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Volumen3Nmero4705Abril2016
En este nmero:
ARN de clulas de la sangre: una fuente til para diagnosticar y conocer los mecanismos
patolgicos genticos de la enfermedad de McArdle
Anlisis de metilacin del ADN libre en sangre para detectar mltiples patologas
ISSN23865113EdicinOnline
MedigenePressS.L
2016|Nm.47|Vol.3|GenticaMdicaNews|1
revistageneticamedica.com
GenticaMdicaNews
ISSN23865113EdicinOnline
UniversitatdeValncia
DepartamentodeGentica
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paraunpacienteesresponsabilidaddelosmdicosyfacultativos.ElcontenidodelapublicacinGenticaMdicaNewsnoes,enmodoalguno,sustitutodelconsejopropor
cionado por personal profesional de la salud cualificado. MedigenePress S.L. recomienda consultar de forma independiente otras fuentes, as como a otros profesionales
antesdeconfiarenlafiabilidaddeuntratamiento.
2|GenticaMdicaNews|Vol.3|Nm.46|2016
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Enestenmero:
ARNdeclulasdelasangre:unafuentetilparadiagnosticaryconocerlos
mecanismospatolgicosgenticosdelaenfermedaddeMcArdle
UnavariantegenticararaaumentaelcolesterolHDLyelriesgodeenfermedad
coronaria
Variabilidadgenticaenlaregin5q33.3yresistenciaalatuberculosis
10
AnlisisdemetilacindelADNlibreensangreparadetectarmltiplespatologas
12
PropuestaparaunServicioClnicodeResultadosGenmicosSecundarios
14
16
20
Variantes del gen SETD1A asociadas con la esquizofrenia y los desrdenes del
desarrollo
22
24
SMBEmeetingonRNAmodification.Del17al20deMayoenValencia,Espaa
28
NOTICIASCORTAS
31
CURSOSYCONGRESOS
36
Enportada:
Unnuevomtodo,basadoenelanlisisdemetilacindelADNlibreensangre,permitedetectarmltiplespatologas,
incluyendodiabetes,cncer,traumaoneurodegeneracin.
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revistageneticamedica.com
ARNdeclulasdelasangre:unafuentetilpara
diagnosticaryconocerlosmecanismospatolgicos
genticosdelaenfermedaddeMcArdle
Ines GarciaConsuegra1,2,3, Alberto Blzquez1,2,3,
Juan Carlos Rubio1,2,3, Joaqun Arenas1,2, Alfonsina
BallesterLopez4, Danille Coenen4,5, Adrin Gon
zlezQuintana1,2, Antoni L. Andreu6, Toms Pi
ns3,7,JaumeCollCant4,8 ,AlejandroLucia2,9,Gise
laNogalesGadea4#,MiguelA.Martn1,2,3#
1
Laboratoriodeenfermedadesmitocondrialesyneuro
musculares.Hospital12deOctubre,Madrid.
MaastrichtUniversity,Holanda.
InstitutdeRecercaValdHebron,Barcelona.
UniversidadEuropea,Madrid.
#Igualcontribucinenestetrabajo
LaenfermedaddeMcArdleesuntrastornometabli
cocaracterizadoporlaintoleranciaalejerciciofsico.
Los pacientes no pueden metabolizar el glucgeno
musculardebidoaladeficienciaenlaisoformamus
culardelaenzimaglucgenofosforilasaomiofosfo
rilasa(NogalesGadeaG.etal.,2016).Debidoaesta
deficiencia, los pacientes presentan fatigabilidad,
dolormuscular,dificultadoincapacidadpararealizar
tareas simples de la vida diaria, y en los casos ms
graves,lospacientespuedenpresentardebilidadcr
nica, que en algunas ocasiones les lleva a requerir
soporteparasumovilidad(LuciaA.etal.,2012).
Esunaenfermedadgenticadeherenciaautosmica
recesiva, causada por mutaciones en el gen PYGM
(NogalesGadea G. et al., 2016). Hasta el momento
se han descrito ms de 140 mutaciones diferentes
quehansidoreportadascomocausadeestapatolo
ga. El incremento en la frecuencia de nuevos casos
descritospornuestrogrupoyporotros,sugiereque
an un buen nmero de pacientes permanece sin
diagnosticar(LuciaA.etal.,2012;NogalesGadeaG.
etal.,2015).
Hastaelmomento,eldiagnsticodelospacientesse
llevaba a cabo mediante una extraccin sangunea
paraestudiarlasposiblesmutacionesmsfrecuentes
enelADN.Adems,serealizabaunabiopsiamuscu
larenaquelloscasosenlosquenosehabadetecta
do ninguna mutacin con el mtodo anterior o los
cambios encontrados eran de significado incierto. A
travsdelanlisisdeARNmuscularseproporcionaba
diagnstico a los casosms complicados, y enalgu
nasocasionesseevidenciabalapatogenicidaddelos
cambiosgenticosencontrados(GarcaConsuegraI.
etal.,2009).
Enesteestudiopresentamosunnuevoprotocolode
diagnstico basado en el estudio de ARN de la
miofosforilasa en clulas mononucleares de sangre
perifrica (abreviado PBMCs, del ingls, peripheral
bloodmononuclearcells).Elobjetivoesintentardiag
nosticar ms pacientes de McArdle y caracterizar
correctamente las mutaciones, en una muestra me
nosinvasivaquelabiopsiamuscular,comoeslaex
traccin de sangre. Para llevar a cabo este estudio,
analizamoselARNdelamiofosforilasaenelmsculo
de14individuos(7controlesy7pacientes),ylocom
paramosconelARNdelamiofosforilasaobtenidode
PBMCs(12pacientesy14controles),paraversiam
2016|Nm.47|Vol.3|GenticaMdicaNews|5
revistageneticamedica.com
MetodologapropuestaporlosautoresparaeldiagnsticogenticodelaenfermedaddeMcArdlebasadaenelestudiodelARNenPBMCs.Imagencortesadelos
autores.
bastcnicaseranigualdeeficacesalahoradedetec
tarmutaciones.
