Metabolismul

Bioenergetica
Ciclul Krebs
Noiuni generale de metabolism. Catabolismui i anabolismul.
Cile metabolice centrale, ciclice i specifice.
Metabolismul intermediar. Metode de studiere.
Noiuni de energie liber standard. Compuii macroergici -
structura chimic i rolul lor. Ciclul ATP-ului.
Caracteristica strii energetice a celulei. Indicii ce o
caracterizeaz. Reglarea metabolismului celular.
Decarboxilarea oxidativ a acidului piruvic - enzimele, cofactorii,
reglarea.
Ciclul Krebs - reaciile pariale. Esena biologic a ciclilui Krebs,
reglarea lui. Noiune de fosforilare la nivel de substrat.
Stoichiometria ciciului Krebs.
Reaciile anaplerotice (reaciile care furnizeaz produse
intermediare al ciclului acizilor tricarboxilici).
Metabolismul
Metabolismul sistem coordonat de transformri a
substanelor i energiei sub aciunea sistemelor
multienzimatice.
Deosebim: metabolismul extern i intermediar
Metabolismul extern include procesele necesare
pentru: asimilarea substanilor nutritive , transportul
metaboliilor intermediari ntre celulele diferitor organe i
esuturi i eliminarea produselor finale din organism.
Metabolismul intermediar totalitatea reaciilor chimice
ce decurg ntr-o singur celul vie (i asigur viabilitatea,
creterea i reproducerea ei).

Funciile metabolismului:

1. aprovizionarea celulelor cu energie
chimic (ce se formeaz la scindarea
substanelor nutritive);
2. transformarea substanelor nutritive n
precursori necesari pentru sinteza
macromoleculelor
3. asamblarea macromoleculelor n
componeni celulari;
4. biosinteza i degradarea biomoleculelor
cu destinaie special (h, mediatori,
cofactori);
Fazele metabolismului

Evideniem 2 faze:
1. Catabolismul faza de degradare a
macromoleculelor n micromolecule.
este nsoit de eliberarea energiei (care
poate fi acumulat sub form de ATP sau
NADPH+H
+

2. Anabolismul faza de sintez a
macromoleculelor din micromolecule,
necesit utilizarea ATP sau NADPH+H
+
Etapele catabolismului:
I etap - decurge n TGI (fr eliminare
de E). Macromolecule alimentare se
scindeaz n monomerii si.
II etap monomerii se transform ntr-
un precursor comun Acetil-CoA (are loc
generare de energie).
III etap amfibolic - ciclul Krebs si
fosforilarea oxidativ (FO) H2O+ CO2
are loc generare de energie
Proteine Glucide Lipide
AA
monozaharide
AG+glicerol
Piruvat
Acetil -CoA
c. Krebs
H2O
L.R
FO
CO2
gluco
Ceto-
I
I
I
II
III
ADP + Pi ATP
Deosebirile cilor catabolice
de anabolice
considerentul energetic;
succesiunea reaciilor este reglat
separat;
difer dup localizarea n celul.
CILE METABOLICE
- reprezint reaciile chimice in lant, cu o anumit
funcie.
S ==>A ==> B ==> C ==> P
DEOSEBIM CI METABOLICE:
A. a) centrale (comune pentru degradarea i sinteza
principalelor macromolecule)
b) specifice (caracteristice doar pentru substane
individuale (cofactor).
B. a) liniare (glicoliza)
b) ciclice (ciclul Krebs)
C. a) anabolice
b) catabolice
c) amfibolice
D. a) aerobe
b) anaerobe
Metode de studiu a cilor
metabolice
Pe organismele intact aport eliminare se
aplic att pe organismele sntoase ct i pe
organismele bolnave (infectate) i stresate. Se
efectuiaz prin marcarea metaboliilor cu izotopi.
Studiul experimental prin perfuzarea organelor
intacte.
Studiul seciunilor tisulare.
La nivel celular.
La nivelul organitelor celulare.
REGLAREA METABOLISMULUI

Se realizeaz la diferite nivele:
1. la nivelul proprietilor specifice enzimelor (cantitatea de E i S,
prezena Co, pH, t);
2. la nivelul E reglatoare alosterice;
3. Majoritatea reaciilor sunt reglate de starea energetic a celulei.
Indicatorul ei este sarcina energetic


