Tema 7.

Actividad enzimtica
Definicin, clasificacin y nomenclatura de las enzimas

Coenzimas y cofactores

Mecanismos de la catlisis enzimtica

Centro activo y especificidad

Tipos de catlisis

Generalidades Enzimas
Catalizadores biolgicos especficos que aumentan la velocidad de las
reacciones bioqumicas.
Aumentan la velocidad de reaccin hasta por un factor de 1017

Casi todas las enzimas son protenas excepto las ribozimas (formadas por
RNA slo o asociado a protenas)

Generalidades Enzimas
Las enzimas son necesarias para que las reacciones bioqumicas:
Se produzcan a una velocidad adecuada para la clula
Se dirijan hacia rutas tiles y necesarias segn necesidades energticas
y necesidad de produccin de distintas sustancias.
Caractersticas
Gran poder cataltico

Alto grado de especificidad

Actan en soluciones acuosas en condiciones determinadas de T y pH
Su actividad puede regularse
Importancia
Agricultura
Industria alimentaria
Medicina

Generalidades Enzimas
Caractersticas catalticas

E+S

ES

E+P

Las enzimas aceleran las reacciones multiplicando su velocidad.

No se alteran en el proceso, no se modifican en su actuacin.
No llevan a cabo reacciones que sean energticamente desfavorables, no
modifican la constante de equilibrio de la reaccin, sino que aceleran su
consecucin.

Algunos enzimas necesitan cofactores

A veces la actividad cataltica depende de componente qumico adicional
Cofactor: metales o iones inorgnicos pequeos, Fe, Mg, Mn, Zn, Co

Coenzima: molculas orgnicas pequeas

Apoenzima + Cofactor = Holoenzima

Algunos enzimas necesitan cofactores

Contribuyen alineamiento enzima-sustrato
Sitio adicional de enlace

(FAD)
(NAD)

Vitaminas como cofactores enzimticos

VITAMINAS

FUNCIONES

Enfermedades
carenciales

C (cido
ascrbico)

Coenzima de algunas peptidasas. Interviene en la sntesis de

colgeno

Escorbuto

B1 (tiamina)

Coenzima de las descarboxilasas y de las enzima que

transfieren grupos aldehdos

B2
(riboflavina)

Constituyente de los coenzimas FAD y FMN

B3 (cido
pantotinico)

Constituyente de la CoA

B5 (niacina)

Constituyente de las coenzimas NAD y NADP

B6
(piridoxina)

Interviene en las reacciones de transferencia de grupos

aminos.

B12
(cobalamina)
Biotina

Beriberi

Dermatitis y lesiones
en las mucosas
Fatiga y trastornos del
sueo
Pelagra
Depresin, anemia

Coenzima en la transferencia de grupos metilo.

Anemia perniciosa

Coenzima de las enzimas que transfieren grupos carboxilo, en

metabolismo de aminocidos.

Fatiga, dermatitis...

Nomenclatura de enzimas
Cdigo numrico encabezado por las letras EC (enzyme commission)
Cuatro nmeros separados por puntos
El 1 indica a cual de las seis clases pertenece la enzima
El 2 se refiere a distintas subclases dentro de cada grupo
El 3 y el 4 se refieren a los grupos qumicos especficos que
intervienen en la reaccin.
Nombre sistmico

Sustrato preferente + reaccin + asa

Etanol

Alcohol DH

Alcohol deshidrogenasa

Acetaldehdo
E.C. 1.1.1.1

Clasificacin de enzimas
1.- Oxidorreductasas: Reacciones de oxido-reduccin

2.- Transferasas: Transferencia de grupos intactos de una molcula a

otra

3.- Hidrolasas: Reacciones de hidrlisis

(ruptura de enlaces con participacin del agua)

4.- Liasas: Adicin de grupos a dobles enlaces

(sin participacin del agua)

5.- Isomerasas: Transferencia intramolecular de grupo

(cis/trans, L/D, aldehdo/cetona)

6.- Ligasas: Unin de dos sustratos a expensas de la hidrlisis del ATP

Clasificacin de enzimas

Hidrolasas

Oxidorreductasas
Deshidrogenasas
Oxidasas
Reductasas
Peroxidasas
Catalasas
Oxigenasas
Hidroxilasas

Liasas
Descarboxilasas
Aldolasas
Hidratasas
Deshidratasas
Sintasas
Liasas

Transferasas
Transaldolasas y transcetolasas
Acil-, metil-, glucosil- y fosforil- transferasas
Quinasas
Fosfomutasas

Esterasas
Glucosidasas
Peptidasas
Fosfatasas
Tiolasas
Fosfolipasas
Amidasas
Desaminasas
Ribonucleasas

