Estud Biol.

2008 jan/dez;30(70/71/72):143-8
[T]
A ERA DA BIOINFORMTICA: SEU POTENCIAL E SUAS
IMPLICAES PARA AS CINCIAS DA SADE
TTUL [I] O
The effects and applications of bioinformatics on the biomedical area
[A]
Nilberto Dias de Arajo
[a]
, Rodrigo Pessoa de Farias
[a]
, Patrcia Barbosa Pereira
[a]
, Flvia Mota de
Figueirdo
[a]
, Alanna Michely Batista de Morais
[a]
, Livina Costa Saldanha
[a]
, Jane Eyre Gabriel
[b]
[a]
Acadmico do curso de Bacharelado em Biomedicina ofertado pelas Faculdades Integradas de Patos (FIP), Patos, Paraba, PB - Brasil.
[b]
Professora adjunto I do Centro de Cincias e Tecnologia Agroalimentar (CCTA), Universidade Federal de Campina Grande
UFCG, Pombal, Paraba, PB - Brasil, e-mail: eyre.gabriel@gmail.com
[R]
Resumo
A bioinformtica ou biocomputao associa conhecimentos em distintas reas do conhecimento a fm de
decifrar o cdigo gentico contido nas biomolculas pelo estabelecimento de modelos lgico-matemticos
e estatsticos. Tais estratgias tm assegurado a interpretao e elucidao de eventos biolgicos gerados
a partir do sequenciamento de genes e protenas. Bancos de dados de informaes biolgicas cada vez
mais crescentes, o desenvolvimento de novas abordagens para anlise e apresentao desses dados e a
investigao de novas e complexas perguntas so as foras motrizes da bioinformtica. A partir do advento
dos projetos genomas, biologistas moleculares passam a empregar ferramentas computacionais capazes de
analisar grandes quantidades de dados biolgicos, a predizer funes dos genes e a demonstrar relaes
entre genes e protenas. A internet e sua capacidade de compartilhar dados, alm do desenvolvimento de
processadores mais rpidos e com maior memria, desempenharam um papel decisivo para a consolidao
da bioinformtica como potencial campo do conhecimento cientfco. Entre suas aplicaes extensamente
descritas na literatura, pode-se destacar a busca pela identifcao de protenas diferencialmente expressas sob
condies patolgicas como potenciais alvos para a produo de frmacos antitumorais. Assim, a presente
reviso de literatura objetiva relatar os eventos que marcaram o surgimento da bioinformtica, descrevendo
o panorama atual no qual est inserida essa nova rea do conhecimento e ressaltando suas potencialidades e
implicaes s pesquisas na rea mdica, com nfase na terapia gnica e na produo de novos frmacos.[#]
[P]
Palavras-chave: Biologia computacional. Sequenciamento de DNA. Banco de dados biolgicos.[#]
[B]
Abstract
Genomics was developed to simultaneously identify the elements of heredity and to assign biological
function to these elements. The completion of the human genome project, and other genome
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de Arajo ND, de Farias RP, Pereira PB, de Figueirdo FM, de Morais AMB, Saldanha LC, Gabriel JE.
