437
VIII.6 Metabolismul glicerol'osi'oliptdelor. ...............................
441
VIII.7 Metabolismul sfingolipidelor.................................... 445
"VIII.8 Metabolismul colesterolului................................. 448
VIII.8.1 Digestia i absorbpa colestcrolului........................450
VU3.8.2 Biosinteza colesterolului. ................... ........ . ........
450
VHI.8.3 Catabolismul colesterolului. ...................
............ 455
VIII.9 Lipidele plasmatice............................................... 457
VI11.9.3 Analiza lipidelor plasmatice............................... 458
VII1.9.2 ChiJomicixmii....................................................... 461
8
VIIL9.4 Lipoproteinele cu densitate midi (LDL, (3-lipoproteine)
464
VIIL9.5 Lipoproteinele cu densitate mare (HDL, cx-lipoproteine)
466
VIII.9.6 Acizii grai liberi (AGL, acizi grai neesterificaji), . .
467,
VIH.9.7 Dislipidemiiie. ............................ ........................467
VIII. IO Eicosanoizii. ....... ..................................................
471
VIIU0.1 Biosinleza eicosanoizilor.............................. ........473
VIII.10.2 Catabolismul prostaglandinelor........ ................... . .
476
VIII.
10.3 Actiunile bioiogice ale eicosanoizilor............... . . 476
Cap. IX. Metabolisms^ proteineior 1 aS anriuoadzilor. (Prof. Dr. E.Trupa)
............................................................................................. 479
IX.
1 introduces.............................................................
479
1X.2 Starea dinamicS a proteineior. Bilanjuri azotate ....... 479
IX.3 Digestia proteineior alimentare i absorbpa aminoacizilor. Hidroliza
proteineior endogene. .... 481
IX.4 Fondul de aminoacizi. Aminoacizi] esenpali...............485
1X.5 Catabolismul aminoacizilor: dezamtnarea oxidativa i ciclul ureogenetic
............................................................................................ . . 486
IX.
5.1 Aspecte generale.................................. . ......486
1X.5.2 Dezaminarea oxidativa a aminoacizilor $i Iranspoitul amoniacului
rezultat..............................................................................486
IX.5.3 Biosinteza ureei. ........ . ...................... .................... 490
IX.5.4 Relalii intre ciclul ureogenetic i ciclul acizilor tricarboxilici
493
IX.5.5 Boli cauzate de defecie in metabolizarea amoniacului
493
1X.6 Catabolismul aminoacizilor; utilizarea schelelelor de carbon
494
IX.6.1 Aspecte generale.................................................... 494
1X.6.2 Alanina, treonina, glicina, serina, cisteina (i cistina) se degradeaza la
acid piruvic. ...... 495
IX.6.3 Arginina, prolina, histidina, glutamina i acidul glutamic se degradeaza
la acid ct-cetoglutaric. . .................................................... 497
IX.6.4 Aspargina $d acidul aspartic se degradeaza la oxaloacetat 499
IX.6.5 Izoleucina, valuta i meliomna se degradeaza la succinil-CoA
499
IX.6.6 Leucina i lizina se degradeaza la acid acetoacetie sau acetoacetil-CoA
...........................................................................................502
1X.6.7 Triplofanul se degradeaza la acctil-CoA alanina......503
IX.6.8 Fenilalanina $i lirozina se degradeaza la acid fumaric gi acid
acetoacetie........................................................................503
IX.6.9 Boli cauzate de defecte in utilizarea .scheletului de carbon ai
aminoacizilor......................................................................506
IX.7 Biosinteza aminoacizilor neesen|sali......................... 508
IX.7.1 Aspecte generale................................................... 508
IX.7.2 C5i particular de biosinteza....................................
510
IX. 8 Formarea din aminoacizi a unor compugi cu func^ii specializate 513
IX.8.1 Compugii rezulta|i prin decarboxilarea aminoacizilor 513
1X.8.2 Biosinleza glutationului, . .............................................
515
IX.8.3 Sinteza creatinei. Relajia creating - creatinfosfaL Creatinina 516
IX.
8.4 Conpugi de conjugare a aminoacizilor...........
517
Cap. X. Metabolism!]! hemoproteinelor. (Prof.Dr. E.Tru|ia).
................................................................. 519
X. l Aspecte cliimice....................................................... 519
X.2 Biosinteza hemukii..................................................... 521
X.
2.1 Etapele biosintezei........................................... 521
X.2.2 Reglarea biosintezei hemului................ ................ .
525
X.2.3 Porfiriilc...................................................................... . . 526
X.3 Catabolismul hemukii.................................................. 529
X.3.1 Etapele initiate. ............................................. ...... 529
X.3.2 Bilirubina: fomtare, patmndere in ficat, caracLeristici, conjugare,
excrepe biliara.................................................................... 530
X.3.3 Etapele finale. . .................................. . .............. . 533
X. 3.4 Hiperbilirubinemiile........................... ...................... .
534
Cap. XI. MetaboUsmul nudeotidelor purinice si piritmdinicc. (Prof. Dr. Elena
Popa-Cristea).....................................................................538
XL1 Metabolismul nudeotidelor purinice........................... 538
XI.
1.1 Biosinteza de novo a nudeotidelor purinice......_ 540
Biosinteza IMP. . .......................... . ................ ........ 540
Biosinteza AMP gi GMP. .. . .................................................. 542
Biosinteza nudeotidelor cu legaturi fosfat ntacroergice...... . . 544
Biosinteza dezoxiribonucleotidelor....................................544
Reglarea biosintezei de novo a purinelor...........................544
XI.
1.2 Interconversiunile i reutilizarca purinelor......... 546
XI.1.3 Catabolismul purinelor ...... .................................... 551
XI.
1.4 Palologia metabob'smului purinelor.........................
553
9
XI.2 Metabolismul nudeotidelor pirimidinice
XI.2,1 Biosinteza de novo a nudeotidelor pirimidinice. . . .
XI.2.2 Reutilizarea, catabolismul nudeotidelor pirimidinice.
XI.2.3 Patologia metabolismului pirimidinelor
Cap. XII. HormotiU. (Prof. Dr. Elena Popa-Cristea).....562
. XII. 1 Introducers..............................................................362
XII.2 Receptorii hormonal! .......................................... 564
XII.3 Mecanismele de ac|iune a honnonilor, .. ................... 571
XII.3.1 Mecanismul de acjiune a honnonilor steroidici 1 tiroidieni
......................................................................... 571
XII.3.2 Mecanismul de acjiune a honnonilor peptidici $i a catecolaminelor
...................................................................................... . .. .572
Proteinele G......*......................... ................................. ...573
AMPC> adenilat cidaza i AMPC fosfodiesteraza.....,............576
Protein kinaze i fosfoproteinfosfataze............................... 577
AMPC mediator al expresiei genice ....................................
580
GMPC, guanilat ciclaza i GMPC fosfodiesteraza .....................
581
Fosfolipaza C i mesagerii intracelulari. Diacilglicerol i inozitoltrisfosfat 583
Ca2* mesager intracelular al semnalelor exteme..............585
Mecanismul de acjiune a unor honnoni care regleazS creterea i proliferarea
celulara. ...... 586
XII.4 Honnonii tiroidieni. ...............................................
592
X1I.5 Hormonii care rcgleaza calcemia (honnonii calciotropi). . .
............................................................................. . 593
XII.5.1 Homionul paratiroidian...........................................594
X1I.5.2 Calcitonina........................................................... 595
XII.5.3 1,25-Dihidroxicolecaldferol (Calcitriol)................. 598
XII.6 Honnonii pancreatici, .......................... -....................598
XII.6.1 Insulina....................................................................603
XII.6.2 Glucagonul........................................................
604
XII.6.3 Somatostatina........................................................... , 606
XII.6.4 Polipeplidul pancreatic. ............................. .........
..................................... 607
XII.7 Honnonii gastrointestinal! .......................................... 608
XII.8 Honnonii raeduiosuprarenalieni ............ . ................. 612
XII.9 Honnonii corticosuprarenalieni................................ 618
X11.10 Honnonii sexuali.................................................. 618
XII. 10.1 Androgenii.......................................................... 622
XII. 10.2 Honnonii ovarieni. . ............................................. 624
XII. 11 Hormonii hipofizari $i hipoUilamici.........................624
XILU.l Hormonii adenohipofizari....................................... 626
Peptide'derivate din pro-opiomelanocoitina (POMC)....... 628
Giupui honnonilor somatomainotropi......... ,..................... 629
Honnonii hipofizari glicoproteici. ............................................
630
XU.I 1.2 Hormonii neurohiporizari.........,. . ........................ 631
XII. .12 Epifiza (glanda pinealS)....................................
633
XII.13 Endorfine..................................................................' 634
XII. 14 Factorii de cregtere. ..............................................., . 635
XII. 14.1 Familia EOF (Epidennal growth factor)............... .635
XII.14.2 Familia FGF (Fibroblast growth factor).....; . . .......
636
XII. 14.3 Familia PDGF (Platelet derived growth factor)......636
XII.14.4 Familia TGF p (Transforming growth factor p).........
..................................................................... . 637
XU.14.5 Factorii de cregtere insulin-like (IGF, somatomedine)
...................................................................... 638
XII, 14.6 NGF (Nerve growth factor)................................... .
........................................... . 638
XII,14.7 Familia CSF (Colony-stimulating factor).............. 639
643
Dr.
-.
694
macromolecule
informajionale, cu sravenje specifice de aniino.acizi, sunt expresia
epigenetic# a
genomului celular, '
Proteinele Indeplinesc funcjii fundamental, specifice organismelor vii
(Tabelul LI):
Label LL
Exemple de proteine i funcjii fndepiinite de accstea
Proteina
Funclia
Principala proteina a Jesuturilor
Colagenul
conjunctive
Histona
Proteina nucleara asociata cu ADN
Proteina eritrocitar# cu rol in mentinerea
Spectrina
fonnei celuiare
Amilaza
Enzima, participa la digestia amidonului
Pepsina
EnzimS, participa la digestia proteinelor
Glicogen
sintaza
Enzima, participa la sinteza glicogenului
Lactat
Enzima, catalizeaza oxidarea lactatului
dehidrogenaza
la piruvat
Actina
Proteina contractile din muchi
Miozina
Proteina contractila din muchi
Insulina
Hormon pancreatic hipoglicemiant
Hormonul de
cretere
Mormon hipofizar
Serumal
Proteina plasmatica, transporta ioni,
burnina
vitamine, hormoni
Transporta oxigenul in sistemul
Hemoglobina
circulator
Transferina
Transporta ioni de fier in plasma
Feridna
Forma de depozitare a Feral ui
Citocromii
Transporta electroni
Imunoglobulinel Andcorpi care fixeaza i imobilizeaza
e
agenjii bacterieni
ProteinS. plasmadcS cu rol in coagularea
Fibrinogenul
sangeiui
- Proteinele au un rol structural, major, ele constituie materialul din care
sunt construite to ate structurile celuiare, membrane, organite celuiare ca i
materialul intercelular al {esuturilor i organelor. Proteinele exist# Intr-o
varietate molecular# -foarte mare i ele
asigur# diversitatea $i specificitatea de form# a tuturor fiin|elor jiL
1-3
- Protemele exergita.^ acjiuni catalitice. determinand varietatea nesfSrita
de reacfii biochimice i specified transformerilor chimice din organismele vii.
- Proteinele contractile sunt instrumentele cu ajutorul c^rora organismele
vii indeplinesc activitatea contractile i locomotoare.
e ele pot aoc&gLiiaosin^
:,,SMEa5LChimM
ca ioni metalici, vitamine, oxigen, dioxid de carbon.
Alanina:
1
NHj
CH3-
Valina:
CH3-
Leucina:
CH3-
Izoleucina:
CH3CH,
NH,
CH CH2 CH COOH
CH,
NH,
ii
CH,
CH COOH
I
NH,
14
Tahelul 12
Siructurile si demimirile aminoacizilor proteinogeni
Formula structurald
Denumirea Denumirea rationale
uzuala
3
Acid aminoacetic
NHa
2
glicocoi
(glicina)
Prescu
rtarea
de irei
litere
,4
Gly
CH3 CH COOH 1
alanina
Acid a-aminopropionic
Ala
j)A
valina
Acid a-aminoizovalerianic
Val
. V
leucina
Acid a-aminoizocaproic
Lea
izoleucina
Acid a-amino-Pmetiivaleriaiiic
He
4U
Phe
1
CH2COOH
Simb
ol de
o
litera
5
(}
NH2
CH, CH CH COOH 1 1
CH3 NH;
CH3 CH C-H2 CH
COOH
ii
CH3 NH2
fenilaianin
a
V/
2
prolina
3
Acid pirolidin-a-carboxilic
4
Pro
5
\P
1 i \l
i
Hisddina
Acid a-amino-pimidazoiilpropionic
His
.pH
tj
Triptofan
Acid a-aminopindoiilpropionic
Trp
p)w
Senna.
Acid a-amino-phidroxipropionic
Ser
f) s
Treonina
Acid a-amino-phidroxibutiric
Thr
COOH
- CH2 CH COOH
I
' NH2
-CH2CH COOH
V^
H
Tirozina
p-hidroxifenilalanina
Tyr
CH? CH COOH
II
SH NH2
Tabelul 1.2 (continuare)
Cisteina
Acid a-amino-ptiopropionic
Cys
1
CH3 S CH2
COOH
2
Metionina
3
Acid a-airrino-S-nietUtiobutiiic
4
Met
Acid aminosuccinic
Asp
NH2
Acid
aspartic
Asparagin
a
Acid a-amino-Pamidosuccinic
Asn
Acid
glutamic
Acid a-aminoglutaric
GIu
Glutamina
Acid a-amino-yamidoglutaiic
Gin
1Q
Lizina
Acid a,e-diaminocaproic
Lys
Arginina
Arg
,AR
Sj
HO CH2 CH COOH
NH2
CH2
CH
.C
-}
5
ti) M
NH2
i/j
NH2
Tabelul 13
Amlnoaclzii neproteinogeni
Formula structurald
P - Alanina
Acid Paminopropionic
Component
al coenzimei
A
Acid yaminobutixic,
GABA
Neuromodula
tor
Acid 8aminolevulinie
H2N CO NH (CH2)3
CH(NH2) COOH
Citnilina
Funcpe
Intermedia!
in biosinteza
hemuiui
Intermediar
al ciclului
ureogenetic
Ornitina
Acid a, 5-diamino
valerianic
Homocisteina
Homoserina
Acid a-amino-yhidroxibutixic
H2N C6H4 OH
Acid paminobenzoic
Intermediar
al dclului
ureogenetic
Intermediar
m metaholismtil
aminoacizilor
Intermediar
in metabolismtil
aminoacizilor
Factor de
cregtere
persfni
bacterii,
compo-'
i*ent a!
aciduiui
folic *
Prolina cuprinde o grupare aminic5 secondary situate intr-un ciclu derivat din
pirol:
COOH
'1ST
H
N
H
pirol
prolinS
Aminoacizii cu grupdri hidroxilice. Serina i treonina-curpind in R funcfii
alcool:
CH3 CH CH COOH OH NH2
Serina
Treonina
Tirozina posedft o funcjie adifionalS fenol:
CH2 CH COOH
OH NH,
HO \
7 CH2 CH COOH
NH '
19
Aminoacizii cu sulf (tioarninoacizii). Ci-steina cuprinde foncfia liol (R =
SH) i metionina o funcfie doeter (R = S R);
CH2 CH COOH
CH3 S CH2 CH2 CH COOH
SH NH2
NH2
Cisteina
Metionina
Aminoacizi dicarboxilicL Acidul aspartic i acidul glutamic sunt acizi
monoaminodicar boxilici, iar asparagina i glutamina sunt amideie lor:
HOOC CH2 CH COOH
HOOC CH2 CH2 CH COOH
m2
NH2
Acidul aspartic
Acidul glutamic
H>NOC CH2 CH COOH
|
NH,
H2NQC CH2 CH2 CH COOH NH2
Glutamina
Asparagina
Aminoacizii diamlnici. Lizina are ca funcfie adiJionalS o grupare aminidl
primary
\ CH2 Ci
NH2
NH
H2N CH2 CH2 CH* CH, CH COOH
Arginina cuprinde o grupare guanidil, NH C
derivatft din guanidine, H2N C NH2 :
NH
m?
H2N C NH CH2 CH2 CH2 NH
CHCOOH
NH2
Arginina
Propriet&tile fizice ale aminoacizilor. Toji aminoacizii sunt substanje solide,
cu pun'cte de topire ridicate, mai mari de 200 i se descornpun inainte de a
se topi. Aminoacizii se dizolv&, intr-o mSsuriS mai mare sau mai mica, in
ap&, dar sunt greu solubili in solvenfii nepolari ca: eter, cloroform, benzen.
Sunt uor solubili in soiufii diluate de acizi i baze.
Izomeria optica a aminoacizilor, Tofi aminoacizii, cu excepjia glicocolului,
posedS un centru chiralic (un carton asimetric) care este Ca:
R
CH COOH NH2
20
Izoleucina i treonina au on carbon asimetric adijional, atomul Cp.
Formuleie de configurajie ale enantiomerilor unui aminoacid oareeare,
reprezentate in sistemul D-L, m care substanja de referinjS este aldehida
gliceric# dexlrogirS sunt:
COOH
COOK
H c m2
H2N C H
R
R
D aminoacid
L aminoacid
In structura proteinelor nu se intalnesc decSt L-aminoacizi. Aminoacizii din
seria D apar numai ocazional, in special la unele microorganisme i
totdeauna au roluri specifice.
Proprieta$ile acidobazice ale aminoacizilor. Aminoacizii cuprind o grupare
- NH2 bazic# i una COOH acid# i intre aceste dou# funcjii poate avea
loc transferal de protoni:
COOH
R CH '
R OH
COO
NH2
NH3*
ion bipolar (amfion)
Datorit# interacfiunilor electronice posibile intre cele dou# funcfii
invecinate, echilibrul reacfiei este deplasat aproape in totalitate spre
dreapta, practic aminoacizii (monoaminomonocarboxilici), In cristale ca i in
solujie, exists numai sub form# de amfioni (ioni bipolari). Structura bipolar#
a aminoacizilor este susjinut# de numeroase fapte. Prin m#sur#tori de
distance interatomice s-a g#sit c# in gruparea carboxil, distanfele C-0 sunt
egale (1,26 A), eie corespund ionului carboxilat, unde are loc conjugarea n-p:
1
H*
NH3*
NH2
4- H +
acid
baza
21
Funcjia bazic& a unui aminoacid este ionul carboxiiat COO" , baza
conjugate a grup&rii carboxil:
+ H+
COO'- COON
H*
baza
acid
Unii aminoacizi ca: lizina, acidul glutamic, acidul aspartic, cuprind In
radicalul de la Ca grupSri acide sau bazice adijionaie, Pentru inceput In exam
in area comport&rii aminoacizilor ca acizi i baze se iau in considerate numai
aminoacizii monoaminomono- carboxilici (aminoacizi neutri):
, 000
R CHNH3*
Pentru caracterizarea aciditdjii i bazicitSfii aminoacizilor se folosesc
exponenjii de aciditate,
pK, (pKa = log KJ. Funcfia carboxil este caracterizati prin pKa-coOH iar
funcjia aminicft printr-un pKoe-NH3+, .La unii aminoacizi se adaugd o a fcreia
mSrime pK, corespunz&toare funcjiei acide adijionale.
In Tabelul L4 se dau valorile pK ale color 20 de aminoacizi naturali.
Din examinarea datelor din Tabelul 1.4 se remarcil, in piimul rand, faptul
c& fimcjia . COOH este tin acid mai puternic (pK * 2) decat gruparea
similar^ a acizilor carboxilici oarecari (pK pentru acidul acetic este 4,76).
Aciditatea grup&rii NH3+ este redusS (pK = 9-10), dar intrece totup
bazicitatea COO. Din aceastd eauz&, in ap& purd, gruparea NH3+
doneazS mai mulfi protoni decdt accepts ionul COO. Solujiile apoase ale
aminoacizilor sunt slab acide.
label L4
Valorile pK i pi ale aminoacizilor
Aminoacid
pf<a~NH3 pKfi
Pi
pKa-CQOH
+
(25)
1. Glicocol
2,34
9,60
5,97
2. Alanina
2,35
9,69
6,02
3. Valina
2.32
9,62
5,97
4. Leueina
2,36
9,60
5,98
5. Izoleucina
2,36
9,68
6,02
5,98
6. Fenilalanina
1,83
9,13
7. ProlinS,
1,99
10,60
6,10
8. Triptofan
2,38
9,38
5,88
9. Seiina '
2,21
' 9,15
5,68
10. Treonina
2V63
10,43
. 6,53
11. Tirozina
2,20
9,11
10,07 5,65
12. Cisteina
1,71
10,78
8,33
.5,02
13. Metionina
2,28 '
'9,21
5,75
14. Asparagina
2,02
8,8
5,41
15. Glutamina
2,37
9,13
. 5v65
16. Acid
aspartic
2,09
9,82
3,86
2,97
17. Acid
glutamic
2,19
9,67
4,25
3,22
18. Histidina
1,82
9,17
6,00
7,58
19. Lizina
2,18
8,95
10,53 9,74
20. Arginina
2,17
9,04
12,48 10,76
22
Un aminoac'id prin func[iile acid& i bazicS pejsare le cuprincle, poaie
reacfiona cu baze eedand protoni i cu acizi, accept&nd protoni. IncSrcarea
electrics a unui aminoacid depihde de pH~ul solujiei. DacS un aminoacid se
alia intr-o solujie puternic acid# (pH ~ 0-1) grup&rile aceeptoare de protoni
sunt protonate in totalitate. La titrarea acestuia cu o bazil tare (HG) proton.il
sunt eliberaji In ordinea descrescfitoare a aciditfijii funcjiilor acide. Au loc
reacfiile:
<jXH COOH NH/
R
R
i
H+ I
<j)H
-----^ (jjf-j ___
COO"
COO'
NH3*
m2
In fig. 1.1 este prezentat& curha de titrare'a aianinei, a-neutralize
funcjiilor COOH i
NH3+ CU o solufie de'NaOH.
[Acid]
23
rezuita c3 La un pH egal cu pKa-cooH (2,35) exists egalitatea:
H3N CH(CH3) COOH - H.N CH(CH3) COO
iar ia pH = pKa-NH3+ (9,69) egalitatea:
H3N CH(CH3) COO * H2N ~~ CH(CH3) COO
La un pH egal cu semisuma valorilor pK, sarcina nets a aminoacidului este
practjc nul&, In solujie existand numai ionii bipolari. Acst pH este denumit
izoelectric (pi), in Tabelul 1.4, coloana 5, sunt date valorile pi ale
aminoacizilor proteinogeni. Pentru aminoactzii neutri, punctele izoelectrice
sunt, situate la valori de aproximativ 6, pH pujin inferior pH-ului fiziologic. La
pH = pi solubilitatea aminoacizilor este minimi.
Comportarea aminoacizilor cu grupdri acide i bazice adifionale. Un
num&r de 5 aminoacizi din cei 20 cuprind in radicalul R de la Ca grup&ri
acide sau bazice: acidul aspartic, acidul glutamic, lizina, arginina p histidina.
Funcfia fenol din tirozinU p cea tioalcool din cisteinft sunt acizi foarte slabi
care la pH-ul fiziologic se ionizeazft intro m&suril neglijabilft. La acegti
aminoacizi se adaugS o constants pK suplimentarS (Tabelul
1.4). Pentru acidul aspartic p glutamic aciditatea acestei funcjii este mai
micS decat; a grupului carboxilic de ia Ca, are o tSrie comparabilii cu a
acizilor monocarboxilici aiifatici (pK = 3,86 la acid aspartic p 4,25 la acid
glutamic), nu se mai simte influenja grup&rii am inice vecine.
Formele aciduiui aspartic, in raport cu pH-ul solujiei in care se aflft, pot fi
deduse, ca p in cazul aminoacizilor neutri, prin protonare maximal^ p apoi
adftugare treptat& de baz&; funcfiile acide vor ceda protoni in ordinea
descresc&toare a tiiriei lor:
(jXDOH t^OOH
<j;oo
f^OO
H
9 2
QH2
9H2
9H2
- H+ 1
- H+ 1
- H+ 1
1
pH . . MH +
CH MH +
w. PWNH
CjJH NH/
.1
COOH
COO
COO
COO
(+)
(0)
(-)
(2-)
pH-ul izoelectric al acestor aminoacizi este dat de semisuma valorilor pK ale
funcjiilor care genereazd ionul f&rS sarcinS netd. Pentru acidul aspartic p
acidul glutamic, punctele lor izoelectrice sunt situate la valori net acide (2,97
p, respectiv 3,2).
Lizina este un aminoacid bazic cu o funcpe aminicS in R. Formele lizinei In
raport; cu variable de pH ale mediului sunt:
(j)H2 NH3*
<j:H2-NH3*
(J;H2 Nhy
^H2~
(^HJ,
(^H2)3
(^H253
<JH ----- 1
NH3*
^ <pH NH3+
^ CpH NH2
COOH
COO
COO
COO
(-2)
(+)
(0)
(-)
pH-ul izoelectric al lizinei este situat la valorarea 10.
24
Arginina are un caracter bazic net prin gruparea guanidinicft;
NH
NH/
II
+ H*
II
R NH C NH2
R NH C NH2
H+
ion guanidinium
lonul guanidinium, datorita conjugSrii rc p poate fi serfs:
R NH - C
+ 1 NH2 ^
NH
+ 1 *2
Histidina prezinta caracter bazic prin nucieul heterociciic al iniidazolului:
N
HN i
i
||
-rH* '
|t
11
w
11
Bazicitatea acestei grup8ri este mai redusd (pK = 6,00) i pi este situat la
valori apropiate de pH-ul fiziologic (7,58).
Din cele expuse mai inainte rezuM c& ionizarea aminoacizilor, sarcina
electric!! pe care o poartS fiecare dintre ei, depinde de pH-ul solujiei in care
sunt cupringi. DacS jinem seama eft in organismele vii aminoacizii sunt
cuprini in lanfurile poiipeptidice ale proteineior este important de examinat
comportarea ca acizi sau baze a resturilor aminoacide -NH CH(R) CO
sarcina electric^ pe care o poartft aceste resturi la pH-ul fiziologic. Resturile
aspartil i glutamil au in aceste condijii o sarcinft netft (-) pe cand resturile
lizii, arginil i histidil au sarcina (+):
cjxxr
cjxxr
(fH*)*
NH,
NHCHCO; NHOHCO;
-HNCHCO;
(CpU
-HN CHCONH2
NH2
Restul histidil este redat prin douft stmcluri tautomere:
HN
H
CH2 CH
/
NH
\ CO
HN
HH CH2 CH {
\co
y
H
25
Clasificarea aminoacizilor dupd naiura radicaiului de la Ca.
In proteine, aminoacizii sunt. angaja{i in legiltur^l peptidicfl prin gruparca
aminic&-i cea
carboxil:
R
NH CH CO
rest ammoacidic
Ceea ce diferen|iazd resturile celor 20 de aminoacizi este natura
radicaiului de la Ca. Natura interacjiuniJor ce se pot stabili intre resturile
aminoacidice depinde de incftrcarca electrics. a acestor resluri, de caracterul
lor polar sau hidrofob. Jinandu-se scama de aceste insuiri ale resturilor R de
la Ctt aminoacizii sunt imparjiji in patru grupe.
a. aminoacizi cu R hidrofob, nepolar; alanina, vnlina, Ieucina, izoleucina,
prolina, fenilalanina, triptofanul, metionina;
b. aminoacizi cu. R polar, dar fdrM sarcina electric*!: serina, treonina,
lirozina, cisteina, asparagina, glutainina $i glicocolul (R = H);
c. aminoacizi cu R mc&rcat (-) (la pH-ul fiziologic): acidul aspartic, acidul
glutamic;
cl, aminoaocizi cu R mefircai (+) (la pH-ul fiziologic): lizina, arginina,
histidina.'
Reacf.iile chimice ale aminoacizilor, Aminoacizii prezinttl diverse reacjii
chimice la care participii atat funcjiiie amino 1 carboxil comune tuluror
aminoacizilor, cat. i grupilriie prezente in radicalii de la Cw.
ReacpJ ale grupdrii -COOH. Aminoacizii formeazS. derivaji normali ai
acestei funcjii:
esten, amide, anhidride, nitrilL Prin decarboxilare, aminoacizii formeaxfr
amine, multe dintre ele substanje cu proprietaji fiziologice i farmacologice
remarcabile (amine biogene):
R CH COOH ---------------> R CH2 NHa + C02
NH2
Unelc amine, produi.ai reacjiei de decarboxilare a aminoacizilor, sunt
ar&taji mai jos:
N
CH2 CH2 NH2
HOOC (CH2)3 NH2
Nx
hi,stamina
H
(din histidinft)
ad d y-am inobuti ric (din acid glutamic)
(jlH2 CH2 NH2 OH
-0
X
z:
1
2H
NHL
NH2
NH
Inloeuirea grupSrii NH2 cu OH:
+ HOH
R CH COOH----------------O
cx-cetoacid (a-oxoacid)
NH,
NH,
R CH COOH
I
OH
a-hidroxbacid
Reacpi ale funcfiitor prezente in radicalul de la Ca.
Penlru funcfia tioalcool din cisteind sunt caracteristice reacfiile: - oxidare
bland! si reversibilS la disulfura:
CH? CH2 S S SH
CH2
i
- 2H I
1
CH NH2
CH
1
+ 2H I
I
COOH COOH
CO
OH
cistina
27
- formare de s&ruri cu metale grele, marcaptide:
R SH + AgN03 ---------------------R SAg 4- HNOs
- oxidare energies la acid cisteic:
CH2S
CH2 S03H
H
1
oxidare I
CH ------ CH
NH2
NHo
12
COOH COOH
acid cisteic
Serina, treonina i tirozina prin func|ia hidroxi formeazS esteri, cu acidul
fosforic, rezuMnd;
CH2 O POSH2
0 FOSH2
s2
1
CH
P0
H
rS
3
CH NH 1
P
COOH
CH NH2 |
acid
serinfosforic
COOH
V
CH2 CH
2
l
I
NH2
acid
ireomnfosforic
acid tirozinfosforic
Gruparea NH2 de la Ce al lizinei confers acestui aminoacid sau restuiui
Vasopr
esina
apa gi, respectiv, entropia apei create dac# aceast# molecul# este excius#
din ap#.
34
Interne jiimile hidrofobe sunt factorii cei mai important care determine
conformafia unei molecule proteice prin insumarea unui foarte mare num&r
de contacte nepolare. Dintre cei 20 aminoacizi proteinogeni, apte posed# R
cu caracter hidrofob.
Punjile disulfurice S S care se pot stabili intre dou# resturi Cys,
dei sunt leg#turi covalente, au un rol determinant pentru conformajia
proteinei. Realizarea unei punfi S S necesit# aducerea a douS resturi
Cys in pozijii potrivite care se realizeaza prin forje necovalente.
Fiecare specie proteic# este un unicat in ceea ce privete structura
primary i conformafia. Din studiul conformafiilor unui numir de proteine se
pot formula principiile generate care guverneaz# organizarea spafial# a
tuturor moleculelor proteice. Cele douS elemente structuraie ale unei
proteine, axul catenei polipeptidice i cele 20 de tipuri de radicaii legafi la Ca
care se pot g&si intr-o multitudine de relafii reciproce contribuie la realizarea
structurii secundare i terfiare a proteinelor:
R.
R?
R3
l
l
i
NH CH CO NH CH CO NH CH CO Structura
secundard a proteinelor
Pauling i colab. incepand din anui 1930 au intreprins studii sistematice,
pin cristalografie cu raze X, de m&surare a distanfelor interatomice, a
unghiurilor de ieg#tur& din aminoacizi, din peptide. S-a stabilit c#in
gruparea peptidicS are ioc o conjugare n-p, legStura NH CO capM un
caracter partial de leg&tur# dubl#, rotafia liberal in juml acestei legSturi
fiind astfel impiedicat#. Atomii Ca vor adopta pozifii rigide faf# de planul
legHturii duble. In peptidele naturale se intalnete numai configurafia trans,
mai stabile decat aceea cis (Fig. 1.4).
GH ~ NH
i
C CH
0 alts inspire a grup3rii peptidice este capacitatea grupei NH de a forma o
leg&turli d.e hidrogen cu un grup C = O aparjlnand altei grupftri peptidice:
^ N H -- O * C
Conjugarea n pa gruparii peptidice accentueazd aceaste fnsuire.
Un lanj polipeptidic, in solujie, ar putea adopta o infinitate de conformafii
prin rotafii in jurul legiUurilor CH(Rj) NC^ i CH(R2) CO . Unele
din aceste
conform ajii vor fi mai stabile dace permit realizarea de punji de hidrogen
intre grupSrile peptidice. Plecand de la principiul c& aranjamentul cel mai
stabil este acela in care se realizeazS cel mai mare numSr de punji de
hidrogen, Pauling i Corey (1951) au postulat dou& structuri secundare
pentru lanjurile polipeptidice a - elicea i structura [3. O. structure elicoidalft,
distinct^ de cea descris# de Pauling, este intSlnite la colagen, proteina
major2 a matricei extracelulare, care are o compozijie aminoacidice
particular^.
Structura de elice alfa. Lanful polipeptidic se rsucete (la nivelul
leg&turilor simple) pentru ca grupdrile O = C i ^:NH s3 devinft adiacente
stereochimic pentru a
forma punfi de hidrogen. Se objine astfel o structure repetitive eiicoidala in
care ioate unitSjile se aflii in raporturi spajiale identice cu unitSile vecine. O
grupare NH
formeaz# punte de hidrogen cu gruparea CO aparfin&nd celui de-al patrulea
rest
aminoacidic din secvenja linear&. In acest fel, toate grupele CO i NH
sunt unite prin punfi de hidrogen (Fig. 1.5).
Stereochimia grupSrii peptidice, unghiurile de legSturi, distanjele
interatomice, colinearitatea punfilor de hidrogen, apartenenja aminoacizilor
la aceeai serie optics (seria L) determine o anumite geometrie a a-eLicei;
- cu fiecare rest aminoacidic se avanseaze pe verticaie, cu 1,47 A;
~ pasul elicei, distanfa intre done puncte echivalente pe verticaie este de
5,21 A i cuprinde 3,6 resturi aminoacidice;
- diametrul elicei, diametrul suprafejei cilindrice In care se afle atomii
Ctt, este de 10,1 A;
- sensul nlsucirii lanpdui polipeptidic este de la stanga la dreapta (elice
dreaptd);
36
Chimotripsina
15
Lungimea i repart izarea segmentelor de a-elice in cuprinsul moleculei
este diferitS de la o proteins la alia, in funcfie de distribujia factorilor
stabilizator! i destabilizatori ai elicei in structura primarS. Resturile prolil,
prin geometria lor particulars, impiedicS rSsucirea elicoidalS a lanjmilor
polipeptidice. La nivelul unui rest Pro, lanjul se indoaie cu un unghi de 130.
Resturile glicil, lipsite de catena laterals, confers lanjurilor polipeptidice
flexibilitate i adesea la nivelul resturilor Gly structura secundarS a este
imreruptS, ianful schimbandu- i uor direejia.
Resturile de valinS, izoleucinS, treoninS, prin radicaiii voluminoi de la Cp
determinS o stanjenire stericS daca aceste R ajung adiacente in elice. Serina,
prin capacitatea de a forma punji de hidrogen prin gruparea alcoolicS
desiabilizeazfi elicea.
Resturile de cisteinS cfmd formeazS punji disulfurice leagS covalent, rigid,
porjiuni ale lanjului polipeptidic i in vecinStatea acestor regiuni rSsucirea
elicoidalS nu mai poate avea loc.
Structura secundarS a se intalnet:e in diverse proporjii atat la proteine
fibrilare cat i la proteine globulare. O proteins fibrilarS cu slructurS
secundarS a in proporjie de aproape 100% este keratina, proteins abundentS
in par, piele, unghii. Este alcStuitS din lanjuri polipeptidice lungi, cu slructurS
de a-elice, asociate cate douS i- superincolScite. Prin asocierea acestor
dimeri se realizeazS fibrile i fibre rezistente. In aceste fibrile, grupSrile R pot
inieracjiona prin valenje secondare in cele mai bune condijiuni. In plus,
structura superelicoidalS este stabilizatS i prin punji disulfurice
intercatenare, keratina avand un conjinut ridicat in cisteinS.
Mioglobina i hemoglobina au un procent mare (70%) de slructurS
secundarS a. In aceste cazuri, segmentele de a-elice sunt scurte, ele sunt
intrerupte de porjiuni
38
neelicoidale. La nivelul acestora din urma, lanjul polipeptidic ii schimbSL
direcjia sub diverse unghiuri, permijand realizarea unei structuri compacle.
Un ait motiv structural intalnit ia proteins cu un procent mare de structure
secundard a const# in asocierea paralel# a unui numflx de segments de aelice. Acest motiv structural putandu~se repeta de mai multe ori in cuprinsul
molecule! proteice.
Stmctura p. O alt# structure secundar# a lanfurilor polipeptidice in care
se realizeaz# potenfialul maxim de legare prin punji de hidrogen a grupdrilor
^:C = O i ^:NH este structura (J sau structurain foaie plisat#. In acest caz
punjiie de hidrogen sunt intercatenare, lanjurile polipeptidice se aeaz# in
foi. Cea mai stabil# interac{iune se obfine dac# lanfurile evolueaz# unul de
la capdtui N-terminal spre cel C-terminal i cel#lalt in sens in vers (structura
(3 cu lanjuri antiparalele, Fig. 1.6).
39
DatoritS rigidit^ljii legdturii peptidice i coplanarit&jii grupului
i
i
CH NH CO CH se realizeazS structuri asem&n&toare unei foi
plisate. Radicalii R sunt oriental, alternativ, de o parte i de alta.
