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De acuerdo con los estudios anteriores, los resultados actuales mostraron muy pocos individuos (4/94)
con una mezcla africana superior al 10%. En particular, cuando se examin la mezcla individual, la mezcla
amerindia y europea mostr una varianza muy grande y la contribucin individual amerindia vari de 1,5 a
84,5% en los 94 sujetos argentinos. Estos resultados indican que la mezcla debe ser considerada cuando se
estudia la epidemiologa clnica o los anlisis genticos de casos y controles en esta poblacin.
El presente estudio proporciona un conjunto de SNP informativos que pueden utilizarse para
determinar o controlar esta estratificacin potencialmente oculta. Adems, la gran variacin en sujetos
argentinos individuales mostrada por este estudio sugiere que esta poblacin es apropiada para futuros
estudios de cartografa de mezcla.
Los mtodos recientemente desarrollados tambin sugieren que las poblaciones recientemente
mezcladas tambin pueden ser tiles para definir la localizacin cromosmica de los rasgos asociados a la
ascendencia. Estos procedimientos que se basan en la identificacin y vinculacin de un rasgo con la
ascendencia en localizaciones cromosmicas especficas ha mostrado valor potencial en estudios recientes de
la hipertensin y la esclerosis mltiple.
Aparecieron caractersticas bastante dispares de estos diferentes grupos por la invasin europea y la
migracin, as como por la trata transatlntica de esclavos.
Para las poblaciones de Estados Unidos y Mxico la contribucin ancestral amerindia es de alrededor
de 50% y la contribucin africana es menor que 5%, en contraste para Puerto Rico el componente amerindio es
aproximadamente el 12% y el componente africano es ms del 20%.
Estudios anteriores han examinado la mezcla total en la poblacin argentina usando un conjunto muy
limitado de marcadores que incluan slo nueve antgenos de grupos sanguneos.
Recientemente, se examin la estructura gentica de una poblacin argentina de Buenos Aires para
evaluar la contribucin africana en individuos utilizando 12 marcadores que discriminaban entre ancestros
africanos y europeos, pero este estudio no examin la contribucin amerindia individual.
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Los resultados actuales complementan estos estudios confirmando la limitada contribucin africana a
la poblacin argentina no indgena y proporcionando una evaluacin precisa de la contribucin amerindia, as
como la variacin individual en la mezcla usando los SNP.
MATERIALES Y MTODOS
Muestras de poblaciones
Se incluyeron europeos americanos y mexicanos, mexicanos, amerindios y africanos occidentales en
este estudio. Estas poblaciones se basaban en una afiliacin tnica autoidentificada.
Se obtuvieron muestras de sangre o de clulas bucales de todos los individuos, de acuerdo con los
protocolos y procedimientos de consentimiento informado aprobados por las juntas de revisin institucionales,
y se etiquetaron con un nmero de cdigo annimo.
Anlisis de laboratorio
Se seleccionaron polimorfismos de un solo nucletido (SNP) con grandes diferencias de frecuencia
entre las poblaciones continentales basndose en estudios previos
En la tabla 1 se presentan los valores de Fst (estadstico F segn Ley de Hardy-Weinberg) para las
frecuencias europeas / africanas, europeas / amerindias, africanas / amerindias y de alelos para todos los
marcadores informativos de ascendencia (AIM). Estos estudios incluyeron 29 SNP no reportados en nuestros
estudios anteriores.
De los 78 AIMs utilizados en el estudio, 44 fueron utilizados en tres anlisis poblacionales de las
muestras argentinas junto con genotipados de europeos americanos (EURA), amerindios (AMI), Mexicano,
Mexicano Americano (MAM) y africanos occidentales (AFR). Estos 44 marcadores fueron muy informativos. No
hubo evidencia de desequilibrio de ligamiento (LD) entre estos marcadores en cada una de las poblaciones
para este conjunto de SNPs.
De los 78 AIMs, se utilizaron 66 AIMs en dos anlisis poblacionales junto con muestras americanas,
amerindias y mexicoamericanas genotipadas con los mismos marcadores. Este anlisis no incluy aquellos
marcadores que no distinguan entre ancestros europeos y amerindios. Para este conjunto de SNPs solamente
tres combinaciones de pares de marcadores en el mismo cromosoma mostraron una LD mnima o moderada
en cualquiera de estas poblaciones
Todos los genotipos se realizaron mediante TaqMan ensayos utilizando procedimientos descritos
anteriormente. Todos los AIMs estaban en equilibrio de Hardy-Weinberg (H-W) en cada grupo de poblacin.
