Curso de Microbiología General

de Enrique Iáñez
UBICACIÓN DE LOS MICRORGANISMOS
EN EL MUNDO VIVO
.
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Contenidos
ENCLAVE TAXONÓMICO DE LOS MICROORGANISMOS: PERSPECTIVA HISTÓRICA|
PROCARIOTAS| MICROORGANISMOS EUCARIÓTICOS| CARACTERES DISTINTIVOS DE LOS
PROCARIOTAS| OBJETIVOS| ENLACES| GLOSARIO| AUTOEVALUACIÓN

1 ENCLAVE TAXONÓMICO DE LOS MICROORGANISMOS: PERSPECTIVA

HISTÓRICA| a Contenidos

Tras el descubrimiento de los microorganismos, se intentó encuadrarlos en los dos grandes reinos
reconocidos por la Biología de la época, en base a los rasgos que entonces servían para distinguir
entre plantas y animales. De este modo, a finales del siglo XVIII el reino Plantae englobaba a las
algas (inmóviles y fotosintéticas) y a los hongos (inmóviles y no fotosintéticos), mientras que en el
reino Animalia Lamarck habilitó el grupo de los Infusoria para incluir los microorganismos que
presentaban movilidad.

El triunfo de la Teoría Celular a mediados del siglo XIX obligó a reconocer la heterogeneidad del
grupo de los infusorios. El célebre microscopista Ehrenberg, en una extensa publicación aparecida
en 1838, reconoció su diversidad y los definió como "organismos perfectos", dotados de todos los
sistemas orgánicos presentes en seres superiores, con lo que, además, intentaba rebatir la noción,
procedente de la filosofía de la naturaleza, de que su estructura sencilla probaba la teoría de la
generación espontánea. Sus detallados trabajos, junto a los de otros, se plasmaron más tarde en la
escisión de los Infusorios en tres grupos distintos: en uno de ellos se colocaron los organismos
pequeños pero pluricelulares, considerados como metazoos; otro grupo era el de los Protozoos,
considerados como animales primitivos unicelulares y flexibles; el tercer grupo, las Bacterias o
Schyzomycetes, abarcaba los microorganismos más pequeños y sencillos, que se adscribieron al
reino vegetal dada su semejanza con las cianofíceas (las consideradas durante mucho tiempo como
algas verdeazuladas).

Pero las paradojas y anomalías de esta sistemática no tardaron en ser patentes: lo único que
caracterizaba a los hongos como plantas era su carencia de formas vegetativas móviles; muchas
bacterias tampoco eran fotosintéticas y eran abundantes las dotadas de movilidad; muchas algas
poseían formas móviles, incluso con grandes semejanzas con determinados protozoos (de hecho
poseían formas móviles, incluso con grandes semejanzas con determinados protozoos (de hecho
algunos flagelados eran estudiados simultáneamente por zoólogos y botánicos), etc.

Haeckel, uno de los más importantes seguidores de Darwin, intentó poner orden en esta confusión
en su famoso árbol filogenético de 1866, proponiendo la creación de un tercer reino, el Protista,
definido como el que engloba a todos los seres vivos sencillos, sean o no fotosintéticos y/o móviles:
protozoos, algas, hongos y bacterias (= Moneres). Esta aproximación, con su buena dosis de
nominalismo, se ha prolongado en nuestro siglo, primero en Herbert Copeland, quien en 1938 aparta
a las bacterias de los Protistas, creando para ellas el reino Monera, y más tarde en Whittaker y sus
seguidores.

Hacia mediados del siglo XX el advenimiento de avances metodológicos como la microscopía

electrónica y las técnicas bioquímicas de separación de fracciones subcelulares permitieron
diferenciar la presencia en las bacterias de componentes químicos y estructurales exclusivos de ellas.
Esto supuso un apoyo experimental a las ideas del biólogo francés Chatton, quien ya en los años 30,
en su intento de establecer una filogenia universal, se había dado cuenta que la ausencia de un
auténtico núcleo rodeado de membrana en las bacterias justificaba crear dos grandes reinos: el de los
procariotas y el de los eucariotas.

A comienzos de los 60 eminentes biólogos como van Niel y Murray enuncian claramente el
significado de estas observaciones y sus consecuencias para la clasificación de los seres vivos. En
1963, el prestigioso libro de texto de Stanier, Adelberg y Doudoroff (The microbial world, 30
edición) afirma ya que "las diferencias en la estructura celular que separan las bacterias y algas
cianofíceas de todos los demás organismos celulares representan probablemente la mayor
discontinuidad evolutiva que pueda encontrarse en el mundo vivo". Hubo que esperar a la 80 edición
del Bergey's Manual of Determinative Bacteriology (1974) para ver estas ideas reconocidas de modo
"oficial": se consideró la existencia del Reino Procaryotae, al que se dividió en Cyanobacteria y
Bacteria.

Sin embargo, la propuesta de dos reinos primarios no fue plenamente aceptada por todos. Robert
Whittaker, en 1969, modifica la clasificación de Copeland -siguiendo, por tanto, en la tradición
haeckeliana- y propone cinco reinos que, en la versión reciente de sus discípulas Lynn Margulis y
Karlene Schwartz, quedan como sigue: aparte de las plantas (en el sentido de Metafitas) y de los
animales (en el sentido de Metazoos), se establece el reino de los Moneras (sinónimo de
Procariotas), el de los Protoctistas (microorganismos eucarióticos y sus parientes macroscópicos,
incluyendo los mohos mucosos y excluyendo los hongos) y el de los Hongos (definidos como
eucariotas no fotosintéticos que forman esporas y que carecen de undilipodios en todo su ciclo
vital).

