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AUTNOMA DE MXICO
CIDOS NUCLEICOS
BASES, NUCLEOSIDOS Y NUCLEOTIDOS I
BCT I (2453)
1
Catalina Crdenas Ascencin
Historia
Dilucidacin de la estructura
2
Freidrich Miescher (1871) aisl del ncleo
de las clulas de pus una sustancia cida
rica en fsforo a la que llam nuclena.
3
Cuando se realiza la hidrlisis
qumica completa de los cidos
nucleicos, se obtiene una mezcla
equimolar de:
Una base nitrogenada
heterocclica:
purina o
pirimidina
Una pentosa:
ribosa o Freidrich Miescher
desoxirribosa.
cido fosfrico . 4
Estudios posteriores a Miescher demuestran la
existencia de dos tipos de cido nucleico: uno
abundante en la levadura, que recibe el nombre de
cido zimonucleico y otro, abundante en el timo,
llamado cido timonucleico.
6
OBSERVACIONES DE GRIFFITH
La cepa S produca infeccin letal en los ratones de
su laboratorio y los de la cepa R, no lo hacan.
Las cepas S muertas por calor son tambin
inofensivas, excepto cuando se las mezcla con cepa R
vivas.
En este ltimo caso, se puede producir una infeccin
fatal y en los ratones infectados se encuentran
clulas vivas con cpsulas caractersticas de la cepa
S.
Este experimento permiti inferir que algn factor
de la cepa S muerta pasa a las cepas R vivas y las
transforma en cepas infecciosas letales.
Griffith no supo cual era ese factor. 7
EXPERIMENTOS DE GRIFFITH
8
EXPERIMENTOS DE AVERY (1944)
14
14
Cuando se realiza la hidrlisis qumica completa de los
cidos nucleicos, se obtiene una mezcla equimolar de:
Una base nitrogenada heterocclica:
purina o
pirimidina
Una pentosa:
ribosa o
desoxirribosa.
cido fosfrico .
15
15
BASES NITROGENADAS
16
BASES NITROGENADAS DERIVADAS DE LA PIRIMIDINA
(DNA/RNA)
(DNA)
(RNA) 17
BASES NITROGENADAS DERIVADAS DE LA PURINA
(DNA/RNA)
(DNA/RNA)
18
OTRAS PURINAS NATURALES
CAFENA TEOFILINA
19
PROPIEDADES FSICO-QUMICAS DE LAS BASES
NITROGENADAS
1. Naturaleza bsica
3. Dipolos
4. Tautomera
5. Absorcin de luz
20
TIPOS DE AZCAR
5 5
4 1 4 1
2 2
3 3
RIBOSA DESOXIRRIBOSA
(ARN) (ADN)
21
ACIDO FOSFRICO
22
LIBERTAD CONFORMACIONAL
23
AZCAR DE 5 C (PENTOSA)
RIBOSA
ENLACE GLICOSDICO
DESOXIRRIBOSA
ENLACE TIPO STER
BASE NITROGENADA
NUCLESIDO
NUCLETIDO
PRICA
ADENINA
GUANINA
PIRIMIDNICAS
TIMINA
CITOSINA
URACILO
GRUPO FOSFATO 24
NOMENCLATURA DE NUCLETIDOS Y CIDOS NUCLEICOS
25
NUCLETIDOS
26
ADENINA NUCLESIDO
H2O
+
HO -
DESOXIADENOSINA
DESOXIRRIBOSA 27
Nuclesido
NUCLETIDO
HO -
+ H2O
Desoxiadenilato
(Desoxiadenosn -5- monofosfato)
cido fosfrico 28
Funciones de los NUCLETIDOS
30
ATP (adenosin trifosfato): Es el portador
primario de energa de la clula. Esta molcula
tiene un papel clave para el metabolismo de la
energa.
31
ATP (Adenosin trifosfato)
32
33
Nuclesido polifosfatos
5-Adenosina
monofosfato, AMP
5-Adenosina
difosfato, ADP
5-Adenosina
trifosfato, ATP
34
ATP
35
ADP
El adenosn difosfato (ADP) es un nucletido
difosfato, es decir, un compuesto qumico formado por
un nuclesido y dos radicales fosfato unidos entre s.
En este caso el nuclesido lo componen una base
prica, la adenina, y un azcar del tipo pentosa que es
la ribosa.
Se produce ADP cuando hay alguna descarboxilacin
en algunos de los compuestos de la gluclisis en el
ciclo de Krebs.
El ADP es almacenado en los densos grnulos de las
plaquetas, y es movilizado por la activacin
plaquetaria. 36
ATP COMO DONADOR DE ENERGA
37
AMP cclico - AMPc
Se forma a partir de ATP en el interior celular por la accin de
la adenilato ciclasa.
