MOLECULAR STRUCTURE OF NUCLEIC ACIDS

a structure for deoxyribose nucleic acid

we wish to suggest a structure for the salt of deoxyribose nucleic acid (D.N.A). this structure has
novel features which are of considerable biological interest.
A structure for nucleic acid has already been proposed by pauling and corey. They kindly made
their manuscript available to us in advance of publication. Their model consists of three
intertwined chains, with the phosphates near the fibre axis, and the bases on the outside. In our
opinion. This structure is unsatisfactory for two reasons:
We believe that the material which gives the X-ray diagrams is the salt, not the free acid. Without
the acidic hydrogen atoms it is not clear what forces would hold the structure together, especially
as the negatively charged phosphates near the axis will repel each other. Some of the van der
walls distances appear to be too small.
Another three-chain structure has also been suggested by fraser (in the press). In his model the
phosphates are on the outside and the bases on the inside, linked together by hydrogen bonds.
This structure as described is rather ill-defined, and for this reason we shall not comment on it.
We wish to put forward a radically different structure for the salt of deoxyribose nucleic acid.
This structure has two helical chains each coiled round the same axis (see diagram). We have
made the usual chemical assumptions.namely, that each chain consists of phosphate diester
groups joining b-D-deoxy-ribofuranose residues with 3,5 linkages. The two chains (but not their
bases) are related by a dyad perpendicular to the fibre axis. Both chains follow righthanded
helices, but owing to the dyad the sequences of the atoms in the two chains run in opposite
directions. Each chain loosely resembles furbergs model no. 1 ; that is, the bases are on the
inside of the helix and the phosphates on the outside. The configuration of the sugar and the
atoms near it is close to furbergs standard configuration, the sugar being roughly perpendicular
to the attached base. There is a residue on each chain every 3-4 A. in the z-direction. We have
assumed an angle of 36 between adjacent residues in the same chain, so that the structure repeats
after 10 residues on each chain, that is, after 34 A. the distance of a phosphorus atom from the
fibre axis is 10 A. as the phosphates are on the outside, cations have easy acces to them.
The novel features of the structure is the manner in which the two chains are held together by the
purine and pyrimidine bases. The planes of the bases are perpendicular to the fibre axis. They are
joined tog9in pairs, a single base from one chain being hydrogen-bonded to a single base from
the other chain, so that the two lie side by side with identical z-co-ordinates. One of the pair must
be a purine and the other a pyrimidine for bonding to occur. The hydrogen bonds are made as
follows: purine position 1 to pyrimidine position 1; purine position 6 to pyrimidine position 6.
If it is assumed that the bases only occur in the structure in the most plausible tautomeric forms
(that is, with the keto rather than the enol configurations) it is found that only specific pairs of
bases can bond together. These pairs are : adenine (purine) with thymine (pyrimidine), and
guanine (purine) with cytosine (pyrimidine).

In other words, if an adenine forms one member of a pair, on either chain, then on these
assumptions the other member must be thymine; similarly for guanine and cytosine. The
sequence of bases on a single chain, does not appear to be restricted in any way. However, if only
specific pairs of bases can be formed , it follows that if the sequence of bases on one chain, is
given, then the sequence on the other chain is automatically determined.
It has been found experimentally that the ratio of the amounts of adenine to thymine, and the
ratio of guanine to cytosine, are always very close to unity for deoxyribose nucleic acid.
It is probably impossible to build this structure with a ribose sugar in place of the deoxyribose, as
the extra oxygen atom would make too close a van der walls contact.
The previously published X-ray data on deoxyribose nucleic acid are insufficient for a rigorous
test for of our structure. So far as we can, it is rigorous compatible with the experimental data,
but it is must be regarded as unproved until it has been checked against more exact result. Some
of these are given in time following, communications. We were not aware of the details of the
result presented there when we devised our structure, which rests mainly though not entirely on
published experimental data and stereo-chemical arguments.
It has not escape our notice that the specific pairing we have postulated immediately suggests a
possible copying mechanism for the genetic material
Full details of the structure, including the condition assumed in building it, together with a set of
co-ordinates for the atoms, will be published elsewhere.
We are must indebted to Dr. Jerry Donohue for constant advice and criticism, especially on
interatomic distance. We have also been stimulated by a knowledge of the general nature of the
unpublished experimental result and ideas of Dr. M. H. F. Wilkins, Dr. R. F. Franklin and their
co-workers at Kings College, London. One of us (J.D.W.) has been aided by a fellowship from
the Foundation for Infantile Paralysis.

