Explorați Cărți electronice
Categorii
Explorați Cărți audio
Categorii
Explorați Reviste
Categorii
Explorați Documente
Categorii
EDITIA A II-A
\\
EDITURA MEDICALA
DUMITRU BUIUC MARIAN NEGUT
Membru al Academiei de Stiinte Membru al Academiei de Stiinte
Medicale Medicale
Profesor u'M.F. "Gr. T. Popa", Iai Profesor U.M.F. "Carod Davila",
Catedra de microbiologie Bucureti
Catedra de microbiologie
Director Adjunct Institutul Cantacuzino
Bucureti
TRATAT DE
MICROBIOLOGIE \J
CLINICA
EDITIA A II-A REVIZUITA SI ADAUGITA
EDITURA MEDICAL\.
BUCURE~TI 2008
CUPRINS
20. Diagnosticul de laborator a1toxiinfeqiilor alimentare (Dumitru Buiuc, Marian Ncgut) . 363
Xl
Partea a IV-a: METODE IMUNOLOGICE. METODE ALE BIOLOGIEI
MOLECULARE. METODE CROMATOGRAFICE
~I DE DEVELOPARE ENZIMATICA
IN MICROBIOLOGIA CLINICA
28. Identificarea cocilor gram-pozitivi aerobi $i facultativ anaerobi (Irina Coditii, Dumitru Buiuc,
Carmen Panzaru, Vasilica Ungureanu) . 562
29. Identificarea cocilor gram-negativi aerobi (Marian Negut, Ileana Levenet, Alexandru Rafilal 6m:
30. Identificarea bacililor gram-pozitivi aerobi (Angela Diaconescu, Dumitru Buiuc, Carmen
Pauzaru, Maria Damian, Dana Magdalena Caplan) . 619
31. Identificarea bacililor gram-negativi aerobi glucozo-fennentativi (Marian Negut, Dumitru Buiuc) 695
32. Identificarea bacililor gram-negativi aerobi glucozonefermentativ (Dumitru Buiuc, Marian
Negut, Gabriel lonescu) . 765
33. Identificarea bacililor gram-negativi aerobi sau facultativ anaerobi pretentio~i nutritiv (Nicolae
Mihancea, Georgeta Mihai, Veronica Alecu, Liviu A. Sicinschi, Dumitru Buiuc, Marian
Negut, Olivia Vizitiu) . 796
34. Identificarea bacililor acido-rezistenti (Lorena Gabriela Popa, Mircea loan Popa) . ~81
35. Identificarea bacteriilor anaerobe (Alexandra Macovei) . 900 j
XII
Partea I
GENERALITA.TI
1.1. DEFINITIE
PRE LEVARE
DE PROBE
ADECVATE:
MARCARE,
CONSERVARE,
TRAt-bPORT LA
LABORATDR
,\
CULTIVARE PEN-
EX"MEN DIRECT TRU IZOLARE
MA CRO sCaPI c, REZULTAT PRELIMINAP. MEDII ADECVA-
MICROSCOPIC, OAc4 ES1E FDSIBIL TE ATMOSFERA.
ALTE METDDE TEMPERA rUM,
PAPIOE TIMP
2
tehnici imunologice pentru depistarea $i identificarea antigenelor microbienc:
tehnici de depistare a unor metaboliti sau structuri moleculare specifice. e.g., a
acizilor gra$i volatili, a acidului tuberculostearic prin cromatografie gaz-lichicl: a
endotoxinei prin testul Limulus;
tehnici de biologie moleculara, e.g., sonde de acizi nucleici, reactia de amplificare
genica numita Polymerase Chain Reaction (peR).
2) ]zolarea microorganismelor in cuhura pura cu:
identificarea izolatelor;
preeizarea semnificatiei lor clinice;
antibiograma, cand terapia antimicrobiana este posibila $i necesara.
Metodele indirecte includ telmici pentru depistarea, caracterizarea $i cuantificarea
efectorilor imunitari: anticorpi (diagnosticul serologic), limfocite specific sensibilizate
(e.g., diagnostic prin reactii intradermice).
Necesitatea urgentei apare in raport cu impactul asupra deciziei clinice $i sub
rapoli economic.
In raport cu impactul asupra deciziei cfinice, informatiile furnizate de examenul
microbiologic Ie putem aprecia la trei nivele:
1) Foarte urgente. Orienteaza in 1-4 ore decizia clinic a prin rezultatele tehniciJor
rapide de depistare directa a microorganismelor in prelevatele patologice.
2) Urgente. Orienteaza decizia clinica in interval de 18-36 ore prin iclentificarca
prezumtiva a izolatelor cu semnificatie clinica, mai ales daca testuJ b-Iactamazei sau
antibiograma sunt posibile pe primoculturi.
3) Fara constrangere. Influenteaza decizia clinica abia dupa 2-5 zile saL!mai mult
prin identificarea definitiva a speciei, antibiograma pe subcultura, determinarea nivclului
de eficienta -cida a umorilor in cursul antibioticoterapiei, serodiagnosticul.
Investigatiile fomie urgent $i urgente sunt esentiale in bolile infectioase acutc grave
(e.g., septicemii, meningite, pneumonii, unele diarei acute) sau in infectii cronice grave
determinate de organisme cu cre$tere lenta (e.g., meningite tuberculoase) - tabelul 1-].
Sub raport economic investigatiile care dau mai rapid rezultate utile deciziei clinicc
sunt de preferat atat prin economia de materiale, cat $i prin scurtarea spitalizarii (e.g.,
antibiograma pe cultura primara in infectiile tractusului urinar).
I':~lliollarcli illvcstigatiilor III microbiologia c1inica III raport cu impactul asupra dccizici c1illicc
morfi
Idcntificarea dcfinitivii a Nivelul il1lportan(ei
lade~-Iactamaza
limita
tampoaneabsen!a defercn!iere
exsuda-
sau
cuConfirmare
Antibiogral11aintravcnoase
Oiprezum(iei
granl-negativi
Antibiogram:l
angina >llcmocu
a mononucleoza
~Ipozitiva
microscopia plco- Oaea1000
Prczum( sunt
deprin:Fara2-3Ituraspeciei
3Transport
Vincent:
Exsudatul
M(hel110culturi
Nivel
Proteina
suficiente
infee!ioasii
18-24'
Antigen
idenlifi-
Antigene
IdcllliJ'
carea
organisme
eonstnlngere
tului; seroasclor
Baclerioscopie
Examen
Hcmoculturi
icdeCateterul -eid
Idcntifiearca
seric
Cultivare biochimic
CdiInainte
bactcrii
o/ re)ml
Urgent
~-lactal11azii
Antibiogral11ii
~-lactal11aza so!ubil
il1lediat
iIcucograma
b.carca
Idcnlifieare
antibioterapie
Citologie
inscqiei
Antibiogramii"1
Antibiograma
ieroscopic: -cid
solubile 0aprezumtivii
reactival)
cantitativa
lterie fara
toxigcncza dc~iInainte
Inainte
-eidserolipului
dcfinitivii
al11prenta ~idecalitativii
anti-
sel11icanlitativii
refri-
lest ba a Foarle
deinser(iei bacili
Identificarca
monitor
speCIeIurgentde C01)
croseopieii,
Idcntificare
Idcntifiearc dcfinitivii
sonde de AON,
prezul11tivii
l1licroscopicii a
(l11i-
(::: 2-3~-Iactamaza
~-lactal11azii
Prelevate zite) ~i exigen!e
(1-3 ore)
If. injllll'l1;'{{{'
dcspeciei
IItI,dllll 1(1'011111111"11')
semJ-
izolatului
hematii, foar-te
refri-curatii sauare,
dcalzolare
microscopicii
din
lobacter sauVezi ;::10-15
asociate
dehemoeulturi
HCllloculturiVezi
vibrioni Foarte
lorClel urgent
inflamatorii
Confirlllarea 0 sau+dcfinitivii NJ~~!,lillll)(lI'(;lllIC i
Entitatea
sau
probii scua-
semni-
illlediat
cantitativii
polilllorfonucIe-
jetCitobaetcrioscopie:
ldentificarea
pansalllentc
germel1l deepiteliale
Suspiciune
opace definitivii
intestinale
diagnosticului
Pune(ie-aspira(ie
mijlociu/aspirat
Prelevate
biotcrapici;
inainte 11'de:eelule-
sauholeriei
de ealitate
~iexigen(e
antibioterapie:
1:;' ficativ
Identificarea
(IX-24
zumtivii
Vezi
cOlIsln'
shigele,
aeantitativii
spc-2Urgent
1substan(e
Identificare
Antibiogramii
Inaintea
suprapubian clinic
HcmocuJturi
tului
hemoeulturi
ore)
3ldelIgl'
C?Citobacterioscopic
polilllorfonlicieare
Antigene
baetcrii
Prczen(a
exigen(e
Illobili,
prin
Idcntiticarea
Identiticarea
Antibiogralllii2)
Antibiogramii Iradio-
din
,ilt:J_
Citobacterioseopie:
aerobilor
selllnificativ
l'campi-
euprczllmtivii
anti-
solubile
identificarea
vibrioni
trans- ...aceea~i
idcntifieare
definitivii aaclinic
izola-
categorie
spirili
dcfinitivii
bacterii speeiei
pre-a Antibiograma
spe- ei ilor aerobe/anaerobe
Hemoclilturi
-Transport
Urinii:
scurt
Uriniiposibil In interval cat Illai
~i siinge
eoee (1-2 zile
6
ECHIPA OC RECOLTARE PROBA ESTE TRANS-
lOENTIFICA PACIEt:!TUL PORTATA LA LABO-
SI PRELEVA PROBA RATOR
[lArAEST0 NOW.
TA NECESARA
RECOL-
SUPERVIZORUL VERl-
FICA REZUl TATUL. LA
NEVOIE CONTACTEA-
7.A MEDICUL
S[CRETARA LABrnA-
MEOfCUl CLlNlcAM.,
EVALUEA7A
SI IA OECIZIA TORULUI PREGATESTE
BU1ET'(SAI
1lL NULDE ANA-
---J Fig. 1-2. Circuitul informational inlrc mcdic ~i lahorlltor. Ohserva!i suhcircuitclefccd-h((ck carl' asigura 0 operatic con'cla.
Fluxul datelor care intra in laborator consUi din inregistrarea informatiilor desprc
pacient ~i a cererilor de analiza. In prezent, in laboratoarele noastre informatiile desprc
pacient sunt conjugate cu cererea de analiza, iar ie~irea este rezultatul testelor inscris in
buletinul de analiza. Dar, progresiv, trebuie sa ne pregi'itim pentru integrarea cOl11unicarii
medic-laborator intr-un circuit computerizat, care permite conexiuni cu alte servicii ale
spitalului (e.g., farmacia, alte seqii ale laboratorului etc.).
7clhell11 1-2
8
intre sensibilitate ~i speeifieitate, pe de 0 parte, ~i proportia rezultatelor fals nega-
:lye (FN) ~i fais pozitive (FP), pe de alta parte, exista 0 relatie strimsa:
proport1a. FN =RP FN
+ FN ( ecuapa. 3);
FP
proponia FP = FP + RN (ecuatia 4).
De unde rezuWi:
proportia FN = (l-Se) (ecuatia 5);
Predic{ia pozitiva (PP) masoara proportia pacientilor cu boala din totalul celor ell
cestuI pozitiv. Raspunde deci Intrebarii: "Daea paeientul are un test pozitiv, cat de verosimil
este sa aiba boaIa?".
PP = RP
RP + FP (eeuatia 7).
Predic{ia negativa (PN) masoara proportia persoanelor tara boaia din totalul eelor
eu testul negativ. Raspunde deci IntreMrii: "Daca 0 persoana are un test negativ, cat de
\erosimil este sa nu aiM boaIa?".
PN= RN
FN + RN (ecuatia 8).
Valoarea maxima a fiecaruia din indicatorii de performanta definiti mai sus estc
1 (100% dadi valoarea raportului 0 inmuitim eu 100) ~i este influentata semnificativ de
prevalenta bolii In colectivitate.
Prevalen{a (Pr) ullei anumite boli exprima fraetiunea persoanelor din colectivitate
care au acea boala.
9
atunci, prin substitutie, obtinem:
PN = (l-Pr)' Sp
(l-Pr)' Sp + Pr(1-Se) (ecuatia 16).
10
-~=------=====~~~------
Fiabilitatea testiirilor calitative depinde de raportarea la standarde determinate (e.g.
antibiograma difuzimel1ica, utilizarea unormedii de cultura ~ireactivi cu proplietati verificate.
precum ~ide folosirea unei tenninologii taxonomice recunoscute (e.g. izolarea ~iidentiticarea
microorganismelor).
Reproductibilitatea sau precizia masoara gradul de asemanare Intre rczultatclc
aceleia~i testari repetate pe un e~antion sau un grup de e~antioane similare, prelevate de la
acela~i pacient. Depinde de omogenitatea ~i stabilitatea qantioanelor ~i reactivilor.
Omogenitatea e!jantioanelOl: Izolatele din prelevate contaminate (e.g. sputa. fecak)
pot varia (cantitativ ~icalitativ) daca Insamantarile se fac din zone diferite ale unei probe sau
din probe repetate.
Stabilitatea e!jantioanelor!ji reactivilOl: MOaItea unormicroorganisme, supralnmlll(irea
altora pe durata prelevare-examinare influenteaza negativ reproductibilitatea. Determinarea
repetata a antibiogramei difuzimetrice a unei tulpini bacteliene poate da rezultate diferite ciar
care trebuie sa se Incadreze Intre limite acceptate.
11
~i competenta sunt indeplinite in confom1itate cu standardele de referinta in vigoarc.
Managementul calitatii include activitati de planificare, asigurare, control ~i imbunaU"itire
a calitatii.
Documentatia sistemului de management al calitatii este structuratii ~i ierarbizata,
documentul principal fiind Manualul calitiitii. In Manualul calitiitii sunt prezentate politica
~i obiectivele in domeniul calitatii, este descris sistemul de management al laboratorului
~i structura documentatiei utilizate, sunt definite rolul ~i respol1sabilitatea ~eful labonl-
torului ~i al managerului calitiitii pentru asigurarea .conformitiitii cu standardu\ de
acreditare. Manualul calitatii unui laborator de microbiologie contine sau face trimiteri
la celelalte documente: procedurile sistemului de management ~ila cele ajutiitoare, inclusiv
la procedunle tehlJce, lit instructiu1111ede manipulare a aparaturii din dotare, la telmicile
de lucru utilizate, eu detaliile strict necesare, la fonnularele utilizate ~i la modul de
co~letare, la specificatiile privind reactlvll ~i mediil~n1Ule, reguli de
preparare, con~~Evare~Lcontrol), la algoritmurile de izolare, identificare ~i caracterizare
--rcfilrcroorg311Tsmelor,la nomenclatorul analizelor pe care laooratorul este competent sa
Ie execute, lalibrmele de prelevare, conservare ~i transporta pieTevaTetorpTIwtugice etc.
Cerintele sfandardelor de referintii ~i docum"eilta.!l3. i";ltel'n~ a sls1e111uTllide
management al caliH"itii trebuie sa fie cunoscute ~i aplicate de intreg persona]ul
laboratorului, iar modul in care acestea sunt respectate trebuie evaluat ~i imbunatatit
continuu.
1.3.3.2. Standardizarea.
Standardizarea reprezinta un ansamblu de conventii care faciliteaza schimbul de
produse, servicii ~i informatii utile, garantate calitativ ~i care s-a extins de la domeniul
industrial ~ila cel al ingrijirilorpentru sanatate. In domeniul medical, un fenomen biologic
sau patologic este insa influentat de mai multe variabile decat a actiune tehnologica. De
aceea, poate, in medicina ar fi mai cOJ"ectsa utilizam termenul de nonne dedit cel de
standarde sensu stricto. Aplicarea acestor norme ne permite sa control am sursele de
variabilitate care influenteaza rezultatele investigatiei microbiologice (revezi 1.3.).
Pe plan mondial, activitatea de elaborare a standardelor este asiguratii de Organizalia
~tionaL:i 9g Standardizare (ISO), f~deratie mondiala constituita din organisme
f1ationale de standardizare2 din peste 140 de tari.
Vom aborda in continuare rolul standardiziirii pentru controlul variatiilorpreanalitice
~i analitice din microbiologia clinica.
1.3.3.3. Controlul variatiilor preanalitice include norme pentru alegerea.
recoltarea ~i transportul probelor, criteriile de calitate a probelor acceptate pentru
examinare, atitudinea fata de probele neadecvate.
A) Norme pentru prelevarea probelor destinate examenului microbiologic
1) Alegerea prelevatelor patologice, l1lomentul .$i ritlllul prelevclritor. Microbul
infectant il cautam in leziunile de la poarta de intrare a infectiei ~i din organele (inta sau
focare metastatice nespecifice apreciate pe baza examenului clinic. Poate fi prezent ~i in
12
100
mo
7 zile 14 zile 7zIle
Ilnvazla ][ Perioada de stare 11 Oeclin H
Fig. 1-3. Dinamica izolarii bacililor tifici ~i a raspunsului imun umoral in cursul febrei tifoide.
caile de raspandire in organism (e.g., sange, ganglioni limfatici) sau la nivelul diilor dc
eliminare (e.g., intestin, cai urinare). Alegerea momentului optim al prelevarii impunc
cunoa~terea evolu!iei ~i fiziopatologiei proceselor infeqioase. Pentru ilustrare prezcntam
in figura 1-3 dinamica izolarii bacililor tifici in cursul bolii din diferitele prelevate ~i
dinamica anticorpilor.
Antigene ale microbului infectant sunt cautate 1n umori ~i exsudate din focarul
infeqios (e.g., sputa, lichid cefalo-rahidian), in sange ~i 1n urina.
Ritmul pr~or influentel-Jzi'lsensibilitatea diagnosticului (revezi 1.3.2). dar ~i
rela!ia cost-beneficiu.
MffV\oC -e Doua-trei seturi de hemoculturi in prima zi de intemare, eventual repetate a
doua zi, mai'esc-~arisa diagnosticului in septicemn ~1 bacteriemii.
)f'-\<\Y. Sputa matinala, dupa tuse spontana ~i profunda, prelevata trei zile consccutiv
ame1Joreaza sensibilitatea deplstam bacllTIor tUberculozei.------
~ffCcv\ L\ Cate 0 proba de scaun prelevata trei zile consecutiv faVOI~a depistarea
agen!ilor iiifeqio~i intestinali. Daca, in ciuda suspiciunii c1inice, rezultatul ramane negativ.
este indicata 0 noua proM prelevata dupa administrarea unui purf@tj~ali_n_.__
La pacientii pneumonici estesmicienta a singura proM de sputa eu ealitatc
eorespunziltoare.
~.~~ ... ~cult~varea. de rutina a exsudatului faringian sau urinei trebuie ,sa se rezume la 0
~~~~,
Este formal eontraindicata_colectarea sputei sau urinei din 24 ore, interval in
care conditia microbiol()g~~_il_P.rQb~Lse_mod+fiea-inacceplabil (e.-g.~-multipl icarea
contaminantiIOiT
2)Prelev-g;'ile sefac Inaintea instituirii tratamentului antimicrobian. Izolarea unor
bacterii foarte' sensibile (e.g., streptoco~ii ~-hemolitici, g0!!2c()cii,.-llleningocoeii sau
Hael7~o..pJljlJ.~~i!Jf1yel1we)
poate deveni imposibila dupa primele ore de antibloticoterapie.
el-([arineficientii. Oridt de mare ar fi urgen!a tratamentului antimicrobian 1ntr-o boala
infee!ioasa grava, intotdeauna pot fi ~i trebuie gasite cateva minute, inai nte de
13
administrarea primei doze de antibiotic, pentru prelevarea corecta a probelor destinate
examenului microbiologic.
Daca aceasta norma nu a putut fi respectata, rar se poate recurge la prelevatc alter-
native (e.g., medulocultura mai pem1ite izolarea bacililor tifici ~i dupa 24 de ore de la
negativarea hemoculturii).
Probele_Qbtinute sub antibioticoterapie nu vor fi respinse peJltru ca:
unele antibiotice sunt numai bacteriostatice ~i microorganismul poate fj izolat
dupa ce inoculul a fost diluat suficient in mediul de cultura proaspat, fara antibiotic;
uneori antibioticul nu realizeaza concentratii inhibitorii in focarul infeqios,
Oricum, un rezultat negativ va trebui comentat corespunzi'itor in buletinul de analiza.
~ , ~lJI'l0lfl;ziuni;--care
:r:::/!!'pre. levatele
vehiculeaza
exam inate
microbul
trebuie sa
infectant
contina sau
realul
antigenele
prodlls patol~)gic,
sale. In sange,
adic5in material"
lichidul
wr cef~lo_"i~ian sau in urina microbii antrenari din leziuni sunt ]=-epartTZatiuniform.
Distributia lor in probele de sputa, de materiIfeCaIe, exsudate oe pe-suprafata mucoasclOr.
din plagi $. a. nu este in mod necesar unifo~ Daca in loc de sputa se trimite spre
Jvv
~~
cu saliva, in loc de portiunile muco-sanguinolente din scaun portiuni prelevate aleator.
un raspuns util din partea laboratoruluidinpoate
e~defxsudatul foselefi a;nigdaliene
imposibi1. un tampon imbibat aleator
4) Pr!}levarile se fac aseptic. Trebuie prevenita sau redllsa contaminarea probelor
Cllmicrobiota indigena din secretii, exsudate, tesuturi ~i organe Invecino/e ~mpol1Ld
C j? endometrial, sau endocervical trebuie ferit de contaminarea cu secretiivagil1ilJe.
'COntaminarea urinei cu microbiotftLTi'etrala $i perineala trebuie redusa la maxim~~mprin
(,A,~ preleVan;; de probe ~-E~:~lPiLQ~ontaminarea ariei periuretra~)yprinse in zbor din
~jetul mijlociu $. a. m. d.).' , ~ -----.
Cand metodele curente de reducere a contaminarii nu dau rezultate concludente,
putem recurge la prelevari care :51111teaza caile naturale de eJiminare ,~icon/mllinore
(e.g., aspiratie transtraheala, aspiratie suprapubiana). Acestea sunt insa tehnici agresive
indicate $i acceptate numai cand relatia risc-beneficiu inclina in favoarea beneficiului.
5) Probele trebuie prelevate In cantitate suficienta pentru efectuarea coreeta a
examenelor microbiologice (microscopie, insamantari pe medii de cultura indicate saul
$i inoculari la gazde de laborator). Impun atentie lezil!nile sarace in ~11icrobi,cum sunt
cele din infectii --
, cronice.= ~L<VVV\ pct.~ t/Y. 'VVV\.~~ - (
Inca frecvent se primesc inlaborator tampoane a roa e uscate cu exsudatepuruleme.
care ar fi putut fi prelevate in cantitate m ] mare prin punctie $i aspirarie. Se mai primesc
probe de cca 0,5 IllI sputa ori spalatura bron$ica cu cererea de a urmari bacterii cu crqtcrc
rapida, microbactei1Gi fungi, lucru evident imposibil. Asemenea probe, daca nu pot fi
imediat repetate, vor fi examinate, dar cu comentariul de rigoare al unui rezultat negativ.
In situatii in care, prin natura leziunii, cantitatea de material prelevabil este minima.
acesta trebuie suspensionat initial intr-un bulion de transport adecvat dupa ce laboratorul
a fost prevenit.
6) Instrumente ~i recipiente pentru prelevari :ji trall!,jJortul probelor: Ull instru-
ment de'S-utilizat pentru prelevare $i transport de probe este tampo/lul de vata stel-ilizat in
14
<\F~'
-
rub inchis etan~ prin dop sau capac. Tamponul trebuie sa fie Ii sit de inhibitori microbieni
~,
ca acizi gra~i din vata, ioni metalici sau sub stante distilate din tija port-tampon 111CurSll!
sterilizarii. Recomandam ):an1ponul de vata hidrofila cu fibra lunga rulata pe port-tam-
0: .1.)\ w-LA
J.('\r.eb~e
,'.~ \f'~colo at prelevate
~--~-~----"'-----'--~---------~--~----'
Gram. Depeaceeatampon se vapentruevitaa utilizarea
Ie putea depista pe frotiul
tamponului ori efectuit extemporaneu
de cate ori sunt posibile~i
,2"-"j; prelevarnn carltrtati mai mari (aspira1ia exsudatelor fluide, produse de chiuretaj sall
~'.1iV ~ biopsii). Se VOl"preleva mai multe tampoane daca examenul presupune efectuarea de
uni1arite~-Thate trebuie sa aiba capac protector etan~. Pot fi folosite recipiente existeiifc
in laborator sau prov~ din spital (eprubete, flacoane, borcane cre~o mL dm st1Cla
etc.). Condltionarea lor presupune spiiliire foarte mgnjlta pentru inde artare ror
urll1e~~ substante antimicrobiene ~i sterilizare exelusiv prin a enti tlzici. esigur, mai
avantajoasa este folosirea reclpiente I' tipizate din material plastic, ster' lzate. care pot
fi alese din cataloagele comerciale.
7) Marearea eontainerelor ell prelevate patologiee se face vizibiL Cll etichete
autocolante pe care se consemneaza prin pix cu bila u1111atoareledate minimale: nUll1e1e
~iprenumele pacientului, prelevatul, sursa, medicul, data ~iora prelevarii, numarul cererii
de analiza.
In figura 1-4 sugeram un model de cerere ~i buletin de analiza microbiologica.
Semnificatia datelor info1111ativedin cererea de analiza se b'Tupeaza astfe1:
date necesare identificarii probei: numele, prenumele, varsta pacientu1ui. data
recoltarii, spitalul, sec1ia, salonul;
date necesare alegerii celor mai adecvate tehnici de prelucrare a probei:
diagnosticul prezumtiv, natura probei, examenul solicitat (in termeni cat mai preci~i).
precizarea faptului daca este yorba de bolnav (inclusiv data debutului bolii), convales-
cent sau purtator, prec;za1'i asupra te1'apiei antimicrobiene eventuale;
15
CERERE DE ANALIZA MICROBIOLOGICA
Medicul solicitant
(Semnatura ~i parafa)
* Semnificative in contextul clinic
Laboratorul Tel.lFax _
Nr. de primire din ora _
Conditiile In care a ajuns proba In laborator _
Rezultatul analizei:
Microscopia directa
Examene serologice: _
16
date pentru precizarea responsabilitatii prelevarii ~i transportului: ora recoltarii.
data ~i ora primirii in laborator, medicul care a recomandat analiza ~i persoana care a
facut recoltarea ~i a asigurat transportul;
date necesare pentru interpretarea de catre microbiolog a unor rezultate: vaccinari
in antecedentele recente, prelevare sub terapie antimicrobiana sau imunosupresiva etc.
Doua obiective majore uTI1larimin intervalul dintre prelevarea probe lor ~iexamenu]
lor microbiologic, care poate varia de la cateva minute la mai multe ore sau zile, dupa cum
proba este destinata laboratorului din spital ori polielinica sau unui laborator de referinta:
1) Mentinerea cat mai mult posibil a conditiei microbiologice initiale a probei:
supravietuirea microbului infectant, inhibarea multiplicarii microbilor contaminanri pc
seama nutrientilor din prelevatul patologic; mentinerea nealterata a citologiei.
2) Prevenirea raspandirii microblllui injectant la personal ~i in colectivitatc.
M031iea microbilor infectanti din probele destinate examenului microbiologic este
o sursa de erori. Poate fi cauzata de: razele solar,: directe; deshidratare; modificari de
pH; autoliza; oxigenul atmosferic in cazul anaerobilor stricti. De aceea, odata reco]tate,
probele trebuie examinate in eel mai scurt timp posibil sau conservate prin refrigerare ~i
medii de transport adecvate.
ReJrige rarea. La ODC (container izoterm cu gheata umeda) sau la 4DC (frigider)
majoritatea microbilor patogeni supravietuiesc timp de cateva ore necesare transportului,
iar multiplicarea contaminan!ilor este oprita.
purine bacterii nu rezista la refrigerare: meningococul, gonococul, Hacmoplzilus
il\flllenzae.
M cdiil e de transport asigura supravietuirea microorganismelor prevenind desicareil,
variatiile de pH, oxidarea ~i autoliza. Cel mai frecvent utilizate in bacterio]ogia clinica
sunt mediile care contin substante stabilizatoare non-nutritive: e.g., Cary-Blair, Amies
sau Stuart. Alte medii sunt indicate pentru transportul ~i conservarea virusurilor.
Formulele acestor medii, indicatii privind modul de folosire ~i firme producatoare
sunt precizate in cap. 39. Un indicator, cum este ro~u-fenol, permite monitorizarea
vizuaHi a pH-ului cand aceasta conditie este critica pentru supraviewirea unoI' microbi
(ca virusuri, shigele etc.).
Microbii care sunt izola!i pe culturi de celule sau embrioni de gaina (ca virusuri Ie,
chlamidiile) se transporta in medii cu antibiotice (penicilina, streptomicina, nistatina).
Cand insa in acela~i prelevat urmarim atat virusuri cat ~ibacterii, proba va fi suspensionata
in mediul de transpOli lara antibiotice, umland ca acestea sa fie adaugate diferentiat ]a
prelucrarea probei in laborator. Cel mai bine insa prelevatul se suspensioneaza in cele
doua medii de transport cu precizarea elm"aa destinatiei fiecaruia.
o aten!ie aparte trebuie acordata bacteriilor anaerobe:
Daca transportul la laborator ~i examinarea se fac fara intarziere, cea mai
accesibila metoda este aspirarea probelor fluide in seringa etan~a cu indepaliarea imediata
a bulelor de aer ~i obturarea acului prin in!epare intr-un dop steril. Exista insa riscul
transmiterii prin in!epare a virusului hepatitei B sau al imunodeficien!ei umane.
Pentru probe1e biopsice ~i tampoane sau dadi interva1u1 pfl11a1a examinare se
pre1unge~te, sunt indispensabi1e containere comercia1e speciale (tuburi, flacona~e, pungi)
care con!in un sistem generator de CO2, un agent reducator ~i un indicator "redox"
(resazurina sau albastru de metilen) pentru monitorizarea vizua1a a anaerobiozei.
Containere speciale cu atmosfera imbogatita in CO, ~i me diu microaerofil sunt
avantajoase pentru probele in care urmarim Neisserici gonorrhoeae ~i respcctiv
CCilllpylobacter jej un i.
Cei interesati in expedierea de produse l11icrobiene prin po~ta trebuie sa respectc
exigen!e1e de conservare ~i siguran!a impuse de standarde recunoscute intemational.
Dintre acestea recomandam procedeul standard elaborat de National Committee.f(JlO Clini-
cal LaboratOlY Standards (NCCLS, 1980).
.-
~TampOl;
micobacte-;:ii"..
unic cu solic.it~,i mllltipJ~_Jip depistare de "aerobi, anaerobi, fungi.
_..~- ... - .. -
.. d) Probe evident contaminate cu sub stante straine, e.g., bariu, coloranti, sub stante
grase, insecte.
e) Probe autorecoltate de pacient.
f) Probe evident contaminate prin prelevare $i transpOli in containere neadecvate:
e.g., feca]e pentru coprocultura expediate in cutii de chibrituri (vezi $i Capitolul 2 -
securitatea microbiologica).
g) P]aci cu mediul de cultura uscat sau suprafata invadata prin organiSl1]~_~
contalninare . ..-- -------------- -.- ---- --.-.-.---.--
. ..-' .
h) Se exclud de la cultivarea pentru bacterii anaerobe urmatoarele categorii de
produse: sputa; spalatura gastrica; urina dinjet mijlociu: secreria prostatica prelevata
transuretral; arice prelevate de la nivelul gurii, nasului, oro- $i nazofaringelui (exceptfllld
piese biopsice profunde, intraoperatorii); prelevate cutanate superficiale; fecale
(exceptand so]icitarile pentru depistarea unor anaerobi diareigeni cum sunt Clostridium
difficile, C. perfringens, C. septicum; tampoane din orificiile de ileostomie sau
colostomie. Prezenta n01111ala,in numar enom1, a anaerobilor in aceste prelevate face
examinarea inoperanta.
19
i) Nu se cultiva probele tisulare transportate in solutii fixatoare (formol etc.). Doar
in cazul probelor cu dimensiuni mari, primite in laborator imediat dupa recoltare, se pot
incerca spalarea piesei cu solutie salina izotona sterila, sectionarea ~i prelevarea pentru
cultivare din mijloculmasei tisulare.
Ca 0 concluzie privind controlul variatiilor preanalitice, putem spune ca reZlIlw!lIl
U7111i exalllen microbiologic nil poate Ii niciodata mai bun dedit prodllSlIl potologic
exalllinat.
Tocmai pentru a tine sub control cat mai eficient calitatea prelevatelor am propus
ca prelevarile sa fie rncute de catre 0 echipa subordonata direct ~i instruita de laborator
(fig. 1-2). Acolo unde aceasta fOI111Ula nu este agreata, din diferite motive, urmeaza ca
laboratorul sa puna la dispozitia fiecarei sectii un !11Cl}zualClt tell1!icile corecte del2q:l1J' re
~isa monitorizeze prelevarile, ceea ce in final se poate dovedi mai putin econOlnlc (cfortul .
de instruire a unui personal mult mai numeros, cu mai multe subordonari; efortul dc
monitorizare ~i numarul mare de probe necorespunzatoare calitativ).
serun
Reactivul
SteriCllIitate,
Ibidem
cu
cultura
de
antigene
de lot pH, I, lot;;arja
fiecare
Fiecare Titrul
Ibidem
comercial
Vezi comercial
Activitatea hemolitica
fiecare
sau dozare
laborator,
selectiva
$1
proprietatiFiecare
reaqii Observa\ii
cienta
pH.CapitoluJ
Conditii Fiecare
hOl11ologe
Diferentierea
nutritivel, de25referinta;
lot
Frecventa
urmarite
proprietati $i reaqie
afinitatilor
eficienta
Fiecare $aIja I,tinc-
coloratie
nutritive activi-
selectival,
preparata efi- in Capitolul4139
Capitolul
cultura lara
20
Tabe/lil ] -3 (continuarel
.;.. :~ Diameu'ul
anti-
Reaetivul
pentruzoneloreu deCMlinhibilie
Reaetia
aCondilii '),2.+
Furmarita
tuJpiniJor
Observatii
Reactia
rinta ~~.ieeare
Fieeare testare
test
lot
Freevenla
pentru
unnarite are semestrial
sau
detulpinile
referinta de refe- Fieeare lotVai Capito IeIe: ~ I
ei anti-
Cat timp patologia infectioasa a fost dominata de agentii infectio~i clasici (e.g ..
difteria, febra tifoida, holera ~. a.), diagnosticul etiologic ~i interpretarea rezultatelor de
laborator erau facilitate de postulatele llli Koch-Henle care stabilesc ca un microb poate
fi incriminat drept cauza a unei boli daca:
1) este depistat in toate cazurile bolii respective, iar distributia lui in organism
corespunde leziunilor caracteristice ale bolii;
21
NN Tabelllll-4
Intretinerea curcnta
8 la -20C nominala:
Curatire
Cllra!irc
Cllra(irc
e.g.. Stergcrca Revizia -- 600
~i~idccongelarcdelalaC
Scmeslrial
.35.5"C
70' kSemestrial
Semeslrial
tehnicii
schil11barea
StergercaLil11itelctoleran!ei
prafului
Omoriirea
dccongelare
praflllui
Omorarea
Fuziune/vir~ul
Fuziune/virajul -750
pepcapei
sporilor
spori pcreti
pcrcli
lor Continuu
Continllu
Zilnic
LaLunar
~iContinull
liccarelunideschidere
Saptal11anal
culoriiLaraftllri
rafturi
Fiecarc2 ~arja
Saptamanal ~i dupa ficcarc 2-8C
cf. temperaturii nominale
fiecare Tempcratura
Aparatul __ 0-
Frecventa
intreru
fioleperecudespori
intrerupere
-- benzi curentde B. stearotherl/lophilus
stearotherl/lophillls
Tlibell/ll-4 (contil1llal\:)
l-l
,~
IV
-I>-
intretinerea eurenta
Aparatul Frccven\a Limitele toleran\ei Revizia tehnica
Performanta / Conditia
pH-metrll Eficacitatea:
- testare prin scara CllpH cunoscul La fjecare utilizare 0,I unitati de pH Anual
Recipiente din I Variatia de pH a apei distilate dupa I Fiecare lot achizitionat Cre~tere de pH sub 0,5 unita!i
sticla autoclavare
ASOCIAT" SIMBI011CE
[)elo, Ambli
o ependeny.l (
partla~ Asoc"lerea
ocazlOl1a \a
26
3) Reversia sau substitutia alelidi a genei mutante trebuie sa restaureze patoge-
=-~:tatea.
Reiese, din contextul sumar prezentat mai sus, ca un acela$i microorganism depistat
:::.diferiti pacienti sau la acela$i pacient in diferite momente poate avea semnificatii
':::r'erite:infectant, de portaj, contaminant, de colonizare n0l111alasau anonnala. De unde
se degaja doua concluzii importante:
Niciodata un microb depistat nu trebuie acceptat drept cauza a bolii numai pentru
21 este un patogen recunoscut, ci numai prin argumente convingatoare .
Niciodata un microb depistat nu trebuie respins drept cauza a bolii nUl11aipentru
23 nu este un patogen recunoscut, ci nUl11aiprin argumentare convingatoare.
27
Cazul prelevatelor din zone normal colonizate. ldentificarea integral a a izolatelor
din asemenea probe este inutila. In functie de sindromul clinic, un11arimnumai principalele
microorganisme patogene care II pot cauza (e.g., izolarea Streptococcus pyogenes din
exsudatul faringian, izolarea shigelelor, a salmonelelor sau vibrionilor holerici din scaunul
diareic). Absenta din proM a unei bacterii patogene, care sa explice tabloul clinic.
orienteaza investigatia spre microorganisme conditionat patogene, virusuri ~.a. lmplicarea
microorganismelor conditionat patogene depistare in aceste situatii 0 facem prin: teste
de patogenitate (e.g., izolarea din scaunul diareic a tulpinilor de Escherichia coli
enterotoxigene, el1teroil1vazive etc.); condiria pacientului (e.g., ooehi~ti i de
Cr)ptosporidiu11l au seml1ifieatie elinica in seaunul diareie al gazdei il11unoeol11promise).
Autoserodiagnosticul (del11onstrarea la pacient a unei dinamici sel11uiticative a
antieorpilor fata de izolatul eu presupusa seml1ificatie clinidi) este un argument l11airar
utilizat ~i trebuie il1terpretat prudent din cauza unor posibile inrudiri al1tigeniee intre
microbi.
28
Sefullaboratomlui realizeaza indmmarea ~i controlul personalului in subordine
prin mai multe metode: scrisa, orala, rondul prin laborator, verificarea performantelor
tehnice prin probe oarbe.
29
8) Frecventa cu care rezultatele finale intarzie mai mult de 5 zile.
9) Frecventa cu care pacientii sunt tratati cu chimioterapice la care microbul infectant
a fost rezistent in vitro.
In raport cu rezultatele acestor verificari, ~eful laboratorului programeaza
perfectionarea personalului prin studiul individual, stagii in laboratoare ierarhic
superioare, cursuri in universitatile acreditate de catre Ministerul Saniitiitii.
31
Asemenea discrepante pot fi 0 eroare, fie de laborator, fie de diagnostic prezumtiv.
in aceste situatii, clinicianul, familiarizat cu sursele variabilitatii, in detel'minarile de
laborator, trebuie sa revizuiasca in pril11ulrand conditia pacientului in momentul prelevari i
probei. Oaca persista suspiciunea erorii de laborator, trebuie solicitat un nou exam en pe
aceea~i proba (daca aceasta mai exista) sau, daca este posibil, pe 0 noua proM. AstfeL de
cele mai multe ori, situatia este clarificaHi. Oaca a fost 0 eroare de laborator, se poate
depista sursa pentru a preveni repetarea ei. Oaca nu a fost 0 eroare de laborator.
rationamentul clinic urmeaza a fi corectat. Ambele spre binele pacientului.
Comunicarile intre l11icrobiologul, executant, ~i clinicianul, solicitant ~i beneficial'
in numele pacientului, pot fi: comunicari scl'ise, intalniri organizate, intalniri spontane,
vizite periodice in serviciile clinice.
Comunidirile scrise:
Buletinul de analiza a fast eomentat mai sus.
Manualulutilizatorului include atentionari asupra practicilor gl'e~ite, nOl11en-
clatol'ul analizelor efectuate de laborator, infomlatii pentru mediei ~i asistente pl'iviroal'e
la exigentele prelevarii probelor pentru exal11enele microbiologice ~i serologice, ghidul
de interpretare a rezultatelor. Insistam asupra oportunitatii formarii unor echipe specia-
lizate pentru prelevare (fig. 1-2) .
Scrisorile l7letodologice ale laboratoarelor de referinta sau Societatii Romanc
de Microbiologie, publicate periodic, pot atentiona asupra modificarilor recente in
investigatia microbiologica clinica, modificarilor survenire in nomenclatura microorga-
nismelor, aparitiei unor noi microorganisme patogene.
InHUnirile organizate cu medicii ~i asistentele din sectiile care apeleaza cel mai
frecvent la serviciile laboratorului de microbiologie sunt utile pentru a anunta, a explica
modificari reeente ale protocoalelor de laborator ~i a analiza deficiente ale colaborarii
elinica-Iaborator.
Intftlnirile spontane "Ia dejun" sau "la coltul coridoarelor" cu schimb de opinii
asupra serviciilor de laborator (exigente ale medicilor privind rezultatele analizelor de
laborator, exigente ale microbiologilor privind prelevarile etc., necesitatea implementarii
unui nou test ~. a.).
Vizitele periodice in serviciile cHnice sunt operative ~i eficiente daca au ca obiect
un afi$ier de sesizari (blocuri eu foi deta~abile) in care asistentele ~imedieii consemneaza
orice comentarii privind serviciile laboratorului. Cu aceasta ocazie se poate stabili
contactul personal al microbiologului cu medicii care au ridicat problemele respective.
32
J.c~iune sunt: a) cunoa~terea precisa a costului analizelor; b) prescrierea unor examene
:L:1tlcrobiologice cu indicarie adecvata; c) triajul de calitate al probelor dublat de
:Twnitorizarea prelevarii ~itransportului probelor; d) alegerea testelor pentru investigatia
:nicrobiologica.
2.1. PLANIFICAREA ACTIVIT A TII 2.5.12. Echipament din sticla, material plastic
2.1.] . Personal necesar ~i articole mici de laborator
2.6. REGULI DE COMPORTARE: RE-
2.1.2. Aprovizionarea laboratorului
2.2. SPA T1UL NECESAR AMPLASARE ~1 GIMUL ANTIEPIDEMIC, PROTECTlf\
PLAN MUNCIL PREVENIREA ~l STIN-
GEREA INCENDIILOR
2.2.1. Spa]iul necesar
2.6.1. Regimul anti epidemic
2.2.2. Amplasarea
2.6. I .1. Clasificarea microorgallismelor III/I/IICrie
2.2.3. Planul de ansamblu
de riscllI illrecrios
2.2.4. Pia nul principale!or compartimente
2.6.] .2. Cai de transmitere .~ipOr{i de illlmre III
2.3. CONSTRUCTlA $1 1NSTALA TULE OIxwlism all' illfecriilor de labowtor
2.4. MOBIUERUL
2.6. I .3. Clasificarea labowtoare!or III/iI/IC{ie de
2.5. ECHIPAMENTUL
exigellta sigllralltei allfiiJ(fi'ctioa.le
2.5.1. Microscoape ~i lupe 2.6.1.4. Barierele alltiinfi'Ctioase: primare. seClm-
2.5.2. Incubatoare, biii de apii sau de nisip dare, tertiare
2.5.3. Refrigeratoare 2.6.1.5. Illcilltele (boxele) de protec{ie microbio
2.5.4. Centrifuge logica
2.5.5. Balan]e 2.6.1.6. Sigllrall{afa{i/ de silbstantele intlamabile.
2.5.6. Omogenizatoare, agitatoare, dispozitive combllstibile. roxice .yi I'oro:il'e
35
PLANlfICARE: 2) Volumul global de activit ate repartizata pe
REACTIVI
tipuri de analize plus cre~terea estimata conform
prevederilor statistice sau programului de dezvoltare
al unitatilor beneficiare.
3) Volumul mediu al activitatii zilnice repar-
tizat pe tipuri de analize.
4) Variatiile sezoniere ale volumului activitatii,
care au ca baza de calcul analizele efectuate in primul
~i al treilea din ultimii trei ani de activitate.
PLANIFICARE Pornind de la aceste patru premise, putcm pla-
STICLARJE.
INSTRUMENT[ . nifica realist: spatiul, dotarile, reactivii ~i personalul
APARATURA
necesar pentru 0 activitate eficienta, actuala ~i de
Fig. 2-1. Premisele de planificare a perspectiva. Figura 2-1 sugereaza relatiile dintre pre-
activitatii in microbiologia clinica. mise ~i planificarea activitatii.
Valori ale UTP au fost stabilite de diferite foruri: College qf American Por/z%-
gists. Pentru laboratoarele noastre nu sunt stabilite insa UTP ~i nici nu putem extrapola
aprecierile forurilor de specialitate straine, din cauza diferentelor dintre dotari, facilitati,
tehnologii ~i calificari. De aceea ca1culul necesarului de personal pentru 0 activitate
economidi eficienta este inca aproximativ ~i subiectiv.
36
900 x 25 g
Cantitatea necesara pentru consum per an = 100 = 225 g.
37
7) La primirea aparatului trebuie verificate: documentele comerciale, livrarea
manualului de utilizare ~iintretinere, a certificatului de garanlie, integritatea ~i funqiona-
litatea aparatului ~i accesoriiloL
Procedura este valabila ~i pentru reactivi.
Ca reguli generale:
In fiecare laborator, unul dintre speciali~ti trebuie desemnat pentru gestiunea
inventarului ~i personalul responsabil de inventarierea sau autorizat pentru eomanda
reaetivilor, echipamentului ~i aparaturii.
Oriee comanda pentru aprovizionare se face in scris.
Contractele anuale pentru livrarea de reactivi ~i materiale consumabiIe trebuie sa
prevada expres: numele reactivilor, calitatea, numarul de cod, pretul estimat, cantitatilc
necesare defalcate pe termene de Iivrare (lunar, trimestrial, anual, in funqie de
perisabilitate ~i cantitatile folosite).
La primirea in laborator reactivii ~i alte materiale sunt imediat dezambalate ~i
confruntate cu documentul comerciaI. Se urmaresc in mod special: termenul de valabi-
Iitate, degradari ~i defecte macroscopice, perfonnantele calitative fata de martori adcevati.
Toate neconcordantele cu prevederile contractului sunt astfel semnalate 121 timp pentru
inlocuirea de ciltre fumizor a materialelor necorespunzatoare.
Reactivii verificali sunt inregistrali in cmioteei, marcati cu data primirii ~idepozi-
tati, In ordinea tenl1enilor de perisabiJitate, In condi!iile de pastrare indicate de produeator.
2.2.2. Amplasarea
38
2.2.3. Planul de ansamblu
Birou Recept~
Once laborator de Microbiologice clinica
::-:-::,,o:.:pune
urmatoarele compartimente: de
Oependinte (1 ) Depen din fe [3)
-~c::,:<-=u:-a.de investigatii, de pregatire a sticla-
-:",i. j", preparare $i condition are a mediilor de
: "::~Jra ~i reactivilor, de depozitare (sticlarie, Dependintel2 )
:::i:
:-:-_~c:j: de cultura, reactivi), birou, dependinte a
c
CL
I~I
1,75m 1
I
N Qo,
I
0-
3
'3
I
I
I
I
,
Modul Modul [-8 I Modul 1_
-.J
I
linear Inn L If ~ in"U" Ul
'3
-3,6m- -3,6m-
40
~\Jod!ljlll in "U" este celmai eficient pentru 0 gama diversificata de examene sau
~~~::imc][1e eu etape multiple (e. g., centrifugare, microscopie, insaman!~iIi ~. a.). Frontul
:JJ1I""lilll de lueru pentru un tehnician este de 2 m liniari masa pe fiecare latura a literei U.
41
Laboratorul necesitEi unnatoarele instalatii: electrica, de gaz, de apa rece, calda ~i
deionizata, de Incalzire ~i aer conditionat. Existenta unei instalatii centrale de abur
conditioneaza folosirea autoclavelor orizontale modeme. In limita posibilitatilor, 0
instalatie centrala de vacuum ~i una de aer comprimat amelioreaza mult condiTiile de
lucru.
Instalatii de aer conditionat ~ide Incalzire trebuie sa asigure temperatura ~iumiditate
constanta pe tot parcursul anului, reducand la minimum curentii de aer In ariile de
activitate.
Sisteme exhaustoare VOl'fi prevazute pentru locurile de lucru unde apar vapori
iritanti (manipularea un or reactivi), aburi (funqionarea autoclavelor, ma~inilor de spalat
etc.) sau mirosuri neplacute (culturi ale bacteriilor anaerobe, enterobacteriacee).
Iluminarea corecta a locurilor de lucru, fara reflexe sau umbre suparatoare, asigura
precizia manipularii. Pentru aceasta tehnicienii VOl'lucra In fata ferestrelor, iar cOlVurile
de iluminat, tuburi fluorescente care asigura lumina "de zi", VOl'fi fixate pe tavan. Surse
suplimentare de lumina pot fi plasate dupa necesitatile fieciirui loc de activitate.
Este foarte important ca instalatia eleetridi sa faea fata sareinii impltse de
ji/1/e{ionarea eoneomitenta a aparatelor din laborator sau din restul cladirii (mai ales
cand intra In circuit mari consumatori ca aparatura radiologica, statia centrala de aer
conditionat etc.) ~i sa asigure curentul sub tensiune stabilizata. Vor fi prevazute prize la
distante de 1,5-2 m una de alta in compartimentele de lucru, inclusiv In lungul fronturilor
de lucru multimodulare.
Chiuvete din mateliale necorosive cu instalatie de apa rece ~icalda trebuie prevazute
la extremitatea fiecarui modul de lucru al tehnicienilor. Bacurile din compariimentu] de
spalare a sticlariei impun acelea~i exigente.
2.4. MOBILIERUL
Mai convenabil este mobilierul de tip modular, care poate fi confecrionat din leml1,
otel sau masa plastica rezistenta.
Blatulmeselor trebuie sa fie neted, neinflamabil, impermeabil ~inecorosiv, pentru
a fi u~or de spalat ~i dezinfectat. Culoarea neagra evita reflexele supariltoare ~i permite
umlarirea facila a culturilor In placi Petri, a reaqiilor de aglutinare pe lama etc.
Dulapuri cu u~a glisanta, plasate pe mas a ~i sub masa, asigura depozitarea mate-
rialelor necesare fieciirui modul de lucru. Este indicata ancorarea lor la perete.
In spatiile de depozitare sunt necesare rafturi. Pentru sticlarie, medii de cultura ~i
chimicale necorosive, mai convenabile sunt cele din lemn sau aluminiu.
