UNIVERSITE DALGER /FACULTE DE MEDECINE /

DEPARTEMENT DE pharmacie

MODULE DEPIDEMIOLOGIE

INVESTIGATION DUNE EPIDEMIE

5me ANNEE DE PHARMACIE
ANNEE UNIVERSITAIRE 2015-2016

Cours rdig par :

Dr. H. BENELFEKIR

Matre-assistante en pidmiologie
& mdecine prventive

5me ANNEE EN PHARMACIE

Cours dpidmiologie-P5

Investigation dune pidmie

Plan du cours
I)

Introduction et dfinitions
1) Dfinitions de lpidmie et de linvestigation
2) Objectifs de lenqute pidmiologique

II)

Exemples de maladies lorigine dpidmies

1) Intoxications alimentaires (TIAC)
2) Maladies transmission hydrique (MTH)

III)

Etapes dune investigation dun pisode pidmique

1)
2)
3)
4)
5)
6)
7)
8)
9)

Affirmation de lexistence de lpidmie.

Identification de la maladie et confirmation du diagnostic.
Dfinition et dcompte des cas
Traitement et analyse des donnes : temps (CE), Lieu et personnes.
Formulation dhypothses
Vrification et test des hypothses par une enqute tiologique
Comparaison de lhypothse retenue avec les faits tablis
Ralisation dune tude plus approfondie
Mise en place de mesures de lutte et de prvention
10) Rdaction dun rapport scientifique dinvestigation

IV)
V)

Conclusion
Rfrences bibliographiques

Objectifs du cours
A la fin du cours sur linvestigation dun pisode pidmique, ltudiant doit tre capable de :
1) Dfinir une pidmie
2) Citer les objectifs de linvestigation
3) Identifier les diffrentes phases de linvestigation
4) Citer et dcrire les diffrentes tapes de linvestigation dune pidmie
5) Citer les critres utiliss pour la dfinition dun cas

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Investigation dune pidmie

6) Citer les caractristiques pidmiologiques identifier dans une population

investigue

I) Introduction
Une investigation peut seffectuer en population gnrale ou en population ferme pour une
pathologie infectieuse ou pas, ou pour tout autre phnomne survenant selon un mode
pidmique. Les maladies transmissibles restent cependant notre champ dtude principale.

1) Dfinitions
1-1) Dfinition dune pidmie :
On appelle pidmie la survenue de cas dune maladie ou d un vnement,
vnement, dont lincidence
observe est plus leve que l'incidence attendue dans une priode de temps donne, en un
lieu donn et dans une population donne.
Ce principe est relatif, en effet
pour les maladies radiques,
radiques, un seul cas est considr comme une pidmie :
exemple un cas de variole, un 2 cas de peste,
pour les maladies bnficiant dune surveillance systmatique, on utilisera la
notion de dpassement de seuils prdtermins pour qualifier laugmentation
dorigine pidmique : exemple plusieurs douzaines de cas par semaine d'angines
streptocoques ou d'hpatite virale A, reprsentent simplement une prvalence
endmique.

1.2) Dfinition dune investigation

Cest une dmarche scientifique consistant :

- recueillir des donnes et collecter des informations de bonne qualit
sur lpisode pidmique,
-

dcrire le phnomne pidmique,

analyser les causes dune pidmie.

Cest un processus, seffectuant la suite dune dclaration et dont le but est une prise de
dcision rapide et approprie.

2) Objectifs de lenqute pidmiologique

Plusieurs raisons peuvent motiver une investigation.

