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La taxonoma clsica es la
ms antigua, que ha existido
desde siempre, y que se basa
en
las
caractersticas
macroscpicas
y
microscpicas,
las
caractersticas metablicas y
bioqumicas,
los
requerimientos fsicos de
crecimiento (hay organismos
que para crecer necesitan
ms cosas que otros), las
estructuras
antignicas,
capacidad de esporular o no;
todo eso se usa para
clasificar a los microorganismos. La clasificacin ms ampliamente difundida es esta
que se usa en los laboratorios de microbiologa clnica; cuando se quiere clasificar
rpidamente un microorganismo, y ya que el tiempo es algo importante, se clasifican en
Gram positivos, Gram negativos y otros tipos de bacterias. Dentro de los Gram
positivos estn las cocaceas y los bacilos; dentro de las cocaceas Gram positivas (un
grupo muy abundante) estn los Streptococcus, Enterococcus y Staphylococcus; dentro
de los bacilos Gram positivos (que no son tantos) estn los Bacillus, la Listeria, y los
Corynebacterium. Gram positivo y Gram negativo se refiere a las capacidades
tintoriales en una tincin de Gram, a los positivos los veo violeta y los Gram negativos
los veo rojos. Las cocaceas Gram negativas (son muy pocas) son las Neisseria (por
ejemplo la Neisseria Gonorrea); dentro de los bacilos Gram negativos (son muchos)
estn las Enterobacteriaceae (Coli, Chigera, Enterobacter), y estn los bacilos Gram
negativos no fermentadores (Pseudomonas). Los otros son los fastidiosos, ya que no
crecen en los medios de cultivo convencionales. Por ejemplo cuando llevo una muestra
de un absceso al laboratorio clnico, se siembra en medios convencionales: agar sangre,
agar chocolate (agar sangre hidrolizado) y agar MacConkey; estos son medios ricos para
el crecimiento de microorganismos, y crecen todos los Gram positivos y Gram
negativos, pero los fastidiosos no crecen en esos medios, necesitan medios ms ricos
con vitaminas, extracto de cerebro, aminocidos que no se pueden sintetizar, etc. Los
fastidiosos no crecen en los medios convencionales, necesitan medios muy ricos para
crecer y se demoran en crecer (no como una Coli que demora 24 horas), adems
necesita que le adicione aminocidos, vitaminas u otro tipo de compuestos. Las
myccobacterias tambin estn en la categora otros porque no crecen en los medios
convencionales (por ejemplo tuberculosis), la Treponema (por ejemplo la Treponema
Pallidum causante de la sfilis), y las Deficitarias que son an ms fastidiosas ya que no
pueden crecer en un medio de cultivo, necesitan crecer dentro de otra clula (por
ejemplo la Clamidia, que es un patgeno genital), a estas bacterias le falta maquinaria
metablica para sintetizar sus propias vitaminas, sus propios aminocidos, entonces hay
que darle todo, adems tampoco tiene pared lo que la hace muy sensible.
Esta es la clasificacin que ms se usa en los laboratorios clnicos a pesar que estamos
en la era de la biologa molecular y la clasificacin por RNA.
subunidad grande, ambas formadas por una o dos molculas de RNA y protenas, eso
es un ribosoma, una mezcla de RNA ribosomal y protenas. Lo que hacen es sintetizar
las protenas.
En los ribosomas se dejan lugares para que vengan los tRNA que son los que traen los
aminocidos, entonces los tRNA se van colocando en distintos sitios que hay dentro de
los cromosomas y se va formando la cadena polipeptdica.
Los ribosomas se pegan a un RNA mensajero, varios de ellos, y estas cadenas es lo que
se ve al microscopio electrnico, cada uno de ellos es un cromosoma, y de cada uno de
estos va saliendo una cadena polipeptdica. Esa cadena se llama polirribosoma, la
cadena de ribosomas pegados a un RNA mensajero, y son tpicas de bacterias.
Las inclusiones citoplasmticas son
reservas de la bacteria, cuando hay
abundancia de nutrientes la bacteria
aprovecha y guarda. Puede haber de
varios tipos, estn las orgnicas con
polisacridos (como glucgeno o
almidn), de hidrocarburos, etc.;
tambin estn las inorgnicas, como
los grnulos de azufre, como en esas
bacterias que pueden vivir solo
oxidando azufre para obtener su
energa, ellas guardan grnulos de
azufre; y las inclusiones de sales
minerales y de pigmentos solubles.
As se ven las bacterias del azufre, los grnulos de azufre se
ven dentro como muy refractarios a la luz, eso que est ah es
azufre elemental (azufre cero), ellas lo oxidan y obtienen
energa.
El otro elemento que podemos encontrar en el citoplasma de la
bacteria es el citoesqueleto. Hace algunos aos se pensaba que
las bacterias no tenan citoesqueleto, as como se pensaba que no tenan intrones, esto
era como reglas o dogmas. Hasta que en 1970-1980 empezaron a aparecer las primeras
ideas de actina y tubulina bacteriana; actina y tubulina son las protenas que forman el
resistencia a antibiticos. La particularidad que tienen las Gram negativas es que tienen
membrana externa por
fuera del peptidoglicano,
que tiene una estructura
asimtrica, pero tambin
es una bicapa, los lpidos
que componen esta bicapa
son distintos que los de
esta, y tienen insertadas
unas
protenas
de
membrana
llamadas
porinas por la que entran
los nutrientes, antibiticos
y muchos compuestos. La
mitad interna de la
membrana externa est
formada por fosfolpidos
igual a los de la membrana interna; la monocapa externa est formada por un compuesto
lipdico especial llamado LPS.
