Le monde des microorganismes

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Master Physique, Imagerie et

Le monde des microorganismes

1. Introduction
En 1673, Antoni Van Leeuwenhoek (1632-1723) fut le premier observer
les bactries quil appela animalcules. En plus de la premire description des
globules rouges et des spermatozodes, ce chercheur hollandais observa pour
la premire fois les bactries et dcrivit leurs diffrentes formes.
Ce nest que deux sicles plus tard que le rle des bactries dans les
processus de fermentation et dans la transmission des maladies a t
dcouvert et que leur tude a commenc. Les scientifiques les plus illustres de
cette poque furent Louis Pasteur et Robert Koch.

2. Types de microorganismes
2.1. Bactries :
Ce sont des organismes unicellulaires relativement simples sans
membrane nuclaire appels, pour ceci, procaryotes. Les procaryotes incluent
les bactries et les archaea. La paroi bactrienne est compose dun complexe
protine-carbohydrate appel peptidoglycane. (Par opposition la cellulose qui
est la substance majeure de la paroi des plantes et des algues.)

2.2. Archaea :
Comme les bactries, ce sont des procaryotes mains dans les cas o ils
possdent une paroi, celle-ci est dpourvue de peptidoglycane. Les archaea
sont souvent rencontrs dans les milieux extrmes et sont divises en trois
groupes : Les mthanognes produisent du mthane comme produit de dchet
de respiration. Les halophiles extrmes vivent dans les milieux extrmement
sals comme la mer morte. Les thermophiles extrmes vivent dans les sources
chaudes. On ne connat pas de maladies humaines causes par les archaea.

2.3. Champignons :
Les champignons sont des eucaryotes avec des cellules ayant un noyau
entour dune membrane nuclaire. Ils peuvent tre unicellulaires ou
pluricellulaires. Les grands champignons multicellulaires peuvent paratre
comme des plantes mais ils sont incapables de faire la photosynthse comme
les plantes le font. Les vrais champignons ont des parois cellulaires formes
principalement de chitine.
Les formes unicellulaires des champignons comme la levure, sont des
microorganismes ovales, plus larges que les bactries. Les moisissures sont
des champignons typiques qui forment des masses visibles appeles myclium
(mycelia), composes de longs filaments dits hyphes (hyphae). Les croissances
cotonneuses parfois trouves sur le pain ou les fruits sont des moisissures.
Les champignons se reproduisent de faon sexue (par miose) et
asexue (par mitose).
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2.4. Protozoaires :
Les protozoaires sont des eucaryotes unicellulaires. Ils se dplacent par
pseudopodes (extensions du cytoplasme appeles faux pieds), flagelles, ou
cils.
Les protozoaires ont une varit de formes et vivent ou bien librement en
absorbant les composs organiques du milieu environnant, ou encore comme
des parasites (en utilisant les nutriments dautres organismes htes vivants).
Ils se reproduisent sexuellement ou asexuellement.

2.5. Algues :
Les algues sont des eucaryotes photosynthtiques avec une varit de
formes et des formes de reproduction sexue et asexue. La paroi cellulaire
des algues est compose de cellulose.
Les algues sont abondantes dans les eaux douces et sales, dans le sol et
en association avec les plantes. Comme les algues sont capables de
photosynthse, elles ont besoin de lumire et dair pour produire leur
nutriment et nont en gnral pas besoin de composs organiques du milieu.
Les algues produisent de loxygne et des hydrates de carbone qui sont
utiliss par dautres organismes, y compris les animaux.

2.6. Virus :
Les virus forment un groupe diffrent ; ils sont trs petits et ne peuvent
tre vus quavec un microscope lectronique. Ce sont des formes acellulaires.
Les particules virales contiennent une partie centrale (core) contenant un seul
acide nuclique ; soit de lADN, soit de lARN.
Les virus sont des parasites et ne peuvent se reproduire que sils utilisent
la machinerie cellulaire de lorganisme hte quils infectent. En dehors des
organismes htes vivants, les virus sont inertes.

2.7. Parasites des animaux multicellulaires :

Se ne sont pas des microorganismes par stricte dfinition. Durant les
premiers stades de leur cycle de vie, les helminthes sont microscopiques.
On distingue la classe des:

Plathelminthe, vers plats, contenant les ordres des Trmatodes (douves

et schistosomes) et des Cestodes (Tnias)
Nmathelminthes, ordre des nmatodes (anguille, ankylostome,
trichocphale, ascaris).

3. Classification des microorganismes

Luniversalit du code gntique a montr que tous les organismes
vivants, eucaryotes et procaryotes, descendent dun seul et mme anctre (
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, ancestor). Ltude de gnes existants chez tous les tres vivants, du fait
de fonctions mtaboliques particulirement importantes, comme ceux codant
pour les ARN ribosomiques, a montr que leurs squences ont peu vari au
cours des ges et que la comparaison de ces squences permet de trouver les
relations existant entre organismes.
Dans la hirarchie phylogntique, les organismes sont classs selon les
proprits communes impliquant quun groupe dorganismes est issu dun
anctre commun : chaque espce retient quelques caractristiques de
lanctre. Certaines informations utilises pour la classification et dterminer
les relations phylogntiques dans les organismes suprieurs, proviennent des
fossiles.