Los microorganismos 1) Caracteres generales de los microorganismos, clularas procariota y

eucariota y su presencia en los microorganismos. Los virus. Transferencia de material gentico

en procariotas
2) Estrategias nutritivas y bioenergticas en los microorganismos. Fotosntesis, respiraciones y
fermentaciones en procariotas y eucariotas. Efecto del ambiente: temperatura, pH, presin
osmtica, gases, sustancias qumicas
3) Los protistas inferiores: bacterias tipicas, actinomicetes y cianobacterias, las
arqueobacterias. Criterios taxonmicos, efecto del ambiente, principales funciones en la
naturaleza
4) Los protistas superiores: algas, hongos, protozoos. relaciones evolutivas, caractersticas
nutricionales, efecto del ambiente y funciones en ecosistemas naturales
Ecologa microbiana 5) Nociones de jerarqua ecolgica. Ambientes microbianos: acuticos,
terrestres. Mtodos de estudio en ecologa microbiana: actividad biolgica global, enzimtica,
metablica. Grupos fisiolgicos. Biomasa microbiana. Reconocimiento de los microorganismos
por tcnicas moleculares
Procesos microbianos en la conservacin y produccin de alimentos 6) Fermentaciones lctica
y alcohlica. Aplicaciones biotecnolgicas: leche y derivados, ensilados. Uso de las levaduras,
produccin de etanol. Los microorganismos como fuentes de protenas
Procesos microbianos en los ciclos biogeoqumicos 7) Transformaciones de la materia orgnica
y mineral por procesos microbianos de: mineralizacin-inmovilizacin, o xido-reduccin,
solubilizacin-precipitacin, fijacin-volatilizacin. Caractersticas de los ciclos del carbono y del
nitrogno
8) Degradacin de la materia orgnica. Glcidos simples, polmeros de reserva y de pared
vegetal: almidn, celulosa, sustancias pcticas. Sustancias aromticas: fenoles y derivados,
lignina, taninos. Los hidrocarburos. Humificacin: procesos de humificacin y deshumificacin
9) Mineralizacin-inmovilizacin del nitrgeno: Amonificacin y nitrificacin. Microoganismos,
ecologa y rol para los vegetales y el ambiente. Ciclo interno del nitrgeno, biomasa
microbiana. Prdidas de nitrgeno, desnitrificacin
10) Ciclos de otros elementos; azufre, fsforo, hierro: Procesos microbianos, microrganismos y
ecologa
Los microorganismos y los animales 1) Microorganismos del rumen: mtodos de estudio,
bacterias, protozoos y hongos. Actividad biolgica y asociaciones microbianas. Procesos
microbianos en las interacciones con los vegetales 12) La rizosfera, filosfera, espermatosfera,
mantillos. Mtodos de estudio. Compuestos liberados por las races y metabolitos microbianos.
Efectos rizosfrico sobre grupos microbianos. Ecologa
13) Interacciones biolgicas entre microorganismos. Neutralismo. Sinergismo: comensalismo,
protocooperacin o simbiosis nutricional, simbiosis. Antagonismo: competencia, amensalismo,
predacin, parasitismo. Funciones en los ecosistemas
14) Fijacin biolgica del nitrgeno (FBN) por diazotrofos en vida libre y en la rizosfera.
Bioqumica de la FBN, la nitrogenasa. Proteccin frente al oxgeno. Fijacin por autotrfos:
bacterias fotosintticas anoxignicas, cianobacterias. Por hetertrofos: Azotobacter,
Azospirillum, Clostridium.
15) Fijacin de nitrgeno por la simbiosis rhizobio-leguminosa. Las leguminosas. La bacteria:
taxonoma, requerimientos nutritivos. Nodulacin y estructura nodular. Gentica y factores
limitantes de la FBN: fsicos, nutrientes, el N-combinado, otros microorganismos. Inoculacin.
16) Simbiosis fijadoras de nitrgeno en no-leguminosas. Ndulos tipo Cycas, tipo Parasponia.
Asociaciones con Frankia (actinorrizas). Especies noduladas, distribucin y usos. Aislamiento y
cultivo del endofito. Nodulacin, fijacinde nitrgeno, perspectivas.
17) Las micorrizas. Tipos ms importantes: ectomicorrizas y endomicorrizas del tipo arbuscular.
Interaccin entre los hongos y las races. Hongos simbiticos, posibilidades de cultivo y
formulacin de inoculantes. Ecologa y manejo de estas simbiosis.
Procesos microbianos promotores del crecimiento vegetal 18) Promocin del crecimiento
vegetal por mecanismos directos: liberacin de sustancias probiticas, fitohormonas,
mineralizacin, solubilizacin de nutrientes Por mecanismos indirectos: Control biolgico de
microorganismo fitopatgenos. Seleccin de antagonistas (bacterias, hongos), evaluacin de
efectos. Formulaciones comerciales.