Los resultados mostraron que todas las mutaciones
encontradas en el msculo fueron tambin detecta
das en PBMCs. Adems, en las PBMCs fue posible
detectar mutaciones que en el msculo no haban
sidoidentificadas,comoeselcasodelamutacinsin
sentidop.R50*.Esteresultadoseexplicaatravsdel
mecanismo nonsensemediated mRNA de
cay (NMD), por el cual se eliminan transcritos abe
rrantes que contienen mutaciones sin sentido o que
rompen la pauta de lectura, previniendo as su acu
mulacin, y cuyo papel ya haba sido descrito en el
tejido muscular de los pacientes de McArdle
(NogalesGadea et al., 2008). Este mecanismo no
parece actuar en las PBMCs, posiblemente debido a
labajaexpresindelgenPYGMenestasclulas.Por
estemotivo,enlasPBMCspudimoscaracterizarpor
primera vez una mutacin c.645G>A, que produce
una insercin total del intrn 6 en el transcrito, adi
cionando 91 pares de bases y alterando la pauta de
lectura.DebidoalNMD,estetranscritoeradegrada
doenelmsculoimpidiendosudeteccinycaracte
rizacin.
ElusodePBMCsresultaserunmtodomssensible
paradetectarycaracterizarestetipodemutaciones.
6|GenticaMdicaNews|Vol.3|Nm.47|2016
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Referencia:
GarciaConsuegraI,etal.Takingadvantageofanold
concept, illegitimate transcription, for a proposed
novelmethodofgeneticdiagnosisofMcArdledisease.
Genet Med. 2016 Feb 25. doi: http://
dx.doi.org/10.1038/gim.2015.219
Bibliografa:
NogalesGadeaG,etal.Genesandexerciseintoleran
ce: insights from McArdle disease. Physiol Genomics
2016;48:93100.
Doi:
10.1152/
physiolgenomics.00076.2015
Lucia A, et al. Genotypic and phenotypic features of
McArdle disease: insights from the Spanish national
registry.JNeurolNeurosurgPsychiatry2012;83:322
328.Doi:10.1136/jnnp2011301593.
2016|Nm.47|Vol.3|GenticaMdicaNews|7
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Unavariantegenticararaaumentaelcolesterol
HDLyelriesgodeenfermedadcoronaria
NiveleselevadosdecolesterolHDLcausadosporunamutacinenelgenSCARB1aumentanelriesgoadesarrollarunaenfermedadcoronaria.Imagen:Medigene
PressS.L.
Tradicionalmente,losnivelesaltosdecolesterolHDL
enplasmasehanasociadoaunmenorriesgoasufrir
enfermedad coronaria, lo que ha llevado a conside
rarlo como colesterol bueno. Frente al coleste
rol malo o colesterol unido a lipoprotena de baja
densidad(LDL),cuyosniveleselevadoshansidoaso
ciados a un aumento en el riesgo cardiovascular, el
colesterol HDL, unido a lipoprotenas de alta densi
dad,permitetransportarelcolesterolnonecesarioo
presente en las arterias, al hgado, para ser excreta
do.Sinembargo,larelacinentreelmetabolismodel
colesterol HDL y el desarrollo de enfermedades car
diacas es compleja y se empieza a cuestionar queel
colesterolHDLprotejadelaenfermedadcardiacade
formadirecta.
UnrecienteestudiodelaUniversidaddePensilvania,
8|GenticaMdicaNews|Vol.3|Nm.47|2016
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publicadoenScience,acabaderevelarquelosnive
leselevadosdecolesterolHDLnosiempresonbene
ficiososyquecuandoseproducencomoconsecuen
ciadeunamutacinengenSCARB1,puedenincluso
aumentarelriesgoadesarrollarunaenfermedadco
ronaria.
Eneltrabajo,losinvestigadoresanalizaronlasecuen
ciacodificantedeunconjuntodegenesrelacionados
conlosnivelesdelpidosenplasmaen328personas
que presentaban una elevada concentracin de co
lesterolHDLenplasma.Deestemodo,identificaron
aunamujerportadoradeunamismamutacinenlas
dos copias del gen SCARB1, y 4 personas ms con
una de las dos copias del gen mutadas. A continua
cin, el equipo evalu el cambio gentico encontra
do, que da lugar a un cambio de aminocido en la
protena,dentroelcontextodelosdatosdemsde
300.000 personas recogidos por el Consorcio Global
deGenticadeLpidos,encontrandoquesupresen
ciaestabaasociadadeformaespecficaaunaumen
toenlosnivelesdecolesterolHDL.
ElgenSCARB1codificaparalaprotenaSRB1,prin
cipalreceptordelHDLenlasuperficiedelasclulas.
Conelobjetivodedeterminarcmoafectabaelcam
bioidentificadoalafuncindelreceptor,losinvesti
gadoresgeneraronclulasmadrepluripotentesindu
cidasapartirdelapersonaportadoradelamutacin
enlasdoscopiasdelgenylasdiferenciaronenclu
lashepticas.Deestemodoobservaron,queelcam
bio daba lugar a la completa prdida de funcin del
receptor.
Losresultadosdeltrabajocomplementanlosobteni
dos previamente en ratn, especie en la que se ha
observadoquelasobreexpresindeSCARB1reduce
los niveles de colesterol HDL y la aterosclerosis
mientras que la delecin del gen equivalente a lo
que sucede en las personas con mutaciones que
afectanalafuncindelgenenlasdoscopiasdeste
aumenta los niveles de colesterol HDL y acelera la
aterosclerosis. No obstante se mantienen algunas
diferencias entre ambas especies, ya que la prdida
de SCARB1 afecta a funcin reproductiva en ratn,
mientrasqueenhumanosstasemantieneintacta,
al menos en la mujer identificada con el cambio en
lasdoscopiasdelgen.
raputicaparareducirelriesgodeenfermedadcoro
nariaenlapoblacingeneral.
