Gua Docente:

BIOQUMICA
AMBIENTAL

FACULTAD DE CIENCIAS QUMICAS

UNIVERSIDAD COMPLUTENSE DE MADRID
CURSO 2014-2015

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Bioqumica Ambiental
AAmbienteAmbiente
I.- IDENTIFICACIN
NOMBRE DE LA ASIGNATURA:
NMERO DE CRDITOS:
CARCTER:
MATERIA:
MDULO:
TITULACIN:
SEMESTRE/CUATRIMESTRE:
DEPARTAMENTO/S:

Bioqumica Ambiental
6
Optativa
Complementos Avanzados en Qumica
Avanzado
Grado en Qumica
Segundo semestre (cuarto curso)
Bioqumica y Biologa Molecular I

PROFESOR/ES RESPONSABLE/S:
Teora
Seminario
Tutora

Profesor:
Departamento:
Despacho:
e-mail:

JAVIER TURNAY ABAD

Bioqumica y Biologa Molecular I
L-13, 4 planta, QA
turnay@bbm1.ucm.es

Teora
Seminario
Tutora

Profesor:
Departamento:
Despacho:
e-mail:

JOS IGNACIO RODRGUEZ CRESPO

Bioqumica y Biologa Molecular I
L-3 o despacho 6, 4 planta, QA
nacho@bbm1.ucm.es

II.- OBJETIVOS
OBJETIVO GENERAL
Proporcionar al estudiante una visin general de los ciclos biogeoqumicos y de los
organismos implicados en ellos, de los mecanismos moleculares de toxicidad de los
principales contaminantes medioambientales, as como de los procesos de
biorremediacin empleando microorganismos y plantas.
OBJETIVOS ESPECFICOS
Conocer y clasificar los organismos implicados en los distintos ciclos
biogeoqumicos en funcin de la fuente de energa, carbono y poder reductor
empleadas.
Conocer las principales rutas biosintticas y de obtencin de energa de los
organismos implicados en ciclos biogeoqumicos especficos.
Analizar los principales sistemas enzimticos implicados en reacciones de
destoxificacin en animales y plantas.
Estudiar los mecanismos moleculares de accin especficos o de toxicidad de
pesticidas y de otros contaminantes medioambientales, as como los mecanismos
biolgicos de defensa frente a los mismos.
Analizar los mecanismos biolgicos/bioqumicos implicados en procesos de
biorremediacin de distintos tipos de contaminantes empleando plantas o
microorganismos.

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Bioqumica Ambiental
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III.- CONOCIMIENTOS PREVIOS Y RECOMENDACIONES

CONOCIMIENTOS PREVIOS:
RECOMENDACIONES:
Se recomienda haber cursado y superado la asignatura Bioqumica.

IV.- CONTENIDOS
BREVE DESCRIPCIN DE LOS CONTENIDOS:
Organismos vivos y su interrelacin con el entorno. Contaminacin. Ciclos
biogeoqumicos. Toxicologa: fases cintica y dinmica de los contaminantes.
Reacciones de fase I y fase II. Contaminantes ambientales ms frecuentes. Mecanismos
moleculares de los efectos txicos o de su actividad especfica. Mecanismos biolgicos
de defensa y reparacin. Biorremediacin de la contaminacin mediante
microorganismos y plantas.
PROGRAMA:
A. INTRODUCCIN
1. Introduccin a la Bioqumica Ambiental. Biosfera: flujo de materia y energa y
principales organismos implicados en los ciclos biogeoqumicos. Atmsfera:
composicin qumica, reacciones y contaminantes. Hidrosfera: solubilidad de gases
y contaminacin. Litosfera: composicin de suelos, nutrientes y fertilizantes, y
contaminacin.
B. CICLOS BIOGEOQUMICOS
2. Ciclo del oxgeno. Produccin y consumo de oxgeno por los seres vivos:
fotosntesis y respiracin. Metabolismo energtico aerobio. Fosforilacin oxidativa
y sntesis de ATP.
3. Ciclo del carbono. Relacin con el ciclo del oxgeno. Fotosntesis. Fotolisis del
agua: produccin de ATP y NADPH. Asimilacin de dixido de carbono: ciclo de
Calvin. Fotorrespiracin y adaptaciones fotosintticas a temperaturas elevadas.
4. Ciclo del metano. Metangenos: ruta bioenergtica y ruta biosinttica.
Metanotrofos y metilotrofos: ruta bioenergtica. Rutas biosintticas: vas de la
ribulosa-5-fosfato y de la serina.
5. Ciclo del nitrgeno. Fijacin biolgica del nitrgeno. Asimilacin del amonio y
sntesis de aminocidos. Amonificacin y nitrificacin. Absorcin y reduccin
asimilatoria de nitratos. Desnitrificacin.
6. Ciclos del azufre y del hierro. Bacterias del azufre. Reduccin desasimilatoria de
sulfatos. Reduccin bacteriana del hierro frrico. Oxidacin bacteriana de sulfuros
y del hierro: biolixiviacin de metales.