Structura secundarS p In foaie plisatS este intalnitS in propor{ie de
aproape 100 % in proteina din m&tase, fibroina. Lanfurile polipeptidice
antiparalele sunt intinse i asociate prin leg&turi de hidrogen, d&nd nagtere
unei foi plisate. Aceste foi se aeaz& in straturi, intre straturi se stabilesc
numeroase legSturi intre grup&rile R, care proemineazS de o parte i de alta
a fiec&rei foi. DatorM unei structuri primare speciale, cu multe resturi Gly i
Ala alternante, distanjele dintre foi sunt mici (3,5 A i 5,7 A alternativ).
AceastS structura confers fibroinei rezistenjS la intindere i flexibilitate.
Structurile p sunt motive structurale intalnite frecvent in proteine
globulare. Cel mai simple element, de structure P const# dintr-un
lan{ poiipeptidic indoit asupra iui insugicare realizeaz# douS segmente
antiparalele, denumit p-turn:
II I
o
H
II / N | o R H H
De asemenea, mai multe catene polipeptidice, de regulS 6 dar i mai
multe, pot adopta structure p cu foi plisate. Domeniile structurale ale
imunoglobulinelor i ale proteinelor din aceeagi superfamilie cuprind un
I
CO
I
a!anil
H,C
CH
NH
I
CH
I
CO
I
valil
Resturile cisteinil din multe proteine formeazd legftturi disulfurice care
IeagS covalent regiuni mai depdrtate ale lanjurilor polipeptidice. Pozijiile
acestor legSturi depind i de totalitatea factorilor care asigurft conformafia
nativii a proteinei. Ribonucleaza (104 resturi
aminoacidice) cuprinde patru punji disulfurice intre resturile Cys2&~Cys84,
Cys40-Cys95, Cys5B-Cysno i Cys65-Cys72. Din multitudinea de combinajli posibile,
intre cele 8 resturi cisteinil, in proteina native se realizeazit una singurii
(Fig.1.3).
41
Un lan| polipeptidic adopt#, in m&sura in care ti permite structura sa
primal'#, configurajii de a-elice i de structur# P i prin pliere, impachetarea
lanjului caut# s# satisfac# i afinitaple radicalilor R. Rezultanta tuturor
acestor interacpuni determin# conformapa moleculei proteice. Aceast#
conformape este de fapt un cornpromis nu se pot realiza toate legSturile
de hidrogen posibile, nu toate porpunile nepolare ajung s# fie inconjurate de
un mediu pur hidrofob, nu orice grupare () ajunge ia vecin#tatea uneia
(+) dar este compromisui cel mai favorabil din punct de vedere energetic,
cel mai stabil. Factorul ultim care detenu in# conformapa unei proteine este
structura sa primarS. Informapa genetic# tradus# in secvenje de aminoacizi,
prin jocul forjelor fizico-chimice, se transform# spontan in edificii
tridimensionale specifice.
Prima protein# a c#rei structui# tridimensional# a fost stabilit# in cele
mai mici detalii, precizandu~se pozipa in spapu a tuturor atomilor
componenp este mioglobina (Kendrew i colab., 1957). fMioglobinaJeste
oprotein# abundent#in mugchi, in special la mamiferele
cufund#toare (balen#, cagalot) avand rolul de rezervor tisular de oxigen.
Este o protein# cuprinznd aproximativ 150 aminoacizi (mioglobina din
muyhiul de caalot 153) i o grupare neproteic# denumit# hem. In Fig. 1,7.
se arat# schematic conformapa moleculei de mioglobin#.
1.3.3.
PROPRIETATI GENERALE ALE PRGTEINELOR
Solubilitatea. Proteineie fibrilare sunt insolubile in ap&, pe c&nd cele
globulare prezinttl grade diferite de soiubiiitate. AceastS. inspire este
datoratd repartizMi pe suprafaja moleculelor de resturi aminoacidice cu
sarcini electrice i a acelora care cuprind grupSri polare.
Solubilitatea in apS a proteinelor este puternic influenJatS. de pH-ul
mediului prin modificarea inc&rcSrii electrice a proteinei. De asemenea,
diverse s&ruri ale metalelor uoare NaCl, MgCl2, Na2S04, (NH4)2S04
influenjeaz& considerabil solubilitatea proteinelor. La concentrafii mici ele au
un efect favorabil. De exemplu, proteineie din clasa globulinelor sunt greu
soiubile in apd purS, ele se dizolv& uor numai imsolujii saline diluate. La
concentrafii foarte man, s&rurile amintite scad solubilitatea proteinelor panit
laprecipitarea lor din solujii (salifiere). Albuminele i globulinele se deosebesc
dupd uurinfa cu care sunt precipitate de cdtre sulfatul de amoniu.
Globulinele precipitS cand soiufiile care le cuprind sunt aproximativ semi
saturate in (NH4)2S04, pe cand albuminele precipita la concentrafii mai mari
de 75% saturate. Precipitarea fracJionat& a proteinelor din solujie prin
adSugarea treptatd de (NH4)2S04 este o metodd cu largi utilizSri pentru
separarea proteinelor din medii biologice complexe.
Proprietaiile electrochimice. Proteineie sunt amfoliji macromoleculari,
cuprind un num&r mai mare sau mai mic de grupSri acide gi bazice.
Contribufia cea mai important# o au resturile glutamil, aspartil, lizil, arginil i
histidil. Resturile aminoacidice C-terminal i N-terminal au o contribute
redus&, cu atat mai redus# cu cSt lanful polipeptidic este mai lung. La pH-ul
fiziologic toate aceste funcjii acide sau bazice sunt ionizate complet (restul
histidil este ionizat aproximativ 50%), proteina apare ca un poliamfolit.
47
ProprietStile electrochimice ale protdnelor sunt concretizate prin pH-ul
izoelectric (pi), pH-ul solufiei in care proteina apare cu o sarcinS electric#
nulS, numSrul grup&rilor (+) este egal cu acela al grupSrilor ().
Valoarea pi a unei proteine depinde de compozifia sa arninoacidicS, de
predominenja res- turilor acide, a acelora bazice. 0 proteins cu pi > 7
cuprinde un exces de lizinS i/sau argininS; o proteinS cu pi < 7 cuprinde o
proporfie mare de aminoacizi dicarboxilici (Tabelul 1.8),
La pH-ul izoelectric solubilitatea, mobilitatea proteinei in campuri elec
trice este minimS. La pH-uri depSrtate de pi o proteins are o incSrcSturS nets
+ H*
^------------ P
COOH
NH8*
+ HO"
------------- P
- H20
GOO"
NH2
GOO"
proteina la
proteina la
proteina la
pH < pi
pH = pi
pH > pi
Sub forms de anioni sau cationi, proteinele migreazS in campuri electrics,
proprietate care stS la baza metodelor elect roforetice de separare a
proteinelor din amestecuri.
Tabelul 1.8.
pH-urile izoelectrice (p!) ale unor proteine
Proteina
pi
Sal mini
12,10
Histona
10,80
Serumafbumina 4,90
Miozina
5,20
Fibrinogen
5,50
Tireoglobulina
4,58
Lizozlm
11,00
MioglobinS
6,99
Hemoglobin^
7,07
Citocrom c
9,80
Insulina
5,35
PepsinS
- 1,00
Denaturarea proteinelor. Conformajiile native ale proteinelor globulare,
rezultate prin impachetarea specifics a lanjurilor polipeptidice i asocierea
subunitSjilor in proteinele oligomere sunt extrem de fragile, ele sunt uor
perturbate sub ac{iunea unei multitudini de agenji care afecteazS
interacjiunile necovalente din cuprinsul moleculei, Modificarea conformafiei
native a unei proteine poartS denumirea de denaturare i agenfii care o
provoacS sunt agenji denaturanji. Slructurile de ordin superior ale unei
proteine secundarS, terJiarS, cuaternarS sunt asigurate de legSturi
necovalente de energie joasS i agenjii denaturanji pun in joc forje de
intensitate micS care nu afecteazS legSturile
48
covaiente. In cursul denaturSrii unei proteine nu sunt rupte iegdturile
peptidice, nu se elibereaz! aminoacizi.
Denaturarea proteinelor este provocate de agenji foarte diferiji:
- temperatura de 50-60 denaiureaz! cele mai multe proteine globulare;
pujine proteine, de ex, ribonucleaza, suport! pentru scurt limp temperaturi
Ceruloplasmi 20-50
4,4
4,5 z
160
ns
Fracjiunea p:
Transferina
200-350 77
5,7
7z
Apolipoprotei
60-155
3000
na B
C4
10-40
206
7
Fibrinogen
200-400 340
5,5 .
2,5 z
C3
70-150
180
.
,
p2Mtcroglobulin 0,1-0,2
11,8
a
Fracjiunea y ; 525IgG
1650
160
6-7,3
24 z
IgA
40-390
170
6z
IgM
25-310
900
5z
Proteina
0,8
120
6,2
reactiva C
Serumalbumina. Este cea mai abundentS proteins plasmaticS (3,5 5,5
g/dl) reprezentand jumState din proteinemia totals. 0 cantitate aproximativ
egalS cu cea din plasmS se aflS in spajiile extracelulare.
Serumalbumina are masa molecularS de 69 kD i este alcStuitS dintr-un
lan{ polipeptidic cu 585 resturi aminoacidice. Este o proteins
multidomenialS. Forma generals a moleculei este elipsoidalS. Are pi ~ 5, la
pH = 7,4, poartS un numSr mare de sarcini negative. Este sintetizatS in ficat
(12 g/zi) i in plasmS, are un timp de injumStSjire de 15-19 zile.
52
Prin concentrajia sa moleculard mare, serumalbumina este componentul
care r&spunde cle 75-80% din presiunea osmoticd a plasmei, avand rolul de
a menfine apa in compartimentul intravascular.
Serumalbumina are proprietatea de a lega, mai mult sau mai pufin
specific, divergi component piasmatici, indepiinind funcjia de transporter al
acestora. Serumalbumina leagd compugi hidrofobi, insoiubili in apd, ca
bilirubina, acizi gragi liberi, vitamine liposolubile. Serumalbumina este
transporter plasmatic pentru unii hormoni steroizi, pentru hormoni tiroidieni.
Serumalbumina leagd cationi, Ca2+, Cu2+. De asemenea, serumalbumina este
un vehicul pentru multe medicamente: aspirina, sulfonamide, peniciiind etc.
Imunoglobulinele-. Imunoglobulinele (anticorpii) sunt proteine cu roiuri de
apdrare impotriva microorganismelor bacterii, virusuri, parazi|i care
invadeazd organisrpul. Sunt proteine solubile, se afld major! tar in plasm & gi
reprezintd elementele de recunoag- tere ale sistemului imun umoral.
Imunoglobulinele sunt sintetizate ca un rdspuns specific la pdtrunderea in
organism a unui microorganism sau a unui compus macromolecular
(protein^, polizaharid) strain (nonself). Agenjii strain! capabili sd dedangeze
sinteza de anticorpi sunt denumifi antigene (imunogeni). Un anticorp se
combind cu antigenul specific form and un complex antigen-anticorp
(complex imun) care blocheazd antigenul gi totodatd ini{iazdprocese care
distrug agentul patogen, fagocitoza, activarea complemen- tului (rdspuns
imun).
Factorii coagularii
Facto Denumire
r
uzuala
I
Fibrinogen
la
Fibrina
Protrombin
ii
a
II.
Trombina
in
IV
V
Va
VII
VII.
vm
Factorul
tisular,
trombomod
ulina.
Ca2*
Proacceleri
na
Prooonverti
na
Factor
antihemofili
c
VIII.
IX
IX.
X
Factor
Christmas
Factor
Xa
XI
XI.
XIII.
Activat de trombina.
Cofactor la activareaa H de catre Xa.
Activat de lla + Ca2+.
Impreuna cu Hi activeaza X la Xa.
Activat de lla.
Cofactor af activarii X de catre IXa.
StuartPrower
XII
XII.
XIII
FUNCJIE
Factor
Hageman
Factor
stabilizator
al fibrinei
58
Protrombina, factorii VII, IX i X sunt proteine care cuprind in
segmentele ,N~ terminate resturi de acid Y-carboxiglutamic (Gla). Aceste
resturi aminoacidice se formeaz intr-un proces post-traducjional la care
participS ca intermediar, vitamina K:
COO
OOC
COO
CH2
?CH2
co2
-----Vit. K
CH
i
CH2
HN CH CO
HN CH CO
rest Glu
rest Gla
Proteinele cu resturi Gla au o mare capacitate de a lega ionii Ca2+.
Inifierea procesului de coaguiare este urmat& de activarea in cascade a
factorilor de coagulare, semnalul initial fiind puternic amplificat. Exists dou&
c&i de inifiere a acestei cascade, calea intrinseca (aparent cu participare de
factori exclusiv sanguini) i calea extrinsec#, la care particip& i factori de
engine tisulara. Ambele c&i conduc la activarea protrombinei in trombinS,
aceasta din urma transform^ fibrinogenul in fibrina. Agregatele de trombinS
sub aejiunea factorului XIIIa (activat de trombinS) sunt legate incruciat i
devin insolubile (Fig.1.15).
Calea mtrmseca Calea extrinseca
Fibrinogen
(solubifa)
Xf
Ha
2+
Ca
T
XIil a
Fibrins
(insolubila)
Fig. 1.15 Etapa finals a coagularii sangelui
59
in cele ce urrneazS sunt descrise unele aspecte biochimice, moleculare,
ale coagulSrii, Fibrinogenul are un rol central in coagulare. Este o proteins
plasmaticS cu rriasa molecularS de 340 kD. Concentrajia sa plasmaticS este
de 200-400 mg/dl (2-3% din proteinemia totals). Este un hexamer alcStuit
din trei tipuri de lan$uri: Aa (610 aminoacizi), Bp (461 aminoacizi) i y (411
aminoacizi).
Formula sa molecular! este (Aa BP y)2. Molecula este alungilS (460 A),
prezentand trei zone globulare, douS periferice i una centrals (Fig.1.16).
Lanjnrile Bp i y cuprind oligozaliaii.de legate N-glicozidic. Fibrinogenul
cuprinde multe (17) pun{i disulfurice.
Segmentele N-terminale A i B din lanjurile Aa i Bp, fibrinopeptide,
cuprind multe resturi Glu i Asp, segmentul B mai cuprinde i resturi de
tirozinS sulfatatS:
I
NH
CH
CO
230 A
Ftbr/ncr
Fig. 1.16 Schema structural! a fibrinogenului i a fibrinei.
A i. B: fibrinopeptidele A i B; a \ b: situsurile de interacjiune dintre
moleculele de fibrin!60
1.3,6.
HEMOPROTEINELE
Acest grup de proleine conjugate cuprinde mioglobina i hernoglobina,
transportori de oxigen, citocromii, transportori de electroni, membri ai
lanjului respirator mitocondrial i ai aceluia situat in reticulul endoplasmic
hepatic, diverse oxidaze i peroxidaze.
Gruparea prosteticd a acestor proleine este hemul. Yarietatea
hemoproteinelor rezuM prin uncle diferenfe In structura hemului sau pentru
aceiai grupare hem pot rezulta enfMji distinct in raport cu natura
apoproteinei i a modului de asociere cu hemul.
Hernoglobina (Hb) i mioglobina (Mb) cuprind aceeai grupare hem,
alcatuitii din protoporfirind i Fe2*. Porfirinele sunt compui cu o structure
macrociclicS, tetrapirolicd. In procesul de biosintezS a hemului apar ca
intermediaii naturali uroporfirina, coproporfi- rina i protoporfirina. Piecare
din aceste porfirine derivd dintr-un precursor porfirinogenic. Nucleele
fundamentale macrociclice ale porfirinogenilor i ale porfirinelor sunt:
porfinogenul i porfina.
N
X N/
>N/
H
H
=
\
/= Xz \=
H
/Nv
Z
y
H
/Ns
./W\.
Z
X
Porlinogen
Poriina
Porfirinogenii i porfirinele poart& in pozijiile 1-8 urm&torii substituenfi:
uroporfirinogenui i uroporfirina:
1,3,5, 8
-grupari CH2COOH
2, 4, 6, 7
o=o
/Y/s d/sfd/
-CH,
r!
i\
i!
n;a!
-CH,CH7SCH?
COOFig. 1.17 Hemui citocromului c
Citocromii mitocoridriali (a, a3, b, c, Cj) acjioneazS secvenjial, electronii
prin intermediul unui domeniu de aproximativ 75 kD situat in jumStatea Cterrninal! a ianjurilor A i B. Situsul de legare specific cuprinde secvenja Arg
Gly Asp Ser (RGDS). Peptide niici de sihlez! care cuprind acesl
segment sunt aple s! adere pe suprafaja celulelor.
Reeeptorul celular pentru fibronectina, care recunoagte secvenja RODS, a
fost identificat in toate tipurile de celule. Acest receptor face parte dintr-o
familie de receptor! care recunosc i interac(ioneaz! cu diverse proteine
adezive, familia integrinelor. Integrina specific! pentru fibronectin! este o
glicoprotein!, un heterodimer a (1
Integrina din plachete (glicoproteina IIb IIIa) este distinct! de cea a alter
celule. Integrina plachetelor, pe king! fibronectin!, interaefioneaz! i cu
fibrinogen, fibrin!, cu factorul von Willebrand.
Fibronectina plasmatic! are un rol deosebit In form area cheagului, prin
legare de fibrin!, fibronectina este incorporat! in cheag, Prin
multifuncfionalitatea sa fibronectina asigur! ancorarea cheagului ia celule i
pe mairicea structural! a perefilor vaselor.
66
Cap. IL ENZIMELE
ILL IMTRODUCERE
Numftrul reacpilor cunosciite care au loc in organismele vii este de ordinul
niiilor; cu rare exeeppi, acestc reacpi sunt catalizate.
in anui 1877 .cgMizMoriJor recpilor din organismde vii ,U s-a atribuil
numele de ^enzirne^4 (in drojdie); aceast! denumire, ahlturi de aceea de
.,biocatalizatori, se utilizeaza. i in prezent. Denumirca mai veche a, fost
aceea de JfermenlR (legate i ea de procesele fermentative); pentru enzime
individuate s-au utilizat denumiri specifice, ca
de exemplo, diastazav' (In prezent. a - amilaza),
Locul de, acpune al eelor mai multe enzime este in imeriorul cehilelor;
uncle acponeaza ins! i in afara acestora (de exemplu, o serie de enzime din
plasma sanguinfl intre care si ceie care asiguni coagularea)...Toate enzimeie
specifice unui tip de celule sunt sintetizate chiar de acele celule; enzimeie
care acponeaz! in afara ceiulelor sunt sint.cUz.ate dear de anumile tipuri de
celule .(hepatice, rennie etc.)*
Enzimeie au toate insujirile catalizatorilor utilizap In reaepile chi mice din.
lumea nevie, Ele sunt ins! superioare acestor.catalizatori in mai multe
privinje:
a) Asiguril reacpilor chimice pe care le catalizeaz! viteze cu cateva ordine
de m2 rime in plus;
h) Reac|i.ile pe care le cafaiixeazfi au loc in condipi biande: iemperatur!
sub 50C, presiune atmosfericL pH in jurul lui 7; exist.;!, evident, i unele
exeeppi, Comparativ, eatalizatorii chimici acponeaz! la temperaturi ridicate,
presiuni mari i vaiori. extreme de pH;
c) Au specificitave foaue mare ceea ce asigura ca in reaepile pe care le
catalizcazS s! mi se formeze produi secundari.
Multe enzime au insuiri neintainite la.' catalizatori chimici. Foarie
importanie sunt;
a) Capaeitaiea de regime a producer!! lor in celule i/sa.u de reglare a
activitπ
b) Fosibilitatea caializftrii unor reaepi endergonice prin cuplarea acestora
68
In laborator sau industrie, energia de aciivare necesara reacflilor este
furnizatd sub formd de cdldurd. Imposibilitatca ca reacjiile chimice din
organismele vii sd fie influenfate de cdldurd este compensatd de cStre
enzime, care, asemdnator tuturor catalizatorilor, scad energia de activare.
Cu cat un catalizator scade mai mult energia de activare a reac^iei pe care o
catalizeazd cu atat ei este mai eficace adicd asigurd o vitezd mai mare acelei
reacfii.
Enzimele scad foarte mult energia de activare in raport cu catalizatorii
chimici. Reacfia de descompunere a apei oxigenate poate servi ca exemplu
in acest sens:
2H2Q2
-----2H20 -f 02
in absenja catalizatorilor energia de activare are valoarea de 18 Kcal/moi;
ea este de 11,7 Kcal/mol in prezenja catalizatoruiui de platind coloidald i de
numai 2 Kcal/mol in prezenja-catalazei, enzima cu specificitate absolute
pentru aceastd reacjie (Fig. ILL). Aa se explicit capacilatea cataliticd
deosebit de mare a catalazei: o singurd moleculd din aceastd enzimd
descompune 5 x 106 molecule de apd oxigenatd intr-un minut, in condijii
optime. Existd i enzime care asigurd viteze de reacfie de ordinul 10 10 - 1012
in raport cu reacfiile corespunzdtoare necatalizate.
Scdderea de cdtre cataiizatori a energiei de activare este consecinfa
cursului diferit pe care acedia il imprimd reacfiei. Se tie cd orice reacfie
catalizatd decurge i in absenja catalizatorului' dar cu vitezd foarte micd. In
acest caz substratul (S) se transforms. direct in produs de reacfie (P).
Desfc?Si/r&red redcfre/'
Fig. ILL Energia de activare pentru descompunerea apei oxigenate: a) fara
catalizator; b) in prezenfa Pt coloidaie; c) in prezenja cataizei.
69
Cfmd este prezenl catalizatorul, In cazul reacjiiior din lumea vie enziina
(E), nitre aceasta i substrat se formeazd un complex ES din care apoi
rezultd'P se reface E:
E+S
ES-----E + P
In conformitale eu cele afirmate mai Inainte, energia tie activare pentru
transform area lui S din ES in P este mult mai micd decal la transform area
directs a lui S in P.
In Fig. II. i. este reprezentat i faptul cd intr-o reaejie exergonicd
deelangata prim fumszarea energiei cle activare, se elibereazd o cantilate de
energie case este suma energiei tie activare + variajia energiei iibere
specifice (diferenja intre energia niedie a reacianjilor i a producer),
substrat;
- de grup, dacS enzima catalizeazS acelai lip de reaefie la douS sau la un
numSr restrains de substrate;
- specificitate largS, dacS enzima catalizeazS acelai tip de reaefie la un
numSr foarte mare de substrate.
DoaS dinire enzimele cu specificitate absolute sunt anhidraza carbonic^ i
ureaza:
anhidraza carbonica
CO, 4- H20
HaCOs
y
H2N - CO - NH2 + H20----------------2NH3 + co2
Alcooldehidrogeneza este un exemplu de enzima cu specificitate de grup;
ea catalizeazS transform area prin dehidrogenare a aicoolilor monohidroxilici
inferiori (i chiar a unor alcooli dihidroxilici) in aldehidele corespunzStoare:
alcoofdehidroq aneza
R - CH2 - OH + NAD+ --------------^ R - OHO + NADH + H*
Substratul preferat pentru alcool - DH este alcoolul etilic, acfiunea
cataliticS fiind mult; mai redusS in cazul alcoolului metiJic, propilic,
etilenglicolului etc.
In reaefia de mai sus NAD* i NADH + H+ sunt formele oxidata, respectiv
redusd, ale coenzimei alcooldehidrogenezei (despre coenzime vezi in
coniinuarea acestui capitol gi in capitolul Vitamine i coenzime).
71
Spec if i c i ta tea largfi este intalnit! la mai multe enzime, dar cel mai
frecvent la hidrolaze. Intre ncestea sunt si proteazele digestive; pepsina,
tripsina. i chimotripsina. Specificitatea largS a fiecSreia dintre ele const;! In
capacitatea de a cataliza scindarea hidroliticS a oric^rei proteine din
alimente. Dar acfiunea hidrolitic! a fiecireia In parte chiar ac(iunea simultan!
a lor nu asigurS hidroliza totals (pdn5 la aminoacizii component!) a vreuneia
dintre proteinele din alimente.
FaptuI se explic! prin existenja unei specificit&{.i de legatunT care const!
in aceea c! fiecare dintre cele trei enzime asigur! hidroliza in oricare protein!
numai a anumitor legdturi peptidice. Asti'el chimotripsina eatalizeaz!
hidroliza legdturilor peptidice a cdror grupare CO provine de la aminoacizii
Phe, Tyr, Trp, in timp ce tripsina asigurS hidroliza legdturilor peptidice a cdror
grupare CO derivd de la aminoacizii bazici (lizina, arginina); la fel de specific
acjioneaz! i pepsina:
R
|
NH
CH"
CH2 NH2
(CH2)3 i
i
-CO NHCH
CO-j-NHHO H
i
i
legatura scindata
in prezenja tripsinei
R
C
H
-
CH2
R
|
i
-CONHCH
CO-l-NH- 1
HO H
-CH
CO
iegatura scindat& In
prezenja chimotripsinei
74
11.4.3. ENZIME CU STRUCTURA HETEROPROTEICA
Cele mai muite enzime au structure heteroproteicd; ele sunt alc&luite din
apoenzi~ miC (component# proteicd) i cofactorfct (components
neproteica). Fiind molecule organice, cationi i anioni (mai rar) ai
elementelor, stabilitatea cofactorilor la acfiunea lempleraturii este mai mare
decat. a apoenzimelor.
De regulS, o enzimd are un singur cofactor; exists lotugi i enzime cu doi
cofactori, clifeiiji structural i funcJionaL
In privinfa terminologiei cofactorilor s-au blent recent urmdloarele
recomandSri (ele urmdresc s& elimine cpnfuziile, destul de freevente):
- termenul cofactor se.va utiliza penlru total!tatea compui!or neproteici
din structura heteroenzimelor;
- termenul coenzim3 se va utiliza numai penlru componenteie
neproteice de naturd organic^ care se leagd prin legdturi foarte slabe de
apoenzime (legdturi de hidrogen, ionice, hidrofobe etc.);
- termenul ,,grupare prosletlcd^'se va utiliza lot penlru cofactori de
naturS organic# dai* care se leaga de apoenzime prin legdturi putemice,
inclusiv covalente.
Numarul cofactorilor cimoseufi este foarte mic in comparajie cu numSrul
enzimelor cu structura heteroproleic#. "Faptul se explicit prin aceea c# un
anumit cofactor este capabil s# se asocieze cu diferite. apoenzime rezul&nd
astfel mai multe heteroenzime.- Mai ales o parte dimre eoenzime i ioni au
aceast# capacitate. Exist#, de exernplu, cateva sute de enzime cu rol de
hidrogenaze-dehidrogenaze a edror coenzim# este nicotinandd-adenindinudeotidul, notat NAD* (in forma oxidat#). Ele pot acjiona simullan -inlr-un
eompartiment celular dal care are o -canlitate limitat# de NADA ca urmare a
faptului c# NAD+'trece cu ujurinj# de pe o apoenzim# pe alia in funefie de
reaejia:
CH C COOH 4- MADH + H+
CH3 CH GOOH + NAD*
II
I
O
OH
In sensul de la stanga la dreapta aceastS reaejie incheie glieollza in
condifii anaerobe (vezi s,Glicoliza in capitolul Metaholismui glucidelor% De
aceea izoenzimele LDH cu capacitate ridicabl de Ira as form are a piruvatului
in lactat sunt necesare, d.e exempli? in mugchi (care in eforl catabolizcaz#
glucoza anaerob). Aceste izoenzime sunt M.4 i MIL Mugchii si.n?.ctizeaza
deci mai intens lanjurile M decaf: cele Hi Inima, Jesul cu catabolism aerob al
glucozci, sintetizeaz# intens lanj.ul H, izoenzimele H4 i H3M avand o
capacitate foarte redus# de transformare a piruvatului in lactat.
Creatinfosibkinaza sau creatinkinaza (notalft CPK sau CK) are trei
izoenzime. Lanjurile de baxfi care se asocia/A in accst caz sunt M (tot de la
muscle) i B (de la bruin=creier); lieearc izoenzim# este un dimer, respectiv
M.2, MB ji B2. i aceste izoenzime se afl# in ser i pot ft separate prin
eiectroforez#. .
In jesuturi, izoenzimele Tndeplincsc importance roiuri reglaiorii fiind sigur
implicate gi in morfogenez# i di.ferenji.erea eelular#.
117 CENTRUL ACTIV 1 MECANJSMUL DE ACpUNE AL ENZIMELOR
S-a arista! la inceputul acestui capitol end in orice reaejie ealalizatd
enzimatic form area intermediary a complexului enzimd-substrat este
obligatorie:
E+S
ES-----v E H- P
In prezent, exist# numeroase dovezi experi.nicnta.le, direefe sau
indirecte, privitoare la fonnarea complexului ES. Infr-un num#r redus de
cazuri enzima este legate de sabstrat prin legaturi putemice (covalente);
aslfel de complexe ES stabile au fost izolate i analizate prin difraejia razelor
X i alfe metixle. Complexele in care leg#turile dintre E i S sunt slabe s~au
studiat pe c#i indirecte: satunlnd enzima cu substratul s-au objinut modified
in spectrul de absorhfie, solubililate, stahiiifate termic# etc, Mai non,
formarea complexeior ES este studiat#
78
prin metoda marcajului chimic; ea consul in tratarea enzimelor izolafe cu
coinpui chimici care reactionenzft in mod specific cu anumite grupftri
(aparfinand unor resturi aminoacide) la care se aiageazft prin legftluri
puienii.ee (care nu se scindeazft la hidroliza enzimei). Baal enzima marcatft
nu mai fixeazft S inseamnft eft aminoacidul la care s-a a(aat compusul
chimic este implicat In formarea cornplexului ES. Acest aminoacid poate fi
recunoscut dadl se hidrolizeazft enzima* in hidroiizai apMnd i compexul
aminoacid - compusul chimic, .
O ohservajie important in legftturft cu form area cornplexului enzimft
substrat este eft la anumite enzime indepftrtarea prin proteolizft a unor
porfiuni din macrornoleculele lor nu afecteazft (sau afecteazft in mieft
mftsurft) acti vita tea.
Aceste date experimental corelate cu aceea eft, de regulft, substratul este
foarte mic in ra~ port cu enzima, au permis formularea concluziei eft numai
o zonft resfransft din enzimft. par- ticipft la fixarea i -transformarea chimicft
a lui S; aceastft zona se numete centrul aclhd al enzimei. Tot din studii
m
.0
enzimS substrat enzimS - substrat
Fig. 11.5. Modelul I(centru! activ Indus** de interact!e enzima-substrat
^C-Asp
(sF)
~o \JL
OP'
G/
u
^
3 '"o' ae
5
A
s
p
- ->
G/
u35
100
Fig. if.11. Variajia activitatii enzirnelor tn funeji de temperatura.
~20 ~40 SO t*C
85
88
0
Fig, 11,14. Variajia vitezei reaejiei enzimatice in funcjle de concentrajia
substratuiui.
Deoareee viteza reacjJei caializaul cnzimatic se expand prin canritatea cle
P formal inlr-u imitate de limp, iar [P] este proporjionald cu [ES], sc poate
scric
vo - K3 [ES).
(2)
Cantilatea de ES disponibilil pentru transform are a in E $i P este insa
dependent;!, pe de o parte, de viteza cu care sc orrneax;1, iar, pe de alia
parte, de viteza de disociere in E i S; aceste viteze sunt redate prin:
-
- viteza de formare a lui ES = K, [E]*[S]
(3)
node [El reprezintS concenlrajia enzimci libere (ciisponibila in momenn.il da.t
pentm
form area ES);
<CJLKn&x
T
'"'Fanta z-;
A:
M
max
Fig. 11.15. Reprezentarea grafica a ecuatiei Ltneweaver-Burk.
IL8,8. INHIBIJIA ACTTVITAJII ENZIMELOR
Activilatea multor enzime este inhihat# de compugi chimici divergi; In
sistemele vii asemenea compugi pot fi de origine endogen# (de exemplu
diferiji metaboliji) sau de origine exogen# (cum sunt agenjii toxici sau unele
medicamente).
Inhibifia enzimelor poate fi reversibil# i ireversibi.13, aceasta din urm#
numindu~se i inactivare. In ambele cazuri inhibitorul se leaga de enzirml,
dar in timp ce in inhibijia ireversibil# leg&tura enzim#~inhibitor este
putemicft (covalent#), in inhibijia reversibil# legStura este siabft.
92
Un exemplu de inhibijie ireversibite este oferit de acfiunea iodacetarnidei
asupra enzimelor care au in central activ o grupare - 5H; are ioc reacjia:
Enz CH2 SH+
CH2 -- COMH2 Enz CH2 S CH2 CONHa
+ HI
Complexul Enz CH2 S GH2 CONH2 este complet inactiv (nu poate
fixa substratul).
Tot grupSrile SH din centrele active pot fi blocate i cu acidtii
paraclormercuribenzoic in timp ce grupSrile hidroxil din centrele active (cum
este cazul tripsinei) sunt blocate de inhibitorul di-izopropilfluorofosfat
Se cunosc douS variance majore d:e inhibipe- reversibilil;
a) Inhibifia competitive, prod usd de irihibitori care se leag& tot la nivelul
centrului activ al enzimei, dar prin legdturi slabe. in cazul prezenfei
simultane in medio (sau In celule) a substratului i inhibitorului, intre acedia
are loc o compefijie pentru fixarea pe enzirrte. La o capacitate egate de
legate la nivelul centrului activ a substratului i inhibitorului, enzima va fixa
acegti competitors. in raport cu concentrapile lor. Inhibitorii competitivi 'sunt
compugi cu structure apropiate de cea a substratului. Evenimentele care au
loc pot fi reprezentate simplificat:
In acest tip de inhibipe, partea din enzima aflatd sub forma complexului El
poate fi recuperate daat in mediu apare un execs de substrat (datorite
reversibilit&fii E + I ** El).
Precizarea cd un anumit compos este inhibitor competitiv pentru o
enzim# data se face in mod simplu; se traseazS dreapta l/v0 in funefie de 1/
[S] pentru prezenjain mediu a lui E i S i apoi aceeai dreapte pentru
prezenja in. media a E, S i I. In ultimul caz se remared o pante crescute a
dreptei, interseejia cu ordonata nefiind modificate. Valorile interseejiei
prelungirii dreptei cu abscisa. i panta. dreptei sunt modificate cu
coeficientul 1 + [Ij/Kj, unde are semnificafie asemdnhtoare lui KM dar pentru
icacfia lui E cu I (Fig, 11.16).
Fig, !L16. Reprezentarea grafic^ a ecuatiei Lineweaver-Burk Tn cazul
inhibijiei competitive.
93
Printre numeroasele inhibijii competitive cunoscute sunt i urmStoarele:
Succinat dehidrogenaza, enzima ce catalizeaz# transformarea acidului
succinic in ac-id
fumaric, este inhibat# de acizii dicarboxilici malonic, malic i chiar oxalic.
COOH
.1
CH2
1
CH2
COOH
1
CH2
1
COOH
COOH
1
CH OH
i
COOH
1
COOH
GH2
COOH
COOH
acid
oxaiic
Un num&r de medicamente larg utilizate ii datoreaz# efectele faptului
c# sunt inhibitor! competitive De exemplu, sulfaniiamida, cea mai simple
sulfamidL este asem&n&toare structural cu acidul paraaminobenzoic pe care
il poate inlocui in cursul sintezei acidului folic de cfttre bacterii (vezi vitamine
i coenzime); cum acidul folic este indispensabil bacteriilor, acestea mor (la
om nu se intampl# acest lucru deoarece el ia din hran# acidul folic).
acid succinic
acid malonic
H2N
COOH
H2N
acid mafic
SO2MH2
Aacid para-aminobenzoic
Suifanilamida
In chimioterapia cancerului se utilizeazl analogi structurali ai bazelor
purinice 1 pirimidinice; ei Inhibit sinteza de acizi nucleici impiedicand
diviziunea celular# care este mult mai rapid# la tumori.
b) Inhibijia necompetitiv#; in acest caz inhibitorul, a c#rui structure poate
$& difere destul de mult de structura substratului, se leag# prin legSturi
slabein alt loc decat centrul activ a! enzimei. Afinitatea pentru substrat a
enzimei pare a nu fi modificatL Exist# ins# posibilitatea ca o parte din ES cat
i EI s# formeze complex ESI; transformarea lui S din acest complex in P este
sc&zut# in raport cu transformarea lui S din ES, deci atat v0 .cat i sunt mai
mici. Inhibifia necompetitiv# depinde numai de concentrafia inhibitorului (i
de afinitatea. enzimei pentru el) deoarece substratul in exces nu il poate
deplasa pe acesta.
t
ES
E
ESI
>- El + P (pujin)
El
Dac# se studiaz# cinetica unei asemenea reacjii, reprezentarea l/v 0 in
funcfie de 1/[S] conduce le o dreaptS a cdrei prelungire intersecteaz^
abscisa in acelagi punct cu dreapta objinut# fM inhibitor (deci valoarea KM nu
este modificat#); in schimb, sunt modificate intersecfia cu ordonata \ panta
(Fig. 11.17).
94
Fig. IL17. Ftorazentarea grafted a' ecuajiel Uneweaver- Burk Tn cazuJ
inhibljiel necompatitive.
Exomple sunt unele enzime care confin grupM SH iibere in alte pozijii
decat centrul activ, Aceste grupftri pot fixa prin leghturi slabe ioni ai unor
metale grele cum sunt Ag+ i Hg+ care dirninuft sau chiar anuleazh
capacitatea enzimelor de a transforma substratele in produi. Aa se explicit
efectul otrSvitor til multor metale grele.
119 REGLAREA BIOSINTEZEI 1
ACTWITA11I ENZIMELOR
II.9.L ASPECTS GENERALE
insulin cum sunt capacitatea cataliticS deosebiti, specificiiatea, inhibarea
prin diverji compui etc., se shidiazh in detaliu urm&rind comportarea
0
+ [S]
CHs
CHs
I
L treonfn - a - cetobutirat
CH2
HO-C-H
I
dehidrataza
+ NH3
HCCHs
H-C-NHi
I
COOH L - treonina
COOH L - izoleucina
(->
Fig. 11.19. Inhibarea activitSfii L-txeonin-dehidratazei de cStre L-izoleucina
aflatS in exces.
