un collar forman la fibra bsica de cromatina, que se pliega formando una hlice con 6 nucleosomas por cada vuelta denominada fibra gruesa de cromatina. Contina el empaquetamiento mediante diversos grados de superenrollamiento aadidos, en los que participan otras proteinas nucleares no histonas, logrando de esta forma el mximo grado compactacin, formando la eucromatina que ocupa un espacio reducido, unas 100 veces menor que la molcula totalmente distendida.

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!"#$#%&"'()*%+,'"-%.%&/'0/%!*#,%1*'("2/%3*'2"% ARN Las molculas de ARN son ms ubicuas y variadas que las de ADN, se encuentran tanto en el ncleo como en el citoplasma celular, existiendo molculas de ARN que pueden ser diferenciados por su localizacin, tamao, conformacin y funcin.

Caractersticas estructurales del ARN La estructura primaria del ARN es una sola cadena polinucleotdica, (son monocatenarios), formada por ribonucletidos, cuyas bases son A,G,C y U. En algunos tipos de ARN son frecuentes las bases secundarias y las modificadas qumicamente. Las molculas de ARN tienen en su composicin cantidades de bases muy variadas, y a diferencia del ADN no hay ninguna relacin numrica entre ellas. La longitud de la cadena va de los ARN ms pequeos con unos 70 nucletidos hasta los ms grandes de ms de 10.000. La estructura secundaria se forma a travs de determinados segmentos de la cadena, complementarios y antiparalelos, que emparejan sus bases mediante puentes de hidrgeno intracatenarios. Estas regiones bicatenarias se denominan horquillas y son el tipo ms comn de estructura secundaria, las regiones monocatenarias aisladas por las horquillas son los bucles o lazos. De todos los ARNs descritos, los que mejor caracterizados estn son los ARN de transferencia, Su estructura primaria formada por una cadena de nucletidos relativamente corta, ha permitido conocer sus secuencias y sus siguientes niveles de estructuracin. La estructura secundaria es muy parecida en todos ellos, a travs de enlaces intracatenarios entre las bases adopta una forma denominada en hoja de trbol.

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!"#$#%&"'()*%+,'"-%.%&/'0/%!*#,%1*'("2/%3*'2"% La estructura terciaria corresponde a plegamientos de la molcula, de los cuales se conoce relativamente poco. De todos ellos slo los mismos ARNt estn bien caracterizados, conocindose la posicin en el espacio de las horquillas y bucles con una forma que se describe como L compacta.

Tipos de ARN El ARN es el cido nucleico ms abundante en la clula. Las funciones de los ms importantes seran: 1) ARN nuclear heterogneo (ARNnh), localizado en el ncleo, es el que presenta un mayor tamao molecular ya que es la molcula origen del resto de los ARN celulares. Al fragmentarse se obtienen el resto de los ARNs. 2) ARN nuclear pequeo (ARNsn), situado en el ncleo como el anterior es de menor tamao, de ah su nombre (s de small, pequeo) y presenta actividad cataltica. 3) ARN ribosomal (ARNr), es una de las molculas que componen los ribosomas, es el ms abundante de todos ellos (75%) y en cada ribosoma se encuentran en grandes cantidades y tipos que se distinguen y nombran por su tamao. 4) ARN de tranferencia (ARNt), es uno de los menores ARNs ya que est formado por unos 85 nucletidos, intervienen en la sntesis de protenas permitiendo que los aminocidos se unan con la secuencia correcta. 5) ARN mensajero (ARNm), de tamaos muy variados es el responsable del trnsito de informacin entre los genes y las protenas. Si la informacin que lleva el ARNm sirve para sintetizar ms de un polipptido se le denomina ARNm policistrnico. En el caso de las clulas eucariotas, el ARNm es monocistrnico ya que slo lleva informacin para un polipptido. 6) Existen tambin numerosos virus que contienen ARN como nico material gentico.

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!"#$#%&"'()*%+,'"-%.%&/'0/%!*#,%1*'("2/%3*'2"% TRANSMISIN DE LA INFORMACIN GENTICA La informacin gentica que caracteriza a una especie y a un individuo de la misma, est contenida en el ADN y dentro de ste, en las secuencias de bases que contienen la informacin para la sntesis de protenas. El trasvase de informacin desde unas molculas a otras, se realiza en dos pasos y con la participacin de molculas intermediarias. Estas dos etapas se denominan transcripcin y traduccin. La transcripcin consiste en el paso de informacin desde un segmento concreto de la molcula de ADN (gen), a una molcula de estructura muy similar que es el ARNm , el cual tambin va a utilizar para transportar la informacin una secuencia de bases. La traduccin consiste en el paso de la informacin dada en secuencia de bases, a una informacin dada en secuencia de aminocidos, correlacionando las diferentes combinaciones de bases con el correspondiente orden de aminocidos en la protena. Por ltimo la capacidad de pasar la informacin gentica de padres a hijos, o bien slo entre las consecutivas generaciones celulares en el mismo organismo, es posible realizarlo a travs de la duplicacin del material gentico que se denomina copia o replicacin del ADN.

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