Cules son los principales tipos de procesos que se emplean en el tratamiento de aguas

residuales y describa cada tipo, y de ejemplos de ellos?

Respuesta: se emplean los procesos fsicos, qumicos y biolgicos.
Los procesos fsicos, son aquellos en los cuales se usan las propiedades fsicas de los elementos
para logar un objetivo especfico, dentro de stos podemos mencionar: el cribado, la flotacin, la
sedimentacin, entre otros.
Los procesos biolgicos son aquellos en los cuales se utiliza la capacidad de las bacterias para
degradar la materia orgnica y la de las plantas de absorber los nutrientes generados por las
bacterias, para este propsito se pueden emplear: bacterias aerbicas, anaerbicas o facultativas.




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Parte 4 - Preparar para ordenar


La muestra de ADN se ha purificado, el tubo de PCR debera contener
ahora casi nada ms
que copias del ADNr 16S. Ahora, podemos preparar la muestra para la
secuenciacin automtica. La tecnologa de secuenciacin del ADN es
otra rea de labiologa molecular que ha sido testigo de una impresionante
cantidad de refinamiento.El mtodo predominante, se
muestra aqu, se llama PCR la secuencia del ciclo. (Ms informacin sobre la
secuencia del ciclo antes de continuar.)

En este laboratorio, se utiliza un conjunto de 12 iniciadores, seis para
cada captulo de la doble cadena de ADN. En teora, es posible utilizar un nico
primer ciclo de PCR en la secuencia, pero
no es factible para secuencias largas. Con cebadores mltiples,cortos, se
extiende la superposicin de ADN se ordenan para obtener
la secuenciacompleta. Adems, no es absolutamente necesario para
secuenciar ambas cadenas,aunque ambas cadenas genera la secuencia de
datos redundantes, reduciendo as elerror. El nmero exacto y la localizacin de
los cebadores utilizados en una reaccindepender de la disponibilidad de
los cebadores adecuados. Los cebadoresutilizados aqu son disponibles de una
fuente comercial y se unen a regionesconservadas del gen 16S ADNr. Por
consiguiente, deberan ser capaces de unirse a lasecuencia, independientemente
de la fuente de bacterias.

Cada tubo verde y azul contiene un "brebaje secuencia" que consiste
en tampones,cebadores (uno diferente en cada tubo), las polimerasas de ADN, los
nucletidos, yterminadores de fluorescencia de etiquetado en las proporciones
adecuadas. El producto de PCR del paso anterior se aade a cada tubo y otro de
PCR se ejecuta.Esta vez el objetivo no es producir copias idnticas de ADN,
pero muchas copias delongitud variable. La animacin ilustra lo que
ocurre en un tubo que contiene la cartilla651R. Cada cadena de ADN se
une la cartilla en un extremo y tendr una fluorescenciaterminador marcado en
el otro extremo.

Parte 5 - Secuenciacin de ADN

Desde el ltimo paso, usted tiene 12 tubos que contienen el producto final de la
polimerizacin en cadena, una mezcla de piezas de ADN de longitud variable. Todas las
piezas de ADN en cada inicio del tubo con la misma cartilla, pero termina con un
nucletido diferentes etiquetados con un marcador fluorescente (color diferente para cada
una de nucletidos, T, G, C). Lo que queda por hacer es separar las piezas individuales
de ADN e identificar el nucletido final.

Esto se hace utilizando un secuenciador automtico que realiza electroforesis en gel en el
ADN de cada tubo. electroforesis en gel es un mtodo para separar molculas basndose
en las diferencias de tamao. El secuenciador utilizados en esta prctica tiene un tubo
fino capilar unida a un extremo de un mecanismo de jeringa que contiene una solucin
tampn. El tubo se llena con la solucin tampn y el otro extremo se inserta en uno de los
tubos que contienen las piezas de ADN. A continuacin, una corriente elctrica se aplica
de manera que el extremo del tubo en contacto con el ADN tiene una carga negativa y el
final jeringa una carga positiva. Dado que las molculas de ADN tienen carga negativa,
que comienzan a moverse a travs del tubo hacia el final jeringa cargada positivamente,
con las piezas ms pequeas movindose ms rpido que los ms grandes. Cerca del
final jeringa, un tubo capilar pasa a travs de un rayo lser que excita los marcadores
fluorescentes y detectores pticos detectar el color de la fluorescencia.

