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11
directives
CARACTRISATION
PHNOTYPIQUE DES RESSOURCES
GNTIQUES ANIMALES
11
FAO PRODUCTION ET SANT ANIMALE
directives
CARACTRISATION
PHNOTYPIQUE DES RESSOURCES
GNTIQUES ANIMALES
Citation recommande
FAO. 2013. Caractrisation phnotypique des ressources gntiques animales.
Directives FAO sur la production et la sant animales No. 11. Rome.
iii
vii
ix
xi
Introduction 1
Justification 1
Contexte et laboration des directives
Guide de lutilisateur
Section A
Cadre conceptuel
Le concept de race
10
Approaches de caractrisation
12
14
17
Section B
Cadre oprationnel
29
31
31
34
35
Section C
39
41
43
49
50
51
52
iv
Section D
53
55
56
57
61
61
62
63
Section E
Rapports et communication
65
67
70
77
80
Rapport final
80
82
La voie suivre intgrer les resultats de ltude dans les futurs projets 85
Rfrences et annexes
87
Rfrences bibliographiques
89
93
Directives gnrales
93
93
Variables quantitatives
94
94
95
101
Directives gnrales
101
101
Variables quantitatives
102
102
103
Donnes recueillies sur les caractres ncessitant des mesures rptes 104
Illustrations 105
Annexe 3 Liste de contrle pour la caractrisation phnotypique
des poulets
113
Directives gnrales
113
113
Variables quantitatives
114
114
114
mesures
115
Illustrations 117
Annexe 4 Liste de contrle pour la caractrisation phnotypique des porcs 121
Directives gnrales
121
121
Variables quantitatives
122
122
123
Donnes recueillies sur les caractres ncessitant des mesures rptes 123
Illustrations 124
129
129
129
132
134
136
139
139
139
140
141
143
vi
ENCADRS
1
11
21
22
27
36
37
43
44
4
5
6
7
76
83
TABLEAUX
1
32
75
81
84
FIGURES
1
6
33
vii
Acronymes
ACSAD
Centre arabe pour ltude des zones arides et des terres sches
ADN
Acide dsoxyribonuclique
BM
Banque mondiale
CPF
Facteur de correction pour une population finie
CPS
Communaut du Pacifique
DAD-IS
Systme dinformation sur la diversit des animaux domestiques
DMP
Descripteur normalis des milieux de production
FABISnet Rseau de systmes dinformation sur la biodiversit des animaux dlevage
FIDA
Fonds international de dveloppement agricole
GPS
Systme de positionnement global diffrentiel
ICARDA
Centre international de recherches agricoles dans les rgions sches
IICA
Institut interamricain de coopration pour lagriculture
ILRI
Institut international de recherches sur llevage
ISAG
Socit internationale de gntique animale
OADA
Organisation arabe pour le dveloppement agricole
OCDE
Organisation pour la coopration et le dveloppement conomiques
ONG
Organisation non gouvernementale
SADC
Communaut de dveloppement de lAfrique australe
SAHN
Sequential, agglomerative, hierarchic and non-overlapping
ix
Remerciements
xi
Prambule
Ces Directives font partie dune srie de publications produites par la FAO pour aider les
pays mettre en uvre le Plan daction mondial pour les ressources zoogntiques. Bien
que chacune de ces publications aborde un aspect diffrent de la gestion des ressources
zoogntiques pour lalimentation et lagriculture, elles doivent tre utilises conjointement.
Les Directives sur la caractrisation phnotypique sinscrivent dans la Priorit stratgique 1
du Plan daction mondial, ce qui est aussi le cas de deux autres publications: lune portant
sur la surveillance et le suivi des ressources zoogntiques et lautre sur la caractrisation
molculaire. Les Directives sur la ralisation denqutes et le suivi (FAO, 2012) prsentent une
vision globale qui dcrit le processus de planification des stratgies nationales de collecte
et de mise jour des donnes relatives aux ressources zoogntiques; elles prsentent les diffrents types denqutes pouvant tre intgrs dans ces stratgies et les grandes tapes de
la planification et de la mise en uvre de ces enqutes. Les directives sur la caractrisation
phnotypique dcrivent la faon de mener une tude sur une population animale spcifique
et sur son milieu de production et notamment les critres prendre en compte et les protocoles de collecte et dinterprtation de ces donnes. Les directives sur la caractrisation
molculaire (FAO, 2011) portent sur la faon dobtenir et dutiliser des chantillons dADN
en appui la gestion des ressources zoogntiques. Bien que leurs objectifs soient diffrents,
ces trois publications abordent invitablement des sujets communs.
Introduction
JUSTIFICATION
Trois types dinformations - phnotypique, gntique et historique - sont ncessaires pour
caractriser les ressources zoogntiques pour lalimentation et lagriculture. Le poids
accord chacun dpend du pays (par exemple, dvelopp ou en dveloppement) et de
lobjectif (par exemple amlioration, conservation ou diffrenciation des races). Ces directives se concentrent sur la collecte et lutilisation de linformation phnotypique.
La caractrisation phnotypique des ressources zoogntiques correspond lidentification des diffrentes races et la description de leurs caractristiques externes et de
production dans un environnement et un cadre de gestion donns, en tenant compte des
facteurs socio-conomiques qui les affectent. Les informations fournies par les tudes de
caractrisation sont essentielles pour planifier la gestion des ressources zoogntiques aux
niveaux local, national, rgional et mondial. Le Plan daction mondial pour les ressources
zoogntiques (FAO, 2007) reconnat quune bonne comprhension des caractristiques
des races est ncessaire pour guider la prise de dcision en matire de programmes de
dveloppement et de slection des animaux dlevage. La Priorit stratgique 1 du Plan
daction mondial est consacre la caractrisation, linventaire et la surveillance des volutions et des risques associs.
Le fait que de nombreuses populations animales nappartiennent pas une race
reconnue complique lvaluation de la diversit des ressources zoogntiques. Mme si
une partie de ces populations non dcrites rsulte de croisements multiples de races
reconnues, certains animaux peuvent appartenir des groupes (relativement) homognes
qui se distinguent des populations avoisinantes grce des caractristiques phnotypiques
identifiables et stables (parmi lesquelles il existe peut-tre des caractres uniques et prcieux) qui justifient le fait de les distinguer en tant que races distinctes. La caractrisation
phnotypique a notamment pour objet de distinguer ou non une population en tant que
race. Cette distinction est une condition pralable pour valuer efficacement la diversit des
ressources zoogntiques et dterminer leur niveau drosion gntique. La caractrisation
phnotypique est donc fondamentale pour faire linventaire national des ressources zoogntiques, permettre une gestion efficace de ces populations et mettre en place de systmes
dalerte et dintervention prcoces pour les ressources zoogntiques.
Les activits de caractrisation phnotypique sont difficiles mettre en uvre dun point
de vue logistique et technique. Une planification et une excution minutieuses sont ncessaires pour sassurer que ces activits soient efficaces, rentables et bien cibles (recueillir
des donnes importantes pour les activits prioritaires de dveloppement des ressources
zoogntiques et de llevage dans le pays). Le dveloppement et lutilisation de mthodes
et de procdures standardises sont indispensables pour mener des comparaisons valides
entre des races ou des populations danimaux dlevage, que ce soit au niveau national
ou international. Ces normes et protocoles sont galement ncessaires pour valuer les
demandes de reconnaissance de nouvelles races. Le Plan daction mondial appelle llaboration de normes et de protocoles techniques internationaux pour la caractrisation,
linventaire et la surveillance des volutions et des risques associs (Priorit stratgique 2).
Ces directives ont pour principaux objectifs de fournir des conseils sur la faon de mener
une tude de caractrisation phnotypique bien cible et rentable et contribuer ainsi
amliorer la gestion des ressources zoogntiques dans le cadre de la mise en uvre du
Plan daction mondial au niveau des pays. Elles contribuent galement veiller ce que les
tudes de caractrisation phnotypique fournissent une base solide pour les comparaisons
internationales entre les races et pour la prparation des valuations mondiales de ltat
des ressources zoogntiques.
Introduction
GUIDE DE LUTILISATEUR
Champ dapplication de ces directives
Les directives dcrivent lensemble du processus dorganisation dune tude de caractrisation phnotypique, de lidentification initiale des objectifs, en passant par la planification et
la mise en uvre des activits sur le terrain, la gestion et lanalyse des donnes, jusquau
compte-rendu des rsultats de ltude et la promotion de leur utilisation complte et efficace. Laccent est mis sur limportance du prlvement des donnes la fois sur les animaux
eux-mmes et sur leurs milieux de production; des conseils pertinents pour ces deux aspects
du travail de caractrisation sont inclus dans toutes les sections des directives.
Les directives portent dune part, sur les activits primaires de la caractrisation
phnotypique, qui peuvent tre menes au cours dune seule visite et qui donnent une
image de base de ltat de la diversit des ressources zoogntiques dans la zone dtude,
et, dautre part, sur les activits de caractrisation avances, qui exigent des mesures
rptes sur une longue priode. Des conseils sont donns pour dcider du niveau de
caractrisation, primaire ou avanc, ncessaire pour rpondre aux objectifs de ltude et sur
la faon dont la caractrisation primaire peut jeter les bases de la caractrisation avance.
Les directives se concentrent principalement sur les systmes de production dont le
niveau dintrants est faible ou moyen dans les pays en dveloppement (o les lacunes en
termes de connaissances sur les ressources zoogntiques sont les plus importantes et o
devraient se situer les zones critiques de perte de la diversit au cours des prochaines
dcennies). Un grand nombre de caractres prcieux restent probablement inconnus ou
non documents au sein de ces populations. Cependant, une grande partie de lactivit
dcrite est galement pertinente pour les pays dvelopps et les systmes de production
forts niveaux dintrants, o les activits de caractrisation servent principalement reconnatre de nouvelles races. En raison des implications financires dune telle reconnaissance
(par exemple le droit de demander des subventions), des procdures de caractrisation plus
strictes peuvent savrer ncessaires dans ce contexte.
Les directives abordent deux types de situations: celles o les activits de caractrisation
ciblent des populations danimaux non dcrits (nappartenant pas des races reconnues)
et celles o lobjectif est damliorer ltat des connaissances sur des races dj reconnues.
Ces directives concernent principalement les cinq espces danimaux dlevage les plus
importantes lchelle mondiale - les bovins, les moutons, les chvres, les poulets et les
porcs. Toutefois, les conseils de base sur la faon de planifier et de mettre en uvre une
enqute sont pertinents pour dautres animaux dlevage. En outre, les mmes variables
cls peuvent tre utilises pour dcrire des espces animales troitement apparentes. Par
exemple, les descripteurs utiliss pour les bovins peuvent tre appliqus aux yaks ou aux
buffles avec trs peu de modifications. De mme, dautres espces aviaires peuvent tre
dcrites en utilisant les descripteurs du poulet.
Public cible
Ces directives sont principalement destines aux personnes impliques dans la planification et la mise en uvre des tudes de caractrisation. Ces tudes ont gnralement t
menes par des chercheurs dans des tablissements publics de recherche, des tudiants
ENCADR 1
Un programme damlioration de la
race fond sur des informations de
caractrisation insuffisantes - le cas du
mouton Criollo bolivien
60 ttes.
Introduction
figure 1
Section A
Cadre conceptuel
Section B
Cadre oprationnel
Caractrisation
primaire
Section C
Collecte des donnes
Caractrisation
avance
Section D
Collecte des donnes
Section E
Gestion et analyse des donnes
Section F
Compte rendu et communication
Ces directives fournissent dans leurs annexes des listes de contrle pour dcrire les principales espces dlevage et leurs milieux de production. Ces listes sont conues comme
des guides qui peuvent tre adapts, si ncessaire, pour faire correspondre les objectifs au
contexte des tudes de caractrisation spcifiques.
Les directives ne dcrivent pas les normes pour les variables quantitatives et qualitatives, les outils de collecte de donnes, la prcision de lenregistrement des donnes ou les
mthodes de gestion et de stockage des donnes. En revanche, elles prsentent les options
et les approches et conseillent les utilisateurs sur la faon de les adapter leurs besoins.
Section A
Cadre conceptuel
Cadre conceptuel
10
Il est ncessaire de standardiser ces procdures au niveau mondial pour faciliter lnumration,
lanalyse et la signalisation correctes des races aux niveaux nationaux et internationaux.
LE CONCEPT DE RACE
Dans le cadre de la caractrisation phnotypique, le terme race est utilis pour identifier
des populations distinctes, constitutives des ressources zoogntiques, en tant quunits
de rfrence et de mesure. La diversit de ces populations est mesure de trois faons: la
diversit interpopulation (entre races), la diversit intrapopulation (au sein des races), et
les inter-relations entre les populations. La caractrisation phnotypique est utilise pour
identifier et documenter la diversit au sein et entre les races distinctes, en fonction de leurs
caractres observables. La mesure des relations gntiques entre les races et lhtrozygotie
gntique au sein des races relvent de la caractrisation molculaire (FAO, 2011).
Le concept de race est originaire dEurope et est li lexistence dorganisations dleveurs.
Le terme est maintenant largement utilis dans les pays en dveloppement, mais il a tendance
se rfrer un concept socioculturel plutt qu une entit physique distincte. Par consquent, lutilisation de ce terme dans les pays en dveloppement, o sont situes la plupart des
populations danimaux dlevage traditionnelles et locales du monde, est diffrente de son
utilisation dans les pays dvelopps. Dans les pays dvelopps, les races sont dfinies par un
standard (ensemble de normes phnotypiques), par lutilisation des livres gnalogiques et par
lexistence dassociations dleveurs officielles souvent soutenues par la lgislation. Dans les
pays en dveloppement, les communauts dleveurs et les gouvernements utilisent ce terme
moins rigoureusement et identifient davantage les races en fonction de la localisation gographique, lappartenance ethnique et les traditions des leveurs que par les caractres phnotypiques des animaux. Dans certains cas, le terme est utilis de manire interchangeable avec
population, varit, souche ou ligne pour dcrire des races reconnues au niveau
national. Les dfinitions des termes lis la race sont fournies dans lencadr 2.
La FAO utilise une dfinition large de la notion de race, qui tient compte des diffrences
sociales, culturelles et conomiques, et qui peut donc tre applique au niveau mondial
pour mesurer la diversit des animaux dlevage:
soit un sous-groupe spcifique de btail domestique avec des caractristiques externes
dfinies et identifiables lui permettant dtre identifi par valuation visuelle dautres
groupes pareillement dfinis au sein de la mme espce, ou un groupe pour lequel la sparation gographique et/ou culturelle des groupes phnotypiquement semblables a men
lacceptation de son identit spare (FAO, 1999).
Ces directives utilisent la mme dfinition gnrique.
En plus de la caractrisation des races reconnues, les directives abordent lidentification
et la caractrisation de races nayant pas t dj reconnues au sein des populations traditionnelles et non-dcrites. Cela peut tre fait par ltude de la constitution gntique de la
population, de ses diffrences par rapport dautres populations ou races, de son histoire
et de ses qualits productives, sociales et conomiques.
