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Campus Guadalajara
Introduccin
La anemia falciforme es una enfermedad en la que su cuerpo produce glbulos rojos con
un contorno anormal. Las clulas tienen forma semilunar o de una hoz. Estas clulas son
ms rgidas y menos flexibles, por lo que se atascan en los vasos sanguneos y bloquean
el flujo, esto provoca dolor y puede lesionar los rganos e incluso pueden causar infartos.
Debido tambin a sus extremos puntiagudos, pueden llegar a desgarrar las paredes de
los vasos. A diferencia de los hemates normales, que duran unos 120 das en la corriente
sangunea, los falciformes son eliminados despus de slo unos 10 o 20 das y, como no
pueden reponerse con suficiente rapidez, la sangre tiene insuficiencia permanente de
glbulos rojos (eritrocitopenia), causando la enfermedad conocida como anemia (NIH,
2014).
Las personas con la enfermedad nacen con dos genes de clulas falciformes, uno
de cada padre por lo que son homocigotos. Si hereda el cambio del gen de uno solo de
sus padres, ser portador y tendr el gen de clulas falciformes y otro normal, por lo que
sern heterocigotos, a este rasgo se le denomina drepanoctico. Aproximadamente 1 de
cada 12 personas de raza negra es portadora del rasgo drepanoctico, y la enfermedad
como tal, afecta al 8% de la poblacin afroamericana (ONSALUS, 2013).
Existen varias alternativas para hacer un diagnstico de esta enfermedad por
ejemplo se puede hacer un recuento de reticulocitos, es decir, de la cantidad de glbulos
rojos inmaduros de la sangre, a su vez se puede hacer pruebas para determinar las
concentraciones de hierro en la sangre y en el cuerpo. No obstante una alternativa ms
precisa es el diagnstico molecular, que a su vez es una opcin sencilla y rpida.
El diagnstico molecular se define como el conjunto de tcnicas que emplean la
biologa molecular para identificar anomalas o defectos moleculares subyacentes a una
enfermedad de carcter hereditaria o infecciosa. El empleo de estas tcnicas ofrece una
evaluacin ms especfica, sensible y rpida, adems se requiere cantidades mnimas de
muestra en comparacin con las pruebas convencionales. Para planear una estrategia
de diagnstico es necesario plantearse una serie de preguntas secuenciales para
enfocarse en el problema en cuestin, dichas preguntas se pueden observar en la Tabla1.
Locus localizado?
Gen identificado?
ir a 2
Diagnstico citogentico
ir a 3
NO
SI
ir a 4
NO
SI
ir a 5
Un alelo prevalente?
Diagnstico Directo
prevalente, es decir, mediante la deteccin del cambio producido a nivel del ADN. En el
segundo supuesto, es ms apropiado un diagnstico indirecto mediante el estudio de la
segregacin del carcter estudiado con marcadores polimrficos ntimamente ligados a
ste (Fibla, 2006).
Dado que la anemia falciforme es causada por una sola mutacin, la estrategia
que se describe a continuacin es para un diagnstico directo. Los temas de ingeniera
gentica asociados a este caso son: extraccin de DNA, diseo de oligonucletidos,
reaccin en cadena de la polimerasa (PCR), enzimas de restriccin y el uso de vectores
de clonacin como marcadores de peso molecular.
Glosario
Anemia falciforme
Cebador o primer
Diagnstico
citogentico
Diagnstico directo
Dianstico indirecto
Drepanoctico
Globina beta
Hemates
Herencia mendeliana
Heterocigoto
Homocigoto
Isoesquizmero
Locus
Marcador pUC18/SFC1
PCR
Reticulocitos
Diagrama
Discusin
La anemia falciforme es una enfermedad gentica autosmica recesiva resultado
de la sustitucin de adenina por timina en el gen de la globina beta, lo que conduce a una
mutacin de cido glutmico por valina en la posicin 6 de la cadena polipeptdica de
globina beta, esto ocasiona la produccin de una hemoglobina defectuosa llamada
hemoglobina S. Paralelamente se altera la diana de restriccin para el enzima MstII, o
bien para la enzima Bsu36I, que es un isoesquizmero de MstII, es decir, cortan para el
mismo sitio de restriccin. El cido glutmico tiene carga negativa y la valina es hidrfoba,
entonces se forman contactos con alanina, fenilalanina y leucina, lo que promueve
polmeros cruzados que deforman el glbulo rojo (Fibla, 2006).
