Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
Bioindicateurs - Biomarqueurs
Daniela.Banaru@univmed.fr
&
Thierry.Perez@univmed.fr
BIOEVALUATION
BIOEVALUATION
BIOACCUMULATION
BIOINDICATEUR
BIOACCUMULATION
BIOMARQUEUR
BIOINDICATEUR
BIOMARQUEUR
EVALUATION PHYSICO-CHIMIQUE
EVALUATION PHYSICO-CHIMIQUE
BIOEVALUATION
BIOEVALUATION
BIOACCUMULATION
BIOINDICATEUR
BIOACCUMULATION
BIOMARQUEUR
BIOINDICATEUR
BIOMARQUEUR
EVALUATION PHYSICO-CHIMIQUE
EVALUATION PHYSICO-CHIMIQUE
BIOEVALUATION
BIOEVALUATION
BIOACCUMULATION
BIOACCUMULATION
BIOINDICATEUR
BIOMARQUEUR
BIOINDICATEUR
Indication des effets
moyen et long terme
sur les populations et
communauts
BIOMARQUEUR
Indication dune
exposition ou deffets
prcoces sur les
organismes
EVALUATION PHYSICO-CHIMIQUE
EVALUATION PHYSICO-CHIMIQUE
NIVEAU 2
NIVEAU 3
TRES SENSIBLE
MOYENNEMENT
SENSIBLE
PEU SENSIBLE
Enzymes de dtoxication
Histopathologies
Paramtres de la population
Dommages lADN
Immunologie
Paramtres de la communaut
Energie
Altration du sex-ratio
Enzymes anti-oxydantes
Indices de condition
Paramtres sanguins
Croissance
Protines de stress
Reproduction
trophiques
Sources
Biomarqueurs potentiels
Objectif 2015 !.
Bon tat cologique
Non dtrioration des milieux
Un effort sur les substances dites prioritaires
Mise en place de zones protges
2) Paramtres hydromorphologiques
(profondeur, zone inter-tidale, structure sdiment, dbit, exposition aux vagues, etc.)
3) Paramtres biologiques
ou plutt . cologique
tat cologique
5 niveaux
Tr
Trs bon
Bon
Moyen
Mdiocre
Mauvais
tat physico-chimique
2 niveaux
Bon
Mauvais
Dfinition dindicateurs
Sites de rfrences
Dfinir le TRES BON
Sites perturbs
Bioindicateurs de quoi?
est-ce que les bioindicateurs peuvent attirer notre
attention sur la qualit de lenvironnement ?
est-ce quun bioindicateur peut suggrer une
cause responsable dune altration, et nous
permettre den dduire des consquences et
ventuellement des mesures de remdiation ?
est-ce quun organisme donn, prslectionn,
peut servir caractriser brivement ou exprimer
une gnralit ?
Xnobiotique
Distribution tissulaire
Biotransformations
(systmes
enzymatiques)
Mtabolites
hydrosolubles
inactifs
Mtabolites ractifs
Toxicit
Macromolcules
cellulaires
limination
Xnobiotique
Organisme vivant
Distribution tissulaire
Biotransformations
Phase I
Phase II
Phase I
Mtabolites
hydrosolubles
inactifs
Phase II
Mtabolites ractifs
Toxicit
Macromolcules
cellulaires
Elimination
C
E
L
L
U
L
E
Pntration
Xnobiotiques
Xnobiotiques
Pigeurs de
radicaux
libres
Ractions
radicalaires
Mtabolisme de
Phase I
Mtabolites
Mtabolisme de
Phase II
Composs
radicalaires
Cycles
redox +
autres
Mtabolisme de
Phase I
Conjugus
Espces
ractives de
loxygne
protections
Le contaminant lui
mme
Enzymes
antioxydantes
Mtabolisme
de phase II
Mtabolites
lectrophiles
E
F
F
E
T
S
Dtrioration
des
membranes
T
O
XI
Q
U
E
S
Enzymes
inactives
Proxydation
lipidique
Dtrioration
de lADN
+ autres
Excretion
Les enzymes intervenant sont principalement les UDPglucuronosyl-transfrases, les glutathion-S-transfrases, les
sulfotransfrases et catalysent respectivement la conjugaison
du substrat avec l'acide glucuronique, le glutathion, le sulfate
ou une molcule d'eau. Les xnobiotiques, ainsi oxyds puis
conjugus, sont hydrosolubles et donc excrtables.