Une des caractristiques essentielles dune race est lisolement presque complet sur plusieurs gnrations (cest--dire que laccouplement avec des animaux en dehors de la population a t trs limit), qui a permis la population dacqurir une apparence et des capacits
Cadre conceptuel
11
nettement diffrentes de celles des autres races (FAO, 1992; FAO/PNUE, 1998). Dans les communauts traditionnelles dleveurs, la connaissance indigne locale fournit peut-tre la meilleure information prliminaire disponible sur lidentit de la race; en effet une communaut
particulire peut prtendre lever une population de ressources zoogntiques distincte dans
ENCADR 2
12
un environnement spcifique et en suivant une approche commune de reproduction et dutilisation de ces ressources. Khler-Rollefson (1997) dcrit de la manire suivante la faon dont
le concept de race peut tre appliqu dans les communauts traditionnelles:
Une population danimaux domestiques peut tre considre comme une race,
si les animaux rpondent aux critres suivants: (i) tre soumis un schma dutilisation commun, (ii) partager un habitat/zone de distribution communs, (iii) reprsenter
un patrimoine gntique fortement isol, et (iv) tre considrs comme diffrentis
par leurs leveurs.
Que ce soit dans les communauts traditionnelles ou industrialises, les populations
danimaux dlevage sont souvent dveloppes, entretenues et influences par les humains
et deviennent par consquent lunit de rfrence pour lamlioration et la conservation
des ressources zoogntiques. Il convient donc didentifier ces populations selon leur race
et dinclure dans les tudes de caractrisation phnotypique la fois des enqutes sur
les connaissances autochtones et une classification quantitative. Les outils molculaires
peuvent tre utiliss pour corroborer la classification des populations en races.
Approaches de caractrisation
En termes statistiques, la caractrisation phnotypique peut adopter lune des deux
approches suivantes, selon le type dinformations de base disponibles:
Lapproche exploratoire mise en uvre dans les cas o aucune donne de base
fiable sur lexistence des races dans la zone dtude nest disponible; dans de telles
circonstances, la caractrisation phnotypique vise enquter sur lexistence de races
distinctes dans la zone dtude.
Lapproche confirmatoire mise en uvre dans les situations o certaines informations de base sur lidentit et la distribution de la race sont disponibles; dans de telles
circonstances, lobjectif de la caractrisation phnotypique est de valider lidentit de
la race et de fournir des descriptions systmatiques de cette race.
Si les donnes secondaires disponibles sont insuffisantes pour tablir des plans pour la
caractrisation phnotypique, des donnes prliminaires devront tre collectes sur le terrain
sur lidentit, la rpartition gographique et limportance relative des populations constitutives des ressources zoogntiques (races reconnues au niveau local et national, populations
non-dcrites, etc.) dans la zone dtude, afin de dterminer si une approche exploratoire
ou confirmatoire est ncessaire. Les activits prliminaires de collecte de donnes peuvent
inclure des expditions cartographiques des dplacements au sein de la zone dtude
pour valuer approximativement la rpartition gographique des diffrentes populations et
des valuations rapides lutilisation dune gamme de techniques de terrain (compltes
le cas chant par des informations provenant de sources secondaires) pour obtenir des
informations auprs des populations locales. Lors de lvaluation rapide, les enquteurs
peuvent collecter des informations grce des runions de groupe et des groupes de
rflexion, des entretiens semi-directifs avec des leveurs individuels et dautres informateurs
cls possdant des connaissances sur le sujet concern, et en observant directement les
ressources zoogntiques. Une srie de techniques spcifiques ont t dveloppes pour
faciliter les valuations rapides (appareils de cartographie, calendriers saisonniers, mthode
Cadre conceptuel
Approche exploratoire
Une fois la zone dtude dsigne, ltape suivante consiste laborer un cadre dchantillonnage, cest--dire un ensemble de critres qui seront utiliss pour identifier un chantillon de mnages dleveurs et danimaux pour la collecte des donnes. Si la zone dtude
est tendue, il peut tre ncessaire de stratifier lchantillon en sous-units plus homognes
en fonction du ou des critres suivants:
isolement gographique des populations constitutives des ressources zoogntiques
et de leurs habitudes de dplacement ou de migration;
profils de caractristiques morphologiques et de production connus dans les populations ou existence de pratiques dlevage communes;
informations historiques et connaissances indignes sur lorigine des ressources zoogntiques.
Lapproche exploratoire de la caractrisation phnotypique ncessite galement destimer la population totale de btail dans la zone dtude, ainsi que le nombre dleveurs
propritaires de ces animaux (voir la section C).
Des informations secondaires sur les populations dlevage dans la zone dtude doivent
tre recherches dans les publications et la littrature grise. Le Systme dinformation sur
la diversit des animaux domestiques (DAD-IS http://www.fao.org/dad-is) peut tre une
source utile dinformations de base sur linventaire des races ainsi que sur leur distribution,
les effectifs des populations nationales et ltat de danger des races.
Lapproche exploratoire met lhypothse que la population cible est homogne et ne
possde pas de sous-populations phnotypiquement distinctes. Elle cherche vrifier cette
hypothse en mesurant et en analysant le modle de diversit phnotypique au sein de la
population cible. Des donnes phnotypiques standardises (voir les annexes 1 4) sont
collectes sur les animaux au sein des chantillons dans les zones dtude.
La caractrisation primaire (cest--dire la collecte des donnes lors dune seule visite
de terrain) sinscrit dans cette approche exploratoire. Par souci de simplicit, ces directives
utilisent le terme de caractrisation primaire lorsquelles se rfrent cette approche.
Approche confirmatoire
Lapproche confirmatoire de caractrisation phnotypique a pour but de valider les informations sur lidentits des race disponibles dans les inventaires nationaux des ressources
zoogntiques, la littrature et/ou travers les connaissances locales. Elle prsume que
les races connues ont une distribution gographique dfinie et certains usages et caractristiques phnotypiques communs. Les descripteurs raciaux standards figurant dans les
13
14
Cadre conceptuel
molculaires (Ticho, 2004). Des preuves gntiques similaires pour confirmer les identits
de race phnotypiques ont t obtenues chez des ovins (GebreMichael, 2008), des bovins
(Dadi et al., 2008) et des poulets (Halima-Hassen, 2007).
Des analyses de variance multivarie sont utilises pour dterminer celles, parmi les
nombreux caractres mesurs, qui prsentent un intrt pour distinguer les populations, et
pour valuer lensemble des caractristiques morphologiques ncessaires pour le regroupement. Les procdures taxonomiques numriques qui utilisent lanalyse de variance multivarie examinent un grand nombre de caractres observables de valeur gale (cest--dire
non pondres) chez un grand nombre dindividus et cherchent classer les individus en
fonction de leur similarit globale. Cette mthode de classification repose sur le principe
selon lequel la variation morphologique des organismes individuels est gnralement
discontinue et forme des tableaux bien distincts, et chaque tableau comprend un groupe
dindividus qui possdent certaines caractristiques communes. Ces groupes distincts sont
dsigns comme races, varits, espces, genres, etc. Le classement obtenu en utilisant
cette approche est en quelque sorte artificiel, mais les groupes eux-mmes et les discontinuits observes entre eux ne sont pas des abstractions de la part du classificateur
(Dobzhansky, 1951; pp. 3-18). En effet, les modles de variation morphologique au sein
des espces peuvent tre utiliss pour identifier des sous-groupes homognes danimaux,
et ces sous-groupes peuvent tre considrs comme des races ou varits.
Mthodologie
Analyses discriminantes et de classification. Dans ce type danalyses, on fait rfrence
aux units de rfrence (units taxonomiques) comme units taxonomiques oprationnelles
(UTO). Selon le profil de variation morphologique peru au niveau de la population, les
UTO peuvent tre des animaux individuels ou des groupes homognes danimaux. Dans
les situations o la ressemblance morphologique est leve au sein du troupeau, comme
dans le cas des populations en levage pastoral, les valeurs moyennes des animaux chantillonns - autrement appeles centrodes - sont considres comme des UTO. En labsence
dune telle ressemblance, et en particulier lorsque les identits de race sont moins claires,
les individus chantillonns sont utiliss comme UTO. Lestimation du degr de ressemblance phnotypique (morphologique, physiologique et comportementale) chez les UTO
est une tape fondamentale de lanalyse. Lanalyse de classification plusieurs variables
est ensuite utilise pour rorganiser lensemble htrogne des units taxonomiques en
groupes plus homognes par rapport aux variables (caractres) tudies (Aldenderfer et
Blashfield, 1984). Si la population slectionne comprend dj des catgories distinctes
par exemple si des noms locaux sont donns aux diffrentes populations lanalyse
discriminante peut permettre de valider la classification (Klecka, 1980). Les analyses discriminantes et de classification supposent toutes les deux que la variation morphologique
globale est une combinaison linaire des variables individuelles (tats des caractres ou
mesures phnotypiques) enregistres sur les UTO (individus ou centrodes).
Lanalyse de classification est utilise pour classer les UTO en quantifiant les relations
de similarit globale des paires dUTO en ce qui concerne les caractres considrs (Sneath
et Sokal, 1973; p. 116). Ces relations peuvent tre exprimes comme une distance relative
15
16
Cadre conceptuel
17
18
Cadre conceptuel
lintrieur ou entre les pays. La mta-analyse aux niveaux rgional et mondial exige la
fois de standardiser les descripteurs raciaux et davoir accs des ensembles de donnes
pertinentes. Il est donc important que les Coordonnateurs nationaux pour la gestion des
ressources zoogntiques entrent les donnes sur les caractristiques des races de leur
pays de manire cohrente et aussi exhaustive que possible dans DAD-IS. Il est galement
important que les tudes de caractrisation phnotypique fournissent les donnes ncessaires aux coordonnateurs nationaux pour accomplir leur tche. Les tudes de caractrisation phnotypique devraient viser recueillir un noyau de donnes pertinentes figurant
dans les annexes de ces directives de manire aussi complte que possible, dans le but
de les communiquer au niveau international et de disposer dune base solide pour les
actions nationales visant amliorer la gestion des ressources zoogntiques. La gamme
de donnes peut tre largie si ncessaire pour rpondre des objectifs spcifiques et des
prfrences au niveaux national ou local.
Dans les pays francophones et hispanophones, des tudes de caractrisation phnotypique sparent les caractres qualitatifs en trois catgories - morphologique, morphostructurelle et phanroptique - mais le mme ensemble de caractres qualitatifs que ceux dcrits
ci-dessus y sont essentiellement abords.
Caractres quantitatifs. Cette catgorie de caractres couvre la taille et les mesures
du corps ou des parties du corps des animaux, qui sont plus directement corrles aux
caractres de production que ne le sont les caractres qualitatifs. Par exemple, le poids
et le tour de poitrine sont directement lis la taille du corps et aux caractres de production associs. En rgle gnrale, ces variables ont une expression continue en raison
des nombreux gnes qui dterminent ou influencent leur expression. Alors que les caractres qualitatifs, comme la couleur de la robe, dpendent dun petit nombre de locus et
peuvent tre enregistrs et prdits avec prcision pour des populations animales dfinies,
lvaluation des caractres quantitatifs dimportance conomique exigent denregistrer de
nombreux indicateurs directs et indirects sur chaque animal. En outre, contrairement de
nombreux caractres qualitatifs, la plupart des caractres quantitatifs dpendent de lge
de lanimal et de son milieu de production. Par consquent, il est impratif que seuls des
animaux adultes levs dans leurs milieux de production typiques soient chantillonns.
Les donnes recueillies en une seule visite ne peuvent fournir que des indications sur les
caractres quantitatifs possdant une importance conomique. Une collecte rpte et plus
organise des donnes doit tre mise en uvre pour caractriser de manire systmatique
ces caractres (voir la section D pour plus de dtails).
En raison de leurs fortes corrlations avec les caractres de production comme la production de viande et de lait, les caractres tels que le poids corporel, la longueur du corps et
la hauteur au garrot sont utiliss en tant quindicateurs indirects des caractres de production. Les mensurations corporelles doivent toujours tre accompagnes de notes explicatives au niveau de la nutrition, ou de la saison de lanne et de la manire dont cela affecte
la disponibilit des aliments. Dans les tudes qui couvrent de vastes zones gographiques et
impliquent la caractrisation danimaux au pturage, il faut recueillir toutes les donnes sur
le terrain pendant les saisons de lanne o les stocks alimentaires sont similaires. Sinon, les
donnes de condition corporelle des animaux peuvent tre collects et utiliss pour rendre
19
20
compte des diffrences saisonnires sur le plan de la nutrition, mais cette approche exige
que les collecteurs de donnes aient les comptences requises.
Les caractres comme la largeur du fanon, la longueur de loreille, la hauteur au garrot
et la taille du fourreau sont directement lis aux capacits dadaptation des ressources zoogntiques, et sont donc pertinents pour les tudes de caractrisation phnotypique. Par
exemple, les ressources zoogntiques qui sont bien adaptes aux climats secs et chauds,
comme la chvre Jamunapari dInde ou les bovins Boran dthiopie et du Kenya, ont gnralement des oreilles trs longues et un large fanon.
Les caractres de production dimportance conomique, comme le taux de croissance,
le rendement laitier, la production dufs et le rendement en fibres (par exemple la laine, le
cachemire), ne peuvent pas tre correctement valus lors de visites uniques sur le terrain.
Ils exigent des travaux de caractrisation phnotypique avance impliquant des mesures
rptes de performance (examins plus en dtail dans la section D). Toutefois, certaines
donnes indicatives sur les niveaux moyens de performance peuvent tre collectes travers des mesures uniques, des entretiens avec des leveurs ou des documents disponibles.
La mesure du poids vif un ge spcifique, combine avec les connaissances disponibles
sur la qualit et la valeur marchande de la viande, peut tre utilise comme un indicateur
indirect de laptitude la production de viande de toutes les espces dcrites dans ces directives (bovins, ovins, caprins, porcs et poulets). De mme, les enregistrements de la quantit
moyenne de lait produite par les animaux chantillonns le jour de la collecte des donnes,
en tenant compte du stade de lactation, peuvent donner des indications sur la capacit de
production laitire chez les bovins, les moutons et les chvres. Les formats pour prlever ces
donnes sont prsents dans les annexes 1 4 pour les diffrentes espces. Un exemple plus
dtaill est prsent dans lencadr 3. Il faut cependant prciser que ces approches ne peuvent
tre considres comme des substituts aux mthodes de collecte de donnes standards.
Si les caractres de production spcialiss, comme les caractristiques de la laine, du
cachemire ou du mohair sont considres comme une priorit, des mesures directes de la
qualit des fibres (par exemple le pourcentage en laine et en poils), la longueur, la solidit
et la frisure peuvent tre prleves lors des tudes de caractrisation primaire. Cependant,
chaque fois que ces mesures sont ncessaires, une collecte de donnes dtailles travers
des tudes de caractrisation avance (en ferme et en station) doit tre prvue.
