Un informe de la academia americana de diversidad microbiana marina

La Llave a Habitar de la Tierra E

RESUMEN
La academia americana de microbiologa convoc un coloquio el 8-10 de abril de 2005, en san
francisco, california, enfocar la diversidad martima microbiana. La fisiologa microbiana, la
ecologa, la gentica, la oceanografa, la biologa invertebrada, y expertos de virologa hablaron de
la importancia de microorganismos martimos a la vida sobre este planeta, la biogeografa de estos
organismos, sus papeles en relaciones simbiticas y pato genticas, sus capacidades metablicas,
sus impactos sobre la gente, y objetivos para la investigacin, y la educacin en la microbiologa
martima.
Microbios martimos son nicamente importantes para la vida como lo sabemos. Ya que la vida
ms probablemente comenz en los ocanos, microorganismos martimos son los descendientes
de vida ms cercanos de las formas originales de vida. Ellos son tambin los pilares principales de
la biosfera. Sus metabolismos nicos permiten a microbios martimos para realizar muchos pasos
de los ciclos biogeoquimica que otros organismos son incapaces de completar. El funcionamiento
liso de estos ciclos es necesario vitalicio para seguir la tierra.
Tempranos microorganismos martimos tambin ayudaron a crear las condiciones en las cuales la
vida subsecuente se desarroll. Hace ms de dos mil millones de aos, la generacin de oxgeno
por microorganismos fotosintticos martimos la forma ayudada el entorno qumico en el cual las
plantas, animales, y todas otras formas de vida se han desarrollado.
Mucha investigacin sobre la biogeografa de microorganismos martimos ha sido realizada, pero
mucho aun no persiste, y ms trabajo es necesario para aclarar y entender su complejidad. Ahora
sabe que los microorganismos viven en cada esquina de los ocanos. Sus hbitats son diversos e
incluyen el agua abierta, el sedimento, los cuerpos de marinero macro - y microorganismos,
estuarios, y rajas hidrotermales. Por estudiando estos hbitats, cientficos han desarrollado una
capacidad limitada de predecir la composicin de comunidades martimas microbianas.
Tambin ha sido encontrado aquellos algunos microbios martimos tienen ms distribuciones
cosmopolitas que otros. El trabajo reciente ha encontrado que la mayor parte de los principios
ecolgicos que se aplican a organismos ms grandes tambin pueden ser aplicados a
microorganismos, incluyendo microbios martimos, pero hay excepciones. Casi cada parmetro
ecolgico en los ocanos, como se piensa, tiene un impacto sobre la diversidad de comunidades
microbianas.
La mayor parte de los microorganismos de marinero de interacciones directos tienen con la cada
de organismos ms grande en una de dos amplias categoras: simbiosis o pato gnesis. Simbiosis
beneficiosa microbiana ha permitido a muchas especie invertebradas aprovechar los hbitats que
de otra manera seran no disponibles a ellos. Los invertebrados en estas relaciones tambin
pueden disfrutar de las ventajas de la bio actividad compone microbios pueden producir para
prevenir o rechazar a depredadores. Virus martimos son encontrados en sorprendentemente
altos nmeros en el agua de mar, pero es probable que estas poblaciones estn en el equilibrio
con sus poblaciones de anfitrin.
La diversidad metablica de microorganismos martimos les permite para asumir muchos papeles
en los ciclos bio geoqumicos que otros organismos no pueden completar. Microbios martimos
son tambin capaces de adaptarse a muchos entornos extremos en los ocanos. Como la gente
sigue cambiando el entorno, el cambio climtico inevitablemente afectar comunidades martimas
microbianas y los ciclos bio geoqumicos en los cuales ellos participan, pero la naturaleza exacta de
estos impactos an no puede ser predicha. La salud humana confa en varios el equilibrio crtico
que el agente de bolsa de microorganismos martimo, incluyendo el equilibrio entre virus y sus
anfitriones en los ocanos, los equilibrios que guardan flores de algas daosas en la
comprobacin, los procesos que controlan concentraciones nutritivas en aguas martimas, y otros.
Las capacidades metablicas de microbios martimos pueden ser puestas para trabajar en
cualquier nmero de usos de biotecnologa, incluyendo la fabricacin de productos industriales y
la produccin de energa. Microbios martimos son las fuentes de novela bio activa los compuestos
que pueden tener el uso como productos farmacuticos. Usos potenciales para microorganismos
martimos en mejorar la degradacin ambiental tambin existen.
Accesos innovadores en la investigacin, y la educacin son crticos para avanzar el campo de
microbiologa martima. La investigacin moderna en este campo debera abrazar los nuevos
instrumentos de genomas y meta genomas , pero no a la exclusin de otros mtodos de
descubrimiento. La educacin y entrenando en la microbiologa martima tiene que ser
multidisciplinar. Deberan animar a las disposiciones que exponen a estudiantes de graduado y
cientficos postdoctorales a los laboratorios que realmente trabajan fuera de los campos
inmediatos de los estudiantes de foco.
Introduccin: microbios martimos y tierra en habitat
Los residentes microbianos de los ocanos lderes mundiales han ayudado a hacer la biosfera el
alboroto, el lugar de prosperidad que es hoy. Tambin, dado que la vida sobre este planeta ms
probablemente comenz en el agua, microbios martimos pueden haber sido las primeras formas
de vida sobre la tierra y, de ah, los antepasados de todos los seres vivos, una distincin que pone
microorganismos martimos en una posicin clave en la saga de evolucin.
Durante unos millones de aos despus de la aparicin de las primeras formas de vida, la vida
microbiana en los ocanos influy en la qumica del planeta, cambiando el equilibrio qumico de
los ocanos y la atmsfera e introduciendo los gradientes de oxidantes (hurgar en busca electrn)
y reductores (fuentes de electrones). Tempranos microbios introdujeron el oxgeno molecular a la
atmsfera, un logro que pone la etapa para la evolucin de plantas, animales, y la gente.
Estos cambios inducidos por microbios introdujeron una nueva era de qumica sobre el de la tierra
basado principalmente sobre la qumica de redox, el ir y venir de electrones de una molcula al
otro. La qumica de redox es ahora la base de bio geoqumica equilibrado y los ciclos
climatolgicos que sostienen la vida sobre este planeta
Microbios martimos tambin realizan muchos de los pasos en estos ciclos bio geoqumicos,
hacindolos los caballos de tiro de la biosfera. Los propietarios de una cartera diversa de
actividades posibles, microbios martimos proporcionan la mayor parte de las capacidades
metablicas del planeta que guardan ciclos elementales en el movimiento. Las tarifas metablicas
de comunidades martimas microbianas son tambin altas. Aunque organismos terrestres
comprendan la mayora enorme de la biomasa sobre el planeta (3,200 gigates o ms; es decir 1015
gramos), el plantn martimo (que interviene en aproximadamente 0.4 gigantes) realiza el 45 % de
la respiracin de oxgeno total sobre la tierra.
El ocano est lleno de los microorganismos que moran all permanentemente y otros microbios
que han sido llevados all de entornos terrestres. En la investigacin sobre microbios martimos, es
a menudo necesario llegar una definicin de que, exactamente, un microorganismo martimo es.
Cualquiera de un nmero de definiciones puede ser usada. Una definicin simple dice que
microbios martimos son solamente que - cualquier microorganismo encontrado en sistemas
martimos. Sin embargo, esta descripcin no excluye los organismos que se lavan en los ocanos
de la tierra y no son satisfechos para el crecimiento en el entorno martimo.
Una definicin operacional de microbios martimos los describe como la especie que puede crecer
y reproducirse en el hbitat martimo. La posibilidad para el crecimiento puede ser determinada
usando el istopo que alimenta experimentos, en los cuales los organismos en cuestin son
supervisados para el crecimiento sobre una dieta de sustancias nutritivas como aquellos
encontrados en el hbitat martimo. El problema con esta definicin es que el revs no puede ser
verdadero; una falta de crecimiento no necesariamente indica que un microorganismo no es un
contribuidor al ecosistema. Un microbio inactivo encontrado en el agua de mar puede esperar su
tiempo hasta que las condiciones tengan razn para su crecimiento. Una definicin fisiolgica
identifica microbios martimos como la posesin de adaptaciones especficas al entorno martimo.
Conforme a esta descripcin, microorganismos martimos tienen adaptaciones exactas fisiolgicas
o an exigencias para el sodio.
En algunos casos, la distincin entre los residentes verdaderos de los ocanos y los organismos
que se lavan en la tierra es sin importancia. A veces, organismos exticos (o an los organismos
que mueren una vez expuesto al entorno martimo) pueden desempear un papel en la ecologa
de los ocanos.
Independientemente de la definicin preferida, microbios martimos sostienen una posicin de
importancia nica en la biosfera. Ellos eran la forma original de vida sobre la tierra y hoy
microorganismos martimos son un apoyo primario a los ciclos bio geoqumicos que siguen
haciendo la vida posible. Una investigacin ha sido realizada para aclarar la biogegrafia y el
metabolismo de estos organismos, pero mucho no persisten. Encima a esta lista de preguntas es lo
que los efectos humanos son cambios que tendrn sobre los microbios de mar de servicios que
funcionan para el planeta. La investigacin sobre la microbiologa martima debe seguir o acelerar
para solucionar estos problemas.
Biogeografa y escala de hbitat
Claramente, microorganismos martimos son crticos a hbitat de la tierra, ambos pasado y
presente. Lamentablemente, slo comenzamos a entender muchos de los detalles sobre lo que
sus hbitats son, como sus comunidades son estructuradas y cambian el tiempo, y como ellos son
distribuidos
Hbitats martimos microbianos
Microbios martimos siguen teniendo una influencia profunda sobre la biosfera, pero dnde, con
precisin, son encontrados microbios martimos? Cules son sus varios hbitats? Cmo prueba
usted aceptable los hbitats? Estas preguntas pueden ser contestadas de un nmero de modos,
basados en el nivel de resolucin que es del inters (mirar la tabla 1). El entorno martimo ocurre
sobre mucha balanza, y hay muchos niveles de lugar de lo cual para acercarse a una descripcin de
hbitats. Por ejemplo, un microbio que se flota en medio de Ocano Pacfico podra ser descrito
como "la vida libre", pero esto no es ms o menos exacto que los descriptores "pelgico" (el
significado " el agua abierta, " no el sedimento) " o dentro de Ocano Pacfico Central. "
Quizs el factor ms importante en la definicin de hbitats martimos microbianos es la distancia
sobre la cual estos organismos actan recprocamente con sus entornos. Los atributos de hbitat
que son evidentes al ojo desnudo son por lo general menos importantes para un microbio
martimo que los hechos microscpicos y submicroscpicos, incluyendo las concentraciones de
sustancias nutritivas, la presencia de genes y la materia de partculas, concentraciones metlicas,
alumbran niveles, pH, la exposicin ultravioleta y el flujo solar, la temperatura, la saturacin de
oxgeno, y la redox. De ah, la escala en la cual hbitats martimos microbianos son los ms
relevantes es muy pequea, pero la definicin de las fronteras de estos hbitats es difcil de lograr
en un experimento controlado de laboratorio y es an ms difcil de definir para una clula
microbiana integrada en el entorno.
Hbitats microbianos en los ocanos son bajo la influencia de una serie casi innumerable de
fuerzas y factores, incluyendo la salinidad, corrientes, entradas terrestres, y el clima. La salinidad
es relativamente constante en el ocano abierto, pero es menos estable en reas costeras. Han
mostrado el ocano y corrientes de lecho marino para comportarse de modos otros que antes el
pensamiento, enormemente afectando nuestra comprensin de procesos de transporte en la alta
mar. Entradas terrestres crean los gradientes de sustancias nutritivas, agentes contaminadores, y
otra materia que afecta hbitats. Los efectos de clima representan la escala ms grande de
influencia sobre hbitats microbianos. Temperatura, precipitacin, y viento (incluyendo particuals
de la materia) puede cada comunidad de mar dar impacto de un nmero de modos.
Pretenciosamente, microbios martimos ellos mismos ejercen la influencia sobre sus hbitats por
consumiendo, produciendo, y secuestrando una variedad de compuestos. De ah, en los ocanos,
los gradientes de materiales importantes para micro - y macroorganismos igualmente a menudo
son controlados por procesos realizados por microbios.
En el entorno martimo y en otra parte, los interfaces tienden a ser los puntos conflictivos de
diversidad y la actividad biolgica. Hbitats martimos microbianos en interfaces incluyen el agua
de aire, el sedimento de agua, el sorbete, y reciben interfaces de agua de macroorganismo. La
escala de submilmetro de variabilidad fsica y qumica en estos hbitats plantea un desafo serio a
hbitats de interfaz que estudian detalladamente.
TABLA 1>> LOS EJEMPLOS DE COMO EL ENTORNO MARTIMO PUEDE SER DIVIDIDO EN HBITATS
DIFERENTES MICROBIANOS
Criterios Hbitats
Presencia de otros organismos Vida libre Simbitica Biofilm
Proximidad a la superficie del ocano o
sedimentos
Euphotic (0-150 m) Mesopelagic (150-1000 m)
Bathopelagic (> 1000 m) Benthos (sedimentos)
Concentracin de sustancias nutritivas y
sustratos de crecimiento requeridos
Oligotrophic Mesotrophic Eutrophic

