Licenciatura em Cincias Exatas Biologia IV - Roteiro de estudos Fundamentos de Bioqumica

Universidade de So Paulo USP

Instituto de Fsica de So Carlos IFSC
Licenciatura em Cincias Exatas

Roteiro de estudos

Fundamentos de Bioqumica
2013

Professora Ilana L. B. C. Camargo

Aluna PAE: Mariana Laureano
marianalaureano@gmail.com
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1 A clula e seus componentes

As clulas so as menores unidades estruturais e funcionais de todos os organismos vivos. So
capazes, embora limitadamente, de manter as funes bsicas para a sobrevivncia de um
organismo.

Os organismos vivos so divididos basicamente por dois tipos de clulas: clulas procariotas,
que carregam sua informao funcional num genoma circular sem um ncleo definido, e as
clulas eucariotas que contem um ncleo delimitado, seu genoma possui cromossomos
individuais, e sua estrutura interna bem organizada.

Toda clula possui membrana plasmtica que uma membrana seletivamente permevel. Ela
permite que os sais e nutrientes necessrios entrem na clula e que os produtos de excreo
saiam, mas usualmente exclui a entrada de substncias no necessrias do ambiente. Dentro
de toda clula h o citoplasma, onde ocorre a maioria das reaes catalisadas por enzimas do
metabolismo celular. As clulas usam a energia qumica para realizar o trabalho de construo
e manuteno da sua estrutura e para realizar a movimentao e a contrao celular. Tambm
presentes no citoplasma de todas as clulas esto os ribossomos, pequenos grnulos que
atuam na sntese de protenas. Todas as clulas possuem ainda um ncleo onde o material
gentico replicado e armazenado na forma de cido desoxirribonucleico (DNA).

Entre as clulas procariticas a melhor estudada da Escherichia coli, que est representada
na figura abaixo.

A Clulas eucariticas

A clula eucaritica consiste de citoplasma e ncleo que esto delimitados pela membrana
plasmtica. O citoplasma contem um sistema complexo de membranas internas que formam
as estruturas celulares (organelas). As principais organelas so a mitocndria (nas quais
ocorrem importantes reaes qumicas liberadoras de energia), o retculo endoplasmtico
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(uma srie de membranas onde as glicoprotenas e os lipdeos so formados), o complexo de

Golgi (para determinadas funes de transporte) e os peroxissomos (formao e degradao
de algumas substncias). Clulas eucariticas contm lisossomos, onde numerosas protenas,
cidos nucleicos e lipdeos so degradados. Os centrolos, pequenas partculas cilndricas, so
responsveis pela formao dos microtbulos, nas fases de diviso celular. Os ribossomos so
os responsveis pela sntese de protenas.

B Ncleo celular

Na clula eucaritica a informao gentica est contida dentro de um ncleo que

delimitado pela membrana nuclear. Esta membrana contem poros (poros nucleares) que so
responsveis pelo transporte de substancias entre o ncleo e o citoplasma. O ncleo contem o
nuclolo e a matriz fibrosa com diferentes complexos DNA-protena.

C Membrana plasmtica

O ambiente celular quer seja sangue ou outros fludos corporais, aquoso, e os processos
qumicos no interior da clula envolvem molculas hidrossolveis. Para a manuteno da sua
integridade, as clulas devem impedir a gua e outras molculas de flurem
descontroladamente para dentro ou para fora da clula. Isso realizado por uma membrana
hidrorresistente composta de molculas bipartidas de cidos graxos, a membrana plasmtica.
Tais molculas so fosfolipdios dispostos em uma camada dupla (bicamada) com sua parte
interna lipdica. A prpria membrana plasmtica contem diversas molculas que atravessam a
camada biomolecular lipdica uma ou mais vezes para desempenhar funes especiais.
Diferentes de tipos de protenas de membrana podem ser distinguidos:

(i) Protena transmembrana utilizada como canais para o transporte de molculas de

dentro para fora da clula.
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(ii) Protenas interligadas para fornecer estabilidade.

(iii) Molculas receptoras envolvidas na transduo de sinal
(iv) Molculas com funes enzimticas para catlise interna de reaes qumicas em
resposta ao sinal externo.

D Comparao entre clula animal e vegetal

Clulas de animais e plantas tm vrias caractersticas similares. A diferena fundamental

que a clula de plantas contem cloroplastos para a fotossntese e so envoltas por uma rgida
camada de celulose e outras molculas polimricas. Essas clulas tambm possuem vacolos
para gua, ons, acar, compostos contendo nitrognio ou descartes. Vacolos so
permeveis gua, mas no a outras substncias.
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2 Ligaes qumicas

Ligaes inicas: so formadas por ganho e perda de eltrons. Por exemplo, o sdio (Na) doa
um eltron para o tomo de cloro (Cl). O casamento entre o sdio, um metal de alta
reatividade, com o cloro, um gs verde txico, o sal de cozinha (NaCl).

