G.

Pracros, Inra

Centre de Bordeaux-Aquitaine

Fvrier 2016

 Au cur dune grande rgion agricole et forestire, le centre Inra

Bordeaux-Aquitaine conduit des recherches innovantes et finalises
en sciences du vgtal, cologie et environnement, en rponse
aux enjeux des filires agricoles, sylvicoles et aquacoles.

Hubert de Rochambeau
Prsident du centre Bordeaux-Aquitaine
Dlgu rgional de lInra

LE CENTRE DE RECHERCHE BORDEAUX-AQUITAINE

Acteur essentiel de lcosystme rgional de recherche, notre centre rassemble sur trois principaux sites, et six
autres implantations, plus de 1000 chercheurs, ingnieurs et techniciens et plus de 100 doctorants et postdoctorants. La prsence dans nos laboratoires de 200 enseignants-chercheurs, ingnieurs et techniciens de
nos partenaires (universit de Bordeaux, Bordeaux Sciences Agro, Universit de Pau et des Pays de lAdour,
Institut Polytechnique de Bordeaux et CNRS) tmoigne de lattention toute particulire que nous portons
la construction dun espace de projet partag. Notre stratgie scientifique sappuie ainsi sur une implication
significative dans des projets Investissements davenir, des Groupements dintrt scientifique et des Structures
fdratives de recherches.
Au regard des attentes socitales, nous favorisons les interactions avec le monde socio-conomique tout en
contribuant un dialogue science-socit ouvert au travers de nos actions de culture scientifique et technique.

Partenariat emblmatique entre lInra et luniversit de Bordeaux,

le Labex COTE vise comprendre et prvoir les rponses des cosystmes
aux changements induits par lhomme et fournir des outils
et mthodes de rgulation de leur volution.

DYNAMIQUE DE CENTRE
Par la mobilisation dun large panel de comptences
scientifiques en agronomie, gntique, physiologie
et pathologie des vgtaux, cologie, chimie et physique de
lenvironnement, nos recherches rpondent quatre grands
enjeux qui trouvent des applications multiples en rgion :
1. Renforcer la comptitivit et la durabilit des filires
agricoles de production fruitire, forestire et animale
2. Favoriser une gestion cologique des agro-systmes
et des forts cultives
3. Contribuer une alimentation saine et durable
4. Valoriser la biomasse vgtale.
Nos recherches sinscrivent dans des synergies troites avec
les partenaires de lIDEX universit de Bordeaux et avec
lUniversit de Pau et des Pays de lAdour.
Nos partenaires en rgion

DES PRIORITS RGIONALES

AU RAYONNEMENT INTERNATIONAL
Nos comptences et moyens scientifiques sont positionns
sur trois axes de la Stratgie de spcialisation intelligente
(S3) dfinie en 2014 par la Rgion Aquitaine : agriculture
de prcision et co-efficience agroalimentaire,
gosciences et mtrologie pour une gestion durable des
ressources naturelles, et mobilisation de la biomasse et
dveloppement de bioraffineries pour lindustrie.
Par leurs enjeux, qui transcendent lchelle rgionale,
nos recherches renforcent la visibilit et les partenariats
nous par notre centre linternational.

Nos axes de recherche

Units exprimentales
Unit exprimentale Viticole de Bordeaux
Unit exprimentale Fort de Cestas Pierroton

COLOGIE FONCTIONNELLE ET VOLUTIVE, ET AGROCOLOGIE DES COSYSTMES

CONTINENTAUX (FORT, CULTURES PRENNES, RESSOURCES BIOLOGIQUES AQUATIQUES)

BIOLOGIE INTGRATIVE DES PLANTES ET DE LEURS PATHOSYSTMES

(VIGNE, ESPCES FRUITIRES)

Rseaux et plateformes associs

Institut des sciences de la vigne et du vin (ISVV)
Labex COTE
Equipex Xyloforest
Analyses et Exprimentations sur les Ecosystmes (AnaEEFrance)
European Forest Institute (EFI)
European Phenology Camera Network (EUROPhen)
Evolution of trees as drivers of terrestrial biodiversity (Evoltree)
Integrated Carbon Observation System (ICOS)
Plateformes du Centre de gnomique fonctionnelle
de Bordeaux (CGFB)
Structure fdrative de recherche Milieux et ressources
aquatiques (SFR MIRA)
Structure fdrative de recherche Biologie intgrative
et cologie (SFR BIE)
Rseau mixte technologique Adaptation des forts
au changement climatique (RMT AFORCE)
Rseau mixte technologique (RMT) Fertilisation
et environnement
Rseau mixte technologique Qualit sanitaire des productions
vgtales de grande culture (RMT QUASAPROVE)

