Biologia molecular

1. Tudo comeou quando o material inorgnico contido nos oceanos e lagos

combinaram-se formando os primeiros compostos de carbono. Surgiram os
aminocidos e nucleotdeos que mais tarde deram origem s protenas e cidos
nuclicos. Isto chamado de sntesePrebitica, uma sntese formada sem a presena
de seres vivos.
Ento, polmeros de aminocidos e nucleotdeos se uniram formando inmeras
protenas e cidos nuclicos que foram englobados juntos a outras molculas pela
bicamada de fosfolipdios originando assim a primeira clula procarionte heterotrfica.
Um exemplo clssico desse tipo de clulas so as nossas queridas bactrias.

2. As macromolculas so molculas grandes constitudas de unidades estruturais

que se repetem, os monmeros. Elas constituem os polmeros e podem ser divididas
em naturais e sintticas. As macromolculas naturais so os glicdios, lipdios, as
protenas e os cidos nuclicos. Elas no so absorvidas diretamente pelo nosso
organismo, necessrio que ele as quebre e as torne molculas menores que o nosso
corpo ser capaz de aproveitar e absorver.

Os glicdios, conhecidos tambm como acares, carboidratos ou hidratos de carbono,

so substncias constitudas fundamentalmente por tomos de carbono, hidrognio e
oxignio. Eles so a principal fonte de energia para os seres vivos e podemos
encontr-los em alimentos do nosso dia-a-dia. Os principais glicdios so:

Os lipdios so substncias insolveis em gua e solveis em solventes orgnicos. De

extrema importncia para o bom funcionamento de nosso corpo, eles constituem os
leos e as gorduras animais e vegetais. Podemos encontr-los em alimentos como
manteiga, azeite de oliva, leo, presunto e em frutas gordurosas, como o coco e o
abacate. Dentre os lipdios, podemos destacar:

As protenas so formadas por um grupo de 20 aminocidos. Na nossa alimentao,

as protenas podem ser encontradas no leite, na carne, no ovo, no peixe, no queijo, no
frango, na manteiga e outros alimentos.

Praticamente 15% do nosso corpo formado por protenas, sendo ela indispensvel,
j que so agentes estruturais das clulas e catalisadoras de funes biolgicas.
Podem ter a funo de armazenamento ou at de defesa do organismo, como os
anticorpos. As protenas esto relacionadas com quase tudo que ocorre nas clulas e
ao serem quebradas em aminocidos, nosso corpo as absorve. O papel central das
protenas est no fato de que a informao gentica expressa em protenas. Para
cada protena existe um gene que codifica uma seqncia especfica de aminocidos.
Elas so as macromolculas mais abundantes e versteis.
Os cidos nuclicos so formados por unidades monomricas (nucleotdeos),
grupamento fosfrico (fosfato), glicdio (pentose, variando entre ribose e desoxirribose)
e uma base nitrogenada (sendo ela ou do grupo das pricas, adenina e guanina, ou
das pirimdicas, timina, citosina e uracila). Tudo isso compe o material gentico
encontrado nas clulas de todos os seres vivos. Eles sero quebrados em
nucleotdeos, para que o nosso corpo os aproveite.

3. Porque so constitudos por macromolculas. Estas o formadas por meio de

ligaes covalentes, feitas entre vrias molculas menores, e podem conter centenas
ou milhares de tomos. Carboidratos, cidos nucleicos e protenas so geralmente
encontrados na natureza como polmeros longos. Por causa de sua natureza
polimrica e seu grande (muitas vezes enorme!) tamanho, eles so classificados
como macromolculas, grande (macro-) molculas feitas a partir da juno de
subunidades menores

4. Ligao

5. No. Apenas em 1952, com um novo trabalho, realizado por Hershey & Chase,
demonstrou que o material gentico era o DNA.

6. A diferena bsica entre DNA e RNA, no que diz respeito aos monmeros
constituintes destas molculas, est na presena ou ausncia de um grupo
hidroxila no C2 da Pentose.

No RNA a pentose uma ribose.

No DNA a pentose uma 2-desoxirribose.

Outra diferena entre estas macromolculas est nas Bases Nitrogenadas.

