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ESTADUAL DE LONDRINA
ROZE LORRAINE SALDANHA
Londrina
2006
Londrina
2006
Londrina
2006
COMISSO EXAMINADORA
AGRADECIMENTOS
ABSTRACT
Eight Brazilian isolates of Botryosphaeria (anamorphs and teleomorphs) and one
Australian strain of Botryosphaeria rhodina (isolate MAMB-05, used as a reference),
were evaluated for their growth and the production of the enzymes: laccases,
pectinases and -1,3-glucanases, when grown on basal medium in the absence and
presence of the laccase inducer, veratryl alcohol (VA). The genetic relationship
among the 9 isolates collected from different host plants (fruits, leaves, woods and
legume) was determined based on Internal Transcribed Spacer (ITS) sequence and
Random Amplification of Polymorphic DNA (RAPD) data. ITS sequence analysis
showed eight closely related isolates classified as B. rhodina and its anamorph
Lasiodiplodia theobromae, and one isolate that was out of the main cluster, identified
as B. ribis. RAPD analysis resolved the isolates into 2 main clusters, one constituted
by four isolates with high polymorphism (Group-I), and a second (3 isolates) without
polymorphism (Group-II). Strains belonging to Group-I produced higher levels of
constitutive and inducible laccase, as well as -1,3-glucanase; whereas the Group-II
strains produced lower levels of these enzymes. It appeared to have no correlation
between pectinase production and genetic diversity among the nine isolates.
However, the strain characterized as B. ribis, which was positioned out of the main
cluster, was found to be the highest producer of pectinases in the presence of VA.
Keywords:
Botryosphaeria;
Polymorphism; RAPD.
Laccases;
Pectinases;
-1,3-Glucanases;
RESUMO
Palavras-chave:
Botryosphaeria;
polimorfismo; RAPD.
lacases;
pectinases;
-1,3-glucanases;
LISTA DE ILUSTRAES
2 REVISO BIBLIOGRFICA
Figura
Figura
Figura
Figura
Figura
Figura
Figura
5 RESULTADOS E DISCUSSO
Figura
Figura
Figura 10
Figura 11
Figura 12
Figura 13
Figura 14
Figura 15
LISTA DE TABELAS
4 MATERIAIS E MTODOS
Tabela
5 RESULTADOS E DISCUSSO
Tabela
Tabela
Tabela
ABTS
AV
BDA
C/AV
CCD
DMP
DNA
DNTPS
Endo-PG
Endo-PGL
EPS
Exo-PG-1
Exo-PG-2
Exo-PGL
H2O2
IGS
ITS
Li-P
Mn-P
NCBI
OGL
PAE
PCR
PG
PL
PME
PMG
RAPD
RDNA
S/AV
UV
VA
SUMRIO
INTRODUO........................................................................................
17
REVISO BIBLIOGRFICA...................................................................
20
2.1
21
2.2
26
2.3
31
2.3.1
Lacases............................................................................................
31
2.3.2
Pectinases........................................................................................
36
2.3.3
-1,3-Glucanases.............................................................................
44
FUNGOS
51
52
2.4.2 Polimorfismo Gentico de Microrganismos Utilizando o RAPDPCR e sua Correlao com Caractersticas individuais...............
58
2.4
2.4.1
MTODOS
FILAMENTOSOS...........
MOLECULARES
UTILIZADOS
EM
3
OBJETIVOS.............................................................................................
63
3.1
GERAL....................................................................................
OBJETIVO
63
3.2
ESPECFICOS.........................................................................
OBJETIVOS
63
MATERIAIS E MTODOS......................................................................
64
4.1
MICRORGANISMOS...................................................................................
64
4.2
PREPARO DO INCULO............................................................................
65
4.3
65
4.4
66
4.5
ENZIMTICAS................................................................
4.5.1
Determinao
Lacase...........................................
4.5.2
da
DETERMINAES
de
66
67
4.6
ANALTICAS..................................................................
Atividade
66
DETERMINAES
67
DNA
68
DNA
69
DO
70
4.7
EXTRAO
GENMICO...............................................................
4.8
QUANTIFICAO
EXTRADO........................................................
4.9
AMPLIFICAO
rDNA......................
DA
REGIO
DO
DO
ITS1-5.8SGENE-ITS2
71
4.11 ANLISE DAS SEQNCIAS NUCLEOTDICAS DAS REGIES ITS1 5.8S ITS2......................................................................................................
4.12
ANLISE
(RAPD)....
ACASO
73
74
DE
POLIMORFISMO
DE
DNA AMPLIFICADO
72
AO
5
RESULTADOS
DISCUSSO...............................................................
75
5.1
75
5.2
79
81
5.3
5.4
5.5
84
87
5.6
88
5.7
92
6 CONSIDERAES FINAIS......................................................................
98
REFERNCIAS..............................................................................................
99
ANLISE
ARTIGO......................................................................................................... 114
17
1 INTRODUO
Muitos
microrganismos
so
encontrados
na
natureza
como
fungos
filamentosos,
especialmente
os
isolados
de
como:
ligninoltico,
pectinoltico,
glucanoltico,
celuloltico,
18
de
espcies
fngicas
produtoras
de
enzimas
de
interesse
19
amplificao
de
regies
atravs
da
PCR
seguida
do
20
2 REVISO BIBLIOGRFICA
21
Os
fungos
do
gnero
Botryosphaeria
so
ascomicetos
22
23
est
completamente
esclarecida,
visto
que
organismos
patognicos,
24
sobre
produo
de
enzimas
envolvidas
na
25
ligninolticos,
como
Pleurotus
ostreatus,
Phanerochaete
ascomicetos,
como
no
Botryospheria
sp
(BARBOSA
et
al.,
1996;
26
27
28
29
elevadas
de
glucose
5%
(p/v).