En años recientes se ha comenzado a aplicar técnicas de biología molecular para intentar una
clasificación más natural de los microorganismos, especialmente de las bacterias. Los resultados de
esta nueva Taxonomía Molecular son aún incompletos, y hay que reconocer que ignoramos mucho
todavía sobre las relaciones filogenéticas, pero se puede hablar ya de una auténtica convulsión en
nuestras ideas previas, como lo prueba la puesta en entredicho de los dos reinos primarios de Murray
reconocidos por el Bergey's. A continuación se hará un repaso breve de las características generales
de los distintos grandes grupos biológicos con representantes microbianos, a lo que se añadirá un
comentario sobre las perspectivas filogenéticas que se están abriendo con los nuevos enfoques.

1.1 PROCARIOTAS| a Contenidos

Las bacterias son organismos con organización celular, es decir, al igual que el resto de seres vivos
conocidos, su unidad vital funcional es la célula. El tipo de organización celular es la procariótica,
caracterizada porque su material genético (normalmente un solo cromosoma circular de ADN de
doble hebra) no está recluido en un recinto rodeado de membrana, sino inmerso en el citoplasma;
este cromosoma se replica de modo amitótico y la división celular suele ser por fisión binaria;
carecen de orgánulos rodeados de membrana tales como mitocondrias, cloroplastos, retículo
endoplásmico, lisosomas, así como de undilipodios (cilios y flagelos de estructura fibrilar 9+2 y
rodeados de membrana citoplásmica); sus ribosomas tienen un coeficiente de sedimentación de 70S;
su citoplasma está envuelto por una membrana celular que sirve de barrera selectiva respecto del
medio exterior, con funciones de transporte de nutrientes, producción de energía y de biosíntesis de
ciertas moléculas. Con algunas excepciones (Mollicutes), la mayoría de las bacterias presentan,
externamente a la membrana citoplásmica, una pared celular que, en el grupo de las eubacterias está
basada en una macromolécula peculiar denominada peptidoglucano, mientras que en las
arqueobacterias éste se ve sustituido por una variedad de tipos moleculares y estructurales
exclusivos.

Los primeros intentos de clasificaciones bacterianas descansaban prácticamente solo sobre criterios
morfológicos (siguiendo la costumbre de la Botánica). Más tarde, con la introducción de los cultivos
puros y el establecimiento de razas-tipo, conservadas en colecciones de cultivo, se pudieron
comparar diversas características de las cepas aisladas. Las clasificaciones se realizaban aplicando
valoraciones intuitivas tras un análisis más o menos detallado de distintos rasgos fenotípicos, dando
mayor o menor peso a algunos de estos para establecer jerarquías. Este tipo de taxonomía
"subjetiva" ha sido la imperante durante la mayor parte de este siglo. Una aproximación hacia
criterios más "objetivos" fue posible a partir de los años 60, cuando el desarrollo de los ordenadores
y de los métodos de análisis multivariante dieron nacimiento a la Taxonomía Numérica (o
Taxometría), de base adansoniana. En este sistema se comparan distintos organismos respecto de
gran número de rasgos fenotípicos, a cada uno de los cuales se le adjudica un peso valorativo
semejante, y ha tenido éxito para definir grupos homogéneos ("clusters") de razas, asimilables a
taxoespecies bacterianas. Igualmente permite evidenciar cierta estructura taxonómica y jerárquica
(recurriendo a métodos como el análisis de "clusters"), que se puede traducir a dendrogramas que
expresen relaciones fenéticas. Sin embargo, se ve limitado para establecer criterios válidos en
categorías taxonómicas superiores, y presenta el inconveniente de que con él es difícil deducir
relaciones filogenéticas.

En suma, si bien hay que reconocer la utilidad práctica de los métodos taxonómicos basados en
rasgos fenotípicos, hay que admitir su poco valor para dar una visión de las relaciones naturales de
parentesco entre los taxones, así como la inestabilidad de la Sistemática a la que da origen. Las
polémicas sobre la necesidad o no de una clasificación filogenética no es exclusiva de la
Microbiología (en Botánica, bien entrado el siglo XX, aún se discutían las tentativas de definir las
especies como unidades naturales reales y la pertinencia de establecer parentescos filogenéticos),
pero la carencia, durante mucho tiempo, de una base firme para asentar ese tipo de clasificación,
hizo que se abandonaran tales pretensiones filogenéticas en los esquemas taxonómicos, quedando
estos como guías para la identificación de nuevos aislados.
estos como guías para la identificación de nuevos aislados.

Los intentos de estudiar relaciones filogenéticas entre los organismos se basan en la existencia de
elementos de referencia sobre los que dilucidar dichas relaciones. Estos elementos se pueden
agrupar en dos clases: las moléculas semantoforéticas y las moléculas sintácticas. Las primeras son
moléculas (ADN, ARN, proteínas) cuyas secuencias primarias representan una copia de la
información genética, y su análisis comparativo posibilita establecer relaciones con significado
filogenético; las segundas son sustratos o productos de las funciones ejercidas por las primeras, y se
plasman en las propiedades fenotípicas que han servido de base a la taxonomía clásica. Como cada
grupo se ha estudiado en función de propiedades sintácticas peculiares, la comparación a efectos
filogenéticos con otros grupos definidos por otras propiedades sintácticas diferentes imposibilitó, en
última instancia, una clasificación que revelara las relaciones evolutivas, siendo difícil evaluar la
antigüedad de los grupos definidos por rasgos arbitrarios de los que se desconoce la importancia
filogenética. Por otro lado, existía la creencia de que las bacterias, con sus ciclos vitales cortos,
evolucionaban de modo tan rápido que sería imposible trazar su linaje genealógico. Sin embargo, a
pesar de la rápida reproducción clonal y de la transferencia horizontal de información genética, la
evolución estabilizadora permite fijar conjuntos de genes coadaptados que dan una base firme al
concepto de especie bacteriana, y a su relativa estabilidad.

