J FORAM ADQUIRIDOS OS CONCEITOS PARA

COMPREENDER A BIOENERGTICA?

Quais as reaes tipo?

E fenmenos como o enrolamento
das protenas ou o transporte ativo?
Como podem ser interpretadas do
ponto de vista termodinmico?

Potenciais de transferncia do grupo fosfato

adenosina trifosfato (ATP)

ATP

adenina
NH2
N

N
N

O H2C
H
H
H
H
OH OH

HO

HO

P
O

fosfato

O
O

ribose
O

O
O

HO

P
O

HO

P
OH

A reao de hidrlise do ATP

Potenciais de transferncia do grupo fosfato

A tendncia para uma molcula transferir um grupo fosfato pode

ser quantificada pelo valor de G' para a reao de transferncia de
um grupo fosfato para um composto referncia, em soluo
aquosa.

ATP + H2O

GP0' =-7,7 kcal/mol

ADP + Pi

e
glucose-6-fosfato + H2O

glucose + Pi

GP0'=-3,3 kcal/mol

Potenciais de transferncia do grupo fosfato

composto

G 0P' (kcal/mol) Potencial de transferncia

do grupo fosfato
Fosfoenolpiruvato

-14,8

14,8

1,3-difosfoglicerato

-11,8

11,8

Fosfocreatina

-10,3

10,3

Acetilfosfato

-10,1

10,1

Fosfoarginina

-7,7

7,7

ATP (a ADP)

-7,3

7,3

Glucose-1-fosfato

-5,0

5,0

Frutose-6-fosfato

-3,8

3,8

Glucose-6-fosfato

-3,3

3,3

Glicerol-1-fosfato

-2,2

2,2

DOADORES DE FOSFATO

Potenciais de transferncia do grupo fosfato

A hidrlise do ATP em condies celulares

G = G0 + RT ln Qreaco

REAES ACOPLADAS

Fosfoenolpiruvato + ADP

piruvato + ATP

Pode considerar-se que duas reaes qumicas ocorrem

simultaneamente.
Fosfoenolpiruvato + H2O
ADP + Pi

piruvato + Pi

ATP + H2O

Ento para a reao total

GP0' = (-55,6 + 32,2) = -23,4 kJmol-1

GP0'= -55,6 kJmol-1

GP0'= +32,2 kJmol-1

REAES ACOPLADAS

Nos sistemas biolgicos:

- uma reao endergnica est acoplada a uma reao
exergnica de forma a que a reao global seja exergnica
- geralmente a reao exergnica a hidrlise de ATP a
ADP e Pi
- a reao acoplada frequentemente catalisada por uma
enzima (controlo cintico do processo)

Exemplo - Sntese dos aminocidos

Sntese dos aminocidos um outro exemplo que permite

visualizar a importncia das reaes de acoplamento.
A formao de glutamina (Gina) a partir do glutamato (Gato):

NH +4 + Gato

Gina + H2O

Exemplo - Sntese dos aminocidos

Sntese dos aminocidos um outro exemplo que permite

visualizar a importncia das reaes de acoplamento.
A formao de glutamina (Gina) a partir do glutamato (Gato):

NH +4 + Gato

Gina + H2O

Reaes do metabolismo dos aminocidos

Exemplo - Sntese dos aminocidos

Sntese dos aminocidos um outro exemplo que permite

visualizar a importncia das reaes de acoplamento.
A formao de glutamina (Gina) a partir do glutamato (Gato):

NH +4 + Gato

Gina + H2O

caracterizada por uma constante de equilbrio nas condies fisiolgica

(pH=7) de K 0,003
Ento pode escrever-se:

[
G ]
K =
= 0,003
[G ] [NH ]
ina

ato

G0 = -RTln KG = + 3,4 kcal

A sntese de glutamina a partir de glutamato no
ocorreria espontaneamente no organismo