Des chantillons sanguins peuvent tre prlevs lors de travaux sur le terrain et utiliss
pour valuer les paramtres sanguins, comme lhmatocrite ou la prvalence de parasites
sanguins, ou pour extraire de lADN en vue dune analyse gntique molculaire. Le prlvement de ces chantillons ncessite une planification minutieuse et une coordination avec les
laboratoires chargs de lanalyse. Des informations dtailles sur la caractrisation gntique
molculaire sont disponibles dans la publication des directives complmentaires consacres
ce sujet (FAO, 2011), elles-mmes fondes sur un ensemble de recommandations testes
pour le terrain et les travaux de laboratoire. Concernant lorganisation dune tude phnotypique, le principal point noter est que la phase de terrain est loccasion de recueillir des
chantillons tissulaires ou sanguins. Mais surtout, des approches coordonnes permettent
deffectuer une analyse combine et de comparer les donnes phnotypiques et gntiques,
permettant une valuation plus complte de la diversit des ressources zoogntiques. Cette
Cadre conceptuel
21
ENCADR 3
analyse facilite non seulement une identification plus aboutie des races distinctes dans les
situations o les diffrences phnotypiques semblent mineures (voir encadr 4), mais peut
galement tre utilise pour identifier les relations gntiques entre les races, ce qui est trs
utile pour planifier lamlioration des races et les programmes de conservation.
Des donnes supplmentaires sur la rsistance, ou la tolrance, aux facteurs de stress
biotiques (maladies, parasites, etc.) et abiotiques (climat, pnurie deau, pnurie alimentaire
saisonnire, etc.) peuvent tre recueillies lors des tudes de caractrisation phnotypique
primaires en interrogeant les leveurs individuellement ou dans des groupes de discussions.
Les annexes 1 5 donnent des indications sur les caractres qui peuvent tre tudis grce
des entretiens. Ces donnes sont largement tributaires de la perception des personnes
interroges et doivent donc tre interprtes avec prudence. Une enqute plus approfondie
par des mesures rptes peut savrer ncessaire.
Les services de traction fournis par les bovins sont importants pour de nombreuses
populations rurales en Afrique et en Asie, et doivent par consquent faire partie intgrante
de la caractrisation phnotypique chez cette espce. Au cours des tudes de caractrisation primaire, seule la collecte de donnes sur les prfrences en termes de caractre
est possible. Si ncessaire, des tudes avances pour obtenir des donnes dtailles sur la
vitesse de traction et le travail effectu peuvent tre mises en uvre.
22
ENCADR 4
Cadre conceptuel
Enquter sur les effectifs des races et les menaces qui psent sur la
diversit gntique
Les donnes actualises sur les effectifs et la structure des races sont essentielles pour grer
efficacement les ressources zoogntiques. Lobtention des donnes de base sur les races
dun pays et la surveillance ultrieure des volutions est mieux gre dans le cadre du dveloppement et de la mise en uvre dune stratgie nationale denqute et de surveillance,
qui est susceptible dimpliquer des enqutes sur un chantillon de mnages combines
avec lutilisation dautres outils de collecte de donnes (pour plus de dtails, voir FAO,
2012). Dans les pays o les populations ne sont pas bien caractrises, et en particulier l
o elles ne sont pas distingues en races reconnues, la caractrisation phnotypique est
fondamentale pour constituer une base de donnes de rfrence sur les ressources zoogntiques nationales.
De nombreuses tudes individuelles de caractrisation phnotypique sont menes
trop petite chelle pour leur permettre de fournir des chiffres prcis sur les effectifs des
races concernes, notamment si les races sont largement distribues dans tout le pays.
Nanmoins, ces tudes offrent lopportunit dobtenir des approximations de leffectif de
ces races dans les zones dtude. Par exemple, des mthodes dvaluation rapide peuvent
tre utilises pour recueillir les connaissances locales sur lidentit des races et la distribution
locale des populations. En cartographiant ces distributions et en les reliant aux donnes
dmographiques disponibles pour les espces concernes dans les units administratives
concernes (par exemple partir dun recensement du cheptel), on peut obtenir des estimations sur les effectifs des races dans ces zones (par exemple FARM Africa et ILRI, 1996;
Blench, 1999). Des renseignements supplmentaires issus des discussions de groupe et des
entretiens avec des tmoins privilgis ou de sources secondaires, tels que les tudes prcdentes sur le btail, peuvent permettre daffiner les estimations brutes des populations.
Il faudrait envisager de recueillir des donnes indicatives sur les menaces qui psent
sur les ressources zoogntiques lors des tudes de caractrisation phnotypique, dans le
23
24
cadre de la description des milieux de production des races. Les entretiens et les groupes de
discussion avec les leveurs et dautres informateurs peuvent tre utiliss pour obtenir des
informations sur les menaces lies aux changements socio-conomiques, la disponibilit
des ressources, aux pidmies ou dautres catastrophes. La cartographie de la rpartition
des races dans le cadre des tudes de caractrisation phnotypique (voir ci-dessous) peut
galement contribuer lanalyse et la gestion de certaines menaces.
Cadre conceptuel
25
26
dintrants des pays en dveloppement, les motivations poussant lever certains types de
btail comprennent une gamme de caractres dadaptation et de fonctions de service non
marchands. Dans des environnements stressants, la tolrance face aux pnuries deau et
daliments, aux maladies et aux parasites, aux scheresses occasionnelles et aux tempratures extrmes peut tre prioritaire par rapport aux caractres de production. De mme,
les aptitudes maternelles, la fcondit et la capacit fournir des services de traction ou
jouer des rles socioculturels peuvent tre considres comme des caractristiques prioritaires dans certains systmes de production. Malheureusement, ces caractres sont difficiles
enregistrer au cours des tudes de caractrisation phnotypique. Les progrs rcents
dans le domaine de lvaluation conomique des ressources zoogntiques ont permis de
dvelopper, adapter et tester de nouveaux outils de collecte de donnes et danalyse pour
valuer ces caractres afin de conseiller les plans damlioration et de conservation gntiques ou les dcisions sur limportation de races exotiques (Drucker et al., 2001; Drucker et
Anderson, 2004). Ces outils peuvent tre appliqus au cours des tudes de caractrisation
phnotypique. Voici deux exemples de base:
1. dterminer limportance conomique de la race tudie en posant des questions prcises sur les prfrences de race des intervenants cls (c.--d. limportance relative
des races en tenant compte de toutes les caractristiques conomiques pertinentes);
2. identifier tous les caractres pertinents et les classer par ordre de priorit en fonction
des prfrences des leveurs.
Lorsquun programme damlioration ou de conservation gntique est envisag pour
une race, des tudes supplmentaires peuvent savrer ncessaires pour recueillir des donnes dtailles sur les niveaux des intrants et des extrants au sein des levages.
Limportance plus grande accorde aux caractres non productifs dans les milieux de
production faible intensit dintrants des pays en dveloppement signifie que, dans ces
environnements, il peut tre particulirement important de dvelopper des critres dvaluation de la productivit qui prennent ces caractres en compte et dutiliser ces critres
dans lvaluation et la comparaison des caractristiques des diffrentes ressources zoogntiques (Ayalew et al., 2003; voir encadr 5). Cela signifie galement que les fonctions
non lies au revenu (par exemple le fumier, lpargne, lassurance) doivent tre inclus dans
les programmes damlioration gntique dans ces systmes de production. Les caractres
uniques, comme la rsistance ou la tolrance aux maladies endmiques ou aux parasites,
ou aux pnuries alimentaires et deau saisonnires, doivent galement tre identifis et valus en termes conomiques, travers des tudes de suivi (Drucker et al., 2001). Une autre
raison importante pour lvaluation conomique de ladaptation, des services et des autres
caractres non-productifs est le rle potentiel des ressources zoogntiques dans lexercice
des fonctions publiques ou sociales. Comme cest souvent le cas chez les races qui sont en
danger dextinction, ces rles attirent peu dintrt commercial.
De nombreuses mthodes dvaluation conomique des caractres non productifs ont
comme point commun la documentation des prfrences des leveurs de btail et leur
valuation en termes montaires. En effet, les leveurs peuvent tre invits indiquer leurs
prfrences en termes de race et les raisons spcifiques qui sous-tendent ces prfrences
lorsque plusieurs races sont en considration. Ces donnes peuvent tre recueillies lors des
Cadre conceptuel
27
tudes de caractrisation phnotypique primaires. Lanalyse des donnes peut soulever des
questions conomiques plus spcifiques qui ncessitent dtre tudies travers des tudes
de suivi. Les tudes dvaluation conomique menes en collaboration avec la caractrisation phnotypique peuvent fournir des estimations utiles sur les valeurs que la socit
donne certaines ressources zoogntiques. Les informations sur les prfrences des
leveurs de btail et leurs perceptions des races et de leurs caractres sont extrmement
importantes dans la conception des programmes de conservation et damlioration gntiques. Des experts comptents doivent apporter une contribution technique spcifique
pour faciliter la planification et la gestion des tudes dvaluation conomique associes
au travail de caractrisation phnotypique.
ENCADR 5
Section B
Cadre oprationnel
31
Cadre oprationnel
Cette section sert de transition entre la partie prcdente plus thorique, qui dcrit les
principes, les concepts et les composantes de la caractrisation phnotypique et les sections
suivantes qui traitent de la planification pratique et la mise en uvre des tudes de caractrisation phnotypique. La section B traite de la phase de prparation dune telle tude. Cette
section joue un rle primordial car elle apporte des conseils sur la formation du groupe qui
conduira ltude et aide cette quipe dfinir les objectifs et le champ de ltude.
32
TABLEAU 1
Organisations
Nationale et locale
(zone dtude)
Rgionale
Centre arabe pour ltude des zones arides et des terres sches (ACSAD),
Organisation arabe pour le dveloppement agricole (OADA), Institut
interamricain de coopration pour lagriculture (IICA), Communaut du
Pacifique (CPS), Communaut de dveloppement de lAfrique australe (SADC),
dautres organisations rgionales, notamment les ONG
Internationale
Les comptences suivantes sont requises dans les quipes charges de la caractrisation
primaire ou avance (les exigences supplmentaires pour les tudes avances sont discutes
ci-dessous):
une bonne connaissance de la gntique animale et de la gestion des ressources
zoogntiques;
une bonne connaissance des statistiques et de la gestion des donnes;
une bonne connaissance de la sociologie, et en particulier des approches participatives;
une bonne connaissance des systmes de production du btail dans la zone dtude
et de la signification socio-culturelle des ressources zoogntiques;
de bonnes comptences et de lexprience dans lorganisation du travail sur le
terrain (en particulier des tudes de caractrisation phnotypiques) lchelle
approprie;
de bonnes connaissances sur les contributions actuelles et futures que pourraient
apporter les ressources zoogntiques aux moyens dexistence des leveurs de la
zone dtude et lconomie locale.
Au cas o il serait impossible de rassembler toutes ces comptences au sein de lquipe
dtude elle-mme, il faudra rechercher les conseils techniques dexperts en dehors de
lquipe, aux diffrents stades de la planification et de la mise en uvre de ltude. Lquipe
de recherche devrait tre anime par une personne possdant une vaste exprience dans
les tudes de caractrisation. Les membres de lquipe doivent cooprer troitement les uns
avec les autres durant toutes les phases du projet (planification, travail sur le terrain, gestion
et analyse des donnes et rdaction du rapport).
Par exemple, une quipe dtude typique rpondant aux critres dcrits ci-dessus peut
tre compose des membres suivants:
Cadre oprationnel
33
un investigateur principal, qui peut tre un expert dans une ou plusieurs des comptences souhaites;
un spcialiste de la production et/ou de la gntique animales, de prfrence un
expert sur les espces cibles par ltude;
un sociologue ou anthropologue;
un spcialiste de la gestion des donnes;
du personnel charg de la saisie des donnes;
un analyste de donnes;
un statisticien;
des agents recenseurs (le nombre dpend de la taille de ltude).
Ces membres peuvent possder plusieurs comptences et par consquent responsabilits, mais ces responsabilits ne doivent pas tre partages. Lanalyste des donnes doit
idalement tre un statisticien (dans ce cas, il nest pas ncessaire davoir un autre statisticien dans lquipe), mais un autre membre comptent de lquipe (par exemple, gnticien
ou spcialiste des sciences animales) peut jouer ce rle et tre conseill le cas chant par
un statisticien.
Lquipe dtude doit contacter les autorits locales dans la (les) rgion(s) o ltude
prend place et solliciter leur appui pour faciliter le travail de terrain et le recrutement des
figure 2
Caractrisation
primaire
Caractrisation
avance
Stratgie nationale
et plan daction
pour les ressources
zoogntiques
34
recenseurs. Au cas o il y aurait plusieurs groupes distincts dagents recenseurs, il est essentiel de nommer un superviseur pour chaque groupe et dassurer une bonne coordination
entre les groupes. Il est prfrable que les diffrents groupes aient des membres en commun pour assurer la cohrence des mthodes utilises. Toutefois, cela peut tre difficile
accomplir si les groupes sont sur le terrain en mme temps.
Les tudes de caractrisation avance peuvent impliquer un plus grand nombre de
personnes. Lvaluation en ferme ncessite parfois de passer un contrat avec les leveurs
et demployer des assistants supplmentaires pour la collecte de donnes et la surveillance.
Dans le cas des valuations en station, le personnel qui gre les installations et les procds
exprimentaux devra tre inclus dans lquipe dtude.
Une fois tablie, lquipe de recherche devra entreprendre les tches suivantes:
recueillir les renseignements de base;
clarifier les objectifs et le cadre de ltude;
planifier et excuter le travail sur le terrain pour recueillir des donnes sur les animaux et leurs milieux de production;
planifier et excuter la gestion et lanalyse des donnes;
prparer le rapport de ltude et communiquer les principales conclusions aux parties prenantes concernes.
Ces tches sont rsumes dans la figure 2. Les deux premires sont dcrites ci-dessous
dans cette section. La planification et lexcution du travail sur le terrain pour recueillir les
donnes sur les animaux et leurs milieux de production sont dcrites dans la section C pour
la caractrisation primaire et D pour la caractrisation avance. La planification et la mise en
uvre de la gestion et lanalyse des donnes sont prsentes dans la section E. La section F
traite de la communication des principales conclusions aux parties prenantes concernes.
noter que ces sections sont classes par type dactivit et ne correspondent pas un ordre
chronologique. Par exemple, le groupe dtude doit dabord planifier la gestion et lanalyse
des donnes avant de commencer le travail sur le terrain.
Cadre oprationnel
tre attribues avec certitude des races particulires au sein de la zone dtude, des donnes dtailles sur la taille et la structure de ces populations peuvent tre obtenues afin
de prparer la base dchantillonnage de ltude. La mthode suivante peut tre utilise:
esquisser, sur une carte, la rpartition connue des races au sein de la zone dtude
lchelle de la plus petite unit administrative possible;
relier la carte de rpartition (le schma) aux chiffres disponibles sur la population et
essayer de dlimiter les zones gographiques o les chiffres peuvent tre assembls
avec confiance;
agrger ces informations pour obtenir des estimations sur les effectifs et la rpartition des populations de race.