Dentro de las perspectivas de futuro para el equipo
deinvestigadores,seencuentralacaracterizacinde
otras funciones en el gen SCARB1 relacionadas con
losnivelesdecolesterolHDLyenfermedadcardiaca,
as como la identificacin de otros genes relaciona
dos. Con el tiempo querramos llevar a cabo prue
bas genticas en las personas con niveles altos de
colesterolHDLparaasegurarquenotienenmutacio
nescomostaqueaumentenelcolesterolHDLpero
noprotejanoinclusoaumentenelriesgoaunaenfer
medadcardiaca,manifiestaRader.
Referencia:Zanoti P, et al. Rarevariantinscavenger
receptorBIraisesHDLcholesterolandincreasesriskof
coronary heart disease. Science. 2016. Doi: 10.1126/
science.aad3517
Fuente:PennStudyShowsaFormofGeneticallyEle
vated Good Cholesterol May Actually be
Bad.
http://www.uphs.upenn.edu/news/
News_Releases/2016/03/rader/
2016|Nm.47|Vol.3|GenticaMdicaNews|9
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Variabilidadgenticaenlaregin5q33.3y
resistenciaalatuberculosis
La tuberculosis, enfermedad infecciosa causada por
la bacteria Mycobacterium tuberculosis, constituye
una de las principales causas de mortalidad en todo
elmundo.Sloen2014,casi10millonesdepersonas
enfermarondetuberculosisy1.5murieronporlaen
fermedad, indicaba el informe de la Organizacin
MundialdelaSaludpublicadoen2015.
Ante la infeccin con la bacteria Mycobacterium tu
berculosis no todas las personas desarrollan la tu
berculosis.Porejemplo,laspersonasconunsistema
inmunedebilitadotienenunmayorriesgoadesarro
llartuberculosis.Entreellas,ungrupoespecialmente
susceptiblesonlospacientesconelvirusdelaInmu
nodeficienciaHumana(VIH),paralosquelatubercu
losissuponelaprincipalcausademuerte.
Unrecienteestudio,publicadoenelAmericanJournal
ofHumanGenetics ha comparado la variabilidad ge
ntica de los pacientes con VIH que tienen tubercu
losis con la de los pacientes que no la manifiestan.
Los resultados apuntan a una regin cromosmica
como asociada al desarrollo y progresin de la tu
berculosis y sealan a una ruta molecular como po
tencial diana para el diseo de terapias para la tu
berculosis.
Paraconfirmarestahiptesis,eidentificarlosfacto
res genticos implicados, el equipo llev a cabo un
estudio de asociacin del genoma completo, en el
10|GenticaMdicaNews|Vol.3|Nm.47|2016
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Unestudioidentificaunaregincromosmicaasociadaalaresistencia
alatuberculosis.Mycobacteriumtuberculosis.Imagen:CentrodeCon
trolyPrevencindeEnfermedades.InstitutoNacionaldeSalud.EE.UU.
personasquenolosonparadeterminarlosmecanis
mos moleculares que intervienen en el proceso de
infeccin y desarrollo de la enfermedad. Hemos
identificado un locus que confiere una fuerte resis
tencia a la tuberculosis, demostrando que la utiliza
cindefenotiposextremospuedeserunaestrategia
poderosapararevelarlosmecanismosgenticosdel
hospedador en las enfermedades infecciosas com
plejas,concluyenlosautoresdeltrabajo.Estaapro
ximacinreduceelruidocausadoporlaheterogenei
dadgenticayfenotpicaypermitedetectarseales
de genes importantes en estudios con menor poder
estadstico.
Estedescubrimientopodraserelprimerpasohacia
eldesarrollodenuevostratamientosparalatubercu
losis que podran ser efectivos en ambos, los indivi
duosconVIHylapoblacingeneralindicaWilliams.
Referencia:Sobota RS, et al. A Locus at 5q33.3 Con
fers Resistance to Tuberculosis in Highly Susceptible
Individuals. Am J Hum Genet. 2016. Doi: 10.1016/
j.ajhg.2016.01.015
Fuente:HIV Patients in Africa with a Specific Genetic
Variant Have Much Lower Rate of TB. http://
casemed.case.edu/newscenter/newsrelease/
newsrelease.cfm?news_id=295
2016|Nm.47|Vol.3|GenticaMdicaNews|11
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AnlisisdemetilacindelADNlibreensangre
paradetectarmltiplespatologas
Un estudio publicado en ProceedingsoftheNational
AcademyofSciencesacabaderevelarunmtodoque
permitedetectardiversasenfermedadesenunasim
ple muestra de sangre, por medio del anlisis del
ADN que liberan las clulas de cada tejido cuando
mueren.
Mltiplespatologascomoporejemplo,ladiabeteso
laneurodegeneracinconllevanlamuertedeclulas
especficasdelorganismoenestoscasos,lasclulas
productoras de insulina o las clulas nerviosas, res
pectivamente.As,detectarlamuertecelulardepo
blacionescelularesconcretasdelcuerpohumanopo
drasuponerunaimportanteherramientaeneldiag
nstico y seguimiento de la enfermedad, especial
mentesipuedellevarseacabodeformanoinvasiva.
Sinembargo,losmtodosnoinvasivosconvenciona
lesparadetectarmuertecelularestnbasadosenlos
efectos fisiolgicos ocasionados por la prdida de
clulasyconstituyenmedidasindirectasdelamisma.
Adems,generalmentesoncapacesdedetectarni
camentelaenfermedadcuandoyaestavanzada.
El plasma sanguneo contiene ADN libre circulante
procedente de las clulas muertas de nuestro orga
nismo,porloqueenlosltimostiempos,suanlisis
harecibidogranatencinconfinesdiagnsticos.Por
ejemplo, las denominadas biopsias lquidas han per
mitidoidentificarlapresenciadeADNtumorallibera
dodeclulastumoralescirculantesoclulastumora
les muertas e incluso detectar su origen celular.