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sequencing projects, has spearheaded the emergence of the feld of bioinformatics. Despite the inherent
complexity of the genome, the invention of just a few molecular tools enabled genomics to fourish
into the contemporaneous science. The power of the knowledge emerging from the genome is that
the identifcation of the genetic basis of an inherited disease provides logical strategies to treat those
afficted on an individual basis. Using computer programs to analyze DNA and protein information
has become an important area of life science research and development and it is reasonable to assume
that in the near future, most common genetic diseases will be identifed. Advances in high throughput
analytic chemistry and computing technologies make the creation of a vast database of genotype with
a genomic database will allow the prescription of drugs to be tailored to an individuals genotype. This
same bioinformatic approach, applied to the study of human metabolites, has the potential to identify
and validate targets to improve personalized nutritional health. Bioinformatics has long been focusing
on the technical challenges and the enormous amount of data from image analysis and comparisons
of genes (several hundreds of thousands). Genomic and proteomic technologies will therefore be
complementary in their scientifc and clinical application. The brief review of literature describes
relevant topics concerning the effects and application of the bioinformatics on the biomedical area.[#]
[K]
Keywords: Bioinformatics. DNA sequencing. Gene and protein databases.[#]
HISTRICO DA BIOINFORMTICA
Na era ps-moderna, com o advento e a
consolidao da revoluo robtica no sculo XX,
foi possvel aprimorar a criao de tecnologias com-
putacionais nas mais variadas reas do conhecimento,
o que tem provocado profundas mudanas sociais
em mbito individual e coletivo. Nesse cenrio, a
bioinformtica ou biocomputao surge na dcada
de 1980, a fm de superar as fronteiras das cincias
pelo desenvolvimento de novas abordagens capazes
de promover a anlise e a apresentao de dados
biolgicos, bem como de garantir a investigao
de novos mtodos para a resoluo de complexas
perguntas (1). Inicialmente, a bioinformtica foi tida
como um paradoxo entre o mundo real e o imaginrio,
j que inicialmente parecia remoto que biologistas
pudessem empregar ferramentas computacionais
para desenvolver estratgias a serem empregadas em
trabalhos cientfcos. Contudo, nas ltimas dcadas
a adaptao e os avanos de recursos tecnolgicos,
especialmente na rea de Cincias da Sade, tm sido
uma prioridade para suprir determinadas carncias,
como promover a criao de programas analticos
capazes de armazenar complexas sequncias de genes.
Assim, em pouco tempo, a informtica tornou-se
uma pea essencial aos estudos da rea biolgica,
abrindo novas fronteiras para as anlises de genmica
e protemica.
Em linhas gerais, a bioinformtica pode
ser defnida como sendo o estudo da aplicao de
tcnicas computacionais e matemticas para a gerao
e gerenciamento de bioinformao (1, 2). Buscando
tratar dados biolgicos brutos, a bioinformtica
consolida-se como uma nova rea do conhecimento,
graas crescente necessidade de desenvolver pro-
gramas computacionais que permitam reconhecer
sequncias de genes; predizer a confgurao tri-
dimensional de protenas; identifcar inibidores de
enzimas; organizar e relacionar informao biolgica;
agrupar protenas homlogas; estabelecer rvores
flogenticas; analisar experimentos de expresso
gnica, entre outros (1, 3, 4).
Seu surgimento teve incio a partir dos
avanos na rea de biologia molecular, especialmente
com o advento dos projetos genomas, que geraram
volumes intensos de informaes obtidas a partir
do sequenciamento de fragmentos de cido
desoxirribonucleico (DNA). Diante desse cenrio, a
bioinformtica permite o compartilhamento de dados
biolgicos com a ajuda da internet pela produo
de processadores mais rpidos e efcientes, fatores
decisivos para consolidar a bioinformtica como
importante rea do conhecimento cientfco.
Assim, essa nova disciplina cientfca com
razes nas cincias da computao, na estatstica
e na biologia molecular vem sendo desenvolvida
especialmente para ordenar os resultados gerados das
iniciativas de sequenciamento de genes, que produzem
quantidade cada vez maior de dados sobre sequncias
de DNA e seus produtos proteicos. Desse modo, os
biologistas moleculares tm criado reais oportunidades
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para utilizar mtodos estatsticos capazes de analisar
grandes quantidades de dados biolgicos, de inferir
funes dos genes e de estabelecer relaes estruturais
entre genes e protenas.
indiscutvel que a unio entre a
informatizao e a moderna biologia molecular
contribuiu contundentemente para o surgimento
dessa nova rea do conhecimento. Entretanto, o
advento da bioinformtica teve que esperar muito
tempo para realmente se tornar realidade e deixar de
ser uma aparente novidade. Apesar da estrutura do
DNA ter sido desvendada em 1953 pelos ingleses
Watson e Crick (3), foi preciso esperar at meados
da dcada de 1980 para que fosse desenvolvida
uma lente de aumento sufcientemente boa (uma
mquina automatizada) que permitisse a leitura em
grandes quantidades do cdigo gentico contido nas
biomolculas (5). Do lado da computao foi tambm
preciso um amadurecimento com a revoluo da
informtica pela obteno de computadores capazes
de armazenar cada vez mais informao e de process-
la de modo cada vez mais rpido a custos reduzidos.
