Sunteți pe pagina 1din 8

CURS 3

ELEMENTE DE BIOFIZIC MOLECULAR


Cursul de fata acorda o atentie deosebita studiului apei ca lichid biologic
universal. Se va studia structura moleculei de apa in cele trei stari de agregare,
anomaliile proprietatilor fizice ale apei cat si rolul biologic al apei.
Cuvinte cheie: starea lichida, structura molecular, dipol electric, densitate

3.1. Starea lichid


Lichidele reprezint starea de agregare a substanei intermediar,
stabil ntre cea gazoas i cea solid. Lichidele, ca sisteme fizice prezente n
natur, sunt caracterizate printr-o serie de proprieti ce le deosebesc net de
gaze i solide, dar care totodat le situeaz ca stare tranzitorie ntre acestea.
Cercetri efectuate cu ajutorul razelor X, au artat c, particulele
constituente strii lichide prezint o anumit ordonare local a moleculelor pe
distana a ctorva raze moleculare. Aceast ordine local se stric i se reface
continuu, datorit micrii de agitaie termic.
Distana dintre molecule (particule componente) este mult mai mic dect
la gaze, de aceea lichidele sunt foarte puin compresibile, practic
incompresibile. Acest lucru se datoreaz i existenei unei presiuni moleculare.
ntre moleculele sistemului n stare lichid, se manifest fore de
interaciune molecular mai mari dect ntre moleculele sistemului n starea
gazoas, dar mai mici dect n starea solid :
f atr.G < fatr.L < fatr.S
Forele de coeziune (de atracie ntre molecule de aceeai natur) sunt
destul de mari, ca urmare lichidele au un volum propriu, bine determinat.
Observaie ! Dei forele de coeziune sunt mult mai mari dect la gaze, totui
ele nu sunt suficient de puternice ca s asigure lichidelor i o form proprie.
Prin urmare, lichidele nu au form proprie, ele iau forma vasului n care
sunt puse.
Existena volumului propriu, evideniaz faptul c densitatea sistemelor
n stare lichid este mai mare dect densitatea sistemelor n starea gazoas.
L > G
21

De asemenea, existena volumului propriu face posibil o micare a unei


pri a corpului fa de alt parte a aceluiai corp, prin lunecarea unui strat de
lichid fa de straturile nvecinate. Acest fenomen se numete curgere.
Studiul curgerii lichidelor a fost mult simplificat considerndu-se modelul
de lichid perfect, numit i lichid ideal sau lichidul lui Pascal dup
numele fizicianului francez Blaise Pascal (1623- 1662), cel care a pus bazele
hidrostaticii (legea lui P.).
Lichidele se mpart n dou categorii:
a) lichide ideale b)lichide reale
Un lichid ideal, este, prin definiie, un lichid ipotetic, absolut
incompresibil i de vscozitate nul (alunecarea straturilor de fluid unele peste
altele n procesul de curgere are loc fr frecare).
Lichidele reale sunt vscoase i compresibile.
Observaie ! Proprietile sistemelor n stare lichid, se modific n special cu
temperatura T i foarte puin cu presiunea p.
Micare de agitaie termic la lichide este mai slab dect la gaze, dar ea
se intensific cu creterea temperaturii. Ea este mai puin haotic dect la gaze
deoarece distana dintre molecule este mult mai mic.
3.2. Apa. Rspndirea apei n natur
Apa nseamn via. Ea este indispensabil att existenei umane ct i
meninerii echilibrului mediului ambiant. Viaa a luat natere n mediul acvatic
cu milioane de ani n urm.
Apa reprezint constituentul esenial al materiei vii. Dup aerul
atmosferic, apa este cel de-al doilea element necesar meninerii vieii pe
pmnt. Apa este substana chimic cea mai larg rspndit pe glob, acoperind
71% din suprafaa Terrei (3,6108 km2), suprafaa total a globului terestru
fiinnd de 5,1108 km2.
Apa este considerat drept matricea vieii. Omul nu poate tri dect 5
7 zile fr ap exogen.
Apa planetei, n cantitate invariabil, se gsete n toate cele trei stri de
agregare: n stare gazoas (sub form de vapori), n stare solid (gheaa) i
lichid. ntre cele trei stri se produce un permanent schimb n cadrul circuitului
natural al apei n natur
Apa alctuiete hidrosfera cu un volum total de 1,4109 km3 din care
71013 t se afl n atmosfer sub form de vapori (ntre 1 i 30 g/m3).
Apa natural nu este chimic pur, coninnd dizolvat n ea gaze, sruri i
diferite particule n suspensie. n mri, salinitatea ajunge la 30 o/o, n timp ce
apele dulci au o salinitate de 0,1%.
22

