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Cette classication est principalement fonde sur les mthodes de la cladistique, mthode tablie en 1950 par
Willi Hennig[1] . Cette mthode rvolutionna ainsi toute la
systmatique partir de la n des annes 1960. L'analyse
cladistique qui sert de base l'tablissement de cette classication considre les caractres toutes les chelles
valeur gale : les caractres macroscopiques et microscopiques issus de l'anatomie compare et de l'embryologie,
les caractres molculaires[2] issus de la biochimie et de
la biologie molculaire, ainsi que les donnes apportes
par la palontologie.
1
1.1
Principes
Erreurs induites par la classication classique
2 MTHODES
Mthodes
2.1
Cladistique
3. Eucaryotes
Savoir lesquels de ces trois groupes partagent un anctre
commun qui les distingue du troisime est un sujet de
recherche, comme ce l'est d'ailleurs avec tous les taxons
non binaires (les arbres non enracins , ceux que la recherche n'a pas encore pu diviser en deux taxons de base).
Certains chercheurs ont dj propos leur propre cladogramme, faisant de deux de ces trois clades un ensemble
3
de deux groupes frres, ensemble qui serait son tour
le groupe frre du troisime. Par exemple, Colin Tudge
a propos un arbre enracin o les arches et les eucaryotes sont un ensemble de deux groupes frres, ensemble
qui, son tour, est le groupe frre des eubactries[5] . La
classication de Tudge n'est qu'un exemple car les chercheurs sont rellement diviss quant aux direntes positions prises ce sujet.
2.2
Phylognie molculaire
Classication phylogntique de
l'homme
Un exemple dtaill permet d'avoir une ide de la dirence de rsultat par rapport l'approche traditionnelle.
Prenons l'exemple de l'Homme ; voici donc une partie
des nuds successifs permettant de classer l'homme, telle
qu'elle apparat dans le livre Classication phylogntique
du vivant, de Guillaume Lecointre et Herv Le Guyader. Certains intermdiaires ont t omis arbitrairement
par les auteurs pour montrer un condens de l'arbre, le
nombre de taxons mis en vidence par la mthode tant de
trs loin suprieur. La description associe chaque clade
est peu rigoureuse et vise uniquement xer les ides :
Espce Homo sapiens
Genre Homo : inclut les espces fossiles comme
Homo neanderthalensis ou Homo erectus et ne comprend plus, existant aujourd'hui, que la seule espce
Homo sapiens.
Hominines : les genres Australopithecus et Homo : 1
espce existante
Homininiens : les deux espces de chimpanzs et les
hominines : 3 espces
Hominins : gorille et Hominins (sous-famille des
Homininae dans la classication classique) : 5 espces
Hominids : on ajoute l'orang-outan : 7 espces
Hominods : on ajoute les gibbons : 23 espces
(source NCBI)
Catarrhiniens : les singes de l'ancien monde
Simiiformes : singes
Haplorrhiniens : singes et tarsiers
Primates : la plus grande partie de l'ancien ordre Primates dans la classication classique
sajoutent
dipneustes
puis
L'approche phylogntique bouleverse toutes les classications l'ayant prcde, autant les classications de biologies xistes (comme celles dveloppes par Carl von
Linn ou par Georges Cuvier) que celles qui suivirent
Darwin et qui incluaient la slection naturelle comme
cause de la spciation. La classication de Linn reposait
sur l'adage que toutes les espces sont apparues en mme
temps et que celles-ci taient xes, alors que la classication phylogntique illustre les principes d'volution et de
slection naturelle. Les classications post-darwiniennes
avaient dj inclus ces mmes principes volutifs mais en
tablissant leur critre de classication sur les rapports
d'anctre descendant (gnalogie) alors que la classication phylogntique se base sur le critre de la plus
proche parent entre espces (phylognie). L'arrive de la
thorie de l'volution introduisit l'ide que les taxons ont
volu les uns partir des autres mais elle ne modia pas
immdiatement les critres de classication, qui jusqu'
l'arrive de la cladistique propose par Hennig restrent
essentiellement les mmes que ceux du temps de Linn.
La classication phylogntique ne validant que des
groupes caractriss par des caractres drivs propres
(les synapomorphies) ces groupes sont aussi dits
monophyltiques, c'est--dire d'une seule phylognie,
d'une seule phyliation : celle d'un anctre et de tous
ses descendants. Les classications qui prcdrent la
classication phylogntique ne tenaient pas compte de
la phylognie mais uniquement d'lments qui pouvaient
parfaitement tre contingents ou anthropocentriques
(comme le comportement ou comme la privation de
caractres humains[7],[8] ), mme dans le cas des classications qui acceptaient la thorie de l'volution. La
classication classique, que ce soit sous son ancienne
forme xiste (Linn, Cuvier) ou sous sa forme volutioniste post-darwinienne, a ainsi form des taxons qui,
n'tant pas bass sur le principe d'un anctre et de tous
ses descendants, sont appels paraphyltiques par la
Dans la classication classique, le groupe des reptiles ne comprend pas les oiseaux, or d'aprs la classication cladistique, les
plus proches cousins des crocodiles sont les oiseaux, et non les
lzards ou les serpents par exemple. Le regroupement des crocodiles, lzards et serpents sous le nom de reptile n'est donc pas
pertinent.
