Sunteți pe pagina 1din 151

ISSN 1810-0716

11

FAO PRODUCTION ET SANT ANIMALES

directives

CARACTRISATION
PHNOTYPIQUE DES RESSOURCES
GNTIQUES ANIMALES

11
FAO PRODUCTION ET SANT ANIMALE

directives

CARACTRISATION
PHNOTYPIQUE DES RESSOURCES
GNTIQUES ANIMALES

ORGANISATION DES NATIONS UNIES POUR LALIMENTATION ET LAGRICULTURE


Rome, 2013

Citation recommande
FAO. 2013. Caractrisation phnotypique des ressources gntiques animales.
Directives FAO sur la production et la sant animales No. 11. Rome.

Traduction: Vanessa Board


Rvision technique du texte: Xavier Rognon

Les appellations employes dans ce produit dinformation et la prsentation


des donnes qui y figurent nimpliquent de la part de lOrganisation des
Nations Unies pour lalimentation et lagriculture (FAO) aucune prise de
position quant au statut juridique ou au stade de dveloppement des pays,
territoires, villes ou zones ou de leurs autorits, ni quant au trac de leurs
frontires ou limites. La mention de socits dtermines ou de produits de
fabricants, quils soient ou non brevets, nentrane, de la part de la FAO,
aucune approbation ou recommandation desdits produits de prfrence
dautres de nature analogue qui ne sont pas cits.
Les opinions exprimes dans ce produit dinformation sont celles du/des auteur(s)
et ne refltent pas ncessairement les vues ou les politiques de la FAO.
E-ISBN 978-92-5-207843-2 (PDF)
FAO, 2013 [dition franaise]
FAO, 2012 [dition anglaise]
La FAO encourage lutilisation, la reproduction et la diffusion des informations
figurant dans ce produit dinformation. Sauf indication contraire, le contenu
peut tre copi, tlcharg et imprim aux fins dtude prive, de recherches
ou denseignement, ainsi que pour utilisation dans des produits ou services non
commerciaux, sous rserve que la FAO soit correctement mentionne comme source
et comme titulaire du droit dauteur et condition quil ne soit sous-entendu en
aucune manire que la FAO approuverait les opinions, produits ou services des
utilisateurs.
Toute demande relative aux droits de traduction ou dadaptation, la revente ou
dautres droits dutilisation commerciale doit tre prsente au moyen du formulaire
en ligne disponible www.fao.org/contact-us/licence-request ou adresse par
courriel copyright@fao.org.
Les produits dinformation de la FAO sont disponibles sur le site web de la
FAO (www.fao.org/publications) et peuvent tre achets par courriel adress
publications-sales@fao.org.
FAO 2013

iii

Table des matires


Acronymes
Remerciements
Prambule

vii
ix
xi

Introduction 1
Justification 1
Contexte et laboration des directives

Guide de lutilisateur

Section A

Cadre conceptuel

Quest-ce que la caractrisation phnotypique?

Populations non dcrites

Le concept de race

10

Approaches de caractrisation

12

Procdures quantitatives didentification des races

14

Composantes de la caractrisation phnotypique

17

Section B

Cadre oprationnel

29

Dresser la liste des parties prenantes

31

Constituer lquipe charge de ltude

31

Recueillir les informations de base

34

Clarifier les objectifs et le cadre de ltude

35

Section C

Collecte de donnes pour la caractrisation primaire

39

Dvelopper le cadre dchantillonnage

41

Prparer lquipement et les mthodes de collecte de donnes

43

Prparer le protocole de collecte des donnes

49

Former les agents recenseurs et leurs superviseurs

50

Effectuer des tests pilotes et prliminaires sur les instruments de ltude 51


Organiser la logistique des travaux sur le terrain

51

Finaliser le plan de collecte des donnes

52

iv

Section D

Collecte de donnes pour la caractrisation avance

53

Examiner le cadre et les objectifs

55

Dvelopper le cadre de lchantillonnage

56

Prparer les outils pour la collecte de donnes

57

Prparer le protocole de collecte des donnes

61

Former les leveurs ou les agents recenseurs et leurs superviseurs

61

Effectuer des tests pilotes et prliminaires sur les instruments de ltude 62


Organiser la logistique du travail sur le terrain

62

Finaliser le plan de collecte de donnes

63

Section E

Gestion et analyse des donnes


Gestion des donnes
Analyse des donnes
Section F

Rapports et communication

65
67
70

77

Rapports davancement provisoires

80

Rapport final

80

Produits de communication supplmentaires

82

La voie suivre intgrer les resultats de ltude dans les futurs projets 85

Rfrences et annexes

87

Rfrences bibliographiques

89

Annexe 1 Liste de contrle pour la caractrisation phnotypique


des bovins

93

Directives gnrales

93

Variables discrtes ou qualitatives

93

Variables quantitatives

94

Donnes au niveau du troupeau

94

Donnes relatives lorigine et au dveloppement

95

Donnes recueillies sur les caractres ncessitant des mesures rptes 96


Illustrations 97
Annexe 2 Liste de contrle pour la caractrisation phnotypique
des ovins et caprins

101

Directives gnrales

101

Variables discrtes ou qualitatives

101

Variables quantitatives

102

Donnes au niveau du troupeau

102

Donnes relatives lorigine et au dveloppement

103

Donnes recueillies sur les caractres ncessitant des mesures rptes 104
Illustrations 105
Annexe 3 Liste de contrle pour la caractrisation phnotypique
des poulets

113

Directives gnrales

113

Variables discrtes ou qualitatives

113

Variables quantitatives

114

Donnes au niveau du troupeau

114

Donnes relatives lorigine et au dveloppement


Donnes recueillies sur les caractres qui necessitent de rpter les

114
mesures

115

Illustrations 117
Annexe 4 Liste de contrle pour la caractrisation phnotypique des porcs 121
Directives gnrales

121

Variables discrtes ou qualitatives

121

Variables quantitatives

122

Donnes sur le troupeau

122

Donnes relatives lorigine et au dveloppement

123

Donnes recueillies sur les caractres ncessitant des mesures rptes 123
Illustrations 124

 escripteurs des milieux de production


Annexe 5 D

129

Partie i: Informations gnrales

129

Partie ii: Environnement naturel

129

Partie iii: Environnement technique

132

Partie iv: Caractristiques socio-conomiques

134

Partie v: Qualits particulieres de la race

136

 finition des termes


Annexe 6 D

139

Variables quantitatives pour les mesures corporelles

139

Classes de dentition chez les chvres

139

Estimation de lge des moutons et des chvres partir de la denture 140


Description de lvaluation de ltat corporel

140

Descripteurs du plumage des poulets

141

Descripteurs du milieu de production

143

vi

ENCADRS
1

Un programme damlioration de la race fond sur des informations de


caractrisation insuffisantes - le cas du mouton Criollo bolivien

Dfinitions des catgories de race et des termes connexes

11

Une mthode rapide dvaluation de la production laitire


chez les races bovines

21

Comment combiner la caractrisation gntique avec la caractrisation


phnotypique - un exemple

22

Modle de productivit globale pour lvaluation compare des performances


des ressources zoogntiques

27

Exemples doutils de surveillance pour la collecte des donnes


sur les ressources zoogntiques

36

Lutilisation de la caractrisation avance pour laborer un programme


damlioration de la race - le cas du mouton queue fine de Sumatra

37

Estimation de l'ge des moutons et des chvres partir de leur denture

43

Exemple simple pour dterminer la taille de lchantillon

44

4
5
6
7

10 Le choix des mthodes statistiques selon le but de ltude


de caractrisation

76

11 Aide-mmoire pour rdiger le rapport sur lanalyse des donnes

83

TABLEAUX
1

Exemples de parties prenantes locales, rgionales et internationales

32

Mthodes statistiques pour les tudes de caractrisation

75

Quest-ce qui fait un bon rapport de recherche?

81

Moyens de communication forces et faiblesses

84

FIGURES
1

Structure des directives

Cadre oprationnel pour la caractrisation phnotypique

6
33

vii

Acronymes

ACSAD
Centre arabe pour ltude des zones arides et des terres sches
ADN
Acide dsoxyribonuclique
BM
Banque mondiale
CPF
Facteur de correction pour une population finie
CPS
Communaut du Pacifique
DAD-IS
Systme dinformation sur la diversit des animaux domestiques
DMP
Descripteur normalis des milieux de production
FABISnet Rseau de systmes dinformation sur la biodiversit des animaux dlevage
FIDA
Fonds international de dveloppement agricole
GPS
Systme de positionnement global diffrentiel
ICARDA
Centre international de recherches agricoles dans les rgions sches
IICA
Institut interamricain de coopration pour lagriculture
ILRI
Institut international de recherches sur llevage
ISAG
Socit internationale de gntique animale
OADA
Organisation arabe pour le dveloppement agricole
OCDE
Organisation pour la coopration et le dveloppement conomiques
ONG
Organisation non gouvernementale
SADC
Communaut de dveloppement de lAfrique australe
SAHN
Sequential, agglomerative, hierarchic and non-overlapping

ix

Remerciements

La prparation de ces directives a dbut en 2008 sous la supervision de Badi Besbes. Le


travail initial a t ralis par Manuel Luque Cuesta. Workneh Ayalew a produit une nouvelle
version de ces directives, qui a t prsente et discute lors dateliers organiss en Argentine, au Sngal et en Italie. Ces ateliers ont runi 100 scientifiques, techniciens et dcideurs.
Une version rvise et mise jour a t prpare par Badi Besbes, Workneh Ayalew et
Dafydd Pilling. Les encadrs ont t rdigs par Luis Iiguez et Evangelina Rodero Serrano.
Les illustrations ont t prpares par Antje Weyhe. La FAO tient exprimer ses remerciements toutes ces personnes et toutes celles qui ne sont pas mentionnes ici et qui ont
gnreusement donn de leur temps, leur nergie et leur expertise. Ces directives ont t
prsentes et approuves par la Commission des ressources gntiques pour lalimentation
et lagriculture lors de sa Treizime session ordinaire en juillet 2011.

xi

Prambule

Ces Directives font partie dune srie de publications produites par la FAO pour aider les
pays mettre en uvre le Plan daction mondial pour les ressources zoogntiques. Bien
que chacune de ces publications aborde un aspect diffrent de la gestion des ressources
zoogntiques pour lalimentation et lagriculture, elles doivent tre utilises conjointement.
Les Directives sur la caractrisation phnotypique sinscrivent dans la Priorit stratgique 1
du Plan daction mondial, ce qui est aussi le cas de deux autres publications: lune portant
sur la surveillance et le suivi des ressources zoogntiques et lautre sur la caractrisation
molculaire. Les Directives sur la ralisation denqutes et le suivi (FAO, 2012) prsentent une
vision globale qui dcrit le processus de planification des stratgies nationales de collecte
et de mise jour des donnes relatives aux ressources zoogntiques; elles prsentent les diffrents types denqutes pouvant tre intgrs dans ces stratgies et les grandes tapes de
la planification et de la mise en uvre de ces enqutes. Les directives sur la caractrisation
phnotypique dcrivent la faon de mener une tude sur une population animale spcifique
et sur son milieu de production et notamment les critres prendre en compte et les protocoles de collecte et dinterprtation de ces donnes. Les directives sur la caractrisation
molculaire (FAO, 2011) portent sur la faon dobtenir et dutiliser des chantillons dADN
en appui la gestion des ressources zoogntiques. Bien que leurs objectifs soient diffrents,
ces trois publications abordent invitablement des sujets communs.

Introduction

JUSTIFICATION
Trois types dinformations - phnotypique, gntique et historique - sont ncessaires pour
caractriser les ressources zoogntiques pour lalimentation et lagriculture. Le poids
accord chacun dpend du pays (par exemple, dvelopp ou en dveloppement) et de
lobjectif (par exemple amlioration, conservation ou diffrenciation des races). Ces directives se concentrent sur la collecte et lutilisation de linformation phnotypique.
La caractrisation phnotypique des ressources zoogntiques correspond lidentification des diffrentes races et la description de leurs caractristiques externes et de
production dans un environnement et un cadre de gestion donns, en tenant compte des
facteurs socio-conomiques qui les affectent. Les informations fournies par les tudes de
caractrisation sont essentielles pour planifier la gestion des ressources zoogntiques aux
niveaux local, national, rgional et mondial. Le Plan daction mondial pour les ressources
zoogntiques (FAO, 2007) reconnat quune bonne comprhension des caractristiques
des races est ncessaire pour guider la prise de dcision en matire de programmes de
dveloppement et de slection des animaux dlevage. La Priorit stratgique 1 du Plan
daction mondial est consacre la caractrisation, linventaire et la surveillance des volutions et des risques associs.
Le fait que de nombreuses populations animales nappartiennent pas une race
reconnue complique lvaluation de la diversit des ressources zoogntiques. Mme si
une partie de ces populations non dcrites rsulte de croisements multiples de races
reconnues, certains animaux peuvent appartenir des groupes (relativement) homognes
qui se distinguent des populations avoisinantes grce des caractristiques phnotypiques
identifiables et stables (parmi lesquelles il existe peut-tre des caractres uniques et prcieux) qui justifient le fait de les distinguer en tant que races distinctes. La caractrisation
phnotypique a notamment pour objet de distinguer ou non une population en tant que
race. Cette distinction est une condition pralable pour valuer efficacement la diversit des
ressources zoogntiques et dterminer leur niveau drosion gntique. La caractrisation
phnotypique est donc fondamentale pour faire linventaire national des ressources zoogntiques, permettre une gestion efficace de ces populations et mettre en place de systmes
dalerte et dintervention prcoces pour les ressources zoogntiques.
Les activits de caractrisation phnotypique sont difficiles mettre en uvre dun point
de vue logistique et technique. Une planification et une excution minutieuses sont ncessaires pour sassurer que ces activits soient efficaces, rentables et bien cibles (recueillir
des donnes importantes pour les activits prioritaires de dveloppement des ressources
zoogntiques et de llevage dans le pays). Le dveloppement et lutilisation de mthodes
et de procdures standardises sont indispensables pour mener des comparaisons valides

Caractrisation phnotypique des ressources gntiques animales

entre des races ou des populations danimaux dlevage, que ce soit au niveau national
ou international. Ces normes et protocoles sont galement ncessaires pour valuer les
demandes de reconnaissance de nouvelles races. Le Plan daction mondial appelle llaboration de normes et de protocoles techniques internationaux pour la caractrisation,
linventaire et la surveillance des volutions et des risques associs (Priorit stratgique 2).
Ces directives ont pour principaux objectifs de fournir des conseils sur la faon de mener
une tude de caractrisation phnotypique bien cible et rentable et contribuer ainsi
amliorer la gestion des ressources zoogntiques dans le cadre de la mise en uvre du
Plan daction mondial au niveau des pays. Elles contribuent galement veiller ce que les
tudes de caractrisation phnotypique fournissent une base solide pour les comparaisons
internationales entre les races et pour la prparation des valuations mondiales de ltat
des ressources zoogntiques.

CONTEXTE ET LABORATION DES DIRECTIVEs


Le Plan daction mondial pour les ressources zoogntiques fait appel la FAO pour publier
des directives techniques et soutenir les efforts des pays dans lamlioration de la gestion des
ressources zoogntiques. Comme mentionn dans le prambule, ces directives sur la caractrisation phnotypique font partie dune srie de directives publies par la FAO en rponse
cette demande. Lors de sa douzime session ordinaire en 2009, la Commission des ressources gntiques pour lalimentation et lagriculture a approuv les premires directives de
la srie et a de plus demand la FAO de continuer actualiser et approfondir dautres
directives techniques sur la gestion des ressources zoogntiques pour apporter un soutien
important aux pays dans leur mise en uvre du Plan daction mondial (FAO, 2009a).
Les directives sappuient sur les travaux antrieurs de la FAO sur la caractrisation, qui
ont reprsent une part importante du programme technique de lOrganisation sur les ressources zoogntiques, la Stratgie mondiale pour la gestion des ressources gntiques
des animaux dlevage (FAO, 1999), dont la mise en uvre a dbut en 1993 et qui a
maintenant t remplace par le Plan daction mondial. Avant mme llaboration de la
Stratgie mondiale, des mthodes de caractrisation des ressources zoogntiques ont
t dcrites dans plusieurs publications dans le cadre des tudes FAO: Production et sant
animales (FAO, 1984a, b; 1992). La FAO a publi une liste de base complte de variables
pour dcrire les caractristiques phnotypiques et gntiques des bovins, des moutons, des
chvres et des poulets afin de faciliter la caractrisation phnotypique systmatique de ces
espces (FAO, 1986a, b, c). LOrganisation a galement dvelopp le Systme dinformation
sur la diversit des animaux domestiques (DAD-IS) qui sert de rfrentiel de donnes et de
centre dinformations mondial pour aider les pays grer leurs donnes et les informations
lies aux ressources zoogntiques. Le DAD-IS aide galement les pays sacquitter de leurs
obligations concernant le signalement du statut de leur biodiversit nationale dans le cadre
de la Convention sur la diversit biologique. Les directives actuelles cherchent fournir des
conseils pratiques sur la faon de planifier et mettre en uvre des projets de caractrisation phnotypique. Les versions prliminaires des directives ont t discutes et values
par 100 participants issus de 28 pays lors de trois ateliers qui ont eu lieu en Argentine
(dcembre 2009), au Sngal (mars 2010) et en Italie (juin 2010).

Introduction

GUIDE DE LUTILISATEUR
Champ dapplication de ces directives
Les directives dcrivent lensemble du processus dorganisation dune tude de caractrisation phnotypique, de lidentification initiale des objectifs, en passant par la planification et
la mise en uvre des activits sur le terrain, la gestion et lanalyse des donnes, jusquau
compte-rendu des rsultats de ltude et la promotion de leur utilisation complte et efficace. Laccent est mis sur limportance du prlvement des donnes la fois sur les animaux
eux-mmes et sur leurs milieux de production; des conseils pertinents pour ces deux aspects
du travail de caractrisation sont inclus dans toutes les sections des directives.
Les directives portent dune part, sur les activits primaires de la caractrisation
phnotypique, qui peuvent tre menes au cours dune seule visite et qui donnent une
image de base de ltat de la diversit des ressources zoogntiques dans la zone dtude,
et, dautre part, sur les activits de caractrisation avances, qui exigent des mesures
rptes sur une longue priode. Des conseils sont donns pour dcider du niveau de
caractrisation, primaire ou avanc, ncessaire pour rpondre aux objectifs de ltude et sur
la faon dont la caractrisation primaire peut jeter les bases de la caractrisation avance.
Les directives se concentrent principalement sur les systmes de production dont le
niveau dintrants est faible ou moyen dans les pays en dveloppement (o les lacunes en
termes de connaissances sur les ressources zoogntiques sont les plus importantes et o
devraient se situer les zones critiques de perte de la diversit au cours des prochaines
dcennies). Un grand nombre de caractres prcieux restent probablement inconnus ou
non documents au sein de ces populations. Cependant, une grande partie de lactivit
dcrite est galement pertinente pour les pays dvelopps et les systmes de production
forts niveaux dintrants, o les activits de caractrisation servent principalement reconnatre de nouvelles races. En raison des implications financires dune telle reconnaissance
(par exemple le droit de demander des subventions), des procdures de caractrisation plus
strictes peuvent savrer ncessaires dans ce contexte.
Les directives abordent deux types de situations: celles o les activits de caractrisation
ciblent des populations danimaux non dcrits (nappartenant pas des races reconnues)
et celles o lobjectif est damliorer ltat des connaissances sur des races dj reconnues.
Ces directives concernent principalement les cinq espces danimaux dlevage les plus
importantes lchelle mondiale - les bovins, les moutons, les chvres, les poulets et les
porcs. Toutefois, les conseils de base sur la faon de planifier et de mettre en uvre une
enqute sont pertinents pour dautres animaux dlevage. En outre, les mmes variables
cls peuvent tre utilises pour dcrire des espces animales troitement apparentes. Par
exemple, les descripteurs utiliss pour les bovins peuvent tre appliqus aux yaks ou aux
buffles avec trs peu de modifications. De mme, dautres espces aviaires peuvent tre
dcrites en utilisant les descripteurs du poulet.

Public cible
Ces directives sont principalement destines aux personnes impliques dans la planification et la mise en uvre des tudes de caractrisation. Ces tudes ont gnralement t
menes par des chercheurs dans des tablissements publics de recherche, des tudiants

Caractrisation phnotypique des ressources gntiques animales

ENCADR 1

ny a pas eu daugmentation substantielle des

Un programme damlioration de la
race fond sur des informations de
caractrisation insuffisantes - le cas du
mouton Criollo bolivien

revenus. La taille des animaux a augment, et


avec elle leur besoin en aliments dans un environnement o lalimentation dpend de pturages naturels dgrads. Dans de nombreux cas,
la fertilit des moutons Criollo natifs (> 90 pour

Dans les annes 60, la Bolivie possdait envi-

cent) a diminu, mais la mortalit des agneaux

ron 12 millions de moutons Criollo, mais une

est reste leve. Beaucoup de producteurs

connaissance limite de leur potentiel, lex-

lvent de nouveau des moutons de type Cri-

ception de certaines informations relatives

ollo, mais dsormais de plus grande taille.

leurs mesures morphologiques et leur appa-

Des chercheurs boliviens ont reconnu quils

rence. Ces animaux jouent un rle majeur

navaient pas suffisamment tenu compte la

dans les systmes de production andins la

fois du potentiel productif du mouton Cri-

fois dans les systmes mixtes agriculture-le-

ollo et de ses caractristiques particulires (en

vage et les systmes de pturage - et contri-

dehors de leur petite taille et de leur faible

buent aux moyens dexistence de nombreux

poids, ainsi que de leur apparence dsagr-

mnages grce la production de viande,

able). Suite cette exprience, des tudes de

de laine, de fromage, de lait et de fumier. La

caractrisation ont t menes sur la capacit

taille des troupeaux est comprise entre 40 et

productive du mouton Criollo dans les condi-

60 ttes.

tions dlevage en ferme et sur la demande

Au cours de la mme dcennie, le Gouvernement bolivien et lUniversit de lUtah


ont mis en uvre un programme de coopration pour tudier les moyens damliorer les
systmes de production andins. Les chercheurs,
qui taient insuffisamment documents sur le
potentiel du mouton Criollo, ont conclu que sa
petite taille (le poids moyen dun adulte est de
24 kg) et sa faible production dune laine de
qualit mdiocre (800 g/mouton/an) devaient
tre amliores en le croisant avec des races
plus performantes. Un programme de croisement avec les moutons Corriedale, Targhee
et Rambouillet en provenance des tats-Unis
dAmrique a t men et sest prolong
jusquau milieu des annes 80.
Trente ans plus tard, le producteur de
moutons de montagne nest pas devenu un
producteur de laine fine. Certains producteurs
ont augment leur production de laine, mais,
en raison de la petite chelle de production, il

du march. Elles ont montr que certains


agriculteurs percevaient un revenu rgulier
provenant de la vente de fromages de brebis fabriqus partir des petites quantits
de lait produites par les animaux. De plus, la
demande pour la viande ovine Criollo sur les
marchs tait assez importante, en particulier
dans les principales villes des rgions montagneuses du pays. Enfin, les paysans prfraient
utiliser la laine de mouton Criollo pour la fabrication de feutre et lartisanat local. Aucune
de ces caractristiques navaient t prises
en compte lors de la mise en uvre du programme dlevage, qui na, par consquent,
pas rpondu aux besoins des producteurs.
Cet exemple illustre quelques-unes des
consquences dun programme mal conu
fond sur une caractrisation insuffisante de
la population cible.
Auteur: Luis Iiguez.

Introduction

impliqus dans la recherche acadmique et le personnel des projets de dveloppement


du secteur de llevage. Malheureusement, les rsultats de ces tudes ont souvent fini par
prendre la poussire sur les tagres. Il est donc important de souligner que tous ceux qui
envisagent dentreprendre une tude de caractrisation phnotypique doivent dabord
sassurer quelle rpond une demande spcifique dinformations. Dans un scnario
idal, ltude de caractrisation seffectuerait dans le cadre dune stratgie nationale cohrente de renforcement des connaissances sur les ressources zoogntiques du pays, dans
le but de possder une base solide pour atteindre les objectifs prioritaires de la gestion
des ressources zoogntiques et du dveloppement du secteur de llevage. Quel que soit
le contexte, il faut clairement rflchir la contribution quapportera ltude la gestion
future des ressources zoogntiques, et consulter au pralable les utilisateurs potentiels des
rsultats de cette tude.
Les directives peuvent galement aider les dcideurs mieux comprendre la contribution potentielle des tudes de caractrisation phnotypique aux politiques et programmes
nationaux de gestion des ressources zoogntiques et les pratiques impliques dans la mise
en uvre de telles tudes.

Structure des directives


Ces directives sont divises en six sections (figure 1). La section A prsente le contexte
conceptuel et thorique avant daborder les conseils pratiques dans les autres sections.
Elle commence par discuter de la signification du terme caractrisation phnotypique en
exposant les concepts de race et de population non-dcrite; elle aborde galement
limportance du rle jou par les espces sauvages apparentes aux animaux domestiques dans les tudes de caractrisation phnotypique. Elle distingue ensuite les grandes
approches de la caractrisation phnotypique (exploration vs confirmation). Puis elle prsente un aperu des principes et des mthodes didentification des races, ainsi que des
composantes de la caractrisation phnotypique, y compris la description des milieux de
production et la valorisation conomique des caractres non-productifs.
La section B se concentre sur les activits prparatoires qui prcdent les tudes individuelles de caractrisation phnotypique. Laccent est mis sur limportance de lier ces tudes
aux exigences de la stratgie nationale du pays et au plan daction pour la gestion des
ressources zoogntiques et (sil y a lieu) la stratgie dvaluation et de surveillance nationale. Elle dcrit la formation de lquipe de recherche, la collecte des informations de base,
la clarification des objectifs et le champ dapplication de ltude (y compris la distinction
fondamentale entre la caractrisation primaire et avance). Les sections C et D dcrivent
les activits de collecte de donnes. La premire se concentre sur la caractrisation primaire
et la seconde sur la caractrisation avance. La section E dcrit la gestion des donnes (y
compris le contrle de la qualit, la saisie, le nettoyage, la transformation et larchivage des
donnes) et lanalyse des donnes (y compris une discussion sur les ressources ncessaires,
les programmes statistiques, les tapes critiques du processus danalyse et linterprtation
des rsultats). Les caractrisations primaire et avance sont ici dcrites dans une seule
section. La section F fournit des conseils sur la manire de rendre compte des rsultats de
ltude et de les communiquer aux parties prenantes concernes.

Caractrisation phnotypique des ressources gntiques animales

figure 1

Structure des directives

Section A
Cadre conceptuel

Section B
Cadre oprationnel

Caractrisation
primaire

Section C
Collecte des donnes

Caractrisation
avance

Section D
Collecte des donnes

Section E
Gestion et analyse des donnes

Section F
Compte rendu et communication

Ces directives fournissent dans leurs annexes des listes de contrle pour dcrire les principales espces dlevage et leurs milieux de production. Ces listes sont conues comme
des guides qui peuvent tre adapts, si ncessaire, pour faire correspondre les objectifs au
contexte des tudes de caractrisation spcifiques.
Les directives ne dcrivent pas les normes pour les variables quantitatives et qualitatives, les outils de collecte de donnes, la prcision de lenregistrement des donnes ou les
mthodes de gestion et de stockage des donnes. En revanche, elles prsentent les options
et les approches et conseillent les utilisateurs sur la faon de les adapter leurs besoins.

Section A

Cadre conceptuel

Cadre conceptuel

QUEST-CE QUE LA CARACTRISATION PHNOTYPIQUE?


Le terme caractrisation phnotypique des ressources zoogntiques dsigne gnralement lidentification de races distinctes et la description de leurs caractristiques externes et
productives dans un milieu de production donn. Au sein de ces directives, la dfinition est
largie pour inclure la description du milieu de production. Le terme milieu de production
est utilis ici pour inclure non seulement le milieu naturel, mais aussi les pratiques de
gestion et les diffrentes utilisations des animaux et de leurs produits, ainsi que des facteurs
sociaux et conomiques comme lorientation du march, les opportunits de march de
niche et les questions de parit hommes-femmes. Ltude de la rpartition gographique
des races fait ici partie intgrante de la caractrisation phnotypique. Les procdures complmentaires utilises pour connatre la base gntique des phnotypes et leurs modes
de transmission dune gnration lautre, et tablir des relations entre les races, correspondent la caractrisation gntique molculaire (FAO, 2011). La caractrisation phnotypique et gntique molculaire des ressources zoogntiques est essentiellement utilise
pour mesurer et dcrire la diversit gntique de ces ressources afin de les comprendre et
les utiliser de faon durable.
Les directives distinguent deux phases ou niveaux de caractrisation. Le terme caractrisation primaire est utilis pour dsigner les activits qui peuvent tre ralises en une
seule visite sur le terrain (par exemple la mesure des caractristiques morphologiques des
animaux, les entretiens avec les leveurs, lobservation et la mesure de certains aspects du
milieu de production, la cartographie de la rpartition gographique). Le terme caractrisation avance est utilis pour dcrire les activits qui ncessitent des visites rptes.
Ces activits incluent la mesure des aptitudes de production (par exemple le taux de croissance, la production laitire) et les aptitudes dadaptation (par exemple la rsistance ou la
tolrance des maladies spcifiques) des races dans des milieux de production spcifiques.

POPULATIONS NON DCRITES


En raison du manque dinformations exhaustives sur les fragmentations ou sous-structures des populations et sur leur rpartition gographique, de nombreuses populations
animales dans les rgions du monde en dveloppement sont communment appeles
non-dcrites ou traditionnelles. Linventaire des races dans ces rgions nest pas
considr comme complet, et de nouvelles races continuent tre identifies (par exemple
Khler-Rollefson et LIFE Network, 2007; Wuletaw et al., 2008). Par consquent, les tudes
de caractrisation phnotypique des ressources zoogntiques doivent principalement tre
mises en uvre dans ces rgions.
Des procdures simplifies et cohrentes de caractrisation phnotypique doivent tre tablies pour aider les pays tablir un inventaire plus complet de leur ressources zoogntiques.

Caractrisation phnotypique des ressources gntiques animales

10

Il est ncessaire de standardiser ces procdures au niveau mondial pour faciliter lnumration,
lanalyse et la signalisation correctes des races aux niveaux nationaux et internationaux.

LE CONCEPT DE RACE
Dans le cadre de la caractrisation phnotypique, le terme race est utilis pour identifier
des populations distinctes, constitutives des ressources zoogntiques, en tant quunits
de rfrence et de mesure. La diversit de ces populations est mesure de trois faons: la
diversit interpopulation (entre races), la diversit intrapopulation (au sein des races), et
les inter-relations entre les populations. La caractrisation phnotypique est utilise pour
identifier et documenter la diversit au sein et entre les races distinctes, en fonction de leurs
caractres observables. La mesure des relations gntiques entre les races et lhtrozygotie
gntique au sein des races relvent de la caractrisation molculaire (FAO, 2011).
Le concept de race est originaire dEurope et est li lexistence dorganisations dleveurs.
Le terme est maintenant largement utilis dans les pays en dveloppement, mais il a tendance
se rfrer un concept socioculturel plutt qu une entit physique distincte. Par consquent, lutilisation de ce terme dans les pays en dveloppement, o sont situes la plupart des
populations danimaux dlevage traditionnelles et locales du monde, est diffrente de son
utilisation dans les pays dvelopps. Dans les pays dvelopps, les races sont dfinies par un
standard (ensemble de normes phnotypiques), par lutilisation des livres gnalogiques et par
lexistence dassociations dleveurs officielles souvent soutenues par la lgislation. Dans les
pays en dveloppement, les communauts dleveurs et les gouvernements utilisent ce terme
moins rigoureusement et identifient davantage les races en fonction de la localisation gographique, lappartenance ethnique et les traditions des leveurs que par les caractres phnotypiques des animaux. Dans certains cas, le terme est utilis de manire interchangeable avec
population, varit, souche ou ligne pour dcrire des races reconnues au niveau
national. Les dfinitions des termes lis la race sont fournies dans lencadr 2.
La FAO utilise une dfinition large de la notion de race, qui tient compte des diffrences
sociales, culturelles et conomiques, et qui peut donc tre applique au niveau mondial
pour mesurer la diversit des animaux dlevage:
soit un sous-groupe spcifique de btail domestique avec des caractristiques externes
dfinies et identifiables lui permettant dtre identifi par valuation visuelle dautres
groupes pareillement dfinis au sein de la mme espce, ou un groupe pour lequel la sparation gographique et/ou culturelle des groupes phnotypiquement semblables a men
lacceptation de son identit spare (FAO, 1999).
Ces directives utilisent la mme dfinition gnrique.
En plus de la caractrisation des races reconnues, les directives abordent lidentification
et la caractrisation de races nayant pas t dj reconnues au sein des populations traditionnelles et non-dcrites. Cela peut tre fait par ltude de la constitution gntique de la
population, de ses diffrences par rapport dautres populations ou races, de son histoire
et de ses qualits productives, sociales et conomiques.
Une des caractristiques essentielles dune race est lisolement presque complet sur plusieurs gnrations (cest--dire que laccouplement avec des animaux en dehors de la population a t trs limit), qui a permis la population dacqurir une apparence et des capacits

Cadre conceptuel

11

nettement diffrentes de celles des autres races (FAO, 1992; FAO/PNUE, 1998). Dans les communauts traditionnelles dleveurs, la connaissance indigne locale fournit peut-tre la meilleure information prliminaire disponible sur lidentit de la race; en effet une communaut
particulire peut prtendre lever une population de ressources zoogntiques distincte dans

ENCADR 2

Dfinitions des catgories de race et des termes connexes


Populations traditionnelles: principalement locales; prsentent souvent une grande
diversit phnotypique; sont gres par des fermiers et des leveurs pastoraux avec
une faible intensit de slection, mais peuvent tre soumises une forte pression de
slection naturelle; le pedigree peut tre partiellement connu; les structures gntiques sont principalement influences par des vnements migratoires et des mutations; la taille de la population est gnralement grande (moins sujette lrosion).
Races standardises: drives des populations traditionnelles grce une communaut dleveurs qui sappuients sur une liste reconnue de descripteurs de race
standardiss; prsentent moins de diversit phnotypique car slectionnes pour
rpondre aux standards phnotypiques de base; le pedigree est partiellement connu,
la structure gntique peut tre influence par des effets fondateurs importants; la
population peut tre de grande ou petite taille.
Races slectionnes ou lignes commerciales: drives des races standardises ou
de populations traditionnelles grce une approche de slection vise conomique
et lutilisation de mthodes gntiques quantitatives; les leveurs ont cr des organisations pour enregistrer les pedigrees et les performances, et des animaux slectionns sont mis la reproduction dans diffrents troupeaux; la consanguinit augmente
en raison de la haute intensit de slection; les marqueurs molculaires peuvent tre
utiliss, par exemple pour les contrles de filiation et/ou pour lidentification des gnes
dintrt; la population est gnralement de grande taille.
Lignes drives: dcoulent de lutilisation de mthodes dlevage spcifiques comme
la consanguinit troite; les lignes consanguines hautement spcialises prsentent une
faible variabilit gntique; les lignes synthtiques sont issues du croisement de races
standardises ou de lignes slectionnes, et prsentent un niveau lev de variabilit
gntique; les lignes transgniques et exprimentales entrent dans cette catgorie; la
taille de la population est gnralement limite, sauf pour les lignes synthtiques.
Ces diffrents types de population peuvent tre facilement identifis dans les populations fortement commercialises, comme les populations europennes de bovins,
de porcs et de poulets. Cette classification peut tre moins pertinente pour dautres
espces comme les camlids ou les oies. Nanmoins, elle peut tre utilise comme un
cadre gnral couvrant tous les types de populations domestiques.
Source: adapt de Tixier-Boichard et al. (2007).

12

Caractrisation phnotypique des ressources gntiques animales

un environnement spcifique et en suivant une approche commune de reproduction et dutilisation de ces ressources. Khler-Rollefson (1997) dcrit de la manire suivante la faon dont
le concept de race peut tre appliqu dans les communauts traditionnelles:
Une population danimaux domestiques peut tre considre comme une race,
si les animaux rpondent aux critres suivants: (i) tre soumis un schma dutilisation commun, (ii) partager un habitat/zone de distribution communs, (iii) reprsenter
un patrimoine gntique fortement isol, et (iv) tre considrs comme diffrentis
par leurs leveurs.
Que ce soit dans les communauts traditionnelles ou industrialises, les populations
danimaux dlevage sont souvent dveloppes, entretenues et influences par les humains
et deviennent par consquent lunit de rfrence pour lamlioration et la conservation
des ressources zoogntiques. Il convient donc didentifier ces populations selon leur race
et dinclure dans les tudes de caractrisation phnotypique la fois des enqutes sur
les connaissances autochtones et une classification quantitative. Les outils molculaires
peuvent tre utiliss pour corroborer la classification des populations en races.

Approaches de caractrisation
En termes statistiques, la caractrisation phnotypique peut adopter lune des deux
approches suivantes, selon le type dinformations de base disponibles:
Lapproche exploratoire mise en uvre dans les cas o aucune donne de base
fiable sur lexistence des races dans la zone dtude nest disponible; dans de telles
circonstances, la caractrisation phnotypique vise enquter sur lexistence de races
distinctes dans la zone dtude.
Lapproche confirmatoire mise en uvre dans les situations o certaines informations de base sur lidentit et la distribution de la race sont disponibles; dans de telles
circonstances, lobjectif de la caractrisation phnotypique est de valider lidentit de
la race et de fournir des descriptions systmatiques de cette race.
Si les donnes secondaires disponibles sont insuffisantes pour tablir des plans pour la
caractrisation phnotypique, des donnes prliminaires devront tre collectes sur le terrain
sur lidentit, la rpartition gographique et limportance relative des populations constitutives des ressources zoogntiques (races reconnues au niveau local et national, populations
non-dcrites, etc.) dans la zone dtude, afin de dterminer si une approche exploratoire
ou confirmatoire est ncessaire. Les activits prliminaires de collecte de donnes peuvent
inclure des expditions cartographiques des dplacements au sein de la zone dtude
pour valuer approximativement la rpartition gographique des diffrentes populations et
des valuations rapides lutilisation dune gamme de techniques de terrain (compltes
le cas chant par des informations provenant de sources secondaires) pour obtenir des
informations auprs des populations locales. Lors de lvaluation rapide, les enquteurs
peuvent collecter des informations grce des runions de groupe et des groupes de
rflexion, des entretiens semi-directifs avec des leveurs individuels et dautres informateurs
cls possdant des connaissances sur le sujet concern, et en observant directement les
ressources zoogntiques. Une srie de techniques spcifiques ont t dveloppes pour
faciliter les valuations rapides (appareils de cartographie, calendriers saisonniers, mthode

Cadre conceptuel

de classement et de notation, transects, rcits sur la descendance, etc.) et peuvent tre


utilises pour discuter du systme de production local avec des groupes ou des individus.
La triangulation lutilisation de plusieurs sources complmentaires dinformation est une
caractristique essentielle de lapproche. Des informations complmentaires sur les expditions cartographiques et les valuations rapides sont disponibles dans les Directives sur
la ralisation denqutes et de suivi pour les ressources zoogntiques publies dans cette
srie (FAO, 2012).