Igualmente, las tcnicas de diagnstico prenatal no
invasivaspermitendetectaralgunasalteracionescro
mosmicasapartirdelADNfetalpresenteenlasan
grematerna.Estasaproximaciones,suelenestnba
sadasencompararlasecuenciadeADNentreclulas
dediferentecomposicingenmicanormalcncero
madrenio. No obstante, en el caso de la muerte
celular, la comparacin de secuencias no es posible
puestoquealtratarsedeclulasdelmismoorganis
mo,susecuenciaesidntica.
AdemsdeconsiderarlapresenciadeADNfragmen
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Unnuevomtodo,basadoenelanlisisdemetilacindelADNlibreensangre,permitedetectarmltiplespatologas,
incluyendodiabetes,cncer,traumaoneurodegeneracin.
2016|Nm.47|Vol.3|GenticaMdicaNews|13
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PropuestaparaunServicioClnicodeResultados
GenmicosSecundarios
Aunqueengeneral,muchosdelosresultadosgenmicossecundariosnosonrelevantesparalasalud,paraunpequeoporcentajedepersonaspuedentener
importantesrepercusionesclnicas.ImagencortesadeMartaYerca.
14|GenticaMdicaNews|Vol.3|Nm.47|2016
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sontaninesperados,enlaactualidadrecibenelnom
bremsacertadoderesultadosgenmicossecunda
rios.
La mayor parte de los resultados genmicos secun
darios no son relevantes. Sin embargo para un pe
queoporcentajedepersonas,puedentenerimpor
tantesrepercusionessobrelasalud,algunasdeellas
conpotencialessolucionesclnicas.
El deber u obligacin, por parte de los equipos de
investigacin o profesionales clnicos, de comunicar
laexistenciaderesultadosgenmicosconrelevancia
clnicaalosparticipantesenlosestudiosgenmicos,
es objeto de un intenso debate todava no resuelto.
Existeciertoacuerdosobreelhechodequelosresul
tadosconaltoimpactosobrelasaludpresenteofu
turadelosparticipantesdeberansercomunicadosa
stos.Sinembargo,llevaracaboestaaccinpodra
suponerunagrancantidadderecursosporpartede
los grupos de investigacin, que no siempre estn
Sugerimosqueunservicioasproporcionaramayo
resbeneficiosquelaprcticaactualatodaslaspartes
implicadas,concluyenlosautores.Animamosalos
centrosdeinvestigacinaconsiderarlaadopcinde
unServicioClnicodeResultadosGenmicosSecun
darioscentralizado.
Referencia:DarnellAJ,etal.AClinicalServicetoSup
porttheReturnofSecondaryGenomicFindingsinHu
man Research. Am J Hum Genet. 2016. Doi: http://
dx.doi.org/10.1016/j.ajhg.2016.01.010
Unadelascuestionesaconsiderartambin,eseltipo
de resultados genmicos secundarios que deberan
comunicarsealosparticipantes.Inicialmentelosau
tores recomiendan empezar con una reducida lista
de genes responsables de provocar patologas con
granrepercusinmdica.
Entre los beneficios que supondra tener un Servicio
ClnicodeResultadosGenmicosSecundariosdesta
ca la creacin de mecanismos estandarizados y uni
formesparacomunicarestosresultadosalospartici
pantesenlasinvestigaciones.
Losautoresreconocenquelapropuestarequiereto
davamejoras.Porejemplo,quedanporresolverlas
cuestioneseconmicasoquienasumirloscostesde
confirmarlosresultadosgenmicosytransmitirlosa
laspersonasafectadasoqupartedelprocesocorre
racargodecadapiezadelengranajenecesariopara
completar el Servicio Clnico propuesto. Otro de los
retosesdecidircmoaplicarlapropuestaenaquellos
proyectos de investigacin que carecen de recursos
paraobtenerresultadossecundariosoparahaceruso
de ellos. Este sera el caso de proyectos llevados a
caboenregionesdondelosserviciosdesaludnoper
mitenhacerunseguimientoousodelainformacin
genmicaqueinfluyasobrelasaluddelosparticipan
tes.