Constataram
que
este
30
31
2.3.1 Lacases
32
hidrazina)]
considerado
mais
apropriado
para
33
(1989) o substrato artificial ABTS [2,21 cido azino bis (3-etilbenzotiazoline-6sulfnico)] tem capacidade de agir como mediador, permitindo a oxidao de
modelos no fenlicos de lignina, compostos estes que no so propriamente
substratos para a lacases. Outro substrato que tem sido amplamente utilizado para a
determinao da lacase o 2,6-dimetoxifenol (DMP), em diferentes condies de pH
e temperatura (DEKKER et al., 2001; VASCONCELOS et al., 2000).
A importncia tecnolgica das lacases resultante da sua
capacidade de catalisar a transformao de um grande nmero de compostos
aromticos fenlicos e no fenlicos (DURN et al., 2002).
O uso de enzimas tem crescido nas ltimas dcadas atravs do
desenvolvimento de novos processos biotecnolgicos promovendo a melhoria da
qualidade de vida da populao.
As lacases tm sido aplicadas em diferentes processos industriais
como na produo de bebidas e alimentos, indstrias txteis, papeleiras e indstria
farmacutica, assim como em processos de biorremediao (LEONOWICZ et al.,
2001;
MINUSSI;
PASTORE;
DURN,
2002;
WESENBERG;
KYRIAKIDES;
34
desenvolvidos
com
vinhos
tratados
com
lacases
de
diferentes
35
que
modificam
estrutura
propriedades
toxicolgicas
destes
36
2.3.2 Pectinases
37
PAE:
PME:
Endo-PG:
PMG:
Exo-PG-1:
Acetil esterase
Pectina esterase
Poligalacturonases
Polimetilgalacturonidase
Galacturonana 1,4--galacturonidase
EC 3.1.1.6
EC 3.1.1.11
EC 3.2.1.15
EC 3.2.1.15
EC 3.2.1.67
Exo-PG-2:
Endo-PGL:
OGL:
Exo-PGL :
PL :
Exo-poly-a-galacturonosidase
Pectato liase
Oligogalacturnico liase
Pectato dissacardeo liase
Pectinaliase
EC 3.2.1.82
EC 4.2.2.2
EC 4.2.2.6
EC 4.2.2.9
EC 4.2.2.10
38
39
40
41
42
niger
causa
uma
considervel
despolimerizao
da
goma
43
44
2.3.3 -1,3-Glucanases
et
al.,
2004).
microrganismos,
as
gomas
So
exemplos
xantanas,
de
glucanas
dextranas,
produzidas
gelanas,
pululanas
por
e
botriosferanas.
Dekker e Barbosa (2001), relataram alta viscosidade do meio de
cultivo quando Botryosphaera rhodina foi cultivado em glucose como fonte nica de
carbono. Utilizando vrias concentraes desta fonte de carbono, verificaram que
medida que se aumentava a concentrao de glucose, os acares totais
aumentavam proporcionalmente, enquanto que a quantidade de acares redutores
diminua. Estudos relacionados ao metabolismo fngico confirmam que a glucose
presente no meio de cultivo pode ser armazenada pelo fungo na forma de EPS
(exopolissacardeo). Os autores avaliaram o tipo de ligaes glicosdicas
constituintes do EPS produzido pelo referido fungo. Para tanto, incubaram
separadamente a soluo de glucana de B. rhodina com diferentes enzimas
comerciais, que hidrolisavam ligaes glicosdicas tipo ou , sendo a glucose
liberada quantificada pelo mtodo da glucose-oxidase. Verificaram que somente as
enzimas comerciais que hidrolisavam ligaes glicosdicas do tipo que atuavam
45
R
R= H, Resduos Glucosil
R = -D-Glcp -(1, Resduos dissacardeos glucosil (Gentiobiose)
6
-D-Glcp
1
6
3)- -D-Glcp -(1
3)- -D-Glcp -(1
3)- -D-Glcp -(1
3)- -D-Glcp -(1
3)- -D-Glcp -(1
46
47
microrganismos
que
secretam
-1,3-glucanases,
-1,6-glucanases,
48
lticas
como
as
-1,3-glucanases.
Por
exemplo:
Acremonium
49
50
51
segmento,
utilizando
enzima
DNA
polimerase,
cofatores,
52
53
54
IGS
IGS
55
poro 28S um pouco mais varivel em relao 18S e portanto, apropriada para
a comparao de diferentes gneros. Por outro lado, os espaos internos transcritos,
referentes s regies ITS 1 e 2, evoluem mais rapidamente na unidade de rDNA,
sendo as seqncias destas regies, apropriadas para discriminar espcies
relacionadas, ou at mesmo, variedades de uma mesma espcie (FUNGARO,
2000).