Toutefois, les donnes secondaires doivent tre manipules avec prudence pour laborer les cartes de distribution car elles peuvent tre obsoltes ou inexactes.
Lorsque la rpartition gographique des races cibles par ltude peut tre cartographie
en se basant sur des informations secondaires, on peut (en fonction de linformation disponible) superposer les cartes de distribution avec diverses sources de donnes gorfrences,
qui peuvent fournir un aperu du milieu de production, comme la disponibilit saisonnire
de lalimentation, limportance des maladies endmiques, les usages spcifiques de llevage
(par exemple la traction, la production laitire), la demande du march pour certains produits, les prfrences culturelles et les zones cologiques. Ces informations seront utiles pour
construire la trame de lchantillonnage pour le travail de caractrisation. La cration dune
base de donnes intelligente, qui permettrait de relier les diffrents ensembles de donnes
entre eux, serait particulirement intressante, mais cela dpasse la porte de ces directives.
Lorsquil ny a pas assez dinformations de base disponibles pour planifier ltude,
un travail prliminaire doit tre ralis, sur le terrain et/ou lors de consultations avec des
acteurs comptents. Ces activits doivent tre planifies et budgtises en plus du travail
principal sur le terrain. Une gamme doutils disponibles permet dobtenir des informations
sur les effectifs et la rpartition des races et sur divers aspects de leur gestion. Certains
dentre eux sont numrs dans lencadr 6. De plus amples dtails sont disponibles dans
les directives complmentaires sur les enqutes et le suivi (FAO, 2012).
Dans le cadre dune tude de caractrisation phnotypique, les meilleurs outils pour
collecter des informations prliminaires sont les expditions cartographiques (par exemple
vrifier sur le terrain des informations provenant de sources secondaires sur la distribution
des races), les valuations rapides (par exemple pour obtenir des donnes sur la rpartition
de la race et dautres aspects de llevage qui peuvent tre utiles dans llaboration du
cadre dchantillonnage), ainsi que, dans certaines circonstances, les enqutes par transect
pour obtenir des donnes sur les effectifs et la distribution des races.
35
36
ENCADR 6
aux priorits nationales pour la collection de donnes sur les ressources zoogntiques et
se concerter si ncessaire avec le Coordinateur national et le Comit consultatif national
sur les ressources zoogntiques (ou tout autre organisme qui supervise ce travail au niveau
national). Les objectifs possibles et les questions de recherche associes dune tude de
caractrisation phnotypique comprennent:
Pour identifier de nouvelles races dans la zone dtude:
-- Y a-t-il de nouvelles races distinctes dans la zone dtude?
-- Sagit-il de races connues en dehors de la zone dtude?
-- Comment ces races nouvellement identifies sont-elles relies aux populations
dj connues?
Cadre oprationnel
37
ENCADR 7
38
Lquipe doit examiner si ltude envisage peut atteindre ses objectifs et par quels
moyens. Si ncessaire, des informations supplmentaires doivent tre recueillies et dautres
consultations menes auprs des parties prenantes. Si, compte tenu de ltat des connaissances actuelles et le montant des ressources disponibles pour entreprendre ltude, des
doutes subsistent sur la possibilit datteindre les objectifs fixs, il peut tre ncessaire de
revoir les objectifs.
Lquipe, en concertation avec les parties prenantes participantes, devrait dcider de la
nature de ltude de caractrisation - primaire ou avance.
Les tudes de caractrisation primaires impliquent deffectuer des visites uniques
dans les zones dtude cibles. Laccent est mis sur la collecte de donnes descriptives sur
les races et leurs milieux de production et toute autre information utile la gestion de ces
races.
Les tudes de caractrisation avance impliquent des visites rptes et la collecte
de donnes longitudinales. Laccent est mis sur lvaluation dtaille des caractres de
production et dadaptation afin de fournir des informations factuelles plus compltes pour
la gestion des ressources zoogntiques, en particulier pour la prise de dcisions sur le
dveloppement et/ou la conservation de la race.
Si les travaux de caractrisation primaire doivent tre suivis dune valuation longitudinale approfondie, alors lensemble de ltude peut tre organis en deux phases: la phase I
portant sur la caractrisation primaire et la phase II sur la caractrisation avance.
Section C
41
42
contrasts ou travers diffrentes limites administratives, il peut savrer ncessaire dinclure ces critres dans la la dfinition du cadre dchantillonnage. Ils peuvent tre utiliss
pour diviser la zone d'tude en sous-units plus homognes et grables afin dobtenir un
chantillonnage plus efficace (par exemple Rowlands et al., 2003; Ayalew et Rowlands,
2004). L'quipe doit consulter un expert en statistique lors de l'laboration du plan dchantillonnage, surtout lorsque la zone d'tude ou la population cibles sont grandes.
Au niveau des mnages, la participation des membres de la famille dans la gestion des
ressources zoogntiques et leur connaissance de ces ressources sont susceptibles de varier
selon le sexe, l'ge ou le statut social. Il faut essayer de recueillir des donnes sur les ressources zoogntiques auprs des individus qui sont impliqus dans l'levage.
Pour identifier correctement une race, ce qui importe, c'est le nombre d'animaux mesurs, plutt que le nombre de troupeaux partir desquels les mesures ont t prises. En
revanche, le mnage tant l'unit de mesure pour analyser de nombreux aspects du milieu de production, il faut inclure le plus grand nombre de mnages possible dans ltude.
Cependant, les ressources pour les tudes de caractrisation phnotypique sont toujours
limites, et lquipe devra trouver un compromis entre le nombre de mnages visits et le
nombre d'animaux mesurs dans chaque mnage.
Pour collecter les donnes phnotypiques, il n'est pas ncessaire d'enregistrer les variables morphologiques chez tous les animaux. Il est important de se concentrer uniquement sur les animaux adultes/matures. Les jeunes animaux peuvent ne pas avoir acquis les
caractristiques qui sont typiques chez les animaux adultes. Toutefois, le prlvement des
mesures sur les jeunes animaux peut tre ncessaire pour valuer et comparer les performances de croissance (voir ci-dessous).
La taille approprie de lchantillon danimaux sur chaque site d'tude dpend de la
prcision requise et de la variabilit de la population de l'chantillon. Les coefficients de variation des mensurations des animaux adultes dans les populations d'levage traditionnelles
se situent souvent entre 10 et 30 pour cent. Pour obtenir une signification statistique (au
seuil de 5 pour cent), 100 300 femelles adultes et environ 30 mles adultes de chaque
site d'chantillonnage doivent tre inclus dans ltude. En d'autres termes, si l'intervalle de
confiance souhait est de 10 units pour un niveau de signification de 5 pour cent, la taille
de l'chantillon cible devrait tre d'environ 100 animaux adultes1.
Dans toutes les espces d'animaux d'levage, le nombre de mles adultes reproducteurs
est toujours trs limit. Laccent sera ainsi port sur les femelles matures, en particulier dans
les tudes didentification de race. Les mles seront inclus dans les tudes de description
de la race dans le cas de dimorphisme sexuel connu. De mme, ils seront inclus dans les
tudes de caractrisation gntique. Dans les populations traditionnelles, par exemple les
bovins et les petits ruminants en Afrique sub-saharienne, les femelles adultes constituent
gnralement environ 40 pour cent des animaux du troupeau. Pour identifier et chantillonner ces femelles adultes, il pourra tre ncessaire de combiner les informations fournies
par les leveurs avec les informations obtenues par l'examen de la denture des animaux
(voir encadr 8).
1
Voir http://www.gmi-mr.com/solutions/sample-size-calculator.php
ENCADR 8
Notez que les chiffres ci-dessus sont cits titre indicatif; l'quipe doit solliciter les conseils
techniques spcifiques d'un statisticien si elle ne possde pas elle-mme l'expertise adquate.
Lencadr 9 prsente une mthode gnrique pour dterminer la taille de l'chantillon.
Lquipement
Malgr lutilisation dappareils de mesure standardiss, une certaine subjectivit persiste
lorsquon prend des mesures quantitatives du corps de l'animal. De mme, la collecte de
donnes sur les caractres qualitatifs ou catgoriels peut tre fausse par des incohrences
et des erreurs de jugement de la part de l'observateur. La liste du matriel et des outils prsente ci-dessous fournit galement des conseils sur la faon de rsoudre ces problmes.
Pour la collecte des donnes quantitatives, les instruments suivants peuvent tre ncessaires:
Les rubans de mesure sont utiliss pour les mesures corporelles linaires comme la
longueur du corps, le tour de la poitrine et la longueur de la corne. Ils peuvent tre
en tissu ou en plastique. Les rubans en tissu sont prfrables au plastique, car ils sont
moins affects par les variations de temprature.
43
44
ENCADR 9
n=
( mz ) p(1 p)
2
n=
Le facteur de correction pour une population finie (CPF) est couramment utilis
dans le calcul de la taille des chantillons dans le cas d'chantillonnages alatoires
simples. Il a trs peu d'effet sur la taille de l'chantillon lorsque la taille de lchantillon
est petite par rapport la population, mais il est important d'appliquer le CPF lorsque
l'chantillon a une grande taille (10 pour cent ou plus) par rapport la population.
(cont.)
n' = n
1+ n
N
o n est la taille de l'chantillon tablie sur les calculs prcdents et N est l'effectif
de la population.
Cette formule est prsente seulement titre indicatif et doit tre adapte par le
statisticien de l'quipe.
En appliquant cette formule, et pour N = 16 450, la nouvelle taille de l'chantillon est:
n' =
384
384
=
384
1.023
1+
16 450
= 375.37
Les rgles coulissantes (rgles mtalliques ou en bois munies de barres coulissantes) sont prfrable aux rubans pour mesurer les hauteurs verticales (par exemple
la hauteur au garrot) afin dviter que la mesure de la ligne suprieure ne soit trop
subjective.
Les compas sont utiliss pour mesurer les distances entre deux cts symtriquement opposs d'un animal ou d'un objet (par exemple la largeur du bassin ou le
diamtre de luf). Les compas mtalliques sont moins sujets l'erreur de mesure
que ne le sont les rubans de mesure. Les pointes des compas peuvent tre ajustes
pour s'adapter aux points devant tre mesurs et la distance se lit soit directement
sur la graduation des compas soit en mesurant la distance entre les extrmits des
compas avec un autre outil de mesure.
Les altimtres sont utiliss pour enregistrer l'altitude des sites d'tude.
Les boussoles sont utilises dans des exercices de cartographie et pour orienter les
enquteurs lorsquils visitent de nouveaux sites.
45
46
Balances les dispositifs mobiles pour mesurer le poids des moutons, des chvres
et des poulets sont composs d'un trpied, dun peson ressort et dune sangle
en toile suspendue. Il est souvent difficile de peser les animaux plus grands sur le
terrain en raison du manque de ponts-bascules ou de plateaux de balance mobiles.
Dans les tudes de caractrisation primaire sur les bovins ou les porcs levs dans
des communauts trs disperses, des mthodes indirectes destimation du poids
corporel peuvent tre envisages. Ces options comprennent lutilisation dquations de rgression du poids corporel sur la longueur du corps et le tour de poitrine, qui sont en gnral fortement corrls au poids du corps. Ces quations sont
toutefois spcifiques de la population, c'est--dire qu'elles peuvent tre dveloppes lors dune premire tude sur la population cible et tre ensuite appliques
d'autres tudes sur la mme population (Ribeiro et al., 2004), condition que
leurs niveaux de prcision soient connus. Les ponts-bascules et les pesons ressort
doivent toujours tre talonns avant de commencer la collecte des donnes. Dans
le cas des pesons ressort, le poids des sangles doit tre pris en compte lors de
la lecture des mesures du poids corporel, en soustrayant le poids de la sangle de
portage de la lecture du poids total ou en ajustant le zro de la graduation en
posant la sangle sur la balance.
Pour la collecte de donnes sur les caractristiques qualitatives ou catgorielles, les instruments dcrits ci-dessous peuvent tre ncessaires:
Fiches codes et guides pour les enquteurs l'quipe doit laborer des codes
de donnes pour les variables catgorielles, idalement l'aide d'illustrations personnalises.
Tableaux de couleurs ils sont essentiels pour enregistrer uniformment les caractres tels que le type et les motifs de la couleur de la robe, la couleur du plumage,
la couleur des pattes et la couleur de la peau.
Guide illustrs de la conformation corporelle l'quipe doit tablir des normes
vrifiables pour tous les indicateurs qualitatifs de la taille et de la forme des diffrentes parties du corps. Par exemple, la mthode de classification des profils de
tte - droits, concaves, convexes ou sensiblement convexes - doit tre claire et sans
ambigut. Il en est de mme pour classer lorientation de l'oreille - dresse, latrale,
tombante, pendante ou semi-pendante.
Les autres quipements qui seront ncessaires sur le terrain comprennent:
le matriel pour prlever du sang, des poils avec leurs racines ou des tissus (si du
matriel doit tre collect pour une caractrisation gntique molculaire);
des appareils photo et des camras numriques pour prendre des images des animaux et enregistrer des donnes qualitatives subjectives (par exemple, la forme,
l'aspect et la couleur) a des fins de comparaison et de standardisation;
un appareil GPS;
du matriel pour la prise de note et des sacs;
du matriel de communication;
des moyens de transport (vhicule de terrain, motocyclettes, vlos, etc.).
47
48
La production d'ufs: Une fois que le nombre de poules dans le troupeau slectionn a t dtermin et enregistr, demander aux leveurs de se rappeler du nombre
d'ufs pondus par les poules dans le troupeau au cours des trois derniers jours. Agrger les donnes au niveau des mnages et des villages pour obtenir une estimation
de: 1) la production d'ufs en moyenne pour la priode vise, et 2) la production
dune poule par jour, soit le nombre total d'ufs pondus par le troupeau durant trois
jours divis par les poules-jours couverts (la somme du nombre de poules dans le
troupeau sur chacun des trois jours).
S'ils sont considrs comme des priorits, les caractres spcifiques tels que ceux associs
la production de laine, de cachemire et de mohair peuvent tre tudis au cours des tudes
de caractrisation primaire, par exemple, en prenant des mesures directes de la qualit des
fibres (par exemple le pourcentage de laine et de poils), leur longueur, leur force et leur frisure.
49
50
51
52
avec les reprsentants de la communaut. Il faut pour cela se concerter avec les chefs de
village, les autorits locales ou les prestataires de services (par exemple les vtrinaires)
pour dterminer les moments les plus pratiques pour la collecte des donnes. Les parties
prenantes doivent galement tre directement impliques dans l'organisation des activits
sur le terrain.
Des problmes logistiques comme la rservation de vhicules, l'achat de consommables
(carburant, papier, piles, etc.), les autorisations de voyage et l'hbergement des quipes sur
le terrain doivent tre rgls l'avance.