Approche exploratoire
Une fois la zone dtude dsigne, ltape suivante consiste laborer un cadre dchantillonnage, cest--dire un ensemble de critres qui seront utiliss pour identifier un chantillon de mnages dleveurs et danimaux pour la collecte des donnes. Si la zone dtude
est tendue, il peut tre ncessaire de stratifier lchantillon en sous-units plus homognes
en fonction du ou des critres suivants:
isolement gographique des populations constitutives des ressources zoogntiques
et de leurs habitudes de dplacement ou de migration;
profils de caractristiques morphologiques et de production connus dans les populations ou existence de pratiques dlevage communes;
informations historiques et connaissances indignes sur lorigine des ressources zoogntiques.
Lapproche exploratoire de la caractrisation phnotypique ncessite galement destimer la population totale de btail dans la zone dtude, ainsi que le nombre dleveurs
propritaires de ces animaux (voir la section C).
Des informations secondaires sur les populations dlevage dans la zone dtude doivent
tre recherches dans les publications et la littrature grise. Le Systme dinformation sur
la diversit des animaux domestiques (DAD-IS http://www.fao.org/dad-is) peut tre une
source utile dinformations de base sur linventaire des races ainsi que sur leur distribution,
les effectifs des populations nationales et ltat de danger des races.
Lapproche exploratoire met lhypothse que la population cible est homogne et ne
possde pas de sous-populations phnotypiquement distinctes. Elle cherche vrifier cette
hypothse en mesurant et en analysant le modle de diversit phnotypique au sein de la
population cible. Des donnes phnotypiques standardises (voir les annexes 1 4) sont
collectes sur les animaux au sein des chantillons dans les zones dtude.
La caractrisation primaire (cest--dire la collecte des donnes lors dune seule visite
de terrain) sinscrit dans cette approche exploratoire. Par souci de simplicit, ces directives
utilisent le terme de caractrisation primaire lorsquelles se rfrent cette approche.

Approche confirmatoire
Lapproche confirmatoire de caractrisation phnotypique a pour but de valider les informations sur lidentits des race disponibles dans les inventaires nationaux des ressources
zoogntiques, la littrature et/ou travers les connaissances locales. Elle prsume que
les races connues ont une distribution gographique dfinie et certains usages et caractristiques phnotypiques communs. Les descripteurs raciaux standards figurant dans les

13

14

Caractrisation phnotypique des ressources gntiques animales

annexes 1 4 fournissent un cadre pour collecter des donnes phnotypiques dtailles.


Les outils statistiques peuvent tre utiliss pour vrifier la prsence de diffrences significatives entre plusieurs variables au sein des populations de la zone dtude et donc de
valider leurs identits en tant que races distinctes. La mise en uvre dtudes gntiques
supplmentaires est recommande pour corroborer ces identits.
Lapproche confirmatoire implique galement lvaluation objective des connaissances
locales documentes et des autres types dinformations. Cette valuation peut rvler des
problmes importants de gestion des ressources zoogntiques qui ncessiteront alors une
enqute plus approfondie (par exemple, ltat de danger des races existantes, lmergence
de nouvelles populations composites, et la perception des communauts sur lidentit des
races). Lapproche peut tre utilise pour examiner de plus prs les diffrences entre les
populations identifies lors de la caractrisation primaire, en vue de valider les classifications et de dcrire la faon dont les groupes distincts diffrent les uns des autres.
Lquipe de recherche trouvera peut tre ncessaire dobtenir des informations supplmentaires ou plus actualises pour tablir la base dchantillonnage. Dans ce cas, un
travail prparatoire de terrain (expditions cartographiques et/ou valuations rapides voir
ci-dessus) devra ventuellement tre men dans la zone dtude.
Lapproche confirmatoire est utilise pour lvaluation et la comparaison des races dans
des conditions dlevage en station ou en ferme (cest--dire la caractrisation avance). De
telles tudes se concentrent sur les races qui ont dj t identifies, et visent fournir une
valuation plus complte de leurs performances et de leur adaptation. Par souci de simplicit, ces directives utilisent le terme caractrisation avance lorsquelles font rfrence
lapproche confirmatoire.

PROCDURES QUANTITATIVES DIDENTIFICATION DES RACES


Principes de la classification
En partant du constat que les races danimaux dlevage se distinguent par des diffrences
dans leur apparence, leur conformation et leurs dimensions, des procdures quantitatives
sont utilises pour tudier les races au sein des populations traditionnelles en valuant
systmatiquement lensemble des caractristiques morphologiques dans les groupes danimaux, exactement de la mme manire que les taxonomistes classent les organismes en
groupes hirarchiques. Ces procdures, connues sous le nom de taxonomie numrique,
sont utilises pour explorer les ressemblances morphologiques globales entre les groupes
dorganismes afin de les regrouper de manire hirarchique, en supposant que les groupes
puissent (mais pas ncessairement) reprsenter des processus volutionnistes historiques
lis la diversit structurelle brute (Dobzhansky, 1951). Quand, en plus des donnes morphologiques, les caractristiques socioculturelles, comme lassociation historique avec certaines communauts dleveurs dans des milieux de production bien dfinis, sont utilises
pour dlimiter ces groupes danimaux, alors des races distinctes, qui sont censes partager
clairement des caractres hrditaires et des zones de distribution prcises, peuvent tre
identifies, conformment la dfinition large de la race donne ci-dessus. Cette approche
a t applique, par exemple, au sein de populations de chvres traditionnelles en thiopie
(FARM Africa et ILRI, 1996; Ayalew et al., 2000) et corrobore par des tudes gntiques

Cadre conceptuel

molculaires (Ticho, 2004). Des preuves gntiques similaires pour confirmer les identits
de race phnotypiques ont t obtenues chez des ovins (GebreMichael, 2008), des bovins
(Dadi et al., 2008) et des poulets (Halima-Hassen, 2007).
Des analyses de variance multivarie sont utilises pour dterminer celles, parmi les
nombreux caractres mesurs, qui prsentent un intrt pour distinguer les populations, et
pour valuer lensemble des caractristiques morphologiques ncessaires pour le regroupement. Les procdures taxonomiques numriques qui utilisent lanalyse de variance multivarie examinent un grand nombre de caractres observables de valeur gale (cest--dire
non pondres) chez un grand nombre dindividus et cherchent classer les individus en
fonction de leur similarit globale. Cette mthode de classification repose sur le principe
selon lequel la variation morphologique des organismes individuels est gnralement
discontinue et forme des tableaux bien distincts, et chaque tableau comprend un groupe
dindividus qui possdent certaines caractristiques communes. Ces groupes distincts sont
dsigns comme races, varits, espces, genres, etc. Le classement obtenu en utilisant
cette approche est en quelque sorte artificiel, mais les groupes eux-mmes et les discontinuits observes entre eux ne sont pas des abstractions de la part du classificateur
(Dobzhansky, 1951; pp. 3-18). En effet, les modles de variation morphologique au sein
des espces peuvent tre utiliss pour identifier des sous-groupes homognes danimaux,
et ces sous-groupes peuvent tre considrs comme des races ou varits.

Mthodologie
Analyses discriminantes et de classification. Dans ce type danalyses, on fait rfrence
aux units de rfrence (units taxonomiques) comme units taxonomiques oprationnelles
(UTO). Selon le profil de variation morphologique peru au niveau de la population, les
UTO peuvent tre des animaux individuels ou des groupes homognes danimaux. Dans
les situations o la ressemblance morphologique est leve au sein du troupeau, comme
dans le cas des populations en levage pastoral, les valeurs moyennes des animaux chantillonns - autrement appeles centrodes - sont considres comme des UTO. En labsence
dune telle ressemblance, et en particulier lorsque les identits de race sont moins claires,
les individus chantillonns sont utiliss comme UTO. Lestimation du degr de ressemblance phnotypique (morphologique, physiologique et comportementale) chez les UTO
est une tape fondamentale de lanalyse. Lanalyse de classification plusieurs variables
est ensuite utilise pour rorganiser lensemble htrogne des units taxonomiques en
groupes plus homognes par rapport aux variables (caractres) tudies (Aldenderfer et
Blashfield, 1984). Si la population slectionne comprend dj des catgories distinctes
par exemple si des noms locaux sont donns aux diffrentes populations lanalyse
discriminante peut permettre de valider la classification (Klecka, 1980). Les analyses discriminantes et de classification supposent toutes les deux que la variation morphologique
globale est une combinaison linaire des variables individuelles (tats des caractres ou
mesures phnotypiques) enregistres sur les UTO (individus ou centrodes).
Lanalyse de classification est utilise pour classer les UTO en quantifiant les relations
de similarit globale des paires dUTO en ce qui concerne les caractres considrs (Sneath
et Sokal, 1973; p. 116). Ces relations peuvent tre exprimes comme une distance relative

15

16

Caractrisation phnotypique des ressources gntiques animales

(c.--d. ressemblance) dans un espace euclidien multidimensionnel, dans lequel chaque


variable dfinit un axe. Dun point de vue mathmatique, la distance relative correspond
plutt la mesure dun ensemble de diffrences - plus la valeur de cette distance est grande
plus la dissemblance entre les UTO est grande. Un arbre hirarchique (classification) peut
tre construit (ibid.) en se basant sur les valeurs calcules pour toutes les paires possibles
dUTO.
Analyses en composantes principales. La principale limitation technique pour former directement des groupes partir de variables morphologiques tient dans le fait que
les variables ne sont pas indpendantes les unes des autres, car les variables initiales sont
enregistres sur chaque UTO. Lanalyse en composantes principales (ACP) transforme linairement les variables initiales en un ensemble de variables non corrles, appeles composantes principales, qui expliquent pour lessentiel la mme information statistique (variance)
que lensemble originel de variables. Chaque composante principale est une combinaison
linaire de toutes les variables et a une moyenne de zro et une variance unitaire (Dunteman, 1989). Toutefois, en fonction de la nature de la variation dans lensemble de donnes
de base, les premires composantes principales (les plus importantes) peuvent expliquer
la plupart de la variation totale. Par consquent, un ensemble nettement plus petit de
composantes principales peut expliquer lessentiel de la variance dans les variables initiales,
en rduisant ainsi le nombre de dimensions (nombre daxes) dans lhyperespace correspondant. En outre, lindpendance des variables transformes assurera lorthogonalit
entre chacun des axes. Lorthogonalit des axes implique que chacun dentre eux apporte
une contribution indpendante la discrimination entre les UTO ou les groupes dUTO
(regroupements). Les composantes principales calcules peuvent ensuite tre utilises pour
dvelopper un arbre de classification en utilisant lanalyse de classification.
Mthode de classification. Il existe plusieurs mthodes diffrentes de classification
(Sneath et Sokal, 1973; pp. 201-244; Pimentel, 1979; p. 79; Aldenderfer et Blashfield,
1984), mais la mthode la plus largement applique de classification en systmatique biologique, ainsi quau niveau des sous-espces, est la classification ascendante hirachique
selon le procd SAHN (sequential, agglomerative, hierarchic and non- overlapping). Lalgorithme commence avec t UTO spares qui sont ensuite successivement agglomres en un
nombre de groupes infrieur t, pour finalement obtenir un ensemble unique contenant
les t UTO. Les taxons obtenus, quel que soit leur niveau (rang) sont mutuellement exclusifs
(sans chevauchement), cest--dire que les UTO compris dans un taxon nappartiennent
pas un second taxon du mme rang. Un processus itratif de dagglomration est utilis
pour partitionner les UTO en groupes avec une signification biologique. Cette procdure
donne finalement un arbre hirarchique (ou classification) partir duquel le nombre dsir
de groupes homognes (regroupements) peut tre driv. Tant que lobjectif de lanalyse
est dtudier la structure gnrale des relations entre les UTO telles que reprsentes dans
larbre de classification, le nombre de clusters peut tre dtermin par des dcisions heuristiques. Le choix dont linterprtation biologique est la plus plausible est considr comme
le meilleur. Ainsi, la procdure est sujette des biais dcoulant de lavis des chercheurs sur
ce qui devrait tre considr comme la structure la plus significative pour les donnes. Les
procdures de validation suivantes devraient minimiser les biais:

Cadre conceptuel

reproduire la procdure de classification en utilisant un autre ensemble de donnes;


vrifier la prcision de la classification grce une analyse discriminante par la proportion de cas correctement classs ce qui confirme aussi indirectement le degr
de sparation du groupe;
contrler la stabilit (cohrence interne) de la classification aprs des essais rpts,
de prfrence en utilisant un autre ensemble de donnes issues de la mme population de rfrence.
Les rsultats ainsi obtenus sont satisfaisants dans la mesure o ils rpondent aux deux
objectifs principaux de la taxonomie numrique (Sneath et Sokal, 1973, p 11.):
reproductibilit et comparabilit dans la limite dun niveau acceptable derreur;
objectivit et absence relative de biais imputables aux sentiments personnels et aux
prjugs.

COMPOSANTES DE LA CARACTRISATION PHNOTYPIQUE


Une tude de caractrisation phnotypique consiste collecter un certain nombre de diffrents types de donnes:
la rpartition gographique des races et, si possible, la taille et la structure de leurs
populations;
les caractristiques phnotypiques des races, y compris les caractristiques et lapparence physiques, les caractres conomiques (croissance, reproduction et rendement/
qualit de la production) et certaines mesures (par exemple la gamme) de variation
de ces caractres - laccent est gnralement mis sur la productivit et les caractres
dadaptation des races;
des images dadultes mles et femelles typiques, ainsi que des troupeaux dans leurs
milieux de production typiques;
des informations sur lorigine et le dveloppement de la race;
les relations fonctionnelles et gntiques connues avec dautres races lintrieur ou
lextrieur du pays;
le milieu naturel et les conditions dlevage dans lesquels les races sont maintenus;
les rponses des races face des facteurs de stress environnementaux, comme les
maladies et les parasites, des conditions climatiques extrmes et une alimentation de
mauvaise qualit, ainsi que tous les autres caractres particuliers lis ladaptation;
des connaissances locales pertinentes (y compris les connaissances spcifiques des
femmes et des hommes) sur les stratgies de conduite dlevage appliques par les
communauts pour utiliser la diversit gntique de leur btail.
Alors que la plupart de ces donnes peuvent tre directement collectes lors du travail de terrain, des informations prcieuses peuvent galement tre obtenues partir de
sources secondaires dans la littrature publie et non publie (y compris les ensembles de
donnes lectroniques relatives aux milieux de production). Bien que la plupart des lments numrs peuvent tre recueillis au cours des tudes de caractrisation primaires
(visites uniques sur le terrain), dautres lments exigent des tudes de caractrisation
avances (mesures et observations rptes). Ce dernier groupe comprend des variables
qui dcrivent les caractristiques de performances conomiques (croissance, production

17

18

Caractrisation phnotypique des ressources gntiques animales

laitire, production dufs, production de laine), ladaptation (niveaux de rsistance et de


tolrance face aux facteurs de stress) et les volutions (par exemple en termes deffectif et
de structure de la population, et de performance phnotypique).

Dcrire les races en fonction de leurs caractres qualitatifs et


quantitatifs.
Caractres qualitatifs. Cette catgorie de caractres couvre ltat physique, la forme, la couleur et lapparence externe des animaux. Ces caractres sont considrs comme des variables
discrtes ou catgorielles. Leur caractre de variable discrte tient au fait que ces caractres sont
dtermins par un petit ensemble de gnes. Par rapport aux caractres quantitatifs prsents
ci-dessous, certains de ces caractres (par exemple la couleur du pelage, le type de plume, la
forme des cornes et la longueur de loreille) peuvent prsenter un intrt moindre par rapport
aux fonctions de production et de service des ressources zoogntiques. Ils peuvent cependant tre relis aux caractres adaptatifs. Par exemple, la couleur de la peau et du pelage, et
la taille des oreilles et des cornes, jouent un rle dans la dissipation de la chaleur corporelle
en excs. La longueur de la queue ou la taille du fouet chez les bovins sont importantes dans
les rgions o il y a beaucoup de mouches piqueuses. Dautres caractristiques peuvent tre
pertinentes pour les prfrences ou les gots des leveurs et des consommateurs (par exemple
la couleur du pelage), et certaines sont utilises pour identifier les animaux dans des situations
o lidentification permanente individuelle des animaux est autrement impossible. Dans de
tels contextes, les caractres qualitatifs sont aussi importants que les caractres quantitatifs, et
doivent par consquent tre inclus dans les tudes de caractrisation phnotypique.
Les caractres qualitatifs sont enregistrs soit comme des catgories dexpression
distinctes (par exemple, la couleur des poils ou des plumes) soit sous forme de variables
binaires (prsence ou absence de barbillons). La collecte, la gestion et lanalyse des donnes
sur les caractres qualitatifs diffrent donc des procdures quivalentes pour les caractres
quantitatifs. Ces mthodes sont dtailles dans la section C (collecte de donnes pour la
caractrisation primaire) et la section E (gestion et analyse des donnes).
Le temprament des animaux est troitement li diverses fonctions de production et de
service. Le temprament est enregistr comme tant une mesure subjective (soit catgorielle
ou binaire), de prfrence au niveau du troupeau. Certaines races (par exemple, les bovins
Fulani du Sahel et de lAfrique centrale et de lOuest) ont des caractristiques typiques de
temprament et dattachement leurs propritaires qui les distinguent des autres populations.
Les caractres qualitatifs les plus couramment utiliss dans la caractrisation phnotypique des bovins, moutons, chvres, poulets et porcs sont prsents dans les annexes 1
4. Lenregistrement des caractres comme la couleur des poils, des plumes ou des jarrets,
ou la taille de la bosse implique un certain degr de subjectivit. Des mesures doivent tre
prises pour que les personnes qui collectent les donnes interprtent ces caractres de la
mme faon. Les agents recenseurs doivent recevoir la mme formation sur ces aspects
de la collecte de donnes. Des tableaux analytiques de couleurs normaliss peuvent tre
prpars et apports sur le terrain.
La standardisation du codage des caractres qualitatifs est galement essentielle pour
permettre une large utilisation des donnes, par exemple pour comparer les races

Cadre conceptuel

lintrieur ou entre les pays. La mta-analyse aux niveaux rgional et mondial exige la
fois de standardiser les descripteurs raciaux et davoir accs des ensembles de donnes
pertinentes. Il est donc important que les Coordonnateurs nationaux pour la gestion des
ressources zoogntiques entrent les donnes sur les caractristiques des races de leur
pays de manire cohrente et aussi exhaustive que possible dans DAD-IS. Il est galement
important que les tudes de caractrisation phnotypique fournissent les donnes ncessaires aux coordonnateurs nationaux pour accomplir leur tche. Les tudes de caractrisation phnotypique devraient viser recueillir un noyau de donnes pertinentes figurant
dans les annexes de ces directives de manire aussi complte que possible, dans le but
de les communiquer au niveau international et de disposer dune base solide pour les
actions nationales visant amliorer la gestion des ressources zoogntiques. La gamme
de donnes peut tre largie si ncessaire pour rpondre des objectifs spcifiques et des
prfrences au niveaux national ou local.
Dans les pays francophones et hispanophones, des tudes de caractrisation phnotypique sparent les caractres qualitatifs en trois catgories - morphologique, morphostructurelle et phanroptique - mais le mme ensemble de caractres qualitatifs que ceux dcrits
ci-dessus y sont essentiellement abords.
Caractres quantitatifs. Cette catgorie de caractres couvre la taille et les mesures
du corps ou des parties du corps des animaux, qui sont plus directement corrles aux
caractres de production que ne le sont les caractres qualitatifs. Par exemple, le poids
et le tour de poitrine sont directement lis la taille du corps et aux caractres de production associs. En rgle gnrale, ces variables ont une expression continue en raison
des nombreux gnes qui dterminent ou influencent leur expression. Alors que les caractres qualitatifs, comme la couleur de la robe, dpendent dun petit nombre de locus et
peuvent tre enregistrs et prdits avec prcision pour des populations animales dfinies,
lvaluation des caractres quantitatifs dimportance conomique exigent denregistrer de
nombreux indicateurs directs et indirects sur chaque animal. En outre, contrairement de
nombreux caractres qualitatifs, la plupart des caractres quantitatifs dpendent de lge
de lanimal et de son milieu de production. Par consquent, il est impratif que seuls des
animaux adultes levs dans leurs milieux de production typiques soient chantillonns.
Les donnes recueillies en une seule visite ne peuvent fournir que des indications sur les
caractres quantitatifs possdant une importance conomique. Une collecte rpte et plus
organise des donnes doit tre mise en uvre pour caractriser de manire systmatique
ces caractres (voir la section D pour plus de dtails).
En raison de leurs fortes corrlations avec les caractres de production comme la production de viande et de lait, les caractres tels que le poids corporel, la longueur du corps et
la hauteur au garrot sont utiliss en tant quindicateurs indirects des caractres de production. Les mensurations corporelles doivent toujours tre accompagnes de notes explicatives au niveau de la nutrition, ou de la saison de lanne et de la manire dont cela affecte
la disponibilit des aliments. Dans les tudes qui couvrent de vastes zones gographiques et
impliquent la caractrisation danimaux au pturage, il faut recueillir toutes les donnes sur
le terrain pendant les saisons de lanne o les stocks alimentaires sont similaires. Sinon, les
donnes de condition corporelle des animaux peuvent tre collects et utiliss pour rendre

19

20

Caractrisation phnotypique des ressources gntiques animales

compte des diffrences saisonnires sur le plan de la nutrition, mais cette approche exige
que les collecteurs de donnes aient les comptences requises.
Les caractres comme la largeur du fanon, la longueur de loreille, la hauteur au garrot
et la taille du fourreau sont directement lis aux capacits dadaptation des ressources zoogntiques, et sont donc pertinents pour les tudes de caractrisation phnotypique. Par
exemple, les ressources zoogntiques qui sont bien adaptes aux climats secs et chauds,
comme la chvre Jamunapari dInde ou les bovins Boran dthiopie et du Kenya, ont gnralement des oreilles trs longues et un large fanon.
Les caractres de production dimportance conomique, comme le taux de croissance,
le rendement laitier, la production dufs et le rendement en fibres (par exemple la laine, le
cachemire), ne peuvent pas tre correctement valus lors de visites uniques sur le terrain.
Ils exigent des travaux de caractrisation phnotypique avance impliquant des mesures
rptes de performance (examins plus en dtail dans la section D). Toutefois, certaines
donnes indicatives sur les niveaux moyens de performance peuvent tre collectes travers des mesures uniques, des entretiens avec des leveurs ou des documents disponibles.
La mesure du poids vif un ge spcifique, combine avec les connaissances disponibles
sur la qualit et la valeur marchande de la viande, peut tre utilise comme un indicateur
indirect de laptitude la production de viande de toutes les espces dcrites dans ces directives (bovins, ovins, caprins, porcs et poulets). De mme, les enregistrements de la quantit
moyenne de lait produite par les animaux chantillonns le jour de la collecte des donnes,
en tenant compte du stade de lactation, peuvent donner des indications sur la capacit de
production laitire chez les bovins, les moutons et les chvres. Les formats pour prlever ces
donnes sont prsents dans les annexes 1 4 pour les diffrentes espces. Un exemple plus
dtaill est prsent dans lencadr 3. Il faut cependant prciser que ces approches ne peuvent
tre considres comme des substituts aux mthodes de collecte de donnes standards.
Si les caractres de production spcialiss, comme les caractristiques de la laine, du
cachemire ou du mohair sont considres comme une priorit, des mesures directes de la
qualit des fibres (par exemple le pourcentage en laine et en poils), la longueur, la solidit
et la frisure peuvent tre prleves lors des tudes de caractrisation primaire. Cependant,
chaque fois que ces mesures sont ncessaires, une collecte de donnes dtailles travers
des tudes de caractrisation avance (en ferme et en station) doit tre prvue.
Des chantillons sanguins peuvent tre prlevs lors de travaux sur le terrain et utiliss
pour valuer les paramtres sanguins, comme lhmatocrite ou la prvalence de parasites
sanguins, ou pour extraire de lADN en vue dune analyse gntique molculaire. Le prlvement de ces chantillons ncessite une planification minutieuse et une coordination avec les
laboratoires chargs de lanalyse. Des informations dtailles sur la caractrisation gntique
molculaire sont disponibles dans la publication des directives complmentaires consacres
ce sujet (FAO, 2011), elles-mmes fondes sur un ensemble de recommandations testes
pour le terrain et les travaux de laboratoire. Concernant lorganisation dune tude phnotypique, le principal point noter est que la phase de terrain est loccasion de recueillir des
chantillons tissulaires ou sanguins. Mais surtout, des approches coordonnes permettent
deffectuer une analyse combine et de comparer les donnes phnotypiques et gntiques,
permettant une valuation plus complte de la diversit des ressources zoogntiques. Cette

Cadre conceptuel

21

ENCADR 3

Une mthode rapide dvaluation de la production laitire


chez les races bovines
Dans le cadre dune valuation comparative de lutilit, comme perue par leurs
propritaires, de quatre races bovines locales du sud-ouest de lthiopie leves dans
des petites exploitations, un questionnaire semi-directif a t utilis pour interroger
60 leveurs de bovins situs dans les rgions dorigine de ces quatre races, Abigar,
Gurage, Horro et Sheko. Le questionnaire couvrait, entre autres, les caractristiques de
reproduction, les pratiques dlevage et la production laitire. La production laitire
journalire a t estime par chaque agriculteur pour les trois trimestres de la priode
de lactation, la fois pour la vache la plus ge du troupeau et pour une autre vache
choisie au hasard dans le troupeau. La production de lait nincluait pas la quantit de
lait tte au pis par les veaux. La production laitire a t estime en tant que quantit moyenne par jour pour chaque trimestre de la lactation. Le rendement total de la
lactation a t calcul en se basant sur ces chiffres et la dure de lactation signale. La
dure de la lactation tait la plus longue chez les vaches Sheko et la plus courte chez
les Gurage et Horro. La production laitire tait significativement plus leve chez les
Abigar et Sheko par rapport aux Gurage et Horro. La production de lait la plus faible
a t observe chez la race Gurage.
Source: Stein et al. (2009).

analyse facilite non seulement une identification plus aboutie des races distinctes dans les
situations o les diffrences phnotypiques semblent mineures (voir encadr 4), mais peut
galement tre utilise pour identifier les relations gntiques entre les races, ce qui est trs
utile pour planifier lamlioration des races et les programmes de conservation.
Des donnes supplmentaires sur la rsistance, ou la tolrance, aux facteurs de stress
biotiques (maladies, parasites, etc.) et abiotiques (climat, pnurie deau, pnurie alimentaire
saisonnire, etc.) peuvent tre recueillies lors des tudes de caractrisation phnotypique
primaires en interrogeant les leveurs individuellement ou dans des groupes de discussions.
Les annexes 1 5 donnent des indications sur les caractres qui peuvent tre tudis grce
des entretiens. Ces donnes sont largement tributaires de la perception des personnes
interroges et doivent donc tre interprtes avec prudence. Une enqute plus approfondie
par des mesures rptes peut savrer ncessaire.
Les services de traction fournis par les bovins sont importants pour de nombreuses
populations rurales en Afrique et en Asie, et doivent par consquent faire partie intgrante
de la caractrisation phnotypique chez cette espce. Au cours des tudes de caractrisation primaire, seule la collecte de donnes sur les prfrences en termes de caractre
est possible. Si ncessaire, des tudes avances pour obtenir des donnes dtailles sur la
vitesse de traction et le travail effectu peuvent tre mises en uvre.

Caractrisation phnotypique des ressources gntiques animales

22

ENCADR 4

Comment combiner la caractrisation gntique avec la caractrisation


phnotypique - un exemple
Une tude de caractrisation phnotypique et gntique intgre des trois races bouchres de chvres leves en Afrique du Sud (Boer, Savanna et Kalahari Red) a t
ralise en 2007 afin de dterminer si les caractristiques typiques de ces races taient
entretenues et de sassurer que leurs caractristiques uniques ntaient pas perdues. Les
mmes populations ont t chantillonnes pour la caractrisation phnotypique et
gntique. Une srie de douze mesures linaires a t ralise pour la caractrisation
phnotypique. Dix-huit marqueurs microsatellites, choisis parmi un panel de marqueurs
recommands par la Socit internationale de gntique animale (ISAG) et la FAO, ont
t utiliss pour la caractrisation gntique. Les rsultats ont montr que la variation
morphomtrique au sein des races tait suprieure celle entre les races, et que les diffrences morphomtriques entre les races taient assez insignifiantes. Ces rsultats ont
soulign la ncessit deffectuer une caractrisation gntique pour permettre de distinguer les races avec prcision au niveau gnotypique. Les rsultats des tudes gntiques
ont montr que les trois races avaient des valeurs dhtrozygotie relativement leves
et que chacune des populations tait clairement identifiable en tant que race distincte
daprs les rsultats de gnotypage avec les marqueurs utiliss. En conclusion, dautres
tudes gntiques sont ncessaires pour assurer une diversit suffisante au sein des races
pour la conservation long terme de ces ressources gntiques uniques.
Source: Pieters et al. (2009).

Limites de la caractrisation primaire pour recueillir des donnes sur les


caractres dimportance conomique
Malgr le cot lev et leffort important investi dans les tudes de caractrisation primaire, assez peu dinformations peuvent en tre dduites pour les principaux caractres
de production comme le taux de croissance (pour la production de viande), le rendement
laitier, la production dufs, la production de laine ou la qualit de ces produits. Certains
instruments de collecte de donnes sont disponibles pour enregistrer des informations sur
ces caractres lors dune seule visite sur le terrain, mais ils ne peuvent pas se substituer
la caractrisation avance fonde sur des visites rptes et des mesures contrles (voir
section D). Si les ressources sont limites, il faut faire le choix entre mener une tude de
caractrisation primaire sur une zone largie ou effectuer une caractrisation avance sur
un chantillon ou une zone gographique rduite.

Enqute sur les populations sauvages et frales


Dans certains endroits et systmes de production, les animaux dlevage entrent en
contact et se croisent avec des populations sauvages ou frales. Par exemple, dans les

Cadre conceptuel

rgions montagneuses du nord du Viet Nam, les populations de poulets domestiques


sont frquemment en contact avec des populations apparentes sauvages. De mme,
de nombreuses populations porcines indignes dans les communauts rurales isoles en
Papouasie-Nouvelle-Guine se croisent librement avec les populations de porcs sauvages
et frales. Lorsque cela est possible, il faudrait envisager de collecter des donnes sur ces
populations lors des tudes de caractrisation phnotypique dans ces zones. Les estimations des effectifs et de la rpartition gographique des populations sauvages et frales
sont particulirement intressantes, ainsi que les informations sur lexistence ou non, et
lampleur ventuelle de croisementse entre ces populations et les animaux domestiques.
En dehors de lintrogression gntique, les populations sauvages et frales peuvent jouer
un rle important dans la transmission de maladies contagieuses aux populations domestiques. Les donnes recueillies peuvent galement prsenter un intrt pour la gestion de
ces populations sauvages ou frales, soit pour aider les conserver en tant qulments
importants de la biodiversit locale soit, si elles sont des espces exotiques envahissantes
dans le contexte local, pour rduire leurs nuisances.

Enquter sur les effectifs des races et les menaces qui psent sur la
diversit gntique
Les donnes actualises sur les effectifs et la structure des races sont essentielles pour grer
efficacement les ressources zoogntiques. Lobtention des donnes de base sur les races
dun pays et la surveillance ultrieure des volutions est mieux gre dans le cadre du dveloppement et de la mise en uvre dune stratgie nationale denqute et de surveillance,
qui est susceptible dimpliquer des enqutes sur un chantillon de mnages combines
avec lutilisation dautres outils de collecte de donnes (pour plus de dtails, voir FAO,
2012). Dans les pays o les populations ne sont pas bien caractrises, et en particulier l
o elles ne sont pas distingues en races reconnues, la caractrisation phnotypique est
fondamentale pour constituer une base de donnes de rfrence sur les ressources zoogntiques nationales.
De nombreuses tudes individuelles de caractrisation phnotypique sont menes
trop petite chelle pour leur permettre de fournir des chiffres prcis sur les effectifs des
races concernes, notamment si les races sont largement distribues dans tout le pays.
Nanmoins, ces tudes offrent lopportunit dobtenir des approximations de leffectif de
ces races dans les zones dtude. Par exemple, des mthodes dvaluation rapide peuvent
tre utilises pour recueillir les connaissances locales sur lidentit des races et la distribution
locale des populations. En cartographiant ces distributions et en les reliant aux donnes
dmographiques disponibles pour les espces concernes dans les units administratives
concernes (par exemple partir dun recensement du cheptel), on peut obtenir des estimations sur les effectifs des races dans ces zones (par exemple FARM Africa et ILRI, 1996;
Blench, 1999). Des renseignements supplmentaires issus des discussions de groupe et des
entretiens avec des tmoins privilgis ou de sources secondaires, tels que les tudes prcdentes sur le btail, peuvent permettre daffiner les estimations brutes des populations.
Il faudrait envisager de recueillir des donnes indicatives sur les menaces qui psent
sur les ressources zoogntiques lors des tudes de caractrisation phnotypique, dans le

23

24

Caractrisation phnotypique des ressources gntiques animales

cadre de la description des milieux de production des races. Les entretiens et les groupes de
discussion avec les leveurs et dautres informateurs peuvent tre utiliss pour obtenir des
informations sur les menaces lies aux changements socio-conomiques, la disponibilit
des ressources, aux pidmies ou dautres catastrophes. La cartographie de la rpartition
des races dans le cadre des tudes de caractrisation phnotypique (voir ci-dessous) peut
galement contribuer lanalyse et la gestion de certaines menaces.

Cartographier les distributions gographiques des races


Les donnes sur la rpartition gographique des races danimaux dlevage sont importantes pour dvelopper des plans de gestion des ressources zoogntiques la fois directement (par exemple, la connaissance de la localisation des animaux peut tre ncessaire
pour planifier les rponses aux situations durgence comme lapparition de foyers de
maladie) et indirectement (en raison du lien entre lemplacement et les aspects naturels
du milieu de production - le climat, laltitude, le terrain, lpidmiologie des maladies, etc.).
Les tudes de caractrisation phnotypique devraient toujours inclure lenregistrement des
lieux o les mesures sont prises, et la cartographie aussi prcise que possible de la rpartition des races dans les zones tudies.
Les cartes de rpartition des races peuvent tre esquisses en combinant les mesures de
golocalisation par satellite (GPS) prises sur les sites dtudes avec les informations obtenues au
moyen dentretiens ou dexercices de cartographie mens avec les populations locales. Dans
les systmes dlevage extensifs comme les systmes pastoraux et agropastoraux en Afrique
sub-saharienne, dans les Andes et certaines parties dAsie, lidentit des races correspond souvent aux frontires ethniques des communauts dleveurs. Ces liens peuvent tre corrobors
en utilisant les informations recueillies lors de discussions de groupe et dentretiens avec des
informateurs cls. Des donnes secondaires pertinentes peuvent galement tre utilises pour
dessiner des cartes de rpartition, mais les donnes provenant de sources secondaires doivent
tre interprtes avec prudence car elles peuvent tre inexactes ou obsoltes.

Dcrire les environnements de production


Pour comprendre les qualits de production et dadaptation des races ou des populations
danimaux dlevage, il est essentiel de dcrire leurs environnements de production, et ce,
pour plusieurs raisons. Si les donnes sur les niveaux de production sont recueillies, il est
essentiel de recueillir galement des donnes sur les conditions dans lesquelles les animaux
sont levs. En labsence de donnes sur le milieu de production, les donnes de performance ne sont pas significatives. Non seulement les variations dans les milieux de production donnent lieu des variations de performance, mais les races peuvent tre classes
diffremment selon les milieux de production, cest--dire que la race la plus performante
dans un milieu de production donn peut constituer un mauvais choix dans une autre
situation. Les caractres dadaptation sont complexes et difficiles mesurer, surtout dans
les systmes de production faible ou moyenne intensit dintrants. Ils peuvent cependant tre caractriss indirectement en dcrivant les milieux de production dans lesquels
les populations cibles ont t leves au fil du temps. Les races qui ont d survivre et se
reproduire en prsence de facteurs de stress particuliers et des combinaisons de facteurs de

Cadre conceptuel

stress (tempratures leves ou basses, aliments de mauvaise qualit, maladies ou parasites


spcifiques) auront subit une pression slective pour sadapter ces facteurs de stress.
La description du milieu de production peut aussi tre un moyen important pour identifier les opportunits potentielles de dveloppement. Par exemple, le fait que les races
soient leves dans des milieux naturels spcifiques peut jouer un rle important dans
le dveloppement de marchs de niche pour leurs produits. Les descriptions des milieux
de production des races sont galement essentielles pour planifier des programmes de
conservation et damlioration gntique. Dans ce cas en particulier, il est ncessaire non
seulement de dcrire les conditions physiques dans lesquelles les animaux sont levs, mais
aussi de dcrire les caractristiques du milieu socio-conomique, comme les usages et les
rles du btail, lorientation et laccs au march, les produits spcifiques et les opportunits commerciales, ainsi que les aspects sexospcifiques de llevage.
Les comparaisons significatives entre les races ncessitent deffectuer des descriptions
normalises de leurs milieux de production respectifs. Pour rpondre cette exigence, la
FAO et lAssociation mondiale de zootechnie ont organis un atelier dexperts (tenue en
2008) qui a dvelopp un ensemble de descripteurs normaliss des milieux de production
(DMP) destins tre utiliss dans DAD-IS et les tudes de caractrisation phnotypique
(FAO/WAAP, 2008). Chaque tude de caractrisation phnotypique devrait utiliser ces DMP
comme outils de base et recueillir les donnes supplmentaires sur les milieux de productions qui prsentent un intrt pour atteindre les objectifs de ltude et pour fournir une
description dtaille des conditions dans lesquelles les animaux sont levs.
Le cadre des DMP est prsent en annexe 5. Notez que ce cadre comprend des donnes climatiques moyennes qui ne peuvent pas tre obtenues en visitant une seule fois le
site dtude (en fait, elles ncessitent plusieurs dcennies dobservations). Ces donnes
peuvent tre obtenues partir des enregistrements des stations mtorologiques situes
proximit du site dtude. En outre, de nombreux aspects des milieux de production sont
maintenant enregistrs lectroniquement sur des cartes haute rsolution. Si une tude
de caractrisation phnotypique enregistre la localisation gographique des races cibles, il
devient possible de crer des cartes numriques de distribution des races qui peuvent tre
superposes dautres cartes numrises disponibles pour ces zones. Cette approche est
utilise dans le module DMP de DAD-IS pour tous les aspects des milieux de production
pour lesquels des cartes numrises sont disponibles dans le monde. Les cartes mondiales
incorpores dans DAD-IS comprennent non seulement des donnes climatiques, comme la
temprature, les prcipitations et lhumidit relative, mais aussi les aspects du terrain et de
la vgtation, comme laltitude, la pente, le type de couverture du sol, le couvert forestier
et le pH du sol. Les donnes sur les aspects du milieu de production qui ne sont pas disponibles sous la forme de carte (par exemple, les pratiques de gestion) doivent tre collectes
directement lors des visites sur le terrain. Voir les sections C et D pour plus de dtails sur la
faon de recueillir des donnes sur le milieu de production.