Cloreto de sdio (NaCl)

Ligao covalente: so formadas pelo compartilhamento de eltrons. Por exemplo, temos a

molcula de gua, amnia, dixido de carbono e a molcula de metano.

Exemplos de ligaes covalentes

Ligaes de hidrognio: um tipo de interao intermolecular que confere certa estabilidade

nas ligaes com tomos de alta eletronegatividade (F, O, N).
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Representao de ligaes de hidrognio

Interaes hidrofbicas: Ocorrem entre molculas hidrofbicas que buscam interagir

entre si, evitando assim, o contato com a gua quando possvel.

3 Grupos funcionais
Uma clula viva basicamente composta de carbono (C), hidrognio (H), nitrognio (N) e
oxignio (O), quase que na seguinte distribuio: 50% de tomos de hidrognio, 25% de
carbono e 25% oxignio. Exceto a gua, quase todos os componentes so compostos de
carbono.

O carbono um pequeno tomo com quatro eltrons em sua ltima camada, podendo formar
quatro fortes ligaes covalentes com outros tomos. Porm, mais notavelmente, os tomos
de carbono podem combinar-se entre si para construir cadeias e anis e, dessa maneira,
grandes molculas complexas com propriedades biolgicas especficas.

Os grupos funcionais determinam as propriedades qumicas das molculas. Entre os principais

grupos funcionais temos lcool, amina, aldedo, cetona e os cidos carboxlicos.

A - Compostos de hidrognio, oxignio e carbono

Quatro simples combinaes entre esses tomos ocorrem frequentemente em molculas

biologicamente importantes: grupo hidroxila (-OH; alcois), metila (-CH3), carboxila (-COOH) e
carbonila (C=O; aldedos e cetonas). Eles conferem as molculas propriedades qumicas
caractersticas, inclusive possibilidades para formarem compostos.
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B - cido e steres

Muitas substncias biolgicas contem uma ligao carbono-oxignio com propriedades cidas
ou bsicas (alcalinas). O grau de acidez expresso pelo valor do pH, o qual indica a
concentrao de ons de H+ na soluo, variando de 10-1 mol/L ( pH = 1, extremamente cido)
at 10-14 mol/L (extremamente bsico). A gua pura contem 10-7 mol/L de H+ (pH 7,0). Um
ster formado quando um cido reage com um lcool. steres so frequentemente
encontrados em lipdeos e compostos de fosfatos.

C - Ligaes carbono-nitrognio (C-N)

Ligaes entre carbono e nitrognio ocorrem em muitas molculas biologicamente

importantes: grupos amino, aminas e amidas, especialmente em protenas. As amidas so
formadas pela combinao de um cido e de uma amina. Diferentemente das aminas, as
amidas no possuem carga quando em gua. A ligao peptdica que liga dois aminocidos nas
protenas serve como um dos exemplos. Um cido carboxlico reage com uma amina,
formando uma amida (aminocido) e liberando gua.

cido carboxlico Amina Amida (Aminocido)

Ligao peptdica
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Os aminocidos, que so as subunidades das protenas tem importncia fundamental. Todas as

protenas tem um papel especfico no funcionamento de um organismo.

D - Compostos de fosfato

Os compostos fosfticos ionizados desempenham um papel biolgico essencial. O grupo

HPO42- um on fosfato inorgnico estvel oriundo do acido fosfrico (H3PO4) ionizado.
Normalmente ele representado por Pi.

Grupo fosfato
Entre um on fosfato e um grupo hidroxila livre pode-se formar um ster fosftico.
Frequentemente os grupos fosfato so ligados a protenas deste modo.

Forma
ster fosftico abreviada

A combinao de dois grupos fosfato d origem a um grupo difosfato.

Formao de um grupo difosfato

Os compostos fosfticos desempenham um papel importante em molculas ricas em energia e
vrias macromolculas que podem armazenar energia.

E - Compostos de enxofre
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Muitas vezes o enxofre serve para ligar molculas biolgicas, especialmente quando dois
grupos sulfidrilas (-SH) reagem para formar uma ponte de sulfeto (-S-S-). O enxofre o
componente de dois aminocidos (cistena e metionina) e de alguns polissacardeos e
acares. As pontes de sulfeto desempenham papel em muitas molculas complexas, servindo
para estabilizar e manter as estruturas tridimensionais especficas.