Exemplo - Sntese dos aminocidos

Contudo esta reao est acoplada reao de hidrlise do ATP

ADP + Pi

ATP + H2O

NH +4 + Gato + ATP

K G ,ATP =

H= + 32,2 kJ mol-1

Gina + ADP + Pi

[G ] [ADP] [Pi ] = 9,600

[G ] [NH ] [ATP ]
ina

ato

e o valor de G G0 ',ATP= -RTln KG,ATP = -5,4 kcal

Exemplo - Sntese dos aminocidos

A partir da reaco de sntese da glutamina sozinha e acoplada

reaco de hidrlise do ATP pode ser retirada informao sobre a
reaco de hidrlise do ATP.
K G ,ATP [G ina ] [ADP] [Pi ][G ato ] / [NH 4+ ] [ATP ] [ADP] [Pi ] 9600
6
=
=
=
3
x
10
=
[G ina ] / [G ato ] [NH 4+ ]
[ATP]
KG
0,003

'
A partir deste resultados possvel obter o valor de G 0ATP
=-7,7 kcal
para a hidrlise do ATP

ATP+ H2O

ADP + Pi

'
G 0ATP
=-7,7 kcal

Gliclise
A reao global de oxidao (combusto) da glucose em
presena de O2(g) para formar CO2(g) e H2O(l) est
associada a uma variao de energia de Gibbs bastante
negativa. Usando os valores da variao da energia livre de
Gibbs de formao a 298 K obtm-se para a reao um
G 0298 = -2878 kJ
C6H12O6(s) + 6 O2 (g)

6 CO2 (g) + 6 H2O (l)

A maior parte desta variao de energia livre devida

contribuio entlpica H = -2801 kJ e relativamente pouco
devida contribuio entrpica, -TS = -77,2 kJ.

Gliclise

Assim quando a glucose sofre combusto diretamente com o

oxignio, quase toda a energia libertada como calor. No entanto
nas clulas dos organismos uma frao significativa retida como
energia de ligao qumica, por exemplo na forma de ATP ou na
forma de outras molculas sintetizadas.

Gliclise
glucose

Nos organismos aerbicos

Em condies anaerbicas
no mosto

etanol

Mitocondria

piruvato

Em condies menos aerbicas

no msculo

lactato

ciclo
do cido
ctrico

CO2 + H2O

Gliclise
Go(kJmol-1)

Glucose

ATP

-16,7

ADP

Glucose-6-fosfato
+1,7
Frutose-6-fosfato
ATP

-14,2

ADP

Metabolismo da glucose para a

converso de glucose a piruvato
nas clulas

Frutose-1,6-difosfato
+23,8
Dihidroxiacetona
fosfato

Gliceraldeido-3NAD+ + Pi
fosfato
NADH+H+

2(+6,3)

1,3-Bisfosfoglicerato
ADP
ATP

2(-18,8)

3-Fosfoglicerato
2-Fosfoglicerato
H2O

2(+4,6)
2(+1,7)

Fosfoenolpiruvato

Mitocondria

ADP
ATP

Piruvato

Nos organismos aerbicos

2(-31,4)

ciclo
do cido
ctrico

CO2 + H2O

Gliclise
O primeiro passo do metabolismo da glucose a formao de
glucose-6-fosfato.
Esta reao uma reao com um G positivo que ocorre
espontaneamente no organismo porque est acoplada reao de
hidrlise do ATP (mas que est sob controlo cintico atravs da
enzima hexocinase).
glucose + fosfato
ATP + H2O
glucose + ATP

glucose-6-fosfato + H2O

ADP + fosfato
glucose-6-fosfato + ADP

G 0' =+14,3 kJ
G 0' =-31,0 kJ
G 0' =-16,7 kJ

Gliclise
Go(kJmol-1)

Glucose

ATP

-16,7

ADP

Glucose-6-fosfato
+1,7
Frutose-6-fosfato
ATP

-14,2

ADP

Metabolismo da glucose para a

converso de glucose a piruvato
nas clulas

Frutose-1,6-difosfato
+23,8
Dihidroxiacetona
fosfato

Gliceraldeido-3NAD+ + Pi
fosfato
NADH+H+

2(+6,3)