Effets subcellulaires
Conjugus
Mtabolisme
Activation
Protection
Toxicit
IIB
xnobiotiques globulaires
(ex: barbiturates)
IIIA
(ex: strodes)
IVA
(ex: acides gras)
Inducteurs majeurs
HAP
3-mthylcholanthrne (3-MC)
- naphtoflavone
dibenzo-p-dioxines et
dibenzofuranes chlors
PCB plan
phnobarbital
PCB non plan
prgnnolone-16a-carbonitrile
phnobarbital
dexamthasone
clofibrate
esters de phtalate
Activits types
EROD
ECOD
BPH
PROD, EMND,
APND
EMND
T6H
P6H
LAH
la glucuronidation, la sulfatation et
la conjugaison au glutathion
Dtectable par :
Formation d adduits
Les xnobiotiques peuvent induire deux types daltrations
susceptibles dtre utilises comme biomarqueurs:
Fragmentation de l ADN
Cassures de monomono-brins
dADN (Single Strand
Break)
Extraction, dnaturation et droulement
de l ADN
Les brins casss sont les premiers
Sparation par chromatographie et
quantification
Le test comte
Pas d extraction
Analyse sur les noyaux inclus dans de
l agarose et prsents sur lame
Dnaturation et migration par
lctrophorse
Thierry Perez
Protines de stress :
HSP 110
HSP 90 (83-90 kDa)
Maintien de l homostasie
cellulaire sous l influence de
stress environnementaux
Fonctions
Localisation
Chaperon
Noyau
Cytoplasme,
rticulum
Chaperon molculaire :
Cytoplasme,
rticulum,
mitochondrie,
noyau
protines nuclaires et
cytosoliques
Protines de choc
thermique :
- apprtement de lantigne
HSP 60
Chaperon molculaire
Cytoplasme,
mitochondrie,
chloroplaste,
cytoplasme
HSP de faible poids
molculaire (20-30
chaperons molculaires,
kDa)
constitution du protasome
Nucloplasmide
Formation du nuclosome
Noyau
Ferritine
Stockage du fer
Cytoplasme
Constituant du protasome
Cytoplasme
Facteurs de
HSP
stress
Temprature,
70
PCB, TBT, Cd
Temprature
70
Actiniaires
Madrporaires Temprature 20-30, 70, 90
90
Octocoralliaires Temprature,
PCB (CB118)
Temprature,
70
Mollusques
Cd, PCB
bivalves
Spongiaires
Rfrences
Batel et al., 1993 ; Mller et al., 1995 ; Koziol, 1998 ;
Mller et al., 1998 ; Schrder et al., 1999
Sharp et al., 1994
Black et al., 1995
Wiens et al., 2000
Sanders, 1988 ; Brown et al., 1995 ; Bradley et al., 1998 ;
Smerdon et al., 1995 ; Chapple et al., 1998 ; Steinert &
Pickwell, 1993 ; Lundebye et al., 1997
PROBLEME
Bien que prometteur, ce biomarqueur a t rarement employ en
conditions naturelles
Une majorit dtudes effectues en conditions exprimentales de
stress aigu
OBJECTIFS
tudier in situ les variations des niveaux dexpression de la HSP 70
Confronter les rsultats aux variations de la qualit du milieu, et en
particulier aux variations de la contamination chimique de S.
officinalis
HSP 60 (g/
g/g
de prot
protine)
0.08
0.06
Analyse de corr
corrlation multiple :
temp
temprature et facteurs biotiques
Hemimysis margalefi
1 chantillonnage mensuel
2 p
priodes entre 2000 et 2004
HSP 85
pas de corr
corrlation avec la temp
temprature
aucun autre facteur pris en compte
nexplique la variabilit
variabilit
0.04
0.02
0
fev mar avr mai jun
jul
2000
nov dec
jan
2001
HSP 60 (g/
g/g de prot
protine)
HSP 60
corr
corrlation significative avec la temp
temprature
variation partiellement expliqu
explique par le % de
femelles gravides dans l
chantillon ( HSP)
lchantillon
Temperature (C)
24
22
20
18
16
14
12
10
0.08
0.06
0.04
HSP 45
corr
corrlation significative avec la temp
temprature
variation partiellement expliqu
explique par le %
dindividus immatures (
( HSP)
0.02
0
oct nov dec jan fev mar avr mai jun jul
2002
aou sep oct nov dec jan fev mar avr mai jun jul aou
2003
2004
10/09/2003
HSP 70 (
(g / g prot.)