Como se trata de una sola mutacin en un gen conocido se sigui una estrategia
de diagnstico directo; en primer lugar se extrae el DNA de la sangre, posteriormente
sigue el diseo de primers que flanqueen la diana donde ocurre la mutacin, ya sea con la
herramienta que ofrece Blast o bien manualmente; en este caso se us la herramienta
Blast; despus se procede con la amplificacin y en seguida se emplean enzimas de
restriccin que corten justo en donde ocurre la mutacin; finalmente, un gel de
electroforesis permitir hacer una evaluacin del diagnstico molecular. Estos pasos se
observan en el Diagrama 2 y a continuacin se explican a detalle.
Extraccin de DNA
Diseo de primers
Amplificacin
Corte con enzimas de
restriccin
Electroforesis
Diagnstico
Diagrama 2. Resumen de los pasos para el diagnstico molecular directo.
Extraccin de DNA
La extraccin de DNA a travs de sangre perifrica consta de dos etapas, la primera
es la extraccin de sangre; en donde, se hace uso de herramientas para una extraccin
correcta de sangre teniendo los cuidados necesarios para evitar cualquier tipo de contagio
o de infeccin ya que con el material que se trabaja es biolgico. para la extraccin de
sangre perifrica se necesita de: ligar el brazo de la persona 10 cm arriba del codo y
realizar la bsqueda de la mejor vena por medio de palpaciones, seguido de esto, con
ayuda de torundas empapadas en alcohol se procede a desinfectar el rea de puncin;
una vez que la vena se encuentra sujetada se introduce la jeringa, manteniendo la jeringa
lo ms cerca posible de la piel del antebrazo para no lastimar a la persona. se extraen 3
mL de sangre y una vez dentro de la jeringa se coloca alcohol con ayuda de una torunda
sobre la zona de extraccin y se procede a desligar y retirar la aguja; la sangre es
colocada en un tubo el cual es previamente rotulado. (Roque, 2012).
La segunda etapa es para la extraccin de DNA a travs de la muestra de sangre
obtenida. La extraccin consta de una lisis celular con ayuda de un tensoactivo como Tris
o tritn, los cuales, se encargan de romper las estructuras que confinan el citoplasma y
as liberar su contenido. Una vez lisada la clula se procede a la remocin protica
contaminante con ayuda de Fenol as como la remocin de la carga lipdica con ayuda de
cloroformo para terminar de limpiar la muestra. Para la purificacin del DNA, se precipita
el DNA en alcohol ya que es insoluble en este; se puede usar etanol al 100% fro (4C) o
tambien isopropanol al 100% a temperatura ambiente. el uso de etanol hace que tarde
ms tiempo en precipitar el DNA, el isopropanol lo precipita inmediatamente aunque sea
un poco ms costoso. Por ltimo, se remueven las sales utilizando etanol al 70% y el DNA
es recuperado en agua mili Q. (Microbial, 2009; Falcn, 2004).
Diseo de primers
Para el diseo de primers, se decidi utilizar la herramienta PRIMER BLAST del NCBI.
Pero antes, fue necesario localizar la secuencia donde ocurre la mutacin puntual. Esta
mutacin ocurre especficamente en la cadena de la hemoglobina, ya que la mutacin
Glu6Val provoca que el gen HBB codifique una cadena defectuosa que al unirse en el
heterotetrmero (2 cadenas y 2 cadenas ) forma la hemoglobina S (Hb S), causante
de las clulas con anemia falciforme (Bender y Douthitt, 2014) . Por lo tanto, nuestro
inters fue encontrar el gen HBB, el cual se encuentra en el cromosoma 11 en Homo
sapiens (GeneBank U01317.1). Cabe mencionar que los genes codificantes de las
cadenas se encuentran en el cromosoma 16.
Una vez localizada la secuencia de la mutacin, se procedi a elegir una
secuencia especfica de alrededor de 310 nt, ya que nuestro producto de digestin deban
ser 2 fragmentos de 200 nt y 100 nt a partir del corte de restriccin en el sitio de la
mutacin. Para esto, elegimos 155 nt ro arriba y 155 nt ro abajo a partir de la
mutacin, y tras copiar el formato FASTA, accedimos a la herramienta PRIMER BLAST.
Especificamos que el producto de la PCR deba medir entre 290 y 310 pb y la herramienta
nos arroj 9 primers. De los cuales elegimos el siguiente debido a su % de G y C, y la
poca diferencia en la temperatura de alineamiento:
Amplificacin
Posteriormente se lleva a cabo una reaccin de la polimerasa en cadena (PCR) para
amplificar el segmento de DNA donde se encuentra la mutacin y que est flanqueado por
los primers diseados en el paso anterior. La PCR es un mtodo de diagnstico molecular
que permite obtener enzimticamente grandes cantidades de un fragmento especfico de
DNA a partir de un molde de DNA complejo (Arnheim y Erlich, 1992), para este caso el
DNA extrado de la sangre.
