"

Tratar de desarrollar mtodos de diagnstico, teraputicos y mtodos de

prevencin de enfermedades. No hay que esperar que se desarrolle la
enfermedad. si prevenimos, podemos evitar algunos de los sntomas o
toda la enfermedad. Tratamos de descubrir marcadores de la
enfermedad. Cul o cules son las molculas causantes.

La fuente de la biomedicina molecular es la investigacin bsica,
tratar la molcula.


#














William Osler fue el padre de la biomedicina. Postul que los objetivos
de un mdico deberan ser intentar localizar el secreto de la enfermedad
para buscar las fuentes que causan esta enfermedad y correlacionar
estos datos para posbiles futuras enfermedades.

Variability: variabilidad innata del ser humano. Incluso los gemelos son
diferentes(epigentica distinta). Esto es debido al medioambiente (lo que
comemos, el ejercicio fsico, etc), hace que la forma en la que el
contenido gentico se expresa sea diferente. El tratamiento es lo
complicado (encontrar un tratamiento ideal para cada persona).


















$
Archival Garrod: Estudiar los fluidos (orina) y estudiar los metabolitos
presentes en los enfermos. Metabolitos asociados a rutas metablicas.
Cualquier fallo en cualquiera de estos pasos, va a producir que se
acumule el reactivo y va a presentar una patologa ms o menos grave.
Ej. acumulacin de amoniaco en la orina. Si no se elimina causa
importante toxicidad.

1920-30 V. McKusick dedujo que debera haber una clasificacin
sistemtica de una determinada enfermedad con el gen asociado.

Sistema OMIM: Se le atribuyen 6 dgitos a cada enfermedad cuyo
origen homogentico se conoce. Se suele actualizar semanalmente.
En esta clasificacin se utilizan parmetros como modo de herencia, etc.
- 1er dgito, modo de herencia (1, enfermedad de carcter dominante
en un gen autosmico; 2, recesivo; 3, ligada al sexo; 4 , mitocondrial
)
- 2ndo dgito en que cromosoma se encuentra
Con estos 6 dgitos queda totalmente definida la enfermedad.
Es caracterstico de todas enfermedades genticas que la enfermedad
se deba a dficit de una enzima. Heredabilidad recesiva.





















%



















Asociar el genotipo a un fenotipo determinado ha podido desarrollarse
gracias al estudio de las protenas. Se puede conocer la estructura de
una protena en condiciones normales y patolgicas para ver si existe
alguna diferencia.

Hay aproximadamente un 98% de material gentico que no da lugar a
protenas. (DNA basura). Este DNA es el "interruptor" del resto de los
genes que se tienen que transcribir. Se transcribe a RNa y este regula el
RNAm que se transcribe a protenas.

Con el descubrimiento de la estructura del DNA se pas de las protenas
(difciles de estudiar, de trabajar con ellas, etc). Sin embargo, el DNA es
muy fcil de secuenciar, puedo localizar las mutaciones por terminacin
impropia, alteracin en un aminocido, etc.

CRONOLOGA
1985: PCR implic que con una pequea cantidad podemos tener una
gran cantidad de DNA.
1990: Comienzo del proyecto genoma humano. Se pensaba que al
conocer el origen podramos arreglar las enfermedades. solo un 2% de
diferencia con el genoma del ratn. La diferencia no est en el genoma
si no en cmo se expresa ste. No hay asociacin del DNA (la
&
secuencia) con una enfermedad, pero s hay asociacin de patrones de
DNA.

















RNA interference: Importante para regular la expresin de estos genes.

2012: Yamanaka, clulas diferenciadas podran transformarse en celulas
madre con capacidad de formar cualquier tipo de clula en un organismo
vivo. Aun no se controla la tcnica, podemos curar la diabetes pero
provocar un cncer.















