En su trabajo El inconsciente cerebral, Gauchet pretende lo siguiente:
devolver su inscripcin en el devenir al surgimiento de la figura del sujeto escindido de s mismo (...) contra la ilusin anti-histrica a la que nos ha encadenado el movimiento psicoanaltico, extraamente convencido de su nacimiento por generacin espontnea[13] Con el concepto de el inconsciente cerebral Gauchet se refiere a un nuevo modelo del funcionamiento cerebral surgido en el ao 1840, cuando el entonces joven mdico Thomas Laycock comienza a hablar del cerebro como sujeto a las leyes de la accin refleja. El concepto de reflejo haba sido recuperado y reelaborado por Hall y Muller en 1833 convirtindose la funcin refleja de la mdula espinal en un aspecto fundamental de la actividad nerviosa y un dato bsico para la reflexin neurofisiolgica. Pero no es hasta varios aos despus, que Laycock, y tambin William Carpenter, aplican este concepto a la accin del cerebro. Ambos se disputan la prioridad del descubrimiento de la cerebracin inconsciente, expresin introducida por Carpenter en 1853 para dar cuenta de los fenmenos magnticos, en la que Laycock ve una simple transposicin de su funcin refleja cerebral.Tambin Laycock haba llegado a ese concepto para explicar los fenmenos desconcertantes asociados a la histeria; ms adelante lo extender a los fenmenos del sueo y la patologa mental el delirio, el sonambulismo y la locura. Sin embargo es Carpenter quien ir cada vez ms lejos en la extensin al cerebro de las leyes de la accin refleja al mostrar hasta qu punto la actividad mental desborda la esfera de la conciencia pura. Segn este autor, no basta con decir que gran parte de nuestra actividad intelectual es esencialmente automtica y puede ser descripta en lenguaje fisiolgico como la accin refleja del cerebro, es necesario adems establecer que puede tener lugar inconscientemente[14] Es importante entender la manera en que Gauchet plantea la relacin entre este inconsciente cerebral y el inconsciente freudiano. No postula que el surgimiento de un nuevo cuerpo de conocimientos imponga una idea al sujeto por proyeccin directa, sino que el nuevo conocimiento cientfico influye sobre el pensamiento de tres formas distintas: por sugestin, funcionando como fuente de inferencias, prohibiendo, es decir, situando negativamente cosas en las que no se puede pensar ms y, por ltimo, acreditando, es decir, determinando una propensin a acoger favorablemente cualquier construccin intelectual que lo tenga en cuenta.[15] Gauchet se aparta claramente de plantear la relacin entre el inconsciente cerebral y el inconsciente freudiano en el sentido de una influencia inmediata; pero que no exista un lazo evidente de contenido a contenido no implica que no exista ningn lazo. Gauchet enfatiza lo siguiente: El nuevo modelo de funcionamiento cerebral no ha creado una representacin consistente de la parte inconsciente del ser humano. Pero, en cambio, ha minado eficazmente las bases de la representacin clsica del sujeto consciente y de su poder voluntarista.[16] Es a partir de ese momento entonces que, segn Gauchet, con lo que se sabe del funcionamiento del cerebro, existe una base para la descalificacin de la conciencia como ese centro de presencia por el cual el hombre se posee y se gobierna. [17]