1. Qu es un genoma?

Un genoma es el conjunto de secuencias de ADN que caracterizan a un individuo. es el conjunto

de genes contenidos en los cromosomas, lo que puede interpretarse como la totalidad de
la informacin gentica que posee un organismo. El genoma en los seres eucariotas comprende
el ADN contenido en el ncleo, organizado en cromosomas y el genoma de orgnulos celulares
como las mitocondrias y los cloroplastos; en los seres procariotas comprende el ADN de
su nucleoide.

Cmo difiere el genoma bacteriano respecto de los genomas eucariotas (genoma mitocondrial vs.
genoma nuclear?

Genoma Mitocondrial Genoma Nuclear

ADN no presenta histonas ADN empaquetado en histonas

ADN circular y disperso en la matriz mitocondrial ADN lineal y rodeado de una envoltura nuclear

Presenta un solo punto de replicacin Presenta muchos orgenes de replicacin

Presenta aproximadamente 37 genes que codifican Presenta miles de genes que codifican protenas
protenas mitocondriales. para toda la clula.

Genoma bacteriano Genoma eucariota

ADN no presenta histonas ADN empaquetado en histonas

ADN circular y disperso en el citoplasma ADN lineal y rodeado de una envoltura nuclear

Presenta un solo punto de replicacin Presenta muchos orgenes de replicacin

NO presenta intrones Presenta intrones y exones

Replicacin, Transcripcin y Traduccin se Replicacin y Transcripcin se realiza en el
realiza en el citoplasma ncleo y Traduccin se realiza en el citoplasma

Presenta ADN extra cromosmicos Presenta ADN extra cromosmicos en

denominadas plsmidos. mitocondrias y cloroplastos.

2. Describa los mecanismos de accin de las ADN polimerasas. Cmo acta en la sntesis de la
cadena retrasada y la cadena adelantada. Explique las propiedades de la ADN polimerasa?
Las ADN polimerasas son enzimas que intervienen en el proceso de replicacin del ADN.
Llevan a cabo la sntesis de la nueva cadena de ADN agregando
desoxiribonucleotidos trifosfato (dNTP) con los desoxiribonucleotidos complementarios
correspondientes a la hebra de ADN molde. Los dNTP que se usan en la replicacin del
ADN contienen tres fosfatos unidos al grupo hidroxilo del carbono 5' de la base
desoxirribosa. La reaccin fundamental es una transferencia de un grupo fosfato en la que
el grupo 3'-OH acta como nuclefilo en el extremo 3' de la cadena que est en
crecimiento, es decir liberandose pirofosfato inorganico y de esa manera se alarga la
cadena de ADN.
La cadena hija que adopta como molde a la cadena progenitora que corre en direccin
35 se sintetiza en forma continua, al crecer en direccin 53, y se denomina cadena
adelantada (leading strand). La otra cadena hija, cuyo molde es la cadena del DNA
progenitora que corre en direccin 53 es sintetizada de un modo singular, ya que para
poder crecer en esa direccin debe sintetizarse en direccin opuesta al avance de la
horquilla de replicacin. El problema se supera haciendo de que la sntesis sea discontinua,
lo cual significa que la nueva cadena se sintetiza de a pequeos fragmentos y se le llama
cadena retrasada (lagging strand).
La sntesis de la cadena retrasada se lleva a cabo en la direccin opuesta a la del
movimiento de la horquilla de crecimiento, a partir de una serie de iniciadores de RNA
cortos formados por la primasa en mltiples sitios de la segunda cadena molde. Los
segmentos resultantes de RNA ms DNA se conocen como fragmentos de Okasaki.
Una helicasa y las protenas de unin a las monocadenas (SSB) trabajan para desenrollar y
mantener las cadenas de DNA separadas antes del avance de la horquilla de replicacin

Las helicasas son una clase de enzimas capaces de desplazarse a lo largo del DNA utilizando la
energa de la hidrlisis del ATP, para separar las cadenas.

Las protenas SSB mantienen las cadenas separadas

La DNA Polimerasa, agrega un nucletido al extremo 3 de la cadena de DNA en crecimiento y
forma un enlace fosfodister entre este extremo y el grupo 5-fosfato de nucletido entrante.

El nucletido trifosfato entrante provee la energa necesaria para esta reaccin por la hidrlisis de
los dos fosfatos terminales (PPi).