2.5. ECHIPAMENTUL
42
Tahelul ]-1
Echipamentul compartimentelor din laboratorul de micl"Obiologie clinicii
(A) Sectorul de prelevare a probelor are prevazute incaperi separate pentru venopunctura, pre levari
de urina etc. dotate cu instala1iile, facilitarile, instrumentarul ~i recipientele prevazute conform
precizarilor din Cap. 8-19
Anse Incubator
Pensa
Frigider
Tampoane Propipete vaJiate ~i varfuri corespunzatoare
Baghete de lemn Placi din material plastic cu godeuri pentru reaqii
Etalon nefeloll1etric
serologice
Bec de gaz sau incinerator electric Eprubete
Lame ~i lamele de microscop Placi Petri
Platina incalzitoare
Stative pentru eprubete
Stativ pentru colorarii Tavi pentru t1acoane
Batelie de coloranri ~ireactivi pentru microscopie Containere pentru materialul contaminat
Microscop, lupa Bm'cane separate pentru pipete ~i material ll1ic
Centrifuga ~ibalanra pentru echilibrarea tuburilor de laborator contaminat
Trompa de apa Boxa de siguranla antiepidell1ica
Baie de apa
Autoclav( e), de preferat vertical(e) cu perete Dulap pentru uscat sticlaria spalata sau, inlipsa,
sill1plu rastele corespunzatoare
Bacuri, Iigheane ~i caldari din plastic, seturi de Etuve
perii ~i instalalie pentru spalat pipete Cutii pentru all1balarea ll1aterialelor de sterilizat
Preferabil, 0 ll1a~ina pentru spalat sticlaria
43
2.5.1. Microscoape ~i lupe
2.5.3. Refrigeratoare
2.5.4. Centrifuge
[oan
45
4) Verifica daca ai plasat diametral opus perechile cupa-tub, mai ales la rotoarele
multiloculare.
5) Nu centrifuga material infecrios in tuburi Taracapac ~inu centrifuga in tuburi CLl
dop infundat pentru ca se va infunda ~i mai tare, cele de bumbac piitrunzand in tluidul
din tub.
6) Nu forra cu mana franarea rotorului.
2.5.5. Balante
46
Palnie cu capac Filrru
HEPA
o0 oo'rt+Lumina
Pref i ltr u
Pres-
tub
Ventilator
Cauciuc
Varf din
Deflector
Tub Tub de
______ Aer din exrerior
------_ Aer prefiltrat
~
IT\:3rlor ~~ ump\u t
Qstictii ---- . Aer sreri l
Fig. 2-6. Dispozitiv eu Fig. 2-7. Boxii eu aer laminar pentru sigu-
piUnie pentru turnarea rantii mierobiologieii.
mediilor de eulturii.
Dispozitivul Cll palnie (fig. 2-6). La 0 palnie cilindrica sau conica de 1-2 litri,
prevazuta cu capac, se adapteaza un tub de cauciuc sau material plastic autoclavabil
tenninat cu un tub de sticla efilat. 0 clema, manipulata manual, deschidc ~i inchidc
circuitul. lntregul dispozitiv, sterilizat la autoclav, este fixat intr-un stativ de rctorta.
Pcrmite repmiizarea in tuburi a unor volume aproximativ egale, prin comparatie cu un
tub martor in care este masurat volumul dorit. Volume egale de mediu se pot repartiza
semiautomat daca la dispozitivul cu palnie se adauga 0 seringa, dar asepsia nu poate fi
garantata, deci dispozitivul nu se folose~te la repmiitia mediilor care nu se mai pot stcriliza
inainte de utilizare.
Pentru reparti~area unar volume exacte de mediu folosim pipete aqionate prin
propipeta electrica. In laboratoarele mari sunt indicate aparate alltomate de repartizat
care functioneaza cu pompa peristaltica sau cu pompa tip seringa aqionate prin pedala,
manual sau electric.
Mediile de cultura care, dupa preparare, nu mai suporta sterilizarea trebuie
repartizate in boxa de protectie microbiologica cu flux de aer laminar (fig. 2-7). in lipsa
acesteia este utila 0 boxa pentru siguranta antiepidemica de clasa II (fig. 2-15) in care
suprafata de lucru este scaldata cu aer steri!.
Galeri Cll capac telescopat, din otel inoxidabil, prevazute cu coroana de arificii.
care pot fi inchise ~i deschise, prin rotirea capacului, pentru a permite evacuarea acrului
~i accesul aburului la materiale. Trebuie sa aiba dimensiuni ~i fonml corespunzatoare
autoclavelor din sectorul de spalare a sticlariei; sunt folosite pentru colectarea materialelor
contaminate de la fiecare loc de lucru.
47
Saci din material plastic rezistent sunt folositi pentru colectarea ~itransportul catre
autoclav ~i, subsecvent, la incinerator, a materialelor de unidi folosinta contaminate.
Ace~ti saci vor fi evident marcati: "Materialul de laborator contaminat. Pericol de infcqie".
Vor avea 0 anumita culoare penh'u a nu fi confundati cu sacii In care se transporta halatele
murdare ale personalului de laborator.
Borcane eu solutie dezinfectanta pentru colectarea varfurilor de propipetii
reutilizabile, lame ~i lamele de microscop sau alte articole mici de unica folosintii trebuie
previizute pentlLl fiecare loc de lucm.
se poate recurge la flacoane farmaceutice cu gura larga ~i capac in~urubat, borcane din
s:icla cu volum de 200--400 mL ~i capac in~urubat sau aplicat (mai putin sigur).
Pipete Pasteur. Furnizorii industriali ofera pipete Pasteur din sticla sau poli-
;Jropilena, scurte ~i lungi, cu calibrul de 6-7 mm. Se sterilizeaza, ca ~i pipetele gradate,
ambalate in cutii de aluminiu.
Pipetele gradate din sticla cu capacitate de I, 2, 5, 10 ~i 25 mL se folosesc inchise
cu vata nehidrofiHi la extremitatea de suctiune, pentru a preveni contaminarea fluidului
pipetat cu microbi din propipeta. Eventualele mustati de vata din afara orificiului trebuie
arse in flacara inainte de a adapta pipeta la propipeta, altfel adaptarea nu este etan~a ~i se
pierde din continutul pipetei, cu risc de erori ~i contaminari.
Foarte convenabile sunt pipetele gradate din polipropilena.
Propipetele. In laboratorul de microbiologie aspirarea cu gura a fluidului in pi pete
este interzisa. Pipetarea se face numai cu propipete. Cea mai simpla propipeta este 0
para de cauciuc adaptata la extremitatea de suqiune. Pipetari mai exacte ~i mai comode
pemlite 0 para de cauciuc prevazuta cu supape sau diferite tipuri de propipete automate
eu volum reglabil, la care se adapteaza pipete gradate sau varfuri dispozabile din plastic.
Lame !ji la17lelede microscop. Pentru necesitatile microscopiei, in microbiologie
sunt suficiente lamele cu margini simple, mai ieftine dedit cele cu margini polisate.
Reamintim ca obiectivele putemice sunt corectate numai pentru lamele cu grosimea de
0,17 mm (- Nr. Vz ), care sunt livrate in cutiute cu 100 bucati.
Pentru colOJ'atpreparatele microscopice folosim:
stative din sarnu] ane,yate la tiivi l7letalice el71ailate;
cutii pentru biii de colorant, Borrel pentru colorat 0 singura lama, Laveran pentILl
colm'at simultan 3 lame, Coplin pentru mai muIte lame.
Stative !ji pmzere. Pentru tuburi ~i flacoanele cu medii de cultura sunt indicate stative
autoclavabile din propilena sau metal acoperit cu propilena, care reduc riscul spargerii
eprubetelor, un dezavantaj al stativelor din metal. Stativele din lemn sunt neigienice,
dificil de decontaminat.
Co~urile din sarma sunt riscante pentru incubarea ~i transportul eprubetelor cu
culturi: riscul spargerii ~i al scurgerii lichidului. Pentru eprubete sunt mai convenabile
cutii din propilena, iar pentru flacoane tavi din aluminiu dimensionate pentru 10-100
flacoane, dupa marimea lor. Co~urile din sanna raman rezervate numai recipiente cu
material neinfeqios.
49
Find de 1llSClinlill!areeste confectionat din sarma inoxidabila, de platina sau crom-
nichel, cu grosime in functie de consistenta materialului microbian manipulat. Este fixat
intr-un pOli-fir din metal, care trebuie tinut perfect curat prin frecarea periodica, u~oara,
cu ~mirghel fin a extremitatii inferioare pentru indepartarea materialului carbonizat. Port-
firul din sticla este contraindicat. Find drept (perfect drept) se utilizeaza pentru insa-
mantari prin intepare, ansa (firul buclat la 0 extremitate) pentru insamfmtarea in medii
lichide ~i pentru epuizarea inoculului in striuri pe suprafata medii lor solide, iar fint!
spatulat pentru manipularea coloniilor microbiene cu consistenta ferma (fig. 2-8).
Etaloml de inocul este 0 bagheta din sticla cu diametrul de 3-4 mm, cudata in L
prin incalzire in flacara, la cca 36 mm de extremitate. Folose~te pentru cuantificarea
bacteriilor prin dispersia unifonna, pe placa cu mediu de cultura agarizat, a unui volum dat
de inoculum.
Becuri de gaz
Becul Teclu of era 0 flacara cu temperaturi intre 400-1 OOOC in funqie de aerarea
reglata prin in~urubarea sau de~urubarea placi metalice de la extremitatea inferioara,
tronconica a tubului arzator .
Bead Bunsen ofera 0 flacara cu temperaturi de 700-1000C, functie de aerare,
care se face, la presiunea atmosferica, prin doua orificii diametral opuse la partea
inferioara, cilindrica, a arzatorului
reglate printr-un man~on metalic
rotativ .
Beat! Mecker ofera 0 tlacara
-1::-0 mai mare ~imai fierbinte: de la 700
: la 1200C cand aerarea se face la
~<s.0
.J~~ presiunea atmosferica, prin coroana
~o
~<s. de orificii de la baza cil indrica a
~r.$'
t? i-,Q,
arzatorului sau 1700C cand arderea
..f0rci se intretine cu aer comprimat.
Alte articole de dimensiuni
mici necesare locului de lucru al
~ microbiologului. Pensa de disectie,
Port- Porr-
~{\So 1.'5\1.' (o\\brofa bisturiul, foarfecele pot fi rinute la
fir fir \le \.In mondren
dispozitie i111preunacu ansele intr-
un pahar conic. Tampoane de vata,
similare celor pentru prelevarea
exsudatelor de pe suprafere, sunt
necesare la etalarea inoculului
pentru antibiogra111a difuzimetrica.
Tije port-tampon din le111n(baghete)
sterilizate in cutii de aluminiu sunt
utile pentru manipularea probelor de
Sparula Fir Ansa
sputa. Bucati de panza pentru dezin-
drept fectia curenta a suprafetelor sau
Fig. 2-8. Fire de insamantare ~i modul de calibrare a dupa scurgeri accidentale de mate-
ansei bacteriologice. rial infectios.
50
2.6. REGULI DE COMPORTARE IN LABORATORUL
DE ~nCROBIOLOGIE: REGIMUL ANTlEPIDEMIC, PROTECTIA
MUNCH, PREVENIREA SI STlNGEREA INCENDHLOR
51
Tabelul 2-2 (eontinuare)
Numai eand
cand
De individual:
Grup NumaiIndividual: exista
exista
Rise
la inoeulare mare rise
la manipularea
panarise
Omsk, de
de
Virusurileaerosoli:
aerosoli
Coxiella
Virusul
laeulturilor:
identifieare:
materialelor
Riekettsii
Lassa,
Virusul eoneentrare
sau
CML
Francisella
eu seMachupo
bumeti
(tifos.
Burkholderia
Ebola,
febrelor de
manipuleaza
fUlarensis
spori
febre
hepatitei material
infeetan!i
patate) tulpini
(sol.
pselldo1llal/ei
Exemple
hemoragiee:
B. C Junin. euliura Congo-Crimeea.
Marburg,
mare Baeilii
Gonoeoc tubereulozei
rezistente
formelor la antibiotiee:
filal11entoase):
infeqios, eneefalitei
Virusul manipularea Yersinia
fungi
rusedede pestis
dil110rfi
eulturi in eantita!i mari
primiivara-vara
Tabe11l12-3
Doze illfectioase pelltru 25-50% din voluntari
(dupa W. L BARKLEY ~i A. G. WEDUM, 1977)
Boala sau mierobul 57
105
300
180
10~
I10
O~ Doze*
Calea lnhalare
Intradennie
de piitrundere
lngestie
I
52
Tobellil 2-4
lIt:i:Jm:gu1 numiirului de particule viabile din e~antioane de aer prelevate in cursul unor proceduri de
laborator sau accidente generatoare de aerosoli
omo-
culturi
in
bumbac
ml
cultura
placa
capacul inoculului
Procedura
cu
insuficient
unei
de
0-5,5de 0-35
77-1246
50 ml
genizator
Decantarea
Introducerea
dopului
pe 30 Procedura
Rangul
culturii
ansei
Spargerea fierbinti 6-24
0-115
80-ISDD
0-20
0,8-5,0
centrifugate
in strans
m1 cultura
100 a unui
in centrifuga Agitarea
tub
:0:::-_"c'd de 50 ml
53
Nivelurile 1 $i 2: laboratoarele de baza in care se
manipuleaza microorganisme cu risc de gradul I ~i 11.
Exigentele privind constructia, instalatiile, mobilierul $i
echipamentul sunt cele prezentate mai sus (revezi 2.3-2.5).
Siguranta antiepidemica este asigurata daca in aceste
conditii de dotare ~i facilitati se utilizeaza 0 bwu[ tehnidl
microbiologica, iar intrarea in toate spatiile cu risc bio-
BIOHAZARD logic este corect marcata (fig. 2-9).
Fig. 2-9. Indicatorul internatio- Nivelul 3: laboratoarele cu regim restrictiv, in care
nal pentru risc biologic.
se manipuleaza microorganisme cu risc de gradul II I.
Exigente:
controlul strict al comunicarii incaperilor, nu se admit tavane false ~i alte comu-
nicari intre incaperi decat prin u~a care poate fi zavonlta;
ventilatie in sens unic cu presiune negativa in camerele de lucru ~ifiltrarea aerului
extras din incaperi;
manipularea microorganismelor numai in boxe de siguranta din clasa I sau II
contra aerosolilor;
semnalarea riscului biologic la intrarea incaperilor ~i acces restrictiv in lncaperi.
Nivelul 4: laboratoarele cu regim de maxima restrictie, in care se manipuleaza
microorganisme cu risc de gradul IV, functioneaza In regim de exigenta speciala care
depa~e~te scopurile acestei carti.
54
Alcool2,Scm
peste nlsip
Nisip
Fig. 2-10. Flacon cu alcool ~i nisip Fig. 2-11. Bec Bunsen previizut cu
pentru desciircarea ansei inainte de man~on din tablii inoxidabilii, care
sterilizarea prin ardere la ro~u. previne, la sterilizarea ansei, imprii~-
tierea de particule contaminate.
Garnirura
etcn~
2,5 cm In
recipient
5% fenol
Flacm de sticla
Recipient metalic
Fig. 2-12. Vase pentru decantarea supernatantului dupii centrifugarea tluidelor cu risc infecrios.
55
10) Verifica daca omogenizatoarele folosite nu elimina aerosoli in cursul funqio-
narii. Efectueaza toate omogenizarile, inclusiv cele in mojar sau in tub Griffith, pe un
patrat 40/40 cm din hartie de filtru imbibata cu solutie dezinfectanta (vezi 3.2.2).
11) Asigura penn anent la locul de lucru un recipient cu solutie dezinfectanta activa
(vezi 3.3.1).
12) Dezinfecteaza mas a $i suprafetele de lucru la terminarea activitatii $i dupa
mice varsare de produs infectios sau de cate ori suspectezi 0 contaminare accidentaliL
13) La spargerea accidentala a unui recipient cu cultura sau produs patologic.
acopera locul cu 0 panza $i toama deasupra 0 solutie dezinfectanta. Lasa pe loc 30 minute.
Protejeaza mainile cu manu$i $i, folosind un carton rigid, trage resturile pe un fara$
pentru autoclavare.
14) La fiecare loc de lucru:
folose$te galeti cu capac (sau pungi fixate in galeti) pentru colectarea separata a
materialelor reuti]izabi]e $i de unica folosinta contaminate; in]ocuie$te $i autoclaveaza
zi]nic;
asigura borcane cu so]utie dezinfectanta separate pentru pipete $i mici obiecte
reuti]izabile; gole$te-]e zilnic, pentru decontaminare in continuare, $i pune solutie
dezinfectanta proaspata.
15) Nici un material contaminat dupa fo]osire nu parase$te laboratorul inainte de a
fi sterilizat.
16) Manipuleaza microorganisme]e din grupul III de risc numai daca laboratorul
este autorizat $i numai in boxe de siguranta.
17) Folose$te pentru prelevarea $itransportul probe lor numai recipiente rezistente,
de preferat incasabi]e, bine inchise.
18) Pentru expedierea prin pO$ta amba]eaza ~ieticheteaza l11aterialu]infectios con-
fOlm instruqiunilor Organizatiei Mondia]e a Sanatatii, reglel11entarilor po~tale nationale
$i intemationa]e.
Barierele secundare protejeaza persona]ul de microorganisme scapate prin
barierele primare.
1) Poarta tot til11pul activitatii ha]at, $ort $i capelina de proteqie curate, corect
incheiate $i legate. Pastreaza separat echipamentul de proteqie de hainele ~i lenjeria
pentru exterior.
La manipularea probelor provenite de la bolnavi cu hepatita sau SlDA ori care
contin alte microorganisme din grupu] III de risc, poaria $ort din materia] plastic peste
echipamentul de proteqie $i imbraca manu$i chirurgicale din cauciuc.
2) Dezbraca ~i ]asa la locu] de lucru echipamentul de protectie ori de cate ori te
deplasezi in alte zone de activitate (vestiar, birou, cantina etc.).
3) SpaJa mainile dupa manipularea materia]e]or infeqioase $i inainte de a parasi
locu] de lucru. De darit, pentru aceasta, este 0 chiuveta separata de cea de la masa de
]UCIU.
56
5 I Supune-te eontrolului medical periodic.
6) Raporteaza ~efului de laborator ~i cabinetului medical orice boala intercurenta.
?:.=.:c fi 0 infeqie profesionala.
'7) Comunica acelora~i autoritati:
sarcina, imediat dupa ce survine: poate eontraindiea manipularea anumitor
::::.::roorgamsme;
eventuale tratamente eu steroizi sau medicamente imunosupresive: pot fi 0
.::cmraindicatie pentru eontinuarea activitatii in mediul eu rise infeqios.
8) Supune-te vaceinarilor programate de eondueerea unitatii.
9) In laboratoarele unde se manipuleaza bacilii tuberculozei, personalul trebuie sa
lIe vaccinat BCG sau controlat tuberculino-pozitiv ~i supus anual controlului radiologic
prcventiv.
Barierele tertiare reunesc eehipamente ~i facilitati de proteetie suplimentara a
personalului ~i preventie a raspandirii agentilor infectio~i in afara laboratorului; boxele
de siguranta antiepidemica, eontrolul eurentilor de aer creati prin instalatii1e de ventilatie
~i incalzire, filtrele exhaustoarelor de aer, instalatiile de neutralizare a apelor reziduale.
57
Pentru 0 funqionare eficienta, in box a se
introduc nUl11ai l11aterialele strict necesare.
_ro- 30% aor ",tea,
./ ManipuHirile se fac in l11ijloculariei de lucru. Sunt
interzise surse de caldura (flacara, microinci-
~ neratoare) pentru ca perturba fluxul de aer: se
lucreaza cu anse dispozabile din material plastic.
/~ Dispersor
Mainile se scot din boxa numai dupa 2-3 minute
QJ rnmrn de la tenninarea lucrului, interval necesar aspirarii
~ I'
cl,( I I II I I
aerosolilor ~i, imediat, sunt spalate pan a la cot
avand la vedere 0 contaminare posibila in cursul
.;2 II' tti~ I
: lucrului.
i
A
I II Al11plasarea boxei de securitate microbio-
I i
logica sau antiepidemica in incaperi trebuie sa
I I I I 1
II l' i I I
\ \I:?
\ \ \\ evite curentii de aer creati prin circulatia persona-
:,dri
, '- -;!,:uu '" V
--E--~--- ~::/,,/
~ __ .J&
lului, de u~a; fereastra sau surse de incalzire.
Amanunte privind verificarea fluxului de aer,
schimbarea filtrelor ~idezinfeqia acestor boxe pot
----- Aer curat fi gasite in cartile tehnice insotitoare.
________ Aer contaminat
Este formal interzis a folosi boxa sterila ell
Fig. 2-14. Boxa de c1asa II pentro sigu-
aer laminar orizontalla manipulari de materia!
ranta antiepidemica. i1~fecrios, pentru ca .fiuxul de aer care scalda
suprafara de lucru este protector spre operator
(v. fig. 2-8).
III
Boxa de cIasa este complet inchis3. Operatorul i~i introduce mainile in aria de
lucru prin m3nu~i fixate etan~ la aparat. Aerul este admis ~i evacuat prin filtre (fig. 2-15).
58
Depozitarea substantelor inflamabile ~i combustibile se face la adapost de lumina
solara directa, in incaperi bine ventilate, amplasate departe de ie~ire, de surse de caldura,
flacara sau scantei,
in textul ca11ii toti reactivii ~i substantele cu risc la manipulare (toxic, coroziv,
inflamabil etc.) VOl' purta, intre paranteze, mentiunea "precautii".
59
2) Se interziee folosirea prizelor, ~teeherelor sau transformatoarelor eu eareasa
spmia sau a eonduetorilor improvizati ori eu izolatia alterata.
3) Se interziee folosirea triplu-~teeherelor sau prizelor multiple pentru a nu
suprainearea reteaua electrica.
4) Cordoane prelungitoare pot fi utilizate numai eu aprobarea servieiului tehnie al
spitalului.
5) Cere exeeutarea legliturii eu pamiintul pentru fieeare priza ~i folose~te pentru
coneetare numai ~teehere eu nul de proteqie. Semnaleaza serviciului tehnie, pentru
verifieare de catre electrician autorizat, orice aparat care provoaca la atingere ~oe sau
fumicaturi.
60
3) Nu desehide u~ile bruse, ei eu preeautie.
4) Cireula pe partea dreapta a euloarelor ~i searilor.
5) Nu bloc a, eu mese, ambalaje sau alte materiale, euloarele. Carueioarele pentru
materia Ie pot fi stationate numai temporar ~ipe 0 singura pmie a euloarului.
6) Observa prezenta pe du~umele a liehidelor varsate, hi'trtiilor, mueurilor de tigara,
eablurilor eleetrice ~i ia imediat masuri pentru indepartarea lor in siguranta.
Seful laboratorului este raspunzator de implementarea ~i respectarea tuturor
masurilor de proteetie antiepidemica, a altor masuri de proteetie a muncii in laborator
~i a masurilor de prevenire ~i stingere a ineendiilor. Faptul ea poate delega unor
anume subordonati sareini privind instruetajele, verificarea cuno~tintelor personalului
~i a masurilor la fiecare loe de lueru, nu 11 exonereaza de niei una din aeeste
responsabilitati.
3. STERILIZAREA, DEZINFECTIA SI SPALAREA
IN CIRCUITUL MATERIALELOR DIN
LABORATORUL DE MICROBIOLOGIE
(DUMITRU BUIUC)
3.1. STERILIZAREA
Incalzirea la ro~u este indicata pentru find drept, ansa $i spatula de insamantare.
Flambarea, adica infierbantarea obiectului de sterilizat prin trecerea repetata in flacara
timp de cateva secunde, este indicata pentru, gura eprubetelor $i flacoanelor. Tehnica
este contraindicata pentru sterilizarea obiectelor voluminoase care se incalzesc $i se
r:kesc pre a ineet pentru a fi utilizate imediat (pipete gradate etc.) sau pe care caldura
tlacarii Ie degradeaza (obieete din material plastic, 0tel etc.). ,
lncinerarea presupune arderea eu redueere la eenu$a. In laboratoarele de
microbiologie este indicata pentru materialele dispozabile din plastic, reziduuri organice
solide, gunoiul, cadavrele $i carcasele animalelor de experien!a. Metoda pune probleme
de control al poluarii mediului $i siguran!ei microbiologiee. Cei interesati pot gasi
amanunte privind exigen!ele de construe!ie, de funqionarea $i eontrolul de eficienta a
incineratoarelor din spitale (la care apeleaza uzuallaboratoarele de microbiologie c1inica)
detaliate manuale de specialitate.
Sterilizarea prin aer cald. Judicatz'i: obiecte de laborator din stiela (eprubete.
tlacoane, pipete) sau por!elan (mojare, pistile), seringi Luer din sticla, instrumental'
chirurgical, substan!e grase, pulberi tem10stabile. Contraindicatii: solutii apoase. obiecte
din eauciue sau cu gamituri din cauciuc, seringi din sticla cu metal, tesiituri $i vata din
bumbac sau fibra sintetidi, materiale contaminate din laborator.
Sterilizarea prin aer cald se realizeaza in etuva la 160-l80C timp de 0 ora. Timpul
de sterilizare ere$te peste 0 ora in eazul ambalajelor voluminoase sau obiectelor $i
substan!elor care se incalzesc greu (tabelul 3-1).
rohellil 3- I
Parametrii sterilizi'irii prin aer cald ~i prin vapori de apa sub presiune
I i8
a25
de
60
35-45
25-3018
120-150
50
70
75
20-25 18microbilor
18omorare
25 de egalizare Timpul
17-27
25
45
2-7
7-12
95-125
0 35
50
Timpul'
II ~i volumul
Materialul
volum alopera!iei2
Timpul' in
totalcare este supus
mult
Idem
Ulei de
Soiutii inredus
recipientului)
In
vol.apoase
10
fiole
(maximum permL
dea 10
pima
ambalaje cutie.
I (maximum
la
85% in20eprubete
mlvolumul
voluminoase;
din din volumul
75-80%pulberi in cutii
recipientului)
63
Etuva este 0 incinta cilindrica sau paralelipipedica eu pereti dubli, din tabla.
termoizolanti. Rezistente electriee ~i un termostat permit mentinerea constanta a
temperaturii selectate, unifonnizata in incinta de sterilizare printr-un sistem de ventilatie.
Obiectele de sterilizat se a~eaza in etuva pe rafturi din sita metalica.
Procedura:
1) A~eaza obiectele pregatite pentm sterilizare (vezi mai jos) pe rafturi, tara a
umple incinta la refuz ~irespectand mici spatii inh'e ambalaje pentm circulatia nestanjenita
a aemlui cald.
2) Inchide u~a aparatului, desehide orificiile de ventilatie ~i conecteaza aparatul Ia
reteaua elech'ica. Etuvele mari au ventilator eu palete, care porne~te 0 data cu rezistentele
electrice.
3) Marcheaza timpul de sterilizare (confom1 tabelului 3-1) din momentul In care
tern10metml indica 160-180C,
4) Scoate obiectele sterilizate numai dupa racirea aparatului.
Exista etuve automate cu afi~area continua a parametrilor sterilizarii.
3.1.2.1. Sterilizari la peste 1OOe. Utilizam autoclave in care vapOlii de apa saturati
realizeaza 115C la 0,5 atmosfere, 121C la 0 atmosfera ~i 134C la 2 atmosfere. Prezenta
aemlui compromite sterilizarea: vaporii de apa, mai u~ori, incalzesc partea superioara a
incintei, iar aeml, mai greu, ramane in partea inferioara cu temperaturi insuficiente penn'u
sterilizare. Parametrii sterilizarii la autoclav sunt prezentati in tabelul 3-1.
~~
laborator contaminat. lntrodu flacoanele cu Valva de siguran,fci
capacul semiin~urubat, casoletele cu orifi-
.~ - (/ """11I::._,
65
Valva de siguranta sterilizare, de sus in jos, dupa ce au
trecut prin mantaua de abur ~i au
Incalzit-o (fig. 3-2). In acest autoclav
Valva de gasim unnatoarele accesorii In plus
evacuare
fata de autocIavul cu perete simplu: 0
a aerului
->1" I' \ i
nlor ~
!?i vapo- (\
Mano-
metru
S?
i~
;jAb~J"
r\,' ((CAME~"
I I
palnie de alimentare ~i 0 niveUi pentru
controlul apei din sursa de vapori.
robinete care pun in comunicare sursa
de vapori cu aceste piese, un robinet
I ~ i' I
A\\~I::i de evacuare a aburului ~i un robinet
, \; It 'I'I,'j
I '1
I I
I :: ' ~
r , III
I
::
I
1 prin care se elimina apa de condens
acumulata In partea decliva a incintei
I : I I I
II ,: Aer ; I de sterilizare.
Nivela
Proeedura:
1) Deschide robinetele piUniei
de alimentare cu apa ~i ale nivelei.
2) Toama apa distilata in rezer-
VOl' pana la marca indkata pe nivela.
3) A~eaza in incinta de steri-
lizare materialele in ambalajele lor.
4) Inchide etan~ capacul cazanului.
5) Conecteaza sursa la caldura.
6) Deschide robinetul pentru evacuarea aerului ~i inchide toate celelalte robinete
ale aparatului.
Pelltru sterilizarea solutWor procedeaza in continuare ca la autocIavul cu perete
simplu, etapele 5-9. In acest caz nu operezi deloc nici cu robinetul de evacuare a aburului,
nici cu cel de evacuare a condensului (raman inchise).
Pentru sterilizarea materialelor ehirurgieale, seringilor, sticlariei eu destinatie
speeialii, dupa epuizarea timpului de sterilizare:
- intrerupe sursa de caldura,
- deschide robinetul de evacuare a aburului ~i, cfmd presiunea a coborat la 0,5
atmosfere,
- deschide robinetul pentru evacuarea condensului, iar cand presiunea a coborat
la zero,
- deschide capacul autoclavului,
- scoate casoletele ~i Inchide orificiile numai dupa ce s-au racit in autoclav. In caz
contrar, prin racire In exterior, pana la 0 treil1le din volul1lullor va absorbi aer atl1losferic
contaminat.
Autoclavul orizolltal eu evaeuare gravitationala a aerului poate fi cilindric sau
rectangular. U~a se Inchide cu sistem cabestan (fig. 3-3).
Vaporii proveniti din sursa exterioara cu mare presiune trec spre manta ~i incinta
de sterilizare printr-un regulator de presiune.
66
Filtru
Termo -
metru
y'l,," non-relur
Fig. 3-3. Autoclavul orizontal eu evaeuare gravitationala a aburului.
67
5) La epuizarea timpului de sterilizare: opre~te accesul vaporilor in incinta de
sterilizare, dar continua circularea lor prin manta.
La sterilizarea sohl{iilor: lasa presiunea sa scada pana la zero In incinta de sterilizare.
Pierderea de caldura prin u~a Taramanta a autoclavu1ui realizeaza scaderea presiunii in
10-30 minute, in raport cu volumele de lichid sterilizate. La volume mari de medii agarizate
scaderea presiunii poate dura mai mult de 0 ora, ceea ce poate degrada mediile termo-
sensibi1e. Autoc1avele modeme sunt prevazute cu sisteme de racire a flacoanclor tara
fierbere exploziva. In lipsa acestora, la sfar~itu1 operatiunii racirea poate fa grabita prin
deschiderea foarte lenta a valvei de evacuare a incintei.
La sterilizarea materialelor chirurgicale ~i seringilor:
- Scaderea presiunii in incinta de sterilizare este provocata prin deschiderea
imediata a valvei de evacuare. Uscarea poate fi grabita prin aqionarea sistemului de
vacuum.
- Deschiderea autoc1avului se face numai dupa ruperea vidului din incinta de
sterilizare prin deschiderea valvei de acces a aerului filtrat. Casoletele trebuie sa se
raceasca in autoc1av aproape de temperatura camerei.
Protecfia operatorului.
1) Nu deschide capacul autoc1avului inainte de coborarea presiunii la zero ~i
deschiderea 1enta a robinetului de evacuare a incintei. Volume1e mari de solutii pot avea
Inca pese lOODC~i 1a contactul cu aeru11a presiunea atmosferica pot exploda.
2) Pentru deschiderea capacului, echipeaza-te cu manu~i protectoare tem10izolante
~i protejeaza fata cu un vizor care acopera de asemenea pielea gatu1ui ~i pieptul.
Autoclave1e modeme, incalzite prin rezistente electrice, sunt programate
semi automat sau automat. Pot fi prevazute cu sonda ten110electrica ~isistem de inregistrare
continua a parametrilor sterilizarii.
3.1.3. Filtrarea
Filtrarea este trecerea unui fluid printr-un corp poras, filtru. Filtrele Cll porozitiiti
convenabi1e pot debarasa de microorganisme fluidu1 filtrat, acestea fiind retinute mecanic
~i electrostatic in porii filUll1ui. Metoda este indicata pentru decontaminarea bacteriana
68
;;i fungidi a aerului, a unor medii de cultura pentru microorganisme, reactivi care nu
suporta incalziri. Filtre]e c]asice, confectionate din porte]an sau pamant de infuzorii ori
sticla poroasa (filtre Schott) sunt astazi in]ocuite prin membrane filtrante din acetat de
celuloza cu porozitati intre ] ;;i 0,025 mm. 0 membrana cu porozitatea de 0,22 mm
retine toate bacterii]e.
Pentru utilizare, membrane]e filtrante sunt fixate pe un supOli perforat din ote!
inoxidabi] ;;i montate intre partea superioara ;;i eea inferioara a unei pa]nii adaptate la
sistemu] de filtrare prin presiune negativa sau pozitiva. Membrana impreuna cu palnia
montate ]a recipientu] de co]ectare a fluidu]ui filtrat sunt sterilizate in prea]abi] ]a autoclav.
Filtre]e mici pot fi adaptate ]a seringi (filtrare prin presiune pozitiva) sau la un tub de
centrifuga (filtrare gravitationaHi). Pentru a evita co]matarea porilor, suspensiile cu mare
densitate a particu]e]or sunt prefiltrate printr-un materia] fibros sau granular.
Filtrele HEPA (High Efficiency Particulate Air Filters) sunt fo]osite pentru
sterilizarea aerului in boxe]e de siguranta antiepidemica, a ee]or cu aer laminar etc.
wmpile gennicide sunt tuburi din stic1a specia]a in care descareari]e e]ectriee 1ntr-o
atmosfera cu vapori de mercur la joasa presiune genereaza radiatii uv. Aproximativ
95% din radiatia lampi]or cu vapori de mercur ]a joasa presiune are ]ungimea de undii
gennicida de 253,7 nm. La aceasta se adaugii un mic pro cent de radiatie cu lungimea de
unda de 184,9 nm produeiitoare de ozon cu efect de asemenea germieid. Cantitatea de
ozon produsa de lampile germicide utilizate in spitale ;;i laboratoare nu depa;;e~te
eoncentratia periculoasa de 0 parte la 10 milioane ;;i seade progresiv cu varsta lampii.
La alegerea intensitatii lampilor ;;i a timpului necesar de expunere trebuie tinut
cont ca intensitatea radiatiei UV variaza invers proportional cu piitratul distantei de la
sursa.
Viata de funqionare a lampilor gem1ieide uzua]e este de 100 de ore, dar scade mai
repede dupa aprinderi freevente. Cand intensitatea radiatiei UV produse scade sub 60(/,,0
din cea nominala (dupa cea 3/4 din timpul prevazut), lampi]e trebuie sehimbate. Lampi
speciale cu catod rece au 0 viata mai lunga.
Pentru a ]e mentine efectu] gem1icid maxima], lampile trebuie periodic euratate
prin ;;tergere cu 0 carpa moale umezita in alcoo] sau amoniac ;;i apa.
In laboratorul de microbiologie, radiatiile UV fac parte din sistemu] barierelor
secundare antiepidemice. Cum inhalarea este 0 modalitate frecventa de transmitere a
infectiilor de laborator, instal area de ]ampi gennicide este indicata pentru:
Reducerea incarcaturii microbiene a spatiilor de ]ucm. Lampi gem1icide sunt
montate la partea superioara a peretilor ~i, separate de incapere prin ecran opac.
functioneaza pe durata activitatii. Sistemu] de conditionare a aeru]ui asigura trecerea
pem1anenta a microbilor din aer prin raza de actiune a lampilor.
Constituirea unei bariere protectoare intre aria cu anima]e inoculate, boxe]e de
necropsie etc., ;;i personalul de laborator sau animale sanatoase.
Laboratoarele care nu dispun de boxe cu aer laminar sau boxe pentru siguranta
antiepidemica pot folosi, pentru repartizarea medii]or de cu]tura sau alte manipu]ari
aseptice, boxe sau hote cu aerul ;;i suprafete]e sterilizate prin radiatii Uv.
69
3.1.5. Controlul eficientei sterilizarii
Tuburi cu indicatori chimici sau biologici se plaseaza la diferite nivele ale ineintei
de sterilizare, in eentrul ambalajului. Uzual, sterilizarea fiecarui lot de l11aterialese testeaza
prin indicatori fizici ~i chimici, iar saptamanal aparatele sunt verificate prin indicatori
biologici.
3.2. DEZINFECTIA
70
antiseptice, daca toxicitatea mai redusa permite aplicarea lor pe tegument, unele mucoase
sau phlgi. Dneori, aceea~i substanta (e.g., cloramina B) in solutii diluate este antiseptic,
iar in solutii mai concentrate dezinfectant.
Agentii chimici de dezinfectie difera prin eficienta antimicrobiana, activitatea in
prezenta substantelor organ ice ~itoxicitate. Cele mai sensibile la substantele dezinfectante
sunt organismele in fonna vegetativa (bacterii, fungi, protozoare) ~i virusurile cu inveli~
lipidic; relativ rezistente sunt micobacteriile ~i virusurile nude, iar endosporii bacterieni
~i multi dintre sporii fungici sunt foarte rezistenti (tabelul 3-3).
Tabel1l13-3
amoniu cuatemar
71
Necesitatea testeJor de eficienta a dezinfectanteJor
Testari efectuate de produceitor ~i de laboratoarele de referin{a atesta capacitatea
antimicrobiana a dezinfeetantelor ~i stabilitatea soIutiilor.
Coeficientul fenolic arata cu cat este mai activ un compus fenoIie in comparatie eu
fenolul pur. Testul Rideal- Walker detennina coeficientuI fenolie eu substante pure, iar
testul Chick-Martin iI detennina in prezenta de substanta organiea. Coefieientul fenolie
se exprima printr-o cifra unnata de initialele R. W. sau C. M., care precizeaza eonditiiJe
de testare. Substantele cu coefieienti fenolici mai mari au efeet antimicrobian mai mare.
CoeficientuI fenolic C. M. este mai mic decat ceI R. W. din eauza testarii in prezenta de
substanta organica.
Testul de capacitate fll utilizarea Kelsey-Sykes este mai adecvat diversitatii actuale
a substantelor dezinfectante. TestuI reproduce circumstantele de utilizare "curat" ~i
"murdar" prin adaugarea Ia dilutiile testate de substanta organica. Testul Kelsey-Sykes
precizeaza coneentratiile de dezinfectant indicate pentru situatiile "eurat" sau "murdar".
Amanuntele privind testarea depa$ese scopurile acestui capitol. Cei interesati pot consulta
lucrari de referinta cum ar fi KELSEY ~i MAURER (I974) sau excelenta sinteza a lui
POLl ~i colab. (1979).
Testarea dezi'~fectantelor III cOlldifiile de utilizare revine fiecarui laborator ~i se
impune ca test periodic.
Principiu: Prezenta unui numar redus de microorganisme viabile in solutia unui
dezinfectant este posibila, depa~irea unei anumite limite indica insa defieienta in
prepararea, manipularea sau conservarea soIutiei.
Necesar:
- pipete gradate de 1 mL sterile,
- flacoane de 25 mL sterile eu capac in~urubat,
- diluant neutralizant (tabelul 3-4),
- propipeta de 20 mL
- plaei eu agar nutritiv.
Ti:lbelllI3-4
Procedura:
1) Preleva aseptic 1 mL solutie dezinfectanta din fiecare bore an sau galeata folosind
pipete separate. Prelevarile se fac din containerele cu solutii stoe diluate pentru utilizare,
borcanele ~i containerele cu echipament contaminat (pipete, lame de microseop,
instrumente etc.), galetile eu carpa sau peria pentru du~umeIe etc.
72
2) Transvazeaza fiecare proM de 1 mL solutie dezinfectanHi in dite un recipient cu
9 ml diluat neutralizant, marcat pentru identificarea probei, ~i omogenizeaza.
3) ]n interval de cel mult 0 ora dupa omogenizarea probe lor de dezinfectant, preleva
eu pipete Pasteur separate un mie volum din fiecare amestec dezinfectant-diluant
neutralizant ~i insamanteaza, in spotun separate, cate 0,2 mL pe suprafata bine uscata a
doua placi cu agar nutritiv.
4) Incubeaza cele doua pliici astfel:
Una timp de trei zile la 32 sau 37C. Bacteriile patogene cultiva optimla 37C,
dar celor afectate prin dezinfectant Ie poate fi mai convenabila temperatura de 32C.
A doua timp de 7 zile la temperatura camerei pentru cultivarea bacteriilor saprofite
~i a fungilor.
5) Numara coloniile dezvoltate pe spoturile de insamantare.
Inte Ip retare:
Numaru Illllcroorgamsme
. Ior / m I = NxD, _ ,
solutie dezinfectanta Volumul msamantat
unde: N = numar de colonii;
D = factorul de dilutie (inversul dilutiei);
Volumul insamantat = 0,2 mL.
Deei, dacii am numarat 6 colonii, in solutia dezinfeetanta verificata au fost
6x 10= 300 mieroorganisme viabile / mL. Peste 250 mieroorganisme viabile / mL indica
0,2
o solutie dezinfectanta ineficienta.
Protectia personalului. Multe dezinfectante sunt iritante pentru oehi, caile
respiratorii, piele. La manipularea substantelor stoe pentru prepararea solutiilor, operatorul
va purta, dupa caz, manu~i ~i ochelari de protectie.
73
COlltrailldicafii: Corodeaza metalele. Nu se aplica pe suprafe!ele metalice ale
centrifugelor ~i aparaturii supusa la solicitiiri mecanice.
Precau!ii: Efecte iritante, functie de concentratie, asupra pielii, ochilor, cailor
respiratorii.
Derivati fenolici. Efectul gennicid se limiteaza la bacterii In fonna vegetativa
(inclusiv micobacterii) ~i fungi, nu este afectat de proteine, dar eficienta scade pe
suprafetele de cauciuc, lemn sau material plastic. Sunt ineficienti asupra sporilor ~i
virusurilor nude.
Indicafii: Dezinfectia suprafetelor, borcane pentru pipete ~i echipament mic
contaminat. Solutiile 1% sunt indicate pentru circumstante "curate", cele 2-5% pentru
circumstan!e "murdare". Solutiile se schimba la 24 ore.
Precaufii: Efect iritant posibil asupra ochilor ~i pielii.
Formaldehida este un gaz foarte iritant, stabil numai la temperaturi peste 80C; la
temperatura camerei polimerizeazii repede ~i formeazii pe suprafete un depozit atb. Se
comercializeaza sub doua fonne:
parafonnaldehida, polimer solid, alb, cu miros u~or intepiitor din cauza degajarii
de formaldehida;
formolul, solutie apoasii 37-48% de formaldehida stabilizata cu 8-15% metanol
contra polimerizarii la temperaturi mai joase.
Efectul germicid putemic se extinde asupra tuturor microorganismelor, Tara a fi
inactivat de proteine sau detergenti.
Forme de uti/hare ~i illdicafii:
I) Forma gazoasa este indicata pentru dezinfectia suprafetelor, echipamentului ~i
efectelor care nu pot fi udate. Principala indica!ie in laboratorul de microbiologie este
dezinfectia periodicii a boxelor de securitate microbiologica.
Are efect antimicrobian mai putemic la temperaturi peste 20C ~i umiditate mai
mare de 60% (optimii 80-90%). Se obtine prin incalzirea fonnolului (un volum formol +
2 volume apii In fierbiitor electric) sau parafonnaldehidei (pe re~ou electric). Concentratii
maxime de 2 g fomlaldehida per m3 se obtin, la 20C, dar suficienta pentru dezinfectie
este concentratia de 0,05 g/m3 Pentru dezinfectia unei boxe de securitate microbiologica
(cca 0,3-0,4 m3) sunt suficienti 25 ml fonnoI sau 3-4 g paraformaldehida, iar pentru
ind'iperi 15 ml fonnol/m3 aer.
Penetrabilitatea fomlei gazoase este redusa, ca atare suprafe!eIe supuse dezinfectiei
trebuie bine etalate. Fonnaldehida fiind foarte iritantii, boxeIe pentru dezinfeqie vor fi
inchise etan~. ParafomlaIdehida depusa pe suprafe!ele dezinfectante emite timp indelungat
vapori iritanti, ceea ce impune fie aerisirea prelungitii, fie neutraIizarea paraf01111aldehidei
prin vapori de amoniac.
2) Solzqii cu 4% formaIdehidii (fonnol diIuat I110) sau mai concentrate (pana ]a
10%) sunt indicate pentru dezinfectia suprafeteIor sau culturilor microbiene. Solutii1e
0,04- 1% sunt foIosite pentru inactivarea suspensiilor bacteriene aglutinabile.
Glutaraldehida are efect alltimicrobian foarte bun (inclusiv asupra virusurilor
hepatitei B, C), neinfluentat de proteine. Se utilizeaza in concentratii de 2% activata in
solutie alcalina (tamponatii cu bicarbonat de sodiu lapH 7,5-8,5). Este indicata pentru
dezinfectia suprafeteIor metal ice pe care nu Ie corodeaza. De~i este mai put in iritanta
decat fomlaIdehida, contactul cu pielea ~i conjunctivita trebuie prevenit.
74
Detergentii cationici sunt compu~i de amoniu cuatemar activi asupra bacteriilor
(mai ales gram-pozitive), mai putin asupra fungi lor ~i inactivi asupra micobacteriilor ~i
sporilor. Sunt inactivati de proteine, alte sub stante organice, mase plastice, detergenti
anionici ~i sapunuri. Solutii apoase 1-2% sunt larg utilizate pentru spalarea (agenti
tensioactivi de udare ~i spumanti) ~i dezinfectia suprafetelor. Nu corodeaza metalele, nu
sunt toxici, nici iritanti.
Alcoolii utilizati pentru dezinfectie sunt etanolul ~i propanolul in solutii apoase
70-80%. Au efect antimicrobian relativ lent ~isunt ineficienti asupra fungilor ~i sporilor.
Nu sunt inactivati de proteine sau detergenti, iar activitatea antimicrobiana cre~te mult
prin asociere cu hipoeloriti (la concentratie finala de 2.000 ppm elor activ) sau cu formol
(10% formol in alcool 70%). EvWi contactul direct al tegumentului cu asemenea solutii.
Protejeaza-te cu manu~i de cauciuc.
Sunt utilizati ca atare, mai bine in amestec cu hipoeloriti sau formol, pentru
dezinfectia suprafetelor ~ipentru echilibrarea cupelor de centrifuga. A1coolii sunt iritanti
pentru conjunctiva, dar nu afecteaza pie lea nom1ala.
Iodoforii (iodo = iod; phor = purtator; purtator de iod) sunt detergenti neionici din
clasa propilenglicolilor, care complexeaza iodul ~i, in solutii apoase, 11elibereaza lent Cll
efecte germicide asupra bacteriilor (inelusiv micobacteriile), fungilor, sporilor ~i
virusurilor cu inveli~ lipidic sau nude. Sunt fnsa inactivati de proteine ~i alte substante
organice, mase plastice ~i detergenti anionici. In solutii apoase eu 75-150 ppm iod pot fi
utilizati in borcanele pentru pipete ~i eehipament contaminat, pentru dezinfeqia supra-
fetelor, iar solutiile in 50% alcool cu 1 600 ppm iod au efecte sporocide ~i sunt utilizate
penu'U antiseptizarea mainilor. Petele Eisate de iodofori pe piele ~i suprafetele sunt u~or
fndepartate cu 0 solutie de tiosulfat de sodiu.
La manipularea iodoforilor trebuie evitat contactul cu conjunctiva.
Galeti Cll capac pentru colectarea recipientelor cu culturi sau resturi de prelevate
patologice. Trebuie sa fie lipsite de fisuri sau gauri pentru a se evita scurgeri contaminante
periculoase. Sigure sunt galetile din otel inoxidabil sau din plastic rezistent la autoclavare
(polipropilena). Nu trebuie sa fie mai adanci de 25 cm, pentru a pem1ite 0 buna penetrare
a vaporilor de apa, iar diametrul corespunziitor unei manipulari facile in autoclav.
Niciodata nu se vor umple pana la refuz.
75
Pungile din plastic autoclavabil este de dorit sa dubleze interiorul galetilor. Trebuie
sa fie rezistente ~i manipulate atent pentru a evita spargerea sau ruperea. Legate la gura
eu sanna, VOl' fi transportate in camera de sortare impreuna cu galeata suport. Galetile ~i
pungile colectoare trebuie marcate distinct pentru materialul reutilizabil ~i pentru cel
dispozabil.
Boreanele en solntie dezinfeetanta stau pe masa de lucru pentru colectarea
echipamentului mic contaminat ~i, separat, a pipetelor contaminate. Prea frecvent sunt
alese ~i manipulate incorect.
Alegerea borcanelor. Cele din sticla sunt casabile ~i, ca atare, periculoase. De
preferat sunt recipientele rezistente din polipropilena. Pentru echipamentul mic convin
borcane de llitru cu capac in~urubat (permite in final inclinari repetate, pentru imersarea
completa a articolelor supuse dezinfectiei). Borcanele inalte trebuie sa permita imersarea
completa a pipetelor tara riscul scurgerilor contaminante.
Umplerea Cll solllfie dezinfectantii. Borcanele pentru echipamentul mic VOl' fi
marcate cu vopsea la nivelul de 750 mL. eu 0 mensura se introduce in borc::mdezinfectant
in cantitate suficienta sa asigure concentratia recomandata pentru "circumstanta murdar"
dupa completarea volumului la 750 mL cu diluant.
La fel se procedeaza ~i cu borcanele pentru pipete, tinand cont de volumul lor.
Adaugarea unui detergent compatibil cu dezinfectantul utilizat (tabelul 3-3) u~ureaza
spalarea final a a pipetelor.
Utilizarea corectii a solufiilor dezinfectante
1) Nu supraincarca, pentru a evita scurgeri contaminante la mobilizarea borcanului.
2) Nu introduce obiecte care plutesc decat dad pot fi umplute ~i imersate complet
sau daca borcanul are capac ~i poate fi inclinat repetat.
3) Nu introduce materiale cu continut proteic mare, ci colecteaza-Ie separat pentru
autoclavare directa.
4) Nu dilua dezinfectantul prin scurgeri de lichide. Pentru supematantul din tuburile
de centrifuga folose~te un container separat cu solutie mai concentrata de dezinfectare ~i
prevazut cu palnie pentru retinerea aerosolilor contaminanti (fig. 2-12).