Partenaires acadmiques
Bordeaux Sciences Agro
CNRS
IFREMER
INRIA
Institut polytechnique de Bordeaux (IPB)
IRSTEA
Observatoire aquitain des sciences de lunivers (OASU)
Universit de Bordeaux
Universit de Pau et des Pays de lAdour (UPPA)
Communaut dUniversits et Etablissements dAquitaine
(ComUE dAquitaine)

1
Echantillons de bois de chne en attente danalyses
(Plateau technique Genobois) A. Girard, Inra

1
Les changements globaux modifient les cosystmes
terrestres et aquatiques. Lambition dune gestion durable
ncessite didentifier les leviers de fonctionnement de ces
cosystmes et les services quils rendent, et de comprendre
et prdire leurs volutions long terme.
En faisant appel la modlisation, nos quipes cherchent
identifier les facteurs climatiques, biotiques ou anthropiques
des changements environnementaux et leurs impacts sur les
proprits des cosystmes (structures, processus, services et
rgles organisationnelles), ainsi qu examiner les rponses
et les mcanismes dajustement des cosystmes (rsistance,
adaptation, migration). Les recherches se focalisent sur des filires
de premier plan lchelle rgionale (arbres fruitiers, vigne,
poissons, fort et grandes cultures) tout en analysant limpact de
ces mutations lchelle internationale.

Units de recherche et de service

Unit mixte de recherche Biodiversit, gnes et communauts
(BIOGECO)
Unit mixte de recherche cologie comportementale et
biologie des populations de poissons (ECOBIOP)
Unit mixte de recherche Ecophysiologie et gnomique
fonctionnelle de la vigne (EGFV)
Unit mixte de recherche Sant et agrocologie du vignoble
(SAVE)
Unit mixte de recherche Interactions sol plante atmosphre
(ISPA)
Unit de recherche Mycologie et scurit des aliments (MycSA)
Unit de service Analyses vgtales et environnementales
(USRAVE)

2
Les filires agricoles et agroalimentaires sont confrontes
des enjeux de qualit et defficacit conomique et
environnementale. Le croisement des approches en sciences
du vgtal permet de comprendre les dterminants de la
qualit des productions et de les amliorer.
Nos recherches ont pour objectif de mieux comprendre les facteurs
contribuant au dveloppement des fruits et des graines et leurs
qualits gustative, nutritionnelle et sanitaire (mycotoxines, mtaux
lourds). Laccent est galement mis sur lidentification des caractres
dintrt conomique ou cologique des vgtaux diffrentes
chelles (du gne au phnotype), tout en considrant les interactions
entre plantes, bioagresseurs et insectes. Nos recherches se dclinent
sur des espces modles et des espces dimportance pour lconomie rgionale : arbres forestiers, vignes, fruits, lgumes et mas.

Units de recherche et de service

Unit mixte de recherche Biologie du fruit et pathologie (BFP)
Unit mixte de recherche Biodiversit, gnes et communauts
(BIOGECO)
Unit mixte de recherche Ecophysiologie et gnomique
fonctionnelle de la vigne (EGFV)
Unit de recherche Mycologie et scurit des aliments (MycSA)
Unit de service Analyses vgtales et environnementales
(USRAVE)
Unit sous contrat nologie (USC nologie)

Units exprimentales
Unit exprimentale Fort de Cestas Pierroton
Unit exprimentale Viticole de Bordeaux
Unit exprimentale Arboricole

Rseaux et plateformes associs

Institut des sciences de la vigne et du vin (ISVV)
Infrastructures nationales MetaboHUB et PHENOME
Plateformes du Centre de gnomique fonctionnelle
de Bordeaux (CGFB)
Structure fdrative de recherche Biologie intgrative
et cologie (SFR BIE)
Rseau mixte technologique Qualit sanitaire des productions
vgtales de grande culture (RMT QUASAPROVE)
Rseau mixte technologique Diagnostic en sant vgtale
(RMT VEGDIAG)
Centre de ressources gntiques (CRG) Prunus

Partenaires acadmiques
Bordeaux Sciences Agro
CNRS
Universit de Bordeaux
Communaut dUniversits et Etablissements dAquitaine
(ComUE dAquitaine)

Un dispositif dunits
remarquables

Plus dinformations sur

nos actualits et nos recherches
www.bordeaux-aquitaine.inra.fr/

Marquage de cellules microgliales et de neurones

J.-C. Delpech, NutriNeurO

Des units remarquables enrichissent le dispositif

de recherches du centre et contribuent relever
des dfis scientifiques en matire de nutrition
humaine et neurobiologie, de nutrition des
poissons, de sant humaine et de bois.
En nutrition aquacole nous cherchons comprendre les
rgulations, par les nutriments, des voies mtaboliques des
poissons par une approche intgrative des gnes lanimal.
En nutrition et sant humaine, nous tudions limpact de la
nutrition sur les fonctions crbrales et le rle pathogne
et lpidmiologie de deux bactries (Mycoplasma et
Chlamydia) pour amliorer les diagnostics et traitements
des infections. Enfin, nous analysons les liens entre
proprits du bois, dterminants environnementaux
et pratiques sylvicoles pour valoriser la ressource boismatriau.

