DNA

O DNA composto por um grupo fostato, um acar

( desoxirribose) e quatro bases nitrogenadas: adenina, guanina,
citosina e timina.
Regras de Chargaff: a quantidade total de pirimidinas (T+C)
sempre igual quantidade total de purinas (A+G); a
quantidade de T sempre igual a de A e a quantidade de C
sempre igual a de G. Mas A+T nem sempre igual a G+C.
O DNA composto de duas cadeias lado a lado de nucleotdeos
torcidos na forma de dupla hlice que so mantidas juntas pelo
pareamento complementar de A com T e G com C.
A replicao do DNA semiconservativa.

A forquilha de replicao encontrada no DNA o local no qual a

dupla hlice desenrolada para produzir os dois filamentos que
serviro de molde.
A DNA polimerase (DNA pol) tem como atividades: polimerase
que catalisa o crescimento da cadeia no sentido 5-3;
exonuclease 3-5, que remove os pareamentos errados das
bases; e exonuclease 5-3, que degrada a dupla hlice de DNA.

A DNA pol III atua na forquilha de replicao, a zona onde a

dupla hlice est se desenrolando. Entretanto, como a DNA pol
sempre adiciona nucleotdeos na ponta 3, apenas uma das
fitas servir de molde para a replicao. Nesse filamento, a
sntese ocorre de maneira contnua, formando um filamento
contnuo.
A sntese do outro filamento tambm ocorre na ponta 3, mas
no sentido inverso da forquilha. Como a sntese deve ocorrer no
sentido da forquilha, a sntese contrria apresenta segmentos
 curtos: a polimerase sintetiza um segmento, e ento move-se
para a ponta 5, onde a forquila exps um novo molde. Esses
trechos so os fragmentos de Okazaki.

A polimerase precisa de um primer para iniciar a replicao.

Um primer uma cadeia curta de nucleotdeos que se liga ao
filamento molde para se iniciar a replicao. Primers so
sintetizados em primossomos, compostos por primases, uma
enzima que sintetiza um trecho curto de RNA complemenar a
uma regio especfica do cromossomo.
Na fita contnua, apenas um primer necessrio. J para os
fragmentos de Okazaki, para cada trecho necessrio um
primer diferente.
A DNA pol I remove os primers de RNA e substitui por DNA.
A DNA ligase junta a ponta 3 do DNA ponta 5 do fragmento
de Okazaki posterior, formando um fragmento descontnuo.

O desenrolamento do DNA ocorre graas a helicases e

topoisomerases. As helicases so enzimas que rompem as
pontes de hidrognio
que mantm os dois filamentos da dupla hlice juntos. A
helicase ajusta-se como uma rosca ao redor do DNA; dessa
posio, ela rapidamente desenrola a dupla hlice a frente da
sntese de DNA. O DNA desenrolado
estabilizado por protenas de ligao unifilamentares, que se
ligam ao DNA unifilamentar e impedem a reestruturao do
dupla hlice; As topoisomerases relaxam o DNA super-
helicoidizado quebrando um nico filamento de DNA ou ambos
os filamentos, o que permite que o DNA gire para uma
molcula relaxada. A topoisomerase 1 termina reunindo os
filamentos da molcula
de DNA agora relaxada.
Uma mquina molecular chamada replissomo faz a sntese de
DNA. Ela inclui duas unidades de DNA polimerase para fazer a
sntese em cada filamento e coordenar a atividade de protenas
 acessrias necessrias para o priming, deselicoidizao da
dupla helice e estabilizao dos filamentos isolados.
Os telmeros so estruturas especializadas, nas pontas dos
cromossomos, que contm repeties em tandem de uma
curta sequncia de DNA que adicionada a ponta 3' pela
enzima telomerase. Os telmeros estabilizam os cromossomos
evitando a perda de informao genmica aps cada rodada de
replicaco do DNA, e associando-se a protenas para formar
um revestimento que esconde" as pontas dos cromossomos
da maquinaria de reparo de DNA da clula.
RNA, transcrio e traduo