Uma vez que os genes 18S e 28S apresentam regies altamente
conservadas, primers ditos universais (ITS1 e ITS4) foram desenhados (WHITE et
al., 1990), permitindo a amplificao dos espaos internos transcritos de qualquer
fungo, independente do gnero a que pertence. A regio amplificada, no entanto,
compreender o ITS1, o 5.8S e o ITS2, a qual poder ter seqncia de nucleotdeos
variveis entre espcies distintas, porm seqncias conservadas entre linhagens
de uma mesma espcie, permitindo assim sua identificao (SKOUBOE et al., 1999;
FUNGARO, 2000).
A
amplificao
de
regies
atravs
da
PCR
seguida
do
56
57
58
59
tcnica,
tm
sido
amplamente
utilizada
na
pesquisa
60
(BERTOUT
et
al.,
2001),
bactria
Fusobacterium
nucleatum
61
colaboradores
(1996)
utilizaram
duas
ferramentas
62
63
3 OBJETIVOS
64
4 MATERIAIS E MTODOS
4.1 MICRORGANISMOS
B. rhodina
B. ribis
L. theobromae
L. theobromae
L. theobromae
L. theobromae
L. theobromae
L. theobromae
L. theobromae
Eucaliptus spp
Eucaliptus citriodora
Micropholis venulosa
Solanum melongena
Annona muricata L.
Citrus sp
Mangifera indica L.
Mangifera indica L.
Annona squamosa L.
Cancro
Cancro
Madeira currupix
Leguminosa (berinjela)
Fruto (graviola)
Fruto(laranja)
Folha (de mangueira)
Fruto (manga)
Fruto (pinha)
65
O inculo para o cultivo em meio lquido foi iniciado pelo repique dos
microrganismos em placas de Petri contendo meio mnimo de sais (VOGEL, 1956),
gar (2% p/v) e glucose 1% (p/v) como fonte de carbono. As placas foram incubadas
durante 5 dias 28 2C. Decorrido este tempo, trs esferas de 7mm foram
removidas do meio slido e utilizadas como inculo para cultivo em meio submerso.
66
67
ensaios foram incubados durante 5min, o volume final da reao foi 1ml. A atividade
de lacase foi expressa como o nmero de moles de substrato oxidado por min.ml-1
de extrato enzimtico nas condies descritas.
68
novamente
fase
aquosa
foi
transferida
para
novos
microtubos
69
repetindo-se
este
procedimento
por
duas
vezes.
Aps
descarte
dos
70
71
72
4.11 ANLISE DAS SEQNCIAS NUCLEOTDICAS DAS REGIES ITS1 5.8S - ITS2
73
Life
Technologies,
USA-50mM),
1l de
dNTP
(Invitrogen Life
74
75
5 RESULTADOS E DISCUSSO
76
0.07
ABTS
DMP
-1
Atividade de lacases (U ml )
0.06
0.05
0.04
0.03
0.02
0.01
0.00
h.
B. r
v.
o.
ar.
ru.
ibis h.Cur. th.Ber.
.Gra L.th.L .th.M.F th.M.F
B. r
h
t
L.
.
L.t
.
L
L
L
.P
L.th
i.
Isolados
77
ABTS
-1
Atividade de lacases (U ml )
DMP
4
0
h.
B. r
r.
r.
v.
ibis
.Be
.Cu
.Gra
B. r
L.th
L.th
L.th
r.
o.
ru.
.La
.M.F
.M.F
L.th
L.th
L.th
.Pi.
L.th
Isolados
78
79
5.2 AVALIAO
DA
PRODUO
DE
PECTINASES
PELOS
DIFERENTES ISOLADOS
DE
80
0.30
c/AV
-1
Atividade de Pectinase (U ml )
s/AV
0.25
0.20
0.15
0.10
0.05
0.00
h
B. r
r.
v.
o.
u.
ibis h.Cur. th.Ber.
Gra L.th.La th.M.F h.M.Fr
.
t
B. r
h
.
.
t
L
L
L.
L.
L.t
.Pi.
L.th
Isolados
Todos
os
microrganismos
avaliados
produziram
pectinases
81
salienta
diversidade
entre
espcies,
confirmada
pelo
5.3
82
83
84
s/AV
-1
Atividade de beta-1,3-Glucanase (U ml )
1.50
c/AV
1.25
1.00
0.75
0.50
0.25
0.00
h.
B. r
v.
o.
ar.
ru.
ibis h.Cur. th.Ber.
.Gra L.th.L .th.M.F th.M.F
B. r
L.
L.t
.
L.th
L
L
.Pi.
L.th
Isolados
5.4
COMPARAO
DE
pH
NOS
DA
PRODUO
CULTIVOS
DE
DOS ISOLADOS DE
Botryosphaeria,
NA
E DA
VARIAO
AUSNCIA
E NA
85
que sua produo de biomassa foi igual a 7,4 g l-1 na presena de lcool veratrlico,
enquanto que na ausncia deste composto foi igual a 4,1 g l-1.
Resultados semelhantes foram obtidos em 2001 por Vasconcelos et
al., onde foi comparada a produo de biomassa fngica pelos fungos B. rhodina, B.
ribis e L. theobromae cultivados sob as mesmas condies descritas no presente
trabalho. De acordo com os resultados obtidos pelos autores, o B. rhodina na
presena de AV apresentou uma diminuio na produo de biomassa, como
tambm foi observado no presente trabalho. A produo de biomassa fngica,
protenas e variao do pH final dos cultivos dos diferentes isolados de
Botryosphaeria esto apresentadas na Tabela 2.
