Elemente de biofizica molecular i macromolecular

Moleculele vii studiate individual se suprapun principiilor

fizice i chimice obinuite care guverneaz comportarea
materialelor inerte , dar studiate n ansamblu interacioneaz
ntre ele conform unui alt grup de principii care alctuiesc logica
molecular a strii vii. Aceste principii nu includ n mod necesar
legi fizice noi, nedescoperite nc. Ele trebuie privite ca un grup
de reguli fundamentale care guverneaz natura, funcia i
interaciuni specifice ale moleculelor din organismele vii,
proprieti ce confer acestora din urm capacitatea de a se
autoorganiz, autoreplica i autoreglarea. Este mult mai potrivit
s considerm aceste grupri de reguli ca axiome deoarece unele
dintre ele sunt iniiative i nu pot fi demonstrate nc.
Compoziia chimic a materiei vii este calificativ fa de a
mediului n care aceasta se gsete. n esen organismele vii au
constituia lor ioni de dimensiuni foarte mici microioni ( Na,
K, Cl implicat n excitabilitatea, Ca implicat n contracia
muscular; Mg rol n procesele de bioluminiscen; H 2
secretat de mucoasa gastric i generator de tensiuni
protonmotrice n anumite microorganisme).
Micromoleculele care pot fi disociate sau neutre
(aminoacizi, mononucleotide, monozaharide, acizi grasi).

Structura fizic a moleculei

Molecula este o grupare de atomi ce formeaz o

configuraie stabil datorit forei de interaciune dintre ei.
Forele exercitate ntre molecule sunt fore intermoleculare.
Condiiile de formare a moleculei se realizeaz atunci cnd fora
de atracie dintre atomi este egal cu cele de respingere iar E p
este minim. Cnd este perturbat molecula se disociaz.
Fora care acioneaz ntre elementele ce formeaz
biomolecula este fora intermoleculara (se pot msura prin
metode specifice ca rezonan magnetic nuclear i rezonan
de spin, ce msoar valoarea forei i difraciei de raze X, care

1
msoar fora indirect prin msurarea distanei dintre atom la un
moment dat).
Fortele interatomice ionice i covalente
Legatura ionic electostatic
Teoretic fora de legtur se poate determina prin legea lui
Coulomb
Legea covalent este legea n care doi atomi cedeaz i
primesc electroni de valen formnd un nivel electronic stabil.
Leninghes spune ca moleculele din organismele vii
strudiate individual se suprapun principiilor fizice i chimice
obinuite ce guverneaz comportarea materiei inerte. Studiate n
ansamblu aceste molecule interacioneaz ntre ele conform unui
alt grup de principii care alectuiesc logica molecular a strii
vii. Aceste principii nu includ n mod necesar legii fizice noi
nedescoperite nc. Ele trebuie privite ca un grup de reguli
fundamentale care guverneaz natura, funcia i interactiunile
tipurile specifice de molecule din organismele vii.
Principiu = axiome ce nu pot fi demonstrate nc.

Compoziia chimic a materiei vii

Este cantitativ diferit fa de a mediului n care acesta se

gsete. Organismele vii au in constituia lor:
- Ioni de dimensiuni foarte mici microioni Na; K; Cl
implicai n excitabilitate; Ca n contracia muscular; Mg
rol n bioluminiscen; H2 secretat de mucoasa gastric i
generator de tensiuni protomatrice n anumite organisme; ion
carboxil; fosfat; oxidril.
- Micromoleculele care pot fi neutre sau disociate reprezentate
de aminoacizi, mononucleotide, monozaharide, acizi grai
- Macromoleculele i complexele macromoleculare.

Molecula este o grupare de atomi ce formeaz o configuraie

stabil datorit forelor de interaciune dintre ei. Aceste fore de
interaciune se numesc fore interatomice sau fore
intramoleculare

2
- O molecula se formeaz atunci cnd forele de atracie dintre
atomi sunt egale cu cele de respingere i energia potenial a
ansamblului este minim.