97
Pi
F2
P"$
+p
c__^ }__
t________________________ _ _ -;______________j
(a)
/
<y
D
'*A )
r-)~
- P7
/
> - P2
(b)
E1 E2
A-5t-+B-==-+ C--------------- ----- P
'A
(c)
(+)
Fi
F9
F-t
FA
A-RL^ e
C-> D-4- E-------> P
v
~ ~ W fV (d)
Fig. il.20, Moduiarea activitajii enzimelor aiosterice:
(a)
inhibi|ie Tntr-o cafe metaboiica lineara;
(b)
inhibifii In cale metaboiica cu ramificajii;
(c)
activare prin substrat; (d) feed-forward stimuiare.
Studiind i alte c&i de biosintezfl, Monod i colaboratorii au fost in m&sura
sS generalizeze c& produsul final, acumulat peste necesit&jile de moment,
devine inhibitor al enzimei care catalizeazd prima sau una din primele reacjii
ale girului celor implicate in biosin teza sa (Fig. II.20.a).
in cazul cfiiior metaboiice cu ramificajii, produgii finali sunt inhibitor! ai
enzimelor care cataiizeazd reacjiile de la nivelul ramificajiilor; deseed, fiecare
dinlre produgii finali inhibit gi activitatea primei enzime (Fig. II.20.b). Monod
gi colaboratorii au denumit acest tip de inhibijie, inhibifie prin produs final,
inhibijie feedback sau retroinhibijie; enzimeie inhibate s-au denumit enzime
aiosterice iar inhibitorii, inhibitor! alosterici sau modulatori (efectori)
negativi.
Au fost idenlificate i enzime aiosterice a c&ror activitate create in
prezenja unor compugi care au fost numiji activatori alosterici sau modulatori
pozitivi. Asemenea modulatori pot fi substratul (care acliveazd prima enzimS)
(Fig. II.20.c), unul dintre intermediari care activeaz& o enzimit aflatS in
continuarea c&ii metaboiice (feed-forward stimuiare) (Fig, II.20.d), diferiji alji
compugi. Al&turi de denumirile deja enumerate se utilizeazd gi aceea de
efectori alosterici in leg&tur& cu totalitatea compugilor cu rol activator sau
inhibitor.
98
Pentru cele mai multe enzime alosterice exists atat modulator! pozitivi cat
i negativi.
Modulatorii intensified sau scad activitatea enzimelor ca urmare a fixdrii
lor pe acestea. Locurile de fixare sunt distincte pentru modulatorii pozitivi i
cei negativi i altele decat centrul activ. De aid denumirile de enzime
alosterice, inhibitor! alosterici (alio = alt loc).
Existd in prezent mai multe argumente, bazate pe cercetdri
experimentale, privind locurile distincte de fixare pe enzime a activatorilor i
inhibitorilor de acest tip. Astfel, s-au realizat desensibilizdri ale unor
enzime alosterice prin aepuni fizice sau chimice: pH-uri extreme, enzime
proteolitice, ureea, temperaturi sedzute sau crescute, unele radiajii; s-au
realizat astfel de models experimentale inc&t sd fie afectate numai locurile
de legare ale modulatorilor nu i centrul activ. In alte experience s-a putut
proteja centra! activ de aejiunea unor agen|;i denaturaji prin intermediul
modulatorilor.
i alte insugiri ale enzimelor alosterice, a reacjiilor catalizate de ele,
precum i a condifiilor in care se desfdgoard aceste reaejii au importance
Starea R
~ substrat
Fig, 11.21. Fixarea substratului i tranzifia T - R in cazul unei enzime
alosterice formata din doi monomeri.
T
S/area f
Starea S
Fig. 11.22. Stabiiizarea starii T a enzimeior alosterice de c&tre inhibitor! i a
starii R de catre activatori.
100
Diferenja esen{iala Inlre modelul secvenfial i modelul simetric const! in
aceea c5 primal abandoneaz! principiul simr.eriei. Legarea subslratului d.e
c&tre on monomer reclaim! i Tn acesl: eaz iranzijia T > R dar nu este
excJus! imeracpa sfiirii R a. acestuia. cu starile- T ale celorlaifi monomeri.
Cooperativilatea se resirange de asl! data la influenja monomerilor T si R
vecini. Legarea subslratului de cLSxe primal monomer se face i in acest caz
cu dificultate daiorit! stSrii T a iuturor monomerilor enziinei. Modific!ndu-i
conformajia prin legarea substratului, acesl monomer va induce modificarea
corespunz&toare doar la monomerul vecin care va fixa substralul cu mai
mult! uurinfa, Chiar dacft numSrul enzimelor cu cooperativitate negative
este foarte rnic (dintre acestea se citeaz! Urozil-ARNt-sintetaza), modelul
secvenfial s-a dovedit a ri mult mai potrivil d.ecat cel simetric in cazul
acestora.
Ulterior eiaborarii celor dou! modele, Eigen a demonstrat c! ele sunt
cazuri particular ale unei scheme mult mai complexe; dependent de
paidicularita|:i 1 e structurilor terfiara i cuuiernaizL uncle enzime alosierice
acfioneaz! dupa modelul simetric, allele dup! cel secvenfial, allele dupfi
modelul generalize (cel propus de Eigen),
Sub aspect cinetic, Kill a stabilil o ecuajie cu vaJabiliUUe atai pentru
enzimele Michaeliene cat i pentru cele alosierice;
log ~~------------------------- nH * iogfS] - iogK
V-v
max o
unde vG, i S au semnificajiile cunoscute, K este constants specific! pentru
interacjiunea enzimS-ligand; nH este coeficicntul Hill, o constants, empirical
care reflect;! atat numarul locusurilor de fixare a iiganzilor cat i intensitatea
interacfiunii acestora.
Reprezenland grafic log v0/Vnhlx - v0 in funcjie de log [S] (Fig. 11.23) se
obfine dreapta 1 (pornind din origine) pentru enzime lipsite dc
cooperativitate, dreapta 2 (intersecjie abscisa) pentru cele cu cooperativitate
pozitiv! i 3 (intersecjie ordonat!) pentru cele cu cooperativitate negaliva.
Panta. dreplelor 2 i 3 redd gradul de cooperativitate.
Fig. 11.23. Drepteie objinute la reprezentarea graficS a ecuajiei Hill pentru
enzime lipsite de cooperativitate (1), cu cooperativitate pozitiv! (2) i
cooperativitate negative (2).
101
In ultimii 15-20 ani s-au evidential la unele enzime alosterice structuri gi
mecanism e de acfiune mult mai complexe. Un exemplu este aspartattranscarbamilaza, enzimM cu rol de reglare in calea de biosint.ez3 a
nucleotidelor pirimidinice (vezi gi capitolul MetaboIismul nucleotidelor
purinice gi pirimidinice^)* Enzima are 12 subunit&ji dintre care gase sunt
catalitice gi gase sunt reg!atorii. !n starea T, subunitajile catalitice sunt
grupate In doi trimeri iar subunitdjile reglatorii sunt grupate in trei dimeri,
intreg ansamblul avand o anumit& simetrie gi o maxima compactizare.
Tranzifia T > R const& in trecerea spre un aranjament cu o aM simetrie, in
care ansamblul subumtftjilor este mult mai deschis. Cele doufi substrate se
leagd numai la unitdjile catalitice: legarea gi transform area se realizeaz#
printr-un mecanism cooperativ sofisticat gi deosebit de eficient. Produsul
final al eSii metabolice, acidul citidintrifosforic (CTP) se leagS numai la
Asp
His
COO +
146
94
NH;
p.
Fig. IL25. Legaturi ionice intre subunitafile Hb In starea T; acestea se
scindeaza cand Hb se oxigeneaza.
Important deosebM are i faptul ca in starea T Fe2+ din fiecare subunitale
este situai in afara planului protoporfirinei IX (la. o distant tie 0,6 A) ca
urmare a leg&rii lui dc-r histidina proximalS (Fig.11.26.)
NeinsemnatS la inceput, acceptarea 02 de c&tre Hb se face simjitd pe
mSsurS ce se for$eaz& prin cregterea presiunii. Fixarea 02 la o prim
subunitate (sau, dupS Perutz, deodatS la cele douh subunMfi a), este corelatii
cu modil'ictlri structural relativ insernnate nu numai la nivelul acesteia
(acesiora) ci, in concordanfd cu modelul simetric (considerat polrivit pentru
Hb), la nivelul tuiuror subunitSjilor, Semnalul este dat de revenirea in planul
protoporfirinei IX a Fe2* ca urmare a iegSturii ce se stabilegte intre acesta gi
02 care se plaseazft intre planul hemului i histidina distalS. Cum leg&tura
Fe2+ cu histidina proximaM nu se scindeazS in urma fix&rii 02 (Fe2+ trece doar
din starea pentacoordinatS in starea hexacoordinatS), sunt, antrenate prin
acest rest aminoa.dd.ic modificSri in structurile secundarS gi terJiarS ale
fiecSrei subunit^Ji. Se scindeaz&totodatft gi ceie opt leg&turi ionice Find
angajate modificSri semnificative in structura cuaternarl S-a stabilit de altfel,
in urma unor analize prin difracfia razelor X, efi un dimer |3 se rotegte in
raport cu cei&Ialt, considerat fix, cu 15. Aceste niodifidiri (influence 1
factorii de care se face deocamdatS abstacjie) constituie de fapt {ranzijia T
> R a Hb. Afinitatea mare pentru C)2 a stMi R se traduce prinir-o rapid#
Fixare a acestuia de chtre subunit&file 2, 3 gi 4 (sau 3 gi 4). Doar in
apropierea presiunii de 100 mrn Hg, capacilatea de fixare diminu# ca urmare
a saturSrii.
Planul hemului
+ o2
-o2
HC0P0 ~~
2, 3 - bisfosfogliceratul (DPG)
H-C-H 0~
I
0
!
o=p-o~
1
o~
Fig. 11.27. Structure 2,3-DPG i intercalarea acestuia in cavitatea centrala a
Hb neoxigenate.
O variate alat de mare a presiunii parjiale a 02 pentru ca acesta s se
fixeze pe Hb ar constitui, in vivo, un dezavantaj. In pldmani ms;l presiunea
parfiaLI a 02 nu variazft Intre 0 i 100 mm Eg ca in condifiilc experimenlale
descrise ci ea este constant la nivelul valorii maxime. Accasta inseamnS e&
doar ultima porfiune a curbci din Fig. 11.24 este valabilS pentru condi(iile
Fiziologice, ceea ce i explicit oxigenarea extrem de uoar& a Hb.
Pe de altS parte, cedarea 02 la nivelul (esuturilor esle favorizatS i chiar
determinate de condifiile fixarii redate in Fig. 11.24. Evident, disocierea 02 de
Hb se face dupd nceeai curbs dar parcursS in sens in vers; presiunea
parfialfi a 02, care este in fesuturi de cca 30 mm Hg, favorizeaza procesul
cedarii sale de caire Hb dar il i intrerupe in rnomentul cand Hb este indl
oxigenat# in proporjie de 50-60%. Deci, Hb va prelua in pklmani doar restul
de 40-50% 02 ceea ce favorizeazS suplimentar oxigenarea. Condi-tiile
descrise ale oxigenSrii i deoxigendrii Hb asigunl gi alte avantaje funcjionale:
105
Fig, 11.28. Deplasarea curbei de oxigenare a Hb tn func|ie de vaioarea pHului. IL9.5. REGLAREA COVATENTA A ACTlVlTkfn ENZIMELOR
In prezent se cunosc multe enzime cu rol reglator a cSror conversie formS
inactive A
formS activa are loc prin modificSri chimice care implies formarea sau
ruperea unor legSturi covalente.
Cazul cel mai freevent este al enzimelor cam se activeazS prin fosforilare
(sau defosforiiare),
Fosforilarea se face de cStre ATP care transfers, de regulS, an singur rest de
acid fosforic; acesta esterificS grupM hidrox.il ale unor resturi de serinS, mai
rar tirozinS sau IreoninS, care nu fac
A
parte din central activ. Reacjiile de fosforilare sunt catalizate de kinaze
specifice, care, la randul
j.
lop pot exists in forme fosforilate numite fosfokinaze i defosforilate numite
defosfokinaze. Fiind
:
putemic exergonice, reacjiile de fosforilare sunt ireversibile. Transformarea
inversS, formS
;
defosforilatS - formS fosforilatS, se lace hidrolitic in piezenja unor fosfalaze
specifice; i aceste
|
reaefii sunt ireversibile (Fig. 11.29).
f
Enzimele interconvertibile prin fosforilare-defosforilare apar numai in
celulele organismelor superioare. Dupa caz, unele enzime interconvertibile
pe aceastS cale sunt active in forma fosforilatS (glicogenfosforilaza) sau
defosforilatS (glicogensintetaza).
t
Activarea unor enzime prin fosforilare (defosforiiare) este, de multe ori, etapa
ultimS intr-o
:
cascadS de evenimente declangatS odatS cu fixarea de catre celule a unor
hormoni sau alfi
j
compui chimici cu rol reglator. Aceste mecanisme sunt tratate in capilolul
Hormoni.
j
0 activare-inactivare 'printr-un mecanism covalent aparte este intalnitS la
enzima
A
glutaminsintetazS care catalizeazS reac{ia:
A
COOH
COOH
|
|
CH NH2
(CH2)a + NH3 +
ATP
COOH
107
;
ATP
ADP
CH NH,
|
- - -^
(CH2)2
CQNH2
, _
Zimogen ;____________________________tnzima activa
Transform !rile acesiea sunt unidireejionale, nu exists posibiiitalea refacerii
zimogenului din enzimeie active. Modalit!|ile particulare de activare a
aeestor enzime se pot urmart in capitolul MetaboIismuI proieinelor i a!
aminoaeizilorT
ILK) LOCALIZAREA INTRACELULARA A ENZIMELOR
Pe masura ce cuno$tintele privind structure celulclor speeiaiizate din
fosuturile organismelor superioare s-au amplificat, imaginea distribujiei
haotice a enzimelor in interiorul acestora (celule sunt saci. cu enzime'*)
datand din secolul trecuh a fost inlocuil! cu una diametral opus!.
Separarea prin ultracentrifugare a orga.nit.elor celulare urmat! de
identi.fi,carea prin tehnici histochimice i biochimice a enzimelor in fiecare
clintre aceste organke a constituit metodologia care a permis elaborarea unui
adevfrat tablou al distributed intracelulare a enzimelor. Cftfeva elemente ale
acestui tablou se prezint.fi in continuare.
Este o regal! general c! orice celul! specializat! dispune numai de acele
enzime care cataiizeaz! efectiv reacjii in ceiula dat!. Uriele enzime (sau seturi
de enzime) se all! in loate tipurile de celule speeiaiizate. Este cazul enzimelor
implicate in c!i metabolice fundamentale cum sunt: biosint;eza proieinelor 1
acizilor nucleici, glicoliza, ciclul acizilor tricarboxilici etc. F!r! funefionarea
aeestor e!i, care asigur! multiplicarea si dezvoltarea, nici un tip de celule nu
poate exista.
Tot ca regula general;!, o aceai enzimft apare in forme uor diferite de la
un tip de celule la ailul. Diferenjcle acesiea apar alat la nivelul strueturii prim
axe i conformajiei (enzime homoloage) cat. i la nivelul strueturii cuaternare
(izoenzimele); aclivitatea lor diferenjiat!, alaturi cle concenlrajia variabil! sunt
in report direct cu necesithfile diferite ale tipurilor de celule.
Pe de alt! parte, fiecare tip de ceiula specializat! dispune de seturi de
enzime care cataiizeaz! reacjiile din c!ile metabolice particulare: enzimeie
implicate in biosinteza hormonilor tiroidieni se afl! numai in.tiroid!, cele care
particip! la biosinteza ureei se afl! numai in ficat, creatinkinaza se afl!
aproape in lotaUtato Tn rnuchi etc.
Un alt aspect privegte locul in care se afl! diverse enzime intr-o celul!
dat!; el coincide, evident, cu locul de desf!$urure a c!ii metabolice sau a unei
seevenje a c!ii metabolice din care face parte reaefia pe care o cataiizeaz!.
Astfel, glicoliza se desf!oar! numai in citoplasm!, cleci toate enzimeie
acestei c!i sunt in citoplasm!; biosinteza ureei (in hepatocite) se desf!oar!
partial in mitocondrii partial in citoplasm!, deci unele enzime ale acestei c!i
sunt: citoplasmatice, allele sunt mitocondriale. Enzimeie implicate in
biosinteza ARN-urilor sunt, localizate in nucleul celular care este sediul
sintezei, i enumerarea ar putea continua.
109
Unele enzime au localizare dubld: aspartat aminotransferaza (ASAT =
GOT) cat gi izocitratdehidrogenaza (ICDH) se afi& atat in citopiasmS cat gi In
mitocondri. ICDH citoplasmaticS are coenzima NADP+, cea din mitocondri are
strict miocardicS).
Activitatea multor enzime plasmatice nefunefionale se determinS in
relafie cu bolile de metabolism (glucidic, Iipidic gi proteic). Cele mai
importante dintre acestea sunt prezentate in capitolele respective.
Ill
II12. CLA5IFICAREA SI DENUMIREA ENZIMELOR
Primelor enzime descoperile li s-au atribuit diverse denumiri; in cele mai
muile cazuri numele enzimei s-a formal din numele substralului prin
adilugarea sufixului -azfc ureazii pentru enzirna ee catalizeazd hidroliza ureei
la C02 i NH3, arginazS pentru eazima care catalizeazS hidroliza argininei la
orn.ii.iri3 uree etc. Alter enzime li s-au atribuit denumiri partieulare bird
legaiuni cu reaejia caializala: pepsin! tripsinft, chimotripsinS.
Cand irumarul enzimelor cunoscute a devenit foarte mare i s-au
acumulat date despre structure coenzime, mecanism de aojiime etc., s-a
impus atat introducerea unei clasificari rationale cat i a unor denumiri
bazate pe crilerii chimice care s3 evite confuziilc. Acestea au fost elaborate,
in arm! 1961, de o comisie de enzirn.oi.ogie a Uniunii Intemafionale de
Bioehimie i Biologie Molecular!! (IUBMB) Hind in vigoare i in prezent.
In sistemul de clasificare adoptat fiecare enzimfi este incadraUl intr-o
subclass i, eventual sub-subclas<1 care apartine unei clase, Clasele,
subclasele, sub-subclaseie \ cnzimele individuale se noteazS prin ci'fre
despite de punct.e. Sunt ase clase de enzime avand in ordine numerele i
cat.ali.zand reacfiile:
1. Oxidoreduciaze, catalizeaza reaej-ii de oxido-reducere;
2. Transferaze, catalizeazd transferuri de grupe ce conjin carbon, azot sau
fosfor;
3. Hidrolaze, catalizeazd scindari d.e legaturi covalente cu participarea
apei;
4. Liaze, cataiizeazd ruperi ale legfiturilor OC, C-S i ON;
5. Izomeraze, catalizeazh toate tipurile de izomerizari, inclusiv
racemizftri;
6. Ligaze, catalizeazd formarea de legaturi in be carbon i O, S, N, cupiate
cu hidroliza legdturilor macroerg ice.
Subclasele i sub-subclasele sunt stahilite dup3 tipul grupfuii sau leg&turii
care se modified In cursul reaejiei, dup3 natura coenzimei i alte particularity.
Sistemul acesta de clasificare este deschis, orice enzimft nou descoperiia
putand fi introdusd intr-o clasa, subclass i sub-subclasfn
Comisia a hotfufU c3 se pot utiliza doud modality de denumire pentru
enzime:
a) Numele recomandal: se p3streaz3 (sau se atribuie) denumiri cu
sufixul -az& (glucozidaza, zaharaza, ureaza) sau se d& denumirea dupS
aejiunea specified (lactatdehi- drogenazd, adenilateiclazd); pentru unele
enzime se utilizeazd denumirile specifice (tripsina, pepsina).
b) Numele sislematie: acesta este corelat cu numele ciasei, subclasei i
sub-subclasei; el cuprinde denumirea substratului (substratelor), tipul
reaejiei catalizate, coenzima, eventual alte caracteristici. Astfel fiecare
enzimd are on cod specific. Utilizarea numeiui sistematic este obligatorie
doar in situafiile care reclama evilarea oriedrei ambiguity (lipdrituri, congrese
etc.). Curent se utilizeazd denumirile recoman date.
112
Clasificarea i denumirile sistematice ale enzimelor sunt redate in Tabelul
II.4.
i
Tahelu! 11.4.
Fragment din tableau! vast al clasific&rii enzimelor i a denumirii
sistematice a acestora
1.
Oxsdoreductaze
1.1.
Care acjioneaza asupra gruparii CH OH
1.1.1.
Cu coenzirna NAD+ sau NADP+
1.1.1.1.
Alcooi: NAD+-oxidoreductaz
1.1.1,27. L-lactat: NAD-oxidoreduetaza
1.2.
Care acjioneaza asupra gruparii C = O 1.2.1'. Cu coenzirna NADr
i NADP+
1.2.1.12. D-gliceraidehid-3-fosfat: NAD-oxidoreductaza
1.2.3. Cu 02 ca acceptor
1.2.3.2.
Xantina: oxigen-oxidoreductaza
1.3.
Care acjioneaza asupra iegaturii CH CH
1.3.2.
Cu citocrom ca acceptor
1.4.
Care acjioneaza asupra leg aturii CH NH
2.
Transferaz
2.1. Care transfer^ fragment de un carbon
2,1.1.
MetH transferaze
2.1.1.10. S-adenoziimetionina; L-homocistein S-metiitransferaza
3.
Hidrolaze
3.1.
Care scindeaza iegaturi esterice
3.1.1.
Carboxiesterhidroiaze
3.1.1.3. Giiceroi-ester hidrolaza
4.
Uaze
4.1.
Uaze C C
5.
Izomeraze
5.1.
Racemaze t epimeraze S. Ligaze
6.1.
Care asigura formarea legaturllor C O
113
Cap. Ill VI.TAMINE 1 COEMZIME.
III.
1. GENERALITAJI
Vitaminele sunt o categoric de substanfe strict necesare animalelor
superioare i care nu pot fi sintetizate in organismul lor, De aeeea,
vitaminele trebuie s& fie procurate de rafia alimentary,
in organismele superioare vitaminele nu reprezintS materiale structural,
de felul principiilor mediate (proteine, glucide, lipide) i nu au valoare
energetic^ dar implinesc roluri func{ionale importante. Intr-adev3r,
rnajoritatea vitarninelor - sau derivafi ai lor imediafl - sunt constituent
coenzimatici, participand la multiple i vaiiate reacjii metabolice. Pentru
acest motiv, in capitolul de fafit se vor descrie 1 iiustra asemenea
intervenjii.
Dei pentru implinirea tuturor rolurilor funcjionale ale vitarninelor
organism ul omului are nevoie de cantit&fi foarte raid ( cateva miligrame sau
NH2
CHf"CHrQ~-P~Q~P-OH
OH OH
Fig. 111.2. - TiaminpirofosfatuI (TPP)
115
aklehidi.ce care urmeazfi s& fie transferate pe alte molecule. Se ilustreazS
aid mtervenfia. tiaminpirofosfatului in decarboxilarea acidului piruvic i
formarea de acetaldehid&(' in vitro).
DatoritS pozifiei sale in ciclul tiazolic din tiaminpirofosfat Cf este reactiv;
in unna ionizMi H legal de el devine H+ iar C2 carbanion. Acest carbanion
exercitd on atac nucieofil asupra C2 din molecula acidului piruvic. Ca urmare,
rezuM un compos de aditie al acidului piruvic la tiaminpirofosfat i care se
decarboxileazS, formandu-se hidroxietil tiaminpirofosfat. Ulterior, acesta
elibereaz& molecula de acetaldehidS (rezultatS din hidroxietilul format prin
decarboxilarea acidului piruvic) i regenereazS tiaminpirofosfatul.
+
CH-r CCOOH J 1! o
* H3C HOOC-C OH
4*
OH
CHCH=O
H3C
I!
o
Fig. Hi,4. - Vitamina B2 (riboflavina)
In organism riboflavina formeazii cu ATP-uI douft flavinnucleolide numite:
ttavinmo- nonucleotid (FMN) i flavinadenindinucieotid (FAD). Strucfurile lor
chimice sunt umultoarele:
OH OH OH 1 i i
C CH- CH- CH CHr O - POJH2 l
R
s
H
n
O
FMN sau FAD
COOH
CONH2
^AT
OH OH
Fig. iil.9. - Nicotinamidadenin dinucleotid (NAD+)
NH2
OH OPQ3H2
Fig. iii.10. - Nicotinamidadenin dinucieotidfosfat (NADP+)
119
CHO
CHrOH
Fig. III.12. - Structuriie chimice ale celor trei conpui piridinici cu activitate de
vitamina B6
In citoplasm# aceste trei vitamere devin substrate fa|# de enzima
piridoxal kinaz# care catalizeazS reaefii de fosforilare cu ATP-uI pentru
fiecare. Ca urmare, ele tree in esterii fosforici corespunz#tori (la grupul de
alcool primar din pozijia 5). Dintre acegti esteri, piridoxalfosfatul i
piridoxaminfosfatul sunt coenzime participante la diverse reaejii metabolice;
in special, la transaminarea, decafboxilaiea i trans-sulfurarea a aminoacizilor.
In procesul transaminftrii, piridoxalfosfatul i piridoxaminfosfatul intervin
pentru transformarea - dup# caz - a unui aminoacid in cetoacid i invers:
120
R~CH~~COQH + Rs~C~~CQOM
i
Si
Nf%~
a.
Aminotransferaza (transaminaza)
RO
-OOH+ R-CH-COOH s
NH2
Fig. 1IL14. - Reac|ia general a de transaminare
Mecanismul (de ping-pong) reacfiei de transaminare poate fi urmSrit uor
dac& se iau in considerate notafiiie:
E CHO = aminotransferaza cu coenzimS piridoxalfosfat E CH2NH2 =
aminotransferaza cu coenzimS piridoxaminfosfat gi dacd. se {ine seam a de
int:erven|ia succesivd a celor doud coenzime in reacfii reversibile:
HoQ
R1~CH-NH2 * QHC-E
RiCHN = CHE
$-=-=-*
I
f
COOH
COOH
' Baza SchiffI
R/ CN.CH2-E
R-I-C-COOH + E~CH2~NH2
COOH
O
Baza Schifl
R2-C-COOH + E~CH2~NH2
R2~e~cooH
o
N-CH2~E
Baza SchiffHi
+ HoO '
R^CH-COQH^d** Rp-CH-COOH * E -CHO II
N-CHE
NH2
Baza SchifV
Fig. ill.15. - Mecanismul transaminarii
i
-H
;;=s.
121
In reacplle de decarboxilare a aminoacizilor, piridoxalfosfatul joac& rol de
coenzimft tot prin formare de baze Schiff intermediare.
Coenzima piridoxalfosfat paiticipg. gi ia procesul de trans-sulfurare; spre
exemplu, la reacjia metioninei (sub found de S-adenozil melionind) cu serina
din care rezultd ci stein a (vezi metabolismul acestor aminoacizi).
In sfargit, piridoxalfosfatul participd la mecanismul de acjiune al
fosforUazei implicate in scindarea glicogenului (vezi g!icogenoliza).
Acidul pantotenic gi coenzima A
Acidul pantotenic poartd acest nume (in grecegte, pan = tot, peste tot)
pentru' cd este foarte mult r&spandit in fesuturile vegetale gi animale.
Din punct de vedere structural, acidul pantotenic este produsul
condensarii acidului 2,4 - dihidroxi - 3,35 - dimetil ~ buliric (numit gi acid
pantoic) cu P - alanina:
CHj
HQ-CH3~C- CH - CO- NH- CHr CHr COON 2 \ \ .22
CH3 OH
Acid pantoic
* ft - alanina
Fig. ill.16. - Acidul pantotenic
In majoritatea organelor acidul pantotenic este fosforilat pe seama ATPului, sub acpunea unei kinaze specifice. Produsul rezultat este anirenat
ulterior intr-o serie de alte patru reacpi enzimatice, succesive, eonducand la
formarea coenzimei A:
CH7 \ 3 CH2
i2
NH
-CO
Coenzima A participd la numeroase procese biochimice fundamentale,
atat de biosintezd (spre exemplu, biosinteza acizilor gragi, a colesterolului),
cat i de degradare (in special la degradarea oxidativd a catenelor
hidrocarbonate din divergi cataboliji). Posibilitatea coenzimei A de a participa
la reacjii numeroase gi variate se datoreazd faptului cd gruparea SH din
molecula sapoate forma legdturi tiolesterice, macroergice. Spre exemplu,
activarea acizilor gragi (premergdtoare degraddrii oxidative sau biosintezei
lor) are loc conform reacfiei:
R COOH + CoA SH + ATP ^ R CO - SCoA + AMP +PP;
122
Se observe cH in reacfie s-a prescurtat slructura coenzimei A libere sub
forma' CoA - - SH pentru a se pune in evident grupul reactiv, respectiv - SH.
Acesta este modal obignuit de a se nota forma liberS a coenzimei A. De
asemenea, din reacfie se observe leg&tura macroergM, C ~ S (aflatft in
fiolesterul acidului gras) s-a format prin desfacerea and legSturi macroergice
din ATP (scindat in AMP i PPj).
Un compus macroergic important in const!tujia caruia intr3 coenzima A
este acetil CoA, CH3 CO ~ SCoA, intalnit mult in studiul metabolismelor;
mai ales, In cadrul mefaboiismului glucidic gi lipidic.
Biotina i rolul ei coenzimatic
Biotin a este vitamin!! pentru om i animalele super ioare iar pentru
drojdii, ciuperci i
bacterii este factor de cre'gtere.
In constitujia moleculei de biotinS intr& cidul hidrogenat al imidazolului
condensat cu ciclul hidrogenat al tiofenului. La acesta din urm&, in pozifia a
fa{3 de atomul de suif, se aflS atagat (prin sobstituire) radicalul acidului
valerianic:
O
'CN
HN
NH
HCCH
H2C
CH- {CH2)4 - COOH
Fig. Hi.18 - Biotina
S
In organism biotina unplinegte roluri importante, pariicipand in mod
S|
CO + CO
> CO
+s
CO
''CH,
N/,
1 ''CH, CH
NH/
CH
'coo- CH3
CH2
\
COOH
Carboxibi
otinAcid
Acid
Biotin
enzima
piruvic
R
I
XCH CH
oxalacet
ic
enzima
R
I
yCH CH m\
CH2
CH2
CH2
HC NH2
COOH
HC
NH2
COOH
Me - H4 fotat
{-J
Homocistein
metiitransferaz
a
Homoci
steina
Me t/loobalamina
Fig. HI.21. - Rolui coenzimatic
\
a
A
Met
ion in
a
al metiicobalaminei
125
; ;
' ! . :j.|
ifdU.
Ai"Y
1 iv,
wv' ii I ;
-!
' : i . V ih -
ii
rL!::
CO
CO
\U\
hidrogen NADPH-flT'. Reducerea are loc la nivelul dublelor legfiluii 5-6 i 7-8
din nucieui pteridinic al acidului folic propriu-zis (ptoroilmonoglutamat):
9
10
CHrNHCOOH:
/
-CO-NH-CH
(CH2)Z
}
COOH
Fig. ill.25. - Acidul tetrahidrofolic (FH4 sau THFA)
, In calitatea sa de coenzimil in procese enzimatice de transfer, acidul
tetrahidrofolic participd la trecerea grup&rilor cu un carbon: metil (CH 3),
metilen ( >012), formil (-r-CHO), formimino (CH = NIT), de la un metabolit
la altui. Spre exemplu, transferul grupului cu un carbon de pe serind pe
homocisteinii cu formate de rnetionind are loc conform reaepilor din fig.
IIL26.
127
CHrOH
CH--NH, + I
C-OOH
Senna
N
H
CHrNH~~
CH-NHS
COOH
/ CH, N
^rCHrNN
H
)
FH4
Glicina N5, N 1 ~ me Wen FH4
NSs N 10 metlien - FH4 + NADH * H N $ - metil - FH 4 + NAD*
N^, - metil - FH4 + homocisteina > FH 4 + metionina
Fig.!!!.26. - Particlparea acidului tetrahidrofoISc, cu rol coenzimatic, la
formarea metioninei
Dupd cam s-a arStat la vitamina Bri, ultima reacfie din Fig. 1IL26 tire loc cu
participarea coenzimatic^ a cobalaminei, pentru.lransferul grupului CH3
(Fig, XII.21).
N5, N10 metilen H4F, participant la reacfie are rol coenzimatic i in
cedarea unui OTP metil deoxiuridilatului pentru a-1 transforma in
deoxitimidilat
HN
x
o
2 '-Dezox iuridilat (dUMP)
xiz1
H _____
WA^CHJ
Stntaza
* \X4
N5tN10 -metilen-FH4
A
OH H
XX
\
H
Dih/drofolat
2'-Dezoxitimidilat
(dTMP)
Fig. III.27. Rolul coenzimatic al acidului tetrahidrofolic la formarea
deoxltimldilatuluj
Reacfia. aceasta prezintfl un interes deosebit cad deoxilimidilatul, astfel
format, este precursor implicat in sinteza ADN-ului.
Formiminoglutamalul, un catabolit al histidine!, transfer^, grupul sM imino
la li4
foiat i rezulta N5 formimino H4 folatuL
III,
3.2. VITAMINA C (ACIDUL ASCORBIC)
Vitamina C poart& i numele de acid ascorbic (a - fMrd, scorbic =
r&d&eina cuvantului scorbut) deoarece este 0 substanfii acida (acid organic)
i vindecS boala numild scorbut.
Structural rnoleculei de acid ascorbic este inruditd cu cea a hexozelor. De
fapt, el poate fi considerat drept y - iactona unui add hexuronic, numit acid L
- gulonic. In molecule mai sunt cuprinse i patru grupari - OH: doud alcoolice
(la C5 i C6) gi douS enolice (la C2 i C3). Atomul de carbon C5 are configurate
stSng8,'
128
Prin indepSrtarea atomilor'de hidrogen din cele douS grup&ri. enoiice se
ob{ine acidul dehidroascorbic. Ambeie forme (acid ascorbic, acid
dehidroascorbic) devin interconvertible prin bidrogenare - dehidrogenare i
sunt fiziologic active. Structurile ior chimice sunt prezentate In Fig. XH28.
O
O
1C--------1
I
2C-0H il o
3
OH
4
I
HC--------J
5
i
HO-CH
6
I
CH2~~OH
- 2H *2H
JS*.
c
c~o
l
c~a
HC-----I
HQCH
O
CH2-OH
Acid L - ascorbic
Add L - dehidroascorbic
Fig. Hi.28. - Acidul L-ascorbic i acidul L-dehidroascorbic
Ca atare sau sub forms oxidatd, vitamina C participd la reacfii multiple
pe'care le suferd In organism diverse eategorii de compugi important - din
pu.nct de vedere biochimic: aminoacizi, nucleotide, hormoni, vitamine,
coenzime, ioni metalici.
Majoritatea reacjiilor care au loc cu participarea acidului ascorbic (forma
redusd) sunt hidroxildri In care este implicat i oxigen molecular:
R H + Ac. ascorbic + 02 - -^ R OH + Ac. dehidroascorbic + HzO
Se cunosc Insd i hidroxildri care se fac pe seama acidului
dehidroascorbic. In aceste cazuri, odatd cu hidroxilarea altei substanje are
loc i reducerea fonnei oxidate a acidului ascorbic. Alte oil, reacjiile la care
participd acidul ascorbic (forma redusd) constau numai In reduced. In labelul
1112. se menjineazd cateva reac|ii metabolice in care intervine acidul
ascorbic (forma redusd sau oxidatd), precizandu-se tototdatd l tipul de
reacfie corespunzdton
Tabefui III.2
Unele reacjii metabolice la care partlcipi acidul ascorbic
________Reacfia metabolica
Tipul de reacfie chimica
z
1/2 Q2>O * *
Citocrom a(c) Fe3+ >
Citrocrom a(c) Fe2+
Methemoglobina >Hemogiobina Acid folic > acid tetrahidrofofic
*Frolina -> hidroxiprolina
* Lizina >hidroxiiizina Triptofan >5 - hidroxitriptofan
* Reacjii importante in biosinteza coiagenutui
Reducere
Reducere
Reducere i Cu participarea acidului ascorbic (forma redusd)
Reducere
Hidroxiiare
Oxidare cu participarea acidului dehidroascorbic
129
Pe langft reacfiile menjionate in tabelul precedent, acidul ascorbic
intervine i in diverse alte reacjii de oxidoreducere in care funcjioneaz#
CH, OH
CH,
Vitamina A are mai multe provitamine. Aces tea sunt substanfe care se
yOH
CH3
CH3
Retinol (vitamins A)
Acid retinoic
Fig. ill.31. - Trecerea p-carotenului in retinol i formarea derivator Tnrudiji
i!:
in: '
if.-.
Retinal
izomeraza
IT' ^
Opsins
Rodopsina
Ergosterol (plante)
Ergocalciferol (vitamina D2)
7 - dehldrocofesterol
Colecalciferol {vitamina D3)
(animaie)
Fig. til.33. - Structurile ergosterolului, 7-dehidrocolesterolului i ale
vitaminelor D2 i Da
asemnSnftoare (Fig, IIL35, Tabel.III.3.). Forma cea mai biologic - activ<1 este
a tocoferolul.
