Mycologie, Algologie et Virologie

Licence Microbiologie

Chapitre I: La mycologie
Introduction :
Le terme mycologie est driv du grec myke qui signifie champignon, et logos qui
signifie tude. Assez proche de la botanique qui tudie les plantes. Ainsi, le terme est gnralement
utilis pour dsigner l'tude d'un groupe d'organismes appels champignons.
Les champignons constituent un groupe dorganismes dune extrme varit, des
espces microscopiques aux organismes de plusieurs kilos. Champignon est un nom
donn aux organismes appartenant au rgne des myctes ou Fungi (cinquime rgne);
pour y placer ces tres particuliers, non seulement ceux produisant des sporophores
(carpophores), mais galement dans les dfinitions les plus larges qui ont pu exister
toutes sortes d'organismes eucaryotes multicellulaires ni vgtaux, ni animaux, comme
les moisissures et mme parfois unicellulaires comme les levures.
En fonction de leur taille, les champignons sont rpartis en deux groupes : les
Micromyctes
microscopiques, qui constituent un ensemble passionnant et les
Macromyctes , les grands champignons , remarquables par leurs dimensions, leurs
couleurs et souvent leur valeur gastronomique. Si importante que soit leur fonction dans
le monde vgtal, les macro-champignons reprsentent peu de chose, par rapport
celui que jouent les micro-champignons dans la nature comme dans la vie de
lhomme. Cest cet univers microscopique quappartiennent les levures et les ferments,
de nombreux agents de maladies humaines et animales, les parasites qui ravagent les
cultures, les moisissures qui altrent denres alimentaires, papier, cuir, etc
I. Gnralits sur les champignons :
I-1- Caractres gnraux des champignons
Les champignons, appels aussi myctes, sont des organismes eucaryotes uni ou pluricellulaires, incluant des espces macroscopiques (macromyctes) et dautres
microscopiques (micromyctes), daspect filamenteux ou levuriforme.
Cosmopolites, ils sont retrouvs partout dans la nature. Ils jouent un rle essentiel de
recyclage des matires organiques en puisant leur nergie partir des sources carbones
externes et tablissent aussi avec les espces animales ou vgtales des interactions qui
vont du saprophytisme au parasitisme, en passant parfois par le commensalisme, ou
encore participent des phnomnes symbiotiques.
Ils
sont htrotrophes vis--vis
du carbone :
leur
incapacit
synthtiser des sucres partir de simples ressources minrales les distingue fortement
des vgtaux qui eux sont autotrophes grce la chlorophylle et la photosynthse. Les
champignons doivent extraire de leur environnement des composs organiques dj
constitus. Ils doivent s'alimenter comme le font les animaux, ce qu'ils font soit
en dcomposant de la matire morte (ils sont alors saprophytes), soit au dtriment
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d'organismes vivants (ils sont alors parasites), soit en s'associant avec un organisme
chlorophyllien (ils sont alors symbiotiques) ; Plusieurs de ces stratgies pouvant tre
combines chez certaines espces. Les recherches rcentes sur l'volution des espces
vivantes placent d'ailleurs la plupart des champignons plus prs des animaux que des
vgtaux.
Les champignons sont absorbotrophes : ils se nourrissent par absorption (par opposition aux animaux
qui pratiquent lingestion, et aux vgtaux qui pratiquent lassimilation). Ils scrtent des
enzymes qui digrent des polymres dans le milieu extrieur, ce mcanisme chimique transforme par exemple
les glucides en monomres (petites molcules) qui sont ainsi absorbs.
Ils sont des thallophytes, leur appareil vgtatif, appel myclium est ramifi, diffus
et tubulaire, constitu de filaments fins enchevtrs, les hyphes croissance apicale.
Une autre de leur caractristique remarquable est leur reproduction. Ils produisent en
effet un grand nombre de spores, ce qui leur assure un pouvoir de diffusion (et de
contamination) considrable. Ces spores sont issues de plusieurs
modalits de
reproduction sexue ou asexue qui seront la base de leur classification.
Qu'ils soient sous forme de cellules de levure ou sous forme de filaments constitus en
hyphes, les champignons ont des parois cellulaires externes poreuses et en chitine,
tandis que les parois cellulaires des plantes sont en cellulose.
I-2- Caractres morphologiques des champignons
Les caractres morphologiques concernent quatre sortes d'lments :
-Les lments vgtatifs sont reprsents par un myclium unicellulaire de quelques m
(levure) et/ou pluricellulaire pouvant atteindre plusieurs mtres ( hyphe ou filament
myclien).
- Les lments de la reproduction asexue sont des spores diverses nommes selon leur
origine ou forme : blastospores, arthrospores, aleuriospores, conidiospores, phialospores,
sporangiospores et chlamydospores.
- Les lments de la reproduction sexue sont des zygotes (ou zygospores), des
ascospores ou des basidiospores.
- Les lments d'attente perdurent, parfois de nombreuses annes, sous forme de
fragments d'hyphes, de diaspores ou de sclrotes.
La structure des champignons repose sur leur appareil vgtatif appel thalle, constitu dhyphes ou cellules
allonges en forme de filaments tubulaires de 2 10 m de diamtre.
Ces hyphes comprennent les organites classiques dune cellule : noyau, mitochondrie, cytoplasme, vsicules.
Ils peuvent tre cloisonns ou non et leur association forme le myclium (figure 01). Comme pour tout substrat,
la colonisation est ralise par extension et ramification des hyphes parfois visibles sous forme de petites tches
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colores leur surface. Les hyphes puisent leau et les substances organiques dans les diffrents substrats quils
colonisent pour leur dveloppement.