Lvaluation conomique des caractres non productifs


Les tudes de caractrisation phnotypique pourraient ouvrir la voie des programmes de
conservation ou damlioration gntique. Dans les milieux de production faible intensit

25

26

Caractrisation phnotypique des ressources gntiques animales

dintrants des pays en dveloppement, les motivations poussant lever certains types de
btail comprennent une gamme de caractres dadaptation et de fonctions de service non
marchands. Dans des environnements stressants, la tolrance face aux pnuries deau et
daliments, aux maladies et aux parasites, aux scheresses occasionnelles et aux tempratures extrmes peut tre prioritaire par rapport aux caractres de production. De mme,
les aptitudes maternelles, la fcondit et la capacit fournir des services de traction ou
jouer des rles socioculturels peuvent tre considres comme des caractristiques prioritaires dans certains systmes de production. Malheureusement, ces caractres sont difficiles
enregistrer au cours des tudes de caractrisation phnotypique. Les progrs rcents
dans le domaine de lvaluation conomique des ressources zoogntiques ont permis de
dvelopper, adapter et tester de nouveaux outils de collecte de donnes et danalyse pour
valuer ces caractres afin de conseiller les plans damlioration et de conservation gntiques ou les dcisions sur limportation de races exotiques (Drucker et al., 2001; Drucker et
Anderson, 2004). Ces outils peuvent tre appliqus au cours des tudes de caractrisation
phnotypique. Voici deux exemples de base:
1. dterminer limportance conomique de la race tudie en posant des questions prcises sur les prfrences de race des intervenants cls (c.--d. limportance relative
des races en tenant compte de toutes les caractristiques conomiques pertinentes);
2. identifier tous les caractres pertinents et les classer par ordre de priorit en fonction
des prfrences des leveurs.
Lorsquun programme damlioration ou de conservation gntique est envisag pour
une race, des tudes supplmentaires peuvent savrer ncessaires pour recueillir des donnes dtailles sur les niveaux des intrants et des extrants au sein des levages.
Limportance plus grande accorde aux caractres non productifs dans les milieux de
production faible intensit dintrants des pays en dveloppement signifie que, dans ces
environnements, il peut tre particulirement important de dvelopper des critres dvaluation de la productivit qui prennent ces caractres en compte et dutiliser ces critres
dans lvaluation et la comparaison des caractristiques des diffrentes ressources zoogntiques (Ayalew et al., 2003; voir encadr 5). Cela signifie galement que les fonctions
non lies au revenu (par exemple le fumier, lpargne, lassurance) doivent tre inclus dans
les programmes damlioration gntique dans ces systmes de production. Les caractres
uniques, comme la rsistance ou la tolrance aux maladies endmiques ou aux parasites,
ou aux pnuries alimentaires et deau saisonnires, doivent galement tre identifis et valus en termes conomiques, travers des tudes de suivi (Drucker et al., 2001). Une autre
raison importante pour lvaluation conomique de ladaptation, des services et des autres
caractres non-productifs est le rle potentiel des ressources zoogntiques dans lexercice
des fonctions publiques ou sociales. Comme cest souvent le cas chez les races qui sont en
danger dextinction, ces rles attirent peu dintrt commercial.
De nombreuses mthodes dvaluation conomique des caractres non productifs ont
comme point commun la documentation des prfrences des leveurs de btail et leur
valuation en termes montaires. En effet, les leveurs peuvent tre invits indiquer leurs
prfrences en termes de race et les raisons spcifiques qui sous-tendent ces prfrences
lorsque plusieurs races sont en considration. Ces donnes peuvent tre recueillies lors des

Cadre conceptuel

27

tudes de caractrisation phnotypique primaires. Lanalyse des donnes peut soulever des
questions conomiques plus spcifiques qui ncessitent dtre tudies travers des tudes
de suivi. Les tudes dvaluation conomique menes en collaboration avec la caractrisation phnotypique peuvent fournir des estimations utiles sur les valeurs que la socit
donne certaines ressources zoogntiques. Les informations sur les prfrences des
leveurs de btail et leurs perceptions des races et de leurs caractres sont extrmement
importantes dans la conception des programmes de conservation et damlioration gntiques. Des experts comptents doivent apporter une contribution technique spcifique
pour faciliter la planification et la gestion des tudes dvaluation conomique associes
au travail de caractrisation phnotypique.

ENCADR 5

Modle de productivit globale pour lvaluation compare des


performances des ressources zoogntiques
La multiplicit des fonctions importantes de production, de service et socioculturelles
du btail dans les petites exploitations et les systmes de production de subsistance ne
peut pas tre pris en compte par les critres dvaluation classiques de la productivit
qui se concentrent sur les caractres de production. Les valuations bases sur ces critres sont insuffisantes pour estimer la production animale de subsistance car: 1) elles
ne parviennent pas saisir les avantages non marchands, et 2) le concept de base dun
intrant limitant unique est inappropri pour la production de subsistance, car plusieurs
facteurs limitants (animaux, main duvre et terre) sont impliqus dans le processus de
production. Autant de fonctions du btail (physiques et socio-conomiques) que possible
devraient donc tre regroupes en valeurs montaires et lies aux ressources utilises,
indpendamment du fait que les produits soient commercialiss, consomms par le
mnage ou conservs pour un usage ultrieur. Un modle largi dvaluation impliquant
trois indices complmentaires de productivit lchelle du troupeau a t dvelopp et
utilis pour valuer la production de subsistance de chvres dans les hauts plateaux de
lest de lthiopie. Les rsultats montrent que les troupeaux de chvres indignes gnraient des bnfices significativement plus levs dans un systme dlevage amlior
que dans un systme de gestion traditionnel, remettant ainsi en cause la lide dominante selon laquelle le btail local ne rpond pas bien lamlioration du systme de
production. En outre, ltude a montr que, dans le systme de production de subsistance
considr, lhypothse selon laquelle les croisements de chvres locales et exotiques
taient plus productifs et bnfiques que les chvres locales est errone. Le modle fournit ainsi une base plus raliste pour proposer des programmes damlioration.
Source: Ayalew et al. (2003).

Section B

Cadre oprationnel

31

Cadre oprationnel

Cette section sert de transition entre la partie prcdente plus thorique, qui dcrit les
principes, les concepts et les composantes de la caractrisation phnotypique et les sections
suivantes qui traitent de la planification pratique et la mise en uvre des tudes de caractrisation phnotypique. La section B traite de la phase de prparation dune telle tude. Cette
section joue un rle primordial car elle apporte des conseils sur la formation du groupe qui
conduira ltude et aide cette quipe dfinir les objectifs et le champ de ltude.

DRESSER LA LISTE DES PARTIES PRENANTES


Ltude devrait idalement tre propose dans le cadre de la Stratgie nationale et du Plan
daction du pays pour les ressources zoogntiques (FAO, 2009b) et tre intgre dans une
stratgie nationale sur les enqutes et la surveillance visant satisfaire les besoins du pays
en termes de donnes et dinformations sur les ressources zoogntiques (FAO, 2012). Linitiative peut sinon tre lance par une personne en particulier ou un groupe dindividus, qui
sont conscients de la ncessit de caractriser les populations de certaines ressources zoogntiques locales. Quel que soit le cadre institutionnel, les tudes de caractrisation phnotypique doivent se focaliser sur les principaux besoins des parties prenantes en termes de
connaissance des ressources zoogntiques au niveau local et/ou national. Mme si ltude
nest pas lance au niveau national, il est nanmoins essentiel que le Coordonnateur national pour la gestion des ressources zoogntiques et le Comit consultatif national sur les
ressources zoogntiques (ou la structure quivalente) soient informs et consults.
Une fois que la dcision de mener une tude a t prise, une quipe quilibre et comptente doit tre runie pour planifier et mettre en uvre la caractrisation phnotypique.
Cette tche devra tre organise par lindividu ou le petit groupe qui a lanc ltude ou
qui a t nomm par les autorits nationales pour remplir cette tche. Ce processus peut
impliquer une srie de consultations avec les principaux intervenants. Une premire tape
pourrait consister dresser un inventaire de tous les acteurs qui peuvent contribuer la
planification et/ou la mise en uvre de ltude de caractrisation, tre intresss par les
rsultats ou contribuer aux activits de suivi. Les reprsentants des institutions cls et des
groupes de parties prenantes doivent tre identifis. Le tableau 1 prsente une liste de
contrle qui peut aider identifier les parties prenantes concernes.

CONSTITUER LQUIPE CHARGE DE LTUDE


Selon le champ couvert, lquipe charge de planifier et mener ltude de caractrisation phnotypique peut tre pluridisciplinaire et comprendre des experts et des techniciens ou quelques
chercheurs individuels (et leurs assistants ou tudiants en matrise/doctorat). Les tudes
menes par des quipes universitaires et de recherche devront probablement tre approuves
par leurs institutions respectives pour la comptence technique de lquipe de recherche.

Caractrisation phnotypique des ressources gntiques animales

32

TABLEAU 1

Exemples de parties prenantes locales, rgionales et internationales


Catgorie

Organisations

Nationale et locale
(zone dtude)

Associations de race; syndicats ou associations dagriculteurs ou dleveurs;


organisations de conservation des races; ministres, dpartements ou divisions
au sein du gouvernement national ou rgional; prestataires de services (par
exemple reproduction artificielle, enregistrement de la performance); organismes
de recherche; tablissements denseignement et de formation; organismes de
vulgarisation; institutions de financement et facilitateurs de crdit; agences de
dveloppement rural; autres organisations nationales ou locales y compris les ONG

Rgionale

Centre arabe pour ltude des zones arides et des terres sches (ACSAD),
Organisation arabe pour le dveloppement agricole (OADA), Institut
interamricain de coopration pour lagriculture (IICA), Communaut du
Pacifique (CPS), Communaut de dveloppement de lAfrique australe (SADC),
dautres organisations rgionales, notamment les ONG

Internationale

Centre international de recherches agricoles dans les rgions sches (ICARDA),


Institut international de recherches sur llevage (ILRI), FAO, Fonds international
de dveloppement agricole (FIDA), Organisation pour la coopration et
le dveloppement conomiques (OCDE), Banque mondiale (BM), dautres
organisations internationales, notamment les ONG

Les comptences suivantes sont requises dans les quipes charges de la caractrisation
primaire ou avance (les exigences supplmentaires pour les tudes avances sont discutes
ci-dessous):
une bonne connaissance de la gntique animale et de la gestion des ressources
zoogntiques;
une bonne connaissance des statistiques et de la gestion des donnes;
une bonne connaissance de la sociologie, et en particulier des approches participatives;
une bonne connaissance des systmes de production du btail dans la zone dtude
et de la signification socio-culturelle des ressources zoogntiques;
de bonnes comptences et de lexprience dans lorganisation du travail sur le
terrain (en particulier des tudes de caractrisation phnotypiques) lchelle
approprie;
de bonnes connaissances sur les contributions actuelles et futures que pourraient
apporter les ressources zoogntiques aux moyens dexistence des leveurs de la
zone dtude et lconomie locale.
Au cas o il serait impossible de rassembler toutes ces comptences au sein de lquipe
dtude elle-mme, il faudra rechercher les conseils techniques dexperts en dehors de
lquipe, aux diffrents stades de la planification et de la mise en uvre de ltude. Lquipe
de recherche devrait tre anime par une personne possdant une vaste exprience dans
les tudes de caractrisation. Les membres de lquipe doivent cooprer troitement les uns
avec les autres durant toutes les phases du projet (planification, travail sur le terrain, gestion
et analyse des donnes et rdaction du rapport).
Par exemple, une quipe dtude typique rpondant aux critres dcrits ci-dessus peut
tre compose des membres suivants:

Cadre oprationnel

33

un investigateur principal, qui peut tre un expert dans une ou plusieurs des comptences souhaites;
un spcialiste de la production et/ou de la gntique animales, de prfrence un
expert sur les espces cibles par ltude;
un sociologue ou anthropologue;
un spcialiste de la gestion des donnes;
du personnel charg de la saisie des donnes;
un analyste de donnes;
un statisticien;
des agents recenseurs (le nombre dpend de la taille de ltude).
Ces membres peuvent possder plusieurs comptences et par consquent responsabilits, mais ces responsabilits ne doivent pas tre partages. Lanalyste des donnes doit
idalement tre un statisticien (dans ce cas, il nest pas ncessaire davoir un autre statisticien dans lquipe), mais un autre membre comptent de lquipe (par exemple, gnticien
ou spcialiste des sciences animales) peut jouer ce rle et tre conseill le cas chant par
un statisticien.
Lquipe dtude doit contacter les autorits locales dans la (les) rgion(s) o ltude
prend place et solliciter leur appui pour faciliter le travail de terrain et le recrutement des

figure 2

Cadre oprationnel pour la caractrisation phnotypique

Constituer lquipe dtude et


dfinir les objectifs et le champ
d'application (Section B)

Caractrisation
primaire

Collecte des donnes


(Section C)

Caractrisation
avance

Collecte des donnes


(Section D)

Gestion et analyse des donnes


(Section E)

Compte rendu et communication


(Section F)

Note: = prise de dcision.

Stratgie nationale
et plan daction
pour les ressources
zoogntiques

34

Caractrisation phnotypique des ressources gntiques animales

recenseurs. Au cas o il y aurait plusieurs groupes distincts dagents recenseurs, il est essentiel de nommer un superviseur pour chaque groupe et dassurer une bonne coordination
entre les groupes. Il est prfrable que les diffrents groupes aient des membres en commun pour assurer la cohrence des mthodes utilises. Toutefois, cela peut tre difficile
accomplir si les groupes sont sur le terrain en mme temps.
Les tudes de caractrisation avance peuvent impliquer un plus grand nombre de
personnes. Lvaluation en ferme ncessite parfois de passer un contrat avec les leveurs
et demployer des assistants supplmentaires pour la collecte de donnes et la surveillance.
Dans le cas des valuations en station, le personnel qui gre les installations et les procds
exprimentaux devra tre inclus dans lquipe dtude.
Une fois tablie, lquipe de recherche devra entreprendre les tches suivantes:
recueillir les renseignements de base;
clarifier les objectifs et le cadre de ltude;
planifier et excuter le travail sur le terrain pour recueillir des donnes sur les animaux et leurs milieux de production;
planifier et excuter la gestion et lanalyse des donnes;
prparer le rapport de ltude et communiquer les principales conclusions aux parties prenantes concernes.
Ces tches sont rsumes dans la figure 2. Les deux premires sont dcrites ci-dessous
dans cette section. La planification et lexcution du travail sur le terrain pour recueillir les
donnes sur les animaux et leurs milieux de production sont dcrites dans la section C pour
la caractrisation primaire et D pour la caractrisation avance. La planification et la mise en
uvre de la gestion et lanalyse des donnes sont prsentes dans la section E. La section F
traite de la communication des principales conclusions aux parties prenantes concernes.
noter que ces sections sont classes par type dactivit et ne correspondent pas un ordre
chronologique. Par exemple, le groupe dtude doit dabord planifier la gestion et lanalyse
des donnes avant de commencer le travail sur le terrain.

RECUEILLIR LES INFORMATIONS DE BASE


Afin de dfinir le champ dapplication du travail, lquipe doit recueillir des informations
pertinentes sur les populations danimaux dlevage cibles et leurs milieux de production,
ainsi que sur les activits passes ou en cours lies leur caractrisation. Cette tche parat
simple, mais elle peut prendre beaucoup de temps et doit tre comptabilise et budgtise
correctement. Il faut rechercher et examiner les informations disponibles dans les documents publis ou non, les rapports officiels et la lgislation pertinente.
Lquipe charge de lenqute doit rechercher des donnes sur les effectifs des populations des espces concernes, dans les zones cibles par ltude. Les rsultats du dernier
recensement agricole ou du cheptel sont parfaitement adapts et peuvent galement
tre une source dinformations supplmentaires sur les systmes agricoles et le milieu
biophysique et socio-conomique dans la zone dtude. La plupart des recensements ne
distinguent pas les animaux en fonction de leur race. Toutefois, les donnes du recensement peuvent tre combines avec des informations sur la distribution des races provenant
dautres sources (FAO, 1996; ACO, 2006). Lorsque les donnes du recensement peuvent

Cadre oprationnel

tre attribues avec certitude des races particulires au sein de la zone dtude, des donnes dtailles sur la taille et la structure de ces populations peuvent tre obtenues afin
de prparer la base dchantillonnage de ltude. La mthode suivante peut tre utilise:
esquisser, sur une carte, la rpartition connue des races au sein de la zone dtude
lchelle de la plus petite unit administrative possible;
relier la carte de rpartition (le schma) aux chiffres disponibles sur la population et
essayer de dlimiter les zones gographiques o les chiffres peuvent tre assembls
avec confiance;
agrger ces informations pour obtenir des estimations sur les effectifs et la rpartition des populations de race.
Toutefois, les donnes secondaires doivent tre manipules avec prudence pour laborer les cartes de distribution car elles peuvent tre obsoltes ou inexactes.
Lorsque la rpartition gographique des races cibles par ltude peut tre cartographie
en se basant sur des informations secondaires, on peut (en fonction de linformation disponible) superposer les cartes de distribution avec diverses sources de donnes gorfrences,
qui peuvent fournir un aperu du milieu de production, comme la disponibilit saisonnire
de lalimentation, limportance des maladies endmiques, les usages spcifiques de llevage
(par exemple la traction, la production laitire), la demande du march pour certains produits, les prfrences culturelles et les zones cologiques. Ces informations seront utiles pour
construire la trame de lchantillonnage pour le travail de caractrisation. La cration dune
base de donnes intelligente, qui permettrait de relier les diffrents ensembles de donnes
entre eux, serait particulirement intressante, mais cela dpasse la porte de ces directives.
Lorsquil ny a pas assez dinformations de base disponibles pour planifier ltude,
un travail prliminaire doit tre ralis, sur le terrain et/ou lors de consultations avec des
acteurs comptents. Ces activits doivent tre planifies et budgtises en plus du travail
principal sur le terrain. Une gamme doutils disponibles permet dobtenir des informations
sur les effectifs et la rpartition des races et sur divers aspects de leur gestion. Certains
dentre eux sont numrs dans lencadr 6. De plus amples dtails sont disponibles dans
les directives complmentaires sur les enqutes et le suivi (FAO, 2012).
Dans le cadre dune tude de caractrisation phnotypique, les meilleurs outils pour
collecter des informations prliminaires sont les expditions cartographiques (par exemple
vrifier sur le terrain des informations provenant de sources secondaires sur la distribution
des races), les valuations rapides (par exemple pour obtenir des donnes sur la rpartition
de la race et dautres aspects de llevage qui peuvent tre utiles dans llaboration du
cadre dchantillonnage), ainsi que, dans certaines circonstances, les enqutes par transect
pour obtenir des donnes sur les effectifs et la distribution des races.

CLARIFIER LES OBJECTIFS ET LE CADRE DE LTUDE


Lquipe de recherche doit avoir une vision claire de lobjectif et des principales questions
de recherche de ltude. Une consultation et une runion de planification prliminaires
peuvent tre organises afin de clarifier l (les) objectif(s) du travail, faire le point sur les
activits en cours ou prvues qui peuvent influer sur ltude, et dfinir un plan de travail
pour le projet. Lquipe doit revoir les objectifs de ltude et sassurer quils sont conformes

35

Caractrisation phnotypique des ressources gntiques animales

36

ENCADR 6

Exemples doutils de surveillance pour la collecte des donnes


sur les ressources zoogntiques
Expditions cartographiques: plusieurs dplacements au sein de la zone dtude
destins obtenir des informations de base sur la rpartition gographique des races
et de populations spcifiques.
Enqutes par transect: une mthode destimation de leffectif et de la composition
de la population animale dans une zone dfinie base sur le comptage effectu le long
de bandes troites dans la zone et des mthodes statistiques pour obtenir des estimations pour lensemble de la zone. Cet outil est susceptible de produire des rsultats
intressants dans les milieux de production homognes o les animaux sont rpartis
uniformment plutt quen groupes spars.
Relevs ariens: les expditions cartographiques ou les enqutes par transects
ariennes peuvent permettre de localiser et dnombrer les races connues, mais elles
fournissent peu dinformations supplmentaires.
valuations rapides: lutilisation de diffrentes techniques pour obtenir une gamme
dinformations auprs des leveurs et dautres informateurs locaux, individuellement
ou en groupe.
Enqutes auprs des mnages: lutilisation de questionnaires pour recueillir des
donnes chez un sous-ensemble alatoire de mnages dleveurs dans la zone cible.
Ces enqutes sont gnralement coteuses en temps, en efforts et en frais financiers.
Obtenir des informations auprs des associations dleveurs: lorsquelles existent,
les associations dleveurs peuvent fournir des informations dtailles sur leffectif et
la structure de la population, sa distribution, les standards de la race, ses utilisations,
ainsi que dautres aspects, concernant la race quils lvent. Cependant, ces informations peuvent ne pas couvrir lensemble de la race et tre soumises des biais de toutes
sortes.
Source: FAO (2012).

aux priorits nationales pour la collection de donnes sur les ressources zoogntiques et
se concerter si ncessaire avec le Coordinateur national et le Comit consultatif national
sur les ressources zoogntiques (ou tout autre organisme qui supervise ce travail au niveau
national). Les objectifs possibles et les questions de recherche associes dune tude de
caractrisation phnotypique comprennent:
Pour identifier de nouvelles races dans la zone dtude:
-- Y a-t-il de nouvelles races distinctes dans la zone dtude?
-- Sagit-il de races connues en dehors de la zone dtude?
-- Comment ces races nouvellement identifies sont-elles relies aux populations
dj connues?

Cadre oprationnel

37

ENCADR 7

Lutilisation de la caractrisation avance pour laborer un programme


damlioration de la race - le cas du mouton queue fine de Sumatra
Il existe peu dexemples dtude de caractrisation avance ayant servi laborer des
programmes damlioration des races, en particulier dans lesquelles la caractrisation
a t mene dans le but de concevoir un programme de slection. Le cas du mouton
queue fine de Sumatra (QFS) en Indonsie, un petit animal (22 kg poids adulte) originaire de Sumatra, fait partie de ces exemples.
Une tude de caractrisation sur quatre ans a rvl que le mouton QFS possdait
un des plus hauts indices de reproduction au monde parmi les races de moutons, avec
un taux de reproduction de 1,54 agneau/agnelage, un intervalle entre agnelages de
201 jours et 1,84 agnelage/an. Ces caractristiques permettent de produire jusqu 3,6
agneaux sevrs et 31,9 kg de poids vif total par brebis et par an.
Ltude de caractrisation a t complte par des recherches sur laptitude des croisements entre les moutons QFS avec dautres races tropicales, telles que le mouton
Sainte-Croix des les Vierges amricaines, le mouton Blackbelly de la Barbade et le
mouton javanais grosse queue de lest de Java. Les informations obtenues ont jou un
rle crucial pour mettre en vidence le schma de croisement pour la production dune
population synthtique drive du mouton QFS et du mouton Blackbelly de la Barbade,
qui a montr de meilleures adaptations et performances que les croisements entre le
mouton QFS et le mouton Sainte-Croix ou le QFS et le mouton grosse queue de Java.
Au cours de la caractrisation du mouton QFS, des cas dinfestation par la douve
pancratique (Fasciola gigantica), qui sattaque la fois aux races natives (Sumatra)
et exotiques, comme le mouton Sainte-Croix et grosse queue de Java, ont t diagnostiqus. Des tudes ultrieures ont montr que les mouton QFS, et indonsiens en
gnral, taient plus rsistants ce parasite que les Sainte-Croix, et que cette rsistance
a probablement un dterminisme gntique simple.
Auteur: Luis Iiguez.

Pour caractriser, phnotypiquement, les races nouvellement identifies et dj


connues dans la zone dtude:
-- Quelles sont les caractristiques phnotypiques propres des races?
-- Les races sont-elles associes des zones agro-cologiques ou des groupes
socio-conomiques ou culturels particuliers au sein de la zone dtude?
-- Les races possdent-elles des adaptations spcifiques ou des caractres uniques?
-- Quels sont les effectifs des races dans la zone dtude?
-- Quelles sont les distributions gographiques des races?
-- La survie des races est-elle menace ou existe-t-il des facteurs pouvant conduire
lrosion gntique?

38

Caractrisation phnotypique des ressources gntiques animales

Lquipe doit examiner si ltude envisage peut atteindre ses objectifs et par quels
moyens. Si ncessaire, des informations supplmentaires doivent tre recueillies et dautres
consultations menes auprs des parties prenantes. Si, compte tenu de ltat des connaissances actuelles et le montant des ressources disponibles pour entreprendre ltude, des
doutes subsistent sur la possibilit datteindre les objectifs fixs, il peut tre ncessaire de
revoir les objectifs.
Lquipe, en concertation avec les parties prenantes participantes, devrait dcider de la
nature de ltude de caractrisation - primaire ou avance.
Les tudes de caractrisation primaires impliquent deffectuer des visites uniques
dans les zones dtude cibles. Laccent est mis sur la collecte de donnes descriptives sur
les races et leurs milieux de production et toute autre information utile la gestion de ces
races.
Les tudes de caractrisation avance impliquent des visites rptes et la collecte
de donnes longitudinales. Laccent est mis sur lvaluation dtaille des caractres de
production et dadaptation afin de fournir des informations factuelles plus compltes pour
la gestion des ressources zoogntiques, en particulier pour la prise de dcisions sur le
dveloppement et/ou la conservation de la race.
Si les travaux de caractrisation primaire doivent tre suivis dune valuation longitudinale approfondie, alors lensemble de ltude peut tre organis en deux phases: la phase I
portant sur la caractrisation primaire et la phase II sur la caractrisation avance.

Section C

Collecte de donnes pour la


caractrisation primaire

41

Collecte de donnes pour


la caractrisation primaire
DVELOPPER LE CADRE DCHANTILLONNAGE
Dans les tudes de caractrisation phnotypique primaire et avance, si la zone d'tude
est trop grande pour dnombrer l'ensemble de la population animale cible, il sera lors
ncessaire d'chantillonner un sous-ensemble reprsentatif de la population. Dans les
tudes de caractrisation primaire, la rpartition gographique des populations devra tre
dtermine dans le cadre de l'tude, tandis que dans les tudes avances on utilise les
informations dj disponibles sur la rpartition des populations cibles pour laborer la
base dchantillonnage.
Comme dcrit dans la section A, la caractrisation phnotypique consiste autant documenter la plage de variation des caractres et les caractristiques uniques dune race qu
calculer les moyennes au niveau de la population. Par consquent, il ne faut pas que les
petites races soient tenues lcart de l'tude en raison dun chantillonnage mal cadr.
Quatre niveaux d'chantillonnage peuvent tre ncessaires dans une tude de caractrisation phnotypique:
la rgion (s'il y a lieu, par exemple, dans une tude de caractrisation concernant
lensemble du pays);
les sites d'tude ou les communauts au sein de la rgion vise par l'tude;
les mnages levant les espces cibles dans les sites d'tudes ou les communauts
choisies;
les animaux levs par les mnages de l'chantillon.
Les petites communauts isoles peuvent lever des ressources zoogntiques uniques.
Ces animaux doivent tre inclus dans la collecte des donnes, car ils peuvent fournir des
aperus historiques uniques de la gestion des ressources zoogntiques (par exemple Wuletaw et al., 2008). En outre, pour des raisons culturelles, religieuses ou socio-conomiques,
seules certaines sous-sections des communauts cibles lvent parfois des populations de
ressources zoogntiques particulires. Ces populations peuvent tre exclues de ltude si
leurs liens avec des groupes sociaux particuliers nont pas t identifis (par exemple travers les groupes de discussions) et pris en compte dans l'chantillonnage.
La diversit gntique des ressources zoogntiques dans les communauts traditionnelles est associe aux caractristiques biophysiques, socio-conomiques et de gestion du
milieu de production (par exemple LPPS et Khler-Rollefson, 2005). Ces facteurs doivent
tre considrs lors de l'laboration de la trame de lchantillonnage pour l'identification
des races et les tudes de caractrisation.
Dans les situations o la population cible par l'tude est rpartie dans diffrentes zones
agro-cologiques, parmi divers groupes ethniques, avec des paramtres socioculturels

Caractrisation phnotypique des ressources gntiques animales

42

contrasts ou travers diffrentes limites administratives, il peut savrer ncessaire dinclure ces critres dans la la dfinition du cadre dchantillonnage. Ils peuvent tre utiliss
pour diviser la zone d'tude en sous-units plus homognes et grables afin dobtenir un
chantillonnage plus efficace (par exemple Rowlands et al., 2003; Ayalew et Rowlands,
2004). L'quipe doit consulter un expert en statistique lors de l'laboration du plan dchantillonnage, surtout lorsque la zone d'tude ou la population cibles sont grandes.
Au niveau des mnages, la participation des membres de la famille dans la gestion des
ressources zoogntiques et leur connaissance de ces ressources sont susceptibles de varier
selon le sexe, l'ge ou le statut social. Il faut essayer de recueillir des donnes sur les ressources zoogntiques auprs des individus qui sont impliqus dans l'levage.
Pour identifier correctement une race, ce qui importe, c'est le nombre d'animaux mesurs, plutt que le nombre de troupeaux partir desquels les mesures ont t prises. En
revanche, le mnage tant l'unit de mesure pour analyser de nombreux aspects du milieu de production, il faut inclure le plus grand nombre de mnages possible dans ltude.
Cependant, les ressources pour les tudes de caractrisation phnotypique sont toujours
limites, et lquipe devra trouver un compromis entre le nombre de mnages visits et le
nombre d'animaux mesurs dans chaque mnage.
Pour collecter les donnes phnotypiques, il n'est pas ncessaire d'enregistrer les variables morphologiques chez tous les animaux. Il est important de se concentrer uniquement sur les animaux adultes/matures. Les jeunes animaux peuvent ne pas avoir acquis les
caractristiques qui sont typiques chez les animaux adultes. Toutefois, le prlvement des
mesures sur les jeunes animaux peut tre ncessaire pour valuer et comparer les performances de croissance (voir ci-dessous).
La taille approprie de lchantillon danimaux sur chaque site d'tude dpend de la
prcision requise et de la variabilit de la population de l'chantillon. Les coefficients de variation des mensurations des animaux adultes dans les populations d'levage traditionnelles
se situent souvent entre 10 et 30 pour cent. Pour obtenir une signification statistique (au
seuil de 5 pour cent), 100 300 femelles adultes et environ 30 mles adultes de chaque
site d'chantillonnage doivent tre inclus dans ltude. En d'autres termes, si l'intervalle de
confiance souhait est de 10 units pour un niveau de signification de 5 pour cent, la taille
de l'chantillon cible devrait tre d'environ 100 animaux adultes1.
Dans toutes les espces d'animaux d'levage, le nombre de mles adultes reproducteurs
est toujours trs limit. Laccent sera ainsi port sur les femelles matures, en particulier dans
les tudes didentification de race. Les mles seront inclus dans les tudes de description
de la race dans le cas de dimorphisme sexuel connu. De mme, ils seront inclus dans les
tudes de caractrisation gntique. Dans les populations traditionnelles, par exemple les
bovins et les petits ruminants en Afrique sub-saharienne, les femelles adultes constituent
gnralement environ 40 pour cent des animaux du troupeau. Pour identifier et chantillonner ces femelles adultes, il pourra tre ncessaire de combiner les informations fournies
par les leveurs avec les informations obtenues par l'examen de la denture des animaux
(voir encadr 8).
1

Voir http://www.gmi-mr.com/solutions/sample-size-calculator.php

Collecte de donnes pour la caractrisation primaire

ENCADR 8

Estimation de l'ge des moutons et des chvres partir de leur denture


Dans les populations d'levage traditionnelles, dans les zones pastorales par exemple,
lexamen de la denture des animaux est essentiel pour identifier les femelles adultes, calculer la pyramide des ges, valuer la proportion relative des sexes et, le cas chant, comparer les courbes de croissance gnralises. Les modles naturels d'ruption des incisives
dciduales et permanentes chez les moutons et les chvres sont fortement lis l'ge des
animaux et la qualit du fourrage (FAO, 1991). Les huit classes dentaires habituelles (voir
annexe 6) sont trop larges pour estimer l'ge des animaux avec une prcision suffisante,
en particulier deux stades de maturit le premier entre lruption de la quatrime paire
de dents de lait et la premire paire dincisives permanentes, et le deuxime lorsque la
denture est complte. Six classes supplmentaires ont t prsentes et testes dans plusieurs tudes en Ethiopie (FARM Africa et ILRI, 1996) et malgr les biais imputables lobservateur, elles se sont avres trs utiles pour obtenir des classes d'ge plus comparables.

Notez que les chiffres ci-dessus sont cits titre indicatif; l'quipe doit solliciter les conseils
techniques spcifiques d'un statisticien si elle ne possde pas elle-mme l'expertise adquate.
Lencadr 9 prsente une mthode gnrique pour dterminer la taille de l'chantillon.

PRPARER LQUIPEMENT ET LES MTHODES DE COLLECTE DE DONNES


Une combinaison de donnes quantitatives et qualitatives doit tre prleve, en format
simplifi, sur les animaux de l'chantillon, les leveurs et le milieu de production. L'quipe
devra prparer le matriel et les outils pour prendre les mensurations des animaux, les
questionnaires pour les entretiens et les guides pour les groupes de discussions et les
autres entretiens informels. Les annexes 1 5 exposent les grandes lignes qui peuvent tre
adaptes, si ncessaire, pour rpondre aux besoins spcifiques de l'tude. Si l'tude comprend des activits de caractrisation gntique molculaire, les outils et les protocoles de
prlvement sanguins ou tissulaires devront tre prpars.

Lquipement
Malgr lutilisation dappareils de mesure standardiss, une certaine subjectivit persiste
lorsquon prend des mesures quantitatives du corps de l'animal. De mme, la collecte de
donnes sur les caractres qualitatifs ou catgoriels peut tre fausse par des incohrences
et des erreurs de jugement de la part de l'observateur. La liste du matriel et des outils prsente ci-dessous fournit galement des conseils sur la faon de rsoudre ces problmes.
Pour la collecte des donnes quantitatives, les instruments suivants peuvent tre ncessaires:
Les rubans de mesure sont utiliss pour les mesures corporelles linaires comme la
longueur du corps, le tour de la poitrine et la longueur de la corne. Ils peuvent tre
en tissu ou en plastique. Les rubans en tissu sont prfrables au plastique, car ils sont
moins affects par les variations de temprature.

43

Caractrisation phnotypique des ressources gntiques animales

44

ENCADR 9

Exemple simple pour dterminer la taille de l'chantillon


Au moins trois facteurs dterminent la taille de l'chantillon pour effectuer un chantillonnage alatoire simple:
1. La marge d'erreur (appele aussi intervalle de confiance): qui mesure la prcision
avec laquelle une estimation faite partir d'un seul chantillon se rapproche de la
valeur de la population. La marge d'erreur (par exemple + ou - 5 pour cent), est troitement lie la taille de l'chantillon, et diminue mesure que la taille de l'chantillon augmente. Cela dpend de la prcision ncessaire pour faire des estimations
de la population partir de l'chantillon.
2. Le niveau de confiance: qui correspond la probabilit quun paramtre de la population se situe dans une marge d'erreur donne. Le niveau de confiance est aussi troitement li la taille de l'chantillon, et augmente mesure que la taille de l'chantillon
augmente. En rgle gnrale, le niveau de confiance est de 95 pour cent.
3. La proportion (ou le pourcentage) d'un chantillon qui choisira une rponse donne
la question dun sondage: qui est gnralement inconnue, mais elle doit tre estime car elle est ncessaire pour calculer la taille de l'chantillon. La proportion de 50
pour cent est la plus couramment utilise car elle est considre comme l'estimation
la plus conservatrice.
La formule pour calculer la taille de l'chantillon, dans le cadre d'un chantillonnage alatoire simple, est alors:

n=

( mz ) p(1 p)
2

o z est la valeur critique de z (par exemple 1,96 pour un niveau de confiance de


95 pour cent); m est la marge d'erreur (par exemple 0,05 = + ou - 5 pour cent); et p
est la valeur estime de la proportion de l'chantillon qui ragira dune faon donne une question de l'enqute (par exemple, 0,50 pour 50 pour cent).
En utilisant les valeurs ci-dessus, et sans utiliser le facteur de correction pour une
population finie (voir ci-dessous), la taille de l'chantillon est:

n=

0.5(1 0.5) = (39.2) (0.25) = 1536.64(0.25) = 384


( 1.96
0.05 )
2

Le facteur de correction pour une population finie (CPF) est couramment utilis
dans le calcul de la taille des chantillons dans le cas d'chantillonnages alatoires
simples. Il a trs peu d'effet sur la taille de l'chantillon lorsque la taille de lchantillon
est petite par rapport la population, mais il est important d'appliquer le CPF lorsque
l'chantillon a une grande taille (10 pour cent ou plus) par rapport la population.
(cont.)