Cambie el tiempo
Hbitats microbianos cambian muchas escalas de tiempo-diel (diario), estacional, decadal, y ms
largo. Muchos de los cambios inducidos por actividades humanas pueden afectar comunidades
martimas microbianas y, a su turno, pueden afectar los caminos por los cuales aquellas
comunidades modulan el entorno y el clima. Cambios temporales de hbitats martimos
microbianos pueden ser ilustrados por describiendo tres hbitats dispares: Ocano Pacfico
central, la Baha Chesapeake, y rajas hidrotermales. Ocano Pacfico central es un hbitat abierto
del ocano que se cambia en una base diel, pero esto tambin ha expuesto cambia dcadas como
los cambios ocurren entre la dominacin de comunidad por diatoms y por picoplankton. La Baha
Chesapeake expone cambios de diel, marc cambios estacionales, y decadal profundo cambia la
pareja pasada de siglos como actividades humanas han tomado su peaje. Rajas hidrotermales
exponen tanto perodos cortos como largos de fluctuacin, cambiando el curso de minutos, horas,
y dcadas. Esta variabilidad crea un hbitat efmero e imprevisible para microorganismos.
En los aos que viene, si las tendencias observadas en emisiones de gas invernadero siguen,
esperan las concentraciones crecientes de dixido de carbono atmosfrico para causar una
disminucin de pH de 0.3 en los ocanos-a el pequeo nmero que significa cambios grandes. Esto
sera una transformacin completamente radical del hbitat del ocano para microorganismos y
macroorganismos igualmente. Para ilustrar, un cambio de pH similar en la acidez de sangre
humana causara la acidosis y una muerte dolorosa.
Las interacciones entre la vivienda de sedimento y comunidades planktonic martimas
microbianas
En general, microbios martimos en y cerca de sedimentos actan recprocamente e interceptan
reluctantes que difunde de los sedimentos debajo y oxidantes que se difunden de la columna de
agua encima. A la inversa, planktonic microbios interceptan compuestos de carbn de actividades
fotosintticas cerca de la superficie del ocano y controlan el flujo hacia abajo de sustancias
nutritivas a los sedimentos. Las conexiones entre la subsuperficie y entornos planktonic son
probablemente las mayores en zonas donde el lecho marino se extiende. Sin embargo, no saben-a
los detalles de las interacciones entre las comunidades microbianas de sedimentos martimos y
comunidades en la columna de agua limpia el hueco en el conocimiento corriente.
Sedimentos martimos, biofilms, y la temprana vida
De algunos modos, las circunstancias fsicas y qumicas de sedimentos martimos, como se piensa,
reflejan aquellos que nutrieron los principios de vida sobre este planeta. El estudiar el sedimento
martimo y la vida que existe all hoy podra proporcionar la perspicacia en la temprana vida:
El enganche de redox puede haber sido importante para la crianza de la formacin de las
molculas orgnicas que propagaron la temprana vida. Sedimentos martimos abrigan la
acodadura marcada de los potenciales de redox que permiten el enganche de redox
extenso.
El metano puede haber sido uno de los componentes bsicos de temprana vida, y hay
numerosas reas del fondo marino donde el metano se filtra encima de la subsuperficie
profunda.
El calor y la presin podran haber facilitado la formacin de tempranas molculas
biolgicas, incluyendo aminocidos. Estas condiciones existen en las partes del lecho
marino que combinan la alta profundidad con la comunicacin con el corazn caliente de
la tierra.
Considerando el papel giratorio de hierro en el funcionamiento de muchas enzimas,
hierro, como se piensa, ha sido abundante donde los sistemas de enzima primero se
desarrollaron. Sedimentos martimos son entornos por lo general de hierro ricos.
Antes del alba de fotosntesis oxygenic, la atmsfera de la tierra era anaerobia, una
condicin reflejada por sedimentos subsuperficiales martimos.
Puede ser argumentado que esteras bajas microbianas y biofilms son la mayor parte de sistemas
apropiados para modelar la temprana vida, como la alta diversidad metablica y la separacin
espacial de los metabolismos de estas disposiciones estrechamente reflejan los ejemplos
fosilizados de tempranas comunidades microbianas. Las comunidades microbianas que moran en
sedimentos martimos pueden ser interpretadas como biofilm o comunidades de estera, dado que
estas comunidades hablan extensamente de las superficies de partculas de sedimento (como
biofilms) y pueden formar las acumulaciones gruesas de clulas que actan recprocamente (como
esteras microbianas).
La composicin de comunidad
Aunque por intuicin evidente, puede ser difcil de alcanzar el acuerdo sobre la definicin exacta
tcnica de una comunidad microbiana. En gran parte es estado de acuerdo con que comunidades
microbianas son los grupos de los microorganismos que actan recprocamente y, juntos, logran
ms que aquellos mismos organismos separadamente. Las comunidades son tambin bajo la
inflluencia de factores comunes y/o el uno por el otro. Sin embargo, la pregunta de si requieren la
interdependencia qumica, una forma de interaccin, entre los miembros de una comunidad es
ms polmica. Un continuo de interacciones, en los lmites de obliga a mnimo, como se piensa,
existe entre los miembros de comunidades microbianas; la interdependencia estricta es no
necesariamente una exigencia para la designacin "la comunidad". Comunidades microbianas, en
las cuales los miembros actan recprocamente, son distintas de asambleas microbianas, en el cual
los miembros simplemente coexisten.
La prediccin de la composicin de comunidades martimas microbianas
Que las condiciones particulares fsicas y qumicas de un hbitat dado martimo, incluyendo la
disponibilidad de recurso, seleccionan para los grupos distintos de microorganismos, y all es una
cierta cantidad de previsibilidad en el carcter de la comunidad de pasar.
El trazar un mapa de la especie microbiana en la variabilidad fsica y qumica de hbitats martimos
se hace cada vez ms factible en ciertos hbitats y con la cierta especie bien descrita. Por ejemplo,
las distribuciones generales de dos gneros planktonic, Synechococcus y Prochlorococcus, son la
informacin que puede ser extrapolada a comunidades desconocidas planktonic. La presencia de
ciertos grupos funcionales, como fijativos de nitrgeno o el carbonato de calcio que produce
microbios, tambin puede ser predicha.
La mayora de las comunidades martimas microbianas an totalmente no son descritas, sin
embargo, entonces es difcil, si no imposible, predecir la composicin de nivel de especie de una
comunidad martima microbiana. De ah, es a menudo posible predecir las funciones en el lugar en
una comunidad dada martima microbiana, pero es raras veces posible predecir el presente de
especie o los gneros.
La escala y el nivel de resolucin de la solicitud de una comunidad martima microbiana son
factores importantes en la previsibilidad. Las comunidades pueden ser imprevisibles por una
pequea escala (1 metro), pero fiables sobre la balanza ms grande (kilmetros). El nivel de
resolucin a menudo determina los resultados de un estudio sobre la diversidad de comunidad. El
muestreo profundo, exhaustivo puede revelar la diversidad mucho mayor y la complejidad que el
muestreo bajo. La previsibilidad en las comunidades martimas microbianas que est basada en 16
rRNA genes no puede ser corroborada por el remoto trabajo en el nivel de secuencia de genoma.
Las secuencias de genoma por lo general revelan mucho mayor y, actualmente, la diversidad
imprevisible.
El concepto bioma puede ser til en la prediccin de la composicin de comunidades microbianas.
Por este razonamiento, las entradas de energa en un ecosistema son evaluadas, y el papel estos
juegos de energa en la definicin de los atributos de la comunidad microbiana son examinados.
O bien, una comunidad microbiana puede ser estructurada por una historia evolutiva que previene
la extensin de aquella comunidad en nuevos entornos o, a la inversa, previene la entrada y
establecimiento de nueva especie en aquella comunidad. Si la historia de una comunidad dicta su
composicin, sera muy difcil de predecir la estructura de la comunidad de rasgos transitorios
como el estado nutritivo y la temperatura.
Ciertas asociaciones apretadas, como el que entre la bacteria Vibrio angulara y el alga Ulva,
pueden permitir a investigadores para usar la presencia de una especie para predecir la presencia
de una especie de compaero. Estudios recientes han mostrado que Ulva propagules no se
establecer sobre una superficie en ausencia de seales qumicas de su compaero de biofilm, V.
angulara. De ah, si Ulva es descubierto en un biofilm, puede ser asumido que V. angulara,
tambin, est presente.
En la busca mejor predecir la estructura de comunidades martimas microbianas, hay una
necesidad de saber ms sobre los organismos de especie de clave posibles que pueden estar
presentes en nmeros bajos o altos, pero realizar funciones indispensables para la comunidad.
La distribucin microbiana en los ocanos
La publicacin de si la especie martima microbiana es tras cosmopolita, o es ms provincial y
limitada con ciertas reas geogrficas, era hace dcadas levantadas. La pregunta dura hoy debido
al porte que esto tiene sobre la conservacin de diversidad biolgica. Si microbios martimos no
son cosmopolitas, entonces tiene que la comunidad internacional cientfica actuar para conservar
la diversidad microbiana abrigada en hbitats en peligro?
Pruebas corrientes indican que la mayor parte de microbios martimos no son cosmopolitas, pero,
en cambio, son restringidos a tipos de hbitat especficos o posiciones geogrficas. Sin embargo,
hay unos ejemplos de organismos realmente cosmopolitas, incluyendo el grupo martimo de alta
mar archaea. Como tecnologas de resolucin nuevas, ms altas se hacen la investigacin
disponible, remota puede mostrar otros microorganismos para ser ms extendido que antes el
pensamiento.
Microbios martimos libre que viven pueden ser ms cosmopolita que simbiontes, microbios
biofilm-asociados, y otros. La extincin es una verdadera posibilidad para microbios simbiticos ya
que ellos son dependientes de la supervivencia de su anfitrin y muchos, mucha especie de
macroorganismos martimos actualmente son puestos en peligro.
Es esencial tener en cuenta que el nmero de representantes de un grupo dado no es
necesariamente ligada a la importancia de aquel grupo en el funcionamiento de la comunidad. Los
organismos comunes no pueden jugar un papel crtico en la dinmica de una determinada
comunidad a pesar de sus nmeros, y los organismos que slo renen 0,1% de prevalencia, como
los fijadores de nitrgeno, puede ser de fundamental importancia. Por consiguiente, no se sabe si
microorganismos cosmopolitas como Synechococcus son comunes porque son esenciales a sus
comunidades o porque son malezas individualistas que pueden sobrevivir en un amplio espectro
de entornos.
Una observacin que parece apoyar la idea de que microbios marinos son en gran medida
cosmopolita, es el establecimiento de nuevas comunidades microbianas en la estela de una
perturbacin. A menudo, las nuevas comunidades estn dominadas por tipos microbianos que
estaban presentes anteriormente en nmeros bajos o indetectables.
La cuestin de largo plazo, de cmo dividir taxonmicamente microbios crea cierta confusin en
las discusiones sobre distribuciones cosmopolita. Es necesaria una definicin de trabajo de una
unidad taxonmica apropiada para abordar la investigacin de la distribucin microbiana en los
ocanos y en otros lugares.
Una anlisis en la escala milimtrica de los hbitats marinos puede ayudar a revelar la variabilidad
de la distribucin de los microbios marinos sobre muy pequeas escalas espaciales.
PREGUNTAS PENDIENTES ACERCA DE LA DISTRIBUCIN MICROBIANA MARINA
Un nmero de preguntas pendientes sobre distribuciones microbianas marinas an no se han
abordado. Estas incluyen:
Cul es la importancia ecolgica de la diversidad funcional de genes observados en las
comunidades microbianas marinas?
La diversidad tiene un impacto en el funcionamiento de los ecosistemas o a la estabilidad
a largo plazo?
Son cambios en las comunidades microbianas prediccin de cambios en la funcin del
medio ambiente?
La variabilidad a largo plazo de las comunidades microbianas marinas es poco conocida.
Puede el muestreo intermitente, como la toma de fotos de comunidad, dirigir esta
pregunta o el muestreo continuo es necesario para evaluar cambios de composicin de
comunidad?
Hay all la especie clave en las comunidades martimas microbianas que son crticas a
una funcin determinada? Cmo pueden los cientficos identificar aquellos organismos?