EC 50 g / ml
2,4
500
1,8
400
1,2
300
0,6
200
0,0
100
Riches en cystine
Cys
Cys
Cys
Cys
Cys
30 % des AA
Cys
Ref
Refrence
Maladie
27/08/2003
1re observation de n
ncroses
chez les spongiaires
1,96*Ec.-Type
1,00*Ec.-Type
Moyenne
Formation de complexes
metal-thiolates
Affinit pour les ions
mtalliques lourds : Zn, Cd,
Ag, Cu, Hg
Cys
Cys
Cys
Cys
Sinon...
Blocage de linflux nerveux
Atteinte du m
mtabolisme nerg
nergtique
C=R+F+U+P
(daprs Widdows)
C: consommation
R: nergie lie au catabolisme endogne, estime par la conso. en O2
ol
c
lo
ng
ea
nn
xo
-sa
Stress on stress
(Daprs Viarengo)
= la rsistance l anoxie
c
e
ol
lie
ita
e
nn
IMPOSEX
Marqueur spcifique d une
contamination par les TBT
En grande partie due linteraction avec le
mtabolisme des strodes
Reproduction success
Changements
physiologiques et
biochimiques induits par
les contaminants
Variabilit
Variabilit de llexpression des prot
protines de
choc thermique chez un gorgonaire
Variabilit
Variabilit de llexpression des prot
protines de
choc thermique chez un gorgonaire
Variabilit
Variabilit plus forte
faible profondeur :
Plane Cv = 85% (contre 40%)
Riou Cv = 40% (contre 22%)
Une variabilit
variabilit des capacit
capacits de r
rsistance visible lil
il nu !
Ils sont bass sur l'apprciation d'effets indsirables sur les individus.
Ces effets ont souvent une origine biochimique tant donn que la
plupart des toxiques exercent leurs effets par le biais de modifications
d'activits enzymatiques. Les effets les plus couramment tudis
concernent des arrts de croissance, des perturbations de la
reproduction, des baisses de l'activit, des effets mutagnes L'effet
pourra tre qualifi "d'indsirable" dans la mesure o l'on connat sa
signification physiologique et cologique et o il ne s'agit pas d'une
raction d'adaptation bnfique pour l'espce tudie.
Acartia torsa
Chaetogamarus marinus
Crangon crangon
Brachionus plicatilis
Nitocra spinipes
Dicentrachus labrax
Artemia salina
Fundulus heteroclitus
boues de forage
effluents industriels
produits chimiques
dispersants dHC
Tests subletaux
Photobacterium phosphoreum
Skeletonema costatum
Balanus improvisus
Mytilus edulis
Mysidopsis bahia
Arbacia punctulata
Cyprinodon variegatus
boues de forage
effluents
2,0
(mthanol/di-chloromthane)
1,6
EC 50 g / ml
400
300
1,2
0,8
200
0,4
100
0,0
Chromatographie
(CCM, GCGC-MS)
Toxicit
Toxicit
EC 50
Rfrence
Composition
de l
lextrait
Maladie
Expression HSP 70
2 fois sup
suprieure
Ref
Refrence
Maladie
Production de d
dfenses chimiques
1,5 fois inf
infrieure
1,96*Ec.-Type
1,00*Ec.-Type
Moyenne
EC 50 g / ml
?
300
Expression de
certaines
mol
molcules
100
Capacit
Capacit de d
dfense
=
Porte ouverte aux pathog
pathognes
Ref
Refrence
Maladie
1,00*Ec.-Type
Moyenne
Richesse sp
spcifique des assemblages de bryozoaires en soussous-blocs
Large erect bryozoans
Richness & abundance (x + sd)/quadrat
12
N Colonies
N Species
10
DOMINANT CIRCULATION: E - W
8
5000m
2400m
900m
700m
400m
400m
1300m
5000m
6
6
SEWER
OUTLET
4
4
1
0
0
Riou
0
Cirque
Maire