Tema

Mecanismos de reaccin y catlisis

1
 Reacciones elementales y reacciones complejas.

Reaccin elemental: es la que ocurre en una sola etapa o evento qumico. No se

detectan compuestos intermedios.

Reacciones complejas: son aquellas en las que est implicada ms de una reaccin
elemental.
Se desarrollan siempre a travs de mecanismos consistentes en series de reacciones
elementales, que se combinan entre s.

Las reacciones complejas las podemos dividir en varias clases: 1) reacciones reversibles,
2) reacciones consecuEvas, 3) reacciones paralelas, y 4) procesos mixtos.

Si ningn compuesto intermedio de reaccin puede ser detectado, la reaccin se
supone elemental. Asegurar que una reaccin es elemental es complicado ya
compuestos intermedios pueden pasar desapercibidos a los mtodos de deteccin.

Preguntas: Ponga un ejemplo de una reaccin elemental.

Cmo son la mayora de las reacciones que ocurren en los organismos vivos?
2
 Reacciones elementales. Molecularidad
La molecularidad de una reaccin elemental es el nmero de parPculas reacEvas
(tomos, molculas, radicales libres o iones) implicados en el suceso qumico
individual.

Ejemplo: La conversin de ciclopropano en propileno se cree que es una reaccin
elemental:
CH2 CH2
CH3 CH =CH2 unimolecular. v = k [ ciclopropano]
CH2

Br + H2 HBr + H bimolecular. v = k [ Br ] [ H 2 ]

Las reacciones elementales se clasican en monomoleculares, bimoleculares y

trimoleculares (raras).

El concepto de molecularidad slo puede denirse en una reaccin elemental.
No hay que confundirlo con el orden de una reaccin, que es una magnitud experimental.
Orden y molecularidad slo coinciden en reacciones elementales.
3
 Reacciones homogneas y heterogneas
Una reaccin homognea es la que ocurre enteramente en una fase.

P.ej.: Reaccin entre gases en un reactor, una reaccin de neutralizacin cido-base en
disolucin.

Una reaccin heterognea implica la presencia de especies en dos o ms fases.

P.ej.: La reaccin que ocurre en un catalizador del escape de un coche o
Las reacciones en los electrodos de una pila galvnica.

Pregunta: Ponga algn ejemplo de reacciones homogneas y heterogneas en un ser

vivo.

4
 Reacciones reversibles
Reacciones reversibles u opuestas son aquellas en las cuales los productos se pueden
reconverEr en los reacEvos originales.

La velocidad aparente de la reaccin directa disminuye conforme se agotan los reacEvos
y la velocidad de la reaccin inversa aumenta a medida que se acumulan productos hasta
que se alcanza el estado de equilibrio dinmico.

En el equilibrio las reacciones directa e inversa @enen la misma velocidad.

k1
Ejemplo: 2A B
k2
2
Velocidad de desaparicin de A o formacin de B por vd = k1 [ A]
el proceso directo:
Velocidad de formacin de A o desaparicin de B por vi = k2 [ B]
el proceso inverso:
2
Velocidad neta de reaccin: v = vd vi = k1 [ A] k2 [ B]

5
 2
En el equilibrio: v = vd vi = k1 [ A]eq k2 [ B]eq = 0
k1 [ B]eq (sta no es la constante de equilibrio
Kc = = termodinmica)
k2 [ A]2eq
Ejemplo: Las constantes de velocidad directa e inversa de la dimerizacin de la proavina
son 8.1 108 M-1 s-1 y 2.0 106 s-1 respecEvamente. Cul es la constante de equilibrio, Kc?
Estado de transicin
Variacin con la temperatura:

d ln K c d ln k1 d ln k2
=

Energa
dT dT dT Ea,d
Ea,i
d ln k E d ln K c r H o
= a2 ReacEvos
dT RT dT RT 2
rHo Productos