Tocoferolii au in moieculele lor, ca structure de bazfi, tocolul. La randul
situ, acesta conjine un nacieu cromanic substituit in pozijia 6 cu un hidroxil
iar in pozijia 2 cu un metil gi un radical saturat conjinand 16 atom! de
carbon, Din toco! derive, prin median in diverse pozijii (5,7 sau 8) , cei palru
tocoferoli naturali:
p (beta)
5,8 - dimetiltocol.
y (gamma)
7,8 - dimetiltocol
A (delta)
8 - metil locol
Deoarece vitamina E este cuprinsil in Ijoidclc aiMeMeto^dupd ingerarea
acestora ea se ebbereaza gi se absorbe la nivelul intestinului sublire in cursul
digestiei iipidelor. Ulterior, vitamina E este transportatS de sSnge la ficat gi
alte organe. Se consider^ cl transportul vitaminei se face prin inglobare in
chilomicroni iardupS eliberarea din ei este preluaU1.de iipoproteine. Date
relativ recente tind s&arate eft fosfolipidele din mitocondrii, reticulul
endoplasmatic gi membranele plasmatice posedft afinitftji deosebite
(specifice) peniru a - tocoferol, ceea ce duce la concluzia cl vitamina E se
concenlreazft in aceste formapuni. De asemenea, dupft cum s-a mai
menjionat, depozilarea tocoferolilor se face in {esutul adipos.
135
in organismul urnan vitamina E joac& un rol important, funcfionanci ca
antioxidant , In aceasta calitate, ea protejeazd hematiiie fa0 de divergi toxici
oxidanji (radicali liberi- ai oxigenului), previne oxidarea unor hormoni
hipofizari 1 suprarenalieni precum oxidarea altor substanje ce sunt, utile ca
atare; spre exemplu, vitamina A i acizii gm$i esenjiali
Mecanismul interven{iei tocoferolilor in procesul antioxidativ se explied in
fclul urm&tor: tocoferolii pot intrerupe irul reac{iilor (inlSnJuite) ale
radicalilor liberi datoritS capacitajii lor de a transfera un hidrogen fenolic
propriu la un radical liber peroxi di.o.rr- un peroxid de acid gras polinesaturat:
Toe OH + ROD' -----------------------^ Toe 0 + ROOH
Ulterior, radicalul liber fenoxi format din tocoferol reaefioneazd cu un alt
peroxi! liber: Toe O 4- ROG' ROOH + produs de oxidare fara radical
liber Acest produs fM radical liber are struclura din Fig. III.36.
oc~o
\
CHrCH3
Fig, HI.36. - Produsul de oxidare ai a-tocoferoiufui
DupS conjugarea sa cu acidul glucuronic, produsul de oxidare a!
tocoferolului este excreta! prin bil& - intestin.
Acfiunea antioxidants a tocoferolilor este apreciabilS. i eficientS la
concentxatii ridicate ale oxigenului. DatoritS acestui fapt, tocoferolii au
tendinfa sS se concentreze in acele structuri lipidice care - in genere - sunt
expose h presiuni ridicate de oxigen; spre exemplu, in rnembrana eritrocitarS
i in mernbranele arborelui respirator.
Up alt fapt demn de semnalat In legdturd cu acfiunea. antioxidants, a
tocoferolului esie conlucrarea sa cu seleniul in acelag scop, intr-adevdr, in
calitate de component: ai sistemului glutation peroxidazei - seleniu
dependents, seleniul participS p el la prevenirea aejiunii distructive a
peroxizilor, alftturi de vitamina E.
Pe de aldi parte, aa cum sa specificat la vitamina A, tocoferolul poate fi
intovMit. in activitatea sa antioxidantd de p - caroten, cu acfitme sinergicS
de acela tip.
IH.4.4. VITAMINA K
Vitamina K poartS acest: indicator deoarece este necesarfl coagulSrii
(Koagulations Vitamin). Pentru acest motiv i se mai spune i vitamina
antihemoragicS. Intr~adevSr, earenfa vitaminei K determine predispozifii la
hemoragii datorate prelungirii timpului de coagulare a sangelui.
136
o
o
N
FIlochinona (vitamina KJ
CWa,
Menadio! ~ difosfatuf de sodiu
'Fig, Hf.37. - Struoturile vitaminefor K naturale i de sinteza
Ca i celelalle viiamine liposolubiie, vitamina K am mai muite vifamere cu
structuri chimice asemSnfltoare (Fig. 37). In primal r3nd, exists cioiul
viiamine K naturale important; vitamina K), izolatii din vegetale i vitamina
K2, izolatii din jesuturi animate i baeterii iniestinale (care au capacitafea de
Fig. IN. 38. - Carboxilarea resturilor de acid glutamic la resturi de acid ycarboxiglutamic, pentru constituirea factorilor de coagulare, prin intervenjia
vitaminei K
Resturile de acid y - carboxiglutamic (protrombina conjine 10 asemenea
resturi) pot chela ionul calciu:
Ca2+
O Om -Q O %/
cc
\/
CH
!
CH2
CCHNFig. ili.39. - Chelarea ionuiui de calciu de catre acidui f-carboxtgiutamic
Acest proces de fixate a calciului este esee|ial pentni rolul biologic al
factorilor de coagulare.
S-a constatat cS pe langS factorii de coagulare exists i alte proteine care
conjin resturi de acid y - carboxiglutamic, formate tot prin intervenjia
vitaminei K. Aceste proteine au fost identificate in diverse organe: piSmanL
spliriS, rinichi, placentS, case (osteocalcina).
138
CapJV. ACIZH NUCLEICI
IV. 1. INTRODUCERS
Acizii nucleici sunt, din punct de vedere chimic, produji de policondensare
a unor uni- tiifi denumite nucleotide.
Se cunosc dou& clase de acizi nucleici; acizi dezoxiribonucleici (ADN) i
acizi ribonucieici (ARN), Atat ADN cat i ARN sunt macromolecule
informaponale care permit stocarea, transmitereai i exprimarea informapei
genetice.
Molecula de ADN repezintd baza chimicd a eieditip, ea confinand
informajia genetic^ cu privire la biosinteza proteinelor. Conpmitul
informational al ADN, inserts in secvenja nucleotidelcr ce constituie
macromolecula, permite specificarea structurii fiecSiei proteine, determine
deci, prin definirea caracterelor morfofuncponale ale unui organism,
individualitatea acestuia.
Transmiterea informapei genetice de-a lungul generapilor, cu o fidelitate
ireprogabiM, este rezultatul capacMpi de autoreplicare a moleculei ADN in
virtutea cSreia molecula de ADN parental este copiatS astfel incat s&
formeze doud molecule - fiice avand o secvenp nucleotidic^, deci un conpnut
informational, identic^ cu ADN parental.
Exprimarea informatiei genetice cuprinsd in molecula de ADN in secven{e
specifice de aminoacizi, deci in proteine, se realizeaz& pe parcursul a doud
procese:
- transcrierea - constdnd in rescrierea unor pftrp din mesajul genetic sub
forma unui ARN denumit mesager. Acesta. preia din nucleu mesajul genetic
cu privire la biosinteza unei anumite proteine 1-1 aduce in citoplasmS, locul
de biosinteza a proteinelor;
- traducerea - in cursul c&reia mesajul genetic, care se afl& inseris intr-o
succesiune de triplete (grup de trei nucleotide) din ARNm este exprimat in
secvenjS de aminoacizi. Fiec&ruia dintre cei 20 de aminoacizi ii corespunde o
succesiune de trei nucleotide, desemnat# drept codon. Amplasarea
aminoacizilor intr-o secvenpi caracteristic^ unei proteine (codificatd de un
anumit fragment ADN i transcrisd intr-un anumit ARNm) este asiguratS de
molecule de ARN de transfer44, purlfttoare ale unor triplete complementare
cu divergi codoni din structura ARNm denumi{i anticodoni. Acest ARN de
transfer adapteazS un anumit aminoacid, cel pe care-1 transports, in faja
codonului de pe ARNm ce specified aminoacidul dat, gra{ie recunoagterii
HCH|
H _ c OH 1
H c OH
i
1
CH2OH
CH2OH
D-riboza
D-2-dezoxiriboza
IY.2.1. BAZELE AZOTATE DIN STRUCTURA ACIZILOR NUCLEICI.
Razele azotate care intr# in structura acizilor nucleici deriv# din dou#
structuri heterocidice: purina i pirimidina.
6*
C OH |
1
Piiimidlny
Razele purinice din structura acizilor nucleici sunt adenina (6amino~purina) i guanina (2-amino-6-hidroxipurina).
Ca baze pirimidinice s-au identificat 3 baze majore:
- uracilul (2,4-dihidimi-pirimidina);
- timina (2,4-dihidr6xi-5-metil-pirimidina);
- citozina (2-hidroxi-4-aminOpirimidina).
Razele purinice i pirimidinice prezint# fenomenul de tautomerie. Se
considers structuri tautomere doua structuri care difer# una cle cealalt# prin
pozijia unui atom de hidrogen i a unei dubie legSturi. Bazele azotate
prezinta tautomeric lactim-lactam datorit#
OH
O
grupei C = N care exist# in echilibm cu forma C NH ~
O
OH
G NH
C=N
forma lactam
forma lactim
140
In structura acizilor nucleici se g^sesc formele lactam, mai stabile.
NH 2
0
- Adenma
(6-aminopurina)
lac fjft)
Guanina
Lactirn
Lactam
Uracil
(2,^-dfhjdroW'p/rim/dina)
OH
PH3
CH,
HO
HN"
v/
N
Laclim
H
Lactam
Timina
(5'mel/i-u'adf)
tactim
Lactam
Citozina
(2-hidfO-4-arnino*fMfjmiaina)
Derivajii aminaji care nu confin grup&ri -OH prezintS i ei tautomeric iminoamino,
dar echilibrul este net deplasat in favoarea formei amino;
NH2
141
Ca atare, adenina se va prezenta sub forma amino.
De menfionat cd uracilul este baza pirimidinicd specified AR.N, In limp ce
trmina este baza pirimidinicd'specified ADN.
Atat ADN cat i ARN (in special ARNt) confin i baze minore ce
reprezintd forme mediate, tiolate sau glicozilate ale bazelor majore. Ra|iunea
prezenfei lor in acizii nucleici va fi discuta td ulterior.
Bazele azotate sunt molecule plane, relativ insolubile in apd. Prezinfd on
maxim de absorhfie in ultraviolet intre 252-271 nm, in funefie de natura
bazei azotate i de pH, ceea ce permite determinarea cantitdfii de acizi
nucleici intr-o probd.
IV.2.2, NUCLEQZIDE 1 NUCLEOTIDE DIN STRUCTURA ACIZILOR NUCLEICI
Nucleozidele sunt compui ce rezultd prin stabilirea unei legdturi Nglicozidice intie hidroxilul semiacetalic (de la C ) al pentozei i atomul de
azot din pozifia 9 a unei baze purinice sau din pozifia 1 a unei baze
pirimidinice.
Ribonucleozidele confin ca pentozd p-D-ribofuranoza, in limp ce
dezoxiribonucleo- zidele confin P-2 -dezoxi-D-ribofuranoza,
NH 2
O
OH
142
Citidinn
DeioxiUmiclinn
Dezoxiribonucleozidele se citesc adSugand prefixul dezoxi la numele
ribonucleozidului corespunzStor. In unde nucleozide pirimidinice, denumite
pseudonucleozide, leg&tura intre pentozS i baza azotatS se realizeaz-S prin
intermediul C5 i N,.
Nudeotidele sunt esteri fosforici ai nucleozidelor la gruparea alcool de la
C5>, sau C3> al pentozei. In structura acizilor nucleid intrS nucleozid-5fosfa{i.
i!-M
Ac
V
;C^V
;
,i in\ i
N
144
De menjionat exisfcenfa a douS conforma|ii posibiie- pentru nucleozide gi
nucleotide derivand din suprimarea/ofafiei libere in jure 1 legSturii J$-Nglicozidice: conformafiu anti gi conformafia syn. In conformerii anti,
dezoxiriboza gi baza sunt situate de pSr{i opuse fatS de legStura glicozidicS,
ceea ce reduce repulsia stericS intre acestea. UzuaJ, conformerii anti sunt
prezenji in dubla helice Watson-Crick (ADN-forma B) in timp ce conformed!
syn sunt prezenji in ADN-forma Z (vezi structura ADN)-
0"
Struclura 3',5' AMP(AMPc)
O
0"
Slrucluf 3',5 GMP (GMPc)
145
adenozin monofosfatul ciciic (rnesagerul secund). AMPC este interprets
acfiunii hormonilor respectivi in celulS, el realizand, prin intermediul unor
kinaze, fosforilarca reversibiD a unor enzime, aciivarea sau inactivarea
acestora (vezi hormoni). Suprimarea acfiunii hormonului se traduce prin
hidroliza AMPC sub acfiunea fosfodiesterazei.
o
A.
7)
A7
HO
HO OH 6- Aza-uridina
HOH2C
kQ?
A/, OW Zidovudina (AZT)
SH
6 - Marcapt^punna
MM ^ H 6 - Tioadenina
IV.5.2. STRUCTURA COVALENXA A ACIZILOR NUCLEICI
Acizii nucleici sunt poiinucleotide realizate prin stabilirea de legatori
covalente Intre nucleotidele ce se succed in ianp
Gruparea 5-hidroxi a unui nucleotid este legatd la gruparea S-bidroxi a
nucieotiduiui urmdtor prin legdturd fosfat diestericd (Figura IV. L)
De remarcat cd orice catena polinucleotidicd are o direcjie (o polaritate)
specified, in sensul cd, toate legaturile internucleotidice au aceeagi orientare
de-a lungul lanfului. Fiecare catena polinucleotidicd va avea doud capete:
capdtui 5\ ia care gruparea -OH de la C5 este liberd, i capdtui 3, la care
gruparea -OH de la C3 nu este angajatd intr- o legdturd internucleotidicd.
Prin convenjie, structura unei catene polinucleotidice este scrisd
intotdeauna cu capdtui 5 in stanga i cel 3* in dreapta. De exemplu,
succesiunea ACGAC semnified faptuj cd adenina are grupa 5-OH neangajatd
in legdtura cu alt nucleotid in limp ce citozina are liberd gruparea 3-OH.
Doud lan{uri polinucleotidice sunt antiparalele atunci ednd unul evolueazdin
direejia 5 >3\ iar celdiait in direefia 3?~A5? (Figura IV.2).
148
timus de vljel
150
ADN
dubiu
helicoidal
151
i concentrate de agenji' denaturanji relativ mici), exist! i alte aplicafii ale
acestui proces. Printre cele mai importante se numM hibridarea molecular^.
Tehnica hibridSrii moleculare permits renaturarea prin combinare a unor
monocatene de ADN sau a unor monocatene de ABN cu ARN, in condijiile
unui grad relativ crescut de. complementaiitate a acestora, cu formarea unui
heteroduplex.
Detec tarea regiunilor hibride aie unui heteroduplex se poate face
electrono-micrcscopic (contur mai ingroat). Vizualizarea electronomicroscopicd a heteroduplexurilor ADN- ARNra, formate in solujie, permits
determinarea pozifiei intronilor (vezi mai departe) in rnoleculele de ADN sau,
in cazul heteroduplexurilor ADN, evidenjierea delefiilor cromozomiale.
Detec tarea heteroduplexurilor ca i determinarea gradului de hibridare se
pot face i prin marcarea uneia dihtre monocatene cu 32P, urmat& de
/
0
0X
10
C
L
1
H20
3'
7~
T
O-POg OH
A ~|~
T
HO
0~PQ'
Fig, IV.5 Hidroliza bazic& a ARN
152
Rezistenja la hidroliza bazicd a ADM este uor de injeles i poate fi
interpretatd ca o necesitate servind funcjiei de depozifare a informajiei
genefice.
Atat ADN cat i ARN pot id hidrolizafi enzimatic sub acjiunea unor enzime
denumite nucleaze. Se cunosc doud tipuri de nucleaze: endonucleaze, care
hidrolizeaz# legdturile fosfat diesterice din interiorul catenei polinucleotidice
i exonucleaze, care hidrolizeazd nucleotidele terminate de la capdtul 5 sau
3 ale until lanj polinucleotidic. Aceste enzime sunt distribuite ubicuitar.
Nucieazele secretate de pancreas particip# la procesul de degradare a
acizilor nucleici. Acjiunea nucleazicd, in special cea exonucleazicd, este
proprie i unor enzime implicate in biosinteza ADN, cum ar fi ADN polimeraza
III.
O elasd important de endonucleaze specifice, denumite enzime de
restricjie sau restrictaze, a fost evidential# la bacterii. Rajiunea existenjei
acestor enzime este aceea de a distruge once ADN strain care a patruns
in.baclerie, prin calitatea de a recunoagte secvenje specifice de 4-6
nucleotide i a cliva, intr-un loc specific, cate o iegdturd. fosfat diestericd de
Timidin a
Dezoxiadenozina
Superrasuciri
pozltlve
157jib
A
A:j
f::
:
\
'
V;
conformafia syn iar cel a 1 citozinei pe cea anti, ceea ce face ca lanjul sft
evoiueze in zigzag intne cele douM conformafii (Fig. IV. 10).
MinoritarS fa|ii cle dubla helice Watson-Crick i avand o stabilitate mai
mic decat ea, prezenja acestei con.forma{ii are, probabil, o semnificafie
biological; se sugereazS cS ar reprezenta un semna.1 de recunoagtere sau ar
I M -.1 :: z-
Nucleozom miezw
Fig. IV,12
161
in sfudiile de microscopie electronic! cromatina are aspectul unor m!rgele
peaf!. M!rgelele reprezint! o suit! de particule sferice cu diametru de -10
nm, iar afaA porjiuni de ADN liber. Unitatea repetitive de 10 nm, evidential!
163
atat la procariote cat i la eucariote, sinteza semiconservativd asigurd
transferal de informajie geneticd de la ADN parental la ADN fiu i deci
menjinerea stabilitiijii genetice a fiecdrui organism i a speciei.
Procesul de biosintezd a ADN este un proces de mare compiexitate care
necesitd, atat la procariote cat i la eucariote:
- prezenja ADN matrix (template);
- prezenja celor patru dezoxiribonucleozid-trifosfaji (dATP, dGTP, dCTP,
dTTP);
- prezenja ribonucleozid-trifosfajilor (ATP, GTP, UTP, CTP), sugerand
necesitatea sintezei de ARN in cursul sintezei ADN;
- prezenja ionilor de magneziu;
- un sistem enzimatic complex avand ca enzime constitutive: .
a) helicaza - enzimd care realizeazd desfacerea duplexului parental
^OH
(X'
.....N ....."*
EE
IP-R-AI
P
AMP
R
s
rA
Fig. IV.15 - Mecanismul de ac|iune a ADN ligazei
Replicarea ADN la procariote
DesfSurarea procesului de biosintezS a ADN la procariote implicit
urm&txwea. succesiune de evenimente: inifiere, elongare, terminare a
replicarii.
1. Inijierea replicarii se produce in puncte bine determinate, avand
caracteristici distinctive u^or de recunoscut de cStre enzimele mifierii
(helicaze, topoizomeraze, ADN primaze), denumite regiuni-origine (ori). La
Escherichia coli ar exista o singurS regiune ori. Aceste regiuni conjin
secvenje ,,consens foarte bine conservate de-a lungul evolufiei, bogate in
perechi A=T, rccunoscute de proteina dna A responsabilS de corectitudinea
ini|iem. Duplexul de ADN circular se replies simultan in ambele direejii;
cromozomul bacterian arc in timpul rcplicSrii forma literci theta. (Fig. IV. 16).
Regiunea activS in replicare la un moment dal care se deplaseazS de-a
lungul duplexului parental este desemnatS drept bifurca{ie de replicare*4.
Pe cromozomul bacterian evolueaza douS bifureajil de replicare, una in sens
orar, cealalta in sens antiorar, Replicarea bidirectional# s-a dovedit a fi
uzualS atat la bacterii cat i la virusuri,
Iniperea replicSrii parcurge douS etape:
a) desfacerea duplexului parental pe anumite porfiuni replicatori sub
acfiunea helicazelor (proteine dna B); procesul, presupunand ruperea
legSturilor de hidrogen dintre bazele complementarc, se produce cu un
substantial consum de energie (ATP). Desfacerea duplexului parental
(denaturarea acestuia), realizatS initial pe o por{iune micS de ADN (in
regiunea oriu), continu# de-a lungul moieculei pe mSsura inaintSrii
165
0
-v
old
U-. 2
:;
:n
I s i /:\
167
HO-TiROZiNA ENZIMA
i
i
- / ?'
OH
/
r
A_____/
"'P J
s
/
7/
/
/
u, P-P-P
/
/
'VDH
&
/
/
p7
/
___ c -
P7
... I j _ /
p/
/
/
3
5'
P
/
R7
/
/
P7
/
P7
/
P
P7
_ .Z
-7
.
-^
OH
E
C
L
py
Z
c
c
<
z
/
p
j -pp
?
T
C
OH
T
P7
A
- - - -U
-
. Z ..
P/
v:: c /
/
" g:/.
P
J
w
C
D
____
G
V
/
A
--- - y
____
z__^
s
_
<
L
>
a
.
2
C
C
<
p7
p/
/_____
- ^
-c
vG
3
OH
p
l
Fig. IV. 18 - Eiongarea primerului ia capaiui 3OH
cn, .00
GiRAZA
supercontrol a ADN polimerazei III eliminS erori ce s-ar fi comis dacS singurul
mecanism de control ar fi fost respectarea principiuiui complernentariEjii
bazeior. Intr-adevir, dacii ADN polimeraza III n-ar fi fost inzestraE cu activitate
de corector, perechea adenind-citozirE s-ar fi menjinut in ADN non sintetizat,
generand o mutafie.
Incapacitatea ADN polimerazei III de a ini Jia catene polinucleotidice,
respectiv necesitatea unui primer, nu este un handicap al enzimei ci o
necesitate impusd de exigenjele procesului de replicare; ADN polimeraza III
poate s& exclude un nucieotid impostor numai dacfi acesta se aM la capStul
3 al unui lanj polinucleotidic in cregtere, ceea ce ar permite o inijiere
defectuoasl
Solujia pare a fi intr-adevar o inijiere mai aproximativS, prin sinteza unui
ARN primer, sub acjiunea unei ARN poiimeraze lipsitS. de activitate de
corector, gi excluderea ulterioaE a acestuia, care va fi inlocuit. cu fragmentul
de ADN corespunz&tor.
InsSgi alegerea unui sens unic al replicSrii, i anume cel cu direcjia 5"
>3% contribuie la asigurarea acuratejii procesului, permijand ADN
polimerazei sil-gi exercite acfiunea de autocontrol si corectare a erori!or.
Dacd lan{ul sintetizat ar avea direcfia
gi la
cap&tul S ar apare o gregeaE de imperechere, excluderea
dezoxiribonucletidului impropriu ar face imposibiM continuarea replicSrii in
condifiile date, de unde necesitatea pSstrSrii lui, chiar cu preful
compromiterii fidelitStii, aproape absolute, a procesului.
Ca rezultat al funcpei de corector a ADN polimerazei gi al imperativului
complemen- taritS|ii bazeior, frecvenja erorilor in procesul de replicare a ADN
este de una la 106 - 107 pexechi de nucleotide. Totugi, frecvenja erorilor in
ADN al Escherichiei coii este de numai una la 109 perechi de nucleotide,
grape unui sistem enzimatic ce acfioneazS post-replicativ (vezi mai departe).
Pe langii activitatea de corector, ADN polimeraza III este o enzimS cu o
capacitate cataliticS excepJionaE; ea reugegte sS adauge in cursul elong&rii
aproximativ 60 000 de nucleotide pe minut. Viteza extrem de mare de
polimerizare o face demiE de rolul pe care gi-1 asumS in sinteza ADN.
171
".
v;i j
Mitoza
ADN
duhlu catenar
Inserfia ADN
Fig. IV.22 - Repibarea ADN pe ma- trifa de ARN sub acpunea ADN polimerazei
- ARN dependent# (revers transcriptaza)
Ambele procese sunt catalizate de c&tre revers transcriptaza in virtutea a
douS activity enzimatice adifionaie de care dispune:
1) activitate ribonucleazicS, ce-i permite s# hidrolizeze ARN din hibridui
ARN/ADN (de unde i desemnarea sa ca ribonucleaz# II);
174
2) activitate ADN polimerazidt ADN - dependents.
Primerul foiosit de revers IranscriplazS in activitaiea sa. polimerazicS este,
surpiinzS- tor, un ARNt inglobat in particula viralS (preluat in cursul unei
infecfii anterioare).
ADN rezultat prin revers transcriere se insert in genomul gazdS putanduse exprima in proteine, intr-o anumitS conjuncture.
Cum numeroase virusuri ARN sunt oncogene i genomul viral este
motenit, se considers eft fiecare subiect uman este purt&torul unei
oncogene neexprimate, ca rezultat ai pfttrunderii in organism a unor astfel
de virusuri ARN (retrovirusuri), intr-un moment al evolufiei. Dacft apare o
condifie care sft le favorizeze exprimarea, deci dacft vor fi transcrise i
traduse, celula se malignizeazft prin acfiunea unor proteine ce realizeazft
transformarea neoplazicS (adesea kinaze).
Revers transcriptaza comite gregeli, neavand activitate 3->59
exonucleazicft; acest fapt ar constitui una dintre explicable varietftfii mari de
tulpini virale producfttoare de boalft.
Un retrovirus, prin excelenfft versatil,virusul imunodeficienjei umane (HIV)
este rftspunzator de sindromul imunodeficienjei dobftndite (SIDA).
175
if ;
yii-i;
il f >
maturi, care vor servi ca matrite pentru sjnteza -unuia sau a mai
mul1or.-..nolipeptideJgcygnte specif ice, de aminoadzL^
Timpul de supraviejuire a ARNm in celuia este variabil. ARNm bacterian are
o..........................................................................................viajh
foarte scurth (2-3 minute); dupd ce servete la sinteza catorva zeci...de
.exemplare din proteina pe care ^itccifica' egej^rMaLdb^micIeaze.
La eucariote, ARN, are o viafh de ordinal orelor; aceasta diferenfd este
uor de infeles finand seama de fluctuafiile mari de mediu la care o bacterie
se obstineazir sh se adapteze continuu.
177
AKN tie transfer (ARNt)
Moleculde de ARN, sunt molecule mici (70-90 nucleotide), monocatenarg,
In care procentul de baze complementare este deosebit de mare fajd. de
celeialte specii de ARM* 'Raportul A+G/U+C din ARNt este apropiat de 1.
ARNt nuclear, nu gi cel mitocondrial, prezintS o conformajie in .dome de
trifoiA avand 4 zone deperechi complementare gi 3 necomplementare.
expulzatecu bucle (Fig. IV.25).
5*
-<?QbHU (iif^dmahtd^rui
H2
/
o DHU
Vt
-o~o.
95&
1
o9i
3'
9
c
9
Brat
aminoacid
9t
O
\
O-O-O-O-O
.o-q
Bra( 9
rwcP
O-O-O-O-fXj^P
b'O~0h
u'Q9
0
1
p
p
'0-0 Braf adlponal
~o-oy
O-c
! I 1 Bra} anticodon
Fig. IV.25 - Structura tridimensionala a ARNt
La capStul 5 terminal, cei mai mulji ARNt au restul acid guanilic, iar la
cap&tul 3\ top. au secvenfa nudeotidicS CCA. La cap&tui buclei inferioare se
g&segte aga-numita portiune anticodon, care variazS cu natura ARN t. i alte
secvenje nucieotidice sunt important in procesele de recunoagtere; de
exemplu, in brau]JDHU exists o secventS. nucleotidicS care recunoaste. gi
se leagS la aminoacil-ARNr"Sintetaza, enzimS care... JncarcSRAELLxn un
aminoacid specific, activat. In braful PRC, o anumitS secvenja nucleotidicS
asjgurS legarea la ribozom a complexului. aipinoacil - ARN
178
o
Toate tipurile de ARNf au on procent neobisnuit de mare de baze rninore;
A.
HN NH
OH OH
Pseudouridina (^V)
OH OH 4-Tiouridina
O
OH OH
Dihidrouridina (DHU)
CH3
HOH,
k
f3C \
O'
OH OH
Ribotimfdina (T)
OH OH 3 - MetifcitidinS
N
J
HOHfC |
C?
OH OH Inozina
In procesul de biosintezS a onitemeier, ARNt are de Indeplinit dooa func(ii:
1. Transports aminoacizilor activati in faza solubilS, la ribozomi, sub formS
de complcxe aminoacii - ARM. FiecSraia dintre cei 20 deaminoacizi care intrS
in stnictura profeliefof il corespunde cel pujin un ARNt specific. Exists, cel
pujin 20 de lipuri de ARNt. In general, exists mai mul{i ARNt specific! pentru
un aminoacid - ARNt izoacceptori - fapt explicabil prin caracterul degenerat al
codului genetic (un aminoacid poate fi specificat de mai mulfi codoni).
Legarea aminoaeidului se face la reziduul adenilic din secvenja CCA i
constS in stabilirea unei legaturi macroergice intre -OH din 35 al adeninei i
restul acil al aminoaeidului (vezi sinteza profceineior).
2. Adaptarea gninoaciduiui transportat In dreptul codpnului de pe
ARNL.care-1 specifics. AceastS racordare a. aminoaci3uiui este posibilS prln
recunoagterea codon-anticodon. Porjiunea anticodon din ARNt este
complementers. succesiunii de nucleotide din ARNm ce codified aminoacidul
transportat de ARNt respectiv gi ca atare cele douS regiuni pot stabili legSturi
de hidrogen (Fig. IV.26). ARN, este relativ slabil la.procariote gi mai putin
stabil ia eucariote.
Fig. IV.26 - Recunoag- terea codon - anticodon
3'
A ~ aaf
C
C
A ~ BB2
C
C
iM
m
m.
m
m
m
'Id
t
in
M :: i
179
ARN ribozomal (ARNr)
Moleculele de ARN, sunt rnacrornolecule flexibife. si deformafaiM, care
contin. zone dubiu catenare Mrerupte de zone monocatenare,
Extrem de heterogen ca forrnS i inMrime, ARNt se fmparte, in funcjie de
constanta de sedimentare (S), care depinde de mSrimea i forma particulei,
in;
ARNr 23 S, 16 S i 5Ji la procariote i
ARNr 28 S, IB S, 5,8 S i 5 S la eucariote.
ARNr reprezinta tipul de ARN cel mai abundent (aproximaliv 75% din
totalpl .de ARN.. celular) i cel mai stabil metabolic..
ARNr se agregd cu prot:eine,"3Iverseiaii lipide, constituind particule
ribonucleoproteice denumite rihozomi (desccperiji de George Palade). Dupd
valoarea constantei de sedimentare, acetia pot fi 70 S la bacterii i 80 S la
eucariote.
Ribozomii pot disocia reversibil in dou& subunit5|i; 50 S si 3Q..JLpentru
procariote 1 60 S, Te^ectiyjjli^
La procariote, subunitalea mare. 50 S, contine ARM 23 S. ARN, 5 S si 34
tipuri de
3^ (dup& apartenenja la subunitatea mic& - small) (Fig. IV.27). Proteinele
ribozomale au roluri bine stabilite, nu in intregime descifrate, decurgand fie
din capacitatea cataliticS (peptidil transferaze, GTP-aze), fie din abi-litatea de
a construi arhitecturi stereospe- cifice, esentiale in recunoasterea si
lesarea diverselor tipuri de ARN implicate, in biosinteza proteinelor (ARN m,
aminoacil-ARN,).
70S
80S
50 S
SOS
ii
60S
40 S
ARNr 5 S ARNr 16 S
ARNr 5 S
ARNr 18 S
ARNr 23 S 21 poiipeptide
ARNrS,8 S
+
+
~ 33 poiipeptide
34 poiipeptide
ARNr 28 S
+
~ 46 poiipeptide
Fig. IV.27 - Ribozomii ia procariote i eucariote
180
Ribozomii. constituie sediul hiogntezei ^roteirjel^L^Aceste unit&fi
mecano-chimice permit conlucrarea ARNm, ARNt i ARJ^lnTetLrea desfdgurdrii
procesului de sintezd a proteinelor.
Pe suprafaja fiecdrui ribozom exists doud situsuri i anume: situsul
aminoacid, care leagd ARN. portS.tor ai unui ...aminoacid, si situsul peptid,
care ieagd ARN, purtStor al unui jant polipeptidic.
Subunitatea micd a ribozomului (30 S sau 40 S) ieagd ARNL.intr-un loc
specific^ astfel incat ribozomul sd se afle cu locusul peptid in fafa codonului
care specifics aminoacidul initiator i cu locusul aminoacid in fata codonului
ce specified, aminoacidul 2.
Legarea subunitdfii man de complexul ARNm - subunitate micd determine
formarea ribozomului functional. ARNm i ribozomii se pot deplasa unui in
raport cu celSlalt, ribozomul giisand pe ARNm. Aceastd deplasare reciprocd
permite trecerea tripletelor de pe ARNm, care specified aminoacizi suceesivi
in lanful polipeptidic, prin fafa locusului aminoacid, indicand
acestuiacomplexul aminoacil-ARNt ce trebuie legal. Aminoacizii vor fi
incorporafi in molecula proteied In curs de edificare. Dupd sinteza unei
molecule proteice, ribozomii disoeiazd, permifdnd reluarea sintezei unei noi
molecule proteice.
Cercetari recente sugereazd participarea cataliticd a ARN. in sinteza
legdturii peptidice. ,
~
~
ARN nuclear de mkl diinensiuni
O a patra categoric de ARN intalnitd la eucariote, despre care no se tiu
ined multe lucruri certe, este reprezentatd de ARN de mici dimensiuni - scurt
(small nuclear RNA).
Acest tip de ARN este constituit din aproximativ 100 de nucleotide i
confine un procent mare de uridind. Existd sub forma mai multor specii
moleculare notate U1? U2 etc.
Se gdsete cu preeddere in nucleu, asocial cu proteine, generand
ribonucleoproteine desemnate dupd tipul de ARN scurt: snRNPUj, snRNPU 2
etc. (small nuclear ribonucleo- proteins = snurps).
snRNP(U!, U2, U4, U5 i U6) intervin in' excizia infronilor din ARNm transcript
primal*, snRNPU3 sunt implicate in prelucrarea ARNt transcript primar iar
snRNPU7 pare responsabild de formarea capdtului 5 al ARNm precursor
pentru histone.
TV.4.2. BIOSINTEZA ARN PE MATRIJA DE ADN Transcrierea
Modalitatea majord, specified, de sintezd a tuturor specifier de ARN, atfit
la procariote cat i la eucaiiote, este transcrierea, respectiv sinteza ARN pe
matrijd de ADN.
In vivo, transcrierea este asimetried in sensul cd, intr-o anumitd regiune a
genomului, se copiazd o singurd catend a ADN desemnatd drept catend
matritd (template) sau necodificatoare, cealaltd catend a ADN, purtdtoare a
informatiei cu privire la sinteza unui lan{ polipeptidic, in spejd, este catena
codificatoare. Succesiunea bazelor in ARN nou sintetizat (ARN transcript
primar) este aceeai cu succesiunea bazelor azotate din catena codificatoare
(cu excepfia inlocuirii timinei cu uracilul).
Reia|ia catend template - catend codificatoare se schimbd funejie de gena
transcrisd, sensul sintezei ARN rdmdnand obligatoriu 5->3 (Fig. IV.28).
181
Gena A Gena B Gena C
Gena B
*__________-.... ^. ....................t
Catena matrifa (template)
Fig. IV.28. Transcrierea asimetrica a ADN
Biosinteza ARN, spre deosebire de replicaxe, proces care angajeazd
sirnuitan Intregul cromozom, vizeazd numai anumite porfiuni de ADN, acelea
po/memze/
Fig. IV.29 - ARN polimeraza se afla cu situsul catalitic in dreptul semnalului de
inijiere a transcrierii
3. ARN polimeraza, prezentd cu situsul activ in dreptul semnalului de
inijiere a transcrierii (Fig. IV.29), catalizeazd formarea primei legdturi fosfat
diesterice in Ire nucleotidul +1, aproape invariabil until purinic, i nucieotidul
+2.
Enzima, care conjine pe subunitalea P un situs de legare a nucleotidului
nou introd'us i altul de legate a moieculei de ARN in curs de edificare, se
deplaseazdfn pozijia +3 pe template -i continud sinteza, Subunitalea a, care
se disociazd din complexul ARN polimeraza -ADN- ARN dupd fonnaiea
primelor legdturi fosfat diesterice, se asqciazd unei alte molecule de ARN
polimeraza miez i incepe o noua runda de transcriere (Fig. IV.30).
0 ; Id:
,::.V V ;
is-
183
t:\
m'.uh
sir. u; :
f
f-e-c-c'
urp
CTP
ARN-po/meraza avansaazA (disoc/erea facforv/uiG)
M-U-C-G-G-C
$*
t.
ARN-oo/imeraza (OJ Catena, rSUDiimtoteeCr t&J template
+
A UCtrGCUUA CG +> +
Fig. IV.31 - llustrarea procesului de transcriere cu sublinierea rolului ARN
polimerazei i a factorilor o ip
IL Elongarea lantului polinucleotidic
La^ capStul 3 terminal al ARN in cretere se adaugS ribonucleotidele
dictate de matri^S. Toate evenimentele transcrierii decurg in bucla de
transcriere care cuprinde 1247 perechi de baze ADN-ARN. Pe mSsurS ce
molecula de ARN transcript primar se sintetizeazS, are loc disocierea sa din
duplexul hibrid cu catena template, permijandu-se refacerea ADN duplex,
asistatS, ca i desrSsucirea, de topoizomeraze, parte integrants a
complexului de transcriere.
Viteza de elongare nu este constants, ea depinzand de secvenfele de ADN
citite de ARN polimerazS.
III. Terminarea transcrierii
Exists cel pujin douS modalitSfi de terminate a transcrierii: rho (p)
dependents i rho independents, rho fiind un factor proteic reglator (Fig.
IV.31).