Ya Orla-Jensen, en 1909, había intentado una clasificación filogenética, y en 1936 Kluyver y van
Niel proponen otro esquema "natural" basado en criterios bioquímicos; pero ambas clasificaciones
eran muy especulativas, y por supuesto basadas en los fenotipos, aunque al menos tuvieron el mérito
de proporcionar un entramado conceptual sobre el que poder pensar más en serio. Al igual que en
Zoología y Botánica sistemáticas (y quizá en mayor medidad que éstas), la taxonomía bacteriana se
ha beneficiado de los resultados de la investigación general, básica, de modo que diversos
conocimientos y metodologías de biología fundamental se han convertido en valiosos auxiliares de
la investigación taxonómica, incorporándose a esta disciplina especial. Concretamente, desde inicio
de los años 60 se vienen desarrollando una serie de enfoques y técnicas que parecen abrir, por fin,
perspectivas serias de elaborar una clasificación natural de las bacterias. La base común de estos
planteamientos es analizar moléculas semantoforéticas, esencialmente rasgos del genotipo.

En 1974 la 80 edición del Bergey's incluía muchos porcentajes de G+C, aunque su valor de
referencia filogenética es bastante limitado. La auténtica revolución comenzó con la cuantificación
de homologías entre genomios de distintos microorganismos, mediante experimentos de hibridación
entre ácidos nucleicos (heterodúplex ADN-ADN y ADN-ARN), que señalaban la necesidad de
introducir correcciones a la taxonomía clásica. Se estableció, por ejemplo, que Salmonella consta de
una sola especie; que las especies de Pseudomonas fitopatógenos no deberían clasificarse basándose
en la planta parasitada; que Escherichia parece prácticamente homólogo con Shigella, etc. Este tipo
de conclusiones preocuparon a algunos, que temieron la llegada de una clasificación poco práctica;
de hecho razones de esta clase, junto con la muy asentada rutina de identificación, especialmente en
clínica, hacen que la introducción de las nuevas propuestas se realice con cierta moderación. De
todas formas, con pocas excepciones, es posible encontrar rasgos fenotípicos que se correlacionen
bien con cada grupo de homología detectado por técnicas moleculares, de modo que aquellos
puedan usarse en la identificación de nuevos aislados de forma rápida, cómoda y fiable.

Las técnicas de hibridación entre ADN y ARN ribosómico, los catálogos de oligonucleótidos
generados tras tratamiento del ARNr 16S con ribonucleasa T , y más recientemente, la
generados tras tratamiento del ARNr 16S con ribonucleasa T1, y más recientemente, la
secuenciación total de dichos ARNr, permiten medir distancias filogenéticas mayores. Así, por
ejemplo, el monumental y temprano estudio de Norberto Palleroni sobre Pseudomonas (1973)
manifestó la existencia de cinco grupos distintos, que más tarde (1983) De Vos y De Ley
demostraron que guardan menos relación entre sí que con otros géneros de bacterias Gram
negativas, confirmando el carácter de "cajón de sastre" que se había creado bajo aquella
denominación genérica. Algo parecido le ocurre a Clostridium (uno de los más ricos en especies),
que consiste en no menos de cuatro grupos merecedores de rango de géneros distintos.

Sobrepasando las implicaciones sobre adscripción a géneros, los resultados más excitantes y
provocadores para la taxonomía bacteriana de estas técnicas, se iniciaron en 1977, cuando el grupo
de Woese, Fox y Stackebrandt comienza a aplicar de forma amplia el sistema de la comparación de
los catálogos oligonucleotícos (y más tarde, la secuenciación) del ARNr 16S de muy distintas
especies, y cuya consecuencia más trascendental ha sido la propuesta de una clasificación
filogenética bacteriana (Woese, 1987). El planteamiento descansa sobre los siguientes supuestos
(bien asentados sobre la genética molecular): para cualquier rasgo fenotípico existen numerosos
genotipos equivalentes; esto significa que la mayoría de los cambios que se fijan en el genotipo son
selectivamente neutros, lo que les confiere un carácter cronométrico. Este tipo de variabilidad
genética -sin cambios apreciables de fenotipo- no está sometida a presión selectiva darwiniana (del
ambiente externo), por lo que los cambios mutacionales detectables a nivel de secuencia primaria se
comportan como cronómetros moleculares que se pueden emplear para medir relaciones evolutivas
y tiempos relativos de divergencia entre linajes distintos, pudiendo inferirse de ellos ciertas
características mínimas del antepasado común. Los primeros cronómetros empleados fueron
secuencias de proteínas, por ejemplo el citocromo c; sin embargo, es difícil encontrar una proteína
distribuida universalmente en los grandes grupos de seres vivos (en el ejemplo citado, el citocromo c
está representado de modo general en eucariotas, pero sólo está presente en algunos procariotas), y
además su función no suele ser siempre constante, de modo que en el transcurso evolutivo se pueden
introducir mutaciones selectivas que empobrecen sus cualidades de cronómetro. Por consiguiente,
un buen cronómetro molecular con amplio significado evolutivo ha de cumplir los siguientes
requisitos:

• ser de distribución universal;

• cambiar con suficiente lentitud como para permitir detectar relaciones muy antiguas;
• poseer una función constante;
• ser de fácil aislamiento y purificación.

Los ARN ribosómicos, especialmente los 16S bacterianos (y sus equivalentes 18S eucarióticos),
cumplen con bastante adecuación estos puntos. Además, estudios comparativos de control usando
otras "sondas evolutivas" (p. ej., reasociación entre ADNs) han dado resultados concordantes.