Grupo sulfdrila Ponte dissulfeto

4 Carboidratos

So substncias biorgnicas encontradas em sistemas biolgicos e possuem diversas funes,

como componentes estruturais essenciais das clulas, tambm atuam como stios de
reconhecimento da superfcie da clula e servem como principal fonte de energia metablica.

Carboidratos

Monossacardeos Oligossacardeos Polissacardeos

Hexoses (Amido(amilose e
Pentoses Dissacardeos
(Glicose amilopectina)
(Ribose (Maltose
Galactose Glicognio,
Desoxirribose) Lactose)
Frutose) Celulose)
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A - Monossacardeos

Os monossacardeos (acares simples) so aldedos (-C=O, -H) ou cetonas (>C=O) com dois ou
mais grupos hidroxilas [frmula geral (CH2O)n]. O grupo aldedo ou cetona pode reagir como
um dos grupos hidroxilas para formar um anel. Essa a configurao usual dos acares que
tm cinco ou seis tomos de carbono (C) (pentoses e hexoses). Os tomos C so numerados.
As formas D- e L- de acares so ismeros especulares da mesma molcula.

As formas que ocorrem naturalmente so as D-(dextro) formas. Estas incluem, adicionalmente,

as formas e como estereoismeros. Nas formas cclicas, os tomos C dos acares no
esto em um plano, mas tridimensionalmente tomam a forma de uma cadeira ou de um barco.
A configurao -D-glicopiranose (glicose) favorecida energeticamente, j que todas as
posies axiais so ocupadas por tomos H. O arranjo dos grupos OH pode diferir, de modo a
se formarem estereoismeros como a manose ou a galactose.

As formas e da glicose diferem pela configurao no carbono anomrico

-D-glicose -D-glicose
estereoismeros

Glicose
Conformao tipo
Ismeros da glicose
cadeira

B - Dissacardeos

Os dissacardeos so formados pela unio de dois monossacardeos, e seus representantes

mais conhecidos so a sacarose e a lactose. Os dissacardeos so solveis em gua.

Sacarose: formado por uma molcula de glicose e uma molcula de frutose.

A sacarose o acar que consumimos em casa, que usamos em nosso caf, sucos,
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doce. Esse carboidrato pode ser encontrado principalmente na cana-de-acar e na

beterraba.
Lactose: formado por uma molcula de glicose e uma molcula de galactose.
o acar encontrado no leite, e a principal fonte de energia para o beb durante a
amamentao.

C - Derivados de acares

Quando determinados grupos hidroxilas so substitudos por outros, formam-se os derivados

de acar. Estes ocorrem especialmente em polissacardeos. EM um grande grupo de
sndromes determinadas geneticamente, os polissacardeos complexos no podem ser
degradados, devido funo enzimtica reduzida ou ausente (mucopolissacardeos,
mucolipidoses). Exemplos dos derivados de acares so o cido glicurnico, glicosamina e a
N-acetilglicosamina.
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Oxidao no carbono
C6 da glicose cido
glicurnico
Hidroxila no carbono
C2 substituda por
amina glicosamina
-D-glicose

Responsvel pelo mecanismo

de desintoxicao da clula N-acetil-
quando se conjuga com a Construo de
cartilagem; Glicosamina
bilirrubina
Lubrificao das
articulaes

D Polissacardeos

Os polissacardeos so formados pela unio de centenas, e at mesmo milhares, de

monossacardeos e no so solveis em gua. Os exemplos mais conhecidos
de polissacardeos so:

Amido: principal fonte de energia em nossa alimentao. As plantas utilizam o amido

como reserva de energia, e por isso podemos encontr-lo no interior de caules, mas
principalmente nas razes, tubrculos e sementes.
Celulose: a celulose o principal componente da parede celular dos vegetais.
Quitina: principal constituinte do exoesqueleto (esqueleto externo) dos artrpodes,
como os insetos, aracndeos, crustceos.

Exemplos de distrbios humanos hereditrios no metabolismo de carboidratos

Diabete melito: um grupo heterogneo de distrbios caracterizado por elevados nveis

sanguneos de glicose, com aspectos genticos e clnicos complexos.

Distrbios do metabolismo da frutose: so conhecidos trs distrbios hereditrios: frutosria

benigna, intolerncia hereditria frutose com hipoglicemia e vmitos e deficincia
hereditria de frutose 1,6-bifosfato com hipoglicemia, apneia, acidose lctica e
frequentemente, resultado letal em recm-nascidos.