La enzima acta por la unin a la membrana celular de
determinadas molculas (hormonas).
La formacin del AMPc activa enzimas que actan en
reacciones metablicas
Se le conoce tambin como segundo mensajero (las
hormonas son los primeros mensajeros
38
39
AMP cclico - AMPc
41
NAD+ y NADP+: (nicotinamida adenina dinucletido y
nicotinamida adenina dinucletido fosfato). Son
coenzimas que intervienen en las reacciones de oxido-
reduccin, son molculas que transportan electrones
y protones. Intervienen en procesos como la
respiracin y la fotosntesis.
Abreviado NAD+ en su forma oxidada y NADH en su
forma reducida, es una coenzima encontrada en
clulas vivas y compuesta por un dinucletido, ya que
est formada por dos nucletidos unidos a travs de
sus grupos fosfatos, siendo uno de ellos una base de
adenina y el otro de nicotinamida. Su funcin
principal es el intercambio de electrones e
hidrogeniones en la produccin de energa de todas
las clulas. 42
Transportadores de electrones: FMN
FMN
El flavin mononucletido
(FMN), o riboflavina-5'-fosfato,
es un derivado de la riboflavina
(vitamina B2) que acta como
coenzima de diversas
oxidoreductasas.
43
Transportadores de electrones: FAD
El flavn adenn
FAD dinucletido o dinucletido
de flavina-adenina
(abreviado FAD en su forma
oxidada y FADH2 en su forma
reducida) es una coenzima
que interviene en las
reacciones metablicas de
oxidacin-reduccin.
Interviene como dador o aceptor de electrones y
protones (poder reductor) en reacciones
metablicas redox 44
Coenzima A
45
cGMP
El guanosn monofosfato cclico,
GMPc o GMP cclico es derivado
cclico del nucletido trifosfato
GTP, generado por mediacin de
la enzima guanilato ciclasa
46
Nucletidos (desoxirribonucletidos)
5-dTMP 3-dCMP
47
ANTIBITICOS NUCLEOSDICOS
Puromicina
Antibitico inhibidor
de la sntesis de
protenas
Cordicepina
Medicamento contra el cncer;
es un tipo de antibitico antitumoral.
48
ANTIVIRALES NUCLEOSDICOS
Citosin arabinsido
(Vidarabin)
Activo contra herpes y varicela
49
ANTIRRETROVIRALES NUCLEOSDICOS, EJ. VIH
50
Espectros de absorcin de los nucletidos ms comunes
51
ESTRUCTURA DEL ADN
REGLAS DE CHARGAFF PARA ADN DE DOBLE HLICE
A=T. la relacin entre adenina y timina es igual a la
unidad (A/T=1).
A partir
Rosalin dela los
Franklin, que estudios
lo hizo tododel
ADN mediante la difraccin de los rayos X,
Franklin y Wilkins observaron entre 1950 y 1953 que el cido
desoxirribonucleico tena una estructura fibrilar de 20 de dimetro,
en la que se repetan ciertas unidades cada 3,4 , y que haba otra
repeticin mayor cada 34 .
Su trabajo, una estructura helicoidal
3,4
20
Amstrongs
Amstrongs
53
Basndose en los datos anteriores, J. Watson y F. Crick elaboraron, en
1953, el modelo de la doble hlice.
El ADN, segn dicho modelo, estara formado por dos cadenas de
polinucletidos que seran antiparalelas, es decir, tendran los enlaces
5'3' orientados en diferente sentido, complementarias y enrolladas una
sobre la otra en forma plectonmica o de doble hlice.
54
Las cadenas del ADN son complementarias, no
iguales, Por lo tanto, la secuencia de cada cadena
es diferente.
El DNA es una
doble hlice
plectonmica y
dextrgira,
3.4 nm con un paso de
rosca de 3.4 nm
58
MODELO DE WATSON-CRICK, B
5 3
3 5
Cada una de las dos hlices es un polinucletido entrelazado
con el otro de manera que su polaridad es opuesta (es decir,
corren en sentido antiparalelo) 59
MODELO DE WATSON-CRICK, C
0.34 nm
62
Guanina (G) slo
puede interaccionar con
citosina (C) (y viceversa),
a travs de tres puentes
de hidrgeno
63
GEOMETRA DE LA DOBLE HLICE (DNA-B)
Pares de bases/vuelta 10
Anchura 2.4 nm
2.4
64
JAMES WATSON Y FRANCIS CRICK, CAMBIARON EL MUNDO EN UNA
PGINA
65
Modelo de la doble hlice de ADN Representacin abreviada de un segmento
de ADN
66
Pares de bases del
ADN:
La formacin
especfica de enlaces
de hidrgeno entre
G y C y entre A y T
genera los pares de
bases
complementarias
67
UNA CORTA SECCIN DE LA DOBLE HLICE DE ADN
68
Flexibilidad y polimorfismo del DNA.