Ahora bien, está claro igualmente que no tiene sentido aplicar de modo inflexible los parámetros
filogenéticos como único criterio válido para circunscribir unidades taxonómicas, debido
principalmente a que distintos grupos y géneros definidos fenotípicamente pueden tener distintas
edades genealógicas (Stackebrandt, 1988; a este punto se hace referencia más adelante). Los
principales resultados de este acercamiento a una clasificación filogenética de las bacterias se
pueden resumir en los siguientes puntos:

Las Arqueobacterias (término acuñado por Woese y Fox en 1977) representan una línea evolutiva de
organización celular ciertamente procariótica, pero que parecen no estar más relacionadas con el
resto de las bacterias de lo que lo están con el núcleo de los eucariotas. Muestran diferencias
moleculares, de organización y expresión genética, fisiológicas y ecológicas suficientemente
importantes respecto del resto de las bacterias como para justificar la creación de dos Reinos
procarióticos perfectamente diferenciados: Archaeobacteria y Eubacteria, que junto a los
Eucariotas, constituirían los tres grandes Reinos primarios del mundo vivo.

Las Eubacterias parecen agruparse en 10 phyla o linajes naturales. En unos pocos casos, estos phyla,
definidos según su secuencia de ARNr, coinciden con taxones identificados por criterios fenotípicos
(tal es el caso del grupo de las bacterias con morfología y estructura espiroquetal); en otros casos el
phylum coincide con bastante aproximación con una agrupación de bacterias que presentan un rasgo
clásico en común (por ejemplo, el phylum de eubacterias Gram-positivas que, con pocas
excepciones, engloba a todas los procariotas con pared celular típica Gram-positiva); sin embargo, la
mayoría de los phyla de Woese carecen de una característica fenotípica clara en común (así ocurre,
por ejemplo el grupo de Bacteroides, Flavobacterium y relacionados), y suponen un desafío a la
Microbiología para encontrar las "marcas" unificadoras subyacentes.

Por otro lado, de estos estudios surge por primera vez un esbozo de árbol filogenético universal,
desprovisto de raíz , en el que se plantea la fascinante cuestión de cómo se relacionan
evolutivamente los tres reinos primarios. Woese propone una entidad hipotética, antecesor universal
(progenote), que pudo existir en tiempos remotos, y que quizá pudo dar lugar a las tres grandes
líneas, cada una con un conjunto de soluciones a los problemas de transferencia de las instrucciones
genéticas no resueltos por el progenote.

Recientemente (1990) Woese ha recogido la evidencia actual sobre estas tres grandes líneas
evolutivas del mundo vivo, y ha propuesto que sean admitidas con la categoría de dominios
(=reinos primarios), con las siguientes denominaciones: los dos dominios con organización celular
procariótica se rebautizan como Bacteria (equivalente a Eubacteria) y Archaea (sinónimo de
Archaebacteria), y el dominio eucariótico pasa a denominarse Eukarya.

A pesar de (o incluso, debido a) las grandes implicaciones de estos estudios, la mayor parte de sus
conclusiones no han encontrado su traducción "oficial" en la reciente edición del Bergey's
(convertido ya en Manual of Systematic Bacteriology), si bien en ésta se reconoce el valor de las
nuevas propuestas y se introducen algunas novedades al respecto. En el Manual, Murray (1984)
señala las dificultades de índole práctica que desaconsejaban en el momento de su redacción la
inclusión de las derivaciones de todos los estudios moleculares, aparte de la necesidad de
acumulación de más datos sobre una amplia variedad de grupos, de los que se carecía de suficiente
información.

La clasificación a niveles jerárquicos superiores propuesta por Gibbons y Murray en 1978 e

incorporada a esta novena edición del Bergey's (1984) es la siguiente: se reconoce un solo reino
bacteriano, el Procaryotae, en el que se distinguen cuatro divisiones, según la presencia y
composición de la pared celular:
composición de la pared celular:

División I. Gracilicutes, caracterizados por su pared de tipo Gram-negativo. Dentro de ella se

incluyen tres clases: Scotobacteria, bacterias Gram-negativas indiferentes a la luz (no
fotosintéticas), Anoxyphotobacteria, bacterias fototrofas con fotosíntesis anoxigénica, y
Oxyphotobacteria, con fotosíntesis oxigénica.

División II. Firmicutes, bacterias con una estructura de pared celular típicamente Gram-positiva, con
peptidoglucano en varias capas. Se consideran dos clases: Firmibacteria, y Thallobacteria (estas
últimas, bacterias con tendencia a formar hifas ramificadas, y las relacionadas con ellas).

División III. Tenericutes, con la clase única de los Mollicutes; se trata de procariotas pleomórficos y
flexibles, carentes de pared celular (micoplasmas)

División IV. Mendosicutes, con una sola clase, Archaebacteria, caracterizados por sus paredes
celulares (cuando existen) carentes de peptidoglucano.

Actualmente estamos asistiendo a una intensa reevaluación de la Sistemática Bacteriana bajo los
nuevos planteamientos. Parece que se consolida la Taxonomía Filogenética, y hay numerosas
propuestas de modificar definiciones anteriores y la nomenclatura de géneros y especies, creándose
combinaciones nuevas y descripciones "corregidas" de taxones clásicos. Un repaso a los últimos
ejemplares del International Journal of Systematic Bacteriology, la publicación oficial del Comité
Internacional de Bacteriología Sistemática, basta para tomar consciencia de las recientes tendencias.