Arches
Bactries
vertes
filamenteuses
Gram
positives
Eucaryotes
Myxomyctes
Amibes
Animalia
Methanosarcina
Halophiles
Methanobacterium
Methanococcus
T. celer
Thermoproteus
Pyrodicticum
Fungi
Plantae
Cilis
Flagells
Trichomonades
Microsporides
Diplomonades
5
Une autre dirence avec la systmatique traditionnelle
est que la systmatique phylogntique rejette toute catgorisation des niveaux hirarchiques[9] . Pour des raisons
pratiques, l'arbre phylogntique donne lui-mme la hirarchie que tentaient de fournir les anciennes catgories
qu'taient les rangs taxinomiques du systme linnen. Ce
systme exprimait l'ide anthropocentrique et non objective d'une chelle des tres, une hirarchie dans laquelle
l'homme tait le couronnement[8] , et ce autant dans le
modle xiste crationniste que dans le modle volutionniste pr-phylogntique. Au contraire la classication phylogntique ore une vision des tres vivants qui
n'attribue pas de prminence certains tres vivants sur
certains autres. L'volution les a produits en leur donnant
la proprit d'tre tous adapts leur milieu, ce qui les
rend gaux face une tentative de les organiser selon un
quelconque ordre hirarchique qui soit bas sur le critre
d'un jugement de valeur. La hirarchie de la classication
phylogntique est strictement celle de l'embotement des
taxons les uns l'intrieur des autres. Les vers de terre
ou les cafards ne sont donc pas infrieurs aux tres humains du point de vue de la classication scientique, ils
occupent leur position dans l'arbre phylogntique tout
comme les humains occupent la leur. Les jugements de
valeurs appelant une supriorit de l'espce humaine
sur les autres espces ne se font donc plus dans le domaine des sciences naturelles mais uniquement dans les
domaines non-scientiques ou non-empiriques, ceux qui
sont intrinsquement lis une ide de transcendance,
par exemple la religion, la philosophie, la mtaphysique
ou voire la politique, la sociologie, la dontologie de la
mdecine etc.
La nomenclature binominale en latin pour nommer les espces. Deux rangs taxinomiques sont donc
conservs, l'espce et le genre, mais ils n'tablissent
pas une hirarchie autre que celle du simple embotement des taxons.
Le latin comme langue vhiculaire pour nommer les
taxons.
L'ide vague d'un arbre volutif. Cette notion est
conserve sous la forme des cladogrammes, mais
les rapports entre taxons sont strictement phylogntiques.
Applications secondaires
Notes et rfrences
[1] Grundzge einer Theorie der phylogenetischen Systematik Hennig Grundzge einer Theorie der phylogenetischen
Systematik, Deutscher Zentralverlag, Berlin 1950. (Fondements d'une thorie de la systmatique phylogntique),
publie en Allemagne. La traduction anglaise de son livre
ayant t publie en 1966. W. Hennig, Phylogenetic Systematics, Illinois University Press, 1966, traduit par D.
Dwight Davis & R. Zangerl., Hennig trouva un plus large
auditoire.
[2] Particulirement pour les micro-organimes : dans Microbiololgie, Prescott & Col., De Boeeck Suprieur : Une
des meilleures approches de la taxonomie est l'tude des
protines et des acides nucliques. [...] La comparaison
des protines et des acides nucliques fournit une information considrable sur les parents vritables. Ces approches
molculaires rcentes ont pris de plus en plus d'importance
dans la taxonomies des procaryotes.
[3] Lecointre Guillaume et Le Guyader Herv, Classication
phylogntique du vivant, page 39, 2e dition, 2002, Belin,
Paris, ISBN 2-7011-2137-X
[4] Voir le site treebase qui fait rfrence en la matire
[5] (en) Colin Tudge, The Variety of Life, Oxford, Oxford
University Press, 2000, poche (ISBN 978-0-19-8604266)
[6] Lespce nest quune collection monophyltique dindividus, dnie au mieux par une synapomorphie, au pire
par la moyenne et la variance de paramtres mesurs in
Lecointre Guillaume et Le Guyader Herv, Classication
phylogntique du vivant, page 18, 2e dition, 2002, Belin,
Paris, ISBN 2-7011-2137-X
VOIR AUSSI
8 Voir aussi
8.1 Articles connexes
Phylognie
Thorie de l'volution
Arbre phylogntique
8.2
Liens externes
8.2
Liens externes
Portail de lvolution
Portail de la biologie
9.1
Texte
9.2
Images
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9.3
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