r H o Ea,d Ea,i
Coordenada de reaccin
La energa de ac@vacin representa una barrera de entalpa entre los reac@vos y los
productos.
6
 Relajacin al equilibrio
La forma ms sencilla de estudiar una reaccin reversible es estudiando su relajacin al
equilibrio. Si llamamos x = [A] [A]eq:
Tiempo [A] [B]
k1
A B 0 [A]0 = [A]eq + x0 [B]0= [B]eq - x0 k1 [ B]eq
k2 t [A]eq + x [B]eq x K eq = =
[A]eq [B]eq k2 [ A]eq
d [ A] dx
v=
dt
( )
= = k1 [ A]eq + x k2 [ B]eq x
dt
( )
dx
= k1 [ A]eq k2 [ B]eq + k1 x + k2 x = ( k1 + k2 ) x = ( k1 + k2 ) x
dt
Integrando
xdx t
x0 x = ( k1 + k2 ) 0 dt
!x$ ( k1+k2 )t
ln # & = ( k1 + k2 ) t O bien: x = x0 e
" x0 %
Siguiendo la variacin de x, la cinEca se comporta como una cinEca irreversible de
primer orden con una constante de velocidad igual a k1 + k2.
7
 Ejemplo: k1 = 0.10 s-1 ; k2 = 0.02 s-1 ; [A]0 = 1 M ; [B]0 = 0 M
k1 [ B]eq 1
K eq = = =5 [ A]eq = ([ A]0 + [ B]0 )
k2 [ A]eq 1+ K eq
K eq
[ B]eq = ([ A]0 + [ B]0 )
1+ K eq

8
 Reacciones consecu@vas. Intermedios de reaccin
Muchas reacciones y en general, la mayora de los procesos biolgicos Eenen
mecanismos complejos con reacciones consecuEvas. El caso ms simple es:
k1 k2 C
A B
OH- OH-
Ejemplo: CH3-CN + H2O CH3-CONH2 + H2O CH3-COO- + NH4+

El compuesto B se conoce como intermedio de la reaccin. No es reacEvo ni producto de

la reaccin, pero se genera transitoriamente durante la misma.

Las ecuaciones de velocidad:

Y las formas integradas:

9
 Aplicando la condicin de mximo a la concentracin de B:

! d [ B] $ k1 [ A]0 1 k1
# & = ()k1ek1tmax + k2 ek2tmax *+ = 0 t [ B] = ln
" dt %[ B]max k2 k1
max
k1 k2 k2
Es el Eempo de reaccin para el cual el intermedio alcanza su concentracin mxima.

Simulacin: [A]0 = 1 M: k1 = 0.1 s-1 ; k2 = 0.2 s-1

Concentraciones reactivos Si k1 k2 el intermedio B se acumular.

1.2
Si k1 << k2, la concentracin de B ser
1
siempre muy baja en todo momento,
ya que toda molcula de B que se
[Reactivos] (M)

0.8

0.6
]A[
forme se convierte rpidamente en C.
0.4
]B [
0.2 ]C [
Ejemplo: Calcule el Eempo en el que
R E #
0
0 6 12 18 24 30 36 42 48 54 60
!F [B] es mxima en la simulacin
tiempo (s)

10
 La etapa limitante de una reaccin compleja
ParEendo del ejemplo: k1 k2 C
A B

C = A
"
[ ] [ ]0 $1
1
(2
k e k1t
k e k2t
%
)'& ek1t >> ek2t
1 Si k2 >> k1
# k2 k1
k2 k1 k2
[ ] [ ]0 (
C A 1 e k1t
)
La formacin de productos depende slo de la velocidad de la etapa lenta (etapa
limitante de la velocidad).
En general, la etapa limitante de una reaccin compleja es la etapa ms lenta que sea
crucial en el camino de formacin de los productos.

