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COMPUTADORA

Mquina capaz de efectuar una secuencia de operaciones mediante un programa, de tal


manera, que se realice un procesamiento sobre un conjunto dedatos de entrada,
obtenindose otro conjunto de datos de salida.
TIPOS DE COMPUTADORAS
Se clasifican de acuerdo al principio de operacin de Analgicas y Digitales.

COMPUTADORA ANALGICA
1.

Aprovechando el hecho de que diferentes fenmenos fsicos se describen por


relaciones matemticas similares (v.g. Exponenciales, Logartmicas, etc.) pueden
entregar la solucin muy rpidamente. Pero tienen el inconveniente que al cambiar el
problema a resolver, hay que realambrar la circuitera (cambiar el Hardware).
COMPUTADORA DIGITAL

1.

Estn basadas en dispositivos biestables, i.e., que slo pueden tomar uno de
dos valores posibles: 1 0. Tienen como ventaja, el poder ejecutar
diferentes programas para diferentes problemas, sin tener que la necesidad de
modificar fsicamente la mquina.

HISTORIA DE LA COMPUTACIN
Uno de los primeros dispositivos mecnicos para contar fue el baco, cuya historia se
remonta a las antiguas civilizaciones griega y romana. Este dispositivo es muy sencillo,
consta de cuentas ensartadas en varillas que a su vez estn montadas en un marco
rectangular. Al desplazar las cuentas sobre varillas, sus posiciones representan valores
almacenados, y es mediante dichas posiciones que este representa y almacena datos. A este
dispositivo no se le puede llamar computadora por carecer del elemento fundamental
llamado programa.
Otro de los inventos mecnicos fue la Pascalina inventada por Blaise Pascal (1623 - 1662)
de Francia y la de Gottfried Wilhelm von Leibniz (1646 - 1716) de Alemania. Con
estas mquinas, los datos se representaban mediante las posiciones de los engranajes, y los
datos se introducan manualmente estableciendo dichas posiciones finales de las ruedas, de
manera similar a como leemos los nmeros en el cuentakilmetros de un automvil.
La primera computadora fue la mquina analtica creada por Charles
Babbage, profesor matemtico de la Universidad de Cambridge en el siglo XIX. La idea que
tuvo Charles Babbage sobre un computador naci debido a que la elaboracin de las tablas
matemticas era un proceso tedioso y propenso a errores. En 1823 el gobierno Britnico lo
apoyo para crear el proyecto de una mquina de diferencias, un dispositivo mecnico para
efectuar sumas repetidas.
Mientras tanto Charles Jacquard (francs), fabricante de tejidos, haba creado un telar que
poda reproducir automticamente patrones de tejidos leyendo la informacin codificada en
patrones de agujeros perforados en tarjetas de papel rgido. Al enterarse de
este mtodo Babbage abandon la mquina de diferencias y se dedico al proyecto de la
mquina analtica que se pudiera programar con tarjetas perforadas para efectuar
cualquierclculo con una precisin de 20 dgitos. La tecnologa de la poca no bastaba para
hacer realidad sus ideas.
El mundo no estaba listo, y no lo estara por cien aos ms.

En 1944 se construy en la Universidad de Harvard, la Mark I, diseada por un equipo


encabezado por Howard H. Aiken. Esta mquina no est considerada como
computadora electrnica debido a que no era de propsito general y su funcionamiento
estaba basado en dispositivos electromecnicos llamados relevadores.
En 1947 se construy en la Universidad de Pennsylvania la ENIAC (Electronic Numerical
Integrator And Calculator) que fue la primera computadora electrnica, el equipo de diseo lo
encabezaron los ingenieros John Mauchly y John Eckert. Esta mquina ocupaba todo un
stano de la Universidad, tena ms de 18 000 tubos de vaco, consuma 200 KW de energa
elctrica y requera todo un sistema de aire acondicionado, pero tena la capacidad de
realizar cinco mil operaciones aritmticas en un segundo.
El proyecto, auspiciado por el departamento de Defensa de los Estados Unidos, culmin dos
aos despus, cuando se integr a ese equipo el ingeniero y matemtico hngaro John von
Neumann (1903 - 1957). Las ideas de von Neumann resultaron tan fundamentales para
su desarrollo posterior, que es considerado el padre de las computadoras.
La EDVAC (Electronic Discrete Variable Automatic Computer) fue diseada por este nuevo
equipo. Tena aproximadamente cuatro mil bulbos y usaba un tipo de memoria basado en
tubos llenos de mercurio por donde circulaban seales elctricas sujetas a retardos.
La idea fundamental de von Neumann fue: permitir que en la memoria coexistan datos con
instrucciones, para que entonces la computadora pueda ser programada en un lenguaje, y no
por medio de alambres que elctricamente interconectaban varias secciones de control,
como en la ENIAC.
Todo este desarrollo de las computadoras suele divisarse por generaciones y el criterio que
se determin para determinar el cambio de generacin no est muy bien definido, pero
resulta aparente que deben cumplirse al menos los siguientes requisitos:

La forma en que estn construidas.

