NATURALEZA DEL GEN Y EL GENOMA

D. en C. No Velzquez Mrquez

Introduccin
1865
individuales
herencia)

(unidades
de
la

1880; W. Flemming
(cromosomas)

1903; W. Sutton
(cromosomas homlogos)

1909-1911
(entrecruzamiento)

1911-1913; H Morgan (mapeo y

ordenamiento de genes)

Introduccin
1944-1952
(DNA como
material
gentico)

1953
(Estructura
del DNA)

Introduccin

Cromosomas politnicos

Introduccin

Drosophila melanogaster
(13,601)

Seres humanos (22,000)

Bacterias (5,000)

Levaduras (6,245)

Nematodo (18,424)

Introduccin
Se estima que los genes humanos forma
alrededor de 1,000 familias diferentes
La totalidad de los genes y el DNA de cada
clula de un organismo se llama genoma

genmica

La totalidad de las protenas que se expresan

en un organismo se llama proteoma

protemica

Introduccin
Los genes se localizan en los cromosomas
Locus gentico
(posicin definida de
un gen)
Loci (conjunto de locus)

Qu es un gen?
Un gen se define como la secuencia completa de cidos nucleicos necesaria
para la sntesis de un producto gnico funcional (polipptido o RNA).
Sitio de unin del represor
paro

inicio

Enhancer

Gen
Sitio de
unin del
activador

Caja
TATA

Intrn

Exn

Terminador

Expresin gnica

cidos nucleicos
Los cidos nucleicos son macromolculas construidas con series largas
(cadenas) de monmeros llamados nucletidos.

DNA (cido desoxirribonucleico)

RNA (cido Ribonucleico)

Funciones

Almacenamiento y transmisin de la
informacin gentica
Funciones estructurales y catalticas

cidos nucleicos: nucletidos

Base
nitrogenada

Nuceltidos
(componentes)

Pentosa
Fosfato

cidos nucleicos: nucletidos

Bases nitrogenadas

Guanina (G)

Citosina (C)

Purinas

pirimidinas

Adenina (A)

Timina (T) (DNA)

Uracilo (U) (RNA)

cidos nucleicos: nucletidos

Los cidos nucleicos contienen dos tipos de pentosas
Los desoxinucleotidos del DNA

Los ribonucleotidos del RNA

La molcula sin el grupo

fosfato se denomina
nuclesido
2-desoxi-D-ribosa

D-ribosa

cidos nucleicos: nucletidos

Bases purnicas y pirimidnicas secundarias

Formas metiladas
Formas hidroximetiladas
(DNA vrico)

Formas
glicosiladas
(DNA vrico)

Son importantes
en la regulacin y
proteccin de la
informacin
gentica

En el RNA, y en especial el tRNA, se

encuentran tambin base secundarias

Bases purnicas y pirimidnicas secundarias

Bases poco abundantes en el DNA

Bases poco abundantes en el RNA

Los nucletidos estn unidos por enlaces ster

Extremo 5

Los nucletidos sucesivos de los

cidos nucleicos (DNA y RNA) estn
unidos por enlaces fosfodister

Enlace
fosfodister

Extremo 5
Enlace
fosfodister

Extremo 3

Enlace fosfodister
Extremo 3

Los nucletidos estn unidos por enlaces ster

Extremo

G
P

A
P

Extremo
OH

La secuencia de bases est escrita en la direccin 5 3

El DNA y el RNA tienen POLARIDAD

Estructura de
cidos nucleicos

los

El DNA almacena informacin gentica

1) Experimento de Avery-MacleodMcCarty (1944)
2) Experimento
(1952)

de

Hershey-Chase

Reglas de Chargaff (1950)

1) [A]=[T] y [G]=[C]
2) La suma de las [purinas] = a la suma de las [pirimidinas]

3) El porcentaje de ([C] + [G]) no necesariamente es igual a la de ([A] +

[T])

Reglas de Chargaff (1950)

G

A=3

T=3

G=4

C=4

Purinas (7)