Section D
Collecte de donnes
pour la caractrisation avance
55
Collecte de donnes
pour la caractrisation avance
Comme il est expliqu dans les sections A et B, la caractrisation avance est le terme
utilis dans ces directives pour dcrire les aspects de la caractrisation phnotypique qui
ne peuvent tre traits en une seule visite sur le site dtude, c'est dire qui ncessitent la
prise de mesures rptes sur une priode de temps prolonge. Une planification efficace
de la caractrisation avance, y compris la dfinition des objectifs spcifiques et l'tendue
de l'tude, dpend de la disponibilit des donnes de base sur les races cibles et leurs
milieux de production, qui sont issues des phases prcdentes de l'tude ou des rsultats
de prcdentes tudes dcrites dans la littrature.
Cette section et la prcdente dcrivent toutes deux la collecte des donnes, et se
recoupent donc invitablement. Cependant, elles sont aussi complmentaires, notamment
en ce qui concerne les enqutes rptes. Par consquent, les lecteurs sont incits lire
ces deux sections mme sils sont principalement intresss par la caractrisation avance.
56
des mesures rptes des performances dans les populations animales cibles pendant une
priode de temps dfinie, couvrant gnralement plusieurs cycles de production complets.
Les deux approches ont pour objectif de gnrer des donnes de performance sur la production principale et les caractres d'adaptation.
Les tudes de performance en ferme peuvent tre conues pour estimer les paramtres
gntiques dans le cadre de programmes d'amlioration gntique (par exemple, le schma de slection noyau ouvert chez le mouton Djallonk en Cte d'Ivoire: Yapi-Gnaore et
al., 1997a,b), ou pour surveiller la productivit globale du troupeau au niveau du site, ainsi
que les impacts des interventions spcifiques (par exemple Agyemang et al., 1997; Osaer
et al., 2000). Si elles sont menes sur des priodes suffisamment longues, de telles tudes
permettent de surveiller la structure des troupeaux et les volutions de la population et
didentifier les causes et les facteurs associs.
De mme, pour les valuations en station, un chantillonnage raisonn plutt qualatoire peut tre ncessaire lorsque:
la slection alatoire des animaux de lexprimentation est limite par un manque
d'informations de base sur la population;
les leveurs ne sont pas disposs se sparer de leurs animaux pour l'tude;
seuls les animaux qui rpondent certaines exigences minimales peuvent tre slectionns pour l'tude.
57
58
de donnes varient en fonction du type de caractres cibls et des mthodes utilises pour
la mesure et l'enregistrement. En gnral, ils augmentent avec le niveau de prcision et
d'automatisation ncessaire et disponible. Cette section se concentre sur des techniques
simples et peu coteuses, mais qui ne compromettront pas les rsultats de l'tude.
Malgr lutilisation dappareils de mesure standardiss, une certaine subjectivit persiste
dans la prise de mesures. Cette prsentation des caractres et des outils comporte des
recommandations qui peuvent aider rsoudre ces problmes:
La production de lait: lensemble ou une partie des animaux en lactation doivent tre
identifis pour pouvoir effectuer l'enregistrement hebdomadaire de tous les volumes
de traite (matin et soir), un jour fixe de la semaine et pour une priode de temps
dfinie (par exemple pendant un mois ou toute la priode de lactation). Les outils
suivants sont ncessaires: du matriel de traite aux normes sanitaire; une prouvette
ou une carafe gradues pour mesurer le volume de lait ou une balance numrique
pour mesurer le poids du lait; et des feuilles d'enregistrement des donnes.
La qualit du lait: les chantillons de lait peuvent tre analyss sur place ou envoys
un laboratoire pour dterminer la teneur en matire grasse et en protines, et si
ncessaire le nombre de cellules somatiques. Le pourcentage de matires grasses
dans le lait peut tre dtaill en termes de composition en acides gras et le pourcentage de protines en fonction des diffrents types de casines. Des bouteilles
de prlvement de lait standardises et une glacire sont ncessaires pour prlever
des chantillons de lait frais pour l'analyse chimique en laboratoire. De mme, des
trousses d'chantillonnage sont ncessaires pour prlever des chantillons de lait frais
et contrler sa qualit microbiologique.
Le taux ou la courbe de croissance: ils peuvent tre dtermins partir du poids vif
corporel diffrents ges. Le poids corporel des animaux de boucherie en croissance
doit tre mesur et enregistr rgulirement (tous les mois) pendant une priode de
temps dtermine (trois ou quatre mois conscutifs). En combinant ces rsultats avec
les mesures de la consommation alimentaire sur un chantillon d'animaux pour un
nombre dtermin de jours (par exemple trois semaines pour les volailles et beaucoup plus longtemps pour les ruminants), on peut calculer lefficacit de conversion
alimentaire pour la priode d'observation. La mesure individuelle de la consommation
alimentaire ncessite disoler chaque animal (par exemple dans un box) et ne peut
tre ralise quen station et pour estimer les paramtres gntiques. La croissance
peut tre enregistre laide de ponts-bascules mobiles, de pesons ressort ou de
rubans de mesure du poids corporel.
La qualit des carcasses et de la viande: les mesures du rendement labattage,
du rapport os/viande ou de la teneur en matire grasse ncessitent dabattre les animaux, et ne sont ralisables quen station et pour les petits animaux. Une valuation
indirecte peut tre obtenue en prenant des mesures morphologiques (voir section
C) qui fournissent des informations sur la conformation de l'animal. Des techniques
de pointe, telles que la rsonance magntique, des radio-isotopes, la tomographie,
la radiographie et l'chographie, peuvent tre utilises pour valuer la composition
et la qualit de la carcasse (la quantit et la distribution des tissus spcifiques). Par
exemple, pour mesurer lpaisseur du lard dorsal chez les porcs et les autres animaux
levs pour la production de viande, un chographe spcialis, largement utilis
des fins commerciales, peut fournir des mesures prcises. Les caractres qualitatifs de
la viande (par exemple, tendret, jutosit) sont rarement signals dans les tudes de
caractrisation (en particulier chez les animaux autres que les poulets), mais peuvent
jouer un rle important dans la valorisation des races locales.
La production d'ufs: le nombre d'ufs pondus et le taux de mortalit devraient tre
enregistrs quotidiennement pendant une priode de temps limite (trois mois). En
station, la priode d'enregistrement peut tre beaucoup plus longue (par exemple un
an). Les poules doivent tre peses au dbut et la fin de la priode de ponte. En
le combinant avec des mesures de la consommation alimentaire sur un chantillon
de poules pour un nombre dtermin de jours (par exemple trois semaines), l'enregistrement de la production d'ufs permet de mesurer l'efficacit de conversion des
aliments pour la priode d'observation.
Qualit des ufs: deux chantillons d'ufs (par exemple 10 20 ufs) doivent tre
prlevs au dbut et la fin de la priode de ponte. Les ufs doivent tre pess
pour dterminer leur poids moyen. Les mmes chantillons peuvent tre utiliss pour
estimer la quantit de coquille, soit directement (par pese de la coquille aprs lavoir
spare de l'albumen et du jaune) ou indirectement en fonction de la densit des
ufs (en utilisant diffrents rcipients deau avec des niveaux croissants de salinit).
La solidit de la coquille peut tre mesure directement (mesure de la force de fracture) ou indirectement (mesure de dformation). Pour mesurer la qualit interne de
l'uf, la teneur en matire sche, les poids du vitellus et de l'albumen ou la hauteur
de lalbumen peuvent tre mesurs sur les mmes chantillons d'ufs. Beaucoup de
ces mesures (par exemple le poids de luf, sa densit, le ratio vitellus sur albumen)
peuvent tre prleves l'aide de dispositifs simples, mais d'autres (dformation,
force de fracture, teneur en matire sche et hauteur de l'albumen) ncessitent des
outils plus sophistiqus et peuvent ne pas tre ncessaires dans toutes les tudes.
La production de laine: elle ne peut tre mesure correctement que pendant la saison de
tonte, qui se produit gnralement au printemps. Le calendrier de la collecte des donnes doit tre planifi en fonction. Toute la laine de tonte doit tre pese pour connatre
le poids de la laine en suint. La toison doit ensuite tre minutieusement lave (dgraisse) et pese pour dterminer le rendement en laine lave fond. Pour effectuer de
telles mesures il faut se munir de tondeuses manuelles ou motorises et dune balance.
La qualit de la laine: la qualit de la laine est exprime en termes de longueur, de
diamtre, de force, de frisure et de couleur de la fibre. Tout cela ncessite du matriel
de mesure prcis, et ces donnes ne peuvent par consquent pas tre collectes sur
le terrain. Des chantillons de laine peuvent tre prlevs durant la tonte pour tre
analyss en laboratoire. Les outils indispensables sur le terrain comprennent les tondeuses et les rcipients dchantillonnage.
La reproduction: en ce qui concerne les moutons, les chvres et les porcs, les mises
bas et les cas de mortalit des jeunes animaux peuvent tre surveills pendant une
priode de temps dfinie (par exemple, quelques mois). Dans les rgions tempres
59
60
Questionnaires
Les questionnaires sont utiliss dans les enqutes rptes ou les tudes menes sur le long
terme dans l'exploitation pour collecter des informations sur les milieux de production, surveiller les structures des troupeaux et l'volution des populations, et identifier les causes de
ces changements. Dans les deux types d'tudes, des questionnaires directifs, semi-directifs
et, dans certains cas ouverts peuvent tre utiliss pour enregistrer systmatiquement des
donnes au moyen dentretiens. Toutefois, si les leveurs sont interviews plusieurs reprises,
des prcautions doivent tre prises pour ne pas risquer de les dsintresser. La porte et
l'approfondissement des questionnaires doivent tre guids par les exigences des donnes
spcifiques de l'tude. Voir la section C pour de plus amples conseils et discussions.
61
62
Lors de la mise en uvre denqutes rptes, les superviseurs et l'quipe doivent visiter
les sites slectionns afin d'informer officiellement les autorits locales et les communauts cibles sur la collecte de donnes prvue, comme cest le cas pour la caractrisation
primaire. La date, l'heure et le lieu des visites sur le terrain doivent tre convenus avec les
reprsentants de la communaut. Il faut pour cela consulter les chefs de village, les autorits locales ou les prestataires de services (par exemple les vtrinaires) pour dterminer les
moments les plus pratiques pour la collecte des donnes. Il peut tre appropri d'impliquer
ces acteurs directement dans l'organisation des activits sur le terrain.
Pour l'valuation en station, l'quipe doit s'assurer que les installations de recherche
sont non seulement capables de mettre en place un environnement physique et une
gestion prdfinie, mais aussi de permettre le suivi et l'enregistrement des rponses des
animaux dans des milieux de production donns. L'quipe doit dterminer si le personnel
de la station de recherche est en mesure de faire face la charge de travail supplmentaire
lie l'tude de caractrisation, et recruter du personnel supplmentaire si ncessaire.
Des problmes logistiques tels que la rservation de vhicules, l'achat de consommables
(carburant, papier, piles, etc.), les autorisations de dplacement et d'hbergement pour les
quipes sur le terrain doivent tre rgls l'avance.
63
Section E
67
La collecte dun grand volume de donnes est souvent ncessaire pour mener bien une
tude de caractrisation phnotypique. Les donnes doivent tre traites et analyses, et
les rsultats publis pour apporter des conseils sur les prises de dcision concernant les
ressources zoogntiques. La phase de planification de ltude doit aborder la gestion et
lanalyse des donnes de manire rigoureuse et approfondie. Cette section passe en revue
les activits et les outils requis.
Voir http://www.census.gov/population/international/software/cspro/
68
Traitement de linformation
Les activits dcrites dans ce paragraphe constituent une partie trs importante de la prparation des donnes avant lanalyse. Lanalyste est charg de veiller ce quelles soient
correctement ralises. Le traitement des donnes en fonction des besoins prcis de
ltude concerne tout ou partie des activits suivantes:
utiliser le logiciel de statistiques choisi pour importer lensemble de donnes stock
dans la base;
crire et excuter un programme pour cataloguer les variables et les valeurs;
fusionner ou fractionner les ensembles de donnes;
gnrer des variables drives ou composites pour une analyse plus approfondie;
transformer les donnes pour effectuer des contrles ou dautres analyses. Par
exemple, il peut tre plus facile de voir si les valeurs sont inhabituelles si elles sont
transformes en units familires comme le kilogramme ou lhectare. Lensemble des
donnes peut inclure diffrents types de donnes (ordinales, nominales, code de texte
discret, texte libre, images, fichiers vido, fichiers audio, etc.) Ces donnes doivent
tre codes et reclasses avant lanalyse;
crire et excuter un programme qui produit des statistiques descriptives de lensemble frquence des donnes qualitatives (par exemple, la couleur du pelage)
et moyennes et distributions simples des donnes quantitatives (par exemple, la
longueur du corps) pour nettoyer encore davantage les donnes. Les statistiques
69
70
Personnel et ressources
Lanalyse des donnes est un domaine trs technique qui ncessite une expertise professionnelle. Bien que les programmes statistiques puissent grer les tches de routine dans la
gestion et lanalyse des donnes, il est important de recevoir les conseils dun expert sur le
choix du modle et le traitement efficace des donnes. Plus important encore, les conseils
dun expert sont ncessaires pour guider lanalyse des donnes et sassurer quelle rpond
Programmes statistiques
Lanalyse des donnes doit disposer du matriel informatique et des programmes statistiques appropris. Les programmes utiliss doivent tre adapts aux objectifs de ltude et
au niveau de comptence de lanalyste. Comme indiqu plus haut, une gamme de logiciels
statistiques gnraux est disponible dans le commerce pour analyser les donnes (par
exemple, SAS, GenStat, SPSS, STATA, S -Plus, XLStat, CNSS, Statistica, Systat). Le logiciel
de domaine public R3 est non seulement distribu librement, mais permet galement le
dveloppement personnalis des outils danalyse. Une version antrieure de GenStat4
est disponible gratuitement dans certains pays en dveloppement. Des programmes statistiques spcialiss pour lanalyse des donnes denqute sont galement disponibles. En
gnral, les programmes statistiques choisis pour lanalyse doivent fournir les possibilits
suivantes:
une capacit suffisante pour faire face lampleur et la diversit des donnes qui
seront recueillies;
des algorithmes faciles dutilisation;
des capacits en tableaux et graphiques suffisantes;
des options danalyse des donnes rponses multiples;
les moyens de diagnostiquer si les donnes sont cohrentes avec les hypothses du
modle;
les moyens de prsenter les rsultats sous des formats qui facilitent linterprtation
des donnes.
Vrifiez si les programmes envisags permettent de prendre en compte simultanment
les variables quantitatives et qualitatives dans lanalyse des donnes; par exemple, SAS en
est incapable. Un logiciel qui permet de traiter conjointement les deux types de donnes
est prfrable car il permet une analyse plus complte.