Cdigos
Protenas
pH final
-1
(g l )
(mg ml )
s/AV
c/AV
s/AV
c/AV
s/AV
c/AV
B. rh.
4,07 0,46
2,04 0,51
0,01 0,00
0,05 0,00
5,96 0,11
5,13 0,29
B. ribis
4,09 0,44
7,43 0,43
0,02 0,00
0,06 0,00
6,01 0,02
6,24 0,15
L.th.Cur.
4,29 0,26
2,72 0,46
0,03 0,00
0,04 0,00
6,02 0,06
5,22 0,32
L.th.Ber.
4,34 0,21
3,46 0,45
0,03 0,00
0,03 0,00
5,75 0,35
4,13 0,37
L.th.Grav.
4,69 0,29
3,68 0,38
0,04 0,00
0,04 0,00
6,20 0,06
4,93 0,47
L.th.Lar.
4,25 0,09
2,42 0,24
0,03 0,00
0,03 0,00
6,08 0,10
4,99 0,43
L.th.M.Fo.
3,55 0,29
3,16 0,17
0,02 0,00
0,01 0,00
4,84 0,10
4,02 0,09
L.th.M.Fru
3,50 0,41
2,35 0,21
0,03 0,00
0,04 0,00
5,44 0,06
3,93 0,15
L.th.Pi.
3,61 0,09
2,46 0,26
0,05 0,00
0,02 0,00
4,33 0,09
4,40 0,14
86
87
5.5
DE
Botryosphaeria
NA
AUSNCIA
E NA
PRESENA
DE
LCOOL VERATRLICO
88
-1
-1
(mg ml )
Cdigos
(mg ml )
s/AV
c/AV
s/AV
c/AV
B. rh.
0,05 0,01
0,08 0,01
0,63 0,04
0,68 0,03
B. ribis
0,06 0,00
0,06 0,01
0,52 0,01
0,55 0,05
L.th.Cur.
0,04 0,00
0,04 0,01
0,55 0,00
0,62 0,01
L.th.Ber.
0,07 0,00
0,06 0,00
0,76 0,03
0,70 0,01
L.th.Grav.
0,06 0,00
0,07 0,00
0,68 0,02
0,69 0,02
L.th.Lar.
0,06 0,00
0,06 0,01
0,76 0,03
0,61 0,03
L.th.M.Fo.
0,05 0,01
0,07 0,01
0,59 0,00
0,59 0,01
L.th.M.Fru.
0,06 0,00
0,08 0,01
0,58 0,01
0,61 0,01
L.th.Pi.
0,06 0,00
0,07 0,00
0,54 0,03
0,59 0,02
89
Cdigos
5
18S ITS 1
15
25
35
45
55
B. rh.
B. ribis
L.th.Cur.
L.th.Ber.
L.th.Grav.
L.th.Lar.
L.th.M.Fo.
L.th.M.Fru.
L.th.Pi.
CCGAGTT--C
CCGAGTTGAT
CCGAGTT--T
CCGAGTT--T
CCGAGTT--T
CCGAGTT--T
CGGAATT--T
CCGAATT--T
CCGAGTT--T
65
75
B. rh.
B. ribis
L.th.Cur.
L.th.Ber.
L.th.Grav.
L.th.Lar.
L.th.M.Fo.
L.th.M.Fru.
L.th.Pi.
TTGGCGG--TTGGCGGGCC
TTGGCGG--TTGGCGG--TTGGCGG--TTGGCGG--TTGGCGGG-TTGGCGG--TTGGCGG---
---------GCGGTCCTCC
----------------------------------------------------------------
125
135
B. rh.
B. ribis
L.th.Cur.
L.th.Ber.
L.th.Grav.
L.th.Lar.
L.th.M.Fo.
L.th.M.Fru.
L.th.Pi.
AAGGACCTTC
GAGGACCATA
AAGGACCTTC
AAGGACCTTC
AAGGACCTTC
AAGGACCTTC
AAGGACCTTC
AAGGACCTTC
AAGGACCTTC
AAACTCCAGT
AAACTCCAGT
AAACTCCAGT
AAACTCCAGT
AAACTCCAGT
AAACTCCAGT
AAACTCCAGT
AAACTCCAGT
AAACTCCAGT
185
195
B. rh.
B. ribis
L.th.Cur.
L.th.Ber.
L.th.Grav.
L.th.Lar.
L.th.M.Fo.
L.th.M.Fru.
L.th.Pi.
AACTTTCAAC
AACTTTCAAC
AACTTTCAAC
AACTTTCAAC
AACTTTCAAC
AACTTTCAAC
AACTTTCAAC
AACTTTCAAC
AACTTTCAAC
AACGGATCTC
AACGGATCTC
AACGGATCTC
AACGGATCTC
AACGGATCTC
AACGGATCTC
AACGGATCTC
AACGGATCTC
AACGGATCTC
245
255
265
275
285
295
B. rh.
B. ribis
L.th.Cur.
L.th.Ber.
L.th.Grav.
L.th.Lar.
L.th.M.Fo.
L.th.M.Fru.
L.th.Pi.