FUERZAS EN TRABAJO AL MANTENIMIENTO DE ESTADO ESTABLE EN COMUNIDADES
MARTIMAS MICROBIANAS
Muchas aguas martimas superficiales mantienen las poblaciones estables de aproximadamente
106 bacteria y 107 virus por mililitro, una condicin que puede ser determinada por limitaciones
nutritivas y controles de depredacin impuestos por protistas y virus. Se cree que, en algunos
casos, las cifras de poblacin microbiana se mantienen en alrededor de un orden de magnitud por
debajo de la capacidad de carga del hbitat, presumiblemente por la depredacin. Se piensa que
los virus pueden coexistir con sus anfitriones, ayudando a estructurar comunidades y diversidad,
pero algunos estudios han mostrado que el retiro de virus de un sistema no tiene ningn efecto
sobre la abundancia bacterial y la estructura de comunidad. Los protistas, por otro lado, se cree
que desempean un papel antagnico, menos exigente en el mantenimiento de estado
estacionario de abundancia de clulas bacterianas por el consumo de muchos diferentes tipos de
presas bacterianas.
TEORA MACROECOLGICA Y MICROBIOS DEL OCANO
Slo se hizo posible poner a prueba la teora ecolgica ya que se aplica a las comunidades
microbianas marinas dentro de los ltimos 10 aos, despus de las preguntas bsicas sobre la
distribucin y abundancia de las especies de los microorganismos marinos haban sido
contestadas. En general, los conceptos ecolgicos como la depredacin, la competencia y la
diversidad parecen ser aplicables a las comunidades microbianas marinas, pero problemas
particulares relacionados a escalas, redes de alimentos, el concepto de especie, y el foco
tradicional sobre ciencias bioqumicas y geoqumicas dentro de la ciencia martima excluyen el
amplio uso de teora ecolgica a estas comunidades. Las pequeas escalas correspondientes a los
microbios a menudo no se abordan adecuadamente por macroecologa tradicional. Tambin, la
estructura de redes de alimentos en sistemas microbianos probablemente toman una forma muy
diferente que aquellos descritos por la macroecologa tradicional.
El concepto de especie representa un gran obstculo para la aplicacin de la teora ecolgica en
los sistemas microbianos marinos. La agrupacin de los organismos en grupos de especies es la
base de la teora ms ecolgica, pero la mayora de los microorganismos no caen bien en
categoras de especies debido a su capacidad de reproducirse asexualmente. Puede ser que los
genes o genomas son unidades taxonmicas ms apropiadas que las especies para el modelado en
sistemas microbianos.
Hasta cierto punto, el foco biogeoqumico y geociencia de las ciencias marinas ha impedido slida
integracin de la teora ecolgica y evolutiva en microbiologa marina. Es necesaria la inclusin
rigurosa de la ciencia ecolgica dentro de la ciencia oceanogrfica clsica para abordar
satisfactoriamente los desafos contemporneos en microbiologa marina. Para ello ser necesario
un amplio dilogo entre los ecologistas tericos, cientficos evolucionistas, oceangrafos fsicos y
qumicos y microbilogos marinos.
Con presiones sobre los sistemas naturales del mundo que crecen anualmente por el hombre, un
profundo conocimiento de la ecologa de los ambientes, los ocanos incluido, ser necesario para
mitigar los daos y gestionar nuestros recursos naturales en beneficio de las generaciones futuras.
Debido a sus tiempos de generacin cortos y fisiologa relativamente simple, los microorganismos
han sido y siguen siendo modelos de sistemas potentes para probar las teoras ecolgicas.
FACTORES QUE AFECTAN LA DIVERSIDAD MARTIMA MICROBIANA
La lista de factores que afectan la diversidad microbiana marina no es corta. Casi cada variable
mensurable fsica, qumica, y bitica en el entorno martimo ha sido encontrada para aumentar,
disminuirse, o alterar la diversidad microbiana. Ver tabla 2 para una lista de varios de los factores
ms importantes.
En su mayor parte, el grado en que cada una de estas influencias actualmente opera en el medio
ambiente y los contextos en los que son importantes no se haban determinado.
El cambio climtico, que se senta por las comunidades microbianas marinas como los cambios en
la temperatura del ocano, sin duda altera la diversidad de las comunidades de maneras
imprevistas. El cambio climtico debera ser considerado un regulador principal descendente de
comunidades microbianas.
La contaminacin, incluyendo los aportes de nitrgeno debido a la fijacin de nitrgeno
antropognico, tambin afecta la diversidad martima microbiana (mirar la seccin sobre la Gente
y Microbios Martimos). Los aportes de nitrgeno antropognico a los ocanos constituyen ahora
la mitad de los aportes de nitrgeno totales a los ocanos, circunstancia que ha dado lugar a
vastas zonas muertas en las zonas costeras y una mayor incidencia de floraciones de algas nocivas.
INTERACCIONES ENTRE MICROBIOS MARTIMOS Y MACROORGANISMOS MARTIMOS
La mayora de los ecosistemas marinos se alimentan de la regeneracin de nutrientes-procesos
mediados por microorganismos marinos. Este es el servicio ms importante proporcionado por
microbios marinos, que son responsables de los ciclos que se sustentan todos los seres vivos de los
ocanos.
Los microbios tambin juegan un papel ms directo en la salud de los corales y otros organismos
marinos. Por ejemplo, los corales mueren cuando se eliminan las bacterias que viven en sus
superficies, aunque no se conoce el mecanismo detrs de esta observacin. Adems, se ha
demostrado que las bacterias se asocian con los huevos de calamar para proteger los huevos de la
infeccin fngica. Las bacterias del biopelcula son conocidas por transmitir seales atraccin que
afectan el establecimiento de larvas invertebradas en aquellas biopelculas.
>> MUCHAS INTERACCIONES DIRECTAS ENTRE LOS MICROORGANISMOS Y MACROORGANISMOS
MARINOS PUEDEN CLASIFICARSE EN UNA DE DOS CATEGORAS: LA SIMBIOSIS O PATOGNESIS.
EN SIMBIOSIS CON INVERTEBRADOS BENEFICIOSOS, TANTO EL MICROBIO COMO EL
INVERTEBRADO TIENEN BENEFICIO EN LA RELACIN. ESTE TIPO DE RELACIN DE GANAR-GANAR
ES TAMBIN LLAMADO MUTUALISMO. EN LA PATOGNESIS, EL MICROBIO QUE ASUME EL PAPEL
DE DEPREDADOR PROCURANDO EXPLOTAR Y POSIBLEMENTE DESTRUIR AL ANFITRIN.
SIMBIOSIS CON INVERTEBRADOS
Un nmero de invertebrados marinos, incluidas las especies de corales, esponjas, calamares,
shipworms, y otros, estn asociados con especies nicas de bacterias y/o arqueas simbiontes.
Simbiosis entre un microbio y un invertebrado marino ofrece al microbio un refugio, nutrientes, y
posiblemente una ruta para la reproduccin y dispersin, y ofrece al husped una variedad de
beneficios. En algunos casos, una de las especies de invertebrados pueden ser anfitrin de
muchos, posiblemente cientos, de especies microbianas nicas, un detalle que tiene implicaciones
importantes para la diversidad microbiana marina considerando el hecho de que alrededor de
1.000 especies de coral y ms de 5.000 especies de esponjas pueblan los ocanos. La diversidad de
simbiontes marinos es un campo poco estudiado.
La diversidad de simbiontes microbianos marinos y la cercana de las relaciones simbiticas puede
ser determinada por el modo de transmisin empleado por los hospedadores invertebrados. La
transmisin se lleva a cabo ya sea por medio "horizontal" o "vertical". Los estudios han encontrado
que los simbiontes horizontalmente transmitidos, que son dispersados en el entorno y recogidos
por invertebrados, son taxonmicamente ms diversos que simbiontes verticalmente transmitidos
en lo que concierne al espaciador internamente transcrito (ITC) en regiones de su ADN ribosomal.
(La regin ITS es variable en longitud y secuencia y se puede utilizar para identificar y establecer la
relacin entre los microorganismos.) La razn de esta diferencia puede ser el hecho de que la
transmisin vertical, que pasa simbiontes de generacin en generacin a travs de los gametos,
permite ms fcilmente la transmisin de organismos clonales idnticos entre los miembros de
una especie de invertebrados. Las secuencias del genoma completo de forma verticalmente y
horizontalmente trasmitidos por simbiontes marinos se estn estudiando actualmente y
probablemente arrojar ms luz sobre la diversidad de estos organismos.
La transmisin vertical probablemente conduce a una simbiosis cercana entre el microbio y su
anfitrin, ya heredar un simbionte de los propios antepasados ofrece pocas oportunidades para la
acogida y simbionte de conmutacin. En la transmisin horizontal, el anfitrin con mayor
probabilidad adquiere simbiontes apropiados por la posicin particular donde el anfitrin se
instala.
Es posible que en las primeras etapas de una nueva relacin simbitica, la transmisin horizontal
de un simbionte puede ser utilizado con eficacia, pero, como la relacin se vuelve ms estrecha y
ms necesario para la supervivencia de los microbios y su husped, la transmisin debe cambiar al
modo vertical, a travs de los gametos. Se sabe que los simbiontes eliminan aquellas partes sus
genomas que son redundantes dentro de los lmites protectores del husped, haciendo la
transmisin vertical necesaria para la supervivencia del simbionte.
En el estudio de simbiontes marinos in situ, puede ser difcil separar los simbiontes de los
patgenos y las poblaciones de microbios transitorios que tambin se pueden encontrar en y
alrededor de un invertebrado. Sondas Filotipo-especficos que detectan preferentemente
microbios con altas concentraciones de ARN en comparacin con aquellos con menores
concentraciones se pueden utilizar para este propsito.
Simbiosis y la Invasin de Nuevos Entornos
La simbiosis con bacterias y / o arqueas han permitido a algunos invertebrados marinos explotar
hbitats que de otra forma no podran obtener. Las fuentes hidrotermales, por ejemplo,
representan un ambiente muy inhspito para el gusano del tubo preparado, pero los gusanos de
tubo se desarrollan en zonas ricas en azufre, las zonas oligotrficas (con bajo contenido de
carbono orgnico) albergan bacterias quimioautotrficas que sintetizan carbono orgnico usando
la energa para respirar reduciendo compuestos de azufre inorgnicos. La bacteria proporcionan
los compuestos orgnicos a sus huspedes, permitiendo a los gusanos vivir en el carbono de
fuentes inorgnicas y la apertura de un nuevo mundo de hbitats para los gusanos.
Otros ejemplos de simbiontes que han permitido a los invertebrados que se aprovechan de un
nuevo entorno incluyen la fijacin de nitrgeno, celulosa bacterias simbiontes degradantes, que
han permitido que sus huspedes carcoman para vivir con una dieta de madera y a las bacterias
simbiontes luminiscentes que las puedan cazar los calamares en aguas iluminadas por la luna sin
una sombra que puede ser detectado por los depredadores.
En algunos casos, la simbiosis obligatoria con microbios pueden limitar la capacidad de un
invertebrado para invadir un nuevo hbitat. Los lmites de temperatura de la bacteria simbionte
Symbiodinium, por ejemplo, parecen reducir el nmero de lugares en los que las especies de coral
husped pueden sobrevivir. Los estudios demuestran que las Symbiodinium tambin puede ser
ms sensibles al estrs de fuentes antropognicas (por el hombre) que su husped otro factor que
podra limitar los hbitats donde el coral podra establecerse.
SIMBIONTES Y LA PRODUCCIN DE COMPUESTOS BIOACTIVOS
Muchos compuestos altamente bioactivas se han aislado a partir de invertebrados marinos,
incluyendo un nmero de materiales con importancia biomdica o industrial. Ahora se sabe que,
en muchos casos, estas sustancias son producidas por microbios simbiticos en lugar de por los
propios invertebrados. Los simbiontes microbianos sintetizan muchos metabolitos secundarios,
por ejemplo, briozoos y especies de esponjas.
La funcin biolgica exacta de los compuestos bioactivos producidos por simbiontes microbianos
no se conoce, pero en el caso de compuestos citotxicos que se encuentran en esponjas y
tunicados (un tipo de gusano marino), se pueden utilizar para evitar el ensuciamiento del husped.
Otros materiales pueden ser utilizados para disuadir a los peces de arrecife de la alimentacin en
los invertebrados.
Los compuestos bioactivos producidos por simbiontes microbianos pueden ser tiles para los seres
humanos en cualquier variedad de formas. Si los microbios que las producen se pueden aislar con
xito, puede ser posible lograr una produccin a gran escala de estos materiales mediante
procesos de fermentacin industriales similares a los empleados comnmente por las compaas
farmacuticas para la produccin a gran escala de antibiticos.
EFECTOS MICROBIANOS SOBRE LA ECOLOGA E HISTORIA DE VIDA DE INVERTEBRADOS
MARTIMOS
Los simbiontes microbianos pueden tener efectos profundos en sus huspedes los efectos que
tienen consecuencias para la ecologa y la historia de vida de estos invertebrados. Por ejemplo, la
diversidad microbiana local ha demostrado afectar el conjunto de simbiontes albergadas por una
especie muy extendida de mejilln. Los estudios de la "ITS" en la regin del ADN ribosomal de
simbiontes mejilln y sus entornos han demostrado que una especie de mejilln tiene diferentes
poblaciones de bacterias en diferentes reas geogrficas, un reflejo de las poblaciones de