La disponibilit des ressources (par exemple pour payer lutilisation de logiciels commerciaux) doit galement tre prise en compte dans le choix du programme statistique.
Les options et les implications relatives lutilisation future du logiciel (comme les frais de
renouvellement des licences annuelles obligatoires) doivent tre envisages. Si lquipe
dtude ne comprend pas de statisticien, il peut tre ncessaire de consulter un professionnel externe sur le choix du logiciel appropri. La facilit apparente avec laquelle le logiciel
traite les donnes et gnre des rsultats ne garantit pas lefficacit et lefficience du traitement des donnes, la slection des modles ou lobtention de rsultats.
3 http://www.R-project.org/
4 www.genstat.co.uk
71
72
des questions comme Qui sont les leveurs qui possdent des animaux appartenant la
race nouvellement identifie?
Analyse confirmatoire des donnes. Lanalyse confirmatoire des donnes a pour
principaux objectifs les estimations et le test des hypothses. Lanalyste doit dcrire les facteurs et les paramtres qui doivent tre estims et noncer lhypothse qui doit tre teste.
Il est important de veiller ce que les estimations prennent en compte les coefficients de
pondration de lchantillonnage. Si lchantillonnage est chelonn (stratifi), les observations ne seront pas chantillonnes avec une probabilit gale. Dans de tels cas, une
moyenne pondre (x = wx/ w avec des poids w) peut tre utilise la place de x pour
compenser les probabilits ingales. Si la moyenne pondre nest pas utilise, il est important de justifier la validit des estimations en expliquant pourquoi elles ont t calcules
sans pondration. Assurez-vous, ce stade, que les erreurs dchantillonnage (estimations
des erreurs types et des intervalles de confiance voir encadr 9) soient calcules.
Dans la caractrisation phnotypique, les mthodes danalyse des donnes multivaries
(classification) sont utilises pour valuer les similitudes morphologiques globales entre les
groupes danimaux, en sappuyant sur un ensemble slectionn de donnes phnotypiques
quantitatives et qualitatives. Ces mthodes sont prsentes dans la section A. Le lecteur est
pri dexaminer ces techniques avant de lire le reste de cette section.
Dans les tudes de caractrisation phnotypique primaire (lorsque lobjectif est didentifier des races distinctes), lanalyse doit inclure les actions suivantes:
Dterminer lunit taxonomique oprationnelle (UTO) pour la classification. Les UTO
peuvent tre des animaux individuels ou les moyennes des mesures prises sur un
chantillon danimaux provenant dun site particulier (centrodes).
Utiliser les outils danalyse de variance pour filtrer les variables afin de slectionner
celles qui contribuent de manire significative la variation phnotypique observe.
Dterminer si lanalyse des donnes doit tre faite par groupe de sexe (femelles
et mles sparment). Certains caractres phnotypiques dpendent du sexe de
lanimal. Si ces caractres contribuent de manire significative la variation totale
observe, ils doivent tre inclus dans lanalyse multivarie des donnes. Il peut tre
appropri danalyser sparment les donnes pour les animaux mles et femelles et
comparer les rsultats. Si les rsultats indiquent un dimorphisme sexuel important,
lanalyse finale de classification doit tre faite sparment pour les femelles et les
mles.
Vrifier et viter la colinarit dans lensemble des variables retenues pour lanalyse,
cest--dire viter les situations dans lesquelles les variables de classification sont
fortement corrles, comme lutilisation de caractres qui sont drivs dautres caractres (association) ainsi que les composants des caractres.
Transformer les donnes brutes en composantes principales standardises et indpendantes.
Dcider du type de mthode de regroupement utiliser pour llaboration de larbre
de classification (dendrogramme), la mthode la plus courante est squentielle,
ascendante, hirarchique et non chevauchante (SAHN).
Chercher linterprtation biologique la plus logique de larbre de classification.
73
74
75
Tableau 2
Type de variable
Application
Quantitative
Analyse de classification
multivarie
Quantitative
Analyse discriminante
Quantitative
Test de Bonferroni
Quantitative
Analyse en composantes
principales
Quantitative
Analyse en facteurs
Quantitative
Qualitative
Qualitative
Quantitative
Qualitative
Distance de Mahalanobis
Quantitative
Gntique
(identification des
allles)
F-statistiques de Wright
Gntique
(identification des
allles)
Gntique
(identification des
allles)
Analyse de Weitzman
Gntique
(identification des
allles)
* Les quatre dernires lignes du tableau dcrivent les mthodes utiliser dans les tudes gntiques.
Ces mthodes nentrent pas strictement dans le champ dapplication de ces directives, mais sont inclues titre
dinformation complmentaire.
76
ENCADR 10
2. Ndumu et al. (2008) ont suivi des procdures identiques pour caractriser et
identifier les populations de btail de la rgion des Grands Lacs en Afrique.
Cependant, Rodero et al. (sous presse) ont montr la supriorit des mthodes
statistiques heuristiques (perceptrons multicouches, rseaux de neurones probabilistes et machines vecteurs de support) par rapport aux analyses discriminantes pour diffrencier correctement des races locales andalouses.
Ces exemples montrent la ncessit de clarifier les objectifs de ltude de caractrisation et de choisir la mthode statistique approprie pour atteindre ces objectifs.
Auteur: Evangelina Rodero.
Section F
Rapports et communication
79
Rapports et communication
80
RAPPORT FINAL
Les objectifs et les questions spcifiques cibls par ltude de caractrisation doivent avoir
t clarifis ds le dbut du processus de planification (voir la section B). Le rapport final
doit apporter des rponses ces questions. Il est fortement recommand que le rapport
final soit mis la disposition du Coordonnateur national pour la gestion des ressources zoogntiques, du Comit consultatif national sur les ressources zoogntiques (sil existe), des
ministres concerns et de tous les partenaires qui ont particip ltude. La communaut
scientifique doit galement tre informe. Un bon moyen pour avoir une audience internationale est denvoyer le rapport la FAO pour linclure dans la bibliothque de DAD-IS et
le distribuer via le groupe de discussion lectronique DAD-Net.
En plus de fournir des rponses aux questions de ltude, un rapport final bien prpar
offrira galement une base pour la planification des tudes futures, indiquera sil est ncessaire de procder des tudes supplmentaires ou complmentaires, et attirera lattention
sur les possibilits damliorer la mthodologie. Le rapport doit prsenter le processus de
caractrisation du dbut la fin et noncer les conclusions de ltude.
Lensemble de lquipe doit tre impliqu dans sa prparation. Si les tapes dcrites
dans ces directives ont t suivies (cest--dire si tous les plans et les phases de travail ont
t correctement documents), une grande partie du rapport aura dj t prpare.
Lquipe dtude doit dcider sil est ncessaire de produire des rapports distincts pour
diffrents publics cibles (voir ci-dessous pour de plus amples dtails sur des projets de
communication diffrencis). La structure du (des) rapport(s) doit tre adapte aux publics
cibles. Sil est destin des chercheurs qui sintressent des donnes dtailles sur lesquelles ils peuvent travailler, le rapport doit suivre la structure standard dune publication
scientifique. Les dcideurs et les professionnels du dveloppement, qui recherchent des
stratgies et des ides pour les aider dans leur planification, seront plus intresss par des
rapports concis qui visent spcifiquement rpondre des questions comme:
Rapports et communication
81
Existe-t-il des races nayant pas t prcdemment identifies dans la zone dtude?
Les races dans la zone dtude ont-elles des caractristiques uniques?
Quel est leffectif estim de la population et la rpartition actuelle des races et leur
situation en matire de risque?
Existe-t-il des menaces qui mritent une attention immdiate?
Y a-t-il des activits de gestion en cours ou prvues pour ces races?
Les rsultats dune enqute auprs de 100 utilisateurs de donnes sur ce quils souhaitent
trouver dans les rapports de recherche (Hague, 2006) sont prsents dans le tableau 3.
Le rapport dune tude de caractrisation phnotypique peut inclure les lments suivants:
le rsum;
lintroduction, qui doit inclure un nonc des objectifs, les questions auxquelles il faut
rpondre et le champ dapplication de ltude;
la mthodologie, avec des dtails supplmentaires dans les annexes;
les rsultats;
la discussion sur les rsultats et leurs implications;
les recommandations pour la poursuite des travaux afin de rgler les problmes
en suspens, y compris les connaissances acquises sur le processus de ralisation de
ltude: ce qui aurait pu tre mieux fait et comment?
les rfrences;
les annexes, qui doivent inclure:
- les plans originaux dtaills pour les oprations sur le terrain, la gestion et lanalyse
des donnes, y compris la documentation de tous les changements dans ces plans;
- la description de larchivage des donnes;
- les annexes techniques qui apporteront des dtails sur lanalyse statistique;
- une liste des personnes et des institutions impliques.
TABLEAU 3
Rponses brves
33
Structure claire
29
Interprtation/conclusions
27
Recommandations/actions requises
21
Concision
21
Bien prsent
19
Bon rsum
Taille de lchantillon
18
100
* Rponses une question ouverte. Les personnes sondes ont mentionn plusieurs facteurs de sorte que le
total ne correspond pas 100.
Source: Hague (2006).
82
En plus du texte, les rsultats doivent tre prsents le cas chant sous forme de
graphiques et de tableaux. Les graphiques ont plus dimpact que les tableaux car ils simplifient la lecture des donnes et prsentent les principales conclusions sous forme dimages.
Inversement, un tableau peut contenir beaucoup plus dinformations quun graphique
tout en restant intelligible. Une attention particulire doit tre accorde la faon dont
les tableaux sont disposs, car cela affecte leur facilit ou difficult tre lus. Si possible,
les tableaux doivent non seulement prsenter les valeurs moyennes des mesures phnotypiques des populations slectionnes, mais aussi ltendue et lampleur des variations
autour de ces moyennes. Les chiffres figurant dans les tableaux doivent tre prsents sous
un format standard pour faciliter les mta-analyses et la comparaison entre les tudes.
La prsentation doit tre centre sur la mthodologie, les rsultats de lanalyse et
leur interprtation. Lencadr 11 fournit un aide-mmoire qui vous aidera faire en sorte
que cette partie du rapport remplisse son objectif. Le rapport doit, autant que possible,
contribuer lidentification des prochaines tapes logiques dans la gestion des ressources
zoogntiques.
Le rapport doit indiquer o et comment les copies lectroniques et les copies papier
des donnes brutes sont archives en toute scurit pour une utilisation future. Avec les
progrs rapides des outils danalyse statistique et de la capacit informatique, les donnes
de caractrisation des races provenant de diffrentes sources peuvent tre combines pour
analyser les volutions long terme des caractristiques des populations constitutives des
ressources zoogntiques, par exemple face la dgradation de lenvironnement et au
changement climatique.
Il faut envisager la manire dont les rsultats de ltude peuvent tre utiliss pour amliorer lenregistrement des donnes sur les races et les milieux de production du pays dans
DAD-IS. Les Coordonnateurs nationaux pour la gestion des ressources zoogntiques (ou
leurs collgues en charge) sont responsables de lentre des donnes dans DAD-IS (ou un
systme dinformation associ FABISnet). Lquipe de recherche doit veiller ce que la prsentation des donnes dans le rapport final permette de les transfrer efficacement dans de
tels systmes dinformation (par exemple, des tableaux de rsultats qui refltent les crans
de saisie de donnes dans DAD-IS).
Rapports et communication
83
ENCADR 11
Une fois que les messages pour chaque groupe de parties prenantes ont t dfinis, des
moyens de communication appropris doivent tre choisis en tenant compte des cots, de
lampleur de la couverture dsire et de limpact probable sur les bnficiaires. Les points forts
et les faiblesses des diffrents moyens de communication sont rcapituls dans le tableau 4.
La tlvision, la radio, les e-mail ou le Web peuvent tre utiliss pour diffuser du matriel
audio, des images ou des informations textuelles. Certains pays peuvent avoir des systmes
84
nationaux dinformation pour les ressources zoogntiques dans lesquels les donnes et
images peuvent tre publies. Les documents imprims et reproduits (CD-ROM, DVD)
doivent tre dvelopps, conus, produits et distribus en nombre suffisant. Les cots
engendrs et lexpertise ncessaire pour chaque tape du dveloppement du produit
doivent tre identifis et planifis.
TABLEAU 4
Forces
Faiblesses
- interactivit
-e
ncouragement de la
collaboration
- impact plus direct
-p
ossibilit de distribution de
documents imprims ou dautres
matriels de communication
- plus coteux
- moins coteux
- diffusion largie
- continuit
- aucune interactivit
- moins coteux
- diffusion largie
- continuit
- aucune interactivit
- besoins technologiques levs
- impact moins direct
- diffusion largie
- continuit
- confrences
- ateliers
- journes sur le terrain
- expositions, marchs
- activits de vulgarisation
- formations et dmonstrations
Matriel imprim
- documents dorientation
- prospectus, brochures
- rapports
- livres
- r evues scientifiques (nationales,
internationales)*
- presse agricole
- journaux locaux
- journaux nationaux
Audio:
- radio
- CD-ROM
- lecture de flux audio sur internet
Film:
- tlvision
- DVD
- lecture de flux vido sur internet
Systme dinformation sur le web:
- national
- international (par exemple
DAD-IS)
* La FAO supervise la publication de la revue Ressources gntiques animales (pour de plus amples informations, envoyez
un e-mail AnGR-Journal@fao.org).
** DAD-IS et le systme dinformation FABISnet connexe ont dj t mis en place si bien que les cots supplmentaires et
les besoins technologiques sont faibles.
Source: adapt de FAO (2012).
Rapports et communication
Quel que soit le moyen de communication choisi, les rsultats doivent tre rsums et
prsents de manire simple et comprhensible, en tenant compte des objectifs de ltude.
Des graphiques, tableaux, images et encadrs attrayants attirent lattention des lecteurs et
les aident se rappeler des messages cls.
Avant de finaliser et mettre en uvre la stratgie de communication, il faut envisager
les impacts potentiels sur les diffrents groupes de parties prenantes. Par exemple, la
publication de la dcouverte de nouvelles races via les mdias de masse peut conduire
une attention non dsire et des perturbations au sein des communauts dleveurs
concernes. Si ces impacts sont prvus, les personnes susceptibles dtre affectes doivent
tre consultes sur ce quelles jugent appropri et la manire dont elles aimeraient que le
processus soit gr5.
Notez que dans tous les cas, la dsignation et la prsentation des nouvelles races ncessite la consultation et
lapprobation des autorits nationales comptentes ou dun organisme mandat comme le Comit consultatif
national pour les ressources zoogntiques.
85
86
de caractrisation primaire ou avance. Dans le premier cas, sil est question de mener des
actions de suivi aprs ltude, il faudra dcider de la possibilit de mener une tude de
caractrisation avance plus approfondie sur les populations animales cibles. Cette dcision doit tre prise en collaboration avec les diffrentes parties prenantes qui pourraient
utiliser les rsultats ou tre impliques dans la mise en uvre de ltude. Les comits ou
groupes de travail supervisant les stratgies et les plans nationaux pour le dveloppement
de llevage et la gestion des ressources zoogntiques doivent galement tre consults.