Forma en que el ser humano se comunica con ellas.

Generacin de las Computadoras


Teniendo en cuenta las diferentes etapas de desarrollo que tuvieron las computadoras, se
consideran las siguientes divisiones como generaciones aisladas con caractersticas propias de
cada una, las cules se enuncian a continuacin.
Primera Generacin (1951 - 1958)
Bulbos
Caractersticas Principales:

Sistemas constituidos por tubos de vaco, desprendan bastante calor y tenan una vida
relativamente corta.

Mquinas grandes y pesadas. Se construye el ordenador ENIAC de grandes


dimensiones (30 toneladas).

Alto consumo de energa. El voltaje de los tubos era de 300v y la posibilidad de


fundirse era grande.

Almacenamiento de la informacin en tambor magntico interior. Un tambor magntico


dispona de su interior del ordenador, recoga y memorizaba los datos y los programas
que se le suministraban.

Continuas fallas o interrupciones en el proceso.

Requeran sistemas auxiliares de aire acondicionado especial.

Programacin en lenguaje mquina, consista en largas cadenas de bits, de ceros y


unos, por lo que la programacin resultaba larga y compleja.

Alto costo.

Uso de tarjetas perforadas para suministrar datos y los programas.

Computadora representativa UNIVAC y utilizada en las elecciones presidenciales de


los E.U.A. en 1952.

Fabricacin industrial. La iniciativa se aventuro a entrar en este campo e inici la


fabricacin de computadoras en serie.

Segunda Generacin (1959 - 1964)


Transistores
Cuando los tubos de vaco eran sustituidos por los transistores, estas ltimas eran ms
econmicas, ms pequeas que las vlvulas miniaturizadas consuman menos y producan
menos calor. Por todos estos motivos, la densidad del circuito poda ser aumentada
sensiblemente, lo que quera decir que los componentes podan colocarse mucho ms cerca
unos a otros y ahorrar mucho ms espacio.
Caractersticas Principales:

Transistor como potente principal. El componente principal es un pequeo trozo de


semiconductor, y se expone en los llamados circuitos transistorizados.

Disminucin del tamao.

Disminucin del consumo y de la produccin del calor.

Su fiabilidad alcanza metas inimaginables con los efmeros tubos al vaco.

Mayor rapidez, la velocidad de las operaciones ya no se mide en segundos sino en


milsimas de segundos.

Memoria interna de ncleos de ferrita.

Instrumentos de almacenamiento: cintas y discos.

Mejoran los dispositivos de entrada y salida, para la mejor lectura de tarjetas


perforadas, se dispona de clulas fotoelctricas.

Introduccin de elementos modulares.

Aumenta la confiabilidad.

Las impresoras aumentan su capacidad de trabajo.

Lenguajes de programacin ms potentes, ensambladores y de alto nivel (fortran, cobol


y algol).

Aplicaciones comerciales en aumento, para la elaboracin de nminas, facturacin y


contabilidad, etc.

Tercera Generacin (1964 - 1971)


Circuito integrado (chips)
Caractersticas Principales:

Circuito integrado desarrollado en 1958 por Jack Kilbry.

Circuito integrado, miniaturizacin y reunin de centenares de elementos en una placa


de silicio o (chip).

Menor consumo de energa.

Apreciable reduccin de espacio.

Aumento de fiabilidad y flexibilidad.

Aumenta la capacidad de almacenamiento y se reduce el tiempo de respuesta.

Generalizacin de lenguajes de programacin de alto nivel.

Compatibilidad para compartir software entre diversos equipos.

Computadoras en Serie 360 IBM.

Teleproceso: Se instalan terminales remotas, que puedan acceder a la Computadora


central para realizar operaciones, extraer o introducir informacin en Bancos de Datos,
etc...

Multiprogramacin: Computadora que pueda procesar varios Programas de manera


simultnea.

Tiempo Compartido: Uso de una computadora por varios clientes a tiempo compartido,
pues el aparato puede discernir entre diversos procesos que realiza simultneamente.

Renovacin de perifricos.

Instrumentacin del sistema.

Ampliacin de aplicaciones: en Procesos Industriales, en la Educacin, en el Hogar,


Agricultura, Administracin, Juegos, etc.

La minicomputadora.

Cuarta Generacin (1971 - 1982)


Microcircuito integrado
El microprocesador: el proceso de reduccin del tamao de los componentes llega a operar a
escalas microscpicas. La microminiaturizacin permite construir el microprocesador, circuito
integrado que rige las funciones fundamentales del ordenador.
Las aplicaciones del microprocesador se han proyectado ms all de la computadora y se
encuentra en multitud de aparatos, sean instrumentos mdicos, automviles, juguetes,
electrodomsticos, etc.
Memorias Electrnicas: Se desechan las memorias internas de los ncleos magnticos de
ferrita y se introducen memorias electrnicas, que resultan ms rpidas. Al principio presentan
el inconveniente de su mayor costo, pero este disminuye con la fabricacin en serie.
Sistema de tratamiento de base de datos: el aumento cuantitativo de las bases de datos lleva a
crear formas de gestin que faciliten las tareas de consulta y edicin. Lo sistemas de
tratamiento de base de datos consisten en un conjunto de elementos de hardware y software
interrelacionados que permite un uso sencillo y rpido de la informacin
Caractersticas Principales:

Microprocesador: Desarrollado por Intel Corporation a solicitud de una empresa


Japonesa (1971).