'
Definicin gentica de la enfermedad: Asociamos una enfermedad al
genotipo. Hoy en da se pueden asociar muchas enfermedades de
herencia mendeliana y definir los loci que estn implicados. Tambin
podemos definir enfermedades polignicas pero es importante decir que
el parmetro clnico y gentico deben ir ligados.


























Migraas se han asociado a condiciones ambientales. El contenido
gnico est predispuesto a expresarse en diferentes ocasiones y frente
a diferentes situaciones.







(


















Diferentes mutaciones en el mismo locus ! Sndromes diferentes.
Cada mutacin da lugar a una enfermedad distinta. Una mutacin en el
mismo locus (nico sitio donde se aloja un gen; y este gen formado por
los exones) puede dar lugar a una sobreactividad de este gen o una
infractividad, produciendo enfermedades distintas.

Sobreactividad: Unin ligando alterado, se va a poner a fosforilar sin
ligando, sin estimulacin. Esta fosforilacin excesiva hace que comience
a crecer, produciendo cncer.
Infractividad: No responde siquiera a ligando (aunque se una el ligando,
no hay respuesta) . Puede ocurrir que ciertos rganos que tienen que ser
enervados no lo sean porque no llegan las neuronas a ellos. Falta de
movilidad en el esfago, atasco, infeccin que puede provocar una
sepsis, pasando la infeccin a la sangre.

El conocimiento de una mutacin determinada sin asociar un fenotipo
ms no nos dice nada. Si no se dan las condiciones adecuadas, si
estamos en un ambiente contaminado o no contaminado, una ingesta de
comida u otra puede llevarnos o no a esa enfermedad ! solo nos
predispone.



)
Mutaciones en diferentes loci ! mismo sndrome clnico.
Hemos detectado en el cromosoma 17 una regin que codifica para un
gen determinado secuenciado que sabemos que produce la protena
BRCA que produce el cncer de mama hereditario.

Las hijas se someten a la secuenciacin y no tienen esta mutacin en el
cromosoma 17. Al cabo de un tiempo desarrollan cncer. La mutacin
estaba en el cromosoma 13. Otra protena, BRCA, que no es la 1 , es la
2 pero tienen la misma funcin.
Las unidades de consejo gentico estn muy bien para mutaciones muy
especficas y definidas como el cncer de clon.























Comenz como un consorcio pblico pero posteriormente apareci
Celera Genomics que era una empresa privada que hizo que se llevara a
cabo ms rpido la secuenciacin del genoma humano.




*









































La complejidad est
en como se expresan
dichos genes.
"+









































Promotores a los que
se unen y dicen si se
va a transcribir o no.
La parte promotora es
la que dice si se va a
traducir,
""














Cdigo de colores.
Rojo son las que finalmente nos va a dar lugar a la secuencia de la
protena.
Negro: se transcriben pero no se traducen.
Verde: nos dice si estas dos regiones, la negra y la roja, se van a
transcribir.
La regin de arriba no se sabe hasta donde llega, cuntos pasos se
necesita.A partir del conocimiento de algunos promotores, buscamos
secuencias promotoras en la secuencia.


















"#
LINEs, SINEs, LTR, Transp. Estas secuencias altamente repetitivas
que suelen tener origen en genoma vrico. No codificantes para
protenas, pero si para RNA. Estudio en el futuro.






















FACTOR VIII: patologa o anomala que produce las hemofilias.
Asociado al cromosoma Y (herencia recesiva). Las mujeres no tendrn
hemofilia pero pueden ser portadoras.