1,3-Bisfosfoglicerato
ADP
ATP

2(-18,8)

3-Fosfoglicerato
2-Fosfoglicerato
H2O

2(+4,6)
2(+1,7)

Fosfoenolpiruvato

Mitocondria

ADP
ATP

Piruvato

Nos organismos aerbicos

2(-31,4)

ciclo
do cido
ctrico

CO2 + H2O

Gliclise
Logo, numa via metablica baseada numa cadeia de reaes, o
contributo favorvel dos parmetros termodinmicos para a sua
ocorrncia no pode ser baseado num passo especfico, mas sim
avaliado pela variao da energia livre de Gibbs do processo
global.
KT = K1 x K2 x x Kn

RTln(KT) = RTln(K1) + RTln(K2) + + RTln(Kn)

G T0 ' = G 10' + G 02' + ... + G 0n'

Termodinmica e estruturas biolgicas

Qual o papel da termodinmica na formao das

estruturas biolgicas?

Porque as protenas assumem uma determinada

conformao?

Porque ocorre desnaturao (alterao da conformao) com

o aumento da temperatura?

Como formada e como se mantm estvel a estrutura em

dupla camada nas membranas biolgicas?

Estrutura das protenas

Aminocidos

Estrutura das protenas

Ligao
peptdica

Estrutura das protenas foras inter-atmicas

fraca (2-5 kcal/mol vs.

covalente: 70-100 kcal/mol),
mas presente em abundncia
Oxidao de dois resduos
sulfidrilo (intermolecular:
ribonuclease; entre
subunidades: insulina)

fraca (3 kcal/mol),
afetada pelo pH

Interaes dipolo-dipolo induzido: foras de van der Waals (transiente e fraca: 0.1-0.2 kcal/mol)
Interaes hidrofbicas, tendncia apresentada por grupos hidrofbicos que leva minimizao da interao
com o meio hidroflico

Foras inter-atmicas e estrutura das protenas

Foras que estabilizam a estrutura das protenas

Interaes entre tomos dentro da cadeia da protena

Interaes entre a protena e o solvente

Foras inter-atmicas e estrutura das protenas

Foras que estabilizam a estrutura das protenas: tipos de ligao

Ligao covalente
Ligao de hidrognio
Complexao com metais
Interaes inicas
Pontes dissulfureto
Interaes electrostticas
Van der Waals

250 kJ/mol
20 kJ/mol

5 kJ/mol
1-5 kJ/mol

Estrutura das protenas foras inter-atmicas

sequncia de
aminocidos
interaes
locais

interaes mais
afastadas
interaes entre
subunidades

A estrutura da protena depende da sequncia de aas e interaes

Estrutura terciria e funo cataltica

Efeito hidrofbico
O que ocorre quando uma molcula apolar transferida para um solvente
polar?
CH4 (em CCl4)

G = + 12 kJ mol-1
H = - 10 kJ mol-1
S = - 75 kJ mol-1

CH4 (aq)

Efeito hidrofbico formao de pontes de hidrognio

Efeito hidrofbico

As molculas de
gua formam uma
gaiola, rodeando
a molcula apolar

Efeito hidrofbico

Efeito hidrofbico
O que ocorre quando uma molcula apolar transferida para um solvente
polar?
CH4 (em CCl4)

CH4 (aq)

G = + 12 kJ mol-1
H = - 10 kJ mol-1 devido s pontes de H
S = - 75 kJ mol-1 devido ao aumento da organizao do solvente

Efeito hidrofbico membranas

Efeito hidrofbico - protenas

HOH
+
HOH
no enrolada
(unfolded)
Maior exposio da zona
hidrofbica,
maior organizao
do solvente

enrolada
(folded)

Menor exposio da zona

hidrofbica,
maior desorganizao
do solvente

Termodinmica do enrolamento (folding) das protenas

No caso das protenas

Observao:
Os resduos hidrofbicos localizam-se para o interior e os
hidroflicos para o exterior
A superfcie exterior das protenas pode ser constituda por
cerca de 60% de tomos polares
O enrolamento das protenas (folding) ocorre de forma a
maximizar a eficincia das ligaes por pontes de hidrognio
no solvente (gua).