2016|Nm.47|Vol.3|GenticaMdicaNews|15
revistageneticamedica.com
Diagnsticomolecularporsecuenciacinmasiva
deglucogenosisyenfermedadesconsntomas
clnicossolapantes
AnaIVega 1,2,3,CeliaMedrano 1,2,3,RosaNavarrete
1,2,3
, Lourdes R Desviat 1,2,3, Begoa Merinero 1,2,3,
PilarRodrguezPombo 1,2,3,IsidroVitoria 4,Magda
lenaUgarte1,2,3,CeliaPrezCerd1,2,3,BelnPrez
1,2,3
1
CentrodeDiagnsticodeEnfermedadesMoleculares,
CentrodeBiologaMolecularSOUAMCSIC,Universi
dad Autnoma de Madrid, Campus de Cantoblanco,
Madrid
2
InstitutodeInvestigacinLaPaz(IdiPAZ),Madrid
Eltrminoglucogenosis(GSD)comprendeungrupo
de enfermedades genticas caracterizadas por pre
sentar alteraciones en el metabolismo del gluc
geno. Hasta el momento, han sido identificados 23
tiposdedefectosconunamplioespectroclnicoque
abarcadesdealteracioneshepticas,cardiacas,mus
cularesyfrecuentementeconafectacindelsistema
nervioso central. Se estima que su incidencia en la
poblacinoscilaen1casoporcada2.000a43.000
individuos(Ozenetal.,2007;Hicksetal.,2011)
Curiosamente,lavariacinfenotpicaesamplia,yla
enfermedad puede tomar diferentes cursos clnicos
inclusoapesardequeestinvolucradalamismaen
zima. Tambin se observa variacin en la edad de
aparicindelossntomas,morbilidadymortalidad,y
dependiendo del gen afectado y de la mutacin es
pecfica involucrada el pronstico puede ser favora
ble o desfavorable (Pascal Laforet, 2012). En cual
quier caso, es imprescindible un diagnstico precoz
sisequieremejorarlacalidaddevidadelpacientee
16|GenticaMdicaNews|Vol.3|Nm.47|2016
revistageneticamedica.com
instaurar,sifueraposible,untratamientoadecuado
enlamayorbrevedadposible.Hastaahora,debidoa
la inespecificidad de su presentacin clnica y a la
inexistenciademarcadoresespecficos,eldiagnsti
co bsicamente estaba basado en la secuenciacin
gen a gen mediante el mtodo tradicional de San
ger, resultando ser un procedimiento muy largo y
costoso.Afortunadamente,elrecientedesarrollode
la captura y secuenciacin de alto rendimiento ha
hechoalasecuenciacinmasivaunatcnicafactible
para el diagnstico gentico de rutina (Ng et al.,
2010), siendo una tcnica muy efectiva econmica
menteyespecialmenteapropiadaenlabsquedade
mutaciones en defectos con alta heterogeneidad
gentica como son la GSD, defectos congnitos de
glicosilacin, defectos lisosomales, defectos mito
condriales,etc.(Jonesetal.,2011;DaReetal.,2013;
FernandezMarmiesse et al., 2014; Wang et al.,
2013).Adems,paragenesgrandescomoeselAGL,
causantedelaGSDtipoIII,elanlisisgenticocon
vencionalconsisteenlaamplificacinde34exonesy
los correspondientes controles de contaminacin,
ademsdelaconsecuentesecuenciacinbidireccio
nal. La secuenciacin masiva no solo permite se
cuenciartodoslosexonesdeunasolavez,reducien
do el coste y tiempo empleado, sino que facilita el
anlisisdevariospacientesenelmismoensayotras
aadir marcadores especficos de secuencia (como
un cdigo de barras de DNA) para cada muestra.
Adems,lasecuenciacinmasivaevitaelalleledrop
out, y en muchos casos permite detectar reordena
mientosgenmicos,loscualespuedensercompleta
mente caracterizados utilizando arrays del genoma
completo.Todoello,hacequeresulteunatcnicade
altorendimientoconmenorcosteytiempodeejecu
cin.
Presentamoseluso,tantodeunpaneldiseadoque
captura 120 genes responsables de distintas enfer
medadesmetablicas,incluidoslosgenescausantes
de GSD, como el panel de exoma clnico Trusight
Lautilizacindeunpaneldeexomaclnicojuntoconunahistoriadetalladadelpacienteresultaeficazeneldiagnsticodedefectosconfenotiposclnicossolapan
tes.
Eldiagnsticogenticoesimprescindibleparapoderllevaracabountratamientoadecuado.Imagen:NationalInstitute
ofHealth,EEUU,http://www.genome.org.
18|GenticaMdicaNews|Vol.3|Nm.47|2016
revistageneticamedica.com
elgenLIPA(OMIM613497,DeficienciaenLipasaAci
daLisosomal).Enlosotros3pacientes,quepresenta
ban afectacin cardiaca o muscular, identificamos
cambios descritos en los genes NKX25 (OMIM
600584, Tetraloga de Fallot), CPT2 (OMIM 600650,
miopatapordeficienciaencarnitinapalmitoiltrans
ferasa II) y ANO5 (OMIM 608662, Distrofia muscular
de cintura y extremidades tipo 2L). En todos los ca
sos,lapresentacinatpicadelaclnicadelpacientey
el solapamiento de rasgos fenotipos y bioqumicos
con las GSD dieron como resultado una sospecha
diagnstica inicial errnea. Por ejemplo, el defecto
en LIPA fue descartado por los clnicos por la ligera
dislipidemia que presentaba el paciente y el defecto
enCPT2fuedescartadoporlaausenciadeacilcarniti
nas en plasma, ambos marcadores bioqumicos de
dichaspatologas.Lareevaluacindelosdatosclni
cosenestrechacolaboracinconlosmdicospermi
tiqueserealizaraundiagnsticopreciso.Enconse
cuenciaesdedestacarquesininformacinfenotpica
delpaciente elanlisisgenmicotieneunvalorm
dicolimitado
El diagnstico gentico adems de proporcionar la
posibilidaddeasesoramientogenticoesimprescin
dibleparainstaurarunadecuadotratamientoyevitar
daos irreversibles al paciente, aunque esta tarea
puede ser de alta complejidad cuando se trata de
patologas heterogneas donde pueden estar impli
cados mltiples genes. Algunos de los diagnsticos
realizadosenestetrabajopermitieronlaprescripcin
de tratamientos adecuados a los pacientes. Por
ejemplo, el paciente con deficiencia en LIPA antes
diagnosticadocomoGSDahorasehaincluidoenun
ensayo clnico de reemplazamiento de la protena
(www.synageva.com/) y el paciente con deficiencia
en ALDOB antes diagnosticado de GSD ahora se le
haprescritounadietalibredefructosayhamejorado
considerablemente.
Enresumen,losresultadosobtenidosdemuestranel
altorendimientodelasecuenciacinmasivaaplicada
endefectosaltamenteheterogneosgenticamente
comoeslaGSD,respectoaltiempodeejecucinyal
coste econmico. Adems, el uso de un panel de
exoma clnico junto con una historia detallada del
paciente resulta altamente eficaz en el diagnstico
dedefectosconfenotiposclnicossolapantes,loque
permitepreinscribiruncorrectotratamientoyevita
que los pacientes sigan un tratamiento inadecuado
duranteaosyaos.