1.2 MICROORGANISMOS EUCARIÓTICOS| a Contenidos

Los microorganismos eucarióticos son seres vivos unicelulares o pluricelulares, pero nunca con
diferenciación en tejidos, pudiendo ser coloniales, cenocíticos o miceliares, y cuyo pequeño tamaño
obliga a emplear el microscopio para observarlos y analizar su estructura. Su organización celular
eucariótica se caracteriza por su compartimentalización estructural y funcional: el material genético
(ADN de doble hebra), repartido en varios cromosomas, y normalmente unido a proteínas básicas
especiales, se alberga en un núcleo rodeado de membrana; pueden existir diversos orgánulos
limitados por membrana: retículo endoplásmico, aparato de Golgi, lisosomas, mitocondrias, etc; las
células pueden disponer de uno o más orgánulos de locomoción (cilios y flagelos, denominados
genéricamente como undilipodios), con una estructura de 9+2 fibrillas internas, envueltas por
prolongaciones de la membrana citoplásmica. Sus ribosomas, más grandes y complejos que los de
procariotas, poseen un coeficiente de sedimentación de 80S, y el citoplasma contiene ciertos tipos de
elementos citoesqueléticos (microtúbulos, microfilamentos y filamentos intermedios).

Tradicionalmente se han venido considerando tres grupos dentro de los microorganismos

eucarióticos: algas, protozoos y hongos, pero cada una de estas denominaciones no designa
categorías filogenéticamente coherentes.

Las Algas son eucariotas macro o microscópicos, normalmente aerobios y capaces de realizar
fotosíntesis oxigénica por medio de cloroplastos (aunque algunos grupos presentan formas
leucofíticas heterotrofas). Pueden ser unicelulares, cenocíticas, o pluricelulares (filamentosas,
coloniales, etc.), pero nunca con diferenciación en tejidos, aunque muchas algas macroscópicas
exhiben llamativas diferenciaciones morfológicas. Las algas microscópicas requieren el empleo de
técnicas plenamente microbiológicas para su estudio. Actualmente se consideran varios grupos
cuyas relaciones filogenéticas no están aclaradas: Chlorophyta (algas verdes), Gamophyta (algas
conjugadas, que algunos incluyen en el phylum anterior), Euglenophyta (algas flageladas),
Chrysophyta (algas doradas), Xantophyta, Bacillariophyta (diatomeas), Haptophyta
(cocolitoforales), Cryptophyta, Phaeophyta (algas pardas) y Rhodophyta (algas rojas). Ejemplos de
grupos disputados durante mucho tiempo por zoólogos y botánicos son los Euglenófitos y los
Criptófitos.

Los Protozoos constituyen un grupo heterogéneo de microorganismos eucarióticos unicelulares no

fotosintéticos (exceptuando la clase Phytomastigophorea, dentro del subphulum Mastigophora),
muchos con capacidad de movimiento en medios acuosos por medio de pseudópodos o de
undilipodios, y con numerosos representantes con formas de vida parasitaria. Sus relaciones
filogenéticas no están claras, si bien del estudio de los Dinoflagelados se deduce que al menos
algunos grupos pudieron derivar de phyla de algas. La actual clasificación (Levine et al., 1980)
distingue siete grandes phyla, que reseñamos brevemente a continuación.

El phylum Sarcomastigophora se caracteriza por poseer un único núcleo (excepto en los

foraminíferos heterocarióticos); cuando existe sexualidad, ésta es por singamia; la movilidad es por
flagelos, pseudópodos, o por ambos. Dentro de este grupo, el subphylum de los Mastigophora
(caracterizado por trofozoitos con uno o más flagelos) incluye los fotosintéticos Fitomastigóforos
estudiados igualmente por los ficólogos, y los Zoomastigóforos, un grupo polifilético con
numerosos órdenes de interés parasitológico, como los Kinetoplastida -Trypanosoma, Leishmania,
etc.-, los Diplomonadida -por ejemplo, Giardia-, los Trichomonadida, etc. El subphylum Opalinata,
consta de protozos que presentan numerosos cilios cubriendo toda su superficie en filas oblicuas. El
subphulum Sarcodina se distingue por la posesión de pseudópodos o de flujo protoplasmático sin
pseudópodos auténticos; de existir flagelos, quedan restringidos a las fases de desarrollo. La mayor
parte son de vida libre. En la superclase de los Rizópodos, existen dos órdenes con relevantes
representantes parasitos, el Amoebida (con Entamoeba, Acanthamoeba, Iodamoeba, etc.) y el
Schizopyrenida (con Naegleria); muy interesante es el orden Pelobiontida, cuyas especies (por ej.,
Pelomyxa), carecen de mitocondrias, pero presentan bacterias endosimbióticas. La otra superclase,
la de los planctónicos Actinópodos, consta de los clásicos radiolarios (ahora escindidos en dos
nuevas clases) y de los Heliozoos.

El phylum de los Labyrinthomorpha es considerado por algunos como un representante de "hongos

inferiores" (véase más adelante, bajo la denominación de Labyrinthulomycetes).

El phylum Apicomplexa se caracteriza por el llamado complejo apical, un conjunto de anillos

polares, roptrias, micronemas, microtúbulos, etc., distinguibles a microscopio electrónico. Carecen
de cilios, su sexualidad es por singamia, y todos son parasitos. Dentro de la subclase Coccidia, de la
clase Sporozoea, encontramos géneros de interés clínico, como Eimeria, Isospora, Cryptosporidium,
Toxoplasma, Plasmodium, etc. La subclase Piroplasmia incluye al género Babesia.

El phylum Microspora es muy interesante por su gran antigüedad filogenética, probablemente

anterior a la "radiación eucariótica" que se produjo con el establecimiento de las condiciones
oxidantes en la atmósfera. Posee esporas unicelulares con pared imperforada y carece de
mitocondrias. Son parasitos obligados de muchos grupos de animales. Un representante con interés
"histórico" es el género Nosema.

El phylum Ascetospora presenta esporas multicelulares con uno o más esporoplasmas; igualmente
son de vida obligadamente parasitaria.