Units de recherche
Unit mixte de recherche Nutrition et neurobiologie
intgre (NutriNeurO)
Unit mixte de recherche Nutrition, mtabolisme,
aquaculture (NuMeA)
Unit sous contrat Infections humaines
mycoplasmes et chlamydiae (USC IHMC)
Unit sous contrat Institut de mcanique
et dingnierie de Bordeaux (USC I2M)

Units exprimentales
Unit exprimentale Palmipdes foie gras
de Benquet
Unit exprimentale Mas de Saint-Martin-de-Hinx

Rseaux et plateformes associs

Equipex Xyloforest
Labex BRAIN
Unit mixte technologique Alimentation,
nutriments lipidiques et cerveau (UMT ALICE)

Partenaires acadmiques

Infection tardive de mildiou sur lhybride amricain Concord (Michigan, USA)

F. Delmotte, Inra

CNRS
cole nationale suprieure darts et mtiers - Arts
et mtiers ParisTech
Institut polytechnique de Bordeaux (IPB)
Universit de Bordeaux
Universit de Pau et des Pays de lAdour (UPPA)

PARTENARIAT, VALORISATION ET INNOVATION

Des partenariats structurs avec les acteurs socio-conomiques
Notre centre participe deux ples de comptitivit, Xylofutur qui coordonne les acteurs de la filire
fort-bois pour rpondre aux attentes des industriels de la valorisation, et Agri Sud-Ouest Innovation sur
lingnierie des agrochanes au service des filires agroalimentaires et des agriculteurs.
Partenaire privilgi de la filire vitivinicole (CIVB, IFV), nous sommes membres du cluster InnoVin qui vise
accompagner le dveloppement conomique des entreprises de la filire.
Nous avons nou un partenariat actif avec les chambres dagriculture et les instituts techniques au service
de linnovation et sa diffusion dans les filires. Nous sommes ainsi investis dans quatre groupements
dintrt scientifique, le GIS Pin maritime du futur, le GIS Piscicultures de demain, le GIS Palmiple et le GIS
GRISAM sur les poissons migrateurs amphihalins. Ces dynamiques partenariales se traduisent galement
par notre implication dans deux groupements dintrt conomique (Fruits et lgumes, Fleurs et plantes),
quatre rseaux mixtes technologiques (AFORCE, Fertilisation et environnement, QUASAPROVE et VEGDIAG)
et une unit mixte technologique Alimentation, nutriments lipidiques et cerveau (UMT ALICE).

Lexcellence scientifique au cur de notre dynamique partenariale

Spectromtre proche infrarouge du Plateau technique Xylomic :

chantillons dessences de bois en attente danalyses en vue
de dterminer leurs composs. A. Girard, Inra

Impliqu dans 10 projets labelliss Investissements

dAvenir, nous contribuons renforcer les capacits
de formation de haut niveau, de recherche et
dinnovation en rgion.
Ainsi, nous pilotons lEquipement dexcellence
(Equipex) Xyloforest visant dvelopper des solutions
innovantes et durables cratrices de comptitivit pour
les filires fort-bois ainsi que linfrastructure nationale
MetaboHUB en mtabolomique et fluxomique. Nous
copilotons le Laboratoire dexcellence (Labex) COTE
sur lvolution des cosystmes continentaux et
ctiers et participons activement aux Labex BRAIN
(neurosciences) et AMADEus (matriaux avancs).

De nouvelles stratgies
dalimentation des poissons
dlevage

Nourrir les poissons dlevage avec des formulations alimentaires

dorigine vgtale. A. Girard, Inra

Lunit NuMA contribue lmergence

de systmes aquacoles durables en tudiant
les freins qui limitent lefficacit des aliments
dpourvus de matires premires dorigine
halieutique. A titre dexemple, nous avons
dvelopp une nouvelle stratgie dite de
programmation nutritionnelle, afin dadapter
le poisson une nouvelle alimentation par le
biais dune intervention nutritionnelle prcoce.
Ainsi, nous avons dmontr que lexposition
prcoce des alevins de truite un rgime
alimentaire base de plantes amliore
sensiblement lacceptation et lutilisation
du mme rgime alimentaire lorsquil est
administr des stades ultrieurs de la vie.