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2016|Nm.47|Vol.3|GenticaMdicaNews|19
revistageneticamedica.com
EliminacindelgenomadelVIHdelinfocitos
humanosmediantetcnicasdeedicin
delgenoma
UnequipodeinvestigadoresdelaUniversidadTem
ple ha conseguido eliminar, utilizando la tecnologa
CRISPR de edicin del genoma, el genoma del virus
delVIHdelinfocitosTCD4humanos.
Aproximadamente 37 millones de personas estn
infectadasconelvirusdelainmunodeficienciahuma
na,elVIH.Laterapiaantiretroviral,recibidaporcerca
de16millonesdelosinfectados,controlalosniveles
delvirusyrestauraloslinfocitosTCD4+principaltipo
celularafectadoporelvirus.Sinembargo,noesca
pazdeeliminarlainfeccinlatente,representadapor
los linfocitos T en los que el genoma del VIH se ha
integrado en el genoma humano. Adems, si se de
tiene el uso de los frmacos antivirales, el VIH es
reactivadoylainfeccinprogresadenuevo.
Unaestrategiaparacurardeformadefinitivalainfec
cin por el VIH sera eliminar completamente el VIH
integrado en el genoma de las clulas diana. Para
ello,losinvestigadoresdisearontcnicasdeedicin
del genoma basadas en CRISPR que reconocieran
secuencias especficas del ADN proviral del VIH. A
continuacin,introdujeronenunalneacelularinfec
tadaporelVIHloscomponentesdelsistemaCRISPR:
ARNs gua complementarios a secuencias del ADN
proviral yunaenzima,Cas9,quecortarael ADNen
las posiciones marcadas por los ARNs gua, seccio
nando parte del genoma proviral fuera del genoma
humano. Posteriormente, las roturas en el genoma
humanoseranreparadasporlapropiamaquinariade
laclula,dejandocicatricesomutacionesenelgeno
maproviral,inactivndolo.
Utilizando esta aproximacin, los investigadores no
sloconsiguieroneliminarelADNproviraldelVIHen
linfocitosCD4+,sinoquetambininhibieronlainfec
cin de HIV en linfocitos T CD4+ en cultivo y supri
mieron la replicacin del virus en clulas mononu
cleadasdesangreperifricaobtenidasdepacientes.
Atravsdelasecuenciacindelgenomaydiferentes
anlisis bioinformticos, el equipo comprob que la
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LinfocitoinfectadoporelVIH.Imagen:InstitutoNacionaldeAlergiayEnfermedadesInfecciosas(NIAID).InstitutoNacionaldeSalud(NIH),EE.U
nomapuedenserdiseadosparareconocersecuen
cias especficas del genoma viral y actuar como
agentesantiviralesenlasclulasinfectadasconVIH.
Una estrategia similar a la utilizada recientemente
para eliminar retrovirus endgenos del genoma del
cerdo con el objetivo de abrir el camino hacia los
trasplantesdecerdoahumano.
Estos experimentos no se haban realizado previa
mente hasta este nivel, concluye Khalili. Pero las
cuestionesqueplanteansoncrticasylosresultados
nospermitenavanzarenestatecnologa.
2016|Nm.47|Vol.3|GenticaMdicaNews|21
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VariantesdelgenSETD1Aasociadasconla
esquizofreniaylosdesrdenesdeldesarrollo
Un estudio internacional acaba de revelar que las
personas con mutaciones que afectan la funcin del
genSETD1Apresentanunriesgoadesarrollaresqui
zofrenia35vecesmayorqueelrestodelapoblacin
as como un riesgo aumentado a otros desrdenes
deldesarrollo.
La esquizofrenia es un desorden neuropsiquitrico
complejoenelqueintervienentantofactoresgenti
coscomoambientales.Diferentesestudiosgenmi
cos han mostrado que la base gentica responsable
de la esquizofrenia incluye la participacin tanto de
variantes genticas de riesgo comunes en la pobla
cincomopocofrecuentesydenuevaaparicin.Sin
embargo, esta compleja arquitectura gentica ha
dificultadolaidentificacindelasvariantesgenticas
individuales responsables de la enfermedad y hasta
elmomentomuypocashansidoencontradas.
El nuevo estudiodirigidoporelWellcomeTrustSan
gerInstituteanaliz el exoma completo, la parte del
genomaquecodificaparaprotenas,demsde4.264
pacientes con esquizofrenia, 9.343 controles y 1.077
trosdefamiliasconlaenfermedad,encontrandouna
fuerte asociacin entre variantes de prdida de fun
cindelgenSETD1Ayelriesgoadesarrollarlaenfer
medad. Los investigadores encontraron variantes
genticas que afectan la funcin de SETD1A en 10
pacientesconesquizofrenia,7deloscualestambin
presentaban problemas de aprendizaje. Adems, el
equipo encontr cuatro portadores de este tipo de
variante, muy poco frecuente en la poblacin gene
ral, en una muestra de 4.281 nios con desrdenes
deldesarrollo,ydosportadoresmsenunamuestra
de casi 6.000 exomas de poblacin finlandesa con
sntomasneuropsiquitricos.
SETD1A codifica para una enzima metiltransferasa
encargadadecatalizarlaadicindeungrupometilo
enposicionesconcretasdelahistonaH3,componen
tedelacromatina.Estohacepensarquelasmodifi
cacionesdelacromatina,ylaregulacindelaexpre
singnicaqueseproducecomoresultado,constitu
yenunimportantemecanismomoleculareneldesa
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rrollodelaesquizofrenia.Mutacionesenotrosmiem
bros de la familia a la que pertenece SETD1A, dan
lugaradesrdenesmendelianos(causadospormuta
ciones en un nico gen) que incluyen discapacidad
intelectual lo que apoya el importante papel de las
metiltransferasasylasconsecuenciaspatolgicasde
sualteracin.
Las variantes identificadas en el gen SETD1A son
muy poco frecuentes en la poblacin y adems, se
presentan en una pequea fraccin de los pacientes
con esquizofrenia. No obstante, los resultados del
trabajoproporcionanunanuevapiezaenelrompeca
bezasdelaesquizofrenia,elpapeldelametilacinde
lacromatina,ademsdeidentificarunelementoco
mndelaenfermedadconotrosdesrdenesdelneu
rodesarrollo.