bacterias disponibles para la colonizacin. En ms rgidos, la simbiosis obligatoria, como la que
existe entre el tubo de ventilacin hidrotermal gusano Riftia y sus simbiontes, la presencia de
simbiontes que viven en libertad es necesaria para un invertebrado para as colonizar un rea
determinada, lo que supone una limitacin de los hbitats disponibles para ese organismo. En otro
ejemplo de una estrecha relacin (tal como se describe anteriormente), la bacteria Vibrio angulara
que requieren las algas Ulva para establecerse sobre una superficie.
Hay alguna evidencia que las algas son culpables de las floraciones de algas nocivas (que han
causado tanto como $ 1000 millones de daos en la ltima dcada) requieren no slo los
nutrientes adecuados con el fin de proliferar en una flor, sino que tambin dependen de ciertos
asociados bacterianas. En otras palabras, si la bacteria est presente, un florecimiento de algas es
posible y si la bacteria no se encuentra entonces una la floracin no puede suceder. El mecanismo
detrs de este fenmeno no se conoce todava.
VIRUS MARINOS
A primera vista, el nmero de virus encontrados en las aguas marinas parecen ser demasiado alto.
Las ubicaciones estudiados hasta la fecha han revelado cuentas virales en el orden de 10 millones
de virus por mililitro de agua. Sin embargo, estas cifras son menos sorprendentes si se tiene en
cuenta el nmero probable de huspedes microbianos disponible para aquellos virus.
Aproximadamente 1.000.000 microbios se encuentran en un mililitro de agua de mar, haciendo la
proporcin de virus a anfitriones aproximadamente 10:1, una proporcin razonable de asegurar
que un virus se encuentra con posibles huespedes a menudo lo suficiente para propagarse a s
mismo antes de desintegrarse.
La vida media de los virus es en promedio entre dos a cuatro das, por lo que una poblacin de
virus debe ser lo suficientemente grande como para asegurar que al menos algunos de sus
miembros se encuentran con un husped apropiado durante esa ventana de tiempo. Los virus que
infectan huspedes necesitan vivir durante largos periodos de tiempo para sobrevivir el intervalo
entre eventos de infeccin.
Los virus marinos probablemente desempean una serie de funciones importantes en la ecologa
de los microbios marinos. Obviamente, los virus actan como depredadores, causando la
mortalidad de los microbios marinos. Los virus tambin ayudan a mantener los altos niveles de
diversidad gentica microbiana observada en los ecosistemas marinos porque los huspedes son
conocidos por manipular sus genomas para evadir enfermedades. Moviendo ADN entre las clulas
husped, los virus actan como agentes de sexo, barajando la informacin gentica en la
comunidad y proporcionando nuevas y sorprendentes combinaciones de genes de sus huspedes.
Los virus tambin pueden desempear un papel en la ecologa de las clulas husped mediante la
conversin lisognica, un fenmeno en el que un fago cambia el fenotipo de una clula husped
ya sea por la introduccin de material gentico en el genoma del husped o por otros medios. Se
ha encontrado, por ejemplo, que los virus marinos pueden llevar a los genes necesarios para la
fotosntesis, y que estos genes son transferidos regularmente entre clulas husped de
Prochlorococcus. Este almacenamiento temporal en los virus y el arrastrar eficiente de los genes
entre especies Prochlorococcus probablemente ha tenido un profundo impacto en la evolucin de
estos genes de la fotosntesis y en la ecologa de Prochlorococcus.
La diversidad de los virus marinos no se limita a los bacterifagos (virus que infectan y lisan las
bacterias). Muchas otras formas de virus, incluyendo virus de ADN y ARN con una amplia variedad
de diferentes tamaos, gammas de huspedes, y propiedades biolgicas, permanecen casi en su
totalidad incaracterizados. Los virus marinos representan un nuevo mundo inexplorado de la
diversidad.
LA ABUNDANCIA Y DISTRIBUCIN DE BACTERIAS Y PATGENOS VIRALES
En el medio marino, como en otros, la distribucin de un patgeno bacteriano o viral es
determinado directamente por la virulencia del patgeno y el nmero de huspedes susceptibles
disponibles. Este equilibrio entre los huspedes y patgenos genera y mantiene la diversidad de
ambos grupos. Sin embargo, esta delicada relacin se rompe en algunos casos. Por ejemplo:
>> La trasnferencia lateral de genes entre bacterias (realizado por virus) y la conversin lisognica
pueden ser mediadores importantes de cambio de no patgenos a los estados patgenos en
algunas bacterias.
>> Los patgenos oportunistas como Vibrio cholerae no cumplen con las reglas de la disponibilidad
husped, ya que pueden existir fuera del husped.
>> Factores relacionados con el clima, incluyendo la temperatura, han sido mostrados para
provocar un estado patgeno en ciertos patgenos oportunistas como Vibrio shiloi coral y algas
simbiticas llamada zoozanthellae.
>> Las actividades humanas y la contaminacin qumica tambin pueden influir en la abundancia
de patgenos acentuando y desestabilizando comunidades microbianas.
CAPACIDADES METABLICAS Y FUNCIONES
>> MICROORGANISMOS SON CRIATURAS MUY ADAPTABLE, Y LOS MICROBIOS QUE HABITAN EN
LOS OCANOS DEL MUNDO NO SON LA EXCEPCIN. MICROBIOS MARINOS HAN LOGRADO PONER
CASI TODOS LOS PROCESOS QUMICOS ENRGIO FAVORABLE AL TRABAJO PARA ELLOS,
HACINDOLOS PROTAGONISTAS EN LOS CICLOS QUE SE MUEVEN LOS ELEMENTOS NECESARIOS
PARA LA VIDA EN LA BIOSFERA. LA FLEXIBILIDAD DE LOS MICROBIOS MARINOS TAMBIN LES HA
CONCEDIDO UNA SERIE DE CAPACIDADES METABLICAS NICAS Y ADAPTACIONES
ESCALA DE PROCESOS MICROBIANOS EN EL MAR, las interacciones microbianas y procesos tienen
implicaciones en un rango muy amplio de escalas en los ocanos, desde la escala nanomtrica
(0.0000000001 metros) a la escala del kilmetro (1.000 metros) y mayor. El resultado global de los
procesos metablicos microbianos es la integracin de las interacciones en muy pequea escala.
En el diseo de estudios de las comunidades microbianas marinas, es importante recordar la
importancia de convexin. Ellos no deben olvidarse.
Los ciclos globales de BIOELEMENTOS, los ciclos del nitrgeno, oxgeno, carbono, azufre, fsforo,
hierro y otros bioelementos que sustentan la vida en este planeta son conducidos, en parte, por
los microorganismos en los ocanos. Los microbios son capaces de usar cada compuesto natural
del planeta y la mayora de los compuestos hecho as. Es esta flexibilidad metablica que asegura
la importancia de los microbios en el ciclo de los bioelementos. Microorganismos controlan los
pasos de ratelimiting de los ciclos que ningunos otros organismos pueden ejecutar. Los microbios
tambin fortalecen los sistemas de retroalimentacin que aumentan la estabilidad de los ciclos de
los bioelementos. An se desconocen los detalles de muchos procesos claves en los ciclos de
bioelemental, y es en gran parte desconocido que los microbios son los mayores contribuyentes a
estos ciclos, o si es posible para una especie dominante.
Aunque la contribucin exacta de microbios marinos a los ciclos biogeoqumicos es incierto,
debido a su capacidad metablica y sus nmeros absolutos, microorganismos marinos se cree que
son jugadores importantes en cada ciclo relevante a la vida. Se estima que si los ocanos se
vaciaron de microbios, el dixido de carbono en la atmsfera de la tierra aumentara Sptuple. Por
otra parte, la mitad de las microbios mediada por la fijacin de nitrgeno se produce en los
ocanos y nitrificacin y desnitrificacin, dos procesos claves que marcan el ritmo de laciclo del
nitrgeno, se llevan a cabo por los microbios. Microbios marinos tambin pueden desempear un
papel en la formacin de nubes ciclando compuestos como dimethylsulfide a la atmsfera. Se ha
detectado una constante emanacin de metano de la superficie de los ocanos, y aunque el
proceso no es completamente entendido, es sin duda microbios-mediada.
Como cada vez ms de la clave de los jugadores en los ciclos de bioelementos son cultivados y
estudiados en el laboratorio y como los estudios de metagenmica seguir contribuyendo a la
cartografa de los procesos metablicos en las profundidades del ocano y las provincias, los
cientficos estn llegando a un mejor, ms sofisticacin comprensin del ciclo elemental cmo se
lleva a cabo en los ocanos.
CAPACIDADES METABLICAS NICAS DE MICROBIOS MARINOS. Microorganismos marinos
poseen un nmero de funciones metablicas que no se encuentran en microorganismos
terrestres. Al igual que en otros ecosistemas, el hbitat geoqumico impulsa la evolucin de
diferentes capacidades metablicas en el medio marino. Por ejemplo, ambientes fros cerca de las
diferentes adaptaciones del rtico en coche de alta temperatura, alta presin hbitats cerca de los
respiraderos hidrotermales. Filtraciones de metano son otro ejemplo de un ambiente nico
marino que ha motivado la novela capacidades metablicas. En filtraciones de metano, las
concentraciones de sulfato alta combinan con concentraciones de metano alto para favorecer la
oxidacin anaerobia de metano, un metabolismo encontr solamente en los ocanos.
La luz de la bomba de protones proteorodopsina, que se encuentra en bacterias marinas, se cree
que desempean un papel importante en el balance de energa de la biosfera debido a su
capacidad para generar eficientemente energa de la luz. El uso de sodio-dependiente los
transportistas tambin se limita a los microorganismos marinos.
Simbiosis marinas, incluyendo las simbiosis entre bacterias bioluminiscentes y macroorganismos y
Teredo y nitrgeno-fijacin de bacterias celulolticas, han dado lugar a muchas actividades
metablicas nicas.
ADAPTACIN a ambientes extremos, los ocanos se encuentran en muchos tipos diferentes de
ambientes extremos y microbios marinos han encontrado numerosas maneras para prosperar en
esos lugares, cambiando su bioqumica para hacer frente a las condiciones o mediante la creacin
de barreras para evitar que las duras condiciones de sus clulas.
En ambientes fros, las bacterias psicrfilas sobrellevar las condiciones manteniendo las
membranas flexibles y distribuyendo compuestos anticongelantes naturales a lo largo de la clula.
En lugares extremadamente calurosos de los ocanos,losmicrobios hipertermfilas utilizan sutiles
cambios en sus protenas para maximizar el nmero de estabilizar puentes de sal y
emparejamientos de ocasin que mantienen las polisacridos juntos en el calor
En las zonas de altas concentraciones de sal, muchos halophiles se han adaptado , modificando
sus protenas, lo que las hace muy cido, y por lo tanto , resistentes a la protena de dispersin
efectos de altas concentraciones de sal.Otros halophilescirculaosmolitos, pequeas molculas
orgnicas que evitan la prdida de agua a los alrededores muy salados fuera de la clula.
El medio ambiente marino presenta una oportunidad sin precedentes para estudiar la vida en
condiciones extremas. En ningn otro lugar de la tierra existen diferentes condiciones
ambientales en las zonas compactas. Los ocanos son el hogar de presiones extremadamente
altas y a las temperaturas ms altas de cualquier sistema acutico. Salmueras del mar profundo,
que tienen una elevada concentracin de sales y metales pesados, son hbitats singulares donde
abunda la vida a pesar de las dificultades
LOS IMPACTOS DEL CAMBIO INDUCIDO POR EL SER HUMANO EN EL CICLO DE LOS ELEMENTOS
EN LOS OCANOS,
Desde la revolucin industrial, enormes cantidades de importantes bioelementos han sido
tomadas de fuentes relativamente inertes o inaccesibles y liberados en el aire, suelo y agua del
planeta. Entradas para el medio ambiente en esta escala directa e indirectamente impactan los
ocanos y entradas atmosfricas de gases de efecto invernadero han inducido por el cambio
climtico rpido.Como subir las poblaciones del mundo y la explotacin de los recursos se eleva,
insumos ambientales y el cambio climtico se acelera a un ritmo alarmante. Algunas
alteraciones significativas en las comunidades microbianas de los ocanos y, por lo tanto, en el
ciclismo mundial de la ayudarn cada vez ms, se prev que en la raz de estas crecientes
cambios.
Los impactos de la temperatura global cambios resultantes de sistemas enzimticos microbianos
sentirn los cambios de clima. Sistemas enzimticos diferentes tienen diferente temperatura
optima, as microecolgicos procesos en un rea determinada pueden estar deprimidos o
estimulados segn la naturaleza de los cambios de temperatura local (arriba o abajo) y la optima
de los sistemas enzimticos involucrados. Estos cambios no son predecibles, ya que la
temperatura ptima para las enzimas no son fciles de descifrar de hbitat de un organismo.
En algunas zonas del mundo, el cambio climtico ha resultado en una disminucin de las
precipitaciones. En frica subsahariana, una disminucin de las precipitaciones combinadas con
las actividades humanas ha liderado a la desertizacin de muchas reas y alienta un aumento en
polvo llevado por el viento, resultando en un incremento en la deposicin de polvo africano en los
ocanos. Los metales llevados en este polvo, incluyendo el hierro, son probablemente afecten a
las comunidades microbianas marinas y los ciclos llevan a cabo que sustentan la Biosfera. (Como