5) Nu lasa mai mult de 24 de ore materia1ele in solutia dezinfectanta ~i nu refolosi
solutia pentru ca se pot selecta ~i inmulti bacterii de contaminare rezistente.
6) Solutii1e dezinfectante nefolosite 24 de ore se arunca.
76
___ ca~O\JITA UZUALA
NUMAI INCINERATOR CONTROLAT
DE LABDRATOR
-----'IPETE GRADATE
77
pH-ul trebuie sa ramana nesehimbat sau sa ereasea eel mult eu 0,5 unitati. In eontinuare
spalarea ~i sterilizarea pentru utilizare se fae ea ~i in eazul stielariei in uz.
Materialele decontaminate numai in solutie dezinfectanta. Dupa ce au fost
mentinute imersate peste noapte in solutia dezinfectanta sunt manipulate in eontinuare
eu mana protejata in manu~a de caueiuc.
Pipetele gradate sunt seoase din solu!ia dezinfeetanta, dopul de vata este aspirat
printr-un tub de eaueiue eu eapcanii eoneetat la trompa de apii sau este seos eu un carlig
fin ~i sunt introduse in dispozitivul de spalare prin apa sub presiune sau prin sifonari
repetate.
Echipamentul mic este retinut intr-o streeuriitoare din polipropilena dupa scurgerea
boreanului in ehiuveta eonectata la fosa septica. La aceea~i chiuveta se scurg ~iboreanele
din care au fost scoase pipetele. Strecuriitoarea eu continutul ei este apoi plasata intr-un
container pentru autoclavare.
Pregatirea lamelor i lamelelor de microscop: 4.2.4.1.
Borcanele colectoare, golite de solu!ia dezinfectanta, sunt autoclavate pentru
distrugerea eontaminantilor reziduali.
Incinerarea
Cat timp laboratoarele noastre nu dispun de incinerator special supravegheat de
personal calificat corespunzator, este precaut a incinera numai materiale autoclavate,
care nu sunt acceptate de serviciul de salubritate. Pentru a preveni poluari periculoase
este de dorit ca masele plastice sa fie sub 20% din materialul incinerat.
78
La mallipuliiri cu pipete gradate:
Dadi sunt invelite individual in hartie, rupe ambalajul prin riisucire la mijlocul
pipetei. Scoate jumiitatea ambalajului dinspre extremitatea inchisii cu vatii, introdu pipeta
in propipeta apoi scoate jumiitatea ambalajului dinspre varf.
Cand utilizezi pipete cu volum mai mare de 5 ml este f0TI11alcontraindicatii
schimbarea pozitiei pipetei inciircate de la verticalla oblic (inertia mare a coloanei de
fluid poate provoca stropiri). In aceste cazuri este indicat ca scoaterea dopurilor sii fie
fiicuta de ciitre un ajutor.
Manipularea asepticii in boxele de sigurantii antiepidemica are cateva pm1icularitiiti
care decurg din restrictia privind utilizarea fliiciirii: utilizarea anselor disponibile din
plastic, utilizarea tuburilor cu capac in~urubat.
Repartizarea aseptica a mediilor de cultunl se face, ideal, In boxe sterile cu flux
orizontal de aer laminar (fig. 2-8). In lipsa boxei cu aer laminar, pentru repartizarea
aseptica a mediilor de culturii se pot folosi boxele de sigurantii antiepidemicii din cJasa 11
unde aerul piitrunde vertical In aria de lucru dupa filtrare (fig. 2-16).
4. MICROSCOPIE
(DUMITRU BUIUC)
Microscopu] este format, In esenta, din doua sisteme de Ientile cup]ate: a) obiec-
tivu], sistem de Ientile cu distanta focala de ordinulmm, situat catre obiectu] examinat ~i
b) ocularul, sistem de Ientile cu distanta focal a de ordinul cm, situat catre ochiul exa-
minatoru]ui. Obiectivu] fonneaza imagine a primara, real a, marita. Ocularu] funqioneaza
ca 0 ]upa: reia imaginea primara, fom1ata imediat Inauntrul distantei sale foca]e, ~i 0
transfonna In imagine virtua]a, InuIt maritii, rastumata ~i obtinuta ]a distanta minima a
vederii clare a observatorului: 20-25 cm (fig. 4-1).
aU
I...
'-~
I 8. - .'"
I -I'
I I _ - _
I iI --~~-~~--
_-_----- I I
t.-=_
: ..~~~_p_-=---::::-:-
I - - Ii !I
80
13
12
11
14
10
9
8
15
7
16
6
17
5 18
19
20
4 21
22
23
24
25
Fig. 4-2. Schema microscopului de laborator ML-4M produs Industria Optica Romilna.
I) Rozeta pentm manipularea filtrului mat (vedere par[iala). 2) Sursa de lumina. 3) Butoanele
pentru centrarea filamentu]ui sursei de lumina. 4) Corpu] ansamb]u]ui mi~carilor. 5) Butonul
mi~carii grosiere. 6) ]ndice ~irepere pentru cursa mi~carii fine. 7) Bra\Ul microscopului. 8) Supor[ii
reg]abili pentru fixarea ]amei. 9) Obiective. ] 0) Capu] revolver. I]) Capul binocular. 12)
Dispozitivul inelar pentru coreClia ametropiei ocu]are (ine]ul de ajustare a dioptriilor). 13) Ocu-
Jar. ]4) Butonul pentru fixarea capu]ui binocular. IS) Masa port-obiect. 16) Condensor. ] 7)
Butonul de fix are a condensoru]ui. ] 8) Parghia diafragmei de apertura. ] 9) Butoanele telescopate
pentm mobilizarea mesei. 20) Butonu] mi~carii fine. 2]) Butonul de focalizare a condensorului.
22) Loca~u] tl]trelor. 23) Rozeta diafragmei de camp. 24) Butoane]e pentru reglarea oglinzii.
25) Talpa microscopului.
81
4.1.2.1. Partea mecanicii. Talpa (25) este suportul care asigura stabilitatea
aparatului. Pe talpa este fixat cOlpul ansamblului mi.)carilor (4) care poarta:
Bra{ul microscopului (7) pe. care este fixat suportul sistemului optic, tllblll
microscopullli. Deplasarea bratului pe vertical a, prin dispozitivele defocalizare grosiera
.)ifina actionate prin butoane (respectiv 5 ~i 20), asigura mi~carea tubului in axuJ optic.
Butonul mi~carii fine are tamburul divizat in 50 de unitati, fiecare corespmmind la 0
mi~care de 0,002 mm a tubului. Mi~carea diviziunilor se umlare~te in raport cu indicele
triunghiular de referinta, gravat pe un inel concentric cu butonul mi~carii fine ~i fix at pe
corpul ansamblului mi~carilor. Limitele domeniului de luau al mi.)cariijine (cca 1,7 mm)
sunt gravate prin doua repere pe corpul ansamblului mi~carilor .)i un indice pe culisa
mi~carii fine (6). lndicele trebuie adus in mijlocul cursei marcata prin cele doua repere.
A~a pastram pemlanent capacitatea de deplasare a tubului in cele doua sensuri.
Suportul condensorilor actionat pentru focalizare printr-un buton (21).
Masa port-obiect (15) prevazuta cu 0 deschidere centrala pentru iluminarea
obiectului, supor{i reglabili pentru jixarea lamei port-obiect (8) ~i doua butoane
concentrice (19) care controleaza mi~carea transversala ~ilongitudinal a a mesei cu precizie
de 0, I mm urmarita prin sistem vemier pentru fiecare directie.
4.1.2.2. Sistemul optic. Obiectivele (9) se adapteaza la partea inferioara a tubului
printr-un cap revolver (10) cu ajutorul diruia pot fi aduse, pe rand, in axul optic al
microscopului. Pozitionarea corecta a obiectivului in axul optic este semnalata printr-un
dedic. Ocularele (13) sunt adaptate, prin telescopare, la paliea superioara a tubului.
Capul binocular (11) este prevazut cu prisme pentru schimbarea directiei faseiculului
luminos ~idivizarea lui catre cele doua oculare, care se pot adapta la distanta interpupilara
a examinatorului. Tubul ocularului stang este prevazut eu un dispozitiv inelar pentru
corec{ia ametropiei ochilor (12).
Puterea de marire a microscopului se calculeaza multiplicand puterea de marire a
obiectivului cu cea a ocuJarului ~ia capului binocular (valori gravate pe montura fiecareia
dintre aceste piese). Puterea de marire se exprima printr-un numar care arata de cate ori
diamehlll imaginii este mai mare decat diametrul obiectului real.
Distan{a de luau a obiectivului se exprima prin distanta dintre lentila obiectivului,
cand acesta este focalizat pe un preparat sub!ire, ~i suprafata lameJei de acoperire a
preparatului. Cu cat este mai mare puterea unui obiectiv, cu atat este mai mica distanta
de lucru. De aceea in cursul focalizarii imaginii, pentru a evita spargerea preparatului ~i
degrad area lentilei obiectivului prin apasare excesivii pe lama, obiectivele cu marire
putemicii trebuie manipulate cu atentie.
Profunzimeafocala. Grosimea preparatului care poate fi viizutii la un moment dat
in focar, ca ~i aria investigata a preparatului scad 0 data cu distanta focala a obiectivului.
De aceea pentru examenul de ansamblu al unui preparat sunt indicate obiective cu putere
de miirire mica (profunzime focala mare), iar pentru examenul detaliilor, obiective
putemice (profunzime focala mica).
Marirea uti/a este marirea care ofera 0 imagine cu detalii a obiectului real. Cand
depa~e~te 0 anumita limita, miirirea nu mai ofera aceste detalii ~i devine marire goala,
inutilizabilii. Miirirea utila a microscopului depinde de puterea de rezolutie a obiectivului.
Ecuatia care define~te puterea de rezolu!ie a obiectivlllui este:
A
d = 2AN'
82
unde: Axuloptic
obiectivele apocromate: 1,4. Obiectivele cu imersie acromate, utilizate cure nt, au apertura
numerica de 1,25 sau 1,30.
Calitatea imaginii depinde ~i de capacitatea definitorie a obiectivului, capacitatea
acestuia de a forma imagini eu contur net, precis. Capaeitatea definitorie a obiectivllllli
se asigura prin corectarea aberatiilor sferica (fig. 4-5) ~i cromatica (fig. 4-5) a lentilelor.
Obieetivele acromate au aberatia cromatica corectata prin suprapunerea focarului
a doua radiatii (fig. 4-7). Sunt obiectivele utilizate curent in microscopie.
Obiectivele apocromate au aberatia cromatica corectatii prin suprapunerea focarului
a trei radiatii ~i toto data au apertura numeric a maxima.
Pentru a putea alege obiectivul care asigura cele mai bune performante intr-un
scop dat, pe montura fiecarui obiectiv sunt gravate: puterea de marire, apeltura numerica,
coreqia aberatiilor (mentiunea apocromat, cele acromate, uzuale, fiind tara mentiune
speciala), lungimea mecanicii a tubului (160 mm) ~igrosimea lamelei de acoperire pentru
care este corectat obiectivul (uzual 0,17 mm). Microscopia curenta in microbiologie
c1inica necesita umlatoarele obiective acromate 6X/0,l; 1OX/0,30; 20X/0.4; 40X/0,65
~i 90X/1,25 ori 1,30 lU la care asociem, dupa necesitatile de marire, oculare 5X, 7X
sau lOX.
83
ll31;J 6
@
2
r~&~
I I SUfSa rJe /um/fla
Fig. 4-4. Principiul de function are al obiectivului cn imersie: uleiul de cedru dintre preparat ~ilentila
frontalii a obiectivului previne pierderea prin refractie a razelor cu valoare 'in formarea imaginii
(razele 1-5), imaginea apare cu detalii pe camp microscopic bine luminat. Prin refractie in aer, in lipsa
uleiului de cedru, 0 parte din razele cn valoare in formarea imaginii sunt pierdute (razele 7-9)
imaginea apare siiracii 'in detalii pe camp microscopic insuficient luminat.
-i! IFs.
~~U-J~
I
A
FjlI I ~
dI
b
I
8
Fig. 4-5. Aberatia sferid. Zonele inelare ale lentilei au focare proprii, mai apropiate pentru zonelc
periferice decM pentru cele centrale.
Pe ecranul AB, in Fj imaginea punctului luminos L apare cu 0 aureola relativ mare ~i slaba. Dcplas3nd
ecranul spre FJ ajung"em intr-o pozirie ab in care imaginea punctului L este cea mai neta (diametru minim ~i
iluminare relativ unifoll11a). 0 asemenea corectie a aberariei sferice se nume~te "prin lipsa", spre deoscbirc
de corectia prin asociere de Ientile, care este "prin exces" (cre~te distanra focala a zonelor marginale ale
lentilei dincolo de cea a zonelor centrale).
84
r I'Qrlll~ Ii (/I7VI. !
5l/CUS/va(aI/la/Il'l
l'Ciao mlocarll/
I lbas/ru-
-~:.----
yip!!}-
L -- -- I
.,-- rO;,v
L
F
Fig. 4-7. Corectia aberatiei in sistemul apocromat suprapune focaml a doua radiatii diferite:
in exemplul ales, focarul radiatiei verzi (FV) ~i al celei ro~ii (FR).
85
condensorului 0 depa~e~te pe cea a obiectivului, in microscop patrunde lumina parazita,
care produce stralucire aberanta a imaginii. Daca apel1ura numerica a condensatorului
este mai mica dedit cea a obiectivului, se pierd detalii ale imaginii (v. fig. 4-4, B).
Condensorul este fixat sub masa port-obiect printr-un suport care culiseaza pe verticala
aqionat de un buton (21).
Microscopul ML-4M este inzestrat ~i cu 0 oglinda exterioara, care se poate monta
in loca~ul filtrelor dnd, accidental, sursa de lumina intema nu funqioneaza. in acest caz
folose~te ca sursa de lumina un bec mat de 40-60 W sau, mai bine, 0 lampa de mare
intensitate cu diafragm iris.
Microscopul trebuie plasat pe 0 masa stabila intr-o latura a incaperii care perll1ite
a~ezarea examinatorului cu spatele la fereastra. Lumina directa care patrunde in ochi
jeneaza observarea detaliilor microscopice.
Pentru ll1icroscopia cu fond negru sau cu luminescen!a este indicata 0 camera
obscura.
86
6) Prive~te prin oculare ~i ajusteaza-le pentru propria distanta interpupilara pfma
cand obtin viziunea binoculara perfecta a campului microscopic.
7) Focalizeaza preparatul aqionand tubul microscopului numai de jos in sus prin
butonul mi~carii grosiere, apoi, daca lucrezi eu un obieetiv putemic, prin butonul mi~ci'irii
fine.
Selecteaza 0 suprafata din preparat cu elemente bine etalate. Pentru aceasta
aqioneaza butoanele concentrice care controleaza mi~carile transversale ~i longitudinala
ale mesei POli-obiect.
8) Actioneaza butonul de focalizare a condensatorului pana obrii imaginea
diafragmei de camp cu cel mai clar contur. La examinari cu obiectivele lOX sau 6X redu
apertura numerica a condensatorului prin de~urubarea monturii cu lentila superioara.
9) Centreaza imaginea diafragmei de camp aqionand butoanele oglinzii. Initial
ambele butoane trebuie sa fie la jumatatea cursei pentru a asigura suficienta mobilitate
intr-un sens sau altul.
10) Deschide diafragma de camp pana la limita campului microscopic. 0 deschidere
mai mare introduce lumina parazita in microscop, care detemlina stralucire suparatoare
a imaginii.
11) Regleaza deschiderea diafragmei de apertura. Pentru aceasta scoate ocularuL
prive~te prin tubul microscopului ~i actioneaza parghia diafragmei de apertura pana ce
imaginea ei ocupa 1/2 - 1/3 din diametrul pupilei de ie~ire a obiectivului. Deschiderea
spre maximum a diafragmei de apertura cre~te puterea de separare, dar scade contrastul
imaginii; invers, miqorarea ei scade puterea de separare, dar cre~te contrastul imaginii.
Odata stabilite aceste reglaje, este contraindicata reglarea fluxului luminos prin
modificarea diafragmei de camp sau pozitiei condensatorului. Acum fluxulluminos mai
poate fi crescut prin rabatarea filtrului mat, sau scazut prin introducerea filtrului fumuriu
NG 5/2 in loca~ul filtrelor. Filtrul verde VG 6/2 ofera un contrast mai bun imaginii ~i
cre~te puterea separatoare, dar altereaza interpretarea culorilor. Cu filtrul albastru BG
33/2 se obrine nuanra alba a luminii, care nu altereaza culorile preparatului.
12) Focalizarea finala a imaginii prin ajustarea dioptriilor:
Obtureaza ocularul stang cu capacul din trusa microscopului, prive~te Cll ochiul
drept in ocularul drept ~i focalizeaza imaginea prin butonul mi~carii fine.
Obtureaza ocularul drept, prive~te apoi cu ochiul stang prin ocularul stang ~i
focalizeaza imaginea numai prin rotirea inelului de ajustare a dioptriilor lara a atinge
butoanele mi~carii grosiere sau fine a tubului.
1) Tine penn anent microscopulla adapost de praf: sub husa sau in cutie.
2) Mentine in cutia lor obieetivele ~i ocularele nefolosite.
3) Dupa fiecare exam inare curata uleiul de cedru de pe lentila obiectivului lU ell 0
hartie moale, care nu lasa scame. In lipsa acesteia, folose~te pulpa degetului ~i ~terge
imediat uleiul de pe deget cu 0 carpa.
87
4) Nu atinge cu mana suprafetele optice.
5) Nu apropia exagerat ochii de oculare. Clipirea va Hisa um1e de grasime de pe
gene pe lentila ocularului.
Periodic:
6) Sterge elementele optice ale microscopului, exceptand fetele frontale ale
obiectivelor ~i condensatorului, cu 0 carpa curata din finet imnuiata in amestec etanol
96 cu eter in pa11i egale.
7) Curata fata frontala a obiectivelor, in special a celui cu imersie, ~icondensorului
cu 0 carpa de finet umezita in benzina sau xilo!. Este fonnal contraindicata utilizarea
alcoolului pentru aceasta operatie: cleiul folosit de produciitor pentru montarea lentilelor
este solubil in alcoo!.
8) Pentru indepartarea eventualelor pulberi din veciniitatea monturii lentilelor
folose~te 0 mica pensula curata sau, mai bine, insufla cu 0 para un jet de aer (nu sufla
niciodata cu gura pentru ca poti proiecta pe Ientile stropi de saliva).
Apeleaza la un tehnician autarizat pentru revizia anuala a microscopului sau pentru
interventii in caz de incidente pe care nu e~ti abilitat sa Ie rezolvi singur: gripare,
deteriorarea unar piese etc. Pentru aceasta mentioneaza cronologic in fi~a microscopului
toate defectiunile survenite ~i data reviziilor sau interventiilor de remediere.
Cele mai multe sunt legate de examinarea prin obiectivul cu imersie. Unl1are~te
atent tabelul 4-1.
88
Tabelu/4-1
Incidentul
tata cu strat mai Obiectiv
Pulberi
Deschidne
Lentila incorect
sau illlpuritiili
Uleiul defrontal
cedru
imporitati
exeesiva
Cauze a posibileRemedii
sub Schimba
Curata
Poziliollat
a prinsscop. Curala
0 brat
COlltroleaza
a pepcdiafragmei
frotiu:
Corecteaza
ocular:
Ridica
Veritica
Cura(a
obiectivului ocularul
bula0 imagine
bra(ul obieetivul
~iseuleiul
cucudeobiectivul
lama
Pozi(ioneaza xilol
segrija
tubulmicroscopului
acoperita mi~cadelentila
corect
declicul
aerdereclu buna
pozilia
rotesc
camp cudata
cu0cedrll
frotiul lama
0lamei
microscopului unul
revolverului
indica
datii
deschiderea
ulei din
defectarea
decucu cedru
{'~idiati-agmci
~irotiul
ocularul trusa
reiascoate
us- obiectivului
altui
lafocusarea.
pozitiollarea micro-
deprimului
peincidentul
cordonullentila
camp DacadeobiectivlIlui ~i reiauleiuloperalia
se repeta. cllrala de pe frotiu ~ide
cu 0 noua
0 data
ctObiediv
ntre talpa cu~iposibil tivului
obiectiv
bratul Lama
Uleigrosdepusa
pieatura
Frotiu Clluleifrotiul
dedecedru
acoperit
balsam in dejoscorec(ia
c;;uulei
preadecatvascos: cedrulamauscat
aderadupaladeexamin[lr~
asigurata Fabricant~iante-
obiectiv obiec-
cste inlocuiqte lamela
campul micro-
00
..0
sauremediazacontactele
onIncidentul
~tekerelor* Pan a de Cauze
Diafragmacurent
imperechere dedecamp lanumerica
Remedii
posibile
Inoelilare
relea
~i, distan!a
Veri
Vdupa
erifiea
inainte
sauAdapteaza
Verifica fica ~i~i
eaz,suficienta
deextrema
priza
lampa
defilamentullampii
Verificii apertura
Controleaza
inegale
Verifiea corecteaza
~i~icele
lnlocuiqte
coreeteaza
folosind
acorect
remediaza
privi
incorect
doua
declicul
monteaza
remediaza fiecare
Illicroscopului
siguran!a
un bec
prinnecentrate
binocular
diafragme
reglate centrare
revolveruluicudetransforlllatoru-
condensor altcontrol
~ifixeaza transformator
unapertllra
iacorecteaza obieetre-
Pozilionarea
Cllglarea
edaptare
sau becul
ndensor Illi- Illi
insufiei-
cu aper-
dioptriilor obiectivului
91
directie. Un microorganism este mobil cand i~i modifica pozi!ia fa!a de un reper din
vecinatate. Bacteriile monotriche sau lofotriche au mi~cari rapide de rostogolire, cele
peritriche au mi~cari oscilatorii.
92
zonele frotiului unde uscarea intarzie (centru, portiuni mai groase), hiperconcentrarea
sarurilor, pe masura ce uscarea progreseaza, ratatineaza fagocitele, ceea ce creeaza
dificultati la examinare.
c) Fixarea frotiului pentru bacterioscopie se face umal prin ciildura. Trece lama,
cu frotiul in sus, cateva secunde prin flacara unui bec de gaz. Dosul mainii trebuie sa
suporte atingerea lamei astfel inciilzite. 0 incalzire mai putemica poate carboniza frotiul.
Examenul citobacterioscopic sau eel pentru protozoare impune fixarea chimica.
2) Colorareafrotiului
Pune lama cu frotiulln sus pe stativul de colorare.
Acopera frotiul, pe rand, cu reactivii indicati confonn prevederilor fiecarei metode
de colorare (vezi Cap. 41).
Dupa epuizarea timpului indicat spala lama cu apa.
In final, absoarbe excesul de apa intre doua sugative ~i pune lama vertical in
stativ sau orizontal pe platina incalzitoare pentru uscare.
Examineaza la microscop.
3) Protejarea frotiurilor deosebite se face prin montarea In balsam de Canada.
Pentru aceasta:
Spala cu xilol unnele uleiului de cedru de la 0 eventuala examinare anterioara.
Imerseaza lama vertical in baia de xilol.
Scurge partial excesul de xilol.
Mentine lama orizontal in mana ~i depune pe latura lunga, in dreptul frotiului, 0
picatura de balsam de Canada.
Fa contactul intre jumatatea unei laturi lamelei ~i pic:'ltura de balsam. Evi1i
fonnarea bulelor de aer dadi aduci progresiv lamela din pozitie oblica, sprijinita pe
margine a lamei, in pozitie orizontala peste frotiu. Impinge lamela pana acopera frotiul ~i
preseaz-o pentru a elimina eventualele bule de aer ~ia unifonniza, cat mai sub1ire, stratul
de balsam. Cu degetul, infii~urat in strat subtire de tifon, ~terge excesul de xilol ~ibalsam
de pe laturile lamelei.
Lasa lama in pozitie orizontaHi pana a doua zi, dupa care poate fi pusa pe stativ
pentru uscarea completa a balsamului.
93
---- Obiechv difractate ~ireflectate de ditre obiectul iluminat
oblic patrund In obiectiv ~i formeaza imaginea
luminoasa a obiectului pe fondul negru al
~, campului. Un astfel de condensor este conden-
satorul cu ogJinzi sferice concentrice (fig. 4-8).
La microscopia pe fond negru obiectul floteaza
_Condensor Intr-o pelicula de lichid pentru a evita retlexia
total a a razelor Inainte ca acestea sa-l lumineze.
lndicafii: Examen electiv pentru depistarea
rapida a spirochetelor, organisme fomie tIne, putin
refringente ~imobile.
Necesar:
1) Condensor cu oglinzi sferice concen-
Sursa de trice, care Inlocuie~te condensorul pentru camp
lumina
luminos la un microscop optic.
Fig. 4-8. Condensorul eu oglinzi sferice 2) Sursa de lumina cu mare intensitate ~i
eoneentrice pentru microscopia pe fond diafragma iris. La microscopul ML-4M exami-
lntuneeat. narea se face cu geamul mat rabatat din fata
diafragmei de camp.
3) Lame de micros cop cu grosimea de 1,0 mm. Numai pe asemenea lame preparatul
este plasat In focarul condensatorului, care are distanta focala de 1,2.
4) Ulei de cedru.
5) Camera obscura.
Procedura:
1) Centreaza diafragma de camp folosind condensorul de cfllnp luminos ~iobiectivul
lOX.
2) Inlocuie~te condensorul de camp luminos cu cel pentru iluminare pe fond negru.
3) Depune 0 picatura de ulei de cedru pe lentila superioara a condensorului ridicata
la nivelul mesei port-obiect.
4) Pune preparatul umed Intre lama ~i lamela peste picatura de ulei de cedru de pe
lentila condensorului.
5) Examineaza preparatul cu obiectivull OX, apoi cu un obiectiv uscat mai putemic,
dupa necesitate. Cu cat obiectivul are 0 apertura mai mare, fondul campului microscopic
este mai putin Intunecat.
6) Dupa examinare, depune preparatullntr-un recipient cu solutie dezinfectanta.
Interpretare: Pe fondul negro al campului microscopic observa imaginea luminoasa,
stralucitoare a spirochetelor mobile.
94
trecerea printr-un obiect transparent (e.g., 0 celula) razele
refractate ~i difractate sufera numeroase defazari interme-
diare intre situatiile extreme mentionate mai sus. Aceste
defazari intennediare oscileaza in jurul a I din lungimea de OCULAPUL
95
4) Roteaza sub condensor diafragma inelara corespunzMoare obiectivului ales.
5) Inlocuie~te ocularul cu ocularul de centrare, care pennite observarea planului
focal superior al obiectivului cu placa de faza.
6) Privind prin ocularul de centrare ~i folosind ~uruburile de centrare plasate sub
condensor, suprapune exact diafragma inelara cu inelul de faza.
7) Reinsera ocularul obi~nuit ~i examineaza.
lnterpretare: Pe fondul cenu~iu al campului microscopic se observa imaginea
obiectului cu detalii structurale net distincte. Examenulln camera obscura ~i utilizarea
filtrului verde favorizeaza observarea detaliilor.
96
5) Obiective acromate (obiectivele apo- ~OchiUI examinahJrulUi
,, ...
,
cromate pot avea sticla fluorescen1ii), dintre care Filtru de proFecrie
obiectivul cu imersie trebuie sa aiM diafragma Ocular
Procedura:
~ (~ Sursij
lumIna
dE
1) Monteaza la microscop dispozitivul r
Lentila de ciimp
monocular, singurul care valorifica integral Filtru caloric
fluxulluminos fluorescent evitand diviziunea in Filtru de excJ~t'e
97
5. IZOLAREA BACTERIILOR SI STUDIUL CULTURILOR
(DUMITR U B UIDC)
Cultivarea bacteriilor in microbiologia clinica are drept scop: izolarea lor din
prelevatele patologice, identificarea ~i testari pentru initierea ~imonitorizarea terapiei
antimicrobiene.
Prelevatele patologice odata reception ate ~i triate calitativ, microbiologul trebuie
sa hotarasca:
1) Mediile de cultura ~i metodele indicate pentru izolare.
2) Atmosfera, temperatura ~i intervalul necesare pentru izolarea tuturor
microorganismelor cu semnificatie clinica din prelevatul examinat.
3) Izolatele cu semnificatie clinica, algoritmul ~i stadiul pana la care conduce
identificarea acestora.
4) Daca antibiograma este indicata ~i care din rezultatele ei se impun comunicate.
Semnificatia clinic a a unor izolate poate fi stabilita inca in primocultura, ci'md se
face ~i identificarea lor microscopica (e. g., izolatele din prelevate necontaminate, bacili
gram-negativi izolati dincolo de un anumit prag in urocultura cantitativa). In aceste cazuri,
~i in urgente, antibiograma poate fi efectuata inaintea identificiirii pana la nivel de gen
sau specie. In urgente 0 antibiograma difuzimetrica orientativa poate fi Iacuta in
primocultura unor prelevate necontaminate daca cito-bactelioscopia atesta densitatea
suficienta a bacteriei semnificative clinic (e. g., cazul meningitelor purulente.
pielonefritelor acute etc.). Dar semnificatia clinicii a unor izolate poate fi stabilita numai
dupa identificarea speciei, a serovarului etc. (e. g., izolarea bacililor dizenterici sau a
bacililor tifici in coproculturi).
In acest capitol yom aprofunda numai izolarea bacteriilor in primocultura, obtinerea
culturilor pure necesare identificiirii ~i antibiogramei, locul caracterelor de cultura $i
microscopice pentru initierea identificarii. Amanunte privind conditiile de calitate,
prelucriiri speciale, criterii de semnificatie a izolatelor din prelevate particulare, mediile
de cultura, testele de identificare, testele microbiologice pentru initierea ~i monitorizarea
terapiei antimicrobiene sunt detaliate in capitole speciale.
98
5.1. IZOLAREA BACTERIILOR
99
Moderat selective (e. g., mediul Salmonella-Shigella - agenti inhibitori saruri
biliare ~i verde briliant), care inhiba, pe langa bacteriile gram-pozitive, ~i 0 parte din
bacilii gram-negativi comensali.
inalt selective (e. g., mediul Wilson-Blair - agent inhibitor verde briIiant), care
inhiba 0 gama mai larga de bacterii pentru a facilita izolarea salmonelelor.
Agarul-sange poate fi tacut selectiv pentru izolarea unor patogeni pretentiosi
nutritivi prin adaos de antibiotice: colil11icina ~i acidul nalidixic inhiba dezvoltarea
bacteriilor gram-negative ~i favorizeaza izolarea celor gram-pozitive; bacitracina inhiba
dezvoltarea bacteriilor gram-pozitive ~i favorizeaza izolarea hemofililor, kanal11icina Si
vancomicina favorizeaza izolarea bacililor gram-negativi anaerobi ~. a. m. d.
Mediile de imbogatire sunt medii lichide care, prin anumite substante inhibitoare,
prelungesc faza de lag a bacteriilor de contaminare, tara a intarzia insa intrarea anumitor
patogeni in faza exponentiala. Astfel preincubarea fecalelor 18 ore la 37C in bulion cu
selenit de sodiu ~.a., inainte de epuizarea pe un mediu selectiv adecvat, favorizeaza izolarea
sa1mone leIor.
Utilizarea mediilor diferentiale ~i selective nu trebuie ul111aritacu orice pret, ci
numai in masura in care aduce avantaje reale, tara a incarca inutil costul analizei. Exemple:
Includerea unui mediu diferential lactozat in bateria de medii pentru izolarea
patogenilor din sputa nu 0 vedem indispensabila pentru ca: a) nu aduce nici un avantaj
nutritiv suplimentar comparativ cu agarul-sange; b) nu caracterizeaza nici un factor de
patogenitate; c) semnificatia clinica a izolatelor conditionat patogene este stabilitii pe
criterii cantitative, raportul cu celulele inflamatorii ~.a.,intre care capacitatea de fem1entare
a lactozei nu i~i afla locul; antibiograma izolatului cu semnificatie clinica se impune Si
se poate face inaintea identificarii.
Izolarea salmonelelor in bacteriologia clinica nujustifica utilizarea mediilor inalt
selective. Microbiologul bine familiarizat cu aspectul culturii enteropatogenilor pe un
singur mediu cu selectivitate mijlocie izoleaza bacilul tific cu acela~i randament ca ~i
restul salmonelelor sau bacililor dizenterici tara a mai trebui sa apeleze ~i la mediul inalt
selectiv Wilson Blair.
Tulpini ale unui patogen pot sa nu cultive pe mediul selectiv ales. De aceea
sensibilitatea izolarii unor patogeni cre~te daca mediul selectiv este dublat ~i de un
mediu neselectiv: tulpini de bacili dizenterici care nu cultiva pe medii cu selectivitate
mijlocie, dar pot fi izolate pe mediul cu selectivitate joasa (e. g., mediul Mac Conkey
~. a.) sau diferential lactozat (e. g., agar cu albastru de bromtimol lactoza etc.); tulpini
de baciI difteric care sunt inhibate pe mediile cu telurit, dar pot fi izolate pe agar-
sange etc.
Suspiciunea prezentei in prelevat a bacteriilor cu perete defectiv (e. g., infeqii
persistente la pacienti sub terapie cu antibiotice ~-lactamice confonn antibiogramei)
obliga la insamantarea ~i intr-un l11ediuprotector hiperton cu zaharoza.
100
5.1.2. Prelucrarea prelevatelor patologice ~itehnici de insamantare
pentru izolarea ~iidentificarea bacteriilor
B c
101
Tabelul5-1
Aprecierea semnifieativa a ere~terii in primoeultura pe placi
eu mediu agarizat dupa epuizarea inoeulului in 4 eadrane
---
23<5
<5
>5
>5 >10
<10
,
din cadranele
I
i Numarul coloniilor pe striurile de insamfmtare
Pentru izoUiri pe medii selective, cantitatea de inoculum trebuie sa fie mai mare,
iar epuizarea mai putin drastica. Initial, conform schemei din figura 5-2, etalam in aria A
una sau mai multe anse cu inocul ori inocul prelevat pe tampon. Epuizam apoi inoculul,
rara sterilizari intermediare ale ansei, prin 3 serii de striuri: B, C ~iD (fig. 5-2). Cantitatea
de fluid prelevata in ansa difera cu pozitia de scufundare ~i retragere a ansei: cantitate
minima ~i constanta la scufundarea ~iretragerea verticala, cantitate maxima la scufundare
cat mai oblica ~i retragerea ansei prin "smulgere" din fluid.
Pura poate fi considerata ace a cultura formata din descendentii unei singure colonii
rezultate dupa 0 epuizare a materialului microbian, care duce la cre~terea sub f01111ade
colonii bine izolate pe un mediu de cultura neselectiv. Ideal ar fi ca asemenea cre~tere sa
p0111eascade la indivizi izolati. Practic ea p0111e~tede la unitati f01111atoarede colonii
(po ate indivizi, poate 0 mica grupare de organisme asemanatoare).
In microbiologia clinica, 0 singura epuizare optima pe un me diu neselectiv poate fi
suficienta, dar 0 reepuizare este de doril. Cand cultura primara rezulta dupa epuizare pe
un mediu selectiv, reepuizarea pe un me diu diferential este obligatorie. Coloniile
microorganismului urmarit pe mediul selectiv pot contine un numar de contaminanti
inhibati, care la repicarea directa in mediul de identificare i~i reiau activitatea. Bacteriile
inhibate raman in profunzimea coloniilor, in apropierea suprafetei insamantate. De aceea,
la purificarea izolatelor de pe mediile selective, pentru repicarea prin reepuizarea acestor
colonii prelevam inoculul numai prin atingerea suprafetei
A
coloniei; niciodata nu trebuie sa sectionam colonia cu ansa.
Izolarea bacteriilor din prelevate contaminate cu Pro-
teus este posibila pe medii care inhiba caracterul invaziv al
c o acestor specii: agar cu saruri biliare, agar cu eritrocite de
cal ~i carbune activ (sangele integral reduce capacitatea
adsorbtiva a dirbunelui), agar-sange cu alcool feniletilic,
un agar deficient in electroliti.
In prezenta clostridiilor invazive, izolarea bacteriilor
anaerobe in cultura pura este mai dificila ~i poate impune
Fig. 5-2. Epuizarea eu ansa a repicari multiple.
unui prelevat patologie pe
plaea eu mediu seleetiv Sansa de a repica 0 mutanta in cursul purificarii unei
(sugestie). culturi pe medii nutritive uzuale este de una la cateva
102
milioane. Pentru a 0 minimiza, odatiiconvin~i de puritatea culturii,
nu mai repiciim colonii individuale, ci un inocul prelevat din mai
multe colonii.
2) Insaman{area nmedii liehide 0 facem direct cu seringa
de prelevare (hemoculturi), cu pipeta (sedimentul lichidului
cefalo-rahidian), cu ansa incarcata cu prelevat patologic
monomicrobian ori cultura pura (fig. 5-3).
(A) lnclina tubul ~i descarcii ansa pe peretele tubului a~a
cum indica figura. (B) Cand readuci tubulla verticala, inoculul
ajunge submers ~i difuzeaza in mediu.
3) Izolarea baeteriilor sporulate de eele nesporulate pe
baza termorezisten{ei sporilor. Mentine in baia de apa la 80C, A B
103
5.1.3. Incubarea culturilor
Majoritatea bacteriilor cu interes medical cresc bine la 37C. Unele bacterii (e. g.,
Yersinia enterocolitica, Y. pseudotuberculosis, Listeria monocytogenes) cultiva optim
sau/~i exprima caractere importante pentru identificare la temperatura camerei, 20-30C
(mobilitate etc.). Altele cresc optim la 42C (e. g., Campylobacterjejwzi/coli). Cre~terea
fungilor cu interes medical este optima la 30C.
Laboratoarele mici se pot rezuma insa la un incubator reglat pentru 35-37C. La
aceasta temperatura yersiniile se VOl'dezvolta mai lent ~i vor necesita prelungirea cu 24
ore a perioadei de incubare, Campylobacterjejuni se poate dezvolta ~i la 37C pe mediul
Campy-BAP. Cercetarea mobilita!ii yersiniilor sau cultivarea fungilor poate fi ul111arita
~i la temperatura camerei.
In laboratoarele mari, incubatoarele reglate la 0 gama mai larga de temperaturi
sunt necesare nu numai pentru a ameli ora randamentul izolarilor, ci ~ipentru identificarea
corecta a multor izolate (yersinii, listerii, micobacterii).
Incinta incubatoarelor trebuie supravegheata pentru a asigura (v. tabelul ]-4):
Constanta temperaturii.
Umiditatea de eel pu!in 70% poate fi ob!inuta prin men!inerea in incinta a unui
cristalizor deschis din care apa se evapora liber. Este esen!iala pentru cultivarea un or
bacterii, mai ales daca perioada de incubare se prelunge~te. Incubatoarele model11e au
rezervoare cu apa care regleaza umiditatea dupa necesita!i.
Indepartarea regulata a pulberilor prin ~tergerea suprafe!elor cu carpa umezita.
Bacteriile aerobe ~i facultativ anaerobe Ie cultivam in atmosfera n0l111ala.
Bacteriile carboxifile Ie cultivam uzual intr-un borcan acoperit in care Uisam sa
arda 0 lumanare, care se stinge cand concentra!ia CO2 atinge 5-10%. Concentra!ia de 5%
CO2 0 ob!inem i prin reac!ia dintre carbonatul de ca1ciu ~i acidul clorhidric dintr-un mic
vas plasat in borcan acoperit sau exsicator:
Buca!ele de mal111Ura(0,25 x V) g,
Acid clorhidric 25% (2,50 x V) ml,
unde V = volumul in litri al borcanului de incubare. Concentra!ii mai mari de CO2
ob!inem crescand cantitatea reactivilor.
Bacteriile microaerofile pot fi cultivate in tennostate cu atmosfera reglata sau in
pungi etane din plastic insuflate cu amestec gazos: oxigen 5-7%, dioxid de carbon 8-10%
i azot 85%.
Pentru cultivarea bacteriilor strict anaerobe recurgem, in functie de dotarea
laboratorului, la procedee fizice, chimice sau biologice.
1) Procedeele .fizice cu mare randament i eficien!a pennit cultivarea bacteriilor
anaerobe pe placi cu mediu agarizat:
Camera anaeroba (glove box) In care toate opera!iunile, de la Insamantarea i
observarea culturilor pana la repicari, se fac in absen!a oxigenului.
Sistemul Mac Intosh i Fildes. Dintr-un borcan etan aerul, Indepartat cu 0 pompa
de vid, este Inlocuit cu hidrogen sau un amestec gazos (azot 85%, dioxid de carbon 5</"0,
hidrogen 10%), iar clorura de paladiu inclusa in azbest catalizeaza la cald (rezistentii
electrica) fixarea hidrogenului pe urmele de oxigen.
104
Sistemul Gaspak este un borcan etan~ in care reactia dintre apii ~i 0 tab1etii cu
borohidrat de sodiu, clorura de cobalt, acid citric ~i bicarbonat de sodiu degajii hidrogen
~i dioxid de carbon. Granule din aluminat de paladiu, fixate la capac, catalizeazii 1areee
fixarea completii a oxigenului pe hidrogen cu fonnare de apii.
In incintele anaerobe potentialul de oxido-reducere poate fi monitorizat vizual.
Mai utilizat este indicatorul Fildes ~i Mac Intosh cu albastru de metilen:
a) Glucozii solutie apoasii 6% (prezervata cu un mic cristal de timol);
b) NaOH solutie 1/10 N: 6 ml in 94 ml apii distilata;
c) Albastru de metilen solutie apoasii 0,5%; 3 ml in 100 ml apii distilatii.
Cite 1 ml din solutiile a, b ~i c se amestecii intr-o eprubetii, iar continutul se fierbe
pana 1adecolorare, dupa care se plaseaza in incinta anaeroba inainte de a 0 inchide etan~.
Pe parcursu1 ~i la sIa.r~itul incubarii:
- culoarea albastra = rH nesatisfiiciitor;
- incolor = rH satisfiiciitor pentru cultivarea anaerobi1or.
2) Procedee chimice
Bulioane cu ingrediente reduciitoare (acid tioglicolic sau tioglicolat de sodiu), u~or
agarizate, pentru cre~terea vascozitiitii, ~i cu un indicator pentru monitorizarea rH-ului
(albastru de metilen sau resazurina) sunt repartizate in tuburi in co1oanii ina1ta. Cand
indicatorul de rH apare oxidat pe iniiltime mai mare de 1, de la suprafala coloanei, mediuJ
trebuie "regenerat prin fierbere 15 minute in baie de apii pentru indepiirtarea aeru1ui
solvit. Dupii regenerare, tuburile, racite brusc la curent de apii, sunt insiimanlate.
Intr-o cutie Petri creiim, prin parafinare, 0 incintii etan~ii din care oxigenu1 este
indepiirtat prin reactia cu piroga1olul in mediu a1calin (fig. 5-5). Un pachelel eu:
Piroga1ol 0,4 g,
Carbonat de potasiu 0,4 g,
Talc 4,0 g
este suficient pentru a crea anaerobioza intr-o eutie Petri cu diametrul de 11 cm.
3) Procedee biologice
Procedeul Tarozzi utilizeazii tuburi eu bulion nutritiv in care agent reduciitor
sunt fragmente de organe proaspete de animal prelevate aseptic (ficat, rinichi). Tuburile
sunt insamantate dupa verificarea sterilitatii timp de 24-48 ore la 37C.
In diametrul unei placi Petri mediul agarizat, adecvat exigenlelor nutritive ale
anaerobilor, este decupat ~i indepiirtat pe 0 liitime de 2-3 mm. Pe 0 jumatate a p1iicii
insiimantiim dens 0 bacterie aeroba foarte avidii de oxigen (e. g., Bacillus subtilis), iar pe
Pachetelcu
reducalor ,.
l
amesJec
~ 1.7'-. ~./C" --''-
II II I "~ . v/
Paraflna //// I
105
cealalta jumiitate epuizam bacteria anaeroba, imediat etan~am cutia prin parafinare. Bac-
teria aeroba consuma oxigenul ~i creeaza conditii pentru cre~terea bacteriei anaerobe.
Cultivarea pe placii Petri transformatii, chimic sau biologic, in incinta anaerobii are
posibilitati modeste ~ipennite cultivarea numai a anaerobilor dependenti de un rH relativ
scazut.
Prezervarea de contactul cu aerul a culturilor in tuburi este realizata prin acoperirea
bulionului cu un strat de ulei de parafina steril sau prin cultivare in tuburi Weinberg
(tuburi de 240/10 mm) cu coloanii de geloza moale regeneratii.
In microbiologia clinicii bacteriile anaerobe trebuie izolate prin epuizarea pe pHiei
cu mediu de culturii preredus.lnsamantarea bulioanelor anaerobe ramane indicatii pentru
hemoculturi. Practica insamantarii in paralel a unui tub cu bulion anaerob ~i a unei pliici
aerobe eu repicarea ~i identificarea izolatelor din bulion numai in absenra cre~terii aerobe
expune la erori ~i cheltuieli inutile: cre~terea in bulion poate fi initiatii doar de cateva
unitari fonnatoare de colonii care sunt lara semnificarie clinica reala.
106
Q
0.
Circulara
Bombat
Filamentoasa
.'
FORMA
Plat
Punctiforme
Convex
~.-
Neregulata 0
()O
@f
RELIEFUL Lenticulara
Dendritic a
Acuminat
Ombilicat
Papilat
MARGINILE
invazive
intregi D Ondulat-
~Filamentoase
~Erodate
D
L:s
Ondulate
Lobate
107
.lrizafii ale suprafeTeiunar colonii pot fi surprinse in anumite unghiuri de iluminare.
Culoarea eoloniilorpoate fi alba, galbena, aurie, neagra etc. in funqie de varietatea
pigmenTilor produ~i sau a virajului de culoare a unar indicatori inclu~i in mediul de
cultura.
Modifidiri ale mediului din jurul eoloniilor pot fi produse de citotoxine, enzime
sau pigmenTi difuzibili:
- Hemoliza pe agar-scmge poate fi de tip:
- Alfa: zona de inverzire a mediului cu numeroase hematii intacte din cauza
hemolizei parriale.
- Beta: zona complet clara, incolora, din cauza hemolizei complete.
- Alfa-prim: halou de hemoliza incompleta cu inverzire, imediat inconjurat cu 0
zona de hemoliza clara, completa.
- Gamma, de fapt un atribut impropriu, pentru ca indica absenTa hemolizei.
Denumirea se refera la coloniile streptococilor nehemolitici.
- Cald-rece: zona clara de hemoliza completa (aparuta dupa incubare la 37C)
inconjurata cu 0 zona de hemoliza mai puTin clara, dar lara modificare de culoare a
mediului (aparuta dupa incubarea in continuare la temperatura camerei sau la frigider).
- Reae{ii pe medii diferenfiale zaharate: virajul de culoare a mediului ~i
culoarea coloniilor in functie de indicatorii de pH ~i fermentarea sau nefermentarea
substratului.
- Reacfii pe lnediul eu giilbenu!j de ou:
- Lecitinaza: precipitat opac in jurul coloniilor.
- Lipaza: film circular cu irizaTie perlata in imediata vecinatate a coloniilor.
- ProteoIiza: clarificarea mediului din jurul coloniilor.
- Pigmentogeneza. Pigmentii hidrosolubili difuzeaza ~icolareaza progresiv mediul:
fluoresceina, piocianina, melanina. Revezi mai sus culoarea coloniilor.
Mirosul degajat de eultura anumitar izolate poate fi semnificativ:
- PseudolllOnas aeruginosa: aroma asemanatoare florilor de iasomie.
- Proteus: ~ocolata arsa.
- Clostridii: putrid, fecaloid, de corn ars.
- Prevotella melaninogeniea: acru.
- Nocardiile ~i streptomicetele: de subsol mucegait.
Consistenfa coloniilor poate fi untoasa, mucoasa-filanta, a albu~ului de ou bine
batut spuma, friabila, cretoasa, pasloasa, pieloasa.
Aderen(a la mediu: neaderente (antrenate de ansa aluneca pe suprafata mediului),
puTin aderente, aderente, incastrate in mediu.
108
..
Afinitatea tinctoriaUi (reactii de culoare) deteffilinata prin colorariile diferenriale
Gram, care imparte bacteriile in gram-pozitive (violete), gram-negative (ro~i) ~i gram-
variabile, colora!ia Ziel-Neelsen (sau coloratii inrudite), care impart bacteriile in aeido-
rezistente (ro~ii) ~ineacido-rezistente (albastre).
Circumstan!ele izolarii, caracterele de cultura ~imicroscopice pennit 0 identificare
precoce a unor bacterii, utila pentru decizia terapeutica inainte de identificarea speeiei ~i
de antibiograma. E. g., izolarea, din hemoculturi sau exsudate seroase ori puroi aspirat
prin punc!ie, a unor coci gram-pozitivi a~ezati in ciorchini, care fomleaza colonii mari,
bombate, opace, galben-aurii, ~-hel110litice, eu consisten!a untoasa sugereaza un Staphy-
lococcus; izolarea dintr-un exsudat a unor coei gral11-pozitivi a~ezari in lanturi, care
formeaza colonii miei, transparente, cu 0 zona larga de b-hemoliza sugereaza un Strepto-
coccus.
Regulat recurgem la colora!ia Gram. Colora!ii pentru baeteriile acido-rezistente
sunt utile in circumstante clinice care sugereaza prezenta unor asemenea baeterii (infectii
granulomatoase eronice etc.).
Pentru a simplifica descrierea ~i inregistrarea caracterelor morfotinctoriale ale
bacteriilor sugeram umlatoarele categorii microscopice mai freevent izolate sau observate
in prelevate patologice:
1) Actinomicete: bacterii filamentoase, ramifieate, gram-pozitive, cu aspeete de
pseudo-hife intre!esute in pseduo-micelii laxe. La efectuarea frotiului prinmi~cari brutale
ale ansei, pseudo-hifele se pot fragmenta in fonne bacilare difterimorfe.
2) Bacillus: bacili aerobi gram-pozitivi, unii miei (0,5/1,2 /lm), al!ii mari (2,5/1 /lm),
cu capete rotunjite sau retezate drept, izola!i sau fonmlnd lanfliri lungi; poarta cate un
endospor, mai frecvent oval (dar la unele specii pot fi ~i sferici) central sau subtermina],
care mai frecvent nu defoffileaza sporangiul (dar la unele specii i1pot defoffila). Sporangiul
apare unifoml colorat sau vacuolar. Speciile de Bacillus morfologic asemanatoare eu
Bacillus anthracis (bacili gram-pozitivi mari, cu capetele retezate, inliintuiti ~i cu spor
central, oval, care nu defonneaza sporangiul) Ie numim uzual bacili antracoizi.
3) Bacteroidacee: bacili anaerobi, gral11-negativi, nesporulati, drepti, ineurbati sau
helieoizi, polimorfi.
