Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
I BIOSTATISTIC
CURS I
Elena Poenaru
elena.poenaru@gmail.com
Course schedule
Biostatistica II 20.10
Biostatistica IV 3.11
Evaluare
Laborator 20%
Examen practic 20%
Examen teoretic, grila 40%
conditie de trecere minim nota 5
Conditii de trecere:
minim 5 la fiecare componenta la laborator
minim 5 la examenul teoretic
Obiectivele cursului
Concepte IT&C si
terminologie
Intelegerea notiunilor de
Informatica Medicala
Aplicatii utilizate in
Informatica Medicala
Notiuni de Biostatistica
Aplicatii utilizate in
biostatistica
De ce acest curs?
Informatica medicala
Informatica Medicala (Health Informatics): este domeniul
Informatica medicala
Stiinta Informatica Medicala: este tiina care utilizeaza
Standardizare
Organismele de standardizare lucreaz la modaliti care
au ca scop ncurajarea colaborrii ntre tehnologi i
clinicieni pentru a asigura reuita deplin la nivel mondial a
aplicaiilor de informatica medicala.
Exemplul relevant este IEEE Standards Association (una dintre cele
mai dezvoltate organizatii la nivel mondial care are ca focus noile
tehnologii si utilizarea lor in beneficiul umanitatii), entitate
recunoscut la nivel mondial ca fiind organismul prin care se
stabilesc standardele de comunicaie, activ implicat n elaborarea
standardelor care contribuie la dezvoltarea telemedicinei.
Standardizare
Instituii de standardizare din domeniul IT (IEEE, IETF, ITU,
ETSI, ANSI, etc) au deja adoptate standarde care privesc
echipamentele medicale, nu doar n ceea ce privete
construcia hardware, dar i legate de modul de comunicaie
sau formatul datelor, pe arii de interes:
coninutul semantic, structura i schimbul de date (ex. HL7, DICOM);
modelul, reprezentarea datelor i specificaii speciale (ex. IEEE 11073)
construcia dispozitivelor medicale (ex. ISO 11633);
interoperabilitatea dispozitivelor medicale (ex. IHE)
securitatea i calitatea serviciului de comunicaie (ex. AES);
securitatea datelor medicale (ex. ISO27799)
Telemedicina
Telemedicina: Furnizarea de servicii de ingrijire a
sanatatii ntre indivizi separai geografic, cu ajutorul
sistemelor de telecomunicaii, de exemplu,
conferine video.
Telemedicina
Totalitatea sistemelor care ajut la procesul de ngrijire a
sntii prin schimbul ct mai eficient de informaie
medical
(Bannet,1978)
Telemedicina se constituie ca un sistem integrat de ngrijire
a sntii bazat pe resurse tehnologice, organizaionale i/
sau sistemice
Telemedicina const n esen n utilizarea semnalelor
electronice, a tehnologiei informaiei i a telecomunicaiilor
pentru a transfera informaiile medicale de la un sistem la
altul.
Telemedicina
Dezvoltarea infrastructurii tehnologice ca suport important n
activitatea medical;
Diminuarea costurilor pe pacient n condiiile n care acestea sunt
ridicate i nu acoper necesarul;
Integrarea datelor existente la nivel de pacient ntr-un sistem
unitar, realizat conform standardelor actuale existente la nivel
mondial (ex. HL7);
Colectarea i integrarea la nivel de sistem a datelor complete
despre pacient, care s poat asigura informaiile necesare
diagnosticrii i tratrii acestuia, indiferent de locaia n care
acesta se afl
Remodelarea sistemului de sntate ntr-un sistem integrat care
s poat susine ngrijirea continu a pacienilor, s asigure
securitatea informaiilor legate de pacient .
Telemedicina
Progresele realizate n domeniul tehnologiilor de
telecomunicaii utilizate n sistemele de sntate din ultimul
deceniu au extins posibilitile de dezvoltare ale aplicaiilor
dedicate acestuia.
Astzi aplicaiile destinate acestui domeniu sunt n
extindere datorit posibilitiilor de utilizare a serviciilor
video interactive, prin
posibilitaile de stocare i
transmitere a informaiilor
care au fost realizare n
ultimul timp.
Teleconsultatia:
consultare clinic realizat
utiliznd un serviciu
telemedical.
Telemedicina
Telehealth
Elementele principalele:
Interaciunea direct medic pacient i cooperarea medic
medic prin intermediul mijloacelor audio/video/date,
definit de obicei sub numele de telemedicin;
Schimbul de informaii ntre entitile ce asigur servicii de
sanatate (health providers);
Serviciile de sntate public;
Asociaiile medicale profesionale;
Educaia pacienilor.
Telemedicina
Telemedicina, ca i concept, cuprinde o mare varietate de
servicii; cele mai des menionate n studiile de
specialitate sunt:
teleradiologia
telepatologia
teledermatologia
teleconsultaia
telemonitorizarea
telechirurgia
teleoftalmologia.