As bases do DNA so Adenina, Guanina, Citosina e Timina.

As bases do RNA so Adenina, Guanina, Citosina e Uracila.

O DNA uma longa hlice dupla de nucleotdeos com uma estrutura secundria
regular e simples, enquanto os RNAs so, geralmente, molculas de uma nica fita de
nucleotdeos, bem menores que o DNA, apresentando, todavia, uma enorme
diversidade de estruturas.

A molcula de DNA mais estvel e regular que as molculas de RNA.

10. Estrutura relativamente simples, Dois filamentos de nucleotdeos

complementares, Polaridade inversa, Dupla-hlice.

11. As purinas, adenina (A) e guanina (G), so maiores

e contm mais de um anel, ao contrrio das
pirimidinas, citosina (C), uracila (U) e timina (T), que
so menores e compostas apenas por um anel.

12. Estrutura primria - Associao da dupla hlice do DNA com um grupo

especfico de histonas. Duas cpias de cada uma das quatro histonas (H2A,
H2B, H3, H4) constituem um octmero, em torno do qual um segmento de
dupla hlice de DNA se enrola, como uma linha em torno de um carretel. O
octmero circundado por duas voltas de DNA constitui
um nucleossomo. Cerca de 140 bases de DNA esto associadas a cada
centro de histonas. Aps um segmento de DNA curto (20 a 60 bases), forma-se
o centro seguinte de complexo de DNA, e assim por diante, conferindo
cromatina a aparncia de contas num cordo. Este primeiro nvel de
compactao reduz o tamanho da molcula de DNA em 6 a 7 vezes.

2) Solenides - A histona H1 tem papel na organizao da cromatina

ocupando lugar na regio entre os nucleossomos, forando o material a outro
tipo de compactao, em estruturas secundrias helicides, denominadas
solenides. O solenide corresponde compactao de 6 a 7 nucleossomos.
Essa nova fibra a unidade fundamental da organizao da cromatina. O
solenide capaz de condensar aproximadamente 1200 bases de DNA.
3) Alas - Com a formao do solenide, tem lugar a ao de protenas no-
histnicas, que formam estruturas em alas ou domnios. As alas podem ser o
incio de espessamentos parecidos com ns, denominados crommeros.
medida que os cromossomos se condensam mais, os crommeros adjacentes
fundem-se em estruturas maiores, que depois se tornam s bandas
cromossmicas.
4) Cromossomos - Encontramos essas formas na metfase, quando h a
maior condensao da cromatina. o enrolamento final, do qual participa a
topoisomerase II.
Nvel 1-Voltas do DNA ao redor das Histonas criado
a estrutara do nucleossomo;
Nvel 2- Nucleossomos conectados por um fio de
DNA formando um "colar de contas" (beads on a
string), tambm conhecido como solenide;
Nvel 3- Solenides dobram-se formando fibras que
so estabilizadas por proteinas no histonicas,
formando fibras cromossmicas, nesse nvel os
cromossomos comeam a aparecer (300 nm);
Nvel 4- Formao dos loops com 700 nm de
espessura.Como o cromossomo metfasico possui
duas cromtides este atinge o dimetro de 1400 nm.

14. existem vrias origens de replicao, o que permite que a duplicao do

DNA se inicie simultaneamente em vrios locais dos cromossomos, tornando
o processo mais rpido.

15. A PCR encontra sua principal aplicao em situaes onde a quantidade de DNA
disponvel reduzida. Em teoria, possvel amplificar qualquer DNA. Uma das principais
aplicaes da PCR na medicina forense, onde pequenas amostras de DNA retiradas da
cena de um crime (pedaos de cabelo que contenham bulbo, gotas de sangue ou saliva,
pedaos de pelo ou at mesmo a minscula quantidade de DNA deixada em
uma impresso digital) so amplificadas para serem analisadas pelo mtodo
de fingerprinting. O PCR tambm rotineiramente utilizado em procedimentos cientficos
de Biologia Molecular como amplificao para gerar mutagnese, deteco de mutaes
ou preparao de fragmentos de DNA para clonagem (insero em plasmdeo, por
exemplo) como tambm pode ser utilizado para identificao de patgenos que esto
presentes em amostras como por a exemplo identificao de agentes como Cndida
sp, Chlamydia trachomatis, HPV Vrus do papiloma humano e seus gentipos, HIV Vrus
da Hepatite B. etc A PCR tambm utilizada na paleontologia para o sequenciamento
gnico de animais pr-histricos. Tambm muito utilizada na identificao de
microrganismos, tendo em vista que apenas 1% dos microrganismos so cultivaveis e
podendo ser isolados. A PCR o primeiro passo para o posterior sequenciamento. Aps
obter as sequencias geradas pelos equipamentos pode-se consultar bases de dados na
internet para tentar localizar suas possiveis origens, sendo bactrias, archeas ou etc.