Collecte de donnes pour la caractrisation primaire

L'quation de la taille de l'chantillon pour n (nouvelle taille de l'chantillon) lorsque


le facteur CPF est pris en compte est:

n' = n
1+ n
N

o n est la taille de l'chantillon tablie sur les calculs prcdents et N est l'effectif
de la population.
Cette formule est prsente seulement titre indicatif et doit tre adapte par le
statisticien de l'quipe.
En appliquant cette formule, et pour N = 16 450, la nouvelle taille de l'chantillon est:

n' =

384
384
=
384
1.023
1+
16 450

= 375.37

Des exemples de calculateurs de la taille de lchantillon sont disponibles sur:


http://www.raosoft.com/samplesize.html;
http://surveysystem.com/sscalc.htm#ssneeded;
http://calculators.stat.ucla.edu/

Source: Adapt de Cochran (1977) et http://grants.nih.gov/grants/funding/modular/eval/Sample_MGAP.doc


(consult en mars 2012).

Les rgles coulissantes (rgles mtalliques ou en bois munies de barres coulissantes) sont prfrable aux rubans pour mesurer les hauteurs verticales (par exemple
la hauteur au garrot) afin dviter que la mesure de la ligne suprieure ne soit trop
subjective.
Les compas sont utiliss pour mesurer les distances entre deux cts symtriquement opposs d'un animal ou d'un objet (par exemple la largeur du bassin ou le
diamtre de luf). Les compas mtalliques sont moins sujets l'erreur de mesure
que ne le sont les rubans de mesure. Les pointes des compas peuvent tre ajustes
pour s'adapter aux points devant tre mesurs et la distance se lit soit directement
sur la graduation des compas soit en mesurant la distance entre les extrmits des
compas avec un autre outil de mesure.
Les altimtres sont utiliss pour enregistrer l'altitude des sites d'tude.
Les boussoles sont utilises dans des exercices de cartographie et pour orienter les
enquteurs lorsquils visitent de nouveaux sites.

45

46

Caractrisation phnotypique des ressources gntiques animales

Balances les dispositifs mobiles pour mesurer le poids des moutons, des chvres
et des poulets sont composs d'un trpied, dun peson ressort et dune sangle
en toile suspendue. Il est souvent difficile de peser les animaux plus grands sur le
terrain en raison du manque de ponts-bascules ou de plateaux de balance mobiles.
Dans les tudes de caractrisation primaire sur les bovins ou les porcs levs dans
des communauts trs disperses, des mthodes indirectes destimation du poids
corporel peuvent tre envisages. Ces options comprennent lutilisation dquations de rgression du poids corporel sur la longueur du corps et le tour de poitrine, qui sont en gnral fortement corrls au poids du corps. Ces quations sont
toutefois spcifiques de la population, c'est--dire qu'elles peuvent tre dveloppes lors dune premire tude sur la population cible et tre ensuite appliques
d'autres tudes sur la mme population (Ribeiro et al., 2004), condition que
leurs niveaux de prcision soient connus. Les ponts-bascules et les pesons ressort
doivent toujours tre talonns avant de commencer la collecte des donnes. Dans
le cas des pesons ressort, le poids des sangles doit tre pris en compte lors de
la lecture des mesures du poids corporel, en soustrayant le poids de la sangle de
portage de la lecture du poids total ou en ajustant le zro de la graduation en
posant la sangle sur la balance.
Pour la collecte de donnes sur les caractristiques qualitatives ou catgorielles, les instruments dcrits ci-dessous peuvent tre ncessaires:
Fiches codes et guides pour les enquteurs l'quipe doit laborer des codes
de donnes pour les variables catgorielles, idalement l'aide d'illustrations personnalises.
Tableaux de couleurs ils sont essentiels pour enregistrer uniformment les caractres tels que le type et les motifs de la couleur de la robe, la couleur du plumage,
la couleur des pattes et la couleur de la peau.
Guide illustrs de la conformation corporelle l'quipe doit tablir des normes
vrifiables pour tous les indicateurs qualitatifs de la taille et de la forme des diffrentes parties du corps. Par exemple, la mthode de classification des profils de
tte - droits, concaves, convexes ou sensiblement convexes - doit tre claire et sans
ambigut. Il en est de mme pour classer lorientation de l'oreille - dresse, latrale,
tombante, pendante ou semi-pendante.
Les autres quipements qui seront ncessaires sur le terrain comprennent:
le matriel pour prlever du sang, des poils avec leurs racines ou des tissus (si du
matriel doit tre collect pour une caractrisation gntique molculaire);
des appareils photo et des camras numriques pour prendre des images des animaux et enregistrer des donnes qualitatives subjectives (par exemple, la forme,
l'aspect et la couleur) a des fins de comparaison et de standardisation;
un appareil GPS;
du matriel pour la prise de note et des sacs;
du matriel de communication;
des moyens de transport (vhicule de terrain, motocyclettes, vlos, etc.).

Collecte de donnes pour la caractrisation primaire

Les mthodes pour obtenir des mesures indicatives des caractres de


production
La caractrisation phnotypique primaire rvle trs peu dinformations sur les principaux
caractres de production tels que les taux de croissance, la production laitire, la production
d'ufs, la production de laine ou la qualit de ces produits. L'valuation de ces caractres
ncessite des tudes plus approfondies. Des mthodes pertinentes sont dcrites dans la section D. Toutefois, il est possible de recueillir des informations indicatives sur ces caractres
dimportance conomique au cours des tudes de caractrisation primaire. Les exemples
suivants illustrent des mthodes qui peuvent tre utilises dans les petites exploitations.
La production laitire: demander aux leveurs, de prfrence aux membres du mnage chargs de la traite des animaux, d'identifier deux de leurs animaux laitiers qui
ont termin au moins une lactation: la vache qui a le plus rcemment termin sa lactation (en tant que vache prise au hasard) et la vache qui est connue pour tre la plus
productive. Demander ensuite aux leveurs de se rappeler de la dure de la lactation
de chacune de ses vaches, diviser la en trois trimestres, puis estimer le volume de la
production journalire moyenne pour chacun des trimestres. Les mesures de volume
utilises doivent tre comprhensibles pour les leveurs, comme la mesure en nombre
de tasses ou de calebasses par exemple, et seront ensuite converties en litres. Les
chiffres obtenus sont ensuite agrgs pour fournir des estimations plus ralistes de
la production laitire que celles obtenues par les estimations directes du total de la
production (par exemple, Stein et al., 2009). Voir aussi l'encadr 3.
Le taux de croissance des animaux (bovins, moutons, chvres, porcs, poulets) destins la production de viande: Tout d'abord demander aux leveurs d'identifier un
animal de boucherie qui est sur le point dtre vendu, puis enregistrer le poids et l'ge
estim (donn par le propritaire ou estim en fonction de la denture) de cet animal.
Choisir au hasard trois ou quatre autres animaux du mme sexe et avec un ge dcroissant. Peser les animaux et enregistrer leurs ges. Ces donnes peuvent tre utilises pour
calculer un taux de croissance moyen estim entre un ge prcoce et lge au poids de
vente des animaux commercialisables dans le troupeau slectionn. Cette mthode ne
fournit que des estimations assez grossires, mais peut donner une indication rapide du
gain de poids pendant la priode couverte. Si elle est applique de manire cohrente,
la mthode peut tre utilise pour comparer les taux de croissance entre les troupeaux.
Dans les cas o le poids corporel ne peut pas tre directement enregistr, des rubans
de mesure estimateurs du poids peuvent tre labors l'avance en se basant sur une
quation de rgression connue, par exemple, du poids du corps sur le tour de poitrine.
Le taux de reproduction et la frquence des naissances multiples chez les bovins,
moutons, chvres et porcs: Demander aux leveurs de se rappeler des pisodes de
parturition (nombre et type de naissances) de toutes les femelles slectionnes dans
l'tude. Cela permet destimer la taille moyenne des portes et la frquence des naissances multiples dans la population de l'chantillon. Si les animaux sont identifis par
leur origine (c.--d. ns sur place ou achets) et que leur ge a t estim, il est possible
d'estimer le nombre probable de parturitions pour un groupe d'ge donn, en fonction
du systme de production ou de la race (voir, par exemple, FARM-Africa et ILRI, 1996).

47

48

Caractrisation phnotypique des ressources gntiques animales

La production d'ufs: Une fois que le nombre de poules dans le troupeau slectionn a t dtermin et enregistr, demander aux leveurs de se rappeler du nombre
d'ufs pondus par les poules dans le troupeau au cours des trois derniers jours. Agrger les donnes au niveau des mnages et des villages pour obtenir une estimation
de: 1) la production d'ufs en moyenne pour la priode vise, et 2) la production
dune poule par jour, soit le nombre total d'ufs pondus par le troupeau durant trois
jours divis par les poules-jours couverts (la somme du nombre de poules dans le
troupeau sur chacun des trois jours).
S'ils sont considrs comme des priorits, les caractres spcifiques tels que ceux associs
la production de laine, de cachemire et de mohair peuvent tre tudis au cours des tudes
de caractrisation primaire, par exemple, en prenant des mesures directes de la qualit des
fibres (par exemple le pourcentage de laine et de poils), leur longueur, leur force et leur frisure.

Dcrire les milieux de production


Le travail sur le terrain men lors dune tude de caractrisation phnotypique est loccasion la fois de collecter directement des donnes sur les milieux de production des populations cibles et de recueillir des donnes sur leur rpartition gographique qui peuvent
tre par la suite relies des ensembles de donnes cartographies issus d'autres sources
(voir la section A).
La plupart des donnes lies la gestion des animaux et aux aspects socio-conomiques,
au commerce et aux aspects sexospcifiques du milieu de production doivent tre recueillies
directement sur le terrain. Cela peut se faire via des entretiens avec les leveurs ou d'autres personnes locales (individuellement ou en groupes) et par l'utilisation d'outils de collecte de donnes participatifs. Les donnes de base recueillir pour dcrire le milieu de production sont
numres sous la rubrique Gestion de lenvironnement en annexe 5. Ces dernires peuvent
tre compltes par des donnes supplmentaires sur la production et l'environnement que
les membres de lquipe estiment pertinentes pour rpondre aux objectifs de l'tude et fournir
une description dtaille des conditions dans lesquelles les animaux sont levs.
La prsence de maladies et de parasites est un autre aspect du milieu de production qui
ncessite de mener une enqute sur le terrain moins que des donnes pertinentes, issues
d'es tudes prcdemment menes sur la zone cible ne soient disponibles. Des cartes
mondiales haute rsolution de la distribution des maladies ne sont actuellement pas disponibles. Des conseils dtaills sur la faon d'enregistrer la charge de morbidit des maladies et des parasites au sein dun cheptel dpasse le champ d'application de ces directives.
Sil s'avre ncessaire de collecter des donnes sur cet aspect particulier du milieu de production, il faudra alors consulter des experts en pidmiologie classique et/ou participative.
Les donnes de terrain peuvent galement complter les donnes gorfrences sur
le sol et la vgtation (par exemple, pour enregistrer la nature du terrain substrat, pente,
etc. dans les zones spcifiques o les animaux pturent rellement plutt que dutiliser
les moyennes pour la rgion dans son ensemble). Ces caractristiques peuvent tre tudies grce des entretiens avec les populations locales, mais certains aspects du terrain
peuvent aussi tre directement observs et/ou mesurs par l'quipe, mme pendant les
visites uniques sur le terrain.

Collecte de donnes pour la caractrisation primaire

La plupart des donnes climatiques quantitatives (par exemple, les tempratures


moyennes, mesure en C, sur le long terme) sont impossibles recueillir au cours de la
phase de terrain d'une tude individuelle de caractrisation phnotypique. L'approche base sur la cartographie dcrite dans la section A est le seul moyen de dcrire ces aspects du
milieu de production. Cependant, il peut savrer utile de complter les donnes climatiques
gorfrences avec des donnes recueillies sur le terrain auprs des leveurs ou d'autres
acteurs locaux, pour obtenir par exemple des informations sur les aspects du climat qui ne
sont pas disponibles dans les bases de donnes gorfrences mondiales (par exemple les
chutes de neige et la couverture de neige - voir annexe 5). Les donnes obtenues lors des
entretiens peuvent galement donner des indications sur la manire dont les populations locales peroivent les volutions climatiques rcentes et leurs effets sur la production animale.

Prparer des questionnaires pour les entretiens individuels et en groupe


Les enquteurs peuvent rcolter de manire systmatique des donnes au moyen d'entretiens, laide de questionnaires directifs, semi-directifs et ouverts. Des entretiens peuvent
tre mens avec des individus ou des groupes d'individus slectionns. Outre les leveurs,
les entretiens individuels peuvent tre raliss avec des responsables gouvernementaux,
des fournisseurs de services, des commerants de btail, des dirigeants communautaires
ou des agents de dveloppement/vulgarisation. Des groupes de discussions peuvent tre
organiss avec les leveurs, les reprsentants de la communaut ou d'autres intervenants.
Les donnes gnres par les questionnaires peuvent inclure des descriptions des milieux
de production, des pratiques de gestion, l'origine historique et l'volution des populations
animales, et des donnes sur les perceptions des leveurs (ou d'autres personnes) concernant les ressources zoogntiques et leur gestion. Les descripteurs cls pour la gestion des
ressources zoogntiques et les caractristiques de la race sont numrs en annexe 5.
Ceux-ci peuvent tre complts ou adapts en fonction des circonstances de chacune des
tudes spcifiques.
La porte et la profondeur des questionnaires doivent correspondre aux exigences spcifiques de l'tude. Le temps et les ressources ncessaires pour la collecte et le traitement
des donnes peuvent tre considrables et l'accent devrait tre mis sur la collecte des seules
donnes ncessaires pour complter l'analyse et atteindre les objectifs de l'tude.
Lentretien oral se dfinit par l'interaction et le partage d'informations entre les intervieweurs et les personnes interroges sur une priode de temps limite. Le lieu et la date
peuvent limiter la participation de certains individus, groupes ou communauts. Des comptences en animation de groupe sont ncessaires pour grer les groupes de discussions.
Par exemple, les effets potentiels des structures sociales et la dynamique de groupe dans les
dbats participatifs doivent tre reconnus (LDG, 2003).

PRPARER LE PROTOCOLE DE COLLECTE DES DONNES


Pour assurer l'uniformit dans la collecte des donnes, l'quipe devra laborer un protocole
pour les agents recenseurs dtaillant le cadre dchantillonnage, l'quipement et les outils,
avec des instructions sur la faon d'utiliser les questionnaires, et prendre des mesures sur
les animaux slectionns. Le protocole peut s'appuyer sur le matriel prsent dans cette

49

50

Caractrisation phnotypique des ressources gntiques animales

section et dans les annexes, en ladaptant si ncessaire aux circonstances spcifiques de


l'tude. Le protocole peut tre utilis comme support lors de la formation des agents
recenseurs.
Les sources potentielles d'erreur systmatique dans la mesure et l'enregistrement des
donnes doivent tre plus particulirement soulignes. Tous les codes de donnes et les
acronymes doivent tre clairement dcrits dans le protocole. Ce protocole doit se pencher
sur le cas particulier o des types de donnes non initialement prvus doivent tre collects,
et insister sur le fait que les enquteurs ne doivent pas utiliser de nouveaux codes pour les
enregistrer, mais plutt recueillir autant d'informations explicatives que possible afin que
l'quipe soit, par la suite, en mesure de prendre une dcision approprie sur la faon de
coder les donnes en questions.

FORMER LES AGENTS RECENSEURS ET LEURS SUPERVISEURS


Il est extrmement important que les recenseurs et leurs superviseurs soient forms l'utilisation de l'ensemble des instruments de collecte de donnes. La formation devrait inclure
la fois des enseignements formels et des exercices pratiques. Elle doit permettre la comprhension commune du processus de collecte des donnes, deses rapports hirarchiques, et
de la manire de rpondre aux requtes qui mergent au cours de la collecte des donnes.
La formation devrait se poursuivre au cours des tests prliminaires et de l'tude pilote.
La formation doit tablir une communication efficace et de bonnes relations de travail
entre les membres spcialiss de lquipe d'tude (qui assurera la formation) et les agents
recenseurs et leurs superviseurs. Cela permettra aux agents recenseurs et leurs superviseurs dtre responsables et de sapproprier les donnes et les rsultats, et par consquent
de collecter les donnes avec une plus grande prcision. La communication entre les superviseurs et les agents recenseurs est galement trs importante. Une bonne communication
permettra d'assurer un soutien correct aux enquteurs quand ils en ont besoin et la supervision efficace de la collecte des donnes. Les superviseurs doivent tre forms :
Assurer la cohrence dans la collecte des donnes issues des entretiens et dans la
prise de mesures sur les animaux slectionns. Les mthodes de collecte de donnes
doivent tre aussi cohrentes que possible d'un recenseur l'autre et d'un milieu
de production l'autre.
Vrifier les donnes brutes dans les questionnaires et les autres formats de collecte
de donnes afin didentifier les erreurs videntes et les donnes manquantes. Des
instructions doivent tre fournies sur la faon de rsoudre ces erreurs, si ncessaire,
en remontant aux sources de donnes. Les vrifications doivent tre effectues ds
que possible aprs la collecte des donnes. Les questionnaires qui ont t vrifis
doivent ensuite tre signs la fois par les enquteurs et les superviseurs. Toutes ces
procdures doivent tre dfinies dans les protocoles de travail sur le terrain
Si l'tude ncessite de dployer plusieurs quipes sur le terrain, il est conseill, si les circonstances le permettent, de leur attribuer des membres en commun pour promouvoir
l'homognit dans la collecte des donnes.

Collecte de donnes pour la caractrisation primaire

EFFECTUER DES TESTS PILOTES ET PRLIMINAIRES SUR LES INSTRUMENTS


DE L'TUDE
Le protocole et tous les instruments de collecte de donnes doivent tre pralablement
tests dans quelques sites choisis au sein de la zone d'tude pour:
minimiser les variations entre les agents recenseurs;
identifier les incohrences et les questions sensibles dans le questionnaire;
dterminer si chaque question est bien formule et comprise par les agents recenseurs et les personnes interroges;
dterminer si toutes les questions sont pertinentes et si des questions supplmentaires sont ncessaires;
tester la disposition et l'ordre des questions dans le questionnaire et le systme de
codage;
dterminer la dure prvue de chaque entretien et donc de l'ensemble de l'tude (si
les entretiens sont trop longs, les personnes interroges peuvent sen dsintresser,
ce qui aura une incidence sur la qualit des rponses).
Par la suite, une tude pilote complte doit tre mene dans la zone d'tude. Cela permettra aux aspects suivants du travail sur le terrain dtre valus:
le rythme de la collecte et de la vrification des donnes;
les interactions avec les leveurs;
les relations de supervision au sein de l'quipe.
Les leons tires de l'tude pilote permettront une planification plus raliste de la collecte des donnes proprement dite: en particulier le nombre d'enquteurs et de superviseurs ncessaires, le type et la quantit de services de soutien ncessaires, le calendrier et
le budget. Les donnes recueillies lors de l'tude pilote doivent tre utilises pour affiner le
codage des donnes nominales, textuelles et, le cas chant, des donnes numriques pertinentes en les divisant en catgories distinctes prcisment dfinies pouvant tre utilises
pour l'analyse.

ORGANISER LA LOGISTIQUE DES TRAVAUX SUR LE TERRAIN


Au cours de la finalisation des prparatifs techniques, lquipe doit simultanment commencer prparer lagenda et la logistique du travail sur le terrain, en collaboration avec
les enquteurs et les superviseurs. Avant de dcider des dates du travail de terrain, les
questions suivantes doivent tre poses:
Est-ce que la saison de l'anne (fortes pluies, scheresse, etc.) pourrait affecter la
collecte de donnes dans des sites particuliers de ltude ou travers toute la zone
slectionne?
Les pics dactivits agricoles (prparation du sol, rcolte, etc.) affectent-ils la collecte
de donnes?
Les vnements socioculturels (par exemple, les ftes religieuses) peuvent-ils affecter
la collecte des donnes?
Les superviseurs et les membres de lquipe doivent visiter les sites de ltude pour informer officiellement les autorits locales et les communauts slectionnes sur la collecte
de donnes prvue. La date, l'heure et le lieu des visites sur le terrain doivent tre convenus

51

52

Caractrisation phnotypique des ressources gntiques animales

avec les reprsentants de la communaut. Il faut pour cela se concerter avec les chefs de
village, les autorits locales ou les prestataires de services (par exemple les vtrinaires)
pour dterminer les moments les plus pratiques pour la collecte des donnes. Les parties
prenantes doivent galement tre directement impliques dans l'organisation des activits
sur le terrain.
Des problmes logistiques comme la rservation de vhicules, l'achat de consommables
(carburant, papier, piles, etc.), les autorisations de voyage et l'hbergement des quipes sur
le terrain doivent tre rgls l'avance.

FINALISER LE PLAN DE COLLECTE DES DONNES


Le plan final pour la collecte des donnes doit inclure le plan dchantillonnage et les dtails
de tous les instruments, guides et protocoles de collecte de donnes, ainsi que le calendrier
des travaux sur le terrain. Le plan devrait tre accompagn d'un rapport sur le budget, qui
prsente toutes les questions logistiques et les besoins en ressources humaines.

Section D

Collecte de donnes
pour la caractrisation avance

55

Collecte de donnes
pour la caractrisation avance

Comme il est expliqu dans les sections A et B, la caractrisation avance est le terme
utilis dans ces directives pour dcrire les aspects de la caractrisation phnotypique qui
ne peuvent tre traits en une seule visite sur le site dtude, c'est dire qui ncessitent la
prise de mesures rptes sur une priode de temps prolonge. Une planification efficace
de la caractrisation avance, y compris la dfinition des objectifs spcifiques et l'tendue
de l'tude, dpend de la disponibilit des donnes de base sur les races cibles et leurs
milieux de production, qui sont issues des phases prcdentes de l'tude ou des rsultats
de prcdentes tudes dcrites dans la littrature.
Cette section et la prcdente dcrivent toutes deux la collecte des donnes, et se
recoupent donc invitablement. Cependant, elles sont aussi complmentaires, notamment
en ce qui concerne les enqutes rptes. Par consquent, les lecteurs sont incits lire
ces deux sections mme sils sont principalement intresss par la caractrisation avance.

EXAMINER LE CADRE ET LES OBJECTIFS


L'quipe d'tude doit identifier les caractres particuliers cibler, ainsi que les donnes sur
le milieu de production qui doivent tre enregistres. Cela aidera dfinir le cadre du travail
et la dmarche suivre. Les aspects suivants de l'tude doivent tre examins ce stade:
dterminer l'effectif et la rpartition gographique de la population de base partir
de laquelle des chantillons reprsentatifs de troupeaux doivent tre choisis;
fixer la priode de l'tude, y compris la planification, la collecte de donnes, lanalyse
et le compte-rendu des donnes;
dcider si les donnes doivent tre collectes dans le milieu de production habituel
des animaux (c.--d. en ferme) ou dans une station de recherche o les variables cls
du milieu peuvent tre contrles.

valuation de la performance en ferme


Lvaluation des caractres de production et d'adaptation dans le milieu de production
normal des animaux reflte les vritables niveaux de performance dans la population de
base. Dans ces tudes, des troupeaux reprsentatifs sont slectionns afin de pratiquer une
surveillance continue de ces caractres sur une priode suffisamment longue pour pouvoir
estimer les moyennes et la variance des performance, et documenter les caractristiques du
milieu de production qui influent sur les niveaux de performance. Selon la disponibilit des
ressources et le niveau de dtail ncessaire pour atteindre les objectifs de l'tude, l'valuation en ferme peut tre organise comme un ensemble de visites rptes dans les exploitations d'levage chantillonnes, ou comme un processus de suivi complet impliquant

56

Caractrisation phnotypique des ressources gntiques animales

des mesures rptes des performances dans les populations animales cibles pendant une
priode de temps dfinie, couvrant gnralement plusieurs cycles de production complets.
Les deux approches ont pour objectif de gnrer des donnes de performance sur la production principale et les caractres d'adaptation.
Les tudes de performance en ferme peuvent tre conues pour estimer les paramtres
gntiques dans le cadre de programmes d'amlioration gntique (par exemple, le schma de slection noyau ouvert chez le mouton Djallonk en Cte d'Ivoire: Yapi-Gnaore et
al., 1997a,b), ou pour surveiller la productivit globale du troupeau au niveau du site, ainsi
que les impacts des interventions spcifiques (par exemple Agyemang et al., 1997; Osaer
et al., 2000). Si elles sont menes sur des priodes suffisamment longues, de telles tudes
permettent de surveiller la structure des troupeaux et les volutions de la population et
didentifier les causes et les facteurs associs.

L'valuation des performances en station


Les tudes en station permettent d'valuer les performances de la race et son potentiel
dans un milieu de production relativement bien dfini et contrl. Cela permet de mesurer
plus prcisment la performance individuelle, y compris la capacit rpondre des amliorations de la conduite de l'levage, et ventuellement des niveaux particuliers de stress
(charge parasitaire, privation d'eau, mauvaise qualit de l'alimentation, etc.). Ces tudes
en station ont pour principal avantage la possibilit de comparer en mme temps plusieurs races dans diffrents environnements dlevage, et de permettre ainsi dvaluer les
interactions entre le gnotype et l'environnement. L'valuation en station peut galement
ouvrir la voie l'tablissement d'une population-noyau et contribuer la conservation
de la population caractrise et son amlioration gntique long terme. Ces tudes
sont limites par le fait que ces animaux peuvent ne pas tre adapts l'environnement
contrl et que certains caractres, comme le comportement au pturage et les rponses
aux stress environnementaux observs dans les milieux de production habituels de ces
animaux, ne peuvent pas sexprimer et tre mesurs. Ainsi, les avantages spcifiques
d'une population locale peuvent ne pas tre reconnus, et les conclusions tires de l'tude
seront trompeuses car elles ne tiennent pas compte des interactions entre le gnotype et
l'environnement.

Dvelopper le cadre de lchantillonnage


Une autre srie d'outils statistiques diffrente de celle utilise pour la caractrisation primaire peut tre utilise pour identifier les populations slectionnes pour la caractrisation
phnotypique avance. Bien quil soit toujours important de slectionner des populations et
des fermes/exploitations agricoles reprsentatives, les circonstances locales peuvent dicter
deffectuer un chantillonnage raisonn pour slectionner les populations pour la caractrisation avance. Ces contraintes peuvent inclure:
la rticence des leveurs permettre la collecte de donnes rptes sur leurs animaux;
des contraintes naturelles et dorigine humaine pour accder la zone d'tude et
effectuer des visites rptes.

Collecte de donnes pour la caractrisation avance

De mme, pour les valuations en station, un chantillonnage raisonn plutt qualatoire peut tre ncessaire lorsque:
la slection alatoire des animaux de lexprimentation est limite par un manque
d'informations de base sur la population;
les leveurs ne sont pas disposs se sparer de leurs animaux pour l'tude;
seuls les animaux qui rpondent certaines exigences minimales peuvent tre slectionns pour l'tude.

PRPARER LES OUTILS POUR LA COLLECTE DE DONNES


Les tudes de caractrisation phnotypique avance, que ce soit en ferme ou en station,
ncessitent de collecter, dans des formats simplifis, une combinaison de donnes quantitatives et qualitatives sur une assez longue priode de temps. Il est important de s'assurer
que l'quipement et les outils ncessaires sont prpars et restent disponibles tout au long
de l'tude. La caractrisation avance concerne principalement la collecte de donnes sur
les caractres de production et d'adaptation, mais les caractristiques physiques peuvent
galement tre mesures. Pour cette dernire catgorie, les mesures et des outils pertinents
sont dcrits dans la section C.

L'identification des animaux


Une des principales composantes de la collecte rpte de donnes consiste identifier
correctement chaque animal afin de s'assurer que les donnes recueillies au fil du temps
sont systmatiquement attribues aux bons animaux dans l'analyse des donnes. Tous les
animaux de l'unit exprimentale (les troupeaux de la station de recherche, de lexploitation
ou du village) doivent tre identifis en marquant les deux oreilles. Si un des leveurs refuse
de mettre des boucles sur les oreilles de ses animaux, l'quipe d'tude peut soit slectionner un autre leveur soit essayer de le convaincre de cooprer. Dans ce dernier cas, des
conseils prcis doivent tre recherchs auprs d'un sociologue si l'quipe ne possde pas
dexpertise dans ce domaine. Lorsque les marques auriculaires ne peuvent pas tre utilises,
d'autres mthodes d'identification doivent tre recherches. Dans les communauts pastorales, par exemple, les leveurs donnent des noms chaque animal. Ces dnominations
associes aux caractristiques externes distinctes des animaux peuvent tre utilises pour
identifier les animaux.

Outils et mesures des caractres


Des outils et des formats de collecte de donnes adapts devront tre dvelopps pour
les caractres spcifiques et les variables de contrle cibles par l'tude de caractrisation
avance. Certains caractres et variables de contrle ncessitent un quipement et des
enregistreurs de donnes spcialiss. Ces besoins spcifiques doivent tre identifis et leurs
cots valus au cours de la phase de planification de l'tude.
En plus de recueillir des donnes sur la production laitire, la production de viande, la
production d'ufs, la reproduction, ladaptation, etc., au sein de l'unit exprimentale, le
pedigree de chaque animal doit tre enregistr et des chantillons de matriel biologique
prlevs pour tre analyss en laboratoire. Le cot et la complexit des systmes de collecte

57

58

Caractrisation phnotypique des ressources gntiques animales

de donnes varient en fonction du type de caractres cibls et des mthodes utilises pour
la mesure et l'enregistrement. En gnral, ils augmentent avec le niveau de prcision et
d'automatisation ncessaire et disponible. Cette section se concentre sur des techniques
simples et peu coteuses, mais qui ne compromettront pas les rsultats de l'tude.
Malgr lutilisation dappareils de mesure standardiss, une certaine subjectivit persiste
dans la prise de mesures. Cette prsentation des caractres et des outils comporte des
recommandations qui peuvent aider rsoudre ces problmes:
La production de lait: lensemble ou une partie des animaux en lactation doivent tre
identifis pour pouvoir effectuer l'enregistrement hebdomadaire de tous les volumes
de traite (matin et soir), un jour fixe de la semaine et pour une priode de temps
dfinie (par exemple pendant un mois ou toute la priode de lactation). Les outils
suivants sont ncessaires: du matriel de traite aux normes sanitaire; une prouvette
ou une carafe gradues pour mesurer le volume de lait ou une balance numrique
pour mesurer le poids du lait; et des feuilles d'enregistrement des donnes.
La qualit du lait: les chantillons de lait peuvent tre analyss sur place ou envoys
un laboratoire pour dterminer la teneur en matire grasse et en protines, et si
ncessaire le nombre de cellules somatiques. Le pourcentage de matires grasses
dans le lait peut tre dtaill en termes de composition en acides gras et le pourcentage de protines en fonction des diffrents types de casines. Des bouteilles
de prlvement de lait standardises et une glacire sont ncessaires pour prlever
des chantillons de lait frais pour l'analyse chimique en laboratoire. De mme, des
trousses d'chantillonnage sont ncessaires pour prlever des chantillons de lait frais
et contrler sa qualit microbiologique.
Le taux ou la courbe de croissance: ils peuvent tre dtermins partir du poids vif
corporel diffrents ges. Le poids corporel des animaux de boucherie en croissance
doit tre mesur et enregistr rgulirement (tous les mois) pendant une priode de
temps dtermine (trois ou quatre mois conscutifs). En combinant ces rsultats avec
les mesures de la consommation alimentaire sur un chantillon d'animaux pour un
nombre dtermin de jours (par exemple trois semaines pour les volailles et beaucoup plus longtemps pour les ruminants), on peut calculer lefficacit de conversion
alimentaire pour la priode d'observation. La mesure individuelle de la consommation
alimentaire ncessite disoler chaque animal (par exemple dans un box) et ne peut
tre ralise quen station et pour estimer les paramtres gntiques. La croissance
peut tre enregistre laide de ponts-bascules mobiles, de pesons ressort ou de
rubans de mesure du poids corporel.
La qualit des carcasses et de la viande: les mesures du rendement labattage,
du rapport os/viande ou de la teneur en matire grasse ncessitent dabattre les animaux, et ne sont ralisables quen station et pour les petits animaux. Une valuation
indirecte peut tre obtenue en prenant des mesures morphologiques (voir section
C) qui fournissent des informations sur la conformation de l'animal. Des techniques
de pointe, telles que la rsonance magntique, des radio-isotopes, la tomographie,
la radiographie et l'chographie, peuvent tre utilises pour valuer la composition
et la qualit de la carcasse (la quantit et la distribution des tissus spcifiques). Par

Collecte de donnes pour la caractrisation avance

exemple, pour mesurer lpaisseur du lard dorsal chez les porcs et les autres animaux
levs pour la production de viande, un chographe spcialis, largement utilis
des fins commerciales, peut fournir des mesures prcises. Les caractres qualitatifs de
la viande (par exemple, tendret, jutosit) sont rarement signals dans les tudes de
caractrisation (en particulier chez les animaux autres que les poulets), mais peuvent
jouer un rle important dans la valorisation des races locales.
La production d'ufs: le nombre d'ufs pondus et le taux de mortalit devraient tre
enregistrs quotidiennement pendant une priode de temps limite (trois mois). En
station, la priode d'enregistrement peut tre beaucoup plus longue (par exemple un
an). Les poules doivent tre peses au dbut et la fin de la priode de ponte. En
le combinant avec des mesures de la consommation alimentaire sur un chantillon
de poules pour un nombre dtermin de jours (par exemple trois semaines), l'enregistrement de la production d'ufs permet de mesurer l'efficacit de conversion des
aliments pour la priode d'observation.
Qualit des ufs: deux chantillons d'ufs (par exemple 10 20 ufs) doivent tre
prlevs au dbut et la fin de la priode de ponte. Les ufs doivent tre pess
pour dterminer leur poids moyen. Les mmes chantillons peuvent tre utiliss pour
estimer la quantit de coquille, soit directement (par pese de la coquille aprs lavoir
spare de l'albumen et du jaune) ou indirectement en fonction de la densit des
ufs (en utilisant diffrents rcipients deau avec des niveaux croissants de salinit).
La solidit de la coquille peut tre mesure directement (mesure de la force de fracture) ou indirectement (mesure de dformation). Pour mesurer la qualit interne de
l'uf, la teneur en matire sche, les poids du vitellus et de l'albumen ou la hauteur
de lalbumen peuvent tre mesurs sur les mmes chantillons d'ufs. Beaucoup de
ces mesures (par exemple le poids de luf, sa densit, le ratio vitellus sur albumen)
peuvent tre prleves l'aide de dispositifs simples, mais d'autres (dformation,
force de fracture, teneur en matire sche et hauteur de l'albumen) ncessitent des
outils plus sophistiqus et peuvent ne pas tre ncessaires dans toutes les tudes.
La production de laine: elle ne peut tre mesure correctement que pendant la saison de
tonte, qui se produit gnralement au printemps. Le calendrier de la collecte des donnes doit tre planifi en fonction. Toute la laine de tonte doit tre pese pour connatre
le poids de la laine en suint. La toison doit ensuite tre minutieusement lave (dgraisse) et pese pour dterminer le rendement en laine lave fond. Pour effectuer de
telles mesures il faut se munir de tondeuses manuelles ou motorises et dune balance.
La qualit de la laine: la qualit de la laine est exprime en termes de longueur, de
diamtre, de force, de frisure et de couleur de la fibre. Tout cela ncessite du matriel
de mesure prcis, et ces donnes ne peuvent par consquent pas tre collectes sur
le terrain. Des chantillons de laine peuvent tre prlevs durant la tonte pour tre
analyss en laboratoire. Les outils indispensables sur le terrain comprennent les tondeuses et les rcipients dchantillonnage.
La reproduction: en ce qui concerne les moutons, les chvres et les porcs, les mises
bas et les cas de mortalit des jeunes animaux peuvent tre surveills pendant une
priode de temps dfinie (par exemple, quelques mois). Dans les rgions tempres

59

60

Caractrisation phnotypique des ressources gntiques animales

et subtropicales o la reproduction a souvent un caractre saisonnier, des priodes


d'enregistrement plus cibles peuvent tre ncessaires. Le nombre de naissances
enregistres au cours de la priode d'observation peut tre reli au nombre total
de femelles reproductrices dans le troupeau afin destimer le taux de reproduction
au cours de cette priode. Pour les bovins, la dure de la lactation et l'intervalle de
parturition doivent galement tre enregistrs.
Ladaptation: Les caractres spcifiques d'adaptation comme la tolrance la chaleur
peuvent tre mesurs par la temprature corporelle, mais il ne sera pas possible dvaluer rigoureusement la rsistance ou la tolrance aux maladies endmiques locales
dans ce type dtude. Les paramtres sanguins peuvent tre mesurs en tant quindicateurs des caractres d'adaptation en prlevant des chantillons sanguins et en les
envoyant un laboratoire danalyses. Pour mesurer la tolrance aux parasites comme
les trypanosomes ou les parasites gastro-intestinaux, des prlvements successifs de
sang et de matires fcales peuvent tre collects pendant la saison la plus critique et
envoys un laboratoire danalyses afin de dtecter la prsence de parasites et den
quantifier la charge. Si l'objectif de l'tude est de dterminer la prvalence et lincidence dune maladie ou d'une parasitose, il peut tre utile, si possible, de mettre en
place des laboratoires mobiles. Du matriel de contention et de prlvement sanguin
(vacutainers, lames, microscope optique, des tubes de prlvement) sont ncessaires.
La longvit est probablement le meilleur indicateur de l'adaptation, mais elle ne peut
pas tre mesure dans les tudes de caractrisation. Lorsque les donnes sur l'ge des
animaux peuvent tre obtenues partir des donnes disponibles, la moyenne d'ge
des animaux matures dans les troupeaux chantillonns peut tre considre comme
un indicateur indirect. Les leveurs peuvent galement fournir des informations sur
l'ge des animaux ns dans lexploitation. La viabilit (ou son inverse, la mortalit)
et les niveaux de production sont des mesures faciles obtenir, mais indirectes, de
l'adaptation.

