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Artigos ConclusodoGenomaCncerpropereavaliaoestratgica
Geneticistasdebatemnovofocodepesquisasobrecncer

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PorHeidiLedfordeRevistaNature

UmimensotrabalhodosEstadosUnidosparaproduziroperfilde10miltumoreschegou
oficialmenteaofim.Iniciadoem2006comumoramentodeUS$100milhes,oAtlasdo
Genoma do Cncer (TCGA, em ingls) se tornou o maior componente do Consrcio
Internacional do Genoma do Cncer, uma colaborao de cientistas de 16 naes que
descobriramquase10milhesdemutaesrelacionadasaocncer.

Aperguntaoquefazeraseguir.Algunspesquisadoresqueremcontinuaraseconcentrar
no sequenciamento outros preferem expandir seu trabalho para explorar como as
mutaes que foram identificadas influenciam o desenvolvimento e a progresso do
cncer.

O TCGA deveria ser finalizado e considerado uma vitria, declara Bruce Stillman,
presidente do Laboratrio Cold Spring Harbor, em Nova York. Sempre encontraremos
novasmutaesassociadasaumtipoespecficodecncer.Apergunta:qualarelao

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decustobenefcio?.

Stillmanfoiumdosprimeirosdefensoresdoprojeto,mesmoquandoalgunspesquisadores
temiamqueelepudesseafastarrecursosdefinanciamentosindividuais.OAtlascomeou
comoumprojetodetrsanos,efoiestendidopormaiscincoanos.Em2009,elerecebeu
US$100 milhes adicionais dos Institutos Nacionais da Sade, alm de US$175 milhes
emestmulodepesquisaquedeveriamaceleraraeconomiadosEstadosUnidosdurantea
recessoeconmicaglobal.

O projeto teve dificuldades no comeo. Naquele momento, a tecnologia de

sequenciamento s trabalhava com tecidos moles que haviam sido rapidamente
congelados. Mesmo assim, a maioria das bipsias clnicas so fixadas em parafina e
marcadasparaseremexaminadasporpatologistas.Encontrarecustearamostrasfrescas
detecidosetornouamaiorfontedegastosdoprograma,explicaLouisStaudt,diretordo
EscritrioparaaGenmicadoCncerdoInstitutoNacionaldoCncer(NCI)emBethesda,
noestadodeMaryland.

Outro problema foi a complexidade dos dados. Ainda que alguns indutores [tambm
identificadoscomodrivers]sedestacassemcomocontribuintesparaodesenvolvimentodo
cncer, a maioria das mutaes formava uma confusa mistura de anomalias genticas,
com pouco em comum entre tumores. Testes de drogas que visavam os drivers logo
revelaram outro problema: cnceres costumam desenvolver resistncia rapidamente,
normalmente ativando genes diferentes driblar qualquer processo celular bloqueado pelo
tratamento.
Quase todos os aspectos da pesquisa do cncer se beneficiaram com o Atlas do
GenomadoCncer(TCGA),anunciaBertVogelstein,geneticistadocncer.Agorao
Apesardessasdificuldades,quasetodososaspectosdapesquisadocncersebeneficiaram momentodeavaliarperspectivaseestratgiasdepesquisasnarea
doTCGA,observaBertVogelstein,geneticistadocncerdaJohnsHopkinsUniversityem
Baltimore, Maryland. Os dados produziram novas maneiras de classificar tumores e
apontaram alvos e carcingenos anteriormente desconhecidos. Mas alguns pesquisadores acreditam que o sequenciamento ainda tem muito a oferecer. Em
janeiro, uma anlise estatstica de dados de mutao para 21 cnceres mostrou que o sequenciamento ainda tem o potencial de encontrar mutaes
clinicamenteteis.

Em2dedezembro,StaudtanunciouquequandooTCGAforcompletado,oNCIcontinuarosequenciamentointensivodetumoresdetrscnceres:ovariano,
coloretaleadenocarcinomadepulmo.Eleentoplanejaavaliarosfrutosdessetrabalhoextraantesdedecidirsequeradicionaroutroscnceres.

Escopoexpandido

Dessa vez, porm, os estudos sero capazes de incorporar informaes clnicas detalhadas sobre a sade do paciente, histrico de tratamento e resposta a
terapias.Comoagorapesquisadoresconseguemusaramostrasfixadasemparafina,elespodemaproveitardadosdeexamesclnicosanteriores,eestudarcomo
mutaes afetam o prognstico de um paciente e sua resposta ao tratamento. Staudt declara que o NCI anunciar um pedido de propostas para sequenciar
amostrastomadasduranteexamesclnicosusandoosmtodoserotasdeanliseestabelecidospeloTCGA.

OrestodoConsrcioInternacionaldoGenomadoCncer,quedevedivulgarplanosiniciaisparaumasegundaondadeprojetosemfevereiro,provavelmente
usarumaabordagemsemelhante,explicaseucofundadorTomHudson,presidentedoInstitutoparaaPesquisadoCncerdeOntarioemToronto,noCanad.
Aideiadeencontrarsequnciasquefaamumtumorresponderaterapiasjfoiadotadaporfinanciadoresdogovernoemvriospasesansiososparareduzir
custosdesade,explicaele.Terapiasdecncersomuitocaras.Entonossaprioridadedescobrirquaispacientesresponderiamaummedicamentocaro.

ONCItambmestapoiandoacriaodeumrepositrioparadadosnoapenasdeseusprpriosprojetos,mastambmdetrabalhosinternacionais.Issodeve
levar o acesso a dados e ferramentas de anlise para um maior nmero de pesquisadores, explica Staudt. No momento, os dados da genmica do cncer
constituemcercade20petabytes,esotograndesedifceisdeadministrarqueapenasinstituiescomumacapacidadecomputacionalconsidervelpodem
acesslos.Mesmoassim,seusimplesdownloadpodelevarmeses.

Staudtadmitequenopossveldependerdofinanciamentodeestmuloparaabasteceressesplanos.Masumsequenciamentomaisacessveleacapacidadede

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usarbipsiasarmazenadasembancosbiolgicosdevemreduzirseucusto,observaele.Agenmicaestnocentrodegrandepartedoquefazemosnapesquisa
docncer,explicaele.Agorapodemosformularperguntasmaisespecficas.

Esteartigofoireproduzidocompermissoefoipublicadopelaprimeiravezem5dejaneirode2015.

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