185
Terminarea p independents este impost de faptul eft transcrierea unor
secvenje de ADN specifice devine neconvenabilft, din punct de vedere
terniodinamic, complexuiui de elongate. De exemplu: o secvenjft bogatft in
direepa de transeriere
AGCCCGC\ TCGGGCGL
GCGGGCT
CGCCCGA
TTTTTTTT- AAAAAAA ADM
AAAAAAA
ADN1
De remarcat eh. transcriptul primar ARNm procariot este mai lung decat
insfti gena de transcris. ARN polimeraza transcrie nu numai gena
i.Hh
7A
caveta
TATA
+1
gena structural^
Fig. IV.33 - Elemente implicate in transcriere la eucariote
.MA
187
Funcjia aces tor elemente de control se realizeazd ca urmare a
interacfiiinii cu factor! proteici, respecliv factori de transcriere, avand ca
efect modificdri conforrnajionale in molecula de ADN, modificdri ce pot fi
favorabile sau defavorabile transcrierii.
Secvenjele enhancer sunt asociate cu gene care se exprimS selectiv in
diverse Jesuturi, deci relajia lor cu diferenjierea celularS este de admis.
Tot din clasa secvenjelor interesate in expresia genelor fac parte i
anumite elemente care mediazd rdspunsul la diferite semnale - motiv pentru
care sunt numite elemente de r&spuns*' (responsive elements) foarte
asemdndtoare cu enhancerii.
Sunt identificate eleme-nte de rdspuns44 la hormonii glucocorticoizi,
/1872 nucleotide \
3'
Fig. IV.34 - Transcrierea genei de ovalbumina, cu obfinerea transcriptuiui
primar, urmat# de excizia introniior; ARNm matur rezultat va servi ca matrifa
pentru sinteza ovalbuminei
Constatarea c# ARNm nuclear este mai lung decat a.celai ARNm ajuns in
citoplasm# a dus la concluzia c# ARN polimeraza realizeaz# o copie primar#
identic# cu intreaga gen#, apoi intronii sunt excizafi i exonii se leag#
formSnd ARNm matur, traduclibil (Fig. IV.34).
Departe de a fi un fenomen izolat, discontinuitatea genelor s-a dovedit a fi
un fenomen cvasi-general. Cel mai adesea, secvenfele intron au dimensiuni
cu mult mai mari dec#t ce-le exon (de peste 100 de ori), ceea ce ar constiui
o explicafie parfial# a faptului c# numai 5-10% dm genomul eucariot
repiezint# secvenfe codificatoare pentru proteine i ARN.
Dac# secvenfele de nucleotide dintr-un ADN codificand o protein# nu
sunt adiacente, ci secvenfele codificatoare sunt intrerupte de secvenfe
necodificatoare, este evident c# la eucariote nu se mai poate vorbi de
colinearitatea gen#~protein#, ci numai de o colinearitate exon-fragment din
189
Excizia intronilor din transcriptele primare
Excizia intronilor din ARN precursor, biologic inactiv, se realizeazd pentru
toate tipurile de ARN' in nucleu, sub acpunea unor enzime specializate, care
trebuie sS recunoasci' secvenjele de baze la jonc|iunea intron-exon, sS
asigure juxtapunerea corectif a substratelor i sit efectueze actul catalitic.
In general, intronii au la cap&tul 5 secvenfa GU iar la cel 3' secvenja AG
incadrate adesea in secvente consens mai lungi. Exists o categoric de introni
in care, in amonte fap. de capStul 3 a! intronului (50 nucleotide), este
prezentS o secven{S consens, parte a unui situs de ramificare, confinand
invariabil adenozina; in drojdxi, secvenja consens, diferitS de cea a
vertebratelor, este: 5-TACTAAC-3\
Mutajii in vecinStatea unei jonc{iuni intron-exon, cu precSdere in
3*
intron
Adaos
guanozina
2.
4
5*----
intron liniar
~ cucucuuExoni reunip
tntron excizat
Exons reunifi
Fig. 35.b - Mecanismul transesterificarii Tn reacjia de excizie
Lucrandu-se in medii in care contaminarea cu protein^ era excius& (ARNr
obfinut prin tehniciie ingineriei genetice i mi prin extraejie din nucleu),
concluzia indubitabilS a fost aceea c& ARM' catalizeazii excizia intronilor i
coaserea propriilor exoni (Fig. IV.35a i b). Acestui tip de ARNr, izolat din
Tefcrahymena termophila, i s-a dat numele de ribozim pentru a cpnsfinji
activitatea sa cataliticl Spre deosebire de enzimele clasice, aceast& enzimft
avand activitate autocataliticS nu se regsete neschirnbatii dugii actul
catalitic.
In l&murirea mecanismului de acfiune a ribozimului decisive a fost
constatarea ca la unul dintre capeteie intronului excizat se gSsete on rest
de guanozinS care nu exista in ADN. GIF sau guanozina nu erau folosile in
scopuri energetice, ci ca agent nucleofil apt sS desfacSt leg&tura fosfat
diestericft de la unul dintre capeteie intronului.
Legarea guanozinei la un loc specific din porjiunea intron o orienteazS.
astfel incat o gnipare -OH a acesteia s& poafi ataca legHtura fosfat diestericfi
de la joncjiunea exon- cap&tul 5 al intronului. La capital 5s a! exonului exists
o secvenp. de 6 nucleotide pirimidinice CUCUCU care se imperecheazS cu o
porjiune din intron GGGAGG. Agezatft convenabil steric, guanozina atacft
joncfiunea exon-intron la capital 5\ Aceasfl reacpe de transesterificare are ca
rezultat legarea guanozinei (G) la adenM (A) i eliberarea capital ui 3 al
exonului I. Uracilui (U), devenit capital 3-OH liber al exonului I, efectueazii o a
doua transesterificare cu uracilui de la capital 5' al exonului II, realizandu-se,
oda$ cu excluderea intronului, coaserea celor doi exoni (pieces de splicing)
(Fig. IV35).
De remarcat C& activitatea catalitic^ a ARNf este conditional# de
integritatea conformajiei sale, intrucat, intocmai ca o enzimii, el trebuie sa
asigure juxtapunerea
corecta a substratelor. Excizia intronilor i coaserea exonilor sunt accelerate,
grape efectului autocatalitic al ribozimului, printr-un factor de ordinul a zece
192
Excizia intronilor die ARNn
Excizia intronilor din ARNm eucariot se desf#oar# similar exciziei
intronilor din ARHr, presupunand, de asemenea, succesiunea a dou# reacjii
de transesterificare (Fig, IV36). Deosebiriie fa{# de excizia intronilor din AKNr
constau in faptul c# agentul nucleofil care opereaz# prima reacjie de
transesterificare nu mai este GTP (sau guanozina) liber, ci un nucleolid in
cadrul infronului, iar excizia intronilor nu este autocatalitic# (gnipul 03 de
intjnoni).
Intr-o prima etap#, gruparea 2-hidroxi a unei unitSji de adenozin# atac#
nucleofil iegdtura fosfat diesteric# ce unegte exonul I (5) cu intronul,
eliberand exonuL LegStura noufi 2\5-fosfatdiesteric# stability da structurii
m
m
i
AH
1
M:
: i;:
195
Intron
ADN
Transcript
pwlmmr
ARNt
4
Excizia intrciiyMi
H
0
ARNm transcris
Mu$chi striatl (STR) '
(N)
Muschi striatl '(STR)'
Creier
Fig. IV.39 - Organizarea ganei a-tropomiozinei ia obo!an; alternativeie de
transcriere
Pe lang# excluderea intronilor prezenfi in ARN eucariot (i in foarte pufine
procariote - mai ales din dasa bacteriilor arhaice), numeroase prelucrSri
adifionale, diferind cu tipul de ARN, des#var;esc trecerea de la ARN
transcript primar ia ARN matur, functional, succesiunea ior temporal^ fiind
stability cu aproximafie.
Spre deosebire de ARNm procariot care este tradus in timp ce este
sintetizat, deci se nate matur, la eucariote ARNm devine functional numai
dupft modificarea capetelor 5' i 3\ Cap&tul 5' al ARNm este modificat
covalent intr-un proces considerat a fi cotran- scripjional, intrucat se
realizeazS chiar inainte ca deplasarea ARN polimerazei II din situsul de
inifiere a transcrierii s# fi avut loc. Modificarea const# in adSugarea unui rest
de 7-mefiI guanozind legal prin leg&turd 5-5 tdfosfat de transcriptul primar
(Fig. IV.40).
La unele specii modificarea la capdtul 5 include i metilarea grupMrii T
hidroxi din nucleotidul ultim, uneori i penultim, din fostul transcript primar.
Marcarea cap&tului 5 al ARNm este necesardintrucat;
- protejeaz# molecula de acjiunea 5-3* exonucleazelor;
determine specificitatea celulara
Modificari posttranscriere adifionale
Modificari adifionale ale ARN raesager eucariot
197
0
1
-O-P = O
I
0
1
-o-p = o
I
0
1
CH.
Baza
Q~~CH?
~op=o
I
0
1
CH2
Baza
O CH?
~QP = Q
Fig. IV.40 - Marcarea oapatului 5 ai ARNm
- favorizeazh ina^erea, fiind recunoscutd de cStre ribozom ca semnal de
inijiere a sintezei proteinelor;
- reprezintd un semnal de recunoatere pentxu enzirnele care-l vor folosi
ca substrat in cursul prelucrMlor ulterioare.
Capital 3 al ARNm este adesea modificat covalent prin poiiadenilare
formarea cozii poli A (200-300 nucleotide).
Poliadenilarea se produce in aval fapl de o secvenf& de semnalizare" a
clivdrii i poliadenildrii i este rezultatul acjiunii concertate a douS enzime: o
endonucleazft care taie molecula de ARNm in vecinStatea secVenJei de
semnalizare: i o poli-A-polimerazS care, fM $& necesite un template,
cataiizeazS polimerizarea resturilor adenilat.
Semnificafia poliadeniklrii la capStul 3 al ARNm este obscurS; jinand
seama c& in cursul existenjei sale in citoplasmS coada poli A a ARN m sufeifi o
scurtare progresi- v5, ca urmare a acjiunii unor 3,~~>5 exonucleaze, se
poate admite c& scopul cozii este acela de protecjie a regiunilor
codificatoare. i totui, ARNm pentru histone i interferon, cel pujin, nu sunt
poiiadenilaji.
In vitro, prezenfa cozii poli A s-a dovedit extrem de utild. Ea servegte ca,
djiator in sinteza ADN pe matrifh de ARN, dec! la objinerea \DNC (C pentru
complementar), utilizat in tehnicile de clonare ca i la izolarea i purificarea
ARNm din totalul de ARN celular din care el reprezint o mich parte.
Prelucrarea ARNm eucariot se incheie cu excizia intronilor (vezi anterior).
Modificari adijionale ale ARN de transfer
La procariote, ca i la eucariote, transcriptul primar confine mai mulfi ARNt
precursor!
(multimeric). ARNt precursor! monomerici, avand extensii 5i 3' relativ
scurte, se obfin prin acfiunea unui mare num&r de ribonucleaze (Fig. IV.38)
In ob|inerea capdtului 3 al ARNt matur este implicate o ribonucleazd cu
activitate endonucleazictt i anume Ribonucleaza P (RNA-aza P), constituM
dintr-o subunitate ARN de c&teva sute de nucleotide i o protein^ cu
caracter bazic, cu masft molecular# de aproximativ 14 kD.
198
In vitro, in prezenja unor concenlrajii maxi de s3ruri, proteina s-a dovedit
a nu fi necesara actului catalitic, Activitatea enzimei in vivo impune prezenfa
ambelor subunit&Ji, actul catalitic fiind instl realizat, aga cum a demonstrat
S. Altman, de c8lre subunitatea ARM, erne poate fi considerate un ribozim.
Prezenja proteinei bazice reduce, ia concentrajii fizioiogice de siiruri, repulsia
ARN r 16 S
precursor 30 S
23 S
ARNt (4S)
metiSare +
hidroliza enzimatica
25 S
ARNt
ARNt
ARN r 23 $
SS
hidroliza
enzimatica
5S
ARN r
Fig. IV.41 - Modificari post transcriere ale moiecuielor
de ARN,
precursor 45 S
18 S
5,8 S
28 S
median
hidroliza
enzimatica
H ..
grupari
metrl
ARN r
ARN r
ARN r
18 S
5,8 S
28 S
Modificari adiflon&le ale ARN miciear de imict dimensitmi
Sintetizat de c3tre ARN polimeraza II, acest tip de ARN transcript primar
va primi la cap&tul s3.u 5 un rest de 7-metil-guanozin& (ca i ARN,*) in
cursul unui proces contranscripfional.
Dup3 ce ARN scurt ajunge in citosol, o metilaz& locals il hipermetileazS
dand un capSt 5 ce confine 2,2,7 trimetil guanozinS (m3G); metilarea se
realizeazd numai dupS asocierea ARN nuclear scurt cu proteine specifice
sintetizate in citosol.
Ribonucleoproteinele rezultate sunt importate de nucleu, dei proteina nu
are semnalele caracteristice proteinelor de import.
S-a demonstrat c3 introducerea m3G este necesarS transportului in
nucleu, mediat receptorial, ca i legarea prealabilft la proteine.
200
Din necesitatea ca particuia s# aM ambele semnaie pentru a fi importat#
s~ar putea deduce c# numai particuiele corect asamblate au acces in
nucleu, unde au de indepiinit funcfii specifice.
IV.4.4. BIOSINTEZA ARN PE MATRIjA DE ARN
Unele virusuri con fin ca material cromozomial ARN, Replicarea acestui
ARN in celula gazd# are Ioc sub acfiunea unei replicaze, o ARN polimeraz#
ARN-dependent#, analoag#, ca mecanism dt acfiune, ARN polimerazei ADNdependenll.
201
Tabelul V. 1.
Codul genetic
//
/
U
C
UUU
UCU
Phe
u
UUC
UCC
Ser
UUA
UCA
Leu
UUG
CUU
UCG
cue
Leu
CUA
CCC
Pro
CCA
CUG
CCG
GCU
A
UAU
Tyr
UAC
UAA
Codon
terminator
UAG
CAU
His
CAC
CAA
Gin
CAG
G
UGU
Cvs
UGC
Codon
UGA
terminator
///
U
C
A
G
UGG Trp
CGU
CGC
Arg
CGA
CGG
AUU
A
AUC
He
AUA
ACU
AAU
Asn
AGU
Ser
ACC Thr
ACA
ACG
AAC
AGC
C
A
AAA
Lys
AAG
AGA
Arg
AGG
GAU
Asp
GAC
GGU
GGC
Gly
GGA
GGG
AUG
Met
GUU
GCU
GUC
Val
GUA
GCC
Ala
GCA
GUG
GCG
GAA
Glu
GAG
204
Caractehsticile codului genetic standard
~ intrucat nu exists semnale care sd indice inceputul i sfaritul fiecdrui
codon, citirea mesajului genetic se face neintrerupt, de la un codon start
pand la an codon terminator. Punctul de start in citire este reprezentat de un
semnal de inijiere incluzand, invariabil, codonul de inijiere AUG. Codul
genetic nu are deci, virgule, semne de punctuajie.
- Codul genetic este degenerat, mai exact, redundant.
Dintre cele 64 de triplete 61 codified aminoacizi particular! Cum nu
exist'd. decat 20 de aminoacizi ce trebuie specificaji, rezultd cd unui singur
aminoacid ii pot corespunde mai multe cuvinte cod, Intr-adevdr, aa cum se
vede din tabelul V.l. numai triptofanul i metionina sunt specificaji de cfUre
un singur codon, in timp ce ulji aminoacizi, cum ar fi de exemplu serina i
leucina, sunt codificafi de catre 6 codoni fiecare (codoni sinonimi).
Degenerarea codului, respectiv existenja mai multor cuvinte cod pentru
acelagi aminoacid, se manifesto in special la nivelul nucleotidului 3 din
codon. Intr-adevdr, este uor de observat cd, in general, primele doud baze
ale codonilor sinonimi sunt constante. Crick a conchis cd asocierea
nucleotidelor 1 i 2 din codon cu nucleotidele 3 i 2 din anticodon este fermd,
respectand principiul complementaritdjii A, U i C, G, in timp ce
imperecherea nucleotidului 3 din codon cu 1 din anticodon este, in general,
laxd, Aceasta s-ar datora particularildjii nucleotidului 1 (capdtul 5) din
anticodon de a se imperechea i cu alte nucleotide, tncdlcand regulile
Watson-Crick (A, U; C, G). De exemplu, in pozijia 1 a anticodonului, uracilul se
poate lega cu A dar i cu G (slab), iar guanina se poate lega cu C, dar i cu U
(slab), din pozijia 3 a codonului. Frecvent prezentd ca nucleotidul 1 in
anticodon, inozina se poate lega de citozind, ca i de uracil sau adenind, dar
legdturile sunt slabe. Cand insd in pozijia 1 a anticodonului se gdsete C sau
A, acestea se pot lega numai dupd regula Watson-Crick cu G, respectiv U din
pozijia 3 a codonului, stabilind legdturi ferme.
In pozijia 1 a anticodonului existd deci, in mulji ARNt, o baza ovdielnicd",
nedccisd\ oscilantd'\ dispusd sd incalce regulile de complementaritate
205
- Codul genetic nu este ambigou, niciodatS acelai triplet no semnific&
doi aminoacizi diferiji.
- Codul genetic este universal-toate viepiitoarele utilizeazS acelai cod
genetic pentru a traduce genele lor specifice in proteine specifice, O abatere
surprinzStoare de la universalitate ne releva codul genetic al mitocondriei.
Astfel, codonul AUA corespunde metioninei, i nu izoleucinei, codonul UGA
corespunde triptofanului, nefiind nn codon non sens, codonii AUA i AUU sunt
codoni de iniJiere i nu codonii ce specific^ izoleucina .a.m.d..
V.2. BIOSINTEZA PROTEINELOR
Edificarea unei macromolecule proteice este, probabil, cel mai complex
I 1! II
NH2
Aminoacil-ARNt
Reacfia global*! de activare a aminoacidului poate fi scrisd:
aminoacid + ARN, + ATP >- aminoacil ARNt + AMP + 2P
Pentru activarea fiecarui aminoacid se consumd doud legaturi
macroergice.
Atat reacfia 1 cat i reacfia 2 sunt catalizate de ligaze-aminoacil ARNt
sintetaze, care manifesto o extremd specificitate atat pentru aminoacid cat i
pentru ARNt, evitandu-se astfel eroarea legSrii la un anumit ARNt a altui
aminoacid decat cel al cfirui codon este complementar cu porfiunea
anticodon a ARNt dat. Pe langd local de legare a ARNt i a ATP, enzima este
inzestratd cu incd doud locusuri, unul pentru legarea aminoacidului, avand o
dimensiune adecvatd acestuia i altui, hidrolitic. Dacd un aminoacid ce diferd
minimal de aminoacidul consacrat se leagd la locusul de legare a
aminoacidului activat, enzima recunoate aminoacidul impostor i-I
exclude prin hidrolizd. De exemplu, dacd in loc de izoleucind se leagd valina,
care diferd doar printr-o grupare metilenicd de prima, enzima corecteazd
imediat aceastd eroare, expulzand valina din locusul hidrolitic, care are
dimensiuni potrivite pentru complexul AMP~valind, nu insd i pentru
AMP~izoleucind. Prin hidroliza complexului valil-AMP, valina este eliminatd i
enzima leagd corect izoleucina.
Fidelitatea procesului de traducere-respectiv adaptarea corectd a
aminoacidului pe matrices de ARNm i stabilirea secven|;ei de aminoacizi
caracteristicd proteinei de
sintetizat este, in mare mdsurd, asiguratd de capacitates de autocontrol a
ARNt sintetazelor.
IL Iniiierea laniului polipeptidic
Citirea de cdtre ribozom a ARNm se face in direcfia 5-3 a acestuia,
proteina edificandu-se de la capdtul amino-terminal spre cel carboxiterminal.
Inifierea presupune ca primd etapd legarea subunitdfii 30 S a ribozomului
la ARNm. Legarea este mediatd de unul dintre cei trei factori de inijiere i
anume de factorul de inifiere 3 (FIS), care are i rolul de a preveni
reasocierea prematurd a celor doud subunitdfi ribozomale. Etapa necesitd
prezenfa GTP. Legarea corectd a ribozomului in dreptul codonului de inifiere,
ce specified aminoacidul N-terminal, este esenjiald pentru citirea corectd a
mesajului genetic. La procariote, aminoacidul N-terminal este, invariaUl, Nformil-metionina. Acestui aminoacid ii corespunde pe molecula de ARNm
codonul AUG (uneori i GUG), cel care specified i metionina nefonnilatd din
209
format din ARNt11,Kt i metionind, sub acjiunea unei transformiiaze avand ca
donator de grupare formil N10-formi!tetrahidrofoiatul (N10-CHO-FH4):
metionina + ARNtfm9t + ATP * rnetionil~ARNthnet + AMP + PR metioni!
ARN/met + N10 - CHO ~ FH4 - formlbmetionil - ARN/' + FH4
De suhliniat faptul ca existd doufi specii diferite de ARNt purtdtoare ale
metioninei: ARN(niel i ARNtfme\ fiecare aptd sd lege metionina generand
metionil~ARNtnie\ respeetiv metionil~ARNtfnwt. Dintre aeestea numai metionilARN/1 este susceptibild la formiiare generand aminoacidul initiator care se
va lega la codonul de inijiere, i nu la oricare codon AUG de pe ARNm, in
dreptul locusului peptid de pe ribozom care-1 accepts (Fig. V.l).
In cea de-a treia etapd a inijierii, subunitatea ribozomald mare, 50 S, se
leagd la complexul anterior format, cu eliberarea simultand a factorilor de
inifiere i hidroliza GTP. Se formeazd, astfel, ribozomul functional desemnat
drept complex de inifiere.
Formil-metionil~ARN,fmct, legal pe principiul complementaritdfii bazelor la
codonul de inifiere, ocupd locusul peptid de pe ribozom (ocupat altfel numai
de lanful polipeptidic in cretere), Locusul aminoacid al ribozomului este
deocamdatd liber (Fig. V.l).
III. Ehmgarea ian^ului polipeptidic
Procesul const! in addugarea succesivd de aminoacizi pand la formarea
proteinei de sintetizat.
Addugarea fiecdrui aminoacid parcurge mai multe etape, ce se vor
exemplifica pentxu aminoacidul 2 din catena polipeptidicd.
a. Recunoaterea de cdtre ARNf purtdtor al aminoacidului doi a celui de-al
doilea codon de pe ARNni. Fixarea corecld a aminoacil~ARNt pe locusul
aminoacid de pe ribozom este asiguratd atat de interacjiunea codonanticodon cat i de interacfiunile ce se stabilesc intre o anumitd porfiune a
ARNt i locusul aminoacid (A). Aceastd etapd a eiongarii necesitd prezenfa
unui factor de elongate (Tu) legal la GTP, ca elector alosteric (Fig. V.2).
b. Formarea legdturii peptidice prin transferul restului formii-medonil pe
gruparea amino a aminoaciI~ARNt din locusu aminoacid. Reacfia este de
fapt o reacjie de acilare a grupei. amino din aminoacidul doi, catalizatd de o
peptid.il transferazd, factonii de elongate G, inclusd in subunitatea 50 S.
Locusul peptid este, in acest moment, ocupat de ARNtfnicL, iar locusul
aminoacid este ocupat, nefiresc, de un ARNt purtdtor al dipeptidului format
(Fig. V.2.)
Energia necesard fonnarii legdturii peptidice este furnizatd de energia
eliberatd la desfacerea legdturii aminoacid inifiator-ARN, corespunzdtor.
c. Glisarea ribozomului de-a lungul ARNm pe o distanjd de un codon spre
capatul 3 al ARNm. Simultan sire loc hidroliza ARNrfmet (fost purtdtor al
aminoacidului 1) cu eliberarea sa in citosol. In acest moment, locusul peptid,
ajuns in dreptul codonului 2, este ocupat de ARK, purtdtor al dipeptidului, iar
locusul aminoacid, ajuns in fafa codonului 3, este gala sa accepts ARNt
purtdtor al aminoacidului 3 (Fig. V.2). Aceastd
210
Pozitia P
Pozitia A
Pozitia P
Pozitia A
214
Biosinteza proteinelor decurge cu o vitezd impresionantd (un lanj
polipepiidic de 100 de aminoacizi este edificat de cdtre un ribozom de
Escherichia coll in numai 5 secunde). Pentru a~i adecva fondul de proteine
necesit&Jilor extrem de variable, impose de fluctuafiile de media,
procariotele cupleazd procesu! de transcriere cu cel de traducere; pe m&surd
Proteina - aa ( N terminal)
7
1
+ PP
Cys -aa-aa-aa ( C terminal)
I atifatici S - farnezil
Fig. V.5 - S - farnezilarea proteinelor
216
Glucoza
Giicoiiza
T
acetiJ CoA
i
i.
-4-^ mevinoiin
V
mevalonat .
i
!
CH3
t
I
izoperttenil pirofosfat (Cs) ( CHS = C-CH2 CH2 ~0(P)0 (P))
i
i
geranil pirofosfat ( CiB)
i
i
o0d
farnezil pirofosfat ( C15 )
YN/YN/Y^
/
/
/
/
/
&
\
\
\
\
\
\
X
coiesterol
farnezilarea proteineior
Fig. V.6 - Provenienja metabolica a farnezil pirofosfatului i utilizarea sa.
Donatorul radicalului farnezil este farnezil pirofosfatul, intermediar in
biosinteza colesterolului (Fig. V.6).
Frecvent, farnezilarea este acompaniat& de metil esterificarea grapSrii
carboxi-terminale.
Sunt susceptibile la S-famezilare polipeptide i proteine din clasa
proteineior G, GMPC fosfodiesterazele diverselor fesuturi (vezi hormoni) i alte
numeroase proteine corelate cu proceseie de transducjie a unor semnale
extracelulare sau implicate in diviziunea celularH
Hidrofobia radicalului farnezil ii justified prezenja in proteinele ancorate la
membrane iar depistarea lor in citosol sugereaz& c5 proteinele famezilate
servesc ca mesageri secunzi ai unor semnale extracelulare, mediate de
proteinele G.
217
O intreagS clasS. cie proteine farneziiate este reprezentatft de
oncoproleine; inhibitori ai farnezii transferazeJor sunl consiiierafi ca fiind
promij&tori in prevenirea maligniz&rii celulare.
cere
Degi acjiuriea compugilor men|iona|i se manifests, cu precMere, in
organismele procariote, unele sunt la fel de active i in cele eucariote
(puromicina, actinomicina D, a-amanitina).
218
VA REGLAREA BIOSINTEZEI PROTEINELOR
Mecanismele care regleazd viteza sintezei de proteine.au fost studiate in
special in cazul procariotelor. Activitatea acestora depinde foarte mult de
mediul in care trdiesc, de fluctuafiile in concentrafia substanfelor nutritive pe
care le utilizeazd. Procariotele au abilitatea de a-gi adecva echipamentul
enzimatic la natura surselor de azot sau carbon ce li se ofera; ele dispun de
doud tipuri de enzime:
a. enzime inductibile;
b. enzime represibile.
a Enzimele inductibile sunt acelea a cdror concentrate depinde de
prezenfa sau absenfa din mediu a unui compus denumit inductor. In general,
enzimele inductibile sunt implicate in cdi catabolice. In mod normal,
cantitatea de enzime inductibile in celule este foarte micd dar ea poate
create spectaculos atunci cand apare necesitatea utilizMi substratului
enzimei respective, substrat care se comportd ca inductor.
Un astfel de exemplu este JLgalaetozidaza, enzimd care catalizeazd
hidroliza lactozei gi care este prezenfcd iritr-un numdr minim de exemplare in
condijiile in care bacteria are la dispozifie altfe surse de carbon, de preferinfd
glucoza, dar care, in condi fiile in care lactoza devine sursa exclusive de
carbon, deci de energie, este sintetizatd in rnii de exemplare. Organizatd pe
principiul maximei economii, bacteria investegte aminoacizi gi energie
pentru sinteza enzimei numai atunci cand aceasta devine imperios necesanl
Transferarea bacteriei pe un mediu confinand glucozd determine sistarea
sintezei P-galactozidazei. Lactoza se comportd ca inductor al sintezei enzimei
ce o catabolizeazd. Utilizarea lactozei presupune participarea a incd doud
enzime i anume: o permeazd, care faciliteazd ti'ansportul (J-galactozidul'ui
in interiorul celulei gi o transacetilazd, a cdrei funcfie nu a fost incd
precizatd. Lactoza induce sinteza nu numai a galactozidazei ci gi a celorlalte
doud enzime. Inducfia prin lactozd este deci coordonatd, referindu-se la
toate enzimele implicate in utilizarea sa.
b. Enzimele represibile sunt acelea a cdror concentrafie depinde de
prezenfa sau absenfa din mediu a unui compus denumit corepresor. In
general, enzimele represibile sunt implicate in cdi anabolice.
O bacterie care cregte pe un mediu confinand surse de azot gi carbon
este aptd sd realizeze sinteza tuturor eeior 20 de aminoacizi. Dacd in mediu
se adaugd unui - oricare - dintre acegti aminoacizi, bacteria inceteazd sd
producd enzimele implicate in biosinteza aminoacidului respectiv.
Aminoacidul addugat produce represia sintezei tuturor enzimelor implicate in
biosinteza sa. Represia prin produsui final al unei cdi anabolice este deci o
represie coordonatd.
Explicarea in termeni molecular! a proceselor de inducfie gi represie
enzimaticd se datoreazd lucrdrilor lui Jacob gi Monod. In 1961, acegtia
elaboreazd modelul privind reglarea biosintezei proteineior la procariote,
reglare ce se efectueazd la nivelul trans- crierii, deci a sintezei ARNm.
<?
Proieine
cod/f/cnte
221
Complexul AMPC-P.R.AMPC, spre deosebire de represor, exercitd on efect
pozitiv m exprimarea operonului lac. Aceastft dubld modalitate de reglare
intalnitd la numeroase bacterii i vizancl diveri operoni, conferd acestora o
mare flexibilitate metabolic#, permi|andude $d-i rezolve problemele de
adaptare la mediul nutritional ce li se oferd ia un moment dat.
Teoria operonului oferd o explicate i fenomenului de represie prin produs
final a biosintezei en.zi.mdor. Genele implicate in biosinteza histidinei-de
exemplu-inceteazd sd se mai exprime trt sauafia in care sinteza histidine! in
celuld depdete utilizarea sa. i, ca urmare, aminoandul se acumuleazd in
mediu. In absen|a histidine!, represorul, sintetizat de cdtre gena reglatoare a
operonului His, este inapt sd se lege la operator. La concentra{ii mari de
histidind insS, aceasta se leagd la represor i induce o tranzitie
conformational^ ce favorizeazd legarea sa la operator. Histidina se
comport# ca un corepresor reuind sd sisteze transcrierea genelor ce
codified enzimele implicate in propria sa sintezd. Are loc astfel represia
coordonatd prin produs final (Fig. V.9). indepdrtarea histidine! din mediu,
respectiv utilizarea sa, produce derepresia transcrierii i dec! aparifia
enzimelor ce o sintetizeazd.
In termeni generali, modelul Jacob-Monod admite existenja unei gene
reglatoare care controleazd exprimarea anumitor gene structurale prin
inteimediul unei proteine, a edrei sintezd o specified, denumild represor.
Activarea represorului suprimd sinteza de ARNni, deci de proteine, in timp ce
inactivarea sa permite transcrierea genelor structurale controlate i sinteza
proteinelor respective.
(lepd
repMvdre
ffepresop in'acfiv ""
Operator s/foefora/a
~~ -------
l
I
AM:
m
/7Z//77<J
\
Frodos (corepresor)
,
<3
Complex represor- corepresor ac/yV
JU
0s
Gena s/roe/vra/anu es/t trooscr/sa
Fig. V.9. - iiustrarea mecanismuiui de reglare a biosintezei proteinelor prin
represie.
222
proteine represoare.
Reglarea la nivelul traducerii poate fi exemplificatS in caznl biosintezei
hemoglobinei trpextracte de reticulocite. Adaosul de hem la acestea
declanjeazS biosinteza glob'inei; suprimarea aportului de hem sisteazS
sinteza. Controlul s-ar exercita asupra unuia dintre factorii de inifiere i
anume factorul de ini{iere-2 (FI-2). Acesta poate trece reversibil dintr-o
formS defosfo, activS, intr-o formS fosfo, inactive, AceastS modificare
covalentS a FI-2 este realizatS de o proteinkinazS AMPC dependents, enzimS
constituitS din dou& subunitSfi reglatoare i douS subunitSfi catalitice cu
activitate kinazicS (C2R2). Sub acjiunea AMPC, proteinkinaza (C2R2) se
disociazS cu eliberarea subunitSJilor catalitice active, care fosforileazS FI-2
trecandu-1 in forma fosfo- inactivS. Deosebit de important este faptul cS
protein kinaza AMPC dependents este inhibatS de hem. DacS hemul este
prezent in probS, proteinkinaza este inactivS i FI-2 rSrnane in forma defosfoactivS, permifand ini{ierea sintezei globinei. In absenfa hemului, inhibijia
proteinkinazei se suprimS 1 ca atare ea va fosforila FI-2 inactivandu-1 deci
oprind sinteza globinei. Conversia formelor fosfo- la defosfo- este realizatS de
cStre o fosfatazS (Fig. V. 10.)
Reglarea biosintezei proteinelor la eucariote presupune i alte mecanisme,
a cSror bazS molecularS este incS neclarificatS.
Hem
A MPc + Cg R2
2C + 2 R-AM Pc
ATP AFP
FI-2
-defosfo- (acff )
-fosfo- (indch'y)
RI-2
FosfdtdTS
Fig. V.10 - Reglarea biosintezei globinei prin fosforilare reversibila a Fl2.
224
V.5. LEZIUNI ALE MOLECULELGR DE ADN X REPARAREA ACESTGRA, MUTAJII
Stabilitatea informa{iei genetice inscrisS in molecuia de ADN este
.esenfialS pentru organisme in sine i pentru continuitatea lor in limp.
Cum medial in care trSiesc acestea poate fi advers, exists .riscul ca
integritatea informajiei genetice s3 fie ameninfatl
Vulnerabilitatea moleculei de ADN la factori chimici (agenji aJchilanfi,
agenp de intercalare, agenfi de nitrozare, analogi structural!, acizi, cum ar fi
acidul azotos, compui care prin metabolizare genereazS radical! liberi) i
fizici (radiajii ultraviolete, X) creeazft premiza aparifiei leziunilor ADN.
Leziuni ale ADN pot fi introduse i in cursul replicSrii, dacS acestea au
scSpat acjiunii de corector (proof reading) a ADN polimerazei III (mismatch
errors).
Leziunile pe care le suferS materialul genetic constau, in principal, din:
- schimbarea stMlor tautomere, cu posibilitatea fmperecherii eronate a
bazelor, fie in cursul replicSrii, fie prin substituirea unei baze proprii ADN cu
un analog structural; astfel, 5 brom-uracilul, analog al timinei, prefers forma
enolicS i nu pe cea cetonicS, pe cam o adopts timina; din acesf motiv 5
brom-uracilul se imperecheazS cu G 1 nu cu Ac
Br
o H - ---------- 0
H
Forma enolica a 5~Br - uracilului
Guanina
Consecinfa este inlocuirea perechii A = T cu G s C (tranzijie),
- depurinSri; aproximativ 5000 de baze purinice se pierd pe zi prin
hidroliza spontanS a legSturii glicozidice;
ruperea legaturilor fosfat diesterice;
cross-linking al bazelor de pe catene opuse;
- dezaminarea spontanS sau sub ac{iunea acidului azolos/cu formarea
unor compui care fie nu se imperecheazS cu bazele azotate, fie sunt
susceptibili la imperecheri eronate.
VZ
Deza/rw&re
/V /V
GuavZnZr
J/
HZpoxmZini 0
11 l
H
Xanana
Fig. V.11 - Dezaminarea due ia baze "strain" ADN
226
Fig. V.12 - Dimeri de timlna.
H3C.
MC
H ff/boza
'dft/AQZtf
\
V.5.I. REPARAREA PRIN EXCIZIE-RESINTEZA
Moiecula de ADN este singura rnacrornolecida care poate' fi reparanl (cu
maxim<1 acurate|.e), atrihut. decurgand din redundanfa informajien
inlrinsecd slructurii dubiu heiicoidale; ori de cate ori o catenS este lezatS
cealaM va servi nu nu'mai la pdstraxea informajiei genelicc, dar i la
repararea catenei lezate. Esenfiale in procesu.1 de reparare sunt detectarea
leziunii gi corectarea acesteia. Numerous enzime (pcste 50) conlucreazS in
acestc procese de recunoagtere specified i reparare, supraveghind
fGGcrA
Adeni/ AON g/zcozidaze
r c c GA r
i
A GGCTA
Nac/eazS
CCGA r
..
AGGCTA
| ADN'flo/merez# /
AON-//g#zd
A rCG G c r
cA
rccGAr
rA G C C ff A G rA GGCrA
Fig. V.13 - Repararea unei catena ADN in care a avut ioc dezaminarea
adeninei la hipoxantina
Un alt exemplu de acjiune a sistemului constitutiv reparator il reprezintS.
excizia dimerilor de timing formaji prin acjiunea radiajiilor UV (Fig. V.14).
Defecte in activitatea enzimelor de reparare se traduc printr-o mare
sensibilitate la acjiunea radiafiilor UV i o frecvenjd. crescuta a cancerelor de
pieie.
imperecherea greita a bazelor in cursul replicSrii (mismatches), scftpata
vigilen|ei ADN polimerazei III, este rezolvatS de un sistem de reparare
specializat care sesizeaza distorsiunile introduse in dublul helix, discriminand
totodata intre catena nou sintetizata (inc& nemetilata specific) i catena
parental!
Pe langS sistemul constitutiv de reparare, organismele dispun de un
sistem inductibil de reparare, reprezentat de o serie de factori de naturd
proteica, a cror fidelitate in replicare este numai aproximativa care, din
acest motiv, a fost dermmit sistemul reparator predispus la erori. Cum el
condijioneaza supraviepiirea, f&c&nd posibiia replicarea ADN, chiar dac& prin
repar&ri oarecum aproximative, a fost denumit i sistem SOS.
228
Repararea este realizatft de sisteme enzimatice care pot preceda procesul de
replicare
sau, dimpotriv8, acfioneazd poslreplicativ.
