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Mtabolisme protique
Collge des Enseignants de Nutrition
2010-2011
Table
des
matires
I Gnralits ....................................................................................................................................... 3
II La synthse protique ....................................................................................................................7
III La dgradation irrversible des acides amins (ou catabolisme oxydatif des acides amins,
ne pas confondre avec la protolyse) ...............................................................................................9
IV La protolyse (ou catabolisme protique) ................................................................................ 11
V Les apports en acides amins exognes ...................................................................................... 13
VI Synthse des acides amins non essentiels ................................................................................14
VII Les moyens dexploration du mtabolisme protique in vivo ...............................................16
VIII Rgulation du mtabolisme des protines ............................................................................. 20
IX Besoins en azote et en acides amins et sources protiques alimentaires ..............................25
NOTE(S) DU CHAPITRE ................................................................................................................ 30
X Annexes.......................................................................................................................................... 30
Points comprendre
Les mthodes dexploration du mtabolisme protique ont des limites qui doivent
tre considres lors de leur application pour lvaluation clinique ou la recherche
fondamentale.
Les besoins en protines doivent tre assurs par un apport suffisant la fois en
azote et en acides amins essentiels, par lingestion de protines dorigine animale
et/ou vgtale.
GNRALITS
Une protine est une molcule comportant de lazote et compose dune squence
dacides amins (au nombre de 20) relis par des liaisons peptidiques. La squence
dtermine la structure primaire de la protine, la configuration de la chaine peptidique dans
lespace dtermine les structures secondaires et tertiaires, lassociation de plusieurs
chanes peptidiques dtermine la structure quaternaire. Par convention, une protine
comportant moins de 50 acides amins est appele peptide. La taille dune protine est
extrmement variable de quelques centaines plusieurs millions de kilo-daltons. De mme,
les protines ont de trs nombreuses fonctions : protines de structure (collagne...),
protines contractiles (myosine...), protines de transport (albumine...), protines
immunitaires (immunoglobulines), protines enzymatiques, hormones, rcepteurs, etc.
Malgr ces structures et fonctions trs variables, toutes les protines ont en commun une
proprit, leur renouvellement permanent schmatis sur la figure 1.
- Support de Cours (Version PDF) 1. Schma gnral du mtabolisme protique chez lhomme
la protolyse (ou dgradation protique) librant des acides amins dans le pool,
les apports protiques compensent les pertes dacides amins, la diffrence entre
apports et pertes constituant le bilan protique (ou bilan azot) et correspondant
galement la diffrence entre synthse et protolyse protique condition que la
taille du pool dacides amins libres ne varie pas, ce qui est le cas la plupart du
temps.
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selon lge : le renouvellement protique est beaucoup plus rapide chez le nouveaun (10 15 g/kg/jour), la synthse tant suprieure la protolyse, ce qui rsulte en
un gain protique 1 1,5 g de protine/kg/jour (correspondant un gain pondral
de 20 30 g/jour compos de 12 % de protines). Chez le sujet g, le
renouvellement protique semble ralenti mais est habituellement normal si la
rduction de masse maigre est considre.
Au total, ces trois situations soulignent la possible dissociation entre un gain protique
dune part (rsultat entre synthse et catabolisme) et une synthse protique dautre part :
une synthse protique leve (comme chez le patient brl ou traumatis) nest pas
forcment associe un gain protique (en raison dune protolyse accrue). Enfin, les
diffrentes variations constates au niveau du mtabolisme protique du corps entier ne
portent pas de faon similaire sur le mtabolisme des diffrents compartiments protiques :
ainsi au cours des situations cataboliques, lacclration du renouvellement protique
hpatique participe de faon majoritaire lacclration du renouvellement protique global
(synthse de protines inflammatoires), le muscle devenant un organe majoritairement
producteur dacides amins (stimulation de la protolyse musculaire).
Quelle est la finalit du renouvellement protique ?
Lexistence dun renouvellement protique relativement rapide permet une meilleure
adaptation aux diffrentes circonstances nutritionnelles et physiopathologiques. Il permet
galement llimination de protines vieillies ne pouvant plus remplir leurs fonctions
physiologiques de faon satisfaisante. Enfin, son rle dans la reconnaissance immunitaire
par la gnration de peptides est important. Par rapport la figure du schma gnral, nous
considrerons le pool dacides amins libres comme lment central du mtabolisme
protique et envisagerons successivement les voies dutilisation des acides amins et les
voies de production de ces acides amins. Le mtabolisme de chaque acide amin ne sera
pas considr individuellement (bien que quelques exemples soient donns) mais en
relation avec le mtabolisme protique vu sous un angle nutritionnel.