Doenas do armazenamento do glicognio: um grupo de distrbios do metabolismo do

glicognio que diferem em sintomas clnicos e nos genes e nas enzimas envolvidos.

Metabolismo da galactose: trs distrbios hereditrios diferentes, com toxicidade aguda e

efeitos a longo prazo.
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5 Lipdios

Os lipdeos geralmente ocorrem como grandes molculas (macromolculas). So componentes

essenciais das membranas e precursores de outras importantes biomolculas, tais como os
esteroides para a formao de hormnios e outras molculas para transmitir os sinais
intercelulares. Alm dos cidos graxos, os compostos com carboidratos (glicolipdeos), grupos
fosfatos (fosfolipdeos) e outras molculas so especialmente importantes. Uma caracterstica
especial sua acentuada polaridade, com uma regio hidroflica (que atrai gua) e outra
hidrofbica (que repele a gua). Isso torna os lipdeos especialmente adequados para
constituir os limites os limites externos da clula (membrana celular).

A cidos graxos

Os cidos graxos so compostos de uma cadeia de hidrocarbonetos com um grupo cido

carboxlico terminal. Assim, so polares, com uma extremidade hidroflica (-COOH) e
outra hidrofbica (-CH3), e diferem no comprimento da cadeia e seu grau de saturao.
Quando ocorrem uma ou mais ligaes duplas na cadeia, o cido graxo classificado como
insaturado. Uma ligao dupla torna a cadeia relativamente rgida e causa uma toro. Os
cidos graxos formam a estrutura bsica de muitas macromolculas importantes. O grupo
carboxila livre (-COOH) de um cido graxo PE ionizado (-COO-).

Hidroflico

Hidrofbico

cido graxo saturado cido graxo insaturado

Slidos a temperatura ambiente gordura Lquidos a temperatura ambiente leos

animal/tecido adiposo vegetais/sementes (amndoa, castanha)

A margarina de origem vegetal, mas sofre hidrognao, e por isso saturada.

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B Lipdeos

Os cidos graxos podem combinar-se com outros grupos de molculas para formar outros
tipos de lipdeos. Como molculas insolveis em gua (hidrofbicas), so solveis apenas em
solventes orgnicos. O grupo carboxila pode entrar em uma ligao de um ster ou de uma
amida. Os triglicerdeos so compostos cidos graxos com glicerol.

Os glicolipdeos (lipdeos com resduos de acar) e os fosfolipdeos (lipdeos com um grupo

fosfato ligado a um derivado de lcool) so as bases estruturais de importantes
macromolculas. Sua degradao intracelular exige a presena de vrias enzimas, cujos
distrbios tm uma base gentica e levam a numerosas doenas determinadas geneticamente.

Os esfingolipdeos constituem um notvel grupo de molculas nas membranas biolgicas.

Nestas, a esfingosina, em vez do glicerol, a molcula de ligao com o cido graxo. A
esfingomielina e os gangliosdeos contm esfingosina. Os gangliosdeos perfazem 6% dos
lipdeos do sistema nervoso central. So degradados por uma srie de enzimas. Distrbios
geneticamente determinados de seu catabolismo acarretam graves doenas, como por
exemplo, a doena de Tay-Sachs, devida degradao defeituosa do gangliosdeo GM2
(deficincia de -N-acetil-hexosaminidase).

Glicerol pode se
ligar a cidos
graxos para
formar
triglicerdios

Triglicerdios

Encontram-se na forma de gordura na alimentao que consumimos.

Circulam em nossa corrente sangunea e se armazenam no tecido adiposo.

Um nvel alto de triglicerdeo pode causar inmeros problemas de sade, incluindo o

desenvolvimento de pancreatite e doenas do corao.
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acar

glicerol cido graxo

Glicolipdio
Esto presentes na hidrofbico
membrana plasmtica
Esto presentes
nas membranas
das clulas e em
Fosfolipdio lipoprotenas
plasmticas

C Agregados lipdicos

Dadas as suas propriedades bipolares, os cidos graxos podem formar agregrados lipdicos na
gua. As extremidades hidroflicas so atradas ao seu ambiente aquoso; as extremidades
hidrofbicas projetam-se da superfcie da gua e formam uma pelcula superficial. Se
estiverem completamente abaixo da superfcie, podem formar membranas com duas camadas
(membrana lipdica biomolecular ou bicamada). Estes so os elementos estruturais bsicos das
membranas celulares, os quais impedem que as molculas da soluo aquosa circundante
invadam a clula.
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Agregados lipdicos