Procesos microbianos en la proteccin ambiental 19) Biodegradacin de restos orgnicos. En
aerobiosis: residuos lquidos (piletas y reactores), slidos: compostaje: fases del msmo,
microflora, productos finales y aplicaciones. En anaerobiosis: metanognesis, etapas del
proceso, metanobacterias. Aplicaciones del biogs y del biofertilizante.
20) Biodegradacin de xenobiticos. Inorgnicos: metales pesados, orgnicos: pesticidas,
molculas recalcitrantes. Biorremediacin de suelos: procesos microbianos en la degradacin
de sustancias slidas.
21) Anexo Prctico Indicadores biolgicos de la calidad del suelo: actividades respiratorias,
enzimticas, biomasa microbiana (Fumigacin-inoculacin, Fumigacin-extraccin. Recuentos
microbianos: microflora heterotrfa total, actinomicetes, hongos, algas, protozoos, Ciclo
biolgico del carbono: celulolticos, amilolticos Ciclo biolgico del nitrgeno: FB por organismos
en vida libre y en la rizosfera: aislamientos y recuentos, efectos rizosfricos (R/S), actividad
nitrogenasa. Simbiosis fijadoras de N2: seleccin de cepas de rhizobio, reconocimiento y
recuentos: totales, viables en caja, en planta. Inoculacin de leguminosas. Aislamiento de
Frankia, medios de cultivo, inoculacin. Mineralizacin del N y prdidas: amonificacin,
nitrificacin, desnitrificacin. Tcnicas ecolgicas. Ciclo biolgico del azufre: aislamiento de
sulfooxidantes y sulfatorreductores, recuentos. Ciclo biolgico del fsforo: aislamiento de
mineralizantes del P-orgnico, solubilizadores del P- insoluble. Tcnica ecolgica. Asociaciones
micorrticas: ectomicorrizas: aislamiento y cultivo de hongos, endomicorrizas arbusculares,
produccin de inoculantes en plantas trampa. Compostaje y vermicompostaje: parmetros de
evaluacin del grado de madurez: C/N, pH, amonio y nitratos, hidratos de carbono
Prlogo
preocupa a la comunidad cientfica que busca soluciones para mejorar la calidad de la vida

El objetivo de este libro es despertar inquietudes en los estudiosos de diferentes disciplinas
como Microbiologa, Ciencias de la Tierra, Biologa y en todos aquellos interesados en
aspectos relacionados a procesos microbianos que contribuyen a la dinmica de los
ecosistemas naturales. Las transformaciones de materiales orgnicos de muy diferente origen
que se depositan en la biosfera, como los restos vegetales, animales y productos de la
actividad del hombre, son de origen biolgico. La polucin consiguiente provocada por la
acumulacin de numerosos productos, Los procesos de xido-reduccin que alteran la
disponibilidad de importantes nutrientes vegetales, como el N, P, S, P, Fe, Mn, etc. son
realizados por equipos enzimticos contenidos en los microorganismos. Un captulo especial
de este libro est dedicado a procesos fermentativos responsables de la conservacin de
alimentos para el hombre y los animales (ensilados). La promocin del crecimiento vegetal por
los microorganismos que se realiza por mecanismos directos: produccin de sustancias
probiticas, aumento de la disponibilidad de nutrientes por procesos de mineralizacin,
solubilizacin, fijacin de N2 y aquellos indirectos, debido al control biolgico de
microorganismos patgenos, merece un tratamiento especial, por las potencialidades de
incidencia que el hombre posee por tcnicas de manejo que incluyen inoculacin con
organismos seleccionados. Finalmente, un apndice prctico permite la realizacin de
experiencias sencillas para poner de manifiesto y evaluar los procesos realizados por los
microorganismos. Deseamos que esta contribucin ayude al desarrollo de futuros
experimentadores.
Ro Cuarto, diciembre de 1999 Montevideo, mayo de 2005
Captulo 1
Caracteres generales de los microorganismos
Introduccin Los microorganismos constituyen un importante grupo de organismos primitivos y
simples, la mayora unicelulares microscpicos y otros macroscpicos filamentosos o
cenocticos, capaces de realizar innumerables procesos biolgicos, que han surgido muy
temprano en la evolucin, pero que se han adaptado a las condiciones ambientales actuales. El
grupo est integrado por las bacterias, algas, hongos, protozoos. Estos organismos cumplen
con los 5 principios caractersticos de las clulas vivas: 1. autoalimentacin o nutricin: las
clulas toman las sustancias qumicas del ambiente, las transforman, liberan energa y
productos de desecho 2. autoduplicacin o desarrollo: las clulas son capaces de dirigir su
propia sntesis. Al crecer, se dividen dando dos clulas cada una idntica a la original. 3.
diferenciacin: la mayor parte de las clulas pueden presentar cambios en su forma o funcin.