Dcrire les milieux de production


Le cadre de descripteurs du milieu de production (DMP) conu pour tre utilis dans DADIS est prsent en annexe 5. L'quipe doit au minimum traiter cet ensemble de DMP et
recueillir toutes les autres donnes de production sur le milieu qui sont pertinentes pour les
objectifs de l'tude afin dapporter une description dtaille des conditions dans lesquelles
les animaux sont levs.
Dans le cas des tudes de caractrisation avances qui enregistrent les paramtres de
production dans un groupe limit d'animaux, l'accent est davantage mis sur l'enregistrement des conditions prcises dans lesquelles les animaux de l'tude sont levs pendant
la priode ainsi couverte que sur l'enregistrement d'une description gnrale du milieu de
production de la race dans son ensemble. En raison de l'objectif restreint de ces tudes et
l'attention porte aux animaux cibls, il doit tre possible d'enregistrer en dtail tous les
aspects importants du milieu de production.

Collecte de donnes pour la caractrisation avance

Questionnaires
Les questionnaires sont utiliss dans les enqutes rptes ou les tudes menes sur le long
terme dans l'exploitation pour collecter des informations sur les milieux de production, surveiller les structures des troupeaux et l'volution des populations, et identifier les causes de
ces changements. Dans les deux types d'tudes, des questionnaires directifs, semi-directifs
et, dans certains cas ouverts peuvent tre utiliss pour enregistrer systmatiquement des
donnes au moyen dentretiens. Toutefois, si les leveurs sont interviews plusieurs reprises,
des prcautions doivent tre prises pour ne pas risquer de les dsintresser. La porte et
l'approfondissement des questionnaires doivent tre guids par les exigences des donnes
spcifiques de l'tude. Voir la section C pour de plus amples conseils et discussions.

PRPARER LE PROTOCOLE DE COLLECTE DES DONNES


Pour assurer l'uniformit dans la collecte des donnes, l'quipe devra laborer un protocole
dtaillant le plan dchantillonnage, les mesures, l'quipement et les outils utiliser. Celui-ci
peut se baser sur le matriel prsent dans cette section et les sections prcdentes, ainsi
que dans les annexes, et tre adapt si besoin des circonstances particulires. Ce protocole peut tre utilis comme matriel de soutien pour la formation des agents recenseurs,
des leveurs et des autres personnels de soutien.
Les sources potentielles d'erreur systmatique dans la mesure et l'enregistrement
doivent tre plus particulirement soulignes. Tous les codes de donnes et les acronymes
doivent tre clairement dcrits dans le protocole. En ce qui concerne les caractres qualitatifs descriptifs et les descripteurs du milieu de production, le protocole doit insister sur le fait
que les enquteurs ne doivent pas utiliser de nouveaux codes pour enregistrer des donnes
non prvues, mais qu'ils doivent recueillir autant d'informations explicatives que possible
afin que, par la suite, lquipe d'tude soit en mesure de prendre une dcision approprie
sur la faon de coder ces donnes.

FORMER LES LEVEURS OU LES AGENTS RECENSEURS ET LEURS


SUPERVISEURS
La mise en uvre de mesures rptes sur les troupeaux villageois chantillonns ncessite de passer des accords contractuels avec les propritaires de btail pour prciser la
nature, l'tendue et les modalits de collecte des donnes. Il faut tre conscient que ces
arrangements contractuels sont limits dans le temps et quelques exploitations, et par
consquent ne doivent pas tre assimils un programme national didentification et de
contrle des performances, dont la mise en uvre soulve des questions institutionnelles
ncessitant une action au niveau national. Dans certaines circonstances, les membres du
mnage eux-mmes peuvent tre recruts et forms pour recueillir des donnes, au lieu
de faire intervenir des enquteurs externes. Le recrutement des agents recenseurs et des
superviseurs est cependant ncessaire dans le cas d'enqutes rptes.
Il est essentiel que les leveurs, ou les agents recenseurs et leurs superviseurs sous
contrat, soient forms l'utilisation de tous les instruments de collecte de donnes la fois
par des cours formels et des exercices pratiques.
La formation doit permettre dobtenir une approche commune du processus de collecte

61

62

Caractrisation phnotypique des ressources gntiques animales

de donnes, de llaboration des comptes rendus, et de la manire de grer les requtes


qui mergent durant la collecte de donnes. La formation devrait se poursuivre au cours
des tests prliminaires et de l'tude pilote.
La formation doit tablir une communication efficace et un bon environnement de
travail entre toutes les personnes impliques dans cette tude. Cela permettra aux leveurs
sous contrat ou aux agents recenseurs, ainsi qu leurs superviseurs de sapproprier et de
sentir responsable des donnes et des rsultats, et par consquent de collecter les donnes
avec une plus grande prcision. Une bonne communication permet de d'aider les leveurs
et les agents recenseurs quand ils en ont besoin. Elle renforce galement lefficacit de la
collecte des donnes. Les superviseurs doivent recevoir des conseils pour:
Assurer la cohrence des mesures prises sur les animaux de lchantillon. Les
mthodes de collecte de donnes doivent tre aussi cohrentes que possible d'un
leveur/recenseur l'autre et d'un milieu de production l'autre.
Vrifier les donnes brutes juste aprs leur collecte afin didentifier les erreurs videntes et
les donnes manquantes. Des conseils doivent tre fournis sur la faon de rsoudre ces
erreurs, si ncessaire, en remontant aux sources de donnes ou en reprenant les mesures.
Si les enqutes rptes impliquent denvoyer plus d'une quipe sur le terrain, il est
souhaitable qu'elles aient des membres en commun pour favoriser l'homognit de la
collecte des donnes. De mme, les leveurs chargs de prendre des mesures devraient, si
possible, tre superviss par la mme personne.

EFFECTUER DES TESTS PILOTES ET PRLIMINAIRES SUR LES INSTRUMENTS


DE L'TUDE
Comme dans le cas de la caractrisation primaire, le protocole et toutes les mesures des
donnes et instruments d'enregistrement doivent tre tests au pralable. Par la suite,
une enqute pilote complte devra tre mene dans la zone d'tude. Les raisons de cette
dmarche sont expliques dans la section C.
Les instruments de mesures utiliss pour les collectes de donnes rptes en ferme
ou en station, doivent tre pralablement tests afin de minimiser les variations entre les
oprateurs (leveurs, techniciens de recherche ou agents recenseurs).

ORGANISER LA LOGISTIQUE DU TRAVAIL SUR LE TERRAIN


Au cours de la finalisation des prparatifs techniques, l'quipe doit commencer prparer
lagenda et la logistique des activits sur le terrain, en collaboration avec les leveurs et/ou
les enquteurs et les superviseurs. Avant de choisir les dates du travail de terrain, les points
suivants doivent tre considrs:
Est-ce que la saison de l'anne (fortes pluies, scheresse, etc.) pourrait affecter la
collecte de donnes dans des sites particuliers de ltude ou travers toute la zone
slectionne?
Les pics dactivits agricoles (prparation du sol, rcolte, etc.) affectent-ils la collecte
de donnes?
Les vnements socioculturels (par exemple, les ftes religieuses) peuvent-ils affecter
la collecte des donnes?

Collecte de donnes pour la caractrisation avance

Lors de la mise en uvre denqutes rptes, les superviseurs et l'quipe doivent visiter
les sites slectionns afin d'informer officiellement les autorits locales et les communauts cibles sur la collecte de donnes prvue, comme cest le cas pour la caractrisation
primaire. La date, l'heure et le lieu des visites sur le terrain doivent tre convenus avec les
reprsentants de la communaut. Il faut pour cela consulter les chefs de village, les autorits locales ou les prestataires de services (par exemple les vtrinaires) pour dterminer les
moments les plus pratiques pour la collecte des donnes. Il peut tre appropri d'impliquer
ces acteurs directement dans l'organisation des activits sur le terrain.
Pour l'valuation en station, l'quipe doit s'assurer que les installations de recherche
sont non seulement capables de mettre en place un environnement physique et une
gestion prdfinie, mais aussi de permettre le suivi et l'enregistrement des rponses des
animaux dans des milieux de production donns. L'quipe doit dterminer si le personnel
de la station de recherche est en mesure de faire face la charge de travail supplmentaire
lie l'tude de caractrisation, et recruter du personnel supplmentaire si ncessaire.
Des problmes logistiques tels que la rservation de vhicules, l'achat de consommables
(carburant, papier, piles, etc.), les autorisations de dplacement et d'hbergement pour les
quipes sur le terrain doivent tre rgls l'avance.

FINALISER LE PLAN DE COLLECTE DE DONNES


Le plan final pour la collecte des donnes doit inclure le plan dchantillonnage, les dtails
de tous les instruments, guides et protocoles de collecte des donnes, ainsi que le calendrier du travail sur le terrain. Ce plan devrait tre accompagn d'un rapport budgtaire
pour toutes les questions logistiques et les besoins en ressources humaines.

63

Section E

Gestion et analyse des donnes

67

Gestion et analyse des donnes

La collecte dun grand volume de donnes est souvent ncessaire pour mener bien une
tude de caractrisation phnotypique. Les donnes doivent tre traites et analyses, et
les rsultats publis pour apporter des conseils sur les prises de dcision concernant les
ressources zoogntiques. La phase de planification de ltude doit aborder la gestion et
lanalyse des donnes de manire rigoureuse et approfondie. Cette section passe en revue
les activits et les outils requis.

GESTION DES DONNES


La gestion des donnes comprend une srie dactivits - conception dun systme de saisie des donnes (base de donnes), mise en place de la structure de la base de donnes,
contrle des donnes, saisie des donnes dans la base, stockage et archivage des donnes.
Le plan de gestion des donnes doit tre labor conjointement avec les plans de collecte
et danalyse. Par exemple, la gestion des donnes doit tre prise en compte dans la conception du questionnaire de ltude, dont le plan et la structure doivent faciliter la collecte et
lenchanement, sans difficult, de la saisie lanalyse des donnes. Il faut dterminer si les
ressources sont disponibles pour grer les rsultats des activits sur le terrain et si la gestion
des donnes collectes est possible sur le plan logistique. Le plan de gestion des donnes
doit galement sassurer que les donnes recueillies sont conserves en toute scurit, dans
leur intgrit et de manire accessible ( la fois en version papier et en version lectronique).
Le choix du logiciel de gestion des donnes dpend des ressources disponibles pour
ltude. Les feuilles de calcul, comme Microsoft Excel, doivent tre utilises avec prcaution
et seulement pour les structures de donnes simples (University of Reading, 2001). Les
donnes relationnelles et hirarchiques ncessitent dutiliser de vrais systmes de gestion
de base de donnes, comme Microsoft Access ou CSPro2 (open source gratuite auprs
du Bureau de recensement des tats-Unis dAmrique), qui possdent des programmes
sur mesure pour saisir, filtrer et rcuprer les donnes. Le personnel de saisie des donnes
doit savoir utiliser ce type de programmes ou bnficier dune formation adquate. Les
donnes doivent absolument tre rgulirement sauvegardes et les copies stockes dans
diffrents lieux.
Pour russir une tude de caractrisation phnotypique, il faut que les procdures de
gestion des donnes soient bien dfinies. Les lments suivants doivent tre inclus dans la
planification:
le contrle des donnes;
un systme de saisie (base de donnes) pour enregistrer les donnes sous format
numrique;
2

Voir http://www.census.gov/population/international/software/cspro/

Caractrisation phnotypique des ressources gntiques animales

68

le nettoyage des donnes;


le traitement des donnes dans une forme approprie pour lanalyse;
larchivage des donnes afin quelles restent disponibles tout au long des phases
suivantes du projet et par le futur.

Contrle de la qualit des donnes


Il faut vrifier les donnes brutes recueillies sur le terrain pour sassurer quelles soient de
la meilleure qualit possible avant de commencer lanalyse. Les contrles effectus par les
superviseurs doivent tre intgrs dans le processus normal de collecte de donnes sur le
terrain. Chaque questionnaire doit tre contrl pour vrifier sil est complet et cohrent.
Tous les problmes qui sont signals doivent tre documents par le superviseur. Les questionnaires qui atteignent les bureaux du personnel de saisie des donnes doivent avoir t
signs par lagent recenseur et le superviseur.

Saisie des donnes


Il est important de sassurer que les donnes recueillies au cours des travaux sur le terrain
sont compltement et correctement transfres du format papier au format numrique.
Les donnes doivent tre saisies dans leur forme brute (c.--d. directement partir des
questionnaires originaux) dans les plus brefs dlais aprs avoir t recueillies sur le terrain.
Un manuel dcrivant les procdures de saisie des donnes doit tre prpar et le personnel
qui saisit les donnes doit tre soigneusement form.
La saisie des donnes peut tre gre laide de logiciels personnaliss de saisie et
de vrification des donnes, de programmes statistiques gnraux (par exemple GenStat,
CNSS, R, SAS, SPSS, XLStat), ou dun logiciel spcialis de gestion des donnes denqutes,
libre ou commercial, comme CSPro. Si les ressources le permettent, les agents recenseurs
peuvent tre en mesure de saisir les donnes directement pendant le travail de terrain
laide dun assistant numrique avec un systme de saisie de donnes personnalis. Ce type
dappareil est particulirement utile pour prendre des mesures rptes des performances
au cours des tudes de caractrisation avance.
Les crans de saisie de donnes doivent, autant que possible, correspondre visuellement
au format du questionnaire. Si possible, les sauts dans le questionnaire (par exemple, si
la rponse est non, passez la question 15) doivent tre programms dans les crans de
saisie de donnes. Les units de mesure utilises pour toutes les variables quantitatives et
leur prcision (nombre de chiffres significatifs) doivent tre clairement dfinies et correspondre la prcision relle des instruments de mesure ou des appareils denregistrement.
La saisie des donnes doit tre organise de manire systmatique, cest dire que
toutes les donnes dun site dtude doivent tre enregistres avant de saisir les donnes
provenant dun autre site dtude. Selon le type de systme de saisie utilis, il est parfois
prfrable dentrer les donnes section par section, plutt que de rentrer toutes les donnes de chaque questionnaire, lun aprs lautre. Il faut identifier les variables cls permettant de fusionner les donnes stockes dans des fichiers ou des tableaux diffrents.
Il faut vrifier lexactitude de la saisie des donnes lors de leur saisie informatique et par
la suite, tout en effectuant des contrles ponctuels pour sassurer que le personnel charg

Gestion et analyse des donnes

de ce processus na pas oubli de question. Si possible, utilisez un logiciel qui comprend


des programmes de contrle et de validation des donnes. Pensez effectuer une double
saisie: assurez-vous que les donnes sont saisies indpendamment par deux personnes
dans des copies spares.

Nettoyage des donnes


Lobjectif doit tre de construire un ensemble de donnes lectroniques qui reflte les
donnes initialement collectes sur le terrain aussi prcisment que possible. Sil y a eu une
double saisie (voir ci-dessus), les deux versions peuvent tre compares et, le cas chant,
les divergences peuvent tre contrles en se rfrant aux fiches techniques ou questionnaires de base.
Il faut essayer de corriger les erreurs dtectes. Si ce nest pas possible, les donnes
peuvent ne pas tre prises en compte dans ltude. Ce type de dcision doit tre pris par
lanalyste de lquipe dtude. Il faut sassurer que le systme de gestion des donnes produit des rapports automatiques qui documentent tous ces changements et corrections. Les
versions corriges des bases de donnes doivent tre conserves sous de nouveaux noms.
Il ne doit y avoir quune seule copie originale de la base de donnes et les analyses
ultrieures doivent tre effectues en utilisant les donnes issues de la copie originale. Le
nettoyage des donnes est loccasion de lancer des analyses prliminaires et dobtenir les
premires synthses de donnes (voir ci-dessous). Enfin, il est trs important de sauvegarder
et stocker les donnes dans des systmes de stockage distincts situs dans des endroits
srs et spars. Les procdures de sauvegarde doivent tre soigneusement documentes.

Traitement de linformation
Les activits dcrites dans ce paragraphe constituent une partie trs importante de la prparation des donnes avant lanalyse. Lanalyste est charg de veiller ce quelles soient
correctement ralises. Le traitement des donnes en fonction des besoins prcis de
ltude concerne tout ou partie des activits suivantes:
utiliser le logiciel de statistiques choisi pour importer lensemble de donnes stock
dans la base;
crire et excuter un programme pour cataloguer les variables et les valeurs;
fusionner ou fractionner les ensembles de donnes;
gnrer des variables drives ou composites pour une analyse plus approfondie;
transformer les donnes pour effectuer des contrles ou dautres analyses. Par
exemple, il peut tre plus facile de voir si les valeurs sont inhabituelles si elles sont
transformes en units familires comme le kilogramme ou lhectare. Lensemble des
donnes peut inclure diffrents types de donnes (ordinales, nominales, code de texte
discret, texte libre, images, fichiers vido, fichiers audio, etc.) Ces donnes doivent
tre codes et reclasses avant lanalyse;
crire et excuter un programme qui produit des statistiques descriptives de lensemble frquence des donnes qualitatives (par exemple, la couleur du pelage)
et moyennes et distributions simples des donnes quantitatives (par exemple, la
longueur du corps) pour nettoyer encore davantage les donnes. Les statistiques

69

Caractrisation phnotypique des ressources gntiques animales

70

descriptives permettront lanalyste dobtenir une vue densemble des donnes et de


leur distribution et, en particulier, didentifier les valeurs tranges (valeurs aberrantes)
qui semblent sortir de la plage de variations lorsque les donnes sont reprsentes
graphiquement ou que des statistiques lmentaires (par exemple, les valeurs minimales et maximales) sont calcules.
La vrification des donnes et toutes les modifications ultrieures des incohrences ou
des valeurs aberrantes doivent tre fondes sur les conseils dun statisticien si lexpertise
ncessaire nest pas disponible au sein de lquipe. Les incohrences et les valeurs aberrantes doivent tre tudies et traites avec soin; les valeurs trs aberrantes peuvent avoir
un impact important sur les rsultats de ltude.
Les termes utiliser pour dcrire les donnes manquantes doivent tre clarifis. Les
donnes peuvent manquer parce quelles ont t perdues aprs la collecte, parce quelles
ont t dclares peu fiables ou douteuses, ou parce quelles nont pas t recueillies pour
une raison quelconque. Chacun de ces types de donnes manquantes doit tre prcisment dfini avant de commencer analyser les donnes. Il est prfrable de cataloguer ces
lments comme tant manquants plutt que dliminer lensemble de lenregistrement
dont elles font partie.

Archivage des donnes


Larchivage et lanalyse exigent toute la documentation (mtadonnes) de lensemble de
donnes. Une fois que ltude est acheve, les fichiers de donnes et les questionnaires
remplis - que ce soit sur support papier ou lectronique - doivent tre transfrs dans des
archives centralises. Les archives doivent inclure toutes les informations recueillies lors de
ltude (y compris les photographies, cartes, etc.) et les communications et rapports cls
crits durant la planification et la mise en uvre de ltude. Les archives doivent tre disponibles (par exemple sur un CD- ROM) pour tous les membres de lquipe dtude et les
organisations ou institutions investies par les autorits nationales pour conserver les donnes recueillies. Les autres intervenants partenaires de ltude doivent uniquement recevoir
les rapports. Toute utilisation de ces donnes en dehors du cadre de ltude doit tre soumise un accord de transfert de matriel dans lequel les droits de proprit intellectuelle
et de partage des bnfices sont clairement spcifis entre lorganisme bnficiaire et
lorganisme dpositaire des donnes.

ANALYSE DES DONNES


Cette sous-section donne un aperu des lments qui contribuent lobtention de rsultats
analytiques de bonne qualit.

Personnel et ressources
Lanalyse des donnes est un domaine trs technique qui ncessite une expertise professionnelle. Bien que les programmes statistiques puissent grer les tches de routine dans la
gestion et lanalyse des donnes, il est important de recevoir les conseils dun expert sur le
choix du modle et le traitement efficace des donnes. Plus important encore, les conseils
dun expert sont ncessaires pour guider lanalyse des donnes et sassurer quelle rpond

Gestion et analyse des donnes

aux objectifs spcifiques et aux questions de recherche de ltude, tout en sassurant de


la validit des hypothses dans le modle analytique. Les besoins en termes dexpertise
doivent avoir t identifis au cours de la phase de planification de ltude et combls en
incluant un statisticien parmi les membres de lquipe dtude ou, si cela na pas t possible, en veillant ce quun statisticien puisse fournir des conseils en cas de besoin.

Programmes statistiques
Lanalyse des donnes doit disposer du matriel informatique et des programmes statistiques appropris. Les programmes utiliss doivent tre adapts aux objectifs de ltude et
au niveau de comptence de lanalyste. Comme indiqu plus haut, une gamme de logiciels
statistiques gnraux est disponible dans le commerce pour analyser les donnes (par
exemple, SAS, GenStat, SPSS, STATA, S -Plus, XLStat, CNSS, Statistica, Systat). Le logiciel
de domaine public R3 est non seulement distribu librement, mais permet galement le
dveloppement personnalis des outils danalyse. Une version antrieure de GenStat4
est disponible gratuitement dans certains pays en dveloppement. Des programmes statistiques spcialiss pour lanalyse des donnes denqute sont galement disponibles. En
gnral, les programmes statistiques choisis pour lanalyse doivent fournir les possibilits
suivantes:
une capacit suffisante pour faire face lampleur et la diversit des donnes qui
seront recueillies;
des algorithmes faciles dutilisation;
des capacits en tableaux et graphiques suffisantes;
des options danalyse des donnes rponses multiples;
les moyens de diagnostiquer si les donnes sont cohrentes avec les hypothses du
modle;
les moyens de prsenter les rsultats sous des formats qui facilitent linterprtation
des donnes.
Vrifiez si les programmes envisags permettent de prendre en compte simultanment
les variables quantitatives et qualitatives dans lanalyse des donnes; par exemple, SAS en
est incapable. Un logiciel qui permet de traiter conjointement les deux types de donnes
est prfrable car il permet une analyse plus complte.
La disponibilit des ressources (par exemple pour payer lutilisation de logiciels commerciaux) doit galement tre prise en compte dans le choix du programme statistique.
Les options et les implications relatives lutilisation future du logiciel (comme les frais de
renouvellement des licences annuelles obligatoires) doivent tre envisages. Si lquipe
dtude ne comprend pas de statisticien, il peut tre ncessaire de consulter un professionnel externe sur le choix du logiciel appropri. La facilit apparente avec laquelle le logiciel
traite les donnes et gnre des rsultats ne garantit pas lefficacit et lefficience du traitement des donnes, la slection des modles ou lobtention de rsultats.

3 http://www.R-project.org/
4 www.genstat.co.uk

71

Caractrisation phnotypique des ressources gntiques animales

72

Temps ncessaire pour lanalyse


Le temps ncessaire lanalyse des donnes est une ressource moins vidente, mais tout
aussi importante. Lanalyse doit commencer le plus rapidement possible aprs la collecte
des donnes, de sorte que les contrles de donnes ncessaires soient effectus quand
les souvenirs de lquipe de terrain sont encore frais, et afin que les rsultats puissent tre
communiqus sans dlai aux parties prenantes. Le temps ncessaire pour analyser une base
de donnes complte dpend de la complexit du cadre dchantillonnage et du nombre
de questions abordes par ltude. Compte tenu de la vitesse des ordinateurs modernes, la
quantit de temps ncessaire ne dpend pas, en principe, fortement de la taille de lchantillon. Lors de la planification de ltude, il est raisonnable de sattendre ce que la gestion
et lanalyse des donnes de caractrisation phnotypique prennent environ le mme temps
que la collecte des donnes en elle-mme.

Examiner les objectifs


Lanalyse doit tre prcde dun examen dtaill des objectifs de ltude et des donnes
qui ont t recueillies, car ces derniers dtermineront le type danalyse statistique qui doit
tre entrepris. Les objectifs doivent tre dcomposs en questions ou en hypothses spcifiques qui peuvent tre traites ou testes lors de lanalyse. Des exemples de questions
pouvant tre rsolues par une tude de caractrisation phnotypique sont numrs dans
la section B. La tche suivante consiste slectionner les variables associes aux questions
indiques et les utiliser dans lanalyse. Ces variables peuvent dj tre disponibles dans
la base de donnes ou peuvent tre construites en recodant ou en combinant les variables
existantes. Si un grand nombre de variables semblent mesurer des caractres semblables,
il peut tre utile de les combiner. Afin de permettre lanalyste de terminer son travail
rapidement et efficacement, une liste de techniques utiliser et de tableaux ou graphiques
produire doit tre prpare. La liste doit tre accompagne dune norme commune pour
le format des tableaux, en-tte, tailles de police, espacements, etc.

Les tapes critiques dans lanalyse des donnes


Avant de commencer lanalyse, assurez-vous que lanalyste soit familier avec les sources et
les mthodes de collecte de donnes, et comprenne clairement les objectifs de ltude et les
questions qui en dcoulent. Il/elle doit comprendre la signification exacte des variables, en
particulier des variables codes. Lanalyse doit commencer par lexploration de donnes (se
familiariser avec les donnes et les synthtiser) en utilisant des approches diffrentes selon
le type de variables; cette tape doit tre suivie dune analyse confirmatoire guide par les
rsultats obtenus lors de la phase exploratoire. La gestion des valeurs manquantes doit tre
planifie en les incluant ou en les omettant de lanalyse - en tant conscient de la faon
dont cela va affecter les rsultats obtenus.
Analyse exploratoire des donnes. Lutilisation de statistiques descriptives simples
moyenne, minimum, maximum, mdiane et cart type pour les donnes quantitatives, ou
les frquences et les tableaux de donnes qualitatives - est recommande. Cela permettra
dvaluer les grandes tendances dans les variables et de faciliter la progression de lanalyse
confirmatoire des donnes. La phase exploratoire de lanalyse est loccasion de rpondre

Gestion et analyse des donnes

des questions comme Qui sont les leveurs qui possdent des animaux appartenant la
race nouvellement identifie?
Analyse confirmatoire des donnes. Lanalyse confirmatoire des donnes a pour
principaux objectifs les estimations et le test des hypothses. Lanalyste doit dcrire les facteurs et les paramtres qui doivent tre estims et noncer lhypothse qui doit tre teste.
Il est important de veiller ce que les estimations prennent en compte les coefficients de
pondration de lchantillonnage. Si lchantillonnage est chelonn (stratifi), les observations ne seront pas chantillonnes avec une probabilit gale. Dans de tels cas, une
moyenne pondre (x = wx/ w avec des poids w) peut tre utilise la place de x pour
compenser les probabilits ingales. Si la moyenne pondre nest pas utilise, il est important de justifier la validit des estimations en expliquant pourquoi elles ont t calcules
sans pondration. Assurez-vous, ce stade, que les erreurs dchantillonnage (estimations
des erreurs types et des intervalles de confiance voir encadr 9) soient calcules.
Dans la caractrisation phnotypique, les mthodes danalyse des donnes multivaries
(classification) sont utilises pour valuer les similitudes morphologiques globales entre les
groupes danimaux, en sappuyant sur un ensemble slectionn de donnes phnotypiques
quantitatives et qualitatives. Ces mthodes sont prsentes dans la section A. Le lecteur est
pri dexaminer ces techniques avant de lire le reste de cette section.
Dans les tudes de caractrisation phnotypique primaire (lorsque lobjectif est didentifier des races distinctes), lanalyse doit inclure les actions suivantes:
Dterminer lunit taxonomique oprationnelle (UTO) pour la classification. Les UTO
peuvent tre des animaux individuels ou les moyennes des mesures prises sur un
chantillon danimaux provenant dun site particulier (centrodes).
Utiliser les outils danalyse de variance pour filtrer les variables afin de slectionner
celles qui contribuent de manire significative la variation phnotypique observe.
Dterminer si lanalyse des donnes doit tre faite par groupe de sexe (femelles
et mles sparment). Certains caractres phnotypiques dpendent du sexe de
lanimal. Si ces caractres contribuent de manire significative la variation totale
observe, ils doivent tre inclus dans lanalyse multivarie des donnes. Il peut tre
appropri danalyser sparment les donnes pour les animaux mles et femelles et
comparer les rsultats. Si les rsultats indiquent un dimorphisme sexuel important,
lanalyse finale de classification doit tre faite sparment pour les femelles et les
mles.
Vrifier et viter la colinarit dans lensemble des variables retenues pour lanalyse,
cest--dire viter les situations dans lesquelles les variables de classification sont
fortement corrles, comme lutilisation de caractres qui sont drivs dautres caractres (association) ainsi que les composants des caractres.
Transformer les donnes brutes en composantes principales standardises et indpendantes.
Dcider du type de mthode de regroupement utiliser pour llaboration de larbre
de classification (dendrogramme), la mthode la plus courante est squentielle,
ascendante, hirarchique et non chevauchante (SAHN).
Chercher linterprtation biologique la plus logique de larbre de classification.

73

74

Caractrisation phnotypique des ressources gntiques animales

Envisager comment valider le classement; cest--dire en reproduisant la procdure de


classification en utilisant des ensembles de donnes distincts ou en vrifiant lexactitude de la classification par une analyse discriminante.
Envisager de discuter des rsultats prliminaires avec les principaux intervenants. Cela
peut fournir des indications supplmentaires sur le modle analytique employ.
Dans la caractrisation phnotypique avance, des outils statistiques sont utiliss pour
valider les diffrences multivaries entre les groupes connus. Des logiciels statistiques
gnralistes ou spcialiss dans lanalyse multivarie peuvent tre utiliss pour lanalyse
discriminante.
Les rsultats de lanalyse multivarie des donnes phnotypiques fournissent le cadre
pour lanalyse des donnes dcrivant les milieux de production. Lobjectif est de dcrire en
dtail lenvironnement physique et le milieu dlevage des races identifies (les descripteurs
principaux sont numrs en annexe 5). Ltude des liens entre les caractristiques des races
et les diffrentes caractristiques de leurs milieux de production peut attirer lattention sur
les caractristiques de production et dadaptation qui mritent une enqute de suivi.
Le tableau 2 rsume les mthodes statistiques utilises dans les tudes de caractrisation. Notez que certaines des mthodes prsentes dans le tableau sont utilises plusieurs
fins. Lencadr 10 illustre la manire dont lobjectif de ltude dtermine le choix de la
mthode statistique.

Interprtation des rsultats


Linterprtation des rsultats doit avoir pour principal objectif de satteler de faon concluante
rpondre aux objectifs spcifiques de ltude, et aux questions qui en dcoulent. Cependant, elle doit aussi permettre de rapporter des rsultats imprvus. Les rsultats doivent tre
compars lensemble des connaissances (thoriques et empiriques) obtenues durant la
phase dexamen des donnes issues de la littrature (voir section B). Cela permet de fournir
des preuves lappui des rponses apportes aux questions de ltude.
Dans la limite du possible, lanalyse et linterprtation des donnes doivent dpasser
la simple description des ressources zoogntiques et de leurs milieux de production. Par
exemple, diffrents types de rsultats (les caractristiques phnotypiques et les caractristiques du systme de production) devraient tre combins pour rpondre des questions
comme: Pourquoi cette race particulire est la seule prsente dans cette rgion ou
Pourquoi cette race est-elle risque?. Il faut envisager de prsenter une analyse critique
de lensemble de donnes, qui devrait souligner les limites de lensemble de donnes ainsi
que son potentiel. Ce dernier peut inclure les possibilits dexplorer les relations et les tendances au sein de lagro-cosystme concern et dfinir les prochaines tapes de la gestion
des ressources zoogntiques. Les donnes sur les milieux de production sont essentielles
pour ce genre danalyse.
Le partage des rsultats prliminaires avec certaines parties prenantes peut savrer ncessaire pour obtenir de nouvelles contributions qui seront utiles dans linterprtation des rsultats
imprvus. Une fois que linterprtation des rsultats a t finalise et approuve par lquipe
dtude, un rapport dtude final doit tre produit et largement distribu (voir section F).

Gestion et analyse des donnes

75

Tableau 2

Mthodes statistiques pour les tudes de caractrisation


Mthode*

Type de variable

Application

Analyse de variance multivarie

Quantitative

Dterminer les caractres les plus intressants d'un


ensemble de caractres, afin de diffrencier les
populations

Analyse de classification
multivarie

Quantitative

Rorganiser un ensemble htrogne dunits


taxonomiques (individus ou populations) dans des groupes
ou clusters plus homognes en fonction des variables
pertinentes

Analyse discriminante

Quantitative

Valider les diffrences entre les races selon les modles


morphologiques ou morphostructuraux

Test de Bonferroni

Quantitative

Comparaison multiple dune variable dans diffrentes


populations ou races, aprs une analyse de la variance

Analyse en composantes
principales

Quantitative

Etudier les relations linaires entre les caractres.


Corriger une analyse de groupement (cluster) lorsque les
variables ne sont pas indpendantes, en les transformant
en variables non corrles

Analyse en facteurs

Quantitative

Rendre compte des facteurs sous-jacents les plus


importants

Analyse factorielle des


correspondances

Qualitative

Estimer la variabilit et la puret dune race

Analyse des correspondances


multiples

Qualitative

Dterminer la similitude entre les individus ou les races

Mthodes heuristiques (rseaux


de neurones)

Quantitative

Dterminer le degr de diffrenciation dune race par


rapport aux autres

Test du X2 pour les estimations


par la mthode des moindres
carrs

Qualitative

Estimer lassociation entre les caractristiques qualitatives


(test non paramtrique)

Distance de Mahalanobis

Quantitative

Dterminer le degr de diffrenciation entre les races


laide de caractres phnotypiques continus ou
normalement distribus

Paramtres pour la mesure de


la variabilit gntique (richesse
alllique, nombre efficace
dallles, htrozygotie, contenu
informatif du polymorphisme)

Gntique
(identification des
allles)

Caractriser gntiquement la population et son profil


gntique

F-statistiques de Wright

Gntique
(identification des
allles)

Estimer la consanguinit, le dficit ou lexcs


dhtrozygotes, le taux de migration et les diffrences
entre les populations

Distances gntiques (Nei,


Reynolds, Cavalli-Sforza et
Edwards)

Gntique
(identification des
allles)

Mesurer les relations gntiques entre les races et les


populations, dans les tudes phylogntiques

Analyse de Weitzman

Gntique
(identification des
allles)

tudes phylogntiques des races

* Les quatre dernires lignes du tableau dcrivent les mthodes utiliser dans les tudes gntiques.
Ces mthodes nentrent pas strictement dans le champ dapplication de ces directives, mais sont inclues titre
dinformation complmentaire.

Caractrisation phnotypique des ressources gntiques animales

76

ENCADR 10

Le choix des mthodes statistiques selon le but de ltude


de caractrisation
Un nombre croissant dtudes utilisent les caractres morphomtriques drivs des
mesures corporelles pour classifier et diffrencier les races. Voici quelques exemples:

1. Les tudes de caractrisation phnotypique de Herrera et al. (1996) et Zaitoun


et al. (2005) visaient identifier et diffrencier les races de chvres en Espagne
et en Jordanie, respectivement, et dterminer quelles variables morphomtriques, parmi les 13 utilises, taient les plus efficaces cet effet. Les mthodes
statistiques utilises dans la premire tude taient lanalyse discriminante
simple, lanalyse discriminante canonique et lanalyse discriminante pas pas.
La deuxime tude a utilis les mmes mthodes en rajoutant une analyse de
classification. La conclusion diffre pour chaque objectif, ce qui souligne donc la
ncessit de normaliser les mthodes statistiques en fonction de lobjectif. Les
deux tudes ont estim la diffrenciation entre les races partir des distances de
Mahalanobis et labor des arbres phylogntiques des relations entre les races.

2. Ndumu et al. (2008) ont suivi des procdures identiques pour caractriser et
identifier les populations de btail de la rgion des Grands Lacs en Afrique.
Cependant, Rodero et al. (sous presse) ont montr la supriorit des mthodes
statistiques heuristiques (perceptrons multicouches, rseaux de neurones probabilistes et machines vecteurs de support) par rapport aux analyses discriminantes pour diffrencier correctement des races locales andalouses.
Ces exemples montrent la ncessit de clarifier les objectifs de ltude de caractrisation et de choisir la mthode statistique approprie pour atteindre ces objectifs.
Auteur: Evangelina Rodero.

Section F

Rapports et communication

79

Rapports et communication

Comme le soulignent ces directives, la caractrisation phnotypique doit idalement tre


ralise dans le cadre de la Stratgie nationale et du Plan daction pour les ressources zoogntiques du pays ou dautres stratgies et programmes de dveloppement de llevage,
pour fournir les donnes sur les ressources zoogntiques ncessaires aux dcideurs politiques, aux professionnels du dveloppement et aux chercheurs, pour la planification et la
mise en uvre de programmes de gestion durable de ces ressources. Une stratgie efficace
de communication doit tre labore au cours de la phase de planification de ltude. Elle
doit permettre de grer la communication pendant toutes les phases de ltude ainsi que
la rdaction du rapport final pour que lquipe puisse:
maintenir lintrt des partenaires de ltude;
dvelopper et rendre compte des principaux indicateurs de performance pour suivre
et valuer ltude;
faire preuve de transparence et de responsabilit;
assurer une visibilit publique approprie de ltude;
sensibiliser et engager les parties prenantes dans un dialogue constructif;
partager les savoirs acquis et les bonnes pratiques avec tous ceux qui envisagent ou
entreprennent un travail similaire.
La rdaction du rapport et les activits de communication doivent commencer au cours
de la phase de lancement et continuer tout au long de ltude. Lquipe doit prparer des
rapports intermdiaires rguliers sur les progrs effectus et un rapport final. Ce dernier
constituera le principal outil pour communiquer les rsultats de ltude aux intervenants
concerns. Cette section fournit des indications sur la structure et le contenu des rapports
intermdiaires et final. Elle aborde galement dautres mthodes qui peuvent tre utilises
pour communiquer les rsultats de ltude, et la ncessit de considrer limpact potentiel
des activits de communication. La manire dont les rsultats de ltude de caractrisation
peuvent tre lis dautres activits en cours dans la gestion des ressources zoogntiques
est galement prise en compte.
La stratgie de communication et dtablissement des rapports doit permettre dassurer
une communication efficace entre les membres de lquipe et les partenaires du projet.
Cela peut tre dcrit comme la communication pour lobtention des rsultats (da Costa,
2009), contrairement la communication sur les rsultats qui sera lobjectif du rapport
final et des produits de communication connexes. La communication pour lobtention des
rsultats est essentielle pour assurer la ralisation efficace de ltude. La communication
doit tre utilise comme un outil dapprentissage interne et pour renforcer la cohrence
des actions de lquipe.

