MASTER Fonctionnement des Ecosystmes et Anthropisation

Biosciences de l'Environnement
PROTECTION DES CULTURES
Septembre 2007
Grgory DECHAMP-GUILLAUME
Professeur de phytopathologie et malherbologie
(dechamp@ensat.fr)
Plan du cours
Introduction et terminologie
tiologie des maladies parasitaires
Les enjeux de la protection des cultures
Les solutions actuelles
Introduction et Terminologie
Ennemis des cultures
= bio-agresseurs
Champignons
Bactries
Phytoplasmes
Virus
Virodes
Vgtaux
Insectes
Acariens
Nmatodes
Mammifres
Oiseaux
Annuelles
Bisannuelles
Vivaces
Phytopathologie
Pathologie vgtale
Phytiatrie
Phytopathology
Plant pathology
Plant disease
Zoologie
Zoology
Malherbologie
Weed science
Parasites Ravageurs Mauvaises herbes
Hampes florales d orobanche
dans un champ de tournesol
Exemples de plantes parasites
Luzerne parasite par de la cuscute
33.7 9.7 12.2 11.8 Toutes cultures
23.4 3.0 7.8 12.6 Fruits
32.4 4.0 6.5 21.8 Pomme de terre
34.5 11.4 13.9 9.2 Crales
Pertes
totales
(%)
Pertes dues
aux
mauvaises
herbes (%)
Pertes dues
aux insectes
(%)
Pertes dues
aux maladies
(%)
Cultures
Pertes estimes des productions agricoles mondiales (estimation 1993) :
En absence de toute lutte, les pertes potentielles dues aux maladies,
aux animaux ravageurs et aux plantes adventices atteignent selon la culture
et la zone gographique concerne entre 50 et 80% de la production potentielle.
26.8 19.0 Fruits
32.0 22.4 Pomme de terre
46.1 17.8 Crales
Pertes totales en voie
de dveloppement (%)
Pertes totales pour
les pays dvelopps
(%)
Cultures
Pertes estimes des productions agricoles (estimation 1993) :
Autre estimation FAO : 30% > 50%
Typologie des pertes de rcoltes occasionnes par les bio-agresseurs
de peuplements cultivs :
L'objectif ultime de la protection des cultures est de rduire les pertes de
rcoltes occasionnes par les bio-agresseurs
Terminologie
Dgts : altrations du produit rcolt
ou du potentiel de production
Pertes de rcolte (=dommages) : dgts
exprims en terme montaire
Exemple 1
Pourriture de tubercules
de pomme de terre
Symptmes ?
Dgts ?
Pertes ?
Qu en pensez- vous ?
Exemple 1
Symptmes : oui, le phnotype des tubercules
nest pas normal
Dgts : oui, le rendement est rduit
Pertes : oui, les tubercules pourris ne sont pas
commercialisables
Exemple 2
Balai de sorcire chez du trfle
(= dveloppement des bourgeons
axillaires suite la perte
de la dominance apicale)
Symptmes ?
Dgts ?
Pertes ?
Qu en pensez- vous ?
Exemple 2
Symptmes : oui, le phnotype est modifi
Dgts :
-Non, en cas de culture fourragre, les pertes
de biomasse sont peu importantes
-Oui, sil sagit dune production de graines
Pertes :
-Non, dans le cas de la culture fourragre
-Oui, sil sagit d une production de graines
Exemple 3
Symptmes ?
Dgts ?
Pertes ?
Panachure chez une plante de tulipe
virose dont la coloration est
normalement unie
Qu en pensez- vous ?
Exemple 3
Symptmes : oui, le phnotype est
certainement modifi par linfection virale
Dgts : non, la production est toujours
commercialisable
Pertes : non, certains consommateurs
apprcient ce phnotype qui peut mme donner
une valeur accrue la fleur
Phnotype** observ
Phnotype attendu
= Symptme
Gnotype* mis en culture
ENVIRONNEMENT
BIOTIQUE
ENVIRONNEMENT
ABIOTIQUE
Terminologie
* Patrimoine hrditaire dun individu. Ensemble des allles
dun individu ports par lADN dune cellule vivante.
** Ensemble des caractres anatomiques, morphologiques et
physiologiques caractrisant un tre vivant donn. Ralisation
du gnotype est fonction de certaines conditions spcifiques du milieu
Etiologie*
des maladies parasitaires
*L'tiologie dfinit l'origine d'une pathologie en fonction des manifestations smiologiques**.
*Smiologie : tude des symptmes et des signes et de la faon de les relever et de les prsenter afin de poser
un diagnostic.
Caractres gnraux des
champignons phytopathognes
- Parasites les plus importants
- Parasites facultatifs* ou parasites obligatoires***
- Infection directe, par orifices naturels ou par blessures
- Spcifiques ou polyphages (gamme dhtes)
- Champignons vrais : - ascomyctes
- basidiomyctes
- deutromyctes
- Organismes fongiformes : - oomyctes
- Dissmination : vent, eau, manipulations
* Saprophytes** et parasites, biotrophes ou ncrotrophes
** Organisme dont la nutrition est assure directement partir de matires organiques en dcomposition
*** Strictement parasites, biotrophes stricts (relation trophique tablie avec cellule vivante)
Deux modes de reproduction
des champignons
Reproduction
asexue
Reproduction
sexue
++++
+
Conservation
+ + + +
+
Dispersion
Tlomorphe
Anamorphe
1845, lagent du mildiou de
la pomme (Phytophthora
infestans), originaire
dAmrique latine, est
introduit accidentellement
en Irlande...
Exemple de maladie fongique
L ergot des crales
Ces sclrotes contiennent des alcalodes toxiques (parmi
lesquels l'acide lysergique*) dont l'absorption provoque des
affections convulsives (le feu sacr) ou gangreneuses
(dformations et ncroses des membres) pouvant conduire
la mort des personnes ou des animaux intoxiqus.
L'histoire a retenu maints souvenirs
de cas d'ergotisme gnralis,
lis aux priodes de disette,
notamment au Moyen Age. En 1722,
l'ergot du seigle aurait provoqu
l'effondrement de l'arme du tsar
Pierre le Grand de Russie, en marche
vers la Turquie. L'un des derniers
cas d'ergotisme eut lieu en 1951
Pont Saint-Esprit (France).
.
* : Lyserg Sure Diethylamid
Exemple de maladie fongique
Exemples de maladies fongiques
Phytophthora infestans
Plasmopara helianthi
Plasmopara viticola
Mildiou
Exemples de maladies fongiques
Odium
Sphaerotheca fuliginea
Erysiphe cichoracearum
Erysiphe cichoracearum
Uncinula necator
Exemples de maladies fongiques
Puccinia recondita
Rouille
Phragmidium disciflorum
Exemples de maladies fongiques
Charbon commun
(Ustilago maydis)
Charbon des inflorescences
(Sporisorium reilianum zeae)
Exemples de maladies fongiques
Pourriture grise
(Botrytis cinerea)
Fusariose
(Fusarium spp.)
Criblure du pcher (Coryneum beijerinckii)