Los resultados fueron sorprendentes, no slo por
encontrar con un elevado grado de certeza que el
gen SETD1A estaba involucrado, sino tambin que
losefectosdelgenerantangrandes,indicaJeBa
rret, director de uno de los grupos de investigacin
implicadoseneltrabajo,enelWellcomeTrustSanger
Institute.Losdesrdenespsiquitricossonenferme
dadescomplejasqueimplicanamuchosgenes,yes
extremadamente difcil encontrar pruebas conclu
yentesdelaimportanciadeunnicogen.Esteesun
resultado realmente emocionante para la investiga
cinenesquizofrenia.
Tenemos un conocimiento muy limitado de cmo
surgelaesquizofreniayestohafrenadolosintentos
de desarrollar nuevos tratamientos, indica Mike
Owen, director del MRC Center for Neuropsychiatric
GeneticsandGenomicsde la Universidad de Cardi.
Los frmacos actuales, nicamente efectivos para
aliviaralgunosdelossntomas,puedenllevarapreo
cupantesefectossecundarios,ysoninefectivaspara
unaminoradecasos.Elinvestigadoraadequelos
defectosenelgenSETD1A,queporsmismoexplica
una pequea cantidad de casos, podran guiar hacia
nuevas rutas moleculares como diana de frmacos
teraputicosenungrannmerodepacientes.
Estructuramoleculardeunnucleosoma,unidadbsicadelacromatina,formadopor8subunidadesdeprotenashistonasrodeadasporunfragmentodeADN.
Imagen:ProteinDataBase1AOI,visualizadaconQuteMol(http://qutemol.sourceforge.net).
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Difundir,conocerydebatir:Twittery
ladivulgacincientficaavanzandelamano
LucaMrquezMartnez,GenticaMdicaNews
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Twitterhalogradohacerseunhuecoenelciberespaciocomoherramientadedivulgacincientficaenmasa,perotam
bincomovehculodeconversacineintercambiodenoticiasentreinvestigadores.
Estaraldadeformasencilla
Desdesunacimiento,Twitterhaestadoencontinua
evolucin, incorporando cambios como el uso de
la @ para mencionar a otros usuarios,
las etiquetas como mtodo para buscar y organizar
contenido o el ahora imprescindible botn de retui
tear.Estasinnovacioneshancontribuidoapotenciar
susposibilidadescomoescenarioptimoparaladis
cusin entre expertos, el acceso al conocimiento
cientfico y la lectura colectiva de contenidos. Y es
que,atravsdelmicroblogging,losinvestigadoresno
solamente pueden mantenerse actualizados y dar
mayor visibilidad a su investigacin, sino tambin
participar en comunidades cientficas virtuales o in
clusocompartirlasdistintasfasesporlasqueatravie
sasutrabajo.
Alahoradeestablecerlaslneasdeactuacinenlas
redessociales,lamayoradecentroscombinantanto
ladifusindesuspropiostrabajoscomodeotrasno
ticias que puedan resultar interesantes para el resto
de usuarios. De esta forma, sus seguidores logran
tenerasualcanceunagrancantidaddeinformacin
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dores.Tambinsugranalcancesocial.Eslaredso
cial ms rpida para comentar eventos en directo y
para diseminar anuncios de iniciativas, resultados o
ideas, apunta Montoliu. Si uno elige inteligente
mente a quin seguir es como leer los titulares de
todo aquello importante que ocurre en tu especiali
dad,aadeDopazo.
EntrelasdesventajasmsrelevantesdeTwiter,des
deelCIBERsealanlasaturacindelainformacin
Siunoeligeinteligentementea
quinseguirescomoleerlos
titularesdetodoaquello
importantequeocurreentu
especialidad
alaquetodosestamossometidoshoyenda,mien
trasqueelCIPFapuntaalusoincorrectoqueciertos
usuarios puedan hacer de la herramienta. Por su
parte, Montoliu destaca la brevedad de sus mensa
jes,que,ensuopininexigeunanecesariayoportu
nareflexindeloqueseescribeantesdelanzarlo.Si
no, Twitter puede convertirse rpidamente en una
plazapblicadondepredominaelgriteroyelruido.
Para Dopazo el problema principal es la imposibili
daddeabarcartodoloqueaunolegustaraseguiry
locomplicadoqueresultaavecestrazarlalneaentre
recibirloqueunoquieresaberyrecibirunainmane
jableriadainformacin.Denuevo,lasaturacinsur
gecomoamenaza.
Dada la audiencia potencial que se encuentra en
Twitterylaposibilidaddellegaramillonesdeindivi
duos, esta red social se presenta tambin como un
mtodo nuevo para que los jvenes cientficos pro
mocionensutrabajo,aumentensuvisibilidadyesta
blezcan un red de contactos estable, amplia, trans
versalydecalidad.Sinembargo,existeciertacontro
versiaalrespecto.Ladifusinesunapartecrucialen
la carrera del cientfico, aunque exista una corriente
depensamientoanticuadaquemantengaposiciones
untantoremisasadifundirfueradecanalesortodo
xoscomorevistasycongresos,sugiereDopazo.
Atravsdelmicroblogging,losinvesti
gadores no solamente pueden man
tenerse actualizados y dar mayor
visibilidad a su investigacin, sino
tambin participar en comunidades
cientficas.
Obviamente,hayquedifundircontenidoecalidado
entramosenelterrenode los vendedores dehumo.
Para ello, resulta de utilidad el ndice Kadashian
(https://en.wikipedia.org/wiki/Kardashian_Index)que
mide la relacin en de la cantidad de difusin que
haceuncientficoylacalidaddeloquedifundeaa
de.