Caractrisation phnotypique des ressources gntiques animales

80

RAPPORTS DAVANCEMENT PROVISOIRES


Les rapports davancement doivent tre prpars rgulirement pour informer les partenaires du
projet sur les progrs accomplis dans la mise en uvre de ltude. Les rapports doivent porter
sur toutes les activits entreprises, en indiquant dans quelle mesure les objectifs noncs dans le
plan ont t atteints. Si les objectifs ne sont pas atteints ou pas atteints temps, des explications
claires sur les problmes rencontrs doivent tre fournies par les personnes impliques dans les
parties concernes du projet, des options doivent tre identifies et values pour surmonter
ces problmes, et une dcision doit tre prise sur la meilleure faon dy remdier. Les rapports
contenant les rsultats prliminaires doivent toujours inclure des avertissements bien visibles
indiquant que ces rsultats sont provisoires et susceptibles dtre modifis. Ils doivent porter la
mention confidentiel et ntre transmis quaux partenaires cls concerns.
Les rapports provisoires facilitent la communication entre les membres de lquipe et
amliorent la comprhension mutuelle des forces et des faiblesses individuelles au sein de
lquipe. Lorsque des litiges surviennent au sujet des responsabilits, les zones dambigut
doivent tre identifies et clarifies. Si ncessaire, le plan de travail et le calendrier doivent
tre modifis.

RAPPORT FINAL
Les objectifs et les questions spcifiques cibls par ltude de caractrisation doivent avoir
t clarifis ds le dbut du processus de planification (voir la section B). Le rapport final
doit apporter des rponses ces questions. Il est fortement recommand que le rapport
final soit mis la disposition du Coordonnateur national pour la gestion des ressources zoogntiques, du Comit consultatif national sur les ressources zoogntiques (sil existe), des
ministres concerns et de tous les partenaires qui ont particip ltude. La communaut
scientifique doit galement tre informe. Un bon moyen pour avoir une audience internationale est denvoyer le rapport la FAO pour linclure dans la bibliothque de DAD-IS et
le distribuer via le groupe de discussion lectronique DAD-Net.
En plus de fournir des rponses aux questions de ltude, un rapport final bien prpar
offrira galement une base pour la planification des tudes futures, indiquera sil est ncessaire de procder des tudes supplmentaires ou complmentaires, et attirera lattention
sur les possibilits damliorer la mthodologie. Le rapport doit prsenter le processus de
caractrisation du dbut la fin et noncer les conclusions de ltude.
Lensemble de lquipe doit tre impliqu dans sa prparation. Si les tapes dcrites
dans ces directives ont t suivies (cest--dire si tous les plans et les phases de travail ont
t correctement documents), une grande partie du rapport aura dj t prpare.
Lquipe dtude doit dcider sil est ncessaire de produire des rapports distincts pour
diffrents publics cibles (voir ci-dessous pour de plus amples dtails sur des projets de
communication diffrencis). La structure du (des) rapport(s) doit tre adapte aux publics
cibles. Sil est destin des chercheurs qui sintressent des donnes dtailles sur lesquelles ils peuvent travailler, le rapport doit suivre la structure standard dune publication
scientifique. Les dcideurs et les professionnels du dveloppement, qui recherchent des
stratgies et des ides pour les aider dans leur planification, seront plus intresss par des
rapports concis qui visent spcifiquement rpondre des questions comme:

Rapports et communication

81

Existe-t-il des races nayant pas t prcdemment identifies dans la zone dtude?
Les races dans la zone dtude ont-elles des caractristiques uniques?
Quel est leffectif estim de la population et la rpartition actuelle des races et leur
situation en matire de risque?
Existe-t-il des menaces qui mritent une attention immdiate?
Y a-t-il des activits de gestion en cours ou prvues pour ces races?
Les rsultats dune enqute auprs de 100 utilisateurs de donnes sur ce quils souhaitent
trouver dans les rapports de recherche (Hague, 2006) sont prsents dans le tableau 3.
Le rapport dune tude de caractrisation phnotypique peut inclure les lments suivants:
le rsum;
lintroduction, qui doit inclure un nonc des objectifs, les questions auxquelles il faut
rpondre et le champ dapplication de ltude;
la mthodologie, avec des dtails supplmentaires dans les annexes;
les rsultats;
la discussion sur les rsultats et leurs implications;
les recommandations pour la poursuite des travaux afin de rgler les problmes
en suspens, y compris les connaissances acquises sur le processus de ralisation de
ltude: ce qui aurait pu tre mieux fait et comment?
les rfrences;
les annexes, qui doivent inclure:
- les plans originaux dtaills pour les oprations sur le terrain, la gestion et lanalyse
des donnes, y compris la documentation de tous les changements dans ces plans;
- la description de larchivage des donnes;
- les annexes techniques qui apporteront des dtails sur lanalyse statistique;
- une liste des personnes et des institutions impliques.

TABLEAU 3

Quest-ce qui fait un bon rapport de recherche?


Quest-ce qui fait un bon rapport de recherche?

Rponses brves

Pourcentage des personnes interroges le mentionnant*

33

Structure claire

29

Interprtation/conclusions

27

Recommandations/actions requises

21

Concision

21

Bien prsent

19

Bon rsum
Taille de lchantillon

18
100

* Rponses une question ouverte. Les personnes sondes ont mentionn plusieurs facteurs de sorte que le
total ne correspond pas 100.
Source: Hague (2006).

82

Caractrisation phnotypique des ressources gntiques animales

En plus du texte, les rsultats doivent tre prsents le cas chant sous forme de
graphiques et de tableaux. Les graphiques ont plus dimpact que les tableaux car ils simplifient la lecture des donnes et prsentent les principales conclusions sous forme dimages.
Inversement, un tableau peut contenir beaucoup plus dinformations quun graphique
tout en restant intelligible. Une attention particulire doit tre accorde la faon dont
les tableaux sont disposs, car cela affecte leur facilit ou difficult tre lus. Si possible,
les tableaux doivent non seulement prsenter les valeurs moyennes des mesures phnotypiques des populations slectionnes, mais aussi ltendue et lampleur des variations
autour de ces moyennes. Les chiffres figurant dans les tableaux doivent tre prsents sous
un format standard pour faciliter les mta-analyses et la comparaison entre les tudes.
La prsentation doit tre centre sur la mthodologie, les rsultats de lanalyse et
leur interprtation. Lencadr 11 fournit un aide-mmoire qui vous aidera faire en sorte
que cette partie du rapport remplisse son objectif. Le rapport doit, autant que possible,
contribuer lidentification des prochaines tapes logiques dans la gestion des ressources
zoogntiques.
Le rapport doit indiquer o et comment les copies lectroniques et les copies papier
des donnes brutes sont archives en toute scurit pour une utilisation future. Avec les
progrs rapides des outils danalyse statistique et de la capacit informatique, les donnes
de caractrisation des races provenant de diffrentes sources peuvent tre combines pour
analyser les volutions long terme des caractristiques des populations constitutives des
ressources zoogntiques, par exemple face la dgradation de lenvironnement et au
changement climatique.
Il faut envisager la manire dont les rsultats de ltude peuvent tre utiliss pour amliorer lenregistrement des donnes sur les races et les milieux de production du pays dans
DAD-IS. Les Coordonnateurs nationaux pour la gestion des ressources zoogntiques (ou
leurs collgues en charge) sont responsables de lentre des donnes dans DAD-IS (ou un
systme dinformation associ FABISnet). Lquipe de recherche doit veiller ce que la prsentation des donnes dans le rapport final permette de les transfrer efficacement dans de
tels systmes dinformation (par exemple, des tableaux de rsultats qui refltent les crans
de saisie de donnes dans DAD-IS).

PRODUITS DE COMMUNICATION SUPPLMENTAIRES


Lquipe doit tenter didentifier les messages pertinents pour certains groupes de parties
prenantes. On peut prparer un tableau dans lequel les lignes reprsentent les diffrents
rsultats de ltude et les colonnes reprsentent les diffrents groupes de parties prenantes
(collectivits dleveurs, dcideurs, services de vulgarisation, services de sant animale,
ducateurs, partenaires internationaux, grand public, etc.) Pour chaque cellule du tableau,
lquipe peut alors se demander si les rsultats du projet sont pertinents pour le groupe
de parties prenantes concernes. Aprs avoir fait correspondre les rsultats de ltude aux
groupes dintervenants, il faut rdiger les messages spcifiques destins chaque groupe.
Cela peut tre fait en prparant un autre tableau de groupes dintervenants et en listant
la gamme des messages pertinents pour chacun deux. Ces mthodes sont dtailles de
manire plus approfondie dans FAO (2012).

Rapports et communication

83

ENCADR 11

Aide-mmoire pour rdiger le rapport sur lanalyse des donnes


1. Les objectifs de ltude figurent-ils dans la liste?
2. Le cadre de lchantillonnage et les autres mthodologies de terrain sont-ils
dcrits de manire adquate?

3. La description des mthodes statistiques est-elle adquate, y compris les


mthodes utilises pour le nettoyage ou la transformation des donnes, afin
quelles puissent tre rptes sans laide dun autre analyste?

4. Le choix des modles statistiques est-il justifi?


5. Est-ce que les hypothses sous-tendant les modles sont lists?
6. Les modles ajusts rpondent-ils aux objectifs fixs et reconnaissent-ils toutes
les variables de ltude?

7. Est-ce-que les rsultats dcrits dans le rapport:


rpondent aux objectifs de ltude et aux questions souleves;
fournissent des mesures de confiance pour les estimations et les prvisions
faites;
valuent les biais possibles et leur ampleur potentielle;
valuent les effets que des hypothses invalides du modle auraient sur les
rsultats;
identifient les sources derreur exprimentales importantes et, le cas
chant, comment celles-ci peuvent tre mieux contrles dans les tudes
futures;
signalent les rsultats inexpliqus qui mritent une enqute plus approfondie pour dterminer sils sont les artefacts dun dfaut de conception ou un
rsultat inattendu mais rel;
identifient les mesures durgence qui peuvent tre ncessaires la suite de
lanalyse?

8. A-t-on envisag de personnaliser la prsentation des rsultats pour certaines


parties prenantes?
Source: adapt de FAO (2012).

Une fois que les messages pour chaque groupe de parties prenantes ont t dfinis, des
moyens de communication appropris doivent tre choisis en tenant compte des cots, de
lampleur de la couverture dsire et de limpact probable sur les bnficiaires. Les points forts
et les faiblesses des diffrents moyens de communication sont rcapituls dans le tableau 4.
La tlvision, la radio, les e-mail ou le Web peuvent tre utiliss pour diffuser du matriel
audio, des images ou des informations textuelles. Certains pays peuvent avoir des systmes

Caractrisation phnotypique des ressources gntiques animales

84

nationaux dinformation pour les ressources zoogntiques dans lesquels les donnes et
images peuvent tre publies. Les documents imprims et reproduits (CD-ROM, DVD)
doivent tre dvelopps, conus, produits et distribus en nombre suffisant. Les cots
engendrs et lexpertise ncessaire pour chaque tape du dveloppement du produit
doivent tre identifis et planifis.
TABLEAU 4

Moyens de communication forces et faiblesses


Mthodes de communication

Forces

Faiblesses

Rencontres face face

- interactivit
-e
 ncouragement de la
collaboration
- impact plus direct
-p
 ossibilit de distribution de
documents imprims ou dautres
matriels de communication

- plus coteux

- moins coteux
- diffusion largie
- continuit

- aucune interactivit

- moins coteux
- diffusion largie
- continuit

- aucune interactivit
- besoins technologiques levs
- impact moins direct

- diffusion largie
- continuit

- peu de frais de gestion


- diffusion largie
- continuit

- c ots initiaux levs pour tablir un


systme national**
-b
 esoins technologiques levs pour
tablir un systme national**
- impact moins direct

- confrences
- ateliers
- journes sur le terrain
- expositions, marchs
- activits de vulgarisation

- plus difficile organiser


- chancier prcis
- diffusion plus limit
- vnements uniques

- formations et dmonstrations
Matriel imprim
- documents dorientation
- prospectus, brochures

- impact moins direct

- rapports
- livres
- r evues scientifiques (nationales,
internationales)*
- presse agricole
- journaux locaux
- journaux nationaux
Audio:
- radio
- CD-ROM
- lecture de flux audio sur internet
Film:
- tlvision
- DVD
- lecture de flux vido sur internet
Systme dinformation sur le web:
- national
- international (par exemple
DAD-IS)

cots initiaux levs


aucune interactivit
besoins technologiques levs
impact moins direct

* La FAO supervise la publication de la revue Ressources gntiques animales (pour de plus amples informations, envoyez
un e-mail AnGR-Journal@fao.org).
** DAD-IS et le systme dinformation FABISnet connexe ont dj t mis en place si bien que les cots supplmentaires et
les besoins technologiques sont faibles.
Source: adapt de FAO (2012).

Rapports et communication

Quel que soit le moyen de communication choisi, les rsultats doivent tre rsums et
prsents de manire simple et comprhensible, en tenant compte des objectifs de ltude.
Des graphiques, tableaux, images et encadrs attrayants attirent lattention des lecteurs et
les aident se rappeler des messages cls.
Avant de finaliser et mettre en uvre la stratgie de communication, il faut envisager
les impacts potentiels sur les diffrents groupes de parties prenantes. Par exemple, la
publication de la dcouverte de nouvelles races via les mdias de masse peut conduire
une attention non dsire et des perturbations au sein des communauts dleveurs
concernes. Si ces impacts sont prvus, les personnes susceptibles dtre affectes doivent
tre consultes sur ce quelles jugent appropri et la manire dont elles aimeraient que le
processus soit gr5.

LA VOIE SUIVRE INTGRER LES RESULTATS DE LTUDE DANS LES


FUTURS PROJETS
En plus de la prparation du matriel de communication pour les diffrents groupes dintervenants, lquipe doit examiner si certaines parties prenantes impliques dans les activits, prvues ou en cours, de gestion des ressources zoogntiques ou de dveloppement
de llevage doivent participer activement la promotion de lutilisation des rsultats de
ltude et la planification des prochaines tapes.
Les liens entre ltude de caractrisation et les stratgies nationales concernes
devraient avoir t clarifis lors de la phase de planification, mais les options concernant
lutilisation des rsultats de ltude doivent galement tre examines la fin du processus
et discutes avec les parties prenantes concernes. Les candidats pouvant participer cette
discussion doivent avoir t identifis dans linventaire des parties prenantes tabli durant la
phase de planification de ltude (voir la section B) et inclure les personnes impliques dans:
les projets damlioration gntique concernant la population couverte par ltude;
les projets de dveloppement rural avec des composantes de gestion des ressources
zoogntiques;
les programmes de repeuplement du btail mis en uvre la suite de catastrophes;
la prestation de services de sant animale et de surveillance des maladies;
lorganisation de recensements et denqutes dans le milieu agricole ou de llevage;
les programmes de conservation des ressources zoogntiques.
Une bonne faon de promouvoir lutilisation des rsultats de ltude est dorganiser un
atelier au cours duquel les rsultats sont prsents et les implications pour les travaux futurs
sont discutes avec un ventail de parties prenantes. Si des actions de suivi immdiates
sont ncessaires, latelier sera loccasion pour lquipe dalerter et de consulter les parties
prenantes concernes.
En dfinissant le champ de ltude de caractrisation phnotypique (section B),
lquipe, en accord avec les parties prenantes participantes, aura dcid de faire une tude

Notez que dans tous les cas, la dsignation et la prsentation des nouvelles races ncessite la consultation et
lapprobation des autorits nationales comptentes ou dun organisme mandat comme le Comit consultatif
national pour les ressources zoogntiques.

85

86

Caractrisation phnotypique des ressources gntiques animales

de caractrisation primaire ou avance. Dans le premier cas, sil est question de mener des
actions de suivi aprs ltude, il faudra dcider de la possibilit de mener une tude de
caractrisation avance plus approfondie sur les populations animales cibles. Cette dcision doit tre prise en collaboration avec les diffrentes parties prenantes qui pourraient
utiliser les rsultats ou tre impliques dans la mise en uvre de ltude. Les comits ou
groupes de travail supervisant les stratgies et les plans nationaux pour le dveloppement
de llevage et la gestion des ressources zoogntiques doivent galement tre consults.

Rfrences et annexes

89

Rfrences bibliographiques

ACO. 2006. Pakistan Livestock Census 2006. Agricultural Census Organization of the Government of Pakistan, Lahore, Pakistan.
Agyemang, K., Dwinger, R.H., Little, D.A. et Rowlands, G.J. 1997. Village NDama cattle production in West Africa. Six years of research in the Gambia. International Livestock
Research Institute, Nairobi.
Aldenderfer, M.S. et Blashfield, R.K. 1984. Cluster analysis. Sage University Paper Series on
Quantitative Applications in the Social Sciences, 07-044. Sage Publications Ltd, Beverly Hills,
tats-Unis dAmrique et Londres.
Ayalew, W., King, J., Bruns, E. et Rischkowsky, B. 2003. Economic evaluation of smallholder
subsistence livestock production: lessons from an Ethiopian goat development program. Ecological Economics, 45(3): 331339.
Ayalew, W. et Rowlands, J. (eds.). 2004. Design, execution and analysis of the livestock breed
survey in Oromia Regional State, Ethiopia. Oromia Agricultural Development Bureau et International Livestock Research Institute, Addis Ababa et Nairobi.
Ayalew, W., Peacock, C., Alemayehu, N., Reda, A. et Rey, B. 2000. The characterization
of indigenous goat types of Ethiopia and Eritrea. Dans R. Blench et K. MacDonald, eds. The
origins and development of African livestock: archaeology, linguistics and ethnography, pp.
280289. University College London Press, Taylor & Francis Group, Londres.
Blench, R. 1999. Traditional livestock breeds: geographical distribution and dynamics in relation
to the ecology of West Africa. Working Paper 122. Overseas Development Institute, Londres.
Cochran, W.G. 1977. Sampling techniques. 3e dition. Wiley and Sons, New York, tats Unis
dAmrique.
da Costa, P. 2009. Study on communicating development results. Command par lOECD DAC
Development Co-operation Directorate & DevCom Network. The 2009 Annual Meeting of the
Informal Network of DAC Development Communicators, 810 Novembre, Dublin.
Dadi, H., Tibbo, M., Takahashi, Y., Nomura, K., Hanada, H. et Amano, T. 2008. Microsatellite analysis reveals high genetic diversity but low genetic structure in Ethiopian indigenous
cattle populations. Animal Genetics, 39(4): 425431.
Dobzhansky, T. 1951. Genetics and origin of species. 3e dition. Columbia University Press,
New York, tats-Unis dAmrique.
Drucker, A., Gomez, V. et Anderson, S. 2001. The economic valuation of farm animal genetic
resources: a survey of available methods. Ecological Economics, 36(1): 118.
Drucker, A.G. et Anderson, S. 2004. Economic analysis of animal genetic resources and the
use of rural appraisal methods: lessons from South-East Mexico. International Journal of Sustainable Agriculture, 2(2): 7797.

Caractrisation phnotypique des ressources gntiques animales

90

Dunteman, G.H. 1989. Principal components analysis. Sage University Paper Series on Quantitative Applications in Social Sciences, 07-069. Sage Publications Ltd, Thousand Oaks, Californie,
Etats Unis dAmrique.
FAO. 1984a. Animal genetic resources conservation by management, databanks and training.
Partie 1. tude FAO: Production et sant animales No. 44/1. Rome.
FAO. 1984b. Animal genetic resources: cryogenic storage of germplasm and molecular engineering. Partie 2. tude FAO: Production et sant animales No. 44/2. Rome.
FAO. 1986a. Animal genetic resource data banks. 1. Computer systems study for regional data
banks. FAO tude FAO: Production et sant animales No. 59/ 1. Rome.
FAO. 1986b. Animal genetic resource data banks. 2. Descriptor lists for cattle, buffalo, pigs,
sheep and goats. tude FAO: Production et sant animales No. 59/2. Rome.
FAO. 1986c. Animal genetic resource data banks. 3. Descriptor lists poultry. tude FAO: Production et sant animales No. 59/3. Rome.
FAO. 1991. Small ruminant production and the small ruminant genetic resource in tropical Africa, de R. T. Wilson. tude FAO: Production et sant animales No. 88. Rome.
FAO. 1992. The management of global animal genetic resources. tude FAO: Production et
sant animales No. 104. Rome.
FAO.1996. Conducting agricultural censuses and surveys. Rome.
FAO.1999. The global strategy for the management of animal genetic resources: executive brief. Rome (disponible ladresse internet http://dad.fao.org/cgi-bin/getblob.cgi?sid=-1,50006152).
FAO. 2007. Plan daction mondial pour les ressources zoogntiques et la dclaration dInterlaken.
Rome (disponible ladresse internet http://www.fao.org/docrep/010/a1404f/a1404f00.htm).
FAO. 2009a. Rapport de la douzime session ordinaire de la Commission des ressources gntiques pour lalimentation et lagriculture, Rome (Italie), 19-23 octobre 2009 (CGRFA-12/09/
Rapport). Rome (disponible ladresse internet ftp://ftp.fao.org/docrep/fao/meeting/017/
k6536f.pdf).
FAO. 2009b. Prparation de stratgies et de plans daction nationaux pour les ressources zoogntiques. Directives FAO: Production et sant animales. Numro 2. Rome (disponible
ladresse internet http://www.fao.org/docrep/012/i0770f/i0770f00.htm).
FAO. 2011. Molecular genetic characterization of animal genetic resources. FAO Animal Production and Health Guidelines No. 9. Rome (disponible ladresse internet http://www.fao.org/
docrep/014/i2413e/i2413e00.htm).
FAO. 2012. Ralisation denqutes et de suivi pour les ressources zoogntiques. Directives FAO:
Production et sant animales. Numro 7. Rome (disponible ladresse internet http://www.
fao.org/docrep/015/ba0055f/ba0055f00.htm).
FAO/UNEP. 1998. Primary guidelines for development of national farm animal genetic resources
management plans. Rome.
FAO/WAAP. 2008. Production Environment Descriptors for Animal Genetic Resources. Report
of the FAO/WAAP Workshop held in Capralola, Italy, 6-8 may 2008, dit par D. Pilling, B.
Rischkowsky et B. Scherf. Rome.
FARM Africa et ILRI. 1996. Goat types of Ethiopia and Eritrea. Physical description and management systems. London, FARM-Africa et Nairobi, International Livestock Research Institute.

Rfrences

Gebremichael, S. 2008. Sheep resources of Ethiopia: genetic diversity and breeding strategy.
Wageningen University, Animal Genetics and Genomics Centre. Wageningen, Pays-Bas.
(Thse de doctorat)
Hague, P. 2006. A practical guide to market research. Free e-book (disponible ladresse internet http://www. b2binternational.com/library/books/pub_free2.php).
Halima-Hassen, M. 2007. Phenotypic and genetic characterization of indigenous chicken
populations in northwest Ethiopia. Faculty of Natural and Agricultural Sciences, Department
of Animal, Wildlife and Grassland Sciences. University of the Free State, Bloemfontein, Afrique
du Sud. (Thse de PhD)
Herrera, M., Rodero, E., Gutierrez, M.J., Pea, F. et Rodero, J.M. 1996. Application of multifactorial discriminant analysis in the morphostructural differentiation of Andalusian caprine
breeds. Small Ruminant Research, 22: 3947.
Klecka, W.P. 1980. Discriminant analysis. Sage University Paper Series on Quantitative Applications in the Social sciences, 07-019. Sage Publications, Beverly Hills, Etats Unis dAmrique
et Londres.
Khler-Rollefson, I. 1997. Indigenous practices of animal genetic resource management and
their relevance for the conservation of domestic animal diversity in developing countries.
Journal of Animal Breeding and Genetics, 114: 231238.
Khler-Rollefson, I. et LIFE Network. 2007. Keepers of genes. The interdependence between
pastoralists, breeds, access to the commons, and livelihoods. The Life Network, Sadri,
Rajasthan, Inde (disponible ladresse internet www.pastoralpeoples.org/docs/keepersofgenes_web.pdf).
LDG. 2003. The livestock and poverty assessment methodology. A toolkit for practitioners. Livestock Development Group, University of Reading, Reading, Royaume-Uni (disponible ladresse
internet http://r4d.dfid.gov.uk/PDF/Outputs/AnimalHealth/LivestockPA_Manual.pdf).
LPPS et Khler-Rollefson, I. 2005. Indigenous breeds, local communities: Documenting animal breeds and breeding from a community perspective. Lokhit Pashu-Palak Sansthan, Sadri,
Rajasthan, Inde.
Ndumu, D.B., Baumung, R., Hanotte, O., Wurzinger, M., Okeyo, M.A., Jianlin, H., Kibogo,
H. et Solkner, J. 2008. Genetic and morphological characterization of the Ankole Longhorn
cattle in the African Great Lakes region. Genetics Selection Evolution, 40: 467490.
Osaer, S., Goossens, B., Eysker, M. et Geerts, S. 2000. The effects of prophylactic anthelmintic treatment on the productivity of traditionally managed Djallonke sheep and West African
Dwarf goats kept under high trypanosomosis risk. Acta Tropica, 74(1): 1324.
Pieters, A., Van Marle-Koester, E., Visser, C. et Kotze, A. 2009. South African developed
meat type goats: a forgotten animal genetic resource? Animal Genetic Resources Information,
44: 3343.
Pimentel, R.A. 1979. Morphometrics: the multivariate analysis of biological data. Kendall/Hunt
Publishing Co, Dubuque, tats-Unis dAmrique..
Ribeiro, N.L., Medeiros, A.N., Ribeiro, M.N. et Pimenta Filho, E.C. 2004. Estimativas del
peso vivo de caprinos de razas autctonas brasileas a travs de medidas morfolgicas.
Archivos de Zootecnia, 53(203): 341344.

91

Caractrisation phnotypique des ressources gntiques animales

92

Rodero, E., Gonzlez, A., Luque, M., Herrera, M. et Gutirrez-Estrada, J.C. 2012. Classification of Spanish autochthonous bovine breeds. Morphometric study using classical and
heuristic techniques. Livestock science, 143(2):226-232.
Rowlands, J., Nagda, S., Rege, E., Mhlanga, F., Dzama, K., Gandiya, F., Hamudikwanda,
H., Makuza, S., Moyo, S., Matika, O., Nangomasha, E. et Sikosana, J. 2003. A report
to FAO on the design, execution and analysis of livestock breed surveys a case study in
Zimbabwe. International Livestock Research Institute, Nairobi.
Sneath, P.H.A. et Sokal, R.R. 1973. Numerical taxonomy. WH Freeman & Co, San Francisco,
tats-Unis dAmrique.
Stein, J., Ayalew, W., Rege, J.E.O., Mulatu, W., Malmfors, B., Dessie, T. et Philipsson, J.
2009. Livestock keeper perceptions of four indigenous cattle breeds in tsetse infested areas
of Ethiopia. Tropical Animal Health and Production, 41(7): 13351346.
Tixier-Boichard, M., Ayalew, W. et Jianlin, H. 2007. Inventory, characterization and monitoring. Animal Genetic Resources Information, 42: 2947.
Tucho, T.A. 2004. Genetic characterization of indigenous goat populations of Ethiopia using
microsatellite DNA markers. The National Dairy Research Institute. Karnal, Haryana, Inde.
(Thse de doctorat)
University of Reading. 2001. Disciplined use of spreadsheet packages for data entry. Statistical
Services Centre, University of Reading, Reading, Royaume-Uni.
Wuletaw, Z., Ayalew, W. et Soelkner, J. 2008. The Mahibere-Silassie composite: a new cattle
breed type in north-western Ethiopia. Ethiopian Journal of Animal Production, 8(1): 3951.
Yapi-Gnaore, C.V. Rege, J.E.O. et Alemayehu, N. 1997a. Analysis of an open nucleus-breeding programme for Djallonke sheep in the Ivory Coast. 2. Response to selection on body
weights. Animal Science, 64(2): 301307.
Yapi-Gnaore C.V., Rege, J.E.O. et Dagnogo, B. 1997b. Analysis of an open nucleus-breeding
programme for Djallonke sheep in the Ivory Coast. 1. Examination of non-genetic factors.
Animal Science, 64(2): 291300.
Zaitoun, I.S., Tabbaa, M. et Bdour, S. 2005. Differentation of native goats breeds of Jordan on
the basis of morphostructural characteristics. Small Ruminant Research, 56: 173182.

93

Annexe 1

Liste de contrle pour la


caractrisation phnotypique des
bovins
DIRECTIVES GNRALES
Cette liste de contrle est conue comme un guide. Elle doit tre adapte votre
situation et transforme en questionnaire. Les diffrentes catgories doivent tre
enregistres en utilisant des codes appropris (par exemple pour le sexe: 1 = mle, 2
= femelle, 3 = castr).
Les mesures corporelles ne doivent tre prises que sur un ensemble reprsentatif
danimaux adultes (ge estim partir de lexamen de la denture): environ 100 300
femelles et 10 30 mles.
Les mensurations sur les animaux matures doivent au minimum inclure la longueur
du corps, la hauteur au garrot, le tour de poitrine, la longueur de loreille, la longueur de la corne, le tour de museau et le tour de jarret, qui peuvent tre pris au
centimtre prs laide dun mtre ruban. La pese est limite par la disponibilit des
ponts-bascules. Cependant, lorsquil est possible de la faire, il faut galement essayer
didentifier les animaux selon leur ge, ou du moins selon leur denture.
Les mesures doivent tre prises tt le matin pour viter que les mensurations et la
conformation de lanimal soient modifies par la consommation deau et daliments.
Il faut enregistrer des informations descriptives sur leffectif et la structure habituels
des troupeaux, ainsi que sur les diffrentes utilisations des animaux.
Les mesures doivent tre prises lorsque les animaux sont attachs ou confins dans des
tables ou kraals. Il est prfrable dviter deffectuer les mesures sur un animal nerveux.

VARIABLES DISCRTES OU QUALITATIVES


Sexe: femelle, mle, castr
ge estim ou catgorie de denture
Motif de la robe: uni, panachures/ pie, mouchet (petites taches)
Couleur de la robe: noire, rouge fonc, rouge clair, fauve, grise
Couleur de la peau: pigmente, non pigmente
Couleur du mufle: pigment, non pigment
Couleur des paupires: pigmentes, non pigmentes
Couleur des sabots: pigments, non pigments
Prsence de cornes: absentes, prsentes
Couleur des cornes: noires, brunes, blanches

Caractrisation phnotypique des ressources gntiques animales

94

Prsence de cornes (au niveau du troupeau; sparment pour les mles et les
femelles): pourcentage danimaux sans corne, pourcentage danimaux avec cornes
Attache des cornes (au niveau du troupeau; sparment pour les mles et les
femelles): pourcentage de cornes flottantes, pourcentage de cornes fixes
Forme de la corne: droite, courbe, en forme de lyre, flottante, moignon, sans corne
Orientation de la corne (au niveau du troupeau; sparment pour les mles et les
femelles): extrmits pointant latralement, vers le haut, vers le bas, en avant, en
arrire (indiquer galement si lanimal na pas de cornes, si les cornes sont flottantes,
ou si les cornes sont juste des moignons)
Type de poil:
--brillance: brillant, mat
--frisure: fris, raide
Longueur du poil: moyen (1-2 mm), long (> 2 mm)
Forme de loreille: arrondie, bords droits
Orientation de loreille: dresse, latrale, tombante
Taille de la bosse: absente, petite, moyenne, grande
Forme de la bosse: absente, dresse, tombante (en arrire, sur le ct)
Position de la bosse: thoracique, cervico-thoracique
Profil facial (tte): droit, concave, convexe, ultra-convexe
Taille du fanon: absent, petit, moyen, grand
Profil de la ligne du dos: droit, descend vers la croupe, descend partir du garrot,
creus (incurv)
Profil de la croupe: plat, inclin, pointu
Repli ombilical (pour les vaches): absent, petit, moyen, grand
Fourreau (pour les taureaux): absent, petit, moyen, grand
Longueur de la queue: courte (au-dessus des jarrets), moyenne (au niveau des jarrets),
longue (sous les jarrets)

VARIABLES QUANTITATIVES
Poids vif (si un pont-bascule est disponible) en spcifiant lge
Mensurations chez les mles et les femelles adultes ( 0,5 cm prs):
--tour de poitrine
--longueur du corps
--hauteur au garrot
--tour de museau
--tour de jarret

DONNES AU NIVEAU DU TROUPEAU


Temprament habituel: docile, moyennement docile, sauvage
Tous les caractres dadaptation connus6:

Pour des variables plus dtailles sur les caractres dadaptation, voir la partie V de lannexe 5.

Annexe 1 Liste de contrle pour la caractrisation phnotypique des bovins

--tolrance ou rsistance aux maladies et aux parasites


--tolrance la scheresse
--tolrance la chaleur
Type dexploitation: ferme paysanne, centre dlevage, exploitation commerciale,
station exprimentale, station de multiplication
Pratique daccouplement:
--non contrl, non saisonnier, accouplement naturel
--non contrl, saisonnier, accouplement naturel (plusieurs mles reproducteurs)
-- non contrl, saisonnier, accouplement naturel (un mle reproducteur par troupeau)
--monte en main
--insmination artificielle utilise pour au moins une partie du troupeau
Effectif du troupeau
Composition du troupeau (proportion dans le troupeau de):
--femelles reproductrices
--femelles de renouvellement
--mles reproducteurs
--mles non reproducteurs
--bufs (mles castrs)
--veaux femelles
--veaux mles
Image typique dune vache et dun taureau reproducteurs adultes avec un arrire-plan
permettant des comparaisons
Image typique du troupeau avec son milieu de production habituel en arrire-plan
Utilisation des animaux par ordre dimportance (lait, viande, traction, fumier, socioculturel, etc.)7
Type de traction: labour en zone aride, labour dans les rizires, transport, charriage,
transport de charges sur le dos, autres types de traction (prciser: pour le pompage,
meunerie, etc.)

DONNES RELATIVES LORIGINE ET AU DVELOPPEMENT8


Nom de la race de(s) lanimal(aux) slectionn(s)
Synonymes et noms locaux
Contexte pour chacun de ces noms
Races connues pour tre les plus troitement lies cette race
Origine de la race
Origine des animaux, sils sont imports (nom du pays et anne(s) dimportation)
Rpartition gographique dorigine de la race (si possible gorfrence)
Superficie approximative de la distribution (km2) de la race ou en termes de frontires
administratives
Noms des zones gographiques o cette race a t signale
7
8

Pour des variables plus dtailles sur lutilisation des animaux, voir la partie IV de lannexe 5.
Idalement obtenues grce aux groupes de discussion.

95

Caractrisation phnotypique des ressources gntiques animales

96

Estimation de leffectif de la race, accompagner de lanne de lestimation et de la


source/rfrence
Types de communauts ou exploitations qui lvent cette race: leveurs commerciaux, leveurs de subsistance, leveurs pastoraux, centres de slection, stations
exprimentales
Activits connues ou signales damlioration de la race
Mlanges ou croisements de la race (planifis ou alatoires), connus ou signals

DONNES RECUEILLIES SUR LES CARACTRES NCESSITANT DES MESURES


RPTES9
Les indicateurs de performance pour la reproduction et la production laitire sur une vache
choisie au hasard et sur la vache qui a le plus rcemment termin sa lactation:
Dure de la lactation
Production laitire moyenne quotidienne sur trois trimestres
Systme de traite utilis: traite la main avec le veau, traite la main sans le veau,
traite mcanique avec le veau, traite mcanique sans le veau, combinaisons de ces
diffrents systmes ( prciser)
Nombre total de naissances
ge de la vache (peut tre estim)
ge de la vache lors de la premire parturition (peut tre estim)
Nombre davortements
Caractristiques de carcasse (si disponible):
Poids labattage dun animal de boucherie (gnralement un mle engraiss,
prciser si diffrent)
Poids de la carcasse chaude
Poids de la carcasse froide
Rendement labattage

Daprs les leveurs.

Annexe 1 Liste de contrle pour la caractrisation phnotypique des bovins

ILLUSTRATIONS
Longueur du corps

Remarque: Pour obtenir une position debout correcte, les pattes postrieures de lanimal doivent tre rapproches.
Si une patte arrire est en avant de lautre, la mesure sera inexacte. Mesurer partir de la pointe de lpaule jusqu
lischion. Ces deux repres sont dots dune saillie osseuse facilement reprable pour obtenir une mesure exacte.

97

98

Caractrisation phnotypique des ressources gntiques animales

Hauteur au garrot

Remarque: positionner la barre au niveau de lpaule pour permettre une mesure correcte de la hauteur.

Tour de poitrine

Remarque: prendre la mesure juste derrire les pattes antrieures de lanimal.

Annexe 1 Liste de contrle pour la caractrisation phnotypique des bovins

Longueur de la corne

Remarque: mesurer la distance la plus longue de la racine de la corne son extrmit, en suivant la courbure
extrieure.

Longueur de loreille

Remarque: mesurer la longueur larrire de loreille, de la racine la pointe.

99

100

Caractrisation phnotypique des ressources gntiques animales

Largeur du bassin

Tour de museau

Remarque: prendre la mesure un peu au-dessus des naseaux et autour du point o le fanon rencontre le menton.