El phylum Myxozoa se define por sus esporas de origen multicelular, con una o más cápsulas polares
y esporoplasmas.

Finalmente, en el phylum Ciliophora se engloban los protozoos con cilios, ya sea simples, ya sea
formando orgánulos ciliares compuestos, al menos en alguna fase de sus ciclos de vida. Presentan
dos tipos de núcleos. Su fisión binaria es transversal, pero se encuentran también fisión múltiple y
gemación. La reproducción sexual puede ser por conjugación, por autogamia o por citogamia.
Poseen vacuolas contráctiles. La mayoría son de vida libre, pero existen representantes parasitos
(por ejemplo, Balantidium).

La denominación de Hongos es igualmente muy ambigua, ya que define genéricamente a seres

heterotróficos cuya estructura vegetativa suele ser multinucleada y cenocítica, en muchos casos de
crecimiento miceliar. La historia filogenética de los hongos no se conoce bien; aparentemente, el
modo de vida de estilo fúngico ha surgido en repetidas ocasiones durante la evolución.

Los denominados a veces como "hongos inferiores" consisten en varios grupos distintos cuya única
característica en común reside en la posesión de formas móviles en al menos alguna fase de su ciclo
de vida. Los principales taxones son los siguientes:

Los Labyrinthulomycetes: forman colonias de células vegetativas fusiformes que se mueven

aparentemente por deslizamiento sobre pistas mucilaginosas en retículo, formadas por ellos mismos.
Se han descrito isogametos undilipodiados en algunas especies.

Los Acrasiomycetes (mixomicetes celulares, que los zoólogos estudiaban con el nombre de
Micetozoos) presentan un ciclo vital asexual con varias fases, todas ellas haploides: una fase de
amebas solitarias fagotróficas, que en condiciones de carencia de nutrientes se agregan hacia unos
centros de aglomeración, originando un pseudoplasmodio celular migrador provisto de vaina, y que
más tarde entra en fructificación, generando un cuerpo fructífero pedunculado en cuyo ápice las
amebas se diferencian a esporas, que al germinar, cierran el ciclo.

Los Myxomycetes (mixomicetes plasmodiales), al igual que los anteriores, presentan una fase de
células ameboides (mixamebas) que pueden interconvertirse en células flageladas (y viceversa).
Cada uno de estos tipos morfológicos puede diferenciarse en dos sexos opuestos, que tras su fusión
producen un zigoto que, por sucesivas divisiones nucleares origina un plasmodio multinucleado
osmotrófico e inmóvil. En condiciones adversas el plasmodio se diferencia en varias zonas en
esporangios pedunculados, en cuyos ápices los núcleos sufren meiosis (frecuentemente
degenerativa), produciéndose esporas haploides, cada una de las cuales genera una mixameba.

Los Quitridiomycetes (ficomicetes acuáticos) poseen talo vegetativo a base de hifas ramificadas no
septadas que se introducen en el sustrato (rizoides) y que se encuentra separado por un tabique
septadas que se introducen en el sustrato (rizoides) y que se encuentra separado por un tabique
transversal respecto de un esporangio multinucleado, con forma de saco. Éste puede ser un
mitosporangio o un meiosporangio, liberando en ambos casos esporas undilipodiadas uninucleadas.

Los Hyphoquitridiomycetes son microorganismos holocárpicos o eucárpicos con hifas, septadas o

no, de los que se desconocen fases sexuales, siendo su órgano reproductivo un zoosporangio que
produce esporas flageladas.

Los Oomycetes son microoganismos filamentosos cenocíticos, cuyas formas vegetativas carecen de
septos, siquiera parciales, estando separadas por un tabique de estructuras reproductoras masculinas
(anteridios) y femeninas (oogonios); al ponerse en contacto ambos, el anteridio emite un tubo de
fertilización por donde migran los núcleos masculinos al encuentro de los femeninos (oosferas). La
reproducción asexual es por zoosporas flageladas.

Los "hongos superiores" (algunas veces denominados Eumycetes) presentan en común las
propiedades de producir esporas y carecer de undilipodios en todas las fase de sus ciclos vitales.
Exceptuando los "Hongos Imperfectos", todos poseen reproducción sexual, que es por conjugación
de hifas de signos opuestos. Exponemos a continuación una breve descripción de los grupos.

Los Zygomycetes (ficomicetes terrestres) tienen un micelio no tabicado, a excepción de la separación

entre la porción vegetativa y la reproductiva. Las esporas haploides (conidiosporas) se forman en un
esporangio sostenido por un esporangióforo pedunculado. La reproducción sexual se produce por
hifas especializadas (gametangios) de signos opuestos, que al fusionarse por sus ápices dan lugar a
una estructura engrosada donde se produce la cariogamia, seguida de meiosis.

En los Ascomycetes la fusión de las hifas sexuales de signo opuesto da origen a un saco o asca,
donde se produce la meiosis (muchas veces seguida de una o dos mitosis), con formación de
ascosporas haploides. La reproducción asexual se produce por fragmentación del extremos de ciertas
hifas, originando conidiosporas.

Los Basidiomycetes se caracterizan por un micelio primario joven a base de hifas monocarióticas,
multinucleadas y aseptadas, que más tarde desarrollan septos transversales incompletos que
delimitan porciones uninucleadas; dos segmentos de hifas de signo opuesto se conjugan, sin fusión
de núcleos, dando una hifa dicariótica (que puede ser homocariótica o heterocariótica, dependiendo
del homotalismo o heterotalismo de la especie); estos micelios dicarióticos desarrollan unas
estructuras especiales, denominadas basidios, con forma de maza, en cuya superficie se forman las
basidiosporas haploides por migración, a los esterigmas correspondientes, de los núcleos producidos
tras la cariogamia y la subsiguiente meiosis.