Enzimele reparatorii ce preced replicarea sunt in general enzime
constitutive i pot fi surprinse de replicare in urmdtoarele situajii:
ieziunea este complet remediate i bifurcajia de replicare trece normal;
Ieziunea permite trecerea aparatului replicator dar catena in formare
rSmane incomplete
Ieziunea nereparatit, inc3, nu permite desfSjurarea replic&rii.
De menjionat c& sistemul inductibil de reparare este tranzitoriu,
incetandu-i activitatea cand acpunea inductorilor sSi a luat sfSrit.
JSrr"TTi
-s'
-3f
0 erdom/c/eazaspec/A/ca (^d~aqdoqucfecda)c//^dzd a /agarere
resfafd/esfer/cd
3'
s'3'
AON f/qaza re face
/eqa/dra fosfaf if/esfence
,_
s
J__L
Fig. V.14 - Excizia dimerilor de timina (structuri cidobutanice).
229
V.5.2. REPARAREA PRIN REVERSAREA LEZIUNTLOR
Pc langd mecanismele de reparare prin excizie-resinlezd existfi i
posibilitatea d.e reve.rsare a lezkmilor ADN. Astfeh dimerii de timind pot sd
reformeze ^nonomerC sub acjiunea luminii.
Revcrsarea acestui tip de lezitme se datoreazd aetivMi, sub acjiunea
luminii (300-600 nm), a unci fotoliaze (enzima fotomerizantd) care
recunoale regiunea ADN disiorsionatd de dimer, pe care il cliveazd.
Reversarea dircctd este demonstrate gi pent.ru 06-alchiI-guanine forma
enolied, rezultate prin acjiunea unor agenji alchilanji asupra guaninei.
Procesul este enzimalie i acceptorul final este lnsdi enzima-Ofi-alchilguanin-alchil transferaza care se autometiieazd la an reziduu cisteind.
Surprinzdtor, enzima, devenitd inactive, nu se regenereazd.
Exists dovada efi o activitate 06-aichii transferazied scdzutd este o
caracteristicd a ficatului cirolic. Menjinerea OMnetiNguaninei ar fi
responsabild de transformarea malignd a celulelor hepatice prin mu tape de
tip tranzipe (G-A) i activarea oncogene! celulare liras (mecanism admis de
activare a oncogendor).
Cum ciroza hepatied este o elapd In procesul de hepatocarcinogenezd,
teoria privind reiajia mutape-cancer are un argument in plus,
Leziunile care scapd sistemelor de reparare devin rnutapi (schimbarea
permanent^, a
seevenjei nucleotidelor intr-o gend reprezintd o mutafie).
Mutajiile pot interesa o singurd pereche de baze (mutapi punctiforme) sau un
grup de
baze, de pe una sau arnbele catene ale unei molecule de ADN,
Mutajiile punctiforme surd, rezultatui:
1, substitupei care poate dec urge prin:
a) tnmzijie - o pereche de baze este inlocuitd cu alia; o bazd purinied
dintr-o eatend
este inlocuitd lot cu una purinied, sau o bazd pirimidinied este inlocuitd tot
cu una. primidinied.
Acidul azotes dezamineazd adenina, a edrei pereche este timina, la
hipoxantind care se imperecheazd de preferinjd cu citozina:
V.5.3. MUTAJIT
N
citozina
hipoxantina
230
b) transversie - o perechede baze este inlocuitd cu alia; o baz& primidinicd
dintr-o catena este Inlocuitd eu una porinica, sail una purinicd eu una
pmmidinicd. In Fig.
V.15 sunt reprezentate diferile mutajii ce pot avea loc prin tranzijie 1
transversie in gena structural#. corespimzand ianjului P al hemoglobinei,
avand ea rezultat substituirea aminoacidului valind din pozijia 67 cu alji
arninoacizi i dec! aparifia unor hemoglo- bine anormale.
2.inserfiei.
3.delejiei.
Hemogiobina
Milwaukee
Glutamat
Hemogiobina . Bristol Aspartai
Hemogiobina A ( Normaia ) Valina
Hemogiobina
Sydney
Aianina
GAU -------------------------------------GUU------------&GCU
GAC<--------------------------------------GUC-------r---GAA 4----------------:--------- -----------QUA---------------------- GC4
GAG<------------------------------ ---: GUG -------------------+ GCG
Fig, V.15 - Hemoglobin anormale rezuitate prin substitute
V.6. EXPRIMAREA FENOTIPICA A MUTAjllLOR
Modificarea inform ajiei genetice din ADN prin mutajie se exprirnd,
datoritd fluxului informational ADN-ARN-proteind, in lnsdi secvenja
aminoacizilor din proteine. Aceste proteine sunt proteine mutante. Mutafiile
punctiforme care schimba o singurd bazft dintr- tin triplet prin transversie
sau tranzijie pot produce efecte diverse cand se traduc In proteine,
La nivelul ARNm mutafia se traduce prin substitujia unui codon cu altul.
Acegtia pot fi:
a. Cu acelai sens - dacfi mutafia a inlocuit un codon cu un codon sinonim
(degenerarea codului). Proteina rezultatd nu se deosebegte de cea de
engine, mutajia produsd este o mutajie mutii (silent mutation).
b. Cu ait sens - In cazul in care codonui nou format specified alt
aminoacid, O astfel de mutajie punctiforma poate avea un ecou mai mare
sau mai inic asupra expresiei fenotipice, funejie de numerogi factor!, cum ar
fi:
231
precipite, formand cristale in forma de secer# (sickle), ceea ce confer#
acestei proteine anormale denumirea de hemoglobin# S. Hemoliza avansat#
care se produce determine ischemic tisularil mai mult sau mai pufin severe.
Proteina safer# modific#ri mai mici sau mai mari in funcfie de situarea
aminoacidului substituit intr-un loc mai mult sau mai pufin vital pentru
structura, respectiv func{ia proteinei. De exemplu, dac# aminoacidul
schimbat este integral unei porfiuni de lanf proteic angajat in legarea
substratului, este probabil ca repercusiunile s# fie severe, mergand pan# la
^CC'^GG
Mae III
Hind II!
GGV C
Hpa II
cV'GG
Pst 1
CTGCA^G .
Taq i
Bam H 1
T*CGA'
G'kaATCC
A^AGCTT
Escherichia coll
Ry245
Haemophilus
aegyptius
Haemophilus
influenzae Rd
Haemophilus
parainfluenzas
Providencia stuartii
164
Thermus aquatieus
, Bacillus
amyloiiquefadens H
4
5 G A A T T C 3
5-_C TT A AG 5'
IT
j Eco Rl
1
G
A A T J C
CT T A A
G
Alte endonucleaze de restricjie taie ADN bicalenar, formand capete boante
(blunt ends), drepte, necoezive. Hpa I, obJinutS din bacteria Haemophilus
parainfluenzae, taie aslfel:
5 G
-T
- 3
'
AA C
T
3 C
-A
-
T G 5
AT~
-
i
Hpa
i
5 G
-T
A A C
3
T-
0I
3 C
-A
234
P/dSfi7f(f
() AU)
Fig. V.16, - Etapeie c\onaru unui fragment de ADN intr-un plasmid.
Dactl pe o molecule de ADN exists mai multe situsuri de.recunoatere
pentru o restrictazd, aceasta va genera mai multe fragmente de ADN. Cu cat
secvenfa recunoscut& de enzima de reslricjie este mai lungft cu atat
fragmentele de ADN obfinute sunt mai lungi. De exemplu, Eco R I, care
recunoate o secvenjfl de 6 nucleotide, taie fragmente de 10-20000
nucleotide, care pot sft corespundft la una sau mai multe gene,
Fragmentele objinufe prin acfiunea mai muhor enzime de restricfie,
adesea unigenice, pot fi separate prin diferite metode.
Dac<1 atat ADN donor al unei gene, cat i plasrnidul vector sunt clivafi de
aceeai restrictazS, de exemplu Eco R I, este posibiD inserpa genei in
plasmid prin imperecherea nucleotidelor de la nivelul capetelor coezive (Fig.
V.16). O ligazj stabilejte legifturi fosfat diesterice sudand plasrnidul devenit
recombinat.
235
fi :;i
5l
3'
5s
3*
terminal transferaza.
GGGG CCCG3s 5f
3!
ADN iigaza
GGGG-JJYTT'
cccc~~
3(
De remarcat cd, terminal transferaza nu reclamd o catend ADN matrifd.
Alternativ la modalitatea prezentatd, se pot insera direct Tntr-un vector
adecval fie ADNC objinut prin revers transcriere, fie o gend sintetizatd chimic.
L b) Vectori de clonare. Ca vectori de cionare se utilizeazd: plasmidele,
i'agii, cosmidele.
Plasmidele sunt., aa cum s-a ardtat anterior, molecule circulare de ADN
dublu catenar, extracromozomial, care se replied independent de cromozom.
Ele sunt instrument ideale ale tehnologiei ADN recombinant, intrucat
insumeazd calitdji importante, cum ar fi:
- se izoieazd uor i rezistd la manipuldri;
- sunt'molecule rnici care tree uor prin membrana celulei gazdd;
- se replied autonom i rapid, independent de cromozom, ceea ce
permite amplificarea genei (fragrnentului ADN inclus);
- prezinta gene marker care, exprimate fenotipic, le conferd
caracteristici ce permit selecfionarea celulelor transformate (cel mai adesea
gene de rezistenjd la antibiotice).
Plasmidele uzual utilizate pentru cionare au fost modificate in laborator i
conjin in genele de rezistenjd la antibiotice situsuri recunoscute de uncle
enzime de restriejie, Un plasmid foarte popular, confecfionat in laborator,
pBR322, de aproximativ 4 kb, are doua gene care-i conferd rezistenjd la
antibiotice (la ampicilind i tetraciclind), ambele inciuzand situsuri
recunoscute de anumite enzime de restiicjie (Fig. V.17 a), Dacd atat
fragmental de clonal, cat i plasmidul s-au tdiat cu aceeai enzimd de
restriejie, de exemplu Pst I care tale seevenfa CTGCA4G (prezentd in gena
care-i conferd rezistenfa la ampicilind), capetele lor complementare se vor
lega, constituind plasmidul recombinat - o moleculd himerd (Fig. V7!7.b).
Introducerea plasmidelor recombinate in celule bacteriene-gazdd. se face
prin procesul numit transformare\ cu objinerea unor celule transformate"
genetic.
236
plasmid
p8R322
o,r6-
endonudeazS de restrictie (pst!)
strain
O
237
239
unul va hibrida perfect cu gena cie interes. Posibilitatea ca un oligonucleotid
s& hibrideze, prin hazard, cu secvenfe din alte gene oblige la verificaiea cu
un nou set de oligonucleotide sintetizaf conform unei alte secvenje
aminoacidice din proteina de interes (Fig, V.19).
Biblioteci genomice provenind de la specii animate diferite, donate de
preferinfH in bacteriofagi, stau la dispozijia laboratoarelor de genetic*!.
Colonii detecta te
Film au-to- radiografic
Fig, V.18 - Identificarea unei clone conlinand segmentul de ADN dorit.
240
Secvenfe
+
cunoscute de aminoacizl
- Gly Codonipasibiti ($')
GGA
GGC GGU GGG
Leu ~ Pro - 7rp - GIu - 4sp ~ Met - 7?p - P/je
U CCA G G AUG
U UGG A A UGG
A
A C UUC
U ccc
G G UUU
U
A A
G
G U
G ecu
U
A
c
u
e CCG
c
u
u
G
U
G
Regfune de degenerare minima
Val - Arg - COO ~ Gf/U 4G4 p'J Gu'c 4GG GUlU CGA
GI/G CGC
1
GGU ? CGG \
!
Probe sintetice UGG GA* GAfi AUG UGG Uufi GU
Fig. V.19 - Detectarea genei unei proteine cu secvenja de aminoacizi
cunoscuta.
Biblioteci ADNC
Pentru genoamele de mari dimensiuni, utilizarea unei biblioteci genomice
comports probleme, identificarea unei gene anume fiind o operajiune dificilS.
Este motivul pentru care, cel pufin in situafia in care scopul cion&rii este
acela de a objine o anume proteins eucariotS, se recurge la o bibliotedl ADNC.
Pentru constituirea ei, ARNm matur se separS de celelalte tipuri de ARM
celular, mult mai abundente, prin cromatografie de afinitate pe oligodT
imobilizat pe coloanS. HibrideazS cu oligodT exclusiv ARNm care sunt
purtStorii unei cozi poliA; modiiicarea temperaturii 1 concentra}iei saline
per mite eluarea ARNm. Toate moleculele de ARNm dintr-o celula vor servi ca
template pentru sinteza unor ADNC monocatenari, sub acjiunea unor revers
transcriptaze virale (Pig. V.20). ADNC dublu catenari, formafi pe monocatenele
ADN sub acjiunea unei ADN polimeraze modificate, se insert! in vectors de
donate care-i vor introduce in celulele gazdd, constituindu-se o biblioteci
ADNC.
De remarcat cS, pentru un organism dat bibliotecile genomice au acela^i
conjinut, indiferent de Jesutu! utilizat ca sursS de ADN, in timp ee confinutul
unei biblioteci ADNC exprimS funcjiile specializate ale fiecdrui tip de celulS,
refleciate in expresia diferilS a unor gene particulare in diferite |esuturi.
Reprezentand toate genele exprimate la un moment dat intr-un |esut dat,
numftrul de clone cuprinse intr-o biblioteci ADNC complete este relativ mic in
comparajie cu numftrul de clone dintr-o biblioteci genomic# i deci
depistarea unei clone particulare va fi uguratS. O bibliotec# ADNC,
reprezentand molecule de ARNm foarte abundente sau mai pujin abundente,
este deci mai tentantS decat o biblioteci genomic#. Ea prezintS i
y; \
ARNm + oligonucleotid sintetic foiosit ca primer
Fig. V.20 - Construirea unei biblioteci ADNC folosete ARNm sintetizat prin
revers transcriere.
V .7.1.2. Exprimarea fenotipicS a informa$iei ceprtnsa in ADN recombinat
Plasmidele hibride, ca i bacteriofagii hibrizi, reprezint& nu numai o sursS
abundent& de ADN heterolog, dar i o modalitate de a obfine in celula gazd&
mari cantit&Ji de proteine specificate de genele inserate. Clonarea operonului
triptofan din E. coli, de exemplu, a perm is sinteza celor cinci enzime ce-i
corespund, reprezent&nd 40% din proteinele celulare.
242
Utilizarea. unei gazde procariote pentru clonarea unei gene eucariote,
avand ca scop final objinerea proteinei corespunz&toare, poate fi ins3 un
egec dac nu se |ine seama de diferenfele notabile intre transcrierea,
traducerea gi controlul celor douS procese la eucariote fa(3 de procariote.
Vectorii care permit; transcrierea fragmentelor ADN inserate in bacterii
TA - - :
V!
:A
^!: i .
243
Genom retroviral
L
e
T *
n
R flag pa!
v
LTR I
ADN
LTR ga<
ADN retroviral deveni l recornbinat
iRevers transcriplaza
transforma genomul ARN 1h ADN dublu helicoidal
pol
i... ism
f Genele virale s&njlhiocuite
I' cu o gena straina
ADN recornbinat este introdus in celuie
Copii ARN viral recornbinat. produse in prezenta unui virus helper"
246
fragment de clonat
5 s3 '
3* *
5*
5p
P1
CATAGGACAGGO
3 s-----------GGACGTATCCTGTCCGATTGCCA
5'
3'
5
S* - *
ciciui 1
3e
3
*
- S
5' - *
J'
*
dcfuf 2
*
*
3'
*
S
Fig. V.22 - Clonarea geneior prin tehnica PCR (P(fP2 = primeri)
Specificitatea se asigurd, in spejd, prin alegerea unor primeri (care
flancheazd fragmentul de ADN jintd) suficient de lungi, astfel incat
secvenfa lor s& fie, virtual, unicd in genom. Intrucal interacfiunea prin
leg&turi de hidrogen a primerilor cu fragmentul |int& este dependents de
temperaturd i concentrafia salind, amplificafea specified este condijionatd
de stabilirea riguroasd a condifiilor de lucru.
247
j",
Utilizarea unei polimeraze termostabile permite alegerea unor
temperaturi de cuplare
!;
primer-ADN suficient de mari (92-96C) pentru.a exclude
interacfiuni primer-template
i.
de joas& specificitate.
j
Recent, s-a imaginat o strategic de lucru care Iimiteaz3
amplificarea strict la
:j
fragmental Alaturi de primerii consaeraff\ se utilizeazi an
primer intern. Dup&
I'
piima rund de amplificare, desf3urat3 in prezenfa ceior trei
primeri, se ajusteaz&
i
temperatura astfel incat sS fie favorizatS cuplarea primer intern
secvenfS finis
:
(select!vitate infailibild).
Tehnica PCR se practice in aparate automate, cu controlul strict al
timpului i
temperaturii, permifand amplificarea unui ADN, care nu trebuie s2 fie nici
purificat nici proaspSt, provenind chiar dintr-o singurS. pic&turS de sange,
spermti, saliva sau un singur fir de par.
Aplicajiile practice ale tehnicti de clonare in vitro sunt numeroase i uor
de imaginat; stabilirea diagnosticului prenatal intr-o largd arie de boli
genetice, detectarea polimorfis- mului alelic, detectarea infecfiilor virale
inainte de aparifia simptomelor sau a unui r&spuns imun manifest, tiierea
suspecjilor i identificarea celui vinovat in medicina legaM.
V.7.3. APLICAJII ALE CLONARE GENELOR (Determinarea secvenfei
nucleotidelor in oligonucleotide)
Clonarea genelor prin metodele descrise anterior-Tehnologia ADN
recombinant i Tehnica PCR permite objinerea, in cantitSfi suficiente, a
unor polinucleotide a cSror secvenfS trebuie determinate Metoda chimica
Stability de Maxarn i Gilbert, metoda, simple i riguroasii, are ca principiu
fragmentarea ADN i separarea electroforeticS a fragmentelor rezultate,
funcfie de m&rimea lor i independent de natura bazelor, urmata de
identificarea acestora. Simplificand, etapele s-ar succeda astfel:
1) se marcheaz& unui dintre capetele ADN clonat cu 32P.
2) se separd -cele doud catene i se izoleazS populafia omogend,
constituit& din aceeagi monocaten&;
3) se utilizeazif patru probe de ADN monocatenar marcat la capital 5 (de
exemplu) gi fiecare se supune unui agent chimic care distruge select!v una
dintre cele patru baze. S3 admitem c3 oiigonucleotidul marcat lacap&tul 5
este: -G*CTCGTCAA~i c3in proba 1 este degradat3 timina, in a 2-a citozina,
in a 3-a guanina gi in ultima adenina Prin distrugerea in proba 1 a timinei,
oiigonucleotidul este scindat in fragmente de diferite dimensiuni, care vor
avea sau nu capital 5 marcat. Prin indep&rtarea, tot la intamplare, a
citozinei, guaninei, adeninei din probele 2,3,4, se objin seturi de fragmente
de dimensiuni diferite (mono, di, tri, tetra-nucleotide).
4) se separ3 electroforetic fragmentele obfinute in fiecare dintre cele
patru probe, pe
gel de poliacrilamidil
Este necesar ca puterea de rezolufie a gelurilor s3 permits separarea,
neambigu3, a unor fragmente diferind printr-un singur nucleotid. Impunerea
acestui unic criteriu, al
248
lungimii fragmentelor, se realizeazS prin alegerea condifiilor de separare:
gelul confine uree (~8M), iar electroforeza se realizeazft ia ~55C, pentru a
elimina orice asociere prin leg&turi de hidrogen a bazelor.
5) se identifies autoradiografic, exclusiv, fragmentele dinspre capStul 5,
care a fost marcat i se indicS numSrui de nucleotide corespunzStor fiec&uia
pin comparaie cu an etalon.
Admifand (Fig. V.23) cS in proba 1, In care s-a excizat timina, s-au objinut
di- i pentanucleotide marcate (G*C i G*CTCG), este evident cS timina
reprezintS nucleotidul 3, respectiv 6 din oligonudeotidul analizat Similar,
dacS in proba 2, din cane s-a exclus citozina, se objin mono, tri,
hexanucleoiide marcate (G*- capStul 5\.G*CT, G*CTCGT) rezuM cS
nucleotidele 2, 4 i 7 din oligonudeotidul de analizat sunt reprezentate de
citozinS. RajionSnd similar pentru pattemul objinut in cazul probelor 2 i 4,
rezultS c& oligonu- cleotidul analizat este mononucleotidul GCTCGTCAA.
Se poate conchide cd seevenja nucleotidelor din orice ADN poate fi
stability direct pe gelul autoradiografiat, citindu-1 de jos in sus.
OPdonuc/eotid de ane/iratBaza exc/zeta:
G*CTCG TCAA
T
[A1,
G
A
GC
<3C,
ACT
G*crc GlCTCGTC
*CTC6T
G CTCGTCA
Start
Start
Start
Start
Start
nendocr
/eof/d.
GtrCuJ ocbiJ7W
'CA
c/eof/d\
GVrcG te0rc/Se
rc
odo1
GlAPPI
texemc/
L
eot/d
G*CTC
penfaMc
G
/eobb
G*crc
tetrenuc
/eotid
G*cr_
Mrwcfeo
t/d
od/ecpo
G*C
/id
. .G*_
mormuc
/ec/i{j\
1
Proba / ~Proba2 Probe J Probe 4 Probe de
eta/orare
Fig. V.23 - Determinarea seevenjei nucleotidelor dupa tehnica Maxam i
Gilbert
249
De menfionat c&> tn fapt, degradarea chimica afecteaz2 ambele baze
purinice (atat A, cat i G) ca i ambele baze pirimidinice (atat C, cat i T) in
m&surS diferM, funcfie de condifii. Problema se rezolva cu acurateje, folosind
probe cuplate; G i G+A, C i C+T. Modificand condijiile de lucru, de exempli]
in cadrul cupluiui G/G+A, Intr-o probS se distruge, prin excelenje, G, in timp
ce in cea de-a doua se distrug i se elibereazS. (prin ruperea legdturilor
fosfat diesterice), la viteze comparabile, atat G, cat i A. Reziduurile A se pot
identifica comparand pe electroforez& pozifiile G cu cele G+A; similar penirn
cuplul G/C+T (Fig. V.24).
Intrucat nucleolidul 5' terminal nu poate fi identificat (se distruge) i o
verificare a secvenjei catenei ADN in studiu este necesarft, se recurge la
secvenjializarea paralel&a catenei complementare, dupS marcarea acesteia
cu 32P.
Metoda enzimadcd
O modalitate alternative de determinare a secvenjei ADN clonat este
metoda Sanger. Spre deosebire de metoda Maxam i Gilbert, care este o
metoda ehimicS, aceaste tehnicft este o metoda enzimaticS; ea igi propune
s2 determine secvenja catenei complementare cu cea de analizat, avand ca
principiu intreruperea controlata a sintezei acesteia prin incoiporarea unor
analog! structural ai dezoxiribonucleozid trifosfajilor proprii structuiii ADN,
Sinteza in vitro a catenei ADN complementare presupune prezenja:
1) monocatenei ADN de secvenjializat, utilizate ca matrije (template) i
care provine, in general, dintr-un fragment de restricfie.
2) unui primer complement^' cu o mica por- Jiune de la capital 3 a!
smi
................SBB3C G
..... p t^aSSBSS TT
****** T
- AG
.1
i ***'*&*&: t r
?> c ' A A 'X'fpfy l T
:
cA
AA
GGCCA
GGCCATCGTTGA
GGC
GGCC
GGCCATC
GGCCATCG
GGCCATCGTTG
dATP
dCTP
dGTP
dTTP + ddTTP
GGCCAT
GGCCATCGT
GGCCATCGTT
3 N
SecventS complementary > modelului ADN
Fig. V.25 - Secvenfializarea ADN prin metoda Sanger (seevenja nucieotidelor
se citete direct pe electroforegrama).
251
a numeroase benzi electroforetice, fiecare cu un spectru de fluorescent
caracteristic cap&tului s&u 3 terminal, a cror succesiune indicii
succesiunea nucleotidelor In catena ADN (Fig. V.26).
Sistemui de detecjie a fluorescenjei este automatizat i permite
secvenjializarea unor fragmente de ADN (de peste 500 de perechi de baze),
intr-un ritm de -10000 perechi de baze/zh Secvenfa complete a peste 1000
gene, printre care cele codific&nd insulin^, interferoni, citocromi,
hemoglobin^, interleukine, a fost stability.
Secvenfializarea complete a genomului E.coli este iminentS, iar cea a
genomului uman pare sa aparjM unui viilor apropiat, prin aportul decisiv al lui
Fred Sanger, dublu laureat Nobel (pentru secvenjializarea proteinelor in 1958
i pentru secvenjializarea acizilor nucleic! in 1980).
Utilizarea tehnicilor de amplificare a ADN permite stabilirea hazel
moleculare a boiilor genetice (peste 3000), objinerea de sonde necesare
diverselor tipuri de hibridizare, evaluarea producer unei gene (ARNm,
proteine).
Secvenjializarea ARN se face, cel mai adesea, dupS sinteza ADNC,
catalizatS de revers transcriptazd i recurge la ambele tehni.ci descrise
pentru ADN.
Lungimea oligonucleotidului
Fig. V.26. - Detecpa prin fluorescent a tragmenteior oiigonucleotidice objinute
prin metoda didezoxi
252
Acizi nucSeici antisens
Tehnicile de eionare permit, in cazul folosirii unor vector! de expresie,
sinteza unor ARN antisens, respectiv a ARN avand succesiunea nucleo tidic&
(T=U) a catenei necodificatoare. Acest ARN este, desigur, complementar cu
ARNm, a c&rei succesiune nucIeotidicS corespunde catenei codificatoare.
Un ARN antisens poate fi rezultatul clonarii unei gene care este introdusd
in vectorul de expresie in aval fata de promotor, intr-o orientare invetsS,
care-i schimte polaritatea.
Transfecfia vectorului de expresie recombinat in celula parental^ permite
sinteza unui ARN antisens, celula dispunand astfel de ambele categorii de
ARN (antisens i mesager).
Hibridand perfect cu ARNin, un ARN antisens va bloca traducerea ceiui
dintai, intrucat form area hibridului nu numai c& mascheazd situsul de legare
la ribozomi, f&cand mesajul inoperant, dar create i susceptibilitatea la
hidroliz# a ARNm.
Utilitatea producerii acizilor nucleici antisens este, in primul rand,
terapeuticd; posibiiitatea de biocare a sintezei unei proteine virale cu
eventual potential oncogen este dintre cele mai tentante,
rrty> cJip**
v
^ Q
fragmentelor de restrictie
Cromozomii umani homoiogi, ca i segmente ADN homoloage de ia
indivizi diferiji, prezinth diferenfe (motenite) in secvenja nucleotidelor.
Acestea apar cu o frecvenjh de unu la cateva sute de perechi de baze (~ de
107 ori/genom) i constau in delefii, inserfii ample sau numai in mutaiii
punctiforme; modificfrile nu se traduc prin boaM in situajia in care sunt
prezente in regiuni necodificatoare sau se produc in regiuni ale unor gene
neesenjiale funcjiei acestora (variafii genetice).
O mutaiie in secvenjele nucleotidice cuprinzand situsuri specifice pentru
acjiunea unei anumite enzime de reslricfie poate* avea ca rezultat abolirea
unora dintre ele, fapt ce se reflects in dimensiunile diferite ale fragmentelor
de ADN rezuitate prin hidroiiza, Este uor de imaginat reciproca o mutajie
intr-o secvenja nucleotidica poate crea un situs suplimentar de recunoa$tere
pentru o anume enzinia de restricjie.
O diferenfa motenita in patternul de restriefie este desemnatS drept
polimorfismu3 fragmentelor de restricjie" (RFLP=restriction fragment length
polimorfism); ea s~a dovedit extrem de utilS diagnosticului, cand
polimorfismul este intragenic i deficitul functional intr-o boahl creditors nu
este cunoscut.
Separarea prin electroforeza, pe criteriul lungimii fragmentelor de
restricjie, urmatd de aplicarea tehnicii de transfer Southern, pennite
evidenfierea polimorfismului prin utilizarea unei sonde anume.
Detectand RFLP, tehnica Southern este deja o tehnica de rutind in
depistarea i screeningul bolilor genetice umane, utilizandu-se i in
diagnostical prenatal al acestora, alftiuri de alte tehnici, cum ar fi:
hibridizarea imperfecta, secvenfializarea genomica etc.
255
1,15Kb
t
Ii
B.
5'
1,35 Kb
ef p-ct
l
transformdri care are loc la
pe langd componenta capabila sa efectueze travaku
..............................................
(deci o micare ordonata), exista obligatoriu . o component#;(T. AS) care
reprezintd o formlTde
inferioard. In opozipe cip energia liberd, acestei
pdr{i din energia total'll i se spune energie jegatdA
VI.4 VARIATIA ENERGIEI LIBERE . iN REACTIILE CHIMICE 1 BIOCHIMICE
Aproape toate transformarile care au loc in organismele vii sunt, sau au la
hazd, reaejii chimice; de aceea in bioenergetied intereseazd in mod deosebit
AG a*acestor reaejii.
Respectdnd conventia de semne di.n termodinamidL reacjiile chimice pot
fi impdrfite dupftjvatoai&^^
Variapa de entropie se masoarS cu suficienta precizie doar m cazul
sistemelor reprezentate de elemente chimice i molecule mici.
262
gyjjj *#
^ASi4fereacfie
m
*^^5SsEtiaiaSEifioM;
dQsWguiarca dc la stiiiga.la dicapt^i, cncrgic __
A ..
c)
reacjia ejrieJas^Mfem. ea no evolueazS spontan in mci un sens.
Majoritatea reacfiilor chimice care au loc in organismele vii fac parte din ,,g;|
^ BfilitaMee*' care constau din secvenfe de reacfii; evident, fiecSreia dintre
acestea ii corespunde o variafie a energies Iibere:
AG,
-> B
AG9
G
AG
DAG,
E
Fiind o
ener|k U^gr|jge
AGtota, = AG, 4- AG2 4- AG3 4- AG4 ....
Dacfi AGtPtal < 6' calea melaboljcS elc exergonic# intr-o astfel de'cale
obUgatqritf ca fiec&re. reacpe individuals s$ ajbS AG<0? pentru unele reacjii
aceasta putted fi pozitivS. Condijia esle ca sum AG ppgative *4 fi$ mi decat
surra AG po/itive.
CSil^exergompQ sppt ccle dtgmdatiYP (catabqlice)^ c3i endefgonice;
evident, in cazul acestqra^suma AG Poziiivqreste1. maiJojacejuLSSme
absolute decat pma AJ3 negative.
In sintezS, modui in care organismele vii he.terotr.ofe ii asigurft energia.
este: moleculelg organise cqmplf xq (glupidq, Ijiplde1, ptptqne) preluate din
hranS sunt d(egpadate pe chi carc^ai|.AGtotai pegaijve; energy libuS este
utiljuatS pentru proqesde anabolice i pen tip npmqrgasepTtp jiioccse. Pnn
mtennediul moleculelor complexe din hranS (dar i a unor molecule simple)
organismele heterotrofe ii asigurd totodatd elementele i compuii chimici
pe care le vor utiliza pentru sinteza de compui specifici. Numai 0 parte din
energia totals a moleculelor organice complexe este utilizatS aa cum numai
0 parte din de sunt folosite pentru sinteze proprii, restul fiind retumat
mediului; in aceasta constS caracterul deschis ai acestor sisteme.
Transferal energiei iibere care se produce in cursul degradSrilor c&tre
procesele consumatoare se face in organismele vii intr-un mod cu total
aparte.
VI.4.1. YAR1AJIA ENERGIEI LIBERE 1 CONSTANTA DE ECHILIBRU; ENERGIA
LIBERA DE REACJIE STANDARD
Cunoaterea variapei energiei iibere in reacpile chimice este posibiia prin
faptul c3 aceasta estelegaffdeln^i'iml relativ usor misurabilefconstanta de
echilibru i - in cazul reacjiilor de pxido-reducere - potenpalul icdpx.
Dac& energia liberd exprim& tendinja reacpei de a atinge echilibrul (AG ~
0), se injelege ciS AG va fi cu atat mai mare cu cat, in starea inipald, reacfia
este mai departe
4
A se face distincjia intre reacjii ,,exergon^ce-endergonice,, 51 reacjii
"exoterme-endoterme". Reac|iile sunt exergonice sau endergonice dupa
valoarea lui AG i exotenne sau endoterme dupa valoarea lui AH (variapa
caldurii).
263
de echilibrul ei; dec! trebuie sS existe o relafie a AG cu concentrafia
reactanjilor i a
producer de reaefie. Pentru reaefia generals A + B ^ C + D aceastd relafie
este:
L4J^^ccygj^.u4ra|iile^^reactantilar i ale
produgilor iar AG o constants niuiuta Menergijib,ef$ dp reaefie standard'4.
Pentru a defini pe AG se consider^ [A] - [B] - [C] = [D] - lM;-atunci [C]
[D]/[A] [B] = 0 i AG = AG. Deci
Jinand seama c3 la echilibru AG = 0 i inlocuind pe [C] [D]/[A] [B] cu K^,
se obfine:
0 AG + RT in Kech AG = - RT in Kech
Deci se poate calcula vaioarea lui AG dacS se determine valoarea Kech. In
practice, plecand de la concentrafiile de 1 M a fiecSrui reactant i produs de
reaefie se las3 reaefia s3 se desf3oare panS la atingerea echilibrului (stare
stafionarS); atunci se determine nolle concentrafii ale lui A, B, C i D.
Valorile lui AG sunt:
0f
ML
Pentru a respecta in intregime condifiile in care se desf3oarft reaefiile in
organismele vii, in locul valorii AG care corespunde pH-ului imprimat de
reactivi i produ^i se utilizeazS valoarea corectat#5 pentru pH ~ 7 notatS
AG\ Pentru un numSr foarte mare de reaefii care au loc in lumea vie aceste
corecfii sunt cunoscute (se dau in tabele). Valorile AG pentru diverse tipuri
de reaefii sunt date in Tabelul VI. I.
Se impune injelegerea corectii a semnificafiilor iui AG0 i AG; AG0 |indicS
sppsuJLdgL, djesf3surare a reactiei in cpndi|.ii standard fingfogiv pH-ul = 7) i
este o constants, in limp
ce AG^esTte 'variatia energiei1mweTn condifiile speo^^ in cardan loc
reaefiile in organismul viu (concentrafii diferite de 1 M a reactanfilor i
produgilor de reaefie, pH diferit de 7, eventual T diferit de 298K). Ideal ar fi
ca pentru fiecare reaefie s& se poatfi calcula AG care red3 starea energetics
reals in sistemul biologic; acest Iucru este posibil in ultima vreme pentru
reaefii care au loc in aa numitele >.sisteme aceiulare44. Pentru celelalte este
utilize tS valoarea AG\ care, in majoritatea cazurilor, red& suficient de corect
tendinfa de evolufie a sistemului. .
5
Cu rare excepjii, pH-ul m |esuturi p'recum i al umorilor din organismul
uman este in jurul valorii de 7.
264
VL4.2. YARIAJIA ENERGIEI LIBERE IN REACJIILE DE OXIDG-REDUCERE.
POTENTIALUL REDOX I LEGATURA LUI CU ENERGIA LIBERA
Datele din Tabeiul VI. 1 evidenfiazft c& AG0' in reacfiile de oxidate a
gJucozei i a acizilor grai la C02 i H20 au valori negative foarte man. Aceste
valori au fost objinute pe glucozS i acid palmitic care s-au oxidat in bomba
calorimetric! Dar, aa cum s-a ar&tat mai inainte, aceleai valori ale AG
totale se obfin i prin oxidarea treptatft la C02 1 H20 a celor doi compui in
vivo. In faptul cd aceste valori negative ale AG0 sunt foarte ridicate rezidS
explicafia c oxidarea glucidelor i a lipidelor in organismele vii este
resDonsabM de producerea celei mai mari p&rfi a energiei.
Tabeiul VI.l
Valoriie AG0 pentru c&teva reacjii care au Soc fn organismele vis
AG01
Tipul reacfiei Reacfia
kealimol
Oxidare
Acid palmitic 4-2302 -> 16 C02 - 2 338,0
-f 16 H20
Oxidare
Glucoza -f 602 6C02 + 6H2G
- 686,0
Hidroliza
Zaharoza 4- H20 -> Glucoza + - 5,5
Fructoza
Hidroliza
ATP -f H20 ADP + P,
. - 7,3
Glucozo-6-P 4- H20 Glucoza +
Hidroliza
P*
- 3,3
Izomerizare
Glucozo-l-P -4 Glucoza-6-P
- 1,7
Eliminare
Acid malic Acid fumarie + H20 - 0,88
Condensare Acid glutamic + NH3
' ' ' -t-3,4 '
Condensare Glutamina + H20 Glicina +
- -i- 2,2
Glicina Glicilglicina 4- H20
In cazul reacjiilor de oxido-reducere AG se poate calcula din relajia care
Ieag& aceast! m&rime de variajia potenpalului redox standard coiectat
pentru pH = 7, notatft AE*
unde n este nuir
|r AG0' = - n * F AE; ^
it_cMaiLsm*acf
in reactie i
ecliiyaffifful
SSMWW... . . .
- --- t
Valoarea lui se obfine mftsurand pe Ec (Fig. VI.2) care este potenpalul
redox standard al sistemului de oxido-reducere la pH = 0 i adaug&nd -0,421
vol{i cat reprezintA potenjialul redox al unui eiectrod de hidrogen in care [H+]
= I O'7 ioni/iitru fa$ de electrodul normal de hidrogen.
Fig, VL2 - Determinarea potentiaiului redox standard (E0) ai unui sistem de
oxido- reducere. Electrodul normal de hidrogen consta dintr-o placa de
platina platinata cufundata mtr-o soluble de acid tare de concentrajie 1M in
care se sufla un- curent de H2 la presiune de 1atm. Reacts. de oxidoreducere care are loc este H2 ** 2H+ + 2e\ Potenjialui redox ai acestui
eiectrod este, prin canven|ie, zero. In celula de masurare concentrate formei
oxidate i a celei reduse sunt de tM.