DNA A.
DNA Z.
DNA H.
69
MODELOS DE DOBLE HLICE DEL ADN
En la actualidad se conocen tres tipos de estructura en
doble hlice del ADN: las formas B, A y Z
ADN B
70
Modelos de doble hlice del ADN: forma A
La forma A tambin es dextrgira,
pero las bases complementarias se
encuentran en planos inclinados y
une el eje de la molcula que
atraviesa dichos planos por puntos
desplazados del centro.
los surcos
son ms
parecidos
en anchura:
Ms surco Ms
mayor
corta estrecho y larga
profundo
surco el surco mayor
menor no existe, es muy
19 ancho y poco profundo
superficial bases algo
inclinadas:
9 surco menor,
profundo y
estrecho
dextrgira levgira
74
SURCOS DEL ADN:
75
DNA B DNA A
DNA A
77
DNA Z
78
NIVELES DE ORGANIZACIN DEL MATERIAL GENTICO
Qu relacin existe entre: Gene ADN Cromatina Cromosoma?
79
ESTRUCTURA DEL ADN
En el ADN se distinguen los tres
niveles estructurales:
1. La estructura primaria o
secuencia de nucletidos.
2. La estructura secundaria o
doble hlice.
3. La estructura terciaria o ADN
superenrollado: torsin de la
doble hlice sobre s misma.
Para conseguir que el ADN quepa
dentro del ncleo, se encuentra muy
empaquetado, y an ms cuando se
condensa para formar un cromosoma.
80
Estructura ADN
81
ESTRUCTURA PRIMARIA DEL ADN (SECUENCIA DE NUCLETIDOS)
83
TIPOS DE ADN SEGN SU ESTRUCTURA, SU FORMA Y SU EMPAQUETAMIENTO
Monocatenario Asociado a
Lineal histonas
(Virus) (Eucariotas)
Circular No asociado a
Bicatenario
(Procariotas) histonas
84
LONGITUD DEL ADN
85
LONGITUD DEL ADN
86
FUNCIN BIOLGICA DEL ADN
87
EL ADN SUPERENROLLADO. EL EMPAQUETAMIENTO DEL ADN CIRCULAR
88
Superhlices en plsmidos
(ADN extracromosmico)
DNA circular,
relajado
89
SUPERENRROLLAMIENTO
90
INTERACCIN PROTENA-DNA
91
Desnaturalizacin renaturalizacin del ADN
La doble hlice de ADN en estado natural es muy estable; pero, si se
calienta, cuando la temperatura llega aproximadamente a 100C, las dos
hebras de la doble hlice se separan, se produce la desnaturalizacin del
ADN.
92
El caso de Streptomyces
Las tcnicas de
desnaturalizacin y
renaturalizacin permiten
hibridar cadenas de ADN de
distintos organismos.
El porcentaje de hibridacin
dar una idea de la relacin
entre los dos organismos y es
una tcnica muy til en la
diagnosis de enfermedades o
en medicina forense. 93
ACIDOS NUCLEICOS
Desnaturalizacin.
Tm (Composicin de bases).
94
Acidos Nucleicos
95
Estructura de RNAs (tRNA y
rRNA)
96
ARN CIDO RIBONUCLECO
97
98
En general los ribonucletidos se unen entre s,
formando una cadena simple, excepto en
algunos virus, donde se encuentran formando
cadenas dobles.
100
5
2-OH en la pentosa
RNA
3 101
Reactividad qumica:
El RNA, al tener el grupo 2-OH, es mucho ms reactivo
qumicamente que el DNA. En concreto, puede ser completamente
hidrolizado por lcali a una mezcla de 2- y 3-nucletidos.
Estructura tridimensional
Las formas en doble hlice del RNA adoptan la configuracin A (en
lugar de la B, propia del DNA), as como los hbridos DNA-RNA.
102
RNA COMO ENZIMA
Ribozima
hammerhead
103
FUNCIONES Y TIPOS DE RNA
105
-
O O
P O
- H
O N
O N
H
N
H 2C N N
O H
OH
-
O O
P H H
-
N
O
O
H 2C
N
C
Unin del aminocido al O
N O
H 2C N O
C
O
-
O O OH H
H N
P
-
O N
H 2C
O N
N
A
N
O
H O OH
H 3N C C
O
106
R
ESTRUCTURA TRIDIMENSIONAL DEL TRNA
Extremo aceptor
Lazo TYC
Lazo variable
Lazo anticodon
107
rRNA 23s
108
ARN MENSAJERO (ARNm)
Consiste en una molcula lineal de nucletidos
(monocatenaria), cuya secuencia de bases es
complementaria a una porcin de la secuencia de
bases del ADN.