nota al margen, en el desierto de Gobi de China, riego y otras prcticas de uso de tierra han hecho
disminuy el tamao de los desiertos seleccionados. Esto ha conducido a una disminucin de la
deposicin de polvo y podra causar limitacin de hierro en las aguas marinas donde polvo y lleva
el hierro se deposita lo contrario.)
Los aportes de nitrgeno a los ocanos, que representan aproximadamente la mitad de la
aportacin total de nitrgeno estn afectando el ciclo global del nitrgeno en tanto conocidos
como desconocidos . Por ejemplo, contaminacin por nitrgeno ha tenido un gran impacto en el
xido nitroso el ciclismo en los sistemas costeros, aparentemente s da lugar a un aumento neto
de produccin del xido nitroso.Carga de nitrgeno, oxgeno las regiones costeras representan
slo el 2% de la superficie del ocano, pero estas regiones contribuyen aproximadamente el 20%
del xido nitroso los ocanos liberacin a la atmsfera . La concentracin de xido nitroso en la
atmsfera est aumentando a un ritmo acelerado, y no est claro cmo esta trayectoria se
cambiar con el cambio climtico mundial.
Es probable que el aumento continuar aportaciones de nitrgeno para perturbar y transformar
el ciclo del nitrgeno y que las emisiones de xido nitroso de los ocanos continuar
subiendoDebido a sus rpidas tasas de crecimiento y flexibilidad metablica, microbios marinos
posiblemente podran servir como un bfer que ayuda a amortiguar grandes cambios resultantes
de las modificaciones humanas de los ocanos. Hay una gran incertidumbre acerca de cmo
funciona este efecto amortiguador en la prctica, sin embargo. Puede ser que los microbios
marinos tienen cierta capacidad tampn, pero cuando se excedi las condiciones disminuir
notablemente.
Las consecuencias del cambio climtico global y las aportaciones de humanos ayudarn cada vez
ms a los ocanos potencialmente desastrosas. Aumento de la temperatura puede tener un
efecto indirecto sobre la acidez del agua de los ocanos, y por lo tanto, en el hbitat marino. La
solubilidad del dixido de carbono aumenta con la temperatura y de dixido de carbono
disuelto combina con agua para formar cido carbnico, cido (H2CO3) que posteriormente se
disocia en H + y HCO3-. Estos materiales bajan el pH del agua. La concentracin de dixido de
carbono de fuentes humanas tambin va en aumento. Por lo tanto, se espera una disminucin en
el pH del agua de mar al eco de la tendencia del calentamiento global y continuo aumento de las
emisiones de carbono. Acidificacin del ocano tendr un impacto directo en los corales. Se
espera que crezca ms lentamente y se convierten enms frgil en estas circunstancias,
disminuyendo la capacidad de los arrecifes de coral que actan como barreras protectoras isla
incluso cuando aumenta la intensidad de la tormenta debido al cambio climtico.
El cambio climtico tambin podra traer grandes cambios en la estratificacin de los ocanos,
reduccin de la mezcla y la reduccin de la produccin de las pesqueras marinas.
HUMANOS Y MICROORGANISMOS MARINOS
LOS MICROORGANISMOS MARINOS >> ESTN NTIMAMENTE VINCULADOS A LA VIDA HUMANA
MEDIANTE ciclos biogeoqumicos, RELACIONES PATGENOS MICROBIANOS Y OCANO INFLUYE
EN LAS CADENAS trficas. SIN EMBARGO, MUCHAS DE LAS ACTIVIDADES HUMANAS PUEDEN
TENER UN IMPACTO SOBRE DIVERSIDAD MICROBIANA, LA CUAL, A SU VEZ, TIENE UN IMPACTO
EN LOS SERVICIOS microbios marinos nos ofrecen.
Aparte de sus funciones naturales en los asuntos humanos, tambin se pueden poner los
microbios de los ocanos para utilizar en aplicaciones de la biotecnologa o en ayudar a aliviar el
deterioro ambiental.
IMPACTOS HUMANOS EN DIVERSIDAD MICROBIANA MARINA
Ms de 6 billones de personas ahora pueblan el mundo, y se siente el impacto de nuestras
actividades en todos los rincones del globo, incluyendo los ocanos. La biodiversidad de microbios
marinos es que podran verse afectadas por las actividades humanas a escala local y mundial.
A escala mundial, todos los organismos en los ocanos, incluyendo los microbios, responder a la
caracterstica principal del cambio climtico global: los cambios de temperatura. Las temperaturas
elevadas se han encontrado para lograr aumentos en la cantidad de ciertos patgenos
transmitidas por el agua. Temperaturas ms altas tambin pueden desencadenar la actividad de
ciertos genes microbianos, incluyendo genes de virulencia que pueden llevar patgenos
ambientales que causan enfermedades en los seres humanos, los corales y otros
macroorganismos.
Cambios de temperatura en los ocanos tambin pueden perturbar el delicado equilibrio entre el
nmero de bacterias y fagos. El sistema de controles y equilibrios entre el virus y sus huspedes
bacterianas se ha reconocido recientemente como un factor determinante de la diversidad y
abundancia bacteriana y de la eficacia de carbono bicicleta en una determinada comunidad
microbiana. Es posible que el cambio climtico no puede tener efectos drsticos hacia fuera en el
equilibrio entre las bacterias y virus, sin embargo, dada la flexibilidad del sistema y la capacidad de
adaptacin de los microorganismos.
A nivel local, el agujero de ozono sobre la Antrtida, una consecuencia de las emisiones humanas
de sustancias qumicas que agotan el ozono, probablemente tiene efectos sobre las poblaciones
de microbios all. La brecha en la capa de ozono permite altos niveles de rayos ultravioleta para
alcanzar la superficie del ocano y es probable que aumentar las tasas de mutacin microbiana y
cambiar la composicin de la comunidad microbiana en aguas antrticas.
Los impactos locales tambin incluyen la liberacin de agua de lastre exticos.Es conocida la
prctica de dumping de agua de lastre para liberar tanto invasivo macroorganismos y
microorganismos potencialmente dainos en las aguas costeras.
Carga de nutrientes, sea de las actividades de cultivo de peces o de escorrenta, ha tenido
impactos masivos en ambientes costeros. Las granjas de peces han demostrado ser responsables
de eutrofizacin (adiciones de altas concentraciones de nutrientes) de aguas, dando lugar a
grandes cambios en las comunidades microbianas circundantes. Piscicultura escurrimiento y
actividades juntos ha dado lugar a un aumento en la frecuencia de fitoplancton costero,
incluyendo Proliferaciones algales nocivas que cost a los pescadores y los gobiernos millones de
dlares cada ao.
Recoleccin a gran escala de la macrofauna Marina por los seres humanos ha cambiado las redes
trficas de los ocanos y es probable que estar afectando equilibrios marinos y la diversidad
microbiana, manejando los nmeros de algunas especies para arriba y otras abajo. En el Per en la
dcada de 1970, por ejemplo, sobreexplotacin llev a grandes fitoplancton y una sucesin de
bacterias que crean grandes zonas de agotadas oxgeno, llamado "zonas muertas" en las aguas
costeras. En este caso, las actividades humanas condujeron directamente a un cambio
fundamental y devastador en el ecosistema microbiano. La naturaleza exacta de los efectos de la
red trfica cambios resultantes de la pesca excesiva es poco entendida y requiere mayor estudio.
CRTICAS EQUILIBRIOS MEDIADA POR MICROBIOS QUE AFECTAN LA SALUD HUMANA Y
AMBIENTAL
si bien es cierto que los sistemas microbianos marinos conducen los ciclos biogeoqumicos que
hacen posible la vida en este planeta, microbios marinos tambin tienen efectos ms directos e
inmediatos sobre la salud humana y el bienestar de los ecosistemas del ocano. Muchos de estos
efectos directos son el resultado de frgiles equilibrios microbianas, equilibrando puntos entre
oponerse a las tendencias que podran conducir a graves consecuencias para los seres humanos y
el medio ambiente.
El equilibrio entre la bacteria y virus en los ocanos es un ejemplo de la clase de microbios de acto
de equilibrio crticos funcionan cada da. Saben cambios de la radiacin de temperaturas y
ultravioleta de agua (el UV), dos factores sabidos para ser afectado por actividades humanas,
molestar los nmeros relativos de bacteria y virus en los ocanos, con resultados posiblemente
desastrosos para la salud humana. La virulencia de un virus que se alimenta de la bacteria
responsable del clera (Vibrio cholerae), por ejemplo, es afectado por cambios sutiles de la
temperatura. De ah, la temperatura costera es un determinante clave de la carga de clera en
aguas costeras - una materia importante a la gente quien vive cerca de aquellas reas. Los estudios
indican que el UV puede convertir virus entre formas activas e inactivas, tan los cambios
atmosfricos que aumentan la cantidad de luz en estas longitudes de onda que alcanza los
ocanos pueden trastornar el equilibrio entre virus y sus anfitriones, posiblemente conduciendo a
epidemias incontroladas en el pescado, invertebrados, o la gente.
Comunidades microbianas en los ocanos tambin mantienen los equilibrios que pueden guardar
flores de algal daosas en la comprobacin. Algal flores puede envenenar a la gente y la fauna que
consume el marisco corrompido por las algas. Ahora sabe que la contaminacin nutritiva puede
molestar microbios costeros martimos, provocando estas flores.
Tambin podran alterar el equilibrio simbitico entre microbios martimos y sus anfitriones
actividades humanas. Los aumentos de la temperatura de agua, por ejemplo, obligan corales para
expulsar hacia fuera sus simbiontes bacteriales. Microbios martimos median las proporciones
nutritivas en el agua de mar, y las liberaciones de sustancias nutritivas de la final, instalaciones de
tratamiento de aguas negras, u otras fuentes que trastornan aquellas proporciones puede
seriamente la salud de ecosistema de desequilibrio.
Sistemas martimos sumamente son unidos entre ellos - ms tan que sistemas terrestres. Por
consiguiente, cambiando microbianamente - el equilibrio mediado en una parte del ocano a
menudo tendr impactos sobre reas adyacentes y regiones remotas. El enganche entre el
sedimento (llam la zona de benthic) y el agua (se llam la zona pelgica) en reas costeras es la
en particular apretada y que se cambia de aquellos componentes inevitablemente afectar el otro.
Asimismo el ocano profundo recoge el material del ocano superior - los dos son algo separados,
pero inextricablemente unidos.
Los modelos para Estudiar los sistemas de Modelo de Equilibrio Microbianamente mediados son
necesarios para estudiar el equilibrio microbianamente mediado que se relaciona con la salud
humana y ambiental. Algunos modelos de candidato incluyen:
>> Cyanobacteria y cyanophage servira como un modelo bueno para investigar los equilibrios
entre anfitriones y virus.
>> los corales que han conducido al norte por las aguas calientes que estimulan la toxicidad Vibrio
a zoozanthellae simbitico del coral seran un sistema excelente para estudiar los impactos de
actividades humanas sobre symbioses..
>> la Baha Chesapeake podra ser un sistema bueno modelo de un ecosistema sumamente
impactado costero martimo. Entradas nutritivas a la baha han sido acortadas, pero estas
restricciones an no han causado una mejora marcada sobre las medidas de salud ecolgica.
>> sistemas Ligeramente estratificados martimos, como el Mar Rojo, y sistemas sumamente
estratificados prstinos costeros podran servir como modelos buenos para la comparacin el uno
contra el otro para aprender sobre las condiciones que pueden conducir a anoxia.
>> Oligotrophic sistemas sistemas (nutritivos pobres) y eutrophic costeros (contaminados por
sustancia nutritivos) podran hacer sistemas buenos comparativos para la comprensin la
sensibilidad y la resistencia de equilibrio a la carga nutritiva.
Un modelo de flores de algal daosas es crticamente necesario. No saben los mecanismos y
factores de provocacin detrs de estos fenmenos, y un sistema conveniente para el estudio an
tiene que ser encontrado. Redes fluviales de lastre modelas son tambin necesarias. Mucha agua y
muchos mil millones de microbios est siendo movida en el mundo entero como el lastre, pero los
efectos de estas actividades son poco entendidos.
La reversibilidad de Cambios del Equilibrio Microbianamente mediado Claramente, el equilibrio
crtico que microbios martimos mantienen fcilmente puede ser perturbada por acciones
humanas, y muchas de estas condiciones, como los equilibrios que guardan flores de algal daosas
en la comprobacin, son ya en un estado desequilibrado. Sin embargo, algunos de estos impactos
pueden ser reversibles. La contaminacin nutritiva, por ejemplo, que afecta el equilibrio que
controla flores de algal y concentraciones nutritivas en aguas costeras, podra ser controlada por
previniendo el vertido de aguas residuales en el ocano y por restaurando los pantanos y pantanos
de sal que filtran sustancias nutritivas en la final antes de que esto alcance el ocano.
La prevencin de la emisin de clorofluorocarbonos que agotan ozono permitira al agujero en la
capa de ozono sobre el Antrtico para recuperarse dentro de unas dcadas. Una capa de ozono
ms intacta prevendra mucho UV daoso de alcanzar los ocanos y relevara el equilibrio bacterial
viral de los efectos adversos de UV.
En un esfuerzo para limitar liberaciones patgenas, agua usada en operaciones de piscicultura