Enmicasomiintersentwitteresparadifundirlos
eventos o los resultados en los que participamos y
colaboramos, y/o para comentar otros resultados e
ideascientficasquevanapareciendoenelcampo.Es
indudablequelaparticipacinentwitterespartede
lamarcapersonaldecadauno,peroenmicasono
lo uso con objeto de promocionar mi carrera profe
sional, sino para diseminar las ideas o eventos que
creo pueden ser interesantes a otras personas, co
mentaMontoliu.
A menudo en las redes sociales la frontera entre lo
pblico y lo privado se diluye con facilidad. En este
sentido, cabe preguntarse si es positivo para los in
vestigadorescompartirensusperfilesasuntostanto
profesionalescomopersonalesosi,porelcontrario,
lesresultaramsconvenienteceirse nicamentea
cuestionescientficas.Meparecequecadaunodebe
tomar su propia decisin. Lo interesante de Twitter
es que tiene un rpido efecto autorregulador. Si un
investigador con opiniones interesantes inunda su
cuenta con aburridas fotos familiares de sus barba
coas familiares rpidamente perder seguidores,
explicaDopazo.
Yotengounasolacuentadetwitter,queuso,funda
mentalmente para temas cientficos, pero en la que
tambin manifiesto mi visin sobre otros temas o
comparto cuestiones personales que puedan ser de
intersparaterceros,sealaMontoliu.Loscientfi
cos somos tambin miembros de esta sociedad y,
como tales, tenemos nuestras opiniones polticas,
sociales,culturales,etc... Creo quees bueno quelas
manifestemos. Esto nos acerca al resto de la ciuda
dana. Nopodemosquedar impasiblesaloqueocu
rre fuera de nuestra burbuja cientfica, subraya el
investigadordelCIBERER.
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SMBEmeetingonRNAmodification
Del17al20deMayoenValencia,Espaa
MiguelGallach
CenterforIntegrativeBioinformaticsVienna(CIBIV)
ElARNesunamolculaesencialparalaexpresiny
regulacin de los genes. Mediante el procesado o
modificacinbioqumicadelARN,lasclulaspueden
generarunnmerocasiinfinitodevariantesmolecu
lares y formas de regular la expresin gnica. Por
ejemplo,mediantelaconversinoeditadodeadeni
naseninosinas(AenI)ocitosinasenuracilos(Cen
U), las clulas pueden controlar el splicing alternati
vo,regularelprocesadodelosmicroARNs,omodifi
carlapropiasecuenciadeaminocidosoriginalmen
tecodificadaenelgenoma.LametilacindelN6de
lasadenosinas,estimplicadaenlaregulacindela
apoptosis y la pluripotencialidad de las clulas en
mamferosascomoenlainterrupcindeldesarrollo
en plantas. Los microRNAs, adems de su conocida
implicacin en la regulacin de la expresin gnica,
tambinparticipanenlaestabilidaddeloscentrme
rosytelmeros,estructurasprimordialesdeloscro
mosomas. Algunos de esto procesos cooperan o in
clusocompitenporlaregulacindelARN,comoocu
rreentreeditadodeAenIyelARNdeinterferencia.
Varios estudios han mostrado recientemente el po
tencialadaptativodealgunostiposdeprocesadodel
28|GenticaMdicaNews|Vol.3|Nm.47|2016
revistageneticamedica.com
ARNenlaaclimatacinanuevosregmenesdetem
peratura, defensa antiviral o respuesta inmune en
plantasantepatgenos.Culeslacontribucindel
procesadodelARNenlaevolucindelosgenomas?
Los recientes avances en secuenciacin masiva del
ADN (Next Generation Sequencing, o NGS) nos per
mitenahoradetectarmodificacionesdelARNaesca
lagenmica,ynosofrecenunaoportunidadsinpre
cedentes para estudiar lafuerzas evolutivas que go
biernanlaevolucindeestossitios.Unbuenejemplo
deestoeselanlisisgenmicodeleditadodeAenI
medianteelusodeNGS,quenoshapermitidodetec
tar cientos de miles de modificaciones hasta ahora
desconocidas (St. Laurent et al., 2013; Bazak et al.,
2014)yhacerlosprimerosanlisiscomparativosen
tre especies. Una de las observaciones mas intere
santesdeestosanlisisesquelatasadesustitucin
esnotablementemayorenlossitioseditadosqueen
los no editados. Algunos investigadores defienden
que estas diferencias evidencian evolucin adaptati
va en los sitios editados mientras que otros autores
clamanqueestasdiferenciassonproductodelazar,y
portanto,neutrales.
Comprenderlosmecanismosmolecularesypatrones
evolutivos de estos procesos moleculares es uno de
losnuevosdesafosdelainvestigacinbiolgica,m
dicayevolutiva.Por estemotivo,entre el 17yel20
demayo,Valenciaacogerenuncongresoaexpertos
de diferentes pases para discutirlos nuevos avances
enelcampo.Elcongresoestafinanciadomayormen
te por la Society for Molecular Biology and Evolution
(SMBE),unadelassociedadesacadmicasconmayor
prestigio internacional para el estudio de la biologa
molecularyevolutiva.Lagenerosacontribucindela
Universidad de Valencia permitir que la celebracin
del congreso tenga lugar en el emblemtico Jardn
BotnicodelaciudaddelTuria.
Ms informacin del evento
smbeed2016.cibiv.univie.ac.at/.
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SMBESatelliteMeetingonRNAmodificationand
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ECRD2016:TheEuropeanConferenceonRareDi
seases&OrphanProducts
Fechaylugar:1720Mayo2016,Valencia
Fechaylugar:2628Mayo,Edimburgo,ReinoUnido
Organizacin:SocietyofMolecularBiologyandEvo
lution
Informacin:http://www.rarediseases.eu/
Informacin:http://smbeed2016.cibiv.univie.ac.at/
TheEuropeanHumanGeneticsConference
Fechaylugar:2124Mayo2016
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Informacin:https://www.eshg.org/
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