- SE = [ATP]+1/2[ADP]
[ATP]+[ADP]+[AMP] SE= 0,8-0,95

PF = [ATP]/[ADP]*[Pa] = 500
Se = 0 ( AMP); Se=1 (ATP). Atkinson cile metabolice, responsabile
de sinteza ATP sunt inhibate de Se nalt; dar cile de utilizare ale ATP
sunt stimulate.
Cile catabolice ca regul sunt inhibate de ATP, NADH2 i activate de
AMP, ADP, NAD+. Pentru cile anabolice aciunea acestor compui este
invers.
4. reglare prin modificarea covalent a
enzimelor (fosforilare-defosforilare), modulat
de hormoni (adrenalina, glucagon .a)
5. inducia i represia enzimatic -
modificarea concentraiei E la nivel de
transcripie a genelor corespunztoare sub
aciunea hormonilor steroizi.
6. Reglarea dependent de hormonii care
accelereaz activitatea E (adaptare imediat)
sau de viteza sintezei enzimelor (adaptare de
lung durat)
Exemple: adrenalina i steroizii
7. Influiena medicamentelor de
diferit origine

Bioenergetica.
Bioenergetica- tiina ce studiaz
transformrile i utilizarea energiei.
n lumea vie sistemul termodinamic
poate fi reprezentat de un organism
ntreg; un organ; o celul; o reacie
chimic.
Organismele vii pot fi considerate sisteme
termodinamice, pentru care sunt valabile legile
termodinamicei:

I. Principiul conservrii energia
reaciilor chimice nu dispare i nu apare din
nimic, dar se transform dintr-o form n
alt.
Ex.: E chimic se transform n E termic,
electric, mecanic.
II Principiul evoluiei toate procesele
asociate cu transfer de energie se
desfoar de la sine numai ntr-o direcie i
numai pn la o anumit limit - ce
corespunde entropiei maximale.
Sistemele biologice sunt sisteme
deschise (schimb de energie i materie
cu mediul nconjurtor)
Fiecare sistem are o energie intern
(E), care este constituit din energie
liber (G) i energie dependent de
variaiile TS (energie legat).
E= G + TS
Fora motrice a reaciilor este tendina
sistemului att de a-i spori gradul de
dezordine, ct i de a-i reduce coninutul
de energie liber ordonat.
Noiune de energie liber standard.
Energie liber reprezint acea parte din energia (total)
intern a sistemului, capabil s efectuieze un lucru
asupra mediului n condiii constante de T i presiune -
G kcal/mol
Dac E= G + TS G = E - TS.
TS - energia legat - nu poate fi utilizat pentru
efectuarea lucrului (T- t absolut; S variaia entropiei
(gradul de dezordine al sistemului).
Creterea entropiei mpedic revenirea la starea
iniial, de aceea reaciile nsoite de creterea entropiei
- sunt ireversibile.
Energia liber standard este partea de energie total a
sistemului, convertit n lucru n condiii standard (G0)
T=298K, C% iniiala 1,0 mol, pH = 7, presiunea
760 torii (1 atm).
Referitor la o singur reacie chimic - variaia
energiei libere standard este diferena dintre
suma energiilor libere ale produilor i suma
energiilor libere ale reactanilor.
G pozitiv 0 cnd produii conin mai
mult energie dect reactanii (substanele
iniiale) endergonice (nu pot efectua un
lucru spontan, necesit energie din exterior).
AB GB GA
G negativ 0 produii conin mai puin
energie dect substanele iniiale exergonice
(fr folosirea energiei) stnga la dreapta
pot efectua un lucru.
G = 0 nu evalueaz nici ntr-un sens.
Reaciile catabolice exergonice
Anabolice endergonice
Legtura (conexiunea) ntre ele este ATP.
Ciclul ATP
ATP- transportor universal al
energiei
n forma sa activ este un
complex cu ionii de Mg sau
Mn
ATP 2 legturi
macroergice(valoare negativ
ridicat a G0),
Servete ca surs de energie
n:
1. Lucrul mecanic: micare,
contracie
2. Biosinteza moleculelor
biologice
3. Transport: transportul prin
membran
4. n transmiterea
informaiei genetice
Ciclul ATP
n condiii standard hidroliza ATP are loc
pe 2 ci:
ATP
ADP
H3PO4
AMP PP
2H3PO4