Grandes agregados
unidos por foras
hidrofbicas

Membrana plasmtica
em duas camadas
(bicamada fosfolipdica)

D Outros lipdeos: esterides

Os esterides so pequenas molculas que consistem em quatro diferentes anis de tomos

de carbono. O colesterol o precursor das cinco principais classes de hormnios esteroides:
prostgenos, glicocorticoides, mineralocorticoides, andrgenos e estrgenos. Cada uma dessas
classes hormonais responsvel por importantes funes biolgicas, tais como manuteno
da gravidez, metabolismo das gorduras e das protenas, manuteno do volume e da presso
sanguneos e desenvolvimento das caractersticas sexuais.
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Outros lipdios: esteroides

Colesterol

Derivados de colesterol

Testosterona Estradiol

Exemplos de distrbios humanos hereditrios no metabolismo lipdico e lipoprotico:

Hipercolesterolemia familiar, a deficincia de lpase lipoproteica familiar, a
disbetalipoproteinemia e os distrbios da lipoprotena de alta densidade (LDL).

6 Aminocidos
Os aminocidos so as unidades estruturais bsicas das protenas. Uma sequncia linear
definida dos aminocidos e uma estrutura tridimensional especfica atribuem propriedades
fsico-qumicas a cada protena. Um aminocido consiste em um carbono central com uma
ligao a um grupo amino (-NH2), outra a um grupo carboxila (-COOH), a terceira a um tomo
de hidrognio e a quarta a uma cadeia lateral varivel. Os aminocidos so ionizados em
solues neutras, uma vez que o grupo amino adquire um prton (-NH3+) e o grupo carboxila
dissocia-se (-COO-). A cadeia lateral determina as caractersticas distintas de um aminocido,
incluindo tamanho, forma, carga eltrica ou capacidade de ligao com o hidrognio e a
reatividade qumica especfica total. Os aminocidos podem ser diferenciados conforme sejam
neutros ou no neutros (bsicos ou cidos) e possuam uma cadeia lateral polar ou no polar.
Cada aminocido tem suas prprias abreviaturas de trs letras e de uma letra. Os aminocidos
essenciais em vertebrados so: His, Ile, Leu, Lis, Met, Fen, Ter, Tir e Val.
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Estrutura geral dos aminocidos

A Aminocidos so classificados de acordo com sua cadeia lateral

Todos os aminocidos neutros tm um grupo COO- e um grupo -NH3+. Os aminocidos mais

simples apresentam uma cadeia lateral aliftica (ou acclica) simples. Para a glicina, esta
consiste meramente em um tomo de hidrognio (-H); para a alanina, em um grupo metila (-
CH3). Cadeias laterais maiores ocorrem na valina, na leucina e na isoleucina. Tais cadeias so
hidrofbicas (hidrorrepelentes) e tornam seus respectivos aminocidos menos solveis em
gua que as cadeias hidroflicas (com afinidade pela gua). A prolina tem uma cadeia lateral
aliftica que, diferentemente do que se observa em outros aminocidos, sua cadeia lateral
est ligada tanto ao carbono central quanto ao grupo amino, de modo que se forma uma
estrutura em anel. Cadeias laterais aromticas (ou cclicas) ocorrem na fenilalanina (um grupo
fenil ligado ao carbono central por meio de um grupo metileno CH2) e no triptofano (um
anel indol ligado ao carbono central por meio de um grupo metileno). Esses aminocidos so
muito hidrofbicos. Dois aminocidos contm tomos de enxofre (S). Na cistena, este est sob
a forma de um grupo sulfidrila (-SH); na metionina, um tioster (-S-CH3). Ambas so
hidrofbicas. Na cistena, o grupo silfidrila muito reatico e participa da formao de pontes
de sulfeto (-S-S). Tais ligaes desempenham um importante papel na estabilizao da forma
tridimensional das protenas.

A serina, a treonina e a tirosina contm grupos hidroxilas (-OH). Assim, so formas hidrolisadas
de glicina, alanina e fenilalanina, respectivamente. Os grupos hidroxilas as tornam hidroflicas
e mais reativas do que as formas no hidrolisadas. Tanto a asparagina como a glutamina
contm um grupo amino e um grupo amida. No pH fisiolgico, suas cadeias laterais
apresentam carga negativa.