NF1: Neurofibromina puede producir malformaciones y generalmente
generacin de tumores pero tiene un fenotipo muy variado, desde las
manchas caf con leche muy esparcidas por todo el cuerpo hasta
malformaciones en generacion de tejidos externos (crecimiento
excesivo de los tejidos) neurofibromiosis. El mecanismo molecular
consiste en que la NF actua como un factor inhibidor de crecimiento
sobre la protena RAS. sta es una protena de oncogen que controla el
crecimiento celular. Si esta protena la tenemos mutada hay un
crecimiento celular descontrolando, que es lo que genera los tumores.
- TIPO I : Nivel muscular y ganglios distribuidos por el cuerpo que
no son cerebrales.
- TIPO II: Tejido cerebral.
A mayor tamao mayor
probabilidad de encontrar
genes. Un tamao medio de
4kB
"$
DISTROFINA (DMD): Contraccin muscular, patologa que supone la
aparicin de un codn de stop. No se produce la protena. Distrofia
muscular de DUCHENE, la ms grave.
Alteracin del crecimiento, sobre todo musculacin lisa, se degenera el
msculo. Msculos no son capaces de mantener erguido el cuerpo y se
van deformando. Muerte por parlisis de rganos. musculo cardiaco o
musculo respiratorio.
Hay una distrofia menos grave porque se produce un acortamiento de
la protena, que puede suplir un poco de la funcin.































distintas razas y poblaciones
humanas para comparar.
"%
En sus inicios (2005-06) surgi como una necesidad de intentar
descifrar lo que haba sido la secuenciacin del genoma humano.
Explicar por qu habia tan pocas diferencias. Sigue en proceso proque
se va ampliando, ya se va por el 10%.





















Esto ha llevado a redefinir lo que es un gen.
gen: unin de las secuencias genmicas que codifican un conjunto
coherente de productos funcionales, potencialmente solapantes. La
funcin no tiene porqu ser una protena.
solapantes: una misma secuencia puede dar lugar a diferentes
moleculas con diferentes funciones.










"&



















Importancia de los RNA como agentes funcionales. Hoy en da hay
muchas tcnicas teraputicas que basan su inters en los efectos del
RNA de interferencia*.



















"'


Todo proceso patolgico tiene su origen en un gen:
- Enfermedades monognicas: herencia mendeliana. Siguen las
leyes de mendel. Son las ms numerosas, pero son las que
afectan a menos personas (enfermedades poco frecuentes, raras,
que afectan a menos de 5 individuos por 10.000 habitantes).
Estas patologas no estn muy investigadas a nivel de
diagnstico y tratamiento.
- Enfermedades polignicas: Dependen de ms de un gen. No
son muchas (4 0 5) como cncer, obesidad relacionada con
diabetes, etc. Afectan a mucha gente, son muy complejas.
Muchos gobiernos financian todos los programas destinados a la
investigacin de estas enfermedades.

Las principales causas de mortalidad tienen factores genticos:
- Enfermedades cardacas: A este grupo pertenecen entra
hipertensiones, hipercolesterolemia, etc ! Enfermedades que
afectan al sistema cardaco.
- Cncer: Muchas personas no mueren de cncer si no del
tratamiento para tratar el cncer. Tratamientos muy agresivos, no
soportan el tratamiento (Fallo heptico, parada respiratoria,etc.)
Este nmero de mortalidad est infravalorado.
- Enfermedades monognicas: Muchas personas no llegan a
nacer, es incompatible con la vida y se produce un aborto. Esto
no contabiliza como muerte. Por eso porcentaje tan bajo.













cromosoma 14
prcticamente
no tiene brazo
corto
Pueden existir sobre
mutaciones encima de
esa mutacin.
"(
Cmo nombrar un cromosoma:
- 1er numero: Nmero de cromosoma
- Letra: p!pequeo (brazo corto) q! (Brazo largo)
- Nmeros (3-4) se corresponden con la banda en que aparecen.
Estas bandas son debidas a tinciones que se hacen de los
cromosomas con diferentes colorantes que se intercalan en el DNA
dependiendo de la composicin de ste. (TEMSA). La numeracin
comienza con la zona ms cercana al centrmero y va aumentando
conforme nos acercamos a los extremos.




