Pregunta: De los mecanismos siguentes, cules son etapas limitantes de la velocidad

de la reaccin?
1, lenta 2, rpida 1, rpida 2, lenta

3, lenta 4, rpida 3, rpida 4, lenta

11
 Ejemplo: Una de las etapas iniciales de la gluclisis es:
fosfofructoquinasa
Fructosa-6-P + ATP Fructosa-1,6-bifosfato + ADP

La constante de equilibrio de la reaccin es Kc = 1.2 103. Al analizar el tejido

muscular se obEene:
F-1,6BP F-6P ADP ATP
Concentracin (mM) 0.019 0.089 1.3 11.4

Se puede sta un etapa limitante de la velocidad de la glucolisis?

[ F 1,6BP ] [ ADP ] = 0.024 << K

c
[ F 6P ] [ ATP ]

La reaccin est lejos del equilibrio, desplazada hacia el lado de los reacEvos, por lo
que probablemente sea una etapa limitante.

12
 Reacciones consecu@vas reversibles
k1 k3
Caso sencillo: A B C
k2 k4
d [A] d [B] d [C ]
= k1[A] k2 [B] = k1[A] k2 [B] k3 [B] + k4 [C ] = k3 [B] k4 [C ]
dt dt dt
La resolucin de este sistema de ecuaciones es compleja y da lugar a expresiones bastante
complicadas:
k 2 k 4 12 1 (k 2 + k3 + k 4 ) + k 2 k 4 t 2
e + [A0 ] 2 (k2 + k3 + k4 ) + k2 k4 e 2t
2

[A] = [A0 ] +

1

1 2 1 ( 1 2 ) 2 ( 2 1 )
k 4 k 4 1 t k 4 2 t
[B] = k1[A0 ] + e + 1
e 2

1 2 1 ( 1 2 ) 2 ( 2 1 )
1 1 1t 1 2t
[C ] = k1k3 [A0 ] + e + e
1 2 1 ( 1 2 ) 2 ( 2 1 )
p+q pq
2 + (k1 + k 2 + k3 + k 4 ) + k1k3 + k 2 k 4 + k1k 4 = 0 1 =
2
2 =
2
1/ 2
p = k1 + k2 + k3 + k4 [
q = p 2 4(k1k3 + k1k4 + k2 k4 ) ] 13
 Simulaciones
Caso 1: k1 = k2 = 100 s-1 ; k3 = k4 = 30 s-1 Caso 2) k1= k2 = 100 s-1 ; k3 = 10 s-1 ; k4 = 1 s-1
Pre-equilibrio

Caso 3) k1= 10 s-1 ; k2 = 1 s-1 ; k3 = 1000 s-1 ; k4 = 300 s-1. Caso 4) k1= 5 s-1 ; k2 = 50 s-1 ; k3 = 100 s-1 ; k4 = 5 s-1.
Etapa limitante seguida de equilibrio Intermedio en estado estacionario

14
 La aproximacin del estado estacionario
Hemos visto que a medida que los mecanismos de reaccin se complican resulta tanto
ms discil integrar las ecuaciones de velocidad. Es necesario hacer aproximaciones.

La aproximacin del estado estacionario supone que, despus de un @empo de
induccin, la concentracin de intermedios permanece aproximadamente constante
durante la mayor parte de la reaccin.

Ejemplo: k1 k3
A+B C D
k2
Si k3 >> k1, [C] ser baja y aproximadamente constante.
d [C ] k1 [ A] [ B]
= k1 [ A] [ B] k2 [C ] k3 [C ] = 0 [C ] =
dt k2 + k 3

d [ D] kk
= k3 [C ] = 1 3 [ A ] [ B ] = k [ A ] [ B ] Cin@ca aparente irreversible
dt k2 + k 3 de segundo orden.
kk
k= 1 3
k2 + k 3
15
 Pre-equilibrio seguido de etapa limitante
El mismo mecanismo, con k1 y k2 >> k3:

k1 k3
A+B C D
k2

Podemos suponer que la relacin entre [C] y [A][B] es equivalente a la de equilibrio. Se

dice que la etapa rpida se encuentra en pre-equilibrio.