4) Clostridii: bacili anaerobi, gram-pozitivi sau gram-variabili, cu lungimi variate
pana la forme filamentoase, cu capetele rotunjite, ascutite sauboante, izolati, in pereehi
sau formand scurte lanfliri; pomia cate un endospor oval sau sferic, care, uzual, defol111eaZa
bacilu!.
5) Corinebacteriile (bacili difterimorfi): bacili maciucati, frecvent gram-variabili
cu granulatii metacromatice polare, a~ezati in palisate ~ilitere unghiulare (aspect de litere
ehineze~ti).
6) Enterobacteriacee: bacili gram-negativi, ocazional colorati bipolar, mai frecvent
mari (0,3-1/1-6,0 /lm), cu capetele rotunj ite, izola!i, ocazional a~ezati in perechi.
7) Hemojili: mici bacili polimorfi (fonne cocobacilare pana la filamentoase) gram-
negativi, aerobi: cultiva dependent de prezen!a factorilor X ~i V.
8) Neisserii: diplococi gram-negativi, renifol111isau in boabe de cafea. '
9) Pneumoeoei: diplococi gram-pozitivi, ovali sau in flacarii de lumanare, capsulari
in prelevatele patologice.
10) Pseudomonade: bacili gram-negativi fini, drePti sau u~or incurbati.
II) Stajiloeoci: coci sferici, gram-pozitivi, a~ezati in ciorchini, eventual in perechi
sau izolati.
12) Streptoeoci: coci gram-pozitivi, sferici sau ovali, a~ezati in perechi ~i lanruri.
13) Bacii aeido-rezisten{i.
Predicria acestor categorii microscopice penttll bacteriile dintr-un anumit gen este
maximala la bacilii acido-rezistenti, c10stridii ~i Bacillus, stafilococi, streptococi ~i
neisserii, dar scade la 0,8 pentru pseudomonade, la 0,63 pentru enterobacteriacee ~i la
0,44 pentl1l bacteroidacee sau Haemophilus.
III
Al doilea cuvant este un epitet specific descriptiv pentru specie ~i scris cu litera
mica. El poate fi un adjectiv acordat cu numele genului (Staphylococcus aureus, 0 specie
de Staph:vlococcus care produce pigment auriu), un substantiv la genitiv (Mycobacte-
rium chelonae, 0 specie de Mycobacterium gazduita de broa~te !estoase), un nume propriu
la genitiv (Rickettsia prmvazekii, 0 specie de Rickettsia numita in memoria bacteriologului
gem1an Stanislas von Prowazek rapus de tifosul exantematic pe care 11studia).
Cand intr-un text numele genului se repeta, poate fi prescrutat prin ini!iala, daca
aceasta nu creeaza confuzii (Staphylococcus aureus, S. epidermidis, S. capitis ~.a.).
Identificarea unei bacterii numai pana la nivel de gen este men!ionata prin numele
genului urmat de abrevierea spp., 0 specie a genului.
Sufixe diferen!iate latinizeaza numele familiilor (-aceae, Enterobacteriaceae),
ordinelor (-ales, Spirochaetales) sau clasele (-es, Mollicutes).
Observa!i ca numele ~tiin!ifice ale taxonilor biologici sunt scrise cu caractere italice,
iar numele taxonilor de rang superior, incepand cu genul, sunt scrise cu litera initiala
majuscula. in activitatea curenta, nu in documente oficiale (e.g., buletine de analiza
microbiologica) ori texte academice, put em folosi denumiri comune, acceptate prin
consens: meningococ = Neisseria In en ingitidis, bacilullui Koch = Mycobacterium tu-
berculosis, specie descoperita de Robert Koch.
(3) Identificarea este, in esen!a, utilizarea practidi a schemei de clasificare.
Cheile dihotomice de identificare nu sunt "sisteme de c1asificare", ci instrumente
de analiza antitetica: pun intrebari la care raspunsul este DA sau NU. Aceasta u~ureaza
mult compararea caracterelor unei tulpini necunoscute ell cele ale unei specii tip conservata
intr-o coleqie. Cheile dihotomice sunt utile la identificarea preliminara a unei bacterii,
dnd examinihn caractere foarte stabile genetic la grupe mari de bacterii, cum ar fi caractere
microscopice, producerea de catalaza, de oxidaza etc. (e.g., un coc gram-pozitiv catalazo-
pozitiv poate fi Staphylococcus, Micrococcus, dar niciodata Streptococcus). ldentificarea
speciilor prin ehei dihotomice expune insa la erori: un singur earaeter inconstant prezent
sau 0 eroare analitica denatureaza toate etapele ulterioare ale algoritmului de identifieare.
Taxonomia numeridi este metoda de identificare celmai larg folosita in prezent.
Schemele de elasifieare numeriea se bazeaza pe un mare numar de caraetere taxonomice
(in jur de 100). Computerul grupeaza tulpinile pe baza freeven!ei cu care exprima
earacterele fenotipiee. Nivelul uzual prestabilit de similaritate globala este de eel putin
80%. Cu aeeste date este eonstruita 0 matriee de treeven!a ea tem1en de comparatie
pentru identifiearea tulpinilor neeunoscute. Deci, in locul speciei tip, reale, taxonomia
numeric a ofera ca tennen de compara!ie 0 abstrac!ie numerica, matricea de frecventa.
Sinonime sugestive pentru taxonomia numerica sunt: taxonomia computerizata,
taxometrica sau fenetica.
Grupari infraspecifice (subtiparea) ~i aplicatiile lor. Frecvent, in cadrul speciilor
microbiene sunt delimitate grupari infraspecifice (variante) definite antigenic (serovar),
prin activitatea biochimica (biovar), prin sensibilitatea la anumi!i bacteriofagi (lizovar)
~.a.m.d. Ocazional folosim ~i denumirea fonnata prin sufixul -tip: serotip, biotip, lizotip
etc. Gruparile infraspecifice pot fi utili marcheri epidemiologici prin care um1arim filia!ia
cazurilor intr-o epidemie.
112
Valoarea unui sistem de subtipare este masurata prin capacitatea discriminatorie ~i
fiabilitate.
Discriminarea. Un marcher are putere de discriminare cu atat mai mare cu cat
permite repartizarea microorganismului studiat intr-un mare numar de tipuri dintre care
nici unul nu este foarte raspandit. Capacitatea discriminatorie redusa a unui marcher
epidemiologic expuse la rezultate fals pozitive.
Piabilitatea depinde de stabilitatea genetica a caracterului marcher. Lipsa de
fiabilitate are efect opus capacita!ii discriminatorii reduse: rezultate fals negative. Probcibil
nici unul din sistemele clasice de subtipare nu este total fiabil.
Biologia moleculara ne ofera acum sisteme de subtipare cu excelenta capacitate
discriminatorie ~imare fiabilitate: e.g., analiza profilului plasmidic, digestia endonucleazica
de restric!ie a ADN cromosomal sau plasmidic, electroforeza in camp pulsatil ~i electro-
foreza enzimatica multiloculara, ribotipia ~ianaliza prin amplificare genica a fragmentelor
rezultate dupa digestia ADN cu endonucleaze de restric!ie, amplificarea ADN polimorf,
secventierea ADN etc
Clasificarea organismelor procariote a fost insa grevata de dificultati din care
re!inem:
- numarul redus de caractere morfologice ~i insuficien!a amprentelor fosile, care
reflecta filogenia;
- nu poate fi studiat un individ, ci 0 populatie bacteriana;
- aparitia frecventa in populatiile bacteriene a unor variante genetice, care, sub
presiunea selectiva a factorilor de mediu, pot genera clone diferite numai prin unele
caractere de popula!ia parentala ~i care nu altereaza apartenenta la specie;
- inmultirea exclusiv vegetativa face dificil de recunoscut discontinuitatile in
evolutia divergenta a unei populatii procariote.
Populapa este 0 multime de indivizi ai unei specii care habiteaza un anumit biotop.
Populatii ale aceleia~i specii pot sa difere intre ele prin caractere selectate sub presiunea
factorilor de mediu proprii diverselor biotopuri (nutrien!i, factori antimicrobieni etc.).
Biotopul este 0 portiune de spatiu, cu conditii de viata particulare, populata ~i
transfonnata de un ansamblu de organisme vii care constituie 0 biocenoza.
Clona este 0 popula!ie care rezulta dintr-o singura celula prin inmultire vegetativa.
Tulpina microbiana este 0 populatie a unei specii constituita din descendentii
unei singure izolari in cultura pura, pe care microbiologul 0 manipuleaza in scopul
studierii.
In contextul conturat, specia bacteliana ar putea fi privita doar ca 0 grupare de tulpini
cu multe caractere fenotipice comune prin care difera semnificativ de alte tulpini. Acesta
este insa motivul pentru care clasificarea bacteriilor a fost supusa unor repetate remanieri.
Exceptand utilizarea sondelor de acizi nucleici sau reactiile de amplificare genic a
(vezi Cap. 26), tehnicile taxonomice l110demedepa~esc necesitatile microbiologiei clinice,
unde microbiologul recurge in continuare la studiul caracterelor fenotipice, dar, ca ten11en
de referinta, folose~te noile clasificari tot mai apropiate de clasificarea natural a a
microorganismelor.
113
La 0 tulpina care nu a fost inca identificata, ne referim cu denumirea de "izola1";
dupa identificarea genului, pana la identificarea speciei, ne referim cu numele genului
Ulmat de abrevierea sp. (de la specie, 0 specie a genului; e. g., Staphylococcus sp.).
Pentru identificarea bacteriilor, analiza caracterelor fenotipice studiate poate fi
Ia.cuta prin doua metode: secventiala ~i simultana.
Metoda secventiala utilizeaza chei dichotomice, instrumente de analiza antitetica:
pun intrebiiri la care raspunsul este DA sau NU. Caracterele cheie pozitive devin markeri
sau caractere de diagnostic de la care pomesc alte asemenea intrebari pana la incadrarea
bacteriei in specie.
Metoda simultana studiaza toate cracterele unui organism necunoscut, iar unitatea
taxonomica este stabilita prin comparatie cu tabele de identificare.
Desigur, arice test pentru depistarea caracterelor fenotipice are 0 anumitii
reproductibilitate legata de calitatea reactivilor, experienta personalului ~.a. Un rezultat
fals pozitiv sau fals negativ duce mai frecvent la identificari eronate prin metoda secventiala
(mai ales cand eroarea se produce in secventele initiale) decat prin metoda simultana. Dar
metoda secventiala are avantajul incontestabil al comparatiilor rapide, operative. De aceea.
la sugestia lui S. T. Cowan, recomandam 0 conduita eclectica bazata pe controlul riguros
de calitate a testarilor, mai ales in etapa secventiala (vezi Cap. 28-38; 40, 41).
114
b) Calea fenl1entativa: calea acida mixta (testulla ro~umetil) sau calea butilenglicolica
(testul Voges-Proskauer).
c) Spectrul fenl1entativ al carbohidratilor.
Utilizarea unei anumite surse de carbon: citrat, acetat, malonat.
Actiunea asupra compu~ilor azotati: decarboxilarea sau dezaminarea
aminoacizilor, producerea de indol, de hidrogen sulfurat, hidroliza ureei, a hipuratului.
Hidroliza unor sub stante biologice complexe prin producere de proteinaze, 1ipaze,
fosfolipaze, dezoxiribonucleaze, hidroliza amidonului etc.
Sensibilitatea sau toleranta la agentifizici sau chimici:
Sensibilitatea la diferite temperaturi.
T01eranta la conditii extreme de pH, salinitate, bila .
Sensibilitatea la optochin, la bacitracina etc.
Indicatiile, principiul, mediile de cultura, procedura, interpretarea ~i controlul de
calitate al acestor teste sunt detaliate in Cap. 39 ~i 40.
Frecvent, In cadrul speciilor microbiene se delimiteaza taxoni infraspecifici
(variante) definiti antigenic (serovar), prin sensibilitatea la anumiti bacteriofagi (Iizovar),
activitatea biochimica (biovar). Taxonii infraspecifici pot fi utiliza$i ca markeri
epidemiologici. In microbiologia clinica ne limitam la identificarea antibio-varurilor
(antibiograma, rezistograma)$i, uneori, la identificarea serovarurilor unor specii sau a
un or caractere particulare de patogenitate (toxigeneza, capacitati entero-invazive).
5.4.INREGISTRAREA REZULTATELOR
115
Ziua 1: ADCL (ADCL = agar dezoxicholat lactoza);
(a) +++3 mm, L - cu centru negru;
(b) ++2 mm, L - eu centru brun;
(c) + 3 mm, L +.
Repicare din bulion selenit pe ADCL.
(a) 1, (a) 2; (b) 1, (b) 2 repicari pe AABTL, TSI, MILF
(AABTL = agar albastru de brom-timollaetoza;
TSI = mediu politop: triple sugar iron:
MILF = me diu politop: mobilitate, indol, lizindeearboxilaza, feniJalanin-
dezaminaza).
--
, 2 +A+(b)+(b)
+2 12 -
+
Ziua AG AG
(a) (a) 1 +-
AG +; +.
a:la grup
Hd: D:
Glucoza
ri anti-Salmonella: 612 (b) 2: anti-Salmonella polivalent:
Ziua 1: AS/02;
a) ++++ 2 mm, rotunde, bombate, galbene, ~-hemolitice; gram-pozitivi,
stafilococi;
b) + 1 mm, rotunde, bombate, albe, nehemolitice; gram-pozitiv,
stafilococi.
a) Coagulaza: pozitiva.
116
6. CUANTIFICAREA MICROORGANISMELOR
(DUMITRU BUlUC)
117
Necesar:
1) Tuburi 16/160 mm ~i stativ pentru tuburi.
2) Pipete gradate sterile: una de 10 mL ~i mai multe pipete de 1 mL, in raport cu
numarul dorit de dilutii.
3) Diluant steril: apa peptonata 0, I %.
4) Tuburi cu 10 mL mediu agarizat.
5) Placi Petri cu diametrul de 9 em.
Exigen{e:
1) Evita utilizarea apei distil ate sau a solutiei saline izotone ca diluant; pot fi letale
pentru unele bacterii. Cel mai bun diluant pentru uz general este apa peptonata 0, 1%, iar
pentru omogenizarea ~i diluarea probelor biopsice bulionul tioglicolat.
2) Echilibreaza diluantulla temperatura camerei pentru a evita moartea unar bacterii
prin ~oc tennic in diluant la temperatura frigiderului.
3) Utilizeaza pipete foarte curate pentru a evita adsorbtia bacteriilor pe il11puritatile
de pe pipeta; pipetele silieonate sunt l11aibune.
4) Verifica dad varful pipetei este intreg ~i nu utiliza pipete ciobite sau cu varful
reracut.
5) Pipeteaza cu pipeta in pozitie vertical a ~i observa meniscul fluidului eu raza
vederii orizontala.
6) Evita riscurile ~i erorile cauzate de fonnarea bulelor de aer, preeum ~i pipctarea
rapida, brutala, cand se fonneaza mai multi aerosoli ~i pana la 0, I mL fluid pot ral11ane
pe pipeta.
Proceduri:
Indiferent de tehniea aleasa, procedura incepe cu pregatirea dilutiilor. Pentru
aeeasta, cu pipeta de 10 mL, repartizeaza cate 9 mL diluant in tuburi sterile. Tuburile
cu capac in~urubat pot fi apoi autoclavate ~i eonservate la frigider. Daca folose~ti
dopuri din bUl11bacsau eu capac din aluminiu aplieat, repartizeaza aseptic diluantul
steril ~i folose~te tuburile imediat; ~i autoclavarea, ~i conservarea la frigider modifiea
in aeeste cazuri volumul de diluant .
118
5) Procedeaza in continuare ca la punctul (4) pentru a trasnvaza, cu 0 noua pipeta,
1 mL din tubul 2 In tubul 3 ~. a. m. d. confonn tabelului 6-1.
Tabclll16-1
Daca greutatea probei este foarte mica ~ivolumul dilutiei 10.1 nu pennite 0 pipetare
exacta, se poate proceda la omogenizare cu ob!inerea unei dilu!ii ini!iale mai mari.
A) Numiiriitoarea npliici turnate este tehnica de referinta.
1) Tope~te mediul agarizat necesar ~i race~te tuburile la 45C in baie de apa.
2) Marcheaza In acest timp minimum doua pHici Petri per dilutie,
3) Pipeteaza in centrul fiecarei placi cate ImL dilu!ie folosind numai pipeta dilutiei
respective mentinuta in tub. Mai corectii este folosirea pentru fiecare dilutie unei pipete
noi, dar consumul de material devine excesiv. Mentine ridicat capacul placii numai
intervalul strict necesar pipetarii.
4) Toama imediat mediul de culturii dintr-un tub ~i agita u~or placa, prin mi~cari
circulare intr-un diametru de cca 15 cm, de care ori in sens orar ~i anti-orar, apoi de 6 ori
inainte ~i Inapoi pe distanta de cca 15 cm,
5) Lasa mediul sa se gelifice, apoi incubeaza pHicile, cu capaculln jos, 24-48 de
ore la temperatura favorabilii cre~terii.
6) Minimizeaza eroarea, selectand pentru numiiriitoare placile insamc1n!ate Cll
dilutii1e din care s-au dezvoltat Intre 30 ~i 300 de colonii. Plaseaza placa Tara capac, Cll
119
stic1a in sus, pe caroiajul de numarare, bine iluminat prin transparenta ~i, sub lupa,
marcheaza cu creionul de scris pe stic1a fiecare colonie reperata, Folosirea in acest scop
a unui contor de mfma este mai comoda.
Daca nici una din dilutii nu a dat mai putin de 300 colonii, alege placile insamantate
cu dilutia cea mai mare, imparte placa in patrimi sau optimi ~inumara coloniile dintr-un
sector. Pentru calcul multiplica numarul obtinut cu totalul sectoarelor per placa.
7) Calculeaza numarul mediu de colonii dezvoltate per placa la 0 anumita dilutie.
Numarul unitatilor fonnatoare de colonii/mL este egal cu produsul dintre numarul mediu
al coloniilor per placa ~i inversul dilutiei insamantate.
B) Numararea dupa epuizare pe suprafafa mediului este mai putin exacta, dar
satisface exigentele clinice pentru uroculturi, care confrunta laboratorul cu un mare numar
de probe ~i impun diferentierea izolatelor dintr-o proM dupa aspectul coloniilor. Or, la
numararea in placa tumata, coloniile aceleia~i bacterii pot avea trei aspecte, dupa cum
s-au dezvoltat pe suprafata mediului, in profunzime sau intre mediul de cultura ~i sticla.
1) Depune cu micropipeta 0,1 mL dilutie a suspensiei microbiene in centrul unei
placi Petri cu suprafata mediului bine uscata.
2) Disperseaza unifonn inoculul cu etalorul de sticla steril prin mi~cari de du-te -
vino in timp ce rote~ti placa. Se poate folosi ca etalor ~i capilarul inchis al unei pipete
Pasteur cudat in crosa. In final descrie cu etalorul 0 mi~care continua pe circumferinta
plficii pentru a nu lasa acumulari de lichid la acest nive!.
3) Mentine placile cu capacul intredeschis cca 0 ora la 37C pentru adsorbtia
inoculului, apoi incubeaza-le cu capacul injos ~i numara coloniile.
4) Calculeaza unitatile fonnatoare de colonii dupa fonnula:
D
X=Nx vo 1umu l~lllsamantat
~ -~--,
unde:
X = numarul unitiitilor fom1atoare de colonii/mL;
N = numiirul coloniilor per placii;
D = inversul dilutieL
Pentru economie de materiale, la efectuarea curentii a uroculturilor cantitative,
cand unnarim numai un anumit prag ~i un ordin de marime al concentratiei bacteriene
din proba, ne putem rezuma la insamantarea numai a dilutiei 10-2
C) Numararea coloniilor din picatura. Metoda MILES ~iMISRA este larg indicata
pentru testarea calitatii mediilor de cultura ~i capacitatii bactericide a substantelor
antimicrobiene.
1) Usucii bine suprafata pliicilor timp de 30 minute la 37C ~i marcheazii distinct
sectoare pentru fiecare piciiturii.
2) Depune cate 20 mL din fiecare dilutie pe cel putin cinci sectoare (fig. 6-1).
Pentru aceasta tine pipeta vertical, cu viirfulla cca 2 cm de suprafata mediului (evita
raspandirea de stropi la impactul tluidului cu mediu).
3) Mentine pliicile cu capacul in sus pana la uscarea picaturilor, apoi intoarce pliicile
cu capacul in jos pentru incubare.
120
Fig. 6-1. Depunerea piditurilor in seetoare 10 _1
pe pladi en agar nutritiv pentru euantifiearea
baeteriilor prin metoda Miles ~iMisra.
10 - .
121
1 2 3
Insamantarea a doua plaei, una eu ansa de 0,00 I mL ~ieealaIta ell ansa de 0,0 I mL,
poate servi drept control de ealitate.
5) Ineubeaza plaeile ~i, a doua zi, numara eoloniile dezvoItate.
6) Numarul UFC/l11L suspensie testata rezulta din inl11ultirea eu I 000 (la
insamantarea eu ansa de 0,001 mL) sau 100 (ansa de O,OlmL) a numarului de eolonii
obtinute.
Exigen{ele vizeaza: manipularea ansei la prelevarea inoeulului din proM ~ieontrolul
ealibrului ansei, l11aiales al eelor reutilizabile.
Varia{iile volumului prelevat sunt mai mari eu ansele de 0,00 ImL. La prelevari ell
ansa in pozitie vertieala erorile sunt de 50% ~i tind sa fie in minus la prelevarea din
volume l11ieide suspensie. Erorile sunt in plus eand ansa este manipulata oblie: pana la
150% din volul11ul nominal pentru un unghi de 45.
in cazul anselOl- calibrate reutilizabile:
I) Folose~te ansa numai pentru euantifieari.
2) Dupa fieeare utilizare eHite~teansa eu apa distilata ~iverifiea sa nu retina mate-
rial earbonizat.
3) Zilnie, verifiea sub lupa daea nu s-a deformat.
4) Verifiea lunar ealibrul ansei prin metoda eolorimetrarii dilutiei de colorant:
Prepara 0 solutie 0,75% de albastru Evans, filtreaz-o prin hartie Whatman nr. 40.
Pastreaza aeeasta solutie stoe la temperatura eamerei in flacon ennetic inchis.
Prepara cat mai exact di1utii 1 : 500, I : I 000, 1 : 2 000 ~i 1 : 4 000 ale soluriei
stoe in apa distilata. Detem1ina speetrofotometrie la 600 nm densitatea optiea a fieearei
dilutii ~i traseaza 0 eurba liniara de referinta eu densitatile optiee obtinute.
Transvazeaza 10 anse din solutia stoe in 10 mL apa distilata. Clate~te in apa
distilata ~i arde ansa inainte de fieeare prelevare a solutiei stoe.
Coloril11etreazadilutia obtinuta. Densitatea optic a detenninata speetrofotometrie,
a aeestei solutii trebuie sa eorespunda, pentru ansa de 0,001l11L, dilutiei de 1 : I 000 a
122
solutiei stoc 20%. In caz contrar, ansa trebuie inlocuita,
recalibrata, sau trebuie tacuta corectia eorespunzatoare la
cuantificarea UFC.
Frecvent in mierobiologia cliniea suntem insa
confruntati cu necesitatea stabilirii economice a unui anume
prag cantitativ la un mare numar de probe (e. g., 105 UFC/mL
in urocultura probelor dinjetul mijlociu). In acest caz dispersia
inoculului se poate face cu ansa calibrata de 0,001 mL numai
!~
pe 1/4 din suprafata placii cu diametrul de 9 cm, dar In cazul Fig. 6-3. Epuizarea ino-
eulului eu ansii ealibratii
suspensiilor bacteriene dense metoda poate sa ramana utila de 0,001 numai pe 1/4 din
exclusiv pentru stabilirea acestui prag, tara relatii cantitative suprafata unei pliici Petri
este 0 metodii eeonomieii de
mai exacte (fig. 6-3).
stabilire a unui anume prag
cantitativ, fiirii a asigura
insii cuantifiearea unor
6.2. METODA NEFELOMETRICA.
suspensii baeteriene dense.
3
121I
Nr. etalonu1ui
218
59.9
24
30
15
7
6
8
4 230
90,4
9.8
9.0
9.5
9.6
9.1
27
0,8
9.2
0.1
0.9
9,7
9,4
0.7
0,5
1.0
0,6
9,3
0,2
0,3 0.05
0.5
9.95
1,5
aproximativa
Procedura
1) Efeetueaza suspensia bacteriana intr-un tub similar eu ale etaloanelor.
2) Plaseaza tubul in fata unui text tiparit cu caractere negre bine imprimate. Adu,
pe rand, etaloanele pana dnd clarita tea cu care se observa earacterele prin cele doua
tuburi este identica. Acest etalon aproximeaza concentra!ia bacteriana a suspensiei.
Lumina, alba, suficient de intensa ~iunifonna, trebuie sa vina din spatele observatorului ~i
sa traverseze sub aceea~i incidenta tuburile.
123
;000
000
Fig. 6-4. Folosirea comparatorului Walpole
pentru determinarea concentratiei bacteriene
dintr-o cultura in bulion; dispunerea tuburilor:
(4) cultura in bulion nutritiv;(3) apa distilata:
(1), (5) etaloane; (2), (6) bulion nutritiv din low I
folosit pentru cultivarea bacteriei.
l::>
",.-~.. , ,
'."', I
Xl
.D
-<6
( 10 '\~ (~': \
\
-
..... ....
' \ "
'\ __ .','
I I,
"'. ~.. '
. "
~
u::
(;'(-- ----7:\-- n_
,,/>!J 8 I.J
3) Pentru a ajunge la 0 anumita densitate, alege etalonul eorespunzi'itor ~idilueaza
sau concentreaza suspensia pfma la egalizarea opacita!ilor.
Daea suspensia bacteriana este 0 eultura in bulion, pentru comparare corecta,
plaseaza cultura, etaloanele, un tub eu apa distilata ~i tuburi eu bulion martor intr-un
comparator Walpole eonfonn sehemei din figura 6-4. Observa tuburile prin transparenta,
privind prin perechile de orificii 7-10, 8-11 ~i 9-12, In fata unei surse de lumina alba,
unifonna eu 0 sarma neagra interpusa de-a lungul filtrului.
7. TEHNICI BAZATE PE STUDIUL ACIZILORNUCLEICI
UTILIZATE INDIAGNOSTICUL SI SUPRAVEGHEREA
MICROBIOLOGICA A BOLILORINFECTIOASE
MARlA DAMIAN
7.1. INTRODUCERE 7.3.1. Profilul plasmidic
7.2. METODE GENETICE UTILlZATE 7.3.1.1. Profilul de restriqie enzimatica a ADN
IN DlAGNOSTlCUL MICROBIO- plasmidic
LOGIC 7.3.2. Analiza fragmentelor de restrictie (res-
7.2.1. Izolarea ~i purificarea acizilor nucleici triction fragments lenght polymor-
7.2.2. Transformarea geneticii phism-RFLP)
7.2.3. Amplificarea genicii 7.3.2.1. Ribotipia
7.2.3.1. Clonarea
7.3.2.2. Profilul demacrorestric~e in camp pulsator
7.2.3.2. Amplificarea enzimatica in lant (poly- 7.3.3. Metode bazate pe analiza peR
merase chain reaction- PCR)
7.3.3.1. RAPD (Random amplified polymol1)hic
7.2.3.2.1. Electroforeza in gel de agaroza DNA)
7.2.3.2.2. Tipuri de metode PCR. 7.3.3.2. PCR- RFLP
7.2.4. Hibridizarea molecularii
7.3.3.3. Rep- PCR
7.2.4.1. Hibridizarea in solutie
7.3.3.4. PCR-hibridizare
7.2.4.2. Hibridizarea pe membrana
7.3.3.5. PCR-secventiere
7.2.5. Secventierea
7.3.3.6. MLST (Multilocus Sequence Typing)
7.2.5.1. Secventiereaautomata
7.2.5.2. Pyrosecventierea 7.3.3.7. AFLP (Amplified Fragment Lenght Poly-
7.2.6. Microchips (microarray) m01])hism)
7.3. METODE GENETICE UTILlZATE IN 7.4. CONTROLUL DE CAll TATE IN LA-
SUPRAVEGHEREA MICROBIOLO- BORATORUL DE MICROBIOLO-
GICA GIE MOLECULARA
7.1. INTRODUCERE
125
scop descifrarea infoffi1atiei genetice utilizabilii in studii taxonomice ~i/sau epidel11iologice
precum ~i in instituirea unor strategii de prevenire ~i control al infectiilor l11icrobiene.
Utilizand aceste metode au fost definite taxospeciile, care grupeaza tulpini
microbiene cu proprietati fenotipice similare, ~igenospeciile, tulpini care prezinta 0 inalta
omologie in secventa acizilor nucleici.
Avantajele oferite de studiul acizilor nucleici (u~urinta cu care sunt extra~i ~i
purificati, strategii COl11unede abordare a studiului, indiferent de sursa de izolare a
acestora, rapiditatea ~ispecificitatea diagnosticului, in cazul infectiilor produse de gel1l1eni
greu cultivabili sau ne cultivabili, etc.) impun metodele genetice de analiza, ca l11etode
uzuale in laboratoarele de diagnostic ~i epidemiologie (Tabelul 7-1).
Producerea unor evenimente genetice in regiuni inalt conservate conduce la
variabilitatea tulpinilor in cadrul speciei, evidentierea lor constituind l11arkeri genetici
utili in subtiparea tulpinilor.
Elel11entele genetice mobile, cu rol in 1110dificareastructurii genol11ice (plasmide,
bacteriofagi, transpozoni), genele responsabile de sinteza factorilor de virulenta,
secventele de insertie, regiunile repetitive (direct sau invers repetate), genele responsabile
de rezistenta la antibiotice, l11utatiilepunctifonne, mutatiile in regiunile inalt conservate
ale genol11ului bacterian, deletii1e, inversiile, etc, sunt structurile genetice tinta utilizate
in diagnosticull11olecular all11icroorganismelor patogene.
Tabe11l17-1
126
Existenta unor biinci de date privind genomul complet al principalelor entitati im-
plicate in patologia infectioasa (Salmonella, E. coli, COlynebacterium, i.1ycobacte-
rium, Haemophilus, Pseudomonas, Toxoplasma, HPV, HIV, HCV, HVB, influenza/
SARS) a permis dezvoltarea unor metode standardizate de analiza m oleculara, uti lizand
kituri comerciale ~i aparatura dedicata, astfel incat rezultatele obtinute sa poata fi
comparate ~i validate.
Etapele reactiei
1. Liza celulara se poate realiza mecanic, (prin ultrasonare sau spargere cu bile de
sticla), tennic, chimic sau enzimatic.
2. In funcrie de analiza genetica care unneaza a fi efectuata, in continuare sc
rcalizeaza sau nu izolarea ~i purificarca acizilor nuclcici. Accasta etapa poatc fi realizata
dupa un protocol clasic, specific pentru tipul de celule bacteriene studiatc (bacterii gram-
pozitive, gram-negative, acido-rezistente, etc) ~i tipul de acizi nucleici necesari studiului
(ADN plasmidic de dimensiuni mari sau mici, ADN cromozomal, ARN de diferite tipuri),
sau cu kituri comerciale specifice pentru fiecare tip de aplicatie.
3. Pi'istrarea acizilor nucleici se realizeaza in solurie (Tris-EDTA sau apa ultra pura),
la -20oe.
117
7.2.2. Transformarea geneticii
Amplificarea este definita prin cre~terea numarului de c6pii ale unor fragmente de
acizi nucleici de interes. Aceasta se poate realiza prin experimente de clonare ~i prin
amplificare enzimatica in lanr (PCR-polymerase chain reaction).
7.2.3.1. Clonarea consta in introducerea unui fragment de ADN de interes intr-o
celula bacteriana apartinand unui grup taxonomic cu un timp de generarie foarte scurt
(de obicei E. coli), cu scopul de a ob!ine un numar mare de c6pii ale acestuia.
Componentele reactiei
ADN care um1eaza a fi clonat;
Vector de clonare;
Celule bacteriene receptor.
Vectorii de clonare sunt molecule de
ADN care poarta un fragment de ADN strain,
patrund In celula bacteriana receptor ~i se
multiplica odata cu aceasta producand un
numar mare de c6pii. Ace;;tia se caracterizeaZ[l
prin capacitatea de a se autopropaga in celula
bacteriana gazda, prezenta unui situs de
clonare care sa pennita inserarea fragmentuluJ
Fig. 7-1. Transformarea genetica la tulpini
de Acinetobacter sp. de ADN strain ~i a unui marker de seleqie.
B, C, D, E: tuJpini de Acinetobacter spp. Vectorii de clonare utilizari in bacteriologie
A, F: tulpini apartimlnd altar genuri. pot fi plasmide (ADN extracTOmozoma] care
128
se replica autonom), fagi (molecule de ADN linear din bacteriofagi lambda), cosmide
(molecule de ADN extracromozomal cu proprietati de plasmide $i fagi), cromozomi
bacterieni artificiali (obtinuti din plasmide F).
Etapele reac!iei
1. Prepararea fragmentu1ui de ADN care mmeaza a fi clonat.
2. Prepararea vectorului de clonare.
3. Inserarea fragmentului de ADN de interes in ADN vector.
4. Introducerea constructului (vector + ADN de interes) in celule bacteriene
receptor.
5. Se1ectatrea celu1elor care contin fragmentul de ADN de interes.
7.2.3.2. Polymerase chain reaction (peR) consta in amplificarea exponentiala a
unei regiuni de interes medical din genomul bacterian. Reactia se desfa$oara dupa modelul
replicarii naturale a ADN.
Componentele reactiei
ADN matrita, constituit din molecule de ADN care contin fragmentul de interes
medical care lli1neaza a fi amplificat. De cele mai multe ori, cand se Um1are$teidentificarea
prin PCR a unei regiuni genomice de interes in patologia infectioasa, liza celulara tem1ica,
prin inca1zirea suspensiei bacteriene la 100C timp de 10 minute, este suficienta pentru a
pune 1a dispozitia reactiei ADN de cercetat. Cand produsul de amplificare genidi este
utilizat in experimente ulterioare, se impune purificarea ADN, dupa un protocol clasic cu
fenol/clorofonnJa1cool izoamilic $i precipitare cu alcool etilic absolut sau utilizand kituri
comerciale, special concepute pentru purificare ADN in vederea PCR.
ADN matrita trebuie sa fie 1iber de uree, SDS, acetat de sodiu, componente ale mediilor de
cultura, inhibitori prezenti in probele bio1ogice.Cantitatea folosita in reactie este de aproximativ
100 ng, cantitati prea mici nefiind suficiente pentru a se obtine un produs de amplificare
vizibi1 pe un gel de agaroza, cantitati prea mari putand sa inhibe reactia.
Primerii (amorsele) sunt fragmente de ADN monocatenar (oligonucleotide)
complementare celor doua capete ale fragmentului care um1eaza a fi amplificat, sintetizate
in 1aborator. Ace$tia sunt elemente crueiale in desfa$urarea reactiei de amplifieare, de
modul in care sunt construiti depinzand amplifiearea fragmentului dorit, eliminarea
amplificarilor nespecifice, cre$terea randamentului reactiei, obtinerea unui produs de calitate
uti1 in experimente ulterioare.
Continutul in G+C al eelor doi primeri trebuie sa fie cuprins intre 40% $i 60%,
foarte apropiat de eel al matritei, cu 0 distributie corespunzatoare a celor patru baze
azotate pe toata lungimea lor, cu cat mai putine repetitii.
Lungimea primeri10r este de 18-25 nucleotide, iar diferenta dintre cei doi primeri
pereche nu trebuie sa fie mai mare de 3 nucleotide.
Secventa primerilor trebuie sa fie eomplementara unei regiuni inalt conservata din
structura regiunii genomice de interes astfel incat eventuale evenimente genetice care ar
putea avea loc la nivelul acesteia (inversii, de1etii, insert,ii, etc) sa nu influenteze rezultatul
reactiei. Nu trebuie sa contina secvente repetate invers sau secvente complementare pe
lungimea lor mai mari de 3 nucleotide pentru a preveni formarea de structuri in ae de par
(hairpin structures). Seeventa lor trebuie astfel selectata incat in capatul 3' sa se tennine
cu C sau G.
129
Primerii pereche nu trebuie sa fie complementari in capatul 3' pentru a preveni
formarea dimerilor, iar pe toata lungimea lor complementaritatea sa nu depa~easca 3
baze azotate. Cand se unnare~te detectarea prin PCR a regiunii genomice responsabila
de sinteza unei proteine a carei secventa in amino acizi este cunoscuta, se utilizeaza
primeri degenerati, astfel incat sa poata fi amplificate toate combinatiile de codificare
posibile corespunzatoare cADN.
Pentru a minimaliza problemele legate de secventa primerilor, designul ~iselectatrea
acestora este asistata de calculator, fiind disponibile programe capabile sa propuna
secventele cele mai apropiate parametrilor definiti de utilizator (ex. DNA STAR).
Temperatura de denaturare (Tm' 50% denaturare a hibrizilor) a celor doi primeri
pereche se calculeaza astfel incat sa nu difere cu mai mult de 5C, iar a produsului
amplificat fata de primeri sa nu difere cu mai muIt de 100e. Cand lungimea primerilor
este de 15-20 baze azotate, Tmse caIculeaza dupa Ufmi'itoarea formula:
Tm(in 0c) = 2(A+T) + 4(G+C)
Cand lungimea primerilor este de 14-70 nucleotide, Tm se ca1culeaza dupa
urmatoarea formula:
130
Deoxinucleozid trifosfati (dNTP) necesari pentru alungirea lan!ului de ADN nou
sintetizat. Reac!iile PCRstandard con!in cantita!i echimolare de dATP, dTTP, dCTP ~i
dGTP pentru a evita incorporarile eronate in lanftil de ADN. Intr-o reaqie standard,
realizata in volum de 50 ).11,cu 1,5 mM Mgct, se recomanda a se folosi 200 - 250 ).1M
din fiecare dNTP. 0 cantitate excesiva de dNTP poate conduce la incorporari gre~ite de
nucleotide.
Cationi monovalenti (K+) sunt importan!i pentru randamentul reac!iei. Un PCR
standard confine 50 mM KCI, suficient pentru a amplifica un fragment de ADN lung de
500 baze azotate. 0 cantitate mai mare, de 70 - 100 mM, conduce la 0 cre~tere a
cantita!ii de produs amplificat atunci cand fragmentul este scurt.
Tamponul de reac!ie este necesar pentru men!inerea unui pH in mediul de reaqie
de 8,3 - 8,8, la teperatura ambianta. Reac!iile standard se realizeaza in tampon Tris-HCI,
10 - 50 mM. DMSO poate fi util in unele reaqii in concentra!ie de 3-10%. Cantita!i mai
mari inhibi'i pana la 50% activitatea Taq ADN polimerazei. Gelatina, albumin a serica
bovina sau tween 20 pot fi adaugate in reaqie ca stabilizatori ai enzimei, de~i in multe
protocoale reaqia funqioneaza corect tara acestea.
Etapele reactiei
I. Denaturarea moleculei de ADN de cercetat consta in ruperea legaturilor de H
dintre cele doua lanftiri ale dublului helix. 0 denaturare incompleta poate conduce la
e~uarea reaqiei de amplificare. Denaturarea standard se realizeaza la 95C timp de 30
secunde sau la 97C timp de IS secunde. Cand ADN matri!a este bogat in G+C sunt
necesare temperaturi mai ridicte/timp de denaturare mai mare. Intr-un protocol standard
este inc1usa 0 denaturare ini!iala de 3-5 minute la 95C.
2. Alinierea primerilor la molecula de ADN matri!a se realizeaza pe baza de
complementaritate ~i este dependenta de temperatura de aliniere (Ta), calculata cu 3~5C
sub Tm'Daca temperatura de aliniere este prea ridicata, formarea hibrizilor primer/ADN
matri!a este foarte slaba ~i prin urmare cantitatea de produs amplificat este foarte mica.
Daca temperatura de aliniere este prea scazuta, se produc amplificari nespecifice
(amplificarea altor fragmente decat cele de interes). Optimizarea temperaturii de aliniere
este 0 opera!iune importanta a fiecarui protocol de lucru ~i se realizeaza prin efectuarea
unor reactii
, a carol' temperatura variaza intre 2 si 10C sub T In calculata a celor doi
primeri pereche.
3. Extensia primerilor consta in sinteza unui nou Ian! de ADN pe baza
complementarita!ii cu ADN matri!a. Aceasta se realizeaza la temperatura de 72-78 C,
optima de activitate a Taq ADN polimerazei. In primele doua cicluri de amplificare
fiecare primer se va extinde pana la capatul moleculei matri!a, urmand ca in celelalte
cic1uri extensia sa se realizeze numai pe lungimea fragmentului delimitat de cei doi
primeri. Rata de polimerizare a Taq ADN polimerazei este de 2000 nucleotide/minut,
prin urmare timpul de extensie este stabilit in funqie de lungimea fragmentului care
um1eaza a fi amplificat. In cele mai multe protocoale PCR, ultimul cic1u de amplificare
se deruleaza pe un timp de trei ori mai mare dacat cele anterioare pentru a permite
amplificarea completa a produsului.
4. Numarul de cicluri de amplificare depinde de numarul de copii de ADN prezente
in mediul de reaqie, eficien!a de extensie a primerilor, lungimea fragmentului care
um1eaza a fi ampli ficat. In protocoalele standard sunt necesare cel pu!in 25 cicluri, 30 de
131
eic1uri sunt eel mai frecvent realizate, iar peste 30 de eic1uri se amplifiea numai dupa
optimizarea reactiei. Cand numarul de eicluri depa~e~te limit a eoreeta, In reactie apar
produ~i de amplifieare nespeeifica. Figura 7-2 prezinta desfa~urarea schematica a unei
reaetii de amplifieare enzimatica In lant.
5. Vizualizarea produ~ilor de amplifieare se realizeaza prin eleetroforeza In gel de
agaroza.
3' 5'
-""""'"""---- --,,""'-
5' 3'
3' 5'
a
5' 3'
.
5' 3'
3' 5'
----
_"""
--------~
~ .....
__ ' ..,<-=<~--.c""~._~"'~~
3'
5'
5'
5'
C
-. 5'
3'
4Iii 5'
3'
5' 3'
5' .'.')'
3' 5'
_~.'"~_A~"~_
...~.__;;
-
---.-
5" 3'
132
7.2.3.3. Electroforeza in gel de agaroza
Electroforeza in gel de poliacrilamida $i hibridizarea moleculara sunt metode
utilizate in identificarea produ$ilor de amplificare PCR, dar metoda cea mai utilizata de
separare, identificare $i purificare a acizilor nucleici este electroforeza in gel de agaroza.
Principiul metodei consta in migrarea moleculelor de acizi nucleici, incarcate electric
negativ, intr-un camp electric.
Componentele reactiei
Gelul de agaroza. Moleculele de ADN dublu catenar, lineare, migreaza prin
matricea gelului cu 0 rata invers proportionala cu loglOdin greutatea lor moleculara. Prin
unnare, concentra!ia agarozei este func!ie de lungimea $i confonna!ia fragmentelor de
ADN care urmeaza a fi separate.
ADN care um1eaza a fi migrat poate fi circular inchis, circular deschis sau linear.
La aceea$i greutate moleculara, viteza de migrare este func!ie de fonna in care acesta se
afla.
Tamponul de migrare are rolul de a men!ine pH-ul mediului de reaqie in timpul
electroforezei. Tris/acetatul (TAE: tris, acid acetic, EDTA) este cel mai utilizat atunci
cand migrarea este de scurta durata. Trislboratul (TBE: tris, acid boric, EDTA) este mult
mai stabil, se folose$te la electroforezele de lunga durata, dar nu este corespunzator
pentru purificare.
Voltajul aplicat este in func!ie de lungimea fragmentelor care unneaza a fi sepa-
rate. Voltajul scazut determina a rata de migrare scazuta a ADN, dar 0 foarte buna
separare.
Sistemul de electroforeza submers, a1catuit din sursa de curent (necesara stabilirii
voltajului/amperajului sistemului) si cuva de electroforeza (de diferite dimensiuni).
Etapele reac{iei
1. Prepararea gelului. Gelul se prepara din agaroza pentru biologie moleculara
de diferite tipuri, in func!ie de dimensiunile fragmentelor de ADN care urmeaza a fi
separate $i de prelucrarile ulterioare la care este supus. Tamponul pentru prepararea
gelului este identic cu tamponul de migrare. Cantitatea de gel preparata este funqie de
numarul de probe care urmeaza a fi migrate, grosimea optima a gelului fiind de 0,5 mm -
1cm. Concentra!ia agarozei in gel variaza de la 0,7%, pentru fragmentele mari pfl11ala
2,5%-3% pentru fragmentele foarte mici.
2. lncarcarea probelor pe gel se face submers, in cuva de electroforeza in care s-a
pus deja tamponul de migrare. Pentru ca probele sa nu iasa din godeuri se adauga
tampon de depunere (solu!ie de albastru cu rol de a tine proba in godeu ca urmare a
con!inutului in glicerol $i de monitorizare a migrarii ca unnare a con!inutului in albastru
de brom fenol).
Daca proba care urmeaza a fi migrata contine un singur fragment de ADN,
cantitatea de incarcare variaza intre 5ng si 200ng, daca contine mai multe fragmente
se incarca 0,1-0,5 llg, iar dad proba consta din ADN genomic supus digestiei enzimatice
se incarca pana la 10llg.
3. Migrarea se realizeaza ca unnare a voltajului aplicat sistemului. Timpul de
migrare $i voltajul sunt in relatie directa cu lungimea fragmentelor de ADN supuse
migrarii.
133
4. Vizualizarea se realizeaza dupa colorare cu
bromura de etidiu (BET) ~i iluminare in ultraviolet
(UV). Bromura de etidiu are capacitatea de a se
intercala intre bazele azotate ale moleculei de acid
nucleic ~i de a da lumina fluorescenta la iluminare
Fig 7-3. Detectare prin peR a genelor ~u UV (2~0-36~11l~). Bromura ~e..et!~iu se poate
mtroduce m gelm tlll1pul preparam ~1 m tamponul
care codificii sinteza de toxin a difterica
la tulpini de COIJ!l11bacteriul11 de migrare, dar trebuie avut in vedere ca influenteaza
diphtheriae. (original) rata migrarii.
5. Documentarea gelului se face fie prin fotografiere cu 0 camera Polaroid fie prin
preluarea imaginii pe un computer pentru a fi analizata ~i imprimata (fig. 3).
134
cu conditia ca fiecare sa fie verificata in reaqie PCR standard. Reactia necesita
optimizarea cantitatii de ADN matrita, Taq ADN polimeraza, concentratia fiecarui primer,
concentratia ionilor de metale, in vederea obtinerii ampliconilor corecti ~i in cantitate
suficienta pentru interpretarea reactiei. Aparatele de PCR cu gradient de temperatura
sunt deosebit de utile pentru optimizarea acestui tip de reactie.
Nested peR este metoda prin care se unnare~te cre~terea specificitatii reaqiei ca
U1TI1area amplificarii regiunii tinta in doua reactii succesive. In prima reaqie este utilizata
o pereche deprimeri care delimiteaza 0 regiune genomica mai larga pe care este localizata
secventa de interes. In a doua reactie, care are ca matrita ampliconul obtinut in prima
amplificare, se folose~te 0 pereche de primeri care contine unul dintre primerii utilizati
in prima reactie ~i un al doilea complementar secvetei de interes, sau doi primeri
complementari celor doua capete ale secventei de interes.
135
Pentru a putea recunoa~te hibrizii, unul dintre lanturile de ADN (de obicei eel
eunoscut) este marcat. Pentru hibridizarea in solutie, marearea se face eu iod radioaetiv
(1251), iar eitirea consta in inregistrarea radiatiilor beta emise intr-un lichid de scintilatie.
Pentru hibridizarea pe sup011solid marcarea poate fi radioactiva e2p, 35S) sau neradioactiva
(biotina, acetylaminofluorena, digoxigenina, etc). Citirea in acest caz se realizeaza prin
radiografiere, chemiluminiscenta sau colorimetrie. Hibridizarea in situ (fluorescence in
situ hybridization-FISH), utilizeaza fragmente de ADN marc ate fluorescent, cu secventa
cunoscuta, in scopul de a localiza pe cromozom 0 regiune de interes medical.
Cantitatea de ADN utilizat in reaqie este esentiala pentru realizarea duplexului.
Aceasta se masoara fie spech'ofotometric, in lumina UV la 260 nm, fie pe gel de
agaroza fata de marker de greutate moleculara (benzi de lungime ~i concentratie
cunoscute).
Temperatura de reasociere este funqie de temperatura de jumiitate denaturare a
ADN ~ieste egala cu Tm - 25C. Temperaturi mai mari conduc la instabilitatea duplexului,
iar temperaturi mai scazute pot determina reasocieri nespecifice. Stabilirea corecta a
temperaturii de hibridizare este critica pentru specificitatea reactiei, atat in hibridizarea
in solutie dh ~i pe membrana.
Concentratia ionica a mediului de reaqie constituie un parametru esential al reaqiei
de hibridizare. Ionii de Na (clorura de sodiu, fosfat de sodiu, EDTA, citrat de sodiu) sunt
utilizati ca agenti chelatori pentru a inhiba nucIeazele din mediul de reactie .
Substantele organice sunt utilizate cu scopul de a scadea temperatura de stabilitate
a duplexului (in special la moleculele bogate in G+C) ~i astfel reaqia sa se desIa~oare, in
conditii de specificitate maxima, la temperaturi mai joase. Se utilizeaza in acest scop
fom1amida, ureea, dimethylsulfoxid, dextran sulfat, polyethylenglycol sau clorura de
tetraethylamoniu, in funqie de conditiile concrete ale experimentului.
Hibridizarea in solutie este in principal utilizata pentru taxonomie bacteriana, in
timp ce hibridizarea pe suport solid este utilizata pentru diagnostic ~i epidemiologie.
7.2.4.2. Hibridizarea pe membrana se realizeaza conform specificatiilor
producatorului de membrana ~i/sau kit de hibridizare.
Etapele reactiei
1. Fixarea ADN pe membrana este prima etapa a reactiei de hibridizare ~i se
realizeaza dupa protocoale diferite, in functie de tipul de analiza care UTIneazaa fi realizat.
Fixarea de realizeaza sub actiunea luminii UV (timp de 5 minute) sau a caldurii (SOC).
a) Hibridizare pe colonii. Coloniile bacteriene care urmeaza a fi studiate sunt spotate
pe membrana (nitroceluloza sau nylon), sunt lizate pe membrana ~i tratate cu RN-aza
pentru eliminarea moleculelor de ARN.
b. Hibridizarea pe cultura totala (replica plate), Cultura totala dezvoltata din proba
de anaIizat este trecuta pe membrana, unde se apIica acela~i procedeu ca in cazul
hibridizarii pe colonii.
c. Dot blot este 0 metoda de transfer a ADN total pe membrana, sub presiune
controlata, utilizandu-se aparate dedicate, cu godeuri. In godeurile aparatului se pune
ADN total, dupa ce celula a fost lizata sau suspensia celulara, liza efectuandu-se in
godeuri.