II LA SYNTHSE PROTIQUE
Pntration intracellulaire des acides amins
Les acides amins libres circulant pntrent dabord lintrieur des cellules laide de
transporteurs dont il existe au moins quatre types, chacun tant commun plusieurs acides
amins. On distingue :
un transporteur pour les acides amins neutres dont il existe plusieurs formes. La
plupart de ces transporteurs sont sodium-dpendants et consomment de lnergie,
traduction de lARNm en un peptide : cette traduction se fait sur les ribosomes (qui
sont les tablis de la synthse protique). En gnral, il existe plusieurs
ribosomes sur un mme brin dARNm qui est donc traduit simultanment. Cette
glycosylation,
labsence ou la faible disponibilit dun seul acide amin suffit ralentir, voire
bloquer lensemble des synthses protiques (concept dacide amin limitant la
synthse),
il peut tre ramin soit en un acide amin identique, soit en un autre acide amin
aprs modification conduisant alors la synthse dacides amins non essentiels,
Le systme lysosomal
Les enzymes concernes sont des protases actives en milieu acide, les cathepsines,
dnommes en fonction de lacide amin de leur site actif (cystine protinase : cathepsines
B, C, H, L, S, aspartate protinases : cathepsines D et E ; srine protinase : cathepsine G).
Ces enzymes sont localises essentiellement lintrieur des vsicules lysosomales qui
incorporent par endocytose les protines dgrader. Elles agissent essentiellement sur les
protines intracellulaires demi-vie longue, sur les membranes cellulaires, et sur les
protines extra cellulaires. Lendocytose peut galement concerner un fragment dorganite
voire un organite entier (macro autophagie). lintrieur de la vsicule, les cathepsines
vont dgrader la protine substrat en peptides et en acides ami-ns qui seront librs dans
le cytosol. Le type de cathepsine et de faon gnrale limportance de la protolyse
lysosomale varie selon lorgane considr : ce mode de dgradation est particulirement
important dans les organes renouvellement protique rapide (foie). Il ncessite de
lnergie sous forme dATP pour maintenir le pH acide lintrieur des lysosomes.
Le systme calpane-capastatine
Les calpanes (au nombre de trois) sont des protases cytosoliques dont lactivit est
troitement fonction de la concentration intracellulaire en calcium. Elles sont plus
spcialises dans la dgradation des protines du cytosquelette. La calpastatine est un
inhibiteur puissant des calpanes, lactivit protolytique globale dpendant de lquilibre
entre calpanes et calpastatine.
Le protasome (systme ATP dpendant)
Il sagit dun volumineux complexe enzymatique compos de nombreuses sous-units dont
deux formes, le protasome 20 S et le protasome 26 S ont t identifies. Les substrats
prfrentiels de ce protasome sont les protines intracellulaires normales, quelles soient
demi-vie courte ou longue mais aussi les protines anormales. Pralablement laction du
protasome 26 S, un marquage pralable de la protine dgrader par lubiquitine est
ncessaire. Lubiquitine est un petit peptide de 76 amins dont la squence est extrmement
conserve chez les eucaryotes. Il se fixe sur les protines dgrader (par liaison covalente
au niveau des rsidus lysine de la protine). Une fois la protine poly-ubiquitine, elle est
recon-nue par le protasome qui la dgrade en acides amins et en peptides courts
relchant lubiquitine qui peut alors tre rutilise. Lensemble de la raction ncessite
plusieurs enzymes, protines porteuses et co-facteurs. Surtout, la raction consomme de
lATP deux niveaux, dune part au moment de lubiquitination, dautre part au moment
de lintervention du protasome. Cette voie ATP dpendante reprsente probablement la
majorit de la protolyse au niveau musculaire. Elle est finement rgule par les
circonstances nutritionnelles et hormonales.
Les signaux de la protolyse
Une question fondamentale et encore non rsolue est la suivante : comment les diffrents
systmes protolytiques savent-ils quelle protine dgrader et quelle vitesse ? En
labsence de tels systmes de reconnaissance, on pourrait imaginer une protolyse continue
incontrlable et rapidement lthale. Il est clair quil existe un mcanisme de ciblage des
protines permettant de dsigner tel ou tel systme ce qui doit tre dgrad ou non. Ce
ciblage est fonction du poids molculaire, du degr de glycolysation, du point isolectrique,
mais des systmes plus spcifiques commencent tre identifis :
Cependant, lheure actuelle, ces deux mcanismes ne concernent que quelques protines
et les signaux conduisant la dgradation de la majorit des protines restent mystrieux.