Apa natural este rezultatul combinrii diferiilor izotopi ai hidrogenului


1
1

cu diferii izotopi ai oxigenului 168 O , 178 O , 168 O .


Cantitatea predominant de ap (cea mai mare parte) rezult din
combinarea izotopului 11 H cu 168 O rezultnd H2O.
Prin combinarea izotopului 12 H = 12 D (deuteriu) cu 168 O rezult apa
grea (D2O) cu densitatea 1,1 g/cm3 (are o densitate mai mare dect a apei
naturale) i rspndit n natur n proporie de 1/6000.
Apa reprezint cel mai important lichid pentru via, lund parte att la
organizarea structural a sistemelor vii ct i la activitatea metabolic a
acestora.
H,

2
1

H,

3
1

H,

3.3 Structura molecuar a apei


Molecula de ap este triatomic fiind format dintr-un atom de 168O legat
covalent de doi atomi de hidrogen 11H .
Pentru atomul de hidrogen:
1
(I)
Z = 1 1s1 exist un singur electron pe stratul K
1H
Pentru atomul de oxigen:
(II) 168 O Z = 8 1s2 / 2s2 2p4 , adic pe stratul K se afl doi electroni iar
pe stratul L se afl 6 electroni.
Pentru a realiza o configuraie stabil de octet, 8 electroni pe ultimul strat
(L) oxigenul i hidrogenul vor pune n comun electroni: 6 electroni ai
oxigenului se unesc cu 2 electroni de la 2 atomi de hidrogen, rezultnd astfel o
configuraie stabil.
H O

H O H

Prin studiul spectrelor de absorbie n IR, s-a demonstrat c molecula de


ap este asimetric, atomii de hidrogen i oxigen fiind legai covalent sub un
unghi de 105o .
Distana dintre nucleii atomici este de 0,99 n starea de agregare lichid
i solid.

23

Observaie ! Legtura covalent este foarte puternic. Energia de legtur a


acesteia este 102 kcal/mol ceea ce demonstreaz c molecula de ap este
deosebit de stabil din punct de vedere termic, disociind n elementele
componente doar la temperaturi foarte nalte, de peste 1000oC (la 2500oC
fraciunea disociat reprezint doar 10%).
Deoarece centrul sarcinilor electrice pozitive (din jurul hidrogenului +)
nu coincide cu centrul sarcinilor electrice negative (- din jurul oxigenului) se
poate spune c molecula de H2O este polar, adic are caracter de dipol electric.
Din punct de vedere electric, apa are o molecul polar ce prezint un dipol
electric permanent.

Definiie: Numim dipol electric, un sistem format din dou sarcini electrice
egale ca mrime, dar de semne contrare (+q, -q) situate la distan d una de
alta.
Caracteristic dipolului electric este momentul electric dipolar (), definit
prin relaia:

= q d

Unitatea de msur tolerat a momentului dipolului este Debye, notat prin D:

[]tol. = 1 Debye;

1D = 10-19 C 10-10 m = 10-29 Cm ;


Unitatea S.I.a momentului electric dipolar fiind:

[]SI = Cm .