136
d. Southern blot este metoda de transfer a ADN extras ~ipurificat, in general, dupa
ce a fost digerat, iar fragmentele de digestie separate prin electroforeza in gel de agaroza
(transfer din gel).
In toate cazurile, inainte de fixare, ADN este supus denatun'irii, astfel incat pe
membrana se afla ssADN, permisiv hibridizarii, daca in mediul de reaqie exista alt
ssADN cu secventa complementara.
2. Prehibridizarea este etapa in care membrana este tratata special, intr-un tampon
de hibridizare, cu scopul acoperirii situsurilor nespecifice in vederea reducerii zgomotului
de fond. Etapa se realizeaza la temperatura Tm-25C, la 0 stringenta ionica
corespunzatoare conditiilor de hibridizare, optimizate in functie de ADN care urmeaza a
fi hibridizat.
3. Hibridizarea consta in introducerea membranei intr-un mediu de reactie care
contine ADN cunoscut, marcat (sonda nuc1eotididi), in vederea identificarii unor zone
de omologie cu acesta pe molecula de ADN fixat pe membrana. Se realizeaza in acelea~i
conditii de temperatura ~i stringenta ionica in care s-a realizat hibridizarea.
4. Revelarea hibrizilor se realizeaza printr-o metoda corespunziitoare tipului de
marcaj utilizat.
5. Citirea ~i interpretarea rezultatelor este asistata de calculator, in prezent existand
un numar important de programe capabile sa realizeze scheme normalizate ale profilului
de hibridizare, sa calculeze gradul de similitudine ~i sa realizeze arbori genetici.
7.2.5. Secventierea
Standardul de aur in diagnosticul ~i epidemiologia moleculara este reprezentat de
secventiere. Metoda consta in detenninarea ordinii nucleotidelor in lantul de acid nucleic.
La 24 ani dupa descoperirea structurii ADN, in anuI1977, au fost dezvoltate doua
metode de secventiere, una bazata pe 0 reaqie de amplificare enzimatica (chain tennina-
tion method) ~i alta pe degradarea chimica a dublului helix.
Metoda eel mai larg utilizata se bazeaza pe sinteza unui nou lant de ADN in prezenta
unei ADN polimeraze ~i a celor patru nucleotide. Un oligonucleotid, cu 0 secventa
complementara unei regiuni de pe ADN matrita, este utilizat ca primer. Cele patru nucle-
otide se introduc in reaqie in amestec echilibrat. In sistemul clasic, se realizeaza patru
reactii pentru cele patru nucleotide, in fiecare dintre acestea introducandu-se, in procent
de 1%, un nuc1eotid modificat (dideoxinucleotid - gruparea OH a carbonului din pozitia
3' este inlocuita cu un atom de H) astfel incat nu se poate lega de nuc1eotidul unnator.
Reactia de sinteza se opre~te in momentul in care, intamplator, in locul unui nucleotid se
incorporeaza omologul sau modificat (metoda denumita Sanger dupa numele
cercetatorului care a descris-o prima data). Primerul sau nucleotidele pot fi marcate
(radioactiv sau chimic).
Elementele reactiei
ADN matrita, denaturat chimic sau termic;
Primerul, complementar unei secvente de pe molecula ADN matrita;
ADN polimeraza, cu rol in sinteza noului lant de ADN;
Cele patru deoxinucleotide (dATP, dGTP, dCTP, dTTP);
Dideoxinucleotide (unul pentru fiecare reactie, ddATP, ddGTP, ddCTP, ddTTP);
137
Aparatul pentru evidentierea secventei (sistem de electroforeza in gel de
poliacrilamida) .
Softuri pentru alinierea ~i interpretarea secventelor
Etapele reactiei
1. Prepararea ADN care Un11eaZaa fi secventiat. ADN matrita se extrage ~i se
purifica din celulele bacteriene de interes. Fragmentul care unneaza a fi secventiat se
obtine fie prin restrictie enzimatica, fie prin PCR. Cand fragmentul de secventiat este
rezultatul unei restrictii acesta se introduce intr-un vector (plasmid sau bacteriofag) in
vederea secventierii. Indiferent de modalitatea de obtinere, ADN de secventiat se purifica
inainte de secventiere.
2. Amplificarea enzimatica se realizeaza intr-o ma~ina de PCR obi~nuita, dupa
optimizarea reaqiei.
3. Separarea fragmentelor amplificate se realizeaza in gel de poliacrilamida, mignlnd
in paralel cele patru reactii (in sistemul clasic de secventiere).
4. Citirea secventei se face manual, in functie de modalitatea de marcare utilizata,
revel area mcandu-se autoradiografic, chemiluminiscent sau enzimatic (in functie de tipul
de marcaj utilizat).
5. Interpretarea se realizeaza utilizand programe de calculator dedicate, multe dintre
acestea fiind accesibile pe internet. Alinierea se face fata de secventele cunoscute ~i
publicate in handle de date (GenBank). In cazul identificarii unei secvente noi, aceasta
se trimite spre introducere in banca de gene.
7.2.5.1. Secventierea automata a aparut ca 0 necesitate a standardizarii metodei,
utilizabila in diagnosticul ~i epidemiologia moleculara a bolilor infectioase. Exista in
prezent retele internationale de supraveghere microbiologica, specializate, care utilizeaza
aceasta metoda pentru tipizarea patogenilor (spa gene pentru Staphylococcl/S aureus,
emm gene pentru Streptococus pyogenes, etc.).
Metoda are la baza secventierea cu dideoxinucleotide, dar utilizeaza nucleotide
marcate fluorescent (fiecare nucleotid este marcat cu un alt fluorocrom). Un laser este
utilizat pentru a stimula lumina fluorescenta, iar fluorescenta este captata de un instru-
ment capabil sa detennine lungimea de unda. Aparatele automate sunt capabile sa
diferentieze nucleotidele dupa tipul de lumina emisa astfel incat cele patru reactii se
realizeaza intr-un singur tub. Rezultatele sunt oferite sub forma unei electroforegrame,
fiecare nucleotid prezentandu-se sub forma unui peak de alta culoare (Fig. 7-4). Aparatul
identifica ~i salveaza secventa in computer.
~~~Hd
Fig. 7-4. Secventa ampliconului blasH\' la Salmonella Enterica. (original).
138
Utilizarea secventierii automate e1imina lucrul cu radioactivitate (periculos pentru
manipulator, producere de de~euri radioactive, multe laboratoare nu au permisiunea de a
lucra cu radioactivitate), reduce timpul de lucru, utilizeaza kituri comerciale, citirea este
automata ~iprin unnare rezultatele sunt mult mai fiabile ~i comparabile interlaboratoare.
7.2.5.2. Pyrosecventierea
Nevoia continua de rapiditate in diagnostic ~i epidemiologie precum ~i necesitatea
de a descoperi noi markeri genetici sau gene cu functii alterate a condus la descoperirea
~iintroducerea in practica de laborator a unei noi metode de secventiere, pyrosecventierea
(secventierea bazata pe sinteza ~i pirofosfat). Are la baza sinteza de ADN nou ca urmare
a alungirii unui primer utilizat ca amorsa, in prezenta ADN polimerazei ~i a celor patru
nucleotide. Incorporarea unui deoxiribonucleotid trifosfat in lantul nou de ADN este
insotita de e1iberare de pirofosfat (PPi). ATP sulfurilaza, existenta in mediul de reactie,
converte~te PPi la ATP care catalizeaza conversia luciferinului la oxiluciferin in prezenta
luciferazei. Oxiluciferinul genereaza lumina vizibila care este captata de 0 camera digitala
sub fonna un or peak-uri (pyrograma). Inaltimea picurilor este proportional a cu numarul
de nucleotide incorporate. Mediul de reactie contine apyraza, 0 enzima care degradeaza
dNTP neincorporate ~i ATP ceea ce face ca emisia de lumina sa inceteze. In acest tip de
secventiere, dNTP sunt introduse in reactie pe rand, dupa ce prima a fost incorporata, iar
excesul degradat.
Este 0 metoda de secventiere in timp real, superioara metodei Sanger in ceea ce
prive~te timpul de executie, pretul de cost, cuantificarea, u~urinta de a fi efectuata ~i de
a citi secventa. Este utilizata pentru identificarea secventei unui fragment de interes
biomedical, tiparea microorganismelor, studii de transgeneza, detectarea mutatiilor
punctifonne, insertiilor, deletiilor, detectarea markerilor genetici de virulenta, de rezistenta
la antibiotice, etc.
Metoda este in intregime automatizata, aparate dedicate ~i kituri de reactivi fiind
astazi comercializate pentru a permite utilizarea acesteia in laboratoarele clinice.
139
Elementele reactiei
Microchipuri pe care sunt fixate fragmente de acizi nucleici tinta, responsabili de
sinteza unei proteine de interes in patologia infectioasa (producere de proteine implicate
in virulenta bacteriana, enzime implicate in rezistenta la antibiotice, toxine, etc). Acestea
pot fi ADN, cADN sau oligonucleotide, obtinute prin restriqie enzimatica, PCR sau sinteza
chimica .
Solutia de hibridizare care contine un amestec de cADN marc at fluorescent.
Acesta constituie proba de analizat. mARN produs de celule este extras, purificat,
amplificat prin revers-transcriere, iar cADN astfel obtinut este marcat cu fluorocromi.
Tehnologia microarray se utilizeaza pentru detectarea nivelului de expresie genica,
interrelatia dintre diferite gene implicate in detenninarea unei maladii, detectarea unor
mutatii, numarul de copii al unor gene repetitive, polimorfismul in secventa unei gene (ex.
SNP), etc.
Din ce in ce mai multe laboratoare apeleaza la acest tip de tehnologie pentlU diag-
nostic molecular, personalizarea medicatiei ~i/sau integrarea diagnosticului cu terapia. De
aceea sunt necesare eforturi pentru standardizarea metodei ~i crearea unei banci de date
accesibila laboratoarelor care utilizeaza aceasta tehnologie. NCB! (National Center for
Biotechnology Information) a lansat "Gene Expression Omnibus", 0 banca de date
accesibila online, iar grupul de lucru "Microarray Markup Language" a construit banca
de date "Microarray Gene Expression" cu scopul de a pune la dispozitia laboratoarelor a
unei platfoDne pentlU trimitere ~ianaliza a cantitatii enODnede infoDnatii privind expresia
genica, colectate in intraga lume.
140
fragmentelor rezultate prin electroforeza in gel de agaroza. Principiulmetodei se bazeaza
pe faptul ca doua fragmente de ADN cu procent de omologie ridicat vor ciaprin restrictie,
cu aceea~i enzima, un profil de fragmente identic.
Elementele reac{iei
Cultura bacteriana de studiat;
Kit pentru purificare ADN plasmidic;
Enzime de restrictie;
Gel de agaroza;
Sistem de documentare a gelului.
Etapele reac{iei
1. Extractia ADN plasmidic se poate realizeaza "clasic" dupa una dintre metodele
utilizate, pentru plasmide mici sau pentru plasmide mari, in functie de interesul medical
al analizei. In prezent exista kituri comerciale care pennit extractia si purificarea ADN
plasmidic (eliminarea in totalitate a ADN cromozomal) intr-un timp mult mai scurt ~i cu
o eficienta sporita.
2. Digestia cu endonucleaze. Se aleg enzime de restrictie in a~a fel incat patternul
generat sa contina un numar suficient de fragmente pentru a fi discriminatoriu ~inu prea
multe pentru a putea fi comparabil. Conditiile de digestie sunt cele indicate de producatorul
enZllnel.
3. Separarea fragmentelor prin electroforeza in gel de agaroza. Conditiile de
electroforeza se optimizeaza pentru fiecare specie analizata.
4. Documentarea gelului se realizeaza, dupa colorare cu bromura de etidiu, fie prin
fotografiere cu sistem Polaroid, fie prin captarea imaginii cu 0 camera digitala ~i salvarea
ei in computer in vederea analizei.
Acest tip de analiza se nume~te RFLP (Restriction fragment Length folymor-
phism) ~i se studiaza utilizand programe cumparate cu licenta sau libere pe internet.
141
a structurii secundare ~iterti are pe intreg spectrul evolutiv. Secventa nucleotidica, atat a
unitatii 16 S cat ~i a unitatii 23 S prezinta regiuni cu un inalt grad de conservare, pre cum
~iregiuni hipervariabile.
ARN ribozomal este ancestral, universal distribuit, aparent neexpus transferului,
cu cea mai mare parte a structurii prim are constanta ceea ce-i confera functionalitate
constanta. Aceste proprietati fac ca moleculele de rARN sa fie considerate "cronometre
moleculare" in studiile taxonomice, filogenetice ~i epidemiologice.
Numarul operonilor I'm, precum ~i pozitia diferitelor gene in structura acestora
influenteaza puterea de discriminare a ribotipiei ca metoda de analiza epidemiologica.
Elementele reac{iei
Cultura bacteriana care unneaza a fi analizata;
Kit de extractie ADN genomic (total);
Enzime de restrictie;
Sistem de electroforeza;
Sistem de documentarea gelului;
Sistem de transfer ADN de pe gel pe membrana (Southern blot);
Sonde nucleotidice;
Kit de marc are ~i revel are a hibrizilor moleculari;
Softuri de analiza a RFLP.
Etapele reac{iei
1. Extragerea ADN total se realizeaza utilizand metoda care pune la dispozi!ie
ADN de calitate (puritate ridicata, molecule lungi, nefragmentate). Dupa extrac!ie ~i
purificare ADN se supune tratarii cu RN-aza ~i dializei pe filtru.
2. Restrictia enzimatidi se realizeaza cu enzime Cl,l situsuri de restrictie dese pe
cromozom pentru a genera un numar mare de fragmente, cu lungimea de la cateva sute
de perechi de baze pana la cateva mii de perechi de baze.
3. Separarea fragmentelor de restrictie se realizeaza prin electroforeza intr-un
gel mare (lung de 20 cm), un voltaj scazut (50Y) ~i un timp indelungat (peste noapte.
14-16 ore) pentru a realiza 0 spatiere corecta a tuturor fragmentelor (de dimensiuni
mari ~i mici).
4. Fotografierea gelului pentru verificarea calitatii restrictiei enzimatice.
5. Transferul fragmentelor de restricpe pe membrana de nylon se realizeaza In conditii
denaturante (concentratie sh-ingenta de ioni de Na+), astfel incat ADN sa se afle pe
membrana in structura monocatenara, pennisiva hibridizarii.
6. Fixarea ADN monocatenar pe membrana se realizeaza fie prin expunere la lumina
UV timp de 5 minute, fie prin "coacerea" membranei la 80C timp de 1 ora.
7. Sonda molecularii este reprezentata de cinci oligonucleotide, doua complementare
cu regiuni conservate ale moleculei l6S, ~itrei cu omologie pe molecula 23 S (5 OligoMix).
Acestea sunt marc ate tenninal cu digoxigenina.
8. Prehibridizarea se realizeaza la 53C, timp de 0 ora, iar hibridizarea la aceea~i
temperatura timp de 16 ore (peste noapte). Sonda va hibridiza cu fragmentele de restriqie
pe care gase~te omologie de secventa.
9. Spalarile posthibridizare, la 45C ~i temperatura camerei au rolul de a elimina
sonda in exces.
142
10. Cuplarea cu anticorpi antidigoxigenina marcati cu fosfataza alcalina se realizeaza
pe fragmentele de restrictie care au hibridizat cu sonda nucleotidica.
11. Revelarea enzimatica. In mediul de reaqie se realizeaza un sandwich, ADN /
sonda + digoxogenina / anticorp anti digoxigenina + fosfataza alcalina, care va fi evidentiat
printr-o reactie de culoare, cu un complex NBT/BCIP (nitrobluetetrazolium ~i bromo-
chloroindofenil). Sunt vizibile pe membrana numai fragmentele care au hibridizat cu sonda,
deci cele pe care sunt Iocalizate secvente omologe operonilor rm.
Documentarea profilului de hibridizare se realizeaza fie prin scanarea membranei ~i
utilizarea imaginii pentru a fi prelucrata cu pachetul de programe TaxotronR (lnstitut Pas-
teur, Paris), un ansamblu de programe alcMuit din RestrictoScanR, RestrictoTyper",
Adanson" ~i Dendrograf'\ fie prin preluarea imaginii cu 0 camera digitala, salvarea ei in
computer ~i analiza cu un alt program dedicat (BioNumerics).
7.3.2.2. Profilul de macrorestrictie in camp pulsator (PFGE, ulsed Eield Gel
Electrophoresis ).
Metoda considerata pana in momentul de fata standardul de aur pentru epidemiologia
moleculara, presupune includerea'microorganismului de studiat in agaroza, liza acestuia
in situ ~i digestia ADN total cu enzime de restrictie cu situsuri rare de recunoa~tere pe
cromozom. Fragmentele generate in urma digestiei sunt separate intr-un pattern de benzi
discrete, in functie de greutatea lor moleculara, prin electroforeza in gel de agaroza, sub
actiunea unui curent electric care i~i schimba sensul dupa un program prestabilit.
Exista mai multe sisteme de camp pulsator care difera prin unghiul sub care este
aplicat campul electric, numarul de electrozi ~i modul de aranjare al acestora, orientarea
gelului, modelul cuvei, etc. Indiferent de tip, toate sistemele PFGE au eliminat distorsiunile
majore in migrarea fragmentelor de ADN ~i sunt capabile sa separe fragmente care
ajung pana la 6000 kb in Iungime.
Rezolutia sistemelor depinde insa de timpul de puIs, puterea campului electric,
temperatura, compozitia tamponului, tipul ~iconcentratia agarozei, unghiul dintre campuri.
Timpul de puIs influenteaza mobilitatea ADN in matricea gelului ~i depinde de
lungimea fragmentelor supuse migrarii.
Voltajul aplicat sistemului este functie de timpul de puIs ~imarimea fragmentelor
de ADN. Pentru separarea fragmentelor mari se recomanda un voltaj scazut, un timp de
puIs mare ~i un timp de migrare indelungat (cateva zile).
Unghiul intre campurile electrice aplicate sistemului este in mod obi~nuit de 90 ~i/
sau 110-120.
Temperatura de migrare este cuprinsa intre 4C si 15C. 0 temperatura controlata
a migrarii permite obtinerea de rezultate reproductibile.
Patternurile de restrictie sunt markeri moleculari utili in stabilirea gradului de inrudire
~ia clonalitatii tulpinilor studiate. Tulpinile sunt considerate clonale, atunci cand pattemurile
lor de restrictie prezinta acela~i numar de fragmente, fragmentele corespondente avand
aceea~i greutate moleculara. Tulpinile sunt considerate strans inrudite, atunci cand profilurile
de digestie difera prin doua sau trei fragmente.
143
Elementele reacfiei
Cu1tura bacteriana supusa ana1izei;
Reactivi pentru liza ce1ulara chimica ~i enzimatica;
Enzime de restrictie cu numar redus de situsuri pe cromozomu1 speciei careia ii
apartin tu1pini1e studiate;
Sistem de e1ectroforeza in camp pulsator;
Sistem de documentare a gelu1ui.
Etapele reacfiei
1. Prepararea ADN de analizat consta in realizeaza unar b1ocu1ele prin ing10barea
cu1turii bacteriene intr-un gel de agaroza cu punct de topire scazut (low melting agarose).
Liza ce1u1ara(chimica ~ienzimatica) se rea1izeaza in situ. E1iminarea tuturor e1emente1or
care ar putea inhiba reactia se rea1izeaza prin spa1ari repetate ale b1ocu1ete1or.
2. Restrictia enzimatica se rea1izeaza de asemenea in situ, enzime1e uti1izate tlind
a1ese in functie de compozitia in G+C a cromozomu1ui speciei care se analizeaza. Inainte
de restrictie b1ocu1ete1ecu ADN sunt echi1ibrate in tamponu1 enzimei care va fi uti1izaHi.
Restrictia se realizeaza in conditiile descrise de producator, un timp indelungat.
3. E1ectroforeza se realizeaza dupa un program prestabilit, linandu-se seama de
lungimea fragmentelor de ADN care unneaza a fi separate ~i de sistemul de PFGE.
4. Documentarea ge1ului se face dupa colorare cu bromura de etidiu ~i deco1orare.
Imaginea este fotografiata sau captata cu 0 camera digitala.
5. Analiza se face ca in toate metode1e RFLP.
144
2. Reactia de amplificare se realizeaza conform instructiunilor producatorului kitului.
3. Electroforeza in gel de agaroza se realizeaza in conditiile unei electroforeze
orizontale c1asice.
4. Documentarea ~i analiza gelului se realizeaza ca in conditiile unui RFLP.
7.3.3.2. PCR-RFLP este 0 metoda care combina 0 reactie de PCR urmata de 0
restrictie enzimatica a produsului amplificat. PCR-ribotipia amplifica fragmentul intergenic
16S-23 S dupa care ampliconul este supus restrictiei cu endonuc1eaze. Regiunea este 0
secventa variabiHi, aici aflandu-se un numar diferit de structuri genetice care codifica
tARN, precum ~iregiuni repetate. Cand doua molecule de ADN analizate sunt izolate din
doua tulpini cu evolutie clonal a, regiunea este identica ~i supusa restrictiei cu aceea~i
enzima va da un profil de restrictie identic. Existenta unor mutatii punctiforme in struCtura
amplificata poate conduce la pierderea unui situs de restrictie, respectiv la aparitia unui
profil de restrictie diferit.
7.3.3.3. Rep-PCR este utilizata pentru amplificarea unor regiuni repetitive de pe
cromozomul bacterian. Numarul acestor regiuni poate fi variabil sau secventa lor poate
suferi diverse modifidiri ca unnare a unor evenimente genetice derulate la nivelul acestora
(deletii, mutatii, inversii, etc). Metoda consta in amplificarea de tip PCR a regiunilor res-
pective urmata sau nu de RFLP (in functie de lungimea secventelor respective). Teoretic,
doua tulpini bacteriene inrudite epidemiologic au un profil de amplificare identic ~i un
RFLP al produ~ilor amplificati identic. ERIC-PCR (Ia tulpini de Enterobacteriaceae) ~i
BOX-PCR (la tulpini de Streptococcus) suntmetode utile in tiparea moleculara a tulpinilor
izolate din contexte epidemiologice speciale.
7.3.3.4. PCR-hibridizare include metode care detecteaza/identifica produsul
amplificat prin hibridizare cu sonde specifice. In acest caz, fie se fixeaza pe membrana
produsul de amplificare, iar sonda, marcata, este introdusa in tamponul de hibridizare, fie
se fixeaza pe membrana sonda, iar produsul de amplificare, marcat este aplicat peste
aceasta in tamponul de hibridizare.
Spoligotyping este 0 metoda de peR asociata cu hibridizarea, conceputa ~iutilizata
pentru prima data pentru analiza moleculara a tulpinilor de Mycobacterium tuberculo-
sis. Fundamentul ~tiintific al metodei consta in structura cromozomului acestei specii care
prezinta un numar important de regiuni repetate separate intreele de regiuni genomice de
dimensiuni diferite. Profilul de amplificare (numarul de regiuni interspatiale) pem1ite
diferentierea/analiza clonala a tulpinilor. Evidentierea profilului se face dupa hibridizare
pe membrana, pe care se afla fixate oligonucleotide specifice diferitelor regiuni interspatiale,
a ampliconului obtinut prin peR.
7.3.3.5. PCR-secventiere este metoda care utilizeaza tehnica PCR pentru
detectarea unei regiuni genomice de interes medical, regiune care este ulterior secventiata
in vederea tiparii moleculare a tulpinilor studiate. Modificari, la nivel de un singur nucleotid,
in secventa regiunii respective modifica secventa aminoacizilor in produsul de expresie ~i
reprezinta marker utilizat in epidemiologia moleculara. Metodadevine din ce in ce mai
larg utilizata in retelele intemationale de supraveghere a bolitor infectioase (spa PCR-
secventiere petru detectarea genelor responsabile de producerea proteinei A la Staphy-
lococcus aureus, emm PCR-secventiere pentru diferentierea tulpinilor de Streptococ-
cus pyogenes, bla PCR-secventiere pentru identificarea tipului de B-Iactamaze la
microorganisme rezistente la antibiotice ~-lactamice, etc).
145
7.3.3.6. MLST (Multilocus Sequence Typing) este metoda de analiza bazata pe
identificarea mutatiilor in gene esentiale pentru bacterii (housekeeping genes). Se bazeaza
pe secventierea automata, rezultatele fiind indubitabile, comparabile intre laboratoare din
intreaga lume. Metoda este universal valabila deoarece acumularea de modificari in
secventa genelor esentiale este un proces relativ lent ~i stabilin timp. S-au facut progrese
impOliante in acest domeniu, datele fiind acumulate in banci cu acces international.
Primerii sunt construiti pe baza secventei complete a principalelor grupari taxonomice
de interes medical existente in bancile de date utilizand programe dedicate. Se realizeaza
o reactie de PCR, ampliconii sunt identificati prin electroforeza in gel de agaroza, purificati
cu un kit comercial ~i cuantificati prin comparare cu un marker de greutate moleculara
(ex. Smart ladder), dupa care sunt supu~i secventierii. Interpretarea rezultatelor se face
automat prin accesarea paginii de web a MLST.
7.3.3.7. AFLP (Amplified fragment Length Eolymorphism) este 0 tehnica de ADN
fingerprinting bazata pe reactia PCR. In analiza AFLP, ADN genomic bacterian este
digerat cu enzime de restrictie, fragmentele sunt ligate cu adaptori, ADN astfel obtinut
reprezentand matrita in reactii PCR. Primerii utilizati pentru PCR contin secvente omologe
adaptorilor care au in capatul 3' nucleotide selective. Numai fragmentele de restrictie in
care nucleotidele care flancheaza situsul de restrictie hibridizeaza cu nucleotidele selec-
tive vor fi amplificate.
Reactia se realizeaza conform instructiunilor producatorului, comercializandu-se
kituri dedicate acestei tehnici.
146
Materialele din plastic, de unidi utilizare, trebuie sa fie sterile.
Echipamente de baza
Se utilizeaza micropipete automate, cu volum reglabil, calibrate. Laboratorul trebuie
echipat cu seturi de pipete dedicate fiecarei arii de lucru.
Aparatul pentru PCR (termocyc1erul), licentiat pentru a fi utilizat in PCR, este
verificat pentru corectitudinea temperaturii afi~ate. Cand aparatul nu este echipat cu
capac incalzit amestecul de reactie este acoperit cu un strat de ulei de parafina stelil
(50 ).11) pentru a impiedica evaporarea probei. Pentru a u~ura optimizarea reaqiei se
comercializeaza aparate cu gradient de temperatura. In functie de capacitatea blocului
ma~inii de PCR ~i de nevoile laboratorului, se pot executa mai multe experimente in
acela~i timp. Pentru fiecare lot de experimente, care se des:fa~oara simultan pe aparatul
de PCR, se introduc in reactie un martor de ADN sigur pozitiv pentru segmentul matrita,
un martor de ADN sigur negativ pentru fragmentul respectiv ~i un martor in care ADN
este inlocuit cu apa.
Hota cu flux laminar prevazuta cu lampa de UV, verificata in ceea ce prive~te
fluxul de aer ~i capacitatea de sterilizare.
Toate celelalte aparate trebuie verificate pentru functionare corecta ~i amplasate in
locatii bine definite.
Toate reaqiile efectuate in laboratorul de microbilogie moleculara includ martori
pozitivi de reactie ~imartori negativi. Pe langa ace~tia, sunt reactii care includ martori de
control al functionarii corecte a principalelor componente ale reactiei.
Prevenirea contaminari/or incrucifjate
Cateva reguli de biosecuritate sunt absolut necesare in laboratorul in care se
efectueaza PCR:
1. Efectuarea procedurilor in spatii speciale conform "alocarii spatiului";
2. Se lucreaza cu manu~i de unica utilizare pentru a evita contactul nuc1eazelor
existente pe piele cu produsele care se manipuleaza;
3. Sunt necesare seturi diferite de micropipete in diferitele arii de lucru ~i pipete
speciale pentru lucrulin hota cu flux laminar;
4. Reactia PCR se efectueaza in hota cu flux laminar prevazuta cu lampa UV;
5. Se utilizeaza varfuri sterile, cu filtru hidrofob, corespunzatoare tipului de pipeta
utilizat;
6. Se prepara ~i se utilizeaza un set special de reactivi numai penhll PCR;
7. Masinile de PCR sunt localizate intr-un spatiu situat in afara celui in care se afla
hota cu flux laminar pentru realizarea PCR;
8. Se reduce la minim traficul prin camera in care se realizeaza PCR;
9. Tampoanele, reactivii, enzimele, repartizate in cantitati mici, se pastreazii in
congelatorullocalizat in spatiul de PCR, cat mai aproape de hota cu flux laminar;
10. Spatiile de PCR sunt prevazute cu echipament mic (vortex, agitator magnetic,
miocrocenh'ifuga);
11. Tuburile de reactie, scoase de pe ma~ina de PCR, se deschid in aria D.
12. lncinta hotei cu flux laminar in care se afla apa pentru PCR, tuburile, stativele,
varfurile, pipetele, uleiul mineral (cand se utilizeaza), tampon de reactie se expunluminii
UV 5-20 minute inainte de reactie.
147
Metodele moleculare de analiza au un rol deosebit de important in cunoa$terea
structurii genetice a microorganismelor circulante intr-o zona geografica $i intr-o perioada
de timp, infonnatiile fiind utile in studiul circulatiei agentilor infectio$i, stabilirea originii
unor epidemii, calea parcursa $i modul de diseminare a acestora, precum $i detectarea
importului intr-o zona indemna. Tehnicile de biologie moleculara se recomanda prin speci-
ficitate, selectivitate $i rapiditate ca metode de analiza epidemiologiea eel putin la nivelul
Centrelor Nationale de Referinta. Datorita dezvoltarii sondelorreci, inconvenientullucrului
cu radioactivitate a fost eliminat, reaqiile de hibridizare $i secventiere puti'mdu-se efectua
la nivelul oricarui laborator dotat cu baza tehnica corespunziitoare.
Analiza asistata de calculator a imaginii $i tratarea statistica a datelor a crescut
exactitatea $i u$urinta compararii moleculelor de ADN de diferite origini.
Extractia $i secventierea automata a aeizilor nucleiei au redus considerabil consumul
de reactivi $i timp de executie, iar aparatele pentru PCR au revolutionat diagnosticul
infectiilor microbiene, reactiile putandu-se efectua direct pe produsul patologic.
Dupa tem1inarea marelui proiect privind structura genomului uman, eunoa$terea
structurii genetice a microorganismelor care colonizeaza organismul uman reprezinta
zona de cercetare de eea mai mare importanta pentru microbiologia clinic a fiind
considerata al doilea mare proiect "Genomul uman: Microbial Community Genomies".
Bibliografie
1. Ausubel EM, Brent R, et aI. Current Protocols in Molecular Biology. 1996, John Wiley
& Sons, Inc, USA.
2. Belkun A. DNA Fingerprinting of Medically Important Microorganisms by Use of
PCR. Clin. MilVbiol. Rev, 1994,7, (2): 174-184.
3. Belkum A, Scherer S, Alphen L, Verbrugh H. Short-sequences DNA repeats In
prokaryotic genomes. Microbial Mol. Bioi Rev, 1998,62 (2):275-293.
4. Dale, W.1. Molecular Genetics of Bacteria, yd Ed. 1998, John Wiley & Sons. Inc.
USA.
5. Damian, M. Ribotipia, metoda moleculara utila in studiile epidemiologice. Bacterial.
Virusol. Parazitol. Epidemiol, 2000,45, (1-2):3-Il.
6. Freifelder, D. Microbial Genetics. 1987, Jones and Bartlett Publishers, Inc.
7. Furows S.J, Ridgway, G.L. Good laboratory practice in diagnostic laboratories using
nucleic acid amplification methods. Clin. Microbial. b!fect., 2001, 5, 227-229.
8. Gavrila L. Genomica. Un tratat despre genom, de la virusuri la om. 2003, Editura
Enciclopedica, Bucuresti.
9. Innis M.A., Gelfand D.H, Sninsky JJ, White Th. J. PCR protocols, a guide to methods
and applications. 1990, Academic Press, Inc.
10. Juni E. Genetic transformation assays for identification of strains of Moraxella
IIrethralis. J Clin Microbial. 1977,5(2): 227-235.
1 I. Kraviec S, Riley M. Organization of Bacterial Chromosome. Microbial. Rev, 1990.
54,3:502-539.
12. Lewin B. Genes VII. 1999, Oxford University Press.
13. Lin 1.J, Kuo J, Ma J. A PCR-based DNA fingerprinting technique: AFLP for
molecular typing of bacteria. Nucl Acid. Res, 1996, 24 (I 8): 3649-3650.
14. Maiden M.C.J, Bygraves 1.A. et a1. Multilocus sequence typing: A portable approach
to the identification of clones within population of pathogenic microorganisms. Proceeding o{ the
National Academy of Science of the United States of America, 1998,95 (6): 3140-3145.
148
15. Olive M.D, Bean P. Principles and Applications of Methods for DNA-Based Typing
of Microbial Organisms. J. Clin. Microbial. 1999,37 (6): 1661-1669.
16. Penner G.A, Bush A, et al. Reproductibi1ityof random amplified polymorphic DNA
(RAPD) analysis among laboratories. PCR Methods and Applications. 1993, (2): 341-345.
17. Raue H.A., Klootwijk J, Musters W. Evolutionary conservation of structure and
function of high molecular weight ribosomal RNA. Prog. Biophys. Malec. Bioi, 1988, 51. (50),
77-129.
18. Regnault B, Grimont F, Grimont P.A.D. Universal ribotyping method using a
chemically-labelled oligonucleotide probe mixture. Res. Microbiol, 1997, (148): 649-659.
19. Widjojoatmodjo M.N, Fluit A.D.C, Verhoef J. Rapid identification of bacteria by
PCR-single strand conformation polymorphism. J. Clill. Microbial, 1994,32 (12): 3002-3007.
20. Sambrook J, Russell D.W. Molecular cloning, a laboratory manual. 2001, 3-rd ed.
Cold Spring Harbor Laboratory Press, New York.
21. Sherratt DJ. Mobile Genetic Elements. 1995, Oxford University Press.
22. Smolinski M.S, Hamburg M.A, Lederberg J. Microbial Threat to Health: Emergence,
Detection and Response. 2003, National Academic Press, SUA.
23. Stackebrandt E, Goodfellow M. Nucleic acid techniques in bacterial systematics.
1991, John Wiley & Sons Inc, USA.
24. Snyder L, Champness, W. Molecular Genetics of Bacteria. 1997, ASM Press.
Washington, D.C.
25. Sullivan C.B, Diggle M.A et al. Multulocus Sequence Typing: Data Analysis in
Clinical Microbiology and Public Health. Molecular Biotechnology, 2005,29, (3): 245-254.
26. Tenover F.C, Arbeit R.D, Goering R.V, Mickelsem P.A, Murray B.E, Persing D.H.
Swaminathan B. Interpreting Chromosomal DNA restriction pattern produced by pulsed-field
electrophoresis: Criteria for bacterial strain typing. J. Clill. Microbial. 1995,33 (9): 2233-2239.
27. Versalovic J, Koeuth Th, Lupski R. Distribution of repetitive DNA sequences in
eubacteria and application to fingerprinting of bacterial genomes. Nuc/. Acid. Res. 1991. 19 (24):
6823-6831.
8. DIAGNOSTICUL INFECTIILOR VIRALE,
CHLAMIDIALE SI RICKETTSIENE
IN LABORATORUL CLINIC
(DUMITRU BUIUC)
150
Motivatia diagnosticului etiologic al infectiilor determinate de chlamidii ~irickettsii
este insa puternici'i: necesitatea dublata de posibilitatea terapiei antimicrobiene.
Diagnosticul serologic al acestor boli este mai operant pentru decizia clinica dedit in
vlroze.
Din anii 1980, diversificarea chimioterapicelor antivirale, aparitia ~i diversificarea
unor metode tot mai performante pentru depistarea antigenic a rapida a antigenelor ~i
acizilor nucleici virali ca ~i progresele metodologice ~i tehnice privind izolarea ~i
identificarea virusurilor au modificat semnificativ relatia cost-beneficiu in favoarea
beneficiului ~i au adus motivatii noi pentru diagnosticul virozelor. lata, in rezumat, cum
se reflecta in sfera motivatiilor diagnostice aceste mutatii tehnologice ~i de cunoa~tere:
1) Accesibilitatea crescuta la diagnosticul virologic pentru tot mai nmlte laboratoare
prin comercializarea unor:
truse cu reactivi pentru depistarea antigenic a a variate virusuri;
culturi celulare.
2) Impactul tot mai important al diagnosticului virologic asupra deciziei clinice prin:
recunoa~terea infectiilor care beneficiaza de tratament antiviral (e. g., infeqiile
grave cu virusurile herpes simplex, varicela-zoster, respirator sincitial ~. a.);
evitarea de tratamente antivirale toxice ~i costisitoare (e. g., administrarea
ribavirinului la sugari cu infectie acuta a tractusului respirator inferior determinata de
alti agenti infectio~i decM virusul respirator sincitial);
evitarea abuzului de terapie antibacteriana la pacienti cu meningoencefaliti'i
enteroviral a, la sugari cu boala respiratorie acuta virala;
3) Reducerea cheltuielilor pentru diagnosticul virologic prin:
Utilizarea unor chei clinice de orientare a investigatiei virologice (e. g., virus
Herpes simplex, adenovirus la un pacient cu keratita), ceea ce apropie precizia cererii de
examen virologic de solicitarea confrrmarii prezentei streptococului ~-hemolitic in exsudatul
faringian sau a bacililor tifici in materiile fecale.
Detectarea virusului prin metode directe imunologice sau non-imunologice.
Diagnosticul prezumtiv al grupului viral pe baza efectului citopatic poate orienta
atitudinea clinicianului in fata unui pacient cu meningita enterovirala ~i face inutila
identificarea costisitoare a serovarului.
4) Izolarea unor virusuri devine mai rapida ~i mai sensibila prin noile tehnici de
centrifugare a inoculului pe filmul celular, iar identificarea izolatelor se poate face rapid
prin coloratie imunofluorescenta a celulelor infectate. Astfel, peste 90% din tulpinile de
virus Herpes simplex pot fi izolate ~i identificate in 24 de ore, iar intervalele de izolare ~i
identificare a virusului citomegalic au fost semnificativ scurtate.
5) Examenele virologice au ameliorat diagnosticul izbucnirilor nosocomiale de
gastroenterite infantile sau infeqii respiratorii acute.
6) Diagnosticul serologic cedeaza tot mai mult locul celui virologic, dar i~ipastreaza
unniitoarele indicatii:
investigarea epidemiologica a virozelor;
151
investigarea starii imune a unar persoane (e. g., aprecierea riscului unei femei
tinere de a contracta rubeola in raport cu titrul anticorpilor antirubeolici);
instrument accesoriu pentru interpretarea, prin autoserodiagnostic, a semnificatiei
clinice a virusurilor izolate din prelevate de pe suprafata unor mucoase (e. g., entero-
virusuri, adenovirusuri, herpesvirusuri);
diagnosticul virozelor al caror agent etiologic cultiva dificil sau deloc.
Fie ca se realizeaza pe probe de ser unice sau prelevate in dinamica, rezultatele
diagnosticului serologic al virozelor trebuie interpretate prudent din cauza reaqiilor
incruci~ate, uneori extinse.
Tabefllf 8-1
152
Izolarea ~i identificarea virusurilor in laboratoarele de nivel III ~i IV satisfac
necesitatilor deciziilor clinice ~iale unor investigatii epidemiologice.
Din nefericire in Romania numai unele spitale judetene au laboratoare care satisfac
partial exigentele nivelului II pentru diagnosticul virologic ~i numai 0 mica parte din
laboratoarele universitare ~i ale institutelor regionale de sanatate publica satisfac exigente
ale nivelului Ill. In aceste conditii singurele laboratoare de referinta pentru izolarea ~i
identificarea virusurilor, chlamidiilor ~irickettsiilor sunt cele ale Institutului de Virusologie
"Stefan Nicolau" ~i ale Institutului "loan Cantacuzino" din Bucure~ti.
Posibilitiitile diagnosticului serologic, pe baza truselor de anti gene comercializate de
cele doua institute precizate mai sus sau obtinute din import, se extind la 0 rete a mai larga
de laboratoare.
In consecinta, consideram ca in aceasta carte este suficient sa precizam numai:
Particularitatile prelevarii, prelucrarii ~iconservarii probelor in vederea expedierii
spre laboratoarele de referinta pentru izolarea virusurilor rickettsiilor ~i chlamidiilor.
Microscopia uzuala pentru depistarea incluziunilor virale ~i chlamidiale.
Reaqiile antigen-anticorp pentru depistarea antigenica ~i diagnosticul serologic.
Metode rapide non-imunologice pentru diagnosticul acestor infectii.
153
VI Tabelul8-2
~
Un ghid de prelevare a probelor pentru diagnosticul principalelor sindroame cHnice cu etiologic virala
Posibillll)
VRS
Rhinovirus
Punc\ie
Aspirat
Gripal
ciell.
gian.
Paragripal
Tampon A,rarnazofarin-
pentru
traheal trdnstora-
B1,2 aspiralie
faringian
Detraheal
VRS
Rhinovirus
nazala
Adenovirus
Mai Bronhii
Pulmon
Enterovirus
A.Trahee
Alternative
Rhinovirus
Coronavirus
Post mortem
Posibila1l
Punqie Btranstoracica
nazofaringian
pentm
Epstein-Barr
elee\ie
nazo(aringian.
Paragripall,2
Paragripal
Aspirat
Tampon
Gripal A,aspirape
SplUllturll
Paragripal Virusuri biopsicPosibili'
I,1.22 sau implicatel)
B31-3 Aspirat e }) patologice
Prelevate Serologic
Guturai TamponPulmon..
VRS
Enterovirus
Posibilii
faringianl\
SpllllHurii
nazofaringian Posibila21
Coronavirus
sau biopsie
pal
pes Asimplex
novirus Adenovirus
Tabelu/ 8-2 (continuare)
Coxsackie
Rotavirus
Coxsackie
Adenovirus
CML
Posibil1i'
Posibilli;' --
" Siinge BAB
-
--
central
nazofaringian
Ilepatitei
Serologie
Norwalk
Fecalc
cefalorahidian
Lichid
Fecale
Coxsackie
Adenovirus
Ehterovirus
Urlian
AIternati
CMV
Post Mai
Coronavirus
Tampon
Aspiratmortem
Biopsie
Epstein-Barr
nazofaringian
De eleqie
Paragripal
gian
gian
PosibiHi
Mai
Urinaftecvent
Fecale
rar
Varicda-zoster
Tampun
Sange
Tampon
nazofaringian
ve Virusuri
rectal
hepatic1\rectalimplicate"
nazofarin-
nazofarin-
+-+- tecale
Tampon Uzual .
Posibilli;'
Prelevate ticat
Tampon rectal
nu' patologice
Posibila7J
Adenovirus
atite Echo
titei A Rotavirus Aspirat
....
Vl
Vl
Vl Tabelu/8-2 (continuare)
0\
FicatPosibila3
Adenovirus
Pulmon
Fecale Posibila'l. 7)
Coxsackie
cefalorahidian
Splina
Serologie
nazofaringian
Aspirat
vezicular
Echo
Post
Rara Maimortem
Creier
Coxsackie
Ficat
Fecale Posibila11
Posibila'
Adenovirus
Miocard
Varicela-zoster
Fccale
Rare
Coxsackie
Urina Posibila"
Alternative
Splinii
Con\inut
Tampon
Gripal
Urimi
Exsudat A.AVirusuri
) 11Rcolon
Ararcerebralii
(pcntru din
pericardic implicate)' Creier
Splina Posibila
Aspirat
Dcnazofaringian
nazot~lringian
Biopsie
Mai elcctie
frecvent
Pulmon
Enterovirus
veziculelor
Raclat rectalhazavirus
Con\inutde laintestinal
Rubeolic
Lichid
Creier
Denga
Aspirat Prelevate patologicc
Echo hemoragica
CMV
Cistita
Togavirus
Epstein-Barr Tampon
Tampon,
Tabelul8-2 (continuare)
- Vaccinal
Coxsackie
PosibilaJ)
Rujeolic
Epstein-Barr
VIH
Alternative
Varicela-zoster
Vaccinal
Raclat
Fecale
DePost mortem
Mai
Tampon
eleclie
Aspirat
A
cornean
rarcornean
nazofaringian Fecale
--Virusuri implicatel)
rectal
conjunctival
Epstein-Barr Prelevate patologicePosibilii'i)
SangePosibiliiJ\
Raclat conjunctival Serologic
Varicela-zoster
Rujeolicsimplex
Herpes Adenovirus
Herpes simplex
IIAbrevieri: VRS = virus respirator sineiliaI; CMV = virus citomegaIic; CML = virusul choriomeningitei limfocitare; SIDA = sindromul imunodefieienlei
dobandite; VIH = virusul imunodeficienlei umane.
21 (a) Rhinovirus: excep(ie din cauza numeroaselor serovaruri, (b) Enterovirus: Iimitat la autoserodiagnostic din cauza numeroaselor serovaruri;
predic(ia pozitiva a izolatelor din faringe: 0,70-0,89. (c) Paramixovirusuri: reac(ii incruci~ate. (d) CMV: precaut sa fie confirnlat prin izolate de virus ~iapreciat
in contextul clinic ~ial altor investiga(ii mierobiologiee.
31 V. Epstein-Barr: metoda de elee(ie. Testul antieorpilor heterofili pozitiv la eea 90% din adul(ii eu mononueleoza infec(ioasa, dar propor(ia scade sub
80% la eopii intre 2-4 ani sau sub 30% la cei sub 2 ani ~i impune, in caz de rezultat negativ, teste eu antigene speeifiee.
4) Enterovirus: doar pentru autoserodiagnostic, data fiind predic(ia pozitiva de 0,70-0,89 a izolatelor din faringe ~isub 0,4 a eelor din feeale.
5) Rotavirus ~iv. Norwalk: interes limitat la izbueniri epidel11iee; enterovirus ~iadenovirus; autoserodiagnostic pentru ca predic(ia pozitiva a izolatelor
Virusurile sunt organisme fragile, mai ales cele cu anvelopa. Semiviata lor se
masoara, de cele mai muIte ori, in ore la temperatura camerei, in zile la 4C ~i in luni la
-70C. De aici decurg cateva imperative:
1) Necesitatea mediilor de transport ~i a medii lor crioprotectoare.
2) Refrigerarea probelor la 4C, uzual pana la 24 ore; maximum 96 ore pentru
transport in laboratorul de referinta.
3) Congelarea la -70C cand intervalul de timp pana la inoculare depa~e~te limitele
mentionate mai sus.
Medii de transport pentru virusuri. Principial, aceste medii sunt solUlii saline,
tamponate, suplimentate cu 0 proteina (serum-albumin a bovina sau, mai obi~l1Uit,gelatina)
pentru stabilizarea virusurilor fragile ~i antibiotice pentru a minimiza contaminarea
bacteriana ~i fungica. Un indicator permite monitorizarea vizuala a pH-ului pentru a
preveni acidifierea mediului, nociva virusurilor.
Intr-un studiu comparativ, trei medii de transport au dat cele mai bune rezultate:
solutia salina Hanks cu gelatina, mediul Stuart ~i mediul Leibovitz-Emory. Mai sunt
indicate bulionul cu triptoza-fosfat (vezi Cap. 40).
Pentru transportul chlamidiilor ~i virusurilor, WARFORD ~i colab. (1984)
recomanda mediul cu zaharoza, fosfat, glutamat (vezi mediul SPG in Cap. 39).
Fecalele (exceptand tamponul rectal), lichidul cefalo-rahidian, saliva, urina, probe Ie
biopsice sau necropsice nu necesita medii de transport. Procedeaza conform indicatiilor
de la prelevarile respective (vezi mai jos 8.2.4).
158
-
In vederea utilizarii, conditionam ~isterilizam volume de 3-4 mL mediu de transpOli
'in flacoane de 5 ml cu capac 'in~urubat. Pana la utilizare, pot fi pastrate, pentru 24 ore, la
4C sau, mai multe saptamani, congelate la -70C ori -20e. In volume mai mari de
me diu praba este diluata, iar 'in volume mai mici se poate usca.
Conservarea la 4C 0 realizam 'in frigider sau, pe durata transportului, 'in container
izotem1 cu granule de gheata hidrica.
Congelarea la -70C trebuie racuta brusc, 'in strat subtire, prin ratire rapida a
flaconului 'in baie de alcool cu gheata carbonica (-78,soC). Daca pastrarea se va face 'in
acela~i amestec refrigerator, probele trebuie initial 'inchise ennetic 'in fiole din sticla
boro-silicata, deoarece CO, difuzeaza prin dopurile de cauciuc sau gamiturile de cauciuc
~i acidifica mediul cu efecte foarte nocive pentru virus.
Decongelarea trebuie racuta brusc sub curent de apa la robinet pentru a asigura 0
cre~tere a temperaturii probei de minim 2YC per minut.
Este fonnal contraindicata pastrarea probelor la -20DC 'in congelatoare de uz casnic:
congelarea la punctul eutectic ~i oscilatiile tennice 'in jurul acestui punct sunt foarte
nocive virusurilor.
o revista cuprinzatoare privind transportul probelar pentru examenul virusologic
a publicat F. S. JOHNSON (1990).
SpaHitura nazala. Necesar: para sterila din cauciuc cu volumul de cca 30 mL .;;i
extremitatea efilata conic; mediu de transport.
Procedura: Plaseaza pacientul ~ezand, cu capacul 'in extensie de cca 70 pe ceara.
Aspira in para de cauciuc 3-7 mL mediu de transport. Insera extremitatea dispozitivului
pana la 'infundarea unei nari, strange ~i relaxeaza brusc para pentru a proiecta fluidul pe
mucoasa nazala ~i a-I absarbi imediat. Transvazeaza prelevatul 'in flaconul de transport.
Altemativ poti folosi un flacona~ picu-
ratar cu tubul tenninat printr -0 tetinii mai volu- Tetlnade
cauciuc
minoasa din cauciuc ~i etan~at la capacul cu
profunzime de cca 1,5 cm. Plaseaza pacientul
'inpozitie ~ezanda ~iumple tubul pi curator cu
mediul de transport din flacon. Introdu tubul
'in nara pacientului ~i proiecteaza viguros Spalatuia - -
naz3la
fluidul 'in nas prin apasarea tetinei. Mentine d'
b 1fl 1 . 1 Me IU de
su nara capacu aconu Ulpentru co ectarea transporf 1":--1- I -_
fluidului de spalare care se scurge (fig. 8-1).