k1 [C ] k1
Kc = = [C ] = [ A] [ B]
k2 [ A ] [ B ] k2

d [ D] kk Cin@ca aparente irreversible

= k3 [C ] = 1 3 [ A ] [ B ] = k [ A ] [ B ]
dt k2 de segundo orden.

k1k3
k= = K c k3
k2
16
 Etapa limitante seguida de equilibrio rpido
k1 k3
A B C
k4
k3 [C ] B y C se encuentran en todo momento
Si k3 y k4 >> k1 Kc = =
k4 [ B ] en equilibrio.

d [ A ] d ([ B ] + [C ]) d [ B ] d [ B] d [ B]
v= = = + Kc = (1+ K c ) = k1 [ A]
dt dt dt dt dt
d [ B] k
= 1 [ A]
dt 1+ K c
d [ A]
Como la primera etapa es irreversible: = k1 [ A] [ A] = [ A]0 ek1t
dt
[ A]0
d [ B] k1 [ A]0 k1t Integrando [ B] = (1 ek1t )
= e 1+ K c
dt 1+ K c
K c [ A]0
[C ] = (1 ek1t )
1+ K c
17
 Reacciones en cadena
Mecanismo general Ocurren a travs de la generacin de dos
Producto,)P) intermedios reacEvos (propagadores), que se
Reac%vo,)Q) regeneran mutuamente.
Iniciacin) Propagacin)
Ejemplo: La reaccin entre Br2 y H2:
+)Q) Br2 + H2 2 HBr
Especie)reac%va,)R1) Especie)reac%va,)R2)
+)Q)
Mecanismo aceptado:
Terminacin) Iniciacin: Br2 + M 2Br + M (k1, lenta)
Propagacin)
Propagacin:
Producto,)P) Br + H2 HBr + H (k2, lenta)
Producto,)P)
H + Br2 HBr + Br (k3, rpida)
Terminacin:
2 Br + M Br2 + M* (k-1, rpida)
Inhibicin:
H + HBr H2 + Br (k-2, rpida)

Cules son las especies propagadoras de la cadena?

Deducir la ecuacin de velocidad.
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 Control de la velocidad por difusin
Muchas reacciones requieren el encuentro (colisin) entre los reacEvos, que deben
difundir en el medio para encontrarse y formar el llamado par de encuentro.

Proceso de difusin y encuentro: A + B AB kd[A][B]

El par de encuentro persiste durante un Eempo y luego A y B pueden separarse por
difusin:
AB A + B kd[AB]
O reaccionar para formar productos: AB productos ka[AB]
ka kd
La velocidad de la reaccin : v= [ A] [ B]
ka + kd '
8RT
Si ka >> kd , v = kd [ A ] [ B ] Control por difusin kd =
3 viscosidad
Si ka << kd ,
kk
v = a d [ A] [ B] Control por ac@vacin
kd '
Ejemplo: La velocidad de cierta reaccin enzimEca est limitada por la difusin de la
enzima y el sustrato. Si la viscosidad de la disolucin es = 8.9 10-4 kg m-1 s-1, esEme
el valor de la constante de velocidad de esa reaccin a 25 C.
19
 Cin@ca Molecular
La Cin@ca Molecular trata de explicar la velocidad de las reacciones desde un
punto de vista molecular uElizando diversas teoras. Las ms importantes son las
teoras de colisiones y la teora del estado de transicin.

