CHAPITRE 10 : METABOLSIME DES ACIDES AMINES

Les acides amins ont des fonctions carboxyles (COOH), et des fonctions amines (NH2).
Globalement, ils sintgrent dans le mtabolisme azot. Celui-ci est impliqu dans des
fonctions trs importantes (croissance, reproduction).

Les tres vivants ne sont pas tous capables dutilise toutes les formes dazote au niveau
de lenvironnement. Ils deux grandes catgories : les formes inorganiques (NO3- ; NO2-,
NH3 et N2), et les formes organiques (acides amins, protines, ures).

I. Utilisation de lazote inorganique : cycle de lazote

La forme inorganique la plus intressante est le NH3 : tous les organismes peuvent
lutiliser.

Par contre, la forme la plus abondante est lazote diatomique (N2) : cela reprsente plus
de 80% de latmosphre. Cette transformation de N2 en NH3 est appele la fixation de
lazote, ou la diazotrophie : cest lentre de lazote dans le monde vivant (biosphre).

Il y a donc un quilibre entre les formes inorganiques et organiques. Cela dmarre avec
la fixation de lazote, ou bien la rduction des nitrates, et cela va en retour se terminer
par la dnitrification qui est du catabolisme (retour linorganique).

1. Fixation de lazote : diazotrophie

Cette diazotrophie ne peut se faire que par certains microorganismes. Elle ncessite
normment dnergie et des cofacteurs rduits.

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Ex : Klebsiella, Azotobacter qui sont des microorganismes libres, et aussi Rhizobium
(bactrie qui vit lintrieur des racines des lgumineuses, de la rhizosphre).

Lenzyme est une nitrognase.

Cette synthse est inhibe par loxygne : cest une synthse anarobie.

Pour cela elle utilise une protine qui pige loxygne, la leg-hmoglobine.

Lazote est une triple liaison dont lnergie est autour de 900 kJ/mol donc il faut
normment dnergie pour la casser.

2. Rduction du nitrate

Cela se fait chez beaucoup plus dorganismes : les bactries, champignons, et presque
toutes les plantes.

Premire tape :

NO3- + NAD(P)H + H+ NO2- + NAD(P)+ + H2O

Nitrate Nitrite

Lenzyme est la nitrate-rductase

Deuxime tape :

NO26 NO- NH2OH NH3 (Ammoniac)

Lenzyme est la nitrite-rductase

II. Utilisation de lammoniaque

Lammoniac est toxique a forte concentration, mais prcurseur du mtabolisme azot

une certaine concentration. La rentre de lammoniac se fait par 4 ractions.

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Glutamate (Glu) et Glutamine (Gln) sont les prcurseurs essentiels.

Le glutamate va permettre la synthse de tous les acides amins. La glutamine va

permettre la synthse de certains acides amins, et des purines.

La glutamate-dshydrognase, la glutamine-synthtase, lasparagine-synthtase, et la

carbamoyl-phosphate-synthtase sont les 4 enzymes qui interviennent.

Dessins des deux molcules :

Lazote en position de Glu et lazote de la liaison amide de Gln sont les deux azotes qui
sont les sources majoritaires pour les biosynthses.

1. La glutamate-dshydrognase

-ctoglutarate + NADH + H+ + NH4+ Glutamate + NAD+ + H2O

Cest une dsamination oxydative du glutamate.

Chez les bactries et les plantes, cest plutt du NADPH, et la raction va dans la
formation. Chez les animaux, cest du NADH et va indiffrent dans un sens ou dans
lautre.

Cela se passe dans la mitochondrie.

2. La glutamine-synthtase

Le prcurseur est le glutamate qui peut accepter un autre azote.

Glu donne Gln. Cette raction ncessite de lATP (donne ADP et Pi) et du NH4+

3. Lasparagine-synthtise

Aspartate donne Asparagine, en utilisant de lATP (qui donne AMP et PPi), et de la

glutamine qui donne du glutamate.

Comme la prcdente il y a besoin dnergie sous forme dATP qui sera hydrolys en
AMP, et pyrophosphate (PPi).

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 4. Carbamoyl-phosphate-synthtase

Les enzymes sont la carbamoyl-phosphate-synthtase I et II.

III. Economie de lazote : synthse des acides amins et dgradation

1. Consquence mtabolique de labsence de stockage de lazote

Pour les glucides et les lipides, il y a possibilit de stockage pour une utilisation future.
Par contre, lorganisme ne stocke pas lazote. Cela veut dire que seul certains organismes
stockent des formes organiques : insectes (quelques protines de stockage dans
lhmolymphe), asperge (qui stocke lasparagine).