No DNA h trechos chamados exons, que expressam protenas,

e trechos chamados introns, que se intercalam entre os exons,
mas no se sabe ao certo a funo deles.
Transcrio o processo de sntese do RNA a partir do DNA.
A transferencia de informao de um gene para o produto
gnico ocorre em varias etapas. A primeira etapa copiar
(transcrever) a informao em um filamento de RNA com o uso
do DNA como um guia, ou molde. A transcrio e a traduo
so separadas espacialmente: a transcrio ocorre no ncleo e
a traduo no citoplasma.
As transcries de DNA e RNA ocorrem pelo pareamento de
bases complementares e a ligao de vrias protenas a stios
especficos no DNA ou RNA.
O RNA geralmente uma cadeia filamentar, o que o deixa mais
flexvel, podendo ter uma variedade de formas moleculares
maior do que o DNA. O RNA pode se dobrar de forma que as
suas bases podem se parear.
O RNA apresenta uma ribose como acar, ao invs de
desoxirribose. As ligaes acar-fosfato so feitas nas
posies 5 e 3 do acar, logo, uma cadeia de RNA ter uma
ponta 5 e uma 3.
Os nucleotdeos de RNA possuem as bases adenina, guanina e
citosina, mas a base timina substituida pela uracil.
O RNA pode catalizar reaes biolgias, mas o DNA no pode.
O RNA mensageiro (mRNA) atua como mensageiro, esse RNA
serve como intermedirio e passa a informao do DNA para as
protenas.
O RNA funcional no codifica a informao para fazer a
protena. Eles funcionam apenas como RNAs. As principais
classes contribuem para vrias etapas na transferncia da
informao do DNA-protena, no processamento de outros RNAs
e na regulao do RNA e dos nveis de protena na clula. As
principais classes so: RNA transportador (tRNA) que so
molculas responsveis por levar o aminocido correto para o
mRNA durante a traduo; e o RNA ribossmico (rRNA) que so
os principais componentes dos ribossomos, que guiam a
montagem das da cadeia de aminocidos pelo mRNA e pelo
tRNA.
 A primeira etapa a produo de um filamento de RNA cuja
sequncia complementar a do DNA.
A transcrio baseada na complementaridade de bases.
Considere a transcrio de um segmento cromossmico que
constitui um gene. Primeiro, os dois filamentos da dupla hlice
de DNA separam-se localmente, e um dos filamentos separado
atua como um molde para um sntese de RNA. No cromossomo
em geral, ambos os filamentos de DNA so usados como
moldes; mas em qualquer gene, apenas um filamento usado
e, nesse gene, sempre o mesmo filamento. Em seguida, os
ribonucleotdeos que foram quimicamente sintetizados em
outra parte da clula formam pares estveis com suas bases
complementares no molde. O ribonucleotdeo A faz par com T
no DNA, G com C, C com G e U com A. Cada ribonucleotdeo
posicionado em oposio a sua base complementar pela
enzima RNA polimerase, que se liga ao DNA e move-se ao
longo dele, unindo os ribonucleotdeos alinhados para fazer
uma molcula de RNA. Durante a sntese, o crescimento
sempre no sentido 5-3, ou seja, os nucleotdeos so
adicionados na ponta crescente 3. Como os filamentos so
complementares, o filamento completo orientado no sentido
3-5.
A medida que a RNA polimerase (RNA pol) se move, ela
desenrola a dupla hlice do DNA a frente e enrola o DNA
transcrito. A medida que a mlecula de RNA progressivamente
aumenta, a ponta 5 do RNA deslocada do molde e a bolha de
transcrio fecha-se atrs da polimerase. Vrias RNApol se
movem ao longo gene, cada uma sintetizando uma molcula
de RNA.
Como as sequncias so complementares, a sequncia do RNA
transcrito deve ser a mesma do filamento no molde de DNA,
exceto pela presena de timina que substituida pela uracil.
 Os promotores eucariticos se alinham a uma sequncia
chamada de TATA boxe, que se situa a 30 pares de bases do
incio do transcrio. A protena de ligao TATA se liga a esse
ponto, ocorre a atrao do cerne da RNApol para o promotor,
iniciando assim a transcrio.
Os promotores eucariticos so primeiro reconhecidos pelos
fatores gerais de transcrio (GTF). A funo dos GTF atrair o
cerne da RNA polimerase II de modo que ela e posicionada
para comear a sntese de RNA no stio de incio de transcrio.
O alongamento ocorre dentro da bolha de transcrio e a
sntese do RNA. O alongamento continua at que seja
reconhecida a sequncia AAUAAA ou AUUAAA perto da ponta
3 por uma enzima que corta a ponta do RNA
aproximadamente 20 bases depois. A essa ponta adicionada
a cauda poli A ( sinal de poliadenilao).
Durante a transcrio os ntrons so removidos e os xons
unidos ( splicing). Essa recomposio junta as regies
codificantes, de modo que o RNA contenha a sequncia
codificante que complementar a protena codificada.
O tRNA so os adaptadores do codon de 3 nucleotdeos no
mRNA ao aminocido correspondente, que levado pelo tRNA
ao ribossomo na traduo. Uma molcula de tRNA pode levar
um aminocido ao ribossomo para a traduo de qualquer
mRNA.
Os RNA ribossmcicos (rRNA) so um dos principais
componentes dos ribossomos, que so grandes complexos que
renem os aminocidos para formar protena cuja sequncia
codificada em um mRNA especfico. Os ribossomos so
 compostos por vrios tipos de RNA de protenas diferentes. Eles
tem uma funo geral, mas podem ser usados para traduzir
mRNA de qualquer gene codificante.
Uma protina uma cadeia de aminocidos (polipeptdeos).
Todos os aminiocidos (aa) possuem uma cadeia reativa. So
20 aa conhecidos nas protenas, cada uma tendo um grupo
reativo diferente. Os aa so unidos por ligaes peptdicas pela
unio de um grupo amina com um carboxila, liberando gua
durante a reao.
Colinearidade: A sequncia linear dos nucleotdeos em um
gene determina a sequncia linear de aminocidos em uma
protena.
Os codons so uma sequncia de trs bases nitrogenadas
consecutivas do mRNA, que funciona como uma unidade
gentica de codificao, especificando um aminocido
particular durante a sntese de protena de uma clula.
So 20 aminocidos diferentes sintetizados por 61 codons, os
outros 3 codons restantes so codons de parada (totalizando
64 codons). Esse codon sinaliza que a protina j est
completa e est na hora de parar a traduo.
Cada aa se liga a um tRNA especfico que leva o aa para o
ribossomo e assim formar a protena.
A ala do meio de cada tRNA chamada de ala de anticodon
porque leva uma trinca de nucleotdeos complementar ao
codon para o aa especfico daquele tRNA (anticodon).
Os aa so ligados ao tRNA por enzimas chamadas de
aminoacil-tRNA sintetases. Existem 20 enzimas para cada um
dos 20 aa. O tRNA com um aa ligado dito carregado.