- Genmicas: Juegos de genomas. Generalmente nosotros
tenemos dos juegos genmicos. En humanos es raros encontrar
esto, pero el trigo tiene hasta 6 veces su material gentico.
- Cromosmicas: Pueden dar lugar a mejoras de especie o
funcin patolgica dando lugar a enfermedad.
o Trisomas
o Sndrome de Down
o Sndrome de Turner que se elimina
o Translocaciones: se intercambian cromosomas



")

















No balanceada: Un cromosoma se queda ms largo que otro al llevar a
cabo la translocacin.






















"*













- Pleiotropismo: Es muy difcil asociar un genotipo a un fenotipo.
Nuestro organismo es multifuncional y multirgano. No todo el mundo
responde igual ante una enfermedad porque depende del nivel de
expresin de un gen. No todo el mundo lo "demuestra" igual.
- Mosaicismo: Inicialmente pensamos que todas nuestras clulas
presentan el mismo material gentico. El material gentico es nico pero
en cada divisin celular ocurren mutaciones y reordenaciones del
material gentico.
Ej. sindrome de down. El nivel de expresin esvdiferente (diferente
grado de afectacin). No todas las clulas presentan trisomas.

El 1% de la poblacin general presenta mosaicismo gentico. En la
mdula sea pueden existir clulas con diferente material ! Rechazo.















#+





















- Carcter penetrante con expresividad constante: Presente en
toda la poblacin y adems con expresividad constante. Todos
presentan el mismo fenotipo y con el mismo grado.
- Carcter penetrante con expresividad variable: En la NF la
expresividad es muy variable, porque pasa de una simple mancha a un
tumor. La penetrancia es total porque todos lo expresan pero la
expresividad es variable porque no todos presentan tumor.

Penetrancia baja a todo lo que est por debajo de 100%
- Penetrancia total (100%)
- Penetrancia baja (<100%)

No existe un tratamiento nico para una enfermedad y mucho
menos para una polignica.






#"









































##






































- Herencia mtDNA: Las mitocondrias se heredan solo de las madres. No
son caracteres ligados al cromosoma x, debido a que no estn ah, pero
si estn ligados al sexo femenino.Como afectan a las mitocondrias y su
#$
funcin es proporcionar energa a las clulas, cualquier alteracin en
ellas afectar a la funcin deproporcionar energa en los rganos que
ms la necesitan. Neuropata ptica hereditaria de Leber:
Degeneracin. Pierde toda la visibilidad en la adoslescencia.
- Impronta gnica: No se hereda como cualquier gen pero s que hay un
patrn de herencia de la impronta. Los cromosomas saben de aquellas
regiones que estn metiladas y tienen que desmetilarse para la divisin
y que luego tienen que metilarse de nuevo. No es una herencia basada
en el material gnico. Prader-Willi, Angelman: Neurodegenerativas.
- Mosaicismo gonadal: Variabilidad en el contenido gnico asociadas a
las clulas germinales. Por lo tanto, se heredan.
- Expansin de tripletes: Produce un gran nmero de enfermedades
asociadas a procesos neurolgicos y neurodegenerativos. Es un factor
predictivo. Se va aumentando conforme van pasando de generacin en
generacin. Cromosoma X frgil: Uno de los ms estudiados.





















Enfermedades del consejo gentico. Personas que tengan
predisposicin pueden desarrollar la enfermedad. Si no esa persona, sus
descendientes si la padecern.
Enfermedad de Huntigton: Tembleque, discapacidad con el tiempo.

#%
- Gentica o de locus
- Fenotpica, Fenotropismo













Si hay deleciones, multiplicaciones, etc siempre se va a producir una
enfermedad. Mutaciones que no producen enfermedad en segn qu
casos.
SNP muy abundantes en el organismo y pueden producir variaciones
fenotpicas pero no patolgicas. Puede determinar en algunos casos
riesgos de padecer enfermedad pero no se tiene y tambin puede
determinar como responde el organismo a determinados factores
ambientales.
Generalmente cualquier tratamiento qumico es la ingesta de algo, un
frmaco que es un xenobioico que tiene que ser eliminado. En funcin
de cmo trabajen de bien estas enzimas as sera la respuesta del
organismo a esta frmaco.
#&






















Diferencia es la frecuencia. Para que un SNP sea considerado como tal
tiene que darse al menos en un 1% de la poblacin. Todas las
mutaciones que se den menos de ese 1% sern mutaciones puntuales.