Teora del estado de transicin

Colisin en una etapa bi-molecular:
Estado de
transicin

Energa potencial
ReacEvos

Productos
complejo ac@vado
Coordenada de reaccin

Principal suposicin de la teora: El complejo acEvado est en pre-equilibrio con los

reacEvos. A + B C D
d [ D] "#C $%
v= = k #$C %& = k K c [ A] [ B] K c =
dt [ A] [ B] 20
 La constante de velocidad predicha por la teora viene determinada por la
Ecuacin de Eyring:
RT
kET = k K c = Kc
N Ah
es el coeciente de transmisin (normalmente se toma 1), que determina qu
fraccin de complejos acEvados que pasan por el estado de transicin se
transforma en productos.
El factor RT/NAh expresa la frecuencia de vibraciones del complejo acEvado que
conducen a productos lo largo de la coordenada de reaccin.

Kc se puede expresar en funcin de una energa de Gibbs de ac@vacin, G :

G

K K =e
c
RT G = H T S
RT (H T S ) RT % RT S R ( H RT
kET = e =' e *e
N Ah & N Ah )
Comparando con la ecuacin de Arrhenius:
d ln kET " RT % S
Ea = RT 2 = H + RT ln A = ln $ '+ +1
dT # N Ah & R 21
 El efecto cin@co salino
Si la reaccin transcurre entre iones, la presencia de otras sales, produce un aumento de
la fuerza inica, que puede estabilizar o desestabilizar el complejo acEvado en relacin
a los reacEvos segn sean sus cargas:
A+ + B C D A+ + B+ C2+ D
Efecto salino desestabilizante Efecto salino estabilizante
a #$C %& 0
K kET

K = C = C = K K c kET =k K =k =
c
aA aB A B [ A] [ B] K K
0
log kET = log kET + log A + log B log C
Usando la ley lmite de Debye-Hckel:
0 1
log kET = log kET + 2AzA zB I 2

Si los reacEvos Eenen cargas opuestas, la velocidad de la reaccin disminuye al aadir sal.
Si los reacEvos son de la misma carga, la velocidad de la reaccin aumenta.

Ejemplo: La velocidad de dimerizacin de una protena, etapa limitante de su

cristalizacin, aumenta con la fuerza inica. Una representacin de log k frente a I1/2
resulta una recta de pendiente aproximadamente 9. Cul es la carga de la protena?
22
 Catlisis
Un catalizador es una sustancia que acelera una reaccin sin sufrir un cambio qumico neto.

Un catalizador acta rebajando la energa de

ac@vacin de la reaccin. Energa(de(
El catalizador evita la etapa limitante lenta ac+vacin(
proporcionando un camino alternaEvo ms rpido.
Energa(de(

Energa(
ac+vacin(con(
catalizador(

Ejemplo: La enzima catalasa reduce la energa

de acEvacin de la descomposicin del Productos(
perxido de hidrgeno de 76 kJ mol-1 a slo 8 Reac+vos(

kJ mol-1, lo que acelera la reaccin 1015 veces. Coordenada(de(la(reaccin(

Tipos de catalizadores:
-Homogneos: Se encuentra en la misma fase que la reaccin.
-Heterogneos: Se encuentra en una fase diferente de la reaccin.

Pregunta: Poner un ejemplo de catalizador homogneo y heterogneo.

23
 Mecanismos de catlisis homognea
Br
Ejemplo: 2 H2O2 (aq) 2 H2O (l) + O2 (g)
Mecanismo: !" H 3O2+ #$
1. H2O2 + H3O+ H3O2+ + H2O Pre-equilibrio K c =
[ H 2O2 ]!" H 3O+ #$
2. H3O2+ + Br- HOBr + H2O Etapa limitante v = k !" H 3O2+ #$!" Br #$

3. HOBr + H2O2 H3O+ + O2 + Br- Etapa rpida

d [O2 ]
La velocidad de la reaccin ser: v= = kK c [ H 2O2 ] !" H 3O + #$!" Br #$
dt

Catlisis cida: En la etapa crucial para la catlisis se transere un protn desde un

cido a uno de los reacEvos.
Ejemplo: Hidrlisis de los steres.

Catlisis bsica: Se transere un protn desde uno de los reacEvos a una base.
Ejemplo: Halogenacin de compuestos orgnicos.