7,3
kcal/mol
14,6 kcal/mol
Sinteza ATP din ADP i Pi este posibil
pe 2 ci:
1. FO
2. fosforilare la nivel de substrat reaciile
n care energia necesar pentru sinteza
legturii macroergice fosfat e furnizat de
un substarat supermacroergic.
Particularitile structurale ale ATP
ca donor de energie
la pH=7 are 4 sarcini
negative, care se
resping mai puternic
comparativ cu cele 3 din
ADP
Leg macroergice sunt de
tip anhidrid (unesc 2
resturi acide)
Prezena ionilor de Mg
(afinitatea ADP este de
6 ori mai mare
hidroliza este spre
formarea ADP+Pi)
Legtura macroergic. Substane macroergice
Transportul principal al energiei de la
procesele catabolice spre cele anabolice i
forma major de stocare a ei n organism
sunt legturile macroergice fosfat i
tioesterice din diverse substane
Legtura macroergic care la hidroliza
ei se elibereaz mai mult de 5,2kcal/mol
(21 kJ/mol)
Legtura macroergic. Substane macroergice
Compuii supramacroergici G0 (kJ/mol) kcal/mol
1. fosfoenolpiruvat -61,9 -14,8
2. 1,3 difosfoglicerat -49,3 -11,8
3. creatinfosfat -43,1 -10,3
Compuii macroergici -G0 (kJ/mol)
1. ATP ADP +H3PO4 -30,4 -7,3 (7,6)
2. ADP AMP + H3PO4 -28,4
3. H4P2O7 2Pi+H+ -28,4 - 6,9 (-7,3-8)
4. acil~CoA -31,4 -7,5
Compuii submacroergici
Glucozo-1 P -5,0
Fructozo 6 P - 3,8
Glucozo- 6- P - 3,3
Decarboxilarea oxidativ a
piruvatului
DOP la eucariote e localizat n mitocondrii; la procariote citozol.
Are loc sub aciunea complexului multienzimatic PDH, alctuit din:
1. E1 PDH Co1-TPP
2. E2 dehidrolipoiltransacetilaz
S
Co 2- AL
S
3. E3 dehidrolipoilDH HSCoA a.pantotenic
Co3 FAD NAD+
K kinaza specific
F fosfotaza specific, dependent de Ca2+ i Mg2+
X proteina ligand (n E3)
Caracteristica: la E.Coli compus din 48 de lanuri polipeptidice.
Nucleul l ocup E2; iar E1 i E3 se leag n exterior de nucleu. Lanurile
sunt legate prin fore necovalente.

1. Atacul nucleofil - hidroxietiltiaminoPP,
2. gruparea hidroxiettilic se oxideaz cu gr disulfidic- trece n
sulfhidrilic se formeaz acetillipoamid
CH3-CO-COOH +E1-TPP
E1- TPP-CH-CH3
OH
E1-TPP-CH-CH3 + E2 AL
OH
S
S
E1-TPP + E2-AL
SH
S-C-CH3
+ CO2
O
pyruvate dehydrogenase
complex
E2-AL
SH
C-CH3
O
O
O
+
HS-CoA
E2-AL
SH
SH
+
CH3COSCoA
E2-AL
SH
SH
+ E3-FAD E2-AL
S
S
+ E3-FADH2
E3-FADH2 +NAD
E3-FAD+ NADH+H
Reacia sumar:
CH3-CO-COOH
CH3-CO - S CoA + CO2 +NADH+H
Complexul PDH:
E1-TPP, E2-AL
S
S
E3-FAD HS-CoA, NAD
Ciclul Krebs
LR =3 ATP
+

H
3
C C C O

O O
C S
O
H
3
C CoA
HSCo A
NAD
+
NADH
+ CO
2
Pyruvate Dehydrogenase
pyruvate acetyl-CoA






















Reglarea complexului PDH
Inhibat prin retroinhibiie: AcetilCoAE2; NADH E3
Efectul e reversibil la aciunea NAD i HSCoA
Inhibiia alosteric este amplificat de AG
macromoleculari
Reglare nucleotidic, prin sarcina energetic: inhibat
de GTP i activat de AMP
Reglare covalent: complexul PDH este inhibat prin
fosforilare (kinaza PDH), activat prin defosforilare
(fosfataza PDH).
Fosforilarea se amplific la raportul nalt ATP/ADP; acetil
CoA/HSCoA; NADH/NAD; defosforilarea la concentraii
mari de piruvat i Ca