podra ser tratada y reciclada dentro del sistema. La limitacin de liberaciones a los ocanos
bajara los nmeros de asociado por granja pathogens al cual poblaciones salvajes son expuestas y
restauraran equilibrios locales entre pathogens y anfitriones. El reciclaje tambin eliminara (o al
menos acortara) la liberacin de sustancias nutritivas a aguas locales. El nitrgeno podra ser
quitado del agua de granja la utilizacin de un proceso de amonaco anaerobio realizado por la
bacteria martima. La acuicultura sin la contaminacin biolgica y qumica es un objetivo digno
para la industria.
La gente ha afectado el equilibrio martimo en mucho, y no saben el tiempo requerido para estos
sistemas para recuperarse. La educacin sobre estos asuntos es necesaria para transportar la
severidad de estos impactos a la comunidad global de modo que pasos agresivos puedan ser
tomados para invertirlos.
APLICANDO MICROBIOS MARTIMOS QUE USAN LA BIOTECNOLOGA la gran diversidad metablica
de microbios martimos hace los ocanos una fuente rica de material biolgico para usos de
biotecnologa. Una variedad de metabolites secundario, enzimas, polmeros, y procesos
metablicos puede ser encontrada slo en los microbios que habitan los ocanos, y es probable
que muchos productos ms tiles sern encontrados como la investigacin sigue. El potencial de
biotecnologa de estos organismos es una fuerza motriz principal detrs del empuje para
caracterizar la diversidad martima microbiana.
Hbitats diferentes martimos cedern microbios satisfechos a usos diferentes. La exploracin de
entornos calientes, por ejemplo, desenterrar la bacteria thermophilic que produce las polimerasis
thermostable que podran ser usadas en usos industriales.
Las colecciones de bibliotecas y las colecciones de cultura de microorganismos martimos seran
muy tiles para cosechar productos biotecnolgicos de microbios martimos. La investigacin
fundamental tiene que proporcionar las bibliotecas fundamentales, instrumentos, y metadata que
puede ser unido y pasado a intereses biotecnolgicos y biomdicos para inventar usos para
microbios martimos y sus productos. Los modos innovadores de unir la investigacin para usos
verdaderos mundiales son necesarios.
El Potencial de Usos Industrial los usos industriales de microorganismos martimos es muchos y
variado, incluyendo:
>> el interfaz entre la microbiologa, la nanotecnologa, y la ingeniera puede ceder nuevo
nanostructures o componentes electrnicos producidos con la ayuda de microbios martimos.
>> cuentas Magnticas de la bacteria magnetotactic martima podran tener usos en la ptica y la
electrnica.
>> Ciertos organismos martimos, incluyendo Prochlorococcus y Pelagibacter, han aerodinamizado
los genomas que pueden ser tiles como motores metablicos para fabricar productos
industriales.
>> Alkylophiles puede producir productos tiles para el empleo en detergentes de lavandera.
El Gnero humano de Produccin de Energa afronta necesidades de energa enormes, pero con la
ayuda de microorganismos martimos, biocarburantes, la produccin de energa de limpiador, y
tecnologas alternativas de combustible pueden ser todas dentro del alcance. Los nuevos procesos
que podran construir las fuentes sostenibles de energa pueden provenir de una mejor
comprensin la diversidad de procesos disponibles en microorganismos martimos. La
comprensin la diversidad de procesos microbianos proporcionar la informacin evolutiva,
estructural, y funcional que es necesaria para la organizacin de proceso y la optimizacin. La
produccin microbiana de hidrgeno de la luz y el agua, la fijacin de nitrgeno, y el secuestro de
carbn procesa cada necesidad para ser estudiada en un nivel bsico. Los gradientes de redox
creados por microorganismos en el sedimento martimo posiblemente podran ser usados generar
la electricidad.
Enzimas de Usos Mdicas y compuestos de bioactive de microbios martimos pueden ser muy
tiles en usos mdicos. Hoy, los polisacridos son usados en muchos nuevos productos, y varios
compuestos prometedores martimos estn en la tubera de desarrollo de medicina. La promesa
bioactive compuestos al principio descubiertos en invertebrados martimos puede ser producida
por simbiontes ms bien que por los invertebrados ellos mismos. La cultura acertada de estos
simbiontes puede asegurar un suministro econmico, sostenible de estos compuestos, mejorando
las probabilidades de su desarrollo comercial como medicinas.
Microbios martimos tambin pueden ser usados fabricar compuestos llam "nutriceuticals",
productos naturales solidos como suplementos de dieta promover la salud. Docosahexaenoic el
cido, un cido graso necesario para la funcin apropiada cerebral, por ejemplo, podra ser
cosechado de las culturas de dinoflagellates martimo y procesado para la venta como un
nutriceutical.
La taxonoma tiene algn valor proftico en la unin de potenciales fisiolgicos a taxa especfico.
Por ejemplo, algunos grupos, como actinomycetes y cyanobacteria, son los productores confiables
de compuestos de bioactive. Asimismo thermostable enzimas probablemente son encontrado en
taxa que prospera en entornos calientes, como Thermocales. Sin embargo, los investigadores
deberan recoger la precaucin despus de estos tipos de generalidades para evitar que la
autorealizacin profetice: el encuentro bioactive compone slo donde ellos fueron perseguidos.
Corrientemente, la asignacin de los recursos para la investigacin taxonmica
desproporcionadamente es asignada hacia macroorganismos; ms recursos son necesarios en la
investigacin taxonmica sobre la especie microbiana.
USANDO MICROBIOS MARTIMOS PARA MEJORAR LA DETERIORACIN AMBIENTAL la diversidad
metablica de microorganismos martimos no slo los hace tiles en usos de biotecnologa, esto
los hace instrumentos verstiles para dirigir problemas ambientales. Un uso principal ambiental
para estos organismos es bioremediation el tratamiento de contaminacin qumica que usa
microorganismos. La limpiadura de hidrocarburos, productos expresamente de petrleo, es una
materia sobre todo apremiante en los ocanos, donde los accidentes a bordo de petroleros
pueden liberar miles de los galones del aceite en un incidente solo. En algunos casos, fertilizando
las comunidades indgenas microbianas sobre las playas afectadas con el nitrgeno y el fsforo
puede apresurarse la degradacin del aceite derramado, pero opciones bioremediation en el agua
abierta es limitada debido a dificultades en la entrega sustancias nutritivas suficientes para
sostener la biodegradacin.
Ahora sabe que las acciones de una comunidad entera microbiana son necesarias para estropearse
la materia orgnica compleja, incluyendo el petrleo. Un superorganismo que podra realizar el
proceso entero fue buscado, pero nunca fue aislado o diseado.
Un racimo de los genes que realizan la degradacin de biphenyls tratado con cloro, llamado el
racimo BPH, ha sido aislado y ahora est siendo aplicado en el trato de contaminantes dragados
del estuario Hudson del Ro.
Hoy, la mayor parte de investigacin en bioremediation en el entorno martimo es enfocada en los
organismos ya presentan en las reas afectadas. Por ciertas razones, pocos esfuerzos deben en
camino desarrollar microorganismos tramados para dirigir los problemas de la contaminacin
qumica. Hay problemas particulares en lo que concierne a microbios de liberacin para
bioremediation en entornos acuticos; la limitacin de los organismos al sitio de preocupacin,
por ejemplo, sera difcil.
Finalmente, hay una posibilidad que virus martimos pueden ser usados controlar flores de algal
daosas en una especie " de la terapia viral. " Los virus pueden ser aislados de la especie algal
responsable de flores, luego tramados o de otra manera realzados en el laboratorio, y liberados en
una flor. Este acercamiento sostiene el gran potencial para controlar enfermedades en ajustes de
acuicultura.
LA INVESTIGACIN, LA EDUCACIN, Y ENTRENANDO
>> EL FUTURO DE MICROBIOLOGA MARTIMA MIENTE EN LA INVESTIGACIN INNOVADORA Y EN
LA EDUCACIN EFICAZ Y LA EDUCACIN DE LA SIGUIENTE GENERACIN DE CIENTFICOS. UN
ACERCAMIENTO INTEGRADO SER NECESARIO A LOS ESTUDIANTES DE MENTOR QUE TOMARN
EL DESAFO DE DIRIGIRSE la mayor parte DE QUE TODAVA NO ENTENDEMOS EN EL REINO DE
MICROBIOLOGA MARTIMA.
GENOMICS Y MICROBIOS MARTIMOS Genomics, el estudio de todo o la parte del genoma de un
organismo para contestar preguntas sobre aquel organismo, describe un juego relativamente
nuevo y poderoso de las tcnicas de investigacin que pueden ser aplicadas en la microbiologa
martima. Genomics permitir a investigadores para destapar capacidades antes desconocidas y
metabolismos y definir las relaciones mutuas que mantienen comunidades martimas
microbianas unido, revolucionando nuestra comprensin del campo en los aos que viene.
A pesar de su poder, genomics accesos no puede ser los nicos instrumentos sola dirigir la
biologa martima microbiana. Accesos tradicionales de laboratorio en la gentica, la bioqumica, la
fisiologa, y la ecologa son todava necesarios para validar la biologa. Estudios funcionales a
menudo sern necesarios para seguir sobre los estudios de genomics que destapan genes
desconocidos, por ejemplo. Genes conservados hipotticos plantean otro problema; es no a
menudo posible distinguir la funcin de protena de la secuencia de un gene hipottico solo.
Mejores instrumentos de reconocimiento de adorno podran ayudar a mejorar la capacidad de
distinguir la funcin de la secuencia. Los estudios de microserie tambin podran ayudar por
identificando donde y bajo lo que condiciones el gene de inters es expresado. La integracin de
genomics, transcriptomics, proteomics, con tcnicas ecolgicas, biofsicas, y qumicas ser
necesaria para delinear procesos fundamentales fisiolgicos, entender su regulacin, y
determinar como ellos se relacionan con ciclos biogeochemical.
METAGENOMICS sequencing Genmico de especie sola ha hecho grandes contribuciones a
nuestra comprensin de sistemas martimos microbianos, y metagenomics (en el cual los genomas
de un grupo de organismos son amontonados y estudiados juntos) los accesos ampliarn aquel
conocimiento y aadirn a nuestra comprensin de procesos martimos microbianos.
Metagenomics confiere el potencial para trazar un mapa de los metabolismos de microbios en el
espacio y el tiempo. An puede ser posible identificar diferencias del potencial metablico entre
regiones diferentes del ocano que usan metagenomics accesos. El archivar de los genmicos y
muestras de metagenomic ser necesario para proporcionar datos de base contra los cuales
estructuras de comunidad microbianas pueden ser evaluadas con el tiempo. Adems, la
informacin genmica y metagenomic provee el fundamental para la microserie y las tecnologas
proteomics-basadas que han mostrado la promesa para revelar funciones complejas microbianas.
Proteomics a base de comunidad ha sido aplicado para investigar al comandante protenas
expresadas de estuarine bacterioplankton.
Expresin de protena de Baha Chesapeake picoplankton comunidad mostrada por anlisis de gel
de 2-D (Cortesa de Feng Chen). El gel fue manchado con el Rub SYPRO. EL IP recorrido de 5 a 8, y
la masa molecular de 10-100Kda.
Para hacer el mejor progreso en el campo, ser crtico atar estudios de metagenomics a la
existencia knowledgebase en la oceanografa biolgica. Un modo de lograr esto es de localizar
estudios de escala grande en sitios de estudio existentes, como el Hawaiano de estaciones de serie
de tiempo del ocano la Serie de tiempo del Ocano (CALIENTE) y la Bermudas el Estudio de Serie
de tiempo del Atlntico (MURCILAGOS), para tener un contexto rico de datos existentes
disponibles para la comprensin nuevos datos metagenomics.
Ser importante hacer datos metagenomic y otro genomics datasets accesibles a otros
investigadores y tan fciles de usar como posible.
LAS TCNICAS DE DEPENDIENTE DE 16 el nivel de resolucin de las tcnicas que confan en los 16
ribosomal el gene de ARN son otra publicacin apremiante en la investigacin sobre microbios
martimos. Ribosomal secuencias de gene de ARN a menudo son usados identificar
microorganismos y las sondas de grupo de 16 son usadas evalan la diversidad de los grupos de
microbios. La nueva informacin ha criado preguntas sobre si los genes de 16 ofrecen la resolucin
suficiente para informar a investigadores sobre la distribucin de microbios diferentes. Puede ser
que los genes de 16 simplemente demasiado sumamente son conservados a travs de las
tensiones relacionadas de bacteria y archaea para ser tiles en muchos anlisis y esto estudia lo
que confa en la electrofresis de gel de gradiente denaturing (DGGE) u otros mtodos
dependientes de 16 seriamente subestiman la diversidad microbiana.
Ahora se puede conseguir una mayor resolucin de especies microbianas utilizando otras
herramientas, incluyendo el espaciador interno transcrito (ITS) regin comprendida entre los
genes 16S y 23S, e incluso medidas tales como el tamao del genoma. Los estudios que utilizan
estos mtodos han demostrado que los genes 16S pueden perder una gran cantidad de diversidad
gentica, lo que confirma que la definicin de una especie microbiana es realmente un tema
complicado.

