Structura fiecrei proteine este determinat genetic.
Proteinele au roluri diferite n celul i respectiv n organism. La nivel celular au rol specific, indispensabil pentru funcionarea corect a ansamblului celular. Numrul de proteine identice ntr-o celul este foarte bine determinat. Eemplu! transportorul pentru gluco" #L$%& din celula 'epatic ( valori normale )*+ +++, sub &+ +++ - diabet. Eist un ec'ilibru ntre sinte"a i degradarea proteinelor la nivel celular. Rolul proteinelor Structural .e. compo"iia membranelor celulare, 'istonele n /0N1 2uncional o 3n metabolism .en"imele1 o 4omunicarea ntre organe 5ormoni 6eceptori 'ormonali o %ransportori Prin membrane .glucide, aminoaci"i1 7ntre organe .albumine, apoproteinele1 o Sistemul contractil .mio"ina1 o 3munitate .imunoglobuline, sistemul complement 1 o 4oagulare .fibrina, fibrinogenul1 o 3n genetica celular .factori de transcripie, represori genici1 2i"ico-c'imic .meninerea ec'ilibrului acido-ba"ic, osmotic1 Energetic Structura proteinelor 1 Structura primar ( tipul, numrul i succesiunea aminoaci"ilor n caten. Secvena aminoaci"ilor este re"ultatul informaiei genetice. 3ndiferent de numrul aminoaci"ilor dintr-o protein, fiecare lan va avea la unul din capete un aminoacid cu gruparea ( N5 & liber .captul N ( terminal1, iar la cellalt capt un aminoacid cu gruparea ( 4885 liber .captul 4 ( terminal. Prin convenie, secvena aminoaci"ilor ntru-un lan polipeptidic se consider ntotdeauna de la captul N- terminal spre captul 4-terminal. Structura secundar corespunde unor structuri spaiale regulate! 9 ( 'eli, : ( pliat. /ceste structuri sunt reali"ate prin legturi disulfurice, ionice, de 'idrogen, 'idrofobe. /ceste tipuri de structuri se datorea" proprietilor spaiale a legturii peptidice. Structurile helix sunt stabili"ate prin legturile de 'idrogen intracatenare. Pe fiecare spir a 9-'eliului se afl ;, < resturi de aminoaci"i. Legtura de 'idrogen se reali"ea" ntre gruparea 4=8 i -N5- din dou spire vecine .aflate la o distan de > aminoaci"i consecutivi1. Legturile de 'idrogen sunt paralele cu aul 'eliului. 3n proteinele naturale sensul de rotire al 'eliului este spre dreapta .sensul acelor unui ceasornic1. Structurile pliate sunt stabili"ate prin legturi de 'idrogen intracatenare. Poate fi cu lanuri paralele sau antiparalele .mai stabile1. Legturile de 'idrogen sunt perpendiculare pe sc'eletul polipeptidic. 2 Conformaiile de tip helix i pliat permit realizarea unui numr maxim de legturi de hidrogen ntre componentele legturilor peptidice din interiorul polipeptidelor. Triplul helix al colagenului este reali"at prin intermediul legturilor de 'idrogen intra i intercatenare. /cest tip de structur se datorea" pre"enei prolinei i 'idroi-prolinei. /ceti aminoaci"i nu pot participa la legturi de 'idrogen. Structura colagenului pre"int serii de trei aminoaci"i n care glicina ocup aceeai po"iie. #licina este po"iionat n interiorul 'eliului. 2iecare spir conine un astfel de triplet. Gly-Ala-Pro Gly-Pro-Ala Gly-Pro-Pro(OH) 7n figura de mai sus glicina este repre"entat cu rou. Structura teriar se refer la aran?area spaial a acestor structuri secundare .po"iionarea n spaiu a fiecrui atom1. Este re"ultatul unor legturi diverse .'idrogen, 'idrofobe, electrostatice, covalente1 ntre aminoaci"ii aceleiai catene dar care nu sunt vecini n structura primar. 0atorit acestor interaciuni, lanul polipeptidic nu poate adopta o structur ordonat n spaiu, pe toat lungimea sa, ci structurile ordonate sunt separate de coturi sau bucle. Structura tridimensional a 3 unei proteine native n mediul su fi"iologic este aceea pentru care energia liber a sistemului este minim. 3nteraciunile dintre catenele laterale ale aminoaci"ilor influenea" modul de pliere a lanului polipeptidic n forma tridimensional specific proteinei funcionale. 7n funcie de structura teriar, proteinele se clasific n! fibrilare i globulare. Legturile din cadrul structurii teriare sunt mai mult sau mai puin stabile, sunt influenate de mediu. 0e eemplu aci"ii i ba"ele tari intervin n legturile electrostatice ceea ce determin denaturarea proteinelor. Legturile disulfurice se reali"ea" preponderent ntre resturi de cistein. /genii oidani i reductori puternici pot oida cisteina sau pot reduce legturile disulfurice denatur@nd proteina. 4ele mai multe proteine denaturate sunt insolubile, deci precipit n soluie. Structura primar a unui lan polipeptidic determin structura teriar a acestuia. Pornind de la aceast premis este dificil de eplicat faptul ca proteinele denaturate nu revin automat la conformaia nativ, n condiii de mediu adecvate. /cest lucru se deduce din faptul c plierea catenelor se face etapi"at. Plierea nu are loc la finalul sinte"ei ntregului lan polipeptidic ci pe msura sinte"ei proteinei. /cest fenomen limitea" configuraiile alternative de pliere a lanurilor polipetidice mari. 7n plus, eist o clas special de proteine .4'aperone ( proteine nsoitoare1 care interacionea" cu lanul polipeptidic n diverse etape ale procesului de pliere. Structura cuaternar se nt@lnete la proteinele formate din mai multe subuniti. Este re"ultatul unor legturi diverse .'idrogen, 'idrofobe, electrostatice, covalente1 ntre aminoaci"ii din catene diferite dar care sunt unite ntr-o singur molecul. 2iecare caten este denumit protomer. Structura cuaternar poate fi definit ca numrul, tipul i modul de legare a subunitilor .protemerilor1 dintr-o entitate proteic cu activitate biologic bine definit.