Termodinmica do enrolamento (folding) das protenas

No caso das protenas
Justificao:
Quando os resduos hidrofbicos esto expostos para o solvente
a estrutura por pontes de hidrognio da gua desfeita.
A quebra das pontes de hidrognio na gua no
energeticamente favorvel.
As molculas da gua reorientam-se em torno das molculas
hidrofbicas (S < 0).
A estrutura hidrofbica compactada: parte das molculas de
gua afastada e deixa de estar em contacto com a estrutura
proteica (S > 0).

Termodinmica - protenas

Durante a biossntese de protenas, a ligao de um dado aminocido ao respectivo

tRNA catalisada por uma enzima, designada por aminoacil-tRNA sintetase, que por
sua vez especfica para um dado aminocido.
Considerando a enzima isoleucil-tRNA sintetase, foram obtidos os seguintes dados
sobre a ligao desta enzima a distintas molculas de tRNA:
Substrato
tRNA (isoleucina)
tRNA (valina)

H0 / kJ mol-1
0
+33,4

S0 / J mol-1 K-1
+ 142,0
+225,7

A partir destes valores, calcule a razo que traduz o favorecimento da ligao correcta
(tRNA (isoleucina)) comparativamente com a ligao incorrecta (tRNA (valina)) a 293 K
e a 313 K.

Termodinmica - protenas

Durante a biossntese de protenas, a ligao de um dado aminocido ao respectivo

tRNA catalisada por uma enzima, designada por aminoacil-tRNA sintetase, que por
sua vez especfica para um dado aminocido.
Considerando a enzima isoleucil-tRNA sintetase, foram obtidos os seguintes dados
sobre a ligao desta enzima a distintas molculas de tRNA:
Substrato
tRNA (isoleucina)
tRNA (valina)

H0 / kJ mol-1
0
+33,4

S0 / J mol-1 K-1
+ 142,0
+225,7

A partir destes valores, calcule a razo que traduz o favorecimento da ligao correcta
(tRNA (isoleucina)) comparativamente com a ligao incorrecta (tRNA (valina)) a 293 K
e a 313 K.

Termodinmica - protenas

A razo que traduz o favorecimento da ligao correcta (tRNA (isoleucina))

comparativamente com a ligao incorrecta (tRNA (valina)) dada por:

K eq ligao ( tRNA (isoleucina))

K eq ligao ( tRNA ( valina))
Considerando novamente a relao

S0 H 0
ln K eq =

R
RT
possvel calcular os valores de ln Keq para a ligao entre a enzima isoleucil-tRNA
sintetase e cada uma das molculas de tRNA.

Termodinmica - protenas

tRNA (isoleucina)
T = 293 K e 313 K

ln Keq = S0 / R porque H0 = 0
ln Keq = 142 / 8,314 = 17,08

tRNA (valina)
T = 293 K

ln Keq = S0 / R - H0 / (RT)
ln Keq = 225,7 / 8,314 33,4 x 103 / (8,314 x 293) = 13,46

T = 313 K

ln Keq = 225,7 / 8,314 33,4 x 103 / (8,314 x 313) = 14,31

Termodinmica - protenas

K eq correcta
K eq incorrecta

ln K eq correcta

ln K eq incorrecta

=e

ln K eq correcta ln K eq incorrecta

Razo a 293 K

K eq correcta
K eq incorrecta

= e17 ,08 13 , 46 = 37 ,3

Razo a 313 K

K eq correcta
K eq incorrecta

= e17 ,08 14 ,31 = 16 ,0