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Molcula

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En qumica, una molcula es una partcula formada por un conjunto de tomos ligados por
enlaces covalentes o metlicos (en el caso del enlace inico no se consideran molculas,
sino redes cristalinas), de forma que permanecen unidos el tiempo suficiente como para
completar un nmero considerable de vibraciones moleculares. Constituye la mnima
cantidad de una sustancia que mantiene todas sus propiedades qumicas. Las molculas
lbiles pueden perder su consistencia en tiempos relativamente cortos, pero si el tiempo de
vida medio es del orden de unas pocas vibraciones, estamos ante un estado de transicin
que no se puede considerar molcula. Hay molculas de un mismo elemento, como O2, O3,
N2, P4..., pero la mayora de ellas son uniones entre diferentes elementos.
Se habla de molculas monoatmicas", pese a lo contradictorio de la expresin, al referirse
a los gases nobles y a otros elementos en los casos en que se hallan en forma de tomos
discretos.
Las molculas pueden ser neutras o tener carga elctrica; si la tienen pueden denominarse
ion-molcula o ion poliatmico.
Una sustancia qumica formada por molculas neutras contendr un nico tipo de tales
molculas, pero si contiene iones-molcula necesariamente ha de contener tambin iones
monoatmicos o poliatmicos de carga contraria.
La qumica orgnica y gran parte de la qumica inorgnica se ocupan de la sntesis y
reactividad de molculas y compuestos moleculares. La qumica fsica y, especialmente, la
qumica cuntica tambin estudian, cuantitativamente, en su caso, las propiedades y
reactividad de las molculas. La bioqumica se conoce tambin como biologa molecular,
ya que estudia a los seres vivos a nivel molecular. Las molculas rara vez se encuentran sin
interaccin entre ellas, salvo en gases enrarecidos. As, pueden encontrarse en redes
cristalinas, como el caso de las molculas de H2O en el hielo o con interacciones intensas
pero que cambian rpidamente de direccionalidad, como en el agua lquida. El estudio de
las interacciones especficas entre molculas, incluyendo el reconocimiento molecular es el
campo de estudio de la qumica supramolecular.
Estas fuerzas son fundamentales para propiedades como la solubilidad o el punto de
ebullicin. Algunas de ellas, en orden decreciente de intensidad, son:

Puente de hidrgeno.

Interaccin dipolo-dipolo.

Fuerzas de Van der Waals.

La dinmica molecular es un mtodo de simulacin por computadora que utiliza estas


fuerzas para tratar de explicar las propiedades de las molculas.

Descripcin [editar]
La estructura molecular puede ser descrita de diferentes formas. La frmula qumica es til
para molculas sencillas, como H2O para el agua o NH3 para el amonaco. Contiene los
smbolos de cada elemento que contiene la molcula, as como su proporcin por medio de
los subndices.
Para molculas ms complejas, como las que se encuentran comnmente en qumica
orgnica, la frmula qumica no es suficiente, y vale la pena usar una frmula estructural,
que indica grficamente la disposicin espacial de los distintos grupos funcionales.
Cuando se quieren mostrar variadas propiedades moleculares (como el potencial elctrico
en la superficie de la molcula), o se trata de sistemas muy complejos, como protenas,
ADN o polmeros, se utilizan representaciones especiales, como los modelos
tridimensionales (fsicos o representados por ordenador). En protenas, por ejemplo, cabe
distinguir entre estructura primaria (orden de los aminocidos), secundaria (primer
plegamiento en hlices, hojas, giros...), terciaria (plegamiento de las estructuras tipo
hlice/hoja/giro para dar glbulos) y cuaternaria (organizacin espacial entre los diferentes
glbulos).

Figura 1. Representaciones de la terpenoide, atisano, 3D (centro izquierda) y 2D (derecha).


En el modelo 3D de la izquierda, los tomos de carbono estn representados por esferas
grises; las blancas representan a los tomos de hidrgeno y los cilindros representan los
enlaces. El modelo es una representacin de la superficies molecular, coloreada por reas
de carga elctrica positiva (rojo) o negativa (azul). En el modelo 3D del centro, las esferas
azul claro representan tomos de carbn, las blancas de hidrgeno y los cilindros entre los
tomos son los enlaces simples.

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