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Investigation dune pidmie

1) Enrayer la propagation du phnomne

2) Prvenir la survenue de nouveaux pisodes
3) Approfondir les connaissances sur la chane de transmission du phnomne
4) Mise en place des mesures de lutte et de prvention
5) valuer et/ou mettre en place un nouveau systme de surveillance

II) Exemples de maladies lorigine des pidmies

1) Les Infections et toxi-infections dorigine alimentaire et hydrique :
Les TIAC survenues en restauration collective reprsentent 70 % des
foyers, dont un tiers en milieu scolaire Ces toxi-infections alimentaires
sont soit :
dexpression digestive : les bactries sont les plus frquemment
en cause : Salmonella non typhiques, Shigella, Campylobacter
jejuni , Escherichia coli, Saphylococcusaureus, Bacillus cereus,
Clostridium perfringens
dexpression extradigestive : prdominante sont dues aux
micro-organismes suivants: Clostridium botulinum, Intoxication
histaminique,

2) Les maladies transmissibles (MTH) :

Les principales maladies transmissibles qui sont lorigine des pidmies sont reprsentes
par les maladies transmission hydrique (MTH) : Hpatite A, Typhode, Amibiase,
Cholra, Dysenterie bacillaire etc

III) Etapes dune investigation dun pisode pidmique

Un pisode pidmique est rsum en 10 tapes que lon regroupe en
deux phases successives :
1- La premire phase est descriptive : elle permet dtudier la ralit des faits en
- affirmant lexistence de lpidmie.
- confirmant le diagnostic et dfinir un cas.
- faisant une recherche rapide des cas existants.
- traitant et analysant les donnes recueillies.

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Investigation dune pidmie

2- La deuxime phase est analytique : elle exige

- la formulation dhypothse.
- le test de ces hypothses par le choix et la conception dun plan denqute vise
tiologique (cohorte ou cas-tmoins).
cas-tmoins).
- lexcution de ce plan denqute et le recueil de donnes.
-le traitement et lanalyse des donnes de lenqute analytique.
Laboutissement du travail tant :
- la proposition de mesures de lutte et de prvention.
- la rdaction dun rapport final.

1) 1re tape : Affirmation de lpisode pidmique ou de lexistence

dune pidmie :
On affirmera lexistence de lpidmie si les taux observs ou nombre de cas observs sont
suprieurs aux taux attendus ou au nombre de cas attendus.
Le taux attendu est le taux de base correspondant au taux dincidence sporadique, ou
endmique, ou seuils connus et admis. Si lon ne dispose pas de seuil connu, 1 cas dune
maladie disparue ou inconnue, 2 cas de toxi-infection alimentaire ou un multiple de 4 de la
frquence de toute autre pathologie constituent ce seuil.
Si ce seuil a t franchi nous sommes en situation pidmique.

Elle se fera par :

le reprage du cas index (ou du premier cas ayant donn lalerte,
le dcompte rapide des cas dclars pendant la priode prsume de lpidmie au sein
de la mme population,
lestimation de cette population cible,
le calcul des indicateurs : taux dincidence par exemple (taux observ) ou nombre de
cas observs,
la comparaison de ce taux ou du nombre observ, au taux attendu (thorique ou de
base) au nombre ou taux rsultant denregistrements antrieurs.
Il sera parfois ncessaire de confirmer lexistence dune pidmie en consultant les sources
dinformation suivantes :
4

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Investigation dune pidmie

structures de soins : hpitaux, cliniques publiques ou prives, laboratoires publics ou

privs, laboratoire de rfrence ;
structures extra sanitaires : APC, structures dducation et
denseignements (crches, coles, institutions professionnelles.).

Le recensement peut utiliser aussi les enqutes pidmiologiques autour des cas et en
population gnrale (enqutes en communaut) si cela savre ncessaire.

2) 2me tape : Confirmation du diagnostic

Le diagnostic clinique doit tre imprieusement confirm laide des
techniques de laboratoire comme lisolement de lagent causal, la
srologie, la recherche de toxiques, la srotype, la lysotypie (permet de
suivre la propagation dune pidmie) etc
Cependant, tous les cas de maladie nont pas besoin dtre confirms. Si
la plupart des malades ont des signes cliniques similaires, il suffit de
confirmer 15 20% des cas.
Il est galement plus convaincant pour lpidmiologiste de pouvoir
examiner un ou plusieurs cas lui-mme ou en compagnie dun spcialiste.