110
ARN DE TRANSFERENCIA (ARNt)
Este es el ms pequeo de todos, tiene
aproximadamente 75 nucletidos en su cadena,
adems se pliega adquiriendo lo que se conoce como
forma de hoja de trbol plegada.
112
Regiones complementarias dentro de
la misma cadena de ARN
113
El ADN y el ARN se diferencian:
ADN ARN
Peso molecular mayor menor
Azcar desoxirribosa ribosa
Bases nitrogenadas A, T, G, C A, U, G, C
114
Diferencias estructurales entre el DNA y el RNA
DNA
RNA
115
Diferencias entre DNA y RNA
DNA RNA
Doble cadena helicoidal Cadena Simple
Tiene las bases A, T, G y C Tiene las bases A, U, G y C
La pentosa es una La pentosa es una ribosa
desoxirribosa
Es una Macromolcula Es ms pequea que el DNA
Esta en el Ncleo Se encuentra en el citoplasma
Constituye los Genes (se replica o Es una molcula involucrada en
se trascribe a RNA) la sntesis de protenas
116
ESTRUCTURA DE LOS CIDOS NUCLEICOS
5 terminal
5 terminal
Enlace Enlace
fosfo fosfo
dister dister
ARN
ADN
3 terminal 3 terminal
117
Bioqumica Mathews, van Holde y Ahern. Addison Wesley 2002
REPRESENTACIN ESQUEMTICA DE LA SECUENCIA DE NUCLETIDOS
3
OH Nucletido
Oligonucletido
118
Se ha observado la existencia
de ARN con funcin
biocatalizadora (ribozimas),
por lo que se ha sugerido
que, en el origen de la vida,
los ARN pudieron ser las
primeras molculas capaces
de auto duplicarse. Despus,
Ribozima
sera el ADN el encargado de hammerhead
guardar la informacin
gentica, ya que su cadena es
ms estable.
Participan en el procesado del RNA transcrito
primario y en la formacin de enlace peptdico en la
sntesis de protenas. 119
El ARN se encuentra en muchos tipos de virus y en las clulas procariotas y
eucariotas. En stas hay de cinco a diez veces ms ARN que ADN.
120
ARNm ARNr ARNt
121
EL ARN DE TRANSFERENCIA (ARNt).
124
EL ARN NUCLEOLAR (ARNn).
Es un ARN que se encuentra constituyendo, en parte, el nuclolo.
126
FUNCIONES DE LOS CIDOS RIBONUCLEICOS
Las funciones de los ARN pueden resumirse en tres:
1. Transmisin de la informacin gentica desde el ADN a los ribosomas.
Las enzimas ARN-polimerasas a partir de un gen de ADN, es decir, una
secuencia de nucletidos de ADN con informacin sobre una protena,
sintetizan, mediante la complementariedad de las bases, un ARN
mensajero, proceso denominado transcripcin. Luego, este ARNm llegar
hasta los ribosomas. El ADN es utilizado nicamente como almacn de
informacin gentica.
128
EL ARN MENSAJERO (ARNm)
Es monocatenario, bsicamente
lineal, y con un peso molecular que
oscila entre 200.000 y 1.000.000.
Su funcin es transmitir la
informacin contenida en el ADN y
llevarla hasta los ribosomas, para que
en ellos se sinteticen las protenas a
partir de los aminocidos que
aportan los ARNt.
132
En el extremo 3' o extremo final posee
de 150 a 200 nucletidos de adenina,
lo que se denomina cola de poli-A.
Es un estabilizador frente a las
exonucleasas.
Entre la sntesis y la degradacin del
ARNm no transcurren ms que unos
cuantos minutos, para evitar una
superproduccin de protenas.
El ARNm eucaritico es
monocistrnico, es decir, slo contiene
informacin para una cadena
polipeptdica.
133
134
ESTRUCTURA DEL ARNm DE PROCARIOTAS
El ARNm procaritico no adopta la estructura del ARN
eucaritico.
No presenta exones e intrones
Carece de caperuza (empieza con un nucletido trifosfato no
invertido, por ejemplo: pppG-...) y de cola de poli-A,.
Es policistrnico, es decir, contiene informaciones separadas
para distintas protenas.
Secuencia
espaciadora 135
ESTRUCTURA DEL ARNm DE PROCARIOTAS
Secuencia
espaciadora
El sector comprendido entre el extremo 5 y el codn de inicio se
denomina Lder (no lleva informacin).
Cada Cistrn posee un codn de inicio y uno sin sentido (finalizacin). 136
EL ARN RIBOSMICO (ARNr)
139
RNA ribosomal
140
Diversidad de tipos y tamaos.
Avance sostenido de la ciencia genmica
141
Acidos Nucleicos (Seccin Bioqumica)
DETALLES DE LA ESTRUCTURA DE ADN
142