Pyrales adultes
Larve de pyrale
Pourriture grise de la vigne
(Botrytis cinerea)
Exemples de maladies fongiques
Pourriture de raisins en conservation
(Botrytis cinerea)
Tordeuse de la grappe
Pitin chaudage du bl
(Gaeumannomyces graminis)
chaudage (pis de droite)
(symptme secondaire
= symptme consquence)
Pourriture racinaire
(symptme primaire
= symptme cause)
Pourriture Sclerotinia sur carotte
Photo FUSAGx
Pourriture de pommes en conservation
Exemples de maladies fongiques
La maladie des taches noires du rosier
(Marssonina rosae)
Exemples de maladies fongiques
Exemple de maladies fongiques
Pourridi agaric
(Armillaria mellea)
Caractres gnraux des
bactries phytopathognes
- La plupart des bactries phytopathognes sont des parasites facultatifs
- Les bactries phytopathognes sont des bacilles (btonnets allongs)
- Spcifiques ou polyphages (gamme dhtes)
- Infection par orifices naturels ou blessures
- Lutte difficile : antibiotiques interdits en France
- Dissmination : eau, vecteurs
Exemples de maladie bactrienne
Exsudats bactriens (ooze) sur orge
(Xanthomonas campestris pv. translucens)
Ncrose bactrienne sur haricot
(Xanthomonas campestris pv. phaseoli)
(Pseudomonas syringae pv. phaseolicola)
(Pseudomonas syringae pv. syringae)
Le feu bactrien des rosaces
Rameau atteint par
le feu bactrien
Dprissement dun
jeune cognassier
Charpentire taille
et tronc cur
Erwinia amylovora
Exemple de maladie bactrienne
Tumeur dAgrobacterium tumefaciens
Caractres gnraux des virus
phytopathognes (=phytovirus)
- Diagnostic difficile
- Ce sont des parasites obligatoires
- Linfection ncessite une blessure
- Spcifiques ou polyphages (gamme dhtes)
- Dissmination : manipulations, vecteurs
- Lutte difficile : - pas de traitements chimiques
- thermothrapie, prmunition
- prophylaxie*
- slection sanitaire
- varits rsistantes
*Prophylaxie : processus actif ou passif ayant pour but de contrecarrer l'apparition ou la
propagation d'une maladie
Exemple de maladie virale
Virus de la mosaque
de lorge
Symptmes foliaires
Particules virales
Virus de la mosaque dore
du haricot
(BGMV)
Mosaque virale sur courgette
Exemple de maladie virale
Agents non parasitaires (physiques-chimiques)
Climat
Froid, chaud, scheresse, excs de
prcipitation, grle, foudre, vent, neige
Nutrition
Dsquilibres, carences, excs, pH, salinit,
toxiques naturels
Pollution
Atmosphrique (SO
2
, F, etc), sols, eaux
(nitrate, pesticides), poussires industrielles
(Pb, Zn), pesticides (herbicides)
Agents parasitaires
Virus, virodes
Bactries, phytoplasmes, protozoaires,
champignons, phanrogames non
chlorophylliens,
Phanrogames chlorophylliens
Synthse des causes des maladies
chez les plantes
Parasites facultatifs
ou obligatoires
Les enjeux de la protection
des cultures
- Limiter les pertes de rendement
- Limiter les dgradations qualitatives des productions vgtales :
- Aspect (ex : taches sur fruit)
- Got (ex : vin)
- Etat sanitaire (ex : mycotoxines, LSD)
Amlioration de la production
Prserver lenvironnement
- Eaux (ex : atrazine)
- Sols (ex : cuivre, lindane)
- quilibres naturels (ex : imidaclopride)
www.srpv-midi-pyrenees.com
www.gramip.fr
Prserver lenvironnement
- Transport des produits phytosanitaires
- Stockage des produits phytosanitaires :
- Prparation des bouillies, rglage des buses, rinage des cuves