G + C (57%)
T + A (43%)

Pirimidinas (7)

Difraccin de rayos X

Hemoglobina

Linus Pauling

Interpretacin del patrn difraccin de

rayos X del DNA

Rosalind E.
Franklin

Propuesta de Watson y Crick

1953. Ao culminante:
J. Watson y F. Crick resuelven la estructura tridimensional del
DNA (Nature 171: 737-738)

1953. Ao culminante:

Complementariedad de las bases

Modelo en metal
del DNA
J. Watson y F. Crick
Concluyen: La estructura del DNA es una
doble
hlice,
formada
por
cadenas
orientadas
en
direcciones
opuestas
(antiparalelas). La estructura se mantiene
gracias a enlaces de hidrgeno entre las
bases nitrogenadas que se encuentran
orientadas hacia el interior de las cadenas

Estructura del DNA

El DNA es un polmero de
unidades de desoxirribonucleico

Guanina (G)

Citosina (C)

Purinas

pirimidinas

Adenina (A)

Timina (T)

Estructura del DNA

Esta formado por dos cadenas
complementarias de nucletidos

3.4
Surco
mayor

Doble hlice dextrgira

Cadenas antiparalelas

36
Surco
menor

20

DNA-B dextrgira

Replicacin del DNA segn Watson & Crick

DNA parental

Progenie
(1ra generacin)

Progenie (2da generacin)

El DNA adopta diferentes formas

tridimensionales
Forma A

Predomina
en
disoluciones
relativamente pobres en agua (in
vitro)

Forma B

Forma natural

Forma Z

Predomina en regiones cortas del

DNA de procariotas y eucariotas

El DNA adopta diferentes formas

tridimensionales

Estructuras de DNA no habituales

1) Secuencias palindrmicas

Dbale arroz a la zorra el abad

Estructuras de DNA no habituales

2) DNA triplex (apareamiento de
Hoogsteen)

3)
Tetrplex
(apareamiento
cuatro hebras)

G
de

Estructuras de DNA no habituales

4) DNA H
(DNA triple)
Presente en regiones de
polipurina y polipirimidina

Dos hebras contienen

pirimidinas

Una
contiene
purinas

Estructuras de DNA no habituales

Replicacin
Recombinacin

Transcripcin

Estructura del RNA

Guanina (G)

Citosina (C)

Purinas

pirimidinas

Adenina (A)

Uracilo (U)

mRNA
tRNA
rRNA

snRNA

piRNA

snoRNA

scaRNA

siRNA
miRNA

DNA superenrollado

DNA superenrollado
Positiva torcimiento excesivo

Negativa desenrollamiento (mitocondrial, viral, bacteriano; DNA

lineal eucariota)
Durante la replicacin del
DNA
Durante la transcripcin

Las topoisomerasas
Catalizan cambios en el nmero de enlaces del DNA (aumentan o
disminuyen el grado de subenrollamiento del DNA)

Topoisomerasas I (rotura
en una sola cadena)

Replicacin
Transcripcin

Topoisomerasas
Topoisomerasas
(rotura en las
cadenas)

II
dos

Desenreda las molculas

de DNA antes que los
cromosomas duplicados
puedan
separarse
durante la mitosis

Las topoisomerasas
Doxorrubicina

Etopsido

Topoisomerasas II

Afecta la separacin
de las cadenas

Estructura del genoma

Secuencias
altamente
repetidas (1
10%)

GENOMA
EUCARITA

Secuencias
moderadamente
repetidas (20 a
80%)
Secuencias
repetidas

no

Estructura del genoma

Secuencias
altamente
repetidas (1 a
10%)

DNA satlite (5 a
500 pb)

Forman grupos que contienen 100

millones de pb (aparecen rpido
en el transcurso de la evolucin)

DNA minisatlite
(10 a 100 pb)

Grupos de 1000 a 3000 pb

repeticiones
(muy
inestables
puede aumentar o disminuir)

DNA microsatlite (2
a 5 pb)