Momentul dipolului moleculei de ap este = 1,84 D. Valorile


momentelor electrice pot da indicaii utile despre forma moleculelor. n
24

practic, dipolmomentul molecular se determin msurnd constanta dielectric


a moleculelor.
3.3.1 Structura moleculei de ap n cele trei stri de agregare
Caracterul polar al moleculelor, determin asocierea acestora (o anumit
tendin de ordonare) asociere ce confer apei proprieti fizice deosebite, ca:
- punct de fierbere ridicat (100oC) avnd n vedere c H2S fierbe la 64oC
n condiii normale (p=1atm).
Asocierea moleculelor de H2O se realizeaz prin legturi de hidrogen,
numite i legturi prin puni de hidrogen (natura lor a fost determinat prin
difracia razelor X).
Moleculele polare de ap au tendina de a se orienta n spaiu: zona
negativ (O) a unei molecule se ndreapt (este atras) spre zona pozitiv (H) a
altei molecule, formnd legturi de hidrogen (1,77) .
O molecul de ap poate stabili cel mult 4 legturi prin puni de hidrogen
fiind nconjurat de alte 4 molecule de ap, legate prin legturi de hidrogen.
Cei doi atomi de oxigen unii prin legturi de hidrogen se afl la distana
de 2,76 unul de altul.
Legtura de hidrogen este o legtur de natur electrostatic, ce se
reprezint prin linie punctat.

Energia de legtur pentru legtura de hidrogen variaz ntre 2 5


kcal/mol (1 cal = 4,18, J). Aceste legturi sunt relativ slabe, contribuia lor la
stabilitatea n soluie este practic nul, ns au valoare semnificativ n
determinarea structurii spaiale a biomoleculelor.
n ansamblu, prin legturi de hidrogen, se formeaz reele cu att mai
stabile i mai ordonate cu ct temperatura este mai sczut i agitaia termic
mai redus.
Starea solid
25

n gheaa puternic rcit (t < 0oC) toi atomii de hidrogen sunt prini n
legturi de hidrogen. Fiecare atom de oxigen al unei molecule de ap este legat
de alte 4 molecule prin legturi de hidrogen. Datorit legturilor intra- i
intermoleculare, structura tetraedric a gheii este o structur ordonat, deschis,
de tip hexagonal, cu ochiuri mari i spaii neocupate.
Structura gheii (densitatea gheii, =0,91 g/cm3 este mai mic dect
densitatea apei) este o structur ordonat, dar cu multe goluri n reeaua
hexagonal, determinate de legtura de hidrogen.
Starea lichid
Pe msur ce crete temperatura, crete i micarea de agitaie termic
astfel nct unele legturi de hidrogen se desfac, moleculele respective devenind
libere. Pentru desfacerea unei legturi de hidrogen este necesar un consum de
energie de 20 de ori mai redus dect pentru ruperea unei legturi covalente.
La temperatura de 0oC, gheaa primind o cantitate de cldur Q, 15%
din legturile de hidrogen se rup (se desfac brusc), apa continund s pstreze o
structur cristalin dar din ce n ce mai mobil. Cretera temperaturii, produce
desfacerea legturilor de H n proporie din ce in ce mai mare, structura
cristalin devenind tot mai mobil (cvasicristalin).
Spunem c, apase mpacheteaz mai strns (se ntreptrund) deoarece
moleculele de ap libere rezultate n urma ruperii legturilor de H, intr n
golurile reelei cristaline i acest proces de rupere a legturilor de hidrogen
continu pn se ating 4oC.
Astfel, ntre 0 4 C deoarece moleculele ptrund n spaiile libere ale
reelei cristaline ca molecule interstiiale, volumul apei scade, el fiind minim la
4 C. La temperatur mai mare de 4 C, ntruct agitaia termic se intensific,
moleculele libere (monomerii) prsesc ochiurile reelei, astfel nct volumul
apei va crete. Se produce astfel creterea n volum sau dilatarea normal a apei.
Structurile cristaline, se desfac i se refac, cu att mai repede cu ct
agitaia termic este mai mare (temperatura crete).
n stare lichid, apa este format dintr-un amestec de
- molecule libere (monomeri),
- molecule legate cte dou prin puni de hidrogen (dimeri)
- molecule legate cte patru prin puni de hidrogen (tetrameri)
- molecule legate cte ase prin puni de hidrogen (hexameri).
Punile de hidrogen(legturile) existente persist circa 10-9 s; ele se
distrug i se refac permanent. Timpul lor de existen corespunde la cteva mii
de ciocniri intermoleculare.
La temperatura de 40oC, aproximativ 50% din legturile de hidrogen sunt
desfcute i apa devine mai fluid i mai reactiv. Se vorbete chiar de al
doilea punct de topire al apei.