Los Deuteromycetes o Fungi Imperfecti constituyen una clase-forma, o sea, no suponen un grupo
natural; abarcan todos los géneros de eumicetos de los que no se ha podido demostrar fase sexual,
aunque algunos exhiben fenómenos de parasexualidad. Es posible que muchas especies carezcan en
realidad de procesos sexuales, representando formas de Ascomicetos y Basidiomicetos que
perdieron la capacidad de producir ascas y basidios.

Aunque, como se ha indicado más arriba, la filogenia de los hongos no se conoce bien, se ha
propuesto que los Ascomicetos y Basidiomicetos pueden provernir de algún antepasado de tipo
zigomiceto, que a su vez puede mantener alguna relación evolutiva con otros organismos
eucarióticos que se reproducen por conjugación (algas gamofitas o rodofitas).

2 CARACTERES DISTINTIVOS DE LOS PROCARIOTAS| a Contenidos

Los estudiaremos sobre la base de su comparación con los eucariotas.

DIFERENCIAS ENTRE PROCARIOTAS Y EUCARIOTAS

Datos relativos Procariotas Eucariotas

a:
Genóforo o Un solo cromosoma circular Varios cromosomas lineares
nucleoplasma cerrado covalentemente terminados en telómeros
No existe membrana nuclear Existe membrana nuclear
(no hay núcleo) (núcleo auténtico)
No hay histonas asociadas al Histonas asociadas al ADN
ADN
División del No mitosis Mitosis
material
genético
Organización No orgánulos eucarióticos Orgánulos (mitocondrias,
del citoplasma cloroplastos, RE, Golgi,
centriolos, etc)
No citosqueleto (no corrientes Citosqueleto (corrientes
citoplásmicas, ni mov. citoplásmicas)
ameboide)
Ribosomas tipo 70S Ribosomas tipo 80S

OTROS RASGOS (NO UNIVERSALES) DE LOS PROCARIOTAS| a Contenidos

• No existen esteroles en las membranas, aunque muchas bacterias poseen un tipo de

politerpenoides llamados hopanoides. Los únicos procariotas con esteroles son algunas
especies de cianobacterias y de bacterias metilotrofas. Los micoplasmas (Mollicutes)
presentan esteroles, pero los obtienen a partir de sus hospedadores eucarióticos.
• No existen cilios ni flagelos eucarióticos (tipo 9+2 fibrillas). Pero muchos procariotas se
mueven por un tipo de flagelos totalmente distinto, constituidos por subunidades de una
proteína, arrolladas helicoidalmente.
• Pared celular a base de una molécula exclusiva de procariotas: la mureína (=mucopéptido o
peptidoglucano), excepto los Mollicutes (micoplasmas), que carecen de pared celular, y las
Arqueobacterias, cuya pared celular no se basa en peptidoglucano.

Los rasgos distintivos de las Arqueobacterias serán estudiados en el capítulo correspondiente de la

sección de Taxonomía Bacteriana.
En este curso de Microbiología General vamos a estudiar de modo casi exclusivo los
microorganismos procarióticos, de modo que casi podríamos titular la parte principal de este curso
como "Bacteriología General", si bien abordaremos igualmente sendas introducciones a la Virología
y a la Inmunología. Diversos aspectos de los microorganismos eucarióticos son materia de estudio de
otras asignaturas (Zoología, Botánica, Parasitología).

BIBLIOGRAFIA| a Contenidos

LAST, G.A. (1988): Musings on Bacterial Systematics: how many kingdoms of life? ASM News 54:
22-27.

KRIEG, N.R. (1988): Bacterial classification: an overview. Can. J. Microbiol. 34: 536-540.

MARGULIS, L., K.V. SCHWARTZ (1985): Cinco Reinos. Labor, Barcelona.

MURRAY, R.G.E. (1984): Higher taxa, or a place for everithing...?. En: "Bergey's manual of
Systematic Bacteriology". Williams & Wilkins, Baltimore.

STACKEBRANDT, E. (1988): Phylogenetic relationships vs. phenotypic diversity: how to achieve a

phylogenetic classification system of the eubacteria. Can. J. Microbiol. 34: 552-556.

WOESE, C.R. (1991): Prokaryote Sistematics: the evolution of a science. En "The Prokaryotes"
(2nd. edition). Springer Verlag, Nueva York, pp. 3-18.

ENLACES| a Contenidos

• SERES VIVOS http://www.geocities.com/CapeCanaveral/Cockpit/5591/seresvivos.htm

• Clasificación de los seres vivos
http://www.tareasya.com/noticia.asp?noticia_id=531
• INTRODUCCIÓN AL CONCEPTO Y CONTENIDO DE LA MICROBIOLOGÍA http://www.e-
mas.co.cl/categorias/biologia/microbio.htm
• MICROORGANISMOS DE INTERES INDUSTRIAL http://edicion-
micro.usal.es/web/SEFIN/MI/tema02MI.html
• El sistema de los Cinco Reinos http://danival.org/notasbio/clas/clas_5_%20reinos.html
• microb
http://ciencias.bc.inter.edu/yserrano/microb.html

GLOSARIO|a
GLOSARIO| a Contenidos

Análisis Cluster o Taxonomía Numérica: Técnica de análisis de datos multivariable que

persigue la formación de grupos (clusters) con las observaciones (o individuos), de forma que
dentro de los grupos se reúnan las observaciones más homogéneas y que los grupos obtenidos
sean lo más heterogéneos posibles entre ellos, definiendo dichos grupos a partir de las
variables.Su origen se encuentra en la biología y botánica, debido a la necesidad de agrupar
las distintas especies animales y vegetales conocidas en fami- lias lo más homogéneas
posibles, definiendolas por aspectos de tipo taxonómico (medidas físicas externas, o
características definitorias), a partir de las cuales, proceder al cálculo de su semejanza o de su
disimilaridad y a su agrupación.