Fore interatomice pot fi msurate cu metode specifice:

rezonan magnetic nuclear; rezonan electronic de spin sau
disfracia cu raze X. Aceste fore interatomice pot fi ionice i
covalente.
Legea ionic: are natur electrostatic.
Legea lui Coulomb specific pentru ccorpurile
macroscopice.
Legtura covalent se realizeaz prin punerea n comun a
electronilor. Este o legtur de distan mic, distan dintre
atomi fiind inferioar razei de interaciune interatomic. Are
caracter de saturaie; odat format legtura dintre doi atomi,
perechile electronice nu mai permit alte legturi.
Legtura coordinativ punerea n comun de electroni
(electronii provenind de la un singur atom ).
n legturile covalente formate din atomi diferii, perechea
de electroni de legtur nu este repartizat simetric ntre cei doi
atomi, fiind atras spre atomul mai electronegativ, legtura
cptnd astfel un moment de dipol. Acest moment de dipol va
fi cu att mai mare cu ct diferena de electronegativitate este
mai mare.

Caractere generale ale legturii covalente

Legtur de distan mic; distana dintre doi atomi este

inferioar razei de aciune interatomic

3
 Are caracter de saturaie. Odat format legtura dintre doi
atomi, forele electronice nu mai permit alte legturi.
Cristalele formate prin legile covalente sunt dure (diamant).

Legtura coordinativ - este format din doi electoni pui

n comun. Electornii sunt furnizai de acelai atomi pentru
completarea nivelului energetic extern. Exemplu: oxigenul
poate realiza dou legturi covalente i poate fi receptor pentru o
legtur coordinativ.
n legile covalente formate dintre atomi difer perechea de
electroni de legtur nu este repartizat simetric ntre cei doi
atomi ci este atras spre atomul mai electronegativ, aceasta
reprezint realizarea unui dipol. Dipolul reprezint momentul n
care legtura va fi cu at mai mare cu ct diferena de
electromegativitate este mai mare.
Legtura metalic legtura puternic realizat cu
electroni pui n comun care genereaz i electroni liberi de
conductibilitate.

Forele intermoleculare sunt fore care se exercit ntre

moleculele ce formeaz structur biologic. Acestea sunt mai
mici dect cele intermoleculare dar efectul lor devine
semnificativ datorit numrului mare de interacii de acest fel.
Energia mic corespunztoare acestor fore permite ruperea i
formarea lor destul de uor, lucru ce caracterizeaz funciile
biologice ale biomoleculelor. Aceste fore se manifest la
distan mic.

Dipol electric este un sistem format din dou sarcini

electrice egale i de semn contrar aflate la distan d una fa
de alta. Momentul dipolului = F d

Energia de interaciune dipol ion

FORMULA

4
 Semnul - indic existena unei fore de atracie dintre
dipol i ionul respectiv.
= 0 - dipolul este aliniat cu Q
= 90 - dipolul este perpendicular pe r i Wp = 0
deoarece cele dou sarcini + q i q sunt egal deprtate de Q
= 180 dipol aliniat cu ionul de sarcin electric Q

Energia de interaciune dipol dipol

FORMULA

n biofizic se ntlnesc n mod frecvent biomolecule ce

sunt din punct de vedere electric, dipoli permaneni. AA,
proteine, lipide au acest caracter datorit distribuiei de gradul
de sarcin pe suprafaa moleculelor.

Legtura de hidrogen

Este un caz particular al interaciei dipol dipol. O

molecul format dintr+un atom de hidrogen i un atom
electronegativ prezint o legtur covalent cu caracter parial
ionic. Se formeaz un dipol cu sarcina negativ spre atomul
electronegativ i cea pozitiv spre atomul de hidrogen. Dac n
apropierea dipolului se gsete un alt act atunci ntre acesta i
dipol se realizeaz o legtur determinat de atracia dintre
protonul i electronul atomului. Aceast legtur format dintre
dipol i atom reprezint legtura de hidrogen.
Caracteristici: distana dintre atomi este foarte mic;
energia legturii de hidrogen este mai mare dect W leg dintre doi
dipoli.