Este pirofosfato es luego hidrolizado a fosfato inorgnico (Pi), lo cual permite que la reaccin de
polimerizacin sea irreversible.
Una vez que el origen de replicacin se ha formado, el alargamiento para formar la cadena
adelantada progresa sin mayor dificultad.
Una primasa se une a un sitio adyacente a la helicasa en el segmento monocatenario del molde de
la cadena retrasada e inicia la sntesis de otro iniciador de RNA, el mismo que la polimerasa
procede a alargar para formar otro fragmento de Okasaki.
El ncleo polimersico que sintetiza la cadena adelantada se desplaza, junto con su abrazadera de
subunidad (estabiliza a la DNA poli), a lo largo de su molde en la direccin del movimiento de la
horquilla, y as alarga la cadena.

3. Describa los pasos durante el inicio de la transcripcin en procariotas. Cul es la funcin de

cada uno de los factores de la RNA polimerasa?

INICIACION

El par de bases donde se inicia la transcripcin recibe el nombre de sitio de iniciacin de la

transcripcin, o sitio de inicio. Por convencin, el sitio de iniciacin de la transcripcin suele
llevar el nmero +1. A los pares de bases que se extienden en la direccin de la transcripcin,
(es decir, hacia el extremo 5 del molde de DNA o corriente abajo) se les asigna nmeros
positivos y aquellos que se extienden en la direccin opuesta (o sea, hacia 3 o corriente arriba)
se les asigna nmeros negativos.
ELONGACIN

La subunidad de una molcula de DNA polimerasa se une a una secuencia de DNA promotora
y se forma un complejo cerrado, en el cual las cadenas de DNA tienen sus bases apareadas. La
polimerasa separa las cadenas en una distancia de 10-12 pb alrededor del sitio de iniciacin de
la transcripcin, con lo que se forma un complejo abierto. Despus de que se han polimerizado
10 ribonucletidos, el factor se libera y el ncleo polimersico contina la transcripcin de la
cadena molde.

La fase de elongacin de la sntesis de RNA comienza despus de la formacin del primer

enlace fosfodister. Un cambio importante es la prdida del factor .

La regin que contiene la RNA Pol, el DNA y el RNA se denomina burbuja de transcripcin. El
RNA recin sintetizado forma una hlice hbrida con la hebra de DNA molde, se cree que est
hlice RNA-DNA tiene una longitud de ~12pb.
TERMINACIN

En la fase de terminacin, cesa la formacin

de enlaces fosfodister, se disocia el hbrido

DNA-RNA, se rebobina la regin fundida del

DNA y la RNA Pol se libera del DNA.

Terminacin independiente de rho ():

Las regiones transcritas de los moldes de DNA contienen seales de terminacin (stops
signals). La ms sencilla es una regin palindrmica rica en GC seguida de una regin rica en
AT. El transcrito de RNA de este DNA palindrmico es autocomplementario. Por lo tanto sus
bases se pueden emparejar para formar una estructura secundaria en tallo-asa estable en el
transcrito de RNa.

Este tallo-asa viene seguida de una secuencia de cuatro o ms residuos U. El transcrito de RNA
finaliza en ellos o justamente despus.
4. Describa la estructura de la ARN polimerasa bacteriana? Cmo actan las ARN polimerasas?.
Qu diferencias existen entre ARN polimerasas procariotas de eucariotas la ADN polimerasa?
La RNA Polimerasa

Localiza en el DNA los centros de iniciacin y las seales de terminacin que determinan el final
de la transcripcin

Desenrolla un tramo del DNA para producir un molde de DNA de una sola hebra.

Selecciona el ribonuclesido trifosfato correcto y cataliza la formacin de un enlace

fosfodister. La RNA Polimerasa es completamente progresiva: el transcrito es sintetizado de
principio a fin por una sola molcula de RNA polimerasa.

Subun Funcin
.

Se une a secuencias reguladoras

Forma enlaces fosfodister

Se une al DNA molde

Reconoce al promotor e inicia

sntesis

RNA Polimerasa de E.coli (RNAPol)

 5. Represente y explique las etapas del proceso de replicacin en procariotas?
6. Cules son los pasos generales en el procesamiento de un pre-ARN en un ARNm?
7. Represente y explique las etapas del proceso de traduccin en procariotas?. Por ejemplo
describa la sntesis del pentapptido met-val-lis-his-arg.

9. Defina los siguientes trminos y d ejemplos:

- transicin - transversin - mutacin silenciosa mutacin sin sentido, mutacin de cambio
de sentido, mutacin por insercin y delecin.
10. Describa los mecanismos de reparacin de dao por luz ultravioleta (dmero de timina).