Proteinuria sebagian besar berasal dari kebocoran glomerulus (proteinuria
glomerular) dan hanya sebagian kecil berasal dari sekresi tubulus (proteinuria tubular). Perubahan integriti membran basalis glomerulus menyebabkan peningkatan permeabiliti glomerulus terhadap protein plasma. Protein utama yang keluar ke dalam urin adalah albumin. Ini berlaku kerana kemusnahan pada membran basalis glomerulus menyebabkan pertambahan saiz dan bilangan pori-pori atau liang pada membran. Ini akan memudahkan lagi laluan molekul-molekul yang besar seperti protein. Laluan protein plasma yang lebih besar dari 70 kD melalui membrana basalis glomerulus normalnya dibatasi oleh charge selective barrier (suatu polyanionic glycosaminoglycan) dan size selective barrier. Kebiasaannya, Glycoprotein yang bercas negatif akan menolak albumin dan plasma protein lain yang juga bercas negatif. Oleh yang demikian, protein plasma tidak akan di turas dan kekal dalam salur darah. Namun dalam SN ini, kecelaruan atau kemusnahan cas negatif pada membran basalis glomerulus akan menyebabkan albumin serta protein plasma yang lain di turas keluar dari salur darah ke dalam urin. Pada nefropati lesi minimal, proteinuria disebabkan oleh hilangnya charge selectivity sedangkan pada nefropati membranosa disebabkan terutama oleh hilangnya size selectivity. Secara umumnya, lebih tinggi kadar kehilangan protein ke dalam urin , maka lebih rendah tahap albumin di dalam serum dan menyebabkan keadaan yang dipanggil hipoalbuminemia.