Au total, les points essentiels retenir sur la protolyse sont :
la protolyse est tout autant que la synthse protique un phnomne trs bien
rgul par les conditions nutritionnelles et hormonales, mme si cette rgulation est
actuellement mal connue.
la quantit dacides amins absorbe par le grle nest pas de 70 g 100 g mais
comprend en plus des protines ingres les protines scrtes par le tube
digestif sous forme denzymes, de mucus, de dbrits cellulaires... Ces protines
le premier organe rencontr par les acides amins absorbs est le foie. Seule une
fraction des acides amins absorbs passe dans la circulation gnrale, le reste tant
transamin, oxyd ou incorpor dans les synthses protiques hpatiques. Ce
phnomne dextraction splanchnique
Parmi les acides amins non essentiels, deux sont considrs comme particulirement
importants, lalanine et la glutamine :
Non essentiels
Alanine
Glutamine
Glutamate
Aspartate
Asparagine
Cystine
Proline
Glycine
Arginine
Tyrosine
Srine
lexcrtion azote fcale est en principe faible (10 % 15 % des pertes azotes). Il ne
faut pas oublier de prendre en compte lexcrtion azote des fistules digestives
lorsquelles existent.
Globalement un bilan azot fiable doit tre pratiqu sur une priode minimum de 3 5
jours. Il sagit donc dun examen relativement lourd en pratique clinique. On peut lui
substituer le seul dosage dazote urinaire dj trs informatif pour le suivi dune
alimentation artificielle. Signalons enfin que compte tenu de la tendance la surestimation
des entres et la sous estimation des pertes, les bilans azots sont quasi
systmatiquement survalus.
La chromatographie des acides amins
La mesure des concentrations plasmatiques en acides amins est parfois propose comme
tmoin de ltat nutritionnel. Bien que cette concentration soit abaisse au cours des
malnutritions protiques svres, son intrt est minime en pratique courante : les acides
amins plasma-tiques ne reprsentant quun faible pourcentage des acides amins totaux et
leur concentration dpend de lquilibre entre synthse, protolyse et oxydation, ce qui la
rend dinterprtation difficile. Il sagit de plus dun dosage assez dlicat.
Les mthodes dynamiques
Ces mthodes ont en commun dtre plus invasives et de ncessiter des techniques
analytiques plus lourdes, elles sont encore rserves au domaine de la recherche.
Les mthodes dynamiques locales (diffrences artrio-veineuses)
La mthode consiste tablir un bilan des acides amins de part et dautre dun organe ou
dun tissu. Chez lhomme, la mthode a t essentiellement pratique sur des segments de
membres (avant-bras et membre infrieur) et reflte donc surtout le mtabolisme protique
musculaire. Connaissant les concentrations artrielles et veineuses des diffrents acides
amins ainsi que le dbit sanguin, on peut dduire pour chaque acide amin un bilan net
positif ou ngatif selon ltat nutritionnel. Ladjonction de traceurs permet galement laccs
la synthse et la protolyse musculaire. Le transport des acides amins dans le muscle
peut aussi tre calcul si une biopsie est ajoute. Linconvnient de la mthode est dordre
pratique puisquelle ncessite un cathtrisme artriel.
Les mthodes dynamiques globales
Elles donnent accs la synthse et la protolyse au niveau du corps entier ainsi qu
loxydation des acides amins. Elles ncessitent lutilisation de traceurs qui, en France, sont
exclusivement des acides amins marqus avec des isotopes stables non radioactifs (carbone
13, deutrium ou azote 15). Ces traceurs, inoffensifs, ont linconvnient de ncessiter pour le
dosage un spectromtre de masse, appareil complexe et coteux.
Le principe gnral de la mthode est celui de la dilution isotopique (Annexe I). Le dbit
de production dun acide amin est calcul en mesurant la dilution dun acide amin
marqu introduit dans lorganisme. Le rapport de dilution (acide amin marqu/non
marqu) est inversement proportionnel au dbit de production de lacide amin. ltat
stationnaire (concentrations stables), ce dbit de production est gal au dbit dutilisation.
Lensemble production-utilisation constituant le dbit de renouvellement de lacide amin.
La destine de lacide amin peut galement tre quantifie dans certaines voies
mtaboliques si lon suit le traceur dans lorganisme. On mesure ainsi loxydation dun
acide amin en collectant dans les gaz expirs le CO2 marqu rcupr aprs
administration dun acide amin marqu au carbone 13.