En esta reaccin, se utiliza una mezcla que contiene el juego de primers, la
muestra de DNA, desoxirribonucletidos-trifosfato (dNTP), sales, amortiguadores y una
Los isoesquizmeros son enzimas de restriccin que comparten el mismo sitio diana
(Pingoud, Alves y Geiger, 1993).
Electroforesis del producto de la PCR despus del corte con enzimas de restriccin
Se realiz una electroforesis en gel (ver Figura 3) para separar las molculas de DNA
obtenidas posterior a la amplificacin de los fragmentos de inters generados por una
PCR convencional y a partir de los cortes producidos por accin endonucleasa (enzima de
restriccin). La electroforesis es una tcnica que permite la separacin, identificacin, y
purificacin de macromolculas en funcin a su tamao, propiedades elctricas y otras
propiedades fsicas. (Somma, M. s.f.).
Diagnstico Molecular
La utilizacin de un mtodo de corte por enzimas de restriccin permite un
diagnstico efectivo y temprano para enfermedades con etiologa gentica. Para el caso
particular de anemia falciforme el diagnstico molecular supone una alternativa de
tratamiento efectiva, sensible y temprana. El hecho de que sea una enfermedad de
carcter mendeliano permite conocer si la descendencia puede tener predisposicin, o no,
a padecer la enfermedad. Para conocer las posibles recombinaciones de la anemia
falciforme, se simul un cruzamiento gentico entre dos padres heterocigotos para la
enfermedad. Las posibles opciones de manifestacin del padecimiento gentico son 50%
de probabilidad de que el individuo sea heterocigoto para la enfermedad. Para este caso
el individuo es sano, sin embargo una centsima parte de sus eritrocitos son falciformes,
por lo cual deber llevar a cabo medidas preventivas para no agravar los posibles
sntomas. Se tiene un 25% de probabilidad de que el individuo sea homocigoto silvestre y
no presente la enfermedad o ninguno de sus sntomas, y el otro 25% de probabilidad
corresponde a un individuo homocigoto mutante, de forma que ambos alelos tendrn la
mutacin y por lo tanto la enfermedad se manifestar.
A pesar de la eficacia de un diagnstico molecular, no se puede afirmar con
completa seguridad que la anemia falciforme se presentar en todos los casos en los
cuales se tenga el alelo mutante para la enfermedad, ya que representa un padecimiento
multifactorial que se puede aliviar o agravar dependiendo del contexto de desarrollo y los
hbitos de salud del paciente afectado.
encuentra uno ro arriba a 1.2 kb y otro ro abajo a 2 kb, por lo que el corte del fragmento
total (1.4 kb), producir 2 fragmentos de 1.2 kb y 2 kb. No obstante, una vez que se
realiza la digestin, existirn miles de fragmentos producto de la digestin con MstII, por lo
que es necesario identificar aquellos de nuestro inters. Para esto, todos los fragmentos
digeridos son separados por tamao en un gel de agarosa tras realizar una electroforesis.
Posteriormente se transfiere el resultado a un filtro de nitrocelulosa. Finalmente, mediante
el uso de una sonda complementaria al fragmento de 1.2 kb, podemos detectar el
fragmento al que pertenece la sonda tras visualizarlo en rayos X (Fibla, 2006).
Obteniendo los siguientes resultados:
Figura 4.Posibles resultados del diagnstico de anemia falciforme mediante Southern Blot (Fibla,
2006).
Como se observa, en la Figura 4, hay 3 posibles resultados, los cuales son descritos a
continuacin:
1. Normal: La primera columna corresponde a un paciente sin mutacin en sus 2 alelos, por
lo que la sonda se uni al fragmento de 1.2 kb, ya que s se realiz el corte de restriccin
por MstII.
2.
puede
generar
un
mismatch
(A).
Al
encuentran cercanos (C). Al excitar al reportero con una luz a su respectiva longitud de
onda, se puede medir la emisin del reportero libre. Por otro lado, la emisin del reportero
que no se ha liberado se trasmite va FRET al quencher adyacente y no se detectar la
seal. Esta deteccin se repite despus de cada ciclo y como resultado la intensidad del
reportero libre muestra un crecimiento exponencial por unidad de tiempo (D).
Conclusin
En breve, el diagnstico molecular es una herramienta de gran utilidad para el tratamiento
de enfermedades genticas, tal es el caso de la anemia falciforme. Existen mltiples
formas de abordar el problema, como el uso de polimorfismos de longitud de fragmentos
de restriccin, el cual se describi en este trabajo. No obstante, las posibilidades dentro
de este campo son tantas y van desde las ms simples hasta las ms complejas, (como el
uso de sondas Taqman). Todo depende del enfoque que se le quiera dar al problema y
los recursos disponibles.
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