Arqueobacterias (del griego arkhaios = antiguo;bakterion = bastón: grupo de procariotas de

unos 3.500 millones de años de antigüedad, presentan una serie de características
diferenciales que hicieron que Carl Woese, profesor de la Universidad de Illinois, Urbana,
U.S.A., proponga su separación del reino Moneras y la creación de uno nuevo: Archaea,
propuesta que hoy es cada vez mas aceptada.

Asca: célula en forma de saco, que contiene por lo general un número definido de ascósporas
(típicamente ocho) originadas por formación de células libres, en general después de la
cariogamia y de la meiosis; características de la clase de los Ascomicetes.

Basidio: estructura que lleva sobre su superficie un número definido de basidiósporas

(típicamente cuatro) que se forman, por regla general, después de la cariogamia y la meiosis.
Característica de los Basidiomicetos.

Basidiósporas: espora formada sobre la parte externa de un basidio, resulta de un proceso de

reproducción sexuada formada en el interior (= esporídio) del basidio (= espora exógena).

Cariogamia: fusión de dos núcleos.

Cianobacterias: bacterias unicelulares o filamentosas con capacidad fotosintetizadora.

Clostridium: son bacilos grandes móviles, grampositivos y anaerobios, muchos

descomponen proteínas, forman toxinas o ambas cosas. Su hábitat natural es el suelo o el
intestino de los animales y el hombre, donde viven como saprófitos. Entre los patógenos se
encuentran los causantes del botulismo, tétanos, gangrena gaseosa y colitis
seudomembranosa.

Criptófitos: Plantas terrestres con parte resistente debajo del suelo. Carecen de órganos
vegetales visibles, por encima del suelo, durante la estación desfavorable.

Espora: unidad de diseminación, diminuta, que funciona como una semilla, pero que difiere
de las semillas en que la espora no contiene embrión preformado.

Eubacterias (del griego eu = bueno, verdadero; bakterion = bastón): subgrupo del reino
Monera que incluye a las bacterias verdaderas como Escherichia coli.

Euglenófitos: Son algas de estructura muy sencilla cuya caracteristica mas distintiva es la
presencia de una mancha de pigmento fotosensible. Estas disponen de uno o de dos flajelos lo
cual les permite cambiar su forma y estas se multiplican por división longitudinal.

Filogenia: es la ciencia que estudia la historia que siguen las diferentes ramificaciones de la
herencia genética.La filogenia es un instrumento indispensable para el estudio de la evolución
. Hasta hace poco los estudios filogenéticos se realizaban con datos morfológicos, los cuales
no era los óptimos para realizar filogenias exactas, ya que diferencias morfológicas que
nosotros observamos puede ser que no sean precisas como esperabamos o al revés que
diferencias evolutivas grandes pasaban inadvertidas porque no conllevaban cambios
morfológicos. Este problema se ha subsanado con el uso de datos moleculares de DNA y
proteínas. Las ventajas del uso de datos moleculares es que estos son universales, son mucho
más abundantes y evolucionan más uniformemente, y además nos permiten hacer cálculos de
la escala temporal.

Fitopatógeno: que solamente afecta a las plantas.

Fungi (fungus, hongo): Organismos con nucleo, portadores de esporas, aclorofilos, que por
lo general se reproducen sexualmente y asexualmente, y cuyas estructuras somáticas, por lo
común filamentosas y ramificadas, están típicamente rodeados por una pared celular que
contiene celulosa o quitina, o ambos. (Introduccion a la Micologia. Constantine John
Alexopoulos).

Hifa: filamento tubuloso unidad estructural del micelio de los hongos.

Infusoria: clase de protozoos encontrado en agua infusorial.

Micoplasma: microorganismo de forma esférica, ovoide o pleomórfica y de tamaño inferior

al de las bacterias, se diferencian de ellas por carecer de pared celular y por lo tanto de ácido
murámico. Una condensación del citoplasma compuesta de 3 capas, es la que establece los
contornos celulares. A similitud de las bacterias, los micoplasmas poseen ambos ácidos
nucleícos, DNA y RNA; así como sistema enzimático para producción de energía. Se
multiplican por división binaria y son capaces de desarrollar en algunos medios de cultivo
artificiales, propiedad ésta última que permite su diferenciación de las rickettsias y clamidias,
que sólo pueden hacerlo en células vivas. Son además sensibles a diversos antibióticos y
quimiostáticos.

Mixameba: célula ameboide en los mixomicetos.

Protoctista (protos, el primero; ktistos, establecer) Se define por exclusion: sus miembros
no son animales (los cuales se desarrollan a partir de una blástula), ni plantas (que se
reproducen a partir de un embrión), ni hongos (que carecen de undulipodios* y se desarrollan
a partir de esporas) ni procariotas. (Cinco Reinos, Lynn Margulis).

Singamia: aproximación de los pronúcleos de cada gameto, pero sin fusión nuclear.

Taxon: cualquier grupo de organismos a los cuales se aplica alguna fila del nombre
taxonómico.

Taxonomía: Es la parte de la Sistemática que proporciona los principios (reglas) y

procedimientos para realizar una clasificación, ya que siguiendo diferentes principios
podemos obtener diferentes clasificaciones.
 Zoóspora:(1) espora nadadora, producida asexualmente. (2) Espora provista de flagelo(s)
(por tanto móviles).

Zoosporangio: esporangio que contiene zoósporas.

actualizado el 17 de agosto de 1998

 1998 ENRIQUE IAÑEZ PAREJA. Prohibida su reproducción, salvo con fines educativos.
Se agradecen los comentarios y sugerencias. Escríbame a eianez@goliat.ugr.es