A BIOINFORMTICA E SUAS
POTENCIALIDADES
Nas l ti mas dcadas, a soci edade
contempornea tem se deparado com os impactos
provocados pelos avanos e descobertas oriundos
de projetos de pesquisa conduzidos a fm de
decifrar a natureza do material gentico em uma
grande variedade de organismos procariticos e
eucariticos, objetivando o conhecimento total ou
parcial de suas sequncias de DNA. Sabe-se que um
genoma armazena inmeros fragmentos de DNA
dispostos em posies especfcas, denominados
genes, cujas informaes coordenam e controlam
todos os aspectos da sntese de protenas que, em
ltima instncia, atuam como mquinas moleculares
moduladoras da homeostase celular (2).
Sob esse aspecto, os dados gerados pela
bioinformtica podem ser considerados como a
forma mais intramolecular de colher informaes
sobre os seres vivos pela anlise detalhada de seu
cdigo gentico. fascinante pensar que uma clula
de qualquer organismo vivo possa ser codifcada,
decodifcada e recodifcada em caracteres, e que tais
informaes possam ser interpretadas e alteradas
pelos cientistas. Efetivamente, a transformao
da natureza humana passa por implicaes de
alcance incalculvel graas aplicao direta dessas
ferramentas, considerando que esses procedimentos
possibilitam mudanas na linha evolutiva das espcies.
Atualmente, a contribuio da informtica ao
desenvolvimento da era genmica pode ser avaliada
pela rapidez e otimizao na decodifcao de genes
e de suas regies regulatrias por exemplo, uma
nova sequncia de DNA com cerca de 12 mil bases
pode ser decifrada em um minuto, enquanto h alguns
anos a mesma tarefa levaria mais ou menos um ano
(6). De uma maneira geral, uma aplicao direta da
bioinformtica nos estudos de genmica refere-se
identifcao de possveis diferenas nas sequncias
gnicas que possam favorecer o desenvolvimento de
ferramentas para melhor diagnstico de doenas e
anomalias. As diferenas localizadas nas sequncias
nucleotdicas so submetidas a ferramentas
estatsticas, que podero defnir as possibilidades
de adoecimento ou no dos indivduos de uma
populao, em que cada ser vivo se transforma em
informaes, dotados de instrues sobre seu prprio
processo de funcionamento (3, 7).
Um organismo vivo contm em torno
de 50 mil diferentes tipos de protenas, que devem
assumir sua conformao especfca para ser capaz de
exercer corretamente sua funo biolgica. Assim, os
estudos de protemica envolvem a caracterizao de
conjuntos de protenas que intervm nos processos
biolgicos de uma espcie, sendo que nesse estudo
o principal objetivo da bioinformtica determinar
a composio, estrutura e funes das protenas, e,
assim, conhecer a funo dos genes anteriormente
descritos pelos Projetos Genomas (7). O desafo
determinar a funo e o papel biolgico de cada uma
das sequncias de protenas que foram identifcadas. Se
os genes Genoma so os portadores das instrues
que permitem a construo de um determinado
organismo, as protenas Proteoma so as
responsveis pela estrutura e pelo funcionamento
dos eventos envolvidos na homeostase celular.
No seri a exagero afi r mar que a
bioinformtica uma das peas-chave para o sucesso
da anlise de dados dos projetos anteriormente
mencionados. O fortalecimento de pesquisas acerca
desse tema estratgico e necessrio para impulsionar
signifcativamente relevantes descobertas cientfcas
nessa rea do conhecimento. Em funo deste quadro,
a anlise computacional de dados existentes torna-se
um exerccio de suma importncia para viabilizar a
extrao de informaes pertinentes e concretizar
as potencialidades de se possuir o genoma completo
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ou parcial de um organismo. H desse modo,
uma relao de motivao cientfca e tecnolgica
muito forte entre a descoberta do DNA, estudos
de transgenia, materialidade do conhecimento
propiciada pela biologia molecular e pela genmica,
e o desenvolvimento da bioinformtica.
Vista com certa indulgncia, inicialmente
essa nova rea do conhecimento encontrou poucos
adeptos para sua aplicao entre os cientistas.