Telemedicina - Perspective
Piaa de telemedicina la nivel mondial se confrunt deja cu
o cretere semnificativ
Estimrile fcute - crestere de la 9.8 miliarde dolari n 2010
la 23 miliarde dolari n 2015 (o rat compus de cretere
anual de peste 18,6% n urmtorii ani)
Telemedicine: Opportunities for Medical and Electronic
Providers (BCC Research, 2007).
Telemedicina - Perspective
Experii IEEE se ateapt ca anumite tehnologii
s joace un rol strategic n adoptarea aplicaiilor
de telemedicin, inclusiv telefoane inteligente,
senzori uor de purtat i instrumentaie.
Telefoanele inteligente combinate cu reele de mare
vitez de telefonie mobil pot fi folosite pentru a
monitoriza non-invaziv starea pacienilor.
Progrese realizate n domeniul bio-senzorilor, durabilitatea i
fiabilitatea senzorilor care preiau electrocardiograma (EKG),
realizarea de senzori care pot monitoriza de la distan pacientul
cu risc de atac cardiovascular, cu o calitate semnificativ
mbuntit i cu costuri minime pentru monitorizare la distan.
Telemedicina
Cerinte arhitecturale
Portabilitatea conexiuni
Monitorizarea locaiei
Telemedicina
Exemple de aplicabilitate n medicin
Monitorizarea la distan a pacientului
Transferul de mesaje securizate ntre pacient
i providerul de servicii medicale
Msurarea de semnale electrice corporale
de amplitudine sczut
Telemedicina
Machine-to-Machine (M2M)
Sistemele de telemedicin sunt o categorie particular
a unui domeniu mai larg numit M2M (Machine-toMachine)
M2M modalitatea de comunicare directa ntre dou
entiti non-umane n scopul ndeplinirii unei sarcini
bine definite (ETSI, 2011).
Din acest categorie fac parte:
tele-msurtorile (smart metering)
aplicaiile pentru autovehicole
automatizarea oraelor i a locuinelor
monitorizarea pacienilor
Telemedicina
Arhitectura M2M, ETSI
Telemedicina
Machine-to-Machine (M2M)
Domeniul dispozitivelor M2M (M2M Device Domain)
care include totalitatea senzorilor inteligeni i a
metodelor de comunicaie dintre acetia.
Domeniul de reea (M2M Network Domain) care
include totalitatea elementelor fizice ce fac posibil
comunicaia precum i serviciile asociate i
protocoalele care stau la baza lor
Domeniul de aplicaii (M2M Application Domain) care
acoper partea de recepionare i analiz a datelor.
Telemedicina
Machine-to-Machine (M2M) zona DD
Cea mai dinamic zon cu un grad de
diversitate maxim
Organizat sub form de:
PAN (Personal Area Network): totalitatea
dispozitivelor M2M asociate unei persoane sau
unei zone bine definite
BAN (Body Area Network): totalitatea
dispozitivelor M2M ataate de corpul unei
persoane (in-body, on-body, near-body)
Telemedicina
Machine-to-Machine (M2M) zona DD
Comunicaiile n interiorul DD sunt wireless,
guvernate de standarde IEEE
Cerine fundamentale:
Simplitate i fiabilitate
Configurare automat
Utilizare pe dispozitive cu restricii mari n ceea ce
privete puterea de calcul, memoria disponibila i
consumul de curent
Vitez de comunicaie redus (sute de kbps)
Telemedicina
Machine-to-Machine (M2M) zona ND, zona AD
Telemedicina
Machine-to-Machine (M2M) zona AD
Tehnologia moderna
Toate aceste soluii, n curs de dezvoltare, au
un mare potenial de a:
imbunatati calitatea ingrijirii pacientilor,
crete sigurana pacienilor
costuri mai mici pe termen lung.
Tehnologia moderna
Cu toate acestea, n aceast er a informaiei
digitale, aceste noi tehnologii puternice pot afecta
viaa oamenilor n ambele sensuri, atat pozitiv cat i
negativ.
Prin urmare, ar trebui s se ia in consideratie
probleme etice i problemele generate prin
utilizarea i potenialul abuz ce poate fi cauzat de
aceste noi tehnologii.
Permite
Aplicatii
Conduce
Permite
Infrastructura IT
Infrastructura tehnologica
Infrastructura tehnologic a unei organizaii
medicale este o combinaie de hardware
(servere, calculatoare, aparate de informare,
de reea) i software (sisteme de operare i
software de tip server), care va alctui
temelia pe care pot fi construite sistemele de
aplicaii.