Isomerasas
Racemasas
Epimerasas
Isomerasas
Mutasas

Ligasas
Sintetasas
Carboxilasas

Mecanismo de catlisis enzimtica

Enzimas aumentan la velocidad sin modificar la constante de equilibrio de la reaccin

Condiciones para una reaccin bioqumica

Los reactivos deben colisionar
La colisin molecular tiene que ocurrir con una orientacin adecuada

Debe haber un equilibrio favorable. La DG0 debe ser negativo

E+S

ES

EP

E+P

Estado de transicin

Estado basal

Estado basal

Mecanismo de catlisis enzimtica

Estado de transicin

Estado basal

Estado basal

Energa de activacin DG0: Energa necesaria para que se alcance el estado de

transicin y que se produzca la reaccin.
Es la energa necesaria para:
Alinear grupos reactivos
Formar cargas inestables transitorias
Reordenar enlaces

Mecanismo de catlisis enzimtica

Estado de transicin

Estado basal

Estado basal

La enzima se une al de sustrato y le hace adoptar un estado intermediario

semejante al de transicin pero de menor energa
Energa de activacin de la reaccin catalizada es menor que la energa de
activacin de la reaccin sin catalizar

Mecanismo de catlisis enzimtica

Modo de accin de los enzimas

Centro activo: Regin del enzima que se une al sustrato y donde se realiza
la catlisis

Es un bolsillo o hendidura tridimensional compuesto por residuos de

aminocidos de diferentes partes de la molcula que producen un
microambiente especfico.

Es relativamente pequeo en comparacin con el volumen total del enzima.

Los sustratos se unen mediante mltiples interacciones dbiles. Las

interacciones proveen de la energa necesaria para reducir la energa de
activacin.

Proporciona la especificidad al enzima.

Especificidad enzimtica: especificidad de sustrato

Modelo llave cerradura (Fischer 1894)

Modelo del ajuste inducido (Koshland 1958)

Bioqumica Mathews, van Holde y Ahern. Addison Wesley 2002

Especificidad enzimtica: especificidad de sustrato

Sustrato

Modelo llave cerradura

(Fischer 1894)

Centro
activo

Complejo ES

Enzima

Sustrato

Modelo del ajuste inducido

(Koshland 1958)

Centro
activo

Complejo ES

Enzima

Especificidad enzimtica: especificidad de sustrato

Cambio conformacional inducido por la glucosa en la hexoquinasa

D-Glucosa

Especificidad enzimtica: estereoespecificidad

Los enzimas son estereoespecficos porque forman varias interacciones entre
aminocidos del centro activo y los distintos grupos del sustrato

2
3

CH2OH
CHOH

CH2OH

Glicerol
Glicerol quinasa

OH

ATP

CH2OH

CH2OPO3

Glicerol

L-Glicerol 3-fosfato
1
2

OH

CH2OH
C

H
H

Especificidad enzimtica: especificidad de funcin

Un mismo compuesto puede ser sustrato de varios enzimas, que lo modifican
de distinta forma.

Glucosa 6 P

DH
Fosfatasa

Isomerasa
Mutasa

6P-Gluconolactona
Glucosa + Pi
Fructosa 6P

Glucosa 1P

Tipos de catlisis

Catlisis cido-base
Catlisis covalente
Catlisis por iones metlicos

Tipos de catlisis
Catlisis cido-base
Reacciones por transformacin intermediarios cargados inestables por
captacin o cesin de H+
A pH fisiolgico [H+] y [OH-] bajas

Enzimas donantes o aceptores de [H+]

Baja velocidad

Aumentan velocidad

Tipos de catlisis
Catlisis cido-base

Triosa fosfato isomerasa

His 95

Glu 165
G3P se une al
centro activo

E + G3P

Intermediario enediol, se
forma por transferencia de
un protn de C2 al Glu 165 y
un protn de His 95 al
carbonilo

E- G3P

E-enediol

DHAP unida al
centro activo

E- DHAP

E + DHAP

Tipos de catlisis
Catlisis covalente
Se forman enlaces covalentes transitorios E-S para facilitar la formacin de
producto. Ej: Transaminaciones

A-B + X:

A-X + B

A + X: + B

X: = Ncleo nucleoflico de la enzima

GRUPOS NUCLEFILOS Y ELECTRFILOS DE IMPORTANCIA BIOLGICA

a)
b)

Grupos nuclefilos en sus formas bsicas

Los grupos electrfilos contienen un tomo con deficiencia de electrones (rojo)

Tipos de catlisis
Catlisis por iones metlicos
Participan de diferentes formas en la catlisis:

Fijando y orientando adecuadamente al sustrato para que reaccione

Estabilizando estados de transicin de compuestos cargados
Intervienen en reacciones redox cambiando su propio estado de oxidacin

SITIO ACTIVO DE LA ANHIDRASA CARBNICA HUMANA

CO2 + H2O

HCO3- + H+