La mthode la plus couramment utilise chez lhomme est celle dite des prcurseurs o
lacide amin utilis est la leucine. Le modle est dcrit sur la figure en annexe I. Dans cette
situation, le dbit de leucine issu des protines est un index de la dgradation protique.
Le dbit dutilisation de la leucine comporte deux composantes : le flux de leucine
incorpor dans les protines, index de la synthse protique, et loxydation de la leucine.
Cette oxydation de la leucine est mesure, on en dduit par soustraction un index de la
synthse protique.
Lors de la prise alimentaire, ladjonction dun traceur dans le repas permet de mesurer
lextraction splanchnique des acides amins et de corriger la protolyse pour la quantit
dacides amins utilise au niveau des tissus splanchniques (foie, intestin). Les flux dacides
amins dtourns vers la synthse ou provenant de la protolyse peuvent tre convertis en
flux de protines sur la base dun contenu moyen de lacide amin choisi dans les protines
totales de lorganisme (8 % pour la leucine et 4 % pour la phnylalanine). La
reprsentativit de lacide amin vis--vis du mtabolisme protique corps entier est
donc un point crucial et va dterminer le choix de cet acide amin.
La plupart des tudes utilisent la leucine, acide amin essentiel, dont la dgradation
oxydative est simple, se droule la fois dans le foie et dans le muscle (alors que la majeure
partie des autres acides amins ont une oxydation essentiellement hpatique), et dont
lanalyse en spectromtrie de masse est relativement facile.
Ce modle largement utilis et dont ont t drivs les chiffres indiqus dans lintroduction
pose cependant un certain nombre de problmes :
lorsquun bilan protique net court terme (quelques jours) doit tre mesur, le
bilan azot est lexamen de choix.
lorsquun bilan protique net sur plusieurs semaines doit tre valu, cest une
estimation de masse protique quil faudra pratiquer (cf. composition corporelle).
les mcanismes intimes lorigine dun gain ou dune perte dune ou plusieurs
protines.
dabord la rgulation par les substrats eux-mmes , quil sagisse des acides amins
ou des autres substrats nergtiques,
b) les autres substrats nergtiques : de faon gnrale, un apport nergtique suffisant est
indispensable au maintien dun bilan azot neutre ou positif. La source des apports
nergtiques nest pas indiffrente et classiquement, les glucides auraient un effet dpargne
azote suprieur celui des lipides au moins dans des circonstances dapport nergtique
limit. Cette notion est trs discute voire errone pour certains et de toute faon, nest plus
vrai lorsque les apports nergtiques sont excdentaires.
Cette liaison entre apports nergtiques et mtabolisme protique relve de plusieurs
mcanismes complmentaires :
certains substrats (acides gras chaine moyenne par exemple) peuvent avoir un
effet spcifique dactivation des enzymes de dgradation des acides amins.
Il est suivi par le jene, soit court (2 3 jours), soit prolong (suprieur 3 jours).
sujet g probablement peu diffrents de ceux de ladulte voire suprieurs (1 1,2 g/kg/j).
Lexactitude des bilans azots est ici un lment essentiel pour apprcier ces besoins
puisque la surestimation de la balance conduira la sous-estimation des besoins. De mme
une attention particulire doit tre apporte au contenu nergtique du rgime sous
lequel a t dtermin le besoin : un apport nergtique excdentaire rsultera en une
dposition protique (ce qui correspond laugmentation de la masse maigre au cours de
lobsit) et rsultera en une sous-estimation des besoins.
Les besoins en acides amins
Ils sont dtermins par la mthode suivante : des sujets reoivent une alimentation
parfaitement quilibre contenant tous les nutriments et tous les acides amins en quantit
suffisante lexception de lacide amin dont on veut mesurer le besoin. En labsence de cet
acide amin, le bilan azot est ngatif ce qui illustre le fait que labsence dun seul acide
amin suffit ralentir la synthse protique (notion dacide amin limitant). Lapport en cet
acide amin est alors progressivement augment : lorsque le bilan azot se positive, le
besoin est alors couvert.
L encore, la qualit des rsultats obtenus dpend de lexactitude du bilan azot. Les
rsultats obtenus par cette mthode sont actuellement contests par certains groupes qui
ont propos de mesurer non plus le bilan azot mais loxydation de lacide amin par des
mthodes isotopiques. Cette oxydation reste minimale tant que les besoins de la synthse
protique ne sont pas couverts puis augmente rgulirement ds que le besoin est atteint.
Les rsultats obtenus par cette mthode sont deux trois fois suprieurs ceux obtenus
classiquement. Pour linstant, les recommandations alimentaires internationales sen
tiennent aux chiffres obtenus par la mthode classique.