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C. BIOTRANSFORMACIN Y MECANISMOS DE TOXICIDAD DE CONTAMINANTES EN
ANIMALES Y EN PLANTAS

7. Metabolismo de xenobiticos. Esquema general. Reacciones de oxidacin:

citocromos P450. Reacciones de reduccin e hidrlisis.
8. Reacciones de fase II. Glucuronilacin y otras reacciones de fase II en animales.
Reacciones de fase II en plantas.
9. Toxicidad de contaminantes orgnicos. Plaguicidas como principales contaminantes
de suelos: persistencia. Herbicidas: mecanismos de accin e inespecificidad.
Efectos de los insecticidas sobre la neurotransmisin.
10. Mecanismos de accin de dioxinas, dibenzofuranos polihalogenados y bifenilos
polihalogenados. Toxicidad de otros contaminantes orgnicos.
11. Toxicidad de contaminantes inorgnicos. Elementos y compuestos metlicos.
Acciones a nivel molecular de metales pesados y otros metales. Mecanismos
biolgicos de defensa.
12. Contaminantes inorgnicos gaseosos. Monxido de carbono. xidos de azufre.
xidos de nitrgeno y nitritos. Toxicidad del ozono y del smog fotoqumico.
Generacin de radicales libres y especies reactivas de oxgeno: toxicidad y
mecanismos de eliminacin y reparacin.
13. Accin de contaminantes sobre el DNA. Tipos de mutaciones. Mutagnesis
espontnea. Mutagnesis por agentes fsicos: efecto de radiaciones ionizantes y de
la radiacin UV.
14. Mutagnesis por agentes qumicos. Sistemas de reparacin del DNA.
D. BIORREMEDIACIN DE LA CONTAMINACIN
15. Biorremediacin por plantas y hongos. Manipulacin gentica de plantas:
aplicaciones ambientales. Fitorremediacin de suelos contaminados.
16. Bioeliminacin de contaminantes mediante el uso de microorganismos.
Degradacin de hidrocarburos del petrleo. Desulfuracin del petrleo.
Degradacin de pesticidas. Tratamiento microbiolgico de aguas contaminadas por
metales.

V.- COMPETENCIAS
GENERALES:
o CG1-MA1:

Reconocer y valorar los procesos qumicos en la vida diaria.

o CG2-MA1:

Valorar la importancia de la Qumica y su impacto en la sociedad

industrial y tecnolgica.

o CG2-MA2:

Relacionar reas interdisciplinares en plena expansin, y tomar

conciencia de la importancia que la investigacin interdisciplinar
tiene en el avance de la Ciencia.

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o CG3-MA1:

Demostrar una base de conocimientos y habilidades con las que

pueda continuar sus estudios en reas especializadas de Qumica o
en reas multidisciplinares.

o CG4-MA1:

Plasmar los conocimientos especficos de cada materia en el

lenguaje cientfico, universal, entendido y compartido
interdisciplinarmente.

o CG8-MA1:

Valorar investigaciones y estudios detallados en el campo de la

Qumica.

ESPECFICAS:
o CE17-MACQ1: Reconocer los principales mecanismos moleculares de defensa
frente a la accin txica de sustancias procedentes del medio
ambiente.
o CE17-MACQ2: Explicar y proponer procesos de biorremediacin mediante el
empleo de plantas o de microorganismos naturales o modificados
genticamente.
o CE17-MACQ3: Analizar problemas medioambientales actuales y su repercusin
desde un punto de vista bioqumico en los seres vivos y su
entorno.
o CE18-MACQ1: Identificar los principales contaminantes ambientales y formular
las principales vas de actuacin bioqumica de xenobiticos, y su
relacin con los mecanismos de actuacin de sustancias
endgenas.
o CE20-MACQ1: Identificar los principales organismos implicados en los ciclos
biogeoqumicos y en biorremediacin, y las rutas metablicas
energticas y biosintticas implicadas.