El Microprocesador: Circuito Integrado que rene en la placa de Silicio las principales


funciones de la Computadora y que va montado en una estructura que facilita las
mltiples conexiones con los restantes elementos.

Se minimizan los circuitos, aumenta la capacidad de almacenamiento.

Reducen el tiempo de respuesta.

Gran expansin del uso de las Computadoras.

Memorias electrnicas ms rpidas.

Sistemas de tratamiento de bases de datos.

Generalizacin de las aplicaciones: innumerables y afectan prcticamente a todos los


campos de la actividad humana: Medicina, Hogar, Comercio, Educacin, Agricultura,
Administracin, Diseo, Ingeniera, etc...

Multiproceso.

Microcomputadora.

Quinta Generacin y la Inteligencia Artificial (1982 - Actualidad)


El propsito de la Inteligencia Artificial es equipar a las Computadoras con "Inteligencia
Humana" y con la capacidad de razonar para encontrar soluciones. Otro factor fundamental del
diseo, la capacidad de la Computadora para reconocer patrones y secuencias de
procesamiento que haya encontrado previamente, (programacin Heurstica) que permita a la
Computadora recordar resultados previos e incluirlos en el procesamiento, en esencia, la
Computadora aprender a partir de sus propias experiencias usar sus Datos originales para
obtener la respuesta por medio del razonamiento y conservar esos resultados para
posteriores tareas de procesamiento y toma de decisiones. El conocimiento recin adquirido le
servir como base para la prxima serie de soluciones.
Caractersticas Principales:

Mayor velocidad.

Mayor miniaturizacin de los elementos.

Aumenta la capacidad de memoria.

Multiprocesador (Procesadores interconectados).

Lenguaje Natural.

Lenguajes de programacin: PROGOL (Programming Logic) y LISP (List Processing).

Mquinas activadas por la voz que pueden responder a palabras habladas en diversas
lenguas y dialectos.

Capacidad de traduccin entre lenguajes que permitir la traduccin instantnea de


lenguajes hablados y escritos.

Elaboracin inteligente del saber y nmero tratamiento de datos.

Caractersticas de procesamiento similares a las secuencias de procesamiento


Humano.

La Inteligencia Artificial recoge en su seno los siguientes aspectos fundamentales: Los


sistemas expertos, el lenguaje natural, la robtica y el reconocimiento de la voz. Estos
aspectos se explican a continuacin:

Primera Generacin (1951 a 1958)


Las computadoras de la primera Generacin emplearon bulbos para procesar
informacin.
La programacin se realizaba a travs del lenguaje de mquina. Las memorias
estaban construidas con finos tubos de mercurio liquido y tambores magnticos.
Los operadores ingresaban los datos y programas en cdigo especial por medio de
tarjetas perforadas. El almacenamiento interno se lograba con un tambor que
giraba rpidamente, sobre el cual un dispositivo de lectura/escritura colocaba
marcas magnticas.
Estos computadores utilizaban la vlvula de vaco. Por lo que eran equipos
sumamente grandes, pesados y generaban mucho calor.
La Primera Generacin se inicia con la instalacin comercial del UNIVAC construida
por Eckert y Mauchly. El procesador de la UNIVAC pesaba 30 toneladas y requera
el espacio completo de un saln de 20 por 40 pies.

Segunda Generacin (1959-1964)


El Transistor Compatibilidad Limitada sustituye la vlvula de vaco utilizada en la
primera generacin. Los computadores de la segunda generacin ern ms
rpidas, ms pequeas y con menores necesidades de ventilacin. Estas
computadoras tambin utilizaban redes de ncleos magnticos en lugar de
tambores giratorios para el almacenamiento primario. Estos ncleos contenan
pequeos anillos de material magntico, enlazados entre s, en los cuales podan
almacenarse datos e instrucciones.
Los programas de computadoras tambin mejoraron. COBOL desarrollado durante
la 1era generacin estaba ya disponible comercialmente. Los programas escritos
para una computadora podan transferirse a otra con un mnimo esfuerzo. El
escribir un programa ya no requera entender plenamente el hardware de la
computacin.

Tercera Generacin (1964-1971)


Circuitos Integrados, Compatibilidad con Equipo Mayor, Multiprogramacin,
Minicomputadora
Las computadoras de la tercera generacin emergieron con el desarrollo de los
circuitos integrados (pastillas de silicio) en las cuales se colocan miles de
componentes electrnicos, en una integracin en miniatura. Las computadoras
nuevamente se hicieron ms pequeas, ms rpidas, desprendan menos calor y
eran energticamente ms eficientes.