Anlisis de datos
Las proporciones de mezcla de poblacin se determinaron utilizando tanto el mtodo de mnimos
cuadrados ponderado de Long y utilizando los algoritmos de agrupamiento bayesiano desarrollados por
Pritchard.
Cada anlisis se realiz sin asignacin de poblacin previa y se hicieron al menos cinco veces con
resultados similares usando >10.000 repeticiones y ciclos de quemado bajo el modelo de mezcla aplicando la
opcin de inferir con un separado estimado para cada poblacin (donde es El parmetro de Dirichlet para
el grado de mezcla).
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La mayora de los recorridos se realizaron bajo la opcin = 1 donde parametriza la frecuencia del
alelo antes y se basa en la distribucin de Dirichlet de las frecuencias de los alelos. La probabilidad del
logaritmo de cada anlisis en un nmero variable de grupos de poblacin (k) tambin se estima en cada
anlisis.
RESULTADOS
Nuestros estudios iniciales examinaron la estructura gentica argentina utilizando 44 AIMs que
distinguen entre origen europeo, africano y amerindio. Las contribuciones medias de las poblaciones europeas,
africanas y amerindias fueron estimadas utilizando genotipos previamente reportados de estos grupos
poblacionales.
La aplicacin de los algoritmos bayesiano y la comparacin con las poblaciones mexicana y mexicana-
americana se muestran en la Figura 1A. La frecuencia media de los diferentes grupos de poblacin
correspondientes al grupo de clster predominante en Europa, Amerindio y frica fue 0,780, 0,195 y 0,025
respectivamente. Los anlisis, utilizando la prueba de mnimos cuadrados ponderados basados en las
frecuencias de los alelos en las poblaciones, mostraron resultados similares con los siguientes componentes de
ascendencia estimados en los sujetos argentinos: europeo 0,802 0,013 (error estndar), amerindio 0,181
0,0132 y africano 0,017 0,0077.
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La contribucin relativa de las tres poblaciones en cada individuo mostr una gran variacin en los
orgenes ancestrales y proporcion una ilustracin de la contribucin africana relativamente pequea en los
sujetos argentinos individuales. Slo hubo 4/94 sujetos argentinos con una contribucin africana estimada >
10% y 83 de estos sujetos argentinos tenan una contribucin africana estimada <5%. Las probabilidades
estimadas sugirieron adems que slo haba dos grupos principales de la poblacin ancestral que contribuan a
la mayora de los individuos argentinos actuales.
Cuando se considera la mezcla individual, una gran variacin en la contribucin amerindia y europea es
evidente por el anlisis. La contribucin amerindiana en sujetos argentinos individuales vari entre 1,5 y 84,5%.
Tambin se examin si haba diferencias en la contribucin amerindia y europea en las cuatro mayores
regiones de reclutamiento utilizado en el presente estudio. Aunque hubo variaciones considerables en la
mezcla individual, la media de la contribucin amerindia y europea vari en estas regiones de reclutamiento:
Buenos Aires, 12.2% amerindios y 87.8% europeos; Santa F, 15,5% de amerindios y 84,5% de europeos;
Crdoba, 22,8% de amerindios y 77,2% de europeos; Y Mar del Plata, 33.1% amerindios y 66.9% europeos.
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DISCUSIN
En este estudio se analizaron las caractersticas de la mezcla en la poblacin no indgena argentina
actual utilizando las AIMs del genoma nuclear. La poblacin argentina, al igual que otras poblaciones
predominantes en gran parte del "Nuevo Mundo", est compuesta por miembros con diferentes
contribuciones de tres grupos continentales: europeo, amerindio y africano. Al igual que las poblaciones
mexicanas, la actual poblacin argentina no indgena est compuesta principalmente de individuos con
componentes substanciales de mezcla de ascendencia europea y amerindia. Nuestros resultados consistentes
con otro estudio reciente mostraron una mezcla africana limitada dentro de esta poblacin. La gran mayora
tenan menos de un 5% de contribucin africana. En toda Argentina hay muy baja inclusin de ascendencia
africana y no slo en Buenos Aires, donde la poblacin siempre ha sido considerada ms europea.