Astfel este recuperata cca jumatate din
mediul de transport utilizat. Transvazeaza
atent prelevatul din capac 'in flacon. A B
Inlipsa acestor facilitati, dar cu rezultat .
dispozitiv pentru prelevat ~i
. t' satlslacator,
mal PU,1ll . +:-: - proce deaza dupa- cum FIg. 8-1. Un
spiiliitura nazalii.
unneaza: pacientul 'inpozitie ~ezand cu capul (A) Flaconul pregiitit pentru recoltare. (B)
'in u~oara extensie pe ceara; instileaza rapid Picuratorul, tetina ~i capacul in care s-a scurs
'in fiecare nara 4-5 mL mediu de transport ~i Iichidul de spaliitura.
159
imediat flecteaza-i capul pentru a colecta lichidul de spalare intr-un vas steril (e. g., 0
cutie Petri, un pahar dispozabil) mentinut sub nari. Transvazeaza aseptic proba in flaconul
de transport.
Aspiratul nazofaringian. Adapteaza etan~ 0 sonda Nelaton la 0 seringa de 20 mL.
Aspira per-nazal continutul nazofaringian. Descarca sonda in flaconul cu mediul de
transport.
Tamponul nazofaringian: Folose~te tampon umectat cu mediul de transport.
SpaHitura faringiana. Pacientul, cooperant, face gargara cu 10-20 mL mediu de
transport ~ielimina tluidul intr-un pahar steril dispozabil. Transvazeaza aseptic 3-4 mL din
proM in flaconul de transport.
Tamponul faringian: Folose~te tampon umectat cu mediul de transport.
Sputa. De la un pacient cooperant preleva 0 proM dupa tuse spontana profunda
Tusea f0rtata, la comanda, nu da probe de calitate.
Exsudatul san raclatol conjunctival: vezi 17.2.2.
Raclatul cornean: vezi 17.3.2.
Tamponul bucal. Sterge fem1 cu un tampon din vata uscat mucoasa jugala, de
ambele parti, in dreptulmolarilor superiori ~i mucoasa plan~eului bucal anterior limbii.
Descarca imediat tamponul in mediul de transport.
Saliva. Pre1eva 1-2 mL saliva in recipient steril cu gura larga, tara mediu de
transport.
Fecalele. Recolteaza 1-2 probe de scaun 1a interval de 24-48 ore (vezi Cap. 19).
Cu 0 spatula prelevii 4-6 grame de fecale ~i Ie introdu in flacon, tara me diu de transport,
dar ennetic inchis pentm a preveni uscarea. Chiar daca fecalele au 0 bogata microbiota
intrinseca, lucreaza aseptic pentm a preveni contaminarea cu vimsuri de la alti membri
ai anturajului.
Tamponul rectal este indicat pentm prelevari de la sugari sau cand prelevam mai
multe probe de la acela~i pacient. Metoda este insa mai putin sensibiIa de cat prelevarea
din scaunul emis spontan. Sterilizeaza tampoane obi~nuite protejate intr-un tub de sticla
lung de 6 cm, care, inserat in anus, va evita incidentele la introducerea sau retragerea
tamponului prin sfincter. A~eaza pacientul aplecat cu fata ventraIa pe dunga patului.
Lubrifiaza cu ulei de parafina steril 2-3 mm din extremitatea distala exterioara a
man~onului pentm a depa~i mai u~or sfincteml anal. Evita excesul de ulei care po ate
contamina tamponul. Dupa depa~irea sfinctemlui, impinge bland tal11ponul uscat prin
man~on in rect pe 0 profunzime de cca 5 cm. Rote~te bland. Retrage tal11ponul ~i
controleaza daca este colorat cu materii fecale. In caz contrar reia operatia prin l11an~onul
mentinut inca pe loc. In final retrage ~iman~onul. Descarca imediat tamponul prin rotire
viguroasa in mediul de transport. (vezi mai sus).
Urina. Preleva cur at 10-20 mL de urina prinsa in zbor din jetulmijlociu (vezi
Cap. 14).
Lichidul cefalo-rahidian pre1evat de catre specialist (vezi Cap. 10), in cantitatea de
cca 5 mL, tara mediu de transport, este expediat, in recipient inchis etan~, pentm examinare
160
imediata. Multe din virusurile prezente in lichidul cefalo-rahidian sunt labile. De aceea, daca
proba nu poate fi examinata in interval de ore, trebuie congelata la -70C.
Exsudate din seroase sunt prelevate aseptic de ciitre specialist, prin punc!ie ~i
aspira!ie, in volum de cca 5 mL, ~i expediate la laborator, tara mediu de transport, in
recipient inchis etan~.
Fluidul vezicular ~i raclate cutanate. Alege cateva vezicule recent aparute ~i
decontamineaza-le suprafata prin ~tergere blanda cu solutie salina izotona sterila sau cu
eter (precau!ie). Nu folosi alcool sau alcool iodat pentru decontaminare. Veziculele de
pe suprafata mucoaselor pot fi abordate ca atare.
Punctioneaza ~i aspira continutul mai multor vezicule cu un ac de 25-26 G adaptat
la seringa pentru tuberculina. Dilueaza imediat aspiratul in 1-2 mL mediu de transport
pentru a preveni coagularea. Altemativ, veziculele pot fi deschise cu varful unui bisturiu
sau cu un ac steril, iar fluidul absorbit cu un tampon, care h'ebuie descarcat imediat in
mediul de transport.
Prelevarea poate fi completata prin raclarea u~oara a bazei leziunii cu lama unui
bisturiu, rara a produce sangerare, iar materialul celular obtinut suspensionat in acela~i
recipient cu fluidul vezicular.
Frotiuri din leziuni veziculare. Prelevatul trebuie sa contina suficiente celule pentru
a pennite depistarea inc1uziunilor virale prin microscopie uzuala sau a antigenelor virale
prin coloratie imunofluorescenta. Fluidul vezicular nu contine suficiente celule pentru
acest scop.
Alege leziuni in stadiul incipient, vezicular (nu pustule). Decontamineaza suprafata
~ideschide vezicula prin incizie periferica, cu bisturiul steril. Ridica epidenna ~i absoarbe
fluidul cu un tampon sau cu hartie de filtru. Rac1eaza u~or baza leziunii cu lama bisturiului
(vezi mai sus). Etaleaza materialul celular prelevat pe doua lame de microscop in strat
fin cu diametrul de 5-10 mm. Pentru coloratia imunofluorescenta asigura 3 lame tinand
cont de martorii necesari.
Probe biopsice sau necropsice. Abordeaza leziunile cat mai precoce. Utilizeaza
seturi separate de instrumente sterile pentru incizia tegumentului ~i abordarea fiecarei
leziuni. Preleva probe cu latura de cca 1,3 cm ~i plaseaza-le in borcane separate. In
virozele sistemului nervos central preleva probe din cortextul lobului temporal, din
mezencefal, maduva cervicala ~ilombara. Nu utiliza mediu de transport sau lichid fixator.
Probele biopsice ~i necropsice trebuie pastrate la 4C in recipient inchis etan~ ~i
prelucrate cat mai curand dupa prelevare. Numai la nevoie vor fi conge late, pentru perioada
limitata, la -70C.
Atentie deosebita trebuie acordata probelor cu volum mic, cum sunt biopsiile prin
ac, pentru a Ie feri de uscare: se expediaza, prin curier special, in flaconul inchis etan~
impreuna cu cateva picaturi din mediul de transport steril.
De la cadavru, pentru izolare de enterovirusuri, preleva segmente de 5-7 cm din
colonul descendent cu continutul fecal retinut inh'e duble legaturi.
Sangele poate fi prelevat pentru examen serologic sau virologic.
Viremia este prezenta in multe viroze, dar folosirea si'mgelui pentru diagnosticul
virologic apare indicata numai intr-un numar limitat de infectii:
faza acuta a infectiei cu virusul citomegalic la gazda n0TI11oreactiva;
161
--------
pneumonii cu virus citomegalic la pacienti cu transplant de maduva osoasa sau in
cadrul SlDA;
arboviroze manifestate ca boli febrile nediferentiate, meningoencefalite sau febre
hemoragice;
infectia cu virusul choriomeningitei limfocitare.
Cat mai curand dupa debutul bolii, preleva 2-4 mL de sauge heparinat de la pacientii
suspecti de infectie cu virus citomegalic. Izolarea arbovirusurilor se poate face atat din
sangele prelevat pe anticoagulant, cat ~i din cheagul sanguin.
SpaHituri nazale, faringiene sau bucale. Examineazii proba dupa agitare. Daca
se observa particule (debriuri celulare etc.) saumucus, procedeaza ca in cazul tampoanelor
(vezi mai jos). Daca apare omogena, poate fi inoculata ca atare.
Tampoane. Prelucreaza identic tampoanele nazofaringiene, faringiene, conjuncti-
vale, bucale, rectale sau din vezicule. Dupa descarcarea ingrijita a tamponului, transfera
suspensia intr-un tub de centrifuga cu capac in~urubat, care contine cateva perle sterile
din sticla cu diametrul de 4-5 mm. Agita bine cca 30 secunde, manual sau pe agitator
Vortex, pentru dispersia particulelor in suspensie. Centrifugheaza 30 minute la 3 000 xg
~i 4C. Aspira supematantul cu atentie pentru a nu mi~ca perlele, care pot tulbura
sedimentul. Folose~te supematantul pentru izolarea de virus.
Fecale. Intr-un tub de centrifuga cu volumul de 25-30 mL, care contine 20-30 perle
din sticla, pune cu spatula cca 1 g de fecale ~iadauga solutie Hanks cu antibiotice pentru a
asigura urmatoarele concentratii finale: penicilina 1000 U/mL, streptomicina 1000 /-lg/mL
(sau gentamicina 200 /-lg/mL) ~inistatina 100 U/mL (sau amfotericina B 20 /-lg/mL)-vezi
Cap. 39. In~urubeaza capacul ~i agitii bine tubul, apoi centrifugheazii cum este descris
pentru prelevatele pe tampoane. Inainte de inocularea in culturile celulare, supematantul
trebuie mentinut 30-60 minute la 40C.
Aspiratul nazofaringian. Procedeaza ca pentru tampoane.
Sputa. Decanteazii proba intr-un tub de centrifuga cu volumul de 25-30 mL, care
contine 20-30 perle din sticlii. Adaugii un volum egal din mediul de transport cu antibiotice
(vezi Cap. 39). In~urubeazii capacul, agitii bine tubul, apoi centrifugheazii cum este precizat
pentru tampoane.
Raclatul conjunctival sau din vezicule. Procedeaza ca pentru spalaturile de pe
mucoase.
Saliva. Adauga 0,1 mL din dilutia 1/10 a fiecarei solutii stoc de antibiotic (vezi
Cap. 39) per ml proM. Agita, centrifugheaza (ca pentru spalaturi de pe mucoase) ~i
mentine supematantul30-60 minute la 4C inainte de inocularea in culturi de celule.
Urina ca atare poate fi toxica pentru culturile celulare; trebuie neutralizata la pH
7,0 cu solutie 0,1 N fie de NaOH, fie de HC1, dupa caz. Adauga antibiotice in proporria
mentionata pentru saliva ~i mentine amestecul 30-60 minute la 4C inainte de inoculare.
Fluidul vezicular nu necesita un tratament special cand este prelevat aseptic prin
punctie ~i aspiratie. Tampoanele din vezicule se prelucreaza ca ~i restul tampoanelor.
162
Lichidul cefalo-nlhidian ~i exsudatele din seroase pot fi utilizate ca atare.
Dad exista suspiciunea de contaminare, trebuie tratate cu antibiotice.
Probele biopsice sau necropsice. Procedeazadupa cum UTI11eaza:
1) Cantare~te proba in cutie Petri sterila.
2) Masoara 0 cantitate din mediul de transport cu antibiotice, suficienta pentru a
realiza suspensia 20% (g/v) a tesutului. E. g., 8 mL mediu pentru 2 g tesut.
3) Marunte~te proba in fragmente mai mici de 2 mm folosind pensa, bisturiu ~i
foarfece sterile.
4) Transfera proba astfe1 maruntita intr-un mojar steril care contine 0 cantitate de
nisip spa1at (vezi Cap. 42), este racit 1a 4C ~i mentinut pe baie cu granule din gheata
hidrica.
5) Mojareaza adaugand progresiv mediu1 de transport. Initial obtii 0 pasta de tesut,
care se omogenizeaza treptat cu restul diluantului.
6) Transfera, cu 0 pipeta, suspensia intr-un tub de centrifuga cu capac In~urubat.
Centrifugheaza 30 minute la 1000 xg ~i 4C. Decanteaza atent supematantu1 pentru
inoculare.
Piesele tisulare mici sau tesuturile moi (creier, ficat) pot fi omogenizate in tubu1
Griffith.
Daca se intentioneaza cocultivarea cu diferite culturi de celule, pentru a spori
sensibilitatea izolarii, tesutul maruntit, mra omogenizare, este suspensionat in mediul de
cultura ~i trebuie sa ajunga in cel mai scurt timp la laboratorul de referinta.
Sangele. Probele pentru examenul serologic sunt tratate conform precizarilor din
Cap. 25.
Pentru izolarea arbovirusurilor inocu1am probe de ser sanguin.
Virusu1 citomegalic poate fi izolat din leucocite. Pentru aceasta, aspira in seringa
cu 2-4 mL sange heparinat suficienta solutie 6% dextran pentru a asigura 1 mL pentru
fiecare 2 mL de sange. Incubeaza seringa, cu pistonul in jos, 30-60 minute la 37"C. In
final, folosind un ac de 21 G, exprima intr-un tub de centrifuga stratul superior, bogat In
leucocite. Sedimenteaza e1ementele figurate sanguine prin centrifugare 20 minute 1acca
300 xg. SpaH'ice1ulele de doua ori cu tampon fosfat salin ~i fo1ose~te suspensia ce1u1ara
spalata pentru izo1area virusu1ui.
Nota. Trimite laboratorului de referinta, dupa caz, suficient produs patologic ca
atare sau prelucrat pentru ca, In principiu:
0 parte din proba este examinata, iar
aha parte, amestecata cu un volum egal din solutia 70% de sorbitol, este conge lata
la -70C pentru cazurile cand se impune reizolarea de virus.
163
PARTEAI
BIBLIOGRAFIE SELECTIV A
BAISDEN, C.R. (1985): The Office practice laboratory, Aspen Systems Corporation, Rockville.
BALS, M. G. (1982): Laboratorul clinic in infeqii, Editura Medicala, Bucure~ti.
BILElE, v., N., POSZGI (editori) (1984): Bacteriologie Medicala, vol. I, Editura Medicala, Bucure~ti.
BUlUC D. (2003): Microbiologie Medicalii, edi!ia 6-a, Editura "Gr. T. Popa", Ia~i.
C.D.C. - N.I.H. (1984): Biosafety in microbiological and biochemical laboratories, U.S. Department of Health
and Human Services, Center for Diseases Control, National Institutes of Health, Washington D.C.
COLLINS, C. H., P. M. LYNE, J. M. GRANGE (1995): Collinns and Lyne's Microbiological Methods,
7-th edn, Butterworth-Heineman, London, U.K.
EDBERG, S. C. (1981): Methods of quantitative microbiological analyses that SUPPOI1the diagnosis, treat-
ment, and prognosis oh human infections. C.R.C. Critical Rev. Microbiol.
FIELDS, B. N. (1996): Virology, 3-rd edn, Raven Press.
FRENEY, 1., F. RENAUD, W. HANSEN, C. BOLLET (2000): Precis de Bacteriologie Clinique, Ed. ESKA,
Paris.
HENRY, J. B., G. A., THREATTE (editors) (2001): Clinical Diagnosis and Managment by Laboratory
Methods, 20-th edn, W. B. Saunders Co., Philadelphia.
LELAND, D. S., (1996): Clinical Virology, W. B. Saunders, Philadelphia.
LENNETTE, E. H., E. T., LENNETTE (1995): Diagnostic Procedures for Viral, Rickettsial and Ch lamydial
Infections, 7-th edn, American Public Health Association, Washington D. C.
MILES, A. A., S. S. MISRA (1938): The estimation of bactericidal power of the blood. 1. H)'g. Camh ..
38:72.
MIMS, C. A., J. H. L. PLAYFAIR, 1. M., ROITT et al. (1993): Medical Microbiology, Mosby Europe
Limited, London.
MURRAY, P. R., E. J. BARON, 1. H., JORGENSEN et al. (2003): Manual of Clinical Microbiology, 8-th
edn, A.S.M. Press, Washington D.C.
NOE, D. A. (1985): The Logic of Laboratory Medicine. Urban and Schwal1zenberg, Baltimore.
RUSSEL, A. D. (1996): Activity ofbiocides against mycobacteria. 1. Apll. Bacterial. Symp. Suppl. 8 J :87S.
RUSSEL A. D., W. B. HUGO, G. A. 1. AYLIFFE (1992): Principles and Practice of Disinfection, Preserva-
tion and Sterilization, 3-rd edn, Blackwell Science, Oxford, U.K.
RUTALA, W. A. (1995): Chemical Gem1icides in Health Care, Polyscience, Morin Heights, PQ, Canada.
STOKES E. J., G. L. RIDGWAY, M.W.D. WREN (1993): Clinical Microbiology, 7-th edn. Edward Arnold.
London, U.K.
TOPlEY & WILSON'S Microbiology and Microbial Infections (2005): 10-th edn, Hodder Arnold, LOll-
don, U.K.
WARFORD, A. L., K. A. REKRUT, R. A. LEVY et al. (1984): Sucrose phosphate glutamate for combines
transport of chlamydial and viral specimens. Am. 1. Clin. Patha!. 8 1:762.
WINN, W. Jr., S. ALLEN, W. JANDA et al. (2005): Koneman's Color Atlas and Textbook of Diagnostic
Microbiology, 6-th edn, Lippincott Williams & Wilkins, Philadelphia.
164
Partea a II-a
INVESTIGAREA ETIOLOGICA
A PRINCIPALELOR SINDROAME INFECTIOASE
165
9.1. INTRODUCERE
Sangele omului nOffi1aleste steril, iar sistemul circulator are importante capacitati
de eliminare a microorganismelor. De aceea numarul unitatilor formatoare de colonii in
cursu 1 bacteriemiilor, fungemiilor ~i septicemiilor ramane, cu ullele excePtii, in general
redus.
Bacteriemia este prezenta in sange a bacteriilor provenite dintr-un focar septic
sau de pe 0 mucoasa lezata. Frecvent starea bacteriemica este lipsita de expresie clinica
sau se insote~te llumai de frison ~i febra la care se pot adauga simptome ~i semne proprii
cOllditiei care a detenninat descarcarea bacteriemica .
Bacteriemii ocazionale:
- Pot fi tranzitorii ~i spontan rezolutive cand sunt ocazionate de extraqii dentare ~i
alte interventii stomatologice, un cateterism uretral, 0 bronhoscopie, interventii chirur-
gicale pe mucoase nom1al colonizate sau pe focare septiee tisulare, urinare, ginecologice.
Majoritatea sunt detenninate de microorganisme din mierobiota indigena.
- Pot evolua gray cand apar dupa perfuzia unor solutii contaminate, cand sunt
detenninate prin colonizarea unor inseqii vasculare (e.g., catetere ~.a.) sau cand apar la
consumatorii de droguri pe cale intravenoasa.
Au unnari grave cand sunt detenninate, prin transloeare intestinala, de bacili gram-
negativi eu un anumit potential patogen la nou-nascuti ~i sugari inainte de constituirea
mioerobiocenozelor climax intestinale cu bariera lor anaeroba (e.g., bacteriemii cu
Escherichia coli Kl, cu Salmonella) sau la pacienti leucemici ori imunosupresati (e.g.,
bacteriemii cu Pseudomonas aeruginosa) .
Bacteriemii intermitente insotesc evolutia celor mai variate focare de infeqie:
nefrite interstitiale, colecistite ~i angiocolecistite, enterocolite, alveolite pulmonare,
meningite, peritonite, osteomielite, artrite, flegmoane ~i abcese, infectii ale plagilor,
arsurilor sau escarelor. GRANDSEN ~i co lab. (1996) au stabilit, prin analiza statistidi,
~apte factori de risc pentru bacteriemii cu Pseudomonas aeruginosa: neutropenia, terapia
citotoxica sau cu corticosteroizi, sexul masculin, infeqia nosocomial a, mai ales in servieii
de terapie intensiva, terapie antibacteriana in antecedente, focarul de infeqie. Foeare de
infeqie ~i interventii cu mare rise generator de asemenea baeteriemii sunt: infectiile
cailor urinare, cateterisme ~i interventii urologiee, iar eu rise redus sunt: foearele de
infeetie osoase, altieulare. meningiene, ale eailor respiratorii superioare ~i ale tractusului
genital feminin.
Intermitenta sistematizata au baeteriemiile din unele boli infeqioase eicliee ea
febrele reeurente, febra de Wolhynia.
166
Bacteriemii continue apar in evolutia unor boli infectioase ciclice ca febrele
enterice, leptospiroze ~.a.; in infectii endovasculare cum sunt endocarditele subacute,
anevrisme infectate, tromboflebite.
Aparitia unor metastaze septice amplifica procesul bacteriemic amorsat de focarul
infectios initial:
Septicemia este termenul clinic prin care individualizam 0 bacteriemie importanta
cu evolutie clinic a neregulata, imprevizibila ~i grava, acompaniata de frisoane, febra
neregulata, toxemie, hipotensiune, prostratie, eruptii cutanate polimorfe ~i variate
metastaze septice tisulare sau viscerale. Gravitatea sindromului septicemic lasa pe al
do ilea plan simptomatologia focarului infectios primar, care trebuie insa intotdeauna
cautat.
Aceasta diferentiere bacteriemie versus septicemie ramfme didactica, este artificiaIa.
Bacteriemiile ~i fungemiile adultilor evolueaza, in general, cu un numar redus de
microorganisme circulante, apreciat de diferiti autori intre 1 ~i 30 UFC/mL sfmge. La
nou-nascuti, sugari ~icopilul mic concentratia depa~e~te frecvent 100 UFC/mL.ln general,
intre gravitatea conditiei clinice, a prognosticului ~i concentratia bacteriilor din sfmge
exista 0 relatie direct proportionala.
Microoranismele izolate cu semnificatie clinica din hemoculturi, in ordinea
aproximativa a frecventei actuale, sunt:
Pana la 10% din bacteriemii pot fi polibacteriene. Exista diferente intre spectrul
etiologic al bacteriemiilor legate de varsta pacienti10r (predominanta bacililor gral11-
negativi facultativ anaerobi intestinali la nou-nascuti ~isugari), reactivitatea il11una(variate
organisl11e oportuniste, inclusiv stafilococi coagulazo-negativi, la gazda imuno-
compromisa), poarta de intrare sau focarul infectios (frecventa bacteriilor anaerobe dupa
intervenrii chirurgicale pe colon; a streptococilor viridans ~ienterococilor in endocarditele
bacteriene subacute; a stafilococilor coagulazo-negativi la pacientii cu proteze valvulare
cardiace sau cu insertii intravenoase).
167
Retinem, Cll importanta pentrll practica hemocll/turii:
gravitatea conditiei septicemice, de unde urgenta unor hemoculturi;
prezenta frecvent intermitenta a bacteriilor in sange, de unde necesitatea
hemoculturilor repetate;
concentratia .J:ngeneral redusa a bacteriilor in sange, de unde necesitatea
insamantarii unor volume mai mari de sange ~i prelungirii timpului de incubare;
prezenta a numero~i factori antimicrobieni in sange, de un de necesitatea
neutralizarii prin diluare sau/~i chimice a acestora;
varietatea microorganimelor implicate, de unde necesitatea un or medii de cultura
~i conditii de incubare care satisfac 0 gama larga de exigente;
controlul contaminarii probe lor prin punctie ~i aspiratie transtegumentara sau
manop era J:nsamantarii, de unde necesitatea antiseptizarii speciale, un anumit mod de
insamantare ~i anumite criterii pentru diferentierea bacteriilor de contaminare de cele cu
semnificatie clinica.
9.3.1. Indicatii
Multe hemoculturi fiind urgente, truse cu materialele precizate mai jos trebuie sa
fie permanent la dispozitia serviciilor in care sunt internati pacienti Cll conditii
bacteriemice:
1) Seringa sterila de 20 mL de unica folosinta (corespunzator mai mica pentru copii).
Seringa poate fi fnlocuita avantajos cu un set de transfer (tub cu ace la ambele
capete) pentru ca permite fnsamdntarea direct fn mediul de cultura, ceea ce minimizeaza
riscul contaminarii. Este operant cand mediile de cultura sunt conditionate in flacoane
cu prevacuum.
168
Ace cu calibrul19 G sau 21 G.
2) Bucata de mU$ama 40/40 cm.
3) Sapun lichid, alcool iodat 2% $i eter (precautie). Alcoolul iodat 2% este bactelicid
in doua minute. II preferam solutiei de betadina gennicida abia in 30 de minute.
4) Pense sterile.
5) Tampoane sterile din tifon 5/5 cm.
6) Garou.
7) Flacoane sau tuburi cu medii adecvate de cultura (vezi mai jos) preindilzite la
37C.
8) Masca sterila $i spirtiera, daca sunt folosite flacoane sau tuburi carora trebuie sa
li se scoata dopul pentru insamantare.
Pentru hemoculturi sunt indicate medii cu mare valoare nutritiva: bulion infuzie
cord-creier, bulion tripticaza-soia, bulion Columbia sau bulion Brucella. Cultivarea ~i a
bacteriilor anaerobe necesita bulion Columbia cu 0,01-0,05% cisteina sau bulion cu
tioglicolat.
Izolarea bacteriilor cu perete defectiv impune folosirea unui bulion hiperton (os-
motic protector) cu 6% sorbitol sau 10% zaharoza.
Adaugarea la mediul pentru hemocultura de "liquoid" (sodium polyanethyl sul-
phonate) in concentratie final a de 0,025-0,050% are un dublu avantaj:
efect anticoagulant, prin care evita formarea cheagului ro$U de sange in care pot
fi mascate colonii bacteriene;
completeazii efectul dilutiei pentru neutralizarea fagocitelor, a complementului
$i a unor antibiotice ca aminoglicozidele $ipolimixinele. "Liquoidul" este anticoagulantul
cu cele mai restranse efecte inhibitoare antibacteriene: limitate numai la meningococi,
gonococi, Streptobacillus moniliformis ~i Gardnerella vaginalis. Utilizarea altor
anticoagulante (citrat, oxalat, EDTA) este fonllal contraindicata pentru efectul lor in-
hibitor.
Rii$ini anionice (antimicrobial removal device) pot adsorbi pana la 100 /lg de anti-
biotic, cu excePtia moxalactamei ~i imipenemului, dar sunt avantajoase numai pentru
izolarea stafilococilor de la pacienti sub tratament antimicrobian.
169
9.3.5. Prelevarea sangelui
170
Aplidi garoulla cca 10 cm proximal de zona punctiei ~i strange-l pentru a aprecia,
prin palpare, dimensiunea ~i elasticitatea venei de punctionat. Simpla inspectie vizuaJa
fi'ecvent nu depisteaza vene profunde excelente pentru punctie. La nevoie, veneJe sunt
evidentiate mai bine dacii pacientul strange ~i relaxeaza de cateva ori pumnul. Nu masa
~inu flagela antebratul.
5) Da drumulla garou.
6) Antiseptizeaza-ti degetele cu alcool iodat 2%.
7) Decontamineaza larg, concentric, zona de punctie, intai prin spalare cu apa ~i
sapun lichid, apoi prin badijonare cu alcool iodat 2%. Dupa cca 1 minut badijoneaza
zona, tot concentric, cu un tampon inmuiat in eter (precautii) pentru a indeparta iodul ~i
a lasa tegumentul cat mai uscat. Punctia ~i aspiratia singelui prin tegument umezit, chiar
cu antiseptic, expune proba contaminarii cu bacterii rezidente in porozitatile epidennei
(stafilococi coagulazo-negativi, Propionibacterium spp., bacili difterimorfi).
8) Antiseptizeaza membrana de cauciuc a flacoanelor cu mediu de cultura, even-
tual contaminata dupa scoaterea capacului protector.
9) Ajutorul reaplica garoul.
10) Fixeaza tegumentul deasupra punctului de punctie prin tensionare pe brat cu
degetele mainii libere ~i, cu seringa pozitionata in axul venei, in unghi de cca 30 cu
tegumentul ~iacul cu bizoul in sus, punctioneaza pielea ~ivena subjacenta printr-o mi~care
moderat de brusca. 0 cedare u~oara este uzual resimtita la piitrunderea acului in vena.
Inainteaza pentru a pIasa in vena bizoul cu 0 parte din ac.
11) Exercita 0 u~oara presiune negativa prin retragerea pistonului. Sangele trebuie
sa patrunda liber in seringa sau in tubul setului de transfer. Cand scurgerea este neregulata,
rote~te u~or seringa pentru a repozitiona bizoul in vena. Sangele nu mai curge cand
varful acului perforeaza vena ~i patrunde in tesut. Retrage putin acul pentru a obtine
sange din nou.
J2) Cand sangele incepe sa curga in seringa sau prin setul de transfer, da drumulla
garou pentru a preveni fonnarea unui hematom.
13) Volumul necesar de sange odata recoltat, retrage acul din vena ~i preseaza
imediat punctul de punctie cu tampon steril. Pacientul sau ajutorul continua compresia
pana la hemostaza completa.
14) Prin perforarea membranei de cauciuc a flacoanelor repartizeaza imediat sangele
recoltat in 2 flacoane cu mediu de cultura (respectiv pentru incubare aerobii ~i anaeroba).
Dacii folose~ti pentru prelevare un set de transfer, ceea ce este de dorit pentru ea
pem1ite insamantarea direct in flaconul eu mediul de cultura, cind sangele a inaintat
sufieient in tubul de legatura, perforeaza membrana flaconului men!inut sub nivelul
punctului de punqie.
In eventualitatea cii prima tentativa de prelevare e~ueaza, folose~te pentru veni-
punctura alt ae sau alt set de transfer.
15) Agita bland flaconul pentru omogenizarea singelui in masa mediului.
16) Asigura, in cel mai scurt timp, transportul flacoanelor fiecarei hemoculturi la
laborator.
Cand hemocultura nu poate fi rucuta la patul bolnavului, folose~te pentru prelevarea
probei un tub eu 1 mL solu!ie 0,25-0,5% "liquoid" ca anticoagulant ~i expediaza imediat
proba la laborator pentru insaman!are.
171
9.3.5.5. Criterii de calitate a hemoculturilor
(1) Prelevarea inaintea terapiei antimicrobiene sau, dad nu este posibil, inaintea
dozei subsecvente de antibiotic. Precizarea antibioticului utilizat.
(2) Punctionarea altei vene la fiecare hemocultura.
(3) Evitarea prelevarilor prin cateter intravascular.
(4) Expedierea imediata la laborator sau, daca nu este posibil, incubarea flacoanelor
la 37C pana in momentul expedierii.
(5) Izolarea aceleia~i bacterii in mai multe flacoane.
in cererea de analiza vor fi specificate: diagnosticul clinic, ora recoWirii; in
caz de tratament antimicrobian, antibioticul ~i ora ultimei administrari inainte de
prelevare; dad prelevarea a fost facuta in cursul frisonului sau puseului febril.
9.4.1. lncubarea
172
Sunt comercializate sisteme semiautomate sau automate computerizate pentru
detectia rapida a bacteriilor in hemoculturi. Principiile pe care se bazeaza aceste sisteme
sunt in esenta:
detectia directa a producerii CO2, fie prin prelevare seriata de e~antioane de gaz
din flaconul de cultura ca in sistemul BACTEC (Becton Dickinson Instruments Systems,
Sparks, USA), fie prin fortarea fluidului de cultura (sub presiunea CO2 degajat) sa treaca
intr-un compartiment semnal de unde poate fi examinat microscopic ~i subcultivat ca in
Oxoid Signal System (Unipath, Basingstoke, Hampshire, England), fie prin difuziunea
CO2 printr-o membrana semipenneabila in cOl11partil11entulsel11nal unde acidifica ~i
schimba culoarea detectorului de la verde la galben ca in sistemul BacT/Alert (Organon
Teknika Corp, Durham, NC, USA);
detectia producerii de CO2, a variatiilor de pH sau Eh prin extinctia fluorescentei
unui indicator ca in sistemul Vital (bio-Merieux, Marcy-l 'Etoile, France);
cre~terea pe suprafetele de agar ale un or medii difazice, ca in Septi-Chek (Roche
Diagnostic Systems, Ruthelford, Ni, USA) ~.a.;
detectia electronica a turbiditatii bulionului.
Microscopia. Deschide ~i l11anipuleaza flacoanele strict aseptic. Efectueaza ~i
examineaza frotiuri colorate Gram.
Subcultivarea. Sunt posibile doua situatii:
Hemoculturi cu cre~tere evidenta. In raport cu flaconul in care a aparut cre~terea,
epuizeaza 0 ansa pe agar-sange ~ocolat pentru incubare aeroba sau cu agar-sange pentru
anaerobi. Epuizarea ingrijita pe 0 jumatate de placa este necesara pentru ca 10-15%
din hemoculturi sunt polimicrobiene. Functie ~i de rezultatul bacterioscopiei, putel11
recurge la:
Teste de identificare in cultura primara.
- Pentru diplococi sau streptococi: sensibilitatea la optochin, la bacitracina, testul
cu bila-esculina, toleranta la sare.
- Pentru stafilococi: testul coagulazei.
Cand cocii gram-pozitivi apar fara a~ezare cracteristica, testul catalazei poate
orienta diagnosticul: pozitiv la stafilococi, negativ la streptococi.
- Pentru bacilii gram-negativi: oxidaza, insal11antarea pe l11ediile politope TSI ~i
MIU/MILF, utilizarea citratului.
Antibiograma directa, nestandardizata, aduce rezultate utile in interval de 6-8 ore
~i are reproductibilitate buna in raport cu antibiograma pe subcultura standardizata.
Insal11anteaza placile cu un tamponinl11uiat in hel110cultura pozitivata (vezi Cap. 23).
Confirmarea rezultatelor prelil11inareprin testarea subculturilor pure este obligatorie.
Avand in vedere posibilitatea bacteriemiilorpolimicrobiene, aceste testari trebuie tacute
pentru mai multe colonii.
Hemoculturi flira cre~tere evidentii. Zilnic epuizeaza cate 0 ansa pe 0 placa cu
agar-sange ~ocolat pentru incubare aeroba ~i agar-sfmge pentru anaerobi.
Contralul final: la sfar~itul perioadei de observatie, din hemocultura ol11ogenizata
prin agitare, insamanteaza cateva picaturi in tub cu bulion tioglicolat ~i um1are~te 3 zile
o eventuala cre~tere la 37C.
173
9.4.3. Interpretarea rezultatelor. Diferentierea contaminantilor
174
Tabe/u/ 9-1
Punctajul de baza pentru calcularea scorului de semnificatie clinica a izolatelor din hemoculturi
(HIRAKATA ~i colab., 1996)
175
Toate izoIateIe trebuie comunicate. Clinicianul este cel care stabile;;te in final
semnificatia lor. Dar microbiologul poate interveni cu interpretari argumentate, de
competenta sa, privind probabilitatea contaminarii (legaturafeedback laborator clinica).
176
- conditii generale ale pacientului: febra, leucograma, VSH, concentratia
proteineiC reactive - suspiciunea de bacteriemie sau sepsis, ori solicitare ca exa-
men de rutina;
- tratamentul antimicrobian, eventual.
Metoda cantitativa. lnfige un ac steril in extremitatea proximala a insertiei i.v. a
cateterului ~i agit-o de cca 3 ori intr-un volum cunoscut de bulion tripticaza-soia. Mai
eficace este omogenizarea timp de un minutpe agitator Vortex. Efectueaza dilutii decimale
in acela~i mediu de cultura ~i epuizeaza dte 0,1 mL din fiecare dilutie, ca ~i bulionul
nediluat, pe ciite 0 placa cu agar siinge. Incubeaza 24-48 ore la 37C. Numara coloniile
dezvoltate ~i, tiniind cont de dilutie ~i volumulinsamiintat, ca1culeaza numarul UFC/
insertie.
lntopretare: prezenta a peste 103 UFC/insertie atentioneaza asupra iminentei
inflamatiei ~i bacteriemiei, care devin efective la peste 104 UFC/insertie.
Metodele semicantitative sunt u~or accesibile oricarui laborator .
Microscopia semicantitativa. Depune insertia i.v. a cateterului (cca 1 cmlungime)
intr-o picatura de solutie salina izotona pe suprafata unei lame de microscop. Acopera
cu a doua lama ~iruleaza insistent insertia intre cele doua lame. Separa lamele, usuca-le
~i Ie fixeaza prin caldura, apoi coloreaza-le Gram ~i respectiv cu albastru de metilen.
Examineaza la microscop cu marire mica (X 100), apoi cu imersia (X 1 000).
lnterpretare: In raport cu numarul polimorfonuclearelor ~i microorganismelor
observate, ca1culeaza scorul de pozitivare dupa sistemul propus de Cooper ~i Hopkins-
tabelul 9-2.
Tabe11l19.2
Punctajul pentru calcularea scorului microscopic* de pozitivitate pentru insertia Lv.a cateterelor
(dupa Cooper ~i Hopkins)
Scar 1/ 5Microarganisme
1/20 PMN
->1-101lama--3-10/lama
cilmpuri
1/5 cfimpuri
campuri
1120 cilmpuri > 1/cfimp
177
Fig. 9-1. Amprenta insertiei
intravenoase a eateterului de
la un sugar eu flebWi septicli
~istare septieemicii: aspeete
micros copice.
(A) la marire de 200 X; (B)la
marire de 1000 X (prin ama-
bilitatea prof. dr. Gabriela
Coman)
178
Rezultatele foarte bune dau testarile pentru prezenta glicocalixului pe suprafata
insel1iei i.v. a cateterului sau capacitatea izolatelor (bacterii gram pozitive, gram-nega-
tive sau levuri) de a produce glicocalix - vezi Cap. 40.
(2) Cateterul este mentinut in venii. Efectuam in tuburi sterile, doua hemoculturi
cantitative (vezi hemocultura cantitativa) comparative: una prin cateter, cealalta din vena
periferica (distal de cateter). Respecta toate precautiile de antisepsie ~i asepsie imp use
de prelevarea hemoculturii. Dupa omogenizarea sangelui, prelevam din fiecare tub 100flL
sange diluat ~i epuizam aceste volume pe cate 0 placa cu geloza sange. lncubam 24-48
ore la 37C.
Interpretarea rezultatelor. Izolarea unui numar de cel putin 5 ori mai mare de colonii
din proba prelevata prin cateter decat cea prelevata din vena periferica semnifica septi-
cemia de cateter.
(3) Catetere venoase periferice. Procedeaza ca in cazul cateterelor venoase centrale
retrase din vena.
Practici gre~ite.
Uscarea cateterului prin temporizarea examenului citobacteriologic. Pentru a
preveni erorile generate in asemenea situatii, este indicata efectuarea extemporaneu a
frotiului ~i insamantarii.
Prelevarea din cateterele centrale (arteriale sau venoase) numai a varfului. Trebuie
prelevata ~i examinata ~i insert,ia intravasculara adiacenta celei cutanate, pentru ca de la
insert,ia epidermica incepe colonizarea cateterului.
179
'----==........
..."""'
. ".,,c~
Este solicitata mai ales la pacientii cu SIDA. Uzual folosim metoda lizei cu
centrifugare.
180
Pentru fungi insamanteaza cate 0 placa cu agar-sange ;;ocolat, agar tripticaza-
soia cu sange, agar Sabouraud $i agar infuzie cord-creier cu sange. Incubeaza primele
doua pUici 3 zile la 37C, apoi 18 zilela 30C, iar ultimele doua 4 saptamani la 30C Cll
examinare zilnica in prima saptamana, apoi bisaptamanal.
Rata contaminarilor accidentale in aceasta metoda laborioasa poate fi controlata
printr-o buna tehnica aseptica in incinta pentru siguranta microbiologica de c1asa II.
Sangele lizat, imediat dupa prelevare, este filtrat prin membrana de acetat de
nitroceluloza. In final membrana filtranta este spalata $i taiata in mai multe parti, care
sunt depuse, cu fata in sus, pe placi cu medii agarizate pentru incubare in variate conditii.
De;;i mai laborioasa $i cu riscuri de contaminare mai mari decat hemocultura prin liza-
centrifugare, metoda prin liza-filtrare are 0 serie de avantaje: cre$te rata izolarilor la
pacienti sub terapie antimicrobiana pentru ca, 0 data cu concentrarea microorganismelor,
elimina $i chimioterapicul din proM; cre~terea izolatelor sub forma de colonii.
10. EXAMENUL LICHIDULUI CEFALO-RAHIDIAN
iN DIAGNOSTICUL INFECTIILOR
, SISTEMULUI
NERVOSCENTRAL
(DUMITRU BUIUC)
10.1. INTRODUCERE
Emisferele cerebrale, cerebelul, puntea ~ibulbul rahidian sunt cuprinse intr-o cutie
osoasa complet inextensibila din momentul inchiderii fontanelelor la sugar. Tot a~a,
maduva spinarii este inconjurata de canalul vertebral, iar riidacinile nervoase spinale
traverseaza gaurile intervertebrale, toate fonnatiuni osoase inextensibile.
182
Intregul sistem nervos central (SNC) este invelit de meninge, care are trei foite:
una externa fibroasa, dura mater, ~i doua interne, mai fragile, arahnoida ~i pia mater.
Arahnoida dubleaza dura mater, iar pia mater acopera intim to ate fonnatiunile anatomice
ale SNC. Intre arahnoida ~i pia mater este delimitat spatiul subarahnoidian, un sistem
areolar de lacune intercomunicante realizate prin trabecule conjunctive formate ca
expansiuni ale arahnoidei.
Lichidul cefalo-rahidian apare, in proportie de 60-70%, ca secretie a plexurilor
coroide din ventriculii cerebrali ~i,in proportie de 30-40%, prin difuzie libeza din tesutul
nervos. Fonnat in ventriculii cerebrali, LCR trece in spatiul subarahnoidian prin trei
foramene ale ventriculului IV. Resorbtia LCR prin vilii ~i granulatiile arahnoidiene este
in echilibru cu secretia.
Rolul fiziologic al LCR este de protectie biomecanicii (amortizare ~i mentinere a
formelor anatomice proprii SNC, tesut cu consistenta semifluida) ~i biodinamica
(eliminarea surplusului de lichid interstitial, mentinerea homeostaziei mediului in care
functioneaza neuronii). Barierele hel11atol11eningee~i hel11atoencefalidi reduc accesul
agentilor infectio~i, al metaboliti1or toxici, dar ~i al chimioterapicelor catre LCR ~itesutul
nervos.
Defecte congenitale, cicatrizarea unoI' leziuni inflamatorii ~.a. stranguleaza circulatia
dintre ventriculii cerebrali ~i spatiul subarahnoidian ~i detennina hidrocefalie, conditie
corectata chirurgical prin ~unturi care evita strictura.
Infectiile SNC pot evolua ca:
1) Meningite purulente cauzate cel mai frecvent de bacterii; ocazional de protozoare.
Afecteaza frecvent tesutul nervos subjacent ~i ventricuIii cerebrali.
2) Meningite cu lichid clar ~i evolutie acuta: sunt determinate mai frecvent de
virusuri (meningite aseptice), uneori de leptospire. Ocazional au variate alte cauze
(chimice, fizice, alergice, neoplazii, focare supurative parameningiale). Ccmd evolueaza
cronic, este posibila etiologia tuberculoasa, sifiIitica sau fungicii. Dificile probleme de
diagnostic pun meningitele bacteriene "decapitate", prin tratament antimicrobian
incomplet, care pot evolua cu lichid claro
3) Ence.falitele, inflamatii ale creierului, mai frecvent sunt virale, dar pot sa apara
~i prin mecanism infecto-alergic. Uzualli se asociaza ~i meningita.
4) Poliol11ielitele sunt inflamarii ale tesutului nervos, care evolueaza cu distrugerea
selectiva a neuronilor motori (spinali, bulbari etc.). Cel mai frecvent sunt virale.
5) Supurariile (abcese cerebrale, subdurale sau epidurale) au un tablou clinic com-
plex in care semnelor neurologice focale (cele mai frecvente) Ii se asociaza semne de
iritatie meningiala ~.a. De altfella ace~ti pacienti punctia pentru prelevarea LCR este
fonnal contraindicata din cauza hipertensiunii intracraniene. Cand se obtin totu~i probe,
profilul modificarilor citologice ~i biochimice din LCR este nespecific. Examenul mi-
crobiologic al puroiului din aceste abcese este prezentat in Cap. 11, iar examenul probelor
biopsice pentru diagnosticul infectiilor fungice intracerebrale se conduce dupa indicatiile
din Cap. 38.
Infectarea SNC se poate produce:
Hematogen, in cursul unor bacteriemii (mai ales cand se depa~esc 104 UFC/mL
sange) sau viremii cu variate porti de intrare. La randul rau, meningele infectat devine
focar bacteriemic.
183
Din nazofaringe prin tecile limfatice olfactive (meningococ, pneumococ,
Haemophilus injluenzae).
Prin contiguitate, din focare infectioase juxtameningiene (otomastoidita, sinuzite,
propagarea rino-cerebrala a infec!iilor cu zigomicete, Aspergillus spp.).
Din exterior (conduct auditiv extern, tegumente, nazofaringe) dupa fracturi
craniene (meningite traumatice cu cel mai variat spectru etiologic), punctii rahidiene san
interven!ii chirurgicale pe nevrax (meningite iatrogene, eventual cu tulpini bacteriene de
spital) ~i la pacien!i cu anomalii congenitale (meningocel ~.a.).
De aceea examenul microbiologic al sangelui ~ial prelevatelor de la variatele poni
de intrare ale infec!iei sunt examene complementare in diagnosticul etiologic al infectiilor
meningoencefalice.
Consecutiv coloniziirii cu bacterii din miocrobiota cutanatii, mai ales Staphy-
lococcus epidermidis, a ~unturilor pentru controlul hidrocefaliei.
Rar pe cale intraneural a (e.g., virusul rabic prin nervii senzitivi periferici,
ocazional virusul Herpes simplex prin radacinile nervului trigemen ori ale nervilor
sacra!i).
Bacteriile izolate din LCR, in ordinea frecven!ei, sunt prezentate in tabelul 10-1.
Tabellil 10-1
184
Meningitele fungice (ClyptococcuS neoformans, Candida albicans) sunt rare ~i
apar la gazda imunocompromisa.
Meningitele bacteriene ~ifungice tratate antimicrobian precoce ~icorect se vindeca.
Dau 0 mortalitate mare dad nu sunt tratate ~i lasa sechele grave daca tratamentul este
tardiv sau incorect.
Meningitele virale sunt relativ frecvente. De~i cele mai multe nu beneficiaza inca
de tratament antiviral, in majoritatea lor evolueaza benign.
Grave, frecvent letale, sunt meningitele amibiene determinate de Naegleriafol,vleri
sau Acantamoeba-Hartmanella. Acestea sunt organisme tennofile, care habiteaza bazinele
de apa contaminate fecal. Boala afecteaza copii ~i tineri dupa imbaierea estivala in
asemenea ape. Forma infectanta sunt trofozoitii, care patrund activ spre meninge prin
tecile limfatice ale nervilor olfactivi.
Meningitele aseptice sunt mai frecvente la copii ~i determinate in cca 70% din
cazuri de enteroviruuri (Coxsackie A7, A9, B2-B5, Echo serovarurile 4,6,9, 11,16,30;
rar poliovirus sau enterovirus 71) ca izbucniri epidemice estivo-autumnale. Imbolnavirile
in sezonul de iama ~iprimavara sunt determinate mai frecvent de virusul urlian, rujeolic,
varicela-zoster. Rar sunt cauzate de virusul gripal, paramixovirusuri, adenovirusuri,
citomegalovirus.
Meningoencefalita herpetica apare ocazional ca infectie a adultului sau nou-
nascutilor. Virusul choriomeningitei limfocitare infecteaza sporadic adultii dupa contact
cu colonii de ~oareci. In Romania meningoencefalitele arbovirale sunt rare.
185
10.4. EXAMINAREA PROBELOR DE LCR
Citologia cantitativa este esentiala pentru probele de LCR clare, opalescente, sau
tulburi. Se poate renunta la ea in cazul probelor purulente.
Agita bine proba dintr-ul1 tub pentm omogenizare. Preleva aseptic cu pipeta Pas-
teur 0 cantitate mica de lichid, suficienta pentru a umple camera de numarat Fuchs-
Rosenthal (fig. 10-1).
186
Lamela
Numaratoarea: 7celule
Sus stanga - umplerea camerei cu proba de LCR. Umeze~te u~or profilele laterale ale lamei
pentru a asigura aderenta lamelei. Lamela a aderat perfect daca la acest nivel observi inelele de
difraerie Newton.
Dreapta - reteaua de numarat are 16 mm\ ceea ce la adfmcimea de 0,2 mm a profilului central al
lamei da volul11ul de 3,2 111m3al camerei (practic 3 mm3). Examineaza cu obiectiv 20X ~j ocular
5X. Daca pe un patrat mare sunt cca 50 celule repartizate unifonn, numara celulele de pe cele 4
patrate mari ale diagonalei: numarul celulelor/mm3 va rezulta din sum a celulelor de pe cele 4
patrate mari inmu1tita cu 4 ~i impartiti'i la 3. Daca densitatea celulelor este mai mica, 1a
numaratoarea pe toate cele 16 patrate mari ale camerei ~i imparte suma la 3 pentru a at1a numarul
celulelor/mm3
Stangajos: detaliul unui patrat mic. Numara, pe rand, celulele de pe latura stfmga, latura superioara,
apoi restul supraferei. in zona laturilor numara numai cclulele care intra cu mai mult de j umatatc
in aria patratului.
10.4.4. Bacterioscopia
Bacterioscopia este cea mai accesibila metoda rapida pentru diagnosticul etio-
logic almeningitelor.
De~i prezenta leucocitelor favorizeaza sedimentarea bacteriilor, multe bacterii nu
sedimenteaza in intervalul de timp ~i acceleratia indicate pentru examenul citologic. De
aceea, probele, in care reactia inflamatorie cu polimorfonucleare este minima, trebuie
concentrate prin centrifugare 10 minute la 10 000 xg sau cel putin 30 minute la 1 500 xg.
In meningitele acute bacteriile realizeaza in LCR celmai frecvent concentratii mai
mari de 105 UFC/ml, situatie in care centrifugarea unei probe pfma la 2 mL da rezultate
satisfacatoare. In meningitele cronice cu bacili acido-rezistenti sau in cele fungice
sensibilitatea depistarii cre~te cu volumul de LCR supus centrifugarii ~i prin examinare
de probe repetate.
Efectueaza frotiurile numai pe lame noi pentru a avea siguranta ca nu au bacterii
restante de la examinari anterioare.
Din probe Ie purulente, pentru un reZUltat mai rapid, putem efectua un frotiu ~i
inainte de centrifugare.
Coloralia Gram. Examinarea atenta, timp de cca 10 minute, cu marire de 1000 X
depisteaza bacteriile din LCR cu sensibilitate variabiala ~i specificitate satisfacatoare.