AGTAATGTGA
AGTAATGTGA
AGTAATGTGA
AGTAATGTGA
AGTAATGTGA
AGTAATGTGA
AGTAATGTGA
AGTAATGTGA
AGTAATGTGA
ATTGCAGAAT
ATTGCAGAAT
ATTGCAGAAT
ATTGCAGAAT
ATTGCAGAAT
ATTGCAGAAT
ATTGCAGAAT
ATTGCAGAAT
ATTGCAGAAT
TCAGTGAATC
TCAGTGAATC
TCAGTGAATC
TCAGTGAATC
TCAGTGAATC
TCAGTGAATC
TCAGTGAATC
TCAGTGAATC
TCAGTGAATC
ATCGAATCTT
ATCGAATCTT
ATCGAATCTT
ATCGAATCTT
ATCGAATCTT
ATCGAATCTT
ATCGAATCTT
ATCGAATCTT
ATCGAATCTT
TGAACGCACA
TGAACGCACA
TGAACGCACA
TGAACGCACA
TGAACGCACA
TGAACGCACA
TGAACGCACA
TGAACGCACA
TGAACGCACA
TTGCGCCCCT
TTGCGCCCCT
TTGCGCCCCT
TTGCGCCCCT
TTGCGCCCCT
TTGCGCCCCT
TTGCGCCCCT
TTGCGCCCCT
TTGCGCCCCT
305
315
TGGTATTCCG
TGGTATTCCG
TGGTATTCCG
TGGTATTCCG
TGGTATTCCG
TGGTATTCCG
TGGTATTCCG
TGGTATTCCG
TGGTATTCCG
GGGGGCATGC
AGGGGCATGC
GGGGGCATGC
GGGGGCATGC
GGGGGCATGC
GGGGGCATGC
GGGGGCATGC
GGGGGCATGC
GGGGGCATGC
B. rh.
B. ribis
L.th.Cur.
L.th.Ber.
L.th.Grav.
L.th.Lar.
L.th.M.Fo.
L.th.M.Fru.
L.th.Pi.