Utilizando dos mtodos analticos diferentes, uno aplicando el algoritmo Bayesiano de agrupamiento y
el otro un cuadrado mnimo ponderado, la contribucin amerindia estuvo de acuerdo (19,5% frente a 18,1%).
Estas estimaciones son algo mayores que las encontradas en el estudio previo nico que utiliz un nmero
limitado de antgenos de bancos de sangre en los que la contribucin amerindia se estim en 15,9%.
Las estimaciones actuales utilizando SNP AIM distribuidos a lo largo del genoma proporcionan tanto
una estimacin ms precisa, as como la capacidad de examinar la mezcla individual.
Curiosamente, la contribucin europea y amerindia pareca variar en parte con la ubicacin del
reclutamiento. En Buenos Aires y Santa Fe se observ una menor contribucin amerindia y una mayor
contribucin europea, que son provincias con una alta incidencia de inmigracin europea (principalmente
italiana y espaola). Crdoba, que tuvo una mayor contribucin amerindia fue una ciudad importante durante
la "poca conquistadora espaola" (ao 1500) y mestizos o criollos son muy comunes en esta provincia. Por
otra parte, la corriente de inmigrantes ms importante en Santa F fue de la poblacin italiana durante la
primera parte del siglo 20 (1900-1950). Con respecto a Mar del Plata, que tambin mostr una mayor
contribucin amerindia, este asentamiento fue muy grande y en realidad se llam Sierra de los Padres para los
Padres, que convirtieron a los amerindios al cristianismo y quedan muchos apellidos amerindios en uso
(Millapan, Quitrupn ). Tambin hay una gran migracin de personas de los pases vecinos y ms amerindios
como Bolivia o Paraguay. Sin embargo, debe advertirse que aunque algunas de estas diferencias fueran
estadsticamente significativas, sera necesario un tamao de muestra mayor para confirmar estas diferencias
regionales. Estos estudios sugieren adems que se necesitar una muestra adicional de otras regiones dentro
de Argentina para proporcionar una estimacin ms precisa de la variacin de la mezcla y una representacin
exacta de la poblacin argentina.
El presente informe se suma al nmero de poblaciones mezcladas en el "Nuevo Mundo" que se han
examinado para las contribuciones continentales relativas utilizando un panel genmico de AIMs.
Para el asma, una menor gravedad de la enfermedad se asocia con ascendencia amerindia en los
mexicoamericanos. Para la diabetes tipo 1 existe una incidencia mucho menor de la enfermedad en las
poblaciones mexicanas y amerindias que en las poblaciones europeas, mientras que se sugiere lo contrario
para la artritis reumatoide y la diabetes tipo 2. Aunque las diferencias ambientales, socioeconmicas y de otro
tipo tendrn que ser consideradas en estos estudios, la diferencia en la ascendencia es por lo menos otro
candidato para elucidar las diferencias en las enfermedades y los fenotipos de la enfermedad en estas
diferentes poblaciones.
La gran variacin en la contribucin amerindia sugiere que la poblacin argentina es bastante adecuada
para los estudios de cartografa para examinar la localizacin cromosmica de varios fenotipos de la
enfermedad. Por lo tanto, si las diferencias en la susceptibilidad o manifestaciones de la enfermedad son, de
hecho, vinculados a la ascendencia, el mapeo puede ayudar a identificar las variaciones reales de genes
responsables. La diferencia en la mezcla relativa entre las poblaciones argentina y mexicana tambin podra
proporcionar una oportunidad para examinar las interacciones gen / gen que pueden diferir dependiendo de
las interacciones epistticas adicionales con la composicin gentica de fondo. Estudios adicionales sern
tambin necesarios para examinar las diferencias de subestructura dentro de las contribuciones europeas y
amerindias que tambin pueden subyacer en diferencias fenotpicas particulares o confundir la epidemiologa
clnica y los estudios de genes candidatos. Sin embargo, las diferencias genticas de la poblacin principal que
pueden resultar en la estratificacin oculta o vinculacin de la ascendencia a los rasgos dentro de esta
poblacin deben ser discernibles usando AIMs tales como sos usados en el estudio actual.