3) 3me tape : Dfinition et dcompte des cas :

3-1) Dfinition dun cas :
La dfinition dun cas stablit sur des critres clairs.
Critres cliniques (fivre, nombre de selles par jours, ruption
cutane,..,) ;
Critres biologiques (FNS, bactriologie, srologie,.)
Critres toxicologiques selon les pathologies et le niveau de connaissances
scientifiques sur le sujet
les caractristiques pidmiologies spatiotemporelles de temps, de lieu et de
personnes.
Lorsque la maladie est connue, sa dfinition officielle peut tre utilise.
o Exemple de dfinition dun cas : un cas de rougeole : cest tout sujet g de
.rsident dans la commune de Sidi MHamed, prsentant une fivre depuis le 01
octobre 20. avec une fivre 38.5ou plus, une ruption cutane depuis 03 jours et
au moins un signe parmi les suivants : toux, coryza ou conjonctivite .

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Investigation dune pidmie

Si le diagnostic est difficile tablir, il faut recourir dautres dfinitions. Un cas est dfini
et class :
Certain, partir de lisolement de lagent causal ou la positivit de test srologique
spcifique
Probable, sur la runion dun faisceau darguments cliniques et biologiques de
prsomption
possible ou indtermin, en absence de confirmation ; ces cas sont alors exclure.
o Exemple de lpidmie de fivre hmorragique virus Ebola dcrite au Zare
en 1976 (Bull OMS 1978 ; 56 :271-93).
-

Un cas possible :
toute personne ayant prsent des cphales et/ou de la fivre pendant au moins
24 heures (quil y ait ou non dautres signes ou symptmes) et qui avait t en
contact avec un cas certain ou probable dans les trois semaines prcdentes. Le
cas devait tre originaire de BUMBA et la maladie ou le dcs avoir eu lieu
depuis le 1er aot 1976.
Un cas certain :
toute personne partir de laquelle le virus avait t isol ou observ au
microscope lectronique ou qui avait un srum titrant au moins 1/64 en
immunofluorescence indirecte dans les trois semaines suivant le dbut des
symptmes.
Un cas probable :
toute personne vivant dans la zone de lpidmie, dcde un ou plusieurs jours
aprs lapparition dau moins deux des symptmes suivantes : cphales, fivre,
douleurs abdominales, nauses, vomissements et hmorragies.

3-2) Dcompte des cas (recherche active des cas) :

Cette tape prliminaire est la garantie de la qualit de l'investigation par la revue des
donnes sur les cas existants selon la dfinition du cas retenu.
Pour dcrire lhistoire naturelle de lpidmie, cette
recherche saccompagne dune collecte
c
des informations sur un questionnaire contenant :
des caractristiques personnelles du cas (lge, le sexe, ladresse, la catgorie et
niveau socioprofessionnelle etc ) ;
de lhistoire de la maladie ou du phnomne (dbut et signes y affrents, volution,
confirmations, traitement reu.. ) ;
des facteurs de risques possibles en liaison avec le phnomne.
des caractristiques pidmiologiques : expositions ventuelles, dplacement
pendant la priode dincubation, provenance etc

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Investigation dune pidmie

Pour effectuer cette recherche active il est utile didentifier, slectionner et rpertorier les
sources dinformation disponibles. Le recueil des donnes concernera aussi bien la
morbidit que la mortalit.

4) 4me tape : Traitement et analyse des donnes

Le traitement permettra une reprsentation tabulaire et graphique des donnes. Cette
reprsentation montre la structure de lpidmie en fonction des caractristiques
pidmiologiques de temps, de lieu et de personnes.

Lanalyse exigera le calculer des indices.

Calcul des indicateurs essentiels : taux dincidence globale ou taux dattaque qui
est une forme particulire de taux dincidence, calcul sur une trs courte priode de
temps ne dpassant pas en gnral le mois (ex. : TIAC) ).Ce taux mesure la rapidit
de la survenue dune maladie dans une population.
Nombre de cas de maladie
TA=

X 100
Population risque

Calcule des taux de morbidit spcifiques : par ge, sexe, localit

Calcule des taux de mortalit.