Recolorarea prelungita la 2 minute cu fucsina favorizeaza depistarea unoI' bacterii ca
HaenlOphilus influenzae ~i Fusobacterium spp., care fixeaza slab contracolorantul, mai
ales safranina.
Bacterioscopia pe frotiuri colorate cu albastru de metilen este frecvent mai
sensibila dedit cea pe frotiuri colorate Gram.
Coloratiile pentru bacili acido-rezistenti. Sensibilitatea depistarii bacililor acido-
rezistenti cre~te pe frotiuri efectuate in straturi suprapuse. Depune cu pipeta Pasteur 0
piciitura din sedimentul probei de LCR tara etalare. Usuca lama ~idepune 0 noua picatura
in acela~i loc. Repeta operatia de 3--4 ori. Frotiul trebuie scrutat cu atentie cca. 15 minute.
Daca laboratorul dispune de microscop pentru fluorescenta, este indicata examinarea
frotiurilor colorate cu auramina sau auramin-rodamina. Sensibilitatea depistarii bacililor
acido-rezistenti variaza in limite foarte largi, specificitatea este insa buna.
188
TabelullO-2
Profilul citologic ~i biochimic al LCR in meningite (adaptat dupa MARTON ~i GEAN, 1986)
- -
PrezentTuberculoasa
<Mononucleare
PMN
?Nonnala
Crescute
Variabil
Crescute:
Foartc
Scazutii
0,76-0,85
0,77-0,81
20-40
0,85
U~or
>35
40-300
-100
65-70
15-100
20-40
(initial
100-200
Leptospirotica
25-100 tinere
Monunucleare
Insuficienta
1000-2000
500
5-1000
Foarte
Crescut: ?Foarte
0.96
lnsuficienta
100-500
Normala
Scazuta
Virala
Amibiana
mg/dL
mg/dL crescute:
mica
Foartc
Mica
PMult
Mica
Crescut:
0,96
1,0Fungica
0,58
crescute:
mg/dL
mg/dL3
mg/dL
segmentate
PMN)
Sute-miil)
mg/dL
Foarte - ?35Normal:
MN crescute:
mica
scazuta mg/dL Mononucleare Tipul de meningita
20-40
:<:;
mg/dL
Bacteriana
I) Uneori < 100, aheori > 60 000; la nou-nascut ~i sugar D.W. Teele (citat de GRENIER ~i MARCHAND, 1983) accepta diagnosticul de meningita
bacteriana acuta (chiar cu cultura stcrila) daca sunt prezente pestc 8 leucocite sau peste I PMN/mm3 LCR.
2) Raportul glicorahie/glicemie < 0,31 are sensibilitate ameliorata pana la 0,70 In meningitele bacteriene acute ~i evita rezultate fals negative la
pacienti cu diabet zaharat (POWERS, 1981).
3) Poate fi redusa la cca [;.\din pacienlii infectati cu virus herpes simplex sau urlian.
In caz de proba hemoragicii se impune corec(ia proteinorahiei: penlru fiecare 100 hemalii/ll1m3 LCR se scad 0,1 mg proteine/dL LCR
41
(FISHMAN, 1987).
\000
>-'
\0 TabelullO-3
o
E~alonarea investigatiilor in mierobiologia elinica in raport eu impactul asupra deciziei eHnice
nou- gram-negativi
(la Test
LA A-Sab
Limulus
Accesorii
Sellsibilitate:
ClE, CoA,___
Microscopic:
Microscopie
Microscopie:
CryptocoCCU,I'
pentru
Cocultivare
Microscopic
Agar
Page ~LA, pecu_______
I)pc:O:\,O
antigen
1,5%
Obligatorii
infrotiu
coloratic
agarfond
contrast colorat
_.negru
.transparent
solutie
Medii de
Examene
eu(tu~E. rapide
. __pentru
___ncgativa
dcsalina
faza
izolare2l
p.
AS, McC, BTS,
LJMediul Korthof AS, BTSde S.(McC),
AS.strie
AS+ (ASC), BTS
BTS,
aureus BTS,
AS
RFC+ pcntru
strie deanticorpi
Specificitate:
Sensibilitate: S.aureus
S. aureusanti-Coccidioides
0,1-0,9
1,0
<1,0
va
I) CIE = eontraimunoelcctroforcza; CoA = eoaglutinare eu S. aureus; LA = latcxaglutinare, RFC = reaqic dc fixarc a cOll1plcmcntului,
2) 0 = ll1edill utilizat hleultativ. AS = agar-sallgc. ASC = agar siinge ~oeolat. McC = agar Mac Conkey, BTS = bulion tioglicolat eu 10% sange de
lepllrc.
Depistarea ~i identificarea microscopidi a altor agenti infectio~i in LCR. Uzual
este preparatul umed intre lama ~i lamela.
Cryptococcus neoformans. Este indicat preparatul colorat negativ cu tu~ de India
sau suspensie 2,5% nigrozina in glicerol 50%. UTInare~te levurile rotunde sau ovale,
inmugurite ~iinconjurate cu un halou mare incolor, capsula. Nu toate tulpinile au capsula
evidenta. Sensibilitatea metodei este de numai 0,5, modesta fata de depistarea antigenica.
Examenul sedimentului din probe repetate cre~te sensibilitatea depistarii. Erori posibile:
confundarea hematiilor, leucocitelor, a particulelor de amidon cu levuri incapsulate.
Leptospire. Examineaza preparatul umed la microscopul cu fond negru ~i
um1are~te prezenta leptospirelor cu morfologia ~imi~earile lor earacteristice. In LCR, ca
~i in sange, leptospirele pot fi depistate in prima saptiimana de boala. In probele
hemoragice, expansiuni fibril are ale hematiilor ~iplachetelor pot fi confundate cu lepto-
spire. In asemenea situatii lasa proba la temperatura camerei pentru sedimentarea spontana
a hematiilor ~i examineaza supematantul.
Amibe. La primirea probei de LCR in laborator, agita u~or tubul pentru a desprinde
trofozoitii de pe stiela. Centrifugheaza imediat proba 5-8 minute la cca 200 xg. Folosind 0
pipeta gradata cu propipeta, decanteaza supematantullasand restant maximum 0,5 mL.
Retine supematantul decantat intr-un tub steril la 4C pentru alte examinari necesare.
Resuspensioneaza sedimentul in supematantul restant.
Depune 0 pici'itura din sedimentul resuspensionat pe 0 lama de mieroscop, acopera
cu 0 lamela nr. 1 ~i examineaza cu obiectivul 1OX ~i 40X ~i lumina diafragmata
corespunzator. De preferat este examinarea la microseop cu platina incalzita la 35-37
~i cu iluminare in contrast de faza.
Pastreaza restul sedimentului pentru cultivare (vezi mai jos).
Naegleriafowleri apare ca trofozoiti ~i chi~ti. Trofozoitiii au un stadiu amibian ~i
unul biflagelar. FOTInaamibiana este alunl;?itaca un limax, are cca 10/35 f.1m~i mi~cari
vii prin pseudopode boante, hemisferice. In stadiul biflagelar organismul este sensibil
mai mic, pirifoTIn. Chi~tii, mai freevent sferici, au diametrul de 7-15 f.1m~i un perete
gros cu mai multi pori plini cu material mucoid.
Acanthamoeba are trofozoiti de 15-45 f.1mdiametru, cu pseudopade subtiri, acumi-
nate (acanthopade). Chi~tii sferici, de 10-25 /lm diametru, au perete dublu, gros:
endochistul rotund, poligonal sau stelat ~i exochistul valurit, zbarcit.
Ambele organisme au nueleul unic, cu un nucleol mare.
Amibele pot fi uTInarite ~i pe preparate fixate ~i colorate. Lasa pici-itura de sedi-
ment pe lama de microscop timp de 5-10 minute, in camera umeda, pentru a permite
amibelor sa adere la stiela. Coloreaza tricrom sau cu sulfat feriamoniacal-hematoxilina
(vezi Cap. 42).
D([eren{ierea dintre amibe fji macro[age. La examenul cu obiectivul mic al
preparatelor umede amibele pot fi confundate cu macrofagele. La marire mai puternica,
mobilitatea este cea care Ie diferentiaza. Dqi cu mi~cari lenqe, Naegleria este evident
mai mobila decat macrofagele. Acanthopodele faciliteaza difrentierea macrofagelor de
Acanthamoeba.
Pe preparatele bine colorate, nueleul rotund cu nueleol unic, mare ~i central, al
acestor amibe se diferentiaza net de nueleul neregulat cu mai multi nucleoli al
macrofagelor. Eritrocite fagocitate se observa intracitoplasmic la Naegleria, dar lipsesc
la Acanthamoeba.
191
La putinii pacienti cu abcese cerebrale amibiene, Entamoeba histolytica se
diferentiaza u~or de Naegleria prin mi~carile mai vii, pseudopode digitifom1e, iar pe
preparatele colorate nucleul apare cu un nueleol mic central sau excentric.
Sensibilitatea ~i specificitatea, in raport ell eultura, a eelor mai utile metode alternative pentru
depistarea rapidli a microorganismelor in LCR (dupa AUWERA, 1987)
0.99
0.94
0,99
Testul/Microorganismul Specificitate
LOOLOO Sensibilitate
0,87
0,60
0,96
0,64
0,90
::;0,71
1,00
H. Endotoxina
injlllenzae
N. meningitidis tip b
N. meningitidis
192
10.4.6. CuHivarea
193
10A.7. Antibiograma
11.1.INTRODUCERE
195
laboratorulintare$te eroarea pe baza unui argument inconsistent: izolarea catorva co]onii
de stafilococi din puroiul unei fistule tara ca microscopia directa sa confimle prezenta
lor intre celulele inflamatorii. In repetate randuri am semnalat etichetari eronate de
stafilococie pentru variate micoze cu manifestari cutanate sau limfocutanate.
Impetigo stafilococic, streptococic sau, uzual, mixt este tot mai frecvent intftlnit,
mai ales la copii, ca 0 boala a mizeriei.
Frecvente sunt infectii]e unitatilor pilo-sebacee (furuncule, carbuncu]e, hidro-
sadenite) cauzate de Staphylococcus aureus.
Manifestari supurative cutanate pot fi cauzate $i de variati fungi dupa diseminari
hematogene (Histoplas17la capsulatum, Coccidioides immitis, Blastomyces dermatitidis)
sau unnare a unor intepaturi cauzate de spini ori a$chii de lemn (Sporothrh schenckii.
Cladosporiwn spp. $.a).
196
se imnultesc independent la acest nivel. (2) Tabeluill-I
Tesutul viabil subjacent de la care pome~te Bacterii izolate in cultura pura ~i cantitati > 10'
procesul de cicatrizare ~icare raspunde prin UFC/g de tesut biopsic din plagi traumatice
inflamatie la contaminarea, colonizarea sau
6I
% din totalul
4032:178
12
16
invazia microbiana. Aceasta
Escherichia
Klebsiela- coli diferentiere izolatelor
Specia
Proteus spp.El1rerobacter
Bacteroides
Staphylococcus
Providel1cia
Streptococi
Pseudomol1as spp.
CorYl1ebacterium
spp.
f3 epidermidis
spp.
- hemolirici
aerugil10sa
Staphylococcus aurells
are consecinte in patogenia infectiei supra-
fetelor denudate, in practica chirurgicala ~i
a investigatiei microbiologice.
Dintre contaminantii plagii, pro-
gresiv, se selecteaza tulpina cu cel mai mare
potential patogen (tabelul 11-1) sau aso-
ciatii bacteriene sinergice (ca Escherichia
coli - Bacteroides fragilis ~.a.), care inva-
deaza tesuturile. Astfel flora gram-pozitiva
de contaminare initiala este in scurt timp
dominata ~i inlocuita de S. aureus sau de bacili gram-negativi. Invazia microbiana a
tesutului viabi1 subjacent plagii se face, pomind de la spatiul mort, in lungul septurilor
fibroase ~i prin 1imfaticele adiacente nervilor ~i vaselor sanguine. Proliferarea
perivasculara a microorganismului invadant detem1ina leziuni caracteristice de vasculita
~ichiar invazia vaselor mici. Vasele mari sunt protejate de invazia intraluminala cu bacterii
prin bariera formata de tesutul elastic ~imembranele bazale. Acestor leziuni de vasculita
Ii se asociaza tromboze septice responsabile de: hemoragii interstitiale, necroza in
teritoriul tisu1ar irigat de vasele trombozate, diseminarea sanguina a infectiei. Daca
acumnularea unei bacterii in concentratii peste 105 UFC/g de tesut semnifidi infeqia,
depa~irea cu numai 2 loglo a acestui prag se insote~te cu diseminare septicemica.
Eradicarea microorganismelor din spatiul mort creat de traumatism este practic
imposibila rura interventie chirurgicala. Daca aceasta intarzie, evolutia spre infectie nu
poate fi evitata. E~antionajul din ora in ora al plagilor dupa traumatism dilacerant a
ariitat ca sunt suficiente 5,17 ore pentru ca bacteriile conditionat patogene sa realizeze
nivelul critic 105 UFC/g de tesut.
Cand colonizarea tesutului denudat se apropie de nivelul critic, inse~i materialele
de sutura scad de cca 1000 ori doza infectata. In experimente pe ~oareci a fost demonstrat
ca in prezenta suturii doza de S. aureus necesara pentru apariiia puroiului scade de la 10"
la 103 UFC.
Patul tisular pregatit pentru greru la pacienti cu arsuri, in ciuda aspectului "curat"
a continut in 34% din cazuri peste 105 UFC bacterii gram-negative/g. La 30 pacienti cu
peste 105 UFC/ g de tesut din acest pat au fost necesare III greruri repetate. Din contra,
77 grefe au prins per primam la 81 pacienti cu sub 105 UFC/g de tesut din pat, de cele
patru e~ecuri fiind responsabil Streptococcus pyogenes.
Plagile traumatice sunt mai frecvent infectate de bacteriile prezentate in
tabelul11-1. Bacilii gram-negativi intestinali sunt frecvent implicati in infeqiile plagilor
din regiunea coapselor, feselor, abdomenului inferior. In infectia plagilor de razboi sunt
larg implicate bacteriile anaerobe, inclusiv clostridiile. Infeqii cronice cu Nocardia ale
plagilor contaminate cu sol sunt frecvent eronat diagnosticate. Micobacterioze
197
posttraumatice sunt cauzate de Mycobacteriumfortuitum-chelonae (provenit din sol, de
la animale inferioare, corpi straini, ace, seringi ~i medicamente injectabile contaminate),
M. marinum (provenit din apa de mare, de la pe~ti).
Pliigile chirurgicale din zone nonnal contaminate se pot infecta cu bacterii din
microbiota regiunii anatomice in care a avut loc interventia chirurgicala (e. g., colon).
Frecvent infectia plagilor operatorii se produce cu tulpini de spital. S. aureus, P.
aeruginosa, Klebsiella spp.
Pliigile mu~cate de animale sunt frecvent infectate cu Pasteurella multocida:
mu~caturile de ~obolan sunt particular infectate cu Spirillum minus sau cu Streptobacil-
lus moniliformis, iar mu~caturile de om sunt urmate de infectii mixte cu aerobi \>ianaerobi
ai cavitatii bucale.
In arsuri intalnim frecvent stafilococi, P. aeruginosa, Klebsiella spp., Enterobacter
spp., enterococi; mai rar Moraxella spp., Proteus spp., Escherichia coli, Providencia
spp., Hajilia. In ultimii ani sunt semnalate tot mai frecvent infeqii ale arsurilor determi-
nate de fungi: Candida spp., zigomicete, Aspergillus spp.
Ulcerele cutanate cronice pot fi infectate de streptococi piogeni (grup A, G ~.a.),
streptococi anaerobi, S. aureus, Nocardia spp., Mycobacterium spp., treponeme.
Investigarea etiologica a unui ulcer cutanat cronic presupune ~i examenele serologice
pentru sifilis.
Sunt frecvent urmarea propagarii pe cale limfatica sau hematogena a infectiei din
focare de la nivelul mucoaselor (uterina, faringiana, bronhopulmonara) sau tegumentelor
(furuncule, celulite). Alteori aceste infeqii apar prin solutii de continuitate intre
inveli~urile organismului ~i cavitatile seroase (perfora!ii intestinale etc.).
Adenite supurate pot fi determinate de streptococi piogeni, stafilococi, bacterii
intestinale, varia!i fungi. La copii pot fi in cauza Mycobacterium tuberculosis sau alte
micobacterii. Buboane tributare p0rtii de intrare a infec!iei apar in tularemie, pesta,
limfogranulomatoza veneriana.
Abcesele viscerale au variate etiologii. Mai frecvent sunt implicate bacterii
facultativ anaerobe sau anaerobe. Ocazional pot fi detenninate de Entamoeba histo~vtica
(in special cu localizare hepatica).
Din puroiul pleural, bacteriile cel mai frecvent izolate sunt:
Streptococcus pneumoniae Enterobacteriaceae
Streptococcus pyogenes Fusobacterium spp.
Staphylococcus aureus Bacteroides spp.
Pseudomonas aeruginosa Peptostreptococcus spp.
In puroiul peritoneal pre domina enterobacteriaceele asociate cu variate bacterii
gram-pozitive ~i gram-negative anaerobe.
Diagnosticul de laborator al supura!iilor pelvine este tratat in Capitolul16.
In etiologia pleureziilor ~i peritonitelor poate fi implicat M,vcobacterium tuber-
culosis.
198
11.2.4. Supuratiile articulare
11.2.5. Micetoamele
Micetoamele sunt infectii cronice locale, progresiv distructive ale pielii, tesutului
subcutanat, musculo-aponevrotic ~i osos detenninate de fungi (eumicetoame) sau de
actinomicete (actinomicetoame) care patrund in tesuturi prin plagi determinate de spini,
a~chii de lemn etc. Clinic se manifesta ca tumefieri care contin granuloame supurative
cu multiple fistule prin care se scurge puroi cu granule micotice variate ca aspect.
Actinomicetoamele sunt determinate mai frecvent de Actinomyces spp. ~i evolueaza in
regiunea cervico-faciala (cca 60% din localizari), abdominal a (cca 30%) sau toracica.
Eumicetoamele sunt localizate cu preciidere la picioare ~i maini, fiind determinate de
ascomicete, ca Emericella, Petrielidium, sau deuteromicete, ca Acremonium spp,
Curvularia spp., Fusarium spp., Madurella spp., Exophiala jeansel711ei.
Prelevarea probelor din supuratii frecvent este unica ~iirepetabila. De aceea legatura
medic-Iaborator trebuie sa fie irepro~abila sub rapOltul: planificarii examenului, avertizarii
laboratorului, tehnicii de prelevare, ambalarii, etichetarii ~i expedierii imediate a probei
in intervalul de maximum 1-2 ore.
Tampoanele sunt contraindicate pentru prelevarea puroiului ori de dite ori putem
obtine probe prin punctie-aspiratie, chiuretaj sau biopsie. I~()lClreabacteriilor anaerobe
de pe tampoanele uzuale este imposibil~, Cu precautii speciale (e. g., utilizarea pentru
transport a unui mediu stabilizator norr-i1Utritiv;~Stuart,Amies ~.a., a containerelor anae-
robe), tampoane pot fi utilizate numai pentru prelevarea puroiului din coleqii foarte
mlCl.
Cand este necesara, irigarea leziunilor se face cu solutii saline non-inhibitorii,
cum este solutia Ringer lactozata.
Leziunile cronice sunt sarace in bacterii, de aceea se imEll]2J2r:~1~~Y(1teprobecu
volum 111aimare decM din leziunile - - .-
199
Tamgond:>
vata sleril Unele bacterii anaerobe sunt omorate ~upa cateva
secunde in contact cu oxigenul atmosferic~~It~Je,_c;i1n
~~ . ~$J~;fJ Bacteroides, Clostridium peJji'ingens, PeptostreptocoCClIS,
supravietuiesc 30-90 minute in prezenta a 2-8% oxigen.
In lips~_COl1tainerelor speciale pentmanaergbLJ?}lroiul
Punctie SI
aspir'arie recoltat plin pupctie cu selinga este h'anspOliat lalal?gl:~to~'~
prin procedeul"seringa anaeroba" (fig. 11-1), care asigur~
f
supra~ietuirea; anaerobilor cel putin 30 dC:]l1inllJ:~_.
__
In laboratOl;,---6data-examenele preliminare ~i insa-
mfmtarile tacute, restul probei, corect etichetat ~i inchis
enlletic, este refrigerat pentm eventualitatea necesitatii
unoI' examene de laborator suplil11entare.
Elimina
i Obtureaza 11.3.2.Prelevari din arsuri, pHigi
bulele
de aer
acul(u cbp
de c:aUClU(
~iulcere cutanate infectate
Arsuri ~ipli'igi
Prelevari biopsice sunt indicate cand conduita
terapeutica impune cunoa~terea concentratiei bacteriene
Fig. 11-1. Prelevarea ~i trans-
in tesuturile viabile afectate prin arsuri sau traumatism ~i
portul in "seringii anaerobii" a
extinderea leziunilor.
probelor de puroi aspirate din
colectii ~i cavitiiti o arie tara escara este spalata cu solutie salina izotona
sterila pentru indepartarea exsudatului stagnant sau a
eventualilor agenti topici antimicro'bieni. Prelevarea se face cu perforatoml dermic de
4 mm. Anestezia nu este necesara in caml plagilor. Proba se expediaza la laborator in
tub inchis el111eticpentru examinare imediata.
Prelevarile intraoperatorii se fac, dupa debridarea ~i excizia tesutului devitalizat,
din resut viabil de la baza plagii .
Prelevarea cantitativa cu tamponul. Alege 0 arie a plagii lips ita de resut necrotic
~i pregate~te-o cum este precizat l11aisus. Umecteaza un tampon din vata hidrofila cu
solurie Ringer lactozata. Invarte varful tamponului, timp de 5 secunde, pe 0 arie de ] cm2
a plagii, suficient de fel111pentru a detel111ina0 u~oara sangerare din resutul subiacent.
Acesta da garanria prelevarii din resut viabil. Imerseaza tamponul intr-un mL bulion
tioglicolat ~i expediaza-lla laborator pentru examinarea imediata.
De$i intervalul de 95% confidenta al prelevarii cantitative pe tampon este in limita
al,7 loglo (u~or mai redus decat al tehnicii biopsice, care este in limita a 1,31 log\ll)'
simplitatea ~i disconfortul redus pentru pacient 0 indica pentru monitorizarea pacienrilor
ar$i, la care poate asigura prelevari bisaptamanale.
E$antionajul corect de la nivelul denudarilor mari impune prelevari din mai multe
puncte ale suprafetei lezate.
PHigi mu~cate. Dupa toaleta ingrijita a plagii sunt indicate, in functie de condiriile
locale: puncria ~i aspiraria din colectiile purulente, punctie oblica, prin tegument nor-
mal, ~i aspirarie din resutul inflal11at. La pacienti suspectati de febra a mu~caturii de
$obolan este utila puncria-aspirarie ganglionara.
200
Ulcerele cutanate cronice. Examinarea prelevarilor pe tampon este in~eHHoare.
Sunt indicate biopsia sau produsul de chiuretaj dupa spalarea exsudatului stagnant de pe
suprafata leziunii. Rezultate bune da aspiratia lichidului interstitial de sub suprafara
denudata facuta prin punctia oblica a tegumentului sanatos de la periferia ulceruJui cu ac
hipodermic adaptat la seringa etan~a.
Din leziuni accesibile punctiei (abcese superficiale, colectii din cavitatile seroase)
puroiul trebuie aspiral(;~_un __
<!~~Jlfi.cientde~~os (pel1t1JdJu~vit~<pl,lnqiaQlr1J~
in caz,-!.l<
puroiuluiVascos) adaptat la seringa etan~3'. - -- - .
Pentru eventualitatea depistarii unui abces in interventii pe organele toracice,
abdominale sau pelvine, chirurgul trebuie sa aiba la indemi'ma recipiente sterile pentru
colectarea ~i expedierea puroiului. De cate ori se excizeaza peretele abcesului (mem-
brana piogena), cateva fragmente trebuie expediate pentru examenuJ microbiologic.
Este posibil numai pentru probele de puroi prelevate in seringa sau recipiente.
Ul111arim:mirosul, culoarea, consistenta, omogenitatea sau prezenta granuleJor.
Culoarea puroiului variaza de la galben la ro~u bruno Aspectul ro~u se datoreaza
prezentei sangelui sau hemoglobinei. Puroiul din abcesele hepatice amibiene este brun
inchis sau galben-brun. Cel din pIagile ~iarsurile infectate cu bacil piocianic este albastru-
verzui. Puroiul verzui sugereaza 0 infectie pneumococica.
Consisten/a. Purciul cre1110s,bine legate~~t.i~yentru infe~lii s,tafiJ.()~.()E!t::.
cel fluid pentru infectii sirepfococice, iafCeICaZeos pentru irifeC1:Tatuberculoasa. Puroiul
poate ajunge la laborator coagulat in infectiile stafiIococice sau in cazuJ probelor
hemoragice.
Puroiulmicetoamelor este fluid ~i contine granule caracteristice, colonii tisulare
ale micetului sau actinomicetului infectant. Pentru observarea granulelor examineaza
proba de puroi, cu ochiulliber ~i cu lupa, in baie de solutie salina izotona, intr-o cutie
Petri a~ezata pe fond negru. Tabelul 11-2 descrie caracterele granulelor din puroiul
micetoamelor in functie de agentul etiologic. Tifonul tampoanelor de acoperire a fistulelor
unui micetom trebuie examinat cu atentie penull ca poate retine granule din puroiul
drenat.
201
No Tabeluill-l
N
Principalele caractere ale granulelor din puroiul micetoamelor (adaptare dupii PADHYE ~i AJELLO, 1980)
MaterialDimensiunea
de
Alba
Absent
Ro~uAbsent
AlbaiGalben
Galbena/
Galbena/
Neagra Albii
Galbena/Bruna
lnchis
Prezent Albii
Ferma
Consistenta
Galbenal omogen Sfericii/Lobata
Ferma-dura
Moale
deschis
Ovala/Lobata
Variabila-multilobata
Lobatii/Miiciucata
Rotunda/Ovala
Moale-ferma
Ovala/Lobata/Ren
Sferica/Lobata
Alba/Ro~iatica
Ro~u-brun/Neagra
periferic Neregulat sfericii, iforma
t,O-2,O
0,5-5,0
0,2-0,5
1,0-5,0
0,5-1,0
1,0-2,0
0,3-0,5
0,025-0,150
0,2-5,0
0,3-0,6
Forma fin dendriticii"cimentare"
Lobata/Ovala/Serpiginoasa
Agentul etiologic I) Culoarea
Petrellidium boydii
Actinomyces spp.
Streptomyces somaliensis
11.4.2. Microscopia
203
11.4.2.2. Examenul preparatului umed
Dupa caz unnarim:
Amibe mobile in puroiul din abcese hepatiee.
Scoleqi sau cro~ete de Echinococcus
Celule levurifol111e ~i pseudohife de Candida, fonna levurica de Histoplasma
duboisii, Blastomyces dermatitidis ori sferule de Coccidioides immitis.
Microcolonii ale actinomicetelor sau fungilor in granulele micetoamelor. Cu
diafragma de apertura redusa corespunzator, baleiaza preparatul sub marire de 100X
pentru a repera structurile filamentoase care diferentiaza granulul actinomicotic de
microeolonii tisulare ale stafilococilor. Examineaza detaliile cu marire de 600X.
In granulele actinomicetoamelor se pot observa 5-6 mase filamentoase intretesute
cu diametrul de cca 100 11m,inconjurate eu filamente radiare, ramificate, cu diametrul
de cca 111m, sau mai subtiri, refringente, miiciucate, dispuse in diferite planuri suprapuse.
Aspectul maciucat poate lipsi.
Granulele eumicetoamelor sunt f0l111atedin hife groase de 2-5 11m, septate ~i
ramifieate, care prezinta din loc in loc, mai ales la peri feria granulelor, celule bizar
balonizate cu diametrul pana la 15 11m.
Referitor la imp0l1anta microscopiei puroiului cu grunji din leziuni inflamatorii
multiplu fistulizate, subliniem ca am intalnit epitelioame spinocelulare cervico-faciale
infectate care mimau actinomicoza, dar microscopia in serie a granulelor galbui cu
diametrul de 1-3 mm a aratat numai aglomerari de celule epiteliale scuamoase, iar culturile
au izolat flora mixta exclusiv actinomicete.
204
11.4.2.4. Examenul frotiurilor colorate pentru bacterii acido-rezistente
ColoratWe Ziehl-Neelsen sau Kinyoun pentru bacilii acidorezistenti sunt indi-
cate la cererea c1inicianului sau dnd bacterioscopia ramfme negativa pe frotiurile colorate
Gram din exsudatele purulente pleurale, articulare, supuratiile osoase sau ganglionare ~i
trebuie suspectata prezenta bacililor tuberculozei.
Baciloscopia puroiului din abcese fesiere dupa injectari intramusculare profunde
poate depista micobacterii din grupul M fortuitum-chelonae ocazional implicate in
asemenea supuratii iatrogene. La pacientii proveniti din zone tropicale nu trebuie neglijate
coloratiile pentru microorganisme acido-rezistente la microscopia racletelor din ulcere
cronice ale gambelor ~i bratelor, care pot fi determinate de MycobacteriUln ulcerans.
Egal sunt indicate aceste coloratii ~i la examinarea rac1etelor din leziunile cutanate
nodulare ulcerate ale inotatorilor ~i pescarilor, care pot fi determinate de Mycobacte-
rium lnarinum .
Coloratiile Ziehl-Neelsen !ji Kinyoun mod!ficate, cu decolorare scurta, sunt in-
dicate pentru diferentierea nocardiilor de alte actinomicete. Pseudohifele sau numai
fragmente de pseudohife ale nocardiilor (N. asteroides, N. brasiliensis, N. caviae) variaza
de la acido-rezistenta partiala la acido-rezistenta completa, in timp ce restul actino-
micetelor sunt neacido-rezistente.
Daca bacterioscopia prin metodele uzuale ramfme negativa, efectueaza imediat,
coloreaza May Grunwald Giemsa ~i examineaza un nou frotiu. In puroi din coleqii
cutanate am putut depista astfel rapid f0TI11a levurica de Histoplasma capsulatulJI ~i
sferule de Coccidioides immitis.
205
Prelevatul pe tampon. Imediat dupa primirea probei, rote~te insistent tamponul
in mediu1 de transport, pentru descarcarea continutului, apoi stoarce-l prin presare
insistenta pe peretele tubului. Di1ueaza decimal suspensia mama astfel obtinuta ~i
procedeaza ca mai sus tinand cont ca tamponul nu este adecvat pentru izolarea bacteriilor
anaerobe.
Numarul UFC/tampon =N x D x 10
1zolatele in cantitate ~ 105 UFC/g de tesut sau ~ 106 UFC/tampon au semnifica!ie
clinica; trebuie identificate ~i se impune antibiograma. Peste 108 UFC/tampon se izoleaza
de la pacientii cu diseminare septicemica a infectiei.
Streptococii ~-hemolitici au semnificatie c1inica indiferent de cantitatea in care
sunt izolati (de verificat, in p1agile feselor, perineului, coapselor sau abdomenului infe-
rior daca aceste izolate nu sunt Enterococcus fa eca lis var. zimogenes, care nu intra sub
incidenta acestui criteriu de semnificatie).
Daca examenul histopatologic confirma prezenta infiltratului inflamator, a leziunilor
de vaseulita ~i tromboza in probele examinate, capata semnifieatie clinic a ~i izolatele in
cantitati de 103-104 UFC/g, mai ales in prezenta unei asoeiatii de baeterii aerobe ~ianaerobe.
206
actinomicetelor anaerobe, celelalte cu incubarea aerobii la 25, 30 ~i 37C pfma la 14
zile pentru izolarea speciilor aerobe. Urmare~te la fiecare doua zile placile pentru aparitia
culturilor .
Bacilii acido-rezistenfi. Decontamineaza chimic probele contaminate (vezi Cap.
13). Insamanteaza mai multe tuburi cu mediu Lowenstein-Jensen. Incubeaza tuburile
aerob la 37C, primele 24 ore in pozitie inclinata pentru adsorbtia inoculului pe panta de
mediu, apoi in pozitie verticala pana la 60 zile. Unnare~te aparitia culturilor de doua ori
in prima saptamana, apoi saptamanal.
Mycobacterium fortuitum-chelonae poate fi omorat prin decontaminarea chimica
a probei, insa prelevatele contaminate nu creeaza probleme pentru ca aceasta bacterie
cultiva, intre 3 ~i 7 zile, pe agar-sange sau agar Mac Conkey.
Fungii. Insamanteazii:
- Pante de agar Sabouraud glucozat neselectiv ~i selectiv prin adaos de cyclo-
heximidii.
- Pante de agar-sange pe baza de infuzie cord-creier nese1ectiv ~i selectiv prin
aditie cu cloramfenicol ~i gentamicinii sau cloramfenicol, gentamicina ~icycloheximida.
Incubeazii aerob, la 30C, tuburile cu mediul Sabouraud pentru izolarea fungilor
fi]amento~i ~ilevurilor oportuniste ~i la 37C tuburile cu mediu imbogatit pentru izolarea
formelor tisulare (levurice) ale fungilor dimorfi. Urmare~te culturile pana la 30 de zile.
Situafia leziunilor granulomatoase cu bacterioscopie neconcludenta. Insaman-
tarile trebuie sa vizeze: brucelele, micobacteriile ~i fungii.
Identifica microscopic ~irepica izolatele clinic semnificative pentru a obtine cultura
pura necesara antibiogramei ~i introducerii In algoritmul de identificare.
De~i in terapia multor supuratii primeaza tratamentul chirurgical, rezultatul
antibiogramei trebuie comunicat in interval minim posibil.
12. DIAGNOSTICUL DE LABORATOR
AL INFECTIILOR TRACTUSULUI RESPIRATOR SUPERIOR
SI CAVITATILOR CONECTE
(DUMITRU BUIUC)
12.1. INTRODUCERE
Infectiile tractusului respirator superior detem1ina boli pentru care se solicita eel
mai frecvent consult medical.
208
Epiteliul respirator, columnar, pseudostratificat, ciliat, dublat cu un strat de mucus
produs de numeroasele celule caliciforme diseminate ~ide glande sero-mucoase, acopera
cavita!ile ~i cometele nazale, sinusurile paranazale, portiunea extraosoasa a trompei lui
Eustachio.
Un epiteliu scuamos stratificat nekeratinizat, prevazut cu glande de tip mucos pur,
continuare din mucoasa bucala ~icontinuat pe mucoasa esofagiana, acopera orofaringele
~i cripetele amigdaliene.
Acumulari de !esut limfatic sunt bogate la nivelul oro- ~i nazo- faringelui unde
constituie amigdalele. Granulocite polimorfonuc1eare, limfocite ~i monocite trec, prin
diapedeza, in fluidul crevaselor gingivale ~i de aici in saliva.
209
sinuzite;
otite medii;
laringite ~i epiglotite.
Lipsa barierelor anatomice distincte intre segmentele ci'iilor respiratorii superioare
pem1ite propagarea infectiei prin continuitate, de unde interpi'itrunderea simptomatologiei
clinice (e.g., nazo-faringite-angine) ~i frecvente complicatii prin afectarea sinusurilor ~i
urechii medii, a laringelui ~i, mai jos, a cihlor respiratorii inferioare.
Propagarea limfatica a infectiei este posibila:
mai rar in infectiile virale (e.g., mononucleoza infectioasa, adenoviroze);
foarte frecventa in infeqiile bacteriene (e.g., limfadenitele cervicale streptococice).
Situatia particulara a propagarii spre meninge, prin tecile limfatice ale filetelor
nervului olfactiv, a unor bacterii care infecteaza nazo- faringele a fost precizata in Cap. 10.
Virusurile sunt patogenii primari care determina cel mai frecvent infectii ale cailor
respiratorii superioare (v. tabelul 8-2). De~i nu beneficiaza de tratament antiviral, aceste
viroze se vindeca spontan dar, prin lezarea epiteliului respirator ~i obstruarea congestiva
a orificiilor sinuzale sau a trompei lui Eustachio, favorizeaza suprainfeqia cu baeterii
din microbiota indigena.
Doar cateva bacterii (e.g., Streptococcus pyogenes, Mycoplasma pneumoniae,
Chlamydia pneumoniae, Corynebacterium diphtheriae, Haemophilus h!flllenzae serovar
b) se manifesta ca patogeni primari la aceste nivele ~i determina boli, uneori eu riseuri
grave, care insa beneficiaza de tratament antimicrobian.
Prediqia semnelor clinice pentru etiologia bacteriana a acestor infeqii este
mediocra. De aici interesul pentru diagnosticul de laborator.
Conditii locale (leziuni prin sub stante iritante, caustice, deshidratare exeesiva a
mucoasei) ~i, mai ales, sistemice (hemopatii maligne ~.a.) favorizeaza aparitia anginelor
u1cero-necrotice determinate de asociatii ale unor specii din mierobiocenozele
orofaringiene (e.g., asociatia fuso-spirilara).
12.2. FARINGITE
12.2.1.1. Viroze. Aproximativ 70% din infeqiile care afecteaza faringele sunt
viroze. Virusurile implicate sunt: rhinovirusurile (in specialla adulti), adenovirusurile,
virusul Herpes simplex 1, virusurile Coxsackie A (mai ales la copii), virusurile grip ale
(la toate varstele), paragripale. Fenomenele inflamatorii fiind mai extinse, pacientii au
rinoree, stranut, disfagie, tuse cu febra, in general moderata. In infeqia cu unele serovaruri
adenovirale se asociaza conjunctivita. Mononucleoza infectioasa, detem1inata de virusul
Epstein- BaIT,se particularizeaza printr -0 angina severa, frecvent u1cerata, adenita cervieaEi
~i semne de afectare sistemica.
210
adenite cervicale supurate, flegmon amigdalian, celulita difuza a plan~eului bucal - an-
gina Ludwig) sau post-infectioase (reumatism cardioarticular acut, glomerulonefrita acuta,
coree). Flegmonul amigdalian ~i angina Ludwig sunt infectii bacteriemice.
La copilul mic infeqia evolueaza ca 0 nazofaringita subacuta cu exsudat discret ~i
febra moderata. La copilul mare ~i adult manifestarile sunt acute, zgomotoase: febra
mare, cefalee, disfagie, greata, varsaturi. Pacientii au faringele putel11ic congestiv, angina
cu variate aspecte ale exsudatului (pultaceu, ulceratie cu falsa membrana etc.), uneori
pete~ii pe palatul moale, frecvent adenita cervicala. De~i sugestiva, aceasta simptoma-
tologie are prediqie mediocra ~i nu poate singura sa evite abuzul sau retinerea eronata
de la antibioticoterapie.
Multitudinea serovarurilor M de S. pyogenes ne expune aproape anual riscului
acestor faringite, totu~i infectiile sunt mai frecvente la copii pana la 12-14 ani.
Fmingitele cu tulpini eritrotoxigene de S. pyogenes se Insotesc cu scarlatina cand
pacientii nu sunt imuni la aceasta toxina .
. 2) Alti streptococi piogeni (grup B, C sau G) sunt ocazional cauza a unor faringite
a caror evolutie poate figrava.
3) Chlamydia pneullloniae este 0 cauza frecventa a faringitelor.
4) Mycoplasma pnelllllOniae detennina pana la 10% din faringitele ~colarilor.
5) Corynebacterium diphtheriae detennina angine pseudomembranoase grave
Insotite cu toxemie. Mult timp stapanita aproape complet Plin vaccinare, in prezent difteria
apare ca boala reemergenta, motiv pentru care trebuie sa reintre in aten!ia clinicienilor
infectioni~ti, epidemiologilor ~i microbiologilor.
6) Arcanobacterillm haemolyticllm (numit anterior Corynebacterium haemol.vticwlI)
cauzeaza ocazional faringite.
7) Gonococii, dupa raporturi sexuale aberante, pot cauza faringite benigne.
Asociatii fuso-spirochetozice detel111inastomatita ~i angina Vincent, caracterizate
prin leziuni ulcero-necrotice care pot fi acoperite de false membrane. Boala, relativ rara,
apare la pacienti cu igiena bucala deficitara ~i deficite locale sau sistemice ale aparari i
antiinfeqioase. Este 0 infec!ie mixta cu bacterii anaerobe dominata de badli gram-negativi
fusiformi (Fusobacterium spp., Prevotella spp.) ~itreponeme bucale. Asocierea S. p.vogcncs
nu poate fi exclusa a priori.
Rolul altor bacterii in etiologia faringitelor ramane inconsistent demonstrat.
211
Necesar: tampoane de uz general, apasiitor de limba, sursa de lumina, masca.
Procedura: Exsudatul faringian se preleva inainte sau dupa 3-4 ore de la toaleta
gurii ori ingestia de alimente.
A~eaza pacientul pe scaun, cu fata spre sursa de lumina, gatulin u~oara extensie ~i
ceafa sprijinita de perete. In conditii de iluminare adecvata, deprima baza Iimbii ell
apasatorul steril ~i, in timp ce pacientul pronunta vocal a A, ~terge cu tamponul fem1, dar
nu brutal, amigdalele ~i peretele posterior al faringelui, vizand in special orice zona
inflamata, ulcerata, depozite purulente. Cand exista, falsa membrana trebuie u~or desprinsa
la periferie ~i tamponata mucoasa subiacenta. Atat la introducerea, cat ~i la scoaterea
tamponului din faringe evita atingerea cu baza limbii sau cu palatul moale. Reintrodu
tamponulin tubul protector etichetat.
Pentru c.ptelevan~a faringiana declan~eaza reflex de tuse, protejeaza-te cu masca
de tifon.
Transport ~i ccnservare. lntervalul de timp in care trebuie efectuata examinarea ~i
modalitatile de conservare a probei sunt functie de microorganismele unnarite. Referitor
la prelevarile pentru diagnosticul virozelor revezi Cap. 8.
212
de cal sau de iepure pentru di hematiile de
epuizarea
berbec contin NAD-aza. Enzima distruge In striurl
cu ansa
factorul V ~iinhiba cre~terea speciilor hemo-
litice de Hae11lophilus, din microbiota
faringelui, ale diror colonii pot fi confun-
date cu cele ale streptococilor ~-hemolitici.
Pe agar cu sange de berbec caracterul
~-hemolitic al Enterococcus faecalis var
ZY11logenes uzuallipse~te, dar se manifesta
pe agarul cu sange de caI. Fig. 12-1. Epuizarea eu ansa a exsudatului
Ruleaza toate fetele tamponului pe un faringian pc 0 jumatate de placa
cadran al unei placi cu diametrul de 9 cm.
Epuizeaza apoi inoculul cu ansa in celelalte trei cadrane. Prin intepare sau scurta seqionare
a mediului cu ansa la sfiir~itul epuizarii in fiecare cadran se creeaza conditii microaerofile
care protejeaza de oxidare streptolizina 0 ~ipennit depistarea tulpinilor de S. pyogenes
neproducatoare de streptolizina S. De aici interesul folosirii placilor cu un strat mai gros
de mediu. Precizam ca in aerobioza, in lipsa streptolizinei S, streptolizina 0 imprima
coloniilor aspect {X-hemolitic.
Pentru economie, un tehnician experimentatpoate epuiza corect tamponul ~i pe 0
jumatate de pladi (fig. 12-1).
Fo1osirea unui mediu selectiv (mai ales asociat mediului de imbogatire) penl1ite
insamfmtarea mai multoI' probe pe 0 singura placa. Sunt recomandate:
Agarul-sange cu cristal violet (1llg/mL), care inhiba stafilococii.
Agarul-sange cu sulfametoxazol (23,75 Ilg/mL) ~i trimetoprim (1,25 Ilg/mL)
inhiba stafilococii, streptococii viridans ~ibacilii gram-negativi, dar inhiba ~iunele tulpini
de streptococi ~-hemolitici grup C sau G, care sunt sensibile la cotrimoxazol. De aceea
aplicarea unei rondele cu cotrimoxazol (din trusa pentru antibiograma difuzimetrica) pe
primul cadran de epuizare favorizeaza reperarea coloniilor ~-hemolitice in zona de
difuzare a chimioterapice1or ~i evita riscul rezultate10r fals negative, aria selectiva fiind
limitata .
Agarul-sange cu 3,5% c10rura de sodiu favorizeaza, cu rezultate superioare altar
medii selective, izolarea streptococilor ~-hemolitici cauzatori de faringite (grup A, B, C,
G) prin inhi, ,area florei de asociatie, mai ales a streptococilor orali, inclusiv streptococii
~-hemo1itici din grupul S. 11lilleri.
Incubarea culturilor 0 facem uzual aerob peste noapte la 3TC cu prelungire
pana la 48 ore daca la prima citire a placilor lipsesc colonii1e ~-hemolitice caracteristice.
Procentul depistarii S. pyogenes cre~te de la 63% in culturile aerobe la 98% in cele
anaerobe prin manifestarea ~-hemolizei i la coloniile tulpinilor care produc numai
streptolizina oxigenlabilii. Dar aceasta exigenta depa~e~te posibilitatile multor laboratoare
~i 0 inlocuim cu insamantarea mediului prin intepare la sfiir~itul fiecarui cadran de
epUlzare.
Citirea culturilor. Examineaza atent placile in lumina reflectata ~iprin transparentii
unl1arind coloniile mici (0,5-1,0 mm diametru), transparente sau opace, inconjurate cu
ozona larga de ~-hemoliza. La examen sub lupa suprafata coloniilor poate fi neregulat
213
mamelonata (colonii matt), lucioasa ~i cu reliefacuminat (colonii glossy) sau mocoida.
Majoritatea coloniilor sunt opace ~i ansa Ie mobilizeaza intregi. In absenta coloniilor
j3-hemolitice, la prima sau la a doua citire a culturilor, urmarim cu atentie hemoliza din
jurul punctelor de intepare a mediului. Daca la acest nivel constatam hemoliza 13,se
impune repicarea culturii din profunzimea intepaturii cu incubare anaeroba a subculturii.
Poate fi 0 tulpina de S. pyogenes produci'itoare exclusiv de streptolizina O.
12.2.3.5. Identificare. Verifica, prin frotiu colorat Gram, daca aceste colonii sunt
de streptococi pentru a Ie introduce in algoritmul de identificare: diferentierea prezumtiva
in streptococi grup A sau non-grup Aplin testul de sensibilitate la bacitraeina, identificarea
antigenica a grupului, identificarea biochimica a unor streptococi non-grup A.
214
este numai aparent: continua simptomatologia bolii virale neinfluentata de penicilina.
Examenul unui nou tampon faringian asociat cu leueograma ~i formula leueoeitara
elueideaza situatia.
Este insa posibil ea sub penieilinoterapie S. pyogenes sa persiste in exudatul
faringian. E~eeul poate avea eel putin 4 cauze:
(a) Infectie la paeient purtator faringian de baeterii producatoare de (}-laetamaza,
cum sunt tulpini de stafiloeoei, de Moraxella catarrhalis, de Haemophilus spp. sau de
Bacteroides spp. De~i explieatia a fost contestata, se impune tirajul izolatelor asoeiate
din oro-faringe pentru produeerea de (}-laetamaza (vezi Cap. 23).
(b) Infectie eu tulpini de S. pyogenes tolerante la penieilina. Asemenea testare
depa~e~te posibilitatile activitatii de rutina.
(c) Reinfeetia eu S. pyogenes in mediul familial sau in eoleetivitati inehise eu
eonditii de promiseuitate. Se impune investigatia epidemiologiea.
(d) Tratament exclusiv eu penieilina Via eopii.
215
agar-sange, prelevatul a fost necorespunzator. (b) Unele angine streptococice pot simula
difteria sau S. pyogenes se asociaza bacilului difteric in unele cazuri grave de difterie .
Placa cu mediul Tinsdale pentru observarea coloniilor caracteristicc bacililor
difterici: negre cu halou bruno Sunt posibile doua eventualitati:
a) Coloniile caracteristice lipsesc: continua incubarea placii cu 0 noua citire dupa
alte 24 de ore ~i epuizeaza pe cate 0 placa cu me diu Tinsdale tamponul faringian ~ipe cel
nazo-faringian imbogatite in mediul O.S.T.
b) Coloniile caracteristice sunt prezente:
- Efectueaza un froiu colmat Gram pentru a elimina eventualitatea unor specii de
stafilococ care pot fonna pe mediile cu telurit de potasiu colonii asemanatoare celor ale
bacililor difterici.
- Repica pe mediul Loffler 0 colonie caracteristica, verificata microscopic pentru
a obtine cultura pura necesara identificarii.
Bacilii difterici apar cu morfologia caracteristica numai in cultura pe me diu I Loffler
ori in falsa membrana, conditiile in care au la dispozitie fosfati in cantitate suficienta
pentn.! f01111areaincluziunilor de volutina.
Cand cultura pe mediul de izolare este prea densa, pentru purificare corecta
efectueaza 0 repicare suplimentarii pe 0 placii cu mediul Tinsdale sau cu agar-sange.
Identificarea. Verifica pe frotiu colorat Gram morfologia ~ipuritatea culturii, iar pe
frotiu colorat Albert prezenta incluziunilor de volutina pentru a introduce tulpina izolatii in
algoritmul de identificare: testele catalazei, nitratazei, ureazei, cistinazei, de fermentare a
glucozei, maltozei, zaharozei, dextrinei, glicogenuluiJamidonului (vezi Cap. 30).
Determinarea toxigenezei este cea care confinna sau infi1111ain final diagnosticul
de difterie. Efectueaza testul Eleck sau e)f.pediaza tulpina laboratorului de referinta pcnttLi
testare in vivo.
12.2.5. Candidoze
Diagnosticul acestor fODne rare de angina sau stomatita este esential microscopic:
prezenta pe frotiu colorat Gram a foarte numero~i bacili fusifoDni gram negativi ~i spi-
rochete in contextul unei reactii inflamatorii. Rezultatul poate fi comunicat imediat.
216
Cultivarea prelevatului pe agar-sange 0 facem nu pentru a confirma rezultatul
microscopiei directe (aceste specii anaerobe sunt foarte dificil de cultivat ~i necesita
timp indelungat), ci pentru a exclude posibilitatea infectiei cu Streptococcus pyogelles.
217
12.3. EXSUDATELE NAZAL SI NAZO-FARINGIAN
218
ro~;ufenol) sau mediul Baird-Parker (agarnutritiv cu clorurii de litiu, telurit de potasiu, glicinii,
piruvat de sodiu ~i giilbenu~ de ou). Incubeazii culturile peste noapte la 37C. Umlare~te
aparitia coloniilor caracteristice: mari, cu diametrul de 1-2 mm, rotunde, S, bombate .
Pe agar-sange sunt eel mai frecvent hemolitice.
Pe mediul Chapman ga1bene, cu ha10u galben .
Pe mediul Baird-Parker, negre cu halou clar.
Verifica puritatea izolatoarelor de pe mediile selective. Daca pe aceste medii nu au
apiirut colonii caracteristice, prelunge~te incubatia panii la 48 ore. Identificarea izolatelor
pe agar-sange trebuie completatii prin microscopie pe frotiu colorat Gram ;;i testul
coagulazei.