- Recyclage des dchets de produits phytosanitaires :
Prserver du manipulateur
Equipements de Protection Individuelle
Produit phytosanitaire
= biocide
Rsultats conomiques de lUIPP
(Union des Industriels de la Protection des Plantes)
http://www.uipp.org
Rpartition du march mondial 2006 par rgion du monde et par catgorie de produits
Les principaux marchs phytosanitaires en 2005
(en millions deuros)
Monde Europe
Evolution du chiffre daffaires des campagnes
agricoles par famille de produits
(en millions deuros)
Tonnage des substances actives
vendues de 1999 2006
Situation actuelle en France
Les ventes en France en 2006 :
Depuis 1999, un march structurellement en baisse.
Une baisse moyenne des utilisations estime 2,2 % par an.
Une baisse cumule des ventes aux distributeurs de 13 %.
Une baisse cumule des tonnages vendus de 40,5 %.
Campagne agricole 2005 / 2006 :
Baisse de 6,4 % par rapport la campagne prcdente ( 1,747 milliards deuros).
Rsulte de facteurs structurels (agriculture raisonne, pressions rglementaires et conomiques) et de
facteurs conjoncturels (conditions climatiques et faible parasitisme).
Fongicides : - 9%
Conditions climatiques (hiver long, un mois de mai marqu par de la pluie et du vent, et un mois de juin chaud
et sec) ont stopp la progression des maladies sur lensemble des cultures.
Herbicides : - 4%
Raisonnement des programmes de dsherbage tant en automne quen sortie dhiver, lie aux conditions
climatiques et au faible salissement des parcelles (crales). Sur mas, changement de comportement,
rduction des surfaces et bonne efficacit des traitements de pr-leve.
Insecticides : 13 %
Tous les marchs (crales, vigne, colza) ont t marqus par une pression des ravageurs faible trs faible.
Analyse de lUIPP
http://e-phy.agriculture.gouv.fr/
Les solutions actuelles
Les produits phytosanitaires
- Retrait de lhomologation de produits dangereux :
- arsenite de sodium (Esca)
- organo-chlors (insectes)
- Disparition de 20 30% des produits phytosanitaires (Europe)
- Rduction des doses de matires actives :
- 1950 : 1000g/ha
- aujourdhui : <100g/ha
- Rduction des volumes de bouillies (ULV < 5L/ha)
- Produits large spectre (ex : strobilurines)
Pulvrisateur
rampe
Pulvrisateur
rampe
Pulvrisateur atomiseur
Les produits phytosanitaires
- Stimulateurs de dfenses naturelles (SDN)
- acide salicylique
- extraits dalgues
- Formulations plus sres pour le manipulateur
- formulations liquides
- formulations en granuls dispersibles
Le raisonnement de la lutte
- Estimation du risque lchelle de la parcelle pour raisonner
les traitements et donc viter la lutte chimique systmatique
- Intrts : - environnement et conomies
- gestion des rsistances
- Le bon produit, au bon moment, sur la bonne cible
- Diagnostics plus rapides et plus fiables
- Prvision de lapparition et du dveloppement des problmes
phytosanitaires :
- modles de prvision
- avertissements agricoles
Exemple de prvision du risque maladie
Avertissements agricoles
Mode daction des fongicides
Comportement des produits phytosanitaires
au niveau des plantes
Effet des fongicides sur les diverses phases
du cycle pidmique de base
dun champignon pathogne
Produit phytosanitaire :
- nom commercial
- matire(s) active(s)
- adjuvants
Mode daction des fongicides
MALADIE MALADIE
(interaction) (interaction)
A
G
E
N
T