101

Annexe 2

Liste de contrle pour la


caractrisation phnotypique des
ovins et caprins
DIRECTIVES GNRALES
Cette liste de contrle est conue comme un guide. Elle doit tre adapte votre
situation et transforme en questionnaire. Il est recommand denregistrer les diffrentes catgories en utilisant des codes appropris (par exemple pour le sexe: 1 =
mle, 2 = femelle, 3 = castr).
Les mesures corporelles ne doivent tre prises que sur un ensemble reprsentatif
danimaux adultes (ge estim partir de lexamen de la denture): environ 100 300
femelles et 10 30 mles.
Les mensurations sur les animaux matures doivent au minimum inclure la longueur du
corps, la hauteur au garrot, le tour de poitrine, la longueur de loreille et la longueur
de la corne, qui peuvent tre pris au centimtre prs laide dun mtre ruban. La
pese est limite par la disponibilit en balances (balances ressort ou ponts-bascules). Cependant, lorsquil est possible de la faire, il faut galement essayer didentifier les animaux selon leur ge, ou du moins selon leur denture.
Les mesures doivent tre prises tt le matin pour viter que les mensurations et la
conformation de lanimal ne soient modifies par la consommation deau et daliments.
Il faut enregistrer des informations descriptives sur leffectif et la structure habituels
des troupeaux, ainsi que sur les utilisations des animaux.
Les mesures doivent tre prises lorsque les animaux sont attachs ou confins dans
des tables ou kraals. Il faut viter de prlever des mesures sur un animal nerveux.

VARIABLES DISCRTES OU QUALITATIVES


Sexe: femelle, mle, castr
ge estim ou catgorie de denture
Motif de la robe: unie, panachures/ pie, mouchet (petites taches)
Couleur de la robe: noir, rouge fonc, rouge clair, fauve, gris
Couleur de la peau: pigmente, non pigmente
Type de fibre (mouton)
--mouton poils
--mouton laine

. laine grossire, jarreuse/ tapis (environ 100 microns)

. laine croise (20-40 microns)

. laine fine (environ 15 microns)
Type de fibre (chvre): mohair/angora, cachemire

Caractrisation phnotypique des ressources gntiques animales

102

Type de poil (chvre): brillant, poil doux, poil long raide, poil dur fris, mat
Longueur du poil: moyen (1-2mm); long (>2mm)
Prsence de cornes (au niveau du troupeau; sparment pour les mles et les
femelles): pourcentage danimaux sans corne, pourcentage danimaux avec cornes
Forme de la corne: partielle, droite, courbe, en spirale, en tire-bouchon
Orientation de la corne (au niveau du troupeau; sparment pour les mles et les
femelles): latrale, oblique vers le haut, en arrire (indiquer galement si lanimal na
pas de cornes, si les cornes sont flottantes, ou si les cornes sont juste des moignons)
Orientation de loreille: dresse, semi-pendante, pendante, horizontale
Profil facial (tte): droit, concave, convexe, ultra-convexe
Pampilles (chvres): absentes, prsentes
Barbe (chvres): absente, prsente
Collerette: absente, prsente
Type de queue (mouton): fine, avec une croupe grasse, paisse la base, grasse
forme de la queue (mouton): cylindrique et droite, cylindrique avec lextrmit recourbe vers le haut, bilobe sans appendice, large sans lobe
Profil de la ligne du dos: droit, descend vers la croupe, descend partir du garrot,
creus (incurv)
Profil de la croupe: plat, pentu, pointu

VARIABLES QUANTITATIVES
Poids vif (si une balance ou un pont-bascule est disponible) en spcifiant lge
Taille du corps chez les mles et les femelles adultes ( 0,5 cm prs):
--longueur du corps
--hauteur au garrot
--tour de poitrine
--profondeur de poitrine
--cart entre les pointes des paules
--longueur de la croupe
--largeur de la croupe
--longueur de la tte
--largeur de la tte
--tour du canon
--longueur de la corne
--longueur de loreille
--longueur de la queue (mouton)
--longueur du poil/ laine (sur la ligne du dos, sur la croupe)

DONNES AU NIVEAU DU TROUPEAU


Temprament habituel: docile, moyennement docile, sauvage
Tous les caractres dadaptation connus10:
10

Pour de plus amples dtails sur les caractres dadaptation, voir la partie V de lannexe 5.

Annexe 2 Liste de contrle pour la caractrisation phnotypique des ovins et caprins

--tolrance ou rsistance aux maladies et aux parasites


--tolrance la scheresse
--tolrance la chaleur
Type dexploitation: exploitation paysanne, centre de slection, exploitation commerciale, station exprimentale, station de multiplication
Pratique daccouplement:
--non contrl, non saisonnier, accouplement naturel
--non contrl, saisonnier, accouplement naturel (plusieurs mles reproducteurs)
--non contrl, saisonnier, accouplement naturel (un mle reproducteur par troupeau)
--monte en main
--insmination artificielle utilise pour au moins une partie du troupeau
Effectif du troupeau
Composition du troupeau (proportion dans le troupeau de):
--femelles reproductrices
--femelles de renouvellement
--mles reproducteurs
--mles non reproducteurs
--mles castrs
--agneaux/chevreaux femelles
--agneaux/chevreaux mles
Image typique dune brebis (chvre) et dun blier (bouc) reproducteurs adultes avec
un arrire-plan permettant des comparaisons
Image typique du troupeau avec son milieu de production habituel en arrire-plan
Utilisation des animaux par ordre dimportance (lait, viande, fibre, traction, fumier,
socioculturel, etc.)11

DONNES RELATIVES LORIGINE ET AU DVELOPPEMENT12


Nom de la race de(s) lanimal(aux) slectionn(s)
Synonymes et noms locaux
Contexte pour chacun de ces noms
Races connues pour tre les plus troitement lies cette race
Origine de la race
Origine des animaux, sils sont imports (nom du pays et anne(s) dimportation)
Rpartition gographique dorigine de la race (si possible gorfrence)
Superficie approximative de la distribution (km2) de la race ou en termes de frontires
administratives
Noms des zones gographiques o cette race a t signale
Estimation de leffectif total de la race, accompagn de lanne de lestimation et de
la source/rfrence
11
12

Pour de plus amples dtails sur lutilisation des animaux, voir la partie IV de lannexe 5.
Idalement obtenues grce aux groupes de discussion.

103

Caractrisation phnotypique des ressources gntiques animales

104

Types de communauts ou exploitations qui lvent cette race: leveurs commerciaux, leveurs de subsistance, leveurs pastoraux, centres de slection, stations
exprimentales
Activits connues ou signales damlioration de la race
Mlanges ou croisements de la race (planifis ou alatoires), connus ou signals

DONNES RECUEILLIES SUR LES CARACTRES NCESSITANT DES MESURES


RPTES13
Les indicateurs de performance pour la reproduction et la production laitire (si les brebis/
chvres sont traites) sur une femelle adulte choisie au hasard et sur la femelle adulte qui a
le plus rcemment termin sa lactation:
Dure de la lactation
Production laitire moyenne quotidienne sur trois trimestres
Systme de traite utilis: traite la main avec lagneau/le chevreau, traite manuelle
sans lagneau/le chevreau, traite mcanique avec lagneau/le chevreau, traite mcanique sans lagneau/le chevreau, combinaisons de ces diffrents systmes ( prciser)
Nombre total de naissances dagneaux/chevreaux
ge de la brebis/chvre (peut tre estim)
ge de la brebis/chvre lors de la premire parturition (peut tre estim)
Nombre davortements
Caractristiques de carcasse (si disponible):
Poids labattage dun animal de boucherie (gnralement un mle engraiss, prcis si diffrent)
Poids de la carcasse chaude
Poids de la carcasse froide
Rendement labattage
Estimations des performances de reproduction pour deux brebis ou chvres, une slectionne au hasard et une autre qui vient de mettre bas rcemment:
ge de la brebis/chvre au premier agnelage/mise-bas
ge actuel de la brebis/chvre (peut tre estim)
Nombres dagnelages/mises-bas observs et taille de chaque porte (nombre
dagneaux/chevreaux ns)
Nombre davortements
Nombres dagneaux/chevreaux sevrs depuis le dernier agnelage/mise bas

13

Daprs les leveurs.

Annexe 2 Liste de contrle pour la caractrisation phnotypique des ovins et caprins

ILLUSTRATIONs
Longueur du corps mouton

Longueur du corps chvre

105

106

Caractrisation phnotypique des ressources gntiques animales

Hauteur au garrot

Remarque: le mtre doit tre tenu verticalement et ne doit pas tre courb le long des paules de lanimal.

Annexe 2 Liste de contrle pour la caractrisation phnotypique des ovins et caprins

Tour de poitrine mouton

Remarque: appuyer doucement pour tre sr que lpaisseur de la laine ne fausse pas la mesure.

Tour de poitrine chvre

107

108

Caractrisation phnotypique des ressources gntiques animales

Longueur de la corne mouton

Remarque: mesurer la distance la plus longue de la racine de la corne son extrmit en suivant la courbure extrieure.

Longueur de la corne chvre

Remarque: mesurer la distance la plus longue de la racine de la corne son extrmit en suivant la courbure extrieure.

Annexe 2 Liste de contrle pour la caractrisation phnotypique des ovins et caprins

Longueur de loreille mouton

Remarque: mesurer la longueur larrire de loreille, de la racine la pointe.

Longueur de loreille chvre

Remarque: mesurer la longueur larrire de loreille, de la racine la pointe.

109

110

Caractrisation phnotypique des ressources gntiques animales

Largeur du bassin mouton

Largeur du bassin chvre

Annexe 2 Liste de contrle pour la caractrisation phnotypique des ovins et caprins

Longueur du trayon (pour les chvres laitires)

111

113

Annexe 3

Liste de contrle pour la


caractrisation phnotypique
des poulets
DIRECTIVES GNRALES
Cette liste de contrle est conue comme un guide. Elle doit tre adapte votre
situation et transforme en questionnaire. Il est recommand denregistrer les diffrentes catgories en utilisant des codes appropris (par exemple pour le sexe: 1 =
mle, 2 = femelle, 3 = castr).
Les mesures corporelles ne doivent tre prises que sur un ensemble reprsentatif
danimaux adultes (ge estim partir de la taille de la crte et des barbillons): environ 100 300 femelles et 10 30 mles.
Les mensurations sur les animaux matures doivent au moins inclure la longueur du
corps, la longueur du tarse, lenvergure des ailes et le tour de poitrine, qui peuvent
tre pris au centimtre prs laide dun mtre ruban. La pese doit tre effectue en
collectant en mme temps des informations sur lge des animaux.
Des informations descriptives doivent tre collectes sur leffectif et la structure habituels de llevage, ainsi que sur les utilisations des animaux.

VARIABLES DISCRTES OU QUALITATIVES


Morphologie de la plume: normale, frise, soyeuse
Distribution du plumage: normal, cou nu, plumes sur les tarses et les doigts, favoris et barbe, huppe, bottes de vautour (= manchettes; longues plumes rigides qui
dpassent en arrire et en-dessous de larticulation du pilon [jarret])
Motif du plumage (motifs sur les plumes, en indiquant le cas chant leur emplacement spcifique sur le corps des oiseaux): uni, barrure (prciser si lie au sexe ou
autosomale),dentel (lac), caillout
Couleur du plumage: blanc, noir, bleu, rouge, froment
Couleur de la peau: non pigmente (blanche), jaune, bleue-noire
Couleur du tarse: blanc, jaune, bleu, vert, noir, brun
Couleur des oreillons: non pigment (blanc), rouge, blanc et rouge
Type de crte: unique, en pois, rosace, en noix, en coussin, en fraise, double, double
en cornes (en V), double en couronne (en coupe)
Taille de la crte: petite, moyenne, grande
Couleur des yeux (frquence phnotypique, %)

Caractrisation phnotypique des ressources gntiques animales

114

Variants squelettiques (frquence phnotypique, %): normal, hernie cphalique


(associe la huppe), polydactylie, doigts supplmentaires, pattes courtes, naine, sans
croupion (absence de queue), ergots multiples
Autres caractres visibles spcifiques et distincts

VARIABLES QUANTITATIVES
Poids vif, si une balance ou pont-bascule est disponible
Mensurations chez les mles et les femelles adultes ( 0,5 cm prs):
--longueur du corps (longueur entre lextrmit du rostrum maxillare (bec) et celle
de la cauda (queue, sans tenir compte des plumes); le corps de loiseau doit tre
tir sur toute sa longueur,
--tour de poitrine (pris la pointe du pectus [poitrine])
--longueur du tarse (longueur en cm du tarse depuis larticulation avec le pilon
jusqu lergot de chaque patte)
--envergure des ailes (longueur en cm entre les extrmits des ailes droite et gauche
aprs les avoir tires de tout leur long)

DONNES AU NIVEAU DU TROUPEAU


Tous les caractres dadaptation connus14:
--tolrance ou rsistance aux maladies et aux parasites
--tolrance aux tempratures extrmes
Type dexploitation: ferme paysanne, centre de slection, exploitation commerciale,
station exprimentale, station de multiplication
Effectif du troupeau
Composition du troupeau (proportion dans le troupeau de):
--poules
--poulettes
--coqs
--poussins
Images typiques dun coq et dune poule adultes avec un arrire-plan permettant des
comparaisons
Image typique dun troupeau avec son environnement de production habituel comme
arrire-plan
Notes sur les utilisations des animaux par ordre dimportance (par exemple la production de viande, dufs, de plumes, le rle socioculturel)15

DONNES RELATIVES LORIGINE ET AU DVELOPPEMENT16


Nom de la race des poulets chantillonns
Synonymes et noms locaux
Contexte de ces noms
14

Pour des questions plus dtailles sur les caractres dadaptation, voir la partie V de lannexe 5.
Pour plus de dtails sur les utilisations des animaux, voir la partie IV de lannexe 5.
16 Idalement obtenues grce aux groupes de discussion.
15

Annexe 3 Liste de contrle pour la caractrisation phnotypique des poulets

115

Races connues pour tre les plus troitement lies cette race
Origine de la race
Origine des animaux, sils sont imports (nom du pays et anne(s) dimportation)
Rpartition gographique de la race (si possible gorfrence)
Types de communauts ou dexploitations qui lvent la race: leveurs commerciaux,
leveurs de subsistance, centres de de slection, stations exprimentales
Estimation de leffectif total, accompagn de lanne de lestimation et de la source/
rfrence
Toute autre information spcifique la race

DONNES RECUEILLIES SUR LES CARACTRES QUI NECESSITENT DE


RPTER LES MESURES17
Caractristiques de la production dufs (N, moyenne, plage de variation et cart-type):
ge au premier uf (mois)
Production annuelle dufs
Taille des couves
Intervalle entre les couves (jours)
Caractres de qualit des ufs (N, moyenne, marge de variation et cart-type):
--Poids des ufs (g)
--Poids de la coquille (g)
--Poids de lalbumen (g)
--Poids du vitellus (g)
--Densit
--Couleur de la coquille (blanc/marron/crme ou teinte/autre)
--Index de la forme de luf18
Caractristiques de reproduction:
--Couvaison: courante, quelques fois, rarement
--Fertili et taux dclosion (%) (N, moyenne, marge de variation et cart-type):
Fertili (le pourcentage de fertilit correspond au pourcentage dufs fertiles
parmi les ufs produits)
Taux dclosion calcul partir des ufs fertiles
Taux dclosion calcul partir de tous les ufs produits
Caractristiques du poids vif et de croissance:
Poids vif

Mle
Moyenne

Plage de
variation

Femelle
N

Moyenne

Plage de
variation

closion (g)
8 semaines (g)
12 semaines (g)
Poids adulte (kg)

17
18

Daprs les leveurs.


Lindice de forme de luf est dfini comme la largeur moyenne de luf/ longueur moyenne de luf * 100.

Caractrisation phnotypique des ressources gntiques animales

116

Mortalit (%) (N, moyenne, plage de variation et cart-type):


--0 - 1 semaine
--1 - 8 semaines
--8 - 20 semaines
--20 - n semaines
Caractristiques des carcasses (N, moyenne, plage de variation et cart-type) pour les
mles et les femelles sparment:
--ge labattage
--Poids vif labattage
--Poids de carcasse (viscr)
Rendement labattage19

19

Le rendement labattage est la proportion, en pourcentage, du poids de la carcasse par rapport au poids vif
de lanimal, en spcifiant si oui ou non le poids labattage a t fait sur un animal jeun, et si la carcasse tait
chaude ou froide pendant la mesure.

Annexe 3 Liste de contrle pour la caractrisation phnotypique des poulets

ILLUSTRATIONs
Longueur du corps

Remarque: mesure de la pointe du bec lextrmit de la queue (sans tenir compte des plumes). Il faut tirer
compltement le cou (qui a une forme sigmodale), en tenant le poulet en position couche.

117

118

Caractrisation phnotypique des ressources gntiques animales

Envergure des ailes (vue de la face dorsale)

Envergure des ailes (vue de la face ventrale)

Remarque: la mesure est prise dans le dos de loiseau.

Annexe 3 Liste de contrle pour la caractrisation phnotypique des poulets

Tour de poitrine

Longueur du tarse

119

120

Caractrisation phnotypique des ressources gntiques animales

Poids vif (en utilisant une balance)

121

Annexe 4

Liste de contrle pour la


caractrisation phnotypique des
porcs
DIRECTIVES GNRALES
Cette liste de contrle est conue comme un guide. Elle doit tre adapte votre
situation et transforme en questionnaire. Il est recommand denregistrer les diffrentes catgories en utilisant des codes appropri (par exemple pour le sexe: 1 =
mle, 2 = femelle, 3 = castr).
Les mesures corporelles ne doivent tre prises que sur un ensemble reprsentatif
danimaux adultes (ge estim partir de lexamen de la denture): environ 100 300
femelles et 10 30 mles.
Les mensurations sur les animaux matures doivent au moins inclure la longueur du
corps, la hauteur au garrot, le tour de poitrine, la longueur de loreille et la longueur
de la queue, qui peuvent tre prises au centimtre prs laide dun mtre en tissu.
La pese est limite par la disponibilit de ponts-bascules. Cependant, lorsquil est
possible de la faire, il faut galement essayer didentifier les animaux selon leur ge,
ou au moins selon leur denture.
Les mesures doivent tre prises tt le matin pour viter que les mensurations et la
conformation de lanimal soient modifies par la consommation deau et daliments.
Il faut enregistrer des informations descriptives sur leffectif et la structure habituels
des troupeaux, ainsi que sur les utilisations des animaux.
Les mesures doivent tre prises lorsque les animaux sont attachs ou confins dans
des porcheries ou kraals. Il faut viter de prlever des mesures sur un animal nerveux.

VARIABLES DISCRTES OU QUALITATIVES


Poils: boucls, raides, courts, longs, denses, clairsems
Dfenses: prsentes, absentes
Museau: long et mince, court et cylindrique
Motifs de la robe: unie, pie, tchete
Couleur de la robe: blanc, noir, rouge fonc, rouge clair, fauve, gris
Profil de la tte: concave (bomb), droit, convexe
Type doreille: pendantes, semi-tombantes (par exemple Pitrain), tombantes, dresses
Orientation de loreille: vers lavant, vers larrire, vers le haut
Peau: lisse, ride

Caractrisation phnotypique des ressources gntiques animales

122

Type de queue: droite, en tire-bouchon (entortille)


Ligne du dos: droite, enselle (c.--d. nettement convexe ventralement)

VARIABLES QUANTITATIVES
Poids vif (si une balance ou un pont-bascule est disponible) avec lge spcifi
Mensurations corps pour un verrat et une truie adulte ( 0,5 cm prs):
--longueur du corps
--longueur de la tte
--longueur de la queue
--longueur de loreille: mesurer la longueur ou classer en tant que grand, moyen ou
petit
--tour de poitrine
--hauteur au garrot
--nombre de trayons: nombre de ttines normales et rudimentaires sur la truie ou la
cochette

DONNES SUR LE TROUPEAU


Temprament habituel: placide et sympathique, assez docile, agressif (sauvage)
Caractres dadaptation20:
--tolrance ou rsistance aux maladies et aux parasites
--tolrance la scheresse
--tolrance la chaleur
Type dexploitation (description gnrale du systme de production): ferme paysanne,
centre de slection porcine, station exprimentale, centre de multiplication, unit de
production commerciale
Pratique daccouplement:
--non contrl, non saisonnier, accouplement naturel
--non contrl, saisonnier, accouplement naturel (plusieurs mles reproducteurs)
--non contrl, saisonnier, accouplement naturel (un mle reproducteur par troupeau)
--monte en main, insmination artificielle utilise pour au moins une partie du troupeau
Effectif du troupeau
Composition du troupeau (proportion dans le troupeau de):
--truies reproductrices
--verrats
--porcs mles en croissance
--cochettes de renouvellement
--porcelets
Images typiques dun verrat et dune truie adultes avec un arrire-plan permettant
des comparaisons
20

Pour des questions plus dtailles sur les caractres dadaptation, voir la partie V de lannexe 5.

Annexe 4 Liste de contrle pour la caractrisation phnotypique des porcs

Images typiques dun troupeau avec son environnement habituel en arrire-plan


Utilisations des animaux par ordre dimportance (par exemple la production de
viande, de revenus, de fumier, le rle socioculturel)21

DONNES RELATIVES LORIGINE ET AU DVELOPPEMENT22


Nom de la race et des animaux chantillonns
Synonymes et noms locaux
Contexte de ces noms
Races connues pour tre les plus troitement lies cette race
Origine de cette race
Origine des animaux, sils sont imports (nom du pays et anne(s) dimportation)
Rpartition gographique dorigine de la race (si possible gorfrence)
Superficie approximative de la distribution (km2) de la race ou en termes de frontires
administratives
Noms des zones gographiques o ce type de race a t signal
Estimation de leffectif totale, accompagn de lanne de lestimation et de la source/
rfrence
Types de communauts ou dexploitations qui lvent cette race: les leveurs commerciaux, les leveurs de subsistance, les leveurs pastoraux, les centres de slection,
les stations exprimentales
Activits connues ou signales damlioration de la race
Mlanges ou croisements de la race (planifis ou alatoires), connus ou signals

DONNES RECUEILLIES SUR LES CARACTRES NCESSITANT DES MESURES


RPTES23
Les estimations de la performance de reproduction de deux truies, une choisie au hasard
et une ayant rcemment mis bas:
ge approximatif de la truie la premire mise bas
Estimation de lge actuel de la truie
Nombre de mises bas observes et taille de la porte pour chacune (nombre de
porcelets)
Nombre davortements
Nombre de porcelets sevrs depuis la dernire mise bas

21

Pour des questions plus dtailles sur les utilisations, voir la partie IV de lannexe 5.
Idalement obtenues grce aux groupes de discussion.
23 Daprs les leveurs.
22

123

Caractrisation phnotypique des ressources gntiques animales

124

ILLUSTRATIONs
Longueur du corps

Tour de poitrine

Remarque: ne pas trop appuyer sur la peau lors des mesures.

Annexe 4 Liste de contrle pour la caractrisation phnotypique des porcs

Hauteur au garrot

Remarque: maintenir le mtre ruban sur une ligne droite jusquau point le plus lev de lpaule du porc. Ne pas
courber le mtre ruban autour de lpaule.

125

126

Caractrisation phnotypique des ressources gntiques animales

Longueur de loreille

Largeur du bassin

Annexe 4 Liste de contrle pour la caractrisation phnotypique des porcs

Longueur de la queue

Remarque: vrifier que la queue est compltement tire.

Tour de jarret

Remarque: cette mesure est particulirement difficile prendre car les porcs peuvent facilement devenir nerveux
lorsquon manipule leurs pattes.

127

129

Annexe 5

Descripteurs des milieux de


production
24

PARTIE I: INFORMATIONS GNRALES


Espce
Nom le plus communment utilis pour dsigner la race ou la population
Autres noms ou synonymes ou noms locaux pour la race ou de la population
Nom de la zone dtude, y compris le(s) nom(s) de(s) la zone(s) administrative(s)
concerneprciser si lie au sexe ou autosomique
Emplacement(s) gographique(s) de(s) la zone(s) dtude(s) (gorfrences)
Carte (aussi complte et prcise que possible) de la distribution gographique de la race
Noms des autres rgions administratives o la race a t signale
Cette race est-elle connue pour tre leve dans plus dun milieu de production?
Est-ce que le milieu de production dcrit correspond une partie dun systme
transhumant saisonnier?
Si oui, indiquer le temps que les animaux passent dans chaque milieu de production
Depuis combien de temps cette race est-elle prsente dans ce milieu de production
particulier:
-- Premire anne: fournir une estimation approximative de lanne o la race a t introduite dans ce milieu de production, ou indiquer que la race est apparue, ou a t introduite, dans ce milieu de production un moment lointain et inconnu dans le pass.
--Dernire anne: fournir une estimation approximative de la dernire anne o la
race a t prsente dans ce milieu de production25, ou indiquer que la race est
toujours prsente dans ce milieu de production.
Proportion de la population totale de la race26 qui est leve dans ce milieu de production particulier

PARTIE II: ENVIRONNEMENT NATUREL


Climat
Temprature
--Moyenne des tempratures maximales quotidiennes (C)
--moyenne des tempratures minimales quotidiennes (C)
24

Adapt de FAO/WAAP (2008).


Cette option est utile pour les enqutes historiques plutt que pour les tudes de caractrisation phnotypique
classiques centres sur les races dans leurs milieux de production actuels.
26 Le calcul de cette proportion ncessite des donnes pour lensemble du pays. Ce calcul peut tre impossible
raliser sil ne se base que sur les rsultats dune tude individuelle de caractrisation phnotypique.
25

130

Caractrisation phnotypique des ressources gntiques animales

--moyenne des tempratures maximales quotidiennes du mois le plus chaud de


lanne (C)
--moyenne des tempratures minimales quotidiennes du mois le plus froid de lanne (C)
Humidit relative
--Humidit relative quotidienne moyenne (%)
--Humidit relative quotidienne moyenne du mois le plus chaud de lanne (%)
--Humidit relative quotidienne moyenne du mois le plus froid de lanne (%)
Prcipitations:
--Prcipitations mensuelles moyennes (mm)
--Moyenne annuelle (mm)
--Variation des prcipitations entre les annes:
grande variation des prcipitations
variation moyenne des prcipitations
variation faible des prcipitations
variation normalement faible des prcipitations, mais sujette des scheresses
sporadiques
--Variation entre les annes des:
couches de neige paisses occasionnelles
couches de neige paisses frquentes
peu ou pas de variation de chutes de neige entre les annes
aucune chute de neige
--Conditions de vent - frquence et type de vents
vents forts occasionnels
vents forts frquents
valeurs de refroidissement olien leves occasionnelles
valeurs de refroidissement olien leves frquentes
vents chauds et secs occasionnels (conditions responsables dune vapotranspiration rapide)
vents chauds et secs frquents (conditions responsables dune vapotranspiration rapide)
vitesse moyenne du vent pour le mois le plus chaud de lanne: (km/h)
vitesse moyenne du vent pour le mois le plus froid de lanne: (km/h)
--Dure dclairement:
Heures dclairement le jour le plus long de lanne
Heures dclairement le jour le plus court de lanne
--Rayonnement solaire:
Indice UV - moyenne annuelle (midi solaire local)
Indice UV - suprieur 5 (lev/trs lev/extrme) (nombre de jours par an)
Nombre total dheures densoleillement par an
Rayonnement solaire (intensit) (kW/m2)

Annexe 5 Descripteurs des milieux de production

Caractristiques du terrain
Altitude
--altitude moyenne pour ce milieu de production (m au-dessus du niveau de la mer)
-- altitude la plus basse pour ce milieu de production (m au-dessus du niveau de la mer)
--point culminant de ce milieu de production (m au-dessus du niveau de la mer)
Pente: le terrain de ce milieu de production est gnralement choisissez une
rponse parmi:
--plat
--vallonn
--escarp et montagneux
--trs variable
Le pH du sol - le sol de ce milieu de production est gnralement:
--trs alcalin (pH> 8,5)
--neutre (pH compris entre 5,5 et 8,5)
--trs acide (pH <5,5)
Les conditions de surface indiquer les principaux tats du substrat sur lequel les
animaux sont gnralement levs:
--vgtation naturelle
--pierreux/rocheux
--sableux
--gnralement humide substrat trs marcageux
--rgulirement et/ou frquemment inond
--rgulirement et/ou frquemment couvert par la neige/glace pendant lhiver
--types de substrats trs variables
Le couvert forestier: indiquer le pourcentage de couverture forestire dans ce milieu
de production.
Maladies, parasites27 et autres menaces pour la sant animale:
Dressez la liste des maladies et des parasites qui prsentent, ou ont prsent, une menace
importante pour les animaux de cette espce dans ce milieu de production et indiquer leur mode
dapparition. Notez que la race elle-mme peut tre rsistante ou tolrante, et ainsi ne prsenter
que peu ou pas de symptmes lorsquelle est atteinte par la maladie ou infeste par le parasite.
Considrez les catgories suivantes de maladies, ectoparasites, endoparasites et autres
menaces:
Catgories de maladies
--bactrienne
-- rickettsia
--virale
--fongique
-- prion
27

Les listes de maladies et de parasites qui peuvent tre saisies dans le module PEDs de DAD-IS sont fournies en
annexe du rapport de la Runion dexperts FAO/WAAP sur les descripteurs des milieux de production (FAO/
WAAP, 2008). Les tudes de caractrisation phnotypique individuelles doivent tenter de dcrire les maladies et
parasitoses locales de manire aussi exhaustive que possible.

131

132

Caractrisation phnotypique des ressources gntiques animales

Frquence de la maladie slectionner le choix le plus appropri pour chaque maladie


numre:
--radique
--rare
--frquente
--endmique
--mergente
Ectoparasites
--insectes
--acariens
--tiques
Endoparasites
--helminthes
--protozoaires
Frquence des parasitoses slectionner le choix le plus appropri pour chaque ectoparasite et endoparasite numrs:
--radiqu
--saisonnier
--occasionnel
--endmique
--mergent
Autres menaces, y compris la prsence de toxines dans les aliments et leau, les prdateurs et autres animaux nuisibles.

PARTIE III: ENVIRONNEMENT TECHNIQUE


Types de systme dlevage
--systmes bass sur les pturages:
en ranch
pastoral
--systmes mixtes:
polyculture-levage
agropastoral
agroforesterie-levage
--systmes sans terres:
industriel
dans la basse-cour familiale/divagant
Niveau de confinement (les animaux sont-ils oui ou non dans un hangar/cage/enclos,
etc. et pendant combien de temps):
--la plupart des animaux sont constamment en libert
--la plupart des animaux sont en stabulation seulement la nuit
--la plupart des animaux sont en stabulation de manire saisonnire
--la plupart des animaux sont en permanence en stabulation

Annexe 5 Descripteurs des milieux de production

Contrle de lambiance:
--protection lmentaire contre la chaleur (abris, arbres dombrage, etc.)
--protection lmentaire contre le froid (abris, brise-vent, etc.)
--logement ambiance non compltement matrise
--logement ambiance entirement matrise
--installations de refroidissement (mares boueuses, jets deau, etc.)
Lutte contre les maladies, parasites et autres menaces pour la sant
--Pour chaque maladie rpertorie comme prsentant une menace pour le milieu de
production local, choisissez lune des options suivantes - la plupart des animaux
sont vaccins:
jamais
parfois
rgulirement
--La plupart des animaux reoivent un traitement prventif contre les ectoparasites
ou autres vecteurs:
jamais
parfois
rgulirement
--La plupart des animaux reoivent un traitement prventif contre les endoparasites:
jamais
parfois
rgulirement
--La plupart des animaux reoivent un traitement vtrinaire quand ils sont malades:
jamais
parfois
en cas de besoin
--La plupart des animaux sont soumis des traitements traditionnels:
jamais
parfois
rgulirement
Disponibilit et gestion de lalimentation et de leau
--Laccs leau potable est:
normalement illimit
parfois limit
souvent limit
--La teneur en sel de leau potable
Leau potable a une forte teneur en sel: oui/non
--La disponibilit en aliments (quantit et qualit):
non limite
souvent limite pendant certaines priodes de lanne
limite tout au long de lanne

Type dalimentation, proportion et saisonnalit

133

Caractrisation phnotypique des ressources gntiques animales

134

Type daliments

Type daliments
donns aux
animaux

pturages naturels, y
compris les feuilles darbres
et darbustes fourragers
(abroutissement)

pturages sems

cultures fourragres

rsidus de cultures (pailles,


chaume, etc.)

concentrs

sous-produits industriels
faible valeur nutritionnelle

complments minraux

vitamines et oligo-lments

Estimation du pourcentage (%) de matire sche apporte par


chaque type daliments dans la ration des animaux
Pendant la priode
de croissance de la
vgtation

En dehors de
la priode de
croissance de la
vgtation

Toute lanne *

* en labsence de priode de croissance de la vgtation distincte

--Variabilit interannuelle des disponibilits alimentaires


Y a-t-il une grande variation de la disponibilit en aliments dune anne sur lautre? oui/non
Stratgies de reproduction
--Lister les mois au cours desquels les accouplements ont lieu
--Type de contrle de la reproduction gnralement employ par les leveurs pour
les animaux reproducteurs de la race:
accouplement non contrl
accouplement contrl
--Mthodes employes pour laccouplement contrl:
monte en main ou en enclos
insmination artificielle
transfert dembryon

PARTIE IV: CARACTRISTIQUES SOCIO-CONOMIQUES


Devenir des animaux et des produits:
--production entirement commercialise
--production en partie de subsistance et en partie commercialise
--production de subsistance
Marchs cibls:
--march international
--march rgional
--march national
--march local

Annexe 5 Descripteurs des milieux de production

Les produits visent-ils des marchs de niche? oui/non


Si les produits visent des marchs de niche, dcrire les produits de niche
Existe-t-il un march pour les animaux reproducteurs et le matriel gntique? oui/non
Principales utilisations et rles de la race dans ce milieu de production classez par
ordre de priorit dans la liste ci-dessous (1 utilisation la plus importante, 2 la deuxime plus importante, etc.):
--nourriture:
prestige
lait
crmonies religieuses et/ou
sociales
ufs
viande
maintien des rseaux sociaux
saindoux
combat
production de jeunes animaux destins --croisement:
la consommation
croisement en gnral
foie gras
ligne mle
sang
ligne femelle
--fibres et peaux:
croisement interespces
--utilisations particulires:
laine
poils
gardiennage
peau/fourrure
couver des ufs trangers
peau/cuir
cornes
--travail:
lutte contre les ravageurs
raction (travail dans les champs)
fins mdicales ou pharmaceutiques
traction (transport)
bt
recherche
gardiennage (y compris pour les taugestion de la vgtation
reaux de combat)
velours
monte pour le travail ou le transport en
laine pour leurres de pche
gnral
cole dquitation espagnole
--fumier:
--loisirs:
engrais
sport
carburant
loisir
--plumage:
course
plumes
quitation (sports/loisirs)
duvet
quitation (pour les enfants)
plumes pour la pche
attelage
--socioculturel:
dressage
gnral
attraction touristique
pargne/assurance
chasse

135

Caractrisation phnotypique des ressources gntiques animales

136

Aspects sexospcifiques de la prise de dcision (note: uniquement pour les systmes


non industriels)
Prise de dcision

Communaut/
cooprative

Mnage
Femme

Homme

Echelle de production

Ventes/achats

Intensit de production

Marchs viss

Objectifs de reproduction

Partage des tches entre les hommes et les femmes cocher une ou plusieurs cases
de chaque range
Partage des tches

Mnages

Communaut/
cooprative

Femme

Homme

Enfants

Alimentation

Abreuvement

Gardiennage

Hygine

Gestion de la sant

Gestion de la reproduction

Rcolte des produits

Commercialisation des produits


et animaux

PARTIE V: QUALITS PARTICULIERES DE LA RACE28


Caractristiques de la race concernant le climat:
--tolrante la chaleur - faible humidit
--tolrante la chaleur - forte humidit
--tolrante au froid - faible humidit
--tolrante au froid - forte humidit
--adapte aux fortes chutes de neige
--adapte un rayonnement solaire lev
Caractristiques de la race relatives au terrain:
--adapte aux altitudes leves
28

Notez que les lments de cette feuille dcrivent les adaptations des animaux aux milieux de production plutt
que les caractristiques des milieux de production en soi. Dans les tudes de caractrisation phnotypique
primaires, ces donnes sont principalement collectes grce des entretiens individuels ou de groupe avec les
leveurs de btail et dautres informateurs cls. Des informations plus dtailles peuvent tre obtenues grce
des tudes de caractrisation avance.

Annexe 5 Descripteurs des milieux de production

--adapte aux terrains en pente


--adapte aux terrains extrmement pierreux/rocheux
--adapt aux terrains extrmement sableux
--adapte des environnements enneigs et verglacs
--adapte la marche sur de longues distances
Caractristiques de la race relatives la sant
Lister toutes les maladies, ectoparasites et endoparasites importants et indiquer si la
race est:
--rsistante
--tolrante
--sensible
Autres adaptations lies la sant animale, y compris aux prdateurs et aux toxines
prsentes dans leau et lalimentation
Tolrance de la race par rapport la disponibilit en nourriture et en eau:
--tolrante de longs intervalles entre deux phases dabreuvement
--tolrante leau de boisson fortement saline
--tolrante leau de boisson avec un pH lev
--tolrante leau de boisson avec un faible pH
--tolrante de longs intervalles entre deux phases dalimentation
--tolrante au fourrage de faible qualit
--tolrante de fortes variations de la qualit des aliments
Autres adaptations lies leau ou lalimentation
Qualit spcifique des produits

137

139

Annexe 6

Dfinition des termes


VARIABLES QUANTITATIVES POUR LES MESURES CORPORELLES29
Longueur de loreille: longueur (en centimtres) de loreille externe depuis sa base sur la
nuque jusqu la pointe.
Longueur de la corne: longueur de la corne (en centimtres) sur son ct extrieur, depuis
sa racine sur la nuque jusqu la pointe.
Hauteur au garrot: la taille (verticale en centimtres) depuis la partie infrieure du pied
avant jusquau point le plus haut de lpaule sur le garrot. La mesure est prise de prfrence
avec une rgle coulissante.
Tour de poitrine: la circonfrence du corps (en centimtres) immdiatement derrire
lomoplate (scapula) dans un plan vertical, perpendiculaire laxe longitudinal du corps.
Longueur du corps: la distance horizontale (en centimtres) depuis la pointe de lpaule
jusqu lischion.
Largeur du bassin: la distance horizontale (en centimtres) entre les points extrmes latraux de lilion (tuber coxae ou pointes de la hanche) du bassin.
Poids vif: le poids vif jeun (en kilogrammes).