TRANSVERSALES:
o CT1-MA1:

Elaborar y escribir memorias e informes de carcter cientfico y

tcnico.

o CT2-MA1:

Trabajar en equipo.

o CT5-MA1:

Consultar, utilizar y analizar cualquier fuente bibliogrfica.

o CT5-MA2:

Manejar bibliografa y bases de datos especializadas, y de recursos

accesibles a travs de Internet.

o CT8-MA1:

Comunicarse en espaol utilizando los medios audiovisuales ms

habituales.

o CT11-MA1:

Desarrollar trabajo autnomo.

o CT12-MA1:

Desarrollar sensibilidad hacia

preservacin del medioambiente.

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temas

medioambientales

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VI. RESULTADOS DE APRENDIZAJE
Al finalizar esta asignatura, el estudiante debe ser capaz de:
Identificar los principales organismos implicados en los ciclos biogeoqumicos y en
procesos de biorremediacin.
Describir el papel desempeado por los elementos abiticos en los seres vivos.
Establecer qu organismos participan en los ciclos del oxgeno, carbono, nitrgeno,
azufre, hierro y fsforo en la Biosfera.
Conocer los mecanismos moleculares generales por los que los distintos organismos
obtienen energa, as como las rutas biosintticas especficas de cada uno de ellos.
Describir las reacciones generales de destoxificacin de xenobiticos en animales y
en plantas, as como enumerar los sistemas enzimticos fundamentales implicados en
dichos procesos.
Clasificar e identificar los distintos tipos de plaguicidas, describiendo sus
mecanismos de actuacin y su posible toxicidad en animales y plantas.
Describir la base molecular de la toxicidad de distintos tipos de contaminantes, tanto
de naturaleza orgnica como inorgnica.
Enumerar los sistemas biolgicos de defensa frente a distintos tipos de
contaminantes.
Enumerar los tipos ms frecuentes de mutaciones, as como los agentes
medioambientales que pueden originarlas y los sistemas enzimticos que las pueden
llegar a corregir.
Definir el concepto de fitorremediacin y clasificar las distintas tcnicas que se
emplean actualmente, indicando el tipo de contaminante hacia el que van dirigidas.
Describir las principales vas metablicas de bioeliminacin por microorganismos de
la contaminacin por hidrocarburos, pesticidas u otros contaminantes orgnicos,
tanto en condiciones aerbicas como anaerbicas.
Enumerar los tipos bacterianos capaces de degradar hidrocarburos azufrados
recalcitrantes y describir las rutas metablicas de mayor inters econmico y
medioambiental.
Esquematizar los principales tipos de tratamientos microbiolgicos de aguas
contaminadas por metales.

VII. HORAS DE TRABAJO Y DISTRIBUCIN POR ACTIVIDAD

Presencial
(horas)

Trabajo
autnomo
(horas)

Crditos

Clases tericas

39

61

4,0

Seminarios

14

0,8

Tutoras/Trabajos dirigidos

0,4

Laboratorios

Preparacin de trabajos y exmenes

15

0,8

52

98

Actividad

Total

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VIII.- METODOLOGA
Las actividades formativas para adquirir las competencias en Bioqumica Ambiental
estn centradas en un conjunto de clases tericas, donde se exponen de forma clara los
objetivos de los distintos temas a tratar durante el curso, as como se desarrollan los
contenidos fundamentales. En dichas clases se pone a disposicin de los alumnos
abundante material grfico, esquemas y vdeos que permiten una mejor compresin de los
aspectos desarrollados. Todo este material adicional se pone a disposicin de los alumnos
como fotocopias o bien en soporte informtico a travs del Campus Virtual.
De forma complementaria a las clases tericas, se fomentar la participacin de los
alumnos en seminarios especializados en distintos temas de actualidad relacionados con
el temario de la asignatura que podrn ser impartidos bien por especialistas en el tema o
bien por los propios alumnos como resultado de la realizacin de trabajos de revisin
bibliogrfica. stos ltimos estarn ayudados por tutoras dirigidas en las cuales se
orientar a los alumnos en las tcnicas ms importantes de bsqueda de informacin
cientfica bien a travs de bsquedas bibliogrficas de revisiones o trabajos especializados,
bien a travs de consultas a travs de Internet de distintas pginas web de grupos
implicados en investigaciones sobre los temas escogidos. Los trabajos desarrollados por los
alumnos se expondrn en pblico, lo que redundar en su beneficio, ya que permite el
afianzamiento de los conocimientos adquiridos y les facilitar en un futuro la exposicin
de sus trabajos de investigacin.