P
A
T
H
O
G
E
N
E
A
G
E
N
T

P
A
T
H
O
G
E
N
E
P
L
A
N
T
E

H
O
T
E
P
L
A
N
T
E

H
O
T
E
Virulence / Avirulence
Agressivit
Disponibilit
Rsistance / Sensibilit
Tolrance
Rceptivit
ENVIRONNEMENT ENVIRONNEMENT
Facteurs biotiques
Facteurs abiotiques
La prvision du risque maladie
Relations compatibles et
incompatibles
Arrt
Non
pntration
Tolrance Rsistance
Incompatibilit Compatibilit
Arrt
Sensibilit
La relation parasitaire
compatible aboutit
une multiplication active
du pathogne
et une colonisation de
tout ou partie de l'hte
par ce dernier
La relation parasitaire
incompatible correspond
un arrt prcoce de
la croissance
du parasite et de la
colonisation de l'hte
Les processus exponentiels et monocycliques rsultent la fois d'un influx initial et de
processus monocycliques successifs, tandis que ces derniers font dfaut dans le cas de
dynamiques mono-cycliques. Les dynamiques polytiques rsultent de lenchanement (au
cours de gnrations d'htes successifs, au cours des annes ou des saisons) de
dynamiques monocycliques (d) ou polycycliques (e).
Dynamiques exponentielle (a),
monocyclique (b), polycyclique (c), et
polytiques (d, e)
Les flches de grande dimension en dbut de
cycle reprsentent un influx, ou la
mobilisation, de populations initiales. Les
flches en boucle reprsentent des
processus monocycliques
Typologie des cycles biologiques des bio-agresseurs
- Insectes / insectes : (lutte biologique sensus stricto en entomologie)
- insectes aphidiphages (coccinelles, syrphes)
- Champignons / ravageurs :
- Beauveria contre chenilles
- Bactries / ravageurs :
- Bacillus thuringinsis contre chenille de la processionnaire du pin
- Virus / insectes :
- Carpovirusine contre carpocapse
- Champignons / champignons :
- Coniothyrium minitans contre Sclerotinia
- Champignons / mauvaises herbes : rtropathologie
- mycoherbicides
La lutte biologique
Syrphe adulte
Larve de syrphe avec des pucerons
Larves de syrphe en action de
prdation contre des pucerons

Pyrales adultes
Larve de pyrale
Larve de pyrale parasite
par Beauveria
Chenille de la processionnaire du pin
Carpocapse du pommier
La protection intgre
- Principe : limiter le plus possible les traitements chimiques
- Prophylaxie :
- emploi de matriel vgtal sain
- limination des dchets de culture
- Mthodes culturales :
- assolements, rotations
- varits rsistantes ou tolrantes
- dates de semis
- manipulations
- fumures et amendements
- alimentation en eau
- Mthodes biologiques
- Mthodes biotechniques (RCI, confusion sexuelle)
Intensifier = fragiliser le systme de
production
htrognit
(diversit)
rotation
rsistance
partielle
environnement
adapt
homognit
(uniformit)
monoculture
rsistance
extrme
environnement
prdisposant
Productivit faible mais stable
(peu d'intrants)
Productivit leve mais fragile
(intrants nombreux)
http://www.inra.fr/internet/Produits/HYP3/index.html
http://www.inra.fr/internet/Produits/HYPPZ/index.htm
http://www.dijon.inra.fr/malherbo/hyppa/hyppa-f/hyppa_f.htm
Parasites :
Mauvaises herbes :
Ravageurs :
Guide pratique de dfense des culture, Editions ACTA
Phytopathologie, Philippe Lepoivre, Les Presses Agronomiques de Gembloux
http://www.fsagx.ac.be/pp/Phytopat/Partie0/AccueilCD.htm
Plant pathology, George N. Agrios, Academic press
Bibliographie
Livres :