Antes del advenimiento de los circuitos integrados, las computadoras estaban


diseadas para aplicaciones matemticas o de negocios, pero no para las dos
cosas. Los circuitos integrados permitieron a los fabricantes de computadoras
incrementar la flexibilidad de los programas, y estandarizar sus modelos.

La IBM 360 una de las primeras computadoras comerciales que us circuitos


integrados, poda realizar tanto anlisis numricos como administracin
procesamiento de archivos. Los clientes podan escalar sus sistemas 360 a

modelos IBM de mayor tamao y podan todava correr sus programas actuales.
Las computadoras trabajaban a tal velocidad que proporcionaban la capacidad de
correr ms de un programa de manera simultnea (multiprogramacin).

Cuarta Generacin (1971 a 1981)


Microprocesador, Chips de memoria, Microminiaturizacin
Dos mejoras en la tecnologa de las computadoras marcan el inicio de la cuarta
generacin: el reemplazo de las memorias con ncleos magnticos, por las de
chips de silicio y la colocacin de Muchos ms componentes en un Chip: producto
de la microminiaturizacin de los circuitos electrnicos. El tamao reducido del
microprocesadory de chips hizo posible la creacin de las computadoras personales
(PC)
En 1971, intel Corporation, que era una pequea compaa fabricante de
semiconductoresubicada en Silicon Valley, presenta el primer microprocesador o
Chip de 4 bits, que en un espacio de aproximadamente 4 x 5 mm contena 2 250
transistores. Este primer microprocesador que se muestra en la figura 1.14, fue
bautizado como el 4004.

Silicon Valley (Valle del Silicio) era una regin agrcola al sur de la baha de San
Francisco, que por su gran produccinde silicio, a partir de 1960 se convierte en
una zona totalmente industrializada donde se asienta una gran cantidad de
empresas fabricantes de semiconductores y microprocesadores. Actualmente es
conocida en todo el mundo como la regin ms importante para las industrias
relativas a la computacin: creacin de programas y fabricacin de componentes.

Actualmente ha surgido una enorme cantidad de fabricantes de


microcomputadoras o computadoras personales, que utilizando diferentes
estructuraso arquitecturas se pelean literalmente por el mercado de la
computacin, el cual ha llegado a crecer tanto que es uno de los ms grandes a
nivel mundial; sobre todo, a partir de 1990, cuando se logran sorprendentes
avances en Internet.

Esta generacin de computadoras se caracteriz por grandes avances tecnolgicos


realizados en un tiempo muy corto. En 1977 aparecen las primeras
microcomputadoras, entre las cuales, las ms famosas fueron las fabricadas por
Apple Computer, Radio Shack y Commodore Busness Machines. IBM se integra al
mercado de las microcomputadoras con su Personal Computer (figura 1.15), de
donde les ha quedado como sinnimo el nombre de PC, y lo ms importante; se
incluye un sistema operativo estandarizado, el MS- DOS (MicroSoft Disk Operating
System).

QUINTA GENERACIN Y LA INTELIGENCIA ARTIFICIAL (1982-1989)


Cada vez se hace ms difcil la identificacin de las generaciones de computadoras,
porque los grandes avances y nuevos descubrimientos ya no nos sorprenden como
sucedi a mediados del siglo XX. Hay quienes consideran que la cuarta y quinta
generacin han terminado, y las ubican entre los aos 1971-1984 la cuarta, y
entre 1984-1990 la quinta. Ellos consideran que la sexta generacin est en
desarrollo desde 1990 hasta la fecha.

Siguiendo la pista a los acontecimientos tecnolgicos en materia de computacin e


informtica, podemos puntualizar algunas fechas y caractersticas de lo que podra
ser la quinta generacin de computadoras.
Con base en los grandes acontecimientos tecnolgicos en materia de
microelectrnica y computacin (software) como CADI CAM, CAE, CASE,
inteligencia artificial, sistemas expertos, redes neuronales, teora del caos,
algoritmos genticos, fibras pticas, telecomunicaciones, etc., a de la dcada de
los aos ochenta se establecieron las bases de lo que se puede conocer como

quinta generacin de computadoras.


Hay que mencionar dos grandes avances tecnolgicos, que sirvan como parmetro
para el inicio de dicha generacin: la creacin en 1982 de la primera
supercomputadora con capacidad de proceso paralelo, diseada por Seymouy
Cray, quien ya experimentaba desde 1968 con supercomputadoras, y que funda en
1976 la Cray Research Inc.; y el anuncio por parte del gobierno japons del
proyecto quinta generacin, que segn se estableci en el acuerdo con seis de
las ms grandes empresas japonesas de computacin, debera terminar en 1992.

El proceso paralelo es aqul que se lleva a cabo en computadoras que tienen la


capacidad de trabajar simultneamente con varios microprocesadores. Aunque en
teora el trabajo con varios microprocesadores debera ser mucho ms rpido, es
necesario llevar a cabo una programacin especial que permita asignar diferentes
tareas de un mismo proceso a los diversos microprocesadores que intervienen.
Tambin se debe adecuar la memoria para que pueda atender los requerimientos
de los procesadores al mismo tiempo. Para solucionar este problema se tuvieron
que disear mdulos de memoria compartida capaces de asignar reas de cach
para cada procesador.