Os aminocidos carregados tm dois grupos amino ionizados (bsico) ou dois grupos carboxilas
ionizados (cidos). Os aminocidos bsicos (de carga positiva) so a arginina, a lisina e a
histidina. A histidina tem um anel imidazol e pode ser de carga negativa ou positiva,
dependendo do meio. Ela frequentemente encontrada nos centros reativos das protenas,
onde toma parte em ligaes alternantes (por exemplo, na regio da hemoglobina que se liga
ao oxignio). O cido asprtico e o cido glutmico tm, cada um, dois grupos carboxilas (-
COOH) e so, assim (via de regra), cidicos.
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Sete dos 20 aminocidos tm cadeias laterais fracamente ionizveis, tornando-os bastante

reativos (Asn, Glu, His, Cis, Tir, Lis, Arg).

Exemplos de distrbios humanos hereditrios no metabolismo dos aminocidos

Os aminocidos glicina, fenilalanina, tirosina, histidina, prolina e lisina e os aminocidos de

cadeia ramificada valina, leucina e isoleucina esto predominantemente envolvidos em vrios
distrbios que acarretam sintomas metablicos txicos, decorrentes de um aumento ou de
uma diminuio de sua concentrao plasmtica.

Fenilcetonria: os distrbios da hidroxilao da fenilalanina resultam em sinais clnicos

variveis, dependendo da gravidade, causados por um espectro de mutaes no gene
responsvel.

Doena de urina em xarope de bordo: um distrbio varivel devido deficincia da

desidrogenase do -cetocido de cadeia ramificada, que acarreta o acmulo de valina, leucina
e isoleucina. A forma grave clssica resulta em srios danos neurolgicos crianas.

Apolares (hidrofbicos), grupo R aliftico

Glicina Alanina Prolina Valina

Gln (G) Ala (A) Pro (P) Val (V)

Leucina Isoleucina Metionina

Leu (L) Ile (I) Met (M)
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Grupo R aromtico

Fenilalanina Tirosina Triptofano

Phe (F) Tyr (Y) Trp (W)

Polares (hidroflicos) sem carga

Serina Treonina Cistena

Ser (S) Thr (T) Cys (C)

Asparagina Glutamina
Asn (N) Gln (Q)
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Grupo R carregado positivamente

Histidina
His (H)
Arginina
Arg (R) Lisina
Lys (K)

Grupo R carregado positivamente

Histidina
His (H)
Arginina
Arg (R) Lisina
Lys (K)
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7 Protenas
As protenas esto envolvidas em praticamente todos os processos qumicos dos organismos
vivos. Sua significncia evidente, visto que, como enzimas digerem as reaes qumicas nas
clulas vivas. Sem a catlise enzimtica, as macromolculas envolvidas no reagiriam
espontaneamente. Todas as enzimas so produtos de um ou mais genes. As protenas tambm
servem para transportar pequenas molculas, ons ou metais. Elas exercem importantes
funes na diviso celular, durante o crescimento, e na diferenciao das clulas e tecidos.
Controlam a coordenao de movimentos por meia da regulao das clulas musculares e da
produo e da transmisso de impulsos dentro das clulas nervosas e entre elas. As protenas
controlam a homeostase (coagulao sangunea) e a defesa imune. Realizam, ainda, funes
mecnicas na pele, nos ossos, nos vasos sanguneos e em outras reas.

A Ligaes peptdicas

As unidades essenciais das protenas, os aminocidos, podem ser mantidas juntas facilmente
devido sua ionizao dipolar (zwitterons). O grupo carboxila de um aminocido liga-se ao
grupo amino do adjacente (uma ligao peptdica, s vezes tambm referida como ligao
amdica). Quando muitos aminocidos so unidos por ligaes peptdicas, forma-se uma
cadeia polipeptdica. Cada cadeia polipeptdica tem um sentido definido, determinado pelo
grupo amino (-NH2) em uma extremidade e pelo grupo carboxila (-COOH) na outra. Por
conveno, o grupo amino representa o inicio, e o grupo carboxila, o trmino da cadeia
polipeptdica.

Ligao peptdica

Aminocido 1 Aminocido 2 Formao de um peptdeo

B Estrutura primria de uma protena

A determinao da estrutura da insulina por Frederick Sanger foi um fato marcante. Mostrou,
pela primeira vez, que uma protena, em termos genticos um produto gnico, tem uma
sequncia de aminocidos precisamente definida. A sequncia de aminocidos fornece
informaes importantes sobre a funo e a origem evolutiva de uma protena.

A estrutura primria de uma protena sua sequncia de aminocidos em um plano

unidimensional.
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Estrutura
Primria Estrutura
Quaternria

Estrutura Estrutura
Secundria Terciria

-hlice

Resduos de Cadeia polipeptdica Subunidades

aminocidos proticas

Nveis de organizao das protenas

B Estrutura secundria de protenas

A estrutura secundria descreve as estruturas regulares bidimensionais formadas por

segmentos da cadeia polipeptdica. Quando ocorre o enrolamento da cadeia ao redor de um
eixo chamamos de -hlice. Quando ocorre interao lateral de segmentos de uma cadeia
polipeptdica chamamos de folha .