O cdigo gentico dito como redundante porque, em muitos

casos, mais de um codon e atribudo a um nico aa; alm
disso, vrios codons podem parear com mais de um anticodon
(oscilao).
 A sntese de protenas ocorre quando o tRNA e as molculas de
mRNA se associam aos ribossomos. A tarefa dos tRNAs e dos
ribossomos traduzir a sequncia de codons de nucleotdeos
em um mRNA em uma sequncia de aa na protena.
O ribossomo constitudo de uma subunidade pequena (40S) e
uma grande (70S), cada uma feita de RNA ribossmico (rRNA).
As molculas de tRNA e mRNA se posicionam no ribossomo de
modo que o codon do mRNA possa interagir com o anticodon
do tRNA.
Duas regies do ribossomo so crticas para a sntese de
protenas, o centro decodificador na subunidade 40S, que
garante que apenas os tRNAa levando antocodons que se
ajustam aos codons sero aceitos no stio A. E o centro de
peptidiltransferase na subunidade 70S, onde a formao da
ligao peptdica catalisada.
O processo de traduo pode ser dividido em 3 fases:
a) Incio: a principal tarefa colocar o primeiro aminoacil-tRNA
no stio P do ribossomo e desse modo estabelecer a leitura
correta. O primeiro aa sintetizado sempre a metionina
(AUG), ele inserido por um tRNA iniciador. Uma vez no
citoplasma, o mRNA expe o codon iniciador (AUG) que se
liga a subunidade 40S. Uma vez no lugar, o complexo se
move no sentido 5-3 e deserola as regies com
pareamento de base. Ao mesmo tempo, a sequncia
exposta percorrida a procura de um codon AUG onde
possa comear a traduo. Aps o codon AUG ser alinhhado
ao tRNA, esse complexo se liga a subunidade 60S,
formando o ribossomo completo (80S).
b) Alongamento

c) Trmino: o ciclo continua at o codon no stio A ser um dos

3 codons de terminao: UGA, UAA ou UAG. O que faz com
uma molcula de gua entre no centro peptidiltransferase,
e sua presena leva a liberao do polipeptdeo do stio P e
a separao das subunidades ribossmicas.
Em sua maioria, as protenas so inativas, a menos que
modificaes aps a traduo ocorra. Alguns eventos ps-
traducionais, tais como a fosforilao ou ubiquitinizao,
modificam grupos laterais de aminocidos, promovendo assim
ativao ou degradao, respectivamente. Outros mecanismos
ps-traducionais reconhecem determinados aminocidos em
uma sequncia de protenas e direcionam essas protenas para
locais onde sua atividade e necessria dentro e fora da clula.