FINANCIACIN DE LA INVESTIGACIN
Hay una serie de preguntas urgentes en la ecologa marina microbiana, como la manera en que el
cambio climtico afectar a microbios marinos y los ciclos biogeoqumicos que slo puede ser
abordado por las grandes iniciativas nacionales. Ms los programas interinstitucionales son
necesarios para dirigir estos tipos de proyectos. Tambin hay una necesidad de centros de
excelencia en microbiologa marina para enfocar los esfuerzos de la comunidad sobre las grandes
preguntas del da a da de este tema.

NUEVAS COLABORACIONES
Preguntas penetrantes en microbiologa marina rara vez mantenemos dentro de los confines de
una persona con la experiencia, este tema requiere la aportacin de muchos y variados puntos de
vista. La colaboracin internacional a travs de las fronteras y de las diferentes disciplinas debe ser
fomentada.
Colaboracin Internacional
La cooperacin internacional en la investigacin de microbiologa marina puede servir para
fomentar el surgimiento de nuevas ideas y fertilizar investigacin con intercambio de tecnologa.
Buques de investigacin y sumergibles estn en oferta limitada, y compartirlos con los cientficos
de otras naciones puede ayudar a todos en el campo de investigacin. Adems, los ocanos del
mundo son un recurso compartido, y la investigacin sobre la vida marina y los procesos marinos
que ayudan a sostener el planeta estn en el inters de todas las personas, independientemente
de su origen o su nacin.
Existen diferencias en los puntos fuertes de investigacin de los cientficos de EE.UU. y los que se
encuentran en el extranjero, y la formacin en algunos de los campos que se refieren a
microbiologa marina es sin duda mejor en otros pases. Con una estrecha colaboracin se puede
aprovechar la capacidad de los pases participantes y promover mejoras que se necesitan en el
campo.
Hay muchas menos posibilidades de colaboracin internacional hoy de las que existan hace 20
aos. Los proyectos de la Unin Europea, por ejemplo, no suelen apoyar la labor de los
americanos, y la Fundacin Nacional de las Ciencias no permite las subvenciones de fondos a
cientficos europeos. Adems cuestiones polticas modernas, como los visados y las medidas de
seguridad nacional, tambin son un obstculo.
Las agencias federales pueden estimular el trabajo internacional mediante el establecimiento de
proyectos de financiacin conjunta con los organismos equivalentes de la Unin Europea, Asia y
otros lugares. El programa International post-doctoral appointments tambin podra facilitar la
cooperacin a travs de las fronteras. Un programa de intercambio financiado por el gobierno
involucrara a 10 asociados postdoctorales en microbiologa marina en un programa de
intercambio cada ao que contribuira en gran medida a fomentar proyectos internacionales. La
Sociedad Internacional de ecologa microbiana (ISME) podra ser un facilitador eficaz de
colaboraciones internacionales.
Colaboracin Interdisciplinaria
Gran parte de los trabajos ms innovadores en microbiologa marina tiene lugar en las fronteras
interdisciplinarias. Por ejemplo, la geobiologa fsica, el cruce de la geoqumica, microbiologa y
geologa, ha hecho grandes avances en los ltimos aos. Otros campos tienen que ser reunidos
para fomentar este tipo de innovacin. Oceangrafos fsicos, oceangrafos qumicos, y bilogos
marinos deben ser capaces de interactuar provechosamente en los estudios de la columna de
agua.
Los microbilogos tambin deben construir interfaces con los ingenieros para desarrollar
instrumentos para el campo. Descubrimientos de metabolitos secundarios y estudios de este
podran llevarse a cabo en colaboracin entre los microbilogos marinos, farmacuticos, orgnicos
y qumicos bioinorgnicos. Otros posibles socios colaboradores de los microbilogos marinos son
los matemticos, los ecologistas, los cientficos informticos, los informticos, los fsicos, los
matemticos y los bilogos marinos.
La biologa se beneficiara de una mejor integracin a nivel universitario. Actualmente, la
administrativa divide la ecologa separando los departamentos tanto de microbiologa celular de
los departamentos de biologa molecular, aunque todos estos campos son directamente
relacionados con la microbiologa marina. La investigacin en microbiologa marina se beneficiara
de una mejor integracin de las universidades que promuevan las interacciones entre las
diferentes especialidades. Una forma de lograr la integracin es establecer iniciativas de
investigacin entre las facultades o carreras dentro de las universidades con el fin de reunir a las
personas interesadas en la "ciencia microbiana", por ejemplo.
ENSEANZA Y OPORTUNIDADES EDUCATIVAS
Hay un serie de formas innovadoras para transmitir la microbiologa marina a los estudiantes
universitarios, estudiantes de postgrado y asociados posdoctorales que sern la prxima
generacin de cientficos.
La capacitacin en microbiologa marina debe ser multidisciplinaria, exponiendo a los estudiantes
de disciplinas tan diversas como la biologa molecular, laboratorio de microbiologa, teora
ecolgica, oceanografa y bioinformtica. El reto radica en expresar y ensear todas las asignaturas
bsicas en estos campos a los estudiantes de una manera coherente.
Un semestre en el mar es una parte importante de la capacitacin en microbiologa marina. Puede
ser aconsejable coordinar con el Sistema Nacional de Universidades de Laboratorios
Oceanogrficos (UNOLS) para llegar a un mayor nmero de estudiantes involucrados en proyectos
de investigacin a bordo de los buques.
Las prcticas de verano o "intercambios", los acuerdos con laboratorios en la que un estudiante
pasa un semestre en un nuevo laboratorio podran fomentar la interaccin interdisciplinaria entre
los estudiantes de postgrado, estudiantes y asociados posdoctorales. Acuerdos como ste
conducira inevitablemente a las interacciones productivas entre los mentores o tutores de los
estudiantes, tambin. Programas como "Experiencia en investigacin para estudiantes
universitarios" tambin ayudara a mejorar la calidad de la formacin de grado en microbiologa
marina. Programas de posdoctorado que capaciten a las personas en campos interdisciplinarios,
como la bioinformtica, deben dirigirse con una inclinacin en microbiologa marina.
Existe una necesidad de tener un buen libro de microbiologa marina. Un libro elaborado con la
contribucin de muchos expertos que integre la informacin a travs de las disciplinas de la
microbiologa, la ecologa, la evolucin y la oceanografa, probablemente sera muy bienvenida por
los instructores.
Es importante capacitar bilogos y eclogos marinos en los fundamentos de la microbiologa y
tcnicas moleculares desde que se estn formando en el pregrado y postgrado. Con el fin de
inculcar en los estudiantes la importancia de sistemas microbianos, es de vital importancia
presentar la microbiologa de una manera que se muestre un gran impacto, en el que se transmite
la importancia de la microbiologa en la comprensin de los ocanos, en lugar de conceptos
detallados. Una forma de lograrlo es mediante la designacin efectiva de profesores invitados.
COMUNICACIN DE LOS TEMAS
La comunidad cientfica debe tomar un papel ms activo en la transmisin de las cuestiones
relacionadas con los microbios marinos para el pblico y para los responsables polticos. Una serie
de enfoques diferentes pueden ser utilizados en la educacin de los que no son cientficos sobre la
importancia de los organismos microscpicos (incluyendo los microbios que viven en los ocanos)
en nuestra vida cotidiana.
El video es una forma muy llamativo para llegar a los diferentes pblicos, especialmente a los ms
jvenes. Un festival de cine para estudiantes de posgrado, que se celebra anualmente en la
reunin de inversiones de la sociedad cientfica sera una excelente manera de fomentar este tipo
de proyectos y destacar la investigacin de estudiantes graduados. El festival de cine patrocinado
por la Organizacin Europea de ciencias de la Vida sera un buen modelo en el que basar este
nuevo festival de cine.
Los videojuegos y los libros para nios con temas de microbiologa son otras maneras de llegar a
un pblico joven.
Los programas de televisin con temas de ciencias forenses han impulsado el inters de los
estudiantes y el pblico en la educacin forense. Tal vez los programas de televisin con temas de
microbiologa se podran utilizar para estimular el inters en este campo.
Para llegar a los responsables polticos, puede ser una buena idea para los microbilogos marinos
participar en el actual programa de cursos de corta duracin para los internos del Congreso. Los
temas especficos de las ciencias del mar podran presentarse a estos nacientes polticos por va
rpida.