Entretanto, a busca por especfcos stios de restrio
de fragmentos de DNA, a anlise da composio
de sequncias de genes contra um banco de dados,
mesmo que ainda reduzido, logo foram transformadas
em ferramentas indispensveis para os avanos na
rea de biologia computacional. provvel que
somente aps a dramtica multiplicao, em tamanho
e em nmero, dos bancos de dados de sequncias
resultantes dos projetos genomas, a bioinformtica
tenha sido amplamente reconhecida como uma
disciplina fundamental para a nova era da gentica,
da biotecnologia e da biologia de sistemas (Figura
1). Modelagem molecular, bioestatstica e outros
campos passaram por um grande desenvolvimento,
ao mesmo tempo em que havia um crescente
interesse dos cientistas das reas de computao pela
aplicao de metodologias, algoritmos, estruturao
e minerao de bancos de dados em um campo
ainda inexplorado da biologia, induzindo, assim, a
to necessria multidisciplinaridade.
Cerca de 1.000 projetos j foram fnalizados
no mundo ou esto em fase de concluso,
sendo responsveis pela disponibilizao de
uma vasta quantidade de dados biolgicos, tais
como: identifcao, sequenciamento e descrio
da estrutura tridimensional de protenas e das
similaridades dos genes dentro de um genoma e
entre diferentes espcies (8, 4). No Brasil, esse
fenmeno pode ser acompanhado de perto pela
efetiva execuo e andamento de diversos projetos
do Programa Genoma, acabando por consolidar
uma nova concepo do desenho institucional da
pesquisa no Pas. Alm disso, tais iniciativas tm
contribudo para o estabelecimento de uma cultura
de interao e de integrao entre as universidades
e as empresas, essencial quando se quer enfrentar
o desafo necessrio e impositivo da transformao
do conhecimento no desenvolvimento de patentes
e em riqueza.
FIGURA 1 - Associao de conhecimentos entre biologia molecular e informtica, que culminou com o advento
da bioinformtica
Atualmente, nfase especial est se deslo-
cando progressivamente do acmulo de dados para a
sua interpretao, visto que estudos de caracterizao
genmica tm gerado um grande volume de dados
que precisam ser caracterizados por anlises experi-
mentais dispendiosas e pelo emprego de ferramentas
computacionais sofsticadas.
A BIOINFORMTICA E SUAS
APLICAES MDICAS
Desde a descoberta da estrutura do DNA
e do desenvolvimento da biologia molecular, o
homem vem buscando novas alternativas que o
auxiliem na busca por maior fuidez nos trabalhos
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de pesquisa, acelerando a gerao de processos e
produtos. A bioinformtica tem contribudo para
avanos na pesquisa bsica, mas tambm na cincia
aplicada, promovendo a elucidao das bases
moleculares envolvidas em importantes eventos
celulares e garantindo sua aplicao direta nos
mais variados setores da sociedade contempornea.
A identifcao de alvos proteicos com potencial
para serem modifcados diretamente pela interao
com frmacos poder minimizar os sintomas ou
as causas de uma doena (9-12). A identifcao de
molculas que podero atuar como princpio ativo
na elaborao de produtos teraputicos, inibindo
ou acelerando certas reaes bioqumicas, poder
apresentar efeitos sobre a cura ou a atenuao da
doena. Na dcada de 1990, as grandes multinacionais
do setor farmacutico tm focalizado seus esforos na
seleo de potenciais molculas, visando produo
de novos medicamentos na rea mdica ou mesmo
na agropecuria (10).
Ainda, as contribuies da bioinformtica
na rea mdica so ilimitadas graas aos avanos
promovidos nas reas de manipulao e terapia
gnica com a identifcao detalhada de novos genes
e de seus mecanismos regulatrios. Por outro lado,
ferramentas computacionais podero permitir a
deteco molecular de parasitas, acarretando no
emprego direto no diagnstico e na epidemiologia
de inmeras patologias (13). Entre as aplicaes das
ferramentas de biologia molecular e bioinformtica
merece ser destacado o sucesso no desenvolvimento
de medidas teraputicas ou preventivas contra
tumores e agentes infecciosos (1, 8). Dessa forma,
novos procedimentos teraputicos tambm podero
assegurar que genes ausentes ou defeituosos sejam
restitudos, ou, ao menos, suprir o seu produto. Em
contrapartida, se um gene est sendo superativado,
sua expresso poderia ser desativada. Todas as essas
implicaes aqui elencadas demonstram o grande
potencial das ferramentas de biologia computacional
no diagnstico de doenas e na elaborao de novas
alternativas teraputicas em reas afns.