Dispositifs et infrastructures scientifiques collectifs

Nous hbergeons trois plateformes technologiques labellises IBiSA du centre de Gnomique fonctionnelle de Bordeaux (CGFB) qui assurent des prestations
technologiques de haute qualit et contribuent des innovations mthodologiques :
Mtabolome pour lanalyse biochimique des produits drivs de plantes,
Gnome-Transcriptome pour les technologies haut dbit de squenage dacides nucliques, recherche de mutations et gnotypage,
Le Ple vgtal du Bordeaux Imaging Center pour limagerie cellulaire dans les domaines de la sant et du vgtal.
De plus, des dispositifs dobservation environnementale (SOERE, ORE), nous permettent dassurer le monitoring des poissons migrateurs (DiaFC), des flux entre
vgtation et atmosphre (ICOS) et des pratiques sylvicoles (ECOSYLVE).

Zoom sur

MetaboHUB : une infrastructure nationale pour la mtabolomique et la fluxomique

MetaboHUB fournit des outils mthodologiques et analytiques de pointe, et des services aux chercheurs
et industriels dans les champs o la comprhension et lanalyse du mtabolome constituent un enjeu.
MetaboHUB, qui associe quatre plateformes labellises IBiSA, pilote et accompagne des recherches
fondamentales et appliques dans les domaines de la sant humaine et de la nutrition, de la production
alimentaire et de lagriculture durable, de la chimie verte, de lenvironnement et des biotechnologies blanches. Confront au dfi de traiter
et danalyser de grands jeux de donnes, une des ralisations de MetaboHUB a permis de dvelopper un workflow qui propose un ensemble
centralis doutils pour lanalyse, la manipulation et la visualisation des donnes issues de lanalyse mtabolomique.
MetaboHUB est porte par lInra et le CEA en association avec le CNRS, lInsat, lInserm, luniversit de Bordeaux, luniversit Blaise Pascal
(Clermont-Ferrand), luniversit Paul Sabatier (Toulouse) et luniversit Pierre et Marie Curie (Paris).

INRA : LINSTITUT EN QUELQUES MOTS

Premier institut de recherche agronomique en Europe avec 8 165 chercheurs, ingnieurs et techniciens, au 2e rang mondial pour ses
publications en sciences agronomiques, lInra contribue la production de connaissances et linnovation dans lalimentation, lagriculture
et lenvironnement.
LInstitut dploie sa stratgie de recherche en mobilisant ses 13 dpartements scientifiques et en sappuyant sur un rseau unique en
Europe, fort de 205 units de recherche et de 45 units exprimentales implantes dans 17 centres en rgion.
Lambition est, dans une perspective mondiale, de contribuer assurer une alimentation saine et de qualit, une agriculture comptitive
et durable ainsi quun environnement prserv et valoris.

CHIFFRES CLS
CENTRE DE BORDEAUX-AQUITAINE

CARTE DES IMPLANTATIONS

CENTRE DE BORDEAUX-AQUITAINE

Les quipes

19 units dont 8 units mixtes et 5 units exprimentales

523 agents titulaires dont 238 femmes et 285 hommes
117 agents contractuels dont 64 femmes et 53 hommes
200 titulaires de nos partenaires prsents dans les units

Centre de Bordeaux-Aquitaine

de notre centre
Les moyens
BORDEAUX

4
5
1

DORDOGNE
24

GIRONDE
33

LOT ETGARONNE
47
7

50,6 millions deuros de budget dont 10,8 millions

en ressources propres
21 infrastructures : 4 plateformes, 3 plateaux techniques,
5 installations exprimentales, 5 dispositifs communs
dobservation (SOERE ou ORE), 3 conservatoires de ressources
gntiques (CRG), 1 collection Tilling tomate/pcher/fraise.
Les rsultats

LANDES
40
8

Liste des sites

1
2

PYRENEESATLANTIQUE
64

3
4
5
6
7
8
9

Centre Inra Bordeaux-Aquitaine

71, avenue Edouard Bourlaux
CS 20032
33882 Villenave-dOrnon Cedex

Villenave-dOrnon
Cestas-Pierroton
Saint-Pe-sur-Nivelle
Bordeaux
Talence
Toulenne
Bourran
Benquet
Saint-Martin-de-Hinx

250 conventions de partenariat en cours,

dont 17 avec lEurope
4 brevets et 11 licences
280 publications par an dans des revues comit de lecture

Tl. : +33 (0)5 57 12 23 00

www.bordeaux-aquitaine.inra.fr
communication@bordeaux.inra.fr
@Inra_BdxAqui