Il sera utile de dterminer la taille de la population risque de dvelopper la maladie)

4-1) Les caractristiques pidmiologiques de temps :
La courbe (histogramme) reprsente la distribution des cas de lpidmie en fonction du
temps (heure, jour, semaine, mois). Elle permet :
-

daffirmer lexistence de lpidmie, den suivre lvolution, et den mesurer

limportance,
den dterminer les dates de dbut et de fin, la dure globale,
destimer le dbut de lexposition et sa dure (si lon connat la distribution dans le
temps et la priode dincubation de la pathologie par exemple),
didentifier ventuellement les cas aberrants,
de relever la date du ou des pics,
de caractriser le profil gnral de la courbe.

Linterprtation de cette courbe tudiera son allure qui peut renseigner sur la nature de la
source et lagent causal:
*Ponctuelle : cest une courbe avec un pic unique (unimodale) avec une
ascension rapide et une dcroissance lgrement tale sur la droite (pidmie explosive,
massive, focale, de courte dure). Exemple : TIAC

Cours dpidmiologie-P5

Investigation dune pidmie

Temps
* Persistante : elle se traduit par une ascension rapide suivie dun plateau .Elle
entrane la survenue de cas pendant une priode de temps assez
longue.
Exemple
Nombre
de: MTH
cas

Temps
*Transmission interhumaine : aprs un pic initial la courbe volue en
plusieurs vagues damplitude croissante traduisant les contaminations de proche en proche
des groupes dindividus (cest une pidmie par propagation dont la dure sera longue.
Lvolution dune pidmie sera dpendante : de la propagation, de limmunit
collective, de la priode dincubation et de contagiosit, de lexposition aux facteurs,
des conditions de lenvironnement, du type dimmunit. Exemple : grippe
Nombre de
cas

Fig1 : Courbe pidmique des cas dhpatite A survenus dans les maternelles de la
rgion de Chinon oct-nov 1993
Temps
Mode=cas mdian

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Investigation dune pidmie

1 mois

Nombre de cas

6
5
4
3

Cas index

2
1
0
4-10/10

11-17/10

18-22/10

23-21/10

01/07/2011

8-14/11

15-21/11

22-28/11

Semaine d'apparition des signes cliniques

4.2)

Les caractristiques pidmiologiques de lieu :

Il peut sagir de zones gographiques plus ou moins importantes :

- dhabitations (maison, quartier, commune ..),
- dactivit professionnelle,
- denseignement (crche, coles, universit ),
- de restauration : cantines, restaurations diverses.. ex : TIAC
- de loisir,
- ou dautres lieux : hpital, casernes.,
La cartographie permettra de visualiser les zones risques ou foyers pidmiques.
Exemple : les taux dattaque calculs au cours de lpidmie de pellagre, trois zones
risque ont t identifies: Tangani, Nyamithutu et Chiringua.
Tableau2 : Epidmie de pellagre chez les rfugis mozamibicains au Malawi en
mai-juin 1990.
TA=cas/population x100
Sites
Kamphata
Mankhokwe
Tengani
Nyamithutu
Kunyienda
Chanjambika
Chifunga
Muloza
Chiringa
Mkhwayi
Total camps

4.3)

Population
8157
38884
17183
18122
21806
13505
19219
19195
6037
9236
171344

Cas
401
3942
2223
2417
2172
1236
1683
1440
795
1057
17366

Les caractristiques pidmiologiques de personnes :

TA pour 100
4,9%
10,1%
12,9%
13,3%
10,0%
9,2%
8,8%
7,5%
13,2%
11,4%
10,1%

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Investigation dune pidmie

La distribution sera analyse selon les diffrentes catgories : sexe, ge, activit
professionnelle, niveau dinstruction, comportement etc
Ce qui mettra en vidence les groupes risque.

Exemple : la figure 2 illustre les diffrents taux dattaque en fonction de lge et le

sexe observs au cours de lpidmie de pellagre au Malawi en 1990.Lanalyse des
taux a permis didentifier un groupe haut risque : les femmes ges de 15 45 ans.