TCGGGCTTCG
TCGAGCTCCG
TCGAGCTCCG
TCGAGCTCCG
TCGAGCTCCG
TCGAGCTCCG
TCGAGCTTCG
TCGAGGTCCG
TCGAGCTCCG
GCTCGACTCT
GCTCGACTCT
GCTCGACTCT
GCTCGACTCT
GCTCGACTCT
GCTCGATTCT
GCTCGACTCT
GCTCGACTCT
GCTCGACTCT
85
---------GCACCGGCGC
---------------------------------------------------------------145
CAGTAAACGC
CAGTGAACTT
CAGTAAACGC
CAGTAAACGC
CAGTAAACGC
CAGTAAACGC
CAGTAAACGC
CAGTAAACGC
CAGTAAACGC
205
TTGGTTCTGG
TTGGTTCTGG
TTGGTTCTGG
TTGGTTCTGG
TTGGTTCTGG
TTGGTTCTGG
TTGGTTCTGG
TTGGTTCTGG
TTGGTTCTGG
325
CTGTTCGAGC
CTGTTCGAGC
CTGTTCGAGC
CTGTTCGAGC
CTGTTCGAGC
CTGTTCGAGC
CTGTTCGAGC
CTGTTCGAGC
CTGTTCGAGC
CCCACCCTTT
CCCACCCAAT
CCCACCCTTT
CCCACCCTTT
CCCACCCTTT
CCCACCCTTT
CCCACCCTTT
CCCACCCTTT
CCCACCCTTT
GTGAACGTAC
GTGTACCTAC
GTGAACGTAC
GTGAACGTAC
GTGAACGTAC
GTGAACGTAC
GTGAACGTAC
GTGAACGTAC
GTGAACGTAC
95
105
-CTCCGG--CCTTCGGGGG
-CTCCGG---CTCCGG---CTCCGG---CTCCGG---CTCCGG---CTCCGG---CTCCGG---
---------GGGCTGGCCA
----------------------------------------------------------------
155
165
AGACGTCTGA
CGCAGTCTGA
AGACGTCTGA
AGACGTCTGA
AGACGTCTGA
AGACGTCTGA
AGACGTCTGA
AGACGTCTGA
AGACGTCTGA
TAAACAAGTT
AAAACAAGTT
TAAACAAGTT
TAAACAAGTT
TAAACAAGTT
TAAACAAGTT
TAAACAAGTT
TAAACAAGTT
TAAACAAGTT
215
225
CATCGATGAA
CATCGATGAA
CATCGATGAA
CATCGATGAA
CATCGATGAA
CATCGATGAA
CATCGATGAA
CATCGATGAA
CATCGATGAA
GAACGCAGCG
GAACGCAGCG
GAACGCAGCG
GAACGCAGCG
GAACGCAGCG
GAACGCAGCG
GAACGCAGCG
GAACGCAGCG
GAACGCAGCG
5.8S ITS 2
335
GTCATTACAA
GTCATTTCAA
GTCATTACAA
GTCATTACAA
GTCATTACAA
GTCATTACAA
GTCATTACAA
GTCATTACAA
GTCATTACAA
345
CCCTCAAGCT
CCCTCAAGCT
CCCTCAAGCT
CCCTCAAGCT
CCCTCAAGCT
CCCTCAAGCT
CCCTCAAGCT
CCCTCAAGCT
CCCTCAAGCT
CTCTGTTGCT
CTCTGTTGCT
CTCTGTTGCT
CTCTGTTGCT
CTCTGTTGCT
CTCTGTTGCT
CTCTGTTGCT
CTCTGTTGCC
CTCTGTTGCT
115
----CCGCCA
GCGCCCGCCA
----CCGCCA
----ACGCCA
----CCGCCA
----CCGCCA
----CCGCCA
----CCGCCA
----CCGCCA
ITS 1 5.8S
175
AATAAACTAA
AATAAACTAA
AATAAACTAA
AATAAACTAA
AATAAACTAA
AATAAACTAA
AATAAACTAA
AATAAACTAA
AATAAACTAA
235
AAATGCGATA
AAATGCGATA
AAATGCGATA
AAATGCGATA
AAATGCGATA
AAATGCGATA
AAATGCGATA
AAATGCGATA
AAATGCGATA
355
CTGCTTGGAA
CTGCTTGGTA
CTGCTTGGAA
CTGCTTGGAA
CTGCTTGGAA
CTGCTTGGAA
CTGCTTGGAA
CTGCTTGGAA
CTGCTTGGAA
90
365
375
TTGGGCACCG
TTGGGCTCCG
TTGGGCACCG
TTGGGCACCG
TTGGGCACCG
TTGGGCACCG
TTGGGCACCG
TTGGGCACCG
TTGGGCACCG
TCCTCACTGC
TCCTC--CAC
TCCTCACTGC
TCCTCACTGC
TCCTCACTGC
TCCTCACTGC
TCCTCACTGC
TCCTCACTGC
TCCTCACTGC
425
435
B. rh.
B. ribis
L.th.Cur.
L.th.Ber.
L.th.Grav.
L.th.Lar.
L.th.M.Fo.
L.th.M.Fru.
L.th.Pi.
CAAGCGTAGT
CAAGCGTAGT
CAAGCGTAGT
CAAGCGTAGT
CAAGCGTAGT
CAAGCGTAGT
CAAGCGTAGT
CAAGCGTAGT
CAAGCGTAGT
AGAATACACC
AGAAAACACC
AGAATACACC
AGAATACACC
AGAATACACC
AGAATACACC
AGAATACACC
AGAATACACC
AGAATACACC
485
495
B. rh.
B. ribis
L.th.Cur.
L.th.Ber.
L.th.Grav.
L.th.Lar.
L.th.M.Fo.
L.th.M.Fru.
L.th.Pi.
CTGAACTTTT
TGAATTATTT
CTGAACTTTT
CTGAACTTTT
CTGAACTTTT
CTGAACTTTT
CTGAACTTTT
CTGAACTTTT
CTGAACTTTT
CTCAAGGTTG
CTCAAGGTTG
CTCAAGGTTG
CTCAAGGTTG
CTCAAGGTTG
CTCAAGGTTG
CTCAAGGTTG
CTCAAGGTTG
CTCAAGGTTG
Figura 12
B. rh.
B. ribis
L.th.Cur.
L.th.Ber.
L.th.Grav.
L.th.Lar.
L.th.M.Fo.
L.th.M.Fru.
L.th.Pi.
385
GGACGCGCCT
GGACGCGCCT
GGACGCGCCT
GGACGCGCCT
GGACGCGCCT
GGACGCGCCT
GGACGCGCCT
GGACGCGCCT
GGACGCGCCT
445
TCGCTTTGGA
TCGCTTTGGA
TCGCTTTGGA
TCGCTTTGGA
TCGCTTTGGA
TCGCTTTGGA
TCGCTTTGGA
TCGCTTTGGA
TCGCTTTGGA
395
405
CAAAGACCTC
TAAAGACCTC
CAAAGACCTC
CAAAGACCTC
CAAAGACCTC
CAAAGACCTC
CAAAGACCTC
CAAAGACCTC
CAAAGACCTC
GGCGGTGGCT
GGCGGTGGCG
GGCGGTGGCT
GGCGGTGGCT
GGCGGTGGCT
GGCGGTGGCT
GGCGGTGGCT
GGCGGTGGCT
GGCGGTGGCT
455
GCGGTTGGCG
GCGCACGGCG
GCGGTTGGCG
GCGGTTGGCG
GCGGTTGGCG
GCGGTTGGCG
GCGGTTGGCG
GCGGTTGGCG
GCGGTTGGCG
415
GTTCAGCCCT
TCTTG--CCT
GTTCAGCCCT
GTTCAGCCCT
GTTCAGCCCT
GTTCAGCCCT
GTTCAGCCCT
GTTCAGCCCT
GTTCAGCCCT
ITS 2 28S
465
475
TCGCCCGCCG
TCGCCCGCCG
TCGCCCGCCG
TCGCCCGCCG
TCGCCCGCCG
TCGCCCGCCG
TCGCCCGCCG
TCGCCCGCCG
TCGCCCGCCG
GACGAACCTT
GACGAACCTT
GACGAACCTT
GACGAACCTT
GACGAACCTT
GACGAACCTT
GACGAACCTT
GACGAACCTT
GACGAACCTT
505
ACCTCGG
ACCTCGG
ACCTCGG
ACCTCGG
ACCTCGG
ACCTCGG
ACCTCGG
ACCTCGG
ACCTCGG
91
92
93
M
pb
2000
1650
1000
850
650
500
400
300
200
Grupo 1
Grupo 2
94
B. ribis L. th.Cur.
Cdigo
B. rh.
1.000
B. ribis
0.157
1.000
L.th.Cur.
0.295
0.196
1.000
L.th.Ber.
0.246
0.173
0.620
1.000
L.th.Grav.
0.258
0.181
0.542
0.722
1.000
L.th.Lar.
0.245
0.126
0.377
0.508
0.482
1.000
L.th.M.Fo.