Les besoins de chacun des neuf acides amins pour lensemble des acides amins essentiels
sont, selon lacide amin, de 30 150 mg/kg/j chez le nourrisson (au total 750 mg/kg/j) et
seulement de 5 15 mg/kg/j (au total 80 mg/kg/j) chez ladulte. Ceci correspond aux
besoins importants de la synthse protique en priode de croissance. Les acides amins
essentiels doivent donc reprsenter chez le nourrisson plus du tiers de lazote total
apport (ce qui signifie que les protines alimentaires devront tre de haute qualit, cf
infra). Chez ladulte, cest seulement 10 % de la ration azote qui devra tre compose
dacides amins essentiels.
Enfin certains acides amins peuvent tre conditionnellement essentiels, ce qui signifie
que, loccasion dune circonstance physiopathologique donne, leur synthse endogne
nest pas suffisante pour couvrir les besoins. Cest le cas de la cystine et de la tyrosine qui
peuvent normalement tre obtenues partir de la mthionine et de la phnylalanine
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a) Lindice chimique :
il est inhrent une protine donne et se dfinit comme suit :
indice chimique = mg dun acide amin essentiel dans 1 g de protine/mg du mme
acide amin essentiel dans 1 g de protine de rfrence.
La protine de rfrence la plus courante est lalbumine de luf. Par exemple, si on
considre la quantit de lysine contenue dans la farine de bl (35 mg/g de protine)
rapporte celle contenue dans lalbumine (70 mg/g de protine) on arrive un indice
chimique pour la lysine et pour la protine de bl de 50 % (35/70). En thorie, lindice
chimique doit tre dtermin pour chaque acide amin essentiel dans une protine donne.
En pratique, on se contente dindiquer lindice chimique le plus bas parmi ceux des
diffrents acides amins, cet acide amin tant appel acide amin limitant (en pratique
sont concerns, la lysine, les acides amins soufrs et le tryptophane). Lalbumine de luf a
t longtemps utilise comme protine de rfrence, mais actuellement la composition de la
protine de rfrence est dtermine en fonction des besoins propres chaque situation
(nouveau-ns, nourrissons, enfants...).
b) La digestibilit est dfinie comme la capacit du tube digestif absorber effectivement
lazote ingr et se calcule comme suit :
azote ingr azote fcal 100
digestibilit = ------------------------------------------------------------------------------azote ingr
La digestibilit vraie inclue de plus une correction pour les pertes azotes fcales
obligatoires. La digestibilit dpend de la structure de la protine elle-mme mais
galement des ventuelles modifications que cette structure a pu subir au cours de la
prparation des aliments. La modification la plus classique est celle obtenue par la raction
de Maillard. Il sagit de la liaison dun sucre rducteur avec le groupe amin libre de la
lysine rsultant en un blocage de celle-ci. Cette lysine ne pourra donc plus tre absorbe
et 10 % 40 % de la lysine ingre (ce chiffre variant selon le mode de cuisson) seront donc
non disponibles, ce qui rduit dautant la digestibilit de la protine. Enfin, les interactions
avec dautres nutriments (en particulier les fibres et les polyphnols) peuvent jouer sur la
digestibilit dune protine.
Au total, la digestibilit est de 95 % 98 % pour les protines animales et de 75 % 95 %
pour les protines vgtales.
Lutilisation protique nette se rsume donc au produit de la digestibilit par lindice
chimique : elle est de 40 % environ pour les protines vgtales de type mas ou mil, 70 %
pour les protines de viande, 87 % pour lalbumine de luf et 95 % pour le lait de femme.
des concentrations est difficile obtenir. La ncessit de travailler une fois lquilibre atteint
explique le dlai impos (environ 2 heures pour la leucine) aprs le dbut de la perfusion
pour obtenir des prlvements significatifs.
NOTE(S) DU CHAPITRE
(97,5 %) : Les apports recommands sont dfinis comme les apports couvrant les besoins
moyens + 2 dviations standards (soit, par dfinition, 97,5 % de la population) + un
supplment variable selon les experts.
X ANNEXES
BIBLIOGRAPHIE
[1] Devlin TM Ed., : Textbook of Biochemistry. Wiley Liss, New York 1992.
Biochimie de la synthse protique (rgulations).
[2] Young V.R., Yu Y.M., Fukagawa N.K. : Energy and protein turnover. In
Energy metabolism , JM. Kinney, H.N. Tucker ed., Raven Press, New York, 1992
(relations nergie/protines).
[6] Martin A. : Apports nutritionnels conseills. Tec & Doc. Lavoisier, Paris 2001.