Segn este proyecto, al que se sumaron los pases tecnolgicamente ms


avanzados para no quedar atrs de Japn, la caracterstica principal sera la
aplicacin de la inteligencia artificial (Al, Artificial Intelligence). Las computadoras
de esta generacin contienen una gran cantidad de microprocesadores trabajando
en paralelo y pueden reconocer voz e imgenes. Tambin tienen la capacidad de
comunicarse con un lenguaje natural e irn adquiriendo la habilidad para tomar
decisiones con base en procesos de aprendizaje fundamentados en sistemas
expertos e inteligencia artificial.

El almacenamiento de informacin se realiza en dispositivos magneto pticos con


capacidades de decenas de Gigabytes; se establece el DVD (Digital VideoDisk o
Digital Versatile Disk) como estndar para el almacenamiento de video y sonido; la
capacidad de almacenamiento de datos crece de manera exponencial posibilitando
guardar ms informacin en una de estas unidades, que toda la que haba en la
Biblioteca de Alejandra. Los componentes de los microprocesadores actuales
utilizan tecnologas de alta y ultra integracin, denominadas VLSI (Very Large
Sca/e Integration) y ULSI (Ultra Lar- ge Scale Integration).
Sin embargo, independientemente de estos milagros de la tecnologa moderna,
no se distingue la brecha donde finaliza la quinta y comienza la sexta generacin.
Personalmente, no hemos visto la realizacin cabal de lo expuesto en el proyecto
japons debido al fracaso, quizs momentneo, de la inteligencia artificial.

El nico pronstico que se ha venido realizando sin interrupciones en el transcurso


de esta generacin, es la conectividad entre computadoras, que a partir de 1994,
con el advenimiento de la red Internet y del World Wide Web, ha adquirido una
importancia vital en las grandes, medianas y pequeas empresas y, entre los
usuarios particulares de computadoras.

El propsito de la Inteligencia Artificial es equipar a las Computadoras con


Inteligencia Humana y con la capacidad de razonar para encontrar soluciones.
Otro factor fundamental del diseo, la capacidad de la Computadora para
reconocer patrones y secuencias de procesamiento que haya encontrado
previamente, (programacin Heurstica) que permita a la Computadora recordar
resultados previos e incluirlos en el procesamiento, en esencia, la Computadora
aprender a partir de sus propias experiencias usar sus Datos originales para
obtener la respuesta por medio del razonamiento y conservar esos resultados
para posteriores tareas de procesamiento y toma de decisiones.

SEXTA GENERACIN 1990 HASTA LA FECHA


Como supuestamente la sexta generacin de computadoras est en marcha desde
principios de los aos noventas, debemos por lo menos, esbozar las caractersticas
que deben tener las computadoras de esta generacin. Tambin se mencionan
algunos de los avances tecnolgicos de la ltima dcada del siglo XX y lo que se
espera lograr en el siglo XXI. Las computadoras de esta generacin cuentan con
arquitecturas combinadas Paralelo / Vectorial, con cientos de microprocesadores
vectoriales trabajando al mismo tiempo; se han creado computadoras capaces de
realizar ms de un milln de millones de operaciones aritmticas de punto flotante
por segundo (teraflops); las redes de rea mundial (Wide Area Network, WAN)
seguirn creciendo desorbitadamente utilizando medios de comunicacin a travs
de fibras pticas y satlites, con anchos de banda impresionantes. Las tecnologas
de esta generacin ya han sido desarrolla das o estn en ese proceso. Algunas de
ellas son: inteligencia / artificial distribuida; teora del caos, sistemas difusos,
holografa, transistores pticos, etctera.

Desarrollan un software para investigar el origen de


enfermedades infecciosas
La aplicacin detecta los genes causantes de los brotes bacterianos
Investigadores del Instituto de Tecnologa de Georgia, en Estados Unidos, trabajan
en una herramienta diseada para analizar la secuenciacin del genoma microbiano
de forma automatizada, y revelar aquellos genes que originan las enfermedades
infecciosas. Bajo el nombre de CG-pipeline, la plataforma se puso a prueba en las
dos intoxicaciones alimentarias, por E.coli y Listeria, registradas el verano pasado,
precisamente las ms virulentas de los ltimos aos. Por Patricia Prez
Un fuerte brote de infeccin por la bacteria Escherichia coli (E. coli), irrumpi el pasado
verano en Alemania, extendindose despus por 16 pases europeos, Canad y Estados
Unidos. Ocasion una de las mayores alertas sanitarias de los ltimos tiempos, con 50
vctimas mortales y 4.075 casos confirmados en todo el mundo. La bacteria fue hallada en
brotes vegetales de una explotacin agrcola de la Baja Sajonia, aunque el gobierno alemn
seal en principio a Espaa como origen de los productos implicados en la intoxicacin
alimentaria, lo que desencaden la famosa crisis del pepino.
Aunque pueda parecer agresivo, el brote fue controlado al identificarse la bacteria que lo
caus. En ello jug un papel decisivo la herramienta CG-pipeline, algo as como la Tubera
de Genmica Computacional, un software de cdigo abierto capaz de automatizar el
anlisis de los genomas secuenciados de las bacterias causantes de enfermedades.
Esta plataforma es fruto de la investigacin de un equipo de estudiantes de postgrado de
Bioinformtica del Instituto de Tecnologa de Georgia, uno de los centros de
investigacin tecnolgica ms importantes del estado norteamericano del mismo nombre.
Segn se explica en un comunicado de dicho instituto, el objetivo del proyecto era crear un
conjunto integrado de herramientas informticas para el anlisis de la secuenciacin del
genoma microbiano.
De esta forma, los investigadores pretendan poner al alcance de los cientficos un
instrumento para comprender mejor las caractersticas microbiolgicas de los organismos
causantes de este tipo de enfermedades, mostrando al mismo tiempo su compromiso para
apoyar las investigaciones de brotes infecciosos de forma ms rpida y eficiente en el futuro.