0.163
0.203
0.292
0.387
0.360
0.206
1.000
L.th.M.Fru.
0.163
0.203
0.292
0.387
0.360
0.206
1.000
1.000
L.th.Pi.
0.163
0.203
0.292
0.387
0.360
0.206
1.000
1.000
1.000
95
96
97
(2001), tambm atua como fonte de carbono para a nutrio do fungo, sendo a
hidrlise enzimtica mediada pela -1,3-glucanase (GIESE et al. 2005).
Considerando-se hipotticamente a ao conjunta das lacases com
as -1,3-glucanases em pelo menos um processo importante do desenvolvimento do
fungo, pode-se inferir que a semelhana do perfil da sntese tanto de lacases como
de -1,3-glucanases dentro dos dois grupos diferenciados por RAPD, esteja
relacionada com a ao de presses seletivas semelhantes sobre ambas, o que
explicaria a correlao entre os nveis de produo destas enzimas e o agrupamento
obtido pelos ndices de similaridade gentica.
Ao contrrio da produo de lacases e -1,3-glucanases, os dados
de pectinases no apresentaram correlao entre produo desta enzima e o perfil
obtido de RAPD, (exceo B. ribis). Vargas et al. (2003) em seus estudos com a
atividade enzimtica proteoltica e quitinoltica de 5 linhagens de Nomuraea rileyi,
tambm demonstraram que no houve nenhuma correlao nestes microrganismos
com a produo de enzimas.
98
6 CONSIDERAES FINAIS
6.1 Na ausncia do AV, observou-se variao no perfil de produo de lacases e -1,3glucanases entre os nove isolados fungicos, enquanto que no perfil de produo de
pectinases, no foi observada diferena significativa entre os isolados. Trs
isolados se destacaram como produtores constitutivos de lacases (B.rh., L.th.Cur. e
L.th.Lar.), enquanto que apenas um isolado se destacou como produtor de -1,3glucanases (B.ribis).
99
REFERNCIAS
100
101
102
103
Cincia
&
104
GIL-AD, N. L.; BAR-NUN, N.; MAYER, A. M. The possible function of the glucan
sheath of Botrytis cinerea: effects on the distribution of enzyme activities. FEMS
Microbiology Letters, Amsterdam, v. 199, p. 109-113, May 2001.
GIRARD, B.; FUKUMOTO, L. R. Apple juice clarification using microfiltration and
ultrafiltration polymeric membranes. Lebensmittel-Wissenschaft und Technologie,
London, v. 32, n. 5, p. 290-298, 1999.
GOLD, M. H.; ALIC, M. Molecular biology of the lignin-degrading basidiomycete
Phanerochete chrysosporium. Microbiology Reviews, Washington, v. 57, p. 605622, 1993.
GOODWIN, D. C.; AUST, S. D.; GROVER, T. A. Evidence for veratryl alcohol as a
redox mediator in lignin peroxidase-catalysed oxidation. Biochemistry, Washington,
v. 34, p. 5060-5065, 1995.
GUARRO, J.; GEN, J; STCHIGEL, A. M. Developments in fungal taxonomy.
Clinical Microbiology Reviews, Washington, v. 12, n. 3, p. 454-500, Jul. 1999.
GUMMADI, S. N.; KUMAR, D. S. Microbial pectic transeliminases. Biotechnology
Letters, Dordrecht, v. 27, n. 7, p. 451-458, Apr. 2005.
HADJ-TAIEB, N.; AYADI, M.; TRIGUI, S.; BOUABDALLAH, F.; GARGOURI, A.
Hyperproduction of pectinase activities by a fully constitutive mutant (CT1) of
Penicillium occitanis. Enzyme and Microbial Technology, New York, v. 30, n. 5, p.
662-666, May 2002.
HAHN, R. C.; MACEDO, A. M.; FONTES, C. J. F.; BATISTA, R. D.; SANTOS, N. L.;
HAMDAN, J. S. Randomly amplified polymorphic DNA as a valuable tool for
epidemiological studies of Paracoccidioides brasiliensis. Journal of Clinical
Microbiology, Washington, v. 41, n. 7, p. 2849-2854, Jul. 2003.
HALL, T.A. BioEdit: A user-friendly biological sequence alignment editor and analysis
program for Windows 95/98/NT. Nucleic Acids Symposium Series, Oxon, v. 41, p.
95-98, 1999.
HEID, C. A.; STEVENS, J.; LIVAK, K. L.; WILLIAMS, P. M. Real time quantitative
PCR. Genome Research, New York, v. 6, p. 986-994, Oct. 1996.
HENRY, T.; IWEN, P. C.; HINRICHS, S. H. Identification of Aspergillus species using
internal transcribed spacer regions 1 and 2. Journal of Clinical Microbiology,
Washington, v. 38, n. 4, p. 1510-1515, Apr. 2000.
HERBERT, C.; JACQUET, C.; BOREL, C.; ESQUERR-TUGAY, M. T.; DUMAS, B.
A cis-acting sequence homologous to the yeast filamentation and invasion response
element regulates expression of a pectinase gene from the bean pathogen
Colletotrichum lindemuthianum. Journal of Biological Chemistry, Bethesda, v. 277,
n. 32, p. 29125-29131, Aug. 2002.
HOONDAL, G. S.; TIWARI, R. P.; TIWARI, R.; DAHIYA, N.; BEG, Q. K. Microbial
alkaline pectinases and their applications: a review. Applied Microbiology and
Biotechnology, Heidelberg, v. 59, p. 409-418, 2000.