6uperea legturilor dintre catene duce la denaturarea proteinei. Eemplu !
'emoglobina este un tetramer Propriet!"i ). soluilitatea depinde de mai muli factori ! - electroliii. Proteinele sunt solubile n soluii diluate de sruri neutre. Soluiile concentrate produc denaturarea lor .precipitare1. Se pot separa diferite clase de proteine n funcie de concentraia la care precipit. - p5-ul. Solubilitatea unei proteine este minim n vecintatea p5i. - solvenii organici. Etanolul, metanolul i acetona determin precipitarea proteinei. &. determinarea masei moleculare .se situea" ntre )+ +++ i p@n la peste ) +++ +++1 Aetode ! aminoaci"i Structura pri#ar! a unei proteine $ Secvena aminoaci"ilor n caten Structura %ecun&ar! a unei proteine $ Legturi de 'idrogen ntre aminoaci"i Structura ter"iar! a unei proteine $ Legturi ntre structurile secundare plisat 'eli Structura cuaternar! a unei proteine $ /socierea mai multor catene polipeptidice plisat 'eli STR'(T'RA PROTEINELOR ) - filtrarea pe gel de detran. Se reali"ea" o separare n funcie de mrimea moleculei. 4ele mai mari vor trece primele prin gel. /poi se compara cu etaloane. - ultracentrigugarea produce sedimentarea n funcie de densitate. Se compar cu etaloane. - electrofore"a ( migrarea moleculelor ncrcate electric sub aciunea unei diferene de potenial. /poi compararea cu etaloane. (la%i*icare 1+ ,up! co#po-i"ia c.i#ic! - 'oloproteine ( formate numai din aminoaci"i - 'eteroproteine ( formate dintr-o parte proteic i o parte neproteic .parte prostetic1 legate prin legtur covalent. Partea neproteic este etrem de variat. 7n funcie de natura ei nt@lnim ! Parte neproteic! Proteina #lucide #licoproteine Lipide Lipoproteine 2osfat 2osfoproteine 3on metalic 4romoproteine .5b, citocromi1 2+ ,up! *or#a #oleculei Proteine fibroase sau scleroproteine. Sunt practic insolubile. E. colagenul, BeratinaC Proteine globulare sau sferoproteine. /u form sferic sau ovoid. 3+ (la%i*icarea /n *unc"ie &e %olu0ilitate /lbumine ( solubile n ap distilat. Precipit prin adugare de sulfat de amoniu ntre D+ i )++E saturaie. /u caracter acid, p5i F D. #lobuline ( insolubile n ap, solubile n soluii saline diluate .e. Na4l *E1. Precipit prin adugare de sulfat de amoniu p@n la saturaia de *+E. 1 Protamine i 'istone ( solubile, talie mic, foarte ba"ice, p5i mare. #lobine ( solubile n ap Prolamine i gluteline ( proteine vegetale insolubile n ap dar solubile n soluii diluate de aci"i i ba"e. 2 3IOGLO4INA Este o 'emoprotein .conine 'emul1 care are rolul de a fia reversibil oigenul n muc'i .l preia de la 'emoglobin i l cedea" mitocondriilor musculare1. Este alctuit dintr-un lan polipeptidic format din )*; aminoaci"i. /re o structur globular compact n care G+E din lanul polipeptidic repre"int o structur de 9-'eli iar &+E este o structur ne'elicoidal. Se gsesc G segmente 'elicoidale .notate cu literele /, H, 4, 0, E, 2, #, 51 intercalate cu D segmente scurte ne'elicoidale formate din )-G aminoaci"i. 7n segmentele ne'elicoidale predomin prolina. 3nteriorul moleculei este alctuit aproape n eclusivitate din aminoaci"i cu caten lateral nepolar. La suprafaa moleculei predomin aminoaci"ii polari unde formea" legturi de 'idrogen at@t ntre ei c@t i cu moleculele de ap. 5emul se gsete ntr-o cavitate .crevas1 determinat de structura teriar a globinei. 7n aceast cavitate se regsesc aminoaci"i 'idrofobi, ca urmare legturile dintre 'em i globin sunt legturi 'idrofobe i c@teva legturi electrostatice dar i dou resturi de 'istidin. 2ierul .2e &I 1 este 'eacoordinat .reali"ea" < legturi1. 5 Legtura dintre 2e &I i globin se reali"ea" prin intermediul a dou resturi de 'istidin din po"iia ED . 5is distal1 i po"iia 2G .5is proimal1. /ceste legturi sunt perpendiculare pe planul 'emului. 8igenul se interpune ntre 5is distal i ionul de 2e &I . 6