LPS es el lipopolisacarido, con una
estructura compleja (de todo un
poco). Tiene un lpido A, un Core y
un antgeno O. El lpido A son dos
glucosaminas unidas que tienen
cadenas de cidos grasos normales
(como los de los fosfolpidos); a
una de las molculas de
glicosamina
est
unido
el
cetodesoxioctonato (KDO) que
tiene azucares convencionales
(glucosa, galactosa), esto forma el
core del polisacrido; y unidos al
KDO hay cadenas de azucares no convencionales (rha, abe, man), y esto es el
lipopolisacarido bacteriano.
El lpido A (tambin llamado endotoxina) es el responsable de la fiebre, el shock txico,
la coagulacin intravascular diseminada; por lo tanto una persona tiene sepsis por una
bacteria Gram negativa; dar antibiticos es muy complicado, ya que pueden hacer lisis
en la bacteria liberando la endotoxina
(se libera solo cuando la bacteria
muere). No es inmunognico, pero es
pirognico.
El antgeno O, por otra parte es muy
antignico y es muy til para
diferenciar las bacterias, por ejemplo la
Salmonella tiene como 2000 tipos
distintos
dependiendo
de
las
combinaciones de azucares, y en base a
eso se clasifican.
(rojo) para poder ver las que decoloraron; el resultado es que las Gram negativas se ven
rojas, y las Gram positivas violeta. Esto habla sobre la estructura de la pared, permite
ver la forma de la bacteria, y su disposicin; por ejemplo en la diapo anterior es un
estafilococco (en racimo, como montoncitos de bacterias), el estreptococo son cadenas
largas, el estreptoneumonia es un diplococo, dos pegaditos y que en agar sangre se ven
de color muy particular.
El micobacterio ms
tpico
es
el
Mycobacterium
tuberculosis, que forma
parte
del
complejo
tuberculosis.
El
diagnstico
de
tuberculosis, se hace junto
a
Mycobacterium
tuberculosis, para todas
estas, que forman el
Mycobacterium
tuberculosis
complex:
Bovis, Africanum, Caprae,
Microtii y Pinnipedii.
Todos ellos son patgenos
para el ser humano, que a pesar de los antibiticos siguen teniendo una prevalencia alta,
con alta mortalidad. Tienen alto contenido de lpidos de alto peso molecular. Y tienen
muchos genes involucrados en la sntesis de cidos miclicos, ya que son difciles de
sintetizar, por eso que su tiempo de generacin es de 15-20 horas (Coli tiene 20
minutos); para obtener una colonia tengo que esperar de 3 a 8 semanas, esto es porque
se demora mucho en crecer por la capa de lpidos complejos, que adems limita mucho
el paso de nutrientes. As se ve una basiloscopa positiva, es una expectoracin teida
con la tincin de Ziehl Neelsen, si aparece esto es porque hay bacilos cido-alcohol
resistentes muy sugerentes de tuberculosis. As se ve una colonia de Mycobacterium
tuberculosis que crece en medio slido llamado Lowenstein Jensen, y este es un medio
especial que se hace con clara de huevo y cosas especiales.
Estas son las otras bacterias que no
encajan en el esquema de Gram
positivo/negativo. Estas no tienen
pared, son las micoplasmas, son
patgenos
humanos
muy
conocidos;
el
micoplasma
neumona, causante de neumona,
etc. Su particularidad es que son
pequeitas, no tienen pared y por lo
tanto son resistentes a betalactmicos (ya que estos actan
contra las que tienen pared). Tiene
una membrana celular de tres
capas, y con esterol y colesterol que
roban del hospedero y clulas que colonizan. Son bacterias muy pequeas, en
comparacin, este es el estafiloaurius, y as sera el micoplasma. Son fastidiosas porque
tener este tamao les cuesta caro, les falta un montn de maquinaria para sintetizar sus
propias molculas, hay que darle todo eso en el medio de cultivo.
Las cepas encapsuladas estn asociadas a bacterias invasoras. Lo que nosotros hicimos
fue analizar 110 cepas aisladas de sujetos distintos que tenan faringitis o infecciones en
regiones ms ???. Digo invasoras porque las cepas fueron sacadas de lquido sinovial,
biopsias, sangre, etc. Entonces vimos su genotipo y fenotipo, y vimos que 3/110 tenan
cpsula. As se ve una colonia de un Pyogenes capsulado. Lo que vimos al agrupar las
cepas invasoras y no invasoras, fue que el contenido de cido hialurnico era mayor en
las invasoras (es decir, contribuye a la invasividad). Lo que hicimos fue secuenciar un
represor de la sntesis de cpsulas; la cpsula est normalmente reprimida, y 2/3
capsuladas tenan mutado el represor, como no tenan represor sintetizaban cpsula
como locas.