Fig2 : Description caractristiques individuelles pidmie de pellagre : nombre de cas par sexe et groupeSource:MSF
dge Malawi - mai250

nombre de cas

Masculin
Fminin

200

150

100

50

0-05

5-15

15-45

>45

Lanalyse des donnes sattachera tudier les facteurs de risque savoir :

lhabitat cologique de certains animaux (ex : rage, peste),

les rseaux deaux uses
(ex : cholra),
Promiscuit, (ex : grippe, MCS.)

les systmes de ventilation des immeubles (ex : lgionellose),

5) 5me tape : Formulation des hypothses

Au terme de la phase descriptive on a mesur lampleur du phnomne et on en connat la
gravit ; la structure de lpidmie devra suggrer des hypothses explicatives quant
la source et sa localisation,
lagent en cause,
lexposition aux facteurs de risque
aux facteurs favorisant la transmission (ou exposition)
au vhicule
au mode de transmission, de diffusion .
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Investigation dune pidmie

Ltude des cas aberrants prcoces ou tardifs, les cas familiaux groups fournissent des pistes
de travail.

6) 6me tape : Test et vrification des hypothses

Ces hypothses peuvent tre vrifies par une enqute de type analytique si cela savre
ncessaire ; le choix dpendra du type de population (ouverte ou ferme) et de la nature du
problme.
En population ferme ou limite (type cantine, restaurant, crche,.) une enqute cohorte
rtrospective peut tre indique, en population ouverte ou les informations sur lorigine du
phnomne sont insuffisantes une enqute cas -tmoin sera plus adapte.
Il consiste :
1. confronter les rsultats avec les donnes cliniques, les rsultats de laboratoire, les
tudes pidmiologiques et les tests statistiques.
2. calculer et comparer les taux dattaque dans les diffrents groupes dtermins selon
lexposition ou la non exposition toutes les sources possibles.
3. calculer les mesures de risque selon le type denqute retenue et les interprter.
Lorsque lanalyse a incrimin un facteur particulier comme par exemple un aliment, le
lait, le rseau deau potable, lenqute peut tre concentre sur ce facteur particulier.
4. confirmer cette source qui ncessite une analyse statistique avec lutilisation dun test
statistique appropri ce type de variables.
Si au terme de cette analyse, on met en vidence une diffrence significative, on dira alors
que la source en question est celle qui est lorigine de lpidmie et on la quantifiera par
linterprtation de la mesure dassociation.
o Exemple dune structure c
ohorte rtrospective :
Tableau 3 : Epidmie de gastro-entrite parmi les pensionnaires dune maison de
retraite, Pennsylvanie, Etats Unis, 1986.
Aliment

ufs brouills
Poulet
Poulet mix
Brocoli
Jambon mix
Sandwich pic
Cocktail de fruits
Pure de pommes
de terre
Supplment
protin

Ont consomms
Total
Malade
TA1(%)

Non pas consomms

Total
Malade
TA2(%)

RR

53
60
28
74
84
56
43

16
15
13
25
26
15
14

30%
25%
46%
34%
31%
27%
33%

41
27
68
19
12
40
53

16
17
19
7
6
17
18

39%
63%
28%
37%
50%
43%
34%

0,8
0,4
1,7
0,9
0,6
0,6
1,0

33

14

42%

63

18

29%

1,5

29

22

76%

74

17

23%

3,3

11

Cours dpidmiologie-P5

Investigation dune pidmie

Etude cas tmoins :

o Exemple dune structure de cas-tmoins :

Tableau 4: Epidmie de gastro-entrite virale au Charente-Maritime en 1994.
Aliment
Huitres
Palourdes

Malade
s /cas
(N1=21)
20
20

%
dexpositio
n des cas
95%
95%

21
21
12
18

100%
100%
57%
86%

29
30
16
28

94%
97%
52%
90%%

19
12

90%
75%

26
21

84%
70%

Langoustines
Crevettes
Mayonnaise
Jambon
Salami
Pte
Roulade de
jambon

Tmoins
%
Diffrence
(N2=31) dexposition
de %
des tmoins
26
84%
11%
19
61%
34%

OR

P(1)
0,42
<0,01

06%
03%
05%
-04%

3,8
12,
6
3,6
2,1
1,3
0,6

06%
05%

1,8
1,3

0,8
1,0

0,7
1,0
0,9
1,0

7) 7me tape : Comparaison de l'hypothse retenue avec les

faits tablis

Elle consiste confronter les rsultats avec :

-

les
les
les
les

donnes cliniques,
rsultats de laboratoire,
tudes pidmiologiques
tests statistiques..