Dipoli indui

Se consider un atom neutru n apropierea cruia se

gsete un ion pozitiv care va exercita o for de atracie asupra
elecronilor i o for de respingere asupra nucleului atomic.
Atomul se va deforma, adic se produce o uoar separare a

5
sarcinilor pozitive i negative de unde rezult un dipol indus
deoarece exist att timp ct ionul exist n jurul atomului.

Dipoli tranzitorii

n general ntr-un atom sau molecul, electronii sunt

distribuii simetric n jurul atomului. Simetria se poate modifica
ducnd la formarea unui dipol. Electronii fiind n continu
micare existena dipolului este condiionat de probabilitatea
asimetriei i distribuiei electrice i dureaz atta tmp ct
dureaz asimetria. Un astfel de dipol este tranzitoriu.
Dac un astfel de dipol se afl n apropierea unei molecule
atunci poate induce n aceasta ali dipoli a cror orientare i
moment s depind de dipolul tranzitoriu, efectul lor fiind
cumulativ, forele dispersive capt importan.

MACROMOLECULE

n definirea unei molecule se accept drept criteriu

greutatea molecular. Se consider a fi macromolecule compuii
a crui mas molecular este mai mare de 5000 de uniti.
Macromoleculele sunt:
1. proteine (heteropolimer de aminoacizi)
2. acizi nucleici (heteropolimer de nucleotide)
3. polizaharide
4. lipide
Cu toate c masele moleculare ale lipidelor individuale
sunt mici comparativ cu alte clase moleculare, unele lipide se
pot asocia spontan n structuri macromoleculare.
Macromoleculele pot fi sintetizate natural sau artificial
proces numit polimerizare sau policondensare. De exemplu
prin prolimerizarea AA se obtin polipeptide; prin
policondensarea glucozei se obin polizaharide (celuloz sau
amidon).
Polimer sunt compui macromoleculari alctuii din grupe
identice de monomeri (A-A-A..-A).

6
 Copolimerii sunt compui macromoleculari a cror grupe
de monomeri nu sunt identice (A-B-C-D-A).
Biopolimerii sintetizai artificial au un comportament
diferit din punct de vedere biofizic fa de cei sintetizai natural.
Acest comportament diferit confer biopolimerilor naturali
proprieti biofizice diferite de cei artificiali.
A. Tipuri fundamentale de polimeri:
1. enzime hidrolitice de transfer de oxidare;
2. proteine de structur
3. proteine respiratorii
4. proteine plasmatice
5. anticorpi
6. proteinele din lapte cazeina
7. hormonii
B. Acizii nucleici - sunt reprezentai de ARN i ADN; acetia
alctuiesc suportul informaiei genetice.
C. Polizaharidele servesc la stocarea glucozei (element de baz
al celulei).
D. Lipidele fosfolipidele membranei celulare.
Dup forma geometric polimerii pot fi: lineari, ramificai,
spaiali. Dup rolul biologic macromoleculele pot fi: biocoloizi
(proteine circulante din plasm i unele solubile din citoplasm),
macromolecule de structur, macromolecule purttoare de
informaii.

Proprietile biofizice generale ale biopolimerilor

1. Macromoleculele particip structural la nivel de membran

celular la realizarea opoziiei la difuzia liber.
2. Sub aspect morfologic macromoleculele stau la baza
structurilor supramoleculare.
3. Reaciile chimice invivo au consum de energie mult mai mic
dect in vitro datorit existenei enzimelor drept catalizator.
4. Macromoleculele au capacitate informaional.

Organizarea structural i conformaional a

macromoleculelor biologice

7
 S-au pus n eviden patru structuri de baz a proteinelor:
1. Structura primar se refer la secvena Aa n lanul
polipeptidic. Proteinele sunt alctuite din aminoacizi legai
ntre ei prin grupri COOH, NH 2 cu eliminarea unei molecule
de H2O.
2. Structura secundar const n spiralarea sau plierea lanului
polipeptidic primar. Legturile intermoleculare se realizeaz
prin puni de H2.
3. Structura terial rezult din indoirile structurii secundare i
d forma moleculei proteice.
4. Structura cuaternal este constituit din alipirea structurilor
teriale.