Automatizacin del proceso


El equipo de investigacin trabaj desde 2008 a 2010 bajo las directrices del profesor
asociado de la Escuela de Biologa de Georgia, King Jordan, en estrecha colaboracin con
los Centros para el Control y Prevencin de Enfermedades (CDC, por su sigla en
ingls), interesados por aquel entonces en un sistema rpido y preciso que pudiera
automatizar el anlisis de los genomas secuenciados de las bacterias causantes de
enfermedades.
Determinar el orden de las bases del ADN de un genoma completo se ha vuelto
relativamente fcil y barato en los ltimos aos, gracias a los avances tecnolgicos apunta
Jordan. Sin embargo, la parte difcil segua siendo descifrar la informacin contenida en la
secuencia del genoma. Nuestro software da ese siguiente paso. Analiza las secuencias,
encuentra los genes y proporciona pistas sobre cules estn implicados en hacer que las
personas enfermen, explica el profesor.
Y todo ello de forma automatizada, agilizando sobremanera el proceso. Mientras
manualmente el anlisis sola tardar semanas, meses o un ao, ahora supone unas 24
horas, aade Jordan, quien adems da nombre al laboratorio de Biologa Computacional y
Bioinformtica Jordan Lab, en ingls- en el Instituto de Tecnologa de Georgia.
Aunque en un principio CG-pipeline fue desarrollado para el CDC, actualmente se utiliza en
todo el mundo para la investigacin en salud pblica. El brote de E. coli del pasado verano
fue su estreno ms destacado. Andrey Kislyuk, uno de los doctorandos de Bioinformtica que
ayud a Jordan a crear el software, lo utiliz mientras trabajaba en la compaa de
biotecnologa Pacific Biosciences, en Estados Unidos, para entender por qu la cepa de la
bacteria que caus el brote originado en Alemania fue tan virulenta.
El software se us para determinar qu material gentico de dos cepas previamente
diferenciadas de E. coli se haban combinado en una nueva y muy virulenta cepa, matiza
Kislyuk. El resultado de esa cepa hbrida, como el investigador la define, parece ser ms
letal que cualquiera de sus antecesoras, como se pudo comprobar mientras dur la alerta
sanitaria. Con todo, su anlisis mediante este sistema permiti agilizar la deteccin de esta
cepa desconocida hasta el momento.

Contra la listeriosis
Sin embargo, no fue esta la nica infeccin alimentaria virulenta registrada el verano pasado
y en la que se puso a prueba CG-pipeline. Otro doctorando de bioinformtica que intervino
en el diseo del software, Lee Katz, analiz la bacteria que caus una pandemia
por listeriosis en Estados Unidos mientras trabajaba en el CDC.
Este brote se detect en los melones de una nica explotacin agraria de Colorado que
estaban contaminados con listeria. Tambin fue un caso inusual, pues era la primera vez que
las autoridades sanitarias estadounidenses vinculaban con fruta fresca un brote de esta
bacteria, ms frecuente en carnes procesadas, vegetales y productos lcteos no
pasteurizados.
Durante varios meses se confirmaron 146 casos de listeriosis y 30 vctimas mortales,
convirtindose en el brote ms mortfero de enfermedades transmitidas por alimentos en
Estados Unidos de los ltimos 25 aos. Usando CG-pipeline, Katz fue capaz de identificar un
importante marcador del genoma epidemiolgico, el cual ayudar a hacer un seguimiento de
las cepas invasivas de Listeria.

La plataforma software puede utilizarse para analizar cualquier secuenciacin del genoma
microbiano. As, ya se ha probado con una bacteria causante de una variedad de
enfermedades infecciosas, incluido el clera, la salmonela y la meningitis bacteriana. Con
todo, Katz contina trabajando en estrecha colaboracin con el Laboratorio Jordan para
mejorar el programa.