Ciclul Krebs Rolul
Const dintr-o secven de reacii ce se
desfoar n ciclu (realizeaz degradarea lui
Acetil Co A pn la 2 mol de CO2 i produce
energie stocat n GTP, NADH+H, FADH2
Are loc n matricea mitocondrial
Caracter aerob
Rolul:
1. Donor de protoni i electroni pentru LR
2. Integrativ
3. Amfibolic
4. energetic
1. Condensarea lui Acetil CoA cu
OA
2. Izomerizaea citratului n izocitrat
3. DH i decarboxilarea
izocitratului
IDH NAD dependent- localizat n MC
IDH NADP dependent- att n MC ct i n citozol
4. Decarboxilarea oxidativ a alfa
cetoglutaratului
5. Fosforilare la nivel de substrat
6. DH succinatului
7. Hidratarea fumaratului
8. DH malatului
Ciclul acizilor tricarboxilici
(Krebs)
Acetyl CoA
ICit
AC
Mal
FR
a-KG
ICDH
NAD
+

NADH
SCoA
aKGDH
NAD
+

NADH
Suc
SCoAS
GDP
GTP
Cit OAA
CS
Fum
SDH
FAD
+

FADH
2

MDH
NAD
+

NADH
3NADH+H
+
=> LR
FADH
2
=> LR
1 Condensarea
Acetil CoA cu OA
E-Citrat sintetaza
cu formare de
Citrat.

CH
3
-C=O
I
SCoA
COOH
I
CH2
I
C=O
I
COOH
COOH
I
CH2
I
OH-C-COOH
I
CH2
I
COOH
COOH
I
CH2
I
H-C-COOH
I
CH- OH
I
COOH
COOH
I
CH2
I
CH2
I
CH=O
I
COOH
COOH
I
CH2
I
HC-OH
I
COOH
COOH
I
CH2
I
CH2
I
C=O
I
SCoA
COOH
I
CH2
I
CH2
I
COOH
2. Trecerea Citratului la
Izocitrat
EAconitaz- ce contine Fe i
glutation redus.
Enzima exist sub 2 forme
izoenzimatice: a. n MC
b. Citoplasm
3. Oxidarea Izocitratului la Alfa-
cetoglutarat . E-IzocitratDH, care
are ca coenzim NAD, necesit
Mg2+, const din 8 subunitti
(380000D)- este activat de:
ADP- inhibat de: NADH+H+ATP
4. Oxidarea alfa cetoglutaratului
la succinil CoA sub actiunea
complexului polienzimatic Alfa
cetoglutaratDH asemntor
cu complexul Piruvat DH
compus din 5 coenzime i 3
enzime. Procesul se
desfoar n cinci etape.
Diacilarea SuccinilCoA cu
formare de Succinat i
GTP, ca rezultat al
fosforilrii la nivel de
substrat
6.Dehidrogenarea
Succinatului la Fumarat
E- SDH FAD
dependent-
8. Oxidarea Malatului la OA E- MDH
7. Hidratarea Fumaratului la Malat
COOH
I
CH
II
CH
I
COOH
Reacia sumar. Bilanul
energetic
CH3COSCoA +3NAD+FAD+GDP+Pi+2H2O
2CO2 +3NADH+H +FADH2+GTP+2H
+HSCoA
+
+
Reglarea ciclului Krebs
Citrat sintaza:
Inhibat - succinil CoA; AG; NADH; citrat
Activat: S- OA, Acetil CoA
IzocitratDH:
Activat: ADP, Mg, Mn
Inhibat: NADH2 i NADPH2, ATP
Alfa cetoglutaratDH
Inhibat: succinil CoA; NADH2; Se mare
Reaciile anaplerotice
Reaciile ce furnizeaz produii intermediari ai
ciclului Krebs
1. Formarea de OA
Piruvat +CO2+ATPOA+ADP+Pi
E- piruvatcarboxilaza (biotin dependent)
Asp+cetoglutarat OA+Glu
n miocard i muchi:
Fosfoenolpiruvat +CO2+GDP OA +GTP
E- fosfoenolpiruvatcarboxikinaza

Reaciile anaplerotice
2. Formarea alfa cetoglutaratului:
Glu+Piruvat Ala + cetoglutarat + Ala
3. Formarea lui succinil CoA din propionil
CoA (1. din oxidarea AG cu numr impar
de atomi de C; 2. din catabolismul Val, Ile,
Met)
4. Formarea fumaratului (din catabolismul
Fen i Tyr)