Rfrences et annexes
89
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93
Annexe 1
94
Prsence de cornes (au niveau du troupeau; sparment pour les mles et les
femelles): pourcentage danimaux sans corne, pourcentage danimaux avec cornes
Attache des cornes (au niveau du troupeau; sparment pour les mles et les
femelles): pourcentage de cornes flottantes, pourcentage de cornes fixes
Forme de la corne: droite, courbe, en forme de lyre, flottante, moignon, sans corne
Orientation de la corne (au niveau du troupeau; sparment pour les mles et les
femelles): extrmits pointant latralement, vers le haut, vers le bas, en avant, en
arrire (indiquer galement si lanimal na pas de cornes, si les cornes sont flottantes,
ou si les cornes sont juste des moignons)
Type de poil:
--brillance: brillant, mat
--frisure: fris, raide
Longueur du poil: moyen (1-2 mm), long (> 2 mm)
Forme de loreille: arrondie, bords droits
Orientation de loreille: dresse, latrale, tombante
Taille de la bosse: absente, petite, moyenne, grande
Forme de la bosse: absente, dresse, tombante (en arrire, sur le ct)
Position de la bosse: thoracique, cervico-thoracique
Profil facial (tte): droit, concave, convexe, ultra-convexe
Taille du fanon: absent, petit, moyen, grand
Profil de la ligne du dos: droit, descend vers la croupe, descend partir du garrot,
creus (incurv)
Profil de la croupe: plat, inclin, pointu
Repli ombilical (pour les vaches): absent, petit, moyen, grand
Fourreau (pour les taureaux): absent, petit, moyen, grand
Longueur de la queue: courte (au-dessus des jarrets), moyenne (au niveau des jarrets),
longue (sous les jarrets)
VARIABLES QUANTITATIVES
Poids vif (si un pont-bascule est disponible) en spcifiant lge
Mensurations chez les mles et les femelles adultes ( 0,5 cm prs):
--tour de poitrine
--longueur du corps
--hauteur au garrot
--tour de museau
--tour de jarret
Pour des variables plus dtailles sur les caractres dadaptation, voir la partie V de lannexe 5.
Pour des variables plus dtailles sur lutilisation des animaux, voir la partie IV de lannexe 5.
Idalement obtenues grce aux groupes de discussion.
95
96
ILLUSTRATIONS
Longueur du corps
Remarque: Pour obtenir une position debout correcte, les pattes postrieures de lanimal doivent tre rapproches.
Si une patte arrire est en avant de lautre, la mesure sera inexacte. Mesurer partir de la pointe de lpaule jusqu
lischion. Ces deux repres sont dots dune saillie osseuse facilement reprable pour obtenir une mesure exacte.
97
98
Hauteur au garrot
Remarque: positionner la barre au niveau de lpaule pour permettre une mesure correcte de la hauteur.
Tour de poitrine
Longueur de la corne
Remarque: mesurer la distance la plus longue de la racine de la corne son extrmit, en suivant la courbure
extrieure.
Longueur de loreille
99
100
Largeur du bassin
Tour de museau
Remarque: prendre la mesure un peu au-dessus des naseaux et autour du point o le fanon rencontre le menton.
101
Annexe 2
102
Type de poil (chvre): brillant, poil doux, poil long raide, poil dur fris, mat
Longueur du poil: moyen (1-2mm); long (>2mm)
Prsence de cornes (au niveau du troupeau; sparment pour les mles et les
femelles): pourcentage danimaux sans corne, pourcentage danimaux avec cornes
Forme de la corne: partielle, droite, courbe, en spirale, en tire-bouchon
Orientation de la corne (au niveau du troupeau; sparment pour les mles et les
femelles): latrale, oblique vers le haut, en arrire (indiquer galement si lanimal na
pas de cornes, si les cornes sont flottantes, ou si les cornes sont juste des moignons)
Orientation de loreille: dresse, semi-pendante, pendante, horizontale
Profil facial (tte): droit, concave, convexe, ultra-convexe
Pampilles (chvres): absentes, prsentes
Barbe (chvres): absente, prsente
Collerette: absente, prsente
Type de queue (mouton): fine, avec une croupe grasse, paisse la base, grasse
forme de la queue (mouton): cylindrique et droite, cylindrique avec lextrmit recourbe vers le haut, bilobe sans appendice, large sans lobe
Profil de la ligne du dos: droit, descend vers la croupe, descend partir du garrot,
creus (incurv)
Profil de la croupe: plat, pentu, pointu
VARIABLES QUANTITATIVES
Poids vif (si une balance ou un pont-bascule est disponible) en spcifiant lge
Taille du corps chez les mles et les femelles adultes ( 0,5 cm prs):
--longueur du corps
--hauteur au garrot
--tour de poitrine
--profondeur de poitrine
--cart entre les pointes des paules
--longueur de la croupe
--largeur de la croupe
--longueur de la tte
--largeur de la tte
--tour du canon
--longueur de la corne
--longueur de loreille
--longueur de la queue (mouton)
--longueur du poil/ laine (sur la ligne du dos, sur la croupe)
Pour de plus amples dtails sur les caractres dadaptation, voir la partie V de lannexe 5.
Pour de plus amples dtails sur lutilisation des animaux, voir la partie IV de lannexe 5.
Idalement obtenues grce aux groupes de discussion.
103
104
Types de communauts ou exploitations qui lvent cette race: leveurs commerciaux, leveurs de subsistance, leveurs pastoraux, centres de slection, stations
exprimentales
Activits connues ou signales damlioration de la race
Mlanges ou croisements de la race (planifis ou alatoires), connus ou signals
13
ILLUSTRATIONs
Longueur du corps mouton
105
106
Hauteur au garrot
Remarque: le mtre doit tre tenu verticalement et ne doit pas tre courb le long des paules de lanimal.
Remarque: appuyer doucement pour tre sr que lpaisseur de la laine ne fausse pas la mesure.
107
108
Remarque: mesurer la distance la plus longue de la racine de la corne son extrmit en suivant la courbure extrieure.
Remarque: mesurer la distance la plus longue de la racine de la corne son extrmit en suivant la courbure extrieure.
109
110
111
113
Annexe 3
114
VARIABLES QUANTITATIVES
Poids vif, si une balance ou pont-bascule est disponible
Mensurations chez les mles et les femelles adultes ( 0,5 cm prs):
--longueur du corps (longueur entre lextrmit du rostrum maxillare (bec) et celle
de la cauda (queue, sans tenir compte des plumes); le corps de loiseau doit tre
tir sur toute sa longueur,
--tour de poitrine (pris la pointe du pectus [poitrine])
--longueur du tarse (longueur en cm du tarse depuis larticulation avec le pilon
jusqu lergot de chaque patte)
--envergure des ailes (longueur en cm entre les extrmits des ailes droite et gauche
aprs les avoir tires de tout leur long)
Pour des questions plus dtailles sur les caractres dadaptation, voir la partie V de lannexe 5.
Pour plus de dtails sur les utilisations des animaux, voir la partie IV de lannexe 5.
16 Idalement obtenues grce aux groupes de discussion.
15
115
Races connues pour tre les plus troitement lies cette race
Origine de la race
Origine des animaux, sils sont imports (nom du pays et anne(s) dimportation)
Rpartition gographique de la race (si possible gorfrence)
Types de communauts ou dexploitations qui lvent la race: leveurs commerciaux,
leveurs de subsistance, centres de de slection, stations exprimentales
Estimation de leffectif total, accompagn de lanne de lestimation et de la source/
rfrence
Toute autre information spcifique la race
Mle
Moyenne
Plage de
variation
Femelle
N
Moyenne
Plage de
variation
closion (g)
8 semaines (g)
12 semaines (g)
Poids adulte (kg)
17
18
116
19
Le rendement labattage est la proportion, en pourcentage, du poids de la carcasse par rapport au poids vif
de lanimal, en spcifiant si oui ou non le poids labattage a t fait sur un animal jeun, et si la carcasse tait
chaude ou froide pendant la mesure.
ILLUSTRATIONs
Longueur du corps
Remarque: mesure de la pointe du bec lextrmit de la queue (sans tenir compte des plumes). Il faut tirer
compltement le cou (qui a une forme sigmodale), en tenant le poulet en position couche.
117
118
Tour de poitrine
Longueur du tarse
119
120
121
Annexe 4
122
VARIABLES QUANTITATIVES
Poids vif (si une balance ou un pont-bascule est disponible) avec lge spcifi
Mensurations corps pour un verrat et une truie adulte ( 0,5 cm prs):
--longueur du corps
--longueur de la tte
--longueur de la queue
--longueur de loreille: mesurer la longueur ou classer en tant que grand, moyen ou
petit
--tour de poitrine
--hauteur au garrot
--nombre de trayons: nombre de ttines normales et rudimentaires sur la truie ou la
cochette
Pour des questions plus dtailles sur les caractres dadaptation, voir la partie V de lannexe 5.
21
Pour des questions plus dtailles sur les utilisations, voir la partie IV de lannexe 5.
Idalement obtenues grce aux groupes de discussion.
23 Daprs les leveurs.
22
123
124
ILLUSTRATIONs
Longueur du corps
Tour de poitrine
Hauteur au garrot
Remarque: maintenir le mtre ruban sur une ligne droite jusquau point le plus lev de lpaule du porc. Ne pas
courber le mtre ruban autour de lpaule.
125
126
Longueur de loreille
Largeur du bassin
Longueur de la queue
Tour de jarret
Remarque: cette mesure est particulirement difficile prendre car les porcs peuvent facilement devenir nerveux
lorsquon manipule leurs pattes.
127
129
Annexe 5
130
Caractristiques du terrain
Altitude
--altitude moyenne pour ce milieu de production (m au-dessus du niveau de la mer)
-- altitude la plus basse pour ce milieu de production (m au-dessus du niveau de la mer)
--point culminant de ce milieu de production (m au-dessus du niveau de la mer)
Pente: le terrain de ce milieu de production est gnralement choisissez une
rponse parmi:
--plat
--vallonn
--escarp et montagneux
--trs variable
Le pH du sol - le sol de ce milieu de production est gnralement:
--trs alcalin (pH> 8,5)
--neutre (pH compris entre 5,5 et 8,5)
--trs acide (pH <5,5)
Les conditions de surface indiquer les principaux tats du substrat sur lequel les
animaux sont gnralement levs:
--vgtation naturelle
--pierreux/rocheux
--sableux
--gnralement humide substrat trs marcageux
--rgulirement et/ou frquemment inond
--rgulirement et/ou frquemment couvert par la neige/glace pendant lhiver
--types de substrats trs variables
Le couvert forestier: indiquer le pourcentage de couverture forestire dans ce milieu
de production.
Maladies, parasites27 et autres menaces pour la sant animale:
Dressez la liste des maladies et des parasites qui prsentent, ou ont prsent, une menace
importante pour les animaux de cette espce dans ce milieu de production et indiquer leur mode
dapparition. Notez que la race elle-mme peut tre rsistante ou tolrante, et ainsi ne prsenter
que peu ou pas de symptmes lorsquelle est atteinte par la maladie ou infeste par le parasite.
Considrez les catgories suivantes de maladies, ectoparasites, endoparasites et autres
menaces:
Catgories de maladies
--bactrienne
-- rickettsia
--virale
--fongique
-- prion
27
Les listes de maladies et de parasites qui peuvent tre saisies dans le module PEDs de DAD-IS sont fournies en
annexe du rapport de la Runion dexperts FAO/WAAP sur les descripteurs des milieux de production (FAO/
WAAP, 2008). Les tudes de caractrisation phnotypique individuelles doivent tenter de dcrire les maladies et
parasitoses locales de manire aussi exhaustive que possible.
131
132
Contrle de lambiance:
--protection lmentaire contre la chaleur (abris, arbres dombrage, etc.)
--protection lmentaire contre le froid (abris, brise-vent, etc.)
--logement ambiance non compltement matrise
--logement ambiance entirement matrise
--installations de refroidissement (mares boueuses, jets deau, etc.)
Lutte contre les maladies, parasites et autres menaces pour la sant
--Pour chaque maladie rpertorie comme prsentant une menace pour le milieu de
production local, choisissez lune des options suivantes - la plupart des animaux
sont vaccins:
jamais
parfois
rgulirement
--La plupart des animaux reoivent un traitement prventif contre les ectoparasites
ou autres vecteurs:
jamais
parfois
rgulirement
--La plupart des animaux reoivent un traitement prventif contre les endoparasites:
jamais
parfois
rgulirement
--La plupart des animaux reoivent un traitement vtrinaire quand ils sont malades:
jamais
parfois
en cas de besoin
--La plupart des animaux sont soumis des traitements traditionnels:
jamais
parfois
rgulirement
Disponibilit et gestion de lalimentation et de leau
--Laccs leau potable est:
normalement illimit
parfois limit
souvent limit
--La teneur en sel de leau potable
Leau potable a une forte teneur en sel: oui/non
--La disponibilit en aliments (quantit et qualit):
non limite
souvent limite pendant certaines priodes de lanne
limite tout au long de lanne
133
134
Type daliments
Type daliments
donns aux
animaux
pturages naturels, y
compris les feuilles darbres
et darbustes fourragers
(abroutissement)
pturages sems
cultures fourragres
concentrs
sous-produits industriels
faible valeur nutritionnelle
complments minraux
vitamines et oligo-lments
En dehors de
la priode de
croissance de la
vgtation
Toute lanne *
135
136
Communaut/
cooprative
Mnage
Femme
Homme
Echelle de production
Ventes/achats
Intensit de production
Marchs viss
Objectifs de reproduction
Partage des tches entre les hommes et les femmes cocher une ou plusieurs cases
de chaque range
Partage des tches
Mnages
Communaut/
cooprative
Femme
Homme
Enfants
Alimentation
Abreuvement
Gardiennage
Hygine
Gestion de la sant
Gestion de la reproduction
Notez que les lments de cette feuille dcrivent les adaptations des animaux aux milieux de production plutt
que les caractristiques des milieux de production en soi. Dans les tudes de caractrisation phnotypique
primaires, ces donnes sont principalement collectes grce des entretiens individuels ou de groupe avec les
leveurs de btail et dautres informateurs cls. Des informations plus dtailles peuvent tre obtenues grce
des tudes de caractrisation avance.