La diferenciacin suele ser parte del ciclo de vida celular: se forman estructuras especializadas
comprometidas con la reproduccin sexual, la dispersin, la sobrevivencia en condiciones
desfavorables (esporas, cistos, etc). 4. sealamiento qumico: interactuan o se comunican con
otras clulas, por seales qumicas 5. evolucin: es la introduccin de cambios hereditarios
como resultado de la seleccin natural.
Consecuencia de estos cambios (que ocurren a velocidad baja pero regular en todas las
clulas) es la seleccin de los organismos mejor capacitados para vivir en determinado
ambiente.
Los estudios con el microscopio electrnico permitieron reconocer diferencias en la
organizacin subcelular de los organismos. Existen dos tipos de clulas: la eucaritica, unidad
estructural de animales, vegetales, protozoos, hongos y la mayora de las algas, y la
procaritica, caracterstica de los organismos ms simples, las bacterias, incluyendo entre
stas a las cianobacterias A pesar de la extraordinaria diversidad de clulas eucariticas,
resultante de la especializacin evolutiva de los distintos grupos, su arquitectura bsica es
comn: compartimentalizacin por sistemas membranosos (RE y Golgi), corrientes
citoplasmticas, mitocondrias y cloroplastos. El ncleo de los eucariotes est rodeado por una
membrana nuclear, contiene varias molculas de ADN y se divide por mitosis o por una
completa reproduccin sexual, que incluye fusin de clulas, formacin de zigote diploide y
segregacin de clulas hapliodes luego de la meiosis (figura 1).
La clula procariota, por el contrario, no posee membrana nuclear, posee una sla molcula de
ADN y la divisin asexual es por biparticin, amittica. La clula no est atravesada por
membranas, no posee organelos, excepto sacos muy simples que alberguen a los pigmentos
fotosintticos y a veces vesculas de gas para flotar en el agua.

Figura 1- Esquemas de una clula procariota (a) y una eucariota (b)
Los estudios a nivel de funciones celulares mostraron que estas diferencias estructurales son la
expresin de mecanismos diferentes de:
transmisin de la informacin gentica
del metabolismo bioenergtico
de los procesos de entrada y salida de sustancias Uno de los hechos ms sorprendentes en
la historia de la evolucin debe ser sin duda la aparicin de la primera clula eucaritica. Se
est lejos de comprender las causas de este gran salto en la evolucin, sobre todo por la
ausencia de fsiles, que permitan reconocer intermediarios. Cavalier- Smith (1981) postula a un
hongo hemiascomicete como el primer organismo eucariota, que fue adquiriendo los 2
caracteres universalmente presentes en los eucariotas y ausentes en los procariotas, a partir
de una bacteria aerobia. Esta hiptesis se contradice con la creencia general de que este
organismo primitivo fuera una cianobacteria (Stanier et al., 1976).
Ya desde la segunda mitad del siglo XIX se vislumbraban diferencias entre animales y
vegetales con los organismos ms simples, como las bacterias, hongos, algas y protozoos. El
zologo alemn Haeckel propuso incluir a estos ltimos organismos en un nuevo reino, el de
los Protistas:
integrado por organismos muy simples, la mayora unicelulares, microscpicos, y otros
macroscpicos filamentosos o cenocticos, conocidos vulgarmente como microorganismos.
No se diferencian en tejidos ni rganos, ni presentan especializacin funcional, excepto, tal vez,
para la reproduccin. Luego de la evidencia de la existencia de los dos tipos de clulas, el reino
de los protistas se dividi en: Protistas inferiores, con clula procariota, que incluye a las
bacterias, con las cianobacterias y actinomicetes y a los Protistas superiores, con estructura
eucariota, que comprende a las algas, protozoos y hongos.
La figura 2 muestra un esquema de la evolucin del mundo vivo basado en la estructura del
ARN de los ribosomas (Brock y Madigan, 1993). Desde el punto de vista evolutivo los
organismos se pueden dividir en tres grupos principales: arqueobacterias, eubacterias y
eucariotes.
Aunque las eubacterias y las arqueobacterias son procariotas, desde un punto de vista
evolutivo no estn ms estrechamente relacionadas entre si como lo estn con los eucariotas.
Las arqueobacterias (Aechaeae) comprenden un grupo muy primitivo que incluye organismos
halfitos y termfilos extremos y a las bacterias metanognicas, anaerobias estrictas