Grupos de 100 pb o menos copias

repetidas
(se
encuentran
esparcidas de forma uniforme)

Estructura del genoma

DNA minisatlite
Gran inestabilidad por el
entrecruzamiento desigual

Polimrficas
Anlisis de huellas
genmicas
1 2 3 4

8 9 10

Estructura del genoma

DNA microsatlite

Tipo I
Trastornos
Tipo II

Trinucletidos
(CCG o CAG)

repetidos

Anomalas
neurodegenerativas
con
repeticin del trinucletido CAG dentro
de las porciones codificantes del gen
Expansin
de
una
variedad
de
trinucletidos (CAG, CCG, CGG) y se
presentan en una parte del gen que no
codifica a.a

Estructura del genoma

DNA microsatlite
5 UTR

Sndrome de X-frgil

Gen FMR1 (17 exones)

CGGn

CGGn (5-60) Normal

CGGn (60-200) premutacin (portador)

CGGn >230 repeticiones mutacin completa

METILACIN

Estructura del genoma

Sndrome de X-frgil
1) Produce una protena llamada FMRN
que participa en el transporte del
mRNA del ncleo a las dendritas
2) Regula la
sinapsis

sntesis

proteica

en

la

Retraso mental hereditario

Estructura del genoma

DNA microsatlite

Huntington

Gen huntingtina
5 UTR

Glutamina

CAG

CAGn (6-26) Normal

CAGn 36 repeticiones o ms

Enfermedad

Estructura del genoma

Huntington
Agregado de huntingtina
mutante

TBP
CBP
Factores de transcripcin
ricos en poliglutamina

Estructura del genoma

Enfermedades genticas por reiteracin del trinucletido
Enfermedad

Trinucletido Intervalo normal

reiterado
de reiteracin

Intervalo de
reiteracin de la Reiteracin del
gen codificante
enfermedad

Atrofia muscular

CAG

11-33

40-62

Si

Enfermedad de
Huntington

CAG

11-34

42-100

Si

X frgil

CGG

6-54

2504000

No

Estructura del genoma

Secuencias de DNA
repetidas con funcin
codificadora

Codifica RNAt y RNAr

y algunas histonas

Secuencias
moderadamente
repetidas
Elementos cortos interpuestos (SINE)

Secuencias de DNA
que carecen de
funcin codificadora

Elementos genticos mviles

Elementos largos interpuestos (LINE)

Estructura del genoma

Secuencias no
repetidas

Contiene la mayor cantidad de

informacin gentica

Estabilidad del genoma: poliploidizacin

Duplicacin
completa del
genoma
(poliploidizacin)

Dos especies relacionadas se aparean para

formar un organismo hbrido que contiene los
cromosomas de ambos progenitores (plantas)
Un
embrin
unicelular
experimenta
duplicacin
cromosmica (animales)

Estabilidad del genoma: poliploidizacin

Susumu Ohno planteo la
hiptesis de las 2R
La
evolucin
de
los
vertebrados
desde
un
ancestro invertebrado mucho
ms simple fue posible por
dos ciclos separados de
duplicacin
completa
del
genoma durante un periodo
evolutivo temprano

Estabilidad del genoma: poliploidizacin

Estabilidad del genoma: duplicacin gnica

Duplicacin gnica

Se
produce
entrecruzamiento desigual

por

Estabilidad del genoma: duplicacin gnica

1

Cromosomas homlogos
(durante la meiosis)
1

1
1

Estabilidad del genoma: duplicacin gnica

DNA donador con TRANSPOSN

Transposasa

Transposasa

DNA receptor

Estabilidad del genoma: duplicacin gnica

DNA donador con RETROTRANSPOSN

RNA

DNA

Transcripcin por RNA polimerasa

TRANSCRIPTASA
INVERSA para formar
cDNA monocatenario
Conversin a DNA bicatenario

DNA

DNA receptor

Dogma central de la biologa molecular

DNA

Transcripcin

RNA

Replicacin
Retrotranscripcin
(+RNA)

Traduccin

Protena