Infrastructura tehnologica
Transformari majore in industria IT
4 Paradigme :
Mainframe
Microcomputer, personal computer
Internet
Mobilitate
+ Virtualizare
Paradigma 1:
Mainframe Architecture
1950 - 1980
Toate programele sunt executate pe mainframe
ATM airline reservation systems
Terminal
Terminal
Terminal
Noiembrie 1985 - Windows as an add-on to MSDOS (in response to the growing interest in
graphical user interface)
GUI: Interfa grafic pentru utilizator - acea parte a unei aplicatii cu care
interacioneaza utilizatorul; acea parte din interfaa care se bazeaz pe structuri
vizuale (ex. icons), care acioneaz ca metafore pentru diferite funcii suportate de
aplicatii (ex. stergerea unui fiier este adoptat prin tragerea unui simbol vizual care
reprezint fiierul intr-un co de gunoi reprezentat printr-o pictograma).
Client-server architecture
Two-tier architecture
Client (user interface + processing)
Client: A computer connected to a network that does not store all the
data or software it uses, but retrieves it across the network from another
computer that acts as a server.
Client-server architecture: A computer network architecture that places
commonly used resources on centrally accessible server computers,
which can be retrieved as they are needed across the network by client
computers on the network
Client-server architecture
Three-tier sau n-tier architecture
Client (user interface)
Database Server
Client: Un calculator conectat la o reea care nu stocheaz toate
datele sau software-ul pe care le folosete, dar le poate prelua prin
reea de la un alt calculator, care acioneaz ca un server.
Client-server architecture: O arhitectur de reea de calculatoare,
care plaseaz resursele utilizate n mod obinuit pe computerele
servere accesibil la nivel central, care pot fi accesate prin reea de
catre computerele care actioneaza ca si clienti in reea
Paradigma 3: Internet
Web Architecture
Aplicatiile devin aplicatii web si pot fi accesate prin
intermediul unui browser
Nu mai este necesara instalarea software-ului pe
masina client.
Client
Internet
Web server
Database
server
Web Architecture
Web-ul devine interfata universala pentru sistemele
informatice
Paginile web contin obiecte: text, imagini, sunete, video, cod
JAVA
HTML = Hypertext Mark-up Language: descriere utilizata
pentru a crea documente care se pot vizualiza pe World Wide
Web (WWW).
HTTP = Hypertext Transfer Protocol: protocolul de
comunicare utilizat de Internet pentru a transfera documentele
HTML.
Paradigma 4: Mobilitate
Piaa de acces la Internet mobil i cea a aplicaiilor
destinate acestui mediu sunt n continua
dezvoltare, ca rezultat firesc al goanei dup
mobilitate.
n tandem cu dezvoltarea serviciilor de Internet
mobil se observa o continu diversificare a
terminalelor de acces telefoanele au devenit tot
mai inteligente, iar dispozitivele smartphone tind sa
fie nlocuite de tablete, chiar i n mediile
enterprise.
Paradigma 4: mobilitate
GSM = The Global System of Mobility: standard internaional
adoptat pe scar larg pentru arhitectura i funcionarea
sistemelor digitale de telefonie mobil, care poate transporta
voce i date, precum si pachete de date scurte (mesaje)
Piata sistemelor de operare mobile:
septembrie 2013
septembrie 2014
http://www.netmarketshare.com
http://www.netmarketshare.com
http://en.wikipedia.org/
Software
Firmware ansamblu de
microprograme
Software - set de programe,
proceduri care determin
calculatorul s ndeplineasc sarcini
specifice
Instruciune routina proceduri
program aplicatie
Hardware
Mediu de intrare care asigura preluarea datelor sau
instructiunilor
Mediu de memorare in care se depoziteaza programul si
datele aferente
Mediu de prelucrare asigura functii de natura aritmetica si
logica pentru prelucrarea datelor
Mediu de iesire asigura extragerea rezultatelor
Mediu de control capabil sa interpreteze instructiunile
extrase din memorie si sa controleze integ procesul de
automatizare a calculelor
Hardware
Input/Output devices
Input
Mouse
Keyboard
Scanner
Microphone
Trackball
Touch screen
Output
Monitor
Printer
Plotter
Boxes
Touch screen
Hardware
Input & Output: dispozitive medicale pentru
masurarea:
Presiunii arteriale
Puls
Masurarea greutatii
Probleme:
a. Transmiterea datelor (tehnic)
b. Procesare (algoritmi)
c. Interoperabilitate
d. Decizie
Software
Exemple:
Linux: SUSE, Mandrake, Ubuntu
Microsoft: Windows XP, Vista, Windows 8
Apple: MacOS
Fisiere
Orice information pe care dorim s o stocam pe
suport permanent.
Orice fisier are un continut si un header (care
contine date de identificare, cu ajutorul caruia pot fi
regasite si accesate datele)
name, - numele fisierului;
lungime - numarul caracterelor din continutul fisierului;
un pointe catre cluster n cazul n care incepe coninutul;
citeva atribute care ajuta la restrictionarea accesului la
fisier;
posibil numele utilizatorului care a creat fiierul
( "proprietarul");
data crearii, de asemenea, data celei mai recente
modificari a coninutului.
Bibliografie
Informatica pentru Medici, vol II L Iliuta, E Poenaru, Editura Carol Davila, 2011
http://en.wikipedia.org/