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Tutorial Chemsketch

Chemsketch es un programa para dibujo avanzado en Qumica. til para dibujar


estructuras qumicas, reacciones y esquemas.
Modo Estructura (Structure Mode) para dibujar estructuras qumicas y calcular sus
propiedades.
Modo Dibujo (Draw Mode) para texto y procesamiento de grficos.
Propiedades Moleculares (Molecular Properties) clculos para la estimacin automtica
de:
Peso frmula
Composicin en porcentaje
Refractividad molar
Volumen molar
Parachor
Indice de refraccin
Tensin superficial
Densidad
Constante dielectrica
Polarizabilidad
Masa monoisotopica, nominal y promedio.

Para comenzar!

1. Iniciar el programa.
2. En la esquina superior izquierda se elige el modo: Structure- Draw .

Modo Estructura

Dibujar molculas

Para dibujar un tomo debemos tener seleccionado el modo de dibujo normal.


En las herramientas de la izquierda de la pantalla podemos seleccionar los tomos
con los que queremos trabajar

tomos
Radicales
Tabla
peridica
Si queremos trabajar con un elemento que no est en la lista de la izquierda, en la
parte superior de la misma podemos seleccionar una tabla peridica, y cliqueando en
el elemento podemos seleccionar el que queramos.
Adems al seleccionar un elemento en esta tabla nos brinda informacin del mismo
como su nombre, masa atmica promedio, el nmero de valencia, el nmero
atmico y la configuracin electrnica. Tambin sus caractersticas, cmo se
encuentra en la naturaleza, una foto de cmo se ve y muchas cosas ms.

Actividad 1. Probemos encontrar el iodo. Cmo se ve en la foto? Quin fue su
descubridor? Cul es su punto de ebullicin (boiling point)? Cules son sus
istopos? Cuales son radiactivos? Cul es su vida media? En qu estado de
agregacin lo encontramos en la naturaleza?

Ahora a dibujar!

Cuando dibujemos un tomo, el programa por defecto lo asociar a los hidrgenos
que correspondan, por ejemplo si dibujamos un tomo de carbono estar asociado a
4 H. Pero al ir asocindolo con otros tomos cambiar un H por un enlace simple.

Actividad 2. Probemos dibujar el O2. (O=O)

Tocamos el smbolo del O en la columna de la izquierda y luego pinchamos en el
centro de la pantalla. Aparece cmo queremos?
Llevamos otro tomo de O y lo colocamos a una distancia corta del primero. Nos
apoyamos en uno y vamos con el botn izquierdo del mouse apoyado hasta el otro
para formar un enlace simple entre los dos. Obtuvimos la molcula como la
queremos?
Para lograr el doble enlace repetimos lo que hicimos recin, tocamos un O y
arrastramos el mouse hasta el otro. Ahora s tenemos nuestra molcula.

Con la herramienta 3D-Viewer podemos ver la molcula en 3D.
Se nos abre una nueva ventana con nuevas posibilidades:









Ahora podemos calcular la distancia de los enlaces: seleccionamos un tomo (se
pone verde), seleccionamos el otro y se abre una ventana que nos dice la distancia
entre los tomos. Podemos tambin desde esta ventana modificarlo.
De la misma manera podemos calcular el ngulo entre tres tomos seleccionndolos.
Actividad 3. Probemos calcular la distancia ptima entre los tomos de O.
Diferentes opciones
para ver las molculas
Diferentes opciones
para mover las
molculas
Distancia de enlaces
Angulo entre tomos
Optimizar estructura
tridimensional

Volvamos al chemsketch.
Actividad 4. Podrn hacer la molcula de CO2? (O=C=O)
Calculemos ahora la distancia ptima de este nuevo doble enlace y el ngulo entre
los tomos que lo forman.
En caso que queramos borrar un tomo tenemos que tocar la goma y luego el
tomo.



Si queremos dibujar una molcula ms compleja, como un alcano o luego un lpido
con una cadena carbonada podemos utilizar la herramienta. Tambin podemos
agregar un radical como un grupo cido utilizando la lista de radicales que
encontramos a la derecha de la pantalla.
Actividad 5. Intentemos ahora algo ms complicado como la vitamina A o retinol:



Tambin podemos trabajar con estructuras que ya estn dibujadas. Para eso,



Y ah elegimos alguna molcula. Por ejemplo podemos buscar la vitamina A. Les
sali parecida?

Actividad 6. Pegar algunos nucletidos y hacer una cadena de RNA o DNA. Ej: A-
C-T/U-G

Actividad 7. Pegar los aminocidos necesarios y hacer una molcula de aspartame,
que se utiliza como endulzante.

Para guardar las molculas, tanto en el Chemsketch como en el 3D viewer:



Pueden directamente utilizar el botn del men o ir a File- Save as y guardar los
archivos con el nombre que deseen.
Para imprimir, o desde el men o File- Print.
Finalmente se pueden guardar en formato pdf desde el men.
Guardar
Imprimir
Hacer archivo pdf