Cand probele nu pot fi examinate imediat, expediaza tampoanele la laborator
imersate in mediul Chapman lichid in care sunt ~i preincubate la 37C pentru imbogatire
inainte de epuizarea pe mediul de izolare.
In focarul epidemic, prelevarea tampoanelor nazale trebuie repetatii de 1-2 ori la
intervale de 0 siiptiimanii pentru a diferentia portajul de durata de eel tranzitoriu.
Dupii identificare, expediazii culturile pure de S. aureus laboratorului de referinta
pentru tiparea fagicii.
219
(revezi 12.2.7). Incubeaza culturile la 37C in atmosfera cu 5-10% CO" cu citirea placilor
dupa 24 ~i 48 ore. Unnare~te pentru indentificare coloniile oxidazopozitive.
Cand probele nu sunt examinate imediat, tampoanele trebuie imersate in mediul
Amies sau Stuart pentru transportul catre laborator.
12.4. SINUZITE
Examenul puroiului sinuzal este, in general, rar solicitat din cauza metodelor agresive
de prelevare a probelor.
Exsudatul aspirat prin punctia aseptica a sinusurilor afectate of era cele mai bune
~anse de stabilire corecta a diagnosticului etiologic. Specialistul otorinolaringolog este
eel care apreciaza oportunitatea examenului microbiologic ~i efectueaza prelevarea dupa
o ingrijita antiseptizare a mucoasei nazale la nivelul punqiei.
220
Fluidul de spaUitura a sinusurilor,efectuata de specialist in scop de drenaj al cavitatii
infectate, poate fi colectat intr-o tavita renal a plasata sub narile pacientului. Produsul
trebuie atent examinat macroscopic pentru prelevarea;;i examinarea numai a p0l1iunilor
purulente.
Exsudatul nazo-faringian prelevat din vecinatatea orificiilor sinuzale este rara
valoare din cauza contaminarii masive cu microbiota indigena. Rezultatele, in~elatoare,
nu justifica efortul examinarii, iar pacietul beneficiaza mai mult prin tratament empiric
de prima inten!ie bazat pe condi!ia clinico-epidemiologica a suferintei.
12.5.0TITE
Aceste boli, mai frecvente la copii in varsta de la 3 luni la 3 ani, sunt favorizate de
infeqii primare cu virusuri respiratorii sau Mycoplasma pneumoniae care, prin congestia
~i edemul trompei lui Eustachio, blocheaza drenajul norn1al al cavita!ii ~i eliminarea
contaminantilor ocazionali proveni!i din microbiota nazo-faringelui. Dintre ace~ti
contaminanti se recruteaza bacteriile care colonizeaza ~i infecteaza urechea medie de
unde infectia se poate extinde la antrul mastoidian ~i, prin contiguitate, la meninge.
Principalii agenti etiologici ai otitelor medii sunt: Streptococcus pneumoniae.
S. pyogenes ~i Haemophilus injluenzae (indiferent de serovar ~ichiar tulpini necapsulate).
Mai rar sunt in cauza Enterobacterioaceae, Moraxella catarrhalis, Staphylococcus allrells
sau/~i bacterii anaerobe.
Pacientii acuza durere pulsatila in urechea afectata, hipoacuzie, ameteli, greata,
varsaturi. Obiectiv se constata: febra, timpan congestiv, ingro~at, bombat, cu reperele
~terse ~i mobilitatea redusa sau absenta. Timpanul se poate fistuliza cu aparitia unei
scurgeri purulent-sanguinolente in conductul auditiv extern.
221
Examenul bacteriologic este solicitat de specialistul otolaringolog numai cfmd
apreciaza necesara 0 terapie antimicrobiana mai tintita dedit cea bazata pe rationamentul
clinico-epidemio 10gi c.
Prelevatul de electie pentru examenul bacteriologic este exsudatul aspirat prin
timpanocenteza. Altemativ se poate recurge la insamantarea extemporanee cu lanteta de
punctie. In caz de perforare spontana a timpanului, exam inam exsudatul prelevat pe un
fin tampon steril ghidat prin speculum auricular ditre fistula. Tamponul trebuie expediat
laboratorului imersat in mediu de transport. Examenul exsudatului nazo- faringian este
lipsit de valoare din cauza motivelor precizate la 12.4.2.
Examenul de laborator include:
I) Microscopia directa pe frotiu colorat Gram din aspiratul prin timpano-centeza.
2) Cultivarea probelor epuizate de 0 placa cu agar-sange ~ocolat, pentru incubarea
aeroba in atmosfera cu 5% CO?, ~i pe una cu agar-sange anaerob.
3) Umlarirea pana la 48 ore a culturilor incubate la 37C
4) Microscopia culturii pentru verificarea puritatii, introducerea izolatelor in
algoritmul de identificare ~i antibiograma.
12.6.1. Laringite
222
poate fi implicata in etiologia sindromului. Pacientii sunt ragu~iti ~i au tuse latratoare.
Infectia se poate extinde ~i in etajul subglotic. La copii sub varsta de 3 ani complicatia
este mai severa ~i frecvent evolueaza cu sindromul de crup dominat prin semne de
obstructie respiratorie acuta. Bacilul difteric este astazi 0 cauza exceptional a a crupului.
Mycobacterium tuberculosis poate infecta laringele pe cale bronhogena sau
hematogena ~i determina laringite cronice, care, cand evolueaza cu ulceratii ~i mase
exofitice, pot impune diferentierea de carcinomullaringian.
Uzual, examenul bacteriologic al exsudatului faringian Ul111are~tenumai excluderea
difteriei ca 0 cauza a crupului la copii. La pacienti cu laringite cronice, specialistul
otorinolaringolog poate solicita depistarea bacililor tuberculozei in probe laringiene (vezi
Cap. 13).
Epiglotita acuta este 0 forma severa a crupului detenninata la copii intre 2 ~i 4 ani
varsta aproape exc1usiv de Haemophilus injluenzae serovar b. La adult sindromul este
rar, fiind determinat de streptococi, stafilocici, pneumococi sau Haemophilus paraphro-
philus. Pacientii au febra, toxemie sistemica, dureri faringiene, disfagie, dispnee pana la
asfixie.
Este interzisa prelevarea probelor pe tampon de la nivelul epiglotei inflamate pentru
ca poate determina spasm glotic cu asfixie, iar izolarea H. injluenzae de la acest nivelnu
este un criteriu suficient de semnificatie c1inica.
Se pot practica hemoculturi, care sunt pozitive cu H. i1!fluenzae la cca 50% din
copiii investigati. Gravitatea sindromului impune insa terapie antimicrobiana de prima
intentie bazata pe criteriile c1inico-epidemiologice.
13. DIAGNOSTICUL DE LAB ORATOR AL INFECTIILOR
TRACTUSULUI RESPIRATOR INFERIOR
(DUMITRU BUIUC)
13.1. INTRODUCERE
224
diologic, leucograma, viteza de sedimentare a hematiilor etc.) ~iepidemiologice (infeqii
domiciliare sau de spital, sporadice sau epidemice) pot orienta diagnosticul catre un
grup mai larg sau mai restrans de agenti etiologici. Dar terapia antimicrobiana orientata
numai prin criteriile c1inico-epidemiologice nu poate acoperi intregul spectru etiologic
al acestor infectii, iar bacteriile mai frecvent implicate in etiologia ITRI au dobandit, in
proporrii variate, rezistenta la antibioticele de electie. De aici interesul pentru diagnosticul
etiologic al ITRl, operatie frecvent dificila ;;i complexa.
De~i supus frecvent contaminarii microbiene, prin pulberi ~i aerosoli inhalati, etajul
infraglotic al tractusului respirator ramane necolonizat gratie unor efieiente bariere
antimicrobiene:
Filtrarea aerodinamicii ~i sedimentarea (fig. 13-1) .
Transportul muco-ciliar (fig. 13-2) accelerat prm viteza ventilatiei pulmonare ~i
reflexul de tuse. Eficienta transportului muco-ciliar este remarcabila: in decurs de 0 ora
sunt eliminate peste 90% din bacteriile trasor depuse pe mucoasa bron~ica. Doar la cca
225
Parhcule
impactah? Macrofaq
antrenal
Direcha tTansportului
fll trate de , mucociliar
""";""'''''' ':i/'''''':'.'(W;:;~\
Particule de10-15.um 9f
. , . ,th,-W;'i\{in
;,'\'t,,((~M\,\.',
I ".- \.
Impacteaza pe
cornetele
~i nazofaringe --V
nazale4V\, Celula caliciform a
(secretoare de mucus)
\~~~.:
~~.~,," ,', ;'":'
Particule de - 5 prn 0
inlermediara
sedimenteaza in ()
bronhii ~i bronhiole
Fig. 13-1. Filtrarea aerodinamidi ~i sedi- Fig. 13-2. Transportul mueo-eiJiar din eiiile respira-
mentarea sunt barierele primare antimiero- torii funetioneazii euplat eu barierele antimierobiene
biene ale diilor respiratorii ehimidi ~i imunologicii
226
0 complexa bariera chimica supeljieiala: mucus, lizozim, lactoferina, surfac-
tant, cxj-antitripsina, interferoni .
Bariera imunologica fonnata din IgA secretoare, IgE-mastocite, limfocite ~i
plasmocite din corionul mucoasei traheo-bron~ice; IgG ~i IgM circulante care amorseaza
sistemul complement ~i faciliteaza fagocitoza.
Tabelul13-1
Tipul Domiciliare
Primare
pneumococi,
influenzae
Circumstante
netipabil, BGN aerobi2)
c1inico-
epidemiologice
Haemophilus
Staphylococcus
Pneumococi,
Virusuri Toxoplasma
aureus pneumoniae
streptococi
I), Mycoplasma grup B, 0, G,
Microorganisme implicate
achomatis, Mvcobacterium
ei bacili coli-
Congenitale
formi, Treponema tuberculosis
pallidum, Listeria nlOno(~Vfogenes,
227
Tabe11l113-1 (continuare)
.,. "
1I1lect1el epl'd emlO
. 'I oglce
. Mlcroorgamsme
- llnpllcate
Pneumonii Pana la 3 luni C. trachomatis, v. citomegalic, Pnellmocystis carinii.
Ureaplasma lIrealyticllm, streptococi grup B, Escher-
ichia coli, S. allreus
.3 luni - 5 ani Virusuri I), pneumococi, H. influen~ae serovar b
.5-35 ani M. pneumoniae, virusuri I), pneumococi, Chlamydia
pnellmoniae
Peste 35 ani Pneumococi, S. aurellS, bacterii anaerobe,il, Legionella
pnellll1ophila, H. influenwe i
228
13.1.5. Prelevate patologiee ~i eriterii de semnifieatie clinidi a izolatelor
229
inteleaga diferenta dintre "a expectora" ~i a "a scuipa". Periajul simplu al dintilor, clatirea
energica a gurii ~i gargara cu apa sunt de dorit inaintea prelevarii. Daci.i proba apare
constituita in principal din saliva, trebuie imediat insistat pentro prelevarea unei noi
probe corespunzatoare calitativ. In infectiile acute 0 proba mucopmulenta cu volum de
1-2 mL este suficienta.
La tu~itorii cronici, pentro diagnosticu1 tuberculozei sau al infeqiilor fungice
bronho-pulmonare, cantitatea de sputa examinata trebuie sa fie mai mare: e.g., toata
sputa de 1a expectoratia matinal a sau cea expectorata in interval de 1-2 ore. Nu examina
insa niciodata probe sumate din 24 ore pentro ca multiplicarea microorganismelor de
contaminare falsifica rezultatele: rezultate fals pozitive prin inmultirea fungilor saprofiti
contaminati; rezultate fals negative prin omorarea micobacteriilor in procedura mai
drastica de decontaminare impusa de asemenea probe.
La pacientii cu tuse slab productiva se pot obtine mai u~or probe de expectoratie
matinala. Stimularea expectoratiei prin inhalare de aerosoli calzi cu solutie salina 10%
~iglicerinata 15% ofera, de multe ori, probe cito1ogice nesatisIa.catoare pentro diagnosticul
infectiilor bronho-pu1monare acute, dar utile pentro diagnosticul tuberculozei.
Transport, conservare. Probele, prelevate intr-un recipient steril (preferabil din
plastic) de cca 100 mL, cu gura larga ~icapac ennetic, sunt etichetate ~i expediate imediat
laboratorolui pentru a fiexaminate in interval de cel mult 0 ora de la prelevare. Modalitati
optime de conservare a probelor nu sunt. Refrigerarea la 4C previne multiplicarea
contaminanti10r, conserva unii patogeni, dar scade pana la anu1are izolarea altora cum
sunt Haemophilus influenzae sau Neisseria meningitidis. Uti1izarea unui mediu de
transport perturbii raporturi1e bacteriilor cu reperele citologice ale exsudatului, esentiale
pentro aprecierea calitatii probei ~i interpretarea rezu1tate1or sputoculturii.
Criterii de caUtate:
Raportul dintre realul produs patologic, obiectivat prin numarol celulelor
inflamatorii, prezenta fibrinei, ~i contaminarea oro-faringiana, obiectivata prin numarol
celulelor epiteliale scuamoase, permite stabilirea unor praguri de calitate acceptata a
probelor. Pragul cito10gic de calitate a probelor de sputa se refera in particular la diag-
nosticul infectiilor determinate de organisme conditionat patogene rezidente din micro-
biota oro-faringiana: numai in probe cu realul produs patologic predominant poate fi
obiectivata semnificatia clinica a acestor microorganisme. Desigur, pentro depistarea
patogenilor care nu fac parte din microbiota oro-faringiana pot fi examinate probe de
sputa ~i sub pragul cito1ogic stabi1it, dar riscul rezultate10rt fa1s negative cre~te odata cu
sciiderea realului produs pato10gic din proM, aspect asupra caroia clinicianul trebuie
atentionat.
Receptia probei in interval de maximum 0 ora dupa prelevare, pentro a incepe
examinarea inainte de inmultirea necontrolata a microorganismelor contaminate.
Prelevarea probei inaintea terapiei antimicrobiene.
Din nefericire, prea frecvent primim spre examinare probe de "sputa" de la pacienti
neinstroctati, nesupravegheati ~i care au ramas peste noapte la capul bolnavului. Ori
to ate acestea inseamna timp ~i materiale cheltuite pentro un rezultat nerelevant clinic
sau chiar periculos pentro pacient.
230
-
Sputa este putin adecvata pentru depis-
tarea corecta a:
- Pneumocystis carinii, Aspergillus spp.,
zigomicete, Candida albicans din cauza
mobilizarii insuficienteprin expectoratie a
acestorpatogeni din focarul bronho-pulmonar.
- Legionella din cauza antagonizarii prin ==
Vacuum
231
13.2.2. Prelevari prin tehnici agresive
232
patologic. Ca urmare, la pacientii cu boala legionarilor, de$i rata izolarii bacteriei din
ATT este mai mare dedit din sputa, rata depistarii microscopice directe prin coloratie
Dieterle sau imunofluorescenta este mai mare in sputa dedit in ATT.
Rezultatele fals pozitive au 0 rata apreciata la 20%. Apar cand pacientul aspira
secretii oro-faringiene in cursul procedurii, daca accesul de tuse proiecteaza varful
cateterului in oro-faringe (riscul este redus la cateterele din polivinil, mai rigide dedit
cele din polietilena) sau la pacientii cu colonizari de fond ale tractusului respirator infe-
rior (bron$ite cronice, bron$iectazii, neoplasme pulmonare).
Bacterii de colonizare a tractusului respirator inferior sunt depistate la majoritatea
pacientilor cu bron$ite cronice $i la bron$iectazici in cantitati care pot depa$i 106 UFC/mL.
In general sunt bacterii aerobe $i facultativ anaerobe, dar la bron~iectazici apar adesea
bacterii anaerobe. Bacteriile de colonizare pot include pneumococi $i hemofili a ci'iror
prezentii trebuie interpretata prudent.
o procedura sensibila $i inofensiva pentru depistarea contaminarii ATT cu secre!ii
oro-faringiene este nebulizarea oro-faringelui pacientilor cu 3 mL solutie 1% albastru de
metilen inaintea aspiratiei. Cu ochiul liber se depisteazii UID1ede colorant panii la 2 j.lg/mL,
corespunz3.ior unei dilutii de 1:5000 a solutiei trasor in secretii purulente sau, in termeni
de contaminare oro-faringiana, contaminari de - 5.104 UFC ale ATT. Metoda este utilii
pentru diferentierea celulelor epiteliale scuamoase metaplazice traheobron~ice de celulele
epiteliale scuamoase normale ale contaminarii oro-far:ngiene.
2) Prelevate bronhoscopice
Preleviirile bronhoscopice, disconfortante pentru pacient, implicii interventia unui
cadru special calificat. Includ: a) aspiratia prin canalul bronhoscopului cu sau rara irigare
bron~icii, periaj bron~ic cu perie neprotejatii: b) periaj endobron~ic cu perie protejata in
sistem de canule telescopate cu dop distal din polietilenglicol, care evita contaminarea
oro- faringianii; c) biopsia transbron~icii.
lndicatii: Pentru investigarea ITRI pre1evarea bronhoscopicii apare indicatii numai
cand infectia este una din ipotezele serioase de diagnostic al pneumopatiei insuficient
argumentata prin tehnicile clasice (absenta expectoratiei sau rezultate irelevante ale
sputoculturii), iar 0 prelevare bron~icii se impune ~i din alte ratiuni diagnostice:
a) prelevari prin periaj sau, la nevoie, prin biopsie transbron$ica de la nivelul unor
leziuni depistate;
b) suspiciunea persistentii de tuberculozii, legionelozii, infeqie fungica sau cu
citomegalovirus neconfinnatii de explorarile conventionale;
c) depistarea unor patogeni oportuni~ti la pacienti pneumonici imunocompromi~i:
Pneumocystis carinii, Nocardia spp. Semnificatia clinica a unor levuri (Candida spp.)
sau bacterii care colonizeaza uzual oro-faringele poate fi stabilita numai in prelevate
obtinute prin dispozitive protejate de contaminarea oro-faringianii sau cand microscopia
confinna pe sectiuni histologice corelatia microorganismului GU focarul inflamator
(biopsie transbron$ica).
Prelevarile prin dispozitive neprotejate de contaminarea oro-faringiana au prea
putine avantaje fata de sputa, doar e~antionaj mai tintit pentru examen citologic $i
ameliorarea depistarii un or patogeni ca P. carin ii, Nocardia sau fungi patogeni.
233
Contraindicatii. De~i bronhoscopia este privita cao tehnica de investigare mai
putin invaziva, are urmatoarele contraindicatii relative: boala cardiovasculara severa,
insuficienta respiratorie severa, hipertensiune pulmonara, uremie, diateza hemoragidi
(sangerari spontane, trombocitopenie refractara la transfuzia de trombocite). Bronhoscopia
poate fi tentata numai la pacienti cu minimum 20 000 trombocite/nuu3, iar daca este vizata
biopsia transbron~ica numarul minim de trombocite trebuie sa fie 50 000-100 000/mm3.
Tehnica. Insistamnumai asupra acelor aspecte implicate in ameliorarea eficientei
examenului microbiologic: efectuarea bronhoscopiei intr-o pozitie a pacientului care
sa reduca scurgerea secretiilor bucale in caile respiratorii inferioare (pozitia ~ezand sau
decubit lateral cu capul decliv); limitarea volumului de anestezic ~i administrarea lui
prinnebulizare pentru a evita diluarea probei.
Odata bronhoscopul directionat spre leziune, cateterul, care protejeaza peri a ata~ata
la 0 sarma retractabila, este inserat ~i impins prin canalul intern pana forteaza dopul de
polietilenglicol. Acesta este netoxic ~i se solva rapid pe suprafata mucoasei. Sub control
vizual peria este scoasa 1-2 cm ~i introdusa direct in exsudatulleziunii, apoi retrasa in
cateter ~i tot dispozitivul este retras prin canalul intern al bronhoscopului. Exteriorul
cateterului este spalat cu alcool ~i uscat, iar peria, de pe care s-a retras cateterul, este
separata aseptic, plasata intr-un flacon cu 1 mL solutie Ringer lactozata ~i imediat
transportata la laborator pentru insamantare cantitativa in interval de maximum doua
ore. Prelevatul este suficient atat pentru examen microbiologic, cat ~i citologic.
Complicatii: febra, bacteriemie, noi infiltrate pulmonare sunt raportate cu frecventa
variata, in general redusa. Scaderea cu 10-20 mmHg a pO, arterial este posibila ~i pune
probleme la pacientii hipoxici. Dupa biopsia transbron~ica- pot sa apara pneumotorax ;;i
hemoptizie la cca 8%, respectiv 7% din pacienti.
Acuratetea. La examinarea prelevatelor bronhoscopice mai frecventa este problema
rezultatelor fals pozitive decat a celor fals negative. Utilizarea dispozitivelor de prevenire
a contaminarii oro-faringiene reduce proportia rezultatelor fals pozitive. Efectul
antimicrobian al anestezicului a fost exagerat: este practic nul daca probele sunt
insamantate la interval de doua ore de la prelevare. Eventualele rezultate fals negative
datorate diluarii patogenului pot fi minimizate prin reducerea volumului soluTiei de
anestezic ~i administrarea ei prin nebulizare. La gazda imunocompromisa biopsia
transbron~ica depisteaza corect patogenul pulmonar in medie la 50% din pacienTi cu
valori extreme intre 26 ~i 76%,0 acuratete diagnostica superioara periajului endobron~ic
~i spalaturii bronho-alveolare. Asocierea biopsiei transbron~ice cu periajul amelioreaza
eficienta investigatiei.
3) Aspiratul pulmonar transtoracic
Asp irati a transtoracica prin ac ofera, pentru examenul citologic ~i microbiologic,
probe necontaminate direct din parenchimul pulmonai.
Indicatii: a) pneumopatii cu leziuni nodulare suspect maligne in care infectia este
una din ipotezele diagnostice: b) infectii pneumonice ale copilului, care nu expectoreaza
~i la care aspiratia transtraheala este riscanta; c) infectii pneumonice neobi~nuite ale
adultului sau la pacienti imunocompromi~i.
Contraindicatii. Majore: boala pulmonara buloasa, diateze hemoragice ireductibile,
leziuni vasculare, respiratie asistata mecanic. Relative: leziuni vecine cordului ~i marilor
vase, hipertensiune pulmonara, tuse necontrolabila, hipoxemie, chist hidatic pulmonar.
234
Tehnica este rezervata pneumologilor experimentati, in consecinta nu insistam
asupra amanuntelor privind executia. Proba trebuie examinata imediat de catre laboratorul
preavizat; se poate rezuma la cateva picaturi, ca atare decizia microscopie (citologie,
colorarii microbiologice) versus culturi pentru microorganismele incluse in ipotezele
diagnostice poate fi arbitrara.
Complicatii: Pneumotorax la 20~30% din punqionati, hemoptizie la 3-10% din
pacienti (senmalate ~i cazuri mortal e), rar embolie gazoasa.
Acuratetea. Aspiratul transtoracic a precizat etiologia pneumpatiilor la 40-60%
din copiii investigati in acest mod, dar proportia rezultatelor fals negative nu se cunoa~te
pentru ca in aceste studii restul copiilor au ramas cu diagnosticul neprecizat, tara
investigatE pentru virusuri sau micoplasme. La adulti imuno-compromi~i, cu infiltrate
pulmonare focale sau difuze, patogenii pulmonari au fost depistari in aspiratul pulmonar
in proportii de la 53 la 82%: fungi oportuni~ti, nocardii, micobacterii, Legionella, P carinii.
4) Biopsia pulmonara
Biopsia pulmonara transtoracica prin ac este tot mai mult abandonata in favoarea
biopsiei transbron~ice sau a biopsiei pulmonare deschise prin toracotomie.
Biopsia pulmonara deschisa ofera, sub control vizual ~itactil, celmai reprezentativ
prelevat in cantitati suficiente pentru un exam en complet histopatologic ~i microbio-
logic. La necesitate pot fi prelevate multiple biopsii din situsuri anatomice diferite. Mai
frecvent, in pneumopatii difuze, se practica prin toracotomie anterioara limitata in al 4-lea
spatiu intercostal. La pacienti cu stare clinica relativ buna, toracotomia posterolateral a
pennite biopsiere pulmonara, pleurala, peribron~ica, hilara ~i de ganglioni mediastinali.
Indicatia principala prive~te diagnosticul infecriei pulmonare la pacienti imunocom-
promi~i. Dezavantajele includ necesitatea pregatirii preoperatorii, anesteziei generale,
ingrij irilor postoperatorii, costul. Incidenta complicatiilor este redusa: pneumotorax
intarziat, hemoragii. Rata deceselor este sub 1%.
In infec!iile pulmonare ale pacienrilor imunocompromi~i proportia depistarii agen-
tului etiologic (bacterii ~i fungi oportuni~ti, actinomicete, micobacterii, Legionella,
P carinii, virusuri) variaza intre 55 ~i91%, superioara depistarii in biopsiile transbron~ice.
Acest examen vizeaza in primul rand sputa din ITRI bacteriene acute detem1inate
de patogeni comuni, pneumococi, H. injluenzae, S. aureus, Moraxella catarrlzalis, bacili
gram-negativi aerobi ~.a., cu ~anse rezonabile de a depista ~i alte bacterii sau fungi cand
ace~tia sunt in cauza. Suspiciunea unei anumite etiologii trebuie expres comunicata
laboratorului deoarece poate impune alte medii de cultura ~i proceduri.
235
13.3.2. Spalarea sputei (revezi ~i 13.1.5.)
13.3.3. Microscopia
236
Fig. 13-5. Sputa: frotiuri colorate Gram ~i examinate cu marire de lOOX
A) ProM intens purulenta cu contaminare oro-faringiana minima: observati fibrina ~i mucina, mult peste 25
CI ~i numai 2 CES/dimp microscopic. B) Proba cu contaminare oro-faringiana masiva: fibrina absenta,
prezente mult peste 15 CES ~i peste 25 Cl/camp microscopic. C) Frotiu efectuat defectuos: exsudatul puru-
lent a fost dilacerat cu ansa, prin mi~cari de dute-vino, in fii~ii subtiri amestecate cu secretii de contaminare
oro-faringiana; pe un asemenea frotiu nu putem efectua corect bacterioscopia cantitativa (vezi textul). D)
Frotiu din sputa mucopurulenta cu insule compacte de CI diseminate pe fondul secretiilor oro-faringiene de
contaminare. In asemenea insule de CI putem efectua corect bacterioscopia cantitativa.
infectii bronho-pulmonare
43 5
2
6 1 acute pana
Grupa la
scuamoase
70% din probe apartin grupei a 5-a de
cali tate, maximala. Dar majoritatea pro-
bel or de la pacienti cu metaplazie scua-
moasa a epiteliului respirator apartin
gmpei a 3-a.
Raportul celule injlamatorii/celule
epiteliale scuamoase mai mic de 5 indica
237
probe nesatismciitoare (nepurulente, cu contaminare orofaringiana masiva). Probele
purulente, in care predomina exsudatul bronho-pulmonar, realul produs patologic, au
raportulCI/CM mai mare de 5 ~i sunt cu atat mai purulente Cll cat raportul este mai mare.
Raportul CIICES permite aprecierea calitativa a probelor examinate eu diferite mariri,
incIusiv pe preparat umed .
Scorul de calitate Q propus de BARTLETT (1974) ~i de BARTLETT ~i colab.
(1979) este calculat conform indica!iilor din tabelul 13-3. E.g., 0 proM de sputa pentru
care examenul microscopic in aceste condi!ii atesta prezen!a fibrinei ~i in medie/camp
peste 25 CI ~i 7 CES are scorul "Q" = +3, rezuItat din (+2) + 0 + 1, in timp ce 0 proba Tara
fibrina eu peste 25 CI ~i peste 25 CES/camp realizeaza seorul "Q" = 0, rezultat din (+2)
+ (-2) + O.
Tabelul13-3
(miirire de
"Q ,,= suma algebrica a calificativeJor pentru CI ~i CES + J (calificativuJ acordat pentru prczenta
fibrinei in preJevatuJ examinat).
238
Fig. 13-6. Sputa intens purulenta (calitatea citologica, in ordinea metodelor de apreciere citate In
text: categoria 5, raportul Cl/CES mai mare de 20, iar "Q" = +3). Bacterioscopie cantitativa pe frotiu
colorat Gram, marire de 1 000 X.
Obse/'va{i: peste 10 bacterii pneumococoide asociate cu 7 granulocite polimorfonucleare ~i fibrilla.
Sputocultura a izolat cantitativ peste 10" UFC Streptococcus pnellllloniae/mL iar semicantitativ predomi-
nant ~i In eantitate mare (4+) pneumoeoei.
Fig. 13-7. Sputa muco-purulenta (citologic, calitatea: categoria 5, raportul Cl/CES peste 20, iar
"Q" = + 3). Bacterioscopie cantitativa pe frotiu colorat Gram, marire de 1 000 X.
Obse/'va{i: sute de bacterii hemofiloide "In bane de pe~ti" asociate eu fibrina ~i 3 polimorfonucleare.
Sputocultura a izolat eantitativ peste 107 UFC Haemophilus influenzae/mL, iar semieantitativ predominant ~i
In cantitate mare (4+) aceea~i bacterie
239
Fig. 13-9. Sputa purulenta (citologic, calitatea:
categoria 5, CI/CES peste 20, iar "Q" = +3). Bacterio-
scopie cantitativa pe frotiu coloratGram, marire de
1000X.
Ohserva{ii: zeei de baeili gram-negativi mai freevent in
pereehi ~i eapsulati asoeia[i eu 6 polimorfonueleare ~i
fibrina. Sputoeultura a izolat eantitativ peste 10" UFC
Klehsiella pnezlIilOniae patogena pentru ~oareee!Il1L iar
semieantitativ predominant (4+) aeeea~i baeteric.
Fig. 13-10. Spalatura bron~ica. Frotiu colorat Gram, marire de 1 OOOX,dar raporturilc de mariI'e
modificate pentru reproducere.
A)Celule ciliate de descuamare ~i celule inflamatorii. B) Ohserva{ii: zeci de bacterii pneumoeoeoidc ~i
hemofiloide asociate cu 3 celule mature de exfoliere din epiteliul respirator.
240
-------.
Celulele expectorate pot fi impar-
-
tite in celule inflamatorii ~i celule de
exfoliere (fig. 13-11). 10J.l~ .. c.~
..m .C .'
1) Celule inflamatorii. Obi~nuit
detenninam procentul acestor celule in d
expectoratii.
Polimorfonuclearele neutrafile e~ _..
(PMN) pot fi integre sau in diferite stadii
de dezintegrare. Celulele integre au . ....,~ .. . .. ..
-
- '" '.'
f~;~..;.c. .. ;g..,,-. ......
..-
------=":;;.:.Jji' II-c!!!
.!!,'
.. R'1""-c~~-
"'''''"'',,,'"'_ ,,_II!", !!!ll!!!!!ll!!!!!ll!! ii""'='"---
242
13.3.4. Fluidifierea
243
La epuizarea cantitativa, tine cont ca 0 colonie de pe placa insamfmtata cu 0,1 mL
din dilutia 10-2 semnifica 103 UFC/mL, respectiv 104 UFC/mL in cazul dilutiei 10-3. La
probele de periaj bron~ic, tinand seama ca peria preleva cca 0,001 mL, fiecare colonie
rezultata dupa epuizarea ansei de 0,01 mL semnifica cel putin 105 UFC/mL exsudat.
Din expectoratiile care indeplinesc exigentele citologice de calitate ~isunt prelucrate
confonn indicatiilor precizate, izolam numai 1-2 bacterii cu cre~tere 4+ sau 3+, dupa
epuizarea semicantitativa, sau peste 105-6 UFC/mL, dupa epuizarea cantitativa. Este
rezonabi1 ca in cazul probe lor cu mai mult de 3 izolate in cantitate mare sa sistam identi-
ficarea la nivel microscopic ~i sa nu tentam antibiograma pentru ca nu putem argumenta,
de obicei, pentru nici unul in mod convingator, semnificatia clinica. In aceste cazuri
antibioticoterapia condusa pe baza rationamentului clinico-epidemiologic este mai utila.
Daca nu regase~ti categoriile microscopice bacteriene depistate pe frotiul direct in
asociatie semnificativa cu leucocitele sau celulele bron~ice (revezi fig. 13-6, 7, 8, 9,10)
printre izolatele predominante ~i in cantitate mare, reincubeaza placile pana la 48 de ore.
Procedeaza la fel ~i in cazul probelor prelevate de la pacienti sub antibioticoterapie.
244
3) Neisseriile. Caracterele microscopice, de cultura ~i reactia oxidazei pozitiva Ie
identifica la nivel de gen. In masura in care citobacterioscopia atesta semnificatia clinica
a acestor izolate, testeaza cre~terea pe mediul Thayer-Martin modificat pentru a diferentia
meningococii de Moraxella catarrhalis. Oricum, coloniile alb-cenu~ii, friabile ~i intens
oxidazo-pozitive sunt puternic sugestive pentru M. catarrhalis.
4) Enterobacteriaceele pot cauza ITRI la gazde compromise. In conditii de
spitalizare sunt implicate ~i alte specii in afara de K. pneumoniae sau tulpini hemolitice
de E. coli. Eforturi de identificare in cadrul familiei pana la nivelul de gen ~i specie sunt
justificate numai in circumstante clinico-epidemiologice sugestive ~i cfmd citobacte-
rioscopia cantitativa atesta asocierea senmificativa a bacililor gram-negativi cu leucocitele
(v. fig. 13-9). Tran~area senmificatiei enteronacteriaceelor izolate in sputocultura po ate
necesita prelevari care ~unteaza contaminarea oro-faringiana.
5) Bacilii gram-negativi nefermentativi izolati in sputocultura presupun, in general,
comentarii similare celor pentru enterobacteriacee. Identificarea bacilulului piocianic,
cel mai important reprezentant al grupului, se face pe baza caracterelor de cultura
(pigmentogeneza, capacitatea de a cultiva la 41 C ~.a.), dar frecvent tulpinile izolate de
la pacienti cu fibroza chistica sunt nepigmentogene ~i trebuie sa recurgem la teste
biochimice de identificare. Restul izolatelor sunt inregistrate la nivel de gen sau grup
(e.g., Flavobacterium spp. saD Pseudomonas spp. diferita de P. aeruginosa etc.),
identificarea speciei unnand numai in caz de semnificatie c1inica demonstrata.
6) Dintre stafilococi se impune.identificat S. aureus, restul ii inregistram numai ea
stafilococi coagulazo-negativi tara a-i comunica. La pacienti sub terapie antimierobiana,
mai ales in conditii de spitalizare, semnificatia c1inica a S. aureus trebuie argumentata
prudent.
7) Bacilii gram-pozitivi. Corinebacteriile Ie inregistram ca baeili difterimorfi nUll1ai
pe baza caracterelor de cultura ~i ll1icroscopice. Insa la pacienti tineri, care au contacte
eu animalele ~i sunt in conditii de imunodeficienta sau imunosupresie, prezenta bacililor
corinefonni in sputa poate sugera 0 infectie cu Rhodococcus equi ~iimpune aprofundarea
identificarii. Posibilitatea unei nocardii trebuie apreciata in raport cu circull1stanta clinica
(revezi tabelul 13-1).
Izolan a in sputocultura a bacililor antracoizi, calificati obi~nuit drept contall1inanti,
trebuie interpretata prudent la gazda cOll1promisa, la care, ocazional, Bacillus cereus ~i
B. subtilis au fost sell1nalati ca 0 cauza de infectii pulmonare.
245
13.3.8. Comunicarea rezultatelor
Comunica izolatele in cantitate de cel putin 105-6 DFC/mL sau izolatele predomi-
nante~i in cantitate mare (cel putin 3+ 1a inregistrarea semicantitativa acre~terii), care
se regasesc semnificativ asociate celulelor il1f1amatorii pe frotiul direct. In infec!iile
grave, antibiograma acestor izolate poate fi efectuata chiar inaintea identifidirii lor pana
la nive1ele stabilite mai sus.
Proportia in care bacterii cu semnificatie c1inica pot fi stabi1ite in sputa acceptata
prin triaju1 cito10gic de 1a pacienti cu ITRI contractate in colectivitatea generala este
relativ modesta: - 60%.
Asocierea sputoculturii cantitative cu inocularea la ~oarece amelioreaza mult, pe
seama pneumococilor, izolarea bacteriilor cu semnificatie c1inica.
13.4.1. Microscopia
Eta1eaza frotiurile numai pe lame noi. Numai la nevoie recicleaza lame cu frotiurile
negative pentru bacili acido-rezistenti, dar numai dupa ce au fost mentinute minimum 48
ore in amestec sulfocromic, spa1ate, degresate ~i sterilizate prin aer cald.
Din sedimentu1 probei omogenizate (vezi 13.4.2) eta1eaza un frotiu subtire ~i uni-
form pe 0 suprafata de cca 3-4/1,5 cm. Frotiu1 efectuat din portiuni bine alese ale probei
(portiuni purulente, cazeoase) poate da rezultate mai bune dedit concentratu1 probei.
1) Examinarea frotiului colorat Ziehl-Neelsen. Examineaza cu marire moderata
(obiectiv 90X ID, ocular 5X) pentru a scruta in timp rezonabi1 0 suprafata cat mai mare.
Depune 0 picatura de u1ei de cedru 1amijlocul unei extremitati a frotiului fara a-I atinge
cu bagheta. Examineaza camp cu camp (cca 2-5 secunde/camp) evitand mi~carea con-
tinua a lamei. Ba1eiaju1 frotiului de 1a0 extremitate la alta pennite examinarea a eea 100
de ciimpuri. Daca pe prime1e 100 de campuri au fost depistati 1-3 bacili sau nu au fost
observati de 10c, continua examenu1 pe alte 100 campuri de pe margine a superioara ~i
respectiv inferioara a frotiului (fig. 13-12). Examenul corect a1 unui frotiu poate dura
pana 1a 20 minute. Artefacte acido-rezistente sunt u~or confundate eu bacili aeido-
rezistenti. De aceea observarea numai a catorva bacili acido-rezistenti pe tot frotiul se
consemneaza ca suspiciune ~i se solicita
examinarea unei noi probe.
i
2) Examinarea frotiulu calm-at fluores-
: (~~ :11 IJ
Fig. 13-12. Baleiajul microscopic al unui
cent cu auramina se face initial cu obiectivul
20X ~i ocu1aru11 OX, iar confinnarea bacililor
depistati, prin examinarea acelora~i campuri cu
frotiu colorat Ziehl-Neelsen pentru bacilo- obiectivul40X. Examenul a 30 de campuri (cca
scopia sputei, schematic 1- 3 minute) echivaleaza Cll scrutarea prin
246
obiectivul cu imersie a celor 300 de dimpuri de pe frotiul colorat Ziehl-Neelsen. Metoda
elimina rapid frotiurile negative, cele pozitive urmand a fi confirm ate prin examinare cu
imersia a aceluia~i frotiu recolorat Ziehl-Neelsen.
Comunica rezultatele semicantitativ (tabelul13-4).
Tabelll/ 13-4
13.4.3. Izolarea
247
fluid a pantei, pentru adsorbtia inoculului, incubeaza in pozitie vertical a tuburile inchise
ermetic. Examineaza culturile dupa 2 saptamani de incubare, initial cu lupa, apoi cu
ochiulliber, saptamanal, pana la 8 saptamani. Daca frotiul direct a depistat bacili acido-
rezistenti care nu apar in cultura, incubeaza tuburile suplimentar pana la 90 zile.
Identifica izolatele prin caracterele microscopice (acido-rezistenta, dispozitie in
corzi), de cultura (temperatura optima ~i viteza de cre~tere, aspectul coloniilor, pigmen-
togeneza), biochimice (producere de catalaza ~i termorezisteta acesteia, producerea de
niacina sau, mai bine, sensibilitatea la hidrazida acidului tiofen-2-carboxilic). Evident,
intre laboratoare apar inevitabil diferentieri privind nivelul pana la care pot conduce
identificarea micobacteriilor. Laboratoarele spitalelor judetene trebuie sa asigure identi-
ficarea M. tuberculosis ~i antibiograma. Identificarea altor specii este de competenta
laboratoarelor de referintii unde urmeaza a fi expediate tulpinile.
Depistarea micobacteriilor condition at patogene in prelevate contaminate capata
semnificatie clinica numai cand, in absenta bacililor tuberculozei, sunt izolate in cantitate
mare sau izolarea lor repetata coincide cu evolutia bolii.
248
Practic, toate laboratoarele clinice arondate marilor colectivitati pediatrice trebuie
sa poata stabili etiologia sindromului de tuse convulsiva prin examen serologic cu baterie
de antigene: aglutinare eu antigen B. pertussis, RFC cu antigene virale (adenovirus,
virusurile paragripale ~i respirator sincitial). Un numar restrans de laboratoare poate fi
antrenat, sub controlullaboratorului de referinta, in eantionajul tulpinilor de B. pertussis
necesar supravegherii sensibilitatii la antibiotice i prepararii vaecinului.
13.7.2. Izolarea
249
pirofosfat feric satisface exigentele nutritive specifice legionelelor, iar prin carbunele
activat previne oxidarea fotochimica a extractului de levura. Decontamineaza sputa fie
prin spalare timp de 5 minute in baie cu tampon 0,2 M HCI- KCI pH 2,0, fie prin inealzire
1,-2 minute in baie de apa la 60C.
Pentru hemocu1turi folose$te mediul CYE difazic aditionat cu L-cisteina $i pirofosfat
feric.
Incubeaza culturile aerob la 37C $i urmare$te-le timp de 7 zile. Singura earboxifila
este Legionella gormanii. Ii asiguram izolarea in borcan eu lumanare. In general,
concentratii de CO2 peste 5% sunt inhibitoare pentru legione1e.
Numai pe mediul BCYE, abia dupa 2-3 zile de incubatie apar primele colonii de
Legionella, initial in ariile dens insamantate, mici punetiforme. DiametiUI lor ere$te
progresiv la 1-2 mm dupa 3 zile de ineubare. Sunt rotunde, eu margini U$or neregulate,
convexe, stralucitoare, verzui.
Repica 2-3 colonii pe un mediu clar, e.g., agar Feeley-Goffi1an pentru a acumula
cultura pura necesara identificarii.
Daca specificitatea izolarii legionelelor este de 1,0, sensibilitatea nu depa$e$te
0,80.
13.8.1. Microscopia
250
13.8.2. Izolarea
251
Sensibilitatea depistarii fungilor in diferite prelevate din ihfectiile bronhopulmonare
am precizat-o mai sus (revezi 13.1.4). Acum insistam $i asupra specificitatii.
Prezenta fungilor, patogeni sau oportuni$ti, in prelevate corect recoltate prin metode
invazive, care $unteaza contaminarea oro-faringiana, are semnificatie clinica. La
examinarea prelevatelor contaminate, microscopia directa are 0 contributie majora pentn:
interpretarea semnificatiei fungilor depistati.
Levurile care, prin fonna, dimensil,me, prezenta, numarul $i modul de ata$are a
blastoconnidiilor, dispozitia intra- sau extracelulara, evoca fonna tisulara a unor anume
fungi dimorfi sau prin prezenta capsulei evoca Cryptococcus neofomzans, trebuie
acceptate cu semnificatie clinica, fiind microorganisme care detennina infectii exogene.
Prezenta in sputa proaspata a hifelor adevarate $i pseudohifelor cu artroconidii
$i blastoconidii evoca 0 specie de Trichosporon cu semnificatie clinica.
In schimb prezenta levurilor inmugurite, rotunde sau ovale, cu diametrul de 2-4 11m,
chiar insotite de pseudohife cu extremitati rotunjite $i blastoconidii tem1inale nu semnifica
in mod necesar 0 candidoza bronho-pulmonara. Aceea$i morfologie 0 au $i speciile de
Candida depistate microscopic frecvent in secretiile oro-faringiene ale pacientilor cu
disbioze (e.g., din cauza igienei bucale precare sau antibioticoterapiei). Invers, absenta
din sputa a levurilor $i pseudohifelor de Candida nu exclude candidoza tractusului res-
pirator inferior.
Hife groase de 8-15 11m,neseptate, hialine indica un zigomicet: mucor, Rh isopus.
Absidia etc. Prezenta exclusiva a hifelor $i izolarea repetata din sputa a aceleia$i specii
Ii argumenteaza semnificatia clinici'i. Zigomicetele contaminante dezvolta in expectoratii
conidii.
Prezenta in pseudomembrane, mulaje sau dopuri bron$ice ori intracavitare a unor
hife mai subtiri, de 5-7 11m (chiar de 2,5 11min aspergiloamele pulmonare), hialine,
regulat septate $i extensiv ramificate pseudodihotomic indica mai frecvent 0 specie de
Aspergillus. La extremitatea putin ramificata (batrana), hifele sunt frecvent goale, iar la
cea ramificata au citoplasma refringenta. In zona activa de cre$tere aspectul inca neseptat
preteaza la confuzii cu zigomicetele. Alte argumente de semnificatie sunt: prezenta
conidioforilor cu extremitatea putemic clavata pe suprafata careia se aliniaza fialide cu
cate un lant de conidii sferice; prezenta in centrul dopurilor purulente sau concretiunilor
de hife putemic balonizate, probabil conidii genninate.
Frecvent, daca nu dispunem de probe biopsice, semnificatia fungilor oportuni$ti,
care pot contamina expectoratiile, ramane a fi tran$ata numai prin serodiagnostic.
Pneumocystis carin ii, aglomerat sub forma de ciorchini in exsudatul alveolar, este
dificil mobilizat in expectoratie. De aceea examenul sputei sau spalaturii bron$ice este
frecvent fals negativ. Rezultatele ameliorate dau probele obtinute prin periaj bron~ic sau
aspiratie transtraheala. eel mai acurat diagnostic 11asigura insa examenul amprentelor
de biopsie pulmonara cu torace deschis.
Uzual examinam frotiuri colorate Giemsa, dar sunt indicate frotiuri de rezerva
pentlll coloratiile de electie cu albastru de toluidina sau Gomori. Fungul poate fi depistat
cu aspecte variate: a) fonne extrachistice rotunde, unele mici de I-311m; b) chi$ti cu
252
diametrul de cca 7 flm, care contin 2-8 fonne intrachistice mici, uneori semilunare.
Chi~tii sunt identificati mai u~or pe frotiurile colorate Gomori cu nitrat de argint-
metenamina, prip prezenta unei perechi de ingro~ari parietale in fonna de virgula.
Izolarea. Insamanteaza probele pe:
agar-sange pe baza de infuzie cord-creier cu incubare aeroba la 37C pentru
izolarea formei levurice a fungilor dimorfi; la suspiciunea blastomicozei utilizeaza,
suplimentar, ~i 0 placa cu acela~i mediu de cultura lara sange .
agar Sabouraud glucozat 2% pentru izolarea fonnei miceliene a fungilor dimorfi,
a fungilor filamento~i sau a levurilor.
Pentru izolarile din prelevate contaminate insamanteaza in para leI acelea~i medii
cu amestec selectiv de antibiotice: penicilina 20 U.I./mL, cloramfenicol 50 flg/mL ~i
cicloheximida 500 flg/mL.
Vezi amanuntele tehnice privind conditionarea mediilor, insamantarea, incubarea
~i unnarirea culturilor, masurile de siguranta antiepidemica in Cap. 2.6.
Identificarea corecta a multor fungi depa~e~te capacitatile laboratorului clinic.
Expediaza asemenea tulpini laboratorului pentru identificare ~i antibiograma.
13.10.2. Chlamidii
253
expediate laboratorului de referinta conservate in mediul 2SP aditionat cu 5% ser de
vitel sau in mediul SPG eu antibiotiee (vezi Cap. 40). Daea examinarea se po ate
face pfma in 24 de ore, probele sunt refrigerate la 4C, in caz contrar trebuie
congelate la -70C.
13.10.3. Virusuri
Examenului preparatului umed intre lama ~i lamela din sputa pennite depistarea
oualor de Paragonimus westennani, protoscolec~ilor de Echinococcus in cazul; de ruptura
a chi~tilor hidatici pulmonari, larvelor de Strongiloides stercoralis sau Ascaris
lumbricoides. Aspectele depa~ese scopurile acestei carti. Cei interesati pot consulta
bibliografia reeol11andata.
14. DIAGNOSTICUL DE LAB ORATOR AL INFECTIILOR
TRACTUSULUIURINAR
(DUMlIRU BUruC)
14.1. INIRODUCERE
lnfectia tractusului urinar (ITU) este una din cele mai frecvente conditi patologice.
Predictia pozitiva pentm lIU a simptomatologiei c1inice oscileaza in jur de 0,5, chiar
mai redusa in cazul sindromului uretralla femei. Un numar apreciabil de lIU evolueaza
asimptomatic, iar la copilul sub varsta de 2 ani simptomatologia ITU este nespecifica.
De aceea, eel mai mare numar de probe care aglomereaza laboratoml clinic sunt cele de
urina, a caror examinare microbiologica cere un anumit discernihnant pentm a nu epuiza
resursele laboratorului in investigatii mra finalitate sau chiar cu rezultatE eronate.
diiunatoare pentru pacient.
255
14.1.1. Conditia anatomo-histologidi a tractusului urinar
Sistemul urinar este fonnat din cei doi rinichi, diile urinare intra- ~i extrarenale.
Partea glandulara a rinichiului coafeaza sinusul, 0 mare cavitate adjacenta hilului renal.
Sinusul contine bazinetul renal, tesut conectiv lax ~i tesut adipos prin care trec spre ~i
dinspre portiunea glandulara nervii, arterele, respectiv venele ~i vasele limfatice.
Bazinetul renal se continua la nivelul hilului cu ureterul prin care urina ajunge in
vezica urinarii, de unde este eliminata periodic prin uretrii.In bazinet se deschid calicele
mari, care reunesc calicele mid.
Partea glandularii este concentrata in cortexul renal, care acopera zona medularii
fonnata din 8-18 piramide renale conice. Baza piramidelor renale este dispusa spre cor-
tex, iar varful sau papUa proemina in lumenul fiecarui calice mic. Varful papilei este
perforat de 10-25 orificii prin care se deschid tubii uriniferi.
Nefronul, unitatea secretorie a rinichiului, este fonnat din segmente repartizate
intre cortex (capsula lui Bowman, care inconjura glomerulul vascular renal, tubii contor!i
proximal ~i distal) ~imedulara (ansa lui Henle, care face jonctiunea dintre tubii contort,i).
La limita dintre corticala ~i medulara, fiecare tub contort distal se continua cu un scurt
tub colector. Tubii colectori strabat radiar zona extema a medularei ~i fuzioneaza rcpetat
cu alti tubi similari in zona intern a pentru a fornla ducturile papilare.
Din arterele arciforme de la jonctiunea corticalei cu medulara radiaza spre periferie
arterele interlobulare ale caror mici ramificatii formeaza glomerulii renali. Circulatia
venoasa, de retur, paralelizeaza arterele. Aspectul striat al medularei renale este dat