Les hypothses doivent tre plausibles, biologiquement acceptables et

expliquant lagent causal, la source, le mode transmission et la dure
dexposition.

8) 8 me tape: Ralisation dune tude plus

approfondie

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Investigation dune pidmie

En parallle, et orientes par :

- les enqutes pidmiologiques (prciser de mode de
transmission,),
- les enqutes environnementales (alimentation, eau, air,
hygine..)
- les enqutes micro biologiques (dose infestante, srotype..).
Elle peut permettre de mieux dfinir les groupes risque et les
facteurs ayant favoris le dveloppement de la maladie

9)
9 me tape : Mise en place des mesures de lutte et de prvention
Ne pas attendre la fin de l'investigation, les mesures de lutte et de prvention peuvent tre
proposes au dbut, puis plus spcifiques selon les rsultats.
La stratgie de lutte contre les maladies transmissibles peut tre tablie en tenant compte des
diffrents lments de la chane pidmiologique (le rservoir, le mode de transmission et la
population risque) :

Prophylaxie de rservoir :

Traitement et /ou isolement des cas,

Lutte contre le rservoir animal,

Dclaration des cas (maladies dclaration

obligatoire).
Prophylaxie de la transmission :
Hygine personnelle/milieu,
Dsinfection/ strilisation (ex : chloration de leau,
),
Contrle vectoriel,
Limitation des dplacements.
Prophylaxie de la rceptivit :

Vaccination et/ou chimioprophylaxie,

Amlioration de la nutrition,

Protection par moyens personnels.

10) 10me tape : Rdaction du rapport denqute

Le rapport dtaill sera transmis aux autorits concerns (locale et sanitaire). Il comportera
une synthse de lenqute (taux dattaque, population touche, les rsultats tiologiques et
biologiques et les causes expliquant la survenue de lpidmie. Il mentionnera les mesures de
lutte et de prvention entreprendre cours et long terme.

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Cours dpidmiologie-P5

Investigation dune pidmie

IV) Conclusion
Linvestigation des pisodes pidmiologies doit permettre de fournir rapidement des
solutions aux problmes de sant publique poss par la communaut. Il est clair que la
dtection initiale dun pisode pidmique repose sur lexistence dun systme de
surveillance pidmiologique et sur la dclaration de tels pisodes.
Il est impratif cependant dvaluer les mesures mises en place et dapporter des correctifs
indispensables.

V) Rfrences bibliographiques
1. OMS : Guide denqute dune pidmie.
2. T.ANCELLE, ditions Maloine : Statistiques et Epidmiologie
B.FALISSARD, MASSON : Comprendre et utiliser les statistiques dans les sciences de la vie.
3. A-J.VALLERON, Flammarion : pour les plus caps : Biostatistique (de la biologie la
clinique)
4. D.Malvy, F Djossou, M Le Bras -Encyclopdie Mdico-chirurgicale - Infections et toxiinfections dorigine alimentaire et hydrique : orientation diagnostique et conduite tenir-8003-A-82
5.M.JENICEK,R.CLEROUX : Epidmiologie principes, techniques applications maloine
S.a/edisem inc 3me tirage 1984.
6.CDC/LM(ENSP) :Cours dpidmiologie applique et de biostatistique Episode
dintoxication alimentaire la suite dun buffet lors dune fte paroissaiale 1989
8.F.DABIS ;J.DRUCKER;A.MOREN-Epidemiologie dintervention/chapitre II:Investigation
dun pisode pidmique-page 81-102 75006 paris 1992
9.Pr.A.BEZZAOUCHA- Epidmiologie et Biostatistique /chapitre II : Investigation dune
pidmie page161-180 3me dition 2004
10.OMS/ REM N 20,15mai 2009- N23,5 juin 2009

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