26

Starea gazoas
La temperatura de 100oC se rup toate legturile de hidrogen i
moleculele de ap devin libere i izolate. Eventual exist civa dimeri. n stare
gazoas, apa nu mai pstreaz nici o structur regulat, fiind nestructurat
(form de vapori).
3.4. Anomaliile proprietilor fizice ale apei
n comparaie cu majoritatea lichidelor, din cauza dipolmomentului
molecular relativ mare i a numrului crescut de legturi de hidrogen, apa
prezint o serie de anomalii ale proprietilor sale.
Proprietile fizice ale apei sunt corelate cu structura molecular
deosebit a sa.
3.4.1Variaia densitii apei cu temperatura
=

m
V

Prin definiie, densitatea absolut a unui corp (solid, lichid sau gazos) este
masa coninut n unitatea de volum.
Unitile de msur SI i tolerat a densitii sunt:
[ ] SI =

kg
g
;
[

]
=
tol
m3
cm 3

Densitatea majoritii lichidelor scade o dat cu creterea


temperaturii, deoarece volumul lichidelor, prin dilatare crete odat cu creterea
temperaturii.
( V = Vo (1 + t )
- coeficientul de dilatare volumic)
=

o
m
m
=
=
V Vo (1 + t ) 1 + t

o, Vo valorile la 0oC

n intervalul de temperatur 0 4oC, apa prezint o variaie anomal a


densitii cu temperatura.
Astfel, n cazul apei, ntre 0 i 4oC, densitatea crete odat cu creterea
temperaturii, atingnd valoarea maxim la 4oC.
La temperaturi mai mari de 4oC, densitatea scade din nou. Acest fenomen
are urmtoarea explicaie:
27

Dac temperatura crete pn la 4oC, un numr din ce n ce mai mare de


legturi de hidrogen se rup (se desfac brusc), astfel nct monomerii rezultai
vor ocupa spaiile (ochiurile) intermoleculare ale reelei cristaline (hexagonale).
Prin apropierea maxim a moleculelor rezult c apa se mpacheteaz mai
strns i volumul scade odat cu creterea temperaturii iniiale. Volumul apei
ajunge minim la +4oC, punct n care densitatea este maxim.

4C = max.
V4C = min.
4o C = 1 g / cm3 ,

la p=1atm

Apa are densitatea maxim la 4C.


Dac temperatura crete peste 4oC, agitaia termic se intensific i pe de
o parte monomerii scap din ochiurile reelei hexagonale iar pe de alt parte tot
mai multe legturi de hidrogen se rup i ncepe creterea n volum sau dilatarea
normal a apei, deci densitatea scade. De la temperaturi mai mari de 4oC pn
la 100oC (fierbere) apa se comport normal din punct de vedere al densitii.
Apa face parte din puinele corpuri care i micoreaz densitatea (i mresc
volumul) prin solidificare. Astfel, gheaa are o densitate mai mic dect
1g/cm3.

Intrebari:
1. Caracterizati starea lichida si definiti lichidul ideal.
2. Specificati structura moleculei de apa (legatura chimica, parametrii
reprezentare schematica).
3.Ce reprezinta un dipol electric? Definiti momentul electric dipolar (unit. de
masura in S.I si sistem tolerat).
4. Ce reprezinta apa din punct de vedere biologic si chimic?
5. Definiti densitatea si precizati unitatile de masura.

28