Podemos suponer que un juego completo de piezas de ADN, todos diferentes en tamao
por exactamente un nucletido, se han generado en el paso anterior. La pieza ms
pequea de ADN que tiene una etiqueta fluorescente que se le atribuye es la cartilla. Este
fragmento de ADN que viajan ms rpido que los dems. Al leer el color (en nuestro
ejemplo, el rojo), determinamos que el primer nucletido ms all de la secuencia de la
cartilla se timidina (T). La pieza ms pequea al lado de ADN fluorescente con el color
(verde), que representa el nucletido siguiente en la secuencia (A) y as sucesivamente
(ver la animacin). Al leer la secuencia de nucletidos en funcin de su fluorescencia
como las piezas de ADN pasar a travs del rayo lser, la secuencia del ADN se puede
reconstruir.

El secuenciador automticamente limpia el buffer del tubo, se mueve la bandeja, y se
ejecuta la electroforesis de nuevo, repitiendo el programa hasta los 12 tubos han sido
examinados. Los conjuntos resultantes de las secuencias son recabados por un programa
informtico para construir la secuencia completa del gen 16S ARNr.
Parte 6 - Anlisis de Secuencia de ADN

Despus de la secuencia de la informacin ha sido obtenida de todos los tubos de
reaccin, el equipo construye la secuencia real de juego en conjunto las diferentes
piezas. Ahora tiene la secuencia de ADNr 16S de esta especie bacteriana,
que puedeser comparada con el resto de secuencias conocidas del rDNA
16S para la identificacin.

Ms informacin sobre la ciencia detrs de la secuencia correspondiente.

Hay muchas bases de datos de secuencia en la existencia. Algunas bases de
datos se venden comercialmente, como parte de un kit
de identificacin. En este ejemplo,usaremos la base de datos GenBank a
disposicin pblica a travs de la BibliotecaNacional de Medicina. El algoritmo
de coincidencia que se conoce como BLAST (Organizacin de investigaciones de
herramientas). Un partido directo de la secuenciade ADN determina la
especie exacta de bacterias se han encontrado. Cuando lasecuencia de
ADN no es una coincidencia exacta, pero un partido cerca de otra que se
encuentran en la base de datos de secuencia, es necesario para evaluar si se
trata deuna especie nueva o una variacin de uno ya existente.

Obtenga ms informacin acerca de los resultados de la bsqueda de BLAST.

Ahora sigue estos pasos para identificar la muestra:

Paso 1: Haga clic aqu para ver la salida de datos desde
el secuenciador. Seleccione los datos de todos en la ventana y copia (Ctrl-c en
el PC o cmd-c en el Mac).

Paso 2: Haga clic aqu para ir al sitio NCBI para realizar su bsqueda. (Esto se
abriruna nueva ventana)

Paso 3: En la pgina de BLAST del sitio NCBI, pegue los datos (Ctrl-V en
el PC o cmden V en Mac) en la casilla "Introduzca el nmero
de adhesin, gi, o secuencia deFASTA," en la tecla "Enter consulta Secuencia "en
la parte superior de la pgina. En la lista "Elija la bsqueda Ajuste" seccin, Base
de datos: "Otros (nr etc)" y "recogida de nucletidos (nr / nt)" debera estar
ya seleccionado. Cuando est listo, haga clic en el azul "Blast" botn. (actualizado
el 21 de octubre 2007)

Paso 4: Siga las instrucciones proporcionadas por el sitio NCBI para obtener sus
resultados.

Paso 5: Vuelve a esta pgina (que debe permanecer abierto) e
identificar la bacteriaen la ventana del laboratorio a la izquierda.