-hlices e folhas so padres comuns de enovelamento

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Um conjunto de estruturas secundrias fornece domnios proteicos. Esses domnios so

responsveis pela formao da estrutura tridimensional das protenas.

-hlice

folha

Estrutura Polipeptdeo Molcula proteica

secundria de domnio formada por dois
nico diferentes domnios

Principais funes das protenas

Estrutural e dinmica: colgeno e elastina

Transporte de molculas: hemoglobina e mioglobina
Mecanismos de defesa: imunoglobulinas
Controle global do metabolismo: insulina
Mecanismos contrateis: actina e miosina

8 Enzimas
Definio: catalisadores de reaes bioqumicas

As enzimas aumentam vrias ordens de grandeza a velocidade das reaes diminuindo a

energia de ativao. Algumas reaes celulares que tm como catalisadores molculas
especiais de RNA que so chamadas de Ribozima.
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Energia de A enzima
ativao para a diminui a
reao Y X energia de
Energia total

Energia total
ativao para a
reao Y X

Reagente Reagente

produto produto
Caminho da reao Caminho da reao
no catalisada catalisada por uma
enzima
As enzimas diminuem as barreiras de energia que impedem que as reaes qumicas ocorram.

Nomenclatura

Existem 3 mtodos para nomenclatura enzimtica:

- Nome recomendado: Mais curto e utilizado no dia a dia de quem trabalha com enzimas;
Utiliza o sufixo "ase" para caracterizar a enzima. Exs: Urease, Hexoquinase, Peptidase

- Nome sistemtico: Mais complexo, nos d informaes precisas sobre a funo metablica da
enzima. Ex: ATP-Glicose-Fosfo-Transferase

- Nome usual : Consagrados pelo uso; Exs: Tripsina, Pepsina, Ptialina

Classificao

As enzimas so classificadas de acordo com o tipo de reao que catalisam.

1. Oxido-redutases (reaes de oxidao-reduo ou transferncia de eltrons

Desidrogenases e Oxidases)
1.1.atuando em CH-OH
1.2.atuando em C=O
1.3.atuando em C=O-
1.4.atuando em CH-NH2
1.5.atuando em CH-NH-
1.6.atuando em NADH, NADPH
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2.Transferases (transferem grupos funcionais como amina, fosfato, acil, carboxil

Quinases eTransaminases)
2.1.grupos com um carbono
2.2.grupos aldedo ou cetona
2.3.grupos acil
2.4.grupos glicosil
2.7.grupos fosfatos
2.8.grupos contendo enxfre
3.Hidrolases (reaes de hidrlise de ligao covalente - Peptidases)
3.1.steres
3.2.ligaes glicosdicas
3.4.ligaes peptdicas
3.5.outras ligaes C-N
3.6.anidridos cidos
4.Liases (catalisam a quebra de ligaes covalentes e a remoo de molculas de gua, amnia e
gs carbnico Dehidratases e Descarboxilases)
4.1. =C=C=
4.2. =C=O
4.3. =C=N-
5.Isomerases (reaes de interconverso entre ismeros ticos ou geomtricos - Epimerases)
5.1.racemases
6.Ligases (catalisam reaes de formao de novas molculas a partir da ligao entre duas pr-
existentes, sempre s custas de energia - Sintetases)
6.1. C-O
6.2. C-S
6.3. C-N
6.4. C-C

Propriedades das enzimas

As enzimas so catalisadores biolgicos extremamente eficientes, elas aceleram em mdia
109 a 1012 vezes a velocidade da reao, transformando de 100 a 1000 molculas de
substrato em produto por minuto de reao. Elas atuam em concentraes muito baixas e
em condies suaves de temperatura e pH. Possuem todas as caractersticas das protenas
e podem ter sua atividade regulada. Esto quase sempre dentro da clula e
compartimentalizadas.
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Cofatores enzimticos e coenzimas

Cofatores so pequenas molculas orgnicas ou inorgnicas que podem ser necessrias para a
funo de uma enzima. Estes cofatores no esto ligados permanentemente molcula da
enzima, mas na ausncia deles, a enzima inativa. A frao proteica de uma enzima, na
ausncia do seu cofator, chamada de APOENZIMA. Chamamos de HOLOENZIMA enzimas
ligada ao cofator.
Coenzimas so compostos orgnicos, quase sempre derivados de vitaminas, que atuam em
conjunto com as enzimas. Podem atuar segundo 3 modelos:
Ligando-se enzima com afinidade semelhante do substrato
Ligando-se covalentemente em local prximo ou no prprio stio cataltico da
apoenzima
Atuando de maneira intermediria aos dois extremos acima citados.