Figure 01: Structure dun hyphe et son dveloppement vers la formation dun myclium

Chez les champignons microscopiques, le thalle peut tre unicellulaire (levures)

ou filamenteux (moisissures). Certaines levures sont toutefois capables de former
des structures filamenteuses (pseudomyclium) dans certaines conditions (figure
02).
Les levures ont une taille gnralement comprise entre 10 et 50 m. Leur
forme peut tre sphrique, ovode, allonge, cylindrique Leur thalle est dit
lvuriforme.

Figure 02 : Morphologie des levures

Les moisissures sont pluricellulaires: les filaments, plus ou moins ramifis, sont appels
hyphes. Lensemble des hyphes constituent le myclium. Chez les Phycomyctes, les
cellules ne sont pas spares par des cloisons transversales : le thalle est dit
coenocytique ou siphonn . Chez les Septomyctes, le thalle est cloisonn ou
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sept . Dans ce cas, des perforations assurent la communication entre les cellules
(figure 03).

Figure 03: Thalle filamenteux

* La croissance du myclium: Le mode de croissance dpend de la nature et de lexploitation du substrat La

colonisation du substrat est ralise par extension et ramification des hyphes. Laccroissement de celles-ci
seffectue par le sommet, ou apex, o seffectue lessentiel des ractions de synthse et dgradation du
mtabolisme dit primaire, indispensable la construction de la cellule du champignon. Les rgions apicales des
hyphes sont caractrises par la prsence de nombreuses vsicules cytoplasmiques contenant les enzymes et les
prcurseurs de synthse de nouveaux polymres (figure 04). Les produits du mtabolisme secondaires non
indispensables au fonctionnement de la cellule, sont plutt stocks en rgion subapicale.
Les mtabolites secondaires les plus connus sont les pigments, les antibiotiques, les mycotoxines..

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Figure 04: Croissance apicale du myclium.

* Sur le plan biochimique, les champignons ont des parois cellulaires externes rigides, poreuses et en chitine*,
tandis que les parois cellulaires des plantes sont en cellulose. l'intrieur de la paroi cellulaire, il y a une
membrane cellulaire spirale (riche en ergostrol), afin d'augmenter l'aire de surface et permettre
l'change de matires. Ces structures sont appeles lomasomes. La membrane cellulaire encadre le cytoplasme
qui suspend les organites caractristiques une cellule eucaryote. Ces organites sont: le noyau, l'appareil de
Golgi, le rticulum endoplasmique, mitochondries, les ribosomes et les vsicules.
*La chitine: est un polysaccharide rsistant mais flexible constitu dazote et de N-actylglucosamine.

Figure 05: structure membranaire des champignons.

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