Ciclo de Krebs

El ciclo de Krebs (conocido tambin

como ciclo de los cidos tricarboxlicos o ciclo del cido ctrico) es un ciclo
metablico de importancia fundamental en todas las clulas que utilizan
oxgeno durante el proceso de respiracin celular. En estos organismos
aerbicos, el ciclo de Krebs es el anillo de conjuncin de las rutas metablicas
responsables de la degradacin y desasimilacin de loscarbohidratos,
las grasas y lasprotenas en anhdrido carbnico yagua, con la formacin de
energa qumica.
El ciclo de Krebs es una ruta metablica anfiblica, ya que participa tanto en
procesos catablicos como anablicos. Este ciclo proporciona muchos
precursores para la produccin de algunos aminocidos, como por ejemplo el
cetoglutarato y el oxalacetato, as como otras molculas fundamentales para la
clula.
El ciclo toma su nombre en honor del cientfico anglo-alemn Hans Adolf Krebs,
que propuso en 1937 los elementos clave de la ruta metablica. Por este
descubrimiento recibi en 1953 el Premio Nobel de Medicina.
Etapas del Ciclo de Krebs
Reaccin 1: Citrato sintasa (De
oxalacetato a citrato)
El sitio activo de la enzima, activa el acetil-CoA para hacerlo afn a un centro
carbonoso del oxalacetato. Como consecuencia de la unin entre las dos
molculas, el grupo tioster (CoA) se hidroliza, formando as la molcula de
citrato.
La reaccin es sumamente exoergnica (G'=-31.4 kJ/mol), motivo por el cual
este paso es irreversible. El citrato producido por la enzima, adems, es capaz
de inhibir competitivamente la actividad de la enzima. Incluso estando la
reaccin muy favorecida (porque es exoergnica), la citrato sintasa puede ser
perfectamente regulada. Este aspecto tiene una notable importancia biolgica,
puesto que permite una completa regulacin del ciclo de Krebs completo,
convirtiendo a la enzima en una especie de marcapasos del ciclo.
Reaccin 2: Aconitasa (De citrato a isocitrato)
La aconitasa cataliza la isomerizacin del citrato a
isocitrato, por la formacin de cis-aconitato. La enzima
cataliza tambin la reaccin inversa, pero en el ciclo de
Krebs tal reaccin es unidireccional a causa de la ley
de accin de masa: las concentraciones (en
condiciones estndar) de citrato (91%), del intermediario cis-aconitato (3%) y
de isocitrato (6%), empujan decididamente la reaccin hacia la produccin de
isocitrato.
En el sitio activo de la enzima est presente un clster hierro-azufre que, junto
a algunos residuos de aminocidos polares, liga el sustrato. En concreto, la
unin al sustrato se asegura por la presencia de un resto de serina, de arginina,

de histidina y de aspartato, que permiten slo la unin estereospecifica del

citrato 1R,2S, rechazando la forma opuesta.
Reaccin 3: Isocitrato deshidrogenasa (De
isocitrato a oxoglutarato)
La isocitrato deshidrogenasa mitocondrial es una
enzima dependiente de la presencia de NAD+ y de
Mn2+ o Mg2+.
Inicialmente, la enzima cataliza la oxidacin del
isocitrato a oxalsuccinato, lo que genera una molcula
de NADH a partir de NAD+. Sucesivamente, la
presencia de un in bivalente, que forma un complejo
con los oxgenos del grupo carboxilo en posicin alfa, aumenta la
electronegatividad de esa regin molecular. Esto genera una reorganizacin de
los electrones en la molcula, con la consiguiente rotura de la unin entre el
carbono en posicin gamma y el grupo carboxilo adyacente. De este modo se
tiene una descarboxilacin, es decir, la salida de una molcula de CO 2, que
conduce a la formacin de -cetoglutarato, caracterizado por dos carboxilos en
las extremidades y una cetona en posicin alfa con respecto de uno de los dos
grupos carboxilo.
Reaccin 4: -cetoglutarato deshidrogenasa (De oxoglutarato a
Succinil-CoA)
Despus de la conversin del isocitrato en -cetoglutarato se produce una
segunda reaccin de descarboxilacin oxidativa, que lleva a la formacin de
succinil CoA. La descarboxilacin oxidativa del -chetoglutarato es muy
parecida a la del piruvato, otro -cetocido.
Ambas reacciones incluyen la descarboxilacin de un -cetocido y la
consiguiente produccin de una unin tioster a alta energa con la coenzima
A. Los complejos que catalizan tales reacciones son parecidos entre ellos.
La -cetoglutarato deshidrogenasa (o, ms correctamente, oxoglutarato
deshidrogenasa), est compuesta de tres enzimas diferentes:
* Subunidad E1: las dos cetoglutarato deshidrogenasas.
* Subunidad E2: la transuccinilasa.
(La subunidad E1 y E2 presentan una gran homologa con las de la piruvato
deshidrogenasa.)
* Subunidad E3: la dihidrolipoamida deshidrogenasa, que es el mismo
polipptido presente en el otro complejo enzimtico.
Reaccin 5: Succinil-CoA sintetasa (De SuccinilCoA a succinato)
El succinil-CoA es un tioster a alta energa (su G de
hidrlisis est en unos -33.5 kJ mol-1, parecido al del
ATP que es de -30.5 kJ mol-1). La citrato sintasa se
sirve de un intermediario con tal unin a alta energa
para llevar a cabo la fusin entre una molcula con dos tomos de carbono
(acetil-CoA) y una con cuatro (oxalacetato). La enzima succinil-CoA sintetasa se
sirve de tal energa para fosforilar un nuclesido difosfato purinico como el
GDP.