Alternativamente, tais estratgias podero
proporcionar melhor entendimento dos processos
evolutivos e das relaes flogenticas. Variaes nas
sequncias de DNA conferem marcas individuais,
tais como impresses digitais, teis na identifcao
e no estabelecimento de relaes de parentesco
e ancestralidade entre diferentes espcies. As
informaes obtidas na anlise comparativa detalhada
de indivduos pertencentes a uma mesma espcie so
de grande valia na antropologia, fornecendo dados
acerca das variaes histricas quanto ao tamanho
e padres de migrao (1, 14).
O alcance e os limites de novos aspectos
assumidos pela bioinformtica, especialmente ao
associar tcnicas e instrumentos da informtica e
da biologia molecular, acarretam em impactantes
efeitos sobre o campo das cincias biolgicas e suas
prticas de pesquisa. Espera-se que nas prximas
dcadas as aplicaes dos conhecimentos gerados
pela bioinformtica posam se tornar mais factveis,
desenvolvendo-se mais rapidamente da pesquisa
bsica para a prtica industrial e clnica padro.
CONSIDERAES FINAIS
A bioinformtica integra essencialmente
o desenvolvimento de programas computacionais
para tratar dados biolgicos preexistentes e identi-
fcar sequncias de genes, predizer a confgurao
tridimensional das protenas, identifcar inibidores
enzimticos, promover o agrupamento de protenas,
estabelecer rvores flogenticas e analisar experimen-
tos da expresso gnica. A bioinformtica caracteriza-
-se como ferramenta indispensvel na ordenao e
agrupamento dos resultados gerados pelas anlises
de sequenciamento de genes, que produzem uma
quantidade cada vez maior de dados sobre a com-
posio de DNA, RNA e protenas. Desse modo, os
biologistas moleculares passaram a utilizar mtodos
estatsticos capazes de analisar grandes quantidades
de dados biolgicos, a inferir funes de genes e a
demonstrar relaes entre genes e protenas.
Sob esse aspecto, a bioinformtica tem
sido objeto de intenso interesse nos tempos atuais,
caracterizando-se como uma das mais importantes
ferramentas para os profssionais da rea da Sade
graas s grandes descobertas e aos avanos
gerados especialmente em mbito biomdico. Seu
valor indispensvel no que tange manuteno
das cincias que caminham concomitantes
tecnologia, principalmente pesquisa biolgica.
Para compreender a grandeza dessa nova rea do
conhecimento, preciso correlacion-la com algumas
habilidades necessrias e indispensveis ao seu uso.
O aprofundado conhecimento de informtica, o
domnio da lngua inglesa, o xito das pesquisas
bsicas na rea de biologia molecular, a crescente
otimizao de tcnicas moleculares mais sensveis
que surgem a cada dia, dentre outros, exigem que
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os profssionais que iro lidar com essa tecnologia
sejam altamente multidisciplinares (4). Embora muitos
desafos estejam sendo superados no que tange a
maximizar a acessibilidade da populao brasileira para
essa nova rea do conhecimento, o fator mais agravante
nesse panorama refere-se escassez de mo de obra
qualifcada, bem como a centralizao de instituies
com condies adequadas para o desenvolvimento
de pesquisas nessa rea de bioinformtica, que ainda
esto restritas a determinadas regies do territrio
nacional. No Brasil, assim como acontece em outras
reas de pesquisa, os investimentos em bioinformtica
esto concentrados na regio Sudeste pela existncia
anterior de mo de obra qualifcada e de investimentos
constantes por parte do Estado de So Paulo nessa
rea do conhecimento. No entanto, iniciativas dos
governos federal e estaduais tm empenhado esforos
para combater essa concentrao, tornando possvel
o desenvolvimento de projetos em biotecnologia em
outros Estados brasileiros, o que deve fazer com que
a demanda por conhecimento em bioinformtica se
distribua de forma igualitria em territrio nacional.
Nesse sentido, a integrao entre os Estados
dever promover a melhoria no desenvolvimento
de tecnologias, aumentando a potencialidade desta
poderosa ferramenta, a bioinformtica, na evoluo da
cincia em favor da humanidade, e provocando impactos
e avanos nos mais variados setores da sociedade.
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Recebido: 06/04/2007
Received: 04/06/2007
Aprovado: 22/12/2007
Approved: 12/22/2007