MOLEKULER
STRUKTUR NUKLEAT ASAM
struktur untuk asam nukleat deoksiribosa
kami ingin menyarankan struktur untuk garam asam nukleat deoksiribosa (D.N.A). Struktur ini
memiliki fitur baru yang menarik biologis yang cukup.
Struktur untuk asam nukleat telah diusulkan oleh Pauling dan Corey. Mereka ramah membuat
naskah mereka tersedia bagi kita sebelum penerbitan. Model mereka terdiri dari tiga rantai
terjalin, dengan fosfat dekat sumbu serat, dan basis di luar. Dalam pendapat kami. Struktur ini
tidak memuaskan karena dua alasan:
Kami percaya bahwa bahan yang memberikan diagram X-ray adalah garam, tidak asam bebas.
Tanpa atom hidrogen asam tidak jelas apa kekuatan akan mengadakan struktur bersama-sama,
terutama karena fosfat bermuatan negatif di dekat sumbu akan saling tolak. Beberapa jarak van
der dinding tampak terlalu kecil.
struktur tiga-jaringan lain juga telah disarankan oleh fraser (dalam pers). Dalam modelnya fosfat
berada di luar dan dasar di dalam, dihubungkan oleh ikatan hidrogen. Struktur ini seperti yang
dijelaskan agak tidak jelas, dan untuk alasan ini kami tidak akan mengomentarinya.
Kami ingin mengajukan struktur yang sangat berbeda untuk garam asam nukleat deoksiribosa.
Struktur ini memiliki dua rantai heliks masing melingkar putaran sumbu yang sama (lihat
diagram). Kami telah membuat bahan kimia yang biasa assumptions.namely, bahwa setiap rantai
terdiri dari kelompok diester fosfat bergabung residu b-D-deoksi-ribofuranose dengan 3,5
keterkaitan. Dua rantai (tapi tidak pangkalan mereka) terkait dengan angka dua tegak lurus
dengan sumbu serat. Kedua rantai ikuti heliks yg memakai tangan kanan, tetapi karena angka dua
urutan atom dalam dua rantai berjalan dalam arah yang berlawanan. Setiap rantai longgar
menyerupai model yang ada Furberg ini. 1; yaitu, basis berada di dalam heliks dan fosfat di luar.
Konfigurasi gula dan atom dekat dekat dengan konfigurasi standar Furberg ini, gula yang kirakira tegak lurus ke dasar terpasang. Ada residu pada setiap rantai setiap 3-4 A. di z-arah. Kita
telah mengasumsikan sudut 36 antara residu yang berdekatan dalam rantai yang sama, sehingga
struktur berulang setelah 10 residu pada setiap rantai, yaitu, setelah 34 A. jarak dari atom fosfor
dari sumbu serat adalah 10 A. sebagai fosfat berada di luar, kation memiliki acces mudah untuk
mereka.
Fitur baru dari struktur adalah cara di mana dua rantai yang diselenggarakan bersama oleh basa
purin dan pirimidin. Pesawat-pesawat dari basis tegak lurus dengan sumbu serat. Mereka
bergabung tog9in pasangan, basis tunggal dari satu rantai yang berikatan hidrogen ke basis
tunggal dari rantai lainnya, sehingga sisi dua kebohongan berdampingan dengan identik zkoordinat. Salah satu pasangan harus menjadi purin dan lainnya pirimidin untuk ikatan terjadi.
Ikatan hidrogen yang dibuat sebagai berikut: posisi purin 1 dengan posisi pirimidin 1; posisi
purin 6 dengan posisi pirimidin 6.

Jika diasumsikan bahwa pangkalan hanya terjadi dalam struktur dalam bentuk tautomerik paling
masuk akal (yaitu, dengan keto daripada konfigurasi enol) ditemukan bahwa hanya pasangan
tertentu basa dapat ikatan bersama-sama. pasangan ini adalah: adenin (purin) dengan timin
(pirimidin), dan guanin (purin) dengan sitosin (pirimidin).
Dengan kata lain, jika adenin membentuk salah satu anggota dari sepasang, di kedua rantai,
maka asumsi ini anggota lain harus timin; sama untuk guanin dan sitosin. Urutan basa pada
rantai tunggal, tampaknya tidak dibatasi dengan cara apapun. Namun, jika hanya pasang spesifik
basa dapat dibentuk, berikut bahwa jika urutan basa pada satu rantai, diberikan, maka urutan
pada rantai lain secara otomatis ditentukan.
Telah ditemukan eksperimental bahwa rasio jumlah adenin untuk timin, dan rasio guanin untuk
sitosin, selalu sangat dekat dengan kesatuan asam nukleat deoksiribosa.
Hal ini mungkin mustahil untuk membangun struktur ini dengan gula ribose di tempat
deoksiribosa, seperti atom oksigen ekstra akan membuat terlalu menutup van der dinding kontak.
Data X-ray yang sebelumnya diterbitkan pada asam nukleat deoksiribosa tidak mencukupi untuk
tes ketat untuk struktur kami. Sejauh yang kami bisa, itu adalah ketat kompatibel dengan data
eksperimen, tetapi harus dianggap sebagai tidak terbukti sampai telah diperiksa hasil yang lebih
tepat. Beberapa ini diberikan dalam waktu berikutnya, komunikasi. Kami tidak menyadari
rincian hasil yang disajikan di sana ketika kita menyusun struktur kami, yang terletak terutama
meskipun tidak sepenuhnya pada data eksperimen diterbitkan dan argumen stereo-kimia.
Hal ini tidak luput dari perhatian kita bahwa pasangan tertentu yang kami telah mendalilkan
segera menyarankan mekanisme menyalin mungkin untuk bahan genetik
Rincian lengkap dari struktur, termasuk kondisi yang diasumsikan dalam bangunan itu, bersamasama dengan satu set koordinat untuk atom, akan dipublikasikan di tempat lain.
Kami harus berhutang kepada Dr. Jerry Donohue untuk saran konstan dan kritik, terutama pada
jarak interatomik. Kami juga telah dirangsang oleh pengetahuan tentang sifat umum dari hasil
percobaan yang tidak dipublikasikan dan ide-ide dari Dr. M. H. F. Wilkins, Dr. R. F. Franklin dan
rekan kerja mereka di King College, London. Salah satu dari kami (J.D.W.) telah dibantu oleh
beasiswa dari Yayasan infantil Paralysis.