SNP: Mutaciones puntuales con una frecuencia mayor de 1% en la
poblacin. Esto significa que tiene un sentido que sean as por la
frecuencia, si no seran al azar. La presencia de SNP y las asociaciones
de stos tiene una significacin mas all del estudio de una mutacin
puntual. En el genoma humano se est encontrando ms
frecuentemente. Puede haber entre 3.000.000 y 6.000.000 de SNP.
Normalmente son cambios de A a T.

Cambio sinnimo: Da el mismo aminocido
Cambio no sinnimo: cambio de aminocido, puede dar lugar a un
cambio estructural de la protena.

Se pueden dar alteraciones en regiones promotores dando lugar a
cambios en la cantidad, espacio o tiempo de la expresin gnica.

#'

Tambin se pueden dar en intrones (alteraciones en el spliciing de la
protena dando lugar proteinas anmalas).
Regiones no codificantes, que tambin pueden ser reguladoras.

SNP no es sinnimo de enfermedad, da variabilidad al ser humano.
Es como la huella gentica.




















Haplotipo: No es un SNP, es el estudio de asociaciones de SNP. Una
asociacin de SNP origina un haplotipo determinado que generalmente
va a ser una asocacin de SNP q van a estar localizados a determinada
distancia para que segreguen juntos (van a terminar en la misma
cromtida). Para que un conjunto de SNP formen un haplotipo deben
estar suficientemente juntos. Por esto se mantienen SNP de padres a
hijos.
HAPMAP: Mapa de haplotipos con el fin de indagar ms en porque la
diferencia, porque muchas veces no se puede asociar un gen a una
enfermedad. Asignar SNPs a un grupo de molculas determinado. El
estudio de HAPMAP es an diverso y no da informacin concreta.

8 Possible haplotypes: Cuando se estudia la poblacin se observa que
unas son ms probables que otras.
las que aparecen
sombreadas son las
que no son probables.
#(



















Se identifican grupos de haplotipos asociados a enfermedades. Se coge
una poblacion de personas que sufren una determinada enfermedad, se
estudia un conjutno de haplotipos y se intenta asociar estos haplotipos a
la enfermedad. Lo que se ha encontrado es que hay alrededor de 300
haplotipos relacionados con 150 enfermedades complejas. Esto me va a
llevar a poder hacer un diagnstico. Biomarcador, puedo utilizar como
biomarcador la glucosa para localizar una diabetes, pero hay
enfermedades de las que se desconocen biomarcadores. Es muy
importante encontrar marcadores de esas enfermedades y los haplotipos
nos pueden ayudar a eso.
Hoy en da es inviable, no se hace porque no nos da informacin, somos
muy variables y a no ser que se haya establecido un estudio como este
no sirve. Es un campo en el que se esta tratando de avanzar.












#)


















Agrupacin familiar: An asociando determinados genes a familias hay
condiciones ambientales que pueden o no definir si la va a padecer.
Podemos pasar de enfermedades monognicas cuyo causantes son los
genes mayormente a enfermedades polignicas donde los factores
ambientales son ms importantes.
El fenotipo de una persona depende de varias cosas entre ellas el
contenido gnico, el ambiental y un factor bastante importante es la
epigentica.















El factor epigentico
es lo que da lugar a la
evolucin, diversidad,
complejidad. Interesa
estudiarla en humano

Desde los genes hasta
factores mediambientales. En
todos ellos est el factor
epigentico.

La complejidad aqu se
refiere a que hace an
mas dificil el estudio de
las enfermedades.

#*
















Regulacin epigentica: Condensamiento de la cromatina, fenmeno
sumamente variable. En cada clula se condensa y se descondensa de
una forma muy variada.





