16. A tcnica de PCR (polymerase chain reaction - reaco em cadeia pela

polimerase) baseia-se no processo de replicao de DNA que ocorre in vivo .
Durante o PCR so usadas elevadas temperaturas de forma a separar as molculas
de DNA em duas cadeias simples, permitindo ento a ligao de oligonucletidos
iniciadores (primers), tambm em cadeia simples e geralmente constitudos por 15
a 30 nucletidos, obtidos por sntese qumica. Para amplificar uma determinada
regio so necessrios dois iniciadores complementares das sequncias que
flanqueiam o fragmento de DNA a amplificar, nos seus terminais 3', de modo a
permitir a actuao da DNA polimerase durante a sntese da cadeia complementar,
usando como molde cada uma das duas cadeias simples constituintes do DNA a
amplificar.

22. Opor qu de uma das fitas ser chamada de lagging (lenta) e a

outra de leading (rpida):

Pelo fato da molcula de DNA ser formada por duas fitas que correm
em sentido antiparalelo, durante a abertura da forquilha de replicao,
um dos filamentos vai sendo aberto no sentido 5' 3' e o outro no
sentido 3' 5'. Assim, embora a progresso da sntese dessas duas
fitas acontea simultaneamente, a medida em que essa forquilha
extendida, em uma delas a DNA polimerase sempre ter uma
extremidade 3-OH livre para colocar o prximo nucleotdeo (a
fita leading). Na outra, de tempos em tempos, ser necessria a
sntese de um novo primer, para que ela possa continuar esse
processo (a fita lagging), conforme pode ser observado no esquema
abaixo:

Considerando o modelo de replicao nas bactrias, a sequncia

laranja representa o primer (RNA) sintetizado pela enzima primase e a
sequncia em azul representa a nova fita de DNA produzida pela DNA
polimerase III medida em que a molcula molde de DNA vai sendo
aberta. Observe que a direo de sntese da nova molcula de DNA
se d no sentido 5 3. Assim, na fita de cima a duplicao
continuar acontecendo de maneira contnua (a fita leading). Por outro
lado, na fita de baixo (a fita lagging), um novo primer dever ser
sintetizado mais frente.
23. O significado da existncia dos fragmentos de Okazaki:

Como vimos, um dos novos filamentos de DNA sintetizado

continuamente pela DNA polimerase III; o outro, precisa ser
sintetizado em partes. Fragmentos de Okazaki so justamente os
trechos curtos de primer + DNA (com cerca de 100 a 200
nucleotdeos, nos eucariotos) produzidos temporariamente na fita de
replicao descontnua.

Logo em seguida, os primers so removidos de ambas as fitas pela

DNA polimerase I (a seta em vermelho do esquema abaixo) que, ao
mesmo tempo, vai completando a sntese da fita de DNA no trecho
liberado. Por fim, os filamentos adjacentes de DNA so unidos via
ligao covalente pela DNA ligase (o tringulo amarelo que aparece
no esquema abaixo):

Um fragmento de Okazaki um relativamente pequeno fragmento de DNA (com um

primer de RNA no termino 5') criado na cadeia atrasada durante a replicao do ADN. Os
comprimentos dos fragmentos de Okazaki so entre 1.000 a 2.000 nucletidos de
comprimento em E. coli e entre 100 a 200 em eucariontes. Foram originalmente
descobertos por Reiji Okazaki, Tsuneko Okazaki, e colegas, enquanto estudavam a
replicao do ADN de bacterifagos em Escherichia coli.

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