La energa procedente del tioster viene convertida en energa ligada a una

unin fosfato. El primer paso de la reaccin genera un nuevo intermediario a
alta energa, conocido como succinil fosfato. Sucesivamente, una histidina
presente en el sitio cataltico remueve el fosfato de la molcula glucdica,
generando el producto succinato y una molcula de fosfohistidina, que dona
velozmente el fosfato a un nuclesido difosfato, recargndolo a trifosfato. Se
trata del nico paso del ciclo de Krebs en el que se produce una fosforilacin a
nivel de sustrato.
El GTP est implicado principalmente en las rutas de transduccin de seales,
pero su papel en un proceso energtico como el ciclo de Krebs es, en cambio,
esencialmente trasladar grupos fosfato hacia el ATP, en una reaccin catalizada
por la enzima nuclesido difosfoquinasa.
Reaccin 6: Succinato deshidrogenasa (De
succinato a fumarato)
La parte final del ciclo consiste en la reorganizacin de
molculas a cuatro tomos de carbono hasta la
regeneracin del oxalacetato. Para que eso sea
posible, el grupo metilo presente en el succinato tiene
que convertirse en un carbonilo. Como ocurre en otras
rutas, por ejemplo en la beta oxidacin de los cidos grasos, tal conversin
ocurre mediante tres pasos: una primera oxidacin, una hidratacin y una
segunda oxidacin. Estos tres pasos, adems de regenerar oxalacetato,
permiten la extraccin ulterior de energa mediante la formacin de FADH2 y
NADH.
La primera reaccin de oxidacin es catalizada por el complejo enzimtico de la
succinato deshidrogenasa, la nica enzima del ciclo que tiene como aceptor de
hidrgeno al FAD en vez de al NAD+. El FAD es enlazado de modo covalente a la
enzima por un residuo de histidina. La enzima se vale del FAD ya que la energa
asociada a la reaccin no es suficiente para reducir el NAD +.
El complejo enzimtico tambin es el nico del ciclo que pasa dentro de la
membrana mitocondrial. Tal posicin se debe a la implicacin de la enzima en
la cadena de transporte de los electrones. Los electrones pasados sobre el FAD
se introducen directamente en la cadena gracias a la unin estable entre la
enzima y el cofactor mismo.
Reaccin 7: Fumarasa (De fumarato a L-malato)
La fumarasa cataliza la adicin en trans de un protn y
un grupo OH- procedentes de una molcula de agua.
La hidratacin del fumarato produce L-malato.

Reaccin 8: Malato deshidrogenasa (De L-malato

a oxalacetato)
La ltima reaccin del ciclo de Krebs consiste en la
oxidacin del malato a oxalacetato. La reaccin,
catalizada por la malato deshidrogenasa, utiliza otra
molcula de NAD+ como aceptor de hidrgeno,
produciendo NADH.
La energa libre de Gibbs asociada con esta ltima
reaccin es decididamente positiva, a diferencia de las
otras del ciclo. La actividad de la enzima es remolcada
por el consumo de oxalacetato por parte de la citrato sintasa, y de NADH por
parte de la cadena de transporte de electrones.