Sunteți pe pagina 1din 4

Am folosit enzima D- lactat dehidrogenaza complexat cu NADH , cod

PDB-4CUK i enzima D-lactat dehidrogenaza necomplexata, cod PDB


4CUJ, ambele de la Salmonella enterica cu lungimea 338 i cu 4 lanturi:
A,B,C,D. (Attarataya i colab.,To be published)

n figur este reprezentata molecula de lactat dehidrogenaz fr


ligand,Sferele albe reprezint heterogruparile , iar sferele albastru deschis
reprezint moleculele de sulf din molecula . n albastru i Violet sunt
reprezentate - helixurile ,iar cu galben sunt reprezentate structurile -
sheet. Figura a fost realizata utiliznd VMD 1.9.3 (Humphrey i
colab.,1996)
n figur este reprezentata molecula de lactat dehidrogenaz cu ligand
NADPH, sferele albastre reprezint moleculele de sulf din molecula. Cu
portocaliu sunt reprezentate cele doua molecule de NADPH. n albastru i
Violet sunt reprezentate - helixurile ,iar cu galben sunt reprezentate
structurile -sheet. Figura a fost realizata utiliznd VMD 1.9.3 (Humphrey
i colab.,1996)
n figur sunt reprezentate cele doua molecule de lactat dehidrogenaz cu
ligand NADPH i fr ligand suprapuse. Cu Violet i albastru deschis sunt
reprezentate structurile secundare ale celor doua enzime. Cu verde sunt
reprezentate cele doua molecule de NADPH, iar cu galben sunt
reprezentate moleculele de sulf din cadrul celor doua molecule. Figura a
fost realizat utiliznd VMD 1.9.3 (Humphrey i colab.,1996).

nainte de suprapunere am obtinut RMSD: 153,02135423519982 ,dup ce


am suprapus cele doua molecule(cu ligand NADPH i fr ligand) (residue
1 to 277) am obinut un RMSD total de : 0,8100617093585467 utiliznd
VMD 1.9.3 (Humphrey i colab.,1996)

Bibliografie
1. Attarataya, J., Zaccai, N. ., Shoemark, D. ., & Brady, R. L. (n.d.). The
Structure of Salmonella D-Lactate Dehydrogenase. To Be Published.
https://doi.org/10.2210/PDB4CUJ/PDB
2. Humphrey, W., Dalke, A. and Schulten, K., "VMD - Visual Molecular
Dynamics", J. Molec. Graphics, 1996, vol. 14, pp. 33-38.