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20 de Agosto de 2015
BIOINFORMTICA BSICA
TALLER 3. Bases de datos biolgicas
1. NCBI Education
1.1. Ingrese a la pgina principal del NCBI y de click sobre el hipervnculo Education o
ingrese a http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Education/.
1.2. Explore las diferentes herramientas que aparecen disponibles en esa pgina.
1.4. Explore la pgina y comente brevemente para qu cree usted que puede serle til una
pgina como sta?
Para buscar determinadas propiedades, estructura, sustitutos, interacciones, expresin,
visualizacin en 3D del amino cido requerido.
2. NCBI Bookshelf
2.1. Ingrese a la pgina del NCBI que le permite buscar informacin en libros relacionados
con medicina (Bookshelf) http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/
2.2. Busque dos libros que le sean de ayuda durante este semestre en cualquiera de las
2.3. asignaturas que est cursando. Adjunte el ttulo de los libros en el documento a
entregar.
Molecular Biology of the Cell. 4th edition. - Alberts B, Johnson A, Lewis J, et al.
Molecular Cell Biology. 4th edition. - Lodish H, Berk A, Zipursky SL, et al.
7.1. En la pgina principal del NCBI, realice una bsqueda de la protena con el nmero de
acceso NP_001092.1
7.4. Complemente:
7.4.1. NG__:007992.1
7.4.2. NM__:001101.3
7.4.3. NP__:001092.1
7.5. Qu utilidad tiene este sistema de codificacin?
Supongo que es una forma de clasificacin y referencia, para ubicar determinadas protenas de
forma rpida y eficiente para ser usada en trabajos acadmicos o determinado grupo estudio.
8. Descarga de secuencias
8.1. Realice una bsqueda de la secuencia de ARNm para la colgeno tipo VI alfa 1
(COL6A1) en humanos
8.1.1. Cul es el nmero de acceso?
NM_001848.2
8.1.2. Cuntos nucletidos tiene la secuencia?
Tiene (4,246 bp)
Probablemente todos los seres orgnicos que hayan vivido nunca sobre esta tierra han descendido de
alguna nica forma primordial, a la que se infundi vida por primera vez... Esta opinin sobre el origen de
la vida tiene su grandeza... porque mientras este planeta ha ido dando vueltas de acuerdo con la ley fija
de la gravedad, a partir de un inicio tan sencillo han evolucionado y siguen evolucionando formas sin fin,
las ms bellas y las ms maravillosas.
Charles Darwin, 18591