Les animaux sont continuellement oblig davoir un apport azot ou bien dutiliser leur
propre protines fonctionnelles. Cela existe lorsque lapport protique est insuffisant
(certains rgimes) : on ne perd pas le gras mais le muscle.

En temps normal, les apports azots sont quilibrs avec les sorties azotes. Cela
sappelle lquilibre azot ou la balance azote. Dans certains cas, cette balance est
positive (plus dapport que de perte : grossesse, rcupration aprs un jene, et toutes
les phases de croissances). Il y a une balance azote ngative lorsque les pertes sont
suprieures aux apports : jene, vieillissement, pathologies comme le cancer (cachexie).

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 2. Capacit de synthse des organismes

La plupart des microorganismes et des plantes peuvent faire la synthse des acides
amins. Gnralement, ils quilibrent leur besoin et leur sortie. Lorsque lacide amin est
prsent, ils vont prfrentiellement lutiliser. Par contre, chez les mammifres, les
acides amins peuvent tre fabriqus et ce sont des acides amins non-essentiels et
certains ne peuvent pas tre fabriqus : les acides amins essentiels.

La qualit nutritionnelle dun lment au niveau protique dpend de la proximit

phylogntique de laliment et de celui qui labsorbe. Pour lhomme, les meilleures
protines sont celles des mammifres, aprs vient le poisson, puis le poulet. Les
protines vgtales (fruits, lgumes) ont la moins bonne qualit nutritionnelle (elles nont
pas tous les acides amins, et sont difficilement absorbables).

3. Transamination

Les ractions de transamination correspondent en partie avec les ractions

anaplrotiques.

Elles consistent au transfert dun groupement amine dun acide amin sur un -ctoacide
pour former un nouvel acide amin.

Les enzymes sont les transaminases.

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L-ctoacide 1 provient de lacide amin 1.

Les ractions de transamination se font dans la mitochondrie et permettent de faire la

production de nouveaux acides amins, partir de l-ctoacide correspondant.

Labsence d-ctoacide correspondant empche la synthse de lacide amin. Cest la

caractristique des acides amins essentiels : on na pas l-ctoacide correspondant.

Dans les processus de dgradation, la transamination est associ la glutamate-

dshydrognase. CF. TP

IV. Dgradation des acides amins

Cette dgradation des acides amins concernent les acides amins alimentaires et les
acides amins de lorganisme : la protolyse musculaire.

1. Aspects communs de la dgradation des acides amins

Chez les animaux, lorsque les apports protiques sont en excs, lexcs est
compltement dgrad avec le squelette rsiduel qui va aller dans le cycle de Krebs.
Dans ce cas-l, les protines deviennent une source nergtique.

Chez les plantes et les bactries, les excs sont rares et contrls. Il y a donc un
catabolisme rduit.

Glucoformateur : si le squelette carbon aboutit au pyruvate ou lOAA, il va partir

dans la noglucogense. Sil aboutit de lactyl-CoA, on aboutit la formation de corps
ctoniques : cest un acide amin qui est ctogne.

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La dsamination oxydative :

Lenzyme est la glutamate-dshydrognase.

2. Dtoxication et excrtion de lammoniaque

Le mtabolisme des acides amins ou des protines conduit la production dammoniaque

(NH4+) gnralement en excs, or il est toxique.

Son limination va se faire soit directement dans leau (poissons), soit aprs
transformation en acide urique (reptiles, et oiseaux), soit aprs transformation en ure
(mammifres). Lure ne modifie par le pH alors que lammoniaque le modifie.

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Chez lhomme cest lure.

3. Le cycle de lure : cycle de Krebs-Henseleit

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 - OTC : ornithine transcarbamoylase
- ASS : argininosuccinate-synthtase
- ASL : argininosuccinate-lyase
- ARG : arginase

Le cycle de lure se fait dans le foie en partie dans la mitochondrie et en partie dans le
cytosol. Lure est ensuite transport dans le sang jusquau rein.

4. Transport de lammoniaque au foie

La dgradation des acides amins produit de lammoniaque. Celui-ci est ensuite convertir
en ure dans le foie. Il existe plusieurs moyens de transports jusquau foie.

Dans les tissus, le glutamate pige lammoniaque et devient la glutamine qui va dans le
foie et restitue lammoniaque en redonnant du glutamate.

Les acides amins du muscle, dont lalanine, sont exports dans le foie, et part
transamination vont permettre la production indirect dammoniaque (cf. cycle glucose-
alanine).

V. Biosynthse des acides amins

Ils drivent tous soit de prcurseurs de la glycolyse, soit dlments de la VPP, soir
dlments du cycle de Krebs.

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