105
106
107
MAYER, A.M.; STAPLES, R.C. Laccase, new functions for an old enzyme.
Phytochemistry, v. 60, n. 6, p. 551565, Jul. 2002.
McCLENDON, J. H.; SOMERS, G. F.; HEUBERGER, J. W. The occurrence of a
variety of enzymes hydrolysing cell wall polysaccharides in apples rotted by
Botryosphaeria ribis. Phytopathology, St. Paul, v. 50, n. 4, p. 258-261, 1960.
MESSERSCHMIDT, A. Multi-Copper oxidases. Singapore: World Scientific, 1997.
MINUSSI, R. C.; PASTORE, G. M.; DURN, N. Potential applications of laccase in
the food industry. Trends in Food Science & Technology, Kidlington, v. 13, n. 6, p.
205-216, 2002.
MORA, D.; FORTINA, M. G.; PARINI, C.; RICCI, G.; GATTI, M.; GIRAFFA, G.;
MANACHINI, P. L. Genetic diversity and technological properties of Streptococcus
thermophilus strains isolated from dairy products. Journal of Applied Microbiology,
Oxford, v. 93, n. 2, p. 278-287, 2002.
MULLIS, K; FALLONA, F. Specific synthesis of DNA in vitro via a polymerase
catalysed chain reaction. Methods in Enzymolology, [New York], v. 55, p. 335,
1987.
NATIONAL CENTER FOR BIOTECHNOLOGY INFORMATION.
Disponvel em: < www.ncbi.nih.gov>. Acesso em: 8 de outubro de 2005
Nucleotide.
108
109
ROJAS, L.; FRAGA, J.; SARIEGO, I.; Genetic variability between Trichomonas
vaginalis isolates and correlation with clinical presentation. Infection, Genetics and
Evolution, Amsterdam, v. 4, n. 1, p. 53-58, Mar. 2004.
RONCERO, M. I. G.; di PETRO, A.; RUIZ-ROLDN, M. C.; HUERTAS-GONZLEZ,
M. D.; GARCIA-MACEIRA, F. I.; MGLEEZ, E.; JIMNEZ, A.; CARACUEL, Z.;
SANCHO-ZAPATERO, R.; HERA, C.; GMEZ-GMEZ, E.; RUIZ-RUBIO, M.;
GONZALEZ-VERDEJO, C. I.; PEZ, M. J. Papel de enzimas lticas de la pared
cellular en la patogenicidad de Fusarium oxysporum. Revista Iberoamericana de
Micologia, Bilbao, v. 17, n. 1, p. S47-S53, 2000.
ROSATTO, S. S.; FREIRE, R. S.; DURN, N.; KUBOTA, L. T. Amperometric
biosensors for phenolic compounds determination in the environmental interess
samples. Qumica Nova, So Paulo, v. 24, n. 1, p. 77-86, Jan./Feb. 2001.
ROUX, J.; WINGFIELD, M.J. Survey and virulence of fungi occuring on diseased
Acacia Mearnsii in South Africa. Forest Ecology and Management, Amsterdam, v.
99, n. 3, p. 327-336, Dec. 1997.
SAITOU, N.; NEI, M. The Neighbor-joining Method: A New Method for
Reconstructing Phylogenetic Trees. Molecular Biology and Evolution, Paris, v. 4,
n. 4, p. 406-425, Jul. 1987.
SALIGKARIAS, I. D.; GRAVANIS, F. T.; EPTON, H. A. S. Biological control of
Botrytis cinerea on tomato plants by the use of epiphytic yeasts Candida
guilliermondii strains 101 and US 7 and Candida oleophila strain I-182: II. A study on
mode of action. Biological Control, San Diego, v. 25, n. 2, p.151-161, Oct. 2002.
SALOHEIMO, M.; NIKUPAAVOLA, M. L.; KNOWLES, J. K. C. Isolation and structural
analysis of the laccase gene from the lignin-degrading fungus Phlebia-radiata.
Journal of General Microbiology, Reading, v. 137, pt. 7, p. 1537-1544, Jul. 1991.
SAMBROOK, J.; RUSSEL, D. W. Molecular cloning. A laboratory manual. 3rd ed.
New York: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2001.
SANCHEZ, M. E.; VENEGAS, J.; ROMERO, M. A.; PHILLIPS, A. J. L.; TRAPERO,
A. Botryosphaeria and related taxa causing oak canker in southwestern Spain. Plant
Disease, St. Paul, v. 87, n. 12, p. 1515-1521, Dec. 2003.
SANGER, F.; NICKLEN, S.; COULSON, A. R. DNA sequencing with chainterminating inhibitors. Proceedings of the National Academy of Sciences of the
United States of America, Washington, v. 74, n. 12, p. 5463-5467, 1977.
SANTOS, T.; VILLANUEVA, J. R.; NOMBELA, N. Production and catabolite
repression of Penicillium-italicum beta-glucanases. Journal of Bacteriology,
Washington, v. 129, n. 1, p. 52-58, Jan. 1977.
SARTORI, D. Marcadores moleculares para deteco de espcies de
Aspergillus produtoras de ocratoxina a em gros de caf. 2005. Dissertao
(Mestrado em Gentica e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Londrina,
Londrina.
110
111
112
113
114
ARTIGO
115
116