RECOMENDACIONES
1. Hay una serie de cuestiones pendientes sobre distribuciones microbianas marinas que
deben ser abordados, entre ellos:

Cul es la importancia funcional ecolgica de la diversidad de genes observados
en las comunidades microbianas marinas?
La diversidad tiene un impacto en el funcionamiento de los ecosistemas o la
estabilidad a largo plazo?
Son los cambios en las comunidades microbianas predictivo de cambios en
funcin del medio ambiente, como el ciclo de los bioelementos?
La variabilidad a largo plazo de las comunidades microbianas marinas es poco
conocida. Puede el muestreo intermitente, como el de la toma instantneas de la
comunidad, frente a esta pregunta y es el muestreo continuo necesario para
evaluar los cambios de composicin de la comunidad?
Hay especies claves en las comunidades microbianas marinas que son crticas
para una funcin determinada?
Cmo pueden los cientficos identificar qu organismos son?
2. El cambio climtico, sin duda, alterara la diversidad de las comunidades microbianas
marinas en formas imprevistas. El cambio climtico debe considerarse como un
importante regulador de arriba hacia abajo de las comunidades microbianas.

3. Interacciones y procesos microbianos tienen implicaciones en un amplio rango de escalas
en los ocanos. En el diseo de la investigacin orientada hacia las comunidades
microbianas marinas, la importancia de microescalas no debe ser pasado por alto.

4. La recoleccin a gran escala de pescado de mar por los seres humanos ha cambiado las
redes trficas de los ocanos y probablemente afecta los equilibrios marinos y la
diversidad microbiana. La naturaleza exacta de los efectos de los cambios en la cadena de
alimentos derivados de la pesca excesiva es poco comprendida y requiere ms estudio.

5. Gran parte de los trabajos ms innovadores en microbiologa marina se lleva a cabo por
equipos interdisciplinarios de cientficos. Colaboraciones entre microbilogos y
geoqumicos, gelogos, oceangrafos fsicos, oceangrafos qumicos, productos qumicos
naturales, ingenieros, fsicos, matemticos, bioinformticos y bilogos marinos deben ser
fomentados y alentados por los organismos federales y las asociaciones profesionales.

6. La formacin en microbiologa marina debe ser multidisciplinar, exponer a los estudiantes
a disciplinas tan diversas como la biologa molecular, laboratorio de microbiologa, la
teora ecolgica, la oceanografa y la bioinformtica.

7. Los seres humanos afectan en muchas formas adversas el equilibrio marino, y el tiempo
requerido de recuperacin para estos sistemas no se conocen. La educacin sobre el
impacto humano en los ocanos es necesario transmitirlo y as mostrar la gravedad de la
degradacin ambiental a la comunidad mundial para que estas puedan tomar medidas
agresivas para revertirlas.

8. Las interacciones entre las comunidades microbianas presentes en los sedimentos y de las
comunidades presentes en la columna de agua marina son poco comprendidos. Esto
representa una clara brecha en el conocimiento actual que se deben abordar en futuras
investigaciones.

9. La diversidad microbiana marina necesita ser explorada a fondo, incluyendo la notable
diversidad que se encuentra en simbiontes microbianos de invertebrados marinos. Los
virus marinos representan un nuevo mundo inexplorado de la diversidad.

10. Se necesita urgentemente un modelo de las floraciones de algas nocivas. Los mecanismos
y factores desencadenantes detrs de las floraciones de algas nocivas no son conocidos, y
an no ha sido encontrado un sistema adecuado para su estudio. Tambin son necesarios
los modelos de sistemas de agua de lastre. Una gran cantidad de agua y miles de millones
de microbios se est moviendo por todo el mundo como un lastre, pero los efectos de
estas actividades son poco comprendidos.

11. Ser importante que los datos de metagenmica y otros datos conjuntos genmica sean
accesibles a otros investigadores y tan fciles de usar como sea posible. La caracterizacin
genmica proporciona entre sus posibles actividades y usos, y la aplicacin de la
protemica basada en la comunidad (metaproteomica) podra ser una forma til para
investigar los procesos microbianos actuales y vincularlos con las funciones micro-
geoqumicas importantes.

12. Hay una necesidad de un buen libro de texto en microbiologa marina. Un libro elaborado
con las aportaciones de muchos expertos que aporten informacin a travs de la
integracin de las distintas disciplinas de la microbiologa, la ecologa, la evolucin y la
oceanografa, probablemente sera muy bienvenida por los instructores.