Un nuevo software acelera el diagnstico precoz del cncer


Identifica a los pacientes con mayores factores de riesgo o con sntomas
preocupantes
Investigadores de la Universidad britnica de Nottingham trabajan en una
herramienta informtica que podra ayudar a los mdicos a evaluar el riesgo de un
paciente de desarrollar dos de los tipos de cncer ms comunes de pulmn y
gastroesofgico-, para mejorar as la deteccin precoz. El sistema permitira salvar
miles de vidas al ao, sin necesidad de nuevos avances en medicina. Por Patricia
Prez.
El cncer de pulmn y el gastro-esofgico son dos de los tipos de cnceres ms comunes en
todo el mundo, con bajas tasas de supervivencia debido fundamentalmente a una deteccin
tarda que impide que el paciente pueda ser tratado con xito. Mejorar el diagnstico
temprano en estos dos casos es el reto que se ha marcado un trabajo de investigacin
iniciado en la Universidad de Nottingham, en el Reino Unido.
Con la colaboracin de ClinRisk Ltd, una conocida compaa britnica especialista en
software mdico, el equipo dirigido por la profesora Julia Hippisley-Cox, de la divisin de
Atencin Primaria de la Universidad, ha desarrollado una herramienta informtica capaz de
detectar el cncer gastro-esofgico y el de pulmn en una etapa temprana, cuando aparece
en el paciente una combinacin de sntomas y factores de riesgo potencialmente
preocupantes, pero que pueden pasar desapercibidos.
Segn explica la Universidad de Nottingham en un comunicado, esta herramienta consiste
en un algoritmo que podra ayudar a los mdicos a acelerar el diagnstico y el tratamiento de
pacientes que sufren dos de los tumores ms comunes, lo que permitira salvar miles de
vidas cada ao. El diagnstico temprano del cncer es un reto importante y esperamos que
esta nueva investigacin ayude a los mdicos a identificar a los pacientes para poder
remitirlos y tratarlos cuanto antes, apunt Hippisley-Cox.
De momento, la investigacin ha arrojado buenos resultados, como demuestran las
conclusiones del estudio publicado la semana pasada en la British Journal of General
Practice, segn el cual el 10% de los pacientes que el algoritmo predijo como los de mayor
riesgo de desarrollar una de las dos enfermedades, representaron el 77% de todos los
cncer gastro-esofgico y de pulmn diagnosticados en los dos aos siguientes.
Este trabajo sigue la lnea marcada por el actual Gobierno britnico, que incluso ha creado en
asociacin con el sector terciario la Iniciativa Nacional de Sensibilizacin y Diagnstico
Precoz (NAEDI) para trabajar en este mbito. Segn sus datos, slo aumentando el
conocimiento de los sntomas y acelerando el diagnstico de la enfermedad se podran salvar
5.000 vidas al ao, sin necesidad de nuevos avances mdicos.
El estudio
Aunque la presencia del cncer puede ser delatada por los conocidos como sntomas de la
Bandera Roja, a veces estos pueden ser comunes y no especficos de un tumor en concreto,

lo que supone un dilema para el mdico de familia en su diagnstico. A ello se suman los
factores de riesgo, pues aunque algunos estn bastante bien delimitados, como el
tabaquismo en el cncer de pulmn, centrarse solamente en uno puede significar dejar atrs
muchos casos que diagnosticar.
As las cosas, el objetivo de este estudio de la Universidad de Nottingham fue precisamente
desarrollar y probar el xito de un algoritmo informtico que incorporara tanto los sntomas
como los factores de riesgo subyacentes de los pacientes para marcar a quienes necesitaran
una investigacin o una actuacin de urgencia.
Para ello se realizaron 375 prcticas reales en el Reino Unido, recogidas en el sistema de
base de datos QResearch, utilizado previamente con xito en investigaciones para la
identificacin de pacientes con mayor riesgo de desarrollar enfermedades del corazn,
fracturas, enfermedades renales o cogulos sanguneos graves.
En este caso se incluy informacin de pacientes annimos de 30 a 84 aos que no hubieran
sido diagnosticados de cncer al inicio del estudio. Para la investigacin sobre el tumor de
pulmn, se descart a los pacientes que haban visitado a su mdico de cabecera en los
ltimos doce meses con sntomas de tos con sangre, prdida de apetito o prdida de peso,
mientras que para el estudio gastro-esofgico se busc a pacientes exentos de dificultad para
tragar, vmito con sangre, dolor abdominal, prdida de apetito o prdida de peso.
De esta forma se identific a aquellos pacientes con mayores factores de riesgo asociados al
cncer, para predecir los que tenan ms probabilidades de desarrollar la enfermedad y poder
validar despus los resultados observando quines haban sido diagnosticados durante los
dos aos siguientes.
Segn las mismas fuentes, el estudio arroj que el nuevo algoritmo funcion tan bien que
podra identificar a un 10% de la poblacin en alrededor del 77% del total de nuevos casos
de cncer surgidos en dos aos.
Aplicacin del algoritmo
Comprobados los buenos resultados del estudio, el equipo de investigacin piensa ya en su
aplicacin prctica y real. Principalmente, el objetivo es incorporar el algoritmo en los
sistemas informticos mdicos, para que los facultativos puedan alertar a aquellos pacientes
con un riesgo potencialmente mayor de desarrollar cualquiera de los dos tipos de cncer
estudiados.
Para ello se han diseado dos sencillas calculadoras web, una para el cncer de pulmn y
otra para el gastro-esofgico para su uso por parte de los mdicos, aunque se baraja la
posibilidad de disear una versin ms simple disponible tambin en Internet para crear
conciencia entre el pblico en general y para animar a los pacientes con sntomas o factores
de alto riesgo a buscar el consejo de su mdico.
En el caso del algoritmo de pulmn, ste tambin podra ser utilizado para informar al
Instituto Nacional de Excelencia Clnica (NICE) britnico sobre directrices en la investigacin
y remisin de pacientes con sospecha de cncer. Por ejemplo, la gua NICE recomienda una
remisin urgente para una radiografa de trax en pacientes con sntomas persistentes como
tos con sangre, dolor en el pecho, falta de aire, tos o prdida de peso, pero no para la
prdida de apetito, a pesar de que el estudio mostr que los pacientes con este sntoma
tienen entre cuatro y cinco veces ms probabilidades de desarrollar cncer.
De momento, los estudios de la Universidad de Nottingham ya han creado gran expectacin