$+
Se tiene en primer lugar el factor epigenerador (tabaco, etc). Una vez
que ese factor llega al ncleo de la clula se establecen cambios en el
material gentico. RNA no codificantes o protenas.
Se necesita adems algo que mantenga ese cambio epigentico
(cambios en las histonas, modificadores de DNA, variantes de histonas
que no son histonas reales, etc.) Todo ello hace que se genere un factor
epigentico que aunque no es propiamente el material gentico,
tambain es heredable.
Nuestro estilo de vida lo vamos a dejar de herencia a nuestras
futuras generaciones.































$"
Ubiquitinacin: Ubiquitina se asocia a protenas y les indica que
orgnulos tienen que ser destruidos o trasladados a algun lugar. En
funcin de la cantidad que tengan, las histonas tendrn una direccin u
otra dentro de la clula.
Impronta gnica: Deja una especie de huella en el DNA que es
hereditaria.



































$#
Genes que en un momento determinado se anulan y no tienen ninguna
funcin. Del cromosoma x (uno de los cromosomas x se silencia).
Hay unos cuantos en el genoma humano que estn regulados por esta
forma. Marcados con estrellitas. Cuando son expresados y no deberan
pueden producir una patologa.
Sndrome de Prader-Willi: Silenciamiento del cromosoma materno.
Sndrome de Silver-Russell: Silenciamiento del cromosoma paterno.


















Vidaza: frmacos cuya diana son factores epigenticos. Patrones de
factores epigenticos. Puedo desarrollar frmacos que me ayuden a
acabar con enfermedades. Hacer que se exprese el gen de factor
supresor de tumeros (no se sabe como se puede hacer, prque tambin
se puede inducir otro tumor).











$$
















Mapa: Tenemos la contribucin de la transcriptomica, protemica,etc
que todas ellas nos ayudan a conocer la enfermedad.
Medicina preventiva: si el diagnostico es precoz.
Terapia Gnica: En algunos casos. Tambin terapica proteica.





















$%


















1990 ! El conocimiento ha hecho que cambiemos el punto de vista.
Antes no importaba el entorno, estudibamos nicamente la molcula.
2000 ! Hay que entender el proceso biolgico como un todo.




















$&
Tambin hay que estudiar el transcriptoma, los transcritos de los genes
son los que dan lugar finalmente o no a la protena.
Una celula cancergena, antes de ser cancergena tiene el mismo
genoma que tena antes, a no ser que haya mutacin de un gen, asi que
lo probable es que haya habido un cambio en el transcriptoma.

Una clula cancergena tienen el mismo genoma antes y despus del
tratamiento normalmente. Ciertos tratamientos son resistidos por las
clulas cancergenas. Ha cambiado el transcriptoma. esa clula se
defiende produciendo una protena que antes la tena, pero la expresaba
poco. Ante un ataque qumico, produce ms protena cuya funcin es
expulsar dicha sustancia qumica, hacindose resistente.





























$'










El proteoma es dinmico por lo que no es fcil de definir algo exacto. Va
cambiando con el tiempo. Hay que definirlo con muchos parmetros.
Localizacin: En muchas enfermedades la protena se expresa pero no
el sitio adecuado.



















Estudios encaminados a hacer un anlisis de los metabolitos de un
individuo y asociarlos con la enfermedad. Si se acumulan, deducimos
que la enzima que los produce est afectado.
Es ms fcil analizar metabolitos porque suelen estar en fluidos
fcilmente accesibles como sangre. Tnicas HPLC, cromatografa de
alta definicin.


$(



















Es ms facil asociar un metaboloma con la ingesta de un frmaco
determinado. Si se acumula podemos deducir que el enzima capaz de
metabolizar ese frmaco est mal .

Fuente de biomarcadores : Ms facil utilizar como biomarcador una
sustancia que se encuentra en la orina y en la sangre que una que est
en el DNA.















$)