Especificidade

As enzimas so muito especficas para os seus substratos. Esta especificidade pode ser
relativa a apenas um substrato ou a vrios substratos ao mesmo tempo. Esta
especificidade se deve existncia, na superfcie da enzima de um local denominado STIO
DE LIGAO DO SUBSTRATO. O stio de ligao do substrato de uma enzima dado por um
arranjo tridimensional especial dos aminocidos de uma determinada regio da molcula,
geralmente complementar molcula do substrato, e ideal espacial e eletricamente para a
ligao do mesmo. O stio de ligao do substrato capaz de reconhecer inclusive
ismeros ticos "D" e "L" de um mesmo composto. Neste stio de ligao encontramos o
local onde ocorre a reao enzimtica, chamado STIO CATALTICO ou STIO ATIVO.
Alguns modelos procuram explicar a especificidade substrato/enzima:
Modelo Chave/Fechadura : Prev um encaixe perfeito do substrato no stio de
ligao, que seria rgido como uma fechadura.

Modelo do Ajuste Induzido: Prev um stio de ligao no totalmente pr-formado,

mas sim moldvel molcula do substrato; a enzima se ajustaria molcula do
substrato na sua presena.
Evidncias experimentais sugerem um terceiro modelo que combina o ajuste
induzido a uma "toro" da molcula do substrato, que o "ativaria" e o prepararia para
a sua transformao em produto.
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Cintica enzimtica

a parte da enzimologia que estuda a velocidade das reaes enzimticas, e os atores que
influenciam nesta velocidade. A cintica de uma enzima estudada avaliando-se a quantidade
de produto formado ou a quantidade de substrato consumido por unidade de tempo de
reao. O complexo enzima/substrato (ES) tem uma energia de ativao ligeiramente menor
que a do substrato isolado, e a sua formao leva ao aparecimento do estado de transio
"Ts". A formao de "P"(produto) a partir de ES a etapa limitante da velocidade da reao. A
velocidade de uma reao enzimtica depende das concentraes de ENZIMA e de
SUBSTRATO.

Equao de Michaelis-Menten

Michaelis e Menten foram pesquisadores que propuseram o modelo acima citado como
modelo de reao enzimtica para apenas um substrato. A partir deste modelo, estas
pesquisadoras criaram uma equao, que nos permite demonstrar como a velocidade de uma
reao varia com a variao da concentrao do substrato:
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Esta equao pode ser expressa graficamente, e representa o efeito da concentrao de

substrato sobre a velocidade de reao enzimtica.

O KM de um substrato para uma enzima especfica caracterstico, e nos fornece um

parmetro de especificidade deste substrato em relao enzima. Quanto menor o KM, maior
a especificidade, e vice-versa.

Principais Fatores que Influenciam na Velocidade de uma Reao Enzimtica

1. Temperatura : Quanto maior a temperatura, maior a velocidade da reao, at se atingir

a TEMPERATURA TIMA; a partir dela, a atividade volta a diminuir, por desnaturao da
molcula.

2. pH : Idem temperatura; existe um pH TIMO, onde a distribuio de cargas eltricas da

molcula da enzima e, em especial do stio cataltico, ideal para a catlise.

3. [E], [S] e presena de inibidores.

Inibio Enzimtica

Os inibidores enzimticos so compostos que podem diminuir a atividade de uma enzima. A

inibio enzimtica pode ser reversvel ou irreversvel. Resumimos em dois tipos o modo de
inibio enzimtica reversvel:

1. Inibio Enzimtica Reversvel Competitiva:

Ocorre quando o inibidor se liga reversivelmente ao mesmo stio de ligao do substrato. Esse
efeito revertido aumentando-se a concentrao de substrato. Este tipo de inibio depende
das concentraes de substrato e de inibidor.
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2. Inibio Enzimtica Reversvel No-Competitiva:

Ocorre quando o inibidor liga-se reversivelmente enzima em um stio diferente do substrato.
Sendo assim, a enzima pode estar ligada ao substrato ao mesmo tempo. Este tipo de inibio
depende apenas da concentrao do inibidor.

Na inibio enzimtica irreversvel, h modificao covalente e definitiva no stio de ligao ou

no stio cataltico da enzima.