entre quienes trabajan en atencin primaria, pues son ellos quienes se enfrentan al
importante reto de la deteccin precoz.

Usan tcnicas de pelculas de animacin 3D para explicar el


cerebro
Un motor de renderizado genera de imgenes de alta calidad de simulaciones
cerebrales
Una investigacin desarrollada en la Facultad de Informtica de la Universidad
Politcnica de Madrid permite usar tcnicas de pelculas de animacin3D para
explicar el proyecto internacional Blue Brain, el primer intento global de ingeniera
inversa del cerebro de los mamferos, con el fin de poder estudiar la funcin y
disfuncin cerebral a travs de simulaciones por ordenador.

Investigadores de la Facultad de Informtica de la Universidad Politcnica de Madrid han


desarrollado un motor de renderizado de imgenes de alta calidad de simulaciones de la
corteza cerebral. Las imgenes obtenidas se utilizan para generar vdeos y pelculas 3D, con
la finalidad de promover la divulgacin cientfica del proyecto Blue Brain.
Tal como se explica en un comunicado de la citada facultad, lainvestigacin ha sido
realizada como proyecto fin de carrera de Omar Agudo Silva y ha estado dirigida por los
profesores delDepartamento de Arquitectura y Tecnologa de Sistemas
Informticos de la Facultad, Jos Mara Pea y Juan Hernando Vieites.
El proyecto internacional Blue Brain (BBP), dentro del cual se ha realizado esta investigacin,
es el primer intento global de ingeniera inversa del cerebro de los mamferos, con el fin de
poder estudiar la funcin y disfuncin cerebral a travs de simulaciones por ordenador.
Esta investigacin facilita a los cientficos del proyecto la generacin de imgenes, vdeos y
pelculas 3D de alta calidad para comunicar los resultados del BBP a la comunidad cientfica y
al pblico general, de manera que stos puedan centrarse en el mensaje a transmitir, en vez
de los aspectos tcnicos de la produccin del video.
Para alcanzar este objetivo, se ha creado un motor de renderizado, un software especializado
en la generacin de imgenes de escenas 3D por medio de tcnicas grficas como el trazado
de rayos. El motor desarrollado permite obtener imgenes de alta calidad de los modelos y
simulaciones neuronales del BBP.

Tcnicas de pelculas de animacin


La tcnica de renderizado empleada ha sido trazado de rayos, ampliamente utilizada en la
produccin pelculas de animacin y que posibilita la generacin de imgenes de alta calidad.
La idea bsica detrs este algoritmo consiste en imitar el modo en que los rayos de luz
interactan con las superficies en la naturaleza, por lo que permite simular una gran
variedad de efectos pticos, tales como la reflexin, refraccin o dispersin de la luz.
Esta tcnica consigue producir imgenes de gran realismo, pero su ejecucin conlleva un alto
coste computacional. Es por ello que la investigacin tambin se ha centrado en minimizar la
memoria y tiempo consumidos en la generacin de las imgenes de los modelos y
simulaciones neuronales.

El motor desarrollado hace uso de software de trazado de rayos ya existente para la


generacin de las imgenes, resolviendo la integracin del mismo en la arquitectura software
del BBP y proporcionando al usuario mecanismos sencillos de configuracin del motor que
permiten elegir entre distintas opciones de renderizado. Entre estas opciones destaca la que
permite la generacin de pares de imgenes estereoscpicas, esto es, imgenes apropiadas
para la produccin de pelculas de proyeccin estereoscpica, al modo del cine 3D.
Asimismo, se ha diseado e implementado una tcnica que permite visualizar la informacin
de simulacin mediante la asignacin de color y transparencia a las neuronas representadas
en funcin de la magnitud a representar, siendo en este aspecto donde ms hincapi se ha
hecho con el propsito de reducir el consumo de recursos.

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