Configuraia acizilor nucleici

Acizii nucleici sunt macromolecule complexe i

ndeplinesc dou funcii:
1. Depoziteaz informaia genetic.
2. Particip la sinteza unor molecule.
Sunt reprezentai de ADN care este suportul informaiei
ereditare.

Datorit descoperirii ultracentrifugii, n 1933, de ctre

T.Svedberg s-a putut trece la studiul materiei vii la nivel
molecular i macromolecular. Prin utilizarea unor metode
moderne ale Biofizicii i Biochimiei, apare o nou tiin,
Biologia molecular. Aceasta a deschis calea explicrii
proceselor normale i patologice din organism, la nivel
molecular.
n definirea unei macromolecule se accept drept criteriu
greutatea molecular. Se consider compui macromoleculari,
substane a cror mas molecular depete 5000u.
Macromoleculele sunt:
Proteine (heteropolimeri de aminoacizi)
Acizi nucleici (heteropolimeri de nucleotide)
Polizaharide

8
 Lipide
Dei masele moleculare ale lipidelor individuale sunt mici
(750 1500 daltoni) n comparaie cu celelalte clase de
molecule, unele lipide se pot asocia spontan n structuri
supramoleculare i uneori funcioneaz n sisteme
macromoleculare, putnd fi considerate n mod arbitrar
macromolecule.
Macromoleculele pot fi sintetizate natural (n celule) sau
artificial, proces denumit polimerizare sau policondensare. De
exemplu:
Prin polimerizarea sau policondensarea aminoacizilor se
obin polipeptidele;
Prin policondensarea glucozei rezult polizaharide de tip
celuloz sau amidon.
Se numesc polimeri compuii macromoleculari alctuii
din grupe identicee de monomeri, care se repet:
A-A-A-A-A
Se numesc copolimeri compuii macromoleculari ai cror
grupe de monomeri nu au o compoziie identic:
A-C-B-A-C-D-A-B-D-.
Biopolimerii sintetizai natural au aceeai structur
biochimic cu polimerii sintetizai artificial, dar se comport
diferit din punct de vedere biofizic. Acest comportament diferit
confer biopolimerilor naturali proprieti biofizice diferite fa
de polimerii artificiali, oferind posibilitatea meninerii
structurilor vii.

Tipuri fundamentale de biopolimeri:

1. Proteinele sunt macromolecule de mare complexitate

alctuite din aminoacizi. Cele mai importante proteine sunt:
Enzime: hidrolitice, de transfer, oxidaze, dehidrogenaze,
etc.
Proteine de structur: keratin, colagen, fibre din testul
conjunctiv.
Proteine respiratorii: hemoglobin, mioglobin

9
 Proteine plasmatice: serumalbumine, globuline, fibrogen
Anticorpi: proteine formate ca reacie la antigeni
Hormoni
Proteinele din lapte: cazein, lactoglobulin
2. Acizii nucleici sunt reprezentai de ADN i ARN. Acetia
alctuiesc suportul informaiei genetice.
3. Polizaharidele servesc la stocarea glucozei, aliment de baz al
celulei.
4. Lipidele i n mod deosebit fosfolipidele membranelor
celulare.

Clasificarea biopolimerilor

Dup forma geometric, polimerii pot fi:

Liniari
Ramificai
Spaiali
Dup rolul biologic n organism, macromoleculele pot fi:
Biocoloizi: proteinele circulante din plasm i unele solubile
din citoplasm
Macromolecule de structur
Macromolecule purtatoare de informaie.

De reinut :
- definiia moleculelor
- structura fizic a moleculeor
- definiia mocromoleculelor
- proprieti biofizice a biopolimerilor

10