IX.- BIBLIOGRAFA
BSICA:
Al principio de curso se comentar la bibliografa recomendada, indicando los aspectos
ms relevantes de cada texto. No se va a seguir un libro de texto concreto para el
desarrollo de la asignatura, ya que se trata de una asignatura multidisciplinar y algunos
de los temas estn basados en artculos recientes publicados en revistas cientficas. En
caso necesario, adems de estos textos, se indicar a los alumnos la bibliografa
especfica para cada tema o artculos de investigacin y revisiones actualizadas. A
continuacin se relacionan textos recomendados de carcter general.
o Tymoczko, Berg y Stryer. Bioqumica. Curso bsico, 2 edicin. Ed. Revert
(2014)
o Stryer, Berg y Tymoczko: Bioqumica con aplicaciones clnicas, 7 edicin. Ed.
Revert (2013).
o Mller-Esterl: Bioqumica. Fundamentos para medicina y ciencias de la vida, 1
edicin. Ed. Revert (2008).
o Lodish: Biologa celular y molecular, 5 edicin. Ed. Mdica Panamericana
(2005).
o Madigan, Martinko, Dunlap y Clark: Brock. Biologa de los microorganismos,
12 edicin. Ed. Prentice Hall/Addison-Wesley (2009).

COMPLEMENTARIA:
o Thieman y Palladino: Introduccin a la biotecnologa, 1 edicin. Ed. Pearson
Educacin (2010).
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o Renneberg: Biotecnologa para principiantes, 1 edicin. Ed. Revert (2008).
o Manahan: Introduccin a la qumica ambiental, 1 edicin. Ed. Revert (2007)

X.- EVALUACIN
Para poder acceder a la evaluacin final ser necesario que el alumno haya participado al
menos en el 70% de total de sesiones en que se reparten las actividades presenciales. El
rendimiento acadmico del alumno y la calificacin final de la asignatura se computarn de
forma ponderada, atendiendo a los porcentajes que se muestran en cada uno de los aspectos
recogidos a continuacin. Todas las calificaciones estarn basadas en la puntuacin
absoluta sobre 10 puntos de acuerdo con la escala establecida en el RD 1125/2003. Ser
necesario alcanzar 5 puntos entre todas las actividades para aprobar la asignatura. Este
criterio se mantendr en todas las convocatorias.
TRABAJO PERSONAL Y ACTIVIDADES DIRIGIDAS:

30%

Se considerarn en este apartado los trabajos de revisin bibliogrfica sobre diferentes

aspectos relacionados con los contenidos de la asignatura as como su exposicin. La
calificacin obtenida por el alumno en junio por este concepto se mantendr en la
convocatoria de septiembre.
Competencias evaluadas: CG1-MA1, CG2-MA1, CG2-MA2, CG3-MA1, CG4-MA1,
CG8-MA1, CE17-MACQ1, CE17-MACQ2, CE17-MACQ3, CE18-MACQ1, CE20MACQ1, CT1-MA1, CT2-MA1, CT5-MA1, CT5-MA2, CT8-MA1, CT11-MA1,
CT12-MA1.
EXMENES ESCRITOS:

70%

Convocatoria de junio: el examen final tendr lugar al finalizar el segundo semestre, en

la fecha, hora y lugar previamente fijado por las autoridades acadmicas del centro. La
calificacin de este examen supondr un 70% de la calificacin final, siendo necesaria,
a efectos de ponderacin con las otras calificaciones, que el alumno obtenga al menos
una calificacin de 4 puntos (sobre 10).
Convocatoria de septiembre: a aquellos alumnos que no alcancen el mnimo de cuatro
puntos exigido en el examen final de junio, o que la media ponderada de todos los
elementos de valuacin no alcance la calificacin de 5 puntos, se les realizar otro
examen en la convocatoria de septiembre. Para la calificacin final de esta
convocatoria extraordinaria se mantendrn los mismos criterios de calificacin mnima
y media ponderada que para la convocatoria ordinaria de junio.
Competencias evaluadas: CG1-MA1, CG2-MA1, CG2-MA2, CG4-MA1, CG8-MA1
CE17-MACQ1, CE17-MACQ2, CE17-MACQ3, CE18-MACQ1, CE20-MACQ1,
CT11-MAQA.
PARTICIPACION ACTIVA:
La asistencia a todas las actividades presenciales es obligatoria, y la participacin activa
del alumno en todas las actividades docentes se valorar positivamente en la calificacin
final.

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Bioqumica Ambiental

PLANIFICACIN DE ACTIVIDADES CRONOGRAMA

TEMA
1. Introduccin a la Bioqumica Ambiental.
2. Ciclos biogeoqumicos.
3. Biotransfromacin y mecanismos de toxicidad de
contaminantes en animales y plantas.
4. Biorremediacin de la contaminacin.

ACTIVIDAD

HORAS

GRUPOS

Clases Teora

Seminario

Clases Teora

11

Seminario

Clases Teora

19

Seminario

Clases Teora

Seminario

Tutora programada*

* Las semanas de las tutoras programadas dependen de la planificacin del resto de asignaturas del curso.

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INICIO

FIN

1 semana

2 semana

3 semana

7 semana

7 semana

14 semana

14 semana

15 semana

Por determinar

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Bioqumica Ambiental
RESUMEN DE LAS ACTIVIDADES

Actividad
docente

Competencias asociadas

CG1-MA1, CG2-MA1,
Clases de teora CG2-MA2, CG4-MA1,
CG8-MA1, CE17-MACQ1,
CE17-MACQ2, CE17MACQ3, CE18-MACQ1,
CE20-MACQ1, CT1-MA1,
CT2-MA1, CT5-MA1,
Seminarios
CT5-MA2, CT8-MA1,
CT11-MA1, CT12-MA1

Actividad Profesor

Actividad alumno

Exposicin de aspectos
tericos de la asignatura

Toma de apuntes. Formulacin

de preguntas y dudas.

Exposicin de trabajos
terico-prcticos
relacionados con el temario
de la asignatura.

Exposicin de trabajos tericoprcticos relacionados con el

temario de la asignatura.
Formulacin de preguntas y
dudas

Procedimiento de
evaluacin

Valoracin de la
participacin y de
las respuestas a
preguntas
relacionadas con
los conceptos
tericos o prcticos
explicados.

Tutoras/
Trabajo
personal

CG1-MA1, CG2-MA1,
CG2-MA2, CG3-MA1,
CG4-MA1, CG8-MA1,
CE17-MACQ1, CE17MACQ2, CE17-MACQ3,
CE18-MACQ1, CE20MACQ1, CT1-MA1, CT2MA1, CT5-MA1, CT5MA2, CT8-MA1, CT11MA1, CT12-MA1

Direccin y supervisin del

estudio y actividades del
alumno. Elaboracin y
propuesta de trabajos.
Valoracin crtica de los
mismos.

Consulta al profesor sobre las

dificultades conceptuales y
metodolgicas que encuentra al
estudiar la materia.
Planteamiento de cuestiones y
respuesta a las propuestas por el
profesor.

Exmenes/
Controles

CG1-MA1, CG2-MA1,
CG2-MA2, CG4-MA1,
CG8-MA1 CE17-MACQ1,
CE17-MACQ2, CE17MACQ3, CE18-MACQ1,
CE20-MACQ1, CT11MAQA

Propuesta, vigilancia y
correccin de los controles.
Calificacin del alumno.

Calificacin de los
Preparacin y realizacin de los
exmenes
exmenes y/o controles.
realizados.

P : Presenciales; NP: no presenciales (trabajo autnomo); C: calificacin

-10-

NP

Total

39

61

100

14

20

30%

10

15

20

70%