CLASSES DE DENTITION CHEZ LES CHVRES30


0 - un chevreau sans dents, souvent un nouveau-n
1 ruption et croissance de la premire paire de dents de lait
2 - ruption et croissance de la deuxime paire de dents de lait
3 - ruption et croissance de la troisime paire de dents de lait
4 - ruption et croissance de la quatrime paire de dents de lait
5 - dents de lait maturit, qui ont commenc scarter
6 - les dents de lait ont commenc suser, ou sont toutes cartes
7 - ruption et croissance de la premire paire dincisives permanentes
8 - ruption et croissance de la seconde paire dincisives permanentes
9 - ruption et croissance de la troisime paire dincisives permanentes
10 - ruption et croissance de la quatrime paire dincisives permanentes
11 - les quatre paires dincisives permanentes ont commenc suser
12 - les incisives sont uses et ont commenc scarter
13 - les incisives uses sont cartes et quelques-unes sont tombes (bouche casse)
14 - L a plupart des incisives sont tombes (bouche lisse) ou uses jusquau niveau de la gencive
Adapt de Edey, T.N. (ed.) 1983. A course manual in tropical sheep and goat production. Assessment
and measurement of the normal animal. Canberra, Comit australien des vice-chanceliers, Programme de
dveloppement international des universits australiennes.
30 Tel quil est employ dans lenqute phnotypique en Ethiopie (FARM-Africa et ILRI, 1996; Ayalew et al., 2000).
29

Caractrisation phnotypique des ressources gntiques animales

140

ESTIMATION DE LGE DES MOUTONS ET DES CHVRES


PARTIR DE LA DENTURE
Stade

Age (anne)

Changements caractristiques des dents

agneau

moins de 1 an

8 incisives de lait

animal dun an

1-2 ans

paire centrale dincisives permanentes

jeune adulte

2-3 ans

2 paires dincisives permanentes

adulte

3-4 ans

3 paires dincisives permanentes

mature

4-5 ans

4 paires dincisives permanentes

plus de 5 ans

sans dent ou avec des dents manquantes

DESCRIPTION DE LVALUATION DE LTAT CORPOREL (score corporel, SC)


SC

Changements corporels caractristiques (vertbres lombaires et queue)

trs amaigri
pas de muscles et de graisse entre la peau et les os dans la rgion lombaire
les graisses de rserve de la queue ont t utilises et les faces intrieure et extrieure

les apophyses pineuses et transverses sont pointues et visibles


on peut facilement passer les doigts sous les apophyses transverses
les rserves de graisse de la queue sont pratiquement compltement

des os du coccyx sont palpables

distingue les vertbres coccygiennes

utilises et on

les

apophyses pineuses sont visibles et on ressent comme une ondulation lors du


passage de la main sur le dos

les apophyses transverses sont lisses et rondes et on peut facilement passer les doigts
en dessous

la queue grasse est un peu lourde et fine au toucher


3

les apophyses pineuses sont lisses et arrondies et on peut sentir leurs os en appuyant
lgrement dessus

les apophyses transverses sont lisses et bien recouvertes


il faut appuyer pour passer les doigts sous les apophyses transverses
la queue grasse est plus arrondie et ferme et on ne palpe pas facilement
coccyx

les os du

les

apophyses pineuses sont palpes comme une ligne lors du passage de la main
sur le dos

les apophyses transverses sont bien couvertes et ne peuvent pas tre palpes
les os coccygiens ne peuvent tre palps en exerant une pression sur le ct intrieur
de la queue

impossible de palper les apophyses pineuses


il faut appuyer trs fort pour passer les doigts sous les apophyses transverses
on ne sent pas les os coccygiens mme en appuyant fortement

Annexe 6 Dfinition des termes

DESCRIPTEURS DU PLUMAGE DES POULETS31


Plumes frises: plumes qui sont boucles et qui se courbent vers lextrieur et vers lavant.
Huppe: touffe presque globulaire de plumes sur le sommet de la tte de certains oiseaux
aquatiques et de basse-cour, comme le Canard hupp blanc, ou les races Polonaise, Crvecoeur, Houdan, Sultane ou Soie pour les poules.
Huppe fendue: huppe dans laquelle il y a une division, avec des plumes tombant de
chaque ct; ce qui est un grave dfaut.
Barbe: groupe de plumes qui pendent sous le bec de certains oiseaux. Toujours associe
des favoris.
Camail: plumage larrire et sur les cts du cou dune volaille. Les plumes sur les mles
et les femelles diffrent dans la forme et la structure, sauf chez les races ayant des coqs
avec un plumage de poule.
Chevron: se rfre gnralement une bande de couleur contraste visible sur la surface
des plumes du camail chez les deux sexes, et le plastron des mles de certaines varits
bigarres. Dans la plupart des cas, la bande stend sur toute la surface paralllement aux
bords extrieurs de la plume et seffile vers un point situ prs de lextrmit infrieure de
la plume.
Cape: plumes courtes la jonction du dos et du cou sous la collerette et entre les paules,
qui prennent la forme dune cape.
Tarses emplums: volailles dotes de plumes sur les cts extrieurs des tarses, et sur les
doigts extrieurs, ou extrieurs et du milieu.
Coussin: masse abondante de plumes sur le dos et la base de la queue dun oiseau, qui lui
donnent une forme globale arrondie.
Bottes de vautour (manchettes): prsence de plumes sur les pilons (jarrets) sont longues
et rigides et se prolongent vers larrire; les races prsentant ce caractre sont dites bottes
de vautour (ou manchettes), comme les races Bantam botte ou Sultane. Les races ayant
le phnotype bottes de vautour ont gnralement des tarses emplums.
Liaison avec les caractres sexuels: lien entre la couleur et le sexe chez certaines races de
volailles (par exemple quand un coq Leghorn noir est accoupl une poule Plymouth Rock
barre, tous les coquelets seront barrs, et toutes les poulettes seront noires).
Plumes exprimant un dimorphisme sexuel: les plumes pointues dans la collerette, sur le
dos, le plastron, les faucilles et larc des ailes dune volaille mle, qui diffrent des plumes
de forme ovale de la femelle sur les mmes parties du corps.
Plumage de poule: correspond un mle qui possde un plumage de poule, cest--dire
avec des plumes ovales au lieu de pointues dans le camail, sur le dos, le plastron, les faucilles et les petites couvertures alaires.
Noir restreint type hermin (Columbian): un type de motif sur le plumage de certains
poulets. La plus grande partie du plumage est blanc, mais certaines plumes dans les rgions
du cou, de la queue et des ailes sont diversement teintes en noir. Cest le modle de
plumage des races Brahma blanche hermine, Plymouth Rock hermine ou Wyandotte
hermine.
31

Source: http://www.eurekaencyclopedia.com/index.php/Category:Chicken_Plumage

141

142

Caractrisation phnotypique des ressources gntiques animales

Barr: plumes montrant des rayures de deux couleurs (barres). Dans le cas de la barrure lie
au sexe (coucou) la barre est blanche et se voit sur un fond noir ou rouge, alors quelle est
noire dans le cas de la barrure autosomale et se voit sur un fond rouge ou argent. Lorsque
les barres sont blanches sur un fond dune couleur, comme dor ou chamois, la couleur est
dcrite comme tant barre (coucou)-dore ou barre (coucou)-chamois.
Couleur uniforme: la mme couleur uniforme dans tout le plumage, comme dans les
varits noires ou blanches.
Couleur unie: toutes les couleurs du plumage sont du mme ton, cest--dire de la mme
teinte ou nuance.
Couleur de la surface: couleur de la partie du plumage qui est expose lorsque les plumes
sont en position naturelle.
Couleur de fond: couleur de base ou prdominante de la surface dune plume. Chez les
varits denteles (laces), crayonnes, barres, paillete ou cailloutes, cest la couleur sur
laquelle les motifs sont dlimits.
Sous-couleur: couleur de la partie infrieure ou pelucheuse des plumes, non visible
lorsque les plumes sont en position naturelle.
Couleur trangre: couleur dans nimporte quelle partie de la volaille qui diffre grandement de la couleur standard.
Moussu: marquages de couleur confus, indistincts, irrguliers ou dsordonns qui
dtruisent le contraste ou le motif de couleur dsir.
Farineux: sapplique au plumage chamois ou roux tachet avec une couleur plus claire,
comme si il avait t saupoudr de farine ou de semoule.
Maill: prsence de trois bandes en collier sur la surface de la plume.
Crayonnage: alternance de marques transversales sombres, comme chez les femelles
Hambourg crayonnes argentes ou dores.
Barrage: marques violettes transversales sur les plumes noires.
Poivr (saupoudrage): plumes saupoudres de petits points de couleur noire ou grise
(pointills).
Coch: grains ou petites tches de couleur noire sur les pointes des plumes de la partie
infrieure du cou.
Dentel (lace): bordure de couleur contraste sur le pourtour de la surface dune plume.
Glaage: marge dilue sur un plumage dentel ou paillet noir.
Paillet (pailletage): marquage distinct de couleur contraste lextrmit dune plume,
en forme de V bien dfini en partie proximale et avec une extrmit distale arrondie. Toujours de couleur noire et peut tre associ avec une couleur de fond argent ou dore.
Caillout / panach: plumage dans lequel la majorit des plumes se terminent par une
pointe blanche. Notez que le panach diffre du caillout en ce que le plumage panach comporte des plumes totalement blanches, des plumes avec des taches blanches et
dautres entirement colores.
Multicolore: poules ayant des plumes de deux ou plusieurs couleurs ou de la mme couleur mais avec des nuances diffrentes.
Fauve: marron-dor clair.
Chamois: nuance moyenne de la couleur jaune-orange avec un teinte dore riche.

Annexe 6 Dfinition des termes

Acajou: plumage brun-roux fonc, plus sombre que le fauve.


Crme: plumes blanches dans lesquelles le rachis et ltendard sont teintes dune couleur
crme ou jaune clair, diffrente du cuivr. Caractristique des nouvelles plumes, en raison
de leur immaturit.
Ardoise fonc: gris bleut trs sombre, se rapprochant du noir.
Beige: brun clair.
Mre: violet trs fonc approchant du noir.
Blanc pur: blanc opaque, se rfre gnralement au blanc immacul des plumes des
femelles des varits blanches ou en partie blanches. Le complment du blanc brillant dans
les plumes des mles des mmes varits.
Saumon: nuance moyenne de la couleur ocre rougetre utilise pour dcrire la couleur de
la poitrine de certaines races (par exemple les femelles Light Brown Leghorn).
Soie: caractrise les plumes des animaux de la race Soie, qui possdent des rachis trs minces et
des barbes trs longues, trs douces et moelleuses, et nont aucune force de maintien et aucun
dispositif de verrouillage; elles sont structurellement similaires au duvet dun plumage normal.
Ardoise (ou aussi lavande): nuance de gris ayant une dominante bleue approchant parfois du noir, avec parfois des nuances plus claires.
Couleur froment: diffrentes teintes de la couleur du bl. Le terme est utilis pour dcrire
la couleur du plumage des femelles de certaines varits.

DESCRIPTEURS DU MILIEU DE PRODUCTION32


Termes gnraux
Milieu de production: comprend lenvironnement naturel et lenvironnement technique
dans lesquels la race est conserve.
Lenvironnement naturel: peut tre dfini en dcrivant le climat, la qualit du sol, le relief
et le type de surface, ainsi que les maladies et les parasitoses qui prvalent lendroit o
la race est leve.
Lenvironnement technique (conduite de llevage): se rfre aux interventions ou
actions qui affectent les conditions dans lesquelles la race est conserve. Il peut tre dfini
en dcrivant le type de systme dlevage, le niveau de confinement, le niveau de contrle
de lambiance, la lutte contre les maladies et les parasites, la gestion de leau et de lalimentation, les stratgies de reproduction et les caractristiques socio-conomiques, notamment
les principaux rles et utilisations de la race.
Systme transhumant: les leveurs transhumants se dplacent avec leurs troupeaux suivant un cycle saisonnier pour trouver de la nourriture et de leau ou viter des conditions
climatiques difficiles. Ils peuvent se dplacer au sein dun seul milieu de production ou entre
deux ou plusieurs milieux de production.

Conditions lies lenvironnement naturel


Temprature: se rfre la temprature ambiante mesure dans une station mtorologique proximit qui reflte fidlement les conditions dans le milieu de production dcrit.
32

Source: adapt de FAO/WAAP (2008).

143

Caractrisation phnotypique des ressources gntiques animales

144

Humidit relative: dsigne lhumidit mesure au niveau dune station mtorologique


proximit qui reflte avec prcision les conditions dans le milieu de production.
Prcipitations: se rfre aux prcipitations et chutes de neige mesures dans une station
mtorologique proximit qui refltent avec prcision les conditions dans le milieu de
production.
Scheresse: phnomne dorigine naturelle qui existe lorsque les prcipitations ont t sensiblement infrieures aux niveaux normalement enregistrs, causant de graves dsquilibres
hydrologiques prjudiciables aux systmes de production sappuyant sur les ressources en terre33.
Grande variation des prcipitations: moins de 75 pour cent de la moyenne long terme
lors de deux annes ou plus, au cours de six annes conscutives.
Variation moyenne des prcipitations: moins de 75 pour cent de la moyenne long
terme lors de deux annes ou moins, au cours de six annes conscutives.
Peu de variation des prcipitations: moins de 75 pour cent de la moyenne long terme
lors de deux annes ou moins, au cours de dix annes conscutives.
Scheresses sporadiques: normalement peu de variations dans les prcipitations (voir
ci-dessus), mais parfois trois quatre annes conscutives avec moins 75 pour cent de la
moyenne long terme.
Fortes chutes de neige: chutes de neige anormalement importantes qui perturbent gravement la production animale pendant une priode prolonge.
Fortes chutes de neige occasionnelles: les fortes chutes de neige se produisent en
moyenne moins de deux fois en dix ans.
Fortes chutes de neige frquentes: les fortes chutes de neige se produisent en moyenne
plus de deux fois en dix ans.
Vents forts34: vents soufflant plus de 62 km/heure.
Refroidissement olien35: se rapporte aux conditions dans lesquelles la temprature de lair
perue par le corps est abaisse par leffet du vent. Lindice de refroidissement olien est couramment calcul en fonction de leffet sur la peau humaine expose. Les animaux dlevage
seront touchs diffremment des humains et pour chacune delles en fonction des caractristiques de leurs pelage/plumage. En labsence dun index spar pour chaque espce, un indice
de refroidissement olien lev (faible temprature ressentie), tel que calcul pour lhomme
sera considr comme un substitut pour valuer les conditions dans lesquelles les espces
danimaux dlevage sont susceptibles dtre affects par une combinaison de froid et de vent.
Vents chauds et secs: dsignent les conditions dans lesquelles lvapotranspiration des
animaux est considrablement aggrave par leffet du vent.
Indice UV: se rfre lindice universel de rayonnement ultraviolet solaire (UVI) qui est
une mesure simple de lintensit du niveau de rayonnement ultraviolet la surface de la
terre36. Les valeurs de lindex varient de zro plus. Plus la valeur de lindice est leve,
Source: Convention des Nations Unies sur la lutte contre la dsertification, Article 1
(http://www.unccd.int/Lists/SiteDocumentLibrary/conventionText/conv-fre.pdf).
34 La Runion dexperts WAAP FAO na tabli aucune dfinition de ce qui doit tre considr comme frquent et
occasionnel dans le contexte de la description des conditions oliennes dans un milieu de production.
35 La Runion dexperts WAAP/FAO na tabli aucune dfinition du refroidissement olien lev pour dcrire un
milieu de production.
33

Annexe 6 Dfinition des termes

145

plus le risque de dommages sur la peau et les yeux est important, et plus les dommages se
produisent rapidement.
En labsence dUVI spar pour les espces danimaux dlevage, lUVI humain est considr
comme un substitut pour les conditions dans lesquelles les espces danimaux dlevage
sont susceptibles dtre affectes par des niveaux levs de rayonnement ultraviolet.
Les catgories dexpositions et les couleurs suivantes sont associes aux diffrentes valeurs
de lindice37:
Catgorie

Gamme UVI

Couleur

Faible

02

Vert

Modre

35

Jaune

Forte

67

Orange

Trs forte

8 10

Rouge

Extrme

11

Violet

Altitude: se rfre la hauteur au-dessus du niveau de la mer du milieu de production.


Dnivellation: se rfre la pente du terrain gnralement observe dans le milieu de
production.
tat de la surface: se rfre ltat du sol (sur lequel les animaux se promnent et se
reposent) gnralement observ dans le milieu de production.
Maladies et parasites: dsigne les maladies et les parasites qui se trouvent dans le milieu
de production et sont susceptibles daffecter les performances et/ou ladaptation de la
race. Les effets dune maladie ou dun parasite peuvent se manifester en termes de baisse
de la performance (diminution des taux de survie, de la production ou de la reproduction), daugmentation des exigences en matire dintervention technique (par exemple
lutilisation de mdicaments vtrinaires), de restrictions sur le choix des races (par exemple
les races sensibles ne peuvent pas tre utilises), ou une combinaison de ces effets.
Notez quune race spcifique peut tre rsistante ou tolrante une maladie ou un parasite
donns et donc ne prsenter que peu ou pas de symptmes. La prsence de ces maladies
et parasites dans le milieu de production devrait nanmoins tre enregistre, car elle peut
avoir affect les facults dadaptation de la race au fil du temps, et est susceptible daffecter
les performances des races nouvellement introduites dans le milieu.
Les maladies et les parasites qui taient auparavant prsents, mais ont maintenant t radiqus du milieu de production naffectent plus la performance, mais peuvent avoir affects
les niveaux de rsistance ou de tolrance de la race. Ces maladies et parasites doivent donc
tre enregistrs dans le mesure du possible. Les informations peuvent tre obtenues dans
les tudes prcdentes. Il peut galement tre possible dobtenir un historique38 de la maladie en menant des exercices participatifs avec les leveurs ou dautres informateurs locaux.
36

Lindice UVI a t dvelopp par lOrganisation mondiale de la sant (OMS), en collaboration avec le
Programme des Nations Unies pour lenvironnement (PNUE), lOrganisation mtorologique mondiale (OMM),
la Commission internationale de protection contre les rayonnements non ionisants (ICNIRP), et le Bureau fdral
allemand de la radioprotection.
37 Source: OMS. 2002. Indice de rayonnement UV solaire: un guide pratique. Genve.

Caractrisation phnotypique des ressources gntiques animales

146

La frquence de la maladie est classe comme:


radique de ce milieu de production (mais prsente autrefois)
rare - des foyers apparaissent en moyenne une fois ou moins dans la vie dun animal
frquente - des foyers apparaissent en moyenne plus dune fois dans la vie dun
animal
toujours prsente dans le milieu de production
mergente - nouvelle dans le milieu de production
Les ectoparasites sont des parasites qui vivent sur les parties extrieures du corps de lhte.
Les endoparasites sont des parasites qui passent une partie de leur cycle de vie
lintrieur du corps de lhte.
La frquence des endo et ectoparasitoses est classe comme suit:
radique de ce milieu de production (mais prsente autrefois)
toujours prsente dans le milieu de production
saisonnire - prsence rgulire sur une (des) priode(s) spcifique(s) de lanne
occasionnelle - parfois prsente sans tendance saisonnire
mergente - nouvelle dans le milieu de production
Toxines alimentaires: substances prsentes dans les aliments ou leau qui sont connues
pour causer des troubles physiologiques chez le btail et peuvent tre mortelles.
Prdateurs: animaux qui consomment dautres animaux (proies). En rgle gnrale, le
prdateur attrape, tue et mange sa proie.

Termes lis lenvironnement technique


Les systmes dlevage: sont classs en fonction de leur relation la terre, lintgration
des cultures et au mode de production.
Les systmes herbagers: sont ceux dans lesquels les animaux consomment une
grande partie du fourrage dans les pturages naturels ou sems.
--Systmes dlevage en ranch: systmes herbagers o le btail est gard sur un
parcours priv.
--Systmes pastoraux: des systmes herbagers o les leveurs se dplacent avec
leurs troupeaux de manire opportuniste sur des terres communautaires pour trouver de la nourriture et de leau pour leurs animaux ( partir ou non dune ferme
dlevage fixe).
Les systmes mixtes: sont ceux dans lesquels llevage est intgr aux autres activits agricoles en formant un tout.
--Systmes de polyculture-levage: sont ceux dans lesquels llevage est intgr
la production agricole.
--Systmes agropastoraux: des systmes axs sur llevage qui produisent certaines
cultures en plus de maintenir le btail au pturage; le btail peut tre dplac loin
des terres cultives pendant une partie de lanne; dans certaines rgions, les sys-

38

FAO. 2000. Manual on participatory epidemiology method for the collection of action-oriented
epidemiological intelligence, par J.C. Mariner et R. Paskin. Manuel de sant animale No. 10. Rome
(disponible http://www.fao.org/docrep/003/X8833E/x8833e00.htm).

Annexe 6 Dfinition des termes

tmes agropastoraux sont issus des systmes pastoraux.


--Systmes dagroforesterie-levage: sont ceux dans lesquels llevage est intgr
avec la production darbres et darbustes.
Les systmes sans terre: la production de btail est spare de la terre, et la nourriture donne aux animaux est produite.
-- Systmes industriels: les systmes de production sans terre grande chelle dans
lequel le milieu de production est fortement contrl par les interventions de gestion.
--Systmes de basse-cour/divagant: sont des systmes de production sans terre
petite chelle dans lesquels les animaux sont gards dans les basses-cours et nourris
avec des dchets mnagers et/ou dautres aliments, ou cherchent eux-mmes leur
alimentation dans le village car ils reoivent peu dalimentation de la part des leveurs.
Niveau de confinement: dsigne si oui ou non, et quelles priodes, les animaux sont
confins. Le confinement peut se rfrer au logement, au confinement lextrieur dans
un enclos ou une cage, ou une combinaison de confinement lintrieur et lextrieur
(par exemple un enclos ou une cage avec un accs un abri); il se rfre des situations
dans lesquelles les animaux sont en grande partie protgs contre les prdateurs qui sont
prsents dans la rgion, et les animaux peuvent tre facilement accessibles pour faciliter
la gestion de llevage. Lorsque les animaux ne sont pas confins, ils peuvent tre plus en
mesure dexprimer leurs comportements instinctifs.
Le logement peut comprendre un contrle complet ou partiel de lambiance.
Contrle complet de lambiance: se rfre aux situations dans lesquelles les animaux
sont levs dans des btiments o tous les aspects importants du climat auxquels les
animaux sont exposs (y compris la lumire) sont entirement contrls par les humains.
Contrle partiel de lambiance: se rfre aux situations dans lesquelles les animaux
sont gards dans des btiments qui offrent une protection contre les aspects ngatifs
du climat local, mais ne permettent pas un contrle complet.
Installations de refroidissement: fait rfrence lquipement utilis pour garder les
animaux au frais (par exemple, les jets deau).
Vaccination: administration dune substance antignique pour induire une immunit
une maladie.
Vaccination rgulire: se rfre un programme de vaccination qui rpond aux
recommandations vtrinaires pour la prvention des maladies (en termes de frquence et de couverture du troupeau, etc.)
Vaccination occasionnelle: se rfre aux situations dans lesquelles certaines vaccinations sont administres, mais o les animaux sont susceptibles de ne pas tre
suffisamment protgs contre la maladie tout moment.
Prophylaxie contre les agents responsables de maladie et les ectoparasites: se
rfre aux mesures prises pour tuer les ectoparasites ou vecteurs de maladies (par exemple,
lapplication dinsecticides ou dacaricides par immersion, pulvrisation, versement ou en
application manuelle).
Prophylaxie rgulire contre les ectoparasites ou agents vectoriels: se rfre
aux situations dans lesquelles des mesures de contrle sont appliques selon un
calendrier qui limine ou minimise les effets nfastes des ectoparasites et des autres

147

148

Caractrisation phnotypique des ressources gntiques animales

agents.
Prophylaxie occasionnelle contre les agents vectoriels et ectoparasites: se
rfre aux situations dans lesquelles certaines mesures de lutte sont appliques, mais
les animaux sont peu susceptibles dtre protgs de manire adquate contre les
effets nocifs des ectoparasites et des autres agents.
Prophylaxie contre les endoparasites: se rfre lutilisation de mdicaments vtrinaires comme mesure prventive contre les endoparasites (par exemple, un programme de
vermifugation).
Prophylaxie rgulire contre les endoparasites: se rfre aux situations dans
lesquelles des mesures de lutte sont appliques selon un calendrier qui limine ou
minimise les effets nocifs des endoparasites.
Prophylaxie occasionnelle contre les endoparasites: se rfre aux situations dans
lesquelles certaines mesures de lutte contre les endoparasites sont appliques, mais
les animaux sont peu susceptibles dtre protgs de manire adquate contre les
effets nocifs des endoparasites.
Traitements vtrinaires: se rfre lutilisation de mdicaments ou dautres interventions, le cas chant, pour gurir des animaux quand ils sont malades.
Traitement vtrinaire en cas de besoin: dsigne les situations dans lesquelles les
animaux malades reoivent toujours, ou habituellement, le traitement vtrinaire appropri (recommand par un vtrinaire comptent familiaris avec le systme de production).
Traitement vtrinaire occasionnel: se rfre aux situations dans lesquelles les
animaux malades reoivent parfois un traitement vtrinaire appropri.
Traitement traditionnel: lapplication de traitements bass sur les connaissances indignes pour contrler ou rduire la propagation de maladies et de parasites et/ou leurs effets
sur les productions animales.
Accs leau de boisson: se rfre la quantit deau potable disponible pour le btail.
Niveaux levs de sel: se rfre la prsence de sel dans leau des concentrations qui
nuisent normalement la sant ou la performance des animaux de lespce en question.
Disponibilit des aliments pour animaux (quantit et qualit): se rfre la mesure
dans laquelle lalimentation disponible (vgtation pture/abrouties et aliments fournis par
lleveur) peut rpondre aux besoins nutritionnels des animaux. La quantit et la qualit des
aliments doivent tre prises en considration pour rpondre cette question linsuffisance
nutritionnelle peut tre le rsultat dune alimentation en quantit insuffisante, de mauvaise
qualit ou une combinaison des deux. Lobjectif de cette question est dobtenir une vue
densemble de ltat nutritionnel des animaux (sils sont confronts des contraintes nutritionnelles continues ou saisonnires, ou sils sont bien nourris tout au long de lanne).
Type, proportions et saisonnalit de lalimentation: dsigne les principales composantes de lalimentation des animaux (voir la liste), leurs proportions approximatives (calcules
partir de la matire sche) et leur variation suivant les saisons.
Concentrs: aliments qui contiennent une forte teneur en nutriments, ils sont gnralement faibles en teneur en cellulose brute (moins de 18 pour cent de la matire sche)
et riches en nutriments digestibles totaux. Les concentrs peuvent tre riches en nergie

Annexe 6 Dfinition des termes

concentrs nergtiques comme les crales et les sous-produits de mouture ou


riches en protines (plus de 20 pour cent protines brutes), et dnomms alors concentrs
protiques39.
Sous-produits industriels faible teneur en nutritients: sous-produits des industries
de transformation qui sont pauvres en nutriment et par consquent ne peuvent pas tre
considrs comme des concentrs; il sagit daliments avec une forte teneur en fibres brutes
(plus de 18 pour cent de la matire sche) et une faible teneur en protines (moins de 20
pour cent). Notez que de nombreux sous-produits industriels donns aux animaux sont
considrs comme des concentrs selon ces dfinitions.
Fourrages: parties comestibles des plantes, autres que les grains utilises seules, qui peuvent servir de fourrage pour les animaux (pturage et abroutissement) ou qui peuvent tre
rcoltes pour lalimentation ltat frais ou conserv (par exemple, foin, ensilage).
Complments minraux: utiliss pour complter les rgimes alimentaires qui sont autrement pauvres en minraux.
Vitamines ou oligo-lments: complments utiliss pour complter les rgimes alimentaires qui sont autrement pauvres en vitamines ou oligo-lments.
Saison de reproduction: priode de lanne o les femelles sont fcondes.
Accouplement non contrl: accouplement au hasard, sans tenir compte du patrimoine
gntique (gnotype) des individus.
Accouplement contrl: accouplement prvu qui tient compte du patrimoine gntique
(gnotype) des individus.
Monte en main: une fois la priode dstrus dtecte, la femelle est tenue la main
lors de laccouplement ou est laisse seule dans un parc ou un enclos avec un mle.
Laccouplement est observ et lleveur a ainsi la garantie quil a bien eu lieu. Cela permet
galement denregistrer prcisment le jour de laccouplement et le patrimoine gntique
des animaux concerns - la diffrence de laccouplement en enclos.
Monte en groupe en enclos: mode de reproduction dans lequel un groupe de femelles est
plac dans un enclos avec un mle pour laccouplement. Toutes les femelles ne seront pas
fcondes et le jour de laccouplement ne sera pas forcment connu (cf. monte en main).
Insmination artificielle: cest le processus par lequel le sperme est plac dans lutrus
(intra-utrin) ou le col de lutrus (intra-cervical) dune femelle en utilisant des moyens artificiels et avec lintention de fconder la femelle, plutt que par un accouplement naturel.
Transfert dembryon: processus par lequel un ou plusieurs embryons sont placs dans
lutrus de la femelle avec lintention de mettre en place une gestation.

Termes relatifs aux caractristiques socio-conomiques du milieu de


production
Orientation du march pour les animaux et les produits: pourcentage de la valeur

39

Source: Hendy, C.R.C., Kleih, U., Crawshaw, R. & Phillips, M. 1995. Interactions between livestock production
systems and the environment impact domain: concentrate feed demand. Livestock and the environment
finding a balance. Natural Resources Institute, Chatham, Royaume-Uni
(disponible http://www.fao.org/WAIRDOCS/LEAD/X6123E/x6123e00.htm#Contents).

149

150

Caractrisation phnotypique des ressources gntiques animales

de la production (animaux vivants et produits) qui est commercialise au lieu dtre utilise
pour la subsistance:
entirement ax sur le march
>90 pour cent
orient la fois vers le march et la subsistance 10-90 pour cent
orient vers la subsistance
<10 pour cent
Marchs cibls: principaux marchs gnralement cibls par les leveurs de la race quand
ils vendent leurs animaux ou leurs produits.
Marchs internationaux: fonctionnent lchelle mondiale et demandent des produits
uniformes avec une garantie de qualit.
Marchs rgionaux: se rfrent une rgion gographique particulire du monde qui a
des exigences spcifiques. Certains marchs rgionaux formels exigent des produits uniformes avec une garantie de qualit, mais les marchs informels acceptent des produits moins
uniformes o la qualit du produit nest pas toujours garantie.
Marchs nationaux: fonctionnent au sein des frontires nationales dun pays spcifique et
demandent gnralement des produits uniformes avec une garantie de qualit.
Marchs locaux: fonctionnent au niveau sous national dans un pays spcifique. En gnral, ils sont moins exigeants concernant luniformit des produits que les marchs nationaux, et la qualit des produits nest pas toujours garantie. Les marchs locaux peuvent tre
des marchs formels ou informels.
Marchs de niche: sous-ensembles dun secteur de march plus prcisment cibls. Ils
peuvent tre considrs comme un groupe troitement dfini de clients potentiels. En raison des avantages de la spcialisation et du ciblage de segments de march identifiables,
les projets de march de niche peuvent tre rentables mme sils sont par nature plus petits
que les marchs de masse. Un march de niche peut tre un sous-ensemble dun march
local, national, rgional ou international.
Aspects sexospcifiques: Ltude des aspects relatifs au genre et lobtention de donnes
ventiles par sexe permet de mieux comprendre les diffrences conomiques, sociales et
politiques qui existent entre les hommes et les femmes; fournit des informations pour
renforcer les efforts pour surmonter les disparits entre les hommes et les femmes dans
le processus de dveloppement; permet de planifier des programmes de dveloppement
qui tiennent compte de la situation spcifique des deux sexes; et contribue crer un
environnement favorable pour le dveloppement durable du pays dans son ensemble.
Dans certains milieux socio-conomiques, les hommes et les femmes sont diffremment
impliqus dans les activits et prises de dcision lies llevage. Dans certaines cultures, le
travail peut tre fait par des enfants. Les groupes distincts selon le genre peuvent prendre
des dcisions diffrentes et faire le travail diffremment. Ces diffrences peuvent influencer
ladaptation et la performance de la race. Il est galement important de les prendre en
compte correctement lors de la planification des activits de gestion des ressources zoogntiques ou, plus gnralement, de dveloppement du secteur de llevage.

Annexe 6 Dfinition des termes

Les principaux domaines de prise de dcision pertinente pour la production animale sont:
lampleur de lactivit, lintensit de la production, les ventes/achats, les marchs cibls et
les objectifs de slection. Les principaux domaines dactivit lis llevage sont les suivants: lalimentation, labreuvement, llevage, lhygine, la gestion de la sant, la gestion
de la reproduction, la rcolte et le commerce des produits.
Echelle de production: se rfre la dcision concernant la taille du cheptel possd par
la famille (pour autant que cela puisse tre dtermin par les leveurs).
Intensit de production: se rfre aux dcisions sur le type et la quantit dintrants externes et internes, y compris la main-duvre et la terre, utiliss pour le cheptel.
Ventes/achats: se rfre aux dcisions concernant la priode et le choix des animaux qui
seront achets ou vendus.
Marchs cibls: se rfre aux dcisions concernant les marchs cibler pour vendre les
produits dorigine animale et les services (par exemple, marchs de niche versus march de
masse; marchs internationaux versus rgionaux versus nationaux versus locaux, marchs
saisonniers versus marchs prennes).
Objectifs de slection: se rfre aux dcisions concernant les caractres que les leveurs
souhaitent amliorer, maintenir ou introduire dans leurs troupeaux.
Abreuvement: travail ncessaire pour fournir de leau de boisson aux animaux ( noter que
le dplacement des animaux un point deau est inclus sous le terme pastoralisme).
Pastoralisme: amener les animaux dans une zone de pturage ou un point deau, les
surveiller si ncessaire, et les dplacer en cas de besoin.
Hygine: le nettoyage de labri, de lenclos, des cages ou des animaux eux-mmes.
Gestion de la sant: toutes les activits qui maintiennent ou amliorent la sant animale
(autre que la ration dentretien, labreuvement et lhygine).
Gestion de la reproduction: toutes les activits qui permettent le contrle de la reproduction (par exemple, la castration, laccouplement, linsmination).
La rcolte des produits: toutes les activits entreprises pour extraire, collecter ou prlever
les produits dorigine animale (par exemple la collecte des ufs, la traite, la tonte).
Commercialisation des produits et des animaux: toutes les activits impliques dans
la vente danimaux ou de produits dorigine animale un intermdiaire ou consommateur.

151

Directives FAO: Production et sant animales


1. Collection of entomological baseline data for tsetse

area-wide integrated pest management programmes, 2009 (A)
2. Prparation de stratgies et de plans daction nationaux pour les ressources

zoogntiques pour lalimentation et lagriculture, 2009 (A, E, F, R, C)
3. Stratgies damlioration gntique pour la gestion durable des

ressources zoogntiques, 2010 (A, E, F, R, Ar, C**)
4. A value chain approach to animal diseases risk management Technical foundations

and practical framework for field application, 2011 (A)
5. Guidelines for the preparation of livestock sector reviews, 2011 (A)
6. Mise en place de cadres institutionnels pour la gestion des

ressources zoogntiques, 2012 (A, F, E)
7. Ralisation denqutes et de suivi pour les ressources zoogntiques, 2012 (A, F, E)
8. Guide de bonnes pratiques en production laitire, 2012 (A, E, F, R, Ar, Pt)
9. Molecular genetic characterization of animal genetic resources, 2011 (A)
10. Designing and implementing livestock value chain studies, 2012 (A)
11. Caractrisation phnotypique des ressources gntiques animales, 2013 (A, F)
12. Cryoconservation of animal genetic resources, 2012 (A)
13. Handbook on regulatory frameworks for the control and eradication of hpai and
other transboundary animal diseases A guide to reviewing and developing the
necessary policy, institutional and legal frameworks, 2013 (A)
14. In vivo conservation of animal genetic resources, 2013 (A)
15. The feed analysis laboratory: establishment and quality control, 2013 (A**)

Disponibilit: novembre 2013


A Anglais
Ar Arabe
C Chinois
E Espagnol
F Franais
Pt Portugais
R Russe

Multil. Multilingue
* Epuis
** En prparation
e
Publication lectronique

On peut se procurer les Directives FAO de production et sant animales auprs des points de
vente des publications de la FAO, ou en sadressant directement au Groupe des ventes et de la
commercialisation, FAO, Viale delle Terme di Caracalla, 00153 Rome, Italie.

Consulter davantage de publications sur:


http://www.fao.org/ag/againfo/resources/fr/publications.html

Le Plan d'action mondial pour les ressources zoogntiques, adopt en 2007, est
le premier cadre convenu au niveau international pour la gestion de la
biodiversit dans le secteur de l'levage. Il implique llaboration de directives
techniques pour soutenir les pays dans leurs initiatives de mise en uvre. La FAO
a publie en 2009 les directives sur la Prparation de stratgies et de plans
d'action nationaux pour les ressources zoogntiques qui sont prsent
compltes par une srie de directives traitant de sujets techniques spcifiques.
Ces directives sur la Caractrisation phnotypique des ressources zoogntiques
s'adressent la Priorit stratgique 1 du Plan d'action mondial: Caractrisation,
inventaire et surveillance des volutions et des risques associs. Elles compltent,
en particulier, les directives sur la caractrisation gntique molculaire et sur la
ralisation d'enqutes et de suivi pour les ressources zoogntiques. Elles ont t
approuves par la Commission des ressources gntiques pour l'alimentation et
l'agriculture.
Ces directives donnent des conseils sur la faon de mener une tude de caractrisation phnotypique bien cible et rentable qui contribue l'amlioration de la
gestion des ressources zoogntiques dans le cadre de la mise en uvre du Plan
d'action mondial au niveau des pays. Un aperu des concepts et des approches qui
soutiennent les tudes de caractrisation phnotypique est suivi de conseils
pratiques sur la planification et la mise en uvre des activits sur le terrain, ainsi
que sur la gestion et l'analyse de donnes. Les annexes comprennent des formats
gnriques de collecte de donnes pour la caractrisation phnotypique des
principales espces d'levage, ainsi qu'un cadre pour l'enregistrement de
donnes sur les milieux de production des races.

I2686F/1/11.13

S-ar putea să vă placă și