24
 Catlisis enzim@ca.
Las enzimas son los catalizadores de las reacciones biolgicas. Suelen ser protenas,
aunque hay cidos ribonuclicos (RNA) con acEvidad enzimEca (ribozimas).

Las enzimas poseen un si@o ac@vo en su

estructura al que los reacEvos (sustratos) se unen
especcamente y donde stos sufren su
transformacin en productos.

En el siEo acEvo diversos grupos qumicos de la
enzima (aminocidos, cofactores, iones
metlicos,) interaccionan con los sustratos
provocando cambios en su estructura que alteran
el mecanismo de la reaccin acelerndola.

Existen dos modelos para la unin del sustrato al
siEo acEvo:
Anhidrasa carbnica con inhibidores
-Modelo de llave-cerradura. unidos al siEo acEvo.
-Modelo de encaje inducido.

25
 Mecanismo de Michaelis-Menten
Al estudiar las velocidades iniciales de las reacciones catalizadas por enzimas se observa:
- Para una concentracin inicial de sustrato [S]0, la velocidad inicial de
formacin de productos es proporcional a la concentracin de enzima [E]0.
- Para una [E]0 determinada y a [S]0 baja, la velocidad de formacin de
productos es proporcional a [S]0.
-Para una [E]0 determinada y a [S]0 elevados, se alcanza una velocidad
mxima, vmax, independiente de [S]0

El mecanismo de Michaelis-Menten para la

catlisis enzimEca:

v"(mol"L(1"min(1"
ka kb
E+S ES P+E
ka
kb [ E ] 0 ka, + kb [ E ] [ S ]
v0 = Km = =
1+ K m [ S ]0 ka [ ES ]
0" 0.005" 0.01" 0.015" 0.02" 0.025"
[S]"

Ejercicio: Aplicar la aproximacin del estado estacionario a este mecanismo para

obtener la ecuacin de velocidad para la formacin de productos:
26
Km es la constante de Michaelis que caracteriza la anidad de unin del sustrato
por la enzima.
kb [ E ] 0 v0,max
v0 = =
1+ K m [ S ]0 1+ K m [ S ]0
kb
-Si [S]0 << Km , Km/ [S]0 >> 1 y la velocidad es proporcional a [S]0: v0 [ E ]0 [ S ]0
Km
-Si [S] >> Km, Km/ [S]0 << 1 y la velocidad es independiente de [S]0: v0 v0,max = kb [ E ]0

Tomando la inversa de la ecuacin de Michaelis-Menten:

140$

1 1 K 1
= + m 120$ Pendiente=Km/v0,max
v0 v0,max v0,max [ S ]0 100$

1/v$
80$

60$

40$
-1/Km
Grco de Lineweaver-Burk.
20$ 1/v0,max
0$
!1000$ !500$ 0$ 500$ 1000$ 1500$ 2000$ 2500$ 3000$
!20$
1/[S]$
27
 Ejemplo: Las velocidades iniciales de hidrlisis del ppEdo N-glutaril-L-
fenilalanina-p-nitroanilida por -quimiotripsina se midieron a diferentes
concentraciones de sustrato:
[S]0/mmol L-1: 0.334 0.450 0.667 1.00 1.33 1.67
v0 /mmol L-1 s-1: 0.152 0.201 0.269 0.417 0.505 0.667
Determinar v0,max y Km.

[S]0 v 1/[S]0 1/v

0,334 0,152 2,99401198 6,57894737
0,45 0,201 2,22222222 4,97512438
0,667 0,269 1,49925037 3,71747212
1 0,417 1 2,39808153
1,33 0,505 0,7518797 1,98019802
1,67 0,667 0,5988024 1,49925037

1/vmax = 0.363 L s mmol-1

Vmax = 2.78 mmol L-1 s-1

Km/vmax = 2.0926 s
Km = 5.82 mmol L-1

28