137
139
Annexe 6
140
Age (anne)
agneau
moins de 1 an
8 incisives de lait
animal dun an
1-2 ans
jeune adulte
2-3 ans
adulte
3-4 ans
mature
4-5 ans
plus de 5 ans
trs amaigri
pas de muscles et de graisse entre la peau et les os dans la rgion lombaire
les graisses de rserve de la queue ont t utilises et les faces intrieure et extrieure
utilises et on
les
les apophyses transverses sont lisses et rondes et on peut facilement passer les doigts
en dessous
les apophyses pineuses sont lisses et arrondies et on peut sentir leurs os en appuyant
lgrement dessus
les os du
les
apophyses pineuses sont palpes comme une ligne lors du passage de la main
sur le dos
les apophyses transverses sont bien couvertes et ne peuvent pas tre palpes
les os coccygiens ne peuvent tre palps en exerant une pression sur le ct intrieur
de la queue
Source: http://www.eurekaencyclopedia.com/index.php/Category:Chicken_Plumage
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Barr: plumes montrant des rayures de deux couleurs (barres). Dans le cas de la barrure lie
au sexe (coucou) la barre est blanche et se voit sur un fond noir ou rouge, alors quelle est
noire dans le cas de la barrure autosomale et se voit sur un fond rouge ou argent. Lorsque
les barres sont blanches sur un fond dune couleur, comme dor ou chamois, la couleur est
dcrite comme tant barre (coucou)-dore ou barre (coucou)-chamois.
Couleur uniforme: la mme couleur uniforme dans tout le plumage, comme dans les
varits noires ou blanches.
Couleur unie: toutes les couleurs du plumage sont du mme ton, cest--dire de la mme
teinte ou nuance.
Couleur de la surface: couleur de la partie du plumage qui est expose lorsque les plumes
sont en position naturelle.
Couleur de fond: couleur de base ou prdominante de la surface dune plume. Chez les
varits denteles (laces), crayonnes, barres, paillete ou cailloutes, cest la couleur sur
laquelle les motifs sont dlimits.
Sous-couleur: couleur de la partie infrieure ou pelucheuse des plumes, non visible
lorsque les plumes sont en position naturelle.
Couleur trangre: couleur dans nimporte quelle partie de la volaille qui diffre grandement de la couleur standard.
Moussu: marquages de couleur confus, indistincts, irrguliers ou dsordonns qui
dtruisent le contraste ou le motif de couleur dsir.
Farineux: sapplique au plumage chamois ou roux tachet avec une couleur plus claire,
comme si il avait t saupoudr de farine ou de semoule.
Maill: prsence de trois bandes en collier sur la surface de la plume.
Crayonnage: alternance de marques transversales sombres, comme chez les femelles
Hambourg crayonnes argentes ou dores.
Barrage: marques violettes transversales sur les plumes noires.
Poivr (saupoudrage): plumes saupoudres de petits points de couleur noire ou grise
(pointills).
Coch: grains ou petites tches de couleur noire sur les pointes des plumes de la partie
infrieure du cou.
Dentel (lace): bordure de couleur contraste sur le pourtour de la surface dune plume.
Glaage: marge dilue sur un plumage dentel ou paillet noir.
Paillet (pailletage): marquage distinct de couleur contraste lextrmit dune plume,
en forme de V bien dfini en partie proximale et avec une extrmit distale arrondie. Toujours de couleur noire et peut tre associ avec une couleur de fond argent ou dore.
Caillout / panach: plumage dans lequel la majorit des plumes se terminent par une
pointe blanche. Notez que le panach diffre du caillout en ce que le plumage panach comporte des plumes totalement blanches, des plumes avec des taches blanches et
dautres entirement colores.
Multicolore: poules ayant des plumes de deux ou plusieurs couleurs ou de la mme couleur mais avec des nuances diffrentes.
Fauve: marron-dor clair.
Chamois: nuance moyenne de la couleur jaune-orange avec un teinte dore riche.
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plus le risque de dommages sur la peau et les yeux est important, et plus les dommages se
produisent rapidement.
En labsence dUVI spar pour les espces danimaux dlevage, lUVI humain est considr
comme un substitut pour les conditions dans lesquelles les espces danimaux dlevage
sont susceptibles dtre affectes par des niveaux levs de rayonnement ultraviolet.
Les catgories dexpositions et les couleurs suivantes sont associes aux diffrentes valeurs
de lindice37:
Catgorie
Gamme UVI
Couleur
Faible
02
Vert
Modre
35
Jaune
Forte
67
Orange
Trs forte
8 10
Rouge
Extrme
11
Violet
Lindice UVI a t dvelopp par lOrganisation mondiale de la sant (OMS), en collaboration avec le
Programme des Nations Unies pour lenvironnement (PNUE), lOrganisation mtorologique mondiale (OMM),
la Commission internationale de protection contre les rayonnements non ionisants (ICNIRP), et le Bureau fdral
allemand de la radioprotection.
37 Source: OMS. 2002. Indice de rayonnement UV solaire: un guide pratique. Genve.
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38
FAO. 2000. Manual on participatory epidemiology method for the collection of action-oriented
epidemiological intelligence, par J.C. Mariner et R. Paskin. Manuel de sant animale No. 10. Rome
(disponible http://www.fao.org/docrep/003/X8833E/x8833e00.htm).
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agents.
Prophylaxie occasionnelle contre les agents vectoriels et ectoparasites: se
rfre aux situations dans lesquelles certaines mesures de lutte sont appliques, mais
les animaux sont peu susceptibles dtre protgs de manire adquate contre les
effets nocifs des ectoparasites et des autres agents.
Prophylaxie contre les endoparasites: se rfre lutilisation de mdicaments vtrinaires comme mesure prventive contre les endoparasites (par exemple, un programme de
vermifugation).
Prophylaxie rgulire contre les endoparasites: se rfre aux situations dans
lesquelles des mesures de lutte sont appliques selon un calendrier qui limine ou
minimise les effets nocifs des endoparasites.
Prophylaxie occasionnelle contre les endoparasites: se rfre aux situations dans
lesquelles certaines mesures de lutte contre les endoparasites sont appliques, mais
les animaux sont peu susceptibles dtre protgs de manire adquate contre les
effets nocifs des endoparasites.
Traitements vtrinaires: se rfre lutilisation de mdicaments ou dautres interventions, le cas chant, pour gurir des animaux quand ils sont malades.
Traitement vtrinaire en cas de besoin: dsigne les situations dans lesquelles les
animaux malades reoivent toujours, ou habituellement, le traitement vtrinaire appropri (recommand par un vtrinaire comptent familiaris avec le systme de production).
Traitement vtrinaire occasionnel: se rfre aux situations dans lesquelles les
animaux malades reoivent parfois un traitement vtrinaire appropri.
Traitement traditionnel: lapplication de traitements bass sur les connaissances indignes pour contrler ou rduire la propagation de maladies et de parasites et/ou leurs effets
sur les productions animales.
Accs leau de boisson: se rfre la quantit deau potable disponible pour le btail.
Niveaux levs de sel: se rfre la prsence de sel dans leau des concentrations qui
nuisent normalement la sant ou la performance des animaux de lespce en question.
Disponibilit des aliments pour animaux (quantit et qualit): se rfre la mesure
dans laquelle lalimentation disponible (vgtation pture/abrouties et aliments fournis par
lleveur) peut rpondre aux besoins nutritionnels des animaux. La quantit et la qualit des
aliments doivent tre prises en considration pour rpondre cette question linsuffisance
nutritionnelle peut tre le rsultat dune alimentation en quantit insuffisante, de mauvaise
qualit ou une combinaison des deux. Lobjectif de cette question est dobtenir une vue
densemble de ltat nutritionnel des animaux (sils sont confronts des contraintes nutritionnelles continues ou saisonnires, ou sils sont bien nourris tout au long de lanne).
Type, proportions et saisonnalit de lalimentation: dsigne les principales composantes de lalimentation des animaux (voir la liste), leurs proportions approximatives (calcules
partir de la matire sche) et leur variation suivant les saisons.
Concentrs: aliments qui contiennent une forte teneur en nutriments, ils sont gnralement faibles en teneur en cellulose brute (moins de 18 pour cent de la matire sche)
et riches en nutriments digestibles totaux. Les concentrs peuvent tre riches en nergie
39
Source: Hendy, C.R.C., Kleih, U., Crawshaw, R. & Phillips, M. 1995. Interactions between livestock production
systems and the environment impact domain: concentrate feed demand. Livestock and the environment
finding a balance. Natural Resources Institute, Chatham, Royaume-Uni
(disponible http://www.fao.org/WAIRDOCS/LEAD/X6123E/x6123e00.htm#Contents).
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de la production (animaux vivants et produits) qui est commercialise au lieu dtre utilise
pour la subsistance:
entirement ax sur le march
>90 pour cent
orient la fois vers le march et la subsistance 10-90 pour cent
orient vers la subsistance
<10 pour cent
Marchs cibls: principaux marchs gnralement cibls par les leveurs de la race quand
ils vendent leurs animaux ou leurs produits.
Marchs internationaux: fonctionnent lchelle mondiale et demandent des produits
uniformes avec une garantie de qualit.
Marchs rgionaux: se rfrent une rgion gographique particulire du monde qui a
des exigences spcifiques. Certains marchs rgionaux formels exigent des produits uniformes avec une garantie de qualit, mais les marchs informels acceptent des produits moins
uniformes o la qualit du produit nest pas toujours garantie.
Marchs nationaux: fonctionnent au sein des frontires nationales dun pays spcifique et
demandent gnralement des produits uniformes avec une garantie de qualit.
Marchs locaux: fonctionnent au niveau sous national dans un pays spcifique. En gnral, ils sont moins exigeants concernant luniformit des produits que les marchs nationaux, et la qualit des produits nest pas toujours garantie. Les marchs locaux peuvent tre
des marchs formels ou informels.
Marchs de niche: sous-ensembles dun secteur de march plus prcisment cibls. Ils
peuvent tre considrs comme un groupe troitement dfini de clients potentiels. En raison des avantages de la spcialisation et du ciblage de segments de march identifiables,
les projets de march de niche peuvent tre rentables mme sils sont par nature plus petits
que les marchs de masse. Un march de niche peut tre un sous-ensemble dun march
local, national, rgional ou international.
Aspects sexospcifiques: Ltude des aspects relatifs au genre et lobtention de donnes
ventiles par sexe permet de mieux comprendre les diffrences conomiques, sociales et
politiques qui existent entre les hommes et les femmes; fournit des informations pour
renforcer les efforts pour surmonter les disparits entre les hommes et les femmes dans
le processus de dveloppement; permet de planifier des programmes de dveloppement
qui tiennent compte de la situation spcifique des deux sexes; et contribue crer un
environnement favorable pour le dveloppement durable du pays dans son ensemble.
Dans certains milieux socio-conomiques, les hommes et les femmes sont diffremment
impliqus dans les activits et prises de dcision lies llevage. Dans certaines cultures, le
travail peut tre fait par des enfants. Les groupes distincts selon le genre peuvent prendre
des dcisions diffrentes et faire le travail diffremment. Ces diffrences peuvent influencer
ladaptation et la performance de la race. Il est galement important de les prendre en
compte correctement lors de la planification des activits de gestion des ressources zoogntiques ou, plus gnralement, de dveloppement du secteur de llevage.
Les principaux domaines de prise de dcision pertinente pour la production animale sont:
lampleur de lactivit, lintensit de la production, les ventes/achats, les marchs cibls et
les objectifs de slection. Les principaux domaines dactivit lis llevage sont les suivants: lalimentation, labreuvement, llevage, lhygine, la gestion de la sant, la gestion
de la reproduction, la rcolte et le commerce des produits.
Echelle de production: se rfre la dcision concernant la taille du cheptel possd par
la famille (pour autant que cela puisse tre dtermin par les leveurs).
Intensit de production: se rfre aux dcisions sur le type et la quantit dintrants externes et internes, y compris la main-duvre et la terre, utiliss pour le cheptel.
Ventes/achats: se rfre aux dcisions concernant la priode et le choix des animaux qui
seront achets ou vendus.
Marchs cibls: se rfre aux dcisions concernant les marchs cibler pour vendre les
produits dorigine animale et les services (par exemple, marchs de niche versus march de
masse; marchs internationaux versus rgionaux versus nationaux versus locaux, marchs
saisonniers versus marchs prennes).
Objectifs de slection: se rfre aux dcisions concernant les caractres que les leveurs
souhaitent amliorer, maintenir ou introduire dans leurs troupeaux.
Abreuvement: travail ncessaire pour fournir de leau de boisson aux animaux ( noter que
le dplacement des animaux un point deau est inclus sous le terme pastoralisme).
Pastoralisme: amener les animaux dans une zone de pturage ou un point deau, les
surveiller si ncessaire, et les dplacer en cas de besoin.
Hygine: le nettoyage de labri, de lenclos, des cages ou des animaux eux-mmes.
Gestion de la sant: toutes les activits qui maintiennent ou amliorent la sant animale
(autre que la ration dentretien, labreuvement et lhygine).
Gestion de la reproduction: toutes les activits qui permettent le contrle de la reproduction (par exemple, la castration, laccouplement, linsmination).
La rcolte des produits: toutes les activits entreprises pour extraire, collecter ou prlever
les produits dorigine animale (par exemple la collecte des ufs, la traite, la tonte).
Commercialisation des produits et des animaux: toutes les activits impliques dans
la vente danimaux ou de produits dorigine animale un intermdiaire ou consommateur.
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Multil. Multilingue
* Epuis
** En prparation
e
Publication lectronique
On peut se procurer les Directives FAO de production et sant animales auprs des points de
vente des publications de la FAO, ou en sadressant directement au Groupe des ventes et de la
commercialisation, FAO, Viale delle Terme di Caracalla, 00153 Rome, Italie.
Le Plan d'action mondial pour les ressources zoogntiques, adopt en 2007, est
le premier cadre convenu au niveau international pour la gestion de la
biodiversit dans le secteur de l'levage. Il implique llaboration de directives
techniques pour soutenir les pays dans leurs initiatives de mise en uvre. La FAO
a publie en 2009 les directives sur la Prparation de stratgies et de plans
d'action nationaux pour les ressources zoogntiques qui sont prsent
compltes par une srie de directives traitant de sujets techniques spcifiques.
Ces directives sur la Caractrisation phnotypique des ressources zoogntiques
s'adressent la Priorit stratgique 1 du Plan d'action mondial: Caractrisation,
inventaire et surveillance des volutions et des risques associs. Elles compltent,
en particulier, les directives sur la caractrisation gntique molculaire et sur la
ralisation d'enqutes et de suivi pour les ressources zoogntiques. Elles ont t
approuves par la Commission des ressources gntiques pour l'alimentation et
l'agriculture.
Ces directives donnent des conseils sur la faon de mener une tude de caractrisation phnotypique bien cible et rentable qui contribue l'amlioration de la
gestion des ressources zoogntiques dans le cadre de la mise en uvre du Plan
d'action mondial au niveau des pays. Un aperu des concepts et des approches qui
soutiennent les tudes de caractrisation phnotypique est suivi de conseils
pratiques sur la planification et la mise en uvre des activits sur le terrain, ainsi
que sur la gestion et l'analyse de donnes. Les annexes comprennent des formats
gnriques de collecte de donnes pour la caractrisation phnotypique des
principales espces d'levage, ainsi qu'un cadre pour l'enregistrement de
donnes sur les milieux de production des races.
I2686F/1/11.13