H2
cbecbrodub
flocwsb
cbebrbdruffe/7
265
Valorile pent.ru o serie de reacjii redox impoitante In biochimie se dau in
Tabelul VL2,
Tabelul VI.2
Valorise Ef0 ale unor slsteme redox (determinate la temperature fntre 25 30C
Reacfia de electrod
Ef0 voi-l'i
- 0,421
2H+ + 2e **H2
a -cetoglutarat + C02 + 2H+ + 2e' ** 2
Izocitrat
- 0,380
NAD+ + 2H+ + 2e' ** NADH + FP
- 0,320
+
+
NADP* + 2H + 2e ** NA.DPH + H
- 0,324
Piravat + 2H+ + 2e' ** Lactat
- 0,185
+
Oxaloacetat + 2H + 2e* ** malat
- 0,166
Fumarat + 2H+ + 2e* * snccinat
- 0,031
2 cit. c(ox) 2e* 2 cit. c(red)
+ 0,254
2 cit. a3(ox) 2e' - 2 cit. a3(red)
+ 0,385
+
1/2 03 + 2H + 2e- ** H,C>
+ 0,816
In afara posibilitdfilor ce le oferil pentru calcuiul lui AG\ valorile
potenfialelor redox standard sunt utile i in stabilirea sensului de curgere a
electronilor in sisteme conjinand mai multe cupluri de oxidoreducere (vezi
Lanjul respirator**); ca i in cazul lui AG\ valoarea informational^ a lui E
este limitata la condipile standard. Potenjialul redox al unui sistem care nu se
ail! in condijii standard se calculeazS cu ajutorul relajiei:
E
R-T in [Ox] TT TRidJ
unde R, T n i F sunt constantele intalnite \ anterior, [Ox] i (Reel)
reprezentand concentrajiile formei oxidate, respectiv reduse.
VI.5. CUPLAREA REACJIILOR ENDERGGNICE CU CELE EXERGONICE;
INTERMEDIARY ENERGETIC. COMUN
Organismele vii utilizeazS in permanents mari cantitati de energie atat
pentru sintea
^
eat i
pentru sustinerea unor nrocese_cum sunt contractia muscular:! excitatia,
transportul activ si altele. Toate aceste procese sunt sustinute defreactiile
exergoniceaEliberarea de energie
prin aceste reaejii se face chiar la locul desfdsurSrii processor consumatoare
prezentat in continuare.
VI.6. LEGATURILE MACROERGICE.
SISTEMUL ATP/ADP, PRINCIPALLY INTERMEDIAR ENERGETIC COMUN (COMPUS
MACROERGIC)
Starile F i I ale intermediarului energetic comun nu au nici o legiUurS cu
stdrile excitatS, - neexcitatd ale atomiior i moleculelor, st8ri convertibile
prin absorbjie-emisie de cuante de energie. F reprezintd un compus care are
leg3turi macroergice66 in timp ce I este produsul reactiei de hidrolizfl a lui P;
dupfl caz, cl nu arc snu mai arc Tnc o leg&turd macroergicS.
Deoarece sistemul format din. ATP.(acidul adenozintrifosfpric),
corespunz&tor lui i APEwtoai degrabd ADP.+. P,), corespunzStor lul l,
constituie intennediarul energetic comun al majori&Jii cuplajelor, se prezintd
mecanismul funcjiondrii acestuia. ATP-ul ca i alfi compugi care au legaturi
maciocrgice sunt dcnumiji curent compui macrocrgieii? dei cored este sS
fie denumiji comp,uL(cu IcgSturi macrocrgiqe". In catena ATP, care
cuprinde trci resluri de acid fosforic* sunt doui legSturi macroergice, notate
NH.
OH OH
Cele doua legaturi macroergice din ATP
268
Fig. VI.3 Cuplarea reaci;ii!or endergorvice cu cele exergonice prin
intermediar cornun
0
o
o
OH l
O- P~ 0~ P~ O- Adenozina + o= P0
O'
0
O"
AG -7,3 Koal/moi
O
o
"0 P- 0- Adenozina* 0- P ~0 P0 i
I
I
0~ 0~ 0
AG0' = -7,3 Kcal/moi
In fiecare dintre cejp douA. seindari se rape o legAturA,, macroergicfl iar AG 0>
este de
-13 kcal/moi: aceastfi valoare s-a luat in bioenergeticS drept referintA in
sensul-cS legAtun macrocvgicc sunt considerate acelea care prin scindare
hidroliticA dibeareazA cel pujin a tala energie. ^ v ; ,
0o
-0P-0--P-OP O Adenozina 0 P-0 P P Adenozin a
0 O" O
0~ 0~
Mg2+
MgATP2"
Mg2+
0
II
MgADP"
HO P 0
1 |
0--- Mg2*
MgHP04
a
Deoarece
&-8fl JW0i wa&J&SU&Q*_
=
2
4IJV 3.B.10 ), reagiaJ^jTu^droliza
In cele mai multe dintre cazurile cfmd ATPTumizeazd energie, el se
scindeazd la ADP i Pr Scindarea ATP_ la 4MP + PP^ urmatd de scmdarea
rapldd a acestuia din urmd la 2P; este intalmtd mai rar, ea este insd
avantajoasd dm punct de vedere energetic (AG0,lora] = -15,3 kcal/moi);
aceastd scindare a ATP se realizeazd cand reacfia endergonicd cuplatd
necesitd mai mult de 7,3 kcal/ipol. Cele doud variante se exemplified prin
feacjiile:
270
I. Activarea glucozei co'nstSnd in fosforilarea ei la glucozQ-6-fogfat6;
intruc&t reacfia necesi^maT^^n^S^Ts kcal/mol, este
CH2 OH
CH2 O P03H2
: . r * ;;
A '!
271
;V
CTP activeaz a
SUSMMisi
A unii compel
lipidici in timp ce la sinteza proteinelor parti cipS atat ATP. c&t i CUffi. In
procesele de biosin teziS ale acizilor nucleici nucletidele trifosforilate (ATP,
GTP, UTP i CTP pentru ARN i ATP, GTP, UTP, CTP, dATP, dGTP, dCTP, dTTP
pentru ADN) sunt, simultan, unitlijii monomerice i furnizori de energie,
Dac& la scindarea hidroliticS a leg&turiior macroergice din celelalte
nucleotide trifosforilate se elihereazft aceeai energie ca la scindarea ATP,
exists in organismele vii alji compui cu legSturi macroergice a c&ror AG in
reacfiile de hidrolizS. este mai mare decat -7,3 kcal/mol; majoritatea
acestora sunt tot compui fosforilafi (Tabelul VL3):
Tabelul VIJ
AG05 in reactiile de hidroUziS ale imor compusi macroergici (fosforilaji sau de
aSta natura) si ale imor conipui fosforilap care nu sunt macroergici
Compustd
AG0
kcallmol
kJimol
Acidul fosfoenolpiruvic
- 14,8
-61,9
Carbamilfosfatul
- 12,3
- 51,4
Acidul 1,3-bisfosfoglicerie
- 11,8
- 49,3
Creatinfosfatul
- 10,3
- 43,1
Acil - CoA
- 7,5
- 31,4
ATP ADP +P(
n^
- 30,5
Glucozo-1 -fosfatul
- 5,0
- 20,9
Fru ctozo-6 - fos fa t ill
- 3,8
- 15,9
G1 u cozo- 6-fosfatul
- 3,3
- 13,8
Glicerol-3-fosfatul
-9,2
- 2,2
Din dispunerea pe baza AG a ATP intr-o pozijie de mijloc in raport cu
ceilalfi compugi fosforila|i reiese $i mai bine rolul siiu de intermediar
energetic (moned& de schimb^). Orice compus macroergic fosforilat (dar i
nefosforilat) cu AG0' negativ mai mare de 7,3 kcal/mol poate transfera
teoretic restul de acid fosforic ADP-ului pentru a se forma ATP; acesta din
urmS este, la randul sftu, capabil sii Iransfere restul de acid fosforic pe
compugi cu AG0 negativ mai mic decat 7,3 kcal/mol. Se realizeazft astfel o
scanl de transfer a restul ui de acid fosforic numitS potenlial de transfer a
grup&rii fosfaf4 (sau potential de fosforilare) care are o mare important in
bionergeticS. Pentru ca aceste transferuri sfi se product in realitaie, este
obligatorie existenfa enzimelor specifice. Lipsa enzimelor specifice face
imposibile transferurile fosfatului intre compugii situaji deasupra ATP in
Tabelul VL3, sau intre acil-CoA i ATP; din acelagi motiv nu este posibilti nici
transfenirea fosfatului de la compusii de deasupra ATP c&tre cei dedesubtul
acestuia.
Fosforilai*ea ADP cu Pt furnizal de compugii macroergici ca
fosfoenolpiruvatul i aci- dul 1,3 bisfosfogliceric reprezinUl, aa cum va reiegi
in continuare, una din modalitSjile de sinteza a ATP in sistemele vii.
Deosebit de important^ este relatia dintre ATP si cieatinfosfat. Acesta din
urm3 se poate acnmula in anumite limite in muschi constituindu-se ca o
rezerviT de
272
^ ts
1 ,tf
,z
*1J0
'K.
f\~p
H
Oj 'b
8
S
4
2
O
fosfoe/rofft/nj^fPSf^f
u
ytorft/ ' , ~A
Creafy'/jfosfyf/
Gfucazo
' 8-far/*/
k
G/t'cero/
3-fosfyfFig. VI.4 - Transferal grup&rii fosfat de la compui macroergici cu AG01 negativ
mai mare decat -7,3 kca!/moS ia ATP i de la acesta la alji compui
Depozitarea se face in starea de repaos i in condifiile excesului de ATP.
Creatinfo- sfatul servete pentru furnizarea rapids de ATP in momentul
contracjiei, sinteza obinuit# de ATP necesitand un timp mai indelungat.
Sinteza i utilizarea creatinfosfatului In muchi se fac prin intermediul
re&cfiei reversibiie cataiizat# de cseatinksnaz#, numita i creatMosfoMnaz#
(CK, CPK):
HN = C'
NH,
CPK
+ ATP
HN = C'
NH ~ P03H2
+ ADP
N CKCOOH
N CHg COOH
CH3
CH3
creating
creatinfosfat
Potenfialul de transfer a grup&rii fosfat i relafia ATP-creatinfosfat sunt
reprezentate
in Fig. VIA.
Se face preeizarea dx acidul fosfoenolpiruvic, creatinfosfatui i acetil~CoA
(in genera! acil~CoA) au ieg&turi macroergice dei nu sunt anhidride. AG
negativ ridicat in leacjiile de hidroliz# a lor ii are explicajia in stabilizarea
prin rezonanf# a produgilor rezultafi.
VI.8 CAILE DE SINTEZA ALE ATP IN VIVO
S-a mai menjionat eft, din punct de vedere energetic, fiecare Jesut, chiat
fiecare celulS, acjioneaz# pe cont propriu, In alji termeni, nu exist#
posibilitatea transferului de energie liber# i nici de compui cu legHturi
macroergice de la o eelul# la alta.
273
Pentru producerea de ATP, celulele utilizeazd energia eliberatH in reacjiile
exergonice din caile de degradare a giucidelor, iipidelor i proieinelor. Cu
excepjia eritrocilelor i a altor cateva tipuri de celuie, toate ceielalte
degradeazd aerob compuii menfionafi ceea ce asigurS producerea unei
cantMfi insemnate de ATP raporat la un mol de compus degradat. In eforturi
intense, celulele musculare degradeaz giucoza i in condijii anaerobe.
Eritrocitele sunt celuie strict anaerobe in limp ce celulele musculare sunt
facultative.
Deoarece cuprind numai o parte din etapele c&ilor degradative aerobe,
cftile anaerobe produc pufina energie i dec! pufin ATP: fajS de 38 moli
ATP/mol de glucozft degradatS aerob, in etapa anaerobe se produc doar doi
moli ATP/mol de glucozd. Sinteza de ATP corelatd cu degradarea anaerobe se
1O
| N OH HC OH
+ ATP
H2C O P03H2
H2C 0 PO3H2
274
Din cele 11,8 kcai/mol ale legftturii macroergice din acidi.il 1,3bisfosfogIiceric doar 73 se conserve in legftturft macroergice din ATP, restul
de 4,5 se disipeazd in media.
2. Sinteza de ATP cupiafil cu tmnsformarea aciduiui fosfoenopiruvic in
acid piruvic este o alld reacjie glicoliticll; ea este catalizate dc pinivatkinnze:
0
<
c#
C#
Piruvat
\\r
j OH
kinaza V
C 0 P03H2 .
ii
1
CH2
O
OH
CH3
+ ATP
Ceie 14,8 kcal/moi cat se eiibereazd la hidroliza aciduiui fosfoenolpiruvic
ar fi suficiente pentru sinteza a doi moii de ATP; in realitate se formeaze
numai unul, 7,5 kcal/mol disipandu-se in mediu.
3. Sinteza de ATP cuplate cu transformarea succinil-CoA in acid succinic;
este ana dintre reacfiile ciclului acizilor tricarboxilici fiind catalizate de
succinii-CoA-tiokinazd:
CO
COOH
OH
j
j
1
Succinii- l
CH2
CoA
CH2
1
tiokinazi 1
GHp -f GDP 4- P;
- - ------CH2
1 ^0
1
C ~ SCoA
CO
OH
LegiStura macroergice din succinil-CoA eiibereazd prin hidrolize ~8
kcal/mol din care 7,3 se utilizeazS pentru form area legSturii macroergice din
GTP. Este singura reacjie in care se formeazfi un alt nucleotid decat ATP-ul;
GTP este utilizat ca atare sau este transformat prin reacfie de schimb in ATP;
GTP -f ADR
GDP + ATP
VI.8.2. LANJUL RESPIRATOR 1 FOSFORILAREA OXIDATIVA
Rolul catabolic al ciclului acizilor tricarboxilici este de a degrada restul
acetii din acetil-CoA care se objine prin degraderi specifice ale glucidelor,
lipidelor i unora dintre aminoacizi. In cursul acestei degraded, carbonii din
restul acetii sunt oxidafi la C02 iar hidrogenii sunt preluaji de coenzimele
NAD+ i FAD care se reduc la NADH + H\
4i
k:
A,
;i
'A :
A
j;i
A
275
FADH2
structura lor a fost elucidate; altele au fost studiate numai pe edi indirecte.
Citocromii sunt compui heteroproteici ale edror grupdri prostetice sunt
hemuri, foarte uor diferite de hemul din hemoglobin^ i mioglobind (vezi
Metabolismul hemoproteineior). Cel mai bine studiat este citocromul c (Cit.
c) care este deosebit de stabil deoarece legdtura intre hem i componenta
proteied este covalentd (Fig, VI.6). O proprietate deosebit de important# a
citocromilor este absorfia selective a unor radiafii din domeniul vizibil al
spectruiui radiafiilor eleetromagnetice; clasificarea citocromilor in a, b, c etc.
(fiecare cu mai multe variante, notate prin indici 1, 2, 3 ...) s-a realizat dupd
acest criteria.
Mecanismui prin care fiecare dintre citocromi aefioneazd in lanful
respirator constii in acceptarea electronilor de la un partener cu potenfxal
redox standard mai negativ (sau pozitiv mai mic) decat al sdu 1 cedarea
apoi a acestor electroni cdtre un partener cu potenfial eiectronegativ mai mic
(sau electropozitiv mai mare) (Fig. VL7). In cursul funefiei lor, citocromii ii
schimbd deci alternativ valenfa fierului intre Fe3+ i Fe2+. Aceastd inspire este
total diferitd de a miogiobinei i hemoglobinei la care valenfa fierului nu se
modified odatd cu fixarea 02; aa se explicit nu numai prin diferenfa structurii
hemului din citocromi ci i prin componentele proteice diferite.
7
Dupa cum se va vedea in continuare, in un.ele- reaefii ale lanfului respirator
se transfers hidrogeni, m altele electroni. Termenul "echivalenfi de reducere"
este comun pentru cele doua transferuri.
277
CH3 CHS.
H,C
HOOC'
v_
/r
V
I
/VSe^-H
yCHs
HOOC
HeC
S'
\
Ctf,
-CHSI
CHj
/
$
V
Fig. VI.6 - Structure citocromului p (componenta neproteica). Legatura cu
proteina specified se face prin intermediul gruparilor -SH ale unor resturi de
cisteina
(Fe**)
Fig. VI.7 - Modul de funcjionare a citocromllor in lanjul respirator (detalii In
text)
Citocromii a i a3> unit&ji distincte dup& spectrele de absorbfie
inregistrate pe fragmente de memhranft intern^ mitocondrial^, no an putut
fi tot-ui separafi imul de altul, Impreunft ei alcdtuiesc citocrom-c-oxidaza,
singurul dintxe componentele lanjului respirator care este capabil s8 reduce
oxigenul.
Coenzirrm Q (CoQ), numit& i ubichinonS, seamSnS structural i functional
cu vitaminele K. Sunt cunoscute variante ale CoQ care difera prin lungimea
catenei izoprenoide; fiecare dintre acestea exists in forms redusli i in forms
oxidala;
funcfia lor in lanful respirator se' bazeaz# tocmai pe alternanja continue intre
cele douil forme:
O
OH
CH,
H C /
3 ^Y'/AS (CH2--CH = C- 0
CoQ, forma oxidata
CH,
(CH2~-CH = C CHZ~^H
CoQ, forma redusa
Flavoproteinele (FP) sunt componente ale lanfului respirator prin
intermediul cMrora se preiau hidrogenii de la coenzimele dehidrogenazelor
NADH + H+ 1 FADH2. Structurile diverselor flavoproteine au fost prezentate
in capitolul Vitamine i coenzimeA In Ian{ul respirator se intSInesc in
variantele;
-flavoproteina N, cu coenzimft FMN, notata FPN; are rolul de a prelua
hidrogenii de la coenzima NADH + H+;.
~ flavoproteina S, cu coenzima FAD, notatS FPS; preia direct, hidrogenul
de pe acidul succinic in ciclul acizilor tricarboxilici;
alte flavoproteine cu coenzima FAD, care preiau hidrogenul de la diverse
substrate; Proteine cu fier i sulf: atomii aces tor elemente sunt grupafi in
centre care se ieag&
de componentele proleice prin intermediul unor resturi de cisteind (Fig. VLB).
S-CyS
\
Fig. VLB - Structura unei proteine cu Fe i S
MATRIX
mm
am
mfrnra
mm
JfiHM
MM
SPAJ'fU SNTERMBMBRANAR
Rg. VI.9 - Locaiizarea m membrana interna mitocondriala a cotnplexeior
1...1V] ale !an|uiui respirator i ATP sintaza
care funcjioneazit individual, celelalte componente se gsrupeaz& in
complexe notate I, 13, m i IV (Fig. V1.9) fiecare complex catalizSnd o
anumitS reacjie de oxido-reducere.
Tot in membrana intemd mitocondriaLI, dupft complexul IV, este inclus
(partial) complexul responsabil de fosforilarea oxidativS numit ATP~sintaz&
dar i ATP-azS, deoarece, dac& este extras din membrane, el catalizeazU
mm
Fig. VI.10 - Un model ai structurii ATP sintazei
ATP
ATP
ATP
conformafionale in raport cu rapiditatea cuplajului transport de electronisintezd de ATP este un serios impediment de impunerea acestei teorii.
c) Teoria chemiosmoticd (Mitchell, 1961) postuleazd cd starea
intennediard energetizatd care determind sinteza de ATP din ADP i P; este
reprezentatd de gradientul de protoni care se stabilegte intre fafa interioard
i cea exterioard a membrane! interne mitocondriale in timpul transportului
de electroni. in alji termeni, transportul direefionat al electronilor in lungul
membranei determind un transport direefionat (vectorial) al protonilor din
interioml mitocondriilor spre exterior (Fig. VI. 12). Gradientul protonilor
ejectafi in spajiul intermembranar are doud componente: una de pH, (ApH)
284
ADP * Pi
ATP
citoplasmd
(naveta este deci hidirecjionald) a echivalenjilor de reducere concur#
malatdehidroge- nazele (MDH) i glumaiic-oxalocetic-transminazele (GOT)
citoplasmalice i mitocondriale precum i transported specializaji pentru
transferul prin membrana intern# mitocondriald a malatului, glutamatului,
aspartatului i a-cetoglutaratului (notaji pe figurd, in ordine 1, 2, 3 i 4). Prin
acjiunea acestei navete se asigurd atat. reoxidarea NADH + H+ citoplasmatic,
cat gi, pe plan mai general, reglarea cuplurilor NADH - NAD+ extra i
intramitocondriale.
NADt * NAOH
OXdZOACeZdZ G/cX71 x
----- -
Asp
*- A~ceN?p/xZdXdZ
B
Fig. VI.13 - A. Naveta unidirectional^ ..glicerol-fosfaf; B. Transferul
bidirectional malat-aspartat
287
I
\4:
V:
F
CN
2,4-dinitrofenol
carboniicianida-p-trifiuorometoxifenilhidrazona (FCCP)
In celule exist# far# indoial# decuplanji natural! ai fosforilSrii oxidative
de lanjul respirator. Ei asigur#, intre altele, stabilirea unui report optim intre
procesele consumatoare de ATP gi producerea de c#ldur# necesar#
menjinerii constants a temperaturii. De exemplu hormonal T4 (tiroxina), in
concentrajii peste limitele norm ale, are un elect decuplant. Energia care nu
se utilizeaz# in alte scopuri se disipeaz# sub form# de c#ldur#. Se admite
gi existenja unei proteine, termogenina (sau leptina), cu rol asem#n#tor.
In Jesuturile adipoase brune, a c#ror euloare este datorat# unui confinut
ridicat de mitocondrii (deci de citocromi), lanjul respirator funcjioneaz#
R
291
iiii
i
Catala
za
V
Superoxiddisrnutaza
ZZZTXZZ:
Hfi2
L
r
2G -SH
OH,
Glutation ~ peroxidaza
IHpG
i
G~ S~S - G
Fig. Vi.15 - Sistemui enzimatic de aparare impotriva speciiior reactive ale
oxigenului
Raclicalul format suferd, la randul lui, o serie de reacjii cu desf&urare
imprevizibilfl. Severitatea afectMi ADN este mare dacft se produc asemenea
lezruni pe ambele lanjuri ale moieculei deoarece sistemele reparatorii nu mai
pci reconstitui macromolecula iniJialS.
2) Peroxidarea lipidelor la nivelul acizilor grai polinesaturafi; este iivijiatd
de mai multi radical! intre care rQ; sau HO. Se produc in serie:
- atacu! radicaiic cu extragerea H :
- rearanjarea moleculara:
- incorporarea oxigenului:
HO-; O.
+ 05
- combinarea radicalului p-eroxi cu H:
O-OH
Sistemele de aparare ale organismului impotriva acestor efecte sunt de
douft tipuri: a) enzimatic, prin care compuii agresivi sunt transformaji in
compui inactivi; enzimele superoxiddismutazS, catalazft i
glutationperoxidazd, care catalizeazd reac{ii!e de
mai jos, sunt, la un loc, sistemui cel mai important de aparare (Fig, YL15):
Superoxid
20; a 2H+--------------------------------->- H202 a 0o
dismutaza
catalaza
2H202
3*- 2H20 + 02
Glutation
H202 + 2G-SH ----------------------- --->- 2H20 + G-S-S-G
peroxidaza
292
Acjiunea glutationperoxidazei este cupiata cu aceea a glutationreductazei,
cu coenzimd NADPH 4- H+, care reface glutationul redos:
Giutation
G S S G -h NADPH + H+
->* 2GSH + NADP*
reductaza
b) neenzimatic, prin care sunt impiedicate proceseie oxidative; o serie de
vitamine, respectiv, C, E i A, prin caracterul ior reducdtor, detoxified celulele
de intermediary reactivi ai oxigenului. Aceasta ar putea fi o explicate ia
constatdrile fdcute in timp cd. prezenja vitaminelor respective in cantitdfi
rnari in brand este corelatd cu on rise mai redos de producere a unor tipuri
de cancer i cu o freevenfd mai scdzutd a alter afecjiuriL
h if I
i
il
Cap. VII METABOLISMUL GLUCIDELOR
VII. 1. CHIMIA GLUCIDELOR
Glucidele sau zaharurile sunt compui polihidroxicarbonilici i derivajx ai
acestora. Numele de hidraji de carbon, care se mai foloset:e incd,
sugereazd di formuiele empirice. ale acestora con Jin C, H, O in raport.de
1/2/1. Degimulte zaharuri se conformeazS formulei empirice (CH20)n, denumirea s-a dovedit improprie pentru un numdr mare de compui din aceastft
dasa care conjin ait raport al atomilor de C, H, O sau conjin in plus azot, sulf,
fosfor.
Glucidele se impart in oze i ozide, dup5 comportarea la hidrolizih Ozele,
sau monozaharidele. sau zaharurile simple, conjin o singurS unitate
polilriita&CT
(sunt decx nehidrolizabiieh Dupd natura grupflrii carbonil din
ijiaiediltL se impart in alcjojffi i cetozg, iar dupii numSrul atomilor de carbon
se impart in trioze, tetrqze, pentqze, hexpze, hegtoze, octoze:'
(n = 1 - 6)
CH2OH
I
G = O (n = 0 - 5)
I
(CHOH)n
CHO
I
(CHOH)n
I
CH2OH
CH2OH
Cele mai import-ante i abundente sunt hexozele (gjucqzd, fnuctozS,
galactozji) i
pentozele (ribozd).
Ozidele se impart, dupd numarul de unitaji monozaharidice la care dau
natere prin hidrolizd, in oligozide si poliozide.
Oligozidele sau oligozaharideie sunt constituite dintr-un numSr relativ mic
de unitaji monozaharidice (intre douft i zece) legate covalent. Dintre
oligozaharideie care se gSsesc in Jesuturile animale i vegetale, ca atare,
cele mai frecvente sunt: zaharoza, lactpza, maltoza. Oligozaharideie
constituite din mai muite subunihlji monozaharidice nu se gftsesc libere; ele
formeazS lanjurile laterale ale unor catene polipeptidice din structura
glicoproteinelor.
Polizaharidele conjin un num&r mare de unitaji monozaharidice (de
ordinul sutelor sau miilor), pe care le pot elibera prin hidrolizS. Polizaharidele
cele mai rhspandite in regnul vegetal sunt amidonul i celuloza, iar in regnul
animal, glicpgenul.
294
VTL1.1. MONOZAHARIDELE Stereoizomeria monozaharidelor
Compuii care au aceeai formula structural# dar clifera prin configurajia
spajial# sunt stereoizomeri. Stereoizomerii aparuji' ca urmare a prezenjei in
molecul# a.-unui atom de carbon asimetric (C* - carbon ale card covalence
sunt satisf&cute cu patru substituenji diferiji) sunt stereoizomeri optic activi.
Num&rul de stereoizomeri posibiii ai umii compus conjinand n carboni
asimetrici este egal cu T; Toate monohazaridde (cu excepfia cetotriozei,
respectjv..dihidroxiacetona) confin in rnolecul# atomi de carbon asimetrici,
fiind optic active. Prezenja unui C* tntr-o molecule face ca aceasta s# poatii
exista in don# configurafii diferite, nesuperpozabile, comport&ndu-se una
fajd de alta ca obiectul i imaginea sa in oglind#, ca mana dreapte faj# de
cea slang#, Moleculele ozelor sunt deci molecule chirale (chiros - man#)
avand ca centra chiralic, de asimetrie, unul sau mai mulfi atomi dFclirbon
asimetrici.
Cea mai simple aldozil, aldotrioza (gliceraidehida), avand un singur
carbon asimetric, se prezint# sub forma a doi stereoizomeri optic activi care
se deosebesc intre ei exclusiv prin sensul in care rotesc planul luminii
polarizate (au aceleai propriety fizice i chimice). Aceti doi stereoizomeri
optic activi poartft numele de enantiomeri i se gfisesc unul faj# de celSlalt
ca obiectul fa{a de imaginea sa in oglinde, Prin convenfie, cei doi
stereoizomeri ai gliceraldehidei au fost desemnaji D i L. Configurafia
absolute a celor patru subsdtuienji ai carbonului asimetric, stability prin
studii de difracjre a razelor X, este redat# prin foimulele de perspective i
plane:
D - giiceraldehida
L - gliceraldehida
295
2>
i
confinfmd doud centre de chiralitate. (doi atomi de carbon asimetrici)* se
prezint# sub forma a 22 (patru) stereoizomeri optic activi care formeazd
(loud perechi . de enantiomeri (I i II):
CHO
CHO
CHO
CHO
r
I
i
|
I
i
H C
HO
C
HO
H
OH
-CH
OH
C
I
l
l
H|
H C
-CH
C
C
HOHO
H
OH I
|
H|
OH |
i
CH2O
CH2
CH2OH
CH2OH
H
OH
Aldopentozele confin trei. atomi de carbon asimetrici ,_gi deci se prezint#
sub forma a 23 (opt) stereoizomeri optic activi grupaji in patru perechi de
enantiomeri. Similar, exist# 16 aldohexoze siereoizomere grupate in opt
perechi de enantiomeri.
Aa cum s-a mai ardtat, stereoizomerii care difer# tntre ei prin
configuratia tuturor atomilor de carboiL^asimetdci... sunt.^nandon^ri. in
timp ce aceia care difer# prin configurafia a unu, maximum ;n T^afonf'Tsimetnci (din totalul de n C*), sunt diastereoizomgn.
Diastereoizomerii care diferd prin configurafia unui singur atom de caiton
asSrietric se numesc egim^g. Schimbarea configurafiei unui C* se numejte
epimerizare.
Enantiomerii se deosebesc inire ei exclusiv prin sensul de rotafie a
planulu; lumuiii polarizate, unghiul de rotafie fiind acelai. Amestecul
echimolecular al celor doi
CHO
HCOH
CH2OH
D - Gliceraidehida
D - Treoza
CfHO HCOH HQOH H(fOH CH2OH D - Riboza
Aloza
CHO HOCH HCOH HCOH HCOH CH2OH D -AltrozS
CHO
CHO
CHO
HQ~C~H
HQOH
HCpH
HCOH
HOCH
HCOH
HOCH
HOC{H
HCOH
CH2OH
CH2OH
CH2OH
DArabinoza
D-XHoza
D-L
ixoza
/\
/\
/\
CH2OH D - Gatactoza
CH2OH D - TaJoza
Fig. Vil. 1 - Seria D a aldozeior
296
-4
CH2OH
c=o
CH2OH
Dihidroxiacetoni
CH2OH
c*o
HCOH CH2OH D- Eritruloza
<f.H2OH C o
HCOH
HCfQH
CH2OH
D- Ribuloza
c-o
HCOH
HCfOH
HCOH
CH2OH
D
Psicoza
CH2OH
C"o
HOCH
HOH
HCOH
CH2OH
D~
Fructoza
CH2OH
CH2OH
c=o .
HCOH
H0(fH
HCOH
C s? O
HOCH
HOCH
HCOH
CH2OH
CH2OH
CH2OH
DDSorboza Tagatoza
Fig.. VII. 2 - Seria D a cetozelor
enantiomeri, dextrogir t levogir, constituie un racemic. Sinteza organic^ dS
natere ia racemici, optic inactivi, in (imp ce natura sintetizeazd nurnai unul
sau altui dintre enantiomeri, grajie stereospecificitilfii enzimelor implicate in
sinteza,
Diastereoizomerii se deosebesc intre ei prin propriet&file chimice i fizice,
precum i prin valoarea unghiului sau sensul de rota{ie a planului luminii
polarizate.
Din motive de sistematizare, compuii optic activi s-au imp^rjit in doud
serii sterice, D i L, dupd inrudirea configurajionali cu un compus de referinpl.
care este gliceraldehida (vezi i aminoacizii). Se consider^ c&
monozaharidele avand configuratia atpm.ylni..de^aito
dej^moam^
aparfin seriei_ sterice D, iar cele avand configurafia aceluiai atom de
caftonTlenHcd cu cea a carbonuiui din L-gliceraldehidS aparfin seriei sterice
L. In Fig, VII. 1 i Fig. VII.2 sunt redate structurile stereoizomeriior aldozelor i
cetozelor aparfinand seriilor D.
297
5~
Nu toji stereoizomerii posibili se gasesc In nature. Cele mai rftspandite i
importante din punct de vedere biologic sunt aldozele D-ribozff, D-glucozS.
D-galactozU i I> manozll i cetozele D;:rihu]pzfi i D-fructozd (numele
cetozelor se formeazS in general inserand sufixul uiu in numele aldozei
corespunzatoare). In natura se gasesc i zaharuri aparfinand seriei L, cele
mai importante i rdspandite fiind L-fucoza i L-sorboza, De subliniat cd
apartenenfa la seria D sau L nu exprimS sensul de rotate a planului luminii
polarizate de c&tre zah&rui respectiv, ci se refers la configurafia absolute a
atomului de C* cel mai depdrtat de gruparea carbonil Din acest motiv este
necesar ca, pe langii convenfia de simbolizare D sau L, s3 se noteze i sensul
de rotafie prin + sau Un compus aparjinSnd seriei D poate fi levogir D (~)
sau dextrogir D (+). Evident, fiecare ozd aparfinand seriei D ti aflii
CH^OH CH?OH
298
.Semiac^laliL^alfimi se iormeazh' cu participarea unei gmpflri -OH situate
intr-o
pozi|ic relativE,fatS...dc carbonileare..SilDemilt|^|m.......samjase
atomi (i nu mai mic sau mai mare), intrucat aces tea sunt favorizate din
punct de^ed&m engrfetic prin
In cazul ciclurilor de cinci atomi unghiurile pentagonului sunt foarte
apropiate de cele pe care le fac carbonul 1 oxigenuJ hibridizaji sp3 (108 fa$
de 1092jQ. In. cazul ciclurilor de ase, atomii nu sunt coplanari, generand
conformed, jpaijg sau scayri, in care unghiurile sunt de(l09^)
Structurile ciclice se formeazh in cazul aldohexozelor prin participarea
carbonilor 1 i 4 sau 1 i 5, iar in cazul cetohexozelor cu participarea
carbonilor 2 \ 5 sau 2 i 6. Structurile mongzahatildox continand numesc
furanozice (prin
analogic, cu heterociclul furan) in tiinp ce acelea conjinand ciclpri de sase
atomi se numesc piranorice^(prin analogic cu heterociclul piran).
r
GHO
CHOH
CH0OH
CH2OH
!" '
|
I
1
I
1
CHOH
CHOH
C-0
COH
I
10
1
i
CHOH
CHOH
CHOH
CHOH
i
i
1o
-CHOH
CH---CHOH
CHOH
11 1
|
a
Ho
1
l
1
1
/
CHOH .
CHOH
CHOH
CH-------}
I
1
1
i
1
CH2OH
CH2OH
CH2OH
CH2OH
fur
str.
cetohexo str.
an
aidohaxozS
furanozica
za
furanozica
piran
CHOH
I
CHOH
I.
CHOH
O
I
CHOH
i '
CH-----------------------1
I
CH2OH str. piranozica
CH2OH
1/i COH
I
CHOH
I
CHOH 0
I ' '
CHOH
CH2- - - -:1
str. piranozica
299
Structurile piranozice sunt mai stabile. In. solute decat cele ftrangzjce,
care se intalnesc, mai ales, in combinajii ale ozelor,
Ca urmare a reaqiei de ciclizare piin seniiaceXalizare, fostul carbon
carbonilic devine carbon asimelric putand sfi adopte douft configurajii sterice
diferite. Apar doi stereoizo- meri supranumerari numijiCgnorne^, in care
1X
i
-o
I
o
1
-
1
OH
H
c - OH
1
Hj C 7
OH
HOH2C c - OH
fl)
^ CH2OH
O
300
HO H
v
C
H-C-OH
HO-C-H C !
H~C------s
H-C-OH
!
CH2OH
P glucofuranozS
HO H
v
C----------H-C-OH i
HO-C-H O
I
H-C-OH
1
H- C-----CH2OH
p - glucopiranoza
CHO
i
H-C-OH
\
HO-C-H
i
H-C-OH
l
H-C-OH
1
CH2OH
glucoza
a)
AT'
H-COH
H-C-OH
I
HO-C-H
1
H~C----l
H-C- OH
\
CH,OH
(X- giucofuranoza
CHgOH
(X - glucopiranoza
CH2OH
HOK 1 N0_ i
HO-C-H
1
O
H-C- OH j
H-CCH2OH
p- fructofuranoza
HO
HO'
HHCH2OH
0 1
C-H
C~
I
CH
OH
OH
p- fructopiranoza
CH2OH
I
c**o
I
HO-C-H
I
H-C-OH
i
H-C-OH
!
CH2OH
fructoza
CH2OH
CH2OH
a-D-fructofuranoza
(3-D-fructofuranoza
Fqrmulele Haworth au a van lajul*. iajiiikxefe de?"ptbieeJIeV dc? 'pdsfra
indmduahtatea atunci cand sunt
unghi. De remarcat cS formulele Haworth prezlnta cicluriie ca fiind plane.
Aceasta este relativ cored pentru. ciclul furanozic degi studiile de difrac|ie a
razelor X efectuate pe fructofuranozS au demonstrat c3 patru din cei cinci
atomi ai ciclului sunt in acelasi plan, in timp ce al cincilea iese din plan cu
0,05 nm.
Cicluriie piranozice pot adopta, ca gi ciclo- hexanul, conformajii f&rS
tensiune corespun- zand conformerilor' baie sau scaun. Studiile cu raze X au
demonstrat ca cicluriie de ase, conjinand un atom de oxigen, se gilsesc
exclusiv in conformajie scaun (Fig. VIL4).
302
-JO
Aminozaharuri
Inlocuirea in molecula unejLozfi-a unei .gmp2i:U)idj:Qxi],cu o
gmpm^miEaJa nagtere la arninozaharuri. Cele mai importante aminozaharuri
sunt jlucozamina, galactozarmna, i manozamina. compusi care se gSsesc in
structura gligppro^n^r/f^ofcoghcanilor si' mai departe).
In proteogiicani se gasesc cu precMere sub forma N-acetilatft sau Nsulfatatfi:
CH2OH
CH2OH
CH2OH
CH2OH
NH S03H
cc-N-acetil-galactozamina
N-sutfatul-galaetozaminei
Prin condensarea unei molecule de manozamiml cu 0 molecula de acid
piruvic rezultft acidul neuraminic:
H
COO
C=0
H
t
I
H2
1
N
C
G-0
H|
|
HO C
CH2
H + | CH? CO COOH 1
H
C
1
H
C
OH
H
OH I
j
C
OH |
CH2O
H
H2N
HO
H
H
C
Hj
C
H
i
C
OH
C
OH
|
CH2O
H
303
-II-
; !r
\u :'S>.
H:
i-
*:
i'jil
CC
i: j
I
CH2
0
I
.
u
H C GH
I
H,N C H
i
1
-------- C H
!
H C OH
I
H C OH
I
CH2OH
acid neuraminic
Dezoxizaharuri
Inlocuirea unei grupari hidrox.il din molecuia unei oze cu un atom
dejridrogen da natere la dezoxizaharuri. Un dezoxizahar important este 2dezoxiriboza, components glucidicft din structura acizilor dezoxiribonucleici
(vezi acizii nucleici).
Un alt dezoxizahar important, provenitdin galaciozl i anume 6-dezoxi-(5L-galactozi1 sau (i-L-fucoza, este prezent, aiaturi de acidui sialic, in structura
glicoproteinelor:
CHO
I
HO C H H C OH
I
H C OH
I
HO C H
I
CH3
L-fucoza
p-L-fucoza
H
O
H
H
CH
O - Q-H
O -Q-H
HO C-H
1 -A
| <
1
A
1
H C OH
H C OH H C H
C OH
OH
C
H
C OH
H C OH H
OH H
1
1
C OH |
CH2OH
CH2OH
CH2OH
CH2OH
Dfructoz
D- giucoza
D-sorbitol
a
D-mariitol
In diabetul zaharat se formeazS mail cantitdji de sorbitol, prin excelenpt in
retiml, ceea ce contribute la instalarea refinopatid diabetice.
2. Oxidarea ozelor poale decurge fie la gruparea carbonii, cand se obfin
acizi aldonici, fie la gruparea alcool primar, cftnd se obfin acizi uronici.
Oxidarca glucozei, sub forms de ester glucozo-6-fosforic la add 6-fosfoglueonic este o reacjie catalizatft enzimatic cu care debuleazii o cale de
metabolizare a glucozei avand ca scop
objinerea de pentoze (vezi $untul pentozelor). Ca acceptor de
CH2
305
-13f
3..
" ;
3
OPO3H2
H2OS NADP4
. (NADPH -r H+*
X
i
0
1
o
X
HO C H
1
H __ C OH
1
H C OH
j
COOH :!
|
H C OH
i
H C OH
1
H C OH
!
'1
;;
acid-6-fosfo-giuconic
CH2OPO3H2
CH
H3C
CH
I
+ H2N
valina
N
termin
als
'
HO
^H
C
H
1
1
C
H
CH,
CH =
N
1
i
c
OH 1
1
C~~
HI
1
C
OH
X
O
1
H3C
NH
1
Amadori
HO
CH2
transpozi
jie
CH
l
i
O
0
1
HC
|
i
H C
H1
1
HC
H i
1
HC
H |
i
CH2mH
CH3
CHgO
H
CO
C-01
1
CH
i
C
OH
1
X
0
1
o
H
CH2OH
Alterarea, prin giicozilare, a unor proteine in diabetul zaharat este
incriminatS in nefropatia, neuropatia, retinopatia diabetics.
4. Esterificarea ozelor cu acid fosforic reprezintS o etapS importantS in
insSi menjinerea ozelor in celulS ca i in metabolizarea lor ulterioarS. Printre
esterii fosforici ai ozelor menjion&m glucozo-6-fosfat.ul fruidozo-^ fnicto
(se
utilizeazS prefixul bis\ pentru desemnarea diesterilor fosforici).
306
CH2QPO3H2
a-gtucozo-6-fosfat
a-fructozo-6-fosfat
a-fructozo-1,6-bisfosfat
5. Formarea gUcozkldor. Gruparea -OH seiniacetaiic& poate forma oxigeneteri cu alji compugi care confin o gmpare-QH (de ex. cu alcooli). Compugii
formaji se numesc glicozide: giicozidele glucozei sunt glucozide, ale
galactozei-galactozide etc. Glicozidele se pot prezenta fie sub forma
anomerului a, fie a ceiui {3. Cele dou& forme anomere ale metil
-glucopiranozidului sunt:
CH2OH
CH2OH
CHOH
I
CHOH O
I
CHOH
H c---------I
CH2OH
dizaharid
dicarboniiic
H C ~ CHOH
I
CHOH 0 CHOH
I
H C---------I
CH2OH
0
. OH
H C ----1
CHOH
I
CHOH O - CH
I
H C --------I
CH2OH
dizaharid
monocarbonilic
308
ff1'
\l
Dintre dizaharidele diearboniiiee cel mai important este zaharoza
(sucroza), glucid foarte r&spandit In regnul vegetal i anume in trestia de
zahr si xn^ sfecllt, avand o valoare nutritive deosebiUL
.Zaharoza este constituitSi dintr-o molecule de a-giuc6pkanQz..$i una de
$-fTuctofuranozii legate 1 - 2, fiind un a-gIucopinifK)zido-|3~fructofuranozid (leg&tuni
diglicozidicil);
CH/OH
Ov
OH
HO
OH
O
zaharoza
HCH2C
OH
zaharazeil denumirtl i [invertaziU zaharoza,
Prin hidrolizS enzimatidt sub acjiunea. zah&r dextrogir ([a] ^ ~ + 66,5),
formeazS un amestec echimolecular de fructozft levogird# ([a] D = - 92)
sffiglucozji dextrogirgi ([a] jj? = + 52,5), care va roti planul luminii polarizate
spre stSnga. Acest proces de hidrolizS a zaharozei poarth, din acest moliv, i
ntimele de invertire a jfMnjliLi.
Zaharoza nu prezintS proprietdfile ozelor conferite de gruparea
semiacelalich, virtual ear bon il (caracter reduchtor, formare de osazone,
anomerie), intruc&t ambele gruphri sunt angajate in formarea leghturii
glieozidice.
Dintre dizahaiid.de monocarbonilice cele mai impoilante sunt maltoza,
celobiozji i lactoza.
Maliaza^rezulth formal prin eiiminarea apei infre hidroxitul semiaeetalie
al unei
mola:ule^^a-D:glucQX>Eanx)z^i hidroxi 1 ui rliii
D0zitia5.....a alte-i
molecule a-D^
glucopiranozd, fiind o a-glucopiranozido-4-glucopiranozh (legSturS
moooglicozidich):
CH2OH
CH2OH
IVlaitoza
309
if
Maltoza ia nagftere prin hidroliza enzimaticfl a amidonului si glicogenului.
Celobioza este dizaharidul format din douft molecule de B-glucopiranoza
legat.e 1,4 fiincl o g-glucopiianozido-4-glucopiranozfl:
Ceiobioza
Celobioza ia natere prin hidroliza celulozei.
Lactoza rezultft formal prin diminarea, unei molecule de aftjintre
hidroxilul semiacetalic al ft-D-galactopiranozei hidroxilul din pozi(:ia 4
aiumeLmolecule de j3- glucopiranozS, fiind o (3-galacto-piranozido-4gIucopiranoz&
CH20H
CH2OH
Lactoza
Lactoza se g&sete !n iaptele manriferelor care o sintetizeaza din glucoza.
Sub ac|iunea unei|p2gt^tozidaze}esie hidroiizatft la zaharurile componente.
Dizaharidele de tip monocarbonilic prezinfd, desigur, proprietajile ozeior
date de gruparea carbonil (caracter reducfttor, formare de osazone). Intrucat
dispun de un hidroxil semiacetalic liber, virtual carbonil, prexinta, de
asemenea, i fettomenul de anomerie.
VII.
1.3. POLIZAHARIDELE
Polizaharidele sau glicanii sunt compui glucidici care prin hidroliza
chimicd sau &QZmMk& fonneazd monozaharide sau derivaji ai acestora
(glucozamina, galacdozaminA acizi uronici, acid N-acetil - neuraminic).
310
~/<3
Se disting:.
OH
OH
OH
OH
- aniilopectina, in care resturile glucozil se leagS nu numai prin legaturi ot(M)glucozidice, ci gi prin legaturi q-( 1 AVglucozidice conferind moleculei o
structura
ramificata:
rcsturi glucozil
(Fig. viirs).
este soiubil|ji ap3, fonpand solufo coloidale sau micelare care dau cu iodul o
colomtie rosie, Prezenfa ramificajiilor in amilopectinS duce la o molecuia de.
tip, globular, foarte condensajtL.(Fig. VII.6.)
Glicogenul este echivalentul animal al amidonului vegetal, reprezent&id
forma de depcjzitare a excesului de hidrati de carbon. Rezerve semnificative
de glicogen se giisesc in muschi i in ficat. CantitSti mici de glicogen se
gftsesc in (oate- fesuturile, inciusiv in creier. Din punct de vedere al
structurii, glicogenul este asem3n&tor amilopectinei, cu
deosebirea c& glicogenul,. avand on
numjfrm^
leglluri 1.6 y
glucozidkc. este
mai ramifieat. Catenele laterale sunt formate in medie din 10-15 Linitafi de
glucozS, in centrul moleculei int&lnindu-se o ramificafie la 3 - 5 uni^fi de
glacozS. Acest tip de organizare face ca glicogenul sd prezinte o sjructurfl
arborescent^ (Fig. VII.7).
Glicogenul
are,, o gnasd moleculard je
ordinul milioanelor.
formeazil solu|ii
cploidale care cu iodul dau o coloratie brun-ragcattLce nu dispttre la cald.
VIL2. DIGESTIA 1 ABSORBJIA GLUCIDELOR
Glucidele ne parvin din alimentajie sub forms de polizaharide (amiuon,
glicogen, penlozani, celujozg), dizahmde (zaharozd, maltozit, lactoz&) i
monozaliaride (glueozS, fruclozi, galactozii, pentoze) intr-un raport
procentual ce variazd cu varsta. Intrucat singura formS absorbabilil este cea
de monozaharid. este necesar ca polizaharidele i dizaharidele si fie mai intai
hidrolizate la monozaharidele componente in cursul procesului de digeslie.
Digestia amidonului, zaKSrul cel mai bogat: in diets, incepe prin acjiunea
tffmilazei)
i$airvarS)i continue in intestinul^subjire sub acfiunea Ijmilazei pancreatic^.
Ambele tipuri de amilaz.isi incep acjiunea de la periferia moleculei spre
cent.ru, desfftcand exclusiv
a
#
**
V
*
V
.*
****
S* #
ffif
P*
#*
*
a#*
*
** ***
\~-x
*
<&
*
is,'
Fig. VII. 6 - Structura amiiopectinei
.* .
#
.: i//
* >**
X
r
/
1
/
?
'
1@ 1
L
#< 2
*
*
\
/
V
--V
.*:
*s
0
a4.'
*
% // *u
*!/%
5
*-* * F *
*
#
* 1 5
t
*
ATP- aza
Fig. Vii. 8 - Transports glucozei prin mucoasa intestinal#
VII,2.1. DEFICITE ENZIMATICE IN DIGESTIA 1 ABSORB JIA GLUCIDELOR
Exist# anumite anomalii in digeslia dizahatidelpr, determinate de deficitul
enzimatic fal dizaharidazeiorjcare due la intolerant# la dizahjtride. Deficitul
de lactazd duce la intoleranjd la lactoz#, cel de zaharazd la intolerant# la
zaharozd. Semnele clinice ale intolerance! la dizaharide sunt eomune i se
exprim# prin/ybureri _abdominale^^iaree gmicd^jflaUile^i, -Acumuiarea in
intestin a dizaharidelor, compusi osmotic activL create presiunea osmotic# i
favorizeaza intrarea apei din spafiile interslijiale in lumenul intestinal ducand
la pierderi digestive de apd. Procesele fermentative declansate.deJlQm
microbian# genereaz# produgi care iritd mucoasaJnjjas.tmal4. (de ex. acid
lactic); in extremis, aceasta devine permeabild la dizaharide, care se vor
elimina prin urind.
316
graparea fosfat, putemic ionizatii la pH~fizioiogic, conferd molecule! de
glucozo-6-fosfat o incdrcare net&jiegativli i anse minime de a strSbate
membrana celuiara,
Basforilarea glucozei, in prezen|a(^E^xaJaaator.de.-gnipai^^slatfl este o
reaejie ireyersibild catalizatS de;'bexpkiMz;'i
C
H
CHO
O
j
1
i
1
H C OH
H
C
OH
l
1
H
C H
HO
c
O
H
1
Mg2*
i
H C OH -f ATP
H
c OH
1
+
Jill
i
hexokinaze
H
H
c OH
C OH 1
1
CH2OPO3
CH2OH
H2
0H
OH
2, Fosforilarea frugtozo-6-fosfatului (P-6-P)
Fosforilarea
gjructofuranozQrl.,6 -bisfosf^|. (F-l, 6-P,)^
se realizeaz# tntr-o reac^kevgrsibilg' (AG = - 3,4 kcal) jsatalizatii de[6fosfofructo-1 -)
kin^a>(6-FF4K).^^^
~
OH
'
OH
Diiitre toate enzimele implicate in giicoliza, 16-fosfofructo-1 -kinaza^ste,
atat in ficat cat in rinichi i mu^chi, enzima cu activitatea
ceTmmlegiisy"Xmpioarea degradarii hexozomonofcsfafilor depinde, in aceste
tesuturi, de.viteza conversiei(|mctozo-6~fosfat - fructozo-jU^bisfosfat, care
este dec? etapa limitantft de-j/itezilin giicoliza.
6-Fosfofructo-i-kinaza este o enzim&~aiosteric2 a carei activitate este
controlata de numerogi efectori metabolici, pozitivi sau negativi.
Astfel, 6-fosfofructo-J.ddnaza este sgns^bi^ .energe.ti.ee a celulei, ATP
comportandu-se ca inhibitor alosteria Concentrajiile mari de ATP intraeelular
inhiM activitatea enzimei prin legarea la un situs alosteric, difent de
locuf^Sv^cel^^AlP^ ca substrat, sub forma complexului iMg 2+-ATP. /
1
Forma anomerica preferata de enzimele glicolizei. (ca gi de cele ale
^untului pentozelor) este forma (k aga cum atesta studii recente de cinelica
enzimalica gi RMN.
319
De menjionat ca AMP (ca i ADP) se comportd ca efector poziiiv,
suprimand inhibijia pria ATP.
Constat area eft in mu^chi fluxul glicolitic poale varia de peste 100 de ori
in tisnp ce coneentraj'ia ATP variazd cu mai pujin de 10% in irecerea de la
stanea de repaos la activitate intense poate ft explicate prin consideraiea
activitdjii adenilat kinazei (miokinaza). Aceastd enzimd, preeminent^ In
muchi (dar i in float i alte Jesuturi), converted ADP rezultatin cursul
contracjiei musculare in ATf i AMP: 2ADP ^ ATP + AMP, IntrucSt concentrajia
ATP este de aproximativ 10 ori mai mate decat cea a ADP i de aproximativ
50 de ori mai mare decat a. AMP este uor de injeles cd semnalul metabolic
reprezentat: de variajii minore in concentrajia ATP este amplifleat, fiind
perceput ia nivelul activitdjii miokinazei in concentrajia ADP, dar mai ales in
concentrajia AMP care se modified major :
([AMP] = [ADP]2 Kccb/[ATP]); astfel, o crejtere procentual minord in
concentrajia ATP, incapabild sd inhibe substantial activitatea 6-fruct.ozo-l
-kinazei, antreneazd o seddere procentual majord a concentrajiei AMP,
suficienld pentru a deprima semnificativ activitatea enzimei,
cf>Fosfofructo-l:kinaza| este inhibatd. de asemenea, de fnafoenolgmivat
i 1,3._ llisfosfoglicerat, intermediari macroergi,ei.mi,.gMcoIizei.
Dependenta activitdjii 6-fosfofructo-1 -kinazei de modiflcdri minore in
statpsul energetic^ celulaijpeimite un control riguros al cantildju de glucozd
antrenatd in glicoliza.
A5 Un inhibitor pateniic nl enzimei s-a dovedit a iiMcMtik care
acceiitu.eazd inhibijia prin ,v#' \ ATP, Citratul, internediar a! ciclului Krebs,
format din acetiTCpA provenit in faza ,n j anabolied din piruvat, recle din
glucozd, se acumuleazd la concentrajii man de ATP (vezi 1 reglarea ciclului
Krebs) i iese in citosol unde inhibd. enzima cheie a giicolizei. Hfecti.il \
Pasteur - respectiv inhibijia giicolizei prin respirajie - ar putea avea aceastd
explicajie.
In Jesuturile ettre fac sintezd de acizi grai din glucozd, citratul ieit in
citosol servete ca donator de grupdri acelil i totodatd ca activator alosteric
al enzimei cheie a procesului- de neolipogenezd. Acumularea de citrat in
citosol reprezintd semnalul celular al satisfacerii nevoilor energetice ale
fesuturilor ca i al necesarului de int:ermed.iari biosintetici al acestora.
Inhibijia prin citrat a 6-fosfofnicto-l-kinazei are i o alia rajiune in jesuturile
care utilizeazd de preferinjd acizii gmi ca sursd energetied (muchiul
scheletic i cardiac) ca i in jesuturile glucoindependente in perioadele
catabolice. in fazd catabolicd raportul glucagon insulind mare, care-i este
propriu, activeazd lipoliza in Jesutul adipos avand ca rezultat aflux de acizi
grai spre Jesuturi. Degradarea acestora prin (Toxidare dace la acetil-CoA
mitosolic care este introdus in ciclul Krebs, via oxaloacctat, sub foimd de
citrat. Cfrnd concentrajia de citrat depdeie posibilitdjile de utilizare In ciclul
Krebs, citratul acumulat iese in citosol i, desigur, inhibd 6- FF-i-K, ceea ce se
soldeazd cu acumulare de glucozo-6-fosfat, inhibitor alosteric al
hcxokinazelor extrahepatice. Reducerea capacitdjii de preluare a glucozei din
circulajie, subseeventd utilizdrii acizilor grai, reprezintd una dintre
modalitdjile prin care jesuturile glucoindependente cmjd glucoza sangvind
: ;
'23
I
i:
ii-
322
- 3D
3. Scindarea. fructozo- 1^6-bisfp^fatului
Fructozo-1,6-bisfosfatul este scindat la doud trioze: glicgraldehid-3-fosfat
i dihidroxiaccton-fosfat, intr-o reacfie reversibild catalizatd de o liazd.
fructozo-1,6^ - bisfosfat iiaza sau aldolaza:
CH2O
I
C=0
CHO
I
+ CHOH
CH2OH
CH2O0
Intre esteriifosforici ai triozelor objinute se stabilegte un echilibru,
conversia unuia.in celdlalt fund catalizatd de o triozofosfat izomerazd:
CH2OH
CHO
1
I
1
C-0
CHOH
j
|
CH2O0
CH20
Cum forma aldehidicd este foarte reactlvd, toate transformdrile ulterioare
vor avea ca punct de plecare gBceFaIdehid-3-fosfatul fapt ce implied
deplasarea echilibrului de mai susjn
geji^urautilkgrii jale.
4, Oxidarea fosforilanta a gliceraldehid-3-fosfatului ___
Qxidarea gliceraldehid-3-fosfatului la 3-fosfoglicerat este catalizatd
defidceraldehid-i) iosfat dchidrogiBzLsi implied participarea obligatorie in
procesul catalitic a unor grupdri sulfhidril ce coopereazd cu iNADj legat ferm
de enzimd (spre deosebire de aite dehidrogenaze NAD dependente), Enzima
este mhibatd de iodpacetat i alfi reactivi liplici. Procesul de oxidare
presupune urnidtoarele etape:
a. adi{;ia^unepgrupdr^-SH din central activ al enzimei la gliceraldehid-3fosfat, cu form area unui semitiaacetal (analog semiacetalilor) i oxidarea
PO,H3
c. depIasare:a^_NADH .legal
decApe^N^
CONH2
NAD+
NADH + H+
SH
oo
10
COOH
i
K*
------*
Mg2*(M
n2t)
1
C - 0 + ATP
i
CH3
Piruvat kinaza se prezinta sub forma a jfouft flzoenzimS de tipJL, proprie
ficatului, 1 de tip M, proprie mu$chiului, izoenzimele de tip L sunt enzime
alosterice, tetrameri, suscgptibile la acfiunea a numero^.i efectori
metaboJigi: etapa catalizata de piruvat kinaza reprezinta, din acest motiv, un
punct de control important al caii glicolitice. Printre
efectorii
.enzimei hepatice se numara fructozo-1, 6-bisfosfatul care
funcjioneaza ca
activatoijffiActivarea unei etape dintr-o secventadereactii printr-un metabolit,
.........................................................................................substrat
al unei etape anterioare poarta numele de feed-forward stimulare.
Exptimand. activitatea enzimei limitanta de vitezd, fructozo-1, 64)isfosMul
3reviiiea enzima, situata. in aval, asupra cantitatii de fosfoenolpiruvat caieia
CH2
I
c-oI
CH3
327
-bfr
Glucoza
ATP
ADP
hexokinaza giucokinaza
"O
. Glucozo 1 -P
Glicogen
Glucozo 6-P
t
Fructozo 6-P
ATP ADP *
6FF-1-K
Qi-----ATP, citrat
(+)'-------------------AMP, fructozo-2,6-bisfosfat
Fructozo 1,6-bisfosfat- -Citoplasma
2xGliceraidehid~3-P - 2xNAD+
-2xNADH + H+
2x1,3-bisfosfoglicerat 2ADP
I 2ATP
2x3-Fosfoglicerat
2x2-Fosfoglicerat
2x2-Fosfoenoipiruvat
2ADP2 ATP l .
Piruvatkinaza
0
2 x Plruvat ATP, alanina
NAD
2 xLactat
NAD +
Citrat
Oxaloacetat
Acetil-CoA
I
Acizi grasi
I
Liplde
Fig. VII. 12 - Glicoliza (reacjii i reglarea procesului)
BILANJU'L ENERGETIC AL GLICOLIZEI
Degradarea glucozei pane ia lactat reprezintS un proces exergonic ce
eiibereaz& o cantitate redusft din conjinutul energetic ai glucozei. Energia
eliberate_ este partial incorporate sub forma de ATP. De remarcat c8. in
procesul de glicoliza anaerobe energia nu se,_elibereaze prin oxidarea -NADH
la niveiul. lanjului respirator, urmate de cuplarea cu fosforilarea, ci exciusiv
..substratulni. In aceste
328
condifii glicoliza isi asigurd pe cent propriu" reoxidarea echivalenfilor
reduedtori, MAOH^rezultat in^et^a glicgraldehidfosfat dehidrogenazieg.
fiind reoxidat la NAD, in cursul readier de tregere a miniva^^
Etapele de fosforilare la nivelul substratului, in care energia incorporate
infoun substrat macroergi'c este transferatd ADP, cu form area ATP, sunt:
- conversia 1,3-bisfosfoghceratului la 3-fosfoglicerat;'
- cqny^rsia.fosfp^
la piruvat.
Cum dintr-o molecule de glucozd rezultd dou3 molecule de.trioze,
cantitatea de ATP formate este de 4 ^
.glucozd fransformatd in lactat.
Cagtigul energetic
net este insd de numai moli ATP dacd^degradarea pornegte de la glucozdj
intrucat reacfiile catalizate de kina/e ?i aiiurne:
ATP
glucoza------------------------------^ glucdzo-6-fosfat *
ATP
fructozo~6-fosfat ----------------fructozo-1, 6-bisfosfat .
s
gmsurngf^ moli ATP) Daed degradarea pomete de la glicogen cajtigul net
este de .Mali AJP intrucat gkicozo-6Tosfatul se obtine prin fosforoliza
glicogenului, neconsuma- toare de ATP. Considered cd energia eiiberatd ia
hidroliza iegdturii fosfat terminate din ATP este de 73 keal/mol, cantitatea de
energie eiiberatd in cursul glicolizei este de 73x2=14,6 keal/mol glucozd,
respectiv 73x3=21,9 keal/mol glucozS. Caotdatea. de energie eiiberatd este.
relatiy mied, astfel incat glicoliza anaerobd pare neayantajoasd. din punct
dej/edere energetic, Viteza foaite mare a fluxului. glicqUtic. permite insd
funxizarea unei cantitlgi de energie care sit satisfacd, cel pu{in pentru
perioade relativ scurte, necesitdjile energetice ale fesuturilor in absenfa
oxigenului. Consumul crescut de glucozd face totui din glicolizd o cale
neecqnomicd.
Dacd anaerobioza este de scurtd duratd i in sistem apare oxigen, lactatul
este oxidat la piruvat. In condijii de aerobiozd piruvatul, format prin
parcurgerea edii Embden- Meyerhof de cdtre glucozil, este oxidat pand la C02
i H20 in scopul eliberdrii integrate a energiei incorporate in molecula
glucozei. Oxidarea finald a oriedrui metabolit presupune antrenarea acestuia
I
OH
pi
o<
V
CH
I
HC
I
OH
Reacfia este catalizakl de subunitatea a a E,,
UrmeazS etapa de oxidate proptiu-zisfi. constand in
pierderea_hi.drogenului i tonsformarea acetaldehidei in radical aeet.il
Reacjia este catalizatft de subunitatea [3 a pjruvat dehidrogenazei (E,). Cum
reaejia se desOioarii in prezenja acidului lipoic, se
330
'03
formeaz# agid...j^cetiLdipoic. De remarcat faptui c# energia eliberat# prin
oxidare se reg&sete in tioesterii care se formeaz# (acetil ~ lipoic i apoi
acetil -CoA).
OH
Radicalul acetil, temporar legat la acidul lipoic, este transferal coenzimei
A cu form area acetil-CoA-tioester macroergic:
SH S ~ COCK
SH SH
4- CoASH
+ CH* C
o
SCoA
Acidul lipoic astfei redus se reoxideaz# in prezenja lipoat dehidrogenazei,
flavin enzim# ce transfer# hidrogenul acidului lipoic pe FAD,
SH SH
S ----------------------------.s
+
FAD
+ FADH2
Atomii de hidrogen din FADH2 sunt apoi transferafi pe NAD.
Reacfia global# a decarboxildrii oxidative a piruvatului:
CH3COCOOH + NAD* + CoASH ^ CH3CO - SCoA + NADH + H+ + C02
este o reacfie ireversibil# avand un AG* foarte negativ (-8 kcal).
Ireversibilitatea acestei reacjii constituie motivul pentru care acizii grai cu
numSr par de atomi de carbon sau divert aminoacizi ce formeaz# prin
degradare acetil -CoA nu sunt glucoformatori (vezi gluconeogeneza).
331
De menjionat cS in avitaminoza B, decarbo?$ais^ realiza prin lipsa TPP,
ceea ce are grave repereusiuni asupra
in
sitiiajiaj^^nu jutea^M
Defi ci tul,, si stem u! ui
vat dehidrog
este responsabil de fenomeneje nervoase ce caracterizeazS boaia beriberi (in
dialect indonezian = nu pot! exprimand deficitul jieuro-muspplar) dar i
pejnarii amafori de aicooL Enzimeie implicate in decarboxilarea oxidativS a
piruvatului, i anume: piruvat dehidrogenaza, lipoil reductaz transacetilaza i
lipoatdehidrqgenaza, alc&tuiesc, aa cum
s-a ar&fat, un sistern^multienzimatic cu o determinaae
Pe .jniezuT
sistemului, reprezentat de lipoil reductaz transacetilazS, sunt ancorate
celelalte douS enzime. Transfonnarea substratelor presupune ca acestea sS
fie purtate succesiv la enzimeie sistemului, Intr-adevSr, operajiunea este
realizatS de eSire acidul lipoic legal la radical ul lizil din molecula lipoil
reductaz transacetilazei care realizeazS astfel un braj flexibil de
aproximativ 1,4 nm:
S "--- S
CH2CH2~~CH2CO NHCH2CH2CH2CH2OH CO
NH
Acest hraf incSrcat efectueazS o migcare de du-te vino intre grupSrile
prostetice ale sistemului multienzimatic in cursul cSreia fiecare enzimS ii
realizeazS acjiunea, produsul unei reac^ii enzimatic cataiizate devenind
substrat pentru urmStoarea enzimS, fSrfi sS difuzeze din complex (Fig. VII.
13).
Grganizarea color trei enzime intr-un sistem multienzimatic confers o
eficienfS deosebitS procesului catalitic, excluzand hazardul coiiziunii
substratelor cu enzimeie respective, pe care bar presupune existenja
acestora in stare liberS.
CercetSri recente au evidential faptul cS la mamifere sistemul piruvat
dehidrogenazS este sediul unui control metabolic riguros realizat atat prin
efectori alosterici cat i prin modificare covalenlS, respectiv prin trecerea
reversibilS a formei fosfo in defosfo. Conversia defosfo-piruvat
dehidrogenazei la fosfo-piruvat dehidrogenazS se realizeazS in prezenja unei
kinaze, AMPC independents, parte integrants a complexului multienzimatic, i
coincide cu innctivarea enzimei, in limp ce conversia fosfo-piruvat dehidrogenazei la defosfo -enzimS este catalizatS de o fosfatazS specifics i duce la
activarea enzimei.
Forma activS, defosfo, a complexului piruvat dehidrogenazS este inhibatS
alosteric de produii acjiunii sale, acetil ~CoA i NADH care sunt in acelai
timp i activatori
332
alosterici, ca i ATP, ai piruvat dehidrogenaz-kinazei, enzixM ce fosforileazft
subunitatea
Ela a piruvat dehidrogenazei, inhiband-o.
Spre deosebire de acetil CoA i. NApfl. piruvatuL ca i CoA-i NAD,
substrate ale complexului multienzimatic, ina.ctiveazfi, la ^oaenlxalMjIiari,
Xo
334
fCitrat sintazafeste o enzima alostgric^ inhibata de ATP, NADH, citrat,
acted gva$i cu lant-lung, ca i de succinil-CoA.. intermediar al ciciului Krebs.
S.e4der^j^inMjiiMciti:3t ,sintazei penfru acetil~CoA ia concentratii marl de
ATP permite ciclnlui Krebs s&-si adaoteze ritmul la necesitatile energetice ale
tesuturiloL De remarcat oil in ficaf si alte. tesirturi.care fae neolipogeneza, formarea
citralului reprezintil o r&sp&ntle metabolic^ extrem de important# in care se
hot&r>e soarta acetatuiui activ. Acesta se poate angaja nu numai in
etapele ulterioare ale ciciului Krebs ci i in biosinteza de novo a acjgjtoi
jgrasL care are loc In citosol. Intruc&t acetibCpA
nu .poate IravgmiBmbraaa mitosoUca, strategia adogtatf.
de celuia consta in eaaaiMjau SUb-JonaLik....dlat, prin mtermediul unui
transportor
specializat, urmatft de clivarea la acetil-CoA si.oxaloacetaf;
citrat iiaza
citrat
acetil~CoA * oxaloacetat
ATP
ADP + P\
Iesirea ctotului din mitosol, In vederea angajdrii sale in neolipogeneza, are
loc exclusiv in condijiile in care evolufia sa in ciclul Krebs este blocaUl prin
cantitatile man de ATP si NADH, rezuitate prin metabolizarea glucozgi, care
sunt mhibitori ai enzimei limitante de yiteza (vezi mai jos),
2. lntr-o etapa ulterioara, citratul este izomerizat la izocitrat prin
intermediui aciduiui, cis-aconitic sub actiunea j^onilazeD
CH2 COOH
CH
HOCOOH
C COO
H H
II
+ H20
H20
C
_____
COOH
1
1
3Bw
C HO C
"
H COO
COOH
S---H
I
41
H2O
NAD* NADH + H+
O
ii
C COOH + CQ2 OH2
CH2 COOH
A fost demonstrata exislenja a doua izoenzime ale izocitrat
dehidro^eitazei; una NAD dependenta, prezenta exclusiv intramitosolic, si
cealaltS KADP dependenta, avand o dubl& localizare: intrarnitosplica gi
citosolic&.{Enzima NADJdependenta estep enzima alosterica av^nd ca
efector pozitiv APR, ceea ce sugereazS ca ea este forma implicata in
desi:aurarea ciciului Krebs, calc catabolici avand ca scop sinteza de ATP.
Activarea
335
4V
enzimei prin ADP antreneazft faptul c3, ori.de cSte ori concentratia ADP este
mare,' enzima isi mSrggte semmficativ activitatea. Simultan, activitatea
intregului ciclu create, etapa..calaikatS de izocitrat dehidrogenazariind_etaga
iimitania de vitezli, Enzima:...este inhibata alosteric si
Uzocitrat dehidrogenaza NADP dependents! este, dimpotriva, inhibata de
ADP i stimulate de ATP. Cum enzima este active tn condifii ce favorizeaza
sintezele (ATP crescut), s-a conchis ca enzima este impiicata, aiaturi
defenzim^mabcljgi zeTeHsunf^ in fumizarea NADPH necesar sintezelor
reductive ce se
desf3oarS esenjial in citosol.
4. Decarboxilarea oxidativa a a-cetoglutaratului la succinat are loc similar
cu decarboxilarea piruvatului. Ea necesita prezenja sistemului
multienzimatic^cetopItaF^
dehidrogenaza |care utilizeazS drept cofactori TPP, acid lipoic, CoASH, NAD,
FAD. Energia eliberata la oxidate este Incorporate sub forma unci legSturi tiol
esterice In succinil~CoA:
COOH
COOH
1
|
1
1
CH2
C-01
1
1
- co2 1
CH2 + NAD" + CoASH
CH2 + NADH
+
CH2
CO - SCoA
1
1
COOH
Succinil~CoA. in prezenja GDP si fosfatuiui anorganic, formeazS jjTP i
succinat. Se formeazd o legdturd fosfat macroergicd realizatd prin fosforilare
la nivelul
substratului,
.....
Reacjia este catalizate detsuccinil tiokinaza tsuccinil CoA sintetaza).
CH2 Ct)OH
CH2 COOH
I
+ GDP + P04H3
|
+ CoASH + GTP
CH2 CO ~ SCoA
CH2 COOH
Sistemul a-cetogiutarat dehidrogenazic este inactivat de succniil-CoA gi
NADH i
activat de Ca_2+.
TTalta modalitate de transformare ajuccmihCoA reprezentata,
exclusiv In Jesuturile extrahepalice. de triinsferul CoAjjejiceto
COOH CH2 CH2 CO - SCoA 4- CH3 CO CH2 COOH
s- .
COOH CH2 CH2 COOH -f CH3 CO CH2 CO- SCoA
Reacjia permite metabolizarea ulterioarft a acetoacetatului sub forme de
acetoacetil CoA. Reacjia este catalizate de succinil CoA - acetoacetat
tioforaza (vezi cetogeneza).
336
... ~J 7
la-Cetoglutarat dehidrogenazai este, ca i ipiru vat dehidrogenaza^
inhibatfl de produsii reacj.iei enzimatice; succinil-CoA i MADE, De asemenea,
enzima este sensibil^ la incflrcarea energetic^ aceluiei, fond inhibatS de.ATP
si activ^ta...<kCai+.
5. Oxidarea succinatuiui la fumarat se realizeazS pnn acpunea
pucelfMAMiilrog^ nazeij enzirngj}Janju|u],^respjra,to ayand drept toenzfmd
PADn
CH2 COOH CH2 COOH
Oxidarea succinatuiui la fumarat este jnJiitod competitiv de malonat, un
fals substrat, ca i de concentratii mail de oxaloacetat. Acwnularea de
oxaloacetat inhM propria-i foimare din succinat.
6. Hidratarea fumaratului duce la L-malat i este catalizatS de|fumaraz|
2;enzimd cu stereospecificitate mareabl fumaraza mi folose^te drept
substrat maleatui:
HOOC CH
II
+ H2O
H C COOH
7. Oxidarea maiatului la oxaloacetat se realizeazli sub acjiunea
^alaSehidrogenazeiFi
COOH
COOH
I
NAD*
NADH + H* I
COOH
COOH
I
CH OH
I
CH2
COOH
FAD
FADH,
HOOC CH
II
HC COOH
COOH
r
o
dehldrogen aza
NAD
NADH+H
NAD"
0 ii
C- COO
1
CH2 * coo
CH3-C0-S-C0A
Ace til CoA Cftrat dt?taZCX-*sH*,^ CoA-SH
CH2- COO" -COO"
r CL >
16
2: X
6'
o
>
HO-C- I
CH2~ coo"
Citrat \
\ AcoWita&Si
A
H2O^ \
CH2- COO" C - COO" CH - COO"
Cis-aconiiat
H2O
Aconitaza
N Fe
2+
NAD
CH2-COO"
CH - COO"
I
HO CH - COO + Izodtrat
NADH+H**
CoA-SH
CO 2
CH2-COO t ifr 2+
Mn
CH2 *
c- coo"
ot- Cetogiutarat
Oxalosucdnat
L ADP,Ca2+
ATP,NADH
izodtrat
dehidrogenaza
NH2
0
COOH~~CH2-OH2CH-CDOH
NH2
NH2
fj
hi
q i
acetil-CoA
Izodtrat
-oc-Cetoglutarat Valina Metionina <J Izoleudna Treonina . Propionat
Glutamina t
* Glutamat
t,
Arginina Prolina S- HistidinaJ
Purine
aminoaaa
Fig. VII, 16 - Giclui Krebs - cale amfibolica (m s= mitosol; c = citosol)
340
QSL
